AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880042416.01


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MsG0880042416.01.T01 AT1G56130 37.394 353 206 6 466 811 487 831 6.28e-60 219
MsG0880042416.01.T01 AT1G29730 39.701 335 186 7 474 802 594 918 7.49e-60 220
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MsG0880042416.01.T01 AT2G42960 40.411 292 163 5 509 796 171 455 2.92e-55 199
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MsG0880042416.01.T01 AT1G68690 40.136 294 162 6 509 796 365 650 9.25e-55 202
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MsG0880042416.01.T01 AT1G55200 38.776 294 170 5 507 797 365 651 4.33e-54 199
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MsG0880042416.01.T01 AT1G07570 40.260 308 160 11 505 796 63 362 5.08e-54 193
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MsG0880042416.01.T01 AT4G03230 24.444 450 284 22 9 432 7 426 1.35e-14 78.6
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MsG0880042416.01.T01 AT5G61350 37.171 304 176 5 507 802 511 807 4.80e-53 199
MsG0880042416.01.T01 AT1G70740 37.377 305 167 7 507 795 36 332 5.35e-53 190
MsG0880042416.01.T01 AT3G59740 33.430 344 206 8 469 798 276 610 5.93e-53 196
MsG0880042416.01.T01 AT3G59700 32.558 344 218 6 466 801 278 615 7.40e-53 196
MsG0880042416.01.T01 AT4G11470 36.176 340 203 8 473 805 292 624 8.42e-53 195
MsG0880042416.01.T01 AT1G61370 28.496 565 319 19 277 807 120 633 9.41e-53 195
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MsG0880042416.01.T01 AT5G03320 37.423 326 183 8 493 804 53 371 2.46e-52 188
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MsG0880042416.01.T01 AT3G09830 37.338 308 180 7 504 801 67 371 1.94e-50 183
MsG0880042416.01.T01 AT3G46340 35.690 297 181 5 498 792 564 852 2.04e-50 191
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MsG0880042416.01.T01 AT5G16900 33.333 327 205 6 478 800 530 847 2.66e-50 191
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MsG0880042416.01.T01 AT5G54590 34.694 294 179 4 509 802 103 383 2.83e-50 183
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MsG0880042416.01.T01 AT2G17220 38.079 302 173 8 505 796 71 368 2.98e-50 182
MsG0880042416.01.T01 AT1G67520 37.097 310 182 8 506 808 244 547 3.31e-50 186
MsG0880042416.01.T01 AT4G11460 36.513 304 182 7 509 807 334 631 3.37e-50 188
MsG0880042416.01.T01 AT5G01950 36.039 308 176 7 502 801 607 901 3.86e-50 191
MsG0880042416.01.T01 AT5G01950 36.039 308 176 7 502 801 607 901 3.86e-50 191
MsG0880042416.01.T01 AT5G01950 36.039 308 176 7 502 801 607 901 3.86e-50 191
MsG0880042416.01.T01 AT5G01950 36.039 308 176 7 502 801 607 901 3.86e-50 191
MsG0880042416.01.T01 AT5G59700 32.126 414 235 12 428 802 353 759 3.87e-50 190
MsG0880042416.01.T01 AT1G51850 34.437 302 187 5 493 792 532 824 4.27e-50 190
MsG0880042416.01.T01 AT1G01540 40.891 247 130 5 507 742 140 381 4.49e-50 181
MsG0880042416.01.T01 AT2G19190 34.810 316 194 5 487 799 540 846 4.53e-50 190
MsG0880042416.01.T01 AT2G21480 35.570 298 183 4 507 802 511 801 4.73e-50 190
MsG0880042416.01.T01 AT4G02010 35.215 372 208 14 456 804 306 667 5.00e-50 188
MsG0880042416.01.T01 AT1G26150 44.068 236 123 4 509 742 418 646 5.16e-50 187
MsG0880042416.01.T01 AT4G05200 36.545 301 179 8 509 804 353 646 5.56e-50 187
MsG0880042416.01.T01 AT1G51850 34.437 302 187 5 493 792 552 844 5.59e-50 190
MsG0880042416.01.T01 AT1G67520 37.097 310 182 8 506 808 273 576 5.65e-50 186
MsG0880042416.01.T01 AT1G67520 37.097 310 182 8 506 808 273 576 5.65e-50 186
MsG0880042416.01.T01 AT4G05200 36.545 301 179 8 509 804 335 628 5.81e-50 187
MsG0880042416.01.T01 AT5G01020 38.983 295 169 7 509 796 57 347 5.96e-50 181
MsG0880042416.01.T01 AT4G23210 36.601 306 181 7 509 810 348 644 6.05e-50 187
MsG0880042416.01.T01 AT1G07870 37.458 299 167 8 507 795 89 377 6.23e-50 182
MsG0880042416.01.T01 AT5G01560 33.634 333 205 6 469 795 310 632 6.88e-50 187
MsG0880042416.01.T01 AT1G29750 39.057 297 170 6 509 801 669 958 7.20e-50 190
MsG0880042416.01.T01 AT1G29750 39.057 297 170 6 509 801 654 943 7.35e-50 190
MsG0880042416.01.T01 AT4G38830 35.737 319 190 8 501 811 324 635 7.91e-50 187
MsG0880042416.01.T01 AT5G02290 36.218 312 169 10 504 796 51 351 8.05e-50 181
MsG0880042416.01.T01 AT5G02290 36.218 312 169 10 504 796 51 351 8.05e-50 181
MsG0880042416.01.T01 AT4G00960 38.430 242 133 5 560 795 5 236 8.34e-50 177
MsG0880042416.01.T01 AT3G26940 35.806 310 178 9 504 800 55 356 8.66e-50 182
MsG0880042416.01.T01 AT1G51790 32.938 337 210 4 473 803 526 852 1.06e-49 189
MsG0880042416.01.T01 AT1G51790 32.938 337 210 4 473 803 526 852 1.06e-49 189
MsG0880042416.01.T01 AT2G29000 35.535 318 191 7 484 796 527 835 1.17e-49 189
MsG0880042416.01.T01 AT2G18890 37.457 291 165 7 507 791 54 333 1.26e-49 179
MsG0880042416.01.T01 AT4G23250 36.025 322 190 9 493 807 326 638 1.27e-49 187
MsG0880042416.01.T01 AT5G56890 38.384 297 169 7 507 796 709 998 1.28e-49 190
MsG0880042416.01.T01 AT4G11460 36.156 307 182 7 509 807 334 634 1.30e-49 187
MsG0880042416.01.T01 AT3G58690 37.748 302 172 8 503 795 69 363 1.34e-49 180
MsG0880042416.01.T01 AT5G18910 38.095 294 167 6 507 797 178 459 1.34e-49 183
MsG0880042416.01.T01 AT3G59420 36.842 323 182 7 507 815 498 812 1.39e-49 189
MsG0880042416.01.T01 AT1G30570 37.793 299 176 5 507 802 506 797 1.40e-49 188
MsG0880042416.01.T01 AT1G67520 37.097 310 182 8 506 808 438 741 1.54e-49 187
MsG0880042416.01.T01 AT4G29990 33.033 333 206 5 475 799 523 846 1.62e-49 188
MsG0880042416.01.T01 AT1G17230 37.248 298 168 7 507 795 785 1072 1.74e-49 189
MsG0880042416.01.T01 AT5G48740 31.865 386 242 9 426 803 513 885 1.83e-49 188
MsG0880042416.01.T01 AT4G04570 41.418 268 139 9 464 719 284 545 1.85e-49 184
MsG0880042416.01.T01 AT2G33170 36.304 303 167 7 509 795 807 1099 1.94e-49 189
MsG0880042416.01.T01 AT2G33170 36.304 303 167 7 509 795 807 1099 1.94e-49 189
MsG0880042416.01.T01 AT4G32000 36.093 302 181 7 506 803 157 450 2.01e-49 181
MsG0880042416.01.T01 AT1G67520 37.097 310 182 8 506 808 481 784 2.12e-49 187
MsG0880042416.01.T01 AT1G49730 35.311 354 193 8 468 795 285 628 2.18e-49 186
MsG0880042416.01.T01 AT1G69270 34.021 291 183 3 509 796 249 533 2.48e-49 183
MsG0880042416.01.T01 AT1G17230 37.500 296 166 7 509 795 787 1072 2.90e-49 189
MsG0880042416.01.T01 AT1G67520 37.097 310 182 8 506 808 488 791 2.94e-49 187
MsG0880042416.01.T01 AT1G51880 31.688 385 233 9 438 802 467 841 4.11e-49 187
MsG0880042416.01.T01 AT4G17660 38.111 307 171 8 505 800 75 373 4.18e-49 178
MsG0880042416.01.T01 AT3G16030 36.774 310 183 8 506 808 389 692 4.33e-49 186
MsG0880042416.01.T01 AT1G49730 39.789 284 142 5 468 727 255 533 4.78e-49 184
MsG0880042416.01.T01 AT1G51880 31.688 385 233 9 438 802 485 859 4.98e-49 187
MsG0880042416.01.T01 AT5G59260 34.441 331 202 7 476 801 310 630 5.38e-49 184
MsG0880042416.01.T01 AT1G51880 31.688 385 233 9 438 802 493 867 5.59e-49 187
MsG0880042416.01.T01 AT3G21340 33.224 304 192 5 491 792 564 858 5.62e-49 187
MsG0880042416.01.T01 AT1G51805 33.626 342 200 7 472 795 490 822 5.90e-49 186
MsG0880042416.01.T01 AT3G16030 36.774 310 183 8 506 808 512 815 6.42e-49 186
MsG0880042416.01.T01 AT5G56460 38.312 308 172 8 501 796 56 357 6.43e-49 178
MsG0880042416.01.T01 AT1G51805 33.626 342 200 7 472 795 514 846 6.59e-49 187
MsG0880042416.01.T01 AT5G18610 36.741 313 186 7 489 795 51 357 6.59e-49 181

Find 146 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 178 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AATGCAAGAATTTCTGATTT+TGG 0.113428 8:-8429636 MsG0880042416.01.T01:CDS
CAAGGAAAATTTGGAGAAAT+TGG 0.162388 8:-8429328 MsG0880042416.01.T01:CDS
TTGTTCACAATGGTTGAATT+TGG 0.212975 8:+8430293 None:intergenic
TTACATTGTTCTTCAGTAAA+AGG 0.215988 8:+8430485 None:intergenic
TCTCACTCATCACAAGAATT+TGG 0.226792 8:-8429898 MsG0880042416.01.T01:CDS
TTTGGTTGGTTCTGTGCTTT+TGG 0.229323 8:-8430246 MsG0880042416.01.T01:CDS
ATCTATTCTAACTTTCAAAA+AGG 0.232850 8:+8430340 None:intergenic
ACATGGTTGCTTTCACCTTC+TGG 0.233098 8:-8431490 MsG0880042416.01.T01:CDS
TGTACTTATGTTGCTAATAA+AGG 0.264612 8:-8430743 MsG0880042416.01.T01:CDS
CCTTCTCAGCTTCTTCAAAA+AGG 0.282778 8:-8431157 MsG0880042416.01.T01:CDS
CCTTCTGGTGACTTTGCCTT+TGG 0.284286 8:-8431475 MsG0880042416.01.T01:CDS
CTTCACTGCCACGCGAGTTT+TGG 0.292533 8:+8429986 None:intergenic
ATTGTTGGACAAGGAAAATT+TGG 0.297882 8:-8429337 MsG0880042416.01.T01:CDS
AGGAATGAGCTGAATGTTAT+TGG 0.301468 8:-8429921 MsG0880042416.01.T01:CDS
CTCCAAATGGTGTCGGGTTA+TGG 0.303311 8:-8431297 MsG0880042416.01.T01:CDS
AATTGGTTATGATTGCTATT+TGG 0.306426 8:-8429311 MsG0880042416.01.T01:CDS
CTTGTTAACTTAGAGAATAT+TGG 0.308269 8:+8429181 None:intergenic
AAGAATTTGGTTCGTTTACT+TGG 0.317871 8:-8429885 MsG0880042416.01.T01:CDS
TAACAGAGAAACTTTGGTTT+TGG 0.325802 8:-8430264 MsG0880042416.01.T01:CDS
ATAAGTGAAGCAACGCAAAT+TGG 0.349645 8:+8430106 None:intergenic
TGTACCACATTTCTCATGTT+TGG 0.351078 8:+8429261 None:intergenic
TCAACCAGCGAGTATCGTTT+TGG 0.357427 8:+8430653 None:intergenic
CTAAGGCTAGAACTTGCAAT+AGG 0.358517 8:-8429756 MsG0880042416.01.T01:CDS
AAAGCTTTCTTCAAGGCTTA+AGG 0.365527 8:-8431131 MsG0880042416.01.T01:CDS
ATCAAGCTCATAGGGAATTC+AGG 0.366186 8:-8429941 MsG0880042416.01.T01:CDS
TCACATCCTTGTATGAAGTC+TGG 0.366448 8:+8430602 None:intergenic
ACATAAGTACATATATTATC+AGG 0.369015 8:+8430755 None:intergenic
GAGCTAGGAAGGGGAGCTTT+TGG 0.370757 8:-8430047 MsG0880042416.01.T01:CDS
TTCCATAACCCGACACCATT+TGG 0.372228 8:+8431295 None:intergenic
CGTGGTGTGTTCAACGATAC+TGG 0.373067 8:-8431241 MsG0880042416.01.T01:CDS
TAGAAAATGTGTTGAAGAAA+TGG 0.385751 8:-8429457 MsG0880042416.01.T01:CDS
TTCTGTTGGATCAAGCTCAT+AGG 0.404649 8:-8429950 MsG0880042416.01.T01:CDS
AAGCAACCATGTAGAGTTGT+TGG 0.405956 8:+8431501 None:intergenic
GATCAATAACAGAGAAACTT+TGG 0.406285 8:-8430270 MsG0880042416.01.T01:CDS
TGTGCTAGAGGGTGCTGGTT+GGG 0.406703 8:-8431212 MsG0880042416.01.T01:CDS
CGATTGGTCTTTGACAGATC+AGG 0.407188 8:-8430956 MsG0880042416.01.T01:CDS
AAGAAGTTACCACTCTCAAA+TGG 0.410332 8:-8430395 MsG0880042416.01.T01:CDS
GTACTTATGTTGCTAATAAA+GGG 0.418202 8:-8430742 MsG0880042416.01.T01:CDS
CAGCTACCATGTGGATCATC+AGG 0.418679 8:+8430629 None:intergenic
AAGGGTATGTTGCACTTGAA+TGG 0.425674 8:-8429554 MsG0880042416.01.T01:CDS
AAAACAAACACTGGCATAAG+AGG 0.427163 8:-8429582 MsG0880042416.01.T01:CDS
ACAATGTAAGAAAGCTTGTA+TGG 0.435495 8:-8430471 MsG0880042416.01.T01:CDS
TCAGGTTAGGTGATAGTTGT+TGG 0.437474 8:-8430421 MsG0880042416.01.T01:CDS
AACTTTGTGCTAGAGGGTGC+TGG 0.438384 8:-8431217 MsG0880042416.01.T01:CDS
AGACTTTGACTGACATTGAC+TGG 0.440141 8:-8430535 MsG0880042416.01.T01:CDS
GTGGAACTCAATGCCGATGA+TGG 0.444717 8:-8431334 MsG0880042416.01.T01:CDS
TATAATAGCTTCTGCAACTT+GGG 0.444900 8:-8430704 MsG0880042416.01.T01:CDS
CATTCTATTAATTTACCATC+CGG 0.446727 8:-8431046 MsG0880042416.01.T01:CDS
AAGAAGAAGCTTAGAAGAGT+TGG 0.447986 8:-8430152 MsG0880042416.01.T01:CDS
TCACTGTCAGTTGAATTCTT+CGG 0.453373 8:+8430803 None:intergenic
TTCACAATGGTTGAATTTGG+AGG 0.453651 8:+8430296 None:intergenic
AAGGTGGAAAGCTTTCTTCA+AGG 0.454241 8:-8431138 MsG0880042416.01.T01:CDS
TAAGGCTAGAACTTGCAATA+GGG 0.462950 8:-8429755 MsG0880042416.01.T01:CDS
CTCATGTTTGGTCTAAGACA+TGG 0.464204 8:+8429273 None:intergenic
AGAAGCCAAGTTGGAAACTA+AGG 0.465578 8:-8429773 MsG0880042416.01.T01:CDS
ATACTAATTTGTGAGGGGTA+TGG 0.476525 8:+8429204 None:intergenic
TTATAATAGCTTCTGCAACT+TGG 0.480197 8:-8430705 MsG0880042416.01.T01:CDS
TTGATTCATGTTCAACAACT+TGG 0.481887 8:+8429608 None:intergenic
TCTGTTGGATCAAGCTCATA+GGG 0.485926 8:-8429949 MsG0880042416.01.T01:CDS
TCTAGCCTTAGTTTCCAACT+TGG 0.487552 8:+8429768 None:intergenic
AAATATGATCCAACTCTTGA+TGG 0.488411 8:-8430371 MsG0880042416.01.T01:CDS
TGTTCTCTCTCAAGACATAC+AGG 0.492342 8:+8430930 None:intergenic
AAAAGGTCAGTGTCTTGGAT+TGG 0.492793 8:+8431445 None:intergenic
TAGCTCTTTGTCAAATCCAT+TGG 0.496529 8:+8430064 None:intergenic
AGAATAGATAATACCTCCAT+TGG 0.497698 8:-8430326 MsG0880042416.01.T01:CDS
GGGTGACAATGAGGCATTGT+TGG 0.499814 8:-8429352 MsG0880042416.01.T01:CDS
ACATCAACCTTAGCAGTGAT+AGG 0.501624 8:+8429519 None:intergenic
CTAACTTCTCCAAATGGTGT+CGG 0.507596 8:-8431304 MsG0880042416.01.T01:CDS
ACTGGCATAAGAGGAACAAA+AGG 0.510022 8:-8429573 MsG0880042416.01.T01:CDS
AGAGAAAGTCCTGCACCAAA+AGG 0.511034 8:-8431364 MsG0880042416.01.T01:CDS
AAAAGAATCACCAATGGCTA+TGG 0.512880 8:+8431534 None:intergenic
TTGGTGCTAACTTCTCCAAA+TGG 0.515119 8:-8431310 MsG0880042416.01.T01:CDS
CTGAAACCAACAACTCTACA+TGG 0.519159 8:-8431507 MsG0880042416.01.T01:CDS
AGAAGTTACCACTCTCAAAT+GGG 0.519368 8:-8430394 MsG0880042416.01.T01:CDS
AAGAGAAACAGAAGCCAAGT+TGG 0.520691 8:-8429782 MsG0880042416.01.T01:CDS
TTGCATTGAAGTAATCATCA+AGG 0.520849 8:+8429652 None:intergenic
GATTGGTCTTTGACAGATCA+GGG 0.522430 8:-8430955 MsG0880042416.01.T01:CDS
TAACTTCTCCAAATGGTGTC+GGG 0.522903 8:-8431303 MsG0880042416.01.T01:CDS
GGAAGATTGCTTCTGTTCTG+TGG 0.527627 8:-8430450 MsG0880042416.01.T01:CDS
GATTTGACAAAGAGCTAGGA+AGG 0.528280 8:-8430058 MsG0880042416.01.T01:CDS
TATTGGATACTAATTTGTGA+GGG 0.538881 8:+8429198 None:intergenic
GGTTTGAGCTAGAACACTGA+TGG 0.540115 8:+8431564 None:intergenic
AAGGTTGATGTGTATAGTTA+TGG 0.543057 8:-8429507 MsG0880042416.01.T01:CDS
ATCAAGTGCTGGAACTCGAT+TGG 0.546045 8:-8430972 MsG0880042416.01.T01:CDS
GTTATTGATCTTGTTCACAA+TGG 0.550618 8:+8430283 None:intergenic
TGAAGCACAGAATCTGACAT+AGG 0.552286 8:+8430512 None:intergenic
AAACATGCCTATCACTGCTA+AGG 0.553049 8:-8429526 MsG0880042416.01.T01:CDS
TGATGTAGATGCATTGGTTG+AGG 0.554611 8:-8429373 MsG0880042416.01.T01:CDS
AATGGATTTGACAAAGAGCT+AGG 0.556366 8:-8430062 MsG0880042416.01.T01:CDS
AATAAAGGGAGTGGTGTTTG+TGG 0.558107 8:-8430728 MsG0880042416.01.T01:CDS
GATGTAGATGCATTGGTTGA+GGG 0.561169 8:-8429372 MsG0880042416.01.T01:CDS
TGCTATTTGGTGTGTTCAAG+AGG 0.562805 8:-8429298 MsG0880042416.01.T01:CDS
TGCACCAAAAGGATCAAAAG+TGG 0.563251 8:-8431353 MsG0880042416.01.T01:CDS
GCCTTGGCACCATCAAGAGT+TGG 0.564575 8:+8430362 None:intergenic
GCTTATGATTGCTACAAAGA+TGG 0.566889 8:-8429396 MsG0880042416.01.T01:CDS
TCCAACTCTTGATGGTGCCA+AGG 0.569338 8:-8430363 MsG0880042416.01.T01:CDS
TACTGGTAACTTTGTGCTAG+AGG 0.569883 8:-8431224 MsG0880042416.01.T01:CDS
GAAGGCAACAAGGTGTCACT+AGG 0.570308 8:+8431175 None:intergenic
AATGTGGTACATATGCTTGA+AGG 0.573779 8:-8429249 MsG0880042416.01.T01:CDS
AATCAAAGCAAAACAAACAC+TGG 0.574568 8:-8429591 MsG0880042416.01.T01:CDS
TACTATGAAAGTGAAACTGC+GGG 0.576910 8:-8431004 MsG0880042416.01.T01:CDS
GGAACAGATACATCAAGTGC+TGG 0.578457 8:-8430983 MsG0880042416.01.T01:CDS
CTGGCATAAGAGGAACAAAA+GGG 0.581543 8:-8429572 MsG0880042416.01.T01:CDS
TATGTTGCTAATAAAGGGAG+TGG 0.582070 8:-8430737 MsG0880042416.01.T01:CDS
CTAATTTGTGAGGGGTATGG+TGG 0.584188 8:+8429207 None:intergenic
TTGTGCTAGAGGGTGCTGGT+TGG 0.584821 8:-8431213 MsG0880042416.01.T01:CDS
ATTCAACTGACAGTGAAGGT+TGG 0.585847 8:-8430796 MsG0880042416.01.T01:CDS
TGCAAGCCAGACTTCATACA+AGG 0.592053 8:-8430608 MsG0880042416.01.T01:CDS
GTGTCCAAAACGATACTCGC+TGG 0.593512 8:-8430657 MsG0880042416.01.T01:CDS
TCATATTTCCCATTTGAGAG+TGG 0.594148 8:+8430386 None:intergenic
GTACATGAGCAATAGCACTT+TGG 0.594956 8:-8429823 MsG0880042416.01.T01:CDS
AGATGGTGATGTAGATGCAT+TGG 0.596367 8:-8429379 MsG0880042416.01.T01:CDS
AGTTAGCACCAACCCATCAT+CGG 0.597152 8:+8431321 None:intergenic
ATATTGGATACTAATTTGTG+AGG 0.598109 8:+8429197 None:intergenic
TTTGACAAAGAGCTAGGAAG+GGG 0.600593 8:-8430056 MsG0880042416.01.T01:CDS
CAATGAGGCATTGTTGGACA+AGG 0.602734 8:-8429346 MsG0880042416.01.T01:CDS
GAGCTAGAAGAAGCTACCAA+TGG 0.605095 8:-8430080 MsG0880042416.01.T01:CDS
ACTGGTAACTTTGTGCTAGA+GGG 0.607132 8:-8431223 MsG0880042416.01.T01:CDS
TGGAGGAAAGTCACCAATGG+AGG 0.610353 8:+8430313 None:intergenic
ACTCAATGCCGATGATGGGT+TGG 0.617515 8:-8431329 MsG0880042416.01.T01:CDS
CTACTATGAAAGTGAAACTG+CGG 0.624682 8:-8431005 MsG0880042416.01.T01:CDS
TCTTCATTAGCATAACCGGA+TGG 0.625355 8:+8431031 None:intergenic
ATTTGGAGGAAAGTCACCAA+TGG 0.628207 8:+8430310 None:intergenic
TGGAACTCAATGCCGATGAT+GGG 0.630231 8:-8431333 MsG0880042416.01.T01:CDS
AAGAAGCTGAGAAGGCAACA+AGG 0.635208 8:+8431165 None:intergenic
CCAAAGGCAAAGTCACCAGA+AGG 0.636933 8:+8431475 None:intergenic
TTGGATTGGAAGAAAACCAA+AGG 0.646218 8:+8431459 None:intergenic
CTCAGTGCGAAAGTTTCTCG+TGG 0.646759 8:-8431259 MsG0880042416.01.T01:CDS
ATTGGATACTAATTTGTGAG+GGG 0.647893 8:+8429199 None:intergenic
AGCAGTAAAAGAATCACCAA+TGG 0.648839 8:+8431528 None:intergenic
AAGAATTCAACTGACAGTGA+AGG 0.651265 8:-8430800 MsG0880042416.01.T01:CDS
TGCTCTAAGATAATAAAGAG+TGG 0.652023 8:+8430865 None:intergenic
ATTTGACAAAGAGCTAGGAA+GGG 0.656890 8:-8430057 MsG0880042416.01.T01:CDS
TACATGAAGAGTGCATCACT+AGG 0.660747 8:-8429710 MsG0880042416.01.T01:CDS
TACAGCTTCCAAAACTCGCG+TGG 0.662759 8:-8429994 MsG0880042416.01.T01:CDS
TCTGGCTTGCAGCTACCATG+TGG 0.668465 8:+8430620 None:intergenic
TAGACCAAACATGAGAAATG+TGG 0.673412 8:-8429265 MsG0880042416.01.T01:CDS
ATTGGTCTTTGACAGATCAG+GGG 0.680984 8:-8430954 MsG0880042416.01.T01:CDS
TCATCAAGGAGTATGTTCTG+AGG 0.689139 8:+8429666 None:intergenic
ATTGGTTGAGGGTGACAATG+AGG 0.691332 8:-8429361 MsG0880042416.01.T01:CDS
CTTGCAATAGGGATAGCTAG+AGG 0.694799 8:-8429744 MsG0880042416.01.T01:CDS
TTCCTGACAAAACTGTTGTG+TGG 0.703863 8:-8431396 MsG0880042416.01.T01:CDS
GTGAAGGTTGGACCACAGTG+TGG 0.707675 8:-8430784 MsG0880042416.01.T01:CDS
CGGGTTATGGAATACTACTG+AGG 0.708648 8:-8431284 MsG0880042416.01.T01:CDS
GTTGATCCTGATGATCCACA+TGG 0.742834 8:-8430635 MsG0880042416.01.T01:CDS
ATCAGGTTTAGACCACACTG+TGG 0.796950 8:+8430772 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ACATAAGTACATATATTATC+AGG + Chr8:8430049-8430068 None:intergenic 20.0%
!! ATCTATTCTAACTTTCAAAA+AGG + Chr8:8430464-8430483 None:intergenic 20.0%
! AATAAGTGAGAAGAGAAAAA+AGG + Chr8:8429210-8429229 None:intergenic 25.0%
! ATAAGTGAGAAGAGAAAAAA+GGG + Chr8:8429209-8429228 None:intergenic 25.0%
! CATTCTATTAATTTACCATC+CGG - Chr8:8429755-8429774 MsG0880042416.01.T01:CDS 25.0%
! GTACTTATGTTGCTAATAAA+GGG - Chr8:8430059-8430078 MsG0880042416.01.T01:CDS 25.0%
! TAGAAAATGTGTTGAAGAAA+TGG - Chr8:8431344-8431363 MsG0880042416.01.T01:CDS 25.0%
! TGTACTTATGTTGCTAATAA+AGG - Chr8:8430058-8430077 MsG0880042416.01.T01:CDS 25.0%
! TTACATTGTTCTTCAGTAAA+AGG + Chr8:8430319-8430338 None:intergenic 25.0%
!! AATGCAAGAATTTCTGATTT+TGG - Chr8:8431165-8431184 MsG0880042416.01.T01:CDS 25.0%
!! AATTGGTTATGATTGCTATT+TGG - Chr8:8431490-8431509 MsG0880042416.01.T01:CDS 25.0%
!! ATATTGGATACTAATTTGTG+AGG + Chr8:8431607-8431626 None:intergenic 25.0%
!! TATTGGATACTAATTTGTGA+GGG + Chr8:8431606-8431625 None:intergenic 25.0%
!!! AAGGAGTCAAATTTTAGTAA+AGG - Chr8:8429689-8429708 MsG0880042416.01.T01:CDS 25.0%
!!! ACAAAGCAATTTTAACTGAT+TGG - Chr8:8431382-8431401 MsG0880042416.01.T01:CDS 25.0%
!!! AGTCAAATTTTAGTAAAGGA+AGG - Chr8:8429693-8429712 MsG0880042416.01.T01:CDS 25.0%
!!! CAAAGCAATTTTAACTGATT+GGG - Chr8:8431383-8431402 MsG0880042416.01.T01:CDS 25.0%
AAATATGATCCAACTCTTGA+TGG - Chr8:8430430-8430449 MsG0880042416.01.T01:CDS 30.0%
AATCAAAGCAAAACAAACAC+TGG - Chr8:8431210-8431229 MsG0880042416.01.T01:CDS 30.0%
ACAATGTAAGAAAGCTTGTA+TGG - Chr8:8430330-8430349 MsG0880042416.01.T01:CDS 30.0%
ACCAAATGGAAAGCAAAAAA+AGG + Chr8:8429376-8429395 None:intergenic 30.0%
AGAATAGATAATACCTCCAT+TGG - Chr8:8430475-8430494 MsG0880042416.01.T01:CDS 30.0%
ATTGTTGGACAAGGAAAATT+TGG - Chr8:8431464-8431483 MsG0880042416.01.T01:CDS 30.0%
CAAGGAAAATTTGGAGAAAT+TGG - Chr8:8431473-8431492 MsG0880042416.01.T01:CDS 30.0%
CTTCTTGTACTGAAAAATGA+AGG + Chr8:8430635-8430654 None:intergenic 30.0%
GATCAATAACAGAGAAACTT+TGG - Chr8:8430531-8430550 MsG0880042416.01.T01:CDS 30.0%
GTTATTGATCTTGTTCACAA+TGG + Chr8:8430521-8430540 None:intergenic 30.0%
TATAATAGCTTCTGCAACTT+GGG - Chr8:8430097-8430116 MsG0880042416.01.T01:CDS 30.0%
TTATAATAGCTTCTGCAACT+TGG - Chr8:8430096-8430115 MsG0880042416.01.T01:CDS 30.0%
TTGATTCATGTTCAACAACT+TGG + Chr8:8431196-8431215 None:intergenic 30.0%
TTGCATTGAAGTAATCATCA+AGG + Chr8:8431152-8431171 None:intergenic 30.0%
TTGTTCACAATGGTTGAATT+TGG + Chr8:8430511-8430530 None:intergenic 30.0%
! AAGAATTTGGTTCGTTTACT+TGG - Chr8:8430916-8430935 MsG0880042416.01.T01:CDS 30.0%
! AGAGCAACTCTTAATTTTGA+TGG - Chr8:8429953-8429972 MsG0880042416.01.T01:CDS 30.0%
! ATTGGATACTAATTTGTGAG+GGG + Chr8:8431605-8431624 None:intergenic 30.0%
! GTTTTCTTCATTAGCATAAC+CGG + Chr8:8429777-8429796 None:intergenic 30.0%
!! AAGGTTGATGTGTATAGTTA+TGG - Chr8:8431294-8431313 MsG0880042416.01.T01:CDS 30.0%
!! AGGAATTTTAGCATACCAAA+TGG + Chr8:8429390-8429409 None:intergenic 30.0%
!! TAACAGAGAAACTTTGGTTT+TGG - Chr8:8430537-8430556 MsG0880042416.01.T01:CDS 30.0%
!! TGCTCTAAGATAATAAAGAG+TGG + Chr8:8429939-8429958 None:intergenic 30.0%
!!! ACCTTTTTTTGCTTTCCATT+TGG - Chr8:8429372-8429391 MsG0880042416.01.T01:CDS 30.0%
AAAAAAGGGAAGAAGTAGAG+TGG + Chr8:8429195-8429214 None:intergenic 35.0%
AAAACAAACACTGGCATAAG+AGG - Chr8:8431219-8431238 MsG0880042416.01.T01:CDS 35.0%
AAAAGAATCACCAATGGCTA+TGG + Chr8:8429270-8429289 None:intergenic 35.0%
AAAGCTTTCTTCAAGGCTTA+AGG - Chr8:8429670-8429689 MsG0880042416.01.T01:CDS 35.0%
AAGAAGAAGCTTAGAAGAGT+TGG - Chr8:8430649-8430668 MsG0880042416.01.T01:CDS 35.0%
AAGAAGTTACCACTCTCAAA+TGG - Chr8:8430406-8430425 MsG0880042416.01.T01:CDS 35.0%
AAGAATTCAACTGACAGTGA+AGG - Chr8:8430001-8430020 MsG0880042416.01.T01:CDS 35.0%
AATGTGGTACATATGCTTGA+AGG - Chr8:8431552-8431571 MsG0880042416.01.T01:CDS 35.0%
AGAAGTTACCACTCTCAAAT+GGG - Chr8:8430407-8430426 MsG0880042416.01.T01:CDS 35.0%
AGCAGTAAAAGAATCACCAA+TGG + Chr8:8429276-8429295 None:intergenic 35.0%
AGGAATGAGCTGAATGTTAT+TGG - Chr8:8430880-8430899 MsG0880042416.01.T01:CDS 35.0%
ATAAGTGAAGCAACGCAAAT+TGG + Chr8:8430698-8430717 None:intergenic 35.0%
ATTTGACAAAGAGCTAGGAA+GGG - Chr8:8430744-8430763 MsG0880042416.01.T01:CDS 35.0%
CTACTATGAAAGTGAAACTG+CGG - Chr8:8429796-8429815 MsG0880042416.01.T01:CDS 35.0%
CTTGTACTGAAAAATGAAGG+AGG + Chr8:8430632-8430651 None:intergenic 35.0%
GCTTATGATTGCTACAAAGA+TGG - Chr8:8431405-8431424 MsG0880042416.01.T01:CDS 35.0%
TAAGGCTAGAACTTGCAATA+GGG - Chr8:8431046-8431065 MsG0880042416.01.T01:CDS 35.0%
TACTATGAAAGTGAAACTGC+GGG - Chr8:8429797-8429816 MsG0880042416.01.T01:CDS 35.0%
TAGACCAAACATGAGAAATG+TGG - Chr8:8431536-8431555 MsG0880042416.01.T01:CDS 35.0%
TAGCTCTTTGTCAAATCCAT+TGG + Chr8:8430740-8430759 None:intergenic 35.0%
TATGTTGCTAATAAAGGGAG+TGG - Chr8:8430064-8430083 MsG0880042416.01.T01:CDS 35.0%
TCACTGTCAGTTGAATTCTT+CGG + Chr8:8430001-8430020 None:intergenic 35.0%
TCATATTTCCCATTTGAGAG+TGG + Chr8:8430418-8430437 None:intergenic 35.0%
TCTAACTTTCAAAAAGGCCT+TGG + Chr8:8430458-8430477 None:intergenic 35.0%
TCTCACTCATCACAAGAATT+TGG - Chr8:8430903-8430922 MsG0880042416.01.T01:CDS 35.0%
TGTACCACATTTCTCATGTT+TGG + Chr8:8431543-8431562 None:intergenic 35.0%
TTCACAATGGTTGAATTTGG+AGG + Chr8:8430508-8430527 None:intergenic 35.0%
! AATGGATTTGACAAAGAGCT+AGG - Chr8:8430739-8430758 MsG0880042416.01.T01:CDS 35.0%
! ATACTAATTTGTGAGGGGTA+TGG + Chr8:8431600-8431619 None:intergenic 35.0%
! GAAGTTGAACAGTTTTCTGT+TGG - Chr8:8430837-8430856 MsG0880042416.01.T01:CDS 35.0%
! GAGCTTCTTTTACAAACTGA+TGG - Chr8:8429719-8429738 MsG0880042416.01.T01:CDS 35.0%
! GCTTTTGGTATTGTTTACGA+AGG - Chr8:8430769-8430788 MsG0880042416.01.T01:CDS 35.0%
! TTGGATTGGAAGAAAACCAA+AGG + Chr8:8429345-8429364 None:intergenic 35.0%
!! AGTTCCACTTTTGATCCTTT+TGG + Chr8:8429455-8429474 None:intergenic 35.0%
!!! AGAGAAACTTTGGTTTTGGT+TGG - Chr8:8430541-8430560 MsG0880042416.01.T01:CDS 35.0%
AAAAGGTCAGTGTCTTGGAT+TGG + Chr8:8429359-8429378 None:intergenic 40.0%
AAACATGCCTATCACTGCTA+AGG - Chr8:8431275-8431294 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
AAGAGAAACAGAAGCCAAGT+TGG - Chr8:8431019-8431038 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
AAGCAACCATGTAGAGTTGT+TGG + Chr8:8429303-8429322 None:intergenic 40.0%
AAGGTGGAAAGCTTTCTTCA+AGG - Chr8:8429663-8429682 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
AATAAAGGGAGTGGTGTTTG+TGG - Chr8:8430073-8430092 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
ACATCAACCTTAGCAGTGAT+AGG + Chr8:8431285-8431304 None:intergenic 40.0%
ACCAAAAACACCATAGCCAT+TGG - Chr8:8429257-8429276 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
ACTGGCATAAGAGGAACAAA+AGG - Chr8:8431228-8431247 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
ACTGGTAACTTTGTGCTAGA+GGG - Chr8:8429578-8429597 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
AGACTTTGACTGACATTGAC+TGG - Chr8:8430266-8430285 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
ATCAAGCTCATAGGGAATTC+AGG - Chr8:8430860-8430879 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
ATTCAACTGACAGTGAAGGT+TGG - Chr8:8430005-8430024 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
ATTTGGAGGAAAGTCACCAA+TGG + Chr8:8430494-8430513 None:intergenic 40.0%
CCTTCTCAGCTTCTTCAAAA+AGG - Chr8:8429644-8429663 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
CTAACTTCTCCAAATGGTGT+CGG - Chr8:8429497-8429516 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
CTAAGGCTAGAACTTGCAAT+AGG - Chr8:8431045-8431064 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
CTGAAACCAACAACTCTACA+TGG - Chr8:8429294-8429313 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
CTGGCATAAGAGGAACAAAA+GGG - Chr8:8431229-8431248 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
GATTTGACAAAGAGCTAGGA+AGG - Chr8:8430743-8430762 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
GCAAAAAAAGGTCAGTGTCT+TGG + Chr8:8429364-8429383 None:intergenic 40.0%
GTACATGAGCAATAGCACTT+TGG - Chr8:8430978-8430997 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
TAACTTCTCCAAATGGTGTC+GGG - Chr8:8429498-8429517 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
TACTGGTAACTTTGTGCTAG+AGG - Chr8:8429577-8429596 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
TCACATCCTTGTATGAAGTC+TGG + Chr8:8430202-8430221 None:intergenic 40.0%
TCAGGTTAGGTGATAGTTGT+TGG - Chr8:8430380-8430399 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
TCTCAGCTTCTTCAAAAAGG+TGG - Chr8:8429647-8429666 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
TCTGTTGGATCAAGCTCATA+GGG - Chr8:8430852-8430871 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
TCTTCATTAGCATAACCGGA+TGG + Chr8:8429773-8429792 None:intergenic 40.0%
TGAAGCACAGAATCTGACAT+AGG + Chr8:8430292-8430311 None:intergenic 40.0%
TGCACCAAAAGGATCAAAAG+TGG - Chr8:8429448-8429467 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
TGTTCTCTCTCAAGACATAC+AGG + Chr8:8429874-8429893 None:intergenic 40.0%
TTCCTGACAAAACTGTTGTG+TGG - Chr8:8429405-8429424 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
TTCTGTTGGATCAAGCTCAT+AGG - Chr8:8430851-8430870 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
TTTGACAAAGAGCTAGGAAG+GGG - Chr8:8430745-8430764 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
! AAGGGTATGTTGCACTTGAA+TGG - Chr8:8431247-8431266 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
! ACCAATGGCTATGGTGTTTT+TGG + Chr8:8429261-8429280 None:intergenic 40.0%
! AGAAGCCAAGTTGGAAACTA+AGG - Chr8:8431028-8431047 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
! AGATGGTGATGTAGATGCAT+TGG - Chr8:8431422-8431441 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
! CTCATGTTTGGTCTAAGACA+TGG + Chr8:8431531-8431550 None:intergenic 40.0%
! TACATGAAGAGTGCATCACT+AGG - Chr8:8431091-8431110 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
! TCATCAAGGAGTATGTTCTG+AGG + Chr8:8431138-8431157 None:intergenic 40.0%
! TTACTTGGATTTTGCGAGAG+TGG - Chr8:8430931-8430950 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
!! ACTTTTGATCCTTTTGGTGC+AGG + Chr8:8429449-8429468 None:intergenic 40.0%
!! ATTGGTCTTTGACAGATCAG+GGG - Chr8:8429847-8429866 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
!! CCTTTTTGAAGAAGCTGAGA+AGG + Chr8:8429647-8429666 None:intergenic 40.0%
!! GATGTAGATGCATTGGTTGA+GGG - Chr8:8431429-8431448 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
!! GATTGGTCTTTGACAGATCA+GGG - Chr8:8429846-8429865 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
!! TACCACACAACAGTTTTGTC+AGG + Chr8:8429410-8429429 None:intergenic 40.0%
!! TCTAGCCTTAGTTTCCAACT+TGG + Chr8:8431036-8431055 None:intergenic 40.0%
!! TCTGTTCTGTGGCTATTTTC+AGG - Chr8:8430362-8430381 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
!! TGATGTAGATGCATTGGTTG+AGG - Chr8:8431428-8431447 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
!! TGCTATTTGGTGTGTTCAAG+AGG - Chr8:8431503-8431522 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
!! TTGGTGCTAACTTCTCCAAA+TGG - Chr8:8429491-8429510 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
!!! TCTGTGGCTATTTTCAGGTT+AGG - Chr8:8430367-8430386 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
!!! TTGGTTGGTTCTGTGCTTTT+GGG - Chr8:8430556-8430575 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
!!! TTTGGTTGGTTCTGTGCTTT+TGG - Chr8:8430555-8430574 MsG0880042416.01.T01:CDS 40.0%
AAGAAGCTGAGAAGGCAACA+AGG + Chr8:8429639-8429658 None:intergenic 45.0%
AGAGAAAGTCCTGCACCAAA+AGG - Chr8:8429437-8429456 MsG0880042416.01.T01:CDS 45.0%
AGTTAGCACCAACCCATCAT+CGG + Chr8:8429483-8429502 None:intergenic 45.0%
ATCAGGTTTAGACCACACTG+TGG + Chr8:8430032-8430051 None:intergenic 45.0%
ATTGGTTGAGGGTGACAATG+AGG - Chr8:8431440-8431459 MsG0880042416.01.T01:CDS 45.0%
CGGGTTATGGAATACTACTG+AGG - Chr8:8429517-8429536 MsG0880042416.01.T01:CDS 45.0%
CTTGCAATAGGGATAGCTAG+AGG - Chr8:8431057-8431076 MsG0880042416.01.T01:CDS 45.0%
GAGCTAGAAGAAGCTACCAA+TGG - Chr8:8430721-8430740 MsG0880042416.01.T01:CDS 45.0%
GGAACAGATACATCAAGTGC+TGG - Chr8:8429818-8429837 MsG0880042416.01.T01:CDS 45.0%
GGAAGATTGCTTCTGTTCTG+TGG - Chr8:8430351-8430370 MsG0880042416.01.T01:CDS 45.0%
GGTTTGAGCTAGAACACTGA+TGG + Chr8:8429240-8429259 None:intergenic 45.0%
GTTGATCCTGATGATCCACA+TGG - Chr8:8430166-8430185 MsG0880042416.01.T01:CDS 45.0%
TGCAAGCCAGACTTCATACA+AGG - Chr8:8430193-8430212 MsG0880042416.01.T01:CDS 45.0%
TGGAACTCAATGCCGATGAT+GGG - Chr8:8429468-8429487 MsG0880042416.01.T01:CDS 45.0%
TTCCATAACCCGACACCATT+TGG + Chr8:8429509-8429528 None:intergenic 45.0%
! ACATGGTTGCTTTCACCTTC+TGG - Chr8:8429311-8429330 MsG0880042416.01.T01:CDS 45.0%
! CTAATTTGTGAGGGGTATGG+TGG + Chr8:8431597-8431616 None:intergenic 45.0%
! TGGATTTTGCGAGAGTGGAA+AGG - Chr8:8430936-8430955 MsG0880042416.01.T01:CDS 45.0%
!! ATCAAGTGCTGGAACTCGAT+TGG - Chr8:8429829-8429848 MsG0880042416.01.T01:CDS 45.0%
!! CAATGAGGCATTGTTGGACA+AGG - Chr8:8431455-8431474 MsG0880042416.01.T01:CDS 45.0%
!! CGATTGGTCTTTGACAGATC+AGG - Chr8:8429845-8429864 MsG0880042416.01.T01:CDS 45.0%
!! CGTTTTGGACACTGACATGT+TGG + Chr8:8430136-8430155 None:intergenic 45.0%
!! TCAACCAGCGAGTATCGTTT+TGG + Chr8:8430151-8430170 None:intergenic 45.0%
CAGCTACCATGTGGATCATC+AGG + Chr8:8430175-8430194 None:intergenic 50.0%
CCAAAGGCAAAGTCACCAGA+AGG + Chr8:8429329-8429348 None:intergenic 50.0%
CCTTCTGGTGACTTTGCCTT+TGG - Chr8:8429326-8429345 MsG0880042416.01.T01:CDS 50.0%
CGTGGTGTGTTCAACGATAC+TGG - Chr8:8429560-8429579 MsG0880042416.01.T01:CDS 50.0%
CTCAGTGCGAAAGTTTCTCG+TGG - Chr8:8429542-8429561 MsG0880042416.01.T01:CDS 50.0%
GTGGAACTCAATGCCGATGA+TGG - Chr8:8429467-8429486 MsG0880042416.01.T01:CDS 50.0%
GTGTCCAAAACGATACTCGC+TGG - Chr8:8430144-8430163 MsG0880042416.01.T01:CDS 50.0%
TACAGCTTCCAAAACTCGCG+TGG - Chr8:8430807-8430826 MsG0880042416.01.T01:CDS 50.0%
TGGAGGAAAGTCACCAATGG+AGG + Chr8:8430491-8430510 None:intergenic 50.0%
! AACTTTGTGCTAGAGGGTGC+TGG - Chr8:8429584-8429603 MsG0880042416.01.T01:CDS 50.0%
! CTCCAAATGGTGTCGGGTTA+TGG - Chr8:8429504-8429523 MsG0880042416.01.T01:CDS 50.0%
!! ACTCAATGCCGATGATGGGT+TGG - Chr8:8429472-8429491 MsG0880042416.01.T01:CDS 50.0%
!! GAAGGCAACAAGGTGTCACT+AGG + Chr8:8429629-8429648 None:intergenic 50.0%
!! GGGTGACAATGAGGCATTGT+TGG - Chr8:8431449-8431468 MsG0880042416.01.T01:CDS 50.0%
!! TCCAACTCTTGATGGTGCCA+AGG - Chr8:8430438-8430457 MsG0880042416.01.T01:CDS 50.0%
GCCTTGGCACCATCAAGAGT+TGG + Chr8:8430442-8430461 None:intergenic 55.0%
GTGAAGGTTGGACCACAGTG+TGG - Chr8:8430017-8430036 MsG0880042416.01.T01:CDS 55.0%
! CTTCACTGCCACGCGAGTTT+TGG + Chr8:8430818-8430837 None:intergenic 55.0%
! GAGCTAGGAAGGGGAGCTTT+TGG - Chr8:8430754-8430773 MsG0880042416.01.T01:CDS 55.0%
! TCTGGCTTGCAGCTACCATG+TGG + Chr8:8430184-8430203 None:intergenic 55.0%
!! TGTGCTAGAGGGTGCTGGTT+GGG - Chr8:8429589-8429608 MsG0880042416.01.T01:CDS 55.0%
!! TTGTGCTAGAGGGTGCTGGT+TGG - Chr8:8429588-8429607 MsG0880042416.01.T01:CDS 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 8429185 8431638 8429185 ID=MsG0880042416.01;Name=MsG0880042416.01
Chr8 mRNA 8429185 8431638 8429185 ID=MsG0880042416.01.T01;Parent=MsG0880042416.01;Name=MsG0880042416.01.T01;_AED=0.49;_eAED=0.49;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|817
Chr8 exon 8429185 8431638 8429185 ID=MsG0880042416.01.T01:exon:1084;Parent=MsG0880042416.01.T01
Chr8 CDS 8429185 8431638 8429185 ID=MsG0880042416.01.T01:cds;Parent=MsG0880042416.01.T01
Gene Sequence

>MsG0880042416.01.T01

ATGGCTTCCACTCTACTTCTTCCCTTTTTTCTCTTCTCACTTATTCTACAATCCATCAGTGTTCTAGCTCAAACCAAAAACACCATAGCCATTGGTGATTCTTTTACTGCTGAAACCAACAACTCTACATGGTTGCTTTCACCTTCTGGTGACTTTGCCTTTGGTTTTCTTCCAATCCAAGACACTGACCTTTTTTTGCTTTCCATTTGGTATGCTAAAATTCCTGACAAAACTGTTGTGTGGTATGCTAATAGAGAAAGTCCTGCACCAAAAGGATCAAAAGTGGAACTCAATGCCGATGATGGGTTGGTGCTAACTTCTCCAAATGGTGTCGGGTTATGGAATACTACTGAGGTACTCAGTGCGAAAGTTTCTCGTGGTGTGTTCAACGATACTGGTAACTTTGTGCTAGAGGGTGCTGGTTGGGAGACTTTCGAGTCTCCTAGTGACACCTTGTTGCCTTCTCAGCTTCTTCAAAAAGGTGGAAAGCTTTCTTCAAGGCTTAAGGAGTCAAATTTTAGTAAAGGAAGGTTTGAGCTTCTTTTACAAACTGATGGTAATCTTGTTATGCATTCTATTAATTTACCATCCGGTTATGCTAATGAAGAAAACTACTATGAAAGTGAAACTGCGGGAACAGATACATCAAGTGCTGGAACTCGATTGGTCTTTGACAGATCAGGGGACCTGTATGTCTTGAGAGAGAACAATACGAAATACAATGTGTCAGAAGAAGAGAGTACAGTCTCTACCACTCTTTATTATCTTAGAGCAACTCTTAATTTTGATGGTGTGTTCGCAGTTTACAAGCATCCGAAGAATTCAACTGACAGTGAAGGTTGGACCACAGTGTGGTCTAAACCTGATAATATATGTACTTATGTTGCTAATAAAGGGAGTGGTGTTTGTGGTTATAATAGCTTCTGCAACTTGGGAGTTGATAAGAGACCAACATGTCAGTGTCCAAAACGATACTCGCTGGTTGATCCTGATGATCCACATGGTAGCTGCAAGCCAGACTTCATACAAGGATGTGAAGAAGATGAACTAAGTAAAAACAGAAATAATCTCTATGAGTTTGAGACTTTGACTGACATTGACTGGCCTATGTCAGATTCTGTGCTTCAAAAGCCTTTTACTGAAGAACAATGTAAGAAAGCTTGTATGGAAGATTGCTTCTGTTCTGTGGCTATTTTCAGGTTAGGTGATAGTTGTTGGAAGAAGAAGTTACCACTCTCAAATGGGAAATATGATCCAACTCTTGATGGTGCCAAGGCCTTTTTGAAAGTTAGAATAGATAATACCTCCATTGGTGACTTTCCTCCAAATTCAACCATTGTGAACAAGATCAATAACAGAGAAACTTTGGTTTTGGTTGGTTCTGTGCTTTTGGGTAGCTCTACTATTCTCAATGTTGTATTGATTGTAGCAATATGTGTCTGTACCTCCTTCATTTTTCAGTACAAGAAGAAGCTTAGAAGAGTTGGCAAAAGTGACACTTCTGTTGAAACCAATTTGCGTTGCTTCACTTATGAAGAGCTAGAAGAAGCTACCAATGGATTTGACAAAGAGCTAGGAAGGGGAGCTTTTGGTATTGTTTACGAAGGAGTCATTAACAGAAATACAGCTTCCAAAACTCGCGTGGCAGTGAAGAAGTTGAACAGTTTTCTGTTGGATCAAGCTCATAGGGAATTCAGGAATGAGCTGAATGTTATTGGTCTCACTCATCACAAGAATTTGGTTCGTTTACTTGGATTTTGCGAGAGTGGAAAGGAAAGACTGCTTGTTTATGAGTACATGAGCAATAGCACTTTGGCAAGTTTTCTTTTCAATGAAGAGAAACAGAAGCCAAGTTGGAAACTAAGGCTAGAACTTGCAATAGGGATAGCTAGAGGACTTGTGTATTTACATGAAGAGTGCATCACTAGGATCATTCATTGTGACATAAAGCCTCAGAACATACTCCTTGATGATTACTTCAATGCAAGAATTTCTGATTTTGGATTAGCCAAGTTGTTGAACATGAATCAAAGCAAAACAAACACTGGCATAAGAGGAACAAAAGGGTATGTTGCACTTGAATGGTTTAAAAACATGCCTATCACTGCTAAGGTTGATGTGTATAGTTATGGTGTAGTGCTACTTGAGATAATTTCATGTAGAAAATGTGTTGAAGAAATGGATGAAGAAGATGAAGACAAAGCAATTTTAACTGATTGGGCTTATGATTGCTACAAAGATGGTGATGTAGATGCATTGGTTGAGGGTGACAATGAGGCATTGTTGGACAAGGAAAATTTGGAGAAATTGGTTATGATTGCTATTTGGTGTGTTCAAGAGGATCCATGTCTTAGACCAAACATGAGAAATGTGGTACATATGCTTGAAGGTACTGTTGAAGTGCAAGTTCCACCATACCCCTCACAAATTAGTATCCAATATTCTCTAAGTTAA

Protein sequence

>MsG0880042416.01.T01

MASTLLLPFFLFSLILQSISVLAQTKNTIAIGDSFTAETNNSTWLLSPSGDFAFGFLPIQDTDLFLLSIWYAKIPDKTVVWYANRESPAPKGSKVELNADDGLVLTSPNGVGLWNTTEVLSAKVSRGVFNDTGNFVLEGAGWETFESPSDTLLPSQLLQKGGKLSSRLKESNFSKGRFELLLQTDGNLVMHSINLPSGYANEENYYESETAGTDTSSAGTRLVFDRSGDLYVLRENNTKYNVSEEESTVSTTLYYLRATLNFDGVFAVYKHPKNSTDSEGWTTVWSKPDNICTYVANKGSGVCGYNSFCNLGVDKRPTCQCPKRYSLVDPDDPHGSCKPDFIQGCEEDELSKNRNNLYEFETLTDIDWPMSDSVLQKPFTEEQCKKACMEDCFCSVAIFRLGDSCWKKKLPLSNGKYDPTLDGAKAFLKVRIDNTSIGDFPPNSTIVNKINNRETLVLVGSVLLGSSTILNVVLIVAICVCTSFIFQYKKKLRRVGKSDTSVETNLRCFTYEELEEATNGFDKELGRGAFGIVYEGVINRNTASKTRVAVKKLNSFLLDQAHREFRNELNVIGLTHHKNLVRLLGFCESGKERLLVYEYMSNSTLASFLFNEEKQKPSWKLRLELAIGIARGLVYLHEECITRIIHCDIKPQNILLDDYFNARISDFGLAKLLNMNQSKTNTGIRGTKGYVALEWFKNMPITAKVDVYSYGVVLLEIISCRKCVEEMDEEDEDKAILTDWAYDCYKDGDVDALVEGDNEALLDKENLEKLVMIAIWCVQEDPCLRPNMRNVVHMLEGTVEVQVPPYPSQISIQYSLS*