AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180005803.01


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MsG0180005803.01.T01 AT2G15480 30.879 489 298 14 8 471 10 483 1.50e-63 214
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MsG0180005803.01.T01 AT3G55700 27.743 483 301 14 1 468 1 450 9.89e-47 168
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MsG0180005803.01.T01 AT4G15280 28.000 500 291 15 8 468 36 505 5.33e-45 165
MsG0180005803.01.T01 AT5G05860 30.544 478 276 21 8 468 9 447 8.31e-45 163
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Find 93 sgRNAs with CRISPR-Local

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
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AGAAATGGAAATTGACTAAA+AGG 0.259932 1:+96310879 None:intergenic
TCTGTGGTTTATATTTCTTT+TGG 0.261069 1:-96310615 MsG0180005803.01.T01:CDS
TGAAATAGCATATGGGTTAT+TGG 0.264850 1:-96310559 MsG0180005803.01.T01:CDS
CCTAAAAGATTTCCTCTTAG+AGG 0.280977 1:+96311206 None:intergenic
CTAAAAGGATGAAGAAAATC+TGG 0.307810 1:+96310894 None:intergenic
AACCACCTTCGGAGGAATTA+GGG 0.329917 1:-96310506 MsG0180005803.01.T01:CDS
AGTCACAAATGCAAAATTCT+TGG 0.338538 1:-96310286 MsG0180005803.01.T01:CDS
ATAGAACATCTCAAACTTGT+TGG 0.346592 1:-96311179 MsG0180005803.01.T01:CDS
GGTAATTGAACATCAATATA+AGG 0.356864 1:+96310945 None:intergenic
ATCAATGGAAGCACTTACTT+TGG 0.370900 1:-96310346 MsG0180005803.01.T01:CDS
CAAGTGAATGAAATAGCATA+TGG 0.385064 1:-96310567 MsG0180005803.01.T01:CDS
ATATAAACCACAGAACCTTT+TGG 0.387524 1:+96310624 None:intergenic
AAGATGAGTGTCCCTAGAAA+TGG 0.398955 1:+96310864 None:intergenic
GTAGGGATTAGATTGGGTTA+TGG 0.399166 1:-96310249 MsG0180005803.01.T01:CDS
CTATAACTATTTCCACAAAC+TGG 0.401688 1:-96310991 MsG0180005803.01.T01:CDS
ATTGTTTATGATACATGAAA+AGG 0.404572 1:+96311106 None:intergenic
TTTGCCAGATGGGTTCTTAG+AGG 0.405833 1:-96310469 MsG0180005803.01.T01:CDS
TGCTTATTGGAAGCTACAAC+AGG 0.405883 1:-96310183 MsG0180005803.01.T01:CDS
AGAGAGGAAAAGTTGTGAAA+TGG 0.407180 1:-96310437 MsG0180005803.01.T01:CDS
TCAATGGAAGCACTTACTTT+GGG 0.408798 1:-96310345 MsG0180005803.01.T01:CDS
ATTTCATTCACTTGTTCTTG+TGG 0.415003 1:+96310576 None:intergenic
ATCATGCTCTAGTTCTTCAT+AGG 0.422004 1:+96310794 None:intergenic
TCACAAACCCATGGAACAAA+AGG 0.449755 1:+96311083 None:intergenic
TTTGGTGTAGGGATTAGATT+GGG 0.453004 1:-96310255 MsG0180005803.01.T01:CDS
TTAGTCAATTTCCATTTCTA+GGG 0.453241 1:-96310875 MsG0180005803.01.T01:CDS
GTGGGTATTAAAACCACCTT+CGG 0.463856 1:-96310517 MsG0180005803.01.T01:CDS
TTGATCATTTGAGAAACAAA+TGG 0.467441 1:+96311152 None:intergenic
GTGAGAGAACCATCACCAAT+TGG 0.469242 1:+96311266 None:intergenic
GGGTTTATGTGTCCTTGTGC+TGG 0.472078 1:+96311407 None:intergenic
TTGTTTATGATACATGAAAA+GGG 0.474261 1:+96311107 None:intergenic
GTTTCCTCTAAGAACCCATC+TGG 0.475372 1:+96310465 None:intergenic
GAGGATGCGGTTGCCGTAGG+TGG 0.478660 1:-96310108 MsG0180005803.01.T01:CDS
AAGGGAAACGTACCAGTTTG+TGG 0.480432 1:+96310979 None:intergenic
AATGTTGACATTTCCAGCAT+GGG 0.490713 1:-96310316 MsG0180005803.01.T01:CDS
CAATGTTGACATTTCCAGCA+TGG 0.493052 1:-96310317 MsG0180005803.01.T01:CDS
AGCAAAGTGTCTTGCTGCAA+AGG 0.493150 1:-96311372 MsG0180005803.01.T01:CDS
TTGTATTTAAGAACTTGAAA+AGG 0.493342 1:+96310924 None:intergenic
AAGAACATAATTTGCCAGAT+GGG 0.496155 1:-96310479 MsG0180005803.01.T01:CDS
GAAGATGATCATCCTCTAAG+AGG 0.496341 1:-96311218 MsG0180005803.01.T01:CDS
AAAGAACATAATTTGCCAGA+TGG 0.501406 1:-96310480 MsG0180005803.01.T01:CDS
TTGTGGTTGGAATTCATCAA+TGG 0.506287 1:-96310361 MsG0180005803.01.T01:CDS
GAAGAAAGCGGCAGAGGATG+CGG 0.514863 1:-96310121 MsG0180005803.01.T01:CDS
GTTTCGTAACACATTGTGGT+TGG 0.516570 1:-96310374 MsG0180005803.01.T01:CDS
ATATAAGGTTCTGTTTCTGA+AGG 0.523191 1:+96310960 None:intergenic
GTGCTGGATAAGAGATAAGA+AGG 0.529561 1:+96311423 None:intergenic
AAGGATATGAGTGTTTGCTT+CGG 0.536727 1:+96311442 None:intergenic
TCAATCTTCGTAAGACCCAT+TGG 0.541457 1:-96310747 MsG0180005803.01.T01:CDS
GTGACTTGATCACCCCATGC+TGG 0.545234 1:+96310303 None:intergenic
GCAAAGTGTCTTGCTGCAAA+GGG 0.545350 1:-96311371 MsG0180005803.01.T01:CDS
TTTAGCCCTAATTCCTCCGA+AGG 0.547618 1:+96310501 None:intergenic
TAAAAGGATGAAGAAAATCT+GGG 0.548773 1:+96310895 None:intergenic
ATATTTGGATTGTGAAACAA+TGG 0.550835 1:+96310723 None:intergenic
TGGCTAAACACAAAGCCAAA+AGG 0.552067 1:-96310639 MsG0180005803.01.T01:CDS
CACTTTGCTAGTCTAAGAAG+AGG 0.557139 1:+96311386 None:intergenic
TTGTGAAACAATGGACCAAT+GGG 0.563623 1:+96310732 None:intergenic
GCAGAGGATGCGGTTGCCGT+AGG 0.563630 1:-96310111 MsG0180005803.01.T01:CDS
CACAAAGCCAAAAGGTTCTG+TGG 0.563752 1:-96310631 MsG0180005803.01.T01:CDS
GAAGTGGAAGAAAGCGGCAG+AGG 0.565645 1:-96310127 MsG0180005803.01.T01:CDS
TGAGCCAATACTTCTTCTTG+TGG 0.573069 1:+96310411 None:intergenic
CCGTAGGTGGATCCTCTGAT+CGG 0.574855 1:-96310095 MsG0180005803.01.T01:CDS
TTCATCACAACAGAGAAAGC+TGG 0.577898 1:-96311335 MsG0180005803.01.T01:CDS
GAGTCCACAAGAAGAAGTAT+TGG 0.578318 1:-96310415 MsG0180005803.01.T01:CDS
AGCCCTAATTCCTCCGAAGG+TGG 0.578340 1:+96310504 None:intergenic
TCACTCACTCCAATTGGTGA+TGG 0.584522 1:-96311275 MsG0180005803.01.T01:CDS
TGAATCCATAACAAAGCAGA+AGG 0.585284 1:+96311038 None:intergenic
CTTATCTCTTATCCAGCACA+AGG 0.587114 1:-96311419 MsG0180005803.01.T01:CDS
TATAAGGTTCTGTTTCTGAA+GGG 0.593373 1:+96310961 None:intergenic
ACTTTGCTAGTCTAAGAAGA+GGG 0.596564 1:+96311387 None:intergenic
CATGCTGGAAATGTCAACAT+TGG 0.596885 1:+96310318 None:intergenic
AAGTGAATGAAATAGCATAT+GGG 0.601672 1:-96310566 MsG0180005803.01.T01:CDS
TTCATCAAGATTCCGATCAG+AGG 0.604344 1:+96310083 None:intergenic
TAAATTAGTAACAAGAGATG+AGG 0.604740 1:-96310214 MsG0180005803.01.T01:CDS
GTTACGAAACATGCCACTGA+TGG 0.608593 1:+96310387 None:intergenic
ATGATTGTAAAATTATAGAG+TGG 0.612349 1:-96310659 MsG0180005803.01.T01:CDS
CTTATTGGAAGCTACAACAG+GGG 0.618372 1:-96310181 MsG0180005803.01.T01:CDS
GGTATTAAAACCACCTTCGG+AGG 0.626039 1:-96310514 MsG0180005803.01.T01:CDS
CCGATCAGAGGATCCACCTA+CGG 0.631198 1:+96310095 None:intergenic
TCGGAATATTAACAGTGCCA+CGG 0.633212 1:+96310040 None:intergenic
ATTGTGAAACAATGGACCAA+TGG 0.633300 1:+96310731 None:intergenic
ATGTTGACATTTCCAGCATG+GGG 0.637801 1:-96310315 MsG0180005803.01.T01:CDS
TGCAATGAAGTGGAAGAAAG+CGG 0.637939 1:-96310133 MsG0180005803.01.T01:CDS
GCATGTTTCGTAACACATTG+TGG 0.641634 1:-96310378 MsG0180005803.01.T01:CDS
TTAGAGGAAACAAATGAGAG+AGG 0.644193 1:-96310453 MsG0180005803.01.T01:CDS
TCAGCTACATCACAAACCCA+TGG 0.646612 1:+96311074 None:intergenic
GCTTATTGGAAGCTACAACA+GGG 0.662731 1:-96310182 MsG0180005803.01.T01:CDS
AGTATTGGCTCATCCATCAG+TGG 0.681283 1:-96310400 MsG0180005803.01.T01:CDS
ATGGAAGACATTCAGAACCG+TGG 0.696567 1:-96310057 MsG0180005803.01.T01:CDS
TGTGATGTAGCTGATGAACA+TGG 0.703527 1:-96311065 MsG0180005803.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATGATTGTAAAATTATAGAG+TGG - Chr1:96310822-96310841 MsG0180005803.01.T01:CDS 20.0%
!! ATTGTTTATGATACATGAAA+AGG + Chr1:96310378-96310397 None:intergenic 20.0%
!! TTGTATTTAAGAACTTGAAA+AGG + Chr1:96310560-96310579 None:intergenic 20.0%
!! TTGTTTATGATACATGAAAA+GGG + Chr1:96310377-96310396 None:intergenic 20.0%
!! TTTCACAATCCAAATATTAA+AGG - Chr1:96310764-96310783 MsG0180005803.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTTTTGCACCTTTAATATT+TGG + Chr1:96310776-96310795 None:intergenic 20.0%
! AAGTGAATGAAATAGCATAT+GGG - Chr1:96310915-96310934 MsG0180005803.01.T01:CDS 25.0%
! AGAAATGGAAATTGACTAAA+AGG + Chr1:96310605-96310624 None:intergenic 25.0%
! ATATTTGGATTGTGAAACAA+TGG + Chr1:96310761-96310780 None:intergenic 25.0%
! GGTAATTGAACATCAATATA+AGG + Chr1:96310539-96310558 None:intergenic 25.0%
! TAAAAGGATGAAGAAAATCT+GGG + Chr1:96310589-96310608 None:intergenic 25.0%
! TAAATTAGTAACAAGAGATG+AGG - Chr1:96311267-96311286 MsG0180005803.01.T01:CDS 25.0%
! TTAGTCAATTTCCATTTCTA+GGG - Chr1:96310606-96310625 MsG0180005803.01.T01:CDS 25.0%
! TTGATCATTTGAGAAACAAA+TGG + Chr1:96310332-96310351 None:intergenic 25.0%
! TTTAGTCAATTTCCATTTCT+AGG - Chr1:96310605-96310624 MsG0180005803.01.T01:CDS 25.0%
!! AAATTCTTGGTAGATGTTTT+TGG - Chr1:96311208-96311227 MsG0180005803.01.T01:CDS 25.0%
!! CTGTGGTTTATATTTCTTTT+GGG - Chr1:96310867-96310886 MsG0180005803.01.T01:CDS 25.0%
!! TCTGTGGTTTATATTTCTTT+TGG - Chr1:96310866-96310885 MsG0180005803.01.T01:CDS 25.0%
AGTCACAAATGCAAAATTCT+TGG - Chr1:96311195-96311214 MsG0180005803.01.T01:CDS 30.0%
ATAGAACATCTCAAACTTGT+TGG - Chr1:96310302-96310321 MsG0180005803.01.T01:CDS 30.0%
ATTTCATTCACTTGTTCTTG+TGG + Chr1:96310908-96310927 None:intergenic 30.0%
CAAGTGAATGAAATAGCATA+TGG - Chr1:96310914-96310933 MsG0180005803.01.T01:CDS 30.0%
CTAAAAGGATGAAGAAAATC+TGG + Chr1:96310590-96310609 None:intergenic 30.0%
CTATAACTATTTCCACAAAC+TGG - Chr1:96310490-96310509 MsG0180005803.01.T01:CDS 30.0%
TCGGAATCTTGATGAATTTA+TGG - Chr1:96311405-96311424 MsG0180005803.01.T01:CDS 30.0%
TGAAGAAAAATGCAATGAAG+TGG - Chr1:96311338-96311357 MsG0180005803.01.T01:CDS 30.0%
! AAACAATCCTTTTGTTCCAT+GGG - Chr1:96310391-96310410 MsG0180005803.01.T01:CDS 30.0%
! AAAGAACATAATTTGCCAGA+TGG - Chr1:96311001-96311020 MsG0180005803.01.T01:CDS 30.0%
! AAAGGTGCAAAAAATATTCG+TGG - Chr1:96310782-96310801 MsG0180005803.01.T01:CDS 30.0%
! AAGAACATAATTTGCCAGAT+GGG - Chr1:96311002-96311021 MsG0180005803.01.T01:CDS 30.0%
! ATATAAACCACAGAACCTTT+TGG + Chr1:96310860-96310879 None:intergenic 30.0%
! TAAACAATCCTTTTGTTCCA+TGG - Chr1:96310390-96310409 MsG0180005803.01.T01:CDS 30.0%
! TGAAATAGCATATGGGTTAT+TGG - Chr1:96310922-96310941 MsG0180005803.01.T01:CDS 30.0%
!! ATATAAGGTTCTGTTTCTGA+AGG + Chr1:96310524-96310543 None:intergenic 30.0%
!! TATAAGGTTCTGTTTCTGAA+GGG + Chr1:96310523-96310542 None:intergenic 30.0%
!!! ACTTTTGAGTTCTTAGATGA+TGG - Chr1:96310236-96310255 MsG0180005803.01.T01:CDS 30.0%
AAGGATATGAGTGTTTGCTT+CGG + Chr1:96310042-96310061 None:intergenic 35.0%
AATGTTGACATTTCCAGCAT+GGG - Chr1:96311165-96311184 MsG0180005803.01.T01:CDS 35.0%
AGAGAGGAAAAGTTGTGAAA+TGG - Chr1:96311044-96311063 MsG0180005803.01.T01:CDS 35.0%
ATTGTGAAACAATGGACCAA+TGG + Chr1:96310753-96310772 None:intergenic 35.0%
CCTAAAAGATTTCCTCTTAG+AGG + Chr1:96310278-96310297 None:intergenic 35.0%
GAAAAATCACTCACTCCAAT+TGG - Chr1:96310200-96310219 MsG0180005803.01.T01:CDS 35.0%
TGAATCCATAACAAAGCAGA+AGG + Chr1:96310446-96310465 None:intergenic 35.0%
TTAGAGGAAACAAATGAGAG+AGG - Chr1:96311028-96311047 MsG0180005803.01.T01:CDS 35.0%
TTGTGAAACAATGGACCAAT+GGG + Chr1:96310752-96310771 None:intergenic 35.0%
TTGTGGTTGGAATTCATCAA+TGG - Chr1:96311120-96311139 MsG0180005803.01.T01:CDS 35.0%
! ACTTTGCTAGTCTAAGAAGA+GGG + Chr1:96310097-96310116 None:intergenic 35.0%
! GTATTCCTTCTGCTTTGTTA+TGG - Chr1:96310438-96310457 MsG0180005803.01.T01:CDS 35.0%
! TTTGGTGTAGGGATTAGATT+GGG - Chr1:96311226-96311245 MsG0180005803.01.T01:CDS 35.0%
!! ATCAATGGAAGCACTTACTT+TGG - Chr1:96311135-96311154 MsG0180005803.01.T01:CDS 35.0%
!! ATCATGCTCTAGTTCTTCAT+AGG + Chr1:96310690-96310709 None:intergenic 35.0%
!! ATTCTCAAGTCTCGTTTTTG+TGG - Chr1:96310945-96310964 MsG0180005803.01.T01:CDS 35.0%
!! CCTCTAAGAGGAAATCTTTT+AGG - Chr1:96310275-96310294 MsG0180005803.01.T01:CDS 35.0%
!! TCAATGGAAGCACTTACTTT+GGG - Chr1:96311136-96311155 MsG0180005803.01.T01:CDS 35.0%
!! TGAGGTGAAAAAGTGCTTAT+TGG - Chr1:96311285-96311304 MsG0180005803.01.T01:CDS 35.0%
!! TTCTCAAGTCTCGTTTTTGT+GGG - Chr1:96310946-96310965 MsG0180005803.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTTGGTGTAGGGATTAGAT+TGG - Chr1:96311225-96311244 MsG0180005803.01.T01:CDS 35.0%
!!! TGGTAGATGTTTTTGGTGTA+GGG - Chr1:96311215-96311234 MsG0180005803.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTGGTAGATGTTTTTGGTGT+AGG - Chr1:96311214-96311233 MsG0180005803.01.T01:CDS 35.0%
AAGATGAGTGTCCCTAGAAA+TGG + Chr1:96310620-96310639 None:intergenic 40.0%
ATGTTGACATTTCCAGCATG+GGG - Chr1:96311166-96311185 MsG0180005803.01.T01:CDS 40.0%
CAATGTTGACATTTCCAGCA+TGG - Chr1:96311164-96311183 MsG0180005803.01.T01:CDS 40.0%
CATGCTGGAAATGTCAACAT+TGG + Chr1:96311166-96311185 None:intergenic 40.0%
CTTATCTCTTATCCAGCACA+AGG - Chr1:96310062-96310081 MsG0180005803.01.T01:CDS 40.0%
CTTATTGGAAGCTACAACAG+GGG - Chr1:96311300-96311319 MsG0180005803.01.T01:CDS 40.0%
GAAGATGATCATCCTCTAAG+AGG - Chr1:96310263-96310282 MsG0180005803.01.T01:CDS 40.0%
GCATGTTTCGTAACACATTG+TGG - Chr1:96311103-96311122 MsG0180005803.01.T01:CDS 40.0%
GCTTATTGGAAGCTACAACA+GGG - Chr1:96311299-96311318 MsG0180005803.01.T01:CDS 40.0%
GTAGGGATTAGATTGGGTTA+TGG - Chr1:96311232-96311251 MsG0180005803.01.T01:CDS 40.0%
GTGCTGGATAAGAGATAAGA+AGG + Chr1:96310061-96310080 None:intergenic 40.0%
GTGGGTATTAAAACCACCTT+CGG - Chr1:96310964-96310983 MsG0180005803.01.T01:CDS 40.0%
GTTTCGTAACACATTGTGGT+TGG - Chr1:96311107-96311126 MsG0180005803.01.T01:CDS 40.0%
TCAATCTTCGTAAGACCCAT+TGG - Chr1:96310734-96310753 MsG0180005803.01.T01:CDS 40.0%
TCACAAACCCATGGAACAAA+AGG + Chr1:96310401-96310420 None:intergenic 40.0%
TCGGAATATTAACAGTGCCA+CGG + Chr1:96311444-96311463 None:intergenic 40.0%
TGAGCCAATACTTCTTCTTG+TGG + Chr1:96311073-96311092 None:intergenic 40.0%
TGCAATGAAGTGGAAGAAAG+CGG - Chr1:96311348-96311367 MsG0180005803.01.T01:CDS 40.0%
TGCTTATTGGAAGCTACAAC+AGG - Chr1:96311298-96311317 MsG0180005803.01.T01:CDS 40.0%
TGGCTAAACACAAAGCCAAA+AGG - Chr1:96310842-96310861 MsG0180005803.01.T01:CDS 40.0%
TGTGATGTAGCTGATGAACA+TGG - Chr1:96310416-96310435 MsG0180005803.01.T01:CDS 40.0%
TTCATCAAGATTCCGATCAG+AGG + Chr1:96311401-96311420 None:intergenic 40.0%
TTCATCACAACAGAGAAAGC+TGG - Chr1:96310146-96310165 MsG0180005803.01.T01:CDS 40.0%
! CACTTTGCTAGTCTAAGAAG+AGG + Chr1:96310098-96310117 None:intergenic 40.0%
! GAGTCCACAAGAAGAAGTAT+TGG - Chr1:96311066-96311085 MsG0180005803.01.T01:CDS 40.0%
AAACCACCTTCGGAGGAATT+AGG - Chr1:96310974-96310993 MsG0180005803.01.T01:CDS 45.0%
AACCACCTTCGGAGGAATTA+GGG - Chr1:96310975-96310994 MsG0180005803.01.T01:CDS 45.0%
AAGGGAAACGTACCAGTTTG+TGG + Chr1:96310505-96310524 None:intergenic 45.0%
ATGGAAGACATTCAGAACCG+TGG - Chr1:96311424-96311443 MsG0180005803.01.T01:CDS 45.0%
CACAAAGCCAAAAGGTTCTG+TGG - Chr1:96310850-96310869 MsG0180005803.01.T01:CDS 45.0%
GGTATTAAAACCACCTTCGG+AGG - Chr1:96310967-96310986 MsG0180005803.01.T01:CDS 45.0%
GTAAGCAGCAAAAACAGCAG+TGG + Chr1:96310471-96310490 None:intergenic 45.0%
GTGAGAGAACCATCACCAAT+TGG + Chr1:96310218-96310237 None:intergenic 45.0%
GTTACGAAACATGCCACTGA+TGG + Chr1:96311097-96311116 None:intergenic 45.0%
TACAACAGGGGAAAAAGCAG+AGG - Chr1:96311312-96311331 MsG0180005803.01.T01:CDS 45.0%
TCACTCACTCCAATTGGTGA+TGG - Chr1:96310206-96310225 MsG0180005803.01.T01:CDS 45.0%
TCAGCTACATCACAAACCCA+TGG + Chr1:96310410-96310429 None:intergenic 45.0%
TTTAGCCCTAATTCCTCCGA+AGG + Chr1:96310983-96311002 None:intergenic 45.0%
! AGCAAAGTGTCTTGCTGCAA+AGG - Chr1:96310109-96310128 MsG0180005803.01.T01:CDS 45.0%
! GCAAAGTGTCTTGCTGCAAA+GGG - Chr1:96310110-96310129 MsG0180005803.01.T01:CDS 45.0%
! GTTTCCTCTAAGAACCCATC+TGG + Chr1:96311019-96311038 None:intergenic 45.0%
! TTTGCCAGATGGGTTCTTAG+AGG - Chr1:96311012-96311031 MsG0180005803.01.T01:CDS 45.0%
!! AGTATTGGCTCATCCATCAG+TGG - Chr1:96311081-96311100 MsG0180005803.01.T01:CDS 45.0%
GGGTTTATGTGTCCTTGTGC+TGG + Chr1:96310077-96310096 None:intergenic 50.0%
AGCCCTAATTCCTCCGAAGG+TGG + Chr1:96310980-96310999 None:intergenic 55.0%
CCGATCAGAGGATCCACCTA+CGG + Chr1:96311389-96311408 None:intergenic 55.0%
CCGTAGGTGGATCCTCTGAT+CGG - Chr1:96311386-96311405 MsG0180005803.01.T01:CDS 55.0%
GAAGAAAGCGGCAGAGGATG+CGG - Chr1:96311360-96311379 MsG0180005803.01.T01:CDS 55.0%
GAAGTGGAAGAAAGCGGCAG+AGG - Chr1:96311354-96311373 MsG0180005803.01.T01:CDS 55.0%
GTGACTTGATCACCCCATGC+TGG + Chr1:96311181-96311200 None:intergenic 55.0%
GAGGATGCGGTTGCCGTAGG+TGG - Chr1:96311373-96311392 MsG0180005803.01.T01:CDS 65.0%
GCAGAGGATGCGGTTGCCGT+AGG - Chr1:96311370-96311389 MsG0180005803.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 96310032 96311471 96310032 ID=MsG0180005803.01;Name=MsG0180005803.01
Chr1 mRNA 96310032 96311471 96310032 ID=MsG0180005803.01.T01;Parent=MsG0180005803.01;Name=MsG0180005803.01.T01;_AED=0.49;_eAED=0.49;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|479
Chr1 exon 96310032 96311471 96310032 ID=MsG0180005803.01.T01:exon:50527;Parent=MsG0180005803.01.T01
Chr1 CDS 96310032 96311471 96310032 ID=MsG0180005803.01.T01:cds;Parent=MsG0180005803.01.T01
Gene Sequence

>MsG0180005803.01.T01

ATGGGATCCGAAGCAAACACTCATATCCTTCTTATCTCTTATCCAGCACAAGGACACATAAACCCTCTTCTTAGACTAGCAAAGTGTCTTGCTGCAAAGGGTGCTTCTGTCATCTTCATCACAACAGAGAAAGCTGGCAAAGACATAAGAACTGTTAACAACATCATTGAAAAATCACTCACTCCAATTGGTGATGGTTCTCTCACTTTTGAGTTCTTAGATGATGGTTTAGAAGATGATCATCCTCTAAGAGGAAATCTTTTAGGTTACATAGAACATCTCAAACTTGTTGGAAAACCATTTGTTTCTCAAATGATCAAGAATCATGCTGATTCAAACAAACCCTTTTCATGTATCATAAACAATCCTTTTGTTCCATGGGTTTGTGATGTAGCTGATGAACATGGTATTCCTTCTGCTTTGTTATGGATTCAATCCACTGCTGTTTTTGCTGCTTACTATAACTATTTCCACAAACTGGTACGTTTCCCTTCAGAAACAGAACCTTATATTGATGTTCAATTACCTTTTCAAGTTCTTAAATACAATGAAATCCCAGATTTTCTTCATCCTTTTAGTCAATTTCCATTTCTAGGGACACTCATCTTAGAACAGTTTAAGAATTTGTCTAAAGTATTTTGTGTTTTAGTAGAAACCTATGAAGAACTAGAGCATGATTTCATTGACTATATTTCAAACAAATCAATCTTCGTAAGACCCATTGGTCCATTGTTTCACAATCCAAATATTAAAGGTGCAAAAAATATTCGTGGAGATTTTGTTAAGAGTGATGATTGTAAAATTATAGAGTGGCTAAACACAAAGCCAAAAGGTTCTGTGGTTTATATTTCTTTTGGGTCTATTGTGTACATTCCACAAGAACAAGTGAATGAAATAGCATATGGGTTATTGGATTCTCAAGTCTCGTTTTTGTGGGTATTAAAACCACCTTCGGAGGAATTAGGGCTAAAAGAACATAATTTGCCAGATGGGTTCTTAGAGGAAACAAATGAGAGAGGAAAAGTTGTGAAATGGAGTCCACAAGAAGAAGTATTGGCTCATCCATCAGTGGCATGTTTCGTAACACATTGTGGTTGGAATTCATCAATGGAAGCACTTACTTTGGGAGTTCCAATGTTGACATTTCCAGCATGGGGTGATCAAGTCACAAATGCAAAATTCTTGGTAGATGTTTTTGGTGTAGGGATTAGATTGGGTTATGGTATGATTGAAAATAAATTAGTAACAAGAGATGAGGTGAAAAAGTGCTTATTGGAAGCTACAACAGGGGAAAAAGCAGAGGAGTTGAAGAAAAATGCAATGAAGTGGAAGAAAGCGGCAGAGGATGCGGTTGCCGTAGGTGGATCCTCTGATCGGAATCTTGATGAATTTATGGAAGACATTCAGAACCGTGGCACTGTTAATATTCCGAAGATGTAA

Protein sequence

>MsG0180005803.01.T01

MGSEANTHILLISYPAQGHINPLLRLAKCLAAKGASVIFITTEKAGKDIRTVNNIIEKSLTPIGDGSLTFEFLDDGLEDDHPLRGNLLGYIEHLKLVGKPFVSQMIKNHADSNKPFSCIINNPFVPWVCDVADEHGIPSALLWIQSTAVFAAYYNYFHKLVRFPSETEPYIDVQLPFQVLKYNEIPDFLHPFSQFPFLGTLILEQFKNLSKVFCVLVETYEELEHDFIDYISNKSIFVRPIGPLFHNPNIKGAKNIRGDFVKSDDCKIIEWLNTKPKGSVVYISFGSIVYIPQEQVNEIAYGLLDSQVSFLWVLKPPSEELGLKEHNLPDGFLEETNERGKVVKWSPQEEVLAHPSVACFVTHCGWNSSMEALTLGVPMLTFPAWGDQVTNAKFLVDVFGVGIRLGYGMIENKLVTRDEVKKCLLEATTGEKAEELKKNAMKWKKAAEDAVAVGGSSDRNLDEFMEDIQNRGTVNIPKM*