AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0480020725.01

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MsG0480020725.01.T01 AT5G59780 52.500 80 38 0 44 123 18 97 3.09e-24 98.6
MsG0480020725.01.T01 AT3G46130 51.852 81 39 0 44 124 18 98 3.43e-24 99.0
MsG0480020725.01.T01 AT3G12820 61.429 70 27 0 49 118 2 71 3.63e-24 97.8
MsG0480020725.01.T01 AT1G18960 37.500 136 73 3 10 145 6 129 6.24e-24 100
MsG0480020725.01.T01 AT1G66380 62.500 72 27 0 45 116 7 78 1.07e-23 94.0
MsG0480020725.01.T01 AT2G39880 49.074 108 52 3 9 116 46 150 1.15e-23 100
MsG0480020725.01.T01 AT5G40360 34.503 171 92 6 9 179 153 303 2.53e-23 99.4
MsG0480020725.01.T01 AT3G27785 44.444 108 58 2 9 116 184 289 3.42e-23 99.8
MsG0480020725.01.T01 AT3G09230 43.810 105 57 2 14 118 55 157 1.46e-22 97.4
MsG0480020725.01.T01 AT1G69560 34.731 167 97 5 9 167 102 264 3.68e-22 95.5
MsG0480020725.01.T01 AT1G69560 34.731 167 97 5 9 167 118 280 4.94e-22 95.5
MsG0480020725.01.T01 AT4G18770 41.284 109 62 2 9 117 212 318 6.11e-22 95.9
MsG0480020725.01.T01 AT5G58850 41.748 103 58 2 14 116 105 205 1.26e-21 95.1
MsG0480020725.01.T01 AT1G17950 44.231 104 54 4 14 116 5 105 4.29e-21 90.9
MsG0480020725.01.T01 AT1G22640 49.398 83 42 0 59 141 1 83 4.97e-21 89.7
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MsG0480020725.01.T01 AT5G11050 28.889 225 135 7 12 224 103 314 1.87e-20 91.7
MsG0480020725.01.T01 AT1G71030 50.617 81 36 2 52 128 5 85 4.58e-20 86.7
MsG0480020725.01.T01 AT1G73410 42.857 112 62 2 14 125 6 115 5.54e-20 87.8
MsG0480020725.01.T01 AT1G71030 50.617 81 36 2 52 128 19 99 5.67e-20 86.7
MsG0480020725.01.T01 AT3G09370 41.228 114 61 3 14 123 135 246 1.56e-19 89.7
MsG0480020725.01.T01 AT3G09370 41.228 114 61 3 14 123 130 241 1.58e-19 89.4
MsG0480020725.01.T01 AT5G17800 38.525 122 66 3 14 135 93 205 1.59e-19 87.8
MsG0480020725.01.T01 AT3G09370 41.228 114 61 3 14 123 143 254 1.78e-19 89.4
MsG0480020725.01.T01 AT5G02320 44.231 104 56 2 14 117 127 228 1.95e-19 89.4
MsG0480020725.01.T01 AT5G02320 44.231 104 56 2 14 117 127 228 1.95e-19 89.4
MsG0480020725.01.T01 AT1G73410 42.857 112 62 2 14 125 6 115 1.99e-19 85.5
MsG0480020725.01.T01 AT5G02320 44.231 104 56 2 14 117 67 168 2.53e-19 89.0
MsG0480020725.01.T01 AT1G26780 41.748 103 58 2 14 116 98 198 3.58e-19 86.3
MsG0480020725.01.T01 AT1G26780 41.748 103 58 2 14 116 98 198 3.82e-19 87.4
MsG0480020725.01.T01 AT3G23250 51.220 82 38 1 59 138 1 82 5.17e-19 84.7
MsG0480020725.01.T01 AT1G66380 47.561 82 42 1 12 93 8 88 1.49e-18 80.5
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MsG0480020725.01.T01 AT5G14750 55.932 59 26 0 59 117 1 59 5.88e-18 79.7
MsG0480020725.01.T01 AT5G14750 55.932 59 26 0 59 117 1 59 5.88e-18 79.7
MsG0480020725.01.T01 AT3G29020 38.462 104 62 2 14 117 67 168 1.93e-17 81.6
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MsG0480020725.01.T01 AT4G32730 40.952 105 58 3 14 117 87 188 6.82e-17 82.0
MsG0480020725.01.T01 AT4G32730 40.952 105 58 3 14 117 87 188 6.82e-17 82.0
MsG0480020725.01.T01 AT4G32730 40.952 105 58 3 14 117 87 188 6.82e-17 82.0
MsG0480020725.01.T01 AT4G32730 40.952 105 58 3 14 117 87 188 6.82e-17 82.0
MsG0480020725.01.T01 AT4G32730 40.952 105 58 3 14 117 87 188 7.39e-17 82.0
MsG0480020725.01.T01 AT5G11510 39.423 104 61 2 14 117 81 182 9.58e-17 81.6
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MsG0480020725.01.T01 AT5G11510 39.423 104 61 2 14 117 81 182 9.58e-17 81.6
MsG0480020725.01.T01 AT5G11510 39.423 104 61 2 14 117 81 182 1.05e-16 81.6
MsG0480020725.01.T01 AT5G11510 39.423 104 61 2 14 117 81 182 1.15e-16 81.3
MsG0480020725.01.T01 AT2G02820 42.000 100 56 2 17 116 33 130 6.00e-16 78.6
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MsG0480020725.01.T01 AT2G02820 42.000 100 56 2 17 116 33 130 7.54e-16 78.6
MsG0480020725.01.T01 AT2G02820 42.000 100 56 2 17 116 33 130 8.54e-16 77.4
MsG0480020725.01.T01 AT4G00540 40.678 118 61 3 11 124 100 212 1.14e-15 77.8
MsG0480020725.01.T01 AT4G00540 40.678 118 61 3 11 124 98 210 1.95e-15 77.0
MsG0480020725.01.T01 AT1G14350 42.000 100 56 2 17 116 28 125 2.20e-15 77.0
MsG0480020725.01.T01 AT1G14350 42.000 100 56 2 17 116 28 125 2.20e-15 77.0
MsG0480020725.01.T01 AT3G18100 29.697 165 95 6 12 173 496 642 1.94e-12 68.6
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MsG0480020725.01.T01 AT3G18100 29.697 165 95 6 12 173 383 529 2.93e-12 67.8
MsG0480020725.01.T01 AT5G39700 35.644 101 63 2 15 115 57 155 3.22e-12 65.1
MsG0480020725.01.T01 AT3G18100 29.697 165 95 6 12 173 331 477 3.48e-12 67.8
MsG0480020725.01.T01 AT1G74650 62.222 45 17 0 78 122 1 45 2.80e-11 63.2
MsG0480020725.01.T01 AT5G59780 50.000 50 25 0 74 123 4 53 6.86e-11 60.8
MsG0480020725.01.T01 AT3G46130 49.020 51 26 0 74 124 4 54 7.46e-11 61.2

Find 56 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 105 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ATAAACATGTTATCTTTAAT+AGG 0.206533 4:-47035473 None:intergenic
TGCAGTCTCTTTGTTAATAT+TGG 0.219777 4:+47034432 MsG0480020725.01.T01:CDS
TAGCCATGGACTCTTGATTT+TGG 0.229521 4:-47035418 None:intergenic
AAGAACAACTTTATGATAAA+TGG 0.255168 4:+47035629 MsG0480020725.01.T01:CDS
TTAAATCCGTTACTAGATTA+TGG 0.287374 4:+47035746 MsG0480020725.01.T01:CDS
TTAAGCTTTGAGTCTTCTTC+TGG 0.294156 4:-47034130 None:intergenic
AACATGGCACTGGTGGAAAT+TGG 0.298316 4:+47034167 MsG0480020725.01.T01:CDS
TGAGATGGCTAAACTATCTT+AGG 0.336588 4:+47034361 MsG0480020725.01.T01:CDS
TAAACATGTTATCTTTAATA+GGG 0.351159 4:-47035472 None:intergenic
AAAGATAACATGTTTATGTT+TGG 0.366890 4:+47035479 MsG0480020725.01.T01:CDS
AAATCCCCATGCTTAATGTT+TGG 0.390382 4:-47034384 None:intergenic
ACAATGATATCAAGAACTAT+TGG 0.403975 4:+47035198 MsG0480020725.01.T01:CDS
GTTATTTGAAGGAAGTGAAA+TGG 0.408479 4:-47035366 None:intergenic
GTTGGATATAGTTATAATAA+TGG 0.408482 4:+47035710 MsG0480020725.01.T01:CDS
AGTGGTGGATTTGAATTTGA+TGG 0.411324 4:+47035596 MsG0480020725.01.T01:CDS
ATAGGGTTGAAACTTGTGTT+TGG 0.411863 4:-47035392 None:intergenic
TCTAAGAATTGATGAGAAGA+AGG 0.426803 4:-47035302 None:intergenic
GAAGGAGAAGGTGGAAATGA+AGG 0.428759 4:-47035284 None:intergenic
AATAGGGTAATTATATTGCA+TGG 0.439492 4:-47035456 None:intergenic
GGTAACAATGGAAGTATTGT+TGG 0.458840 4:+47035650 MsG0480020725.01.T01:CDS
TGAAGATCTATGAAGGAAGT+TGG 0.463076 4:-47035341 None:intergenic
TTTCTTTGATGATGTAATGT+TGG 0.475351 4:-47035260 None:intergenic
TATCATCATCACATGAATAG+TGG 0.484541 4:+47035578 MsG0480020725.01.T01:CDS
GTGTTTGGATAGTTATTTGA+AGG 0.484722 4:-47035377 None:intergenic
ATTCATAAGAATGAAGAGAT+TGG 0.485771 4:+47035830 MsG0480020725.01.T01:CDS
GAGTCTTCTTCTGGTGACCA+TGG 0.489258 4:-47034121 None:intergenic
ATTTCTCTTCCTCATAAAGC+TGG 0.493136 4:+47034190 MsG0480020725.01.T01:CDS
TGATGAGAAGAAGGAGAAGG+TGG 0.495664 4:-47035293 None:intergenic
AGTGCCATGTTTCTCTATGT+AGG 0.507396 4:-47034155 None:intergenic
ATAGGGTAATTATATTGCAT+GGG 0.509971 4:-47035455 None:intergenic
ATATCATTGTCTGTCCTACC+TGG 0.529658 4:-47035185 None:intergenic
ATGTTTATGTTTGGAAGTGA+AGG 0.530266 4:+47035488 MsG0480020725.01.T01:CDS
TCTTTGTTAATATTGGAAGC+AGG 0.533649 4:+47034439 MsG0480020725.01.T01:CDS
ATTATAGCAGCTCAATTGCC+AGG 0.535265 4:+47035167 MsG0480020725.01.T01:CDS
ATTAGTAGCAGCAGCAACAA+AGG 0.539539 4:+47035791 MsG0480020725.01.T01:CDS
AATGGTTTGAAGATCTATGA+AGG 0.546814 4:-47035348 None:intergenic
CTTAGGCCAAACATTAAGCA+TGG 0.547214 4:+47034378 MsG0480020725.01.T01:CDS
GAAGGAAGTAGTTCATCTGA+TGG 0.557638 4:+47035506 MsG0480020725.01.T01:CDS
TTAGTAGCAGCAGCAACAAA+GGG 0.558041 4:+47035792 MsG0480020725.01.T01:CDS
TTACCAAAATCAAGAGTCCA+TGG 0.559133 4:+47035415 MsG0480020725.01.T01:CDS
TTAGGCCAAACATTAAGCAT+GGG 0.561548 4:+47034379 MsG0480020725.01.T01:CDS
AGGATTAACAACACTAGCCA+TGG 0.570853 4:-47035432 None:intergenic
TAGCAGCTCAATTGCCAGGT+AGG 0.572910 4:+47035171 MsG0480020725.01.T01:CDS
ATAGAGAAACATGGCACTGG+TGG 0.573444 4:+47034160 MsG0480020725.01.T01:CDS
TTTATGATAAATGGTAACAA+TGG 0.578179 4:+47035638 MsG0480020725.01.T01:CDS
AATTGATGAGAAGAAGGAGA+AGG 0.583152 4:-47035296 None:intergenic
GGGTAATTATATTGCATGGG+AGG 0.586340 4:-47035452 None:intergenic
CATCATCACATGAATAGTGG+TGG 0.600970 4:+47035581 MsG0480020725.01.T01:CDS
TACATAGAGAAACATGGCAC+TGG 0.602623 4:+47034157 MsG0480020725.01.T01:CDS
GGAAGTTGCACTCTTAGTCA+TGG 0.605348 4:+47035527 MsG0480020725.01.T01:CDS
TGTTTAGGTCTCAAGAGATG+TGG 0.606061 4:+47034324 MsG0480020725.01.T01:intron
TCAAGACCATAATCTAGTAA+CGG 0.633113 4:-47035752 None:intergenic
TAGGCCAAACATTAAGCATG+GGG 0.634007 4:+47034380 MsG0480020725.01.T01:CDS
GACAAAACAAGTGTTAAGAG+AGG 0.658214 4:+47034097 MsG0480020725.01.T01:CDS
AAAGCCTACATAGAGAAACA+TGG 0.705589 4:+47034151 MsG0480020725.01.T01:CDS
CAAGTGTTAAGAGAGGTCCA+TGG 0.733365 4:+47034104 MsG0480020725.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! TATAATGATAATGATTAAAA+GGG - Chr4:47034585-47034604 None:intergenic 10.0%
!!! TTAATAATAATTCTTTTTGA+AGG - Chr4:47034837-47034856 None:intergenic 10.0%
!!! TTATAATGATAATGATTAAA+AGG - Chr4:47034586-47034605 None:intergenic 10.0%
!! AAAAACAATAGATACATTAT+TGG - Chr4:47034634-47034653 None:intergenic 15.0%
!! ATAAACATGTTATCTTTAAT+AGG - Chr4:47035476-47035495 None:intergenic 15.0%
!! TAAACATGTTATCTTTAATA+GGG - Chr4:47035475-47035494 None:intergenic 15.0%
!!! AAAAATTTAAGCATTTTTCA+TGG - Chr4:47034256-47034275 None:intergenic 15.0%
!!! ATAATGATAATGATTAAAAG+GGG - Chr4:47034584-47034603 None:intergenic 15.0%
!!! ATAATGTATCTATTGTTTTT+TGG + Chr4:47034634-47034653 MsG0480020725.01.T01:intron 15.0%
!!! CATTTTTGATATTGATTTAT+AGG + Chr4:47035138-47035157 MsG0480020725.01.T01:intron 15.0%
!! AAAAATGGTTGTATATTAGT+TGG - Chr4:47035034-47035053 None:intergenic 20.0%
!! AAAGATAACATGTTTATGTT+TGG + Chr4:47035479-47035498 MsG0480020725.01.T01:CDS 20.0%
!! AAGAACAACTTTATGATAAA+TGG + Chr4:47035629-47035648 MsG0480020725.01.T01:CDS 20.0%
!! ATATCATATTGAGATTAGAT+TGG - Chr4:47034533-47034552 None:intergenic 20.0%
!! GTTGGATATAGTTATAATAA+TGG + Chr4:47035710-47035729 MsG0480020725.01.T01:CDS 20.0%
!! TTTATGATAAATGGTAACAA+TGG + Chr4:47035638-47035657 MsG0480020725.01.T01:CDS 20.0%
!!! TAGTTGGTATTTTTTTTTGA+GGG - Chr4:47035018-47035037 None:intergenic 20.0%
!!! TTAGTTGGTATTTTTTTTTG+AGG - Chr4:47035019-47035038 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTGATATTGATTTATAGG+TGG + Chr4:47035141-47035160 MsG0480020725.01.T01:intron 20.0%
! AAAGTTGAAGAAAAAACTCA+TGG + Chr4:47035226-47035245 MsG0480020725.01.T01:CDS 25.0%
! AACTTATTTGAACCAAGAAT+TGG + Chr4:47034751-47034770 MsG0480020725.01.T01:intron 25.0%
! AATAGGGTAATTATATTGCA+TGG - Chr4:47035459-47035478 None:intergenic 25.0%
! ACAATGATATCAAGAACTAT+TGG + Chr4:47035198-47035217 MsG0480020725.01.T01:CDS 25.0%
! ATAGGGTAATTATATTGCAT+GGG - Chr4:47035458-47035477 None:intergenic 25.0%
! ATTCATAAGAATGAAGAGAT+TGG + Chr4:47035830-47035849 MsG0480020725.01.T01:CDS 25.0%
! CAAAAATGTGATTATAGTCA+TGG - Chr4:47035126-47035145 None:intergenic 25.0%
! CAATATGAAGAAAAATCAAG+TGG + Chr4:47035686-47035705 MsG0480020725.01.T01:CDS 25.0%
! TGAAGCTATATTGTTGAAAA+AGG - Chr4:47034714-47034733 None:intergenic 25.0%
! TTAAATCCGTTACTAGATTA+TGG + Chr4:47035746-47035765 MsG0480020725.01.T01:CDS 25.0%
!! CACTTGATTTTTCTTCATAT+TGG - Chr4:47035688-47035707 None:intergenic 25.0%
!! TCTATTTCTCTAACTAAAAG+AGG + Chr4:47034672-47034691 MsG0480020725.01.T01:intron 25.0%
!!! ACTCTTGATTTTGGTAAATA+GGG - Chr4:47035412-47035431 None:intergenic 25.0%
!!! TAATTTTTACCAGCTTTATG+AGG - Chr4:47034202-47034221 None:intergenic 25.0%
!!! TTTCTTTGATGATGTAATGT+TGG - Chr4:47035263-47035282 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTAGTTAGAGAAATAGAG+AGG - Chr4:47034671-47034690 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTTTGAGGGAATATTAGT+TGG - Chr4:47035006-47035025 None:intergenic 25.0%
AATGGTTTGAAGATCTATGA+AGG - Chr4:47035351-47035370 None:intergenic 30.0%
AATGTGATTATAGTCATGGA+AGG - Chr4:47035122-47035141 None:intergenic 30.0%
ATGTTTATGTTTGGAAGTGA+AGG + Chr4:47035488-47035507 MsG0480020725.01.T01:CDS 30.0%
CTTGGTTCAAATAAGTTTCT+TGG - Chr4:47034748-47034767 None:intergenic 30.0%
GAAAAAGTTGTAGATTGAGA+TGG + Chr4:47034346-47034365 MsG0480020725.01.T01:CDS 30.0%
GTGTTTGGATAGTTATTTGA+AGG - Chr4:47035380-47035399 None:intergenic 30.0%
GTTATTTGAAGGAAGTGAAA+TGG - Chr4:47035369-47035388 None:intergenic 30.0%
TATCATCATCACATGAATAG+TGG + Chr4:47035578-47035597 MsG0480020725.01.T01:CDS 30.0%
TCAAGACCATAATCTAGTAA+CGG - Chr4:47035755-47035774 None:intergenic 30.0%
TCATATTCAACTCCAATTCT+TGG - Chr4:47034766-47034785 None:intergenic 30.0%
TCTAAGAATTGATGAGAAGA+AGG - Chr4:47035305-47035324 None:intergenic 30.0%
TCTTTGTTAATATTGGAAGC+AGG + Chr4:47034439-47034458 MsG0480020725.01.T01:CDS 30.0%
TGCAGTCTCTTTGTTAATAT+TGG + Chr4:47034432-47034451 MsG0480020725.01.T01:CDS 30.0%
! ACTTTGCATTTTGCACTAAA+AGG - Chr4:47034478-47034497 None:intergenic 30.0%
! AGACATGAAATTTGTTTGTC+TGG + Chr4:47035078-47035097 MsG0480020725.01.T01:intron 30.0%
! GACATGAAATTTGTTTGTCT+GGG + Chr4:47035079-47035098 MsG0480020725.01.T01:intron 30.0%
!! AGTTTGGCTTTAAAATCTGA+AGG - Chr4:47034908-47034927 None:intergenic 30.0%
!! GACTCTTGATTTTGGTAAAT+AGG - Chr4:47035413-47035432 None:intergenic 30.0%
AAAGCCTACATAGAGAAACA+TGG + Chr4:47034151-47034170 MsG0480020725.01.T01:CDS 35.0%
AAATCCCCATGCTTAATGTT+TGG - Chr4:47034387-47034406 None:intergenic 35.0%
AATTGATGAGAAGAAGGAGA+AGG - Chr4:47035299-47035318 None:intergenic 35.0%
ATAGGGTTGAAACTTGTGTT+TGG - Chr4:47035395-47035414 None:intergenic 35.0%
ATTTCTCTTCCTCATAAAGC+TGG + Chr4:47034190-47034209 MsG0480020725.01.T01:CDS 35.0%
GAAGAAAAATCAAGTGGAGT+TGG + Chr4:47035692-47035711 MsG0480020725.01.T01:CDS 35.0%
GACAAAACAAGTGTTAAGAG+AGG + Chr4:47034097-47034116 MsG0480020725.01.T01:CDS 35.0%
TATAGTCATGGAAGGTGATT+AGG - Chr4:47035114-47035133 None:intergenic 35.0%
TGAAGATCTATGAAGGAAGT+TGG - Chr4:47035344-47035363 None:intergenic 35.0%
TGAGATGGCTAAACTATCTT+AGG + Chr4:47034361-47034380 MsG0480020725.01.T01:CDS 35.0%
TGAGATTAGATTGGTGAGAA+CGG - Chr4:47034524-47034543 None:intergenic 35.0%
TTACCAAAATCAAGAGTCCA+TGG + Chr4:47035415-47035434 MsG0480020725.01.T01:CDS 35.0%
TTAGGCCAAACATTAAGCAT+GGG + Chr4:47034379-47034398 MsG0480020725.01.T01:CDS 35.0%
! AAATTTGTTTGTCTGGGTAG+TGG + Chr4:47035085-47035104 MsG0480020725.01.T01:intron 35.0%
!! AGTGGTGGATTTGAATTTGA+TGG + Chr4:47035596-47035615 MsG0480020725.01.T01:CDS 35.0%
!! GGTAACAATGGAAGTATTGT+TGG + Chr4:47035650-47035669 MsG0480020725.01.T01:CDS 35.0%
!! TTAAGCTTTGAGTCTTCTTC+TGG - Chr4:47034133-47034152 None:intergenic 35.0%
!!! ACACTTGTTTTGTCACAACA+TGG - Chr4:47034091-47034110 None:intergenic 35.0%
AGGATTAACAACACTAGCCA+TGG - Chr4:47035435-47035454 None:intergenic 40.0%
AGTGCCATGTTTCTCTATGT+AGG - Chr4:47034158-47034177 None:intergenic 40.0%
ATATCATTGTCTGTCCTACC+TGG - Chr4:47035188-47035207 None:intergenic 40.0%
ATTAGTAGCAGCAGCAACAA+AGG + Chr4:47035791-47035810 MsG0480020725.01.T01:CDS 40.0%
ATTATAGCAGCTCAATTGCC+AGG + Chr4:47035167-47035186 MsG0480020725.01.T01:CDS 40.0%
CATCATCACATGAATAGTGG+TGG + Chr4:47035581-47035600 MsG0480020725.01.T01:CDS 40.0%
CTTAGGCCAAACATTAAGCA+TGG + Chr4:47034378-47034397 MsG0480020725.01.T01:CDS 40.0%
GAAGGAAGTAGTTCATCTGA+TGG + Chr4:47035506-47035525 MsG0480020725.01.T01:CDS 40.0%
GGGTAATTATATTGCATGGG+AGG - Chr4:47035455-47035474 None:intergenic 40.0%
TACATAGAGAAACATGGCAC+TGG + Chr4:47034157-47034176 MsG0480020725.01.T01:CDS 40.0%
TAGGCCAAACATTAAGCATG+GGG + Chr4:47034380-47034399 MsG0480020725.01.T01:CDS 40.0%
TGGTGAGAACGGAACAAAAA+GGG - Chr4:47034513-47034532 None:intergenic 40.0%
TGTTTAGGTCTCAAGAGATG+TGG + Chr4:47034324-47034343 MsG0480020725.01.T01:intron 40.0%
TTAGTAGCAGCAGCAACAAA+GGG + Chr4:47035792-47035811 MsG0480020725.01.T01:CDS 40.0%
TTGGTGAGAACGGAACAAAA+AGG - Chr4:47034514-47034533 None:intergenic 40.0%
TTGTTCATGAGATGTCACCT+TGG - Chr4:47034938-47034957 None:intergenic 40.0%
! TAGCCATGGACTCTTGATTT+TGG - Chr4:47035421-47035440 None:intergenic 40.0%
CAAGTGTTAAGAGAGGTCCA+TGG + Chr4:47034104-47034123 MsG0480020725.01.T01:CDS 45.0%
GAAGGAGAAGGTGGAAATGA+AGG - Chr4:47035287-47035306 None:intergenic 45.0%
GGAAGTTGCACTCTTAGTCA+TGG + Chr4:47035527-47035546 MsG0480020725.01.T01:CDS 45.0%
TGATGAGAAGAAGGAGAAGG+TGG - Chr4:47035296-47035315 None:intergenic 45.0%
TTCATGAGATGTCACCTTGG+TGG - Chr4:47034935-47034954 None:intergenic 45.0%
! ATAGAGAAACATGGCACTGG+TGG + Chr4:47034160-47034179 MsG0480020725.01.T01:CDS 45.0%
! GCATGGGGATTTTTCTGATG+AGG + Chr4:47034395-47034414 MsG0480020725.01.T01:CDS 45.0%
!! AACATGGCACTGGTGGAAAT+TGG + Chr4:47034167-47034186 MsG0480020725.01.T01:CDS 45.0%
!! TAAAAAAAATTATAGAAAAA+TGG - Chr4:47035049-47035068 None:intergenic 5.0%
!!! TTTTTTTTTTATATATGTTT+AGG + Chr4:47034309-47034328 MsG0480020725.01.T01:intron 5.0%
!!! TTTTTTTTTTTAAGAAAAAT+GGG + Chr4:47034788-47034807 MsG0480020725.01.T01:intron 5.0%
!!! TTTTTTTTTTTTAAGAAAAA+TGG + Chr4:47034787-47034806 MsG0480020725.01.T01:intron 5.0%
AAGCCAAACTGTTGCCACCA+AGG + Chr4:47034918-47034937 MsG0480020725.01.T01:intron 50.0%
GAGTCTTCTTCTGGTGACCA+TGG - Chr4:47034124-47034143 None:intergenic 50.0%
TAGCAGCTCAATTGCCAGGT+AGG + Chr4:47035171-47035190 MsG0480020725.01.T01:CDS 50.0%
! TCACCTTGGTGGCAACAGTT+TGG - Chr4:47034924-47034943 None:intergenic 50.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr4 gene 47034076 47035874 47034076 ID=MsG0480020725.01;Name=MsG0480020725.01
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Chr4 exon 47034076 47034211 47034076 ID=MsG0480020725.01.T01:exon:7311;Parent=MsG0480020725.01.T01
Chr4 exon 47034331 47034460 47034331 ID=MsG0480020725.01.T01:exon:7312;Parent=MsG0480020725.01.T01
Chr4 exon 47035160 47035874 47035160 ID=MsG0480020725.01.T01:exon:7313;Parent=MsG0480020725.01.T01
Chr4 CDS 47034076 47034211 47034076 ID=MsG0480020725.01.T01:cds;Parent=MsG0480020725.01.T01
Chr4 CDS 47034331 47034460 47034331 ID=MsG0480020725.01.T01:cds;Parent=MsG0480020725.01.T01
Chr4 CDS 47035160 47035874 47035160 ID=MsG0480020725.01.T01:cds;Parent=MsG0480020725.01.T01
Gene Sequence

>MsG0480020725.01.T01

ATGGGAAGAGCTCCATGTTGTGACAAAACAAGTGTTAAGAGAGGTCCATGGTCACCAGAAGAAGACTCAAAGCTTAAAGCCTACATAGAGAAACATGGCACTGGTGGAAATTGGATTTCTCTTCCTCATAAAGCTGGTCTCAAGAGATGTGGAAAAAGTTGTAGATTGAGATGGCTAAACTATCTTAGGCCAAACATTAAGCATGGGGATTTTTCTGATGAGGAAGACAGAATAATTTGCAGTCTCTTTGTTAATATTGGAAGCAGGTGGTCAATTATAGCAGCTCAATTGCCAGGTAGGACAGACAATGATATCAAGAACTATTGGAACACAAAGTTGAAGAAAAAACTCATGGCTATGCAGTTTCCAACATTACATCATCAAAGAAAACCTTCATTTCCACCTTCTCCTTCTTCTCATCAATTCTTAGACTACTTTTCTCACACACCAACTTCCTTCATAGATCTTCAAACCATTTCACTTCCTTCAAATAACTATCCAAACACAAGTTTCAACCCTATTTACCAAAATCAAGAGTCCATGGCTAGTGTTGTTAATCCTCCCATGCAATATAATTACCCTATTAAAGATAACATGTTTATGTTTGGAAGTGAAGGAAGTAGTTCATCTGATGGAAGTTGCACTCTTAGTCATGGCAAAGAAATCAAGCAAGAAGAAATTGTTTATCATCATCACATGAATAGTGGTGGATTTGAATTTGATGGCTACAACAATAAGAACAACTTTATGATAAATGGTAACAATGGAAGTATTGTTGGTGAAAGTGTTAACCAATATGAAGAAAAATCAAGTGGAGTTGGATATAGTTATAATAATGGTCAAAGTCAAATATTAAATCCGTTACTAGATTATGGTCTTGATGATATTAAACAATTGATTAGTAGCAGCAGCAACAAAGGGTTTAATGTTGATGATATTCATAAGAATGAAGAGATTGGTATGTACTACTTTGATTATTAA
Protein sequence

>MsG0480020725.01.T01

MGRAPCCDKTSVKRGPWSPEEDSKLKAYIEKHGTGGNWISLPHKAGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNIKHGDFSDEEDRIICSLFVNIGSRWSIIAAQLPGRTDNDIKNYWNTKLKKKLMAMQFPTLHHQRKPSFPPSPSSHQFLDYFSHTPTSFIDLQTISLPSNNYPNTSFNPIYQNQESMASVVNPPMQYNYPIKDNMFMFGSEGSSSSDGSCTLSHGKEIKQEEIVYHHHMNSGGFEFDGYNNKNNFMINGNNGSIVGESVNQYEEKSSGVGYSYNNGQSQILNPLLDYGLDDIKQLISSSSNKGFNVDDIHKNEEIGMYYFDY*