AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0580027828.01

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MsG0580027828.01.T01 AT5G65700 29.843 573 331 20 63 593 49 592 1.09e-36 150
MsG0580027828.01.T01 AT5G65700 30.996 271 170 6 523 782 64 328 9.51e-20 95.5
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MsG0580027828.01.T01 AT2G33170 29.870 693 406 20 136 803 87 724 1.34e-46 181
MsG0580027828.01.T01 AT2G33170 28.446 798 440 27 1 760 1 705 2.55e-45 177
MsG0580027828.01.T01 AT1G17230 28.775 702 386 20 155 802 64 705 1.44e-46 181
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MsG0580027828.01.T01 AT5G62230 29.358 545 279 14 315 803 70 564 1.48e-46 181
MsG0580027828.01.T01 AT5G62230 28.333 600 349 18 8 593 11 543 2.78e-31 132
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MsG0580027828.01.T01 AT4G08850 29.393 626 331 24 247 803 101 684 6.24e-46 179
MsG0580027828.01.T01 AT4G08850 30.838 561 288 18 263 784 94 593 1.57e-44 174
MsG0580027828.01.T01 AT4G08850 27.727 660 368 21 30 646 49 642 1.08e-36 150
MsG0580027828.01.T01 AT3G53240 28.834 763 418 27 27 764 6 668 7.35e-46 178
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MsG0580027828.01.T01 AT1G34110 28.080 698 390 20 12 643 10 661 1.26e-25 114
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MsG0580027828.01.T01 AT1G09970 27.303 608 351 25 6 593 11 547 1.96e-27 120
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MsG0580027828.01.T01 AT3G53240 29.028 720 392 25 70 764 7 632 7.36e-44 172
MsG0580027828.01.T01 AT1G17250 29.310 696 370 21 214 843 96 735 1.33e-43 170
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MsG0580027828.01.T01 AT5G20480 26.260 655 360 23 4 594 7 602 2.62e-30 129
MsG0580027828.01.T01 AT5G20480 30.341 323 174 7 491 782 84 386 8.26e-23 105
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MsG0580027828.01.T01 AT5G06940 28.462 520 263 19 110 602 81 518 2.26e-21 100
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MsG0580027828.01.T01 AT2G24130 28.674 558 338 14 261 803 80 592 5.10e-36 147
MsG0580027828.01.T01 AT2G24130 30.812 542 293 17 68 566 66 568 4.23e-29 125
MsG0580027828.01.T01 AT2G24130 28.674 558 338 14 261 803 65 577 7.17e-36 147
MsG0580027828.01.T01 AT2G24130 30.812 542 293 17 68 566 51 553 4.31e-29 125
MsG0580027828.01.T01 AT5G49660 28.201 617 342 22 267 859 76 615 8.55e-36 147
MsG0580027828.01.T01 AT5G49660 27.911 541 276 20 236 740 94 556 3.53e-29 125
MsG0580027828.01.T01 AT5G49660 30.065 459 273 17 342 782 73 501 1.22e-28 124
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MsG0580027828.01.T01 AT1G80080 32.946 258 148 7 503 758 158 392 5.68e-23 104
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MsG0580027828.01.T01 AT1G80080 33.333 249 150 5 207 451 152 388 1.38e-13 74.7
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MsG0580027828.01.T01 AT1G33600 28.835 541 260 22 11 521 8 453 9.13e-22 100
MsG0580027828.01.T01 AT3G12145 28.205 312 173 8 501 810 63 325 7.65e-23 100
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MsG0580027828.01.T01 AT5G06860 32.889 225 136 10 305 521 85 302 3.18e-12 69.3
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MsG0580027828.01.T01 AT1G29750 25.946 370 185 11 464 823 113 403 1.56e-14 78.6
MsG0580027828.01.T01 AT1G29750 30.451 266 155 12 536 798 93 331 3.79e-12 70.9
MsG0580027828.01.T01 AT3G25560 33.146 178 106 4 692 866 104 271 2.41e-14 77.8
MsG0580027828.01.T01 AT3G19320 27.333 300 165 8 488 782 156 407 2.46e-14 77.0
MsG0580027828.01.T01 AT3G19320 28.897 263 166 8 388 636 168 423 2.81e-14 77.0
MsG0580027828.01.T01 AT5G45770 48.837 86 44 0 698 783 198 283 2.55e-14 76.6
MsG0580027828.01.T01 AT5G45770 33.540 161 86 3 627 787 172 311 3.27e-14 76.3
MsG0580027828.01.T01 AT5G45770 33.333 186 116 4 407 586 140 323 5.33e-13 72.4
MsG0580027828.01.T01 AT2G45340 32.544 169 107 3 435 599 70 235 2.65e-14 77.8
MsG0580027828.01.T01 AT2G45340 28.774 212 119 4 476 664 39 241 2.61e-13 74.3
MsG0580027828.01.T01 AT2G45340 39.286 112 62 2 692 797 115 226 4.43e-12 70.5
MsG0580027828.01.T01 AT2G45340 38.596 114 65 2 692 803 139 249 7.71e-11 66.6
MsG0580027828.01.T01 AT1G03440 27.857 280 167 9 492 755 87 347 2.75e-14 76.3
MsG0580027828.01.T01 AT1G03440 23.776 286 165 7 501 760 67 325 2.75e-13 73.2
MsG0580027828.01.T01 AT1G03440 27.698 278 169 8 460 733 124 373 1.17e-11 68.2
MsG0580027828.01.T01 AT1G03440 29.386 228 136 10 401 618 112 324 7.08e-11 65.9
MsG0580027828.01.T01 AT3G25560 33.146 178 106 4 692 866 104 271 2.88e-14 77.4
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MsG0580027828.01.T01 AT2G13800 44.860 107 58 1 692 798 93 198 2.94e-14 77.4
MsG0580027828.01.T01 AT2G23300 31.892 185 103 6 627 810 124 286 4.25e-14 77.0
MsG0580027828.01.T01 AT1G49750 27.273 264 144 6 519 782 190 405 8.26e-14 75.5
MsG0580027828.01.T01 AT1G49750 29.339 242 159 7 400 636 187 421 3.62e-13 73.6
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MsG0580027828.01.T01 AT5G45780 31.707 164 101 4 702 865 69 221 9.87e-14 75.5
MsG0580027828.01.T01 AT5G10290 47.727 88 46 0 696 783 73 160 1.11e-13 75.5
MsG0580027828.01.T01 AT5G10290 47.727 88 46 0 696 783 73 160 1.11e-13 75.5
MsG0580027828.01.T01 AT1G64210 32.164 171 101 3 486 645 35 201 1.56e-13 75.1
MsG0580027828.01.T01 AT1G64210 43.956 91 51 0 692 782 87 177 2.67e-11 67.8
MsG0580027828.01.T01 AT1G64210 42.056 107 58 2 692 798 111 213 5.02e-11 67.0
MsG0580027828.01.T01 AT2G23950 30.151 199 117 4 692 890 97 273 1.62e-13 74.7
MsG0580027828.01.T01 AT2G13790 45.545 101 54 1 698 798 104 203 2.21e-13 74.7
MsG0580027828.01.T01 AT5G53320 31.757 148 94 3 501 645 60 203 2.78e-13 74.3
MsG0580027828.01.T01 AT1G69990 42.017 119 66 2 690 807 86 202 3.60e-13 73.9
MsG0580027828.01.T01 AT1G69990 35.878 131 73 2 497 616 48 178 6.37e-12 69.7
MsG0580027828.01.T01 AT2G23950 30.151 199 117 4 692 890 97 273 4.42e-13 73.6
MsG0580027828.01.T01 AT1G11130 32.738 168 103 4 487 651 76 236 4.82e-13 73.6
MsG0580027828.01.T01 AT4G33430 41.346 104 61 0 692 795 91 194 5.38e-13 73.2
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MsG0580027828.01.T01 AT5G63710 31.285 179 113 4 694 871 58 227 7.59e-13 72.8
MsG0580027828.01.T01 AT1G29720 26.316 209 126 4 440 620 120 328 7.94e-13 73.2
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MsG0580027828.01.T01 AT2G02780 28.444 225 134 5 586 794 88 301 1.12e-12 72.4
MsG0580027828.01.T01 AT2G02780 30.645 186 102 4 485 646 110 292 2.44e-12 71.2
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MsG0580027828.01.T01 AT1G63430 34.694 196 105 7 628 802 13 206 1.90e-12 71.6
MsG0580027828.01.T01 AT3G25560 32.402 179 107 5 692 866 104 272 2.05e-12 71.6
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MsG0580027828.01.T01 AT3G42880 24.638 276 135 8 612 886 78 281 8.76e-12 69.3
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MsG0580027828.01.T01 AT3G23750 25.934 482 278 18 30 494 25 444 3.60e-11 67.8
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MsG0580027828.01.T01 AT3G08680 28.700 223 126 6 692 891 91 303 5.46e-11 67.0
MsG0580027828.01.T01 AT5G65830 36.885 122 70 2 693 808 104 224 5.90e-11 64.7
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MsG0580027828.01.T01 AT5G48380 38.136 118 72 1 690 806 97 214 7.03e-11 66.6
MsG0580027828.01.T01 AT3G28450 35.294 119 76 1 693 810 102 220 7.13e-11 66.6
MsG0580027828.01.T01 AT4G35470 30.037 273 153 12 306 574 261 499 9.52e-11 65.9
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Find 171 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 215 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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GTGAACTTTCAAAATTTAAT+TGG 0.196237 5:-69236612 MsG0580027828.01.T01:CDS
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GGAGAGATTCCAACAATTAT+TGG 0.242914 5:-69235074 MsG0580027828.01.T01:CDS
TCCTTCATGGGCTTCTTCAT+TGG 0.260900 5:-69237322 MsG0580027828.01.T01:CDS
CATAACTTTCTTACATCAAC+TGG 0.266777 5:-69235854 MsG0580027828.01.T01:CDS
TTTCCGAGATCTTTCAGTTT+TGG 0.268056 5:-69235615 MsG0580027828.01.T01:CDS
GTGTTTATCTGTCTTATAAT+AGG 0.268720 5:-69236234 MsG0580027828.01.T01:CDS
ATTAGTTTCGCTTGATCTTT+CGG 0.274413 5:-69236893 MsG0580027828.01.T01:CDS
TCTGTAGTGGTCACAATAAA+AGG 0.275108 5:-69235167 MsG0580027828.01.T01:CDS
ATTTCAGAATAATTCCTATA+AGG 0.283992 5:-69234826 MsG0580027828.01.T01:CDS
CTAAGCTTACCAAATGAATC+AGG 0.286943 5:+69236490 None:intergenic
TTTCAGAATAATTCCTATAA+GGG 0.293342 5:-69234825 MsG0580027828.01.T01:CDS
TTCATATCAAACATTGAGTT+TGG 0.294271 5:+69236196 None:intergenic
TATGCTAGTGGAATGGTATT+TGG 0.297596 5:-69234675 MsG0580027828.01.T01:CDS
TTGGAACCCTTCCATTGATT+TGG 0.302860 5:+69235927 None:intergenic
TAAAGATTGGTCAATGTCTT+AGG 0.321202 5:+69234921 None:intergenic
CTCGGTGGAAACCAACTTAC+TGG 0.322012 5:-69236292 MsG0580027828.01.T01:CDS
ATGGTATTTGGAATACTATT+GGG 0.343062 5:-69234663 MsG0580027828.01.T01:CDS
AGGAATTATTCTGAAATGTA+TGG 0.359928 5:+69234832 None:intergenic
GAAATTCCAGTTCCACCATT+TGG 0.366390 5:-69235773 MsG0580027828.01.T01:CDS
CTTACTTGTGGTTCACTTCA+AGG 0.373866 5:-69237102 MsG0580027828.01.T01:CDS
TCCTTATGTTTCCTTCATTA+CGG 0.375845 5:-69237241 MsG0580027828.01.T01:CDS
CTTTCATATAATAAAATCAT+TGG 0.378626 5:-69235023 MsG0580027828.01.T01:CDS
AATGGTATTTGGAATACTAT+TGG 0.380208 5:-69234664 MsG0580027828.01.T01:CDS
TTCAACTCTCCAATAATTGT+TGG 0.381006 5:+69235065 None:intergenic
ATTTGTTATATTCTAAACTA+AGG 0.385735 5:+69236716 None:intergenic
TCAGGAGTCATTCCTCCATT+TGG 0.385945 5:-69236547 MsG0580027828.01.T01:CDS
TTATCTTCGTCAAGATTTCA+AGG 0.387864 5:-69236949 MsG0580027828.01.T01:CDS
CTTGCATGGAACAACTTTAG+AGG 0.389722 5:-69236520 MsG0580027828.01.T01:CDS
CTCACCTGTGAGCTTGTTTG+AGG 0.389919 5:+69234947 None:intergenic
GGATGGAAAGCTGTGGCTAT+TGG 0.390814 5:-69234699 MsG0580027828.01.T01:CDS
AGATGGAAGAGAGTGCTATT+AGG 0.394944 5:+69237069 None:intergenic
CCACCGAAGGACTGTGGAAT+AGG 0.400478 5:+69234999 None:intergenic
GAGCACTTCTCTCGTGTACT+TGG 0.404558 5:-69236590 MsG0580027828.01.T01:CDS
AACCAACTTACTGGGTCAAT+TGG 0.405787 5:-69236283 MsG0580027828.01.T01:CDS
TTAAAGACTATGAATTTGAA+TGG 0.406420 5:-69235533 MsG0580027828.01.T01:CDS
GAAGTGCCAAATGGTGGAAC+TGG 0.407483 5:+69235767 None:intergenic
TTAACTCATTGAGGAAGCTT+GGG 0.413401 5:+69235981 None:intergenic
AGTTTAAGAAATTGAAGATT+GGG 0.414194 5:+69236658 None:intergenic
TATTCTGAAATGTATGGAAC+TGG 0.416882 5:+69234838 None:intergenic
CTGTCGAACACTTCTTTGTC+AGG 0.417935 5:-69236565 MsG0580027828.01.T01:CDS
CAGTGAAGTTGTTGTGAGAC+AGG 0.419294 5:+69235663 None:intergenic
AGCAAATTATTCAGCCTCTC+TGG 0.420843 5:-69236743 MsG0580027828.01.T01:CDS
CTCCATTTGGTAAGCTTGCA+TGG 0.422906 5:-69236534 MsG0580027828.01.T01:CDS
CACTCAAGTTATTTGATGAT+AGG 0.424948 5:+69236155 None:intergenic
CAATGGTACCATCTCCGGTT+TGG 0.425353 5:-69235357 MsG0580027828.01.T01:CDS
GGTGAGATCCCTGATTCATT+TGG 0.425515 5:-69236499 MsG0580027828.01.T01:intron
TTTAACTCATTGAGGAAGCT+TGG 0.426678 5:+69235980 None:intergenic
CCACACATTTCCTAAGTTGA+GGG 0.432096 5:-69235327 MsG0580027828.01.T01:CDS
GGCAAGCTTCCACGGTGCCT+TGG 0.437722 5:-69235641 MsG0580027828.01.T01:CDS
AGGTTCAATGGTACCATCTC+CGG 0.437927 5:-69235362 MsG0580027828.01.T01:CDS
TAATACTGAGGAAGAGGAAG+AGG 0.439320 5:-69234575 MsG0580027828.01.T01:CDS
TGGTTTAATAATGTGGGAAA+TGG 0.450663 5:-69235902 MsG0580027828.01.T01:CDS
TTATCAAACAACAAATTTGA+AGG 0.451087 5:-69235095 MsG0580027828.01.T01:CDS
TTACGTGCTAATAGGTTCAA+TGG 0.454716 5:-69235374 MsG0580027828.01.T01:CDS
TAGTTTAAGAAATTGAAGAT+TGG 0.456749 5:+69236657 None:intergenic
TCAAATGAACTTGAATCTCT+TGG 0.457735 5:+69234744 None:intergenic
ACAAAATCAGGCTACGTGAT+TGG 0.458010 5:-69237132 MsG0580027828.01.T01:CDS
GGTCCTATTCCACAGTCCTT+CGG 0.466535 5:-69235002 MsG0580027828.01.T01:CDS
CAATATATGAGTGATTCAAA+TGG 0.468888 5:-69235206 MsG0580027828.01.T01:CDS
AAACTTAATCTACGAAGGTT+GGG 0.469172 5:+69236028 None:intergenic
TAAACTTAATCTACGAAGGT+TGG 0.470163 5:+69236027 None:intergenic
CTATCTTACAACCAAATCAA+TGG 0.472726 5:-69235938 MsG0580027828.01.T01:CDS
TCCAAGCTGGTTTAATAATG+TGG 0.475446 5:-69235909 MsG0580027828.01.T01:CDS
CCCACATTATTAAACCAGCT+TGG 0.477876 5:+69235908 None:intergenic
ATCTCAAACAACAAGTTGAC+TGG 0.479955 5:-69235734 MsG0580027828.01.T01:CDS
TAGAGGGCTCATTTCCTAGT+TGG 0.481289 5:-69235430 MsG0580027828.01.T01:CDS
TGATAAGATTAATTTGAGAA+AGG 0.482565 5:+69236086 None:intergenic
TTGGTATGACTCCCTCCAGC+TGG 0.485690 5:+69234868 None:intergenic
CCTCTTCCTCAGTATTAGAC+AGG 0.486608 5:+69234581 None:intergenic
TTGAATGGAAATCAACTGAA+TGG 0.490788 5:-69235518 MsG0580027828.01.T01:CDS
ACCACACATTTCCTAAGTTG+AGG 0.493112 5:-69235328 MsG0580027828.01.T01:CDS
TTCCATGCAAGCTTACCAAA+TGG 0.494285 5:+69236532 None:intergenic
CCTGTCTAATACTGAGGAAG+AGG 0.495309 5:-69234581 MsG0580027828.01.T01:CDS
TTTGTCCTTTGATAGTAAGC+AGG 0.498291 5:+69237207 None:intergenic
CTGTCTTATAATAGGCTACA+TGG 0.498415 5:-69236226 MsG0580027828.01.T01:CDS
ATCACATTCCTCCGTAATGA+AGG 0.499387 5:+69237230 None:intergenic
TGATCTAAGCTTTAACATGT+TGG 0.499868 5:-69235801 MsG0580027828.01.T01:CDS
TCTTGGAGAAAATAAGATAG+AGG 0.502752 5:-69235447 MsG0580027828.01.T01:CDS
CTGTAGTGGTCACAATAAAA+GGG 0.505143 5:-69235166 MsG0580027828.01.T01:CDS
CTGTCTCACAACAACTTCAC+TGG 0.506162 5:-69235662 MsG0580027828.01.T01:CDS
AAAACAAGGACTTGCAACTC+TGG 0.506384 5:+69235395 None:intergenic
GTGAGTTGTGACACAAAATC+AGG 0.506504 5:-69237144 MsG0580027828.01.T01:CDS
GTACAAAAGAACAACCTTGT+TGG 0.507502 5:-69235590 MsG0580027828.01.T01:CDS
TGTTCTTCATCCTCGTGACA+TGG 0.508594 5:+69234768 None:intergenic
GGAAGAGACTCTAGCCAACT+AGG 0.512268 5:+69235416 None:intergenic
TTTGTTATATTCTAAACTAA+GGG 0.512286 5:+69236717 None:intergenic
CTTGAATTCAAGCAAGGCAG+AGG 0.514293 5:+69237275 None:intergenic
ACTATCAAAGGACAAAATCA+TGG 0.514562 5:-69237200 MsG0580027828.01.T01:CDS
GAACCTCTCATTGAACCAGC+TGG 0.518019 5:-69234883 MsG0580027828.01.T01:CDS
CTTGAAGTGAACCACAAGTA+AGG 0.522055 5:+69237103 None:intergenic
GGTTTGATTTAGAGCTAGAG+AGG 0.523956 5:-69235145 MsG0580027828.01.T01:CDS
CCAAGCTGGTTTAATAATGT+GGG 0.526635 5:-69235908 MsG0580027828.01.T01:CDS
CACCAATTGACCCAGTAAGT+TGG 0.528484 5:+69236281 None:intergenic
AACAGCAAGAGAGTAAAGAT+TGG 0.528993 5:+69234908 None:intergenic
TTAGAATATAACAAATTGCA+AGG 0.529205 5:-69236709 MsG0580027828.01.T01:CDS
TCAATGGAAGGGTTCCAAGC+TGG 0.529308 5:-69235922 MsG0580027828.01.T01:CDS
TCCGTAATGAAGGAAACATA+AGG 0.530516 5:+69237240 None:intergenic
TACTGAGGAAGAGGAAGAGG+AGG 0.534991 5:-69234572 MsG0580027828.01.T01:CDS
GAAAAGAAAGAAGTGCCAAA+TGG 0.535542 5:+69235758 None:intergenic
CATCCAAAACTGAAAGATCT+CGG 0.536354 5:+69235612 None:intergenic
CTGTGAGCTTGTTTGAGGAG+AGG 0.537577 5:+69234952 None:intergenic
TGTGTGGTTAGTTTCCAAAC+CGG 0.538494 5:+69235343 None:intergenic
ACTTCACTGGCAAGCTTCCA+CGG 0.539733 5:-69235649 MsG0580027828.01.T01:CDS
CTAAGCTTTAACATGTTGGA+AGG 0.543041 5:-69235797 MsG0580027828.01.T01:CDS
TTGGCAATAACACGAGGTAA+TGG 0.543404 5:+69235494 None:intergenic
ATGTAAGAAAGTTATGAGAA+AGG 0.544011 5:+69235861 None:intergenic
AAGGGAAATCCAAGGCTATG+TGG 0.548402 5:-69234807 MsG0580027828.01.T01:CDS
CCTCCAGCTGGTTCAATGAG+AGG 0.548809 5:+69234880 None:intergenic
GCTAGCAAAGACAAAGTGCT+TGG 0.551939 5:+69236763 None:intergenic
AAAGGAAACCCACATAGCCT+TGG 0.554390 5:+69234798 None:intergenic
AAGTTTCGCGCAAATAAAAG+AGG 0.555062 5:-69234543 MsG0580027828.01.T01:CDS
TAATCTACGAAGGTTGGGTA+AGG 0.555382 5:+69236033 None:intergenic
CTTACAACCAAATCAATGGA+AGG 0.557887 5:-69235934 MsG0580027828.01.T01:CDS
CGGTACGAATTGTTGCTTGT+GGG 0.558133 5:-69237172 MsG0580027828.01.T01:CDS
GTTAGTTTCCAAACCGGAGA+TGG 0.559017 5:+69235349 None:intergenic
TCATTATCAGTGTTATATCT+CGG 0.560099 5:-69236310 MsG0580027828.01.T01:intron
ACGAATTGTTGCTTGTGGGA+TGG 0.561835 5:-69237168 MsG0580027828.01.T01:CDS
CTCTCCTCAAACAAGCTCAC+AGG 0.563590 5:-69234951 MsG0580027828.01.T01:CDS
ATTGGCCTCGACCTTACTTG+TGG 0.565940 5:-69237114 MsG0580027828.01.T01:CDS
AGAATTCTTGAATTCAAGCA+AGG 0.569496 5:+69237269 None:intergenic
GTGATCCTGCTTACTATCAA+AGG 0.577617 5:-69237212 MsG0580027828.01.T01:CDS
GTATGGAACTGGTTCCCACT+TGG 0.578984 5:+69234849 None:intergenic
GTGGCCTAGAAAATCTAGAA+TGG 0.580915 5:-69234980 MsG0580027828.01.T01:CDS
ACCTATTAGCACGTAAAACA+AGG 0.586432 5:+69235381 None:intergenic
GTGATGACTAATGTGAATGA+TGG 0.592181 5:-69235233 MsG0580027828.01.T01:CDS
CTCTCATTGAACCAGCTGGA+GGG 0.592958 5:-69234879 MsG0580027828.01.T01:CDS
ACAAACCAAATCAGCCATTG+TGG 0.593203 5:+69234615 None:intergenic
CCTCTCATTGAACCAGCTGG+AGG 0.595755 5:-69234880 MsG0580027828.01.T01:CDS
ACCAATGAAGAAGCCCATGA+AGG 0.595903 5:+69237321 None:intergenic
AGGGAAATCCAAGGCTATGT+GGG 0.596339 5:-69234806 MsG0580027828.01.T01:CDS
AAGAAAGAAGTGCCAAATGG+TGG 0.598702 5:+69235761 None:intergenic
GTGAACCACAAGTAAGGTCG+AGG 0.599339 5:+69237109 None:intergenic
TAGTTTCGCTTGATCTTTCG+GGG 0.599395 5:-69236891 MsG0580027828.01.T01:CDS
TCGGTGGAAACCAACTTACT+GGG 0.601051 5:-69236291 MsG0580027828.01.T01:CDS
AAAGATCTCGGAAAGTTCCA+AGG 0.601350 5:+69235624 None:intergenic
GTGGCTATTGGATATGCTAG+TGG 0.601788 5:-69234687 MsG0580027828.01.T01:CDS
TAGAATATAACAAATTGCAA+GGG 0.603953 5:-69236708 MsG0580027828.01.T01:CDS
CTTGGAGAAAATAAGATAGA+GGG 0.608566 5:-69235446 MsG0580027828.01.T01:CDS
ACGGTACGAATTGTTGCTTG+TGG 0.613639 5:-69237173 MsG0580027828.01.T01:CDS
ACATTGCCTGTCTAATACTG+AGG 0.615974 5:-69234587 MsG0580027828.01.T01:CDS
TTATGTTTCCTTCATTACGG+AGG 0.617738 5:-69237238 MsG0580027828.01.T01:CDS
AATCTCTCACACATGAACAT+TGG 0.621523 5:-69235830 MsG0580027828.01.T01:CDS
CCTATTCCACAGTCCTTCGG+TGG 0.622807 5:-69234999 MsG0580027828.01.T01:CDS
ATGATAAACTTAATCTACGA+AGG 0.625009 5:+69236023 None:intergenic
TAAGCTTACCAAATGAATCA+GGG 0.629170 5:+69236491 None:intergenic
TGCAGAAGATAATTGAGACA+TGG 0.630622 5:+69237005 None:intergenic
TCTAGGCCACCGAAGGACTG+TGG 0.630656 5:+69234993 None:intergenic
CCCTCAACTTAGGAAATGTG+TGG 0.631175 5:+69235327 None:intergenic
GGAGAGTTGAAGTCACTCAA+AGG 0.634951 5:-69235053 MsG0580027828.01.T01:CDS
TTACAACCAAATCAATGGAA+GGG 0.635493 5:-69235933 MsG0580027828.01.T01:CDS
TAGCTACTATGATTCTGTAG+TGG 0.635580 5:-69235180 MsG0580027828.01.T01:CDS
TTTATTTGGATGGAAAGCTG+TGG 0.638074 5:-69234706 MsG0580027828.01.T01:CDS
ATAACTTTCTTACATCAACT+GGG 0.653492 5:-69235853 MsG0580027828.01.T01:CDS
ATTCCTATAAGGGAAATCCA+AGG 0.654013 5:-69234815 MsG0580027828.01.T01:CDS
GCAAGGCAGAGGAATCATCA+TGG 0.656210 5:+69237286 None:intergenic
CATGCAAGCTTACCAAATGG+AGG 0.664726 5:+69236535 None:intergenic
TATTGGATATGCTAGTGGAA+TGG 0.666860 5:-69234682 MsG0580027828.01.T01:CDS
CTGGAGGGAGTCATACCAAG+TGG 0.668515 5:-69234864 MsG0580027828.01.T01:CDS
GAGACAGGTTGAGTAACTCG+AGG 0.673518 5:+69235678 None:intergenic
TGGAGGGAGTCATACCAAGT+GGG 0.676750 5:-69234863 MsG0580027828.01.T01:CDS
AGACAGGTTGAGTAACTCGA+GGG 0.679218 5:+69235679 None:intergenic
TTGCACTTGGCAATAACACG+AGG 0.684148 5:+69235488 None:intergenic
TTTGTCAAAACCATGTCACG+AGG 0.698747 5:-69234778 MsG0580027828.01.T01:CDS
TAAACTAAGGGAGACCAGAG+AGG 0.700010 5:+69236729 None:intergenic
CGGAAAGTTCCAAGGCACCG+TGG 0.700150 5:+69235632 None:intergenic
TTATCAGTGTTATATCTCGG+TGG 0.704490 5:-69236307 MsG0580027828.01.T01:intron
GAATCATCATGGTTGCACAA+CGG 0.724560 5:+69237297 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! ACAAACTTAAATATTTTATT+TGG + Chr5:69235528-69235547 None:intergenic 10.0%
!!! TTAAATATTTTATTTGGAAT+GGG + Chr5:69235522-69235541 None:intergenic 10.0%
!! CTTTCATATAATAAAATCAT+TGG - Chr5:69236885-69236904 MsG0580027828.01.T01:CDS 15.0%
!! TTGTACAATAATTTACTAAA+TGG - Chr5:69235544-69235563 MsG0580027828.01.T01:CDS 15.0%
!!! ATTTGTTATATTCTAAACTA+AGG + Chr5:69235195-69235214 None:intergenic 15.0%
!!! ATTTTTAATGAGATTTTCAA+AGG + Chr5:69235071-69235090 None:intergenic 15.0%
!!! CAATGATTTTATTATATGAA+AGG + Chr5:69236887-69236906 None:intergenic 15.0%
!!! CTTAAATATTTTATTTGGAA+TGG + Chr5:69235523-69235542 None:intergenic 15.0%
!!! TAAATATTTTATTTGGAATG+GGG + Chr5:69235521-69235540 None:intergenic 15.0%
!!! TTCATCTCAAAATAAATTTT+GGG + Chr5:69236351-69236370 None:intergenic 15.0%
!!! TTTCATCTCAAAATAAATTT+TGG + Chr5:69236352-69236371 None:intergenic 15.0%
!!! TTTGTTATATTCTAAACTAA+GGG + Chr5:69235194-69235213 None:intergenic 15.0%
!! AGATTGTTCATACAATAAAT+TGG - Chr5:69235491-69235510 MsG0580027828.01.T01:CDS 20.0%
!! AGTTTAAGAAATTGAAGATT+GGG + Chr5:69235253-69235272 None:intergenic 20.0%
!! ATTTCAGAATAATTCCTATA+AGG - Chr5:69237082-69237101 MsG0580027828.01.T01:CDS 20.0%
!! GTGAACTTTCAAAATTTAAT+TGG - Chr5:69235296-69235315 MsG0580027828.01.T01:CDS 20.0%
!! TAGAATATAACAAATTGCAA+GGG - Chr5:69235200-69235219 MsG0580027828.01.T01:CDS 20.0%
!! TAGTTTAAGAAATTGAAGAT+TGG + Chr5:69235254-69235273 None:intergenic 20.0%
!! TTAAAGACTATGAATTTGAA+TGG - Chr5:69236375-69236394 MsG0580027828.01.T01:intron 20.0%
!! TTAGAATATAACAAATTGCA+AGG - Chr5:69235199-69235218 MsG0580027828.01.T01:CDS 20.0%
!! TTATCAAACAACAAATTTGA+AGG - Chr5:69236813-69236832 MsG0580027828.01.T01:CDS 20.0%
!! TTTCAGAATAATTCCTATAA+GGG - Chr5:69237083-69237102 MsG0580027828.01.T01:CDS 20.0%
!!! AAGAAGAATTTTTATTTGGA+TGG - Chr5:69237192-69237211 MsG0580027828.01.T01:CDS 20.0%
!!! ACAAGTTTTATATCATTGTT+TGG - Chr5:69235447-69235466 MsG0580027828.01.T01:CDS 20.0%
!!! CATGAAGAAGAATTTTTATT+TGG - Chr5:69237188-69237207 MsG0580027828.01.T01:CDS 20.0%
!!! GTATCTAACAATAATTTTAG+CGG - Chr5:69236612-69236631 MsG0580027828.01.T01:CDS 20.0%
!!! TAAAAATACAACTGACTTAA+AGG - Chr5:69235084-69235103 MsG0580027828.01.T01:CDS 20.0%
!!! TGATAAGATTAATTTGAGAA+AGG + Chr5:69235825-69235844 None:intergenic 20.0%
! AACAAAAAGAAACAAACACA+TGG + Chr5:69234564-69234583 None:intergenic 25.0%
! ATAACTTTCTTACATCAACT+GGG - Chr5:69236055-69236074 MsG0580027828.01.T01:CDS 25.0%
! ATGATAAACTTAATCTACGA+AGG + Chr5:69235888-69235907 None:intergenic 25.0%
! ATGTAAGAAAGTTATGAGAA+AGG + Chr5:69236050-69236069 None:intergenic 25.0%
! CAATATATGAGTGATTCAAA+TGG - Chr5:69236702-69236721 MsG0580027828.01.T01:CDS 25.0%
! GCATACATCAAAAACTTTAA+AGG - Chr5:69236648-69236667 MsG0580027828.01.T01:CDS 25.0%
! GTGTTTATCTGTCTTATAAT+AGG - Chr5:69235674-69235693 MsG0580027828.01.T01:CDS 25.0%
! TCATTATCAGTGTTATATCT+CGG - Chr5:69235598-69235617 MsG0580027828.01.T01:CDS 25.0%
! TCTTAATTGAAAAACCACAA+TGG - Chr5:69237279-69237298 MsG0580027828.01.T01:CDS 25.0%
! TGTTCATACAATAAATTGGT+TGG - Chr5:69235495-69235514 MsG0580027828.01.T01:CDS 25.0%
! TTCATATCAAACATTGAGTT+TGG + Chr5:69235715-69235734 None:intergenic 25.0%
! TTTGATATGAAAAATCTGAC+TGG - Chr5:69235724-69235743 MsG0580027828.01.T01:CDS 25.0%
!! AATGGTATTTGGAATACTAT+TGG - Chr5:69237244-69237263 MsG0580027828.01.T01:CDS 25.0%
!! ATGGTATTTGGAATACTATT+GGG - Chr5:69237245-69237264 MsG0580027828.01.T01:CDS 25.0%
!! CATCAAAAACTTTAAAGGAA+TGG - Chr5:69236653-69236672 MsG0580027828.01.T01:CDS 25.0%
!!! AGGAATTATTCTGAAATGTA+TGG + Chr5:69237079-69237098 None:intergenic 25.0%
!!! CGAAACTAATTTTGATAAAC+GGG + Chr5:69235005-69235024 None:intergenic 25.0%
!!! GCGAAACTAATTTTGATAAA+CGG + Chr5:69235006-69235025 None:intergenic 25.0%
!!! TCTTTTTGTTTTTCCTTCAT+GGG - Chr5:69234574-69234593 MsG0580027828.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTCTTTTTGTTTTTCCTTCA+TGG - Chr5:69234573-69234592 MsG0580027828.01.T01:CDS 25.0%
AAACTTAATCTACGAAGGTT+GGG + Chr5:69235883-69235902 None:intergenic 30.0%
ACTATCAAAGGACAAAATCA+TGG - Chr5:69234708-69234727 MsG0580027828.01.T01:CDS 30.0%
AGAATTCTTGAATTCAAGCA+AGG + Chr5:69234642-69234661 None:intergenic 30.0%
AGGACAAAATCATGGAAAAA+CGG - Chr5:69234716-69234735 MsG0580027828.01.T01:CDS 30.0%
CATAACTTTCTTACATCAAC+TGG - Chr5:69236054-69236073 MsG0580027828.01.T01:CDS 30.0%
CTATCTTACAACCAAATCAA+TGG - Chr5:69235970-69235989 MsG0580027828.01.T01:CDS 30.0%
CTTGGAGAAAATAAGATAGA+GGG - Chr5:69236462-69236481 MsG0580027828.01.T01:intron 30.0%
GAAATTGAAGATTGGGTAAA+TGG + Chr5:69235246-69235265 None:intergenic 30.0%
TAAACTTAATCTACGAAGGT+TGG + Chr5:69235884-69235903 None:intergenic 30.0%
TAAGCTTACCAAATGAATCA+GGG + Chr5:69235420-69235439 None:intergenic 30.0%
TCAAATGAACTTGAATCTCT+TGG + Chr5:69237167-69237186 None:intergenic 30.0%
TCCTTATGTTTCCTTCATTA+CGG - Chr5:69234667-69234686 MsG0580027828.01.T01:CDS 30.0%
TCTTGGAGAAAATAAGATAG+AGG - Chr5:69236461-69236480 MsG0580027828.01.T01:intron 30.0%
TGGAAAAATCATTGAAAGCT+AGG + Chr5:69234886-69234905 None:intergenic 30.0%
TGGTTTAATAATGTGGGAAA+TGG - Chr5:69236006-69236025 MsG0580027828.01.T01:CDS 30.0%
TTACAACCAAATCAATGGAA+GGG - Chr5:69235975-69235994 MsG0580027828.01.T01:CDS 30.0%
TTATCTTCGTCAAGATTTCA+AGG - Chr5:69234959-69234978 MsG0580027828.01.T01:CDS 30.0%
TTCAACTCTCCAATAATTGT+TGG + Chr5:69236846-69236865 None:intergenic 30.0%
TTGAATGGAAATCAACTGAA+TGG - Chr5:69236390-69236409 MsG0580027828.01.T01:intron 30.0%
! AAGTTTTTGATGTATGCTCT+TGG + Chr5:69236645-69236664 None:intergenic 30.0%
! ATTAGTTTCGCTTGATCTTT+CGG - Chr5:69235015-69235034 MsG0580027828.01.T01:CDS 30.0%
! CACTCAAGTTATTTGATGAT+AGG + Chr5:69235756-69235775 None:intergenic 30.0%
! CTAACCATTCTAGATTTTCT+AGG + Chr5:69236935-69236954 None:intergenic 30.0%
! TAAAGATTGGTCAATGTCTT+AGG + Chr5:69236990-69237009 None:intergenic 30.0%
! TGATCTAAGCTTTAACATGT+TGG - Chr5:69236107-69236126 MsG0580027828.01.T01:CDS 30.0%
! TTTTGATAAACGGGAGATTT+TGG + Chr5:69234996-69235015 None:intergenic 30.0%
!! GAAGAGTTTTTAACTCATTG+AGG + Chr5:69235939-69235958 None:intergenic 30.0%
!! GTTTTTGAAGATGATGAAGA+TGG + Chr5:69234859-69234878 None:intergenic 30.0%
!! TATTCTGAAATGTATGGAAC+TGG + Chr5:69237073-69237092 None:intergenic 30.0%
!! TTTTATTTGCGCGAAACTTT+TGG + Chr5:69237364-69237383 None:intergenic 30.0%
AAAAACCACAATGGCTGATT+TGG - Chr5:69237288-69237307 MsG0580027828.01.T01:CDS 35.0%
AACAGCAAGAGAGTAAAGAT+TGG + Chr5:69237003-69237022 None:intergenic 35.0%
AAGTTTCGCGCAAATAAAAG+AGG - Chr5:69237365-69237384 MsG0580027828.01.T01:CDS 35.0%
AATCTCTCACACATGAACAT+TGG - Chr5:69236078-69236097 MsG0580027828.01.T01:CDS 35.0%
ACATCAAAAACCCTCAACTT+AGG + Chr5:69236594-69236613 None:intergenic 35.0%
ACCTATTAGCACGTAAAACA+AGG + Chr5:69236530-69236549 None:intergenic 35.0%
ATTCCTATAAGGGAAATCCA+AGG - Chr5:69237093-69237112 MsG0580027828.01.T01:CDS 35.0%
CATCCAAAACTGAAAGATCT+CGG + Chr5:69236299-69236318 None:intergenic 35.0%
CTAAGCTTACCAAATGAATC+AGG + Chr5:69235421-69235440 None:intergenic 35.0%
CTGTAGTGGTCACAATAAAA+GGG - Chr5:69236742-69236761 MsG0580027828.01.T01:CDS 35.0%
CTGTCTTATAATAGGCTACA+TGG - Chr5:69235682-69235701 MsG0580027828.01.T01:CDS 35.0%
CTTACAACCAAATCAATGGA+AGG - Chr5:69235974-69235993 MsG0580027828.01.T01:CDS 35.0%
GGAGAGATTCCAACAATTAT+TGG - Chr5:69236834-69236853 MsG0580027828.01.T01:CDS 35.0%
GTACAAAAGAACAACCTTGT+TGG - Chr5:69236318-69236337 MsG0580027828.01.T01:intron 35.0%
GTGATGACTAATGTGAATGA+TGG - Chr5:69236675-69236694 MsG0580027828.01.T01:CDS 35.0%
TAAATGGAACAATTCCACAG+TGG - Chr5:69235560-69235579 MsG0580027828.01.T01:CDS 35.0%
TAGCTACTATGATTCTGTAG+TGG - Chr5:69236728-69236747 MsG0580027828.01.T01:CDS 35.0%
TATGCTAGTGGAATGGTATT+TGG - Chr5:69237233-69237252 MsG0580027828.01.T01:CDS 35.0%
TATTGCCAAGTGCAAAAAAC+TGG - Chr5:69236428-69236447 MsG0580027828.01.T01:intron 35.0%
TATTGGATATGCTAGTGGAA+TGG - Chr5:69237226-69237245 MsG0580027828.01.T01:CDS 35.0%
TCCGTAATGAAGGAAACATA+AGG + Chr5:69234671-69234690 None:intergenic 35.0%
TCTGTAGTGGTCACAATAAA+AGG - Chr5:69236741-69236760 MsG0580027828.01.T01:CDS 35.0%
TGCAGAAGATAATTGAGACA+TGG + Chr5:69234906-69234925 None:intergenic 35.0%
TTAACTCATTGAGGAAGCTT+GGG + Chr5:69235930-69235949 None:intergenic 35.0%
TTACGTGCTAATAGGTTCAA+TGG - Chr5:69236534-69236553 MsG0580027828.01.T01:CDS 35.0%
TTAGTTTCGCTTGATCTTTC+GGG - Chr5:69235016-69235035 MsG0580027828.01.T01:CDS 35.0%
TTATCAGTGTTATATCTCGG+TGG - Chr5:69235601-69235620 MsG0580027828.01.T01:CDS 35.0%
TTATGTTTCCTTCATTACGG+AGG - Chr5:69234670-69234689 MsG0580027828.01.T01:CDS 35.0%
TTTAACTCATTGAGGAAGCT+TGG + Chr5:69235931-69235950 None:intergenic 35.0%
TTTATTTGGATGGAAAGCTG+TGG - Chr5:69237202-69237221 MsG0580027828.01.T01:CDS 35.0%
! ATCTCAAACAACAAGTTGAC+TGG - Chr5:69236174-69236193 MsG0580027828.01.T01:CDS 35.0%
! CCAAGCTGGTTTAATAATGT+GGG - Chr5:69236000-69236019 MsG0580027828.01.T01:CDS 35.0%
! CTAAGCTTTAACATGTTGGA+AGG - Chr5:69236111-69236130 MsG0580027828.01.T01:CDS 35.0%
! GTGCAAAAAACTGGAAGTTT+TGG - Chr5:69236437-69236456 MsG0580027828.01.T01:intron 35.0%
! TCCAAGCTGGTTTAATAATG+TGG - Chr5:69235999-69236018 MsG0580027828.01.T01:CDS 35.0%
! TTTCCGAGATCTTTCAGTTT+TGG - Chr5:69236293-69236312 MsG0580027828.01.T01:CDS 35.0%
! TTTGTCCTTTGATAGTAAGC+AGG + Chr5:69234704-69234723 None:intergenic 35.0%
!! GAAAAGAAAGAAGTGCCAAA+TGG + Chr5:69236153-69236172 None:intergenic 35.0%
!!! AAACTGGAAGTTTTGGATCT+TGG - Chr5:69236444-69236463 MsG0580027828.01.T01:intron 35.0%
!!! AACTTCCAGTTTTTTGCACT+TGG + Chr5:69236436-69236455 None:intergenic 35.0%
!!! TCCTTGTTTTACGTGCTAAT+AGG - Chr5:69236526-69236545 MsG0580027828.01.T01:CDS 35.0%
AAAACAAGGACTTGCAACTC+TGG + Chr5:69236516-69236535 None:intergenic 40.0%
AAAGATCTCGGAAAGTTCCA+AGG + Chr5:69236287-69236306 None:intergenic 40.0%
AACCAACTTACTGGGTCAAT+TGG - Chr5:69235625-69235644 MsG0580027828.01.T01:CDS 40.0%
ACAAAATCAGGCTACGTGAT+TGG - Chr5:69234776-69234795 MsG0580027828.01.T01:CDS 40.0%
ACAAACCAAATCAGCCATTG+TGG + Chr5:69237296-69237315 None:intergenic 40.0%
ACATTGCCTGTCTAATACTG+AGG - Chr5:69237321-69237340 MsG0580027828.01.T01:CDS 40.0%
ACCACACATTTCCTAAGTTG+AGG - Chr5:69236580-69236599 MsG0580027828.01.T01:CDS 40.0%
AGCAAATTATTCAGCCTCTC+TGG - Chr5:69235165-69235184 MsG0580027828.01.T01:CDS 40.0%
ATCACATTCCTCCGTAATGA+AGG + Chr5:69234681-69234700 None:intergenic 40.0%
CCCACATTATTAAACCAGCT+TGG + Chr5:69236003-69236022 None:intergenic 40.0%
CTTACTTGTGGTTCACTTCA+AGG - Chr5:69234806-69234825 MsG0580027828.01.T01:CDS 40.0%
CTTGAAGTGAACCACAAGTA+AGG + Chr5:69234808-69234827 None:intergenic 40.0%
CTTGCATGGAACAACTTTAG+AGG - Chr5:69235388-69235407 MsG0580027828.01.T01:CDS 40.0%
GAAATTCCAGTTCCACCATT+TGG - Chr5:69236135-69236154 MsG0580027828.01.T01:CDS 40.0%
GAATCATCATGGTTGCACAA+CGG + Chr5:69234614-69234633 None:intergenic 40.0%
GACAAAGAATAACACCACTG+TGG + Chr5:69235577-69235596 None:intergenic 40.0%
GTGAGTTGTGACACAAAATC+AGG - Chr5:69234764-69234783 MsG0580027828.01.T01:CDS 40.0%
GTGATCCTGCTTACTATCAA+AGG - Chr5:69234696-69234715 MsG0580027828.01.T01:CDS 40.0%
GTGGCCTAGAAAATCTAGAA+TGG - Chr5:69236928-69236947 MsG0580027828.01.T01:CDS 40.0%
TAATACTGAGGAAGAGGAAG+AGG - Chr5:69237333-69237352 MsG0580027828.01.T01:CDS 40.0%
TAATCTACGAAGGTTGGGTA+AGG + Chr5:69235878-69235897 None:intergenic 40.0%
TAGTTTCGCTTGATCTTTCG+GGG - Chr5:69235017-69235036 MsG0580027828.01.T01:CDS 40.0%
TTCCATGCAAGCTTACCAAA+TGG + Chr5:69235379-69235398 None:intergenic 40.0%
TTGGCAATAACACGAGGTAA+TGG + Chr5:69236417-69236436 None:intergenic 40.0%
TTTGTCAAAACCATGTCACG+AGG - Chr5:69237130-69237149 MsG0580027828.01.T01:CDS 40.0%
! CCACACATTTCCTAAGTTGA+GGG - Chr5:69236581-69236600 MsG0580027828.01.T01:CDS 40.0%
! GGTTTGATTTAGAGCTAGAG+AGG - Chr5:69236763-69236782 MsG0580027828.01.T01:CDS 40.0%
! TAGCCTTGGATTTCCCTTAT+AGG + Chr5:69237099-69237118 None:intergenic 40.0%
! TTGGAACCCTTCCATTGATT+TGG + Chr5:69235984-69236003 None:intergenic 40.0%
!! AAGAAAGAAGTGCCAAATGG+TGG + Chr5:69236150-69236169 None:intergenic 40.0%
!! AGATGGAAGAGAGTGCTATT+AGG + Chr5:69234842-69234861 None:intergenic 40.0%
!! TGTGTGGTTAGTTTCCAAAC+CGG + Chr5:69236568-69236587 None:intergenic 40.0%
!! TTTTGGGTATGACTCCAACA+AGG + Chr5:69236335-69236354 None:intergenic 40.0%
!!! TCGTGACATGGTTTTGACAA+AGG + Chr5:69237131-69237150 None:intergenic 40.0%
AAAGGAAACCCACATAGCCT+TGG + Chr5:69237113-69237132 None:intergenic 45.0%
AAGGGAAATCCAAGGCTATG+TGG - Chr5:69237101-69237120 MsG0580027828.01.T01:CDS 45.0%
ACCAATGAAGAAGCCCATGA+AGG + Chr5:69234590-69234609 None:intergenic 45.0%
AGGGAAATCCAAGGCTATGT+GGG - Chr5:69237102-69237121 MsG0580027828.01.T01:CDS 45.0%
AGGTTCAATGGTACCATCTC+CGG - Chr5:69236546-69236565 MsG0580027828.01.T01:CDS 45.0%
CACCAATTGACCCAGTAAGT+TGG + Chr5:69235630-69235649 None:intergenic 45.0%
CAGTGAAGTTGTTGTGAGAC+AGG + Chr5:69236248-69236267 None:intergenic 45.0%
CATGCAAGCTTACCAAATGG+AGG + Chr5:69235376-69235395 None:intergenic 45.0%
CCCTCAACTTAGGAAATGTG+TGG + Chr5:69236584-69236603 None:intergenic 45.0%
CCTCTTCCTCAGTATTAGAC+AGG + Chr5:69237330-69237349 None:intergenic 45.0%
CCTGTCTAATACTGAGGAAG+AGG - Chr5:69237327-69237346 MsG0580027828.01.T01:CDS 45.0%
CTCCATTTGGTAAGCTTGCA+TGG - Chr5:69235374-69235393 MsG0580027828.01.T01:CDS 45.0%
CTGTCGAACACTTCTTTGTC+AGG - Chr5:69235343-69235362 MsG0580027828.01.T01:CDS 45.0%
CTGTCTCACAACAACTTCAC+TGG - Chr5:69236246-69236265 MsG0580027828.01.T01:CDS 45.0%
CTTGAATTCAAGCAAGGCAG+AGG + Chr5:69234636-69234655 None:intergenic 45.0%
GGAGAGTTGAAGTCACTCAA+AGG - Chr5:69236855-69236874 MsG0580027828.01.T01:CDS 45.0%
GGTGAGATCCCTGATTCATT+TGG - Chr5:69235409-69235428 MsG0580027828.01.T01:CDS 45.0%
GTGGCTATTGGATATGCTAG+TGG - Chr5:69237221-69237240 MsG0580027828.01.T01:CDS 45.0%
TAAACTAAGGGAGACCAGAG+AGG + Chr5:69235182-69235201 None:intergenic 45.0%
TAGAGGGCTCATTTCCTAGT+TGG - Chr5:69236478-69236497 MsG0580027828.01.T01:intron 45.0%
TCAGGAGTCATTCCTCCATT+TGG - Chr5:69235361-69235380 MsG0580027828.01.T01:CDS 45.0%
TCCTTCATGGGCTTCTTCAT+TGG - Chr5:69234586-69234605 MsG0580027828.01.T01:CDS 45.0%
TCGGTGGAAACCAACTTACT+GGG - Chr5:69235617-69235636 MsG0580027828.01.T01:CDS 45.0%
TGTTCTTCATCCTCGTGACA+TGG + Chr5:69237143-69237162 None:intergenic 45.0%
TTGCACTTGGCAATAACACG+AGG + Chr5:69236423-69236442 None:intergenic 45.0%
! ACGAATTGTTGCTTGTGGGA+TGG - Chr5:69234740-69234759 MsG0580027828.01.T01:CDS 45.0%
! ACGGTACGAATTGTTGCTTG+TGG - Chr5:69234735-69234754 MsG0580027828.01.T01:CDS 45.0%
! AGACAGGTTGAGTAACTCGA+GGG + Chr5:69236232-69236251 None:intergenic 45.0%
! CGGTACGAATTGTTGCTTGT+GGG - Chr5:69234736-69234755 MsG0580027828.01.T01:CDS 45.0%
! GCTAGCAAAGACAAAGTGCT+TGG + Chr5:69235148-69235167 None:intergenic 45.0%
! GTTAGTTTCCAAACCGGAGA+TGG + Chr5:69236562-69236581 None:intergenic 45.0%
! TAGATTTTCTAGGCCACCGA+AGG + Chr5:69236925-69236944 None:intergenic 45.0%
ACTTCACTGGCAAGCTTCCA+CGG - Chr5:69236259-69236278 MsG0580027828.01.T01:CDS 50.0%
CAATGGTACCATCTCCGGTT+TGG - Chr5:69236551-69236570 MsG0580027828.01.T01:CDS 50.0%
CTCGGTGGAAACCAACTTAC+TGG - Chr5:69235616-69235635 MsG0580027828.01.T01:CDS 50.0%
CTCTCATTGAACCAGCTGGA+GGG - Chr5:69237029-69237048 MsG0580027828.01.T01:CDS 50.0%
CTCTCCTCAAACAAGCTCAC+AGG - Chr5:69236957-69236976 MsG0580027828.01.T01:CDS 50.0%
GAACCTCTCATTGAACCAGC+TGG - Chr5:69237025-69237044 MsG0580027828.01.T01:CDS 50.0%
GAGCACTTCTCTCGTGTACT+TGG - Chr5:69235318-69235337 MsG0580027828.01.T01:CDS 50.0%
GCAAGGCAGAGGAATCATCA+TGG + Chr5:69234625-69234644 None:intergenic 50.0%
GGAAGAGACTCTAGCCAACT+AGG + Chr5:69236495-69236514 None:intergenic 50.0%
GGATGGAAAGCTGTGGCTAT+TGG - Chr5:69237209-69237228 MsG0580027828.01.T01:CDS 50.0%
GGTCCTATTCCACAGTCCTT+CGG - Chr5:69236906-69236925 MsG0580027828.01.T01:CDS 50.0%
GTGAACCACAAGTAAGGTCG+AGG + Chr5:69234802-69234821 None:intergenic 50.0%
TACTGAGGAAGAGGAAGAGG+AGG - Chr5:69237336-69237355 MsG0580027828.01.T01:CDS 50.0%
TCAATGGAAGGGTTCCAAGC+TGG - Chr5:69235986-69236005 MsG0580027828.01.T01:CDS 50.0%
TGGAGGGAGTCATACCAAGT+GGG - Chr5:69237045-69237064 MsG0580027828.01.T01:CDS 50.0%
! ATTGGCCTCGACCTTACTTG+TGG - Chr5:69234794-69234813 MsG0580027828.01.T01:CDS 50.0%
! CTCACCTGTGAGCTTGTTTG+AGG + Chr5:69236964-69236983 None:intergenic 50.0%
! CTGTGAGCTTGTTTGAGGAG+AGG + Chr5:69236959-69236978 None:intergenic 50.0%
! GAAGTGCCAAATGGTGGAAC+TGG + Chr5:69236144-69236163 None:intergenic 50.0%
! GAGACAGGTTGAGTAACTCG+AGG + Chr5:69236233-69236252 None:intergenic 50.0%
! GTATGGAACTGGTTCCCACT+TGG + Chr5:69237062-69237081 None:intergenic 50.0%
CCACCGAAGGACTGTGGAAT+AGG + Chr5:69236912-69236931 None:intergenic 55.0%
CCTATTCCACAGTCCTTCGG+TGG - Chr5:69236909-69236928 MsG0580027828.01.T01:CDS 55.0%
CCTCTCATTGAACCAGCTGG+AGG - Chr5:69237028-69237047 MsG0580027828.01.T01:CDS 55.0%
CTGGAGGGAGTCATACCAAG+TGG - Chr5:69237044-69237063 MsG0580027828.01.T01:CDS 55.0%
TTGGTATGACTCCCTCCAGC+TGG + Chr5:69237043-69237062 None:intergenic 55.0%
! CCTCCAGCTGGTTCAATGAG+AGG + Chr5:69237031-69237050 None:intergenic 55.0%
TCTAGGCCACCGAAGGACTG+TGG + Chr5:69236918-69236937 None:intergenic 60.0%
!! CGGAAAGTTCCAAGGCACCG+TGG + Chr5:69236279-69236298 None:intergenic 60.0%
GGCAAGCTTCCACGGTGCCT+TGG - Chr5:69236267-69236286 MsG0580027828.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr5 gene 69234539 69237391 69234539 ID=MsG0580027828.01;Name=MsG0580027828.01
Chr5 mRNA 69234539 69237391 69234539 ID=MsG0580027828.01.T01;Parent=MsG0580027828.01;Name=MsG0580027828.01.T01;_AED=0.38;_eAED=0.39;_QI=0|0|0|1|1|1|2|0|891
Chr5 exon 69236500 69237391 69236500 ID=MsG0580027828.01.T01:exon:7043;Parent=MsG0580027828.01.T01
Chr5 exon 69234539 69236322 69234539 ID=MsG0580027828.01.T01:exon:7042;Parent=MsG0580027828.01.T01
Chr5 CDS 69236500 69237391 69236500 ID=MsG0580027828.01.T01:cds;Parent=MsG0580027828.01.T01
Chr5 CDS 69234539 69236322 69234539 ID=MsG0580027828.01.T01:cds;Parent=MsG0580027828.01.T01
Gene Sequence

>MsG0580027828.01.T01

ATGGGGTGGTTTGTGTTTCATTCCATGTGTTTGTTTCTTTTTGTTTTTCCTTCATGGGCTTCTTCATTGGTGCCGTTGTGCAACCATGATGATTCCTCTGCCTTGCTTGAATTCAAGAATTCTTTTAGTCCTTATGTTTCCTTCATTACGGAGGAATGTGATCCTGCTTACTATCAAAGGACAAAATCATGGAAAAACGGTACGAATTGTTGCTTGTGGGATGGAGTGAGTTGTGACACAAAATCAGGCTACGTGATTGGCCTCGACCTTACTTGTGGTTCACTTCAAGGTAAACTTCATCCTAATAGCACTCTCTTCCATCTTCATCATCTTCAAAAACTCAACCTAGCTTTCAATGATTTTTCCATGTCTCAATTATCTTCTGCATTTAGTAATCTTAAATCTCTCACGCATCTAAACTTATCTTCGTCAAGATTTCAAGGTGTCATTTCTTCCAAAATCTCCCGTTTATCAAAATTAGTTTCGCTTGATCTTTCGGGGTCAGACGAAACGATATTTGAACAATCAACCTTTGAAAATCTCATTAAAAATACAACTGACTTAAAGGAACTTTCTCTTGATGACATAGATATGTCTTCAATTACACCAAGCACTTTGTCTTTGCTAGCAAATTATTCAGCCTCTCTGGTCTCCCTTAGTTTAGAATATAACAAATTGCAAGGGAAGTTAGCAAGTAACATTCTCCATTTACCCAATCTTCAATTTCTTAAACTAGCTTCGAATTTTAATCTCAAAAGTGAACTTTCAAAATTTAATTGGAGCACTTCTCTCGTGTACTTGGATCTGTCGAACACTTCTTTGTCAGGAGTCATTCCTCCATTTGGTAAGCTTGCATGGAACAACTTTAGAGGTGAGATCCCTGATTCATTTGTGTTATATCTCGGTGGAAACCAACTTACTGGGTCAATTGGTGAATTCTCTGCTTATTCTTTGACACGTGTTTATCTGTCTTATAATAGGCTACATGGTAATATTCCAAACTCAATGTTTGATATGAAAAATCTGACTGGATTGTACCTATCATCAAATAACTTGAGTGTAGCTTTTCACAAATTTTCAAAGCTTCGAAATCTGCAGTTTCTTTACCTTTCTCAAATTAATCTTATCACTTTTAGCTTACACAATGAAAGTAACTTCACCTTACCCAACCTTCGTAGATTAAGTTTATCATCATGCAAACTCAAGAGTTTCCCAAGCTTCCTCAATGAGTTAAAAACTCTTCAGTATTTAAATCTATCTTACAACCAAATCAATGGAAGGGTTCCAAGCTGGTTTAATAATGTGGGAAATGGAACTTTGTCTTCTTTAGACCTTTCTCATAACTTTCTTACATCAACTGGGAATCTCTCACACATGAACATTGGTTATATTGATCTAAGCTTTAACATGTTGGAAGGAGAAATTCCAGTTCCACCATTTGGCACTTCTTTCTTTTCAATCTCAAACAACAAGTTGACTGGAGATTTATCTTCAAGAATTTGCAATGCAAGCTCCCTCGAGTTACTCAACCTGTCTCACAACAACTTCACTGGCAAGCTTCCACGGTGCCTTGGAACTTTCCGAGATCTTTCAGTTTTGGATGTACAAAAGAACAACCTTGTTGGAGTCATACCCAAAATTTATTTTGAGATGAAAGTTTTAAAGACTATGAATTTGAATGGAAATCAACTGAATGGACCATTACCTCGTGTTATTGCCAAGTGCAAAAAACTGGAAGTTTTGGATCTTGGAGAAAATAAGATAGAGGGCTCATTTCCTAGTTGGCTAGAGTCTCTTCCAGAGTTGCAAGTCCTTGTTTTACGTGCTAATAGGTTCAATGGTACCATCTCCGGTTTGGAAACTAACCACACATTTCCTAAGTTGAGGGTTTTTGATGTATCTAACAATAATTTTAGCGGAACTTTGCCAAGAGCATACATCAAAAACTTTAAAGGAATGGTGATGACTAATGTGAATGATGGCTTGCAATATATGAGTGATTCAAATGGAAATAGCTACTATGATTCTGTAGTGGTCACAATAAAAGGGTTTGATTTAGAGCTAGAGAGGATCTTGACTACTTTCACAACTCTTGATTTATCAAACAACAAATTTGAAGGAGAGATTCCAACAATTATTGGAGAGTTGAAGTCACTCAAAGGACTTAACCTTTCATATAATAAAATCATTGGTCCTATTCCACAGTCCTTCGGTGGCCTAGAAAATCTAGAATGGTTAGACCTCTCCTCAAACAAGCTCACAGGTGAGATTCCTAAGACATTGACCAATCTTTACTCTCTTGCTGTTTTGAACCTCTCATTGAACCAGCTGGAGGGAGTCATACCAAGTGGGAACCAGTTCCATACATTTCAGAATAATTCCTATAAGGGAAATCCAAGGCTATGTGGGTTTCCTTTGTCAAAACCATGTCACGAGGATGAAGAACAACCAAGAGATTCAAGTTCATTTGAGCATGAAGAAGAATTTTTATTTGGATGGAAAGCTGTGGCTATTGGATATGCTAGTGGAATGGTATTTGGAATACTATTGGGTTACATTGTATTCTTAATTGAAAAACCACAATGGCTGATTTGGTTTGTTGAAGACATTGCCTGTCTAATACTGAGGAAGAGGAAGAGGAGGAGCCAAAAGTTTCGCGCAAATAAAAGAGGATAG
Protein sequence

>MsG0580027828.01.T01

MGWFVFHSMCLFLFVFPSWASSLVPLCNHDDSSALLEFKNSFSPYVSFITEECDPAYYQRTKSWKNGTNCCLWDGVSCDTKSGYVIGLDLTCGSLQGKLHPNSTLFHLHHLQKLNLAFNDFSMSQLSSAFSNLKSLTHLNLSSSRFQGVISSKISRLSKLVSLDLSGSDETIFEQSTFENLIKNTTDLKELSLDDIDMSSITPSTLSLLANYSASLVSLSLEYNKLQGKLASNILHLPNLQFLKLASNFNLKSELSKFNWSTSLVYLDLSNTSLSGVIPPFGKLAWNNFRGEIPDSFVLYLGGNQLTGSIGEFSAYSLTRVYLSYNRLHGNIPNSMFDMKNLTGLYLSSNNLSVAFHKFSKLRNLQFLYLSQINLITFSLHNESNFTLPNLRRLSLSSCKLKSFPSFLNELKTLQYLNLSYNQINGRVPSWFNNVGNGTLSSLDLSHNFLTSTGNLSHMNIGYIDLSFNMLEGEIPVPPFGTSFFSISNNKLTGDLSSRICNASSLELLNLSHNNFTGKLPRCLGTFRDLSVLDVQKNNLVGVIPKIYFEMKVLKTMNLNGNQLNGPLPRVIAKCKKLEVLDLGENKIEGSFPSWLESLPELQVLVLRANRFNGTISGLETNHTFPKLRVFDVSNNNFSGTLPRAYIKNFKGMVMTNVNDGLQYMSDSNGNSYYDSVVVTIKGFDLELERILTTFTTLDLSNNKFEGEIPTIIGELKSLKGLNLSYNKIIGPIPQSFGGLENLEWLDLSSNKLTGEIPKTLTNLYSLAVLNLSLNQLEGVIPSGNQFHTFQNNSYKGNPRLCGFPLSKPCHEDEEQPRDSSSFEHEEEFLFGWKAVAIGYASGMVFGILLGYIVFLIEKPQWLIWFVEDIACLILRKRKRRSQKFRANKRG*