AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180001256.01

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MsG0180001256.01.T01 AT3G53930 28.487 337 189 10 24 350 20 314 7.46e-28 116
MsG0180001256.01.T01 AT3G53930 28.487 337 189 10 24 350 20 314 7.68e-28 116
MsG0180001256.01.T01 AT2G38910 31.803 305 153 12 22 316 132 391 8.31e-28 115
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MsG0180001256.01.T01 AT3G20410 30.897 301 159 9 24 317 91 349 9.75e-28 115
MsG0180001256.01.T01 AT2G41860 27.717 368 210 13 2 354 24 350 1.03e-27 115
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MsG0180001256.01.T01 AT3G19100 29.851 335 173 13 12 327 129 420 1.02e-26 112
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MsG0180001256.01.T01 AT3G17850 27.300 337 159 10 22 317 880 1171 3.24e-26 111
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MsG0180001256.01.T01 AT4G04720 31.104 299 159 10 24 316 80 337 5.04e-26 110
MsG0180001256.01.T01 AT1G48490 29.909 331 152 12 22 317 827 1112 5.07e-26 111
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MsG0180001256.01.T01 AT1G48490 29.909 331 152 12 22 317 826 1111 5.12e-26 111
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MsG0180001256.01.T01 AT3G08730 27.036 307 164 10 22 317 132 389 7.20e-26 109
MsG0180001256.01.T01 AT4G04695 31.013 316 157 11 24 324 28 297 7.37e-26 109
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MsG0180001256.01.T01 AT3G08720 28.431 306 157 11 24 317 140 395 1.77e-25 108
MsG0180001256.01.T01 AT3G08720 28.431 306 157 11 24 317 140 395 1.77e-25 108
MsG0180001256.01.T01 AT3G08720 28.431 306 157 11 24 317 140 395 1.77e-25 108
MsG0180001256.01.T01 AT3G51850 30.592 304 158 12 22 316 52 311 3.99e-25 106
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MsG0180001256.01.T01 AT3G51850 30.323 310 151 12 22 316 52 311 7.24e-25 106
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MsG0180001256.01.T01 AT4G21940 31.000 300 158 11 24 316 102 359 1.01e-24 106
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MsG0180001256.01.T01 AT4G36070 25.128 390 215 10 22 398 69 394 3.18e-24 105
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MsG0180001256.01.T01 AT5G66210 26.000 350 203 10 22 357 60 367 3.75e-24 104
MsG0180001256.01.T01 AT3G45240 27.575 301 159 8 28 316 112 365 4.13e-24 103
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MsG0180001256.01.T01 AT3G45240 27.961 304 157 9 28 316 112 368 2.36e-23 101
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MsG0180001256.01.T01 AT4G04740 29.110 292 156 9 26 316 85 326 3.50e-23 101
MsG0180001256.01.T01 AT4G04740 29.110 292 156 9 26 316 85 326 3.50e-23 101
MsG0180001256.01.T01 AT4G04740 29.110 292 156 9 26 316 85 326 3.50e-23 101
MsG0180001256.01.T01 AT4G04740 29.110 292 156 9 26 316 85 326 3.50e-23 101
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MsG0180001256.01.T01 AT1G50240 27.119 295 164 10 24 314 6 253 4.91e-22 99.4
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MsG0180001256.01.T01 AT4G14350 27.168 346 160 11 21 317 116 418 6.62e-21 95.1
MsG0180001256.01.T01 AT4G14350 27.168 346 160 11 21 317 116 418 7.20e-21 95.1
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MsG0180001256.01.T01 AT1G30640 29.747 316 192 11 22 317 118 423 8.64e-21 94.7
MsG0180001256.01.T01 AT3G10540 29.766 299 145 10 24 305 45 295 2.46e-20 93.2
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MsG0180001256.01.T01 AT5G58140 27.492 331 160 11 24 317 577 864 2.01e-19 91.3
MsG0180001256.01.T01 AT5G58140 27.492 331 160 11 24 317 577 864 2.01e-19 91.3
MsG0180001256.01.T01 AT5G58140 27.492 331 160 11 24 317 577 864 2.59e-19 90.9
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MsG0180001256.01.T01 AT2G19400 25.915 355 161 10 22 317 103 414 6.39e-19 89.0
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MsG0180001256.01.T01 AT1G63700 25.163 306 177 8 23 321 399 659 1.94e-18 88.2
MsG0180001256.01.T01 AT4G33080 25.846 325 198 9 22 317 92 402 2.47e-18 87.4
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MsG0180001256.01.T01 AT1G03920 26.163 344 165 11 21 317 21 322 6.21e-18 85.9
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MsG0180001256.01.T01 AT1G03920 25.581 344 167 10 21 317 134 435 1.30e-17 85.1
MsG0180001256.01.T01 AT1G49180 28.295 258 139 7 60 311 42 259 1.51e-17 84.0
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MsG0180001256.01.T01 AT2G20470 25.294 340 166 8 24 317 124 421 5.10e-17 83.6
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MsG0180001256.01.T01 AT1G54510 25.558 403 215 17 22 397 2 346 2.16e-16 81.6
MsG0180001256.01.T01 AT1G54510 25.558 403 215 17 22 397 2 346 2.16e-16 81.6
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MsG0180001256.01.T01 AT3G05840 30.556 252 125 13 9 253 62 270 2.64e-13 71.6
MsG0180001256.01.T01 AT4G13000 33.577 137 82 3 204 340 217 344 3.09e-13 70.9
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MsG0180001256.01.T01 AT3G61160 26.415 318 165 13 30 317 108 386 3.99e-12 67.8
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MsG0180001256.01.T02 AT5G25110 36.977 311 133 11 23 321 42 301 4.62e-50 176
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MsG0180001256.01.T02 AT3G01090 35.952 331 158 7 24 350 42 322 5.53e-48 171
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MsG0180001256.01.T02 AT2G26980 33.123 317 152 8 15 320 5 272 3.13e-46 164
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MsG0180001256.01.T02 AT2G34180 34.853 307 147 7 22 321 55 315 3.44e-44 160
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MsG0180001256.01.T02 AT2G38490 35.016 317 145 10 23 328 27 293 3.07e-39 145
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MsG0180001256.01.T02 AT5G21222 34.098 305 149 8 23 320 12 271 3.52e-38 147
MsG0180001256.01.T02 AT5G21222 34.098 305 149 8 23 320 12 271 3.52e-38 147
MsG0180001256.01.T02 AT5G21222 34.098 305 149 8 23 320 12 271 3.52e-38 147
MsG0180001256.01.T02 AT1G29230 33.550 307 149 8 23 321 73 332 2.73e-36 139
MsG0180001256.01.T02 AT5G01820 34.967 306 138 10 23 317 21 276 8.69e-36 136
MsG0180001256.01.T02 AT1G30270 35.246 244 102 8 87 323 1 195 8.72e-36 135
MsG0180001256.01.T02 AT4G11373 82.857 70 12 0 52 121 1 70 2.53e-35 126
MsG0180001256.01.T02 AT5G12180 34.106 302 146 10 24 316 73 330 7.85e-33 129
MsG0180001256.01.T02 AT1G12580 31.894 301 158 8 22 316 42 301 1.30e-32 129
MsG0180001256.01.T02 AT1G35670 34.951 309 152 10 22 323 24 290 4.25e-32 127
MsG0180001256.01.T02 AT4G32830 27.243 301 169 7 24 320 31 285 8.28e-32 122
MsG0180001256.01.T02 AT3G17510 33.603 247 107 8 85 323 5 202 1.52e-31 123
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MsG0180001256.01.T02 AT2G45490 31.541 279 141 8 24 298 22 254 2.33e-31 120
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MsG0180001256.01.T02 AT1G50700 32.890 301 153 10 24 317 73 331 3.03e-30 122
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MsG0180001256.01.T02 AT3G61960 29.530 298 161 8 24 314 10 265 4.14e-30 122
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MsG0180001256.01.T02 AT1G48260 33.043 230 98 7 95 317 1 181 5.71e-30 119
MsG0180001256.01.T02 AT1G48260 33.043 230 98 7 95 317 1 181 5.71e-30 119
MsG0180001256.01.T02 AT5G23580 32.013 303 159 8 22 318 20 281 9.84e-30 120
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MsG0180001256.01.T02 AT2G17290 32.787 305 158 8 22 320 83 346 1.73e-29 120
MsG0180001256.01.T02 AT4G23650 33.003 303 148 10 24 316 78 335 6.94e-29 118
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MsG0180001256.01.T02 AT5G19450 28.402 338 194 10 24 354 57 353 1.52e-28 117
MsG0180001256.01.T02 AT2G31500 31.126 302 157 10 23 316 65 323 1.73e-28 117
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MsG0180001256.01.T02 AT3G10660 32.441 299 155 9 24 316 186 443 6.83e-28 116
MsG0180001256.01.T02 AT3G53930 28.487 337 189 10 24 350 20 314 7.46e-28 116
MsG0180001256.01.T02 AT3G53930 28.487 337 189 10 24 350 20 314 7.68e-28 116
MsG0180001256.01.T02 AT2G38910 31.803 305 153 12 22 316 132 391 8.31e-28 115
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MsG0180001256.01.T02 AT3G20410 30.897 301 159 9 24 317 91 349 9.75e-28 115
MsG0180001256.01.T02 AT2G41860 27.717 368 210 13 2 354 24 350 1.03e-27 115
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MsG0180001256.01.T02 AT5G62310 29.762 336 148 13 24 317 754 1043 3.53e-27 114
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MsG0180001256.01.T02 AT4G38230 30.820 305 164 8 22 320 22 285 9.20e-27 112
MsG0180001256.01.T02 AT3G19100 29.851 335 173 13 12 327 129 420 1.02e-26 112
MsG0180001256.01.T02 AT4G38230 30.820 305 164 8 22 320 52 315 1.27e-26 112
MsG0180001256.01.T02 AT3G50530 29.290 338 177 13 9 327 130 424 1.75e-26 112
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MsG0180001256.01.T02 AT4G35310 32.459 305 159 9 22 320 95 358 2.39e-26 111
MsG0180001256.01.T02 AT3G17850 27.300 337 159 10 22 317 880 1171 3.24e-26 111
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MsG0180001256.01.T02 AT4G04720 31.104 299 159 10 24 316 80 337 5.04e-26 110
MsG0180001256.01.T02 AT1G48490 29.909 331 152 12 22 317 827 1112 5.07e-26 111
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MsG0180001256.01.T02 AT1G48490 29.909 331 152 12 22 317 826 1111 5.12e-26 111
MsG0180001256.01.T02 AT1G48490 29.909 331 152 12 22 317 826 1111 5.12e-26 111
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MsG0180001256.01.T02 AT3G08730 27.036 307 164 10 22 317 132 389 7.20e-26 109
MsG0180001256.01.T02 AT4G04695 31.013 316 157 11 24 324 28 297 7.37e-26 109
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MsG0180001256.01.T02 AT3G08720 28.431 306 157 11 24 317 140 395 1.77e-25 108
MsG0180001256.01.T02 AT3G08720 28.431 306 157 11 24 317 140 395 1.77e-25 108
MsG0180001256.01.T02 AT3G08720 28.431 306 157 11 24 317 140 395 1.77e-25 108
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MsG0180001256.01.T02 AT2G35890 31.596 307 159 12 19 317 127 390 5.51e-25 107
MsG0180001256.01.T02 AT3G51850 30.323 310 151 12 22 316 52 311 7.24e-25 106
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MsG0180001256.01.T02 AT3G51850 30.323 310 151 12 22 316 52 311 8.28e-25 106
MsG0180001256.01.T02 AT4G21940 31.000 300 158 11 24 316 102 359 8.60e-25 106
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MsG0180001256.01.T02 AT4G21940 31.000 300 158 11 24 316 102 359 1.01e-24 106
MsG0180001256.01.T02 AT1G61950 30.132 302 163 10 22 316 96 356 1.41e-24 106
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MsG0180001256.01.T02 AT5G66210 26.000 350 203 10 22 357 60 367 1.73e-24 104
MsG0180001256.01.T02 AT4G36070 27.393 303 171 8 22 316 69 330 2.63e-24 105
MsG0180001256.01.T02 AT5G66210 26.000 350 203 10 22 357 60 367 3.00e-24 104
MsG0180001256.01.T02 AT4G36070 25.128 390 215 10 22 398 69 394 3.18e-24 105
MsG0180001256.01.T02 AT5G66210 26.000 350 203 10 22 357 60 367 3.75e-24 104
MsG0180001256.01.T02 AT5G66210 26.000 350 203 10 22 357 60 367 3.75e-24 104
MsG0180001256.01.T02 AT3G45240 27.575 301 159 8 28 316 112 365 4.13e-24 103
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MsG0180001256.01.T02 AT3G45240 27.961 304 157 9 28 316 112 368 2.36e-23 101
MsG0180001256.01.T02 AT3G45240 27.961 304 157 9 28 316 112 368 2.36e-23 101
MsG0180001256.01.T02 AT1G45160 26.807 332 163 10 22 317 668 955 2.37e-23 103
MsG0180001256.01.T02 AT1G45160 26.807 332 163 10 22 317 668 955 3.24e-23 102
MsG0180001256.01.T02 AT1G08650 26.059 307 174 9 19 316 10 272 3.28e-23 99.0
MsG0180001256.01.T02 AT4G04740 29.110 292 156 9 26 316 85 326 3.50e-23 101
MsG0180001256.01.T02 AT4G04740 29.110 292 156 9 26 316 85 326 3.50e-23 101
MsG0180001256.01.T02 AT4G04740 29.110 292 156 9 26 316 85 326 3.50e-23 101
MsG0180001256.01.T02 AT4G04740 29.110 292 156 9 26 316 85 326 3.50e-23 101
MsG0180001256.01.T02 AT4G04740 29.110 292 156 9 26 316 85 326 3.50e-23 101
MsG0180001256.01.T02 AT4G04740 29.110 292 156 9 26 316 85 326 3.50e-23 101
MsG0180001256.01.T02 AT3G50530 27.642 369 174 15 9 327 130 455 1.60e-22 100
MsG0180001256.01.T02 AT3G56760 27.761 335 174 13 12 327 115 400 1.64e-22 100
MsG0180001256.01.T02 AT5G57630 40.000 145 78 4 174 317 40 176 4.16e-22 96.7
MsG0180001256.01.T02 AT1G50240 27.119 295 164 10 24 314 6 253 4.91e-22 99.4
MsG0180001256.01.T02 AT1G50240 27.119 295 164 10 24 314 6 253 4.91e-22 99.4
MsG0180001256.01.T02 AT4G04710 29.841 315 165 11 24 322 36 310 5.85e-22 98.2
MsG0180001256.01.T02 AT1G08650 25.974 308 173 10 19 317 10 271 6.03e-22 95.1
MsG0180001256.01.T02 AT4G04710 29.841 315 165 11 24 322 36 310 6.19e-22 97.8
MsG0180001256.01.T02 AT3G23310 28.161 348 156 11 21 317 117 421 8.63e-22 97.8
MsG0180001256.01.T02 AT2G46700 28.302 318 174 12 23 327 142 418 1.53e-21 97.1
MsG0180001256.01.T02 AT1G30640 29.747 316 192 11 22 317 25 330 5.69e-21 95.1
MsG0180001256.01.T02 AT4G14350 27.168 346 160 11 21 317 116 418 6.62e-21 95.1
MsG0180001256.01.T02 AT4G14350 27.168 346 160 11 21 317 116 418 6.62e-21 95.1
MsG0180001256.01.T02 AT4G14350 27.168 346 160 11 21 317 116 418 6.62e-21 95.1
MsG0180001256.01.T02 AT4G14350 27.168 346 160 11 21 317 116 418 7.20e-21 95.1
MsG0180001256.01.T02 AT1G30640 29.747 316 192 11 22 317 118 423 8.64e-21 94.7
MsG0180001256.01.T02 AT1G30640 29.747 316 192 11 22 317 118 423 8.64e-21 94.7
MsG0180001256.01.T02 AT3G10540 29.766 299 145 10 24 305 45 295 2.46e-20 93.2
MsG0180001256.01.T02 AT4G04710 31.538 260 125 9 68 322 72 283 4.13e-20 92.4
MsG0180001256.01.T02 AT5G58140 27.492 331 160 11 24 317 577 864 2.01e-19 91.3
MsG0180001256.01.T02 AT5G58140 27.492 331 160 11 24 317 577 864 2.01e-19 91.3
MsG0180001256.01.T02 AT5G58140 27.492 331 160 11 24 317 577 864 2.01e-19 91.3
MsG0180001256.01.T02 AT5G58140 27.492 331 160 11 24 317 577 864 2.01e-19 91.3
MsG0180001256.01.T02 AT5G58140 27.492 331 160 11 24 317 577 864 2.01e-19 91.3
MsG0180001256.01.T02 AT5G58140 27.492 331 160 11 24 317 577 864 2.59e-19 90.9
MsG0180001256.01.T02 AT5G09890 27.812 320 205 10 22 324 100 410 4.97e-19 89.4
MsG0180001256.01.T02 AT5G09890 27.812 320 205 10 22 324 100 410 5.12e-19 89.4
MsG0180001256.01.T02 AT2G19400 25.915 355 161 10 22 317 103 414 6.39e-19 89.0
MsG0180001256.01.T02 AT4G38470 25.874 286 162 9 30 311 296 535 8.08e-19 89.0
MsG0180001256.01.T02 AT4G38470 25.874 286 162 9 30 311 296 535 9.41e-19 88.6
MsG0180001256.01.T02 AT1G63700 25.163 306 177 8 23 321 399 659 1.94e-18 88.2
MsG0180001256.01.T02 AT1G63700 25.163 306 177 8 23 321 399 659 1.94e-18 88.2
MsG0180001256.01.T02 AT4G33080 25.846 325 198 9 22 317 92 402 2.47e-18 87.4
MsG0180001256.01.T02 AT4G33080 25.846 325 198 9 22 317 92 402 2.71e-18 87.0
MsG0180001256.01.T02 AT2G46700 27.675 271 149 9 63 327 8 237 4.01e-18 85.9
MsG0180001256.01.T02 AT2G46700 27.675 271 149 9 63 327 8 237 4.01e-18 85.9
MsG0180001256.01.T02 AT1G03920 26.163 344 165 11 21 317 21 322 6.21e-18 85.9
MsG0180001256.01.T02 AT1G03920 25.581 344 167 10 21 317 134 435 1.30e-17 85.1
MsG0180001256.01.T02 AT1G03920 25.581 344 167 10 21 317 134 435 1.30e-17 85.1
MsG0180001256.01.T02 AT1G49180 28.295 258 139 7 60 311 42 259 1.51e-17 84.0
MsG0180001256.01.T02 AT4G08500 26.578 301 166 11 30 322 339 592 1.82e-17 84.7
MsG0180001256.01.T02 AT1G49180 28.295 258 139 7 60 311 42 259 1.87e-17 84.0
MsG0180001256.01.T02 AT4G29810 24.092 303 181 8 25 319 71 332 1.91e-17 83.6
MsG0180001256.01.T02 AT4G29810 24.092 303 181 8 25 319 80 341 2.67e-17 83.2
MsG0180001256.01.T02 AT2G20470 25.294 340 166 8 24 317 124 421 4.89e-17 83.2
MsG0180001256.01.T02 AT2G20470 25.294 340 166 8 24 317 124 421 5.10e-17 83.6
MsG0180001256.01.T02 AT2G20470 25.294 340 166 8 24 317 124 421 5.10e-17 83.6
MsG0180001256.01.T02 AT5G56580 26.198 313 181 10 25 328 71 342 6.36e-17 82.0
MsG0180001256.01.T02 AT5G12480 29.744 195 129 6 176 366 85 275 9.92e-17 82.0
MsG0180001256.01.T02 AT1G51660 24.841 314 181 9 20 323 72 340 1.85e-16 80.5
MsG0180001256.01.T02 AT1G54510 25.558 403 215 17 22 397 2 346 2.16e-16 81.6
MsG0180001256.01.T02 AT1G54510 25.558 403 215 17 22 397 2 346 2.16e-16 81.6
MsG0180001256.01.T02 AT1G54510 25.558 403 215 17 22 397 2 346 2.16e-16 81.6
MsG0180001256.01.T02 AT1G54510 25.558 403 215 17 22 397 2 346 2.16e-16 81.6
MsG0180001256.01.T02 AT3G15220 27.036 307 164 9 23 320 14 269 6.93e-16 80.1
MsG0180001256.01.T02 AT3G21220 25.000 328 186 10 25 344 71 346 8.03e-16 78.6
MsG0180001256.01.T02 AT3G21220 25.000 328 186 10 25 344 71 346 8.03e-16 78.6
MsG0180001256.01.T02 AT2G25880 31.343 134 84 4 196 328 130 256 2.53e-14 72.8
MsG0180001256.01.T02 AT4G38230 33.333 144 91 3 178 320 2 141 4.79e-14 73.2
MsG0180001256.01.T02 AT4G18710 28.571 259 135 11 9 259 23 239 1.82e-13 70.5
MsG0180001256.01.T02 AT3G05840 30.556 252 125 13 9 253 62 270 2.64e-13 71.6
MsG0180001256.01.T02 AT3G05840 30.556 252 125 13 9 253 62 270 2.64e-13 71.6
MsG0180001256.01.T02 AT4G13000 33.577 137 82 3 204 340 217 344 3.09e-13 70.9
MsG0180001256.01.T02 AT4G18710 28.571 259 135 11 9 259 29 245 3.72e-13 70.9
MsG0180001256.01.T02 AT1G16440 23.907 343 193 12 24 317 113 436 4.81e-13 70.9
MsG0180001256.01.T02 AT5G26751 30.159 252 126 13 9 253 58 266 4.94e-13 70.5
MsG0180001256.01.T02 AT3G61160 26.415 318 165 13 30 317 108 386 2.77e-12 68.6
MsG0180001256.01.T02 AT3G61160 26.415 318 165 13 30 317 115 393 3.43e-12 68.2
MsG0180001256.01.T02 AT1G76040 37.500 104 61 3 214 317 33 132 3.60e-12 67.4
MsG0180001256.01.T02 AT1G76040 37.500 104 61 3 214 317 33 132 3.60e-12 67.4
MsG0180001256.01.T02 AT3G61160 26.415 318 165 13 30 317 108 386 3.99e-12 67.8

Find 24 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 194 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TCAACCACTGCTTCAGATTT+TGG 0.139007 1:+18380349 MsG0180001256.01.T01:five_prime_UTR
GATATTGGTTCTGGGAATTT+TGG 0.146656 1:+18380726 MsG0180001256.01.T01:CDS
GTATCTAGATTCTCTGGTTT+TGG 0.214557 1:+18380154 MsG0180001256.01.T01:five_prime_UTR
CGTGGGTCGATGTTAGATTA+TGG 0.256740 1:-18380484 None:intergenic
CTTGTACGTGATATTGGTTC+TGG 0.321605 1:+18380717 MsG0180001256.01.T01:CDS
TATGAGCTTGTACGTGATAT+TGG 0.330261 1:+18380711 MsG0180001256.01.T01:CDS
GTTGTTAAGACACGTGAAAA+AGG 0.357332 1:-18380380 None:intergenic
ATTCATGTATCTAGATTCTC+TGG 0.388081 1:+18380148 MsG0180001256.01.T01:five_prime_UTR
TATGTTTGTGTGTGTTTAGA+AGG 0.400704 1:-18380233 None:intergenic
GTATATTGAGAGAGGTGATA+AGG 0.427646 1:+18380800 MsG0180001256.01.T01:CDS
TTGTACGTGATATTGGTTCT+GGG 0.467173 1:+18380718 MsG0180001256.01.T01:CDS
TGTCCAACATGGTTCATAGT+AGG 0.481894 1:-18380648 None:intergenic
GTGTGTGTTTAGAAGGTCGT+TGG 0.535436 1:-18380226 None:intergenic
CCATTCCTCCATGTCCAACA+TGG 0.556933 1:-18380659 None:intergenic
GATCCTACTATGAACCATGT+TGG 0.571561 1:+18380645 MsG0180001256.01.T01:CDS
ACTATGAACCATGTTGGACA+TGG 0.586952 1:+18380651 MsG0180001256.01.T01:CDS
CCATGTTGGACATGGAGGAA+TGG 0.587929 1:+18380659 MsG0180001256.01.T01:CDS
GTTGATGTTGCAGAAGAACA+TGG 0.605779 1:-18380331 None:intergenic
CCAACCAAAATCTGAAGCAG+TGG 0.607116 1:-18380353 None:intergenic
CTAGATACATGAATGTAATG+TGG 0.642118 1:-18380139 None:intergenic
ATGAACCATGTTGGACATGG+AGG 0.657274 1:+18380654 MsG0180001256.01.T01:CDS
TTGATGTTGCAGAAGAACAT+GGG 0.696891 1:-18380330 None:intergenic
GCTGTCAAGTATATTGAGAG+AGG 0.707346 1:+18380792 MsG0180001256.01.T01:CDS
ATGTTGCAGAAGAACATGGG+CGG 0.812163 1:-18380327 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAAATAAAAAACATAAACAT+TGG + Chr1:18380185-18380204 MsG0180001256.01.T01:five_prime_UTR 10.0%
!!! ATGTTTTTTTTTTTTTTACA+AGG - Chr1:18380447-18380466 None:intergenic 10.0%
!!! TTTATTTTTTTGAAGAAAAA+TGG + Chr1:18380623-18380642 MsG0180001256.01.T01:exon 10.0%
!! ATAACACAAAAATAGAAAAA+AGG - Chr1:18380854-18380873 None:intergenic 15.0%
!! ATGTTGAAAAATTGAAAAAA+AGG + Chr1:18380577-18380596 MsG0180001256.01.T01:five_prime_UTR 15.0%
!! AATGTTCATTGTAATTTACA+AGG + Chr1:18382729-18382748 MsG0180001256.01.T01:intron 20.0%
!! ATTTGTCTTTCATTTATCTT+TGG + Chr1:18381902-18381921 MsG0180001256.01.T01:intron 20.0%
!! TAAGTTACTATAGATAACAA+TGG + Chr1:18383116-18383135 MsG0180001256.01.T01:intron 20.0%
!! TATCTGTTAAAAAATAGGTA+TGG - Chr1:18381260-18381279 None:intergenic 20.0%
!! TCATCTATCTGTTAAAAAAT+AGG - Chr1:18381265-18381284 None:intergenic 20.0%
!! TGAAATCTTTCAATTTCATT+GGG + Chr1:18381145-18381164 MsG0180001256.01.T01:intron 20.0%
!! TGTATATGTGAGTTAAAATT+TGG + Chr1:18380901-18380920 MsG0180001256.01.T01:intron 20.0%
!! TTCTTATCATATTCAATACA+TGG + Chr1:18381541-18381560 MsG0180001256.01.T01:CDS 20.0%
!! TTGAAATCTTTCAATTTCAT+TGG + Chr1:18381144-18381163 MsG0180001256.01.T01:intron 20.0%
!!! AATCACTTTTTTTGAAATTC+TGG + Chr1:18382498-18382517 MsG0180001256.01.T01:intron 20.0%
!!! AATTGATTTAGCATCATAAT+CGG - Chr1:18382135-18382154 None:intergenic 20.0%
!!! AGAGTTAAATTTTCTAATGT+TGG + Chr1:18380553-18380572 MsG0180001256.01.T01:five_prime_UTR 20.0%
!!! GTTAATTGATTTTTCTTCTA+GGG - Chr1:18382092-18382111 None:intergenic 20.0%
!!! TACGGATTAAAATACATATA+AGG - Chr1:18381398-18381417 None:intergenic 20.0%
! AAACAACAAAAGGTCTAATT+AGG - Chr1:18382161-18382180 None:intergenic 25.0%
! AAGAAAAAGATACATCTACA+AGG + Chr1:18383178-18383197 MsG0180001256.01.T01:three_prime_UTR 25.0%
! AGATAGATGAAAATGTACAA+AGG + Chr1:18381275-18381294 MsG0180001256.01.T01:intron 25.0%
! ATATTGAGAAAGTAAAGACA+AGG - Chr1:18381697-18381716 None:intergenic 25.0%
! ATTTCTTCAATTGTTTGCAT+TGG - Chr1:18382933-18382952 None:intergenic 25.0%
! GAAAAAATAGACACATTAGA+GGG - Chr1:18382680-18382699 None:intergenic 25.0%
! GATAGATGAAAATGTACAAA+GGG + Chr1:18381276-18381295 MsG0180001256.01.T01:intron 25.0%
! TGAAAAAATAGACACATTAG+AGG - Chr1:18382681-18382700 None:intergenic 25.0%
! TTAAACAAGAAAAAGCTAAC+TGG - Chr1:18382288-18382307 None:intergenic 25.0%
! TTATAAATCATAGATCACTG+AGG + Chr1:18381302-18381321 MsG0180001256.01.T01:CDS 25.0%
!! AATACAAAGCATCATGAAAT+AGG - Chr1:18383249-18383268 None:intergenic 25.0%
!! ACGTAGCTTAAATATGTTTT+TGG + Chr1:18382653-18382672 MsG0180001256.01.T01:intron 25.0%
!! ATCTTTGAAAAAGAAAACGT+GGG - Chr1:18380504-18380523 None:intergenic 25.0%
!! CACATTTCAAGTATATTTAC+CGG - Chr1:18382225-18382244 None:intergenic 25.0%
!! GAAAATCAAGAGTTGTTATT+TGG + Chr1:18381004-18381023 MsG0180001256.01.T01:intron 25.0%
!! TGAAAAAAAGGTGAGATTTT+TGG + Chr1:18380589-18380608 MsG0180001256.01.T01:five_prime_UTR 25.0%
!! TTGTGATTTTGGATATTCAA+AGG + Chr1:18381857-18381876 MsG0180001256.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTGGTAACTTAGTTATTAG+CGG + Chr1:18381022-18381041 MsG0180001256.01.T01:intron 25.0%
!! TTTTAAACAGAGAATAAGCA+TGG + Chr1:18382812-18382831 MsG0180001256.01.T01:intron 25.0%
!!! CTTTTTCAAAGATCTGATAT+GGG + Chr1:18380511-18380530 MsG0180001256.01.T01:five_prime_UTR 25.0%
!!! GGTTAATTGATTTTTCTTCT+AGG - Chr1:18382093-18382112 None:intergenic 25.0%
!!! TCTTTTTCAAAGATCTGATA+TGG + Chr1:18380510-18380529 MsG0180001256.01.T01:five_prime_UTR 25.0%
!!! TGTTTTTACTTTTCCTGTTT+TGG + Chr1:18380874-18380893 MsG0180001256.01.T01:intron 25.0%
AAAAGATACATCTACAAGGA+AGG + Chr1:18383182-18383201 MsG0180001256.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
AAATCACAAATCTTCAAACG+AGG - Chr1:18381846-18381865 None:intergenic 30.0%
AATAATGCAGATAATTAGCG+AGG + Chr1:18382950-18382969 MsG0180001256.01.T01:CDS 30.0%
ACATATACACAAACCAAAAC+AGG - Chr1:18380890-18380909 None:intergenic 30.0%
ACATTCACAACCAAAATCTA+CGG + Chr1:18381989-18382008 MsG0180001256.01.T01:CDS 30.0%
ACTTACAGCAAAACAACAAA+AGG - Chr1:18382171-18382190 None:intergenic 30.0%
ATATTTGACGAGTATGAGTA+CGG - Chr1:18381416-18381435 None:intergenic 30.0%
ATCACAATAGCTAAATGTGT+AGG - Chr1:18381453-18381472 None:intergenic 30.0%
ATTCATGTATCTAGATTCTC+TGG + Chr1:18380148-18380167 MsG0180001256.01.T01:five_prime_UTR 30.0%
ATTTGCTTCCTGAAAGATAT+AGG + Chr1:18381720-18381739 MsG0180001256.01.T01:intron 30.0%
CTAGATACATGAATGTAATG+TGG - Chr1:18380142-18380161 None:intergenic 30.0%
GAAGAAATATGATAAGACAC+TGG - Chr1:18381372-18381391 None:intergenic 30.0%
TACACATTTAGCTATTGTGA+TGG + Chr1:18381452-18381471 MsG0180001256.01.T01:CDS 30.0%
TACTCATACTCGTCAAATAT+AGG + Chr1:18381416-18381435 MsG0180001256.01.T01:intron 30.0%
TATGTTTGTGTGTGTTTAGA+AGG - Chr1:18380236-18380255 None:intergenic 30.0%
TCACAATAGCTAAATGTGTA+GGG - Chr1:18381452-18381471 None:intergenic 30.0%
TCTTCCAACAACTTATATCA+GGG + Chr1:18381632-18381651 MsG0180001256.01.T01:CDS 30.0%
TGTCTTTCATTTATCTTTGG+TGG + Chr1:18381905-18381924 MsG0180001256.01.T01:intron 30.0%
TTCTTCCAACAACTTATATC+AGG + Chr1:18381631-18381650 MsG0180001256.01.T01:CDS 30.0%
TTTCCAATTGAAAGATAACG+CGG - Chr1:18382782-18382801 None:intergenic 30.0%
TTTGCTTCCTGAAAGATATA+GGG + Chr1:18381721-18381740 MsG0180001256.01.T01:intron 30.0%
! ATATTTGTTACTACAACCAC+CGG + Chr1:18382203-18382222 MsG0180001256.01.T01:intron 30.0%
! ATTTCAAGTATATTTACCGG+TGG - Chr1:18382222-18382241 None:intergenic 30.0%
! CGTTTGAAGATTTGTGATTT+TGG + Chr1:18381846-18381865 MsG0180001256.01.T01:CDS 30.0%
! GATCTTTGAAAAAGAAAACG+TGG - Chr1:18380505-18380524 None:intergenic 30.0%
! TATATTTTCTAAGCTGTGAG+AGG + Chr1:18383221-18383240 MsG0180001256.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
! TATTCTCCAATTTCAAGTCA+CGG - Chr1:18381800-18381819 None:intergenic 30.0%
!! ATAGTCTTGCGGAAATTTTT+AGG - Chr1:18382429-18382448 None:intergenic 30.0%
!! CATAATCAGGTATTGAGTAT+TGG - Chr1:18382551-18382570 None:intergenic 30.0%
!! GATTTACATGCTTTGATTTG+AGG + Chr1:18381167-18381186 MsG0180001256.01.T01:intron 30.0%
!!! AACAATGGAAACTAGCTTTT+AGG + Chr1:18383131-18383150 MsG0180001256.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
!!! ACAATGGAAACTAGCTTTTA+GGG + Chr1:18383132-18383151 MsG0180001256.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
!!! ATATTGGTTCTGGGAATTTT+GGG + Chr1:18380727-18380746 MsG0180001256.01.T01:CDS 30.0%
!!! ATGGTGTATTAGTTTTGAGT+TGG + Chr1:18381077-18381096 MsG0180001256.01.T01:intron 30.0%
ACCTTATATGTCATGTTGGT+GGG + Chr1:18382375-18382394 MsG0180001256.01.T01:CDS 35.0%
ACTGCTATCAATATCAAGGT+CGG - Chr1:18383075-18383094 None:intergenic 35.0%
AGAACAAAGATATTCGAGTC+AGG - Chr1:18381752-18381771 None:intergenic 35.0%
CACAATAGCTAAATGTGTAG+GGG - Chr1:18381451-18381470 None:intergenic 35.0%
CTTCCAACAACTTATATCAG+GGG + Chr1:18381633-18381652 MsG0180001256.01.T01:CDS 35.0%
GGAGAGATTTGAACATAATC+AGG - Chr1:18382564-18382583 None:intergenic 35.0%
GTATATTGAGAGAGGTGATA+AGG + Chr1:18380800-18380819 MsG0180001256.01.T01:CDS 35.0%
GTTGTTAAGACACGTGAAAA+AGG - Chr1:18380383-18380402 None:intergenic 35.0%
TAAACAGAGAATAAGCATGG+CGG + Chr1:18382815-18382834 MsG0180001256.01.T01:intron 35.0%
TAACCCCTGATATAAGTTGT+TGG - Chr1:18381639-18381658 None:intergenic 35.0%
TATGAGCTTGTACGTGATAT+TGG + Chr1:18380711-18380730 MsG0180001256.01.T01:CDS 35.0%
TCCTTCTTAAGCAAAACTTC+AGG - Chr1:18382038-18382057 None:intergenic 35.0%
TCCTTGAACCTGACAATATT+GGG - Chr1:18381331-18381350 None:intergenic 35.0%
TGTATTCCCAACGATAAGAT+CGG - Chr1:18382880-18382899 None:intergenic 35.0%
TTGATGTTGCAGAAGAACAT+GGG - Chr1:18380333-18380352 None:intergenic 35.0%
TTGCTTAAGAAGGAATACGA+TGG + Chr1:18382044-18382063 MsG0180001256.01.T01:CDS 35.0%
! AGGTTACATGAATAGTCTTG+CGG - Chr1:18382440-18382459 None:intergenic 35.0%
! ATTGTGATGGAATATGCTTC+TGG + Chr1:18381465-18381484 MsG0180001256.01.T01:CDS 35.0%
! GGAGATTTTCAGAATGTCAT+TGG - Chr1:18382114-18382133 None:intergenic 35.0%
! GGTAGAGTGAATTGAGTTTT+TGG + Chr1:18381188-18381207 MsG0180001256.01.T01:intron 35.0%
! TCCTGAAGTTTTGCTTAAGA+AGG + Chr1:18382034-18382053 MsG0180001256.01.T01:CDS 35.0%
!! ATTGTTTGCATTGGTTGTTC+AGG - Chr1:18382924-18382943 None:intergenic 35.0%
!! GAGTGAATTGAGTTTTTGGA+AGG + Chr1:18381192-18381211 MsG0180001256.01.T01:intron 35.0%
!! GTATCTAGATTCTCTGGTTT+TGG + Chr1:18380154-18380173 MsG0180001256.01.T01:five_prime_UTR 35.0%
!! TCAGTGAGCTTTGAAATATG+TGG + Chr1:18383155-18383174 MsG0180001256.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
!! TTGTACGTGATATTGGTTCT+GGG + Chr1:18380718-18380737 MsG0180001256.01.T01:CDS 35.0%
!!! ATTCTGGATTTTGATTGCAG+AGG + Chr1:18382514-18382533 MsG0180001256.01.T01:intron 35.0%
!!! GATATTGGTTCTGGGAATTT+TGG + Chr1:18380726-18380745 MsG0180001256.01.T01:CDS 35.0%
!!! TATTGGTTCTGGGAATTTTG+GGG + Chr1:18380728-18380747 MsG0180001256.01.T01:CDS 35.0%
ACCCACCAACATGACATATA+AGG - Chr1:18382379-18382398 None:intergenic 40.0%
ACTATGAACCATGTTGGACA+TGG + Chr1:18380651-18380670 MsG0180001256.01.T01:CDS 40.0%
ACTTAAGTTTCACCTGTGCA+GGG - Chr1:18382626-18382645 None:intergenic 40.0%
ATGTCACCGTGACTTGAAAT+TGG + Chr1:18381791-18381810 MsG0180001256.01.T01:CDS 40.0%
CAATATTGTCAGGTTCAAGG+AGG + Chr1:18381330-18381349 MsG0180001256.01.T01:CDS 40.0%
CACCACTGCTATCAATATCA+AGG - Chr1:18383079-18383098 None:intergenic 40.0%
CATCAAAATCTTCCGTTCCA+CGG - Chr1:18381056-18381075 None:intergenic 40.0%
CTCCTTGAACCTGACAATAT+TGG - Chr1:18381332-18381351 None:intergenic 40.0%
CTGATCTCAAGGATCTTTGT+TGG + Chr1:18382597-18382616 MsG0180001256.01.T01:CDS 40.0%
CTGCTATCAATATCAAGGTC+GGG - Chr1:18383074-18383093 None:intergenic 40.0%
GACCTTATATGTCATGTTGG+TGG + Chr1:18382374-18382393 MsG0180001256.01.T01:CDS 40.0%
GACTTAAAAGAAGTTGCAGC+AGG - Chr1:18382460-18382479 None:intergenic 40.0%
GAGAAAGTAAAGACAAGGTG+TGG - Chr1:18381692-18381711 None:intergenic 40.0%
GATCCTACTATGAACCATGT+TGG + Chr1:18380645-18380664 MsG0180001256.01.T01:CDS 40.0%
GCTGTCAAGTATATTGAGAG+AGG + Chr1:18380792-18380811 MsG0180001256.01.T01:CDS 40.0%
GGCATTTCCCTATATCTTTC+AGG - Chr1:18381731-18381750 None:intergenic 40.0%
GGTGACCTTATATGTCATGT+TGG + Chr1:18382371-18382390 MsG0180001256.01.T01:CDS 40.0%
GGTTCTTCAAAAACCAATCG+TGG - Chr1:18382851-18382870 None:intergenic 40.0%
GTTGATGTTGCAGAAGAACA+TGG - Chr1:18380334-18380353 None:intergenic 40.0%
TAAGAAGGAATACGATGGCA+AGG + Chr1:18382049-18382068 MsG0180001256.01.T01:CDS 40.0%
TCACAACCAAAATCTACGGT+CGG + Chr1:18381993-18382012 MsG0180001256.01.T01:CDS 40.0%
TCAGTATCTTACTGGTAGCT+TGG + Chr1:18383010-18383029 MsG0180001256.01.T01:CDS 40.0%
TCCCAATATTGTCAGGTTCA+AGG + Chr1:18381327-18381346 MsG0180001256.01.T01:CDS 40.0%
TCTCTCACTCAGTATCTTAC+TGG + Chr1:18383002-18383021 MsG0180001256.01.T01:CDS 40.0%
TGTCCAACATGGTTCATAGT+AGG - Chr1:18380651-18380670 None:intergenic 40.0%
TTTGAGCGAATATGCAATGC+AGG + Chr1:18381498-18381517 MsG0180001256.01.T01:CDS 40.0%
! GACCTTGATATTGATAGCAG+TGG + Chr1:18383074-18383093 MsG0180001256.01.T01:CDS 40.0%
! TCAACCACTGCTTCAGATTT+TGG + Chr1:18380349-18380368 MsG0180001256.01.T01:five_prime_UTR 40.0%
!! CTTGTACGTGATATTGGTTC+TGG + Chr1:18380717-18380736 MsG0180001256.01.T01:CDS 40.0%
!! GAACGGAAGATTTTGATGGA+TGG + Chr1:18381058-18381077 MsG0180001256.01.T01:intron 40.0%
AATCTTCCGTTCCACGGATT+CGG - Chr1:18381050-18381069 None:intergenic 45.0%
ACTAACGTTAACCGCAGCAA+CGG - Chr1:18381582-18381601 None:intergenic 45.0%
ACTTCAGGAGCAATGTATGC+AGG - Chr1:18382023-18382042 None:intergenic 45.0%
AGCGAATATGCAATGCAGGA+CGG + Chr1:18381502-18381521 MsG0180001256.01.T01:CDS 45.0%
AGTGAGAGACTGATGAGTTC+CGG - Chr1:18382991-18383010 None:intergenic 45.0%
AGTGTCGTCATCTGATCTCA+AGG + Chr1:18382586-18382605 MsG0180001256.01.T01:CDS 45.0%
ATGAACCATGTTGGACATGG+AGG + Chr1:18380654-18380673 MsG0180001256.01.T01:CDS 45.0%
ATGTTGCAGAAGAACATGGG+CGG - Chr1:18380330-18380349 None:intergenic 45.0%
CAAATCTTCAAACGAGGAGC+CGG - Chr1:18381840-18381859 None:intergenic 45.0%
CACTTAAGTTTCACCTGTGC+AGG - Chr1:18382627-18382646 None:intergenic 45.0%
CGACCGCGTTATCTTTCAAT+TGG + Chr1:18382776-18382795 MsG0180001256.01.T01:intron 45.0%
CGTGGGTCGATGTTAGATTA+TGG - Chr1:18380487-18380506 None:intergenic 45.0%
CTGATGTTGTCTTGTCGCTA+TGG + Chr1:18382320-18382339 MsG0180001256.01.T01:intron 45.0%
CTTCAGGAGCAATGTATGCA+GGG - Chr1:18382022-18382041 None:intergenic 45.0%
CTTGGACATCGATGACGAAA+TGG + Chr1:18383028-18383047 MsG0180001256.01.T01:CDS 45.0%
GTGTGTGTTTAGAAGGTCGT+TGG - Chr1:18380229-18380248 None:intergenic 45.0%
TACAACGAGTGAGCAGTTTC+AGG + Chr1:18382896-18382915 MsG0180001256.01.T01:CDS 45.0%
TGAGATCAGATGACGACACT+CGG - Chr1:18382586-18382605 None:intergenic 45.0%
TTCAGGAGCAATGTATGCAG+GGG - Chr1:18382021-18382040 None:intergenic 45.0%
TTCCAGCCGATCTTATCGTT+GGG + Chr1:18382871-18382890 MsG0180001256.01.T01:CDS 45.0%
TTGGAGAATACCTTGCTCGA+TGG + Chr1:18381810-18381829 MsG0180001256.01.T01:CDS 45.0%
! CCAACCAAAATCTGAAGCAG+TGG - Chr1:18380356-18380375 None:intergenic 45.0%
! CGTGGAACGGAAGATTTTGA+TGG + Chr1:18381054-18381073 MsG0180001256.01.T01:intron 45.0%
! GGTTAGCTACTGTCATGCAA+TGG + Chr1:18381654-18381673 MsG0180001256.01.T01:intron 45.0%
! GTGATGGAATATGCTTCTGG+AGG + Chr1:18381468-18381487 MsG0180001256.01.T01:CDS 45.0%
! TGAGGCATCCCAATATTGTC+AGG + Chr1:18381320-18381339 MsG0180001256.01.T01:CDS 45.0%
!! CCACTGCTTCAGATTTTGGT+TGG + Chr1:18380353-18380372 MsG0180001256.01.T01:five_prime_UTR 45.0%
!! CGGAAATTTTTAGGCTCCTC+CGG - Chr1:18382420-18382439 None:intergenic 45.0%
CAACGATAAGATCGGCTGGA+AGG - Chr1:18382872-18382891 None:intergenic 50.0%
CATCGATGACGAAATGGACG+AGG + Chr1:18383034-18383053 MsG0180001256.01.T01:CDS 50.0%
CCATGTTGGACATGGAGGAA+TGG + Chr1:18380659-18380678 MsG0180001256.01.T01:CDS 50.0%
CCATTCCTCCATGTCCAACA+TGG - Chr1:18380662-18380681 None:intergenic 50.0%
CGGAGATTCGAAACCACGAT+TGG + Chr1:18382835-18382854 MsG0180001256.01.T01:CDS 50.0%
CTTCCAGCCGATCTTATCGT+TGG + Chr1:18382870-18382889 MsG0180001256.01.T01:CDS 50.0%
GAGATCAGATGACGACACTC+GGG - Chr1:18382585-18382604 None:intergenic 50.0%
TACCTTGCTCGATGGTAGTC+CGG + Chr1:18381818-18381837 MsG0180001256.01.T01:CDS 50.0%
TGAATGCAGTACCGTTGCTG+CGG + Chr1:18381568-18381587 MsG0180001256.01.T01:CDS 50.0%
TGCGTATCCTTTCGAGGATC+CGG + Chr1:18382398-18382417 MsG0180001256.01.T01:CDS 50.0%
TTCCCAACGATAAGATCGGC+TGG - Chr1:18382876-18382895 None:intergenic 50.0%
! ATTGCAGACGTGTGGTCTTG+CGG + Chr1:18382348-18382367 MsG0180001256.01.T01:CDS 50.0%
!!! TGGTTCTGGGAATTTTGGGG+TGG + Chr1:18380731-18380750 MsG0180001256.01.T01:CDS 50.0%
CGTGCCTGCAGCACAAACAA+CGG - Chr1:18381607-18381626 None:intergenic 55.0%
CGTTGTTTGTGCTGCAGGCA+CGG + Chr1:18381605-18381624 MsG0180001256.01.T01:CDS 55.0%
CTTTGTTGGAGACCCTGCAC+AGG + Chr1:18382611-18382630 MsG0180001256.01.T01:CDS 55.0%
GAGGCTACTATTCCTGCAGC+CGG + Chr1:18382969-18382988 MsG0180001256.01.T01:CDS 55.0%
GTATCCTTTCGAGGATCCGG+AGG + Chr1:18382401-18382420 MsG0180001256.01.T01:CDS 55.0%
GTGACCGTTGTTTGTGCTGC+AGG + Chr1:18381600-18381619 MsG0180001256.01.T01:CDS 55.0%
TATTAGCGGAGCCGAATCCG+TGG + Chr1:18381036-18381055 MsG0180001256.01.T01:intron 55.0%
TGGCTCAGATTGCAGACGTG+TGG + Chr1:18382340-18382359 MsG0180001256.01.T01:intron 55.0%
! TTGCAGACGTGTGGTCTTGC+GGG + Chr1:18382349-18382368 MsG0180001256.01.T01:CDS 55.0%
!!! GGGGTACCGACCGTAGATTT+TGG - Chr1:18382002-18382021 None:intergenic 55.0%
AGCCGGACTACCATCGAGCA+AGG - Chr1:18381823-18381842 None:intergenic 60.0%
AGGACGGTTCAGCGAGGATG+AGG + Chr1:18381518-18381537 MsG0180001256.01.T01:CDS 60.0%
CAATGCAGGACGGTTCAGCG+AGG + Chr1:18381512-18381531 MsG0180001256.01.T01:CDS 60.0%
GACTGATGAGTTCCGGCTGC+AGG - Chr1:18382984-18383003 None:intergenic 60.0%
GGTGGGTGCGTATCCTTTCG+AGG + Chr1:18382392-18382411 MsG0180001256.01.T01:CDS 60.0%
! TGCAGACGTGTGGTCTTGCG+GGG + Chr1:18382350-18382369 MsG0180001256.01.T01:CDS 60.0%
GCGGAGCCGAATCCGTGGAA+CGG + Chr1:18381041-18381060 MsG0180001256.01.T01:intron 65.0%
GGCTCCTCCGGATCCTCGAA+AGG - Chr1:18382408-18382427 None:intergenic 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 18380110 18383317 18380110 ID=MsG0180001256.01;Name=MsG0180001256.01
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Chr1 five_prime_UTR 18380110 18380447 18380110 ID=MsG0180001256.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0180001256.01.T01
Chr1 five_prime_UTR 18380474 18380641 18380474 ID=MsG0180001256.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0180001256.01.T01
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Chr1 three_prime_UTR 18383119 18383317 18383119 ID=MsG0180001256.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0180001256.01.T01
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Chr1 exon 18380116 18380821 18380116 ID=MsG0180001256.01.T02:exon:32424;Parent=MsG0180001256.01.T02
Chr1 five_prime_UTR 18380116 18380641 18380116 ID=MsG0180001256.01.T02:five_prime_utr;Parent=MsG0180001256.01.T02
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Chr1 three_prime_UTR 18383119 18383317 18383119 ID=MsG0180001256.01.T02:three_prime_utr;Parent=MsG0180001256.01.T02
Gene Sequence

>MsG0180001256.01.T01

ATGGATCCTACTATGAACCATGTTGGACATGGAGGAATGGATAAACAGATTATGCATGAGAGTGATAGATATGAGCTTGTACGTGATATTGGTTCTGGGAATTTTGGGGTGGCTAGACTTATGAGAGATAAGCATACTAATCAACTTGTTGCTGTCAAGTATATTGAGAGAGGTGATAAGATAGATGAAAATGTACAAAGGGAAATTATAAATCATAGATCACTGAGGCATCCCAATATTGTCAGGTTCAAGGAGGTCATACTTACCCCTACACATTTAGCTATTGTGATGGAATATGCTTCTGGAGGAGAGCTATTTGAGCGAATATGCAATGCAGGACGGTTCAGCGAGGATGAGGTTCTTATCATATTCAATACATGGATTTTGAATGCAGTACCGTTGCTGCGGTTAACGTTAGTGACCGTTGTTTGTGCTGCAGGCACGGTTTTTCTTCCAACAACTTATATCAGGGATATAGGGAAATGCCTGACTCGAATATCTTTGTTCTTTTTTTTAATAAAGCAAGTATGTCACCGTGACTTGAAATTGGAGAATACCTTGCTCGATGGTAGTCCGGCTCCTCGTTTGAAGATTTGTGATTTTGGATATTCAAAGTCTTCAGTGCTACATTCACAACCAAAATCTACGGTCGGTACCCCTGCATACATTGCTCCTGAAGTTTTGCTTAAGAAGGAATACGATGGCAAGATTGCAGACGTGTGGTCTTGCGGGGTGACCTTATATGTCATGTTGGTGGGTGCGTATCCTTTCGAGGATCCGGAGGAGCCTAAAAATTTCCGCAAGACTATTCATAGGATTTTGAAAGTCCAATACTCAATACCTGATTATGTTCAAATCTCTCCCGAGTGTCGTCATCTGATCTCAAGGATCTTTGTTGGAGACCCTGCACAGAGAATAAGCATGGCGGAGATTCGAAACCACGATTGGTTTTTGAAGAACCTTCCAGCCGATCTTATCGTTGGGAATACAACGAGTGAGCAGTTTCAGGAGCCTGAACAACCAATGCAAACAATTGAAGAAATAATGCAGATAATTAGCGAGGCTACTATTCCTGCAGCCGGAACTCATCAGTCTCTCACTCAGTATCTTACTGGTAGCTTGGACATCGATGACGAAATGGACGAGGATATAGATACTGATCCCGACCTTGATATTGATAGCAGTGGTGAAATAGTTTATGCAATGTAA

>MsG0180001256.01.T02

ATGGATCCTACTATGAACCATGTTGGACATGGAGGAATGGATAAACAGATTATGCATGAGAGTGATAGATATGAGCTTGTACGTGATATTGGTTCTGGGAATTTTGGGGTGGCTAGACTTATGAGAGATAAGCATACTAATCAACTTGTTGCTGTCAAGTATATTGAGAGAGGTGATAAGATAGATGAAAATGTACAAAGGGAAATTATAAATCATAGATCACTGAGGCATCCCAATATTGTCAGGTTCAAGGAGGTCATACTTACCCCTACACATTTAGCTATTGTGATGGAATATGCTTCTGGAGGAGAGCTATTTGAGCGAATATGCAATGCAGGACGGTTCAGCGAGGATGAGGTTCTTATCATATTCAATACATGGATTTTGAATGCAGTACCGTTGCTGCGGTTAACGTTAGTGACCGTTGTTTGTGCTGCAGGCACGGTTTTTCTTCCAACAACTTATATCAGGGATATAGGGAAATGCCTGACTCGAATATCTTTGTTCTTTTTTTTAATAAAGCAAGTATGTCACCGTGACTTGAAATTGGAGAATACCTTGCTCGATGGTAGTCCGGCTCCTCGTTTGAAGATTTGTGATTTTGGATATTCAAAGTCTTCAGTGCTACATTCACAACCAAAATCTACGGTCGGTACCCCTGCATACATTGCTCCTGAAGTTTTGCTTAAGAAGGAATACGATGGCAAGATTGCAGACGTGTGGTCTTGCGGGGTGACCTTATATGTCATGTTGGTGGGTGCGTATCCTTTCGAGGATCCGGAGGAGCCTAAAAATTTCCGCAAGACTATTCATAGGATTTTGAAAGTCCAATACTCAATACCTGATTATGTTCAAATCTCTCCCGAGTGTCGTCATCTGATCTCAAGGATCTTTGTTGGAGACCCTGCACAGAGAATAAGCATGGCGGAGATTCGAAACCACGATTGGTTTTTGAAGAACCTTCCAGCCGATCTTATCGTTGGGAATACAACGAGTGAGCAGTTTCAGGAGCCTGAACAACCAATGCAAACAATTGAAGAAATAATGCAGATAATTAGCGAGGCTACTATTCCTGCAGCCGGAACTCATCAGTCTCTCACTCAGTATCTTACTGGTAGCTTGGACATCGATGACGAAATGGACGAGGATATAGATACTGATCCCGACCTTGATATTGATAGCAGTGGTGAAATAGTTTATGCAATGTAA
Protein sequence

>MsG0180001256.01.T01

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>MsG0180001256.01.T02

MDPTMNHVGHGGMDKQIMHESDRYELVRDIGSGNFGVARLMRDKHTNQLVAVKYIERGDKIDENVQREIINHRSLRHPNIVRFKEVILTPTHLAIVMEYASGGELFERICNAGRFSEDEVLIIFNTWILNAVPLLRLTLVTVVCAAGTVFLPTTYIRDIGKCLTRISLFFFLIKQVCHRDLKLENTLLDGSPAPRLKICDFGYSKSSVLHSQPKSTVGTPAYIAPEVLLKKEYDGKIADVWSCGVTLYVMLVGAYPFEDPEEPKNFRKTIHRILKVQYSIPDYVQISPECRHLISRIFVGDPAQRISMAEIRNHDWFLKNLPADLIVGNTTSEQFQEPEQPMQTIEEIMQIISEATIPAAGTHQSLTQYLTGSLDIDDEMDEDIDTDPDLDIDSSGEIVYAM*