AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0580027827.01

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MsG0580027827.01.T01 AT1G74360 32.471 425 211 13 463 859 86 462 1.04e-34 144
MsG0580027827.01.T01 AT1G74360 29.112 608 337 23 175 707 105 693 6.24e-31 132
MsG0580027827.01.T01 AT1G74360 23.906 594 369 15 80 644 162 701 2.22e-25 114
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MsG0580027827.01.T01 AT5G49660 29.362 470 266 17 280 728 129 553 1.14e-34 144
MsG0580027827.01.T01 AT5G49660 28.027 603 312 17 59 649 56 548 5.08e-34 141
MsG0580027827.01.T01 AT5G49660 28.655 342 233 4 77 417 221 552 1.03e-24 111
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MsG0580027827.01.T01 AT1G34420 30.561 553 300 20 346 878 103 591 3.05e-31 132
MsG0580027827.01.T01 AT1G34420 30.296 439 247 11 232 642 181 588 3.55e-28 122
MsG0580027827.01.T01 AT1G34420 33.425 365 190 9 111 464 260 582 1.95e-27 120
MsG0580027827.01.T01 AT1G34420 33.557 298 176 9 102 394 298 578 4.04e-19 93.6
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MsG0580027827.01.T01 AT3G02130 25.969 774 418 25 3 674 9 729 6.97e-35 144
MsG0580027827.01.T01 AT3G02130 27.871 653 349 22 254 835 127 728 3.59e-29 126
MsG0580027827.01.T01 AT3G02130 28.150 373 194 12 553 859 95 459 1.14e-23 108
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MsG0580027827.01.T01 AT1G33600 29.661 354 204 10 568 887 134 476 4.54e-23 104
MsG0580027827.01.T01 AT1G33600 29.428 367 193 10 258 601 130 453 1.95e-22 102
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MsG0580027827.01.T01 AT2G26380 29.381 388 192 12 561 884 107 476 5.34e-22 101
MsG0580027827.01.T01 AT2G26380 31.402 328 203 9 213 530 135 450 1.49e-21 99.8
MsG0580027827.01.T01 AT2G26380 26.772 508 274 18 19 509 29 455 3.73e-20 95.5
MsG0580027827.01.T01 AT3G20820 29.063 320 182 5 572 890 90 365 5.18e-27 114
MsG0580027827.01.T01 AT3G20820 33.333 252 154 6 266 509 90 335 1.83e-24 107
MsG0580027827.01.T01 AT3G20820 26.796 362 206 9 19 367 20 335 2.82e-21 97.4
MsG0580027827.01.T01 AT3G20820 33.180 217 143 2 218 432 90 306 5.98e-20 93.2
MsG0580027827.01.T01 AT3G20820 27.500 280 160 11 380 649 89 335 2.18e-11 67.4
MsG0580027827.01.T01 AT1G54475 48.092 131 66 1 768 898 18 146 2.63e-26 108
MsG0580027827.01.T01 AT5G61240 32.751 229 138 3 207 430 98 315 3.72e-26 111
MsG0580027827.01.T01 AT5G61240 27.875 287 157 5 572 858 85 321 1.64e-17 85.5
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MsG0580027827.01.T01 AT4G06744 27.797 295 166 10 101 384 88 346 2.54e-11 67.4
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MsG0580027827.01.T01 AT2G36570 29.213 178 110 5 772 935 113 288 1.13e-11 69.3
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MsG0580027827.01.T01 AT5G65830 39.286 112 68 0 256 367 82 193 3.83e-11 65.5
MsG0580027827.01.T01 AT4G35470 30.153 262 147 11 397 654 270 499 3.95e-11 67.4
MsG0580027827.01.T01 AT5G06820 33.136 169 110 2 254 422 71 236 4.20e-11 67.4
MsG0580027827.01.T01 AT5G43020 35.294 119 75 1 769 887 122 238 5.02e-11 67.0
MsG0580027827.01.T01 AT4G35470 30.153 262 147 11 397 654 270 499 5.03e-11 67.0
MsG0580027827.01.T01 AT5G41180 30.000 190 119 3 235 416 48 231 5.88e-11 67.0
MsG0580027827.01.T01 AT3G17840 33.775 151 72 3 246 368 56 206 8.57e-11 66.2
MsG0580027827.01.T01 AT3G19230 38.202 89 54 1 256 344 401 488 9.72e-11 65.9

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sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TCTCATCTCAAAATAGATTT+TGG 0.067828 5:+69227627 None:intergenic
GAAAACCACAATGGCTAATT+TGG 0.141144 5:-69226697 MsG0580027827.01.T01:CDS
TGTTCCATTTAGTAAATTAT+TGG 0.153406 5:+69228428 None:intergenic
GGTTACATTGTATTCTTAAT+TGG 0.174618 5:-69226719 MsG0580027827.01.T01:CDS
GTCTTAATGTTTCCTTCATT+TGG 0.175992 5:-69229397 MsG0580027827.01.T01:CDS
CTTTGTTGGTTTGGAAAATC+TGG 0.191893 5:-69227062 MsG0580027827.01.T01:CDS
TTAGTTTCGCTTGATCTTTC+GGG 0.192236 5:-69229047 MsG0580027827.01.T01:CDS
GTGAACTTTCAAAATTTAAT+TGG 0.196237 5:-69228767 MsG0580027827.01.T01:CDS
TTGTCCAATAATTTACTAAA+TGG 0.211822 5:-69228432 MsG0580027827.01.T01:CDS
AACAGGGCCAACCAATTTAT+TGG 0.215363 5:+69228497 None:intergenic
CTTTCATTGTGTAAGCTAAA+AGG 0.228973 5:+69228132 None:intergenic
TCTGTTGCGGTCACAATAAA+AGG 0.231967 5:-69227244 MsG0580027827.01.T01:CDS
GAAATTGAAGATTGGGTAAA+TGG 0.240778 5:+69228820 None:intergenic
CTAACTCAACTTGAATCTTT+AGG 0.250423 5:-69228528 MsG0580027827.01.T01:CDS
TTTACAAAATCTTTCAGTTT+TGG 0.254803 5:-69227683 MsG0580027827.01.T01:CDS
TCCTTCATGGGCTTCTTCAT+TGG 0.260900 5:-69229477 MsG0580027827.01.T01:CDS
TCCACAATCCTTTGTTGGTT+TGG 0.264616 5:-69227071 MsG0580027827.01.T01:CDS
GGAGAGATTCCAACTATAAT+TGG 0.265685 5:-69227151 MsG0580027827.01.T01:CDS
ATTAGTTTCGCTTGATCTTT+CGG 0.274413 5:-69229048 MsG0580027827.01.T01:CDS
TTTCAGAATGATTCCTATAA+GGG 0.276425 5:-69226902 MsG0580027827.01.T01:CDS
TAGCCCTGGATTTCCCTTAT+AGG 0.276490 5:+69226889 None:intergenic
TCAAATGAACTTGAATCTTT+TGG 0.281260 5:+69226821 None:intergenic
CAACTAACTTCTTTGTATCT+TGG 0.281529 5:-69228666 MsG0580027827.01.T01:CDS
CTAAGCTTACCAAATGAATC+AGG 0.286943 5:+69228618 None:intergenic
AGGTTGTTCATCCAATAAAT+TGG 0.287144 5:-69228508 MsG0580027827.01.T01:CDS
TTCATATCAAACATTGAGTT+TGG 0.294271 5:+69228264 None:intergenic
CATAACCATCTTACATCAAC+TGG 0.296287 5:-69227922 MsG0580027827.01.T01:CDS
TATGCTAGTGGAATGGTATT+TGG 0.297596 5:-69226752 MsG0580027827.01.T01:CDS
ATTTCAGAATGATTCCTATA+AGG 0.298804 5:-69226903 MsG0580027827.01.T01:CDS
TTGGAACCCTTCCATTGATT+TGG 0.302860 5:+69227995 None:intergenic
CTCGGTGGAAACCAACTTAC+AGG 0.314603 5:-69228360 MsG0580027827.01.T01:CDS
TTGTTGATCTGTCTCGAAAT+AGG 0.320063 5:-69228302 MsG0580027827.01.T01:CDS
TCTTAATGTTTCCTTCATTT+GGG 0.321995 5:-69229396 MsG0580027827.01.T01:CDS
CCAACAAAGGATTGTGGAAT+AGG 0.337198 5:+69227076 None:intergenic
CAATTGCCATCGGCATTGTT+TGG 0.338711 5:-69228552 MsG0580027827.01.T01:CDS
ATGGTATTTGGAATACTATT+GGG 0.343062 5:-69226740 MsG0580027827.01.T01:CDS
CTCACCTGTGAGTTTGTTTG+AGG 0.353054 5:+69227024 None:intergenic
GAGCACTTCTCTCGTGCAAT+TGG 0.361734 5:-69228745 MsG0580027827.01.T01:CDS
TTAGAGAGTATTAATTTCAA+TGG 0.363996 5:-69227601 MsG0580027827.01.T01:CDS
GAAATTCCAGTTCCACCATT+TGG 0.366390 5:-69227841 MsG0580027827.01.T01:CDS
CCTATTCCACAATCCTTTGT+TGG 0.369184 5:-69227076 MsG0580027827.01.T01:CDS
GGTAAAGCTCCTGCAGATTT+CGG 0.371053 5:+69228175 None:intergenic
GTGAGTTGTGACACAGATTC+AGG 0.374163 5:-69229299 MsG0580027827.01.T01:CDS
AATGGTATTTGGAATACTAT+TGG 0.380208 5:-69226741 MsG0580027827.01.T01:CDS
CTTTCTAGAAACCAACTTGT+AGG 0.381643 5:-69228576 MsG0580027827.01.T01:CDS
TTCAATGGAAATCAATTAAA+CGG 0.384160 5:-69227586 MsG0580027827.01.T01:CDS
AAAACAAGGACTTGCAATTC+TGG 0.386731 5:+69227463 None:intergenic
TTATCTTCGTCAAGATTTCA+AGG 0.387864 5:-69229104 MsG0580027827.01.T01:CDS
TAAGTGCCAAATGGTGGAAC+TGG 0.389526 5:+69227835 None:intergenic
GGATGGAAAGCTGTGGCTAT+TGG 0.390814 5:-69226776 MsG0580027827.01.T01:CDS
TTTCATTGTGTAAGCTAAAA+GGG 0.392439 5:+69228133 None:intergenic
AGATGGAAGAGAGTGCTATT+AGG 0.394944 5:+69229224 None:intergenic
CAAGATACAAAGAAGTTAGT+TGG 0.396479 5:+69228667 None:intergenic
TTGGCCTCGACCTTACTTGC+GGG 0.405593 5:-69229268 MsG0580027827.01.T01:CDS
CAAACAATGCCGATGGCAAT+TGG 0.410551 5:+69228553 None:intergenic
CTTGGATGGAACAACTTTAG+AGG 0.410574 5:-69228648 MsG0580027827.01.T01:CDS
GTACAAAAGAACAACCTTGC+TGG 0.411363 5:-69227658 MsG0580027827.01.T01:CDS
CTGTCGAACACTTCTTTGTC+AGG 0.417935 5:-69228720 MsG0580027827.01.T01:CDS
AGTGTAAGAAATTGAAGATT+GGG 0.418817 5:+69228813 None:intergenic
CAGTGAAGTTGTTGTGAGAC+AGG 0.419294 5:+69227731 None:intergenic
ATTTGTTATCATCTAGACTA+AGG 0.420800 5:+69228871 None:intergenic
TTCAGCTGTCCAATTATAGT+TGG 0.425470 5:+69227142 None:intergenic
GGTGAGATCCCTGATTCATT+TGG 0.425515 5:-69228627 MsG0580027827.01.T01:CDS
TTATCAAACAATAAATTTGA+AGG 0.432693 5:-69227172 MsG0580027827.01.T01:CDS
TTGAGGGCTCATTTCCTAGT+TGG 0.433466 5:-69227498 MsG0580027827.01.T01:CDS
AGTAAATTATTCAGCCTCTC+TGG 0.436802 5:-69228898 MsG0580027827.01.T01:CDS
TAATACAGAGGAAGAGGAAG+AGG 0.441803 5:-69226652 MsG0580027827.01.T01:CDS
TTTAACTCATTGAGGAAGCT+TGG 0.442117 5:+69228048 None:intergenic
CGGTACAAATTGCTACTTGT+GGG 0.442543 5:-69229327 MsG0580027827.01.T01:CDS
GATTCCTATAAGGGAAATCC+AGG 0.442844 5:-69226893 MsG0580027827.01.T01:CDS
ATGATAAACTTAATCGAAGA+AGG 0.446172 5:+69228091 None:intergenic
CTTACTTGCGGGTCACTTCA+AGG 0.447728 5:-69229257 MsG0580027827.01.T01:CDS
TGGTTTAATAATGTGGGAAA+TGG 0.450663 5:-69227970 MsG0580027827.01.T01:CDS
TAACTTCTTTGTATCTTGGA+TGG 0.453307 5:-69228662 MsG0580027827.01.T01:CDS
CACCAATTGGCCCTGTAAGT+TGG 0.454942 5:+69228349 None:intergenic
CACTCAAGTTATTTGATGAT+AGG 0.458748 5:+69228223 None:intergenic
TTGGTATGCCTCCCTCCAGC+TGG 0.458968 5:+69226945 None:intergenic
AACCAACTTACAGGGCCAAT+TGG 0.459535 5:-69228351 MsG0580027827.01.T01:CDS
AAGATACAAAGAAGTTAGTT+GGG 0.459723 5:+69228668 None:intergenic
TTCAAAGCTCCGAAATCTGC+AGG 0.461281 5:-69228184 MsG0580027827.01.T01:CDS
GGCAAGCTTCCACACTGCCT+TGG 0.463883 5:-69227709 MsG0580027827.01.T01:CDS
CCTCTTCCTCTGTATTAGAC+TGG 0.464905 5:+69226658 None:intergenic
AAACTTAATCGAAGAAGGTT+GGG 0.468274 5:+69228096 None:intergenic
AAAGGAATGGTGAGGGTGAA+TGG 0.468857 5:-69227310 MsG0580027827.01.T01:CDS
TAGTGTAAGAAATTGAAGAT+TGG 0.471687 5:+69228812 None:intergenic
CTATCTTACAACCAAATCAA+TGG 0.472726 5:-69228006 MsG0580027827.01.T01:CDS
CTTGAAGTGACCCGCAAGTA+AGG 0.473232 5:+69229258 None:intergenic
CCAGTCTAATACAGAGGAAG+AGG 0.475364 5:-69226658 MsG0580027827.01.T01:CDS
TCCAAGCTGGTTTAATAATG+TGG 0.475446 5:-69227977 MsG0580027827.01.T01:CDS
ACAGATTCAGGCTACGTGAT+TGG 0.476328 5:-69229287 MsG0580027827.01.T01:CDS
CCTCCAGCTGGTTCAATGAG+AGG 0.476588 5:+69226957 None:intergenic
CCCACATTATTAAACCAGCT+TGG 0.477876 5:+69227976 None:intergenic
TAAAGATTGGTCAATGCCTC+AGG 0.479159 5:+69226998 None:intergenic
TTTGTCCTTGGATAGTAAGC+AGG 0.483844 5:+69229362 None:intergenic
GATTCCCAGTTGATGTAAGA+TGG 0.487672 5:+69227917 None:intergenic
CCACACATTTCCTAAGTTGA+GGG 0.489707 5:-69227395 MsG0580027827.01.T01:CDS
TAAACTTAATCGAAGAAGGT+TGG 0.489955 5:+69228095 None:intergenic
GGATAAGATTAATTTGAGAA+AGG 0.494936 5:+69228154 None:intergenic
ATCTCAAATAACAAGTTCAC+TGG 0.495179 5:-69227802 MsG0580027827.01.T01:CDS
CTGTGAGTTTGTTTGAGGAG+AGG 0.496798 5:+69227029 None:intergenic
TTGCATGCTAATAGGTTCAA+AGG 0.499175 5:-69227442 MsG0580027827.01.T01:CDS
TGATCTAAGCTTTAACATGT+TGG 0.499868 5:-69227869 MsG0580027827.01.T01:CDS
CTCACATTCCTCCCAAATGA+AGG 0.502626 5:+69229385 None:intergenic
CTGTCTCGAAATAGGCTACA+TGG 0.502977 5:-69228294 MsG0580027827.01.T01:CDS
GGAAGAGACTCTAGCCAACT+AGG 0.503915 5:+69227484 None:intergenic
ACCACACATTTCCTAAGTTG+AGG 0.503930 5:-69227396 MsG0580027827.01.T01:CDS
CTGTCTCACAACAACTTCAC+TGG 0.506162 5:-69227730 MsG0580027827.01.T01:CDS
GGTTCAATTATGAGCTAAAG+AGG 0.506922 5:-69227222 MsG0580027827.01.T01:CDS
ATGTAAGATGGTTATGAGAA+AGG 0.508427 5:+69227929 None:intergenic
TGTTCATCCAATAAATTGGT+TGG 0.511868 5:-69228504 MsG0580027827.01.T01:CDS
CTTGAATTCAAGCAAGGCAG+AGG 0.514293 5:+69229430 None:intergenic
TACAGAAAGAGAGTAAAGAT+TGG 0.514766 5:+69226985 None:intergenic
GAAAAGAAATAAGTGCCAAA+TGG 0.520182 5:+69227826 None:intergenic
TAAGCAGAGAATTCACCAAT+TGG 0.521208 5:+69228336 None:intergenic
CTTGGAGAAAATAACATTGA+GGG 0.525427 5:-69227514 MsG0580027827.01.T01:CDS
CCAAGCTGGTTTAATAATGT+GGG 0.526635 5:-69227976 MsG0580027827.01.T01:CDS
ATGGCAATTGGCCTACAAGT+TGG 0.527011 5:+69228565 None:intergenic
CTTTCATGTAATAAAATCAC+TGG 0.528737 5:-69227100 MsG0580027827.01.T01:CDS
ACTATCCAAGGACAAAATCA+TGG 0.528790 5:-69229355 MsG0580027827.01.T01:CDS
TCAATGGAAGGGTTCCAAGC+TGG 0.529308 5:-69227990 MsG0580027827.01.T01:CDS
AAAGGCAGGCCACATAGCCC+TGG 0.530260 5:+69226875 None:intergenic
ACTAACAAAGACAGAGTGCT+TGG 0.535208 5:+69228918 None:intergenic
TCCAAACCAACAAAGGATTG+TGG 0.536167 5:+69227070 None:intergenic
TTTGGAAAATCTGGAATGGT+TGG 0.537468 5:-69227053 MsG0580027827.01.T01:CDS
CTGTTGCGGTCACAATAAAA+GGG 0.538315 5:-69227243 MsG0580027827.01.T01:CDS
TTGGCAATAACATGAGGTAA+TGG 0.539020 5:+69227562 None:intergenic
GGTGAATGGCAATGATGGTT+CGG 0.541722 5:-69227296 MsG0580027827.01.T01:CDS
CTAAGCTTTAACATGTTGGA+AGG 0.543041 5:-69227865 MsG0580027827.01.T01:CDS
AAACCTCTCATTGAACCAGC+TGG 0.543158 5:-69226960 MsG0580027827.01.T01:CDS
CTAGATGATAACAAATTGCA+AGG 0.544852 5:-69228864 MsG0580027827.01.T01:CDS
CAACTTAGGAAATGTGTGGT+TGG 0.546101 5:+69227399 None:intergenic
TAATCGAAGAAGGTTGGGTA+AGG 0.553449 5:+69228101 None:intergenic
AAGTTTCGCGCAAATAAAAG+AGG 0.555062 5:-69226620 MsG0580027827.01.T01:CDS
TTTGTTATCATCTAGACTAA+GGG 0.555120 5:+69228872 None:intergenic
CCTGTTCCAAATAAAATTAG+CGG 0.556113 5:-69228480 MsG0580027827.01.T01:CDS
TTGGTTTGGAAAATCTGGAA+TGG 0.556276 5:-69227057 MsG0580027827.01.T01:CDS
GTATTGAACTGCTTCCCACT+TGG 0.557466 5:+69226926 None:intergenic
GTGAGGGTGAATGGCAATGA+TGG 0.557833 5:-69227301 MsG0580027827.01.T01:CDS
CTTACAACCAAATCAATGGA+AGG 0.557887 5:-69228002 MsG0580027827.01.T01:CDS
TCATTATCAGTGTTATATCT+CGG 0.560099 5:-69228378 MsG0580027827.01.T01:CDS
TACAGAGGAAGAGGAAGAGG+AGG 0.561525 5:-69226649 MsG0580027827.01.T01:CDS
CTCTCCTCAAACAAACTCAC+AGG 0.563212 5:-69227028 MsG0580027827.01.T01:CDS
TAATGTTTCCTTCATTTGGG+AGG 0.563679 5:-69229393 MsG0580027827.01.T01:CDS
AGAATTCTTGAATTCAAGCA+AGG 0.564759 5:+69229424 None:intergenic
ACAAACCAAATTAGCCATTG+TGG 0.565984 5:+69226692 None:intergenic
ATTGGCCTCGACCTTACTTG+CGG 0.568052 5:-69229269 MsG0580027827.01.T01:CDS
TGTTCTTCATCCTTGTGACA+TGG 0.568192 5:+69226845 None:intergenic
AAGAAATAAGTGCCAAATGG+TGG 0.570462 5:+69227829 None:intergenic
ACCTATTAGCATGCAAAACA+AGG 0.577808 5:+69227449 None:intergenic
CTCTCATTGAACCAGCTGGA+GGG 0.583303 5:-69226956 MsG0580027827.01.T01:CDS
AAGGGAAATCCAGGGCTATG+TGG 0.585787 5:-69226884 MsG0580027827.01.T01:CDS
TTGCATTTGGCAATAACATG+AGG 0.586738 5:+69227556 None:intergenic
AATCTCTCACATATGAACAT+TGG 0.592605 5:-69227898 MsG0580027827.01.T01:CDS
ACGGTACAAATTGCTACTTG+TGG 0.593732 5:-69229328 MsG0580027827.01.T01:CDS
ACAAATTGCTACTTGTGGGA+TGG 0.594751 5:-69229323 MsG0580027827.01.T01:CDS
ACCAATGAAGAAGCCCATGA+AGG 0.595903 5:+69229476 None:intergenic
ATATTACTATGATTCTGTTG+CGG 0.596689 5:-69227257 MsG0580027827.01.T01:CDS
TCTTGGAGAAAATAACATTG+AGG 0.597124 5:-69227515 MsG0580027827.01.T01:CDS
GTGACCCGCAAGTAAGGTCG+AGG 0.597874 5:+69229264 None:intergenic
TAGTTTCGCTTGATCTTTCG+GGG 0.598695 5:-69229046 MsG0580027827.01.T01:CDS
AAAACTTTAAAGGAATGGTG+AGG 0.598827 5:-69227318 MsG0580027827.01.T01:CDS
GTGGCTATTGGATATGCTAG+TGG 0.601788 5:-69226764 MsG0580027827.01.T01:CDS
ACTTGTAGGCCAATTGCCAT+CGG 0.604006 5:-69228562 MsG0580027827.01.T01:CDS
GAATCATCATGGTTGCATAA+CGG 0.604299 5:+69229452 None:intergenic
GTGAGCCTGCTTACTATCCA+AGG 0.604929 5:-69229367 MsG0580027827.01.T01:CDS
GACAAAGAATAACACCATTG+TGG 0.606398 5:+69228402 None:intergenic
CCTCTCATTGAACCAGCTGG+AGG 0.614572 5:-69226957 MsG0580027827.01.T01:CDS
TCGGTGGAAACCAACTTACA+GGG 0.618132 5:-69228359 MsG0580027827.01.T01:CDS
AAACTTTAAAGGAATGGTGA+GGG 0.624760 5:-69227317 MsG0580027827.01.T01:CDS
TCATTGAACCAGCTGGAGGG+AGG 0.628673 5:-69226953 MsG0580027827.01.T01:CDS
TAAGCTTACCAAATGAATCA+GGG 0.629170 5:+69228619 None:intergenic
TGCAGAAGATAATTGAGACA+TGG 0.630622 5:+69229160 None:intergenic
CCCTCAACTTAGGAAATGTG+TGG 0.631175 5:+69227395 None:intergenic
GGACAGCTGAAGTCACTCAA+AGG 0.634943 5:-69227130 MsG0580027827.01.T01:CDS
TTACAACCAAATCAATGGAA+GGG 0.635493 5:-69228001 MsG0580027827.01.T01:CDS
TTTATTTGGATGGAAAGCTG+TGG 0.638074 5:-69226783 MsG0580027827.01.T01:CDS
TAGATGATAACAAATTGCAA+GGG 0.640522 5:-69228863 MsG0580027827.01.T01:CDS
TCTTAATTGGAAAACCACAA+TGG 0.650258 5:-69226706 MsG0580027827.01.T01:CDS
ACATTGCCAGTCTAATACAG+AGG 0.653577 5:-69226664 MsG0580027827.01.T01:CDS
GCAAGGCAGAGGAATCATCA+TGG 0.656210 5:+69229441 None:intergenic
GTTAGACCAAACAATGCCGA+TGG 0.660195 5:+69228546 None:intergenic
CTGGAGGGAGGCATACCAAG+TGG 0.660314 5:-69226941 MsG0580027827.01.T01:CDS
TGGAGGGAGGCATACCAAGT+GGG 0.661630 5:-69226940 MsG0580027827.01.T01:CDS
ATAACCATCTTACATCAACT+GGG 0.662407 5:-69227921 MsG0580027827.01.T01:CDS
TATTGGATATGCTAGTGGAA+TGG 0.666860 5:-69226759 MsG0580027827.01.T01:CDS
TTTGTCAAAACCATGTCACA+AGG 0.670354 5:-69226855 MsG0580027827.01.T01:CDS
GAGACAGGTTGAGTAACTCG+AGG 0.673518 5:+69227746 None:intergenic
TAAATGGAACAATTCCACAA+TGG 0.674172 5:-69228416 MsG0580027827.01.T01:CDS
AGACAGGTTGAGTAACTCGA+GGG 0.679218 5:+69227747 None:intergenic
TGTAAAGTTCCAAGGCAGTG+TGG 0.684946 5:+69227700 None:intergenic
ATTCCTATAAGGGAAATCCA+GGG 0.686842 5:-69226892 MsG0580027827.01.T01:CDS
TAGACTAAGGGAGACCAGAG+AGG 0.695908 5:+69228884 None:intergenic
TTATCAGTGTTATATCTCGG+TGG 0.704490 5:-69228375 MsG0580027827.01.T01:CDS
ACTCACAGGTGAGATTCCTG+AGG 0.741175 5:-69227014 MsG0580027827.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TTATCAAACAATAAATTTGA+AGG - Chr5:69228944-69228963 MsG0580027827.01.T01:CDS 15.0%
!! ACATACATCAAAAACTTTAA+AGG - Chr5:69228788-69228807 MsG0580027827.01.T01:CDS 20.0%
!! GTGAACTTTCAAAATTTAAT+TGG - Chr5:69227349-69227368 MsG0580027827.01.T01:CDS 20.0%
!! TGTTCCATTTAGTAAATTAT+TGG + Chr5:69227691-69227710 None:intergenic 20.0%
!! TTCAATGGAAATCAATTAAA+CGG - Chr5:69228530-69228549 MsG0580027827.01.T01:CDS 20.0%
!! TTGTCCAATAATTTACTAAA+TGG - Chr5:69227684-69227703 MsG0580027827.01.T01:CDS 20.0%
!!! AAGAAGAATTTTTATTTGGA+TGG - Chr5:69229323-69229342 MsG0580027827.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATTTTTAATGAACTTTTCGA+AGG + Chr5:69227124-69227143 None:intergenic 20.0%
!!! CATGAAGAAGAATTTTTATT+TGG - Chr5:69229319-69229338 MsG0580027827.01.T01:CDS 20.0%
!!! TAAAAATACAACTGACTTAA+AGG - Chr5:69227137-69227156 MsG0580027827.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTAGAGAGTATTAATTTCAA+TGG - Chr5:69228515-69228534 MsG0580027827.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTACAAAATCTTTCAGTTT+TGG - Chr5:69228433-69228452 MsG0580027827.01.T01:CDS 20.0%
! AAGATACAAAGAAGTTAGTT+GGG + Chr5:69227451-69227470 None:intergenic 25.0%
! AGTGTAAGAAATTGAAGATT+GGG + Chr5:69227306-69227325 None:intergenic 25.0%
! ATATTACTATGATTCTGTTG+CGG - Chr5:69228859-69228878 MsG0580027827.01.T01:CDS 25.0%
! ATGATAAACTTAATCGAAGA+AGG + Chr5:69228028-69228047 None:intergenic 25.0%
! ATTTCAGAATGATTCCTATA+AGG - Chr5:69229213-69229232 MsG0580027827.01.T01:CDS 25.0%
! CTTTCATGTAATAAAATCAC+TGG - Chr5:69229016-69229035 MsG0580027827.01.T01:CDS 25.0%
! GGTTACATTGTATTCTTAAT+TGG - Chr5:69229397-69229416 MsG0580027827.01.T01:CDS 25.0%
! TAGATGATAACAAATTGCAA+GGG - Chr5:69227253-69227272 MsG0580027827.01.T01:CDS 25.0%
! TAGTGTAAGAAATTGAAGAT+TGG + Chr5:69227307-69227326 None:intergenic 25.0%
! TCATTATCAGTGTTATATCT+CGG - Chr5:69227738-69227757 MsG0580027827.01.T01:CDS 25.0%
! TCTTAATGTTTCCTTCATTT+GGG - Chr5:69226720-69226739 MsG0580027827.01.T01:CDS 25.0%
! TTCATATCAAACATTGAGTT+TGG + Chr5:69227855-69227874 None:intergenic 25.0%
! TTTCAGAATGATTCCTATAA+GGG - Chr5:69229214-69229233 MsG0580027827.01.T01:CDS 25.0%
! TTTCATTGTGTAAGCTAAAA+GGG + Chr5:69227986-69228005 None:intergenic 25.0%
! TTTGATATGAAAAATCTGAC+TGG - Chr5:69227864-69227883 MsG0580027827.01.T01:CDS 25.0%
!! AAAGATTTTGTAAAGTTCCA+AGG + Chr5:69228427-69228446 None:intergenic 25.0%
!! AAGTTTTTGATGTATGTTGT+TGG + Chr5:69228785-69228804 None:intergenic 25.0%
!! AATGGTATTTGGAATACTAT+TGG - Chr5:69229375-69229394 MsG0580027827.01.T01:CDS 25.0%
!! ATGGTATTTGGAATACTATT+GGG - Chr5:69229376-69229395 MsG0580027827.01.T01:CDS 25.0%
!! CAGTGATTTTATTACATGAA+AGG + Chr5:69229018-69229037 None:intergenic 25.0%
!! CATCAAAAACTTTAAAGGAA+TGG - Chr5:69228793-69228812 MsG0580027827.01.T01:CDS 25.0%
!! CTCATCTCAAAATAGATTTT+GGG + Chr5:69228491-69228510 None:intergenic 25.0%
!! GGATAAGATTAATTTGAGAA+AGG + Chr5:69227965-69227984 None:intergenic 25.0%
!! TCAAATGAACTTGAATCTTT+TGG + Chr5:69229298-69229317 None:intergenic 25.0%
!! TCTCATCTCAAAATAGATTT+TGG + Chr5:69228492-69228511 None:intergenic 25.0%
!! TTTGTTATCATCTAGACTAA+GGG + Chr5:69227247-69227266 None:intergenic 25.0%
!!! AGTGCCACTAAAATTATTTT+TGG + Chr5:69228759-69228778 None:intergenic 25.0%
!!! ATTTGTTATCATCTAGACTA+AGG + Chr5:69227248-69227267 None:intergenic 25.0%
!!! CGAAACTAATTTTGATAAAC+GGG + Chr5:69227058-69227077 None:intergenic 25.0%
!!! GCGAAACTAATTTTGATAAA+CGG + Chr5:69227059-69227078 None:intergenic 25.0%
!!! TCTTTTTGTTTTTCCTTCAT+GGG - Chr5:69226627-69226646 MsG0580027827.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTCTTTTTGTTTTTCCTTCA+TGG - Chr5:69226626-69226645 MsG0580027827.01.T01:CDS 25.0%
AAACTTAATCGAAGAAGGTT+GGG + Chr5:69228023-69228042 None:intergenic 30.0%
AATCTCTCACATATGAACAT+TGG - Chr5:69228218-69228237 MsG0580027827.01.T01:CDS 30.0%
AGAATTCTTGAATTCAAGCA+AGG + Chr5:69226695-69226714 None:intergenic 30.0%
AGGACAAAATCATGGAAAAA+CGG - Chr5:69226769-69226788 MsG0580027827.01.T01:CDS 30.0%
AGGTTGTTCATCCAATAAAT+TGG - Chr5:69227608-69227627 MsG0580027827.01.T01:CDS 30.0%
ATAACCATCTTACATCAACT+GGG - Chr5:69228195-69228214 MsG0580027827.01.T01:CDS 30.0%
ATCTCAAATAACAAGTTCAC+TGG - Chr5:69228314-69228333 MsG0580027827.01.T01:CDS 30.0%
ATGTAAGATGGTTATGAGAA+AGG + Chr5:69228190-69228209 None:intergenic 30.0%
CAACTAACTTCTTTGTATCT+TGG - Chr5:69227450-69227469 MsG0580027827.01.T01:CDS 30.0%
CAAGATACAAAGAAGTTAGT+TGG + Chr5:69227452-69227471 None:intergenic 30.0%
CCTGTTCCAAATAAAATTAG+CGG - Chr5:69227636-69227655 MsG0580027827.01.T01:CDS 30.0%
CTAACTCAACTTGAATCTTT+AGG - Chr5:69227588-69227607 MsG0580027827.01.T01:CDS 30.0%
CTAGATGATAACAAATTGCA+AGG - Chr5:69227252-69227271 MsG0580027827.01.T01:CDS 30.0%
CTATCTTACAACCAAATCAA+TGG - Chr5:69228110-69228129 MsG0580027827.01.T01:CDS 30.0%
CTTGGAGAAAATAACATTGA+GGG - Chr5:69228602-69228621 MsG0580027827.01.T01:CDS 30.0%
CTTTCATTGTGTAAGCTAAA+AGG + Chr5:69227987-69228006 None:intergenic 30.0%
GAAAAGAAATAAGTGCCAAA+TGG + Chr5:69228293-69228312 None:intergenic 30.0%
GAAATTGAAGATTGGGTAAA+TGG + Chr5:69227299-69227318 None:intergenic 30.0%
GTCTTAATGTTTCCTTCATT+TGG - Chr5:69226719-69226738 MsG0580027827.01.T01:CDS 30.0%
TAAACTTAATCGAAGAAGGT+TGG + Chr5:69228024-69228043 None:intergenic 30.0%
TAAATGGAACAATTCCACAA+TGG - Chr5:69227700-69227719 MsG0580027827.01.T01:CDS 30.0%
TAACTTCTTTGTATCTTGGA+TGG - Chr5:69227454-69227473 MsG0580027827.01.T01:CDS 30.0%
TAAGCTTACCAAATGAATCA+GGG + Chr5:69227500-69227519 None:intergenic 30.0%
TACAGAAAGAGAGTAAAGAT+TGG + Chr5:69229134-69229153 None:intergenic 30.0%
TATGAAAAATCTGACTGGAT+TGG - Chr5:69227869-69227888 MsG0580027827.01.T01:CDS 30.0%
TATTGCCAAATGCAAAAAAC+TGG - Chr5:69228568-69228587 MsG0580027827.01.T01:CDS 30.0%
TCTTAATTGGAAAACCACAA+TGG - Chr5:69229410-69229429 MsG0580027827.01.T01:CDS 30.0%
TCTTGGAGAAAATAACATTG+AGG - Chr5:69228601-69228620 MsG0580027827.01.T01:CDS 30.0%
TGGAAAAATCATTGAAAGCT+AGG + Chr5:69226939-69226958 None:intergenic 30.0%
TGGTTTAATAATGTGGGAAA+TGG - Chr5:69228146-69228165 MsG0580027827.01.T01:CDS 30.0%
TGTTCATCCAATAAATTGGT+TGG - Chr5:69227612-69227631 MsG0580027827.01.T01:CDS 30.0%
TTACAACCAAATCAATGGAA+GGG - Chr5:69228115-69228134 MsG0580027827.01.T01:CDS 30.0%
TTATCTTCGTCAAGATTTCA+AGG - Chr5:69227012-69227031 MsG0580027827.01.T01:CDS 30.0%
! AAAACTTTAAAGGAATGGTG+AGG - Chr5:69228798-69228817 MsG0580027827.01.T01:CDS 30.0%
! AAACTTTAAAGGAATGGTGA+GGG - Chr5:69228799-69228818 MsG0580027827.01.T01:CDS 30.0%
! ATGCAAAAAACTGGAAGTTT+TGG - Chr5:69228577-69228596 MsG0580027827.01.T01:CDS 30.0%
! ATTAGTTTCGCTTGATCTTT+CGG - Chr5:69227068-69227087 MsG0580027827.01.T01:CDS 30.0%
! CACTCAAGTTATTTGATGAT+AGG + Chr5:69227896-69227915 None:intergenic 30.0%
! GTCGCCAAAAATAATTTTAG+TGG - Chr5:69228752-69228771 MsG0580027827.01.T01:CDS 30.0%
! TGATCTAAGCTTTAACATGT+TGG - Chr5:69228247-69228266 MsG0580027827.01.T01:CDS 30.0%
! TTTTTCCATGATTTTGTCCT+TGG + Chr5:69226769-69226788 None:intergenic 30.0%
!! CAAGAGTTTTTAACTCATTG+AGG + Chr5:69228079-69228098 None:intergenic 30.0%
!! CGCTAATTTTATTTGGAACA+GGG + Chr5:69227638-69227657 None:intergenic 30.0%
!! GTTTTTGAAGATGATGAAGA+TGG + Chr5:69226912-69226931 None:intergenic 30.0%
!! TTTTATTTGCGCGAAACTTT+TGG + Chr5:69229495-69229514 None:intergenic 30.0%
!!! AACTTCCAGTTTTTTGCATT+TGG + Chr5:69228576-69228595 None:intergenic 30.0%
!!! TTTTGATAAACGGGAGTATT+TGG + Chr5:69227049-69227068 None:intergenic 30.0%
AAAACAAGGACTTGCAATTC+TGG + Chr5:69228656-69228675 None:intergenic 35.0%
AAGAAATAAGTGCCAAATGG+TGG + Chr5:69228290-69228309 None:intergenic 35.0%
AAGTTTCGCGCAAATAAAAG+AGG - Chr5:69229496-69229515 MsG0580027827.01.T01:CDS 35.0%
ACAAACCAAATTAGCCATTG+TGG + Chr5:69229427-69229446 None:intergenic 35.0%
ACATCAAAAACCCTCAACTT+AGG + Chr5:69228734-69228753 None:intergenic 35.0%
ACCTATTAGCATGCAAAACA+AGG + Chr5:69228670-69228689 None:intergenic 35.0%
ACTATCCAAGGACAAAATCA+TGG - Chr5:69226761-69226780 MsG0580027827.01.T01:CDS 35.0%
AGTAAATTATTCAGCCTCTC+TGG - Chr5:69227218-69227237 MsG0580027827.01.T01:CDS 35.0%
ATTCCTATAAGGGAAATCCA+GGG - Chr5:69229224-69229243 MsG0580027827.01.T01:CDS 35.0%
CATAACCATCTTACATCAAC+TGG - Chr5:69228194-69228213 MsG0580027827.01.T01:CDS 35.0%
CTAAGCTTACCAAATGAATC+AGG + Chr5:69227501-69227520 None:intergenic 35.0%
CTTACAACCAAATCAATGGA+AGG - Chr5:69228114-69228133 MsG0580027827.01.T01:CDS 35.0%
GAAAACCACAATGGCTAATT+TGG - Chr5:69229419-69229438 MsG0580027827.01.T01:CDS 35.0%
GAATCATCATGGTTGCATAA+CGG + Chr5:69226667-69226686 None:intergenic 35.0%
GACAAAGAATAACACCATTG+TGG + Chr5:69227717-69227736 None:intergenic 35.0%
GGAGAGATTCCAACTATAAT+TGG - Chr5:69228965-69228984 MsG0580027827.01.T01:CDS 35.0%
GGTTCAATTATGAGCTAAAG+AGG - Chr5:69228894-69228913 MsG0580027827.01.T01:CDS 35.0%
TAAGCAGAGAATTCACCAAT+TGG + Chr5:69227783-69227802 None:intergenic 35.0%
TAATGTTTCCTTCATTTGGG+AGG - Chr5:69226723-69226742 MsG0580027827.01.T01:CDS 35.0%
TATGCTAGTGGAATGGTATT+TGG - Chr5:69229364-69229383 MsG0580027827.01.T01:CDS 35.0%
TATTGGATATGCTAGTGGAA+TGG - Chr5:69229357-69229376 MsG0580027827.01.T01:CDS 35.0%
TGCAGAAGATAATTGAGACA+TGG + Chr5:69226959-69226978 None:intergenic 35.0%
TTAGTTTCGCTTGATCTTTC+GGG - Chr5:69227069-69227088 MsG0580027827.01.T01:CDS 35.0%
TTATCAGTGTTATATCTCGG+TGG - Chr5:69227741-69227760 MsG0580027827.01.T01:CDS 35.0%
TTCAGCTGTCCAATTATAGT+TGG + Chr5:69228977-69228996 None:intergenic 35.0%
TTGCATGCTAATAGGTTCAA+AGG - Chr5:69228674-69228693 MsG0580027827.01.T01:CDS 35.0%
TTGCATTTGGCAATAACATG+AGG + Chr5:69228563-69228582 None:intergenic 35.0%
TTGGCAATAACATGAGGTAA+TGG + Chr5:69228557-69228576 None:intergenic 35.0%
TTGTTGATCTGTCTCGAAAT+AGG - Chr5:69227814-69227833 MsG0580027827.01.T01:CDS 35.0%
TTTAACTCATTGAGGAAGCT+TGG + Chr5:69228071-69228090 None:intergenic 35.0%
TTTATTTGGATGGAAAGCTG+TGG - Chr5:69229333-69229352 MsG0580027827.01.T01:CDS 35.0%
TTTGTCAAAACCATGTCACA+AGG - Chr5:69229261-69229280 MsG0580027827.01.T01:CDS 35.0%
! CAGATTTTCCAAACCAACAA+AGG + Chr5:69229056-69229075 None:intergenic 35.0%
! CCAAGCTGGTTTAATAATGT+GGG - Chr5:69228140-69228159 MsG0580027827.01.T01:CDS 35.0%
! CTAAGCTTTAACATGTTGGA+AGG - Chr5:69228251-69228270 MsG0580027827.01.T01:CDS 35.0%
! CTTTCTAGAAACCAACTTGT+AGG - Chr5:69227540-69227559 MsG0580027827.01.T01:CDS 35.0%
! GGAAGTCCGCTAATTTTATT+TGG + Chr5:69227645-69227664 None:intergenic 35.0%
! TCCAAGCTGGTTTAATAATG+TGG - Chr5:69228139-69228158 MsG0580027827.01.T01:CDS 35.0%
! TTTGGAAAATCTGGAATGGT+TGG - Chr5:69229063-69229082 MsG0580027827.01.T01:CDS 35.0%
!! CCGCTAATTTTATTTGGAAC+AGG + Chr5:69227639-69227658 None:intergenic 35.0%
!! CTTTGTTGGTTTGGAAAATC+TGG - Chr5:69229054-69229073 MsG0580027827.01.T01:CDS 35.0%
!! TTGGTTTGGAAAATCTGGAA+TGG - Chr5:69229059-69229078 MsG0580027827.01.T01:CDS 35.0%
!!! AAACTGGAAGTTTTGGATCT+TGG - Chr5:69228584-69228603 MsG0580027827.01.T01:CDS 35.0%
!!! TCCTTGTTTTGCATGCTAAT+AGG - Chr5:69228666-69228685 MsG0580027827.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTGTGACATGGTTTTGACAA+AGG + Chr5:69229262-69229281 None:intergenic 35.0%
AACAGGGCCAACCAATTTAT+TGG + Chr5:69227622-69227641 None:intergenic 40.0%
ACATTGCCAGTCTAATACAG+AGG - Chr5:69229452-69229471 MsG0580027827.01.T01:CDS 40.0%
ACCACACATTTCCTAAGTTG+AGG - Chr5:69228720-69228739 MsG0580027827.01.T01:CDS 40.0%
CAACTTAGGAAATGTGTGGT+TGG + Chr5:69228720-69228739 None:intergenic 40.0%
CCAACAAAGGATTGTGGAAT+AGG + Chr5:69229043-69229062 None:intergenic 40.0%
CCCACATTATTAAACCAGCT+TGG + Chr5:69228143-69228162 None:intergenic 40.0%
CCTATTCCACAATCCTTTGT+TGG - Chr5:69229040-69229059 MsG0580027827.01.T01:CDS 40.0%
CTGTTGCGGTCACAATAAAA+GGG - Chr5:69228873-69228892 MsG0580027827.01.T01:CDS 40.0%
CTTGGATGGAACAACTTTAG+AGG - Chr5:69227468-69227487 MsG0580027827.01.T01:CDS 40.0%
GAAATTCCAGTTCCACCATT+TGG - Chr5:69228275-69228294 MsG0580027827.01.T01:CDS 40.0%
GATTCCTATAAGGGAAATCC+AGG - Chr5:69229223-69229242 MsG0580027827.01.T01:CDS 40.0%
GTACAAAAGAACAACCTTGC+TGG - Chr5:69228458-69228477 MsG0580027827.01.T01:CDS 40.0%
GTTATGTTCCCCAAAAATGG+AGG + Chr5:69227429-69227448 None:intergenic 40.0%
TAATACAGAGGAAGAGGAAG+AGG - Chr5:69229464-69229483 MsG0580027827.01.T01:CDS 40.0%
TAATCGAAGAAGGTTGGGTA+AGG + Chr5:69228018-69228037 None:intergenic 40.0%
TAGTTTCGCTTGATCTTTCG+GGG - Chr5:69227070-69227089 MsG0580027827.01.T01:CDS 40.0%
TCCAAACCAACAAAGGATTG+TGG + Chr5:69229049-69229068 None:intergenic 40.0%
TCTGTTGCGGTCACAATAAA+AGG - Chr5:69228872-69228891 MsG0580027827.01.T01:CDS 40.0%
TGGGTTATGTTCCCCAAAAA+TGG + Chr5:69227432-69227451 None:intergenic 40.0%
TGTTCTTCATCCTTGTGACA+TGG + Chr5:69229274-69229293 None:intergenic 40.0%
TTTGTCCTTGGATAGTAAGC+AGG + Chr5:69226757-69226776 None:intergenic 40.0%
! ACAAATTGCTACTTGTGGGA+TGG - Chr5:69226793-69226812 MsG0580027827.01.T01:CDS 40.0%
! ACGGTACAAATTGCTACTTG+TGG - Chr5:69226788-69226807 MsG0580027827.01.T01:CDS 40.0%
! ACTAACAAAGACAGAGTGCT+TGG + Chr5:69227201-69227220 None:intergenic 40.0%
! AGGAGTCATTCCTCCATTTT+TGG - Chr5:69227416-69227435 MsG0580027827.01.T01:CDS 40.0%
! CCACACATTTCCTAAGTTGA+GGG - Chr5:69228721-69228740 MsG0580027827.01.T01:CDS 40.0%
! CGGTACAAATTGCTACTTGT+GGG - Chr5:69226789-69226808 MsG0580027827.01.T01:CDS 40.0%
! GATTCCCAGTTGATGTAAGA+TGG + Chr5:69228202-69228221 None:intergenic 40.0%
! TAAAGATTGGTCAATGCCTC+AGG + Chr5:69229121-69229140 None:intergenic 40.0%
! TCCACAATCCTTTGTTGGTT+TGG - Chr5:69229045-69229064 MsG0580027827.01.T01:CDS 40.0%
! TTGGAACCCTTCCATTGATT+TGG + Chr5:69228124-69228143 None:intergenic 40.0%
!! AGATGGAAGAGAGTGCTATT+AGG + Chr5:69226895-69226914 None:intergenic 40.0%
!! GAGTCATTCCTCCATTTTTG+GGG - Chr5:69227418-69227437 MsG0580027827.01.T01:CDS 40.0%
!! GGAGTCATTCCTCCATTTTT+GGG - Chr5:69227417-69227436 MsG0580027827.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTTGGGTATGATTCCAGCA+AGG + Chr5:69228475-69228494 None:intergenic 40.0%
!!! TGTGTGGTTGGTTTTCAAAC+TGG + Chr5:69228708-69228727 None:intergenic 40.0%
AAACCTCTCATTGAACCAGC+TGG - Chr5:69229156-69229175 MsG0580027827.01.T01:CDS 45.0%
AAAGGAATGGTGAGGGTGAA+TGG - Chr5:69228806-69228825 MsG0580027827.01.T01:CDS 45.0%
AACCAACTTACAGGGCCAAT+TGG - Chr5:69227765-69227784 MsG0580027827.01.T01:CDS 45.0%
ACAGATTCAGGCTACGTGAT+TGG - Chr5:69226829-69226848 MsG0580027827.01.T01:CDS 45.0%
ACCAATGAAGAAGCCCATGA+AGG + Chr5:69226643-69226662 None:intergenic 45.0%
ACTTGTAGGCCAATTGCCAT+CGG - Chr5:69227554-69227573 MsG0580027827.01.T01:CDS 45.0%
CAAACAATGCCGATGGCAAT+TGG + Chr5:69227566-69227585 None:intergenic 45.0%
CAATTGCCATCGGCATTGTT+TGG - Chr5:69227564-69227583 MsG0580027827.01.T01:CDS 45.0%
CAGTGAAGTTGTTGTGAGAC+AGG + Chr5:69228388-69228407 None:intergenic 45.0%
CCAGTCTAATACAGAGGAAG+AGG - Chr5:69229458-69229477 MsG0580027827.01.T01:CDS 45.0%
CCCTCAACTTAGGAAATGTG+TGG + Chr5:69228724-69228743 None:intergenic 45.0%
CCTCTTCCTCTGTATTAGAC+TGG + Chr5:69229461-69229480 None:intergenic 45.0%
CTCACATTCCTCCCAAATGA+AGG + Chr5:69226734-69226753 None:intergenic 45.0%
CTCTCCTCAAACAAACTCAC+AGG - Chr5:69229088-69229107 MsG0580027827.01.T01:CDS 45.0%
CTGTCGAACACTTCTTTGTC+AGG - Chr5:69227396-69227415 MsG0580027827.01.T01:CDS 45.0%
CTGTCTCACAACAACTTCAC+TGG - Chr5:69228386-69228405 MsG0580027827.01.T01:CDS 45.0%
CTGTCTCGAAATAGGCTACA+TGG - Chr5:69227822-69227841 MsG0580027827.01.T01:CDS 45.0%
CTTGAATTCAAGCAAGGCAG+AGG + Chr5:69226689-69226708 None:intergenic 45.0%
GGTAAAGCTCCTGCAGATTT+CGG + Chr5:69227944-69227963 None:intergenic 45.0%
GGTGAATGGCAATGATGGTT+CGG - Chr5:69228820-69228839 MsG0580027827.01.T01:CDS 45.0%
GGTGAGATCCCTGATTCATT+TGG - Chr5:69227489-69227508 MsG0580027827.01.T01:CDS 45.0%
GTATTGAACTGCTTCCCACT+TGG + Chr5:69229193-69229212 None:intergenic 45.0%
GTGAGTTGTGACACAGATTC+AGG - Chr5:69226817-69226836 MsG0580027827.01.T01:CDS 45.0%
GTGGCTATTGGATATGCTAG+TGG - Chr5:69229352-69229371 MsG0580027827.01.T01:CDS 45.0%
GTTAGACCAAACAATGCCGA+TGG + Chr5:69227573-69227592 None:intergenic 45.0%
TAGCCCTGGATTTCCCTTAT+AGG + Chr5:69229230-69229249 None:intergenic 45.0%
TCCTTCATGGGCTTCTTCAT+TGG - Chr5:69226639-69226658 MsG0580027827.01.T01:CDS 45.0%
TCGGTGGAAACCAACTTACA+GGG - Chr5:69227757-69227776 MsG0580027827.01.T01:CDS 45.0%
TGTAAAGTTCCAAGGCAGTG+TGG + Chr5:69228419-69228438 None:intergenic 45.0%
TTCAAAGCTCCGAAATCTGC+AGG - Chr5:69227932-69227951 MsG0580027827.01.T01:CDS 45.0%
TTGAGGGCTCATTTCCTAGT+TGG - Chr5:69228618-69228637 MsG0580027827.01.T01:CDS 45.0%
! AGACAGGTTGAGTAACTCGA+GGG + Chr5:69228372-69228391 None:intergenic 45.0%
! ATGGCAATTGGCCTACAAGT+TGG + Chr5:69227554-69227573 None:intergenic 45.0%
! CTCACCTGTGAGTTTGTTTG+AGG + Chr5:69229095-69229114 None:intergenic 45.0%
! CTGTGAGTTTGTTTGAGGAG+AGG + Chr5:69229090-69229109 None:intergenic 45.0%
! TAAGTGCCAAATGGTGGAAC+TGG + Chr5:69228284-69228303 None:intergenic 45.0%
!!! GACATGGTTTTGACAAAGGC+AGG + Chr5:69229258-69229277 None:intergenic 45.0%
!!! AAACTTAAATATTTTAAATT+TGG + Chr5:69227666-69227685 None:intergenic 5.0%
AAGGGAAATCCAGGGCTATG+TGG - Chr5:69229232-69229251 MsG0580027827.01.T01:CDS 50.0%
ACTCACAGGTGAGATTCCTG+AGG - Chr5:69229102-69229121 MsG0580027827.01.T01:CDS 50.0%
CACCAATTGGCCCTGTAAGT+TGG + Chr5:69227770-69227789 None:intergenic 50.0%
CTCGGTGGAAACCAACTTAC+AGG - Chr5:69227756-69227775 MsG0580027827.01.T01:CDS 50.0%
CTCTCATTGAACCAGCTGGA+GGG - Chr5:69229160-69229179 MsG0580027827.01.T01:CDS 50.0%
CTTACTTGCGGGTCACTTCA+AGG - Chr5:69226859-69226878 MsG0580027827.01.T01:CDS 50.0%
CTTGAAGTGACCCGCAAGTA+AGG + Chr5:69226861-69226880 None:intergenic 50.0%
GAGCACTTCTCTCGTGCAAT+TGG - Chr5:69227371-69227390 MsG0580027827.01.T01:CDS 50.0%
GCAAGGCAGAGGAATCATCA+TGG + Chr5:69226678-69226697 None:intergenic 50.0%
GGAAGAGACTCTAGCCAACT+AGG + Chr5:69228635-69228654 None:intergenic 50.0%
GGACAGCTGAAGTCACTCAA+AGG - Chr5:69228986-69229005 MsG0580027827.01.T01:CDS 50.0%
GGATGGAAAGCTGTGGCTAT+TGG - Chr5:69229340-69229359 MsG0580027827.01.T01:CDS 50.0%
GTGAGCCTGCTTACTATCCA+AGG - Chr5:69226749-69226768 MsG0580027827.01.T01:CDS 50.0%
GTGAGGGTGAATGGCAATGA+TGG - Chr5:69228815-69228834 MsG0580027827.01.T01:CDS 50.0%
TACAGAGGAAGAGGAAGAGG+AGG - Chr5:69229467-69229486 MsG0580027827.01.T01:CDS 50.0%
TAGACTAAGGGAGACCAGAG+AGG + Chr5:69227235-69227254 None:intergenic 50.0%
TCAATGGAAGGGTTCCAAGC+TGG - Chr5:69228126-69228145 MsG0580027827.01.T01:CDS 50.0%
! ATTGGCCTCGACCTTACTTG+CGG - Chr5:69226847-69226866 MsG0580027827.01.T01:CDS 50.0%
! GAGACAGGTTGAGTAACTCG+AGG + Chr5:69228373-69228392 None:intergenic 50.0%
CCTCTCATTGAACCAGCTGG+AGG - Chr5:69229159-69229178 MsG0580027827.01.T01:CDS 55.0%
TCATTGAACCAGCTGGAGGG+AGG - Chr5:69229163-69229182 MsG0580027827.01.T01:CDS 55.0%
TTGGCCTCGACCTTACTTGC+GGG - Chr5:69226848-69226867 MsG0580027827.01.T01:CDS 55.0%
! CCTCCAGCTGGTTCAATGAG+AGG + Chr5:69229162-69229181 None:intergenic 55.0%
! TGGAGGGAGGCATACCAAGT+GGG - Chr5:69229176-69229195 MsG0580027827.01.T01:CDS 55.0%
AAAGGCAGGCCACATAGCCC+TGG + Chr5:69229244-69229263 None:intergenic 60.0%
GGCAAGCTTCCACACTGCCT+TGG - Chr5:69228407-69228426 MsG0580027827.01.T01:CDS 60.0%
GTGACCCGCAAGTAAGGTCG+AGG + Chr5:69226855-69226874 None:intergenic 60.0%
TTGGTATGCCTCCCTCCAGC+TGG + Chr5:69229174-69229193 None:intergenic 60.0%
! CTGGAGGGAGGCATACCAAG+TGG - Chr5:69229175-69229194 MsG0580027827.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr5 gene 69226616 69229522 69226616 ID=MsG0580027827.01;Name=MsG0580027827.01
Chr5 mRNA 69226616 69229522 69226616 ID=MsG0580027827.01.T01;Parent=MsG0580027827.01;Name=MsG0580027827.01.T01;_AED=0.37;_eAED=0.37;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|968
Chr5 exon 69226616 69229522 69226616 ID=MsG0580027827.01.T01:exon:7041;Parent=MsG0580027827.01.T01
Chr5 CDS 69226616 69229522 69226616 ID=MsG0580027827.01.T01:cds;Parent=MsG0580027827.01.T01
Gene Sequence

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