AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780041023.01

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MsG0780041023.01.T01 AT1G07250 29.184 490 312 16 10 486 7 474 1.02e-51 183
MsG0780041023.01.T01 AT1G22360 29.825 513 284 18 7 485 8 478 1.40e-51 182
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MsG0780041023.01.T01 AT4G15280 30.375 507 299 14 4 486 31 507 8.94e-50 178
MsG0780041023.01.T01 AT2G29740 30.159 504 295 17 4 484 5 474 5.22e-49 176
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MsG0780041023.01.T01 AT3G16520 33.010 309 180 9 179 483 173 458 3.36e-48 173
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MsG0780041023.01.T01 AT1G01420 27.859 481 298 13 9 473 8 455 4.34e-48 173
MsG0780041023.01.T01 AT2G30140 28.687 495 286 19 9 488 13 455 5.03e-48 172
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MsG0780041023.01.T01 AT2G30140 28.659 492 289 18 9 488 13 454 5.04e-47 169
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MsG0780041023.01.T01 AT3G21780 28.827 503 301 17 7 486 2 470 3.81e-46 168
MsG0780041023.01.T01 AT2G29710 25.859 495 311 18 10 485 6 463 6.36e-46 167
MsG0780041023.01.T01 AT4G15550 29.116 498 300 18 6 485 12 474 6.74e-46 167
MsG0780041023.01.T01 AT1G22340 28.101 516 296 17 7 488 11 485 1.03e-45 167
MsG0780041023.01.T01 AT3G16520 33.673 294 164 9 179 468 173 439 1.47e-45 166
MsG0780041023.01.T01 AT3G16520 33.673 294 164 9 179 468 173 439 1.67e-45 166
MsG0780041023.01.T01 AT2G18570 27.586 493 299 16 9 480 5 460 1.97e-45 166
MsG0780041023.01.T01 AT5G05880 27.383 493 291 16 8 484 7 448 5.19e-45 164
MsG0780041023.01.T01 AT5G26310 27.255 499 292 19 7 477 5 460 6.00e-45 164
MsG0780041023.01.T01 AT1G24100 29.903 515 277 20 1 486 1 460 7.02e-45 164
MsG0780041023.01.T01 AT5G05870 27.328 494 290 17 11 484 10 454 1.74e-44 163
MsG0780041023.01.T01 AT3G50740 28.169 497 298 17 7 478 5 467 2.75e-44 163
MsG0780041023.01.T01 AT3G21790 27.326 516 302 18 7 486 2 480 4.18e-44 162
MsG0780041023.01.T01 AT1G05560 29.508 488 291 17 9 484 5 451 4.55e-44 162
MsG0780041023.01.T01 AT1G05560 29.508 488 291 17 9 484 55 501 5.92e-44 162
MsG0780041023.01.T01 AT5G59580 26.477 491 306 15 7 488 7 451 6.10e-43 158
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MsG0780041023.01.T01 AT4G14090 30.382 497 269 21 9 483 13 454 9.16e-42 155
MsG0780041023.01.T01 AT1G22370 29.953 424 265 15 7 414 11 418 1.04e-41 155
MsG0780041023.01.T01 AT5G49690 28.606 416 237 13 8 403 9 384 1.64e-41 155
MsG0780041023.01.T01 AT5G66690 27.439 492 300 20 7 477 5 460 3.35e-41 154
MsG0780041023.01.T01 AT1G05675 28.099 484 297 16 9 481 6 449 5.17e-41 153
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MsG0780041023.01.T01 AT1G01390 28.302 477 270 15 9 445 25 469 2.87e-40 152
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MsG0780041023.01.T01 AT5G54060 23.241 469 307 16 2 455 6 436 6.03e-20 92.8
MsG0780041023.01.T01 AT2G22930 22.998 487 317 16 5 484 2 437 7.49e-19 89.4
MsG0780041023.01.T01 AT4G09500 31.461 178 110 3 271 448 214 379 2.85e-17 84.3
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Find 96 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 121 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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CTAGCTACGTGAATTGTATA+TGG 0.281830 7:-85625136 None:intergenic
GCTTGCTATGATGGCTAAAA+AGG 0.282014 7:+85626122 MsG0780041023.01.T01:CDS
CAAAGTGGAGCTTTGGATCT+TGG 0.300571 7:-85624757 None:intergenic
CCTTAGTAACACTGATTACT+TGG 0.309401 7:+85625498 MsG0780041023.01.T01:CDS
AATGACAAAGTTTGGTGTAT+TGG 0.320576 7:+85625466 MsG0780041023.01.T01:CDS
GGAACAATTTAGTAGTGATT+TGG 0.321905 7:+85625354 MsG0780041023.01.T01:CDS
ACAGACAGGAATAGGATTAA+AGG 0.322823 7:+85625321 MsG0780041023.01.T01:CDS
TCTCTTAAAACCCAAATAAA+AGG 0.326741 7:-85625694 None:intergenic
AAGAGGAATAGAGAGGTTAA+TGG 0.329634 7:+85626056 MsG0780041023.01.T01:CDS
TAAATGTTGGTGTGAAAATT+GGG 0.334829 7:+85625968 MsG0780041023.01.T01:CDS
TTATATTCCTTTGCATATGC+TGG 0.344408 7:-85625433 None:intergenic
TCTTCTTCACCCCATTTCAT+TGG 0.347577 7:-85626000 None:intergenic
TGATTTGGCTCAAGCTGAAA+TGG 0.362012 7:+85625369 MsG0780041023.01.T01:CDS
AACATTGCACAGACAGGAAT+AGG 0.368421 7:+85625313 MsG0780041023.01.T01:CDS
AATATTCCAAGAATTTCTTT+TGG 0.372088 7:+85625166 MsG0780041023.01.T01:CDS
AAAGTGGAGCTTTGGATCTT+GGG 0.372282 7:-85624756 None:intergenic
GATGGACATAGCCAAAATAT+TGG 0.372570 7:+85624820 MsG0780041023.01.T01:CDS
CTTTGTGTTGTTTCCAATGA+TGG 0.373283 7:+85624775 MsG0780041023.01.T01:CDS
TCAAGATTCTCACACCCTTC+TGG 0.375312 7:-85624986 None:intergenic
CAAGCTGAAATGGGTACTTA+TGG 0.375502 7:+85625379 MsG0780041023.01.T01:CDS
ATATTGTCGCATTATGCAAT+TGG 0.388659 7:+85625823 MsG0780041023.01.T01:CDS
TAAAGTTTCAATTGATGAAT+GGG 0.396430 7:+85625546 MsG0780041023.01.T01:CDS
CCAAGTAATCAGTGTTACTA+AGG 0.402690 7:-85625498 None:intergenic
AACAACACAAAGTGGAGCTT+TGG 0.402923 7:-85624764 None:intergenic
GGGTGAAGAGTCCAATGAAA+TGG 0.404012 7:+85625989 MsG0780041023.01.T01:CDS
CTAGCACGTTATGTTGAATC+TGG 0.411106 7:+85624911 MsG0780041023.01.T01:CDS
AATGTAAAGAAAGAAGAAAA+AGG 0.418337 7:+85626091 MsG0780041023.01.T01:CDS
GTTGTACAAATATTAAATGT+TGG 0.418685 7:+85625955 MsG0780041023.01.T01:CDS
ATAAAGTTTCAATTGATGAA+TGG 0.432715 7:+85625545 MsG0780041023.01.T01:CDS
TCGGATGTTGTATTTCTGTT+TGG 0.451925 7:-85624698 None:intergenic
TGATGAATTGAAGAAATTTG+TGG 0.452603 7:-85625032 None:intergenic
AGGATTAAAGGGTGAAGCTT+GGG 0.453474 7:+85625333 MsG0780041023.01.T01:CDS
TTCAAATTCATTATTAGCCA+TGG 0.456468 7:-85625251 None:intergenic
GATTAGAGAGCTTGCTATGA+TGG 0.458657 7:+85626113 MsG0780041023.01.T01:CDS
CCACTACAGTTGATAGAGCT+TGG 0.466495 7:+85625646 MsG0780041023.01.T01:CDS
AGGCCTAGTGATTAAGGGTT+GGG 0.467439 7:+85625786 MsG0780041023.01.T01:CDS
CAGACAGGAATAGGATTAAA+GGG 0.467672 7:+85625322 MsG0780041023.01.T01:CDS
CAATTTCCATGTAAAGAGAC+TGG 0.470766 7:+85624959 MsG0780041023.01.T01:CDS
GATTCTTAACACATTGTGGT+TGG 0.471225 7:+85625848 MsG0780041023.01.T01:CDS
GGTGAAGAGTCCAATGAAAT+GGG 0.476421 7:+85625990 MsG0780041023.01.T01:CDS
GGATGGTGTGTTGGTAAAGA+AGG 0.480781 7:+85626023 MsG0780041023.01.T01:CDS
ATGTGACCTTGTGCCATCAT+TGG 0.483747 7:-85624788 None:intergenic
GGTAATCCAGTCTCTTTACA+TGG 0.489129 7:-85624965 None:intergenic
TAGGATTAAAGGGTGAAGCT+TGG 0.489818 7:+85625332 MsG0780041023.01.T01:CDS
GATAGAGGCCTAGTGATTAA+GGG 0.493102 7:+85625781 MsG0780041023.01.T01:CDS
AAGAAGGAAGATATTGAAAG+AGG 0.502783 7:+85626039 MsG0780041023.01.T01:CDS
CTGGTGTGCCAATGGTTACA+TGG 0.505452 7:+85625896 MsG0780041023.01.T01:CDS
TTTGAATACTTTGATGTGCC+TGG 0.506430 7:+85625268 MsG0780041023.01.T01:CDS
TTGTCGCATTATGCAATTGG+AGG 0.506463 7:+85625826 MsG0780041023.01.T01:CDS
TCAGTGTTACTAAGGGATAC+AGG 0.519098 7:-85625490 None:intergenic
GAGGAAAGAATCAATGATAG+AGG 0.520836 7:+85625766 MsG0780041023.01.T01:CDS
GAAATTAACATTGCACAGAC+AGG 0.525226 7:+85625307 MsG0780041023.01.T01:CDS
GATTGATGAAAGTGGATTTG+AGG 0.525368 7:+85625747 MsG0780041023.01.T01:CDS
AGTGTTCTCTATGCATGCCT+TGG 0.527566 7:+85625604 MsG0780041023.01.T01:CDS
CTTGACATGCTACCTTCACT+TGG 0.527884 7:+85625004 MsG0780041023.01.T01:CDS
GATTTGGCTCAAGCTGAAAT+GGG 0.529270 7:+85625370 MsG0780041023.01.T01:CDS
TGAAGAAGAGGATGGTGTGT+TGG 0.537235 7:+85626014 MsG0780041023.01.T01:CDS
AGGTCACATGATCCCAATGA+TGG 0.550503 7:+85624802 MsG0780041023.01.T01:CDS
CAAGTAATCAGTGTTACTAA+GGG 0.553879 7:-85625497 None:intergenic
GAGGCCTAGTGATTAAGGGT+TGG 0.557669 7:+85625785 MsG0780041023.01.T01:CDS
GGAGGATTCTTAACACATTG+TGG 0.558686 7:+85625844 MsG0780041023.01.T01:CDS
AAAAGTGGCCATGTAACCAT+TGG 0.565009 7:-85625904 None:intergenic
TTATATTGCATAAACTTCCA+AGG 0.568255 7:-85625621 None:intergenic
CAGATTCAACATAACGTGCT+AGG 0.569325 7:-85624910 None:intergenic
GAGCCCAACCCTTAATCACT+AGG 0.571445 7:-85625789 None:intergenic
CCAAGCTCTATCAACTGTAG+TGG 0.574149 7:-85625646 None:intergenic
ACTCTTGAAGCACTATGTGC+TGG 0.574858 7:+85625877 MsG0780041023.01.T01:CDS
CAATAATATTATAGAAACCA+TGG 0.583231 7:+85625234 MsG0780041023.01.T01:CDS
TCAGAGATAATGCAAGTTGG+TGG 0.585580 7:-85625103 None:intergenic
AATGAAATGGGGTGAAGAAG+AGG 0.589307 7:+85626002 MsG0780041023.01.T01:CDS
GTTAGAGCCAGCATATGCAA+AGG 0.594042 7:+85625426 MsG0780041023.01.T01:CDS
AAAGAGACTGGATTACCAGA+AGG 0.599319 7:+85624971 MsG0780041023.01.T01:CDS
TGGCTTGATTCTCAGAAACA+AGG 0.602159 7:+85625580 MsG0780041023.01.T01:CDS
GAGATAATGCAAGTTGGTGG+TGG 0.606972 7:-85625100 None:intergenic
AAATGTTGGTGTGAAAATTG+GGG 0.617684 7:+85625969 MsG0780041023.01.T01:CDS
TACTTGGATAAGATTCAAAG+AGG 0.618198 7:+85625514 MsG0780041023.01.T01:CDS
TCATTGGAAACAACACAAAG+TGG 0.619275 7:-85624772 None:intergenic
TTTGTGGCTGCACCAAGTGA+AGG 0.622138 7:-85625016 None:intergenic
AAGAGACTGGATTACCAGAA+GGG 0.625432 7:+85624972 MsG0780041023.01.T01:CDS
GGCTTGATTCTCAGAAACAA+GGG 0.627335 7:+85625581 MsG0780041023.01.T01:CDS
ATGATGTCATCATTTGCCAA+TGG 0.630721 7:+85626219 MsG0780041023.01.T01:CDS
TGTAACGAGATGCATTGTGT+GGG 0.634315 7:-85624880 None:intergenic
ACTATGTGCTGGTGTGCCAA+TGG 0.634782 7:+85625888 MsG0780041023.01.T01:CDS
ATGAATGGGAGCACTTGAAG+TGG 0.637627 7:+85625560 MsG0780041023.01.T01:CDS
ATATCAGAGATAATGCAAGT+TGG 0.655264 7:-85625106 None:intergenic
GTGTAACGAGATGCATTGTG+TGG 0.659655 7:-85624881 None:intergenic
AAATGGGGTGAAGAAGAGGA+TGG 0.662496 7:+85626006 MsG0780041023.01.T01:CDS
TGCGACAATATCAATAACTG+AGG 0.672914 7:-85625811 None:intergenic
ATATTGAAAGAGGAATAGAG+AGG 0.673671 7:+85626049 MsG0780041023.01.T01:CDS
ACGAGATGCATTGTGTGGGG+TGG 0.681477 7:-85624876 None:intergenic
TTGTTTCCAATGATGGCACA+AGG 0.693642 7:+85624782 MsG0780041023.01.T01:CDS
GTGAAGAGTCCAATGAAATG+GGG 0.699672 7:+85625991 MsG0780041023.01.T01:CDS
GTAACGAGATGCATTGTGTG+GGG 0.756675 7:-85624879 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AATTAGAAGAATTCAAAAAA+TGG + Chr7:85625725-85625744 MsG0780041023.01.T01:CDS 15.0%
!!! ATGTTAATTTCAATTTTATC+AGG - Chr7:85625298-85625317 None:intergenic 15.0%
!! AATGTAAAGAAAGAAGAAAA+AGG + Chr7:85626091-85626110 MsG0780041023.01.T01:CDS 20.0%
!! AGATAAAAAATGACAAAGTT+TGG + Chr7:85625458-85625477 MsG0780041023.01.T01:CDS 20.0%
!! ATAAAGTTTCAATTGATGAA+TGG + Chr7:85625545-85625564 MsG0780041023.01.T01:CDS 20.0%
!! CAATAATATTATAGAAACCA+TGG + Chr7:85625234-85625253 MsG0780041023.01.T01:CDS 20.0%
!! CTAAACATTCATTCAAAAAT+TGG - Chr7:85625936-85625955 None:intergenic 20.0%
!! GTTGTACAAATATTAAATGT+TGG + Chr7:85625955-85625974 MsG0780041023.01.T01:CDS 20.0%
!! TAAAGTTTCAATTGATGAAT+GGG + Chr7:85625546-85625565 MsG0780041023.01.T01:CDS 20.0%
!!! AACAAAAAGACCTTTTATTT+GGG + Chr7:85625684-85625703 MsG0780041023.01.T01:CDS 20.0%
!!! AATATTCCAAGAATTTCTTT+TGG + Chr7:85625166-85625185 MsG0780041023.01.T01:CDS 20.0%
!!! TATTTTTCTTCATGATATCT+TGG - Chr7:85626194-85626213 None:intergenic 20.0%
! TAAATGTTGGTGTGAAAATT+GGG + Chr7:85625968-85625987 MsG0780041023.01.T01:CDS 25.0%
! TCTCTTAAAACCCAAATAAA+AGG - Chr7:85625697-85625716 None:intergenic 25.0%
! TGATGAATTGAAGAAATTTG+TGG - Chr7:85625035-85625054 None:intergenic 25.0%
! TTAAATGTTGGTGTGAAAAT+TGG + Chr7:85625967-85625986 MsG0780041023.01.T01:CDS 25.0%
! TTATATTGCATAAACTTCCA+AGG - Chr7:85625624-85625643 None:intergenic 25.0%
! TTCAAATTCATTATTAGCCA+TGG - Chr7:85625254-85625273 None:intergenic 25.0%
!! CAACAAAAAGACCTTTTATT+TGG + Chr7:85625683-85625702 MsG0780041023.01.T01:CDS 25.0%
!!! AAAAAATGGATTGATGAAAG+TGG + Chr7:85625739-85625758 MsG0780041023.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTATTTGGGTTTTAAGAGA+AGG + Chr7:85625697-85625716 MsG0780041023.01.T01:CDS 25.0%
AAATGTTGGTGTGAAAATTG+GGG + Chr7:85625969-85625988 MsG0780041023.01.T01:CDS 30.0%
AAGAAGGAAGATATTGAAAG+AGG + Chr7:85626039-85626058 MsG0780041023.01.T01:CDS 30.0%
ATATCAGAGATAATGCAAGT+TGG - Chr7:85625109-85625128 None:intergenic 30.0%
ATATTGAAAGAGGAATAGAG+AGG + Chr7:85626049-85626068 MsG0780041023.01.T01:CDS 30.0%
ATATTGTCGCATTATGCAAT+TGG + Chr7:85625823-85625842 MsG0780041023.01.T01:CDS 30.0%
ATTCCACCAAAAGAAATTCT+TGG - Chr7:85625175-85625194 None:intergenic 30.0%
CTTCCAAAAAAAGGAACATA+TGG + Chr7:85624730-85624749 MsG0780041023.01.T01:exon 30.0%
GGAACAATTTAGTAGTGATT+TGG + Chr7:85625354-85625373 MsG0780041023.01.T01:CDS 30.0%
TACTTGGATAAGATTCAAAG+AGG + Chr7:85625514-85625533 MsG0780041023.01.T01:CDS 30.0%
TCCTTAATCCTTCCAAAAAA+AGG + Chr7:85624721-85624740 MsG0780041023.01.T01:five_prime_UTR 30.0%
TTATATTCCTTTGCATATGC+TGG - Chr7:85625436-85625455 None:intergenic 30.0%
! ATTCCAAGAATTTCTTTTGG+TGG + Chr7:85625169-85625188 MsG0780041023.01.T01:CDS 30.0%
! CAAGTAATCAGTGTTACTAA+GGG - Chr7:85625500-85625519 None:intergenic 30.0%
! GTGATTTTGTGCCAATATTT+TGG - Chr7:85624834-85624853 None:intergenic 30.0%
! TCAATTTTATCAGGAATACC+AGG - Chr7:85625289-85625308 None:intergenic 30.0%
! TTTTGAATTGGCATTTCCAT+TGG - Chr7:85626238-85626257 None:intergenic 30.0%
!! AATGACAAAGTTTGGTGTAT+TGG + Chr7:85625466-85625485 MsG0780041023.01.T01:CDS 30.0%
!! TTTTTGGAAGGATTAAGGAT+CGG - Chr7:85624720-85624739 None:intergenic 30.0%
!!! ATGCCATATGTTCCTTTTTT+TGG - Chr7:85624736-85624755 None:intergenic 30.0%
!!! CATATGTTCCTTTTTTTGGA+AGG - Chr7:85624732-85624751 None:intergenic 30.0%
!!! TCCTTTTTTTGGAAGGATTA+AGG - Chr7:85624725-85624744 None:intergenic 30.0%
AAAAAGGCTGTAGAAAAAGG+TGG + Chr7:85626138-85626157 MsG0780041023.01.T01:CDS 35.0%
AAAAATTGGTCCGCAAAAAG+TGG - Chr7:85625922-85625941 None:intergenic 35.0%
AAGAGGAATAGAGAGGTTAA+TGG + Chr7:85626056-85626075 MsG0780041023.01.T01:CDS 35.0%
ACAGACAGGAATAGGATTAA+AGG + Chr7:85625321-85625340 MsG0780041023.01.T01:CDS 35.0%
ATGATGTCATCATTTGCCAA+TGG + Chr7:85626219-85626238 MsG0780041023.01.T01:CDS 35.0%
CAATTTCCATGTAAAGAGAC+TGG + Chr7:85624959-85624978 MsG0780041023.01.T01:CDS 35.0%
CAGACAGGAATAGGATTAAA+GGG + Chr7:85625322-85625341 MsG0780041023.01.T01:CDS 35.0%
CTAGCTACGTGAATTGTATA+TGG - Chr7:85625139-85625158 None:intergenic 35.0%
GAAATTAACATTGCACAGAC+AGG + Chr7:85625307-85625326 MsG0780041023.01.T01:CDS 35.0%
GAGGAAAGAATCAATGATAG+AGG + Chr7:85625766-85625785 MsG0780041023.01.T01:CDS 35.0%
GATGGACATAGCCAAAATAT+TGG + Chr7:85624820-85624839 MsG0780041023.01.T01:CDS 35.0%
GATTCTTAACACATTGTGGT+TGG + Chr7:85625848-85625867 MsG0780041023.01.T01:CDS 35.0%
GCTAAAAAGGCTGTAGAAAA+AGG + Chr7:85626135-85626154 MsG0780041023.01.T01:CDS 35.0%
TCATTGGAAACAACACAAAG+TGG - Chr7:85624775-85624794 None:intergenic 35.0%
TGCGACAATATCAATAACTG+AGG - Chr7:85625814-85625833 None:intergenic 35.0%
TTTGAATACTTTGATGTGCC+TGG + Chr7:85625268-85625287 MsG0780041023.01.T01:CDS 35.0%
! CCAAGTAATCAGTGTTACTA+AGG - Chr7:85625501-85625520 None:intergenic 35.0%
! CCTTAGTAACACTGATTACT+TGG + Chr7:85625498-85625517 MsG0780041023.01.T01:CDS 35.0%
! GATTGATGAAAGTGGATTTG+AGG + Chr7:85625747-85625766 MsG0780041023.01.T01:CDS 35.0%
! TCGGATGTTGTATTTCTGTT+TGG - Chr7:85624701-85624720 None:intergenic 35.0%
!! CTTTGTGTTGTTTCCAATGA+TGG + Chr7:85624775-85624794 MsG0780041023.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTTGGCTATGTCCATCATT+GGG - Chr7:85624817-85624836 None:intergenic 35.0%
!!! ATTTTGGCTATGTCCATCAT+TGG - Chr7:85624818-85624837 None:intergenic 35.0%
AAAAGTGGCCATGTAACCAT+TGG - Chr7:85625907-85625926 None:intergenic 40.0%
AAAGAGACTGGATTACCAGA+AGG + Chr7:85624971-85624990 MsG0780041023.01.T01:CDS 40.0%
AACAACACAAAGTGGAGCTT+TGG - Chr7:85624767-85624786 None:intergenic 40.0%
AACATTGCACAGACAGGAAT+AGG + Chr7:85625313-85625332 MsG0780041023.01.T01:CDS 40.0%
AAGAGACTGGATTACCAGAA+GGG + Chr7:85624972-85624991 MsG0780041023.01.T01:CDS 40.0%
AATGAAATGGGGTGAAGAAG+AGG + Chr7:85626002-85626021 MsG0780041023.01.T01:CDS 40.0%
AGGATTAAAGGGTGAAGCTT+GGG + Chr7:85625333-85625352 MsG0780041023.01.T01:CDS 40.0%
CAAGCTGAAATGGGTACTTA+TGG + Chr7:85625379-85625398 MsG0780041023.01.T01:CDS 40.0%
CAGATTCAACATAACGTGCT+AGG - Chr7:85624913-85624932 None:intergenic 40.0%
CTAGCACGTTATGTTGAATC+TGG + Chr7:85624911-85624930 MsG0780041023.01.T01:CDS 40.0%
GATAGAGGCCTAGTGATTAA+GGG + Chr7:85625781-85625800 MsG0780041023.01.T01:CDS 40.0%
GGAGGATTCTTAACACATTG+TGG + Chr7:85625844-85625863 MsG0780041023.01.T01:CDS 40.0%
GGCTTGATTCTCAGAAACAA+GGG + Chr7:85625581-85625600 MsG0780041023.01.T01:CDS 40.0%
GGTAATCCAGTCTCTTTACA+TGG - Chr7:85624968-85624987 None:intergenic 40.0%
GGTGAAGAGTCCAATGAAAT+GGG + Chr7:85625990-85626009 MsG0780041023.01.T01:CDS 40.0%
GTGAAGAGTCCAATGAAATG+GGG + Chr7:85625991-85626010 MsG0780041023.01.T01:CDS 40.0%
TAGGATTAAAGGGTGAAGCT+TGG + Chr7:85625332-85625351 MsG0780041023.01.T01:CDS 40.0%
TCTTCTTCACCCCATTTCAT+TGG - Chr7:85626003-85626022 None:intergenic 40.0%
TGATAGAGGCCTAGTGATTA+AGG + Chr7:85625780-85625799 MsG0780041023.01.T01:CDS 40.0%
TGGCTTGATTCTCAGAAACA+AGG + Chr7:85625580-85625599 MsG0780041023.01.T01:CDS 40.0%
TGTAACGAGATGCATTGTGT+GGG - Chr7:85624883-85624902 None:intergenic 40.0%
TTGTCGCATTATGCAATTGG+AGG + Chr7:85625826-85625845 MsG0780041023.01.T01:CDS 40.0%
TTGTTTCCAATGATGGCACA+AGG + Chr7:85624782-85624801 MsG0780041023.01.T01:CDS 40.0%
! GATTTGGCTCAAGCTGAAAT+GGG + Chr7:85625370-85625389 MsG0780041023.01.T01:CDS 40.0%
! TCAGAGATAATGCAAGTTGG+TGG - Chr7:85625106-85625125 None:intergenic 40.0%
! TCAGTGTTACTAAGGGATAC+AGG - Chr7:85625493-85625512 None:intergenic 40.0%
! TGATTTGGCTCAAGCTGAAA+TGG + Chr7:85625369-85625388 MsG0780041023.01.T01:CDS 40.0%
!! AAAGTGGAGCTTTGGATCTT+GGG - Chr7:85624759-85624778 None:intergenic 40.0%
!! GATTAGAGAGCTTGCTATGA+TGG + Chr7:85626113-85626132 MsG0780041023.01.T01:CDS 40.0%
!! GCTTGCTATGATGGCTAAAA+AGG + Chr7:85626122-85626141 MsG0780041023.01.T01:CDS 40.0%
AAATGGGGTGAAGAAGAGGA+TGG + Chr7:85626006-85626025 MsG0780041023.01.T01:CDS 45.0%
AGGCCTAGTGATTAAGGGTT+GGG + Chr7:85625786-85625805 MsG0780041023.01.T01:CDS 45.0%
AGGTCACATGATCCCAATGA+TGG + Chr7:85624802-85624821 MsG0780041023.01.T01:CDS 45.0%
AGTGTTCTCTATGCATGCCT+TGG + Chr7:85625604-85625623 MsG0780041023.01.T01:CDS 45.0%
ATGTGACCTTGTGCCATCAT+TGG - Chr7:85624791-85624810 None:intergenic 45.0%
CCAAGCTCTATCAACTGTAG+TGG - Chr7:85625649-85625668 None:intergenic 45.0%
CTTGACATGCTACCTTCACT+TGG + Chr7:85625004-85625023 MsG0780041023.01.T01:CDS 45.0%
GGGTGAAGAGTCCAATGAAA+TGG + Chr7:85625989-85626008 MsG0780041023.01.T01:CDS 45.0%
GTAACGAGATGCATTGTGTG+GGG - Chr7:85624882-85624901 None:intergenic 45.0%
GTGTAACGAGATGCATTGTG+TGG - Chr7:85624884-85624903 None:intergenic 45.0%
GTTAGAGCCAGCATATGCAA+AGG + Chr7:85625426-85625445 MsG0780041023.01.T01:CDS 45.0%
TCAAGATTCTCACACCCTTC+TGG - Chr7:85624989-85625008 None:intergenic 45.0%
TGAAGAAGAGGATGGTGTGT+TGG + Chr7:85626014-85626033 MsG0780041023.01.T01:CDS 45.0%
! ACTCTTGAAGCACTATGTGC+TGG + Chr7:85625877-85625896 MsG0780041023.01.T01:CDS 45.0%
! GGATGGTGTGTTGGTAAAGA+AGG + Chr7:85626023-85626042 MsG0780041023.01.T01:CDS 45.0%
!! ATGAATGGGAGCACTTGAAG+TGG + Chr7:85625560-85625579 MsG0780041023.01.T01:CDS 45.0%
!! CAAAGTGGAGCTTTGGATCT+TGG - Chr7:85624760-85624779 None:intergenic 45.0%
!! CCACTACAGTTGATAGAGCT+TGG + Chr7:85625646-85625665 MsG0780041023.01.T01:CDS 45.0%
!! GAGATAATGCAAGTTGGTGG+TGG - Chr7:85625103-85625122 None:intergenic 45.0%
!!! GGTTACATGGCCACTTTTTG+CGG + Chr7:85625909-85625928 MsG0780041023.01.T01:CDS 45.0%
CTGGTGTGCCAATGGTTACA+TGG + Chr7:85625896-85625915 MsG0780041023.01.T01:CDS 50.0%
GAGCCCAACCCTTAATCACT+AGG - Chr7:85625792-85625811 None:intergenic 50.0%
GAGGCCTAGTGATTAAGGGT+TGG + Chr7:85625785-85625804 MsG0780041023.01.T01:CDS 50.0%
TTTGTGGCTGCACCAAGTGA+AGG - Chr7:85625019-85625038 None:intergenic 50.0%
! ACTATGTGCTGGTGTGCCAA+TGG + Chr7:85625888-85625907 MsG0780041023.01.T01:CDS 50.0%
ACGAGATGCATTGTGTGGGG+TGG - Chr7:85624879-85624898 None:intergenic 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 85624690 85626260 85624690 ID=MsG0780041023.01;Name=MsG0780041023.01
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Chr7 exon 85624690 85626260 85624690 ID=MsG0780041023.01.T01:exon:17884;Parent=MsG0780041023.01.T01
Chr7 five_prime_UTR 85624690 85624748 85624690 ID=MsG0780041023.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0780041023.01.T01
Chr7 CDS 85624749 85626260 85624749 ID=MsG0780041023.01.T01:cds;Parent=MsG0780041023.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780041023.01.T01

ATGGCATCCCAAGATCCAAAGCTCCACTTTGTGTTGTTTCCAATGATGGCACAAGGTCACATGATCCCAATGATGGACATAGCCAAAATATTGGCACAAAATCACAATGTTATTGTTACAATAGTAACCACCCCACACAATGCATCTCGTTACACATCAATCCTAGCACGTTATGTTGAATCTGGTCTTCATATTCAATTAGTTCAACTTCAATTTCCATGTAAAGAGACTGGATTACCAGAAGGGTGTGAGAATCTTGACATGCTACCTTCACTTGGTGCAGCCACAAATTTCTTCAATTCATCAAAATTTCTACAACAAGAAGTTGAAAAGTTATTTGAAGAGTTAACACCACCACCAACTTGCATTATCTCTGATATGTGTTTGCCATATACAATTCACGTAGCTAGAAAGTTCAATATTCCAAGAATTTCTTTTGGTGGAATAAATTGCTTCTATCTTTTGTGCATGCATAATGCACATGTCAATAATATTATAGAAACCATGGCTAATAATGAATTTGAATACTTTGATGTGCCTGGTATTCCTGATAAAATTGAAATTAACATTGCACAGACAGGAATAGGATTAAAGGGTGAAGCTTGGGAACAATTTAGTAGTGATTTGGCTCAAGCTGAAATGGGTACTTATGGTGTAATCATGAATTCTTTTGAAGAGTTAGAGCCAGCATATGCAAAGGAATATAAAAAGATAAAAAATGACAAAGTTTGGTGTATTGGTCCTGTATCCCTTAGTAACACTGATTACTTGGATAAGATTCAAAGAGGTAATAATAATAAAGTTTCAATTGATGAATGGGAGCACTTGAAGTGGCTTGATTCTCAGAAACAAGGGAGTGTTCTCTATGCATGCCTTGGAAGTTTATGCAATATAACACCACTACAGTTGATAGAGCTTGGTTTAGCATTAGAAGCAACAAAAAGACCTTTTATTTGGGTTTTAAGAGAAGGAAATGAATTAGAAGAATTCAAAAAATGGATTGATGAAAGTGGATTTGAGGAAAGAATCAATGATAGAGGCCTAGTGATTAAGGGTTGGGCTCCTCAGTTATTGATATTGTCGCATTATGCAATTGGAGGATTCTTAACACATTGTGGTTGGAATTCTACTCTTGAAGCACTATGTGCTGGTGTGCCAATGGTTACATGGCCACTTTTTGCGGACCAATTTTTGAATGAATGTTTAGTTGTACAAATATTAAATGTTGGTGTGAAAATTGGGGTGAAGAGTCCAATGAAATGGGGTGAAGAAGAGGATGGTGTGTTGGTAAAGAAGGAAGATATTGAAAGAGGAATAGAGAGGTTAATGGATGAGACAAGTGAATGTAAAGAAAGAAGAAAAAGGATTAGAGAGCTTGCTATGATGGCTAAAAAGGCTGTAGAAAAAGGTGGATCTTCTCACTCTAATGTTTCTTTGTTCATCCAAGATATCATGAAGAAAAATAAAGATATGATGTCATCATTTGCCAATGGAAATGCCAATTCAAAATGA
Protein sequence

>MsG0780041023.01.T01

MASQDPKLHFVLFPMMAQGHMIPMMDIAKILAQNHNVIVTIVTTPHNASRYTSILARYVESGLHIQLVQLQFPCKETGLPEGCENLDMLPSLGAATNFFNSSKFLQQEVEKLFEELTPPPTCIISDMCLPYTIHVARKFNIPRISFGGINCFYLLCMHNAHVNNIIETMANNEFEYFDVPGIPDKIEINIAQTGIGLKGEAWEQFSSDLAQAEMGTYGVIMNSFEELEPAYAKEYKKIKNDKVWCIGPVSLSNTDYLDKIQRGNNNKVSIDEWEHLKWLDSQKQGSVLYACLGSLCNITPLQLIELGLALEATKRPFIWVLREGNELEEFKKWIDESGFEERINDRGLVIKGWAPQLLILSHYAIGGFLTHCGWNSTLEALCAGVPMVTWPLFADQFLNECLVVQILNVGVKIGVKSPMKWGEEEDGVLVKKEDIERGIERLMDETSECKERRKRIRELAMMAKKAVEKGGSSHSNVSLFIQDIMKKNKDMMSSFANGNANSK*