AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680033171.01

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MsG0680033171.01.T01 AT5G65560 25.751 233 145 2 295 527 186 390 7.49e-19 90.9
MsG0680033171.01.T01 AT5G65560 30.482 456 305 4 80 526 216 668 3.25e-71 244
MsG0680033171.01.T01 AT5G65560 29.528 508 315 7 42 507 213 719 1.80e-67 234
MsG0680033171.01.T01 AT5G65560 30.090 442 280 3 85 526 186 598 2.17e-60 214
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MsG0680033171.01.T01 AT1G52620 25.139 541 345 6 12 527 117 622 8.40e-48 178
MsG0680033171.01.T01 AT1G52620 25.740 439 308 4 8 430 343 779 8.24e-43 163
MsG0680033171.01.T01 AT1G52620 25.066 379 270 8 162 529 109 484 1.51e-23 105
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MsG0680033171.01.T01 AT2G35130 22.018 327 197 6 247 521 145 465 8.66e-15 77.8
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MsG0680033171.01.T01 AT3G18110 21.071 579 391 11 1 525 251 817 4.53e-26 113
MsG0680033171.01.T01 AT3G18110 20.833 360 285 0 45 404 785 1144 4.64e-24 107
MsG0680033171.01.T01 AT3G18110 22.812 377 255 2 81 421 680 1056 1.81e-23 105
MsG0680033171.01.T01 AT3G18110 22.930 314 232 3 222 525 225 538 7.32e-20 94.4
MsG0680033171.01.T01 AT3G18110 25.714 245 166 6 295 526 228 469 1.28e-17 87.4
MsG0680033171.01.T01 AT3G18110 18.803 468 343 6 67 526 590 1028 2.81e-17 86.3
MsG0680033171.01.T01 AT3G18110 20.349 344 252 3 1 334 813 1144 2.24e-16 83.2
MsG0680033171.01.T01 AT3G18110 18.214 280 229 0 44 323 889 1168 8.33e-12 68.9
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MsG0680033171.01.T01 AT3G04130 29.870 231 159 3 217 444 219 449 6.65e-27 114
MsG0680033171.01.T01 AT3G04130 26.087 299 209 5 62 353 170 463 6.39e-26 111
MsG0680033171.01.T01 AT3G04130 23.975 317 234 5 83 393 153 468 1.89e-21 98.2
MsG0680033171.01.T01 AT3G04130 24.710 259 186 5 2 255 216 470 1.30e-15 80.1
MsG0680033171.01.T01 AT3G04130 25.189 397 223 8 134 524 102 430 8.85e-32 129
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MsG0680033171.01.T01 AT1G32415 22.464 414 273 10 46 423 230 631 7.72e-20 94.0
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MsG0680033171.01.T01 AT5G61370 23.932 234 158 4 314 530 125 355 9.93e-13 70.9
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MsG0680033171.01.T01 AT1G26500 21.159 345 248 7 49 389 148 472 3.25e-11 66.2
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MsG0680033171.01.T01 AT2G44880 21.578 431 286 9 29 423 60 474 4.28e-21 97.4
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MsG0680033171.01.T01 AT3G53360 21.959 296 214 4 79 369 130 413 3.12e-14 76.3
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MsG0680033171.01.T01 AT2G42920 22.062 417 269 10 48 426 90 488 1.14e-12 70.9
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MsG0680033171.01.T01 AT3G13770 20.323 433 278 14 80 467 16 426 6.09e-14 75.1
MsG0680033171.01.T01 AT3G13770 21.508 358 251 12 72 413 108 451 1.62e-13 73.6
MsG0680033171.01.T01 AT2G22070 21.262 428 308 12 46 465 242 648 7.57e-14 75.1
MsG0680033171.01.T01 AT2G22070 21.159 397 261 10 80 438 4 386 5.48e-11 65.9
MsG0680033171.01.T01 AT2G02750 23.333 240 179 3 10 248 298 533 7.62e-14 74.7
MsG0680033171.01.T01 AT2G02750 21.587 315 233 6 79 388 228 533 1.21e-13 73.9
MsG0680033171.01.T01 AT2G02750 20.954 482 315 12 46 481 65 526 9.38e-13 71.2
MsG0680033171.01.T01 AT2G02750 22.159 352 255 8 76 424 25 360 4.40e-12 69.3
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MsG0680033171.01.T01 AT5G44230 22.191 356 253 9 81 428 16 355 8.04e-14 74.7
MsG0680033171.01.T01 AT5G44230 24.138 261 181 7 46 301 117 365 1.07e-13 73.9
MsG0680033171.01.T01 AT4G37170 19.619 367 261 8 148 493 249 602 8.45e-14 74.7
MsG0680033171.01.T01 AT3G26782 22.222 288 183 6 105 391 206 453 8.82e-14 74.7
MsG0680033171.01.T01 AT3G26782 22.530 253 183 5 14 264 222 463 5.34e-11 65.9

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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GATCAATGGACTTTGTAAAA+AGG 0.199783 6:-58424827 MsG0680033171.01.T01:CDS
CTTTGGTTTGTTCCATGATA+TGG 0.208185 6:-58425523 MsG0680033171.01.T01:CDS
ATTAAAGGTCTGTGTGTTAA+TGG 0.216043 6:-58425876 MsG0680033171.01.T01:CDS
ACCTTTAATAAGCGTATTAA+AGG 0.224122 6:+58425890 None:intergenic
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TTTACACAACCCATTGATTA+AGG 0.250061 6:+58425776 None:intergenic
TAAAGAAACTAAAGGCTTCT+TGG 0.260224 6:+58425217 None:intergenic
TGTTACCTACGGTTCATTAA+TGG 0.261133 6:-58425370 MsG0680033171.01.T01:CDS
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AATGATTGTCAGAGGTCTTT+TGG 0.278998 6:-58420531 MsG0680033171.01.T01:CDS
CCTAGTTAATGAAGTGAATA+AGG 0.296320 6:-58425337 MsG0680033171.01.T01:CDS
ATTGATGGTTTGTGCAAATC+TGG 0.305901 6:-58425141 MsG0680033171.01.T01:CDS
TGGTGTTGTATATGATTTAT+TGG 0.311159 6:-58424276 MsG0680033171.01.T01:CDS
ATCAATGGGTTGTGTAAAAT+GGG 0.322297 6:-58425771 MsG0680033171.01.T01:CDS
GTATTGTAAGTTACCTTATC+AGG 0.327073 6:+58425168 None:intergenic
TGTTTCCCTTTCTCATCAAT+TGG 0.331036 6:-58426048 MsG0680033171.01.T01:CDS
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CACGACCATGTGCTTGCACT+TGG 0.369532 6:-58425828 MsG0680033171.01.T01:CDS
TTAATTGTTACTGCCATCTT+CGG 0.373112 6:-58425980 MsG0680033171.01.T01:CDS
CCTTATTCACTTCATTAACT+AGG 0.387761 6:+58425337 None:intergenic
GGTGTTGTATATGATTTATT+GGG 0.391048 6:-58424275 MsG0680033171.01.T01:intron
GTTTCAAAAGTTACAGCATC+AGG 0.393273 6:+58420614 None:intergenic
TTGTTAAATTCAATGATTGA+TGG 0.393319 6:+58426119 None:intergenic
AATAATGCTTAACACATGTT+TGG 0.395178 6:+58425314 None:intergenic
TAATTGTTACTGCCATCTTC+GGG 0.396119 6:-58425979 MsG0680033171.01.T01:CDS
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AGAATTCCAATTGATGAGAA+AGG 0.397396 6:+58426042 None:intergenic
CAAAATTCATTTCCCGAAGA+TGG 0.403248 6:+58425967 None:intergenic
CATATCCAGGTGAATTCCTT+GGG 0.411985 6:+58424972 None:intergenic
ACTTACAATACTCTCATTGA+TGG 0.413101 6:-58425156 MsG0680033171.01.T01:CDS
AAGCTCTTACCTTCTCAGAT+TGG 0.414721 6:+58424324 None:intergenic
AATAAGCGTATTAAAGGTAA+TGG 0.415767 6:+58425896 None:intergenic
ATAACCCATCTTAAGAATCT+TGG 0.420258 6:+58425929 None:intergenic
AGCTACGGTACCTTAATCAA+TGG 0.421427 6:-58425786 MsG0680033171.01.T01:CDS
GTATTAAAGGTAATGGTATT+CGG 0.429142 6:+58425903 None:intergenic
GTTGGCCAAGATTCTTAAGA+TGG 0.430310 6:-58425934 MsG0680033171.01.T01:CDS
GAACCGTAGGTAACAACATC+TGG 0.432453 6:+58425378 None:intergenic
ATGTATAACACAATCATTGA+TGG 0.436161 6:-58425681 MsG0680033171.01.T01:CDS
TTAAGGTACCGTAGCTAACT+TGG 0.438767 6:+58425793 None:intergenic
GGTCAATTGAAAGAAGCCTT+TGG 0.447993 6:-58425540 MsG0680033171.01.T01:CDS
TTAAGCATTATTTCTCGAAT+GGG 0.452174 6:-58425303 MsG0680033171.01.T01:CDS
AATGCTGATGGTCCTGTATA+CGG 0.454267 6:-58424299 MsG0680033171.01.T01:CDS
GTTGATGAGATGTGTGATAA+TGG 0.456607 6:-58425093 MsG0680033171.01.T01:CDS
AACCCTTAATCAAAAGATCC+TGG 0.465507 6:+58424881 None:intergenic
ACATATCCAGGTGAATTCCT+TGG 0.466770 6:+58424971 None:intergenic
CATAGGAATTGCTCCTGATA+AGG 0.471624 6:-58425181 MsG0680033171.01.T01:CDS
CATTTCATTAAAGAAACTAA+AGG 0.477447 6:+58425209 None:intergenic
GCTACGGTACCTTAATCAAT+GGG 0.478304 6:-58425785 MsG0680033171.01.T01:CDS
ACGTATAATATTATGATCAA+TGG 0.483449 6:-58424841 MsG0680033171.01.T01:CDS
CATTGTATGTGCACATATCC+AGG 0.486829 6:+58424959 None:intergenic
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CATTTCAGAATATAACTCAT+AGG 0.490638 6:+58425629 None:intergenic
CTGGGAGAATCTCCTATGCT+TGG 0.492268 6:-58425122 MsG0680033171.01.T01:CDS
GAATTCCAATTGATGAGAAA+GGG 0.496717 6:+58426043 None:intergenic
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ATTGGTTGATGCTCTATGTA+AGG 0.504718 6:-58425460 MsG0680033171.01.T01:CDS
AGGGTTATAGTGTAAATGCT+TGG 0.508065 6:-58424864 MsG0680033171.01.T01:CDS
AATCTTGGCCAACATAGAAA+AGG 0.511130 6:+58425944 None:intergenic
GGGAAACAGCAGTGGTGTAA+TGG 0.511590 6:+58426063 None:intergenic
CTTATCAGGAGCAATTCCTA+TGG 0.513696 6:+58425182 None:intergenic
TTTAATGAAATGCGGTCCAT+AGG 0.516246 6:-58425198 MsG0680033171.01.T01:CDS
CAATAGCCTTGTCAACATGA+TGG 0.519020 6:+58425016 None:intergenic
ATGCCAGATGTTGTTACCTA+CGG 0.524250 6:-58425381 MsG0680033171.01.T01:CDS
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TTATAAGTGAATATATTAGC+TGG 0.540711 6:+58425066 None:intergenic
ATGCTAAAAGTATAAACACT+TGG 0.546758 6:+58425483 None:intergenic
GTCAAGAAAATTAAAACCCA+AGG 0.548773 6:-58424988 MsG0680033171.01.T01:CDS
TTGAAAATGATAAGAACGGA+AGG 0.554149 6:-58420574 MsG0680033171.01.T01:CDS
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CTTATCGATGGACTATGTAA+AGG 0.555730 6:-58424934 MsG0680033171.01.T01:CDS
CATTTGAACCAAGTTAGCTA+CGG 0.561446 6:-58425801 MsG0680033171.01.T01:CDS
TGCTAAAAGTATAAACACTT+GGG 0.564876 6:+58425484 None:intergenic
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GTTGATGCTCTATGTAAGGA+AGG 0.575458 6:-58425456 MsG0680033171.01.T01:CDS
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TTGATGGTTTGTGCAAATCT+GGG 0.578200 6:-58425140 MsG0680033171.01.T01:CDS
TTTAGTGGGCTTGCTTGCCG+AGG 0.586015 6:-58420672 MsG0680033171.01.T01:intron
GTGTGTTAATGGTAAGGTCA+AGG 0.586543 6:-58425865 MsG0680033171.01.T01:CDS
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GAATTGAAAGTGACAACGGT+AGG 0.592206 6:+58425588 None:intergenic
TTAGTTTCTTTAATGAAATG+CGG 0.592276 6:-58425206 MsG0680033171.01.T01:CDS
ACCTACGGTTCATTAATGGA+TGG 0.599671 6:-58425366 MsG0680033171.01.T01:CDS
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GAAATCCAAGTGCAAGCACA+TGG 0.610248 6:+58425823 None:intergenic
AATCACAAACCAATCTGAGA+AGG 0.610945 6:-58424333 MsG0680033171.01.T01:CDS
ACATACAATGTACTTATCGA+TGG 0.610984 6:-58424946 MsG0680033171.01.T01:CDS
CATATCATGGAACAAACCAA+AGG 0.646932 6:+58425524 None:intergenic
TCCATCCATTAATGAACCGT+AGG 0.646978 6:+58425365 None:intergenic
ATCGATGGACTATGTAAAGG+AGG 0.647226 6:-58424931 MsG0680033171.01.T01:CDS
ATGAGAAAGGGAAACAGCAG+TGG 0.647257 6:+58426055 None:intergenic
CTGCGTGAAATGATTGTCAG+AGG 0.658086 6:-58420539 MsG0680033171.01.T01:CDS
TGAAAATGATAAGAACGGAA+GGG 0.668894 6:-58420573 MsG0680033171.01.T01:CDS
TAGAGAATTGAAAGTGACAA+CGG 0.669177 6:+58425584 None:intergenic
ATAGCTGTGATGATGAAAGA+AGG 0.673676 6:-58425408 MsG0680033171.01.T01:CDS
AAATGATAAGAACGGAAGGG+CGG 0.694929 6:-58420570 MsG0680033171.01.T01:CDS
GCTGATGGTCCTGTATACGG+TGG 0.762781 6:-58424296 MsG0680033171.01.T01:CDS
GAAATTGATTGACACCACTG+TGG 0.770991 6:-58425706 MsG0680033171.01.T01:CDS
TGTGTTATACATTACCACAG+TGG 0.805335 6:+58425692 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! ATTGAATTTAACAAAATTTT+AGG - Chr6:58420547-58420566 MsG0680033171.01.T01:CDS 10.0%
!!! TATAAAGTTTAGAATTTATA+CGG - Chr6:58424771-58424790 MsG0680033171.01.T01:intron 10.0%
!! AAAATAGAATAATTGAATGT+AGG - Chr6:58424871-58424890 MsG0680033171.01.T01:CDS 15.0%
!! AAGATTTCTCATTATATAAT+TGG - Chr6:58422033-58422052 MsG0680033171.01.T01:intron 15.0%
!! ACATATAATATTATGATCAA+TGG - Chr6:58425956-58425975 MsG0680033171.01.T01:CDS 15.0%
!! TAACAGAATAAAATGAAATT+GGG + Chr6:58423215-58423234 None:intergenic 15.0%
!! TAATCATGATAAATAATCAA+TGG - Chr6:58422702-58422721 MsG0680033171.01.T01:intron 15.0%
!! TTGCAAAATAAATAAATCAA+TGG + Chr6:58422099-58422118 None:intergenic 15.0%
!!! ATATCATTATCAATTGTTTT+GGG - Chr6:58425296-58425315 MsG0680033171.01.T01:CDS 15.0%
!!! TATATCATTATCAATTGTTT+TGG - Chr6:58425295-58425314 MsG0680033171.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTTATTTATTTTGCAAAATG+TGG - Chr6:58422103-58422122 MsG0680033171.01.T01:intron 15.0%
!! AAATATTTCTTTGTTCTCAA+CGG - Chr6:58424531-58424550 MsG0680033171.01.T01:intron 20.0%
!! AACAGAATAAAATGAAATTG+GGG + Chr6:58423214-58423233 None:intergenic 20.0%
!! ACGTATAATATTATGATCAA+TGG - Chr6:58421816-58421835 MsG0680033171.01.T01:intron 20.0%
!! AGAATACAATACTATCATAT+AGG + Chr6:58423180-58423199 None:intergenic 20.0%
!! ATAACTTGAATATTTGTTTG+TGG + Chr6:58425154-58425173 None:intergenic 20.0%
!! ATATTCAAAGTGAAAATATC+AGG + Chr6:58420652-58420671 None:intergenic 20.0%
!! ATCAGAAAAATTCACATATT+GGG + Chr6:58423111-58423130 None:intergenic 20.0%
!! ATTAGATTTGATGAAATTAG+TGG + Chr6:58425488-58425507 None:intergenic 20.0%
!! CATCAAAATGTAAAAAGAAA+TGG + Chr6:58425271-58425290 None:intergenic 20.0%
!! CATGATTATACCAAATTAAA+AGG + Chr6:58422690-58422709 None:intergenic 20.0%
!! CATTTCATTAAAGAAACTAA+AGG + Chr6:58421451-58421470 None:intergenic 20.0%
!! CTAACAGAATAAAATGAAAT+TGG + Chr6:58423216-58423235 None:intergenic 20.0%
!! TATCAGAAAAATTCACATAT+TGG + Chr6:58423112-58423131 None:intergenic 20.0%
!! TCTAAACTTTATAAGCTTTA+AGG + Chr6:58424764-58424783 None:intergenic 20.0%
!! TGAAATGACTTACATAATTA+AGG - Chr6:58423410-58423429 MsG0680033171.01.T01:intron 20.0%
!! TGATAAATTCTTTCAAACTT+TGG + Chr6:58424311-58424330 None:intergenic 20.0%
!! TTAGTTTCTTTAATGAAATG+CGG - Chr6:58421451-58421470 MsG0680033171.01.T01:intron 20.0%
!! TTATAAGTGAATATATTAGC+TGG + Chr6:58421594-58421613 None:intergenic 20.0%
!! TTGTATTCTATGTTGAAAAT+TGG - Chr6:58422547-58422566 MsG0680033171.01.T01:intron 20.0%
!! TTGTTAAATTCAATGATTGA+TGG + Chr6:58420541-58420560 None:intergenic 20.0%
!! TTGTTAGAATTTATTAGGAT+TGG + Chr6:58425619-58425638 None:intergenic 20.0%
!!! AAAAATTGATAGTTATCTTC+TGG - Chr6:58424662-58424681 MsG0680033171.01.T01:intron 20.0%
!!! ATATTTCTTCCTGAATATTT+TGG - Chr6:58424084-58424103 MsG0680033171.01.T01:intron 20.0%
!!! CATTTCTTTTTACATTTTGA+TGG - Chr6:58425269-58425288 MsG0680033171.01.T01:CDS 20.0%
!!! CTAAACTTTATAAGCTTTAA+GGG + Chr6:58424763-58424782 None:intergenic 20.0%
!!! GATACATTTTCTATATTAGA+GGG + Chr6:58423598-58423617 None:intergenic 20.0%
!!! GATAGACTTTTTTTTTAACA+AGG - Chr6:58425559-58425578 MsG0680033171.01.T01:CDS 20.0%
!!! TGGATTTTTTAAGAGTAAAA+TGG - Chr6:58421416-58421435 MsG0680033171.01.T01:intron 20.0%
!!! TGTTTATACTTTTAGCATAT+TGG - Chr6:58421179-58421198 MsG0680033171.01.T01:intron 20.0%
!!! TTCGTTTGTTAGAATTTATT+AGG + Chr6:58425624-58425643 None:intergenic 20.0%
!!! TTTGAAGATCTTTTGATTAA+AGG - Chr6:58425914-58425933 MsG0680033171.01.T01:CDS 20.0%
! AATAAGCGTATTAAAGGTAA+TGG + Chr6:58420764-58420783 None:intergenic 25.0%
! AATAATGCTTAACACATGTT+TGG + Chr6:58421346-58421365 None:intergenic 25.0%
! ACAATACATTGCAAAGTTAA+AGG + Chr6:58422246-58422265 None:intergenic 25.0%
! ACCTTTAATAAGCGTATTAA+AGG + Chr6:58420770-58420789 None:intergenic 25.0%
! ACCTTTAATACGCTTATTAA+AGG - Chr6:58420766-58420785 MsG0680033171.01.T01:intron 25.0%
! ACTTCAATCACTGTATATAT+TGG + Chr6:58422612-58422631 None:intergenic 25.0%
! ACTTTCAATTCTCTAATCTA+TGG - Chr6:58421081-58421100 MsG0680033171.01.T01:intron 25.0%
! AGATTAAAGACATCCTATAA+TGG + Chr6:58422795-58422814 None:intergenic 25.0%
! AGCTATAGTATCATGATTAA+TGG - Chr6:58421396-58421415 MsG0680033171.01.T01:intron 25.0%
! AGTACTAGTATAATGTCATT+TGG - Chr6:58425527-58425546 MsG0680033171.01.T01:CDS 25.0%
! AGTTGTTGAGAAAAATTGAA+GGG - Chr6:58420929-58420948 MsG0680033171.01.T01:intron 25.0%
! ATAAAAATGTGGAATCCAAT+TGG - Chr6:58425010-58425029 MsG0680033171.01.T01:CDS 25.0%
! ATAATAAGTGAACTTGGTTA+GGG + Chr6:58424122-58424141 None:intergenic 25.0%
! ATAATTATGGCAAGACAAAA+AGG + Chr6:58422223-58422242 None:intergenic 25.0%
! ATGACATTATACTAGTACTT+CGG + Chr6:58425526-58425545 None:intergenic 25.0%
! ATGATAGTATTGTATTCTCA+TGG - Chr6:58423182-58423201 MsG0680033171.01.T01:intron 25.0%
! ATGTATAACACAATCATTGA+TGG - Chr6:58420976-58420995 MsG0680033171.01.T01:intron 25.0%
! CACAATGTTATATAGAAGAA+TGG + Chr6:58422959-58422978 None:intergenic 25.0%
! CATCATATAATAAGTGAACT+TGG + Chr6:58424128-58424147 None:intergenic 25.0%
! CATGATAAATAATCAATGGT+TGG - Chr6:58422706-58422725 MsG0680033171.01.T01:intron 25.0%
! CATTTCAGAATATAACTCAT+AGG + Chr6:58421031-58421050 None:intergenic 25.0%
! CGTAAAATTGAAACAATTCT+TGG - Chr6:58423255-58423274 MsG0680033171.01.T01:intron 25.0%
! GATTCACTTACATAAAAATG+TGG - Chr6:58424999-58425018 MsG0680033171.01.T01:CDS 25.0%
! GCAAAGTTAAAGGATAATTA+TGG + Chr6:58422236-58422255 None:intergenic 25.0%
! TAGAAGTAATATAACACCTT+TGG - Chr6:58424426-58424445 MsG0680033171.01.T01:intron 25.0%
! TATAATAAGTGAACTTGGTT+AGG + Chr6:58424123-58424142 None:intergenic 25.0%
! TATGATAATAATCTTGTAGC+TGG - Chr6:58424569-58424588 MsG0680033171.01.T01:intron 25.0%
! TATGTCATCATAGTAGTATT+TGG + Chr6:58424408-58424427 None:intergenic 25.0%
! TCAGAAAAATTCACATATTG+GGG + Chr6:58423110-58423129 None:intergenic 25.0%
!! AATTTTTCTCAACAACTGTA+AGG + Chr6:58420926-58420945 None:intergenic 25.0%
!! AGAAACACTTTTGCAAATTT+TGG + Chr6:58423532-58423551 None:intergenic 25.0%
!! AGTTTAGAATTTATACGGTT+AGG - Chr6:58424776-58424795 MsG0680033171.01.T01:intron 25.0%
!! ATCAATGGACTTTGTAAAAA+GGG - Chr6:58421831-58421850 MsG0680033171.01.T01:intron 25.0%
!! ATCTATGGATTTTGCATTAT+TGG - Chr6:58421096-58421115 MsG0680033171.01.T01:intron 25.0%
!! ATGCTAAAAGTATAAACACT+TGG + Chr6:58421177-58421196 None:intergenic 25.0%
!! CGATACATTTTCTATATTAG+AGG + Chr6:58423599-58423618 None:intergenic 25.0%
!! CTCTTTGAAAATGATAAGAA+CGG - Chr6:58426079-58426098 MsG0680033171.01.T01:CDS 25.0%
!! GGTGTTGTATATGATTTATT+GGG - Chr6:58422382-58422401 MsG0680033171.01.T01:intron 25.0%
!! GTACTAGTATAATGTCATTT+GGG - Chr6:58425528-58425547 MsG0680033171.01.T01:CDS 25.0%
!! GTATTAAAGGTAATGGTATT+CGG + Chr6:58420757-58420776 None:intergenic 25.0%
!! TATAGATTTTTCTCAAGGTT+TGG - Chr6:58422918-58422937 MsG0680033171.01.T01:intron 25.0%
!! TATCAAGATTTTGTATGCAT+GGG - Chr6:58425367-58425386 MsG0680033171.01.T01:CDS 25.0%
!! TGCTAAAAGTATAAACACTT+GGG + Chr6:58421176-58421195 None:intergenic 25.0%
!! TTAAGCATTATTTCTCGAAT+GGG - Chr6:58421354-58421373 MsG0680033171.01.T01:intron 25.0%
!!! AACTTGCTAATGTGTTTTTT+GGG - Chr6:58425321-58425340 MsG0680033171.01.T01:CDS 25.0%
!!! TAGTAGATTTGTGGTTTTTT+GGG - Chr6:58423810-58423829 MsG0680033171.01.T01:intron 25.0%
!!! TGGTGTTGTATATGATTTAT+TGG - Chr6:58422381-58422400 MsG0680033171.01.T01:intron 25.0%
!!! TGTTTTTCAATACCATATCA+TGG + Chr6:58421149-58421168 None:intergenic 25.0%
AAAATGTTGCACATGAATCA+AGG + Chr6:58424804-58424823 None:intergenic 30.0%
AAATGCTAAGATGTTAACTG+AGG - Chr6:58423439-58423458 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
AATGCTAAGATGTTAACTGA+GGG - Chr6:58423440-58423459 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
ACATACAATGTACTTATCGA+TGG - Chr6:58421711-58421730 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
ACCAAATTAAAAGGCCTAAT+AGG + Chr6:58422681-58422700 None:intergenic 30.0%
ACTTACAATACTCTCATTGA+TGG - Chr6:58421501-58421520 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
AGAATTCCAATTGATGAGAA+AGG + Chr6:58420618-58420637 None:intergenic 30.0%
ATAACCCATCTTAAGAATCT+TGG + Chr6:58420731-58420750 None:intergenic 30.0%
ATACTATAGCTATGAGCATT+AGG + Chr6:58421387-58421406 None:intergenic 30.0%
ATTAAAGGTCTGTGTGTTAA+TGG - Chr6:58420781-58420800 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
CAAAAAAAAGAACAACACAG+TGG - Chr6:58425591-58425610 MsG0680033171.01.T01:CDS 30.0%
CAAAAAGATCACATTAAGCA+AGG - Chr6:58422893-58422912 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
CAGTTGTTGAGAAAAATTGA+AGG - Chr6:58420928-58420947 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
CCTAGTTAATGAAGTGAATA+AGG - Chr6:58421320-58421339 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
CCTATAATGAGAATAACTGT+GGG + Chr6:58422829-58422848 None:intergenic 30.0%
CCTTATTCACTTCATTAACT+AGG + Chr6:58421323-58421342 None:intergenic 30.0%
CGTAGAAATAGATTGTAGAT+TGG - Chr6:58423312-58423331 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
GAAATGAACATAACAACACA+CGG + Chr6:58422170-58422189 None:intergenic 30.0%
GAATTCCAATTGATGAGAAA+GGG + Chr6:58420617-58420636 None:intergenic 30.0%
GAGGATTATTATACATCTCA+AGG - Chr6:58425037-58425056 MsG0680033171.01.T01:CDS 30.0%
GATTACTTTGTCACCATTAT+AGG - Chr6:58422779-58422798 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
GTATTGTAAGTTACCTTATC+AGG + Chr6:58421492-58421511 None:intergenic 30.0%
GTCAAGAAAATTAAAACCCA+AGG - Chr6:58421669-58421688 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
GTTTCATAAGTTACAACATC+CGG + Chr6:58421911-58421930 None:intergenic 30.0%
TAAAGAAACTAAAGGCTTCT+TGG + Chr6:58421443-58421462 None:intergenic 30.0%
TAATAATCCTCTTGTCCAAT+TGG + Chr6:58425028-58425047 None:intergenic 30.0%
TAGAGAATTGAAAGTGACAA+CGG + Chr6:58421076-58421095 None:intergenic 30.0%
TAGTCACCAATTACTATTCT+TGG + Chr6:58424017-58424036 None:intergenic 30.0%
TCATAAAGATGAGAACGAAA+AGG - Chr6:58421949-58421968 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
TCCTATAATGAGAATAACTG+TGG + Chr6:58422830-58422849 None:intergenic 30.0%
TCTAATGTAAGATCAACACT+AGG - Chr6:58422006-58422025 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
TGAAAATGATAAGAACGGAA+GGG - Chr6:58426084-58426103 MsG0680033171.01.T01:CDS 30.0%
TTAAGGGAAAAACAGTGATT+GGG + Chr6:58424747-58424766 None:intergenic 30.0%
TTAATTGTTACTGCCATCTT+CGG - Chr6:58420677-58420696 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
TTCATTTCTTCGATACATGA+TGG - Chr6:58422182-58422201 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
TTGAAAATGATAAGAACGGA+AGG - Chr6:58426083-58426102 MsG0680033171.01.T01:CDS 30.0%
TTGTCAAAAATGAAGGACAA+TGG - Chr6:58421878-58421897 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
TTGTCAAAAATGGAAGACAA+TGG - Chr6:58426013-58426032 MsG0680033171.01.T01:CDS 30.0%
TTTAAGGGAAAAACAGTGAT+TGG + Chr6:58424748-58424767 None:intergenic 30.0%
TTTGTTCTATTAAGTGGATG+TGG - Chr6:58422405-58422424 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
! AATATTCAAGTTATCTCGTG+AGG - Chr6:58425160-58425179 MsG0680033171.01.T01:CDS 30.0%
! ATCAATGGTCTTTGTTTAGT+GGG - Chr6:58425971-58425990 MsG0680033171.01.T01:CDS 30.0%
! ATTGGGTTTGTTCTATTAAG+TGG - Chr6:58422399-58422418 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
! ATTGGTGACTAACTAATTGT+AGG - Chr6:58424026-58424045 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
! CTATCAAGATTTTGTATGCA+TGG - Chr6:58425366-58425385 MsG0680033171.01.T01:CDS 30.0%
! GAATTTTGCCTTTTCTATGT+TGG - Chr6:58420705-58420724 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
! GATCAATGGACTTTGTAAAA+AGG - Chr6:58421830-58421849 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
! GCAAAATGTGGATTATTCAA+TGG - Chr6:58422115-58422134 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
! GTAGGTTGAAAATTGAAAAG+CGG - Chr6:58422512-58422531 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
! GTTAAGCATTATTTCTCGAA+TGG - Chr6:58421353-58421372 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
! TACAAATGTCTAGTTTCTTG+TGG + Chr6:58424360-58424379 None:intergenic 30.0%
! TAGGTTGAAAATTGAAAAGC+GGG - Chr6:58422513-58422532 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
! TTTACACAACCCATTGATTA+AGG + Chr6:58420884-58420903 None:intergenic 30.0%
!! AATCAATGGGTTGTGTAAAA+TGG - Chr6:58420885-58420904 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
!! ATCAATGGGTTGTGTAAAAT+GGG - Chr6:58420886-58420905 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
!! TCCTATTAGGCCTTTTAATT+TGG - Chr6:58422677-58422696 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
!! TCTCTGAAGTTATTGAAATG+TGG - Chr6:58423386-58423405 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
!! TTCCAGGATCTTTTGATTAA+GGG - Chr6:58421774-58421793 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
!! TTTCCAGGATCTTTTGATTA+AGG - Chr6:58421773-58421792 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
!! TTTGCAAAAGTGTTTCTAGA+AGG - Chr6:58423535-58423554 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
!!! GAACTTGCTAATGTGTTTTT+TGG - Chr6:58425320-58425339 MsG0680033171.01.T01:CDS 30.0%
!!! GATTCATGTGCAACATTTTT+TGG - Chr6:58424805-58424824 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
!!! GTAGTAGATTTGTGGTTTTT+TGG - Chr6:58423809-58423828 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
!!! GTTTTTTTGTTGTGGTTTTG+AGG - Chr6:58422432-58422451 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTTACTATTTTGGCCTTCA+AGG - Chr6:58424175-58424194 MsG0680033171.01.T01:intron 30.0%
AAAGGATTCACATACTCCAA+AGG - Chr6:58423084-58423103 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
AAAGTTGCTGCTGAACAAAA+AGG - Chr6:58423066-58423085 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
AACCCTTAATCAAAAGATCC+TGG + Chr6:58421779-58421798 None:intergenic 35.0%
AAGGACTAGAAAGTGAAAAG+TGG - Chr6:58425056-58425075 MsG0680033171.01.T01:CDS 35.0%
AAGTGAATCTTCTGATCATC+AGG + Chr6:58424988-58425007 None:intergenic 35.0%
AATCACAAACCAATCTGAGA+AGG - Chr6:58422324-58422343 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
AATCTTGGCCAACATAGAAA+AGG + Chr6:58420716-58420735 None:intergenic 35.0%
AATGATCGTCAACACGAAAT+TGG - Chr6:58425698-58425717 MsG0680033171.01.T01:CDS 35.0%
ACACTGACACTTCAGATTAA+AGG + Chr6:58424902-58424921 None:intergenic 35.0%
ACAGTCACCACAATAAAACT+GGG + Chr6:58423857-58423876 None:intergenic 35.0%
ACTTCAGTTTCTCATCCTAA+AGG + Chr6:58423341-58423360 None:intergenic 35.0%
AGGAAGAAATATGACAGCTT+GGG + Chr6:58424076-58424095 None:intergenic 35.0%
AGGGTTATAGTGTAAATGCT+TGG - Chr6:58421793-58421812 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
ATAGCAAACCTCCAACAATT+AGG + Chr6:58425350-58425369 None:intergenic 35.0%
ATGAAAGAGAAGTCAACTAC+AGG - Chr6:58423979-58423998 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
CAAAAACCATCATGTTGACA+AGG - Chr6:58421635-58421654 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
CAAAATTCATTTCCCGAAGA+TGG + Chr6:58420693-58420712 None:intergenic 35.0%
CAAACTGAGGAAATAGCTTA+TGG + Chr6:58425426-58425445 None:intergenic 35.0%
CATATCATGGAACAAACCAA+AGG + Chr6:58421136-58421155 None:intergenic 35.0%
CATCTTTATGAAAGAGAGTG+CGG + Chr6:58421940-58421959 None:intergenic 35.0%
CATTTGAACCAAGTTAGCTA+CGG - Chr6:58420856-58420875 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
CCCACAGTTATTCTCATTAT+AGG - Chr6:58422826-58422845 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
CTCACAAACGTCTATCATAA+TGG + Chr6:58425649-58425668 None:intergenic 35.0%
CTTCAGTTTCTCATCCTAAA+GGG + Chr6:58423340-58423359 None:intergenic 35.0%
GAATATTTGTTTGTGGTGCA+AGG + Chr6:58425147-58425166 None:intergenic 35.0%
GCACTATTCATGTATGTGAA+TGG - Chr6:58423557-58423576 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
GTCACACCAAGAATAGTAAT+TGG - Chr6:58424008-58424027 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
GTGGAAAGACCAAAATATTC+AGG + Chr6:58424096-58424115 None:intergenic 35.0%
GTTTCAAAAGTTACAGCATC+AGG + Chr6:58426046-58426065 None:intergenic 35.0%
TAATTGTTACTGCCATCTTC+GGG - Chr6:58420678-58420697 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
TAGATACAAGAAGTCTATGC+AGG + Chr6:58424623-58424642 None:intergenic 35.0%
TCAATTTGCAGACTCATACA+AGG - Chr6:58423137-58423156 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
TGAAGTAGTAAGAGTTACTG+AGG + Chr6:58422995-58423014 None:intergenic 35.0%
TGCAGCTATCTAATTACCAA+AGG + Chr6:58424445-58424464 None:intergenic 35.0%
TGTGATTGTGATATGATGCT+CGG - Chr6:58424938-58424957 MsG0680033171.01.T01:CDS 35.0%
TGTGTTATACATTACCACAG+TGG + Chr6:58420968-58420987 None:intergenic 35.0%
TGTTACCTACGGTTCATTAA+TGG - Chr6:58421287-58421306 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
TGTTTCCCTTTCTCATCAAT+TGG - Chr6:58420609-58420628 MsG0680033171.01.T01:CDS 35.0%
TTCAGTTTCTCATCCTAAAG+GGG + Chr6:58423339-58423358 None:intergenic 35.0%
TTGGCCAAGATTCTTAAGAT+GGG - Chr6:58420724-58420743 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
TTTAATGAAATGCGGTCCAT+AGG - Chr6:58421459-58421478 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
! AATGATTGTCAGAGGTCTTT+TGG - Chr6:58426126-58426145 MsG0680033171.01.T01:CDS 35.0%
! AGGCGTATAGATTTTTCTCA+AGG - Chr6:58422913-58422932 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
! AGTGAAAAGTGGACTTAGAA+TGG - Chr6:58425067-58425086 MsG0680033171.01.T01:CDS 35.0%
! ATAGCTGTGATGATGAAAGA+AGG - Chr6:58421249-58421268 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
! ATTGATGGTTTGTGCAAATC+TGG - Chr6:58421516-58421535 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
! ATTGGTTGATGCTCTATGTA+AGG - Chr6:58421197-58421216 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
! CATAAGCTATTTCCTCAGTT+TGG - Chr6:58425424-58425443 MsG0680033171.01.T01:CDS 35.0%
! GATCAATGGTCTTTGTTTAG+TGG - Chr6:58425970-58425989 MsG0680033171.01.T01:CDS 35.0%
! GTTGACTTCTCTTTCATGAT+TGG + Chr6:58423976-58423995 None:intergenic 35.0%
! GTTGATGAGATGTGTGATAA+TGG - Chr6:58421564-58421583 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
! TAATCTGAAGTGTCAGTGTT+AGG - Chr6:58424903-58424922 MsG0680033171.01.T01:CDS 35.0%
! TCTGATTTTACTTTGTTCCC+TGG + Chr6:58425776-58425795 None:intergenic 35.0%
! TTGATGGTTTGTGCAAATCT+GGG - Chr6:58421517-58421536 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
! TTTTCTCAACAACTGTAAGG+CGG + Chr6:58420923-58420942 None:intergenic 35.0%
!! AATTCAATGATTGATGGCGA+AGG + Chr6:58420535-58420554 None:intergenic 35.0%
!! AGGCTTGTTGTCAAAAATGA+AGG - Chr6:58421871-58421890 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
!! CTTATCGATGGACTATGTAA+AGG - Chr6:58421723-58421742 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
!! CTTTGGTTTGTTCCATGATA+TGG - Chr6:58421134-58421153 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
!! GACTACTTTTCTACTTGCTA+TGG - Chr6:58423032-58423051 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
!! GATTTTTCTCAAGGTTTGGT+CGG - Chr6:58422922-58422941 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
!! GTCTTCCATTTTTGACAACA+GGG + Chr6:58426011-58426030 None:intergenic 35.0%
!! GTTCTCTGTTTCTCAGTTTT+GGG - Chr6:58423786-58423805 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
!! TCAATGGGTTGTGTAAAATG+GGG - Chr6:58420887-58420906 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
!! TGTCTTCCATTTTTGACAAC+AGG + Chr6:58426012-58426031 None:intergenic 35.0%
!! TGTTCTCTGTTTCTCAGTTT+TGG - Chr6:58423785-58423804 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
!! TTCTCTGTTTCTCAGTTTTG+GGG - Chr6:58423787-58423806 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
!!! CATGTGCAACATTTTTTGGA+TGG - Chr6:58424809-58424828 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
!!! GTGGTTCAGTTTTTTTGTTG+TGG - Chr6:58422424-58422443 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
!!! TACTTTTCTACTTGCTATGG+CGG - Chr6:58423035-58423054 MsG0680033171.01.T01:intron 35.0%
!!! TTGCTAATGTGTTTTTTGGG+TGG - Chr6:58425324-58425343 MsG0680033171.01.T01:CDS 35.0%
AAAGGGTCAAGGTTCTGTTA+TGG + Chr6:58425123-58425142 None:intergenic 40.0%
AAATGATAAGAACGGAAGGG+CGG - Chr6:58426087-58426106 MsG0680033171.01.T01:CDS 40.0%
AAGCTCTTACCTTCTCAGAT+TGG + Chr6:58422336-58422355 None:intergenic 40.0%
AAGGGTCAAGGTTCTGTTAT+GGG + Chr6:58425122-58425141 None:intergenic 40.0%
AATGCTGATGGTCCTGTATA+CGG - Chr6:58422358-58422377 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
AATTCACATATTGGGGCCTT+TGG + Chr6:58423103-58423122 None:intergenic 40.0%
ACATATCCAGGTGAATTCCT+TGG + Chr6:58421689-58421708 None:intergenic 40.0%
ACCAGACGTGAATCTCATAT+CGG - Chr6:58425823-58425842 MsG0680033171.01.T01:CDS 40.0%
ACCTACGGTTCATTAATGGA+TGG - Chr6:58421291-58421310 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
AGATCCCACAGTTATTCTCA+GGG - Chr6:58422822-58422841 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
AGCTACGGTACCTTAATCAA+TGG - Chr6:58420871-58420890 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
AGGATGAGAAACTGAAGTTG+AGG - Chr6:58423343-58423362 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
AGGTCTGTGTGTTAATGGTA+AGG - Chr6:58420786-58420805 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
ATCAACAAGCTTCCAAGCAT+AGG + Chr6:58421550-58421569 None:intergenic 40.0%
ATGCCAGATGTTGTTACCTA+CGG - Chr6:58421276-58421295 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
ATTACTTCCGACTTCATGTC+AGG + Chr6:58424843-58424862 None:intergenic 40.0%
CACAGTCACCACAATAAAAC+TGG + Chr6:58423858-58423877 None:intergenic 40.0%
CAGGAAGAAATATGACAGCT+TGG + Chr6:58424077-58424096 None:intergenic 40.0%
CAGTCACCACAATAAAACTG+GGG + Chr6:58423856-58423875 None:intergenic 40.0%
CATAGGAATTGCTCCTGATA+AGG - Chr6:58421476-58421495 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
CATATCCAGGTGAATTCCTT+GGG + Chr6:58421688-58421707 None:intergenic 40.0%
CATTGTATGTGCACATATCC+AGG + Chr6:58421701-58421720 None:intergenic 40.0%
CCTAATAGGACTATGCTTAG+AGG + Chr6:58422667-58422686 None:intergenic 40.0%
CCTCTAAGCATAGTCCTATT+AGG - Chr6:58422664-58422683 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
CTGCAATTTGTGTGTAGAGT+AGG - Chr6:58422494-58422513 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
CTTATCAGGAGCAATTCCTA+TGG + Chr6:58421478-58421497 None:intergenic 40.0%
CTTCGTGAAATGATTGCTAG+AGG - Chr6:58421983-58422002 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
GAAACAATTCTTGGCTAGCA+AGG - Chr6:58423264-58423283 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
GAAATTGATTGACACCACTG+TGG - Chr6:58420951-58420970 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
GAAGGACAATGGTATCATTC+CGG - Chr6:58421889-58421908 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
GAATTGAAAGTGACAACGGT+AGG + Chr6:58421072-58421091 None:intergenic 40.0%
GCTACGGTACCTTAATCAAT+GGG - Chr6:58420872-58420891 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
GGTCAATTGAAAGAAGCCTT+TGG - Chr6:58421117-58421136 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
GTAGTAAGAGTTACTGAGGT+TGG + Chr6:58422991-58423010 None:intergenic 40.0%
GTGTGTTAATGGTAAGGTCA+AGG - Chr6:58420792-58420811 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
GTTGATGCTCTATGTAAGGA+AGG - Chr6:58421201-58421220 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
GTTGGCCAAGATTCTTAAGA+TGG - Chr6:58420723-58420742 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
TAAAACCCAAGGAATTCACC+TGG - Chr6:58421680-58421699 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
TAAGATGTTAACTGAGGGCA+AGG - Chr6:58423445-58423464 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
TAAGTGAACTTGGTTAGGGA+AGG + Chr6:58424118-58424137 None:intergenic 40.0%
TACCAAGCAGGTCTCTAATT+TGG - Chr6:58425669-58425688 MsG0680033171.01.T01:CDS 40.0%
TAGATCCCACAGTTATTCTC+AGG - Chr6:58422821-58422840 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
TATACAACACCACCGTATAC+AGG + Chr6:58422373-58422392 None:intergenic 40.0%
TCCATCCATTAATGAACCGT+AGG + Chr6:58421295-58421314 None:intergenic 40.0%
TCTTAGTGAAGACCAAACTG+AGG + Chr6:58425439-58425458 None:intergenic 40.0%
TGCAATATGAATGCACAGCT+TGG + Chr6:58425093-58425112 None:intergenic 40.0%
TGTTTGTGGTGCAAGGAAAA+GGG + Chr6:58425140-58425159 None:intergenic 40.0%
TTCATATACCACCATCAAGC+CGG - Chr6:58425866-58425885 MsG0680033171.01.T01:CDS 40.0%
TTGACCCTGAGAATAACTGT+GGG + Chr6:58422876-58422895 None:intergenic 40.0%
TTGGATGCAAACTCATGAAC+TGG - Chr6:58425717-58425736 MsG0680033171.01.T01:CDS 40.0%
TTGTTTGTGGTGCAAGGAAA+AGG + Chr6:58425141-58425160 None:intergenic 40.0%
TTTGACCCTGAGAATAACTG+TGG + Chr6:58422877-58422896 None:intergenic 40.0%
! AAAGTACCATTCGGGACAAA+GGG - Chr6:58422756-58422775 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
! AATGGTACTTTTCCATGCGT+TGG + Chr6:58422747-58422766 None:intergenic 40.0%
! ACTTTTCCATGCGTTGGAAT+AGG + Chr6:58422741-58422760 None:intergenic 40.0%
! ATTGTAGATTGGTCCCCTTT+AGG - Chr6:58423323-58423342 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
! GAATGCACAAGATGTTTTCC+AGG - Chr6:58421758-58421777 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
! TCTTTTGGATGAGAAAGCCT+AGG - Chr6:58426141-58426160 MsG0680033171.01.T01:CDS 40.0%
! TGTGGTGACTGTGTTTGTTT+TGG - Chr6:58423865-58423884 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
!! AAAAGTACCATTCGGGACAA+AGG - Chr6:58422755-58422774 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
!! ACGCATGGAAAAGTACCATT+CGG - Chr6:58422747-58422766 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
!! ATCGATGGACTATGTAAAGG+AGG - Chr6:58421726-58421745 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
!! ATGTGAATGGACTAACCTTC+AGG - Chr6:58423570-58423589 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
!! CAATAGCCTTGTCAACATGA+TGG + Chr6:58421644-58421663 None:intergenic 40.0%
!! CAATGGGTTGTGTAAAATGG+GGG - Chr6:58420888-58420907 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
!! CTATATTAGAGGGTACCTGA+AGG + Chr6:58423588-58423607 None:intergenic 40.0%
!! GTAAGAGCTTTGAATGCTGA+TGG - Chr6:58422346-58422365 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
!! GTGGTGACTGTGTTTGTTTT+GGG - Chr6:58423866-58423885 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
!! TTAAGGTACCGTAGCTAACT+TGG + Chr6:58420867-58420886 None:intergenic 40.0%
!!! GTTTTGCCCCAGTTTTATTG+TGG - Chr6:58423847-58423866 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
!!! GTTTTGGGGTAGTAGATTTG+TGG - Chr6:58423801-58423820 MsG0680033171.01.T01:intron 40.0%
!!! TTTTTGGGTGGCCTAATTGT+TGG - Chr6:58425336-58425355 MsG0680033171.01.T01:CDS 40.0%
AAGGCTACATTGTCTCAGTC+TGG - Chr6:58425933-58425952 MsG0680033171.01.T01:CDS 45.0%
AAGTACCATTCGGGACAAAG+GGG - Chr6:58422757-58422776 MsG0680033171.01.T01:intron 45.0%
AGCAGAAACTGCACTCTATG+TGG + Chr6:58423642-58423661 None:intergenic 45.0%
ATCAGTCCTGAGCTAAAACC+AGG - Chr6:58425755-58425774 MsG0680033171.01.T01:CDS 45.0%
ATGAGAAAGGGAAACAGCAG+TGG + Chr6:58420605-58420624 None:intergenic 45.0%
ATTGAGGCTTAGTGTGTGTG+CGG - Chr6:58423745-58423764 MsG0680033171.01.T01:intron 45.0%
CCAGATAGCTTCAACCTTGA+AGG + Chr6:58424192-58424211 None:intergenic 45.0%
CCTTCAAGGTTGAAGCTATC+TGG - Chr6:58424189-58424208 MsG0680033171.01.T01:intron 45.0%
CTGCGTGAAATGATTGTCAG+AGG - Chr6:58426118-58426137 MsG0680033171.01.T01:CDS 45.0%
GAAATCCAAGTGCAAGCACA+TGG + Chr6:58420837-58420856 None:intergenic 45.0%
GAACCGTAGGTAACAACATC+TGG + Chr6:58421282-58421301 None:intergenic 45.0%
GTGGAATCCAATTGGACAAG+AGG - Chr6:58425018-58425037 MsG0680033171.01.T01:CDS 45.0%
TCAGTCCTGAGCTAAAACCA+GGG - Chr6:58425756-58425775 MsG0680033171.01.T01:CDS 45.0%
TCCGATATGAGATTCACGTC+TGG + Chr6:58425827-58425846 None:intergenic 45.0%
TCGTGCTTCCTTAAGTCTTC+CGG + Chr6:58425888-58425907 None:intergenic 45.0%
! CATTTTTGACAACAGGGCCT+CGG + Chr6:58426005-58426024 None:intergenic 45.0%
!! CGCATGGAAAAGTACCATTC+GGG - Chr6:58422748-58422767 MsG0680033171.01.T01:intron 45.0%
!!! GCTGCAGCTGTTTGGTTTTA+GGG - Chr6:58423659-58423678 MsG0680033171.01.T01:intron 45.0%
!!! GTTTTAGGGTCTGCTGTGTT+TGG - Chr6:58423673-58423692 MsG0680033171.01.T01:intron 45.0%
!!! TGCTGCAGCTGTTTGGTTTT+AGG - Chr6:58423658-58423677 MsG0680033171.01.T01:intron 45.0%
!!! TTGTTCCCTGGTTTTAGCTC+AGG + Chr6:58425764-58425783 None:intergenic 45.0%
!!! ATTTTTTTTTTTTACTATTT+TGG - Chr6:58424166-58424185 MsG0680033171.01.T01:intron 5.0%
AGACGTCCAAGCGAGCAAAA+AGG + Chr6:58423930-58423949 None:intergenic 50.0%
AGCGAGCAAAAAGGGCAACT+CGG + Chr6:58423921-58423940 None:intergenic 50.0%
AGGGCAACTCGGTACAATAG+AGG + Chr6:58423910-58423929 None:intergenic 50.0%
CACTAAGCCTCAATAACCCC+CGG + Chr6:58423739-58423758 None:intergenic 50.0%
CAGTTTCTGCTGCAGCTGTT+TGG - Chr6:58423651-58423670 MsG0680033171.01.T01:intron 50.0%
CCATCAAGCCGGAAGACTTA+AGG - Chr6:58425877-58425896 MsG0680033171.01.T01:CDS 50.0%
CGAGGCCCTGTTGTCAAAAA+TGG - Chr6:58426003-58426022 MsG0680033171.01.T01:CDS 50.0%
CGCCAAATTAGAGACCTGCT+TGG + Chr6:58425674-58425693 None:intergenic 50.0%
CTGGGAGAATCTCCTATGCT+TGG - Chr6:58421535-58421554 MsG0680033171.01.T01:intron 50.0%
CTTCTGATCATCAGGTCCAC+CGG + Chr6:58424980-58424999 None:intergenic 50.0%
GACGTCCAAGCGAGCAAAAA+GGG + Chr6:58423929-58423948 None:intergenic 50.0%
GACGTTTGTGAGTACCAAGC+AGG - Chr6:58425657-58425676 MsG0680033171.01.T01:CDS 50.0%
GGGAAACAGCAGTGGTGTAA+TGG + Chr6:58420597-58420616 None:intergenic 50.0%
GGGTCTGTTTGATGAAGCAG+AGG - Chr6:58421851-58421870 MsG0680033171.01.T01:intron 50.0%
GTAATCCCCTTTGTCCCGAA+TGG + Chr6:58422765-58422784 None:intergenic 50.0%
GTGAACTTGGTTAGGGAAGG+TGG + Chr6:58424115-58424134 None:intergenic 50.0%
GTGCAACCTATTCCAACGCA+TGG - Chr6:58422732-58422751 MsG0680033171.01.T01:intron 50.0%
TCAGGACTGATGAGATCTGC+AGG + Chr6:58425746-58425765 None:intergenic 50.0%
TGCCAAGCCTGACATGAAGT+CGG - Chr6:58424833-58424852 MsG0680033171.01.T01:CDS 50.0%
TGGTGCAAGGAAAAGGGTCA+AGG + Chr6:58425134-58425153 None:intergenic 50.0%
TTCCGACTTCATGTCAGGCT+TGG + Chr6:58424838-58424857 None:intergenic 50.0%
TTGAGGCTTAGTGTGTGTGC+GGG - Chr6:58423746-58423765 MsG0680033171.01.T01:intron 50.0%
TTGGGTGGCCTAATTGTTGG+AGG - Chr6:58425339-58425358 MsG0680033171.01.T01:CDS 50.0%
! AGTTGCCCTTTTTGCTCGCT+TGG - Chr6:58423921-58423940 MsG0680033171.01.T01:intron 50.0%
! CCTTAAGTCTTCCGGCTTGA+TGG + Chr6:58425880-58425899 None:intergenic 50.0%
! TAAGTCTTCCGGCTTGATGG+TGG + Chr6:58425877-58425896 None:intergenic 50.0%
! TTAGTGTGTGTGCGGGGTTT+TGG - Chr6:58423753-58423772 MsG0680033171.01.T01:intron 50.0%
CACGACCATGTGCTTGCACT+TGG - Chr6:58420829-58420848 MsG0680033171.01.T01:intron 55.0%
CAGTGTGAATATGCAGCCGG+TGG - Chr6:58424961-58424980 MsG0680033171.01.T01:CDS 55.0%
CGGCAGTGTGAATATGCAGC+CGG - Chr6:58424958-58424977 MsG0680033171.01.T01:CDS 55.0%
GCAGTTTCTGCTGCTCTGCT+GGG - Chr6:58423705-58423724 MsG0680033171.01.T01:intron 55.0%
GCTGATGGTCCTGTATACGG+TGG - Chr6:58422361-58422380 MsG0680033171.01.T01:intron 55.0%
TGAGGCTTAGTGTGTGTGCG+GGG - Chr6:58423747-58423766 MsG0680033171.01.T01:intron 55.0%
TGCAGTTTCTGCTGCTCTGC+TGG - Chr6:58423704-58423723 MsG0680033171.01.T01:intron 55.0%
TTTCTGCTGCTCTGCTGGGT+GGG - Chr6:58423709-58423728 MsG0680033171.01.T01:intron 55.0%
!! TTTAGTGGGCTTGCTTGCCG+AGG - Chr6:58425985-58426004 MsG0680033171.01.T01:CDS 55.0%
CTCGCTTGGACGTCTTGTGC+TGG - Chr6:58423935-58423954 MsG0680033171.01.T01:intron 60.0%
GTTTCTGCTGCTCTGCTGGG+TGG - Chr6:58423708-58423727 MsG0680033171.01.T01:intron 60.0%
! TGGACGTCTTGTGCTGGCAG+CGG - Chr6:58423941-58423960 MsG0680033171.01.T01:intron 60.0%
GGGTGTGCCGGGGGTTATTG+AGG - Chr6:58423729-58423748 MsG0680033171.01.T01:intron 65.0%
CTCTGCTGGGTGGGTGTGCC+GGG - Chr6:58423718-58423737 MsG0680033171.01.T01:intron 70.0%
GCTCTGCTGGGTGGGTGTGC+CGG - Chr6:58423717-58423736 MsG0680033171.01.T01:intron 70.0%
TCTGCTGGGTGGGTGTGCCG+GGG - Chr6:58423719-58423738 MsG0680033171.01.T01:intron 70.0%
CTGCTGGGTGGGTGTGCCGG+GGG - Chr6:58423720-58423739 MsG0680033171.01.T01:intron 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 58420517 58426162 58420517 ID=MsG0680033171.01;Name=MsG0680033171.01
Chr6 mRNA 58420517 58426162 58420517 ID=MsG0680033171.01.T01;Parent=MsG0680033171.01;Name=MsG0680033171.01.T01;_AED=0.40;_eAED=0.43;_QI=0|0|0|1|1|1|3|0|531
Chr6 exon 58424827 58426162 58424827 ID=MsG0680033171.01.T01:exon:4163;Parent=MsG0680033171.01.T01
Chr6 exon 58424276 58424362 58424276 ID=MsG0680033171.01.T01:exon:4164;Parent=MsG0680033171.01.T01
Chr6 exon 58420517 58420689 58420517 ID=MsG0680033171.01.T01:exon:4165;Parent=MsG0680033171.01.T01
Chr6 CDS 58424827 58426162 58424827 ID=MsG0680033171.01.T01:cds;Parent=MsG0680033171.01.T01
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Chr6 CDS 58420517 58420689 58420517 ID=MsG0680033171.01.T01:cds;Parent=MsG0680033171.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680033171.01.T01

ATGCTTCGTAAGAATCCTTCGCCATCAATCATTGAATTTAACAAAATTTTAGGTTCACTTGTTAAGTCTAACAACAACCATTACACCACTGCTGTTTCCCTTTCTCATCAATTGGAATTCTATAGAATTATTCCTGATATTTTCACTTTGAATATTCTCATTAATTGTTACTGCCATCTTCGGGAAATGAATTTTGCCTTTTCTATGTTGGCCAAGATTCTTAAGATGGGTTATCAGCCGAATACCATTACCTTTAATACGCTTATTAAAGGTCTGTGTGTTAATGGTAAGGTCAAGGAAGCTCTTCACTTTCACGACCATGTGCTTGCACTTGGATTTCATTTGAACCAAGTTAGCTACGGTACCTTAATCAATGGGTTGTGTAAAATGGGGGAAACAAGAACCGCCTTACAGTTGTTGAGAAAAATTGAAGGGAAATTGATTGACACCACTGTGGTAATGTATAACACAATCATTGATGGTTTGTGTAAAGATAAACTTGTAAATGATGCCTATGAGTTATATTCTGAAATGATTACAAAGAGAATTTCTCCTACCGTTGTCACTTTCAATTCTCTAATCTATGGATTTTGCATTATTGGTCAATTGAAAGAAGCCTTTGGTTTGTTCCATGATATGGTATTGAAAAACATCGACCCAAGTGTTTATACTTTTAGCATATTGGTTGATGCTCTATGTAAGGAAGGAAAGATGAAAGAAGCTAAAAATGTGATAGCTGTGATGATGAAAGAAGGCGTGATGCCAGATGTTGTTACCTACGGTTCATTAATGGATGGATATTGCCTAGTTAATGAAGTGAATAAGGCCAAACATGTGTTAAGCATTATTTCTCGAATGGGAGTGACTCCTAATGCTCATAGCTATAGTATCATGATTAATGGATTTTTTAAGAGTAAAATGGTCCAAGAAGCCTTTAGTTTCTTTAATGAAATGCGGTCCATAGGAATTGCTCCTGATAAGGTAACTTACAATACTCTCATTGATGGTTTGTGCAAATCTGGGAGAATCTCCTATGCTTGGAAGCTTGTTGATGAGATGTGTGATAATGGTCAACCAGCTAATATATTCACTTATAATTCGTTAATAGATGCTCTGTGCAAAAACCATCATGTTGACAAGGCTATTGCATTAGTCAAGAAAATTAAAACCCAAGGAATTCACCTGGATATGTGCACATACAATGTACTTATCGATGGACTATGTAAAGGAGGACGACTTAAGAATGCACAAGATGTTTTCCAGGATCTTTTGATTAAGGGTTATAGTGTAAATGCTTGGACGTATAATATTATGATCAATGGACTTTGTAAAAAGGCGAGTCAAATCACAAACCAATCTGAGAAGGTAAGAGCTTTGAATGCTGATGGTCCTGTATACGGTGGTGTTGTATATGATTTATTGGTGGGCTTGCTTGCCGAGGCCCTGTTGTCAAAAATGGAAGACAATGGATGCATTCCTGATGCTGTAACTTTTGAAACAATTGTACGCGCTCTCTTTGAAAATGATAAGAACGGAAGGGCGGAGAAACTACTGCGTGAAATGATTGTCAGAGGTCTTTTGGATGAGAAAGCCTAG
Protein sequence

>MsG0680033171.01.T01

MLRKNPSPSIIEFNKILGSLVKSNNNHYTTAVSLSHQLEFYRIIPDIFTLNILINCYCHLREMNFAFSMLAKILKMGYQPNTITFNTLIKGLCVNGKVKEALHFHDHVLALGFHLNQVSYGTLINGLCKMGETRTALQLLRKIEGKLIDTTVVMYNTIIDGLCKDKLVNDAYELYSEMITKRISPTVVTFNSLIYGFCIIGQLKEAFGLFHDMVLKNIDPSVYTFSILVDALCKEGKMKEAKNVIAVMMKEGVMPDVVTYGSLMDGYCLVNEVNKAKHVLSIISRMGVTPNAHSYSIMINGFFKSKMVQEAFSFFNEMRSIGIAPDKVTYNTLIDGLCKSGRISYAWKLVDEMCDNGQPANIFTYNSLIDALCKNHHVDKAIALVKKIKTQGIHLDMCTYNVLIDGLCKGGRLKNAQDVFQDLLIKGYSVNAWTYNIMINGLCKKASQITNQSEKVRALNADGPVYGGVVYDLLVGLLAEALLSKMEDNGCIPDAVTFETIVRALFENDKNGRAEKLLREMIVRGLLDEKA*