AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180000931.01

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MsG0180000931.01.T01 AT1G67520 37.134 307 174 9 24 318 276 575 1.87e-51 180
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MsG0180000931.01.T01 AT2G42960 36.519 293 172 7 24 308 171 457 1.22e-50 176
MsG0180000931.01.T01 AT2G42960 36.519 293 172 7 24 308 171 457 1.22e-50 176
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MsG0180000931.01.T01 AT3G25560 35.593 295 174 8 23 309 299 585 1.54e-50 178
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MsG0180000931.01.T01 AT1G67520 37.134 307 174 9 24 318 491 790 1.99e-50 180
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MsG0180000931.01.T01 AT5G01540 37.097 310 172 10 10 308 341 638 8.58e-50 177
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MsG0180000931.01.T01 AT1G61360 34.940 332 199 8 24 345 405 729 1.01e-48 174
MsG0180000931.01.T01 AT1G61420 36.213 301 181 7 24 318 332 627 1.03e-48 174
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MsG0180000931.01.T01 AT1G61490 37.624 303 174 9 24 318 328 623 1.92e-48 173
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MsG0180000931.01.T01 AT4G05200 34.983 303 179 9 23 315 334 628 2.10e-48 173
MsG0180000931.01.T01 AT1G61550 37.209 301 178 7 24 318 477 772 2.56e-48 174
MsG0180000931.01.T01 AT5G56890 34.343 297 182 6 19 306 706 998 2.66e-48 175
MsG0180000931.01.T01 AT5G35960 35.179 307 168 9 21 313 118 407 2.79e-48 168
MsG0180000931.01.T01 AT1G07650 35.065 308 187 7 19 318 635 937 3.64e-48 174
MsG0180000931.01.T01 AT1G65800 36.824 296 173 8 33 318 520 811 3.96e-48 174
MsG0180000931.01.T01 AT1G07650 35.065 308 187 7 19 318 667 969 4.08e-48 174
MsG0180000931.01.T01 AT4G23180 42.478 226 124 4 23 245 335 557 4.13e-48 171
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MsG0180000931.01.T01 AT1G61420 36.213 301 181 7 24 318 484 779 4.31e-48 173
MsG0180000931.01.T01 AT5G15730 34.965 286 170 7 23 305 103 375 4.46e-48 168
MsG0180000931.01.T01 AT5G15730 34.965 286 170 7 23 305 103 375 4.46e-48 168
MsG0180000931.01.T01 AT5G15730 34.965 286 168 7 23 305 103 373 4.47e-48 168
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MsG0180000931.01.T01 AT1G70130 37.710 297 166 11 21 307 319 606 5.38e-48 171
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MsG0180000931.01.T01 AT5G54590 33.788 293 164 8 24 305 103 376 1.65e-46 164
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MsG0180000931.01.T01 AT4G03230 35.161 310 192 6 15 318 512 818 1.83e-46 169
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MsG0180000931.01.T01 AT1G55610 35.017 297 180 9 20 306 842 1135 2.44e-46 169
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MsG0180000931.01.T01 AT4G03230 35.161 310 192 6 15 318 669 975 2.59e-46 169
MsG0180000931.01.T01 AT1G61440 35.783 313 182 9 24 326 471 774 3.00e-46 168
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MsG0180000931.01.T01 AT1G61440 35.783 313 182 9 24 326 466 769 3.16e-46 168
MsG0180000931.01.T01 AT4G04540 41.150 226 126 5 23 245 340 561 3.62e-46 166
MsG0180000931.01.T01 AT3G24790 36.301 292 171 9 24 305 35 321 3.83e-46 161
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MsG0180000931.01.T01 AT1G51880 34.021 291 179 6 20 305 578 860 4.35e-46 168
MsG0180000931.01.T01 AT3G46400 33.562 292 182 6 20 306 562 846 4.40e-46 168
MsG0180000931.01.T01 AT1G55200 35.430 302 171 10 20 308 362 652 4.40e-46 166
MsG0180000931.01.T01 AT1G55200 35.430 302 171 10 20 308 362 652 4.40e-46 166
MsG0180000931.01.T01 AT1G55200 35.430 302 171 10 20 308 362 652 4.40e-46 166
MsG0180000931.01.T01 AT1G55200 35.430 302 171 10 20 308 362 652 4.40e-46 166
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MsG0180000931.01.T01 AT1G68690 34.680 297 169 8 24 306 365 650 4.73e-46 167
MsG0180000931.01.T01 AT1G68690 34.680 297 169 8 24 306 365 650 4.73e-46 167
MsG0180000931.01.T01 AT1G51880 34.021 291 179 6 20 305 552 834 5.03e-46 167
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MsG0180000931.01.T01 AT2G19230 34.028 288 178 6 24 306 560 840 9.17e-46 167
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MsG0180000931.01.T01 AT5G63930 36.050 319 177 12 24 324 792 1101 2.65e-45 166
MsG0180000931.01.T01 AT2G29000 33.562 292 182 6 20 306 551 835 2.69e-45 166
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MsG0180000931.01.T01 AT1G61430 41.176 238 134 4 10 244 440 674 2.82e-45 164
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MsG0180000931.01.T01 AT2G28250 34.853 307 167 10 23 306 197 493 3.51e-45 162
MsG0180000931.01.T01 AT2G28250 34.853 307 167 10 23 306 197 493 3.51e-45 162
MsG0180000931.01.T01 AT2G28250 34.853 307 167 10 23 306 197 493 3.51e-45 162
MsG0180000931.01.T01 AT1G10620 34.343 297 179 9 24 310 358 648 3.68e-45 164
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MsG0180000931.01.T01 AT5G65530 32.812 320 188 10 24 331 132 436 4.30e-45 160
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MsG0180000931.01.T01 AT2G28990 32.192 292 186 5 20 306 563 847 1.39e-44 164
MsG0180000931.01.T01 AT4G28350 33.013 312 185 11 8 306 320 620 1.76e-44 162
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MsG0180000931.01.T01 AT5G47070 33.846 325 185 12 24 328 74 388 3.76e-44 157
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MsG0180000931.01.T01 AT1G20650 39.352 216 126 3 24 236 66 279 1.08e-43 155
MsG0180000931.01.T01 AT4G28490 33.766 308 179 7 16 306 666 965 1.09e-43 161
MsG0180000931.01.T01 AT4G29450 32.258 310 183 8 23 311 555 858 1.11e-43 161
MsG0180000931.01.T01 AT1G49730 31.889 323 175 11 23 330 316 608 1.11e-43 159
MsG0180000931.01.T01 AT5G65700 36.559 279 161 7 35 305 695 965 1.17e-43 161
MsG0180000931.01.T01 AT5G65700 36.559 279 161 7 35 305 695 965 1.17e-43 161
MsG0180000931.01.T01 AT4G27290 37.269 271 159 6 38 302 515 780 1.19e-43 160
MsG0180000931.01.T01 AT5G57670 34.247 292 170 8 24 305 255 534 1.41e-43 158
MsG0180000931.01.T01 AT2G16750 33.673 294 180 7 24 310 265 550 1.43e-43 159
MsG0180000931.01.T01 AT2G16750 33.673 294 180 7 24 310 265 550 1.43e-43 159
MsG0180000931.01.T01 AT1G07870 31.361 338 198 11 20 339 87 408 1.61e-43 155
MsG0180000931.01.T01 AT5G13160 34.899 298 167 10 24 305 74 360 1.80e-43 156
MsG0180000931.01.T01 AT1G26150 40.741 216 120 5 24 236 418 628 1.87e-43 159
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MsG0180000931.01.T01 AT4G34440 33.882 304 170 9 22 308 298 587 1.89e-43 159
MsG0180000931.01.T01 AT4G34440 33.882 304 170 9 22 308 298 587 1.89e-43 159
MsG0180000931.01.T01 AT5G07280 34.185 313 185 7 12 306 881 1190 1.96e-43 160
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MsG0180000931.01.T01 AT2G18470 34.564 298 176 8 22 308 270 559 2.38e-43 158
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MsG0180000931.01.T01 AT3G13690 32.951 349 193 13 20 339 394 730 2.42e-43 159
MsG0180000931.01.T01 AT3G58690 33.220 295 178 8 24 305 75 363 2.75e-43 154
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MsG0180000931.01.T01 AT2G43690 34.576 295 177 8 21 307 322 608 4.02e-43 158
MsG0180000931.01.T01 AT1G51805 32.302 291 185 6 20 305 563 846 5.49e-43 159
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MsG0180000931.01.T01 AT1G51860 33.333 288 179 6 23 305 573 852 5.70e-43 159
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MsG0180000931.01.T01 AT5G60320 34.014 294 177 9 20 305 332 616 2.52e-42 156
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MsG0180000931.01.T01 AT1G48210 32.990 291 178 7 28 306 60 345 3.02e-42 150
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MsG0180000931.01.T01 AT3G49670 34.767 279 166 7 35 305 691 961 3.03e-42 157
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Find 77 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 94 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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TGCATTATTAAGAATCTTCA+CGG 0.420979 1:+13376451 None:intergenic
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AATCTCCATCTTCATCAATA+GGG 0.436069 1:+13375832 None:intergenic
CTTAATAATGCAGAGGGAGA+TGG 0.448829 1:-13376440 MsG0180000931.01.T01:CDS
GGCGATGCAAAGGGTGCCAT+TGG 0.450894 1:+13375766 None:intergenic
TGGATCCACAATTTGCTTGA+AGG 0.451895 1:-13375870 MsG0180000931.01.T01:CDS
CAAATCCCTATTGATGAAGA+TGG 0.453963 1:-13375837 MsG0180000931.01.T01:CDS
AACAACAAAGATGATTTCCT+TGG 0.454014 1:-13376266 MsG0180000931.01.T01:CDS
TTCATTGCCGGGCGATGCAA+AGG 0.474228 1:+13375756 None:intergenic
TTGCTTGGCTTCTGTGCAGA+TGG 0.477981 1:-13376356 MsG0180000931.01.T01:CDS
TCTGTGATACAAATGCTTCA+AGG 0.482007 1:-13375732 MsG0180000931.01.T01:CDS
TGTATCCATGACTGCAGCTA+AGG 0.488167 1:-13376060 MsG0180000931.01.T01:CDS
ATGGCACCCTTTGCATCGCC+CGG 0.488382 1:-13375763 MsG0180000931.01.T01:CDS
TTCTCTGATCACAACCTTGG+TGG 0.499603 1:+13376189 None:intergenic
ACAAAGATGATTTCCTTGGA+TGG 0.499740 1:-13376262 MsG0180000931.01.T01:CDS
ACTGCAGCTAAGGGAACATT+AGG 0.504656 1:-13376050 MsG0180000931.01.T01:CDS
TTAATAATGCAGAGGGAGAT+GGG 0.506425 1:-13376439 MsG0180000931.01.T01:CDS
ATGTTATTGTTGGAGATGGT+GGG 0.511382 1:-13375954 MsG0180000931.01.T01:CDS
ATTGCTCTAGGCATAGCTAA+TGG 0.521486 1:-13376224 MsG0180000931.01.T01:CDS
AAAGTACCAACTAATCCGTT+CGG 0.522939 1:-13375693 MsG0180000931.01.T01:CDS
GTTGGTCCGAACGGATTAGT+TGG 0.523758 1:+13375687 None:intergenic
ACAGGGCTTTAAAGCCAACT+AGG 0.528004 1:-13376583 MsG0180000931.01.T01:CDS
TATGTTATTGTTGGAGATGG+TGG 0.530869 1:-13375955 MsG0180000931.01.T01:CDS
CTCCTCCTTCAAGCAAATTG+TGG 0.532741 1:+13375865 None:intergenic
GTTGCAACTTATCCCATCCA+AGG 0.533826 1:+13376249 None:intergenic
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ATACAAATGCTTCAAGGAGA+GGG 0.537480 1:-13375726 MsG0180000931.01.T01:CDS
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ATAAATGAAGTGGGAACCAT+GGG 0.539261 1:-13376407 MsG0180000931.01.T01:CDS
GTTGTAGTTGTTGGTCCGAA+CGG 0.541108 1:+13375678 None:intergenic
AAGGAATTTATAAATGAAGT+GGG 0.542338 1:-13376416 MsG0180000931.01.T01:CDS
GAAGGAATTTATAAATGAAG+TGG 0.544267 1:-13376417 MsG0180000931.01.T01:CDS
TCTGCATAAGAGAACCTAGT+TGG 0.545297 1:+13376569 None:intergenic
AAGTCGGATATATACAGTTA+CGG 0.549994 1:-13375978 MsG0180000931.01.T01:CDS
TAAGGGAACATTAGGCTACA+TGG 0.552916 1:-13376042 MsG0180000931.01.T01:CDS
TGTTCCCTTAGCTGCAGTCA+TGG 0.553300 1:+13376055 None:intergenic
TTTGAAGATAAGATAGGCGA+AGG 0.553606 1:-13376524 MsG0180000931.01.T01:CDS
TGGAAATGTCTCTTATAAGT+CGG 0.558342 1:-13375994 MsG0180000931.01.T01:CDS
AAGATAGGCGAAGGGACTCA+TGG 0.559971 1:-13376515 MsG0180000931.01.T01:CDS
GTATCCATGACTGCAGCTAA+GGG 0.567506 1:-13376059 MsG0180000931.01.T01:CDS
TACAAATGCTTCAAGGAGAG+GGG 0.568086 1:-13375725 MsG0180000931.01.T01:CDS
TATAAATGAAGTGGGAACCA+TGG 0.573545 1:-13376408 MsG0180000931.01.T01:CDS
GTATCACAGATTTCATTGCC+GGG 0.581427 1:+13375745 None:intergenic
GAATTCTCTGATCACAACCT+TGG 0.587937 1:+13376186 None:intergenic
AAGTTGCAACAAATTGCTCT+AGG 0.589174 1:-13376236 MsG0180000931.01.T01:CDS
AGAACGTATGAATTTGGAGC+TGG 0.590068 1:-13375631 MsG0180000931.01.T01:CDS
TACAAGTTGAGTATCCAGAC+TGG 0.599590 1:-13375890 MsG0180000931.01.T01:CDS
AAGATTCTTAATAATGCAGA+GGG 0.600868 1:-13376446 MsG0180000931.01.T01:CDS
ATCCACAATTTGCTTGAAGG+AGG 0.604858 1:-13375867 MsG0180000931.01.T01:CDS
TCATTGCCGGGCGATGCAAA+GGG 0.609203 1:+13375757 None:intergenic
TGGGACTATGGTGTATCCAA+TGG 0.628240 1:-13375782 MsG0180000931.01.T01:CDS
AAATCATCTTTGTTGTTCGG+GGG 0.630995 1:+13376272 None:intergenic
GAAATCATCTTTGTTGTTCG+GGG 0.631531 1:+13376271 None:intergenic
GAAGATTCTTAATAATGCAG+AGG 0.634598 1:-13376447 MsG0180000931.01.T01:CDS
ACGTATGAATTTGGAGCTGG+AGG 0.636351 1:-13375628 MsG0180000931.01.T01:CDS
GATACAAATGCTTCAAGGAG+AGG 0.641717 1:-13375727 MsG0180000931.01.T01:CDS
TTATTGTTGGAGATGGTGGG+AGG 0.642172 1:-13375951 MsG0180000931.01.T01:CDS
GCAAACGAACGACATTGAGA+TGG 0.653421 1:+13376375 None:intergenic
ACAAATGCTTCAAGGAGAGG+GGG 0.654010 1:-13375724 MsG0180000931.01.T01:CDS
TTGAAGATAAGATAGGCGAA+GGG 0.662163 1:-13376523 MsG0180000931.01.T01:CDS
GGTATTGAGTATCTCCACCA+AGG 0.689597 1:-13376203 MsG0180000931.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AATAAATTTGAAGATAAGAT+AGG - Chr1:13375707-13375726 MsG0180000931.01.T01:CDS 15.0%
!! AAGGAATTTATAAATGAAGT+GGG - Chr1:13375821-13375840 MsG0180000931.01.T01:CDS 20.0%
!!! AAACCAAAATCTGTAATTTT+GGG + Chr1:13376127-13376146 None:intergenic 20.0%
!!! AAGAATTGAAAACTTTTTGA+AGG - Chr1:13375628-13375647 MsG0180000931.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTTAGAATTCCAAAAAAGT+TGG - Chr1:13376426-13376445 MsG0180000931.01.T01:CDS 20.0%
! AAGAATACAAAAACAATCAG+TGG - Chr1:13376313-13376332 MsG0180000931.01.T01:CDS 25.0%
! AAGATTCTTAATAATGCAGA+GGG - Chr1:13375791-13375810 MsG0180000931.01.T01:CDS 25.0%
! AAGTTTCTTGAAAAAACTTC+AGG + Chr1:13376223-13376242 None:intergenic 25.0%
! GAAGGAATTTATAAATGAAG+TGG - Chr1:13375820-13375839 MsG0180000931.01.T01:CDS 25.0%
! TCATCTAACAAGACATTATT+AGG + Chr1:13376094-13376113 None:intergenic 25.0%
! TGCATTATTAAGAATCTTCA+CGG + Chr1:13375789-13375808 None:intergenic 25.0%
! TTTGTATTAGTTGTAGTTGT+TGG + Chr1:13376571-13376590 None:intergenic 25.0%
!! CAAACCAAAATCTGTAATTT+TGG + Chr1:13376128-13376147 None:intergenic 25.0%
!!! AAAACTTTTTGAAGGATTAC+AGG - Chr1:13375636-13375655 MsG0180000931.01.T01:CDS 25.0%
!!! AAACTTTTTGAAGGATTACA+GGG - Chr1:13375637-13375656 MsG0180000931.01.T01:CDS 25.0%
!!! CAAAATTACAGATTTTGGTT+TGG - Chr1:13376126-13376145 MsG0180000931.01.T01:CDS 25.0%
!!! GAAGTTTTTTCAAGAAACTT+TGG - Chr1:13376223-13376242 MsG0180000931.01.T01:CDS 25.0%
!!! GTCTATGATTTTTTTTCACA+TGG - Chr1:13375920-13375939 MsG0180000931.01.T01:CDS 25.0%
AAATCTCCATCTTCATCAAT+AGG + Chr1:13376409-13376428 None:intergenic 30.0%
AACAACAAAGATGATTTCCT+TGG - Chr1:13375971-13375990 MsG0180000931.01.T01:CDS 30.0%
AAGTCGGATATATACAGTTA+CGG - Chr1:13376259-13376278 MsG0180000931.01.T01:CDS 30.0%
AATCTCCATCTTCATCAATA+GGG + Chr1:13376408-13376427 None:intergenic 30.0%
GAAGATTCTTAATAATGCAG+AGG - Chr1:13375790-13375809 MsG0180000931.01.T01:CDS 30.0%
TGGAAATGTCTCTTATAAGT+CGG - Chr1:13376243-13376262 MsG0180000931.01.T01:CDS 30.0%
! ACTCCCAAAATTACAGATTT+TGG - Chr1:13376121-13376140 MsG0180000931.01.T01:CDS 30.0%
!! AGGAAATCATCTTTGTTGTT+CGG + Chr1:13375971-13375990 None:intergenic 30.0%
!! TTGATTTTTCGAACACATCT+TGG + Chr1:13376152-13376171 None:intergenic 30.0%
AAGTTGCAACAAATTGCTCT+AGG - Chr1:13376001-13376020 MsG0180000931.01.T01:CDS 35.0%
ACAAAAACAATCAGTGGTGA+AGG - Chr1:13376319-13376338 MsG0180000931.01.T01:CDS 35.0%
ACAAAGATGATTTCCTTGGA+TGG - Chr1:13375975-13375994 MsG0180000931.01.T01:CDS 35.0%
ACTCATGGAGCTGTTTATAA+AGG - Chr1:13375737-13375756 MsG0180000931.01.T01:CDS 35.0%
ATAAATGAAGTGGGAACCAT+GGG - Chr1:13375830-13375849 MsG0180000931.01.T01:CDS 35.0%
ATACAAATGCTTCAAGGAGA+GGG - Chr1:13376511-13376530 MsG0180000931.01.T01:CDS 35.0%
ATGTTATTGTTGGAGATGGT+GGG - Chr1:13376283-13376302 MsG0180000931.01.T01:CDS 35.0%
CAAAGATGATTTCCTTGGAT+GGG - Chr1:13375976-13375995 MsG0180000931.01.T01:CDS 35.0%
CAAATCCCTATTGATGAAGA+TGG - Chr1:13376400-13376419 MsG0180000931.01.T01:CDS 35.0%
CAGTTACGGTATGTTATTGT+TGG - Chr1:13376273-13376292 MsG0180000931.01.T01:CDS 35.0%
TATAAATGAAGTGGGAACCA+TGG - Chr1:13375829-13375848 MsG0180000931.01.T01:CDS 35.0%
TATGTTATTGTTGGAGATGG+TGG - Chr1:13376282-13376301 MsG0180000931.01.T01:CDS 35.0%
TCTGTGATACAAATGCTTCA+AGG - Chr1:13376505-13376524 MsG0180000931.01.T01:CDS 35.0%
TGTATCACAGATTTCATTGC+CGG + Chr1:13376496-13376515 None:intergenic 35.0%
TGTTGCAGAACGTATGAATT+TGG - Chr1:13376600-13376619 MsG0180000931.01.T01:CDS 35.0%
TTAATAATGCAGAGGGAGAT+GGG - Chr1:13375798-13375817 MsG0180000931.01.T01:CDS 35.0%
TTGAAGATAAGATAGGCGAA+GGG - Chr1:13375714-13375733 MsG0180000931.01.T01:CDS 35.0%
TTTGAAGATAAGATAGGCGA+AGG - Chr1:13375713-13375732 MsG0180000931.01.T01:CDS 35.0%
! AAAGTACCAACTAATCCGTT+CGG - Chr1:13376544-13376563 MsG0180000931.01.T01:CDS 35.0%
!! AAATCATCTTTGTTGTTCGG+GGG + Chr1:13375968-13375987 None:intergenic 35.0%
!! GAAATCATCTTTGTTGTTCG+GGG + Chr1:13375969-13375988 None:intergenic 35.0%
!! GGAAATCATCTTTGTTGTTC+GGG + Chr1:13375970-13375989 None:intergenic 35.0%
CCAAAAAAGTTGGCAACAGT+GGG - Chr1:13376436-13376455 MsG0180000931.01.T01:CDS 40.0%
CGGTATGTTATTGTTGGAGA+TGG - Chr1:13376279-13376298 MsG0180000931.01.T01:CDS 40.0%
CTTAATAATGCAGAGGGAGA+TGG - Chr1:13375797-13375816 MsG0180000931.01.T01:CDS 40.0%
GAATTCTCTGATCACAACCT+TGG + Chr1:13376054-13376073 None:intergenic 40.0%
GATACAAATGCTTCAAGGAG+AGG - Chr1:13376510-13376529 MsG0180000931.01.T01:CDS 40.0%
GTATCACAGATTTCATTGCC+GGG + Chr1:13376495-13376514 None:intergenic 40.0%
TAAGGGAACATTAGGCTACA+TGG - Chr1:13376195-13376214 MsG0180000931.01.T01:CDS 40.0%
TACAAATGCTTCAAGGAGAG+GGG - Chr1:13376512-13376531 MsG0180000931.01.T01:CDS 40.0%
TCCAAAAAAGTTGGCAACAG+TGG - Chr1:13376435-13376454 MsG0180000931.01.T01:CDS 40.0%
TCTGCATAAGAGAACCTAGT+TGG + Chr1:13375671-13375690 None:intergenic 40.0%
TCTTCACGGCTACTAGAATT+TGG + Chr1:13375775-13375794 None:intergenic 40.0%
! AGAACGTATGAATTTGGAGC+TGG - Chr1:13376606-13376625 MsG0180000931.01.T01:CDS 40.0%
! ATCCACAATTTGCTTGAAGG+AGG - Chr1:13376370-13376389 MsG0180000931.01.T01:CDS 40.0%
! ATTGCTCTAGGCATAGCTAA+TGG - Chr1:13376013-13376032 MsG0180000931.01.T01:CDS 40.0%
! GAGATGGTGAATTTTTCCCA+TGG + Chr1:13375849-13375868 None:intergenic 40.0%
! TACAAGTTGAGTATCCAGAC+TGG - Chr1:13376347-13376366 MsG0180000931.01.T01:CDS 40.0%
! TGGATCCACAATTTGCTTGA+AGG - Chr1:13376367-13376386 MsG0180000931.01.T01:CDS 40.0%
ACAAATGCTTCAAGGAGAGG+GGG - Chr1:13376513-13376532 MsG0180000931.01.T01:CDS 45.0%
ACTGCAGCTAAGGGAACATT+AGG - Chr1:13376187-13376206 MsG0180000931.01.T01:CDS 45.0%
AGCAAATTGTGGATCCAGTC+TGG + Chr1:13376364-13376383 None:intergenic 45.0%
CTCAATGTCGTTCGTTTGCT+TGG - Chr1:13375866-13375885 MsG0180000931.01.T01:CDS 45.0%
CTCCTCCTTCAAGCAAATTG+TGG + Chr1:13376375-13376394 None:intergenic 45.0%
GCAAACGAACGACATTGAGA+TGG + Chr1:13375865-13375884 None:intergenic 45.0%
GTATCCATGACTGCAGCTAA+GGG - Chr1:13376178-13376197 MsG0180000931.01.T01:CDS 45.0%
GTTGCAACTTATCCCATCCA+AGG + Chr1:13375991-13376010 None:intergenic 45.0%
GTTGTAGTTGTTGGTCCGAA+CGG + Chr1:13376562-13376581 None:intergenic 45.0%
TGGGACTATGGTGTATCCAA+TGG - Chr1:13376455-13376474 MsG0180000931.01.T01:CDS 45.0%
TGTATCCATGACTGCAGCTA+AGG - Chr1:13376177-13376196 MsG0180000931.01.T01:CDS 45.0%
TTCTCTGATCACAACCTTGG+TGG + Chr1:13376051-13376070 None:intergenic 45.0%
! ACGTATGAATTTGGAGCTGG+AGG - Chr1:13376609-13376628 MsG0180000931.01.T01:CDS 45.0%
! AGATGGTTTTCGTCGTGCTT+TGG - Chr1:13375898-13375917 MsG0180000931.01.T01:CDS 45.0%
! GGTATTGAGTATCTCCACCA+AGG - Chr1:13376034-13376053 MsG0180000931.01.T01:CDS 45.0%
!! ACAGGGCTTTAAAGCCAACT+AGG - Chr1:13375654-13375673 MsG0180000931.01.T01:CDS 45.0%
!! TTATTGTTGGAGATGGTGGG+AGG - Chr1:13376286-13376305 MsG0180000931.01.T01:CDS 45.0%
!!! CCCACTGTTGCCAACTTTTT+TGG + Chr1:13376439-13376458 None:intergenic 45.0%
AAGATAGGCGAAGGGACTCA+TGG - Chr1:13375722-13375741 MsG0180000931.01.T01:CDS 50.0%
AGTTGGCAACAGTGGGACTA+TGG - Chr1:13376443-13376462 MsG0180000931.01.T01:CDS 50.0%
TAATGCAGAGGGAGATGGGA+AGG - Chr1:13375802-13375821 MsG0180000931.01.T01:CDS 50.0%
TGTTCCCTTAGCTGCAGTCA+TGG + Chr1:13376185-13376204 None:intergenic 50.0%
TTGCTTGGCTTCTGTGCAGA+TGG - Chr1:13375881-13375900 MsG0180000931.01.T01:CDS 50.0%
!! GTTGGTCCGAACGGATTAGT+TGG + Chr1:13376553-13376572 None:intergenic 50.0%
TCATTGCCGGGCGATGCAAA+GGG + Chr1:13376483-13376502 None:intergenic 55.0%
TTCATTGCCGGGCGATGCAA+AGG + Chr1:13376484-13376503 None:intergenic 55.0%
ATGGCACCCTTTGCATCGCC+CGG - Chr1:13376474-13376493 MsG0180000931.01.T01:CDS 60.0%
!! GGCGATGCAAAGGGTGCCAT+TGG + Chr1:13376474-13376493 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 13375608 13376651 13375608 ID=MsG0180000931.01;Name=MsG0180000931.01
Chr1 mRNA 13375608 13376651 13375608 ID=MsG0180000931.01.T01;Parent=MsG0180000931.01;Name=MsG0180000931.01.T01;_AED=0.49;_eAED=0.52;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|347
Chr1 exon 13375608 13376651 13375608 ID=MsG0180000931.01.T01:exon:9334;Parent=MsG0180000931.01.T01
Chr1 CDS 13375608 13376651 13375608 ID=MsG0180000931.01.T01:cds;Parent=MsG0180000931.01.T01
Gene Sequence

>MsG0180000931.01.T01

ATGAAAAGTGAAGATCATACAAGAATTGAAAACTTTTTGAAGGATTACAGGGCTTTAAAGCCAACTAGGTTCTCTTATGCAGACATAAAGAGAATTACAAATAAATTTGAAGATAAGATAGGCGAAGGGACTCATGGAGCTGTTTATAAAGGTAAATTATCGAACCAAATTCTAGTAGCCGTGAAGATTCTTAATAATGCAGAGGGAGATGGGAAGGAATTTATAAATGAAGTGGGAACCATGGGAAAAATTCACCATCTCAATGTCGTTCGTTTGCTTGGCTTCTGTGCAGATGGTTTTCGTCGTGCTTTGGTCTATGATTTTTTTTCACATGGTTCGTTGCAGAAATTCATTTGTCCCCCGAACAACAAAGATGATTTCCTTGGATGGGATAAGTTGCAACAAATTGCTCTAGGCATAGCTAATGGTATTGAGTATCTCCACCAAGGTTGTGATCAGAGAATTCTACACTTTGACATCAATCCTAATAATGTCTTGTTAGATGACAATTTCACTCCCAAAATTACAGATTTTGGTTTGGCCAAGATGTGTTCGAAAAATCAAAGTATTGTATCCATGACTGCAGCTAAGGGAACATTAGGCTACATGGCACCTGAAGTTTTTTCAAGAAACTTTGGAAATGTCTCTTATAAGTCGGATATATACAGTTACGGTATGTTATTGTTGGAGATGGTGGGAGGAAGAAAGAATACAAAAACAATCAGTGGTGAAGGAAATATACAAGTTGAGTATCCAGACTGGATCCACAATTTGCTTGAAGGAGGAGATATACAAATCCCTATTGATGAAGATGGAGATTTTAGAATTCCAAAAAAGTTGGCAACAGTGGGACTATGGTGTATCCAATGGCACCCTTTGCATCGCCCGGCAATGAAATCTGTGATACAAATGCTTCAAGGAGAGGGGGACAAGTTAAAAGTACCAACTAATCCGTTCGGACCAACAACTACAACTAATACAAATGCTAATATTGTTGCAGAACGTATGAATTTGGAGCTGGAGGTGATTGAAGAACTAGAATAG
Protein sequence

>MsG0180000931.01.T01

MKSEDHTRIENFLKDYRALKPTRFSYADIKRITNKFEDKIGEGTHGAVYKGKLSNQILVAVKILNNAEGDGKEFINEVGTMGKIHHLNVVRLLGFCADGFRRALVYDFFSHGSLQKFICPPNNKDDFLGWDKLQQIALGIANGIEYLHQGCDQRILHFDINPNNVLLDDNFTPKITDFGLAKMCSKNQSIVSMTAAKGTLGYMAPEVFSRNFGNVSYKSDIYSYGMLLLEMVGGRKNTKTISGEGNIQVEYPDWIHNLLEGGDIQIPIDEDGDFRIPKKLATVGLWCIQWHPLHRPAMKSVIQMLQGEGDKLKVPTNPFGPTTTTNTNANIVAERMNLELEVIEELE*