AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0080048206.01

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MsG0080048206.01.T01 AT1G61430 33.427 356 224 9 490 838 427 776 6.19e-54 201
MsG0080048206.01.T01 AT1G61430 33.427 356 224 9 490 838 450 799 7.19e-54 201
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MsG0080048206.01.T01 AT2G43700 34.937 395 227 14 425 802 205 586 1.98e-53 197
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MsG0080048206.01.T01 AT5G65240 38.435 294 172 6 513 800 271 561 1.07e-52 195
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MsG0080048206.01.T01 AT4G03230 38.112 286 170 5 529 812 623 903 3.50e-51 194
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MsG0080048206.01.T01 AT1G61360 31.845 336 212 9 514 843 405 729 2.05e-45 175
MsG0080048206.01.T01 AT1G61360 31.845 336 212 9 514 843 405 729 2.05e-45 175
MsG0080048206.01.T01 AT1G61360 31.845 336 212 9 514 843 405 729 2.05e-45 175
MsG0080048206.01.T01 AT3G28690 34.000 300 177 7 514 798 14 307 2.05e-45 168
MsG0080048206.01.T01 AT1G11340 37.931 290 161 6 465 739 510 795 2.09e-45 176
MsG0080048206.01.T01 AT5G63710 34.884 344 204 11 470 799 227 564 2.15e-45 173
MsG0080048206.01.T01 AT5G18610 33.788 293 179 8 514 797 71 357 2.18e-45 171
MsG0080048206.01.T01 AT5G18610 33.788 293 179 8 514 797 71 357 2.18e-45 171
MsG0080048206.01.T01 AT5G18610 33.788 293 179 8 514 797 71 357 2.18e-45 171
MsG0080048206.01.T01 AT5G63710 34.884 344 204 11 470 799 228 565 2.34e-45 173
MsG0080048206.01.T01 AT5G28680 37.627 295 165 8 513 798 508 792 2.75e-45 176
MsG0080048206.01.T01 AT5G28680 37.627 295 165 8 513 798 508 792 2.75e-45 176
MsG0080048206.01.T01 AT3G45420 37.755 294 166 9 511 797 335 618 2.75e-45 174
MsG0080048206.01.T01 AT5G57670 34.948 289 174 7 514 797 255 534 2.76e-45 172
MsG0080048206.01.T01 AT5G13160 35.154 293 175 8 514 797 74 360 2.81e-45 169
MsG0080048206.01.T01 AT4G35600 34.347 329 187 10 514 824 74 391 3.16e-45 169
MsG0080048206.01.T01 AT1G61360 31.845 336 212 9 514 843 486 810 3.31e-45 175
MsG0080048206.01.T01 AT1G11050 34.706 340 195 10 512 830 281 614 3.41e-45 173
MsG0080048206.01.T01 AT2G19210 32.378 349 209 10 464 801 518 850 3.57e-45 176
MsG0080048206.01.T01 AT4G35600 34.347 329 187 10 514 824 75 392 3.59e-45 168
MsG0080048206.01.T01 AT5G65700 34.333 300 182 7 530 824 700 989 3.73e-45 176
MsG0080048206.01.T01 AT5G65700 34.333 300 182 7 530 824 700 989 3.73e-45 176
MsG0080048206.01.T01 AT2G28930 33.555 301 179 8 514 798 60 355 3.73e-45 168
MsG0080048206.01.T01 AT2G28930 33.555 301 179 8 514 798 57 352 3.77e-45 168
MsG0080048206.01.T01 AT4G29990 33.333 342 206 10 471 801 516 846 4.03e-45 175
MsG0080048206.01.T01 AT1G77280 30.650 323 201 8 514 822 392 705 4.67e-45 174
MsG0080048206.01.T01 AT1G77280 30.650 323 201 8 514 822 392 705 4.67e-45 174
MsG0080048206.01.T01 AT2G28930 33.555 301 179 8 514 798 68 363 4.74e-45 168
MsG0080048206.01.T01 AT5G35960 34.416 308 188 7 492 793 96 395 4.74e-45 167
MsG0080048206.01.T01 AT3G02810 34.576 295 176 9 514 797 52 340 4.84e-45 171
MsG0080048206.01.T01 AT5G60300 31.755 359 214 11 466 813 286 624 4.89e-45 174
MsG0080048206.01.T01 AT5G60300 31.755 359 214 11 466 813 286 624 4.89e-45 174
MsG0080048206.01.T01 AT1G51890 34.843 287 178 5 513 797 495 774 5.06e-45 174
MsG0080048206.01.T01 AT5G42120 32.484 314 191 8 510 809 350 656 5.10e-45 173
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MsG0080048206.01.T01 AT1G51890 34.843 287 178 5 513 797 559 838 6.27e-45 175
MsG0080048206.01.T01 AT5G16900 32.923 325 200 7 478 798 347 657 6.30e-45 173
MsG0080048206.01.T01 AT3G28690 34.000 300 177 7 514 798 63 356 6.66e-45 168
MsG0080048206.01.T01 AT5G62710 36.545 301 164 10 514 801 266 552 7.78e-45 171
MsG0080048206.01.T01 AT1G21240 37.241 290 173 7 514 799 403 687 7.82e-45 173
MsG0080048206.01.T01 AT1G26970 35.216 301 171 10 514 798 71 363 7.85e-45 167
MsG0080048206.01.T01 AT1G66150 33.431 341 206 10 474 802 539 870 8.57e-45 175
MsG0080048206.01.T01 AT5G62710 36.545 301 164 10 514 801 300 586 9.51e-45 171
MsG0080048206.01.T01 AT1G07570 33.555 301 179 8 514 798 56 351 9.56e-45 167
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MsG0080048206.01.T01 AT1G07570 33.555 301 179 8 514 798 56 351 9.56e-45 167
MsG0080048206.01.T01 AT1G52540 34.948 289 177 7 514 797 28 310 9.57e-45 165
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MsG0080048206.01.T01 AT1G61430 38.683 243 141 5 490 727 427 666 1.09e-44 172
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MsG0080048206.01.T01 AT5G54380 37.113 291 170 7 514 798 498 781 1.29e-44 174
MsG0080048206.01.T01 AT3G19300 33.893 298 182 8 505 797 307 594 1.34e-44 172
MsG0080048206.01.T01 AT2G18890 35.786 299 172 10 514 804 56 342 1.35e-44 166
MsG0080048206.01.T01 AT1G61430 38.683 243 141 5 490 727 450 689 1.50e-44 172
MsG0080048206.01.T01 AT1G61430 38.683 243 141 5 490 727 450 689 1.50e-44 172
MsG0080048206.01.T01 AT4G13190 38.528 231 117 7 514 731 59 277 1.58e-44 163
MsG0080048206.01.T01 AT2G05940 35.099 302 177 10 514 803 75 369 1.67e-44 167
MsG0080048206.01.T01 AT2G14510 32.951 349 214 9 462 802 508 844 1.76e-44 173
MsG0080048206.01.T01 AT3G46400 33.803 284 180 4 513 794 565 842 1.82e-44 173
MsG0080048206.01.T01 AT1G49270 40.611 229 128 6 514 739 324 547 1.84e-44 172
MsG0080048206.01.T01 AT2G37050 35.811 296 174 7 514 803 593 878 1.91e-44 174
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MsG0080048206.01.T01 AT2G14510 32.951 349 214 9 462 802 500 836 1.93e-44 173
MsG0080048206.01.T01 AT2G37050 35.811 296 174 7 514 803 594 879 1.97e-44 174
MsG0080048206.01.T01 AT1G17230 33.889 360 221 10 449 797 719 1072 1.98e-44 174
MsG0080048206.01.T01 AT1G24030 35.034 294 176 9 514 796 50 339 2.06e-44 164
MsG0080048206.01.T01 AT2G19230 34.812 293 171 7 514 798 559 839 2.18e-44 173
MsG0080048206.01.T01 AT2G19230 34.812 293 171 7 514 798 560 840 2.19e-44 174
MsG0080048206.01.T01 AT5G60320 34.343 297 180 8 511 801 333 620 2.58e-44 171
MsG0080048206.01.T01 AT1G31420 35.179 307 181 9 512 813 292 585 2.69e-44 169

Find 170 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 406 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GAAGATGACGAGAGGCTTTA+AGG 0.190726 contig240end:-291956 MsG0080048206.01.T01:CDS
CTTCTCTGGTAAGTTTGATA+TGG 0.216881 contig240end:+295504 None:intergenic
GCTATACACATCGGCCTTAT+AGG 0.221326 contig240end:+291396 None:intergenic
TAGCTTTGGAATGCTCTTAA+TGG 0.226429 contig240end:-291377 MsG0080048206.01.T01:CDS
GTAGCACTACTACAATAATT+TGG 0.248373 contig240end:+295868 None:intergenic
AGAAAGGGAGATAGAAATAT+TGG 0.250832 contig240end:-291263 MsG0080048206.01.T01:CDS
GTTGGATATGGAGAAGGTTT+TGG 0.250877 contig240end:+291094 None:intergenic
TGAATAATTTCAGTTGGATA+TGG 0.257114 contig240end:+291082 None:intergenic
TCTTTGTATGAATACCTAAT+TGG 0.257167 contig240end:+291985 None:intergenic
AGGATACGGTAAGGTTTATA+AGG 0.271529 contig240end:-291917 MsG0080048206.01.T01:CDS
TTTGCTGGGTTACTTGATTA+TGG 0.284212 contig240end:-293448 MsG0080048206.01.T01:CDS
GGCTATTGGAATAGGTTTGC+TGG 0.291944 contig240end:-293463 MsG0080048206.01.T01:CDS
TCCAATAGGGAAAGAAAATT+TGG 0.298540 contig240end:+291305 None:intergenic
ATCTAGGGTTTCGTGGCTAT+TGG 0.313183 contig240end:-293477 MsG0080048206.01.T01:intron
CAATAGCATTGTCACTTTAA+CGG 0.320480 contig240end:-291482 MsG0080048206.01.T01:CDS
GCAATCACCCTCTTCAATTC+CGG 0.322037 contig240end:+295596 None:intergenic
GCTTGTAAGTTAAGGAAATA+TGG 0.325106 contig240end:+291671 None:intergenic
ATTTATTATCATTGTAGATT+AGG 0.333843 contig240end:+290961 None:intergenic
TATTGGTAAAGTTTCCTATA+AGG 0.337822 contig240end:-291410 MsG0080048206.01.T01:CDS
GGCCATGTTTATGCCATTGC+TGG 0.338613 contig240end:-295303 MsG0080048206.01.T01:CDS
CTTGACATAGGAAATATCTT+TGG 0.346915 contig240end:-292153 MsG0080048206.01.T01:CDS
GTACATTTGCTTGTAAGTTA+AGG 0.350525 contig240end:+291663 None:intergenic
GTGACCCGGATAAGAGAGTT+TGG 0.353097 contig240end:-294204 MsG0080048206.01.T01:CDS
CAATTCGTTGTAAATCCAAT+AGG 0.360244 contig240end:+291291 None:intergenic
TTCGTAACCTTCCATTCATA+TGG 0.360521 contig240end:+295141 None:intergenic
AAACTTAAGGGAAATAGAAA+TGG 0.360564 contig240end:-291850 MsG0080048206.01.T01:CDS
TTGATTACAGTGAAATTCAT+AGG 0.361521 contig240end:-295110 MsG0080048206.01.T01:CDS
GGAATTCCCTCCTACCAATT+AGG 0.362745 contig240end:-291999 MsG0080048206.01.T01:CDS
AATTCCCAAACTCTCTTATC+CGG 0.365110 contig240end:+294199 None:intergenic
CTCAATAAAACTAATTGAAC+CGG 0.373940 contig240end:+291012 None:intergenic
ATTGTAGTTAGATGTGTGTT+AGG 0.378492 contig240end:-292108 MsG0080048206.01.T01:CDS
GGTTTCGTGGCTATTGGAAT+AGG 0.381490 contig240end:-293471 MsG0080048206.01.T01:CDS
CAAATGTACGAGATATCTAT+TGG 0.382209 contig240end:-291649 MsG0080048206.01.T01:CDS
ATCGCCAAGGTTTCAGACTT+TGG 0.385545 contig240end:-291529 MsG0080048206.01.T01:CDS
AAGGAGTGTTCACTATTAGA+AGG 0.385924 contig240end:+290845 None:intergenic
CAACGAATTGATTGAAGAAA+GGG 0.387608 contig240end:-291278 MsG0080048206.01.T01:CDS
TGATTTCACATAGTATTTAC+CGG 0.394927 contig240end:+295656 None:intergenic
CAATCACCCTCTTCAATTCC+GGG 0.397957 contig240end:+295597 None:intergenic
TCTTAATGGAAATAGCAAAT+AGG 0.400292 contig240end:-291363 MsG0080048206.01.T01:CDS
GTTTCTTTCAAATAGCAATC+TGG 0.400666 contig240end:+295024 None:intergenic
TCCATTGAAGGACGATCAAT+AGG 0.403590 contig240end:+291166 None:intergenic
TTTCATGTTGGTTGTGTCAC+TGG 0.405156 contig240end:-294946 MsG0080048206.01.T01:intron
AAAATGTTGGGTAAACTTAA+GGG 0.411661 contig240end:-291862 MsG0080048206.01.T01:CDS
GCAATGGGTATAAGAATATA+CGG 0.413895 contig240end:-292210 MsG0080048206.01.T01:CDS
ATATGCACCAGCTCTTACTT+TGG 0.413936 contig240end:-295457 MsG0080048206.01.T01:CDS
TCTATTACTCTGTCCATTGA+AGG 0.417323 contig240end:+291154 None:intergenic
TGCCATTGCTGGGGATTTGA+AGG 0.420575 contig240end:-295292 MsG0080048206.01.T01:CDS
TCTAAATTTGGTCTTGACAT+AGG 0.429470 contig240end:-292165 MsG0080048206.01.T01:CDS
GAGAGGCTTTAAGGAAAAGT+TGG 0.430577 contig240end:-291947 MsG0080048206.01.T01:CDS
AAGGCCGATGTGTATAGCTT+TGG 0.434197 contig240end:-291391 MsG0080048206.01.T01:CDS
ACGTCAATAGGAGGCTTTGA+TGG 0.438096 contig240end:-293290 MsG0080048206.01.T01:intron
AAAGCTTCGTAGTGGACCTT+TGG 0.439202 contig240end:-291893 MsG0080048206.01.T01:CDS
TCGATCAAGTTCACGTCAAT+AGG 0.440803 contig240end:-293302 MsG0080048206.01.T01:CDS
ACAACGAATTGATTGAAGAA+AGG 0.447030 contig240end:-291279 MsG0080048206.01.T01:CDS
CCCTATTGATCGTCCTTCAA+TGG 0.449230 contig240end:-291167 MsG0080048206.01.T01:CDS
AATTCGTTGTAAATCCAATA+GGG 0.450457 contig240end:+291292 None:intergenic
ACCAATGTGGTGCGACTTGT+TGG 0.452901 contig240end:-291781 MsG0080048206.01.T01:CDS
GCCATGTTTATGCCATTGCT+GGG 0.454645 contig240end:-295302 MsG0080048206.01.T01:CDS
GAAAGGGAGATAGAAATATT+GGG 0.458363 contig240end:-291262 MsG0080048206.01.T01:CDS
AAATGTTCATAATTGCTTTG+TGG 0.459245 contig240end:-291204 MsG0080048206.01.T01:CDS
ACTACAATAACTACACAATT+CGG 0.462337 contig240end:-295629 MsG0080048206.01.T01:CDS
ACGGCTGCAAGAGGAACAAT+TGG 0.462386 contig240end:-291463 MsG0080048206.01.T01:CDS
TTTGAAGTTTCTTGGATGAC+TGG 0.465522 contig240end:-295072 MsG0080048206.01.T01:CDS
GTGACAATGCTATTGTCAAC+TGG 0.466603 contig240end:+291490 None:intergenic
TTCGATAAACATTCTCAGCT+TGG 0.468107 contig240end:+294327 None:intergenic
TGCAATCTATGTCACTGATA+AGG 0.468171 contig240end:-297089 None:intergenic
AAGAAGGTGGACAATTTGTC+TGG 0.470923 contig240end:+295799 None:intergenic
CCTCAGAGCTGTAGTTATAA+CGG 0.478000 contig240end:+295211 None:intergenic
GCAACTTTAACTTTGTTGTC+CGG 0.482466 contig240end:-295675 MsG0080048206.01.T01:CDS
TAGTATCAACTATTCTTCTC+TGG 0.485586 contig240end:+295490 None:intergenic
TTATCTTGAATAATTTCAGT+TGG 0.487374 contig240end:+291076 None:intergenic
ATTAATGAAGTTGCAACCAT+AGG 0.487390 contig240end:-291817 MsG0080048206.01.T01:CDS
TGATGGTGAAGAGTGAAGAC+TGG 0.487872 contig240end:+295926 None:intergenic
GTTTATGATTTCATGCCCAA+TGG 0.489083 contig240end:-291727 MsG0080048206.01.T01:CDS
TCGTAACCTTCCATTCATAT+GGG 0.491569 contig240end:+295142 None:intergenic
GGAATTGCTTATTTGCATCA+AGG 0.493916 contig240end:-291616 MsG0080048206.01.T01:CDS
GGATACGGTAAGGTTTATAA+GGG 0.496466 contig240end:-291916 MsG0080048206.01.T01:CDS
ATATTTATCAAGAGAGCCAT+TGG 0.500533 contig240end:+291711 None:intergenic
TCGTACGAAAACTTTCCATC+AGG 0.500775 contig240end:+295177 None:intergenic
CAGTCCTGTGAGGGATGATC+CGG 0.501210 contig240end:-295373 MsG0080048206.01.T01:CDS
TGACCCGGATAAGAGAGTTT+GGG 0.501754 contig240end:-294203 MsG0080048206.01.T01:CDS
AAGACCAAAGTCTGAAACCT+TGG 0.502934 contig240end:+291525 None:intergenic
AGAGGCTTTAAGGAAAAGTT+GGG 0.502940 contig240end:-291946 MsG0080048206.01.T01:CDS
TCGCAGGATAACTCGTACCT+CGG 0.505579 contig240end:+295708 None:intergenic
AACTTAAGGGAAATAGAAAT+GGG 0.506409 contig240end:-291849 MsG0080048206.01.T01:CDS
ATTGCTGGGGATTTGAAGGT+TGG 0.506851 contig240end:-295288 MsG0080048206.01.T01:CDS
CTCGGATCACCACAGGTTGT+TGG 0.508336 contig240end:+295726 None:intergenic
TTTCACGATCTAGGGTTTCG+TGG 0.510629 contig240end:-293484 MsG0080048206.01.T01:intron
GCTATTGGAATAGGTTTGCT+GGG 0.510829 contig240end:-293462 MsG0080048206.01.T01:CDS
AAGGAAAAGTTGGGTGAAGG+AGG 0.519749 contig240end:-291937 MsG0080048206.01.T01:CDS
ATTTCAGTTGGATATGGAGA+AGG 0.522815 contig240end:+291088 None:intergenic
GCAGGACTACTACGTGCAAT+GGG 0.527316 contig240end:-292225 MsG0080048206.01.T01:intron
GAGGATTGGCATACTCCTGA+TGG 0.527421 contig240end:-295192 MsG0080048206.01.T01:CDS
ATAACTACAGCTCTGAGGAT+TGG 0.529863 contig240end:-295206 MsG0080048206.01.T01:CDS
GGATCATTCTTAAGTCGAAA+CGG 0.530152 contig240end:+295747 None:intergenic
ACAATTCGGTTAGTTGATCC+CGG 0.530833 contig240end:-295615 MsG0080048206.01.T01:CDS
ACGACAGTTTCCCATATGAA+TGG 0.536015 contig240end:-295152 MsG0080048206.01.T01:CDS
TGCAGGACTACTACGTGCAA+TGG 0.537551 contig240end:-292226 MsG0080048206.01.T01:intron
GTAGATTAGGTATATAGTAA+AGG 0.538644 contig240end:+290974 None:intergenic
AAGAGGAACAATTGGTTACA+TGG 0.538902 contig240end:-291455 MsG0080048206.01.T01:CDS
AGAATATACGGTGGAGCTGA+GGG 0.544527 contig240end:-292198 MsG0080048206.01.T01:CDS
AAGTTGGGTGAAGGAGGATA+CGG 0.544677 contig240end:-291931 MsG0080048206.01.T01:CDS
ATAAACATTCTCAGCTTGGA+TGG 0.546667 contig240end:+294331 None:intergenic
TTGTCAAGAAGAATGTTATG+AGG 0.550130 contig240end:+291559 None:intergenic
CTCGTACCTCGGATCACCAC+AGG 0.550198 contig240end:+295719 None:intergenic
TATTTATCAAGAGAGCCATT+GGG 0.550251 contig240end:+291712 None:intergenic
ATGTTTACCCTCCAGTGACC+CGG 0.550530 contig240end:-294218 MsG0080048206.01.T01:intron
TGTATGAATACCTAATTGGT+AGG 0.553030 contig240end:+291989 None:intergenic
TGAAACATTTGTAATGATTG+AGG 0.557760 contig240end:+295420 None:intergenic
ATGGTTAAACACAGATTCGA+AGG 0.558797 contig240end:-293429 MsG0080048206.01.T01:CDS
TTTAAGGAAAAGTTGGGTGA+AGG 0.559243 contig240end:-291940 MsG0080048206.01.T01:CDS
ATATAGTAAAGGATCTTCTA+CGG 0.560718 contig240end:+290985 None:intergenic
ATTCCCAAACTCTCTTATCC+GGG 0.563417 contig240end:+294200 None:intergenic
CAGTTTCCCATATGAATGGA+AGG 0.567012 contig240end:-295148 MsG0080048206.01.T01:CDS
AGAACTGCCAAAGTAAGAGC+TGG 0.567462 contig240end:+295450 None:intergenic
TTATCAGATGATGATGTCAC+CGG 0.569742 contig240end:-291031 MsG0080048206.01.T01:CDS
TAAGTAATAGTGAGGAATGG+TGG 0.570263 contig240end:+295572 None:intergenic
CAGTGAAATTCATAGGATGT+TGG 0.570931 contig240end:-295103 MsG0080048206.01.T01:CDS
TAATCTATGTAGAACAACGC+TGG 0.571418 contig240end:-294971 MsG0080048206.01.T01:CDS
TGAATACCTAATTGGTAGGA+GGG 0.572938 contig240end:+291993 None:intergenic
GCTATTTGAAAGAAACCACT+TGG 0.574856 contig240end:-295017 MsG0080048206.01.T01:CDS
AAGAATATACGGTGGAGCTG+AGG 0.575260 contig240end:-292199 MsG0080048206.01.T01:CDS
GGAAATATGGTCTTCTCTAG+AGG 0.576103 contig240end:+291684 None:intergenic
CCCCAGCAATGGCATAAACA+TGG 0.580226 contig240end:+295301 None:intergenic
ATCAAGTTCACGTCAATAGG+AGG 0.580335 contig240end:-293299 MsG0080048206.01.T01:CDS
AATCTATGTAGAACAACGCT+GGG 0.583155 contig240end:-294970 MsG0080048206.01.T01:CDS
GTTGTTCTACATAGATTAGA+CGG 0.584062 contig240end:+294976 None:intergenic
ATGAATACCTAATTGGTAGG+AGG 0.584409 contig240end:+291992 None:intergenic
AGTTGATCCCGGAATTGAAG+AGG 0.585592 contig240end:-295604 MsG0080048206.01.T01:CDS
CCATTGAAGGACGATCAATA+GGG 0.587021 contig240end:+291167 None:intergenic
GGGTGAAGGAGGATACGGTA+AGG 0.588537 contig240end:-291926 MsG0080048206.01.T01:CDS
GTCACTTTAACGGCTGCAAG+AGG 0.588866 contig240end:-291472 MsG0080048206.01.T01:CDS
TTTCTCGCAGGTATTACGTA+CGG 0.588960 contig240end:-292333 MsG0080048206.01.T01:intron
AACCTTCAAATCCCCAGCAA+TGG 0.590851 contig240end:+295290 None:intergenic
AGGAGTGTTCACTATTAGAA+GGG 0.592798 contig240end:+290846 None:intergenic
ACATAGGAAATATCTTTGGA+AGG 0.597480 contig240end:-292149 MsG0080048206.01.T01:CDS
TGACAAAGACTTCATCGCCA+AGG 0.599823 contig240end:-291542 MsG0080048206.01.T01:CDS
GTTGATCCCGGAATTGAAGA+GGG 0.609953 contig240end:-295603 MsG0080048206.01.T01:CDS
AAGCTGAGAATGTTTATCGA+AGG 0.621198 contig240end:-294325 MsG0080048206.01.T01:intron
AATTGTCCACCTTCTTCATG+TGG 0.622393 contig240end:-295792 MsG0080048206.01.T01:CDS
GTATAAGTAATAGTGAGGAA+TGG 0.624212 contig240end:+295569 None:intergenic
AGAATCGTAGATATAAGAGC+TGG 0.625063 contig240end:+295533 None:intergenic
CCGTTATAACTACAGCTCTG+AGG 0.625923 contig240end:-295211 MsG0080048206.01.T01:CDS
ATGAACAAGTCGAATTCTCA+AGG 0.626361 contig240end:-295327 MsG0080048206.01.T01:CDS
GAAGCTGCATCCGCATACAC+CGG 0.626905 contig240end:+295354 None:intergenic
TCCAACAAGTCGCACCACAT+TGG 0.628935 contig240end:+291780 None:intergenic
TGAAATTCATAGGATGTTGG+TGG 0.630171 contig240end:-295100 MsG0080048206.01.T01:CDS
TATAAGGGAAAGCTTCGTAG+TGG 0.632786 contig240end:-291901 MsG0080048206.01.T01:CDS
ATTCATAGGATGTTGGTGGG+TGG 0.637761 contig240end:-295096 MsG0080048206.01.T01:CDS
TAATTGTATAAGTAATAGTG+AGG 0.647835 contig240end:+295564 None:intergenic
GTCGCATTCAAGACTCCAAG+TGG 0.648556 contig240end:+295002 None:intergenic
TACACCGGATCATCCCTCAC+AGG 0.650574 contig240end:+295369 None:intergenic
CCATGTTTATGCCATTGCTG+GGG 0.653515 contig240end:-295301 MsG0080048206.01.T01:CDS
GAGATAAAGAAGATGACGAG+AGG 0.654563 contig240end:-291964 MsG0080048206.01.T01:CDS
ATTACGTACGGAATTGCCCA+AGG 0.660989 contig240end:-292321 MsG0080048206.01.T01:intron
AAGAATGATCCAACAACCTG+TGG 0.661242 contig240end:-295735 MsG0080048206.01.T01:CDS
TGAATTGTAGCAGTCCTGTG+AGG 0.669612 contig240end:-295383 MsG0080048206.01.T01:CDS
CAACAACCTGTGGTGATCCG+AGG 0.671364 contig240end:-295725 MsG0080048206.01.T01:CDS
GAGGGATGATCCGGTGTATG+CGG 0.673536 contig240end:-295364 MsG0080048206.01.T01:CDS
GAATTGTAGCAGTCCTGTGA+GGG 0.675490 contig240end:-295382 MsG0080048206.01.T01:CDS
GGTCCTTGTCAAGATCATTG+TGG 0.676589 contig240end:-295051 MsG0080048206.01.T01:CDS
ATATCTATTGGAATTGCACG+TGG 0.677395 contig240end:-291637 MsG0080048206.01.T01:CDS
AGAGTAATAGAAATGCTCGA+AGG 0.682096 contig240end:-291142 MsG0080048206.01.T01:CDS
ATTGGGAGAAGCTACCAATG+AGG 0.690362 contig240end:-291245 MsG0080048206.01.T01:CDS
GAAATTCATAGGATGTTGGT+GGG 0.698591 contig240end:-295099 MsG0080048206.01.T01:CDS
CATTCCAAAGCTATACACAT+CGG 0.699922 contig240end:+291387 None:intergenic
ACTCCACAATGATCTTGACA+AGG 0.700390 contig240end:+295048 None:intergenic
TAATCATGATGACTGTCACG+TGG 0.715162 contig240end:-295259 MsG0080048206.01.T01:CDS
AACAAGTCGAATTCTCAAGG+TGG 0.727769 contig240end:-295324 MsG0080048206.01.T01:CDS
ATGGGTATAAGAATATACGG+TGG 0.749984 contig240end:-292207 MsG0080048206.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! TTTTAATTAATTAAAAATAT+TGG + contig240end:295334-295353 None:intergenic 0.0%
!! AAGGAATATAATAAAAAAAT+TGG + contig240end:293854-293873 None:intergenic 10.0%
!! TTCAATCATAATTTAAATTT+GGG - contig240end:293635-293654 MsG0080048206.01.T01:intron 10.0%
!! TTTCAATCATAATTTAAATT+TGG - contig240end:293634-293653 MsG0080048206.01.T01:intron 10.0%
!!! ATAAAAAGTTCAAAAATTTT+TGG - contig240end:291568-291587 MsG0080048206.01.T01:CDS 10.0%
!!! TCTATCTTTTTATTTTTATT+AGG - contig240end:295065-295084 MsG0080048206.01.T01:CDS 10.0%
!!! TTCTTCTTTATTTTAATTTT+AGG - contig240end:293410-293429 MsG0080048206.01.T01:intron 10.0%
!! AACTTGTATAATTTCATATA+TGG - contig240end:290889-290908 MsG0080048206.01.T01:three_prime_UTR 15.0%
!! ATTTATTATCATTGTAGATT+AGG + contig240end:296810-296829 None:intergenic 15.0%
!! GAATATAATAAAAAAATTGG+CGG + contig240end:293851-293870 None:intergenic 15.0%
!!! ACATTTTATTATATTATTGC+AGG - contig240end:295525-295544 MsG0080048206.01.T01:CDS 15.0%
!!! TAAAAACAAATTTTTTTGCA+AGG + contig240end:295145-295164 None:intergenic 15.0%
!!! TTTTATAGTCACATTTTTTT+TGG - contig240end:295475-295494 MsG0080048206.01.T01:CDS 15.0%
!! AAAAGAAACATTGTTACAAA+GGG + contig240end:297048-297067 MsG0080048207.01.T01:CDS 20.0%
!! ACTCCTTTATTGTATTAAAT+GGG - contig240end:293885-293904 MsG0080048206.01.T01:intron 20.0%
!! ACTTATTGAACTAAAAAAGA+AGG - contig240end:291429-291448 MsG0080048206.01.T01:CDS 20.0%
!! ATTCTTATGTTTGTGATTAT+AGG - contig240end:294986-295005 MsG0080048206.01.T01:CDS 20.0%
!! CATACGACTTAAATTTAATA+AGG - contig240end:293977-293996 MsG0080048206.01.T01:intron 20.0%
!! CTAACTTCTTTAATTATACA+CGG - contig240end:293484-293503 MsG0080048206.01.T01:intron 20.0%
!! GAATTGTTCTACAAAAATAT+TGG - contig240end:296341-296360 MsG0080048206.01.T01:intron 20.0%
!! GTGTATATATAAATGTTTGA+TGG - contig240end:293176-293195 MsG0080048206.01.T01:intron 20.0%
!! TAAAAGAAACATTGTTACAA+AGG + contig240end:297049-297068 MsG0080048207.01.T01:CDS 20.0%
!! TAACCCATTTAATACAATAA+AGG + contig240end:293891-293910 None:intergenic 20.0%
!! TAATTGTATAAGTAATAGTG+AGG + contig240end:292207-292226 None:intergenic 20.0%
!! TATAATCACAAACATAAGAA+TGG + contig240end:294987-295006 None:intergenic 20.0%
!! TATAATTTCATATATGGCAT+AGG - contig240end:290895-290914 MsG0080048206.01.T01:three_prime_UTR 20.0%
!! TATTACTATATTTAAGTGTC+CGG - contig240end:291236-291255 MsG0080048206.01.T01:CDS 20.0%
!! TCATCTAAAGGAAAAAAATA+AGG - contig240end:291004-291023 MsG0080048206.01.T01:CDS 20.0%
!! TGACTATAAAAAATTACCTT+GGG + contig240end:295466-295485 None:intergenic 20.0%
!! TGTATAATTAAAGAAGTTAG+AGG + contig240end:293484-293503 None:intergenic 20.0%
!! TTATCTTGAATAATTTCAGT+TGG + contig240end:296695-296714 None:intergenic 20.0%
!!! ATAAGGAATTTTTTTGATAC+AGG - contig240end:290696-290715 MsG0080048206.01.T01:intron 20.0%
!!! ATATTTTTGTAGAACAATTC+TGG + contig240end:296341-296360 None:intergenic 20.0%
!!! ATTCTTTTCTCTCTTATTAT+TGG + contig240end:292986-293005 None:intergenic 20.0%
!!! GAACACAAAATAGTTTTATT+TGG + contig240end:293741-293760 None:intergenic 20.0%
!!! TTATAACGGAAAAAAGATAT+CGG + contig240end:292546-292565 None:intergenic 20.0%
! AAAAATGTTGGGTAAACTTA+AGG - contig240end:295905-295924 MsG0080048206.01.T01:CDS 25.0%
! AAAATGTTGGGTAAACTTAA+GGG - contig240end:295906-295925 MsG0080048206.01.T01:CDS 25.0%
! AAACAATAAAACTGCAGAAA+AGG - contig240end:295354-295373 MsG0080048206.01.T01:CDS 25.0%
! AAACTTAAGGGAAATAGAAA+TGG - contig240end:295918-295937 MsG0080048206.01.T01:CDS 25.0%
! AAATGTTCATAATTGCTTTG+TGG - contig240end:296564-296583 MsG0080048206.01.T01:intron 25.0%
! AACAATAAAACTGCAGAAAA+GGG - contig240end:295355-295374 MsG0080048206.01.T01:CDS 25.0%
! AACTTAAGGGAAATAGAAAT+GGG - contig240end:295919-295938 MsG0080048206.01.T01:CDS 25.0%
! AATTCGTTGTAAATCCAATA+GGG + contig240end:296479-296498 None:intergenic 25.0%
! ACAATTAGGTCATTTATTTG+AGG - contig240end:291518-291537 MsG0080048206.01.T01:CDS 25.0%
! ACACAAAAAATTTCGTCAAA+TGG - contig240end:293010-293029 MsG0080048206.01.T01:intron 25.0%
! ACATATTCAATCAATGACTT+TGG + contig240end:291281-291300 None:intergenic 25.0%
! ACTACAATAACTACACAATT+CGG - contig240end:292139-292158 MsG0080048206.01.T01:CDS 25.0%
! ACTTTCAAATGATCACAATA+GGG + contig240end:294827-294846 None:intergenic 25.0%
! ATACATGTATGTCAATTCTA+TGG - contig240end:293319-293338 MsG0080048206.01.T01:CDS 25.0%
! ATATAGTAAAGGATCTTCTA+CGG + contig240end:296786-296805 None:intergenic 25.0%
! ATGAAACTATAACTGTTTGT+TGG - contig240end:293296-293315 MsG0080048206.01.T01:CDS 25.0%
! ATGCTAAACAATAAACAGAA+AGG - contig240end:296958-296977 MsG0080048206.01.T01:intron 25.0%
! ATTATAGGCTTTCTATGATT+TGG - contig240end:295001-295020 MsG0080048206.01.T01:CDS 25.0%
! ATTTATAATATGTTGAGGTG+AGG - contig240end:294531-294550 MsG0080048206.01.T01:intron 25.0%
! CAAAGTTGCAAAAATCAAAA+AGG - contig240end:291143-291162 MsG0080048206.01.T01:CDS 25.0%
! CTCAATAAAACTAATTGAAC+CGG + contig240end:296759-296778 None:intergenic 25.0%
! GACTCCTTTATTGTATTAAA+TGG - contig240end:293884-293903 MsG0080048206.01.T01:intron 25.0%
! GACTTATGTATTACAATTTG+TGG + contig240end:291652-291671 None:intergenic 25.0%
! GTAGATTAGGTATATAGTAA+AGG + contig240end:296797-296816 None:intergenic 25.0%
! GTGACTATAAAAAATTACCT+TGG + contig240end:295467-295486 None:intergenic 25.0%
! TACGGTATTATAATCTGAAA+GGG + contig240end:291807-291826 None:intergenic 25.0%
! TATTGGTAAAGTTTCCTATA+AGG - contig240end:296358-296377 MsG0080048206.01.T01:intron 25.0%
! TCAACATATTATAAATGCTC+TGG + contig240end:294527-294546 None:intergenic 25.0%
! TCTTAATGGAAATAGCAAAT+AGG - contig240end:296405-296424 MsG0080048206.01.T01:intron 25.0%
! TCTTTGTATGAATACCTAAT+TGG + contig240end:295786-295805 None:intergenic 25.0%
! TGAAACATTTGTAATGATTG+AGG + contig240end:292351-292370 None:intergenic 25.0%
! TGAATAATTTCAGTTGGATA+TGG + contig240end:296689-296708 None:intergenic 25.0%
! TGATTTCACATAGTATTTAC+CGG + contig240end:292115-292134 None:intergenic 25.0%
! TGGTTATAACAATGATATGA+GGG + contig240end:293721-293740 None:intergenic 25.0%
! TGTTTATTGTTTAGCATACT+TGG + contig240end:296955-296974 MsG0080048207.01.T01:CDS 25.0%
! TTGATTACAGTGAAATTCAT+AGG - contig240end:292658-292677 MsG0080048206.01.T01:intron 25.0%
! TTGGTTATAACAATGATATG+AGG + contig240end:293722-293741 None:intergenic 25.0%
! TTGTCACATTTGTATATATG+TGG - contig240end:295201-295220 MsG0080048206.01.T01:CDS 25.0%
!! AAGTTTACCCAACATTTTTA+TGG + contig240end:295904-295923 None:intergenic 25.0%
!! AGAGCATTTATAATATGTTG+AGG - contig240end:294526-294545 MsG0080048206.01.T01:intron 25.0%
!! ATTCATGTTACTTATAAGAG+TGG - contig240end:294952-294971 MsG0080048206.01.T01:CDS 25.0%
!! TTCATGTTACTTATAAGAGT+GGG - contig240end:294953-294972 MsG0080048206.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTCTCACACTCTATTTTTAT+TGG + contig240end:291690-291709 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTTGATTTCCTGTCTTAA+TGG + contig240end:291344-291363 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTTTGATACAGGTTTTGA+GGG - contig240end:290705-290724 MsG0080048206.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTTTTTGATACAGGTTTTG+AGG - contig240end:290704-290723 MsG0080048206.01.T01:intron 25.0%
AAAAATACATCACACCAATG+TGG - contig240end:295974-295993 MsG0080048206.01.T01:intron 30.0%
AAAGGAGTCATAATACATGA+AGG + contig240end:293873-293892 None:intergenic 30.0%
AAGAAGGAAAACAAATCGAA+TGG - contig240end:291445-291464 MsG0080048206.01.T01:CDS 30.0%
ACAAAACTTATCCGATAGTT+TGG + contig240end:293768-293787 None:intergenic 30.0%
ACAACGAATTGATTGAAGAA+AGG - contig240end:296489-296508 MsG0080048206.01.T01:intron 30.0%
ACAATAAAACTGCAGAAAAG+GGG - contig240end:295356-295375 MsG0080048206.01.T01:CDS 30.0%
ACATAGGAAATATCTTTGGA+AGG - contig240end:295619-295638 MsG0080048206.01.T01:CDS 30.0%
ACTTCATTAAAATTTCTCGC+AGG - contig240end:295423-295442 MsG0080048206.01.T01:CDS 30.0%
ACTTGAACAAGATAAACGAA+AGG - contig240end:290752-290771 MsG0080048206.01.T01:intron 30.0%
AGAAAGGGAGATAGAAATAT+TGG - contig240end:296505-296524 MsG0080048206.01.T01:intron 30.0%
AGAAGGAAAACAAATCGAAT+GGG - contig240end:291446-291465 MsG0080048206.01.T01:CDS 30.0%
ATAAAAACACAGTGACACAA+GGG + contig240end:293532-293551 None:intergenic 30.0%
ATATTTATCAAGAGAGCCAT+TGG + contig240end:296060-296079 None:intergenic 30.0%
ATTAATGAAGTTGCAACCAT+AGG - contig240end:295951-295970 MsG0080048206.01.T01:intron 30.0%
ATTGTAGTTAGATGTGTGTT+AGG - contig240end:295660-295679 MsG0080048206.01.T01:CDS 30.0%
ATTTCTTAATGCGATAACAC+TGG + contig240end:292896-292915 None:intergenic 30.0%
CAAATAAACACCATTAAGAC+AGG - contig240end:291331-291350 MsG0080048206.01.T01:CDS 30.0%
CAAATGTACGAGATATCTAT+TGG - contig240end:296119-296138 MsG0080048206.01.T01:intron 30.0%
CAACGAATTGATTGAAGAAA+GGG - contig240end:296490-296509 MsG0080048206.01.T01:intron 30.0%
CAATTCGTTGTAAATCCAAT+AGG + contig240end:296480-296499 None:intergenic 30.0%
CATATCAAATTGTGCAACAT+TGG + contig240end:294716-294735 None:intergenic 30.0%
CATTTGTACCATGTGTAAAT+GGG - contig240end:296986-297005 MsG0080048206.01.T01:intron 30.0%
CTACGGTATTATAATCTGAA+AGG + contig240end:291808-291827 None:intergenic 30.0%
CTATCAATGAACCTTGTAAA+TGG + contig240end:290810-290829 None:intergenic 30.0%
CTTGAACAAGATAAACGAAA+GGG - contig240end:290753-290772 MsG0080048206.01.T01:intron 30.0%
CTTGACATAGGAAATATCTT+TGG - contig240end:295615-295634 MsG0080048206.01.T01:CDS 30.0%
CTTTCAAATGATCACAATAG+GGG + contig240end:294826-294845 None:intergenic 30.0%
GAAAGGGAGATAGAAATATT+GGG - contig240end:296506-296525 MsG0080048206.01.T01:intron 30.0%
GACAAATCGTAAAAAAAGTG+AGG + contig240end:295186-295205 None:intergenic 30.0%
GACTTTCAAATGATCACAAT+AGG + contig240end:294828-294847 None:intergenic 30.0%
GCAATGGGTATAAGAATATA+CGG - contig240end:295558-295577 MsG0080048206.01.T01:CDS 30.0%
GCTTGTAAGTTAAGGAAATA+TGG + contig240end:296100-296119 None:intergenic 30.0%
GTACATTTGCTTGTAAGTTA+AGG + contig240end:296108-296127 None:intergenic 30.0%
GTAGCACTACTACAATAATT+TGG + contig240end:291903-291922 None:intergenic 30.0%
GTATAAGTAATAGTGAGGAA+TGG + contig240end:292202-292221 None:intergenic 30.0%
GTGATTCAACTATTATGCTT+TGG + contig240end:291599-291618 None:intergenic 30.0%
GTTAGTGACTTAACTCTTAA+AGG + contig240end:293390-293409 None:intergenic 30.0%
GTTGCACAATTTGATATGTT+TGG - contig240end:294718-294737 MsG0080048206.01.T01:intron 30.0%
GTTGTTCTACATAGATTAGA+CGG + contig240end:292795-292814 None:intergenic 30.0%
GTTTCTTTCAAATAGCAATC+TGG + contig240end:292747-292766 None:intergenic 30.0%
TAGAAATGCTAACAAGTGTT+TGG - contig240end:294604-294623 MsG0080048206.01.T01:intron 30.0%
TAGGTCATTTATTTGAGGAT+GGG - contig240end:291523-291542 MsG0080048206.01.T01:CDS 30.0%
TAGTATCAACTATTCTTCTC+TGG + contig240end:292281-292300 None:intergenic 30.0%
TATTGTTCTGACCATTTACA+AGG - contig240end:290796-290815 MsG0080048206.01.T01:intron 30.0%
TATTTATCAAGAGAGCCATT+GGG + contig240end:296059-296078 None:intergenic 30.0%
TCCAATAGGGAAAGAAAATT+TGG + contig240end:296466-296485 None:intergenic 30.0%
TCCATGTCAATAGCATAAAA+CGG - contig240end:291192-291211 MsG0080048206.01.T01:CDS 30.0%
TGAATCACAATTAATCATGC+CGG - contig240end:291611-291630 MsG0080048206.01.T01:CDS 30.0%
TGAGAAAGTTGTCAACAAAA+TGG + contig240end:292932-292951 None:intergenic 30.0%
TGAGGGAGAAAATATTATGA+TGG - contig240end:294794-294813 MsG0080048206.01.T01:intron 30.0%
TGTATGAATACCTAATTGGT+AGG + contig240end:295782-295801 None:intergenic 30.0%
TGTGTTCTTTACCAAACTAT+CGG - contig240end:293754-293773 MsG0080048206.01.T01:intron 30.0%
TTAGCATACTTGGAAACAAA+AGG + contig240end:296945-296964 MsG0080048207.01.T01:CDS 30.0%
TTAGGTCATTTATTTGAGGA+TGG - contig240end:291522-291541 MsG0080048206.01.T01:CDS 30.0%
TTGAACAAGATAAACGAAAG+GGG - contig240end:290754-290773 MsG0080048206.01.T01:intron 30.0%
TTGACATATGTGCAACAATT+AGG - contig240end:291504-291523 MsG0080048206.01.T01:CDS 30.0%
TTGTCAAGAAGAATGTTATG+AGG + contig240end:296212-296231 None:intergenic 30.0%
! AACATCGAAGATTTTCTTCA+AGG - contig240end:295747-295766 MsG0080048206.01.T01:CDS 30.0%
! AACATTTTTATGGCTACCAA+AGG + contig240end:295894-295913 None:intergenic 30.0%
! ACATCGAAGATTTTCTTCAA+GGG - contig240end:295748-295767 MsG0080048206.01.T01:CDS 30.0%
! ACCAAATTTTCTTTCCCTAT+TGG - contig240end:296462-296481 MsG0080048206.01.T01:intron 30.0%
! ACTTGTTAGCATTTCTATAC+CGG + contig240end:294601-294620 None:intergenic 30.0%
! ATTTTCACTGCATAGAAGTT+TGG - contig240end:294250-294269 MsG0080048206.01.T01:intron 30.0%
! CAAATTTTCCCATTTACACA+TGG + contig240end:296997-297016 MsG0080048207.01.T01:CDS 30.0%
! CACATTTTTCTTTTCCTCAT+TGG + contig240end:296540-296559 None:intergenic 30.0%
! GGATTTTCTGACTCTAAATT+TGG - contig240end:295591-295610 MsG0080048206.01.T01:CDS 30.0%
! TGTTGGTTGTCTTTAGTATA+TGG - contig240end:295104-295123 MsG0080048206.01.T01:CDS 30.0%
! TTGATTTTACCACATGAAGA+AGG + contig240end:291988-292007 None:intergenic 30.0%
! TTGGTAGCCATAAAAATGTT+GGG - contig240end:295894-295913 MsG0080048206.01.T01:CDS 30.0%
! TTTGGTAGCCATAAAAATGT+TGG - contig240end:295893-295912 MsG0080048206.01.T01:CDS 30.0%
! TTTTCACTGCATAGAAGTTT+GGG - contig240end:294251-294270 MsG0080048206.01.T01:intron 30.0%
!! CAATAGCATTGTCACTTTAA+CGG - contig240end:296286-296305 MsG0080048206.01.T01:intron 30.0%
!! CTCTTAAACGAATCACTTTT+AGG - contig240end:293660-293679 MsG0080048206.01.T01:intron 30.0%
!! TCTAAATTTGGTCTTGACAT+AGG - contig240end:295603-295622 MsG0080048206.01.T01:CDS 30.0%
!!! ATCGGATAAGTTTTGTTCAT+AGG - contig240end:293772-293791 MsG0080048206.01.T01:intron 30.0%
!!! CGGTTCAATTAGTTTTATTG+AGG - contig240end:296757-296776 MsG0080048206.01.T01:intron 30.0%
!!! TGTTTTAATTTCCCGTCTTT+GGG + contig240end:291374-291393 None:intergenic 30.0%
!!! TTGTTTTAATTTCCCGTCTT+TGG + contig240end:291375-291394 None:intergenic 30.0%
AAAAATATACCGCCCAAAGA+CGG - contig240end:291359-291378 MsG0080048206.01.T01:CDS 35.0%
AAGAGGAACAATTGGTTACA+TGG - contig240end:296313-296332 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
AAGCTGAGAATGTTTATCGA+AGG - contig240end:293443-293462 MsG0080048206.01.T01:CDS 35.0%
AATCAGAGCTACACATACTA+TGG - contig240end:294143-294162 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
AATCTATGTAGAACAACGCT+GGG - contig240end:292798-292817 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
AATTCCCAAACTCTCTTATC+CGG + contig240end:293572-293591 None:intergenic 35.0%
ACATTGTTACAAAGGGACAT+TGG + contig240end:297041-297060 MsG0080048207.01.T01:CDS 35.0%
ACTATGGGAATAAGAGAGAA+TGG - contig240end:294159-294178 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
ACTTTGGTCAACAACAGATA+CGG - contig240end:294689-294708 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
AGAATCGTAGATATAAGAGC+TGG + contig240end:292238-292257 None:intergenic 35.0%
AGAGTAATAGAAATGCTCGA+AGG - contig240end:296626-296645 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
AGGATACGGTAAGGTTTATA+AGG - contig240end:295851-295870 MsG0080048206.01.T01:CDS 35.0%
ATAAACATTCTCAGCTTGGA+TGG + contig240end:293440-293459 None:intergenic 35.0%
ATAATATGTTGAGGTGAGGA+AGG - contig240end:294535-294554 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
ATATCTATTGGAATTGCACG+TGG - contig240end:296131-296150 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
ATCAAGGACATGAAAGGTAA+AGG - contig240end:294225-294244 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
ATCAGAGCTACACATACTAT+GGG - contig240end:294144-294163 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
ATCGTAAAAAAAGTGAGGTC+AGG + contig240end:295181-295200 None:intergenic 35.0%
ATGAACAAGTCGAATTCTCA+AGG - contig240end:292441-292460 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
ATGAATACCTAATTGGTAGG+AGG + contig240end:295779-295798 None:intergenic 35.0%
ATGGGTATAAGAATATACGG+TGG - contig240end:295561-295580 MsG0080048206.01.T01:CDS 35.0%
ATGGTTAAACACAGATTCGA+AGG - contig240end:294339-294358 MsG0080048206.01.T01:CDS 35.0%
ATTGTGAGTGACATGTTGAA+GGG - contig240end:290849-290868 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
ATTTCAGTTGGATATGGAGA+AGG + contig240end:296683-296702 None:intergenic 35.0%
CAATAAAACTGCAGAAAAGG+GGG - contig240end:295357-295376 MsG0080048206.01.T01:CDS 35.0%
CAGTGAAATTCATAGGATGT+TGG - contig240end:292665-292684 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
CATAAAAACACAGTGACACA+AGG + contig240end:293533-293552 None:intergenic 35.0%
CATTCCAAAGCTATACACAT+CGG + contig240end:296384-296403 None:intergenic 35.0%
CCATTTACACATGGTACAAA+TGG + contig240end:296988-297007 MsG0080048207.01.T01:CDS 35.0%
CCATTTGTACCATGTGTAAA+TGG - contig240end:296985-297004 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
CTTCTCTGGTAAGTTTGATA+TGG + contig240end:292267-292286 None:intergenic 35.0%
CTTGTTAGCATTTCTATACC+GGG + contig240end:294600-294619 None:intergenic 35.0%
GAAATTCATAGGATGTTGGT+GGG - contig240end:292669-292688 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
GAGAATGTTTATCGAAGGTA+AGG - contig240end:293448-293467 MsG0080048206.01.T01:CDS 35.0%
GCACAATTTGATATGTTTGG+TGG - contig240end:294721-294740 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
GCTATTTGAAAGAAACCACT+TGG - contig240end:292751-292770 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
GGAATTGCTTATTTGCATCA+AGG - contig240end:296152-296171 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
GGATACGGTAAGGTTTATAA+GGG - contig240end:295852-295871 MsG0080048206.01.T01:CDS 35.0%
GGATCATTCTTAAGTCGAAA+CGG + contig240end:292024-292043 None:intergenic 35.0%
GTCTCATCATATGGCATTAT+GGG - contig240end:295031-295050 MsG0080048206.01.T01:CDS 35.0%
GTTTATGATTTCATGCCCAA+TGG - contig240end:296041-296060 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
TAAGTAATAGTGAGGAATGG+TGG + contig240end:292199-292218 None:intergenic 35.0%
TAATATGTTGAGGTGAGGAA+GGG - contig240end:294536-294555 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
TAATCTATGTAGAACAACGC+TGG - contig240end:292797-292816 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
TATTGTGAGTGACATGTTGA+AGG - contig240end:290848-290867 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
TCAAGGACATGAAAGGTAAA+GGG - contig240end:294226-294245 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
TCAATGAAAGTCAAGAACGA+TGG - contig240end:291720-291739 MsG0080048206.01.T01:CDS 35.0%
TCGTAAAAAAAGTGAGGTCA+GGG + contig240end:295180-295199 None:intergenic 35.0%
TCGTAACCTTCCATTCATAT+GGG + contig240end:292629-292648 None:intergenic 35.0%
TCTATTACTCTGTCCATTGA+AGG + contig240end:296617-296636 None:intergenic 35.0%
TGAAATTCATAGGATGTTGG+TGG - contig240end:292668-292687 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
TGAATACCTAATTGGTAGGA+GGG + contig240end:295778-295797 None:intergenic 35.0%
TGTCTCATCATATGGCATTA+TGG - contig240end:295030-295049 MsG0080048206.01.T01:CDS 35.0%
TTACAATTTGTGGAAGAGAG+CGG + contig240end:291642-291661 None:intergenic 35.0%
TTCGATAAACATTCTCAGCT+TGG + contig240end:293444-293463 None:intergenic 35.0%
TTCGTAACCTTCCATTCATA+TGG + contig240end:292630-292649 None:intergenic 35.0%
TTCTACGTTACGTCATCTAA+AGG - contig240end:290992-291011 MsG0080048206.01.T01:CDS 35.0%
TTTAAGGAAAAGTTGGGTGA+AGG - contig240end:295828-295847 MsG0080048206.01.T01:CDS 35.0%
TTTCACTGCATAGAAGTTTG+GGG - contig240end:294252-294271 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
TTTGCTGGGTTACTTGATTA+TGG - contig240end:294320-294339 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
! ATTTTACCACATGAAGAAGG+TGG + contig240end:291985-292004 None:intergenic 35.0%
! CTTGTTGGATTTTGTGTTGA+GGG - contig240end:296002-296021 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
! GCAACTTTAACTTTGTTGTC+CGG - contig240end:292093-292112 MsG0080048206.01.T01:CDS 35.0%
! GGCAATTTTGTCTCATCATA+TGG - contig240end:295022-295041 MsG0080048206.01.T01:CDS 35.0%
! GGTGTGATGTATTTTTCCTA+TGG + contig240end:295970-295989 None:intergenic 35.0%
! TAAGATTCAACTCTGGGAAA+GGG - contig240end:294907-294926 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
! TACATTGTCGATTAATCGAG+AGG - contig240end:294396-294415 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
! TTATCAGATGATGATGTCAC+CGG - contig240end:296737-296756 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
! TTCGAAGGTTTTACGAACAT+AGG - contig240end:294354-294373 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
! TTTGAAGTTTCTTGGATGAC+TGG - contig240end:292696-292715 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
! TTTTCTCTGCACATGATTGA+TGG + contig240end:291862-291881 None:intergenic 35.0%
!! AAGGAGTGTTCACTATTAGA+AGG + contig240end:296926-296945 MsG0080048207.01.T01:CDS 35.0%
!! ACTTGTTGGATTTTGTGTTG+AGG - contig240end:296001-296020 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
!! AGAGGCTTTAAGGAAAAGTT+GGG - contig240end:295822-295841 MsG0080048206.01.T01:CDS 35.0%
!! AGGAGTGTTCACTATTAGAA+GGG + contig240end:296925-296944 MsG0080048207.01.T01:CDS 35.0%
!! ATTTGATATGTTTGGTGGTG+TGG - contig240end:294726-294745 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
!! TAGCTTTGGAATGCTCTTAA+TGG - contig240end:296391-296410 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
!! TGGATTTCACTTTAGAGCTA+CGG + contig240end:291825-291844 None:intergenic 35.0%
!! TTTGATATGTTTGGTGGTGT+GGG - contig240end:294727-294746 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
!! TTTGGTGGTTTGTGGTATTT+TGG - contig240end:294559-294578 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
!!! CTGGGAAAGGGTTTTTTTTT+AGG - contig240end:294919-294938 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
!!! GAGTTTGGGAATTTTGAGTT+TGG - contig240end:293579-293598 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
!!! TTGGGAATTTTGAGTTTGGT+CGG - contig240end:293583-293602 MsG0080048206.01.T01:intron 35.0%
AAAATATACCGCCCAAAGAC+GGG - contig240end:291360-291379 MsG0080048206.01.T01:CDS 40.0%
AACAAGTCGAATTCTCAAGG+TGG - contig240end:292444-292463 MsG0080048206.01.T01:intron 40.0%
AACCAGGTAAGATTCAACTC+TGG - contig240end:294900-294919 MsG0080048206.01.T01:intron 40.0%
AAGAAGGTGGACAATTTGTC+TGG + contig240end:291972-291991 None:intergenic 40.0%
AAGAATGATCCAACAACCTG+TGG - contig240end:292033-292052 MsG0080048206.01.T01:CDS 40.0%
AATTGTCCACCTTCTTCATG+TGG - contig240end:291976-291995 MsG0080048206.01.T01:CDS 40.0%
ACCAGGTAAGATTCAACTCT+GGG - contig240end:294901-294920 MsG0080048206.01.T01:intron 40.0%
ACGACAGTTTCCCATATGAA+TGG - contig240end:292616-292635 MsG0080048206.01.T01:intron 40.0%
ACGTCGGAAAATGATTCGAT+CGG - contig240end:294199-294218 MsG0080048206.01.T01:CDS 40.0%
ACTCCACAATGATCTTGACA+AGG + contig240end:292723-292742 None:intergenic 40.0%
ATATGCACCAGCTCTTACTT+TGG - contig240end:292311-292330 MsG0080048206.01.T01:intron 40.0%
ATCAAGTTCACGTCAATAGG+AGG - contig240end:294469-294488 MsG0080048206.01.T01:intron 40.0%
ATTCCCAAACTCTCTTATCC+GGG + contig240end:293571-293590 None:intergenic 40.0%
ATTGCTATGTGAATGCCAGT+TGG + contig240end:295251-295270 None:intergenic 40.0%
CAAGGACATGAAAGGTAAAG+GGG - contig240end:294227-294246 MsG0080048206.01.T01:intron 40.0%
CAGTTTCCCATATGAATGGA+AGG - contig240end:292620-292639 MsG0080048206.01.T01:intron 40.0%
CATAGGCAAGCAAAACAATG+TGG - contig240end:293789-293808 MsG0080048206.01.T01:intron 40.0%
CATCATATGGCATTATGGGT+TGG - contig240end:295035-295054 MsG0080048206.01.T01:CDS 40.0%
CATTTGCGATGTCACGTTTA+TGG + contig240end:294034-294053 None:intergenic 40.0%
CCATTGAAGGACGATCAATA+GGG + contig240end:296604-296623 None:intergenic 40.0%
CCTCAGAGCTGTAGTTATAA+CGG + contig240end:292560-292579 None:intergenic 40.0%
CTTTGGTCAACAACAGATAC+GGG - contig240end:294690-294709 MsG0080048206.01.T01:intron 40.0%
GACAACGTTTATTGTGCAAC+TGG - contig240end:294875-294894 MsG0080048206.01.T01:intron 40.0%
GAGATAAAGAAGATGACGAG+AGG - contig240end:295804-295823 MsG0080048206.01.T01:CDS 40.0%
GGAAATATGGTCTTCTCTAG+AGG + contig240end:296087-296106 None:intergenic 40.0%
GTGACAATGCTATTGTCAAC+TGG + contig240end:296281-296300 None:intergenic 40.0%
TAATCATGATGACTGTCACG+TGG - contig240end:292509-292528 MsG0080048206.01.T01:intron 40.0%
TAGGTGTGTGATGTCAATTG+AGG - contig240end:294373-294392 MsG0080048206.01.T01:intron 40.0%
TATAAGGGAAAGCTTCGTAG+TGG - contig240end:295867-295886 MsG0080048206.01.T01:CDS 40.0%
TATTGTGCAACTGGTAAACC+AGG - contig240end:294884-294903 MsG0080048206.01.T01:intron 40.0%
TCCATTGAAGGACGATCAAT+AGG + contig240end:296605-296624 None:intergenic 40.0%
TCGATCAAGTTCACGTCAAT+AGG - contig240end:294466-294485 MsG0080048206.01.T01:intron 40.0%
TCGTACGAAAACTTTCCATC+AGG + contig240end:292594-292613 None:intergenic 40.0%
TCTGTTGTTGACCAAAGTAC+AGG + contig240end:294687-294706 None:intergenic 40.0%
TGAATGCCAGTTGGACAATT+TGG + contig240end:295242-295261 None:intergenic 40.0%
TTGGAAGGTTTCACGATCTA+GGG - contig240end:294276-294295 MsG0080048206.01.T01:intron 40.0%
TTTCTCGCAGGTATTACGTA+CGG - contig240end:295435-295454 MsG0080048206.01.T01:CDS 40.0%
TTTGGAAGGTTTCACGATCT+AGG - contig240end:294275-294294 MsG0080048206.01.T01:intron 40.0%
! AAGACCAAAGTCTGAAACCT+TGG + contig240end:296246-296265 None:intergenic 40.0%
! ACAATTCGGTTAGTTGATCC+CGG - contig240end:292153-292172 MsG0080048206.01.T01:CDS 40.0%
! ATAGAAGTTTGGGGTTTGGA+AGG - contig240end:294261-294280 MsG0080048206.01.T01:intron 40.0%
! ATGTGATGAGTTTGAGACGT+CGG - contig240end:294183-294202 MsG0080048206.01.T01:CDS 40.0%
! GCTATTGGAATAGGTTTGCT+GGG - contig240end:294306-294325 MsG0080048206.01.T01:intron 40.0%
! GTAAGATTCAACTCTGGGAA+AGG - contig240end:294906-294925 MsG0080048206.01.T01:intron 40.0%
! GTTGGATATGGAGAAGGTTT+TGG + contig240end:296677-296696 None:intergenic 40.0%
! TGATGGAAAGTTTTCGTACG+AGG - contig240end:292593-292612 MsG0080048206.01.T01:intron 40.0%
! TTTAATTTCCCGTCTTTGGG+CGG + contig240end:291371-291390 None:intergenic 40.0%
! TTTCATGTTGGTTGTGTCAC+TGG - contig240end:292822-292841 MsG0080048206.01.T01:intron 40.0%
!! ATAACTACAGCTCTGAGGAT+TGG - contig240end:292562-292581 MsG0080048206.01.T01:intron 40.0%
!! GAGAGGCTTTAAGGAAAAGT+TGG - contig240end:295821-295840 MsG0080048206.01.T01:CDS 40.0%
!! GCCGTTTTATGCTATTGACA+TGG + contig240end:291196-291215 None:intergenic 40.0%
!! TAAACGAAAGGGGCATTCAA+AGG - contig240end:290764-290783 MsG0080048206.01.T01:intron 40.0%
!!! TGGGTGGTTTTGAAGTTTCT+TGG - contig240end:292688-292707 MsG0080048206.01.T01:intron 40.0%
AACCTTCAAATCCCCAGCAA+TGG + contig240end:292481-292500 None:intergenic 45.0%
AAGAATATACGGTGGAGCTG+AGG - contig240end:295569-295588 MsG0080048206.01.T01:CDS 45.0%
AAGGAAAAGTTGGGTGAAGG+AGG - contig240end:295831-295850 MsG0080048206.01.T01:CDS 45.0%
AAGGCCGATGTGTATAGCTT+TGG - contig240end:296377-296396 MsG0080048206.01.T01:intron 45.0%
AAGTTGGGTGAAGGAGGATA+CGG - contig240end:295837-295856 MsG0080048206.01.T01:CDS 45.0%
ACAAAGGGACATTGGTGTAG+TGG + contig240end:297033-297052 MsG0080048207.01.T01:CDS 45.0%
ACTGTGCCAAATTGTCCAAC+TGG - contig240end:295233-295252 MsG0080048206.01.T01:CDS 45.0%
AGAACTGCCAAAGTAAGAGC+TGG + contig240end:292321-292340 None:intergenic 45.0%
AGAATATACGGTGGAGCTGA+GGG - contig240end:295570-295589 MsG0080048206.01.T01:CDS 45.0%
AGTTGATCCCGGAATTGAAG+AGG - contig240end:292164-292183 MsG0080048206.01.T01:CDS 45.0%
ATCGCCAAGGTTTCAGACTT+TGG - contig240end:296239-296258 MsG0080048206.01.T01:intron 45.0%
ATGATTCGATCGGGAGATCA+AGG - contig240end:294209-294228 MsG0080048206.01.T01:intron 45.0%
ATTACGTACGGAATTGCCCA+AGG - contig240end:295447-295466 MsG0080048206.01.T01:CDS 45.0%
ATTGCTGGGGATTTGAAGGT+TGG - contig240end:292480-292499 MsG0080048206.01.T01:intron 45.0%
ATTGGGAGAAGCTACCAATG+AGG - contig240end:296523-296542 MsG0080048206.01.T01:intron 45.0%
CAATCACCCTCTTCAATTCC+GGG + contig240end:292174-292193 None:intergenic 45.0%
CCATGTTTATGCCATTGCTG+GGG - contig240end:292467-292486 MsG0080048206.01.T01:intron 45.0%
CCCTATTGATCGTCCTTCAA+TGG - contig240end:296601-296620 MsG0080048206.01.T01:intron 45.0%
CCGTTATAACTACAGCTCTG+AGG - contig240end:292557-292576 MsG0080048206.01.T01:intron 45.0%
CGTCGGAAAATGATTCGATC+GGG - contig240end:294200-294219 MsG0080048206.01.T01:CDS 45.0%
CGTCGTCAATGTTGGATATC+CGG + contig240end:291258-291277 None:intergenic 45.0%
CTTACCTAGGGTAACTGTGT+CGG - contig240end:294094-294113 MsG0080048206.01.T01:intron 45.0%
GAAGATGACGAGAGGCTTTA+AGG - contig240end:295812-295831 MsG0080048206.01.T01:CDS 45.0%
GAATTGTAGCAGTCCTGTGA+GGG - contig240end:292386-292405 MsG0080048206.01.T01:intron 45.0%
GCAATCACCCTCTTCAATTC+CGG + contig240end:292175-292194 None:intergenic 45.0%
GCAATCACTATAGAGGGGTA+TGG - contig240end:294116-294135 MsG0080048206.01.T01:intron 45.0%
GCCATGTTTATGCCATTGCT+GGG - contig240end:292466-292485 MsG0080048206.01.T01:intron 45.0%
GCTTAAGACAATGCCACTCT+AGG + contig240end:293825-293844 None:intergenic 45.0%
GCTTCGTTTGTCTCATGTGT+TGG - contig240end:295087-295106 MsG0080048206.01.T01:CDS 45.0%
GGAATTCCCTCCTACCAATT+AGG - contig240end:295769-295788 MsG0080048206.01.T01:CDS 45.0%
GGCTATTGGAATAGGTTTGC+TGG - contig240end:294305-294324 MsG0080048206.01.T01:intron 45.0%
GGTCCTTGTCAAGATCATTG+TGG - contig240end:292717-292736 MsG0080048206.01.T01:intron 45.0%
GGTGAGGGAGTAATTGATGA+GGG - contig240end:294777-294796 MsG0080048206.01.T01:intron 45.0%
GGTTTCGTGGCTATTGGAAT+AGG - contig240end:294297-294316 MsG0080048206.01.T01:intron 45.0%
GTTACCCTAGGTAAGACCTA+TGG + contig240end:294089-294108 None:intergenic 45.0%
GTTGATCCCGGAATTGAAGA+GGG - contig240end:292165-292184 MsG0080048206.01.T01:CDS 45.0%
TCCCAGAGTTGAATCTTACC+TGG + contig240end:294905-294924 None:intergenic 45.0%
TGAATTGTAGCAGTCCTGTG+AGG - contig240end:292385-292404 MsG0080048206.01.T01:intron 45.0%
TGACAAAGACTTCATCGCCA+AGG - contig240end:296226-296245 MsG0080048206.01.T01:intron 45.0%
TGACCCGGATAAGAGAGTTT+GGG - contig240end:293565-293584 MsG0080048206.01.T01:intron 45.0%
TGTCGGCAATCACTATAGAG+GGG - contig240end:294111-294130 MsG0080048206.01.T01:intron 45.0%
! ACAACGCTGGGTTTTCATGT+TGG - contig240end:292810-292829 MsG0080048206.01.T01:intron 45.0%
! ACGTCAATAGGAGGCTTTGA+TGG - contig240end:294478-294497 MsG0080048206.01.T01:intron 45.0%
! ATCTAGGGTTTCGTGGCTAT+TGG - contig240end:294291-294310 MsG0080048206.01.T01:intron 45.0%
! ATTCATAGGATGTTGGTGGG+TGG - contig240end:292672-292691 MsG0080048206.01.T01:intron 45.0%
! CTGCATAGAAGTTTGGGGTT+TGG - contig240end:294257-294276 MsG0080048206.01.T01:intron 45.0%
! GAGAGGCATGCCTAAGATTA+AGG + contig240end:294424-294443 None:intergenic 45.0%
! GCTATACACATCGGCCTTAT+AGG + contig240end:296375-296394 None:intergenic 45.0%
! GTGTCGGCAATCACTATAGA+GGG - contig240end:294110-294129 MsG0080048206.01.T01:intron 45.0%
! TGATGGTGAAGAGTGAAGAC+TGG + contig240end:291845-291864 None:intergenic 45.0%
! TGTGTCGGCAATCACTATAG+AGG - contig240end:294109-294128 MsG0080048206.01.T01:intron 45.0%
! TTTCACGATCTAGGGTTTCG+TGG - contig240end:294284-294303 MsG0080048206.01.T01:intron 45.0%
!! AAAGCTTCGTAGTGGACCTT+TGG - contig240end:295875-295894 MsG0080048206.01.T01:CDS 45.0%
!! GGATATGGAGAAGGTTTTGG+AGG + contig240end:296674-296693 None:intergenic 45.0%
!!! AGTTGCGATGTTGTTTTCGC+AGG + contig240end:292079-292098 None:intergenic 45.0%
!!! CAGGTTTTGAGGGAAACTCA+AGG - contig240end:290715-290734 MsG0080048206.01.T01:intron 45.0%
!! TTAAATATAGTAATATTTAA+AGG + contig240end:291231-291250 None:intergenic 5.0%
!!! ATACTTATTTTTATTTTTTT+TGG + contig240end:293086-293105 None:intergenic 5.0%
AACTCTCTTATCCGGGTCAC+TGG + contig240end:293564-293583 None:intergenic 50.0%
ACCAATGTGGTGCGACTTGT+TGG - contig240end:295987-296006 MsG0080048206.01.T01:intron 50.0%
ACGGCTGCAAGAGGAACAAT+TGG - contig240end:296305-296324 MsG0080048206.01.T01:intron 50.0%
AGAGAGAGAGAGAGAGAGAG+GGG - contig240end:294062-294081 MsG0080048206.01.T01:intron 50.0%
AGGCATGCCTCTCGATAACA+GGG - contig240end:294431-294450 MsG0080048206.01.T01:intron 50.0%
ATGTTTACCCTCCAGTGACC+CGG - contig240end:293550-293569 MsG0080048206.01.T01:intron 50.0%
ATTGCCGACACAGTTACCCT+AGG + contig240end:294101-294120 None:intergenic 50.0%
CAACACTCCCTGTTATCGAG+AGG + contig240end:294441-294460 None:intergenic 50.0%
CCCCAGCAATGGCATAAACA+TGG + contig240end:292470-292489 None:intergenic 50.0%
CGGGAGATCAAGGACATGAA+AGG - contig240end:294219-294238 MsG0080048206.01.T01:intron 50.0%
CGGTGAGGGAGTAATTGATG+AGG - contig240end:294776-294795 MsG0080048206.01.T01:intron 50.0%
GACTTTGGCGTCGTCAATGT+TGG + contig240end:291266-291285 None:intergenic 50.0%
GAGAGAGAGAGAGAGAGAGA+GGG - contig240end:294061-294080 MsG0080048206.01.T01:intron 50.0%
GCAGGACTACTACGTGCAAT+GGG - contig240end:295543-295562 MsG0080048206.01.T01:CDS 50.0%
GGCCATGTTTATGCCATTGC+TGG - contig240end:292465-292484 MsG0080048206.01.T01:intron 50.0%
GTCGCATTCAAGACTCCAAG+TGG + contig240end:292769-292788 None:intergenic 50.0%
GTGACCCGGATAAGAGAGTT+TGG - contig240end:293564-293583 MsG0080048206.01.T01:intron 50.0%
TAGGCATGCCTCTCGATAAC+AGG - contig240end:294430-294449 MsG0080048206.01.T01:intron 50.0%
TCCAACAAGTCGCACCACAT+TGG + contig240end:295991-296010 None:intergenic 50.0%
TCGCAGGATAACTCGTACCT+CGG + contig240end:292063-292082 None:intergenic 50.0%
TGAGAGAGAGAGAGAGAGAG+AGG - contig240end:294060-294079 MsG0080048206.01.T01:intron 50.0%
TGCAGGACTACTACGTGCAA+TGG - contig240end:295542-295561 MsG0080048206.01.T01:CDS 50.0%
TGCCATTGCTGGGGATTTGA+AGG - contig240end:292476-292495 MsG0080048206.01.T01:intron 50.0%
TGGTGTGGGTACGACTATGA+CGG - contig240end:294741-294760 MsG0080048206.01.T01:intron 50.0%
TGTTGAGGTGAGGAAGGGTT+TGG - contig240end:294541-294560 MsG0080048206.01.T01:intron 50.0%
! GAGGATTGGCATACTCCTGA+TGG - contig240end:292576-292595 MsG0080048206.01.T01:intron 50.0%
! GTCACTTTAACGGCTGCAAG+AGG - contig240end:296296-296315 MsG0080048206.01.T01:intron 50.0%
! TACGACTATGACGGAGATGG+AGG - contig240end:294750-294769 MsG0080048206.01.T01:intron 50.0%
! TATGACGGAGATGGAGGAAG+CGG - contig240end:294756-294775 MsG0080048206.01.T01:intron 50.0%
!! AGGAAGGGTTTGGTGGTTTG+TGG - contig240end:294551-294570 MsG0080048206.01.T01:intron 50.0%
!! TCGAGAGGCGCCTTAATCTT+AGG - contig240end:294411-294430 MsG0080048206.01.T01:intron 50.0%
CAACAACCTGTGGTGATCCG+AGG - contig240end:292043-292062 MsG0080048206.01.T01:CDS 55.0%
CAGTCCTGTGAGGGATGATC+CGG - contig240end:292395-292414 MsG0080048206.01.T01:intron 55.0%
CTCGGATCACCACAGGTTGT+TGG + contig240end:292045-292064 None:intergenic 55.0%
CTCTTATCCGGGTCACTGGA+GGG + contig240end:293560-293579 None:intergenic 55.0%
GAAGCTGCATCCGCATACAC+CGG + contig240end:292417-292436 None:intergenic 55.0%
GAGAGAGAGAGAGAGAGAGG+GGG - contig240end:294063-294082 MsG0080048206.01.T01:intron 55.0%
GAGGGATGATCCGGTGTATG+CGG - contig240end:292404-292423 MsG0080048206.01.T01:intron 55.0%
GGGGCCATAGGTCTTACCTA+GGG - contig240end:294082-294101 MsG0080048206.01.T01:intron 55.0%
GGGTGAAGGAGGATACGGTA+AGG - contig240end:295842-295861 MsG0080048206.01.T01:CDS 55.0%
TACACCGGATCATCCCTCAC+AGG + contig240end:292402-292421 None:intergenic 55.0%
TCTCTTATCCGGGTCACTGG+AGG + contig240end:293561-293580 None:intergenic 55.0%
TGAGGTGAGGAAGGGTTTGG+TGG - contig240end:294544-294563 MsG0080048206.01.T01:intron 55.0%
TGGCAAGCGTATGTGTGTCC+CGG - contig240end:294579-294598 MsG0080048206.01.T01:intron 55.0%
TGGCTCACTCTTGCCTAGAG+TGG - contig240end:293809-293828 MsG0080048206.01.T01:intron 55.0%
! GGGTACGACTATGACGGAGA+TGG - contig240end:294747-294766 MsG0080048206.01.T01:intron 55.0%
AGAGAGAGAGAGGGGGCCAT+AGG - contig240end:294070-294089 MsG0080048206.01.T01:intron 60.0%
CTCGTACCTCGGATCACCAC+AGG + contig240end:292052-292071 None:intergenic 60.0%
GGAGATGGAGGAAGCGGTGA+GGG - contig240end:294762-294781 MsG0080048206.01.T01:intron 60.0%
GGGGGCCATAGGTCTTACCT+AGG - contig240end:294081-294100 MsG0080048206.01.T01:intron 60.0%
GTGGAAGAGAGCGGTCTTGC+CGG + contig240end:291633-291652 None:intergenic 60.0%
CGGAGATGGAGGAAGCGGTG+AGG - contig240end:294761-294780 MsG0080048206.01.T01:intron 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
contig240end gene 290687 297103 290687 ID=MsG0080048206.01;Name=MsG0080048206.01
contig240end mRNA 290687 297103 290687 ID=MsG0080048206.01.T01;Parent=MsG0080048206.01;Name=MsG0080048206.01.T01;_AED=0.34;_eAED=0.34;_QI=0|0.37|0.44|0.66|0.25|0.22|9|148|852
contig240end exon 290687 290706 290687 ID=MsG0080048206.01.T01:exon:8658;Parent=MsG0080048206.01.T01
contig240end exon 290851 292243 290851 ID=MsG0080048206.01.T01:exon:8657;Parent=MsG0080048206.01.T01
contig240end exon 292322 292345 292322 ID=MsG0080048206.01.T01:exon:8656;Parent=MsG0080048206.01.T01
contig240end exon 293291 293338 293291 ID=MsG0080048206.01.T01:exon:8655;Parent=MsG0080048206.01.T01
contig240end exon 293415 293493 293415 ID=MsG0080048206.01.T01:exon:8654;Parent=MsG0080048206.01.T01
contig240end exon 294182 294225 294182 ID=MsG0080048206.01.T01:exon:8653;Parent=MsG0080048206.01.T01
contig240end exon 294326 294358 294326 ID=MsG0080048206.01.T01:exon:8652;Parent=MsG0080048206.01.T01
contig240end exon 294947 295962 294947 ID=MsG0080048206.01.T01:exon:8651;Parent=MsG0080048206.01.T01
contig240end exon 297054 297103 297054 ID=MsG0080048206.01.T01:exon:8650;Parent=MsG0080048206.01.T01
contig240end CDS 297054 297103 297054 ID=MsG0080048206.01.T01:cds;Parent=MsG0080048206.01.T01
contig240end CDS 294947 295962 294947 ID=MsG0080048206.01.T01:cds;Parent=MsG0080048206.01.T01
contig240end CDS 294326 294358 294326 ID=MsG0080048206.01.T01:cds;Parent=MsG0080048206.01.T01
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contig240end CDS 293415 293493 293415 ID=MsG0080048206.01.T01:cds;Parent=MsG0080048206.01.T01
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contig240end CDS 290979 292243 290979 ID=MsG0080048206.01.T01:cds;Parent=MsG0080048206.01.T01
contig240end three_prime_UTR 290851 290978 290851 ID=MsG0080048206.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0080048206.01.T01
contig240end three_prime_UTR 290687 290706 290687 ID=MsG0080048206.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0080048206.01.T01
Gene Sequence

>MsG0080048206.01.T01

ATGTCACTGATAAGGAATTTTTTTGATACAGGTTTTGAGGGAAACTCAAGCTCTAAAGTGAAATCCAGTCTTCACTCTTCACCATCAATCATGTGCAGAGAAAAATCATTCTTATTCTTAATCCAAATTATTGTAGTAGTGCTACTACTGCATCAGCATCAAACATGTGATGCAATTACAAATAGTAATAACCAGACAAATTGTCCACCTTCTTCATGTGGTAAAATCAACAACATAAAATATCCGTTTCGACTTAAGAATGATCCAACAACCTGTGGTGATCCGAGGTACGAGTTATCCTGCGAAAACAACATCGCAACTTTAACTTTGTTGTCCGGTAAATACTATGTGAAATCAATCAACTACAATAACTACACAATTCGGTTAGTTGATCCCGGAATTGAAGAGGGTGATTGCTCCACCATTCCTCACTATTACTTATACAATTATAATTTCACCAGCTCTTATATCTACGATTCTGTTGATCCATATCAAACTTACCAGAGAAGAATAGTTGATACTACTATATATAAATATGCACCAGCTCTTACTTTGGCAGTTCTTAGAAGTCCTCAATCATTACAAATGTTTCAGCACGTAATTTACATGAATTGTAGCAGTCCTGTGAGGGATGATCCGGTGTATGCGGATGCAGCTTCTTGCATGAACAAGTCGAATTCTCAAGGTGGCCATGTTTATGCCATTGCTGGGGATTTGAAGGTTGGAAACTATAATCATGATGACTGTCACGTGGAGCTTGTTACGCCGATATCTTTTTTCCGTTATAACTACAGCTCTGAGGATTGGCATACTCCTGATGGAAAGTTTTCGTACGAGGACGACAGTTTCCCATATGAATGGAAGGTTACGAATCAAATGTTTGATTACAGTGAAATTCATAGGATGTTGGTGGGTGGTTTTGAAGTTTCTTGGATGACTGGTCCTTGTCAAGATCATTGTGGAGTTCCAGATTGCTATTTGAAAGAAACCACTTGGAGTCTTGAATGCGACGATCCGTCTAATCTATGTAGAACAACGCTGGGTTTTCATGTTGGTTGTGTCACTGGAACTCCATCCAAGCTGAGAATGTTTATCGAAGTGACCCGGATAAGAGAGTTTGGGAATTTTGAGTTTGGTCGGAATGGTTTCGTGGCTATTGGAATAGGTTTGCTGGGTTACTTGATTATGGTTAAACACAGATTCGAAGGTTTTACGAACATAGGGAGTGTTGAAGACTCGATCAAGTTCACGTCAATAGGAGGCTTTGATGGTATTACGTACGGAATTGCCCAAGGACTACTACGTGCAATGGGTATAAGAATATACGGTGGAGCTGAGGGATTTTCTGACTCTAAATTTGGTCTTGACATAGGAAATATCTTTGGAAGGTATATTTTGTCATCATACATTGTAGTTAGATGTGTGTTAGGTCTCATAGTTTTCTTTGCAAAATTGATACATACATATCGAGCACGACATACATCAATGTATGAAAACATCGAAGATTTTCTTCAAGGGAATTCCCTCCTACCAATTAGGTATTCATACAAAGAGATAAAGAAGATGACGAGAGGCTTTAAGGAAAAGTTGGGTGAAGGAGGATACGGTAAGGTTTATAAGGGAAAGCTTCGTAGTGGACCTTTGGTAGCCATAAAAATGTTGGGTAAACTTAAGGGAAATAGAAATGGGCAAGATTTCATTAATGAAGTTGCAACCATAGGAAAAATACATCACACCAATGTGGTGCGACTTGTTGGATTTTGTGTTGAGGGATCAAAACGTGCTCTTGTTTATGATTTCATGCCCAATGGCTCTCTTGATAAATATATTTCCTCTAGAGAAGACCATATTTCCTTAACTTACAAGCAAATGTACGAGATATCTATTGGAATTGCACGTGGAATTGCTTATTTGCATCAAGGTTGTGACATGCAAATTTTACATTTTGATATCAAGCCTCATAACATTCTTCTTGACAAAGACTTCATCGCCAAGGTTTCAGACTTTGGTCTTGCAAAACTTTATCCAGTTGACAATAGCATTGTCACTTTAACGGCTGCAAGAGGAACAATTGGTTACATGGCACCAGAATTGTTCTACAAAAATATTGGTAAAGTTTCCTATAAGGCCGATGTGTATAGCTTTGGAATGCTCTTAATGGAAATAGCAAATAGGAGAAGAAATTTGAACTCAAATGCAGATGATTCAGACCAAATTTTCTTTCCCTATTGGATTTACAACGAATTGATTGAAGAAAGGGAGATAGAAATATTGGGAGAAGCTACCAATGAGGAAAAGAAAAATGTGAAGAAAATGTTCATAATTGCTTTGTGGTGTATACAATTGAACCCTATTGATCGTCCTTCAATGGACAGAGTAATAGAAATGCTCGAAGGAGATATTGAAGACATTGAAATTCCTCCAAAACCTTCTCCATATCCAACTGAAATTATTCAAGATAATGAAGTTAGCTCTAATGAATCTTTATCAGATGATGATGTCACCGGTTCAATTAGTTTTATTGAGGAAACCGTAGAAGATCCTTTACTATATACCTAA
Protein sequence

>MsG0080048206.01.T01

MSLIRNFFDTGFEGNSSSKVKSSLHSSPSIMCREKSFLFLIQIIVVVLLLHQHQTCDAITNSNNQTNCPPSSCGKINNIKYPFRLKNDPTTCGDPRYELSCENNIATLTLLSGKYYVKSINYNNYTIRLVDPGIEEGDCSTIPHYYLYNYNFTSSYIYDSVDPYQTYQRRIVDTTIYKYAPALTLAVLRSPQSLQMFQHVIYMNCSSPVRDDPVYADAASCMNKSNSQGGHVYAIAGDLKVGNYNHDDCHVELVTPISFFRYNYSSEDWHTPDGKFSYEDDSFPYEWKVTNQMFDYSEIHRMLVGGFEVSWMTGPCQDHCGVPDCYLKETTWSLECDDPSNLCRTTLGFHVGCVTGTPSKLRMFIEVTRIREFGNFEFGRNGFVAIGIGLLGYLIMVKHRFEGFTNIGSVEDSIKFTSIGGFDGITYGIAQGLLRAMGIRIYGGAEGFSDSKFGLDIGNIFGRYILSSYIVVRCVLGLIVFFAKLIHTYRARHTSMYENIEDFLQGNSLLPIRYSYKEIKKMTRGFKEKLGEGGYGKVYKGKLRSGPLVAIKMLGKLKGNRNGQDFINEVATIGKIHHTNVVRLVGFCVEGSKRALVYDFMPNGSLDKYISSREDHISLTYKQMYEISIGIARGIAYLHQGCDMQILHFDIKPHNILLDKDFIAKVSDFGLAKLYPVDNSIVTLTAARGTIGYMAPELFYKNIGKVSYKADVYSFGMLLMEIANRRRNLNSNADDSDQIFFPYWIYNELIEEREIEILGEATNEEKKNVKKMFIIALWCIQLNPIDRPSMDRVIEMLEGDIEDIEIPPKPSPYPTEIIQDNEVSSNESLSDDDVTGSISFIEETVEDPLLYT*