AlfalfaGEDB | MsG0780039962.01

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780039962.01

KEGG: -
GO: GO:0016491
PFAM: PF13561

Nr:

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MsG0780039962.01.T07	PNX90329.1	92.222	180	14	0	1	180	93	272	1.17E-115	340
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MsG0780039962.01.T04	PNX90329.1	91.603	262	22	0	4	265	11	272	7.90E-173	488

Swissprot:

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MsG0780039962.01.T05	A0A165U5V5	59.398	266	100	2	1	258	14	279	8.66E-108	316
MsG0780039962.01.T06	A0A165U5V5	57.371	251	99	2	1	243	29	279	1.48E-97	289
MsG0780039962.01.T07	A0A165U5V5	53.804	184	78	1	1	177	96	279	9.09E-61	193
MsG0780039962.01.T08	Q94KL8	48.507	134	68	1	1	133	140	273	3.84E-42	143

Trembl:

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TFs/TRs:

Gene ID	Type	Classification

Protein Kinases:

Gene ID	Type	Classification

Network:

Co-expression Network

Gene1	Gene2	correlation coefficient	p_value	FDR
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PPI

Gene1	Gene2	Type

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MsG0780039962.01.T01	MTR_8g044240	26.961	204	140	3	15	209	75	278	5.98e-14	71.2
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CRISPR-Local

CRISPR-Local
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CRISPR-GE

badsite warning	sgRNA_sequence	Strand	Position	Region	GC_content
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!!!	AGAATAACACCTTTTTTGTT+TGG	-	Chr7:71147606-71147625	None:intergenic	25.0%
!!!	GAATAACACCTTTTTTGTTT+GGG	-	Chr7:71147605-71147624	None:intergenic	25.0%
	AATGTTTATGGAGCTTTCTT+GGG	+	Chr7:71147552-71147571	MsG0780039962.01.T01:CDS	30.0%
	CTTACCATAATTCGAAACTA+CGG	-	Chr7:71147436-71147455	None:intergenic	30.0%
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	TAATGTTTATGGAGCTTTCT+TGG	+	Chr7:71147551-71147570	MsG0780039962.01.T01:CDS	30.0%
	TGTGTAGAATTAGGACAATA+TGG	+	Chr7:71147720-71147739	MsG0780039962.01.T01:CDS	30.0%
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	AAAGTGAATTGTATCTCACC+AGG	+	Chr7:71147747-71147766	MsG0780039962.01.T01:CDS	35.0%
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	CTTGTTCATATTCAGTGCAT+TGG	-	Chr7:71147796-71147815	None:intergenic	35.0%
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	GCAGATATTCAAGATGAAGT+AGG	+	Chr7:71147318-71147337	MsG0780039962.01.T01:CDS	35.0%
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	GGTAAAGTAGCAATAATCAC+AGG	+	Chr7:71147228-71147247	MsG0780039962.01.T01:CDS	35.0%
	TCTTCCAAGTTCATTGCAAA+GGG	-	Chr7:71147349-71147368	None:intergenic	35.0%
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	TTCTTCCAAGTTCATTGCAA+AGG	-	Chr7:71147350-71147369	None:intergenic	35.0%
!	ATGATAGCGAAGCTTTCAAA+AGG	+	Chr7:71147517-71147536	MsG0780039962.01.T01:CDS	35.0%
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!!	TTCAGTGCATTGGTTAGAAT+TGG	-	Chr7:71147786-71147805	None:intergenic	35.0%
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!!	GAGAAAGTTTTGTCCTCAGT+TGG	+	Chr7:71147825-71147844	MsG0780039962.01.T01:CDS	40.0%
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!	AGTGTTGCTACAGAAACTGC+TGG	+	Chr7:71147636-71147655	MsG0780039962.01.T01:CDS	45.0%
!	CTCAGTTGGTGTGTTGAAAG+AGG	+	Chr7:71147839-71147858	MsG0780039962.01.T01:CDS	45.0%
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Gene Sequence

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