AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780040626.01

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MsG0780040626.01.T01 AT1G56720 36.950 341 176 5 164 481 167 491 2.77e-61 214
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MsG0780040626.01.T01 AT5G45780 37.912 364 180 8 94 430 229 573 2.27e-60 215
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MsG0780040626.01.T01 AT5G18500 39.932 293 148 3 164 433 154 441 1.19e-59 209
MsG0780040626.01.T01 AT5G18500 39.932 293 148 3 164 433 154 441 1.19e-59 209
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MsG0780040626.01.T01 AT5G18500 39.932 293 148 3 164 433 154 441 1.19e-59 209
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MsG0780040626.01.T01 AT1G61860 41.554 296 136 9 164 430 73 360 4.68e-57 200
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MsG0780040626.01.T01 AT1G07650 37.135 342 164 7 117 430 633 951 2.73e-55 206
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MsG0780040626.01.T01 AT1G55200 36.426 291 158 2 164 432 367 652 6.01e-55 201
MsG0780040626.01.T01 AT1G55200 36.426 291 158 2 164 432 367 652 6.01e-55 201
MsG0780040626.01.T01 AT4G21410 34.511 368 205 10 103 443 161 519 6.10e-55 198
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MsG0780040626.01.T01 AT1G29730 38.158 304 156 7 164 443 661 956 7.13e-55 204
MsG0780040626.01.T01 AT2G48020 54.922 193 37 1 523 665 46 238 7.94e-55 194
MsG0780040626.01.T01 AT2G48020 64.516 62 22 0 664 725 307 368 2.63e-17 85.1
MsG0780040626.01.T01 AT1G70740 36.184 304 159 4 164 437 50 348 8.04e-55 195
MsG0780040626.01.T01 AT2G28930 38.636 308 150 6 157 430 61 363 8.39e-55 194
MsG0780040626.01.T01 AT1G76370 39.041 292 148 5 164 430 63 349 1.20e-54 193
MsG0780040626.01.T01 AT5G02290 37.942 311 148 8 157 430 49 351 1.24e-54 193
MsG0780040626.01.T01 AT5G02290 37.942 311 148 8 157 430 49 351 1.24e-54 193
MsG0780040626.01.T01 AT3G09010 42.857 245 105 5 145 359 8 247 1.27e-54 191
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MsG0780040626.01.T01 AT1G07570 37.942 311 148 8 157 430 49 351 1.41e-52 188
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MsG0780040626.01.T01 AT3G13690 37.966 295 148 6 164 432 399 684 5.46e-52 194
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MsG0780040626.01.T01 AT1G49730 29.668 482 257 13 16 429 161 628 7.33e-52 192
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MsG0780040626.01.T01 AT2G07180 38.721 297 148 5 164 431 78 369 7.82e-52 187
MsG0780040626.01.T01 AT1G70740 34.810 316 159 5 164 437 38 348 8.41e-52 186
MsG0780040626.01.T01 AT1G66880 36.503 326 171 8 164 464 957 1271 8.50e-52 196
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MsG0780040626.01.T01 AT3G19300 36.949 295 143 6 163 429 315 594 1.49e-51 191
MsG0780040626.01.T01 AT4G23290 35.347 331 179 6 153 459 340 659 1.73e-51 191
MsG0780040626.01.T01 AT4G21400 33.046 348 172 7 146 438 192 533 1.87e-51 189
MsG0780040626.01.T01 AT3G04690 37.931 290 153 3 163 430 504 788 2.31e-51 193
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MsG0780040626.01.T01 AT4G04570 38.267 277 131 5 105 358 125 384 8.31e-51 183
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MsG0780040626.01.T01 AT5G01950 38.689 305 141 6 164 437 614 903 1.04e-50 192
MsG0780040626.01.T01 AT5G01950 38.689 305 141 6 164 437 614 903 1.04e-50 192
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MsG0780040626.01.T01 AT1G61430 31.773 406 223 12 86 461 384 765 1.33e-50 190
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MsG0780040626.01.T01 AT2G35620 34.232 371 193 10 92 432 225 574 1.91e-50 186
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MsG0780040626.01.T01 AT5G54380 39.597 298 148 6 158 430 491 781 1.45e-49 187
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MsG0780040626.01.T01 AT5G18610 38.636 308 149 9 164 438 71 371 2.11e-49 182
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MsG0780040626.01.T01 AT5G06740 36.859 312 158 9 163 443 317 620 2.30e-49 184
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MsG0780040626.01.T01 AT5G06740 36.859 312 158 9 163 443 329 632 2.76e-49 184
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MsG0780040626.01.T01 AT1G61490 30.923 401 232 10 86 460 408 789 2.90e-49 186
MsG0780040626.01.T01 AT1G61490 30.923 401 232 10 86 460 408 789 2.90e-49 186
MsG0780040626.01.T01 AT4G35600 32.172 373 208 7 142 483 53 411 3.03e-49 179
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MsG0780040626.01.T01 AT1G31420 33.690 374 193 10 92 432 226 577 3.35e-49 183
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MsG0780040626.01.T01 AT3G09830 37.013 308 164 6 157 435 65 371 3.67e-49 179
MsG0780040626.01.T01 AT4G23190 31.915 376 198 10 105 449 290 638 4.17e-49 184
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MsG0780040626.01.T01 AT1G70530 35.165 364 192 10 92 430 248 592 5.24e-49 183
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MsG0780040626.01.T01 AT1G25390 35.294 306 167 6 164 442 279 580 1.02e-48 182
MsG0780040626.01.T01 AT5G42440 33.144 353 204 7 104 430 7 353 1.08e-48 176
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MsG0780040626.01.T01 AT4G03230 32.982 379 211 6 103 443 502 875 1.76e-48 185
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MsG0780040626.01.T01 AT4G03230 32.982 379 211 6 103 443 602 975 2.87e-48 184
MsG0780040626.01.T01 AT1G67520 32.902 386 206 10 104 443 168 546 2.89e-48 180
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MsG0780040626.01.T01 AT1G67520 32.902 386 206 10 104 443 197 575 5.30e-48 180
MsG0780040626.01.T01 AT2G26290 33.333 348 175 9 150 463 59 383 5.76e-48 176
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MsG0780040626.01.T01 AT4G02420 34.503 342 191 8 163 480 337 669 2.14e-47 179
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MsG0780040626.01.T01 AT2G25220 31.633 392 196 12 99 429 41 421 1.02e-46 172
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MsG0780040626.01.T01 AT1G21590 33.663 303 171 5 158 436 351 647 1.05e-46 177
MsG0780040626.01.T01 AT3G59420 35.621 306 163 6 152 430 488 786 1.40e-46 179
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MsG0780040626.01.T01 AT5G58940 36.301 292 155 5 164 429 135 421 1.47e-46 173
MsG0780040626.01.T01 AT5G58940 36.301 292 155 5 164 429 135 421 1.47e-46 173
MsG0780040626.01.T01 AT1G61390 35.000 320 174 8 164 460 508 816 1.48e-46 178
MsG0780040626.01.T01 AT4G23180 38.868 265 121 6 118 358 301 548 1.51e-46 175
MsG0780040626.01.T01 AT1G11330 31.714 391 230 6 106 466 445 828 1.59e-46 178
MsG0780040626.01.T01 AT2G13800 37.500 296 154 6 163 432 262 552 1.60e-46 176
MsG0780040626.01.T01 AT2G13800 37.500 296 154 6 163 432 262 552 1.60e-46 176
MsG0780040626.01.T01 AT1G21590 33.663 303 171 5 158 436 391 687 1.65e-46 177
MsG0780040626.01.T01 AT3G16030 36.943 314 166 7 156 443 507 814 1.74e-46 178
MsG0780040626.01.T01 AT2G43700 32.044 362 194 8 100 432 270 608 1.85e-46 176
MsG0780040626.01.T01 AT2G14510 33.151 365 195 10 89 429 500 839 2.07e-46 178
MsG0780040626.01.T01 AT1G11300 33.333 381 202 10 116 464 445 805 2.10e-46 178
MsG0780040626.01.T01 AT2G43700 32.044 362 194 8 100 432 246 584 2.11e-46 176
MsG0780040626.01.T01 AT2G43700 32.044 362 194 8 100 432 246 584 2.11e-46 176
MsG0780040626.01.T01 AT2G43700 32.044 362 194 8 100 432 246 584 2.11e-46 176
MsG0780040626.01.T01 AT2G43700 32.044 362 194 8 100 432 246 584 2.11e-46 176
MsG0780040626.01.T01 AT3G16030 33.770 382 204 11 102 443 463 835 2.12e-46 178
MsG0780040626.01.T01 AT2G14510 33.151 365 195 10 89 429 492 831 2.13e-46 178
MsG0780040626.01.T01 AT1G11280 33.670 297 165 6 161 431 478 768 2.41e-46 177
MsG0780040626.01.T01 AT2G05940 37.627 295 150 5 164 429 75 364 2.59e-46 172
MsG0780040626.01.T01 AT2G28960 36.426 291 153 7 163 430 430 711 2.71e-46 177
MsG0780040626.01.T01 AT1G11300 33.245 379 201 10 118 464 432 790 2.93e-46 177
MsG0780040626.01.T01 AT1G11280 33.670 297 165 6 161 431 488 778 2.95e-46 177
MsG0780040626.01.T01 AT2G19230 34.153 366 185 10 92 430 504 840 2.95e-46 178
MsG0780040626.01.T01 AT1G18390 31.635 373 211 7 93 429 246 610 3.16e-46 175
MsG0780040626.01.T01 AT4G32300 34.286 315 165 8 156 443 475 774 3.79e-46 177
MsG0780040626.01.T01 AT1G06700 35.690 297 156 5 164 430 56 347 5.61e-46 168
MsG0780040626.01.T01 AT1G06700 35.690 297 156 5 164 430 56 347 5.61e-46 168
MsG0780040626.01.T01 AT1G06700 35.690 297 156 5 164 430 56 347 5.61e-46 168
MsG0780040626.01.T01 AT5G49760 38.420 367 191 8 90 431 547 903 5.85e-46 177
MsG0780040626.01.T01 AT5G03320 36.304 303 161 6 157 429 62 362 6.10e-46 170
MsG0780040626.01.T01 AT5G03320 36.304 303 161 6 157 429 62 362 6.10e-46 170
MsG0780040626.01.T01 AT1G18390 31.081 370 209 7 98 429 255 616 6.40e-46 174
MsG0780040626.01.T01 AT4G13190 36.301 292 155 6 164 429 59 345 7.01e-46 169
MsG0780040626.01.T01 AT5G24080 31.549 355 194 8 104 434 351 680 7.18e-46 176
MsG0780040626.01.T01 AT5G24080 31.549 355 194 8 104 434 351 680 7.18e-46 176
MsG0780040626.01.T01 AT1G16120 35.362 345 184 6 116 430 365 700 1.05e-45 175
MsG0780040626.01.T01 AT3G28690 34.295 312 162 6 154 430 4 307 1.08e-45 168
MsG0780040626.01.T01 AT5G53890 31.720 372 219 5 89 430 660 1026 1.17e-45 177
MsG0780040626.01.T01 AT2G28960 36.271 295 156 7 159 430 558 843 1.21e-45 176
MsG0780040626.01.T01 AT3G59740 31.025 361 201 7 96 429 268 607 1.32e-45 174
MsG0780040626.01.T01 AT5G24080 31.549 355 194 8 104 434 478 807 1.55e-45 176
MsG0780040626.01.T01 AT1G29730 41.150 226 106 3 164 367 628 848 1.68e-45 176
MsG0780040626.01.T01 AT1G11410 30.809 383 221 9 102 450 325 697 1.69e-45 174
MsG0780040626.01.T01 AT1G11330 34.969 326 182 5 164 466 512 830 1.81e-45 175
MsG0780040626.01.T01 AT4G02410 32.402 358 195 8 100 432 294 629 1.93e-45 173
MsG0780040626.01.T01 AT2G25220 35.759 316 155 11 99 378 59 362 2.06e-45 169
MsG0780040626.01.T01 AT2G25220 35.759 316 155 11 99 378 10 313 2.11e-45 167
MsG0780040626.01.T01 AT2G25220 37.124 299 142 10 99 361 59 347 2.18e-45 167
MsG0780040626.01.T01 AT1G61380 29.288 379 218 8 91 445 269 621 2.50e-45 173
MsG0780040626.01.T01 AT3G28690 34.295 312 162 6 154 430 53 356 2.59e-45 168
MsG0780040626.01.T01 AT4G23130 43.182 220 97 4 162 358 330 544 2.98e-45 171
MsG0780040626.01.T01 AT5G61350 36.054 294 156 3 164 430 513 801 3.05e-45 174
MsG0780040626.01.T01 AT1G11340 31.967 366 212 9 102 438 437 794 3.08e-45 174
MsG0780040626.01.T01 AT1G11410 30.809 383 221 9 102 450 440 812 3.27e-45 174
MsG0780040626.01.T01 AT1G11410 30.809 383 221 9 102 450 447 819 3.39e-45 174
MsG0780040626.01.T01 AT1G51850 36.585 287 150 6 163 426 547 824 3.50e-45 174
MsG0780040626.01.T01 AT1G51850 36.585 287 150 6 163 426 567 844 3.54e-45 174
MsG0780040626.01.T01 AT5G59260 33.119 311 177 6 152 439 331 633 3.63e-45 172
MsG0780040626.01.T01 AT1G11410 30.809 383 221 9 102 450 416 788 4.09e-45 174
MsG0780040626.01.T01 AT2G28250 35.505 307 155 10 161 431 195 494 4.40e-45 171
MsG0780040626.01.T01 AT2G28250 35.505 307 155 10 161 431 195 494 4.40e-45 171
MsG0780040626.01.T01 AT2G28250 35.505 307 155 10 161 431 195 494 4.40e-45 171
MsG0780040626.01.T01 AT2G28250 35.505 307 155 10 161 431 195 494 4.40e-45 171
MsG0780040626.01.T01 AT2G28250 35.505 307 155 10 161 431 195 494 4.40e-45 171
MsG0780040626.01.T01 AT2G28250 35.505 307 155 10 161 431 195 494 4.40e-45 171
MsG0780040626.01.T01 AT2G28970 33.333 363 205 9 94 430 363 714 4.55e-45 173
MsG0780040626.01.T01 AT2G19130 36.334 311 164 6 160 444 479 781 4.57e-45 174
MsG0780040626.01.T01 AT2G28970 34.940 332 179 9 125 430 429 749 4.86e-45 173
MsG0780040626.01.T01 AT3G28690 34.295 312 162 6 154 430 104 407 5.13e-45 169
MsG0780040626.01.T01 AT4G17660 40.254 236 108 4 154 361 69 299 5.95e-45 166
MsG0780040626.01.T01 AT5G49770 40.339 295 139 7 164 431 622 906 6.52e-45 174
MsG0780040626.01.T01 AT1G70530 38.699 292 137 9 92 358 248 522 6.62e-45 169
MsG0780040626.01.T01 AT5G07180 36.897 290 144 6 166 429 545 821 6.68e-45 174
MsG0780040626.01.T01 AT1G51820 36.585 287 150 7 163 426 305 582 6.97e-45 171
MsG0780040626.01.T01 AT1G51830 36.237 287 151 6 163 426 382 659 7.00e-45 172

Find 184 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 548 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TCCCACTGCTGTGTTGCTTC+TGG 0.130660 7:+80306905 MsG0780040626.01.T01:CDS
GAGGCTAAGGTAGCAGATTT+TGG 0.179232 7:+80300708 MsG0780040626.01.T01:CDS
AGTCTTTATGATCATTTATT+TGG 0.199398 7:+80300538 MsG0780040626.01.T01:CDS
GATTATTGTTACCGATTTAA+TGG 0.237796 7:+80300507 MsG0780040626.01.T01:CDS
TCTTGTTTCGATTAGGTATC+TGG 0.237816 7:+80308093 MsG0780040626.01.T01:intron
TCAAGTCTCCCAGCAATAAA+AGG 0.239311 7:-80301152 None:intergenic
TACTAGGGTGGCGGGAACTA+TGG 0.247373 7:+80300770 MsG0780040626.01.T01:CDS
ACATACTTCTCAAGAATTTC+TGG 0.251826 7:-80301011 None:intergenic
TAAAGCTAGTAATATACTTT+TGG 0.262643 7:+80300674 MsG0780040626.01.T01:CDS
AGGGCACCTCGGAGTTCTTT+TGG 0.268637 7:-80306552 None:intergenic
GGTCCAGTGCCTTTGGATAT+TGG 0.272502 7:+80306367 MsG0780040626.01.T01:CDS
GGTCGTTGGTTAGAAATAAT+AGG 0.281524 7:+80300946 MsG0780040626.01.T01:CDS
ACTGAGATTGTGATAGGTTT+AGG 0.283295 7:+80300181 MsG0780040626.01.T01:CDS
CCCACTGCTGTGTTGCTTCT+GGG 0.289747 7:+80306906 MsG0780040626.01.T01:CDS
GGTTATGGAAATGTTTATAA+AGG 0.296355 7:+80300313 MsG0780040626.01.T01:CDS
GTCCAGTGCCTTTGGATATT+GGG 0.296992 7:+80306368 MsG0780040626.01.T01:CDS
GCAACACAGCAGTGGGAATA+AGG 0.301338 7:-80306899 None:intergenic
GTATCAGTGTCATTCATAAT+TGG 0.311203 7:+80306718 MsG0780040626.01.T01:CDS
GGAACTGCTAGTTGTTTGTT+TGG 0.321751 7:+80299998 MsG0780040626.01.T01:CDS
TTTATAGGGTCCAGTGCCTT+TGG 0.327122 7:+80306360 MsG0780040626.01.T01:intron
TTACCAAAAGTAGGGGCTTC+CGG 0.327819 7:-80307995 None:intergenic
GAAGGATCTTAGTCTGTCTT+TGG 0.336829 7:+80305739 MsG0780040626.01.T01:CDS
CTCCAACTCAAGAAGCTATT+AGG 0.337233 7:+80305717 MsG0780040626.01.T01:CDS
GTTAATCTTGTTGCTTTAAG+AGG 0.341803 7:+80300445 MsG0780040626.01.T01:CDS
AGGCCGGAAGCCCCTACTTT+TGG 0.343569 7:+80307992 MsG0780040626.01.T01:CDS
GTCCCAGCACTTGCCGTAAT+CGG 0.344026 7:+80308274 MsG0780040626.01.T01:CDS
ATTTCTGGTGTACCAGGTTC+TGG 0.354550 7:-80300996 None:intergenic
TAATTGGAACAGTACTTTCA+TGG 0.363139 7:+80306734 MsG0780040626.01.T01:CDS
AAGAGAAGGGGAATTATAAT+AGG 0.364747 7:+80300158 MsG0780040626.01.T01:CDS
GCTTCACTTTCCGATGAGTT+TGG 0.366727 7:+80299962 MsG0780040626.01.T01:CDS
TTTAAGAATTGTTCTGTTGC+CGG 0.367321 7:+80300373 MsG0780040626.01.T01:CDS
GGGAGACTAGCAACAGGATA+TGG 0.368465 7:+80306388 MsG0780040626.01.T01:CDS
ATAATTGGGAGTGGTGGTTA+TGG 0.371523 7:+80300298 MsG0780040626.01.T01:CDS
GTCGTTGGTTAGAAATAATA+GGG 0.371683 7:+80300947 MsG0780040626.01.T01:CDS
TGAAGAGGCAGAAGAAATTC+AGG 0.379612 7:+80307134 MsG0780040626.01.T01:CDS
CTCAGCCTTCGATTATTCAT+AGG 0.379866 7:+80300646 MsG0780040626.01.T01:intron
AACTGAAAGTGGGGAAAGGA+TGG 0.382809 7:-80308468 None:intergenic
ACTTGCCGTAATCGGCATAT+TGG 0.388619 7:+80308282 MsG0780040626.01.T01:CDS
AGGAGTGATGTGTTTAGTTT+CGG 0.390507 7:+80300837 MsG0780040626.01.T01:CDS
AATAGGACTGAGATTGTGAT+AGG 0.393783 7:+80300175 MsG0780040626.01.T01:CDS
ATACCTGATTTAAGGTAGTC+AGG 0.404425 7:-80306572 None:intergenic
GATTGTGATAGGTTTAGGTT+CGG 0.407759 7:+80300186 MsG0780040626.01.T01:CDS
GATAGGTTTAGGTTCGGGTT+TGG 0.410779 7:+80300192 MsG0780040626.01.T01:CDS
TTCGATTAGGTATCTGGATC+AGG 0.410915 7:+80308099 MsG0780040626.01.T01:intron
TTGAAGTTATTGCTAGTGTT+AGG 0.413388 7:+80300419 MsG0780040626.01.T01:CDS
GGTTAGAAATAATAGGGCTT+TGG 0.415379 7:+80300953 MsG0780040626.01.T01:CDS
TTATTACTTACCAGCCATCT+AGG 0.415487 7:-80306951 None:intergenic
ATCAGAGTACTACTTTGATT+AGG 0.415534 7:+80300224 MsG0780040626.01.T01:CDS
TTTCTAGGGATAATATAATT+GGG 0.417920 7:+80300284 MsG0780040626.01.T01:CDS
TTCCTAATAGCTTCTTGAGT+TGG 0.419270 7:-80305719 None:intergenic
CTGAAAGTGGGGAAAGGATG+GGG 0.420298 7:-80308466 None:intergenic
GAACTGAAGTTGCTTTGAAA+AGG 0.422395 7:+80300350 MsG0780040626.01.T01:CDS
TATAAAGGTTTGTTGAATGA+TGG 0.422763 7:+80300328 MsG0780040626.01.T01:CDS
TGGAGGGCTTTAGCTATAAT+CGG 0.425528 7:+80306754 MsG0780040626.01.T01:CDS
AAGTAGAAGCACGCCGACTT+TGG 0.425559 7:-80301250 None:intergenic
CCATACCAATATGCCGATTA+CGG 0.426709 7:-80308287 None:intergenic
GGATGACTCATATGAGTACT+AGG 0.427426 7:+80300754 MsG0780040626.01.T01:CDS
ATTGTGATAGGTTTAGGTTC+GGG 0.427835 7:+80300187 MsG0780040626.01.T01:CDS
TGCCCTGACTACCTTAAATC+AGG 0.427867 7:+80306569 MsG0780040626.01.T01:CDS
GGATGAGAAGTTTGAGGCTA+AGG 0.429676 7:+80300695 MsG0780040626.01.T01:CDS
CAGTGACTTGGCTTGGTCGT+TGG 0.430002 7:+80300932 MsG0780040626.01.T01:CDS
AGTAGAAGCACGCCGACTTT+GGG 0.434681 7:-80301249 None:intergenic
TCATTCCAGAGTCTCCTAGA+TGG 0.435503 7:+80306937 MsG0780040626.01.T01:CDS
GCTTTGGATGTTATTGAAGA+TGG 0.436247 7:+80300969 MsG0780040626.01.T01:CDS
CTTTAAATTTACCAAAAGTA+GGG 0.436278 7:-80308003 None:intergenic
TCTGGATCAGGATTGGTTGC+AGG 0.437259 7:+80308111 MsG0780040626.01.T01:CDS
ACTAGGGTGGCGGGAACTAT+GGG 0.437963 7:+80300771 MsG0780040626.01.T01:CDS
ATGCCGATTACGGCAAGTGC+TGG 0.438063 7:-80308277 None:intergenic
TGCGAGGCCAACGATGGATC+AGG 0.445362 7:+80301070 MsG0780040626.01.T01:CDS
GTTACCGATTTAATGGAGAA+TGG 0.446621 7:+80300514 MsG0780040626.01.T01:CDS
AGAAAGAGTATGAAAGAGAA+GGG 0.447217 7:+80300145 MsG0780040626.01.T01:CDS
ACTCCCATTCTCCATTAAAT+CGG 0.448010 7:-80300518 None:intergenic
ACTGCTACTACTAATTTAGA+AGG 0.453131 7:+80300475 MsG0780040626.01.T01:CDS
CTGCATTCAGTGACTTGGCT+TGG 0.453861 7:+80300925 MsG0780040626.01.T01:CDS
GCTTTAAATTTACCAAAAGT+AGG 0.457971 7:-80308004 None:intergenic
GTAAGCGCTTCAGAGCGTTT+AGG 0.459248 7:-80299875 None:intergenic
TCCGGCCTGCTCTATCTATG+AGG 0.461836 7:-80307977 None:intergenic
TCAAGAATTTCTGGTGTACC+AGG 0.469813 7:-80301002 None:intergenic
GATTGAAGAGCTTGAAGTGC+AGG 0.469958 7:-80299803 None:intergenic
TTACCGATTTAATGGAGAAT+GGG 0.473523 7:+80300515 MsG0780040626.01.T01:CDS
ACTGAAAGTGGGGAAAGGAT+GGG 0.482190 7:-80308467 None:intergenic
GGTCAGCTCTGCAGTCCAAC+TGG 0.484840 7:+80301203 MsG0780040626.01.T01:CDS
AGAACGTGCTTCTAATTGTA+AGG 0.489718 7:+80301295 MsG0780040626.01.T01:CDS
CTAGCAACAGGATATGGAAT+GGG 0.490163 7:+80306394 MsG0780040626.01.T01:CDS
CTAGCAGTTCCTATGTTAGT+AGG 0.495937 7:-80299986 None:intergenic
CAAGTCTCCCAGCAATAAAA+GGG 0.502409 7:-80301151 None:intergenic
ACCCACTGCATTCAGTGACT+TGG 0.506826 7:+80300920 MsG0780040626.01.T01:CDS
GAAACGTGCTTCTAGTTGTA+AGG 0.512071 7:+80301334 MsG0780040626.01.T01:CDS
GATATTGGGAGACTAGCAAC+AGG 0.513165 7:+80306382 MsG0780040626.01.T01:CDS
GAGAAAGAGTATGAAAGAGA+AGG 0.514981 7:+80300144 MsG0780040626.01.T01:CDS
TGGGTTGGCGAAGTTCAATC+CGG 0.515839 7:+80300728 MsG0780040626.01.T01:CDS
TGCTTCTAATTGTAAGGAAG+AGG 0.518348 7:+80301301 MsG0780040626.01.T01:CDS
TGCTTCTAGTTGTAAGGAAG+AGG 0.518633 7:+80301340 MsG0780040626.01.T01:CDS
GGATCAGGTCGTTAAAATGC+TGG 0.518863 7:+80301085 MsG0780040626.01.T01:CDS
ACAGGTTCATGAAGTGGCTG+TGG 0.519075 7:+80308246 MsG0780040626.01.T01:intron
CTTCGAAGAAGAAGTTGAGT+TGG 0.519830 7:+80300563 MsG0780040626.01.T01:CDS
TCCAGAGTCTCCTAGATGGC+TGG 0.523060 7:+80306941 MsG0780040626.01.T01:CDS
GAAGCGCTTACTTATTTGAC+CGG 0.523471 7:+80299887 MsG0780040626.01.T01:CDS
CAGATTGTGATCACAGGTGT+TGG 0.523824 7:+80307948 MsG0780040626.01.T01:intron
AGCGGTGTAAGAACTACAAT+CGG 0.523989 7:-80299930 None:intergenic
TTAGGTATCTGGATCAGGAT+TGG 0.526007 7:+80308104 MsG0780040626.01.T01:intron
TGCCGATTACGGCAAGTGCT+GGG 0.527544 7:-80308276 None:intergenic
TCTTAGTCTGTCTTTGGCAG+AGG 0.528107 7:+80305745 MsG0780040626.01.T01:CDS
TAGGAATGGGAGCAATTCCA+TGG 0.529632 7:+80308422 MsG0780040626.01.T01:CDS
TGGAACAGTACTTTCATGGA+GGG 0.532101 7:+80306738 MsG0780040626.01.T01:CDS
GCTCCTGAGTATGCATTGTA+TGG 0.532467 7:+80300801 MsG0780040626.01.T01:CDS
CTCATATGAGTCATCCCCTC+CGG 0.533392 7:-80300747 None:intergenic
CTCCCAGCAATAAAAGGGAT+TGG 0.534143 7:-80301146 None:intergenic
TCAGCCTTCGATTATTCATA+GGG 0.534376 7:+80300647 MsG0780040626.01.T01:intron
ACCAGCCATCTAGGAGACTC+TGG 0.543206 7:-80306942 None:intergenic
CTCCCAATATCCAAAGGCAC+TGG 0.543712 7:-80306370 None:intergenic
TGAAAGTGGGGAAAGGATGG+GGG 0.544198 7:-80308465 None:intergenic
TTTAAATTTACCAAAAGTAG+GGG 0.548748 7:-80308002 None:intergenic
TTAACGACCTGATCCATCGT+TGG 0.554446 7:-80301077 None:intergenic
CCGGCCTGCTCTATCTATGA+GGG 0.555047 7:-80307976 None:intergenic
GAAGATGGCATGCCAGAACC+TGG 0.556695 7:+80300984 MsG0780040626.01.T01:CDS
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ACCTCGGACATCACAACCCA+TGG 0.560460 7:-80308439 None:intergenic
GAGTTTGGTCCTACTAACAT+AGG 0.561677 7:+80299977 MsG0780040626.01.T01:CDS
TACCTGATTTAAGGTAGTCA+GGG 0.563340 7:-80306571 None:intergenic
GAAATCTGCTAGCAATAACT+CGG 0.565603 7:+80301181 MsG0780040626.01.T01:CDS
ATTGGCCTTTCCACTACTGA+TGG 0.569307 7:-80301128 None:intergenic
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ACCCAGAAGCAACACAGCAG+TGG 0.576369 7:-80306907 None:intergenic
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GCAATTTCTGCTACGAACAC+AGG 0.587269 7:-80306528 None:intergenic
GACGTTACTGACGGTTACTC+CGG 0.589763 7:-80299906 None:intergenic
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GTATATGCTTGATAACCAGT+TGG 0.594979 7:-80301218 None:intergenic
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CATATGAGTACTAGGGTGGC+GGG 0.595814 7:+80300762 MsG0780040626.01.T01:CDS
GCGCTTGAAACAAATGTGGA+TGG 0.599736 7:+80300894 MsG0780040626.01.T01:CDS
CAGGTTCATGAAGTGGCTGT+GGG 0.601363 7:+80308247 MsG0780040626.01.T01:intron
GTTAGTAGGACCAAACTCAT+CGG 0.602274 7:-80299972 None:intergenic
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GCCAAGTCACTGAATGCAGT+GGG 0.603303 7:-80300921 None:intergenic
AGTCACTGAATGCAGTGGGT+TGG 0.603929 7:-80300917 None:intergenic
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GTTATATGCGAGGCCAACGA+TGG 0.615043 7:+80301064 MsG0780040626.01.T01:CDS
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AGCCAAGTCACTGAATGCAG+TGG 0.621948 7:-80300922 None:intergenic
ATACAATGCAATCCCAAAGT+CGG 0.622216 7:+80301237 MsG0780040626.01.T01:CDS
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TAATGAATGCAGGCAAAGCG+AGG 0.623838 7:+80307051 MsG0780040626.01.T01:intron
GATAATATAATTGGGAGTGG+TGG 0.624292 7:+80300292 MsG0780040626.01.T01:CDS
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TGTCCATACAATGCATACTC+AGG 0.632889 7:-80300804 None:intergenic
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AAACTCATCGGAAAGTGAAG+CGG 0.641202 7:-80299960 None:intergenic
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TTAAGGTAGTCAGGGCACCT+CGG 0.669152 7:-80306563 None:intergenic
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GTTGGCCTCGCATATAACTG+TGG 0.702138 7:-80301059 None:intergenic
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CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
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!!! CAAAATTAAACTTTTAAGTT+GGG - Chr7:80303204-80303223 None:intergenic 15.0%
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!!! TTGTTTTGGAATATATATGC+AGG + Chr7:80306196-80306215 MsG0780040626.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTGATTTGTTTTTACTCCA+TGG + Chr7:80304008-80304027 MsG0780040626.01.T01:intron 25.0%
AAATAAGTGTTTGCAATTGC+AGG + Chr7:80306876-80306895 MsG0780040626.01.T01:intron 30.0%
AACTTCAACTGCAACAATTA+AGG + Chr7:80304110-80304129 MsG0780040626.01.T01:intron 30.0%
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AAGCTGTAAAGTTCTTAGTT+GGG - Chr7:80308177-80308196 None:intergenic 30.0%
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AATACGATATATAGGAACTG+GGG - Chr7:80302653-80302672 None:intergenic 30.0%
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AGAGGTGGAAAATAAAGTAT+TGG + Chr7:80307426-80307445 MsG0780040626.01.T01:intron 30.0%
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ATATGACCAATAACAAGGTT+TGG + Chr7:80301648-80301667 MsG0780040626.01.T01:intron 30.0%
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CCAAGGAGAAAATGAAAATT+TGG + Chr7:80304251-80304270 MsG0780040626.01.T01:intron 30.0%
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GAATAAGAGAACCATTGATA+GGG + Chr7:80305404-80305423 MsG0780040626.01.T01:intron 30.0%
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GCAAGAAATACAATGTTTAG+AGG + Chr7:80305898-80305917 MsG0780040626.01.T01:intron 30.0%
GTAATTATACAGTTGAACCT+TGG + Chr7:80305853-80305872 MsG0780040626.01.T01:intron 30.0%
GTTGAAACTTGAATATTGTG+AGG + Chr7:80302807-80302826 MsG0780040626.01.T01:intron 30.0%
GTTTGTGGTTCTTATGAATT+TGG + Chr7:80305504-80305523 MsG0780040626.01.T01:intron 30.0%
TAAAGTCTAAAGACCCAATT+TGG - Chr7:80303691-80303710 None:intergenic 30.0%
TAATTGGAACAGTACTTTCA+TGG + Chr7:80306734-80306753 MsG0780040626.01.T01:CDS 30.0%
TACAATAGACATTAAAGAGC+TGG + Chr7:80302289-80302308 MsG0780040626.01.T01:intron 30.0%
TACCAAAAGTTTCGAATTGT+AGG - Chr7:80305004-80305023 None:intergenic 30.0%
TATAATATACGCTATCCTTC+AGG + Chr7:80307839-80307858 MsG0780040626.01.T01:intron 30.0%
TATGTACATGAACGTAGTTT+AGG - Chr7:80302686-80302705 None:intergenic 30.0%
TATTTAGATGAAACATGCAG+TGG + Chr7:80306989-80307008 MsG0780040626.01.T01:intron 30.0%
TCATATGATCTTCTTCTTAG+TGG - Chr7:80306810-80306829 None:intergenic 30.0%
TTATACTATTAGAGTCCAGA+CGG - Chr7:80301829-80301848 None:intergenic 30.0%
TTCACTTCTGATGAACAAAA+TGG - Chr7:80302011-80302030 None:intergenic 30.0%
TTGAAGTTATTGCTAGTGTT+AGG + Chr7:80300419-80300438 MsG0780040626.01.T01:CDS 30.0%
TTTAAGAATTGTTCTGTTGC+CGG + Chr7:80300373-80300392 MsG0780040626.01.T01:CDS 30.0%
! AAGCAACTAGGAATTTTTCT+AGG + Chr7:80300269-80300288 MsG0780040626.01.T01:CDS 30.0%
! AAGTATGATGGTGTTAAACT+TGG - Chr7:80307670-80307689 None:intergenic 30.0%
! AAGTTTTCGATTCTTGTTAC+TGG - Chr7:80300050-80300069 None:intergenic 30.0%
! AATAAGCCAAACCTTGTTAT+TGG - Chr7:80301657-80301676 None:intergenic 30.0%
! AATGGATTTACATACAGTAG+TGG + Chr7:80304977-80304996 MsG0780040626.01.T01:intron 30.0%
! AATTCTTGAGAAGTATGTGT+TGG + Chr7:80301016-80301035 MsG0780040626.01.T01:CDS 30.0%
! AGAAAGAGTATGAAAGAGAA+GGG + Chr7:80300145-80300164 MsG0780040626.01.T01:CDS 30.0%
! AGCAACTAGGAATTTTTCTA+GGG + Chr7:80300270-80300289 MsG0780040626.01.T01:CDS 30.0%
! ATCAGAGTACTACTTTGATT+AGG + Chr7:80300224-80300243 MsG0780040626.01.T01:CDS 30.0%
! ATGACAATTTTTGTACCCAA+TGG - Chr7:80305035-80305054 None:intergenic 30.0%
! ATTCATTATTGGTTGGTACT+TGG - Chr7:80307039-80307058 None:intergenic 30.0%
! ATTTTCTTCAAGAATGTGTG+TGG + Chr7:80307388-80307407 MsG0780040626.01.T01:intron 30.0%
! CCAAATTTTCATTTTCTCCT+TGG - Chr7:80304254-80304273 None:intergenic 30.0%
! GAAAGTGTGCAAAGTATTTA+GGG - Chr7:80303491-80303510 None:intergenic 30.0%
! GGTTTAGCTTATTTGCATTA+TGG + Chr7:80300622-80300641 MsG0780040626.01.T01:intron 30.0%
! GTAATTTTCTTTGCCTTTTG+CGG + Chr7:80305982-80306001 MsG0780040626.01.T01:intron 30.0%
! GTATCAGTGTCATTCATAAT+TGG + Chr7:80306718-80306737 MsG0780040626.01.T01:CDS 30.0%
! GTATGTGTTTAATTTCTCTG+TGG + Chr7:80305656-80305675 MsG0780040626.01.T01:intron 30.0%
! GTCGTTGGTTAGAAATAATA+GGG + Chr7:80300947-80300966 MsG0780040626.01.T01:CDS 30.0%
! TACATAGGATCGTTTTCAAT+AGG + Chr7:80308403-80308422 MsG0780040626.01.T01:CDS 30.0%
! TATTTGGAGTATCATTATGG+CGG - Chr7:80306318-80306337 None:intergenic 30.0%
! TGAAAGTGTGCAAAGTATTT+AGG - Chr7:80303492-80303511 None:intergenic 30.0%
! TGATATGCAAGAAAGTATGA+TGG - Chr7:80307682-80307701 None:intergenic 30.0%
! TGGTTTCTTCAATTTTCTTG+CGG - Chr7:80303671-80303690 None:intergenic 30.0%
! TTCCTTGAAGTGTTCATATT+TGG + Chr7:80304135-80304154 MsG0780040626.01.T01:intron 30.0%
! TTTTCATTAGTAAGCCTTTG+CGG - Chr7:80303828-80303847 None:intergenic 30.0%
!! AAACGACACTCATTTTGAAA+CGG + Chr7:80303613-80303632 MsG0780040626.01.T01:intron 30.0%
!! AAGAGTTCTAAATGAACCAA+AGG + Chr7:80303977-80303996 MsG0780040626.01.T01:intron 30.0%
!! AATTTTGCTATATGAGGTTG+AGG + Chr7:80302603-80302622 MsG0780040626.01.T01:intron 30.0%
!! ACCTTGTTATTGGTCATATT+TGG - Chr7:80301647-80301666 None:intergenic 30.0%
!! AGTAGTATTTTTGATCTAGC+AGG + Chr7:80307615-80307634 MsG0780040626.01.T01:intron 30.0%
!! ATTGTTTTGTTCCCTATCAA+TGG - Chr7:80305418-80305437 None:intergenic 30.0%
!! CCATTCAATTTTGCTATATG+AGG + Chr7:80302597-80302616 MsG0780040626.01.T01:intron 30.0%
!! CTGTTTTTCGAATTGTTCTT+TGG - Chr7:80299774-80299793 None:intergenic 30.0%
!! GTTAATCTTGTTGCTTTAAG+AGG + Chr7:80300445-80300464 MsG0780040626.01.T01:CDS 30.0%
!! TAAGAGTATCATACATGAAG+TGG - Chr7:80308065-80308084 None:intergenic 30.0%
!! TATGAGAATGGATTGTGAAA+TGG - Chr7:80303048-80303067 None:intergenic 30.0%
!! TATTGACTTCAGTATGAGAA+TGG - Chr7:80303060-80303079 None:intergenic 30.0%
!! TTACCGATTTAATGGAGAAT+GGG + Chr7:80300515-80300534 MsG0780040626.01.T01:CDS 30.0%
!!! GCTTGTTATTTACTTTTCTG+AGG + Chr7:80306255-80306274 MsG0780040626.01.T01:intron 30.0%
!!! GTTATTTTGTTTTTTCAGGC+TGG + Chr7:80305686-80305705 MsG0780040626.01.T01:intron 30.0%
!!! TTCAAAATGAGTGTCGTTTT+AGG - Chr7:80303612-80303631 None:intergenic 30.0%
AAAATTGTCAGAGACCAAAC+TGG + Chr7:80303762-80303781 MsG0780040626.01.T01:intron 35.0%
AAAGTCAAAACTCAAAAGGG+CGG - Chr7:80302760-80302779 None:intergenic 35.0%
AAATCTGCTAGCAATAACTC+GGG + Chr7:80301182-80301201 MsG0780040626.01.T01:CDS 35.0%
AAATTGTCAGAGACCAAACT+GGG + Chr7:80303763-80303782 MsG0780040626.01.T01:intron 35.0%
AACTCAAGAAGCTATTAGGA+AGG + Chr7:80305721-80305740 MsG0780040626.01.T01:CDS 35.0%
AAGATATTTACGCTCACTCA+CGG + Chr7:80307332-80307351 MsG0780040626.01.T01:intron 35.0%
AATAGGACTGAGATTGTGAT+AGG + Chr7:80300175-80300194 MsG0780040626.01.T01:CDS 35.0%
ACTCCCATTCTCCATTAAAT+CGG - Chr7:80300521-80300540 None:intergenic 35.0%
ACTGAGATTGTGATAGGTTT+AGG + Chr7:80300181-80300200 MsG0780040626.01.T01:CDS 35.0%
AGAACGTGCTTCTAATTGTA+AGG + Chr7:80301295-80301314 MsG0780040626.01.T01:CDS 35.0%
AGATGCTGATATATCTGAAG+AGG + Chr7:80307119-80307138 MsG0780040626.01.T01:CDS 35.0%
AGGCTTACTAATGAAAATGG+AGG + Chr7:80303831-80303850 MsG0780040626.01.T01:intron 35.0%
AGGGATAATATAATTGGGAG+TGG + Chr7:80300289-80300308 MsG0780040626.01.T01:CDS 35.0%
AGTGAAGATGGATATCAAAG+AGG + Chr7:80305358-80305377 MsG0780040626.01.T01:intron 35.0%
ATACAATGCAATCCCAAAGT+CGG + Chr7:80301237-80301256 MsG0780040626.01.T01:CDS 35.0%
ATGAAATTAAGCCGACATAC+CGG - Chr7:80301699-80301718 None:intergenic 35.0%
ATGAGTAAAACTAGCATCAC+CGG - Chr7:80300395-80300414 None:intergenic 35.0%
ATGATTGGTGCAATAACAAG+TGG + Chr7:80306056-80306075 MsG0780040626.01.T01:intron 35.0%
ATTGATTATACTAGCAGCCA+AGG - Chr7:80305873-80305892 None:intergenic 35.0%
CACACATAAGTGAAAGAATC+AGG - Chr7:80301957-80301976 None:intergenic 35.0%
CATAGTCATCAATACTACCA+AGG + Chr7:80305308-80305327 MsG0780040626.01.T01:intron 35.0%
CGAAGAACTACTAATTCTGA+TGG - Chr7:80303144-80303163 None:intergenic 35.0%
CTAATTTAGAAGGTCATCAG+AGG + Chr7:80300485-80300504 MsG0780040626.01.T01:CDS 35.0%
CTATATGAGGTTGAGGTAAA+TGG + Chr7:80302610-80302629 MsG0780040626.01.T01:intron 35.0%
CTATTGTAGCCAATGATGTT+GGG - Chr7:80302277-80302296 None:intergenic 35.0%
CTCTTTCTACTGCTGATATT+AGG + Chr7:80308378-80308397 MsG0780040626.01.T01:intron 35.0%
GAAATCTGCTAGCAATAACT+CGG + Chr7:80301181-80301200 MsG0780040626.01.T01:CDS 35.0%
GAAGCTGTAAAGTTCTTAGT+TGG - Chr7:80308178-80308197 None:intergenic 35.0%
GAGCTGGCAAGAATATTATT+AGG + Chr7:80302305-80302324 MsG0780040626.01.T01:intron 35.0%
GATAATATAATTGGGAGTGG+TGG + Chr7:80300292-80300311 MsG0780040626.01.T01:CDS 35.0%
GATGACTCATATGAGTACTA+GGG + Chr7:80300755-80300774 MsG0780040626.01.T01:CDS 35.0%
GCCAAATATGACCAATAACA+AGG + Chr7:80301643-80301662 MsG0780040626.01.T01:intron 35.0%
GGAATAAGAGAACCATTGAT+AGG + Chr7:80305403-80305422 MsG0780040626.01.T01:intron 35.0%
GGCTTACTAATGAAAATGGA+GGG + Chr7:80303832-80303851 MsG0780040626.01.T01:intron 35.0%
GGTTAGAAATAATAGGGCTT+TGG + Chr7:80300953-80300972 MsG0780040626.01.T01:CDS 35.0%
GTAAACGGAGAGATACTTAA+GGG - Chr7:80304871-80304890 None:intergenic 35.0%
GTCTTTATTATTGTGCCTGA+AGG - Chr7:80307202-80307221 None:intergenic 35.0%
TAAAAACTGAAAGTGGGGAA+AGG - Chr7:80308475-80308494 None:intergenic 35.0%
TAAATGCAGTACTCCTTGTT+TGG + Chr7:80306011-80306030 MsG0780040626.01.T01:intron 35.0%
TACACTAGTGTTGTCTATTG+TGG - Chr7:80302851-80302870 None:intergenic 35.0%
TACCAACCAATAATGAATGC+AGG + Chr7:80307041-80307060 MsG0780040626.01.T01:intron 35.0%
TCAGCCTTCGATTATTCATA+GGG + Chr7:80300647-80300666 MsG0780040626.01.T01:intron 35.0%
TCTAATTGTAAGGAAGAGGA+AGG + Chr7:80301305-80301324 MsG0780040626.01.T01:CDS 35.0%
TCTATTGTAGCCAATGATGT+TGG - Chr7:80302278-80302297 None:intergenic 35.0%
TGCTGATATTAGGTCTACAT+AGG + Chr7:80308388-80308407 MsG0780040626.01.T01:intron 35.0%
TGCTTCTAATTGTAAGGAAG+AGG + Chr7:80301301-80301320 MsG0780040626.01.T01:CDS 35.0%
TGCTTCTACTTGTAATGAAG+AGG + Chr7:80301262-80301281 MsG0780040626.01.T01:CDS 35.0%
TTATTACTTACCAGCCATCT+AGG - Chr7:80306954-80306973 None:intergenic 35.0%
TTCATGAGTAGATTGGAGTA+GGG + Chr7:80307541-80307560 MsG0780040626.01.T01:intron 35.0%
TTCCTAATAGCTTCTTGAGT+TGG - Chr7:80305722-80305741 None:intergenic 35.0%
TTCTTGATTACTTGTCCAAC+TGG + Chr7:80302225-80302244 MsG0780040626.01.T01:intron 35.0%
TTGAAACAAATCCAGCACTT+CGG - Chr7:80307310-80307329 None:intergenic 35.0%
! ACTTTTGGATGAGAAGTTTG+AGG + Chr7:80300689-80300708 MsG0780040626.01.T01:CDS 35.0%
! AGGAGTGATGTGTTTAGTTT+CGG + Chr7:80300837-80300856 MsG0780040626.01.T01:CDS 35.0%
! AGGATCGTTTTCAATAGGAA+TGG + Chr7:80308408-80308427 MsG0780040626.01.T01:CDS 35.0%
! ATACCTGATTTAAGGTAGTC+AGG - Chr7:80306575-80306594 None:intergenic 35.0%
! ATTGTGATAGGTTTAGGTTC+GGG + Chr7:80300187-80300206 MsG0780040626.01.T01:CDS 35.0%
! GAAAGAGTATGAAAGAGAAG+GGG + Chr7:80300146-80300165 MsG0780040626.01.T01:CDS 35.0%
! GACCTACAATTCGAAACTTT+TGG + Chr7:80304999-80305018 MsG0780040626.01.T01:intron 35.0%
! GAGAAAGAGTATGAAAGAGA+AGG + Chr7:80300144-80300163 MsG0780040626.01.T01:CDS 35.0%
! GATTGTGATAGGTTTAGGTT+CGG + Chr7:80300186-80300205 MsG0780040626.01.T01:CDS 35.0%
! GCTTTGGATGTTATTGAAGA+TGG + Chr7:80300969-80300988 MsG0780040626.01.T01:CDS 35.0%
! GGATCGTTTTCAATAGGAAT+GGG + Chr7:80308409-80308428 MsG0780040626.01.T01:CDS 35.0%
! GGTCGTTGGTTAGAAATAAT+AGG + Chr7:80300946-80300965 MsG0780040626.01.T01:CDS 35.0%
! GTATATGCTTGATAACCAGT+TGG - Chr7:80301221-80301240 None:intergenic 35.0%
! TAATTATGGGTTAATCCAGG+TGG + Chr7:80302170-80302189 MsG0780040626.01.T01:intron 35.0%
! TACCTGATTTAAGGTAGTCA+GGG - Chr7:80306574-80306593 None:intergenic 35.0%
! TCAAGTGCTTTTGTATTGCA+GGG + Chr7:80306230-80306249 MsG0780040626.01.T01:intron 35.0%
! TCTTGTTTCGATTAGGTATC+TGG + Chr7:80308093-80308112 MsG0780040626.01.T01:intron 35.0%
! TTATGGTTTGCCAGCAATTA+GGG + Chr7:80307565-80307584 MsG0780040626.01.T01:intron 35.0%
! TTTTCACAGATTGTGATCAC+AGG + Chr7:80307942-80307961 MsG0780040626.01.T01:intron 35.0%
!! AAGCGACACTCATTTTGAAA+CGG - Chr7:80303397-80303416 None:intergenic 35.0%
!! AATCATGGTTGAGTTGGATT+CGG - Chr7:80307918-80307937 None:intergenic 35.0%
!! GAACTGAAGTTGCTTTGAAA+AGG + Chr7:80300350-80300369 MsG0780040626.01.T01:CDS 35.0%
!! GTTACCGATTTAATGGAGAA+TGG + Chr7:80300514-80300533 MsG0780040626.01.T01:CDS 35.0%
!! TAATTCTGATGGACTGTTGT+TGG - Chr7:80303133-80303152 None:intergenic 35.0%
!!! AATGGGGGTTTTTTCATTTG+TGG + Chr7:80306411-80306430 MsG0780040626.01.T01:CDS 35.0%
AAACTCATCGGAAAGTGAAG+CGG - Chr7:80299963-80299982 None:intergenic 40.0%
AAGTTTCAACTTTGCTCCAC+GGG - Chr7:80302797-80302816 None:intergenic 40.0%
ACACAGGTTAAGAGTGAAGA+TGG + Chr7:80305346-80305365 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
ACATGTCGAAATTGCTAGAC+TGG + Chr7:80301909-80301928 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
ACCACAAACTGCAATGAATG+TGG - Chr7:80305493-80305512 None:intergenic 40.0%
ACCACATTCATTGCAGTTTG+TGG + Chr7:80305489-80305508 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
ACTAGCAACAGGATATGGAA+TGG + Chr7:80306393-80306412 MsG0780040626.01.T01:CDS 40.0%
AGATCATCATCATCCATGGA+TGG + Chr7:80305458-80305477 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
AGCAGTTGCATTCTATCTCA+AGG + Chr7:80308146-80308165 MsG0780040626.01.T01:CDS 40.0%
AGCGGTGTAAGAACTACAAT+CGG - Chr7:80299933-80299952 None:intergenic 40.0%
AGGAGAAAATTCGATGCAGA+GGG + Chr7:80304282-80304301 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
AGGTAACTGTGTGTTAGTGT+TGG + Chr7:80307154-80307173 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
AGGTGGTCTATGTTTGATGA+TGG + Chr7:80302187-80302206 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
AGTGTCACGTTTATTCACAG+TGG + Chr7:80304487-80304506 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
ATAATTGGGAGTGGTGGTTA+TGG + Chr7:80300298-80300317 MsG0780040626.01.T01:CDS 40.0%
ATACCGGTCAACAAATGAGA+CGG - Chr7:80301683-80301702 None:intergenic 40.0%
ATCAAGCTGGTACAAACTAG+TGG - Chr7:80301430-80301449 None:intergenic 40.0%
ATCATCAAACATAGACCACC+TGG - Chr7:80302188-80302207 None:intergenic 40.0%
ATCTTCACTCTTAACCTGTG+TGG - Chr7:80305347-80305366 None:intergenic 40.0%
CAAGTCTCCCAGCAATAAAA+GGG - Chr7:80301154-80301173 None:intergenic 40.0%
CAAGTTTCAACTTTGCTCCA+CGG - Chr7:80302798-80302817 None:intergenic 40.0%
CAGACGGAGTATAAACATCA+TGG - Chr7:80301813-80301832 None:intergenic 40.0%
CATGAACGTAGTTTAGGTGT+TGG - Chr7:80302680-80302699 None:intergenic 40.0%
CATGATGTTTATACTCCGTC+TGG + Chr7:80301811-80301830 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
CTAGCAACAGGATATGGAAT+GGG + Chr7:80306394-80306413 MsG0780040626.01.T01:CDS 40.0%
CTAGCAGTTCCTATGTTAGT+AGG - Chr7:80299989-80300008 None:intergenic 40.0%
CTCAGCCTTCGATTATTCAT+AGG + Chr7:80300646-80300665 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
CTCCAACTCAAGAAGCTATT+AGG + Chr7:80305717-80305736 MsG0780040626.01.T01:CDS 40.0%
CTGATTTCGTTGGAAGAAAG+GGG + Chr7:80306087-80306106 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
CTTCATGAGTAGATTGGAGT+AGG + Chr7:80307540-80307559 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
CTTCCAACGAAATCAGCAAT+AGG - Chr7:80306083-80306102 None:intergenic 40.0%
CTTCGAAGAAGAAGTTGAGT+TGG + Chr7:80300563-80300582 MsG0780040626.01.T01:CDS 40.0%
GAACTAAGATTGTACCACAC+AGG + Chr7:80305330-80305349 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
GAAGGATCTTAGTCTGTCTT+TGG + Chr7:80305739-80305758 MsG0780040626.01.T01:CDS 40.0%
GAGTTTGGTCCTACTAACAT+AGG + Chr7:80299977-80299996 MsG0780040626.01.T01:CDS 40.0%
GATGATGATCTTTGCTTGCA+TGG - Chr7:80305449-80305468 None:intergenic 40.0%
GATTGTGACTGTGTCTGTAT+AGG - Chr7:80305289-80305308 None:intergenic 40.0%
GCAAAGATCATCATCATCCA+TGG + Chr7:80305454-80305473 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
GCAGCATTACAAATACTTCG+CGG + Chr7:80307093-80307112 MsG0780040626.01.T01:CDS 40.0%
GCATTTAGTCAATCCGCAAA+AGG - Chr7:80305998-80306017 None:intergenic 40.0%
GCTTTGCCTGCATTCATTAT+TGG - Chr7:80307050-80307069 None:intergenic 40.0%
GGAACTGCTAGTTGTTTGTT+TGG + Chr7:80299998-80300017 MsG0780040626.01.T01:CDS 40.0%
GGATATCAAAGAGGATGTGA+AGG + Chr7:80305367-80305386 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
GGATGACTCATATGAGTACT+AGG + Chr7:80300754-80300773 MsG0780040626.01.T01:CDS 40.0%
GGTAAACGGAGAGATACTTA+AGG - Chr7:80304872-80304891 None:intergenic 40.0%
GTGGTACAATCTTAGTTCCT+TGG - Chr7:80305328-80305347 None:intergenic 40.0%
GTTAGTAGGACCAAACTCAT+CGG - Chr7:80299975-80299994 None:intergenic 40.0%
GTTCGACATCAATTCATCCA+TGG - Chr7:80304028-80304047 None:intergenic 40.0%
TAGCAACAGGATATGGAATG+GGG + Chr7:80306395-80306414 MsG0780040626.01.T01:CDS 40.0%
TATCAAAGAGGATGTGAAGG+TGG + Chr7:80305370-80305389 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
TATCTCTCCGTTTACCAAAG+TGG + Chr7:80304876-80304895 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
TATTAAGTGACCTTGCCTTC+AGG + Chr7:80307184-80307203 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
TATTATTGTGCCTGAAGGCA+AGG - Chr7:80307197-80307216 None:intergenic 40.0%
TCAAGTCTCCCAGCAATAAA+AGG - Chr7:80301155-80301174 None:intergenic 40.0%
TCCAGACATGAGATCTAGTT+GGG + Chr7:80304415-80304434 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
TCTAGTTGTAAGGAAGAGGA+AGG + Chr7:80301344-80301363 MsG0780040626.01.T01:CDS 40.0%
TGAAGAGGCAGAAGAAATTC+AGG + Chr7:80307134-80307153 MsG0780040626.01.T01:CDS 40.0%
TGAAGTCTAAAGACCCAGTT+TGG - Chr7:80303779-80303798 None:intergenic 40.0%
TGCCTGCATTCATTATTGGT+TGG - Chr7:80307046-80307065 None:intergenic 40.0%
TGGAACAGTACTTTCATGGA+GGG + Chr7:80306738-80306757 MsG0780040626.01.T01:CDS 40.0%
TGGAAGAAAGGGGTAATTTC+AGG + Chr7:80306097-80306116 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
TGTCCATACAATGCATACTC+AGG - Chr7:80300807-80300826 None:intergenic 40.0%
TTAGGTATCTGGATCAGGAT+TGG + Chr7:80308104-80308123 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
TTCGATTAGGTATCTGGATC+AGG + Chr7:80308099-80308118 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
TTCTTCAAGAATGTGTGTGG+TGG + Chr7:80307391-80307410 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
TTGGAACAGTACTTTCATGG+AGG + Chr7:80306737-80306756 MsG0780040626.01.T01:CDS 40.0%
! AGGCTAAGGTAGCAGATTTT+GGG + Chr7:80300709-80300728 MsG0780040626.01.T01:CDS 40.0%
! AGTTTTCAACGACTACTGGT+GGG + Chr7:80301977-80301996 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
! CCATACCAATATGCCGATTA+CGG - Chr7:80308290-80308309 None:intergenic 40.0%
! CTTATGGTTTGCCAGCAATT+AGG + Chr7:80307564-80307583 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
! GAAACGTGCTTCTAGTTGTA+AGG + Chr7:80301334-80301353 MsG0780040626.01.T01:CDS 40.0%
! GAAGCGCTTACTTATTTGAC+CGG + Chr7:80299887-80299906 MsG0780040626.01.T01:CDS 40.0%
! GCTGATTTCGTTGGAAGAAA+GGG + Chr7:80306086-80306105 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
! GGTGGTCTATGTTTGATGAT+GGG + Chr7:80302188-80302207 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
! GTCAAGTGCTTTTGTATTGC+AGG + Chr7:80306229-80306248 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
! TATGGTTTGCCAGCAATTAG+GGG + Chr7:80307566-80307585 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
! TCATTTGTTGACCGGTATGT+CGG + Chr7:80301685-80301704 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
! TGCTTCTAGTTGTAAGGAAG+AGG + Chr7:80301340-80301359 MsG0780040626.01.T01:CDS 40.0%
! TGGAGGGCTTTAGCTATAAT+CGG + Chr7:80306754-80306773 MsG0780040626.01.T01:CDS 40.0%
! TGTGAGTTTTCAACGACTAC+TGG + Chr7:80301973-80301992 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
! TTCAGGGCAAAAGTGCAAAT+AGG + Chr7:80302041-80302060 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
! TTTGGCTCCATCTTGACATT+TGG + Chr7:80306029-80306048 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
!! AAAGGCGCTTGAAACAAATG+TGG + Chr7:80300890-80300909 MsG0780040626.01.T01:CDS 40.0%
!! ATCATGGTTGAGTTGGATTC+GGG - Chr7:80307917-80307936 None:intergenic 40.0%
!! GTCTATGTTTGATGATGGGT+TGG + Chr7:80302192-80302211 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
!! TAAGGTAGCAGATTTTGGGT+TGG + Chr7:80300713-80300732 MsG0780040626.01.T01:CDS 40.0%
!! TCAAGAATTTCTGGTGTACC+AGG - Chr7:80301005-80301024 None:intergenic 40.0%
!! TGCTGATTTCGTTGGAAGAA+AGG + Chr7:80306085-80306104 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
!! TTGACATTTGGTGCGATGAT+TGG + Chr7:80306041-80306060 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
!!! ACACGTCATTTTTTCCGCAA+AGG + Chr7:80303811-80303830 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
!!! GACACTCATTTTGAAACGGA+GGG + Chr7:80303617-80303636 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
!!! GGGGTTTTTTCATTTGTGGT+TGG + Chr7:80306415-80306434 MsG0780040626.01.T01:intron 40.0%
AACTGAAAGTGGGGAAAGGA+TGG - Chr7:80308471-80308490 None:intergenic 45.0%
AAGTGAAGCGGCGTAAATAG+CGG - Chr7:80299951-80299970 None:intergenic 45.0%
ACAATCGGAGACGTTACTGA+CGG - Chr7:80299918-80299937 None:intergenic 45.0%
ACTGAAAGTGGGGAAAGGAT+GGG - Chr7:80308470-80308489 None:intergenic 45.0%
ACTTGACCTCCCAACATCAT+TGG + Chr7:80302265-80302284 MsG0780040626.01.T01:intron 45.0%
ACTTGCCGTAATCGGCATAT+TGG + Chr7:80308282-80308301 MsG0780040626.01.T01:CDS 45.0%
AGAGCAATCTTCTGACGAAC+CGG - Chr7:80300589-80300608 None:intergenic 45.0%
AGCAACAGGATATGGAATGG+GGG + Chr7:80306396-80306415 MsG0780040626.01.T01:CDS 45.0%
AGGAATGGGAGCAATTCCAT+GGG + Chr7:80308423-80308442 MsG0780040626.01.T01:CDS 45.0%
ATAGGATTTCCTTCTGCGAC+GGG + Chr7:80307813-80307832 MsG0780040626.01.T01:intron 45.0%
ATCATGGCCTCCAGACAAAA+GGG - Chr7:80301797-80301816 None:intergenic 45.0%
ATGAACCTGTTACTCGCACA+AGG - Chr7:80308236-80308255 None:intergenic 45.0%
CACATCCACAGTTATATGCG+AGG + Chr7:80301054-80301073 MsG0780040626.01.T01:CDS 45.0%
CAGATTGTGATCACAGGTGT+TGG + Chr7:80307948-80307967 MsG0780040626.01.T01:intron 45.0%
CAGCAATTAGGGGGAATCAA+TGG + Chr7:80307576-80307595 MsG0780040626.01.T01:intron 45.0%
CATAGGATTTCCTTCTGCGA+CGG + Chr7:80307812-80307831 MsG0780040626.01.T01:intron 45.0%
CATCGCACCAAATGTCAAGA+TGG - Chr7:80306039-80306058 None:intergenic 45.0%
CCGTAATCGGCATATTGGTA+TGG + Chr7:80308287-80308306 MsG0780040626.01.T01:intron 45.0%
CGAGTAACAGGTTCATGAAG+TGG + Chr7:80308240-80308259 MsG0780040626.01.T01:intron 45.0%
CTCCCAGCAATAAAAGGGAT+TGG - Chr7:80301149-80301168 None:intergenic 45.0%
CTCGTTTGAGAAACTTCCCA+AGG + Chr7:80304234-80304253 MsG0780040626.01.T01:intron 45.0%
GAAGGGACCACTTTGGTAAA+CGG - Chr7:80304886-80304905 None:intergenic 45.0%
GACACTTACCAATCCAGACA+TGG - Chr7:80304473-80304492 None:intergenic 45.0%
GACTCATATGAGTACTAGGG+TGG + Chr7:80300758-80300777 MsG0780040626.01.T01:CDS 45.0%
GAGGAGAAAATTCGATGCAG+AGG + Chr7:80304281-80304300 MsG0780040626.01.T01:intron 45.0%
GATATCCTTGTGCGAGTAAC+AGG + Chr7:80308228-80308247 MsG0780040626.01.T01:intron 45.0%
GATATTGGGAGACTAGCAAC+AGG + Chr7:80306382-80306401 MsG0780040626.01.T01:CDS 45.0%
GATTGAAGAGCTTGAAGTGC+AGG - Chr7:80299806-80299825 None:intergenic 45.0%
GCAATTTCTGCTACGAACAC+AGG - Chr7:80306531-80306550 None:intergenic 45.0%
GCGCTTGAAACAAATGTGGA+TGG + Chr7:80300894-80300913 MsG0780040626.01.T01:CDS 45.0%
GCTAGACTGGATATCGTGAT+CGG + Chr7:80301922-80301941 MsG0780040626.01.T01:intron 45.0%
GCTCCTGAGTATGCATTGTA+TGG + Chr7:80300801-80300820 MsG0780040626.01.T01:CDS 45.0%
GCTTCACTTTCCGATGAGTT+TGG + Chr7:80299962-80299981 MsG0780040626.01.T01:CDS 45.0%
GGATCAGGTCGTTAAAATGC+TGG + Chr7:80301085-80301104 MsG0780040626.01.T01:CDS 45.0%
GTAGATTGGAGTAGGGCTTA+TGG + Chr7:80307548-80307567 MsG0780040626.01.T01:intron 45.0%
GTCCAGACATGAGATCTAGT+TGG + Chr7:80304414-80304433 MsG0780040626.01.T01:intron 45.0%
GTCCAGTGCCTTTGGATATT+GGG + Chr7:80306368-80306387 MsG0780040626.01.T01:CDS 45.0%
GTGGTGAAGTAAACCATCCA+TGG - Chr7:80305474-80305493 None:intergenic 45.0%
GTTCGTCAGAAGATTGCTCT+TGG + Chr7:80300589-80300608 MsG0780040626.01.T01:intron 45.0%
GTTGACACAGCTTGAGGATT+AGG - Chr7:80302572-80302591 None:intergenic 45.0%
TAATGAATGCAGGCAAAGCG+AGG + Chr7:80307051-80307070 MsG0780040626.01.T01:intron 45.0%
TAGGAATGGGAGCAATTCCA+TGG + Chr7:80308422-80308441 MsG0780040626.01.T01:CDS 45.0%
TCAGAAGATTGCTCTTGGCA+CGG + Chr7:80300594-80300613 MsG0780040626.01.T01:intron 45.0%
TCATATGAGTACTAGGGTGG+CGG + Chr7:80300761-80300780 MsG0780040626.01.T01:CDS 45.0%
TCATTCCAGAGTCTCCTAGA+TGG + Chr7:80306937-80306956 MsG0780040626.01.T01:CDS 45.0%
TCTCATGTCTGGACTTTGAG+AGG - Chr7:80304408-80304427 None:intergenic 45.0%
TCTTAGTCTGTCTTTGGCAG+AGG + Chr7:80305745-80305764 MsG0780040626.01.T01:CDS 45.0%
TGCCCTGACTACCTTAAATC+AGG + Chr7:80306569-80306588 MsG0780040626.01.T01:CDS 45.0%
TGTATGGACAGTTGACAGAG+AGG + Chr7:80300817-80300836 MsG0780040626.01.T01:CDS 45.0%
TGTCAAGATGGAGCCAAACA+AGG - Chr7:80306027-80306046 None:intergenic 45.0%
TGTGAAGGTGGCAATCAGAA+AGG + Chr7:80305382-80305401 MsG0780040626.01.T01:intron 45.0%
TGTTGTTGGTCGTGACAATG+TGG - Chr7:80303119-80303138 None:intergenic 45.0%
TTAACGACCTGATCCATCGT+TGG - Chr7:80301080-80301099 None:intergenic 45.0%
TTACCAAAAGTAGGGGCTTC+CGG - Chr7:80307998-80308017 None:intergenic 45.0%
TTGTAGCCAATGATGTTGGG+AGG - Chr7:80302274-80302293 None:intergenic 45.0%
TTTATAGGGTCCAGTGCCTT+TGG + Chr7:80306360-80306379 MsG0780040626.01.T01:intron 45.0%
TTTGAACATCACCAAACCCG+TGG + Chr7:80302778-80302797 MsG0780040626.01.T01:intron 45.0%
! AGGACGCGCAAAAGATTTTG+TGG + Chr7:80307071-80307090 MsG0780040626.01.T01:CDS 45.0%
! AGGCCAATCCCTTTTATTGC+TGG + Chr7:80301143-80301162 MsG0780040626.01.T01:CDS 45.0%
! AGTGCTTTTGTATTGCAGGG+TGG + Chr7:80306233-80306252 MsG0780040626.01.T01:intron 45.0%
! ATGCCGTCTCATTTGTTGAC+CGG + Chr7:80301677-80301696 MsG0780040626.01.T01:intron 45.0%
! ATGGTTTGCCAGCAATTAGG+GGG + Chr7:80307567-80307586 MsG0780040626.01.T01:intron 45.0%
! GAGGCTAAGGTAGCAGATTT+TGG + Chr7:80300708-80300727 MsG0780040626.01.T01:CDS 45.0%
! GAGTTTTCAACGACTACTGG+TGG + Chr7:80301976-80301995 MsG0780040626.01.T01:intron 45.0%
! GATAGGTTTAGGTTCGGGTT+TGG + Chr7:80300192-80300211 MsG0780040626.01.T01:CDS 45.0%
! GCTAGTCTCCCAATATCCAA+AGG - Chr7:80306379-80306398 None:intergenic 45.0%
! GGATGAGAAGTTTGAGGCTA+AGG + Chr7:80300695-80300714 MsG0780040626.01.T01:CDS 45.0%
! GGCCAATCCCTTTTATTGCT+GGG + Chr7:80301144-80301163 MsG0780040626.01.T01:CDS 45.0%
! GGGTACACTGTATGATAGTG+AGG + Chr7:80304302-80304321 MsG0780040626.01.T01:intron 45.0%
! TGTGTTGCAACCCTTTTGTC+TGG + Chr7:80301784-80301803 MsG0780040626.01.T01:intron 45.0%
! TTGCTTCTCGAGCTTTTGAG+TGG + Chr7:80300864-80300883 MsG0780040626.01.T01:CDS 45.0%
!! AAAGGCACTGGACCCTATAA+AGG - Chr7:80306361-80306380 None:intergenic 45.0%
!! AAGGCACTGGACCCTATAAA+GGG - Chr7:80306360-80306379 None:intergenic 45.0%
!! AATGTGTGTGGTGGACTACT+AGG + Chr7:80307400-80307419 MsG0780040626.01.T01:intron 45.0%
!! ATTGGCCTTTCCACTACTGA+TGG - Chr7:80301131-80301150 None:intergenic 45.0%
!! ATTTCTGGTGTACCAGGTTC+TGG - Chr7:80300999-80301018 None:intergenic 45.0%
!! CATTGATTCCCCCTAATTGC+TGG - Chr7:80307578-80307597 None:intergenic 45.0%
!! CGAGCTTTTGAGTGGAAGAA+AGG + Chr7:80300872-80300891 MsG0780040626.01.T01:CDS 45.0%
!! GAAGAAGAAGTTGAGTTGGC+CGG + Chr7:80300567-80300586 MsG0780040626.01.T01:CDS 45.0%
!! GGACCTATTGCTGATTTCGT+TGG + Chr7:80306077-80306096 MsG0780040626.01.T01:intron 45.0%
!! TCATGGTTGAGTTGGATTCG+GGG - Chr7:80307916-80307935 None:intergenic 45.0%
!!! CGACACTCATTTTGAAACGG+AGG + Chr7:80303616-80303635 MsG0780040626.01.T01:intron 45.0%
!! AATTTAATAATTAAAAATCA+TGG + Chr7:80304333-80304352 MsG0780040626.01.T01:intron 5.0%
!!! AAAATCTAATATATTTTTTT+TGG - Chr7:80302460-80302479 None:intergenic 5.0%
!!! ATATGTAAAAATATTTTTAT+TGG - Chr7:80304646-80304665 None:intergenic 5.0%
AATGCCAGCCATGTCTGGAT+TGG + Chr7:80304462-80304481 MsG0780040626.01.T01:intron 50.0%
ACAGGTTCATGAAGTGGCTG+TGG + Chr7:80308246-80308265 MsG0780040626.01.T01:intron 50.0%
ACCCACTGCATTCAGTGACT+TGG + Chr7:80300920-80300939 MsG0780040626.01.T01:CDS 50.0%
AGCCAAGTCACTGAATGCAG+TGG - Chr7:80300925-80300944 None:intergenic 50.0%
AGTCACTGAATGCAGTGGGT+TGG - Chr7:80300920-80300939 None:intergenic 50.0%
ATTATACTCCCCGTCGCAGA+AGG - Chr7:80307825-80307844 None:intergenic 50.0%
ATTGCGCCAAAAGAACTCCG+AGG + Chr7:80306546-80306565 MsG0780040626.01.T01:CDS 50.0%
CAGGTTCATGAAGTGGCTGT+GGG + Chr7:80308247-80308266 MsG0780040626.01.T01:intron 50.0%
CATATGAGTACTAGGGTGGC+GGG + Chr7:80300762-80300781 MsG0780040626.01.T01:CDS 50.0%
CATCATGGCCTCCAGACAAA+AGG - Chr7:80301798-80301817 None:intergenic 50.0%
CCAAAAATGCCAGCCATGTC+TGG + Chr7:80304457-80304476 MsG0780040626.01.T01:intron 50.0%
CTCATATGAGTCATCCCCTC+CGG - Chr7:80300750-80300769 None:intergenic 50.0%
CTGAAAGTGGGGAAAGGATG+GGG - Chr7:80308469-80308488 None:intergenic 50.0%
CTTACCAATCCAGACATGGC+TGG - Chr7:80304469-80304488 None:intergenic 50.0%
GACGTTACTGACGGTTACTC+CGG - Chr7:80299909-80299928 None:intergenic 50.0%
GCAACACAGCAGTGGGAATA+AGG - Chr7:80306902-80306921 None:intergenic 50.0%
GCCAAGTCACTGAATGCAGT+GGG - Chr7:80300924-80300943 None:intergenic 50.0%
GCCCAACTAGATCTCATGTC+TGG - Chr7:80304419-80304438 None:intergenic 50.0%
GCTCTTGTTGACACAGCTTG+AGG - Chr7:80302578-80302597 None:intergenic 50.0%
GGGAGACTAGCAACAGGATA+TGG + Chr7:80306388-80306407 MsG0780040626.01.T01:CDS 50.0%
GGTCCAGTGCCTTTGGATAT+TGG + Chr7:80306367-80306386 MsG0780040626.01.T01:CDS 50.0%
GTTATATGCGAGGCCAACGA+TGG + Chr7:80301064-80301083 MsG0780040626.01.T01:CDS 50.0%
TAGGATTTCCTTCTGCGACG+GGG + Chr7:80307814-80307833 MsG0780040626.01.T01:intron 50.0%
TCAACTTTGCTCCACGGGTT+TGG - Chr7:80302792-80302811 None:intergenic 50.0%
TGAAAGTGGGGAAAGGATGG+GGG - Chr7:80308468-80308487 None:intergenic 50.0%
TGAAGCAGTGCCATCAGTAG+TGG + Chr7:80301118-80301137 MsG0780040626.01.T01:CDS 50.0%
TTGGCGAAGTTCAATCCGGA+GGG + Chr7:80300732-80300751 MsG0780040626.01.T01:CDS 50.0%
! CAGTGCCATCAGTAGTGGAA+AGG + Chr7:80301123-80301142 MsG0780040626.01.T01:CDS 50.0%
! CATAACGGAAGGGACCACTT+TGG - Chr7:80304893-80304912 None:intergenic 50.0%
! CCAGACATGGCTGGCATTTT+TGG - Chr7:80304460-80304479 None:intergenic 50.0%
! CTCCCAATATCCAAAGGCAC+TGG - Chr7:80306373-80306392 None:intergenic 50.0%
! CTGCATTCAGTGACTTGGCT+TGG + Chr7:80300925-80300944 MsG0780040626.01.T01:CDS 50.0%
! GTAAGCGCTTCAGAGCGTTT+AGG - Chr7:80299878-80299897 None:intergenic 50.0%
! GTCTGGACTTTGAGAGGACA+AGG - Chr7:80304402-80304421 None:intergenic 50.0%
! GTTGCAACCCTTTTGTCTGG+AGG + Chr7:80301787-80301806 MsG0780040626.01.T01:intron 50.0%
! GTTGGCCTCGCATATAACTG+TGG - Chr7:80301062-80301081 None:intergenic 50.0%
! TGGACTACTAGGTTGAGAGG+TGG + Chr7:80307411-80307430 MsG0780040626.01.T01:intron 50.0%
! TTAAGGTAGTCAGGGCACCT+CGG - Chr7:80306566-80306585 None:intergenic 50.0%
!! AAGTAGAAGCACGCCGACTT+TGG - Chr7:80301253-80301272 None:intergenic 50.0%
!! AGTAGAAGCACGCCGACTTT+GGG - Chr7:80301252-80301271 None:intergenic 50.0%
!! CATGGTTGAGTTGGATTCGG+GGG - Chr7:80307915-80307934 None:intergenic 50.0%
!! TCTGGATCAGGATTGGTTGC+AGG + Chr7:80308111-80308130 MsG0780040626.01.T01:CDS 50.0%
!! TGGGTTGGCGAAGTTCAATC+CGG + Chr7:80300728-80300747 MsG0780040626.01.T01:CDS 50.0%
!! TGGTGGACTACTAGGTTGAG+AGG + Chr7:80307408-80307427 MsG0780040626.01.T01:intron 50.0%
ACCAGCCATCTAGGAGACTC+TGG - Chr7:80306945-80306964 None:intergenic 55.0%
ACCCAGAAGCAACACAGCAG+TGG - Chr7:80306910-80306929 None:intergenic 55.0%
ACCTCGGACATCACAACCCA+TGG - Chr7:80308442-80308461 None:intergenic 55.0%
AGATTGCTCTTGGCACGGCT+AGG + Chr7:80300599-80300618 MsG0780040626.01.T01:intron 55.0%
AGCTCGCAAAACCGAAGTGC+TGG + Chr7:80307296-80307315 MsG0780040626.01.T01:intron 55.0%
AGGAAGGTAGCTCAGAACGC+AGG + Chr7:80301360-80301379 MsG0780040626.01.T01:CDS 55.0%
ATTGCTCTTGGCACGGCTAG+GGG + Chr7:80300601-80300620 MsG0780040626.01.T01:intron 55.0%
CCCAGAAGCAACACAGCAGT+GGG - Chr7:80306909-80306928 None:intergenic 55.0%
CCCTCATAGATAGAGCAGGC+CGG + Chr7:80307976-80307995 MsG0780040626.01.T01:CDS 55.0%
CCGGCCTGCTCTATCTATGA+GGG - Chr7:80307979-80307998 None:intergenic 55.0%
CGTATCTGTCACTGCCACAC+AGG + Chr7:80307252-80307271 MsG0780040626.01.T01:intron 55.0%
GAAGATGGCATGCCAGAACC+TGG + Chr7:80300984-80301003 MsG0780040626.01.T01:CDS 55.0%
GATTGCTCTTGGCACGGCTA+GGG + Chr7:80300600-80300619 MsG0780040626.01.T01:intron 55.0%
GCAGCCCTCATAGATAGAGC+AGG + Chr7:80307972-80307991 MsG0780040626.01.T01:CDS 55.0%
GTCCCAGCACTTGCCGTAAT+CGG + Chr7:80308274-80308293 MsG0780040626.01.T01:CDS 55.0%
GTTGGCGAAGTTCAATCCGG+AGG + Chr7:80300731-80300750 MsG0780040626.01.T01:CDS 55.0%
TCCAGAGTCTCCTAGATGGC+TGG + Chr7:80306941-80306960 MsG0780040626.01.T01:CDS 55.0%
TCCGGCCTGCTCTATCTATG+AGG - Chr7:80307980-80307999 None:intergenic 55.0%
TGGCGAAGTTCAATCCGGAG+GGG + Chr7:80300733-80300752 MsG0780040626.01.T01:CDS 55.0%
! ATGCCGATTACGGCAAGTGC+TGG - Chr7:80308280-80308299 None:intergenic 55.0%
! TCCATGGGTTGTGATGTCCG+AGG + Chr7:80308438-80308457 MsG0780040626.01.T01:CDS 55.0%
! TGCCGATTACGGCAAGTGCT+GGG - Chr7:80308279-80308298 None:intergenic 55.0%
!! ACTAGGGTGGCGGGAACTAT+GGG + Chr7:80300771-80300790 MsG0780040626.01.T01:CDS 55.0%
!! AGGGCACCTCGGAGTTCTTT+TGG - Chr7:80306555-80306574 None:intergenic 55.0%
!! CAGTGACTTGGCTTGGTCGT+TGG + Chr7:80300932-80300951 MsG0780040626.01.T01:CDS 55.0%
!! CCCACTGCTGTGTTGCTTCT+GGG + Chr7:80306906-80306925 MsG0780040626.01.T01:CDS 55.0%
!! GAAAGGATGGGGGAGTACCT+CGG - Chr7:80308458-80308477 None:intergenic 55.0%
!! TACTAGGGTGGCGGGAACTA+TGG + Chr7:80300770-80300789 MsG0780040626.01.T01:CDS 55.0%
!! TCCCACTGCTGTGTTGCTTC+TGG + Chr7:80306905-80306924 MsG0780040626.01.T01:CDS 55.0%
GGTCAGCTCTGCAGTCCAAC+TGG + Chr7:80301203-80301222 MsG0780040626.01.T01:CDS 60.0%
TGCGAGGCCAACGATGGATC+AGG + Chr7:80301070-80301089 MsG0780040626.01.T01:CDS 60.0%
! AGGCCGGAAGCCCCTACTTT+TGG + Chr7:80307992-80308011 MsG0780040626.01.T01:CDS 60.0%
!! CTAGGGTGGCGGGAACTATG+GGG + Chr7:80300772-80300791 MsG0780040626.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 80299758 80308495 80299758 ID=MsG0780040626.01;Name=MsG0780040626.01
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Chr7 exon 80299758 80300588 80299758 ID=MsG0780040626.01.T01:exon:639;Parent=MsG0780040626.01.T01
Chr7 exon 80300651 80301385 80300651 ID=MsG0780040626.01.T01:exon:640;Parent=MsG0780040626.01.T01
Chr7 exon 80305704 80305766 80305704 ID=MsG0780040626.01.T01:exon:641;Parent=MsG0780040626.01.T01
Chr7 exon 80306367 80306432 80306367 ID=MsG0780040626.01.T01:exon:642;Parent=MsG0780040626.01.T01
Chr7 exon 80306525 80306590 80306525 ID=MsG0780040626.01.T01:exon:643;Parent=MsG0780040626.01.T01
Chr7 exon 80306700 80306775 80306700 ID=MsG0780040626.01.T01:exon:644;Parent=MsG0780040626.01.T01
Chr7 exon 80306898 80306962 80306898 ID=MsG0780040626.01.T01:exon:645;Parent=MsG0780040626.01.T01
Chr7 exon 80307063 80307155 80307063 ID=MsG0780040626.01.T01:exon:646;Parent=MsG0780040626.01.T01
Chr7 exon 80307951 80308013 80307951 ID=MsG0780040626.01.T01:exon:647;Parent=MsG0780040626.01.T01
Chr7 exon 80308108 80308167 80308108 ID=MsG0780040626.01.T01:exon:648;Parent=MsG0780040626.01.T01
Chr7 exon 80308250 80308303 80308250 ID=MsG0780040626.01.T01:exon:649;Parent=MsG0780040626.01.T01
Chr7 exon 80308400 80308495 80308400 ID=MsG0780040626.01.T01:exon:650;Parent=MsG0780040626.01.T01
Chr7 CDS 80299758 80300588 80299758 ID=MsG0780040626.01.T01:cds;Parent=MsG0780040626.01.T01
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Gene Sequence

>MsG0780040626.01.T01

ATGAACATCACAACCAAAGAACAATTCGAAAAACAGCTTTCTAAACCTGCACTTCAAGCTCTTCAATCGAATTGTAACGTTTCTTTTGAGAGAAACGATGCTTGTGCTCTCTGCACACCTAAACGCTCTGAAGCGCTTACTTATTTGACCGGAGTAACCGTCAGTAACGTCTCCGATTGTAGTTCTTACACCGCTATTTACGCCGCTTCACTTTCCGATGAGTTTGGTCCTACTAACATAGGAACTGCTAGTTGTTTGTTTGGTCTTGATTTTTCTTCTTCGTCGAAATCCAGTAACAAGAATCGAAAACTTGTTATTGCGCTTGTTACAGTTTTTACTTTTTTAGGATTGTTGTTTTTTGTTGGATTTTGGATTTTTGTTAAACGGAGAAAGAGTATGAAAGAGAAGGGGAATTATAATAGGACTGAGATTGTGATAGGTTTAGGTTCGGGTTTGGATAAGATGAATCAGAGTACTACTTTGATTAGGTTTAATTTTGATGAGATTAAGAAAGCAACTAGGAATTTTTCTAGGGATAATATAATTGGGAGTGGTGGTTATGGAAATGTTTATAAAGGTTTGTTGAATGATGGAACTGAAGTTGCTTTGAAAAGGTTTAAGAATTGTTCTGTTGCCGGTGATGCTAGTTTTACTCATGAAGTTGAAGTTATTGCTAGTGTTAGGCATGTTAATCTTGTTGCTTTAAGAGGTTATTGTACTGCTACTACTAATTTAGAAGGTCATCAGAGGATTATTGTTACCGATTTAATGGAGAATGGGAGTCTTTATGATCATTTATTTGGTTCTTCGAAGAAGAAGTTGAGTTGGCCGCCTTCGATTATTCATAGGGATATTAAAGCTAGTAATATACTTTTGGATGAGAAGTTTGAGGCTAAGGTAGCAGATTTTGGGTTGGCGAAGTTCAATCCGGAGGGGATGACTCATATGAGTACTAGGGTGGCGGGAACTATGGGGTATGTTGCTCCTGAGTATGCATTGTATGGACAGTTGACAGAGAGGAGTGATGTGTTTAGTTTCGGTGTTTTGCTTCTCGAGCTTTTGAGTGGAAGAAAGGCGCTTGAAACAAATGTGGATGGCCAACCCACTGCATTCAGTGACTTGGCTTGGTCGTTGGTTAGAAATAATAGGGCTTTGGATGTTATTGAAGATGGCATGCCAGAACCTGGTACACCAGAAATTCTTGAGAAGTATGTGTTGGTTGCTGTTTTATGTTCACATCCACAGTTATATGCGAGGCCAACGATGGATCAGGTCGTTAAAATGCTGGAGACAGATGATGAAGCAGTGCCATCAGTAGTGGAAAGGCCAATCCCTTTTATTGCTGGGAGACTTGATATCGAGAAATCTGCTAGCAATAACTCGGGTCAGCTCTGCAGTCCAACTGGTTATCAAGCATATACAATGCAATCCCAAAGTCGGCGTGCTTCTACTTGTAATGAAGAGGAAGAAAACTCAGAACGTGCTTCTAATTGTAAGGAAGAGGAAGGAAACTCGAAACGTGCTTCTAGTTGTAAGGAAGAGGAAGGTAGCTCAGAACGCAGGTCTGCTGGATATTCATCTCCAACTCAAGAAGCTATTAGGAAGGATCTTAGTCTGTCTTTGGCAGAGGGTCCAGTGCCTTTGGATATTGGGAGACTAGCAACAGGATATGGAATGGGGGTTTTTTCATTTGTGGTTCCTGTGTTCGTAGCAGAAATTGCGCCAAAAGAACTCCGAGGTGCCCTGACTACCTTAAATCAGTTCATGATTGTTACTGCTGTATCAGTGTCATTCATAATTGGAACAGTACTTTCATGGAGGGCTTTAGCTATAATCGGCCTTATTCCCACTGCTGTGTTGCTTCTGGGTCTGTTTTTCATTCCAGAGTCTCCTAGATGGCTGGCAAAGCGAGGACGCGCAAAAGATTTTGTGGCAGCATTACAAATACTTCGCGGTAAAGATGCTGATATATCTGAAGAGGCAGAAGAAATTCAGATTGTGATCACAGGTGTTGGAGCAGCCCTCATAGATAGAGCAGGCCGGAAGCCCCTACTTTTGGTATCTGGATCAGGATTGGTTGCAGGATGTATATTTACAGCAGTTGCATTCTATCTCAAGGTTCATGAAGTGGCTGTGGGAGCAGTCCCAGCACTTGCCGTAATCGGCATATTGGTCTACATAGGATCGTTTTCAATAGGAATGGGAGCAATTCCATGGGTTGTGATGTCCGAGGTACTCCCCCATCCTTTCCCCACTTTCAGTTTTTAA
Protein sequence

>MsG0780040626.01.T01

MNITTKEQFEKQLSKPALQALQSNCNVSFERNDACALCTPKRSEALTYLTGVTVSNVSDCSSYTAIYAASLSDEFGPTNIGTASCLFGLDFSSSSKSSNKNRKLVIALVTVFTFLGLLFFVGFWIFVKRRKSMKEKGNYNRTEIVIGLGSGLDKMNQSTTLIRFNFDEIKKATRNFSRDNIIGSGGYGNVYKGLLNDGTEVALKRFKNCSVAGDASFTHEVEVIASVRHVNLVALRGYCTATTNLEGHQRIIVTDLMENGSLYDHLFGSSKKKLSWPPSIIHRDIKASNILLDEKFEAKVADFGLAKFNPEGMTHMSTRVAGTMGYVAPEYALYGQLTERSDVFSFGVLLLELLSGRKALETNVDGQPTAFSDLAWSLVRNNRALDVIEDGMPEPGTPEILEKYVLVAVLCSHPQLYARPTMDQVVKMLETDDEAVPSVVERPIPFIAGRLDIEKSASNNSGQLCSPTGYQAYTMQSQSRRASTCNEEEENSERASNCKEEEGNSKRASSCKEEEGSSERRSAGYSSPTQEAIRKDLSLSLAEGPVPLDIGRLATGYGMGVFSFVVPVFVAEIAPKELRGALTTLNQFMIVTAVSVSFIIGTVLSWRALAIIGLIPTAVLLLGLFFIPESPRWLAKRGRAKDFVAALQILRGKDADISEEAEEIQIVITGVGAALIDRAGRKPLLLVSGSGLVAGCIFTAVAFYLKVHEVAVGAVPALAVIGILVYIGSFSIGMGAIPWVVMSEVLPHPFPTFSF*