AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380014902.01

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MsG0380014902.01.T01 AT1G61440 26.422 791 473 28 34 786 30 749 1.62e-66 236
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MsG0380014902.01.T01 AT1G61360 28.742 755 421 29 87 788 2 692 9.27e-64 228
MsG0380014902.01.T01 AT1G61430 25.939 825 498 33 7 788 8 762 2.92e-63 227
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MsG0380014902.01.T01 AT1G68690 43.643 291 149 7 499 783 365 646 3.93e-63 225
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MsG0380014902.01.T01 AT3G09010 42.020 307 151 9 497 792 32 322 8.86e-62 213
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MsG0380014902.01.T01 AT1G61500 27.299 685 427 21 46 704 33 672 1.33e-60 219
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MsG0380014902.01.T01 AT5G54590 38.667 300 160 5 492 786 96 376 2.48e-60 211
MsG0380014902.01.T01 AT1G61400 25.697 825 502 30 12 788 20 781 2.52e-60 219
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MsG0380014902.01.T01 AT1G61490 24.970 821 483 28 6 786 8 735 3.37e-60 218
MsG0380014902.01.T01 AT1G07650 39.359 343 183 8 451 783 594 921 3.42e-60 221
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MsG0380014902.01.T01 AT1G07650 39.359 343 183 8 451 783 626 953 5.55e-60 220
MsG0380014902.01.T01 AT1G61430 26.757 740 444 30 7 704 8 691 6.22e-60 216
MsG0380014902.01.T01 AT3G26940 41.806 299 150 8 499 784 62 349 8.10e-60 209
MsG0380014902.01.T01 AT1G61460 27.197 717 418 28 5 694 4 643 8.89e-60 216
MsG0380014902.01.T01 AT1G16670 37.538 325 177 9 478 792 11 319 1.62e-59 207
MsG0380014902.01.T01 AT2G20300 40.134 299 161 6 493 786 331 616 3.38e-59 215
MsG0380014902.01.T01 AT1G56120 38.806 335 180 8 461 786 494 812 4.41e-59 216
MsG0380014902.01.T01 AT3G24790 42.574 303 151 10 495 786 31 321 9.05e-59 204
MsG0380014902.01.T01 AT3G24790 42.574 303 151 10 495 786 49 339 1.34e-58 204
MsG0380014902.01.T01 AT1G56120 38.806 335 180 8 461 786 660 978 1.37e-58 216
MsG0380014902.01.T01 AT1G56120 38.806 335 180 8 461 786 642 960 1.39e-58 216
MsG0380014902.01.T01 AT3G16030 27.771 857 503 34 1 792 1 806 1.58e-58 214
MsG0380014902.01.T01 AT5G03140 40.290 345 183 11 456 787 314 648 1.60e-58 212
MsG0380014902.01.T01 AT1G52290 38.796 299 170 6 491 783 123 414 1.80e-58 207
MsG0380014902.01.T01 AT4G11900 28.880 741 402 33 6 670 11 702 2.74e-58 211
MsG0380014902.01.T01 AT4G11900 28.880 741 402 33 6 670 11 702 2.74e-58 211
MsG0380014902.01.T01 AT2G23950 41.611 298 154 9 496 786 284 568 3.00e-58 210
MsG0380014902.01.T01 AT5G20050 37.143 350 188 8 462 786 46 388 3.43e-58 205
MsG0380014902.01.T01 AT4G11900 28.880 741 402 33 6 670 11 702 3.60e-58 211
MsG0380014902.01.T01 AT4G11900 28.880 741 402 33 6 670 11 702 3.60e-58 211
MsG0380014902.01.T01 AT4G11900 28.880 741 402 33 6 670 11 702 4.18e-58 211
MsG0380014902.01.T01 AT5G15080 39.873 316 155 9 496 791 127 427 4.32e-58 206
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MsG0380014902.01.T01 AT4G34440 41.497 294 157 6 499 786 300 584 4.41e-58 210
MsG0380014902.01.T01 AT1G56145 34.324 370 197 8 450 786 626 982 5.55e-58 214
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MsG0380014902.01.T01 AT2G18470 41.311 305 160 8 491 786 262 556 8.05e-58 209
MsG0380014902.01.T01 AT2G18470 41.311 305 160 8 491 786 262 556 8.05e-58 209
MsG0380014902.01.T01 AT1G56130 38.066 331 181 10 465 786 499 814 8.37e-58 213
MsG0380014902.01.T01 AT5G55830 41.447 304 155 8 494 786 348 639 9.42e-58 209
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MsG0380014902.01.T01 AT2G13800 39.000 300 164 6 496 786 143 432 1.34e-57 204
MsG0380014902.01.T01 AT3G14840 37.647 340 180 10 459 789 630 946 1.48e-57 213
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MsG0380014902.01.T01 AT1G56130 38.066 331 181 10 465 786 647 962 2.62e-57 213
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MsG0380014902.01.T01 AT2G13800 39.404 302 160 7 496 786 260 549 8.33e-57 205
MsG0380014902.01.T01 AT5G06740 33.333 348 209 6 449 786 284 618 8.52e-57 206
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MsG0380014902.01.T01 AT3G20530 40.397 302 152 10 499 786 70 357 1.31e-56 199
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MsG0380014902.01.T01 AT2G47060 40.333 300 156 5 499 786 61 349 5.69e-55 194
MsG0380014902.01.T01 AT1G69790 38.820 322 159 12 485 786 48 351 6.07e-55 194
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MsG0380014902.01.T01 AT5G15730 35.197 304 167 6 491 787 96 376 7.40e-55 196
MsG0380014902.01.T01 AT4G23270 36.842 304 175 6 492 788 307 600 8.03e-55 201
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MsG0380014902.01.T01 AT4G23270 37.086 302 173 6 492 786 307 598 8.26e-55 201
MsG0380014902.01.T01 AT1G72540 39.672 305 152 10 499 786 72 361 8.30e-55 196
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MsG0380014902.01.T01 AT5G02290 36.420 324 166 11 486 786 44 350 1.07e-54 194
MsG0380014902.01.T01 AT2G26290 38.188 309 165 9 496 790 73 369 1.09e-54 195
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MsG0380014902.01.T01 AT1G71830 38.079 302 164 7 496 786 287 576 2.22e-54 199
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MsG0380014902.01.T01 AT5G56460 38.994 318 155 11 491 786 56 356 2.62e-54 193
MsG0380014902.01.T01 AT5G15730 35.099 302 168 6 491 787 96 374 2.71e-54 194
MsG0380014902.01.T01 AT1G79620 40.523 306 149 9 495 786 648 934 2.84e-54 203
MsG0380014902.01.T01 AT1G29730 40.000 295 159 7 499 786 628 911 2.87e-54 203
MsG0380014902.01.T01 AT1G79620 40.523 306 149 9 495 786 622 908 3.03e-54 203
MsG0380014902.01.T01 AT4G21400 35.215 372 178 10 467 792 176 530 3.13e-54 197
MsG0380014902.01.T01 AT5G01950 38.562 306 160 9 494 788 609 897 3.52e-54 202
MsG0380014902.01.T01 AT5G01950 38.562 306 160 9 494 788 609 897 3.52e-54 202
MsG0380014902.01.T01 AT5G01950 38.562 306 160 9 494 788 609 897 3.52e-54 202
MsG0380014902.01.T01 AT5G01950 38.562 306 160 9 494 788 609 897 3.52e-54 202
MsG0380014902.01.T01 AT2G41890 26.361 808 477 24 6 786 15 731 3.65e-54 201
MsG0380014902.01.T01 AT1G70530 40.000 295 156 7 499 786 311 591 3.79e-54 199
MsG0380014902.01.T01 AT4G00960 37.864 309 151 10 498 786 43 330 3.86e-54 192
MsG0380014902.01.T01 AT2G07180 40.066 302 155 10 499 786 78 367 3.98e-54 194
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MsG0380014902.01.T01 AT2G28250 38.614 303 165 9 498 786 197 492 4.41e-54 197
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MsG0380014902.01.T01 AT3G21630 39.116 294 162 8 498 786 309 590 4.15e-52 192
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MsG0380014902.01.T01 AT1G48210 37.162 296 163 5 503 786 60 344 4.88e-52 186
MsG0380014902.01.T01 AT5G38240 40.138 289 159 7 497 783 323 599 4.90e-52 192
MsG0380014902.01.T01 AT2G19230 35.294 340 201 5 450 786 516 839 5.43e-52 196
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MsG0380014902.01.T01 AT1G52540 36.667 300 169 6 496 787 22 308 1.32e-51 184
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MsG0380014902.01.T01 AT5G65240 37.209 301 168 6 496 786 269 558 1.52e-51 191
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MsG0380014902.01.T01 AT1G06700 37.117 326 179 7 476 786 32 346 2.47e-51 184
MsG0380014902.01.T01 AT4G04570 36.337 344 192 8 447 783 288 611 2.47e-51 191
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MsG0380014902.01.T01 AT4G04540 37.572 346 180 10 458 783 287 616 2.86e-51 191
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MsG0380014902.01.T01 AT4G23320 35.430 302 178 6 492 786 164 455 4.07e-51 187
MsG0380014902.01.T01 AT2G39660 36.646 322 173 9 490 792 46 355 4.22e-51 184
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MsG0380014902.01.T01 AT2G42960 37.500 304 168 7 499 793 171 461 1.09e-50 186
MsG0380014902.01.T01 AT2G42960 37.500 304 168 7 499 793 171 461 1.09e-50 186
MsG0380014902.01.T01 AT3G59350 35.692 325 180 7 478 786 38 349 1.09e-50 182
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MsG0380014902.01.T01 AT2G30740 37.423 326 178 7 476 786 35 349 1.61e-50 181
MsG0380014902.01.T01 AT2G30740 37.423 326 178 7 476 786 35 349 1.61e-50 181
MsG0380014902.01.T01 AT2G30740 37.423 326 178 7 476 786 35 349 1.61e-50 181
MsG0380014902.01.T01 AT2G30740 37.423 326 178 7 476 786 35 349 1.61e-50 181
MsG0380014902.01.T01 AT2G30740 37.423 326 178 7 476 786 35 349 1.61e-50 181
MsG0380014902.01.T01 AT2G30740 37.423 326 178 7 476 786 35 349 1.61e-50 181
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MsG0380014902.01.T01 AT2G30740 37.423 326 178 7 476 786 35 349 1.61e-50 181
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MsG0380014902.01.T01 AT2G28930 36.223 323 168 11 486 786 45 351 3.22e-50 182
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MsG0380014902.01.T01 AT5G10290 35.548 301 173 6 496 786 275 564 3.66e-50 187
MsG0380014902.01.T01 AT3G15890 35.548 301 175 6 496 788 24 313 3.71e-50 180
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MsG0380014902.01.T01 AT3G59350 35.692 325 180 7 478 786 95 406 3.87e-50 182
MsG0380014902.01.T01 AT2G28930 36.223 323 168 11 486 786 48 354 4.21e-50 182
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MsG0380014902.01.T01 AT2G17220 37.097 310 162 9 496 786 72 367 4.54e-50 182
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MsG0380014902.01.T01 AT5G65700 37.770 278 155 7 515 786 700 965 5.19e-50 190
MsG0380014902.01.T01 AT2G17220 37.097 310 162 9 496 786 71 366 5.20e-50 181
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MsG0380014902.01.T01 AT5G48380 37.864 309 174 6 498 793 290 593 5.75e-50 186
MsG0380014902.01.T01 AT3G17410 38.176 296 160 5 503 786 61 345 5.78e-50 180
MsG0380014902.01.T01 AT3G17410 38.176 296 160 5 503 786 61 345 5.78e-50 180
MsG0380014902.01.T01 AT5G62710 33.242 364 210 8 443 786 198 548 5.90e-50 185
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MsG0380014902.01.T01 AT2G30730 34.911 338 191 7 465 786 1 325 6.20e-50 179
MsG0380014902.01.T01 AT5G38260 37.026 343 187 9 461 786 264 594 6.33e-50 186
MsG0380014902.01.T01 AT4G28490 34.808 339 188 8 468 786 639 964 6.62e-50 190
MsG0380014902.01.T01 AT1G67000 34.366 355 210 10 448 786 492 839 6.69e-50 189
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MsG0380014902.01.T01 AT1G31420 31.279 438 249 14 376 789 168 577 6.95e-50 185
MsG0380014902.01.T01 AT5G35960 36.991 319 172 10 476 786 102 399 6.98e-50 181
MsG0380014902.01.T01 AT5G01560 33.903 351 201 9 446 786 303 632 7.32e-50 187
MsG0380014902.01.T01 AT5G37450 36.721 305 156 9 497 786 593 875 7.33e-50 189
MsG0380014902.01.T01 AT5G18910 37.667 300 159 8 496 786 177 457 7.34e-50 184
MsG0380014902.01.T01 AT1G66930 35.549 346 188 11 459 786 294 622 7.39e-50 187
MsG0380014902.01.T01 AT4G21230 36.304 303 170 7 499 792 321 609 7.44e-50 186
MsG0380014902.01.T01 AT1G21590 34.884 301 178 5 493 786 391 680 7.84e-50 188
MsG0380014902.01.T01 AT3G62220 38.176 296 160 5 503 786 61 345 7.97e-50 179
MsG0380014902.01.T01 AT3G62220 38.176 296 160 5 503 786 61 345 7.97e-50 179
MsG0380014902.01.T01 AT5G35580 38.742 302 159 9 499 786 64 353 8.04e-50 183
MsG0380014902.01.T01 AT5G62710 33.242 364 210 8 443 786 232 582 8.54e-50 185
MsG0380014902.01.T01 AT5G37450 36.721 305 156 9 497 786 641 923 8.58e-50 189
MsG0380014902.01.T01 AT3G46330 34.821 336 183 6 465 786 523 836 8.62e-50 189
MsG0380014902.01.T01 AT3G46330 34.821 336 183 6 465 786 499 812 8.86e-50 189
MsG0380014902.01.T01 AT5G37450 36.721 305 156 9 497 786 617 899 8.94e-50 189
MsG0380014902.01.T01 AT4G32000 35.855 304 175 7 492 787 152 443 9.34e-50 182
MsG0380014902.01.T01 AT1G66880 39.604 303 156 9 495 786 332 618 9.50e-50 186
MsG0380014902.01.T01 AT1G61370 27.698 556 308 19 271 788 124 623 9.58e-50 186
MsG0380014902.01.T01 AT1G07570 36.061 330 171 12 480 786 49 361 9.72e-50 181
MsG0380014902.01.T01 AT5G35580 38.742 302 159 9 499 786 76 365 1.15e-49 183
MsG0380014902.01.T01 AT1G15530 38.926 298 160 9 498 787 348 631 1.19e-49 186
MsG0380014902.01.T01 AT2G28960 34.234 333 176 7 475 786 400 710 1.46e-49 187
MsG0380014902.01.T01 AT1G07570 36.061 330 171 12 480 786 38 350 1.49e-49 180
MsG0380014902.01.T01 AT1G07570 36.061 330 171 12 480 786 38 350 1.49e-49 180
MsG0380014902.01.T01 AT1G07570 36.061 330 171 12 480 786 38 350 1.49e-49 180
MsG0380014902.01.T01 AT2G01820 36.424 302 171 7 499 788 573 865 1.56e-49 189
MsG0380014902.01.T01 AT4G17660 36.859 312 157 10 496 786 76 368 1.69e-49 179
MsG0380014902.01.T01 AT5G42440 38.591 298 161 8 498 786 68 352 1.94e-49 178
MsG0380014902.01.T01 AT4G11470 35.135 296 175 6 498 786 331 616 2.03e-49 186
MsG0380014902.01.T01 AT4G11470 35.135 296 175 6 498 786 326 611 2.04e-49 185
MsG0380014902.01.T01 AT1G18390 39.103 312 161 10 494 792 327 622 2.07e-49 185
MsG0380014902.01.T01 AT4G35600 36.991 319 174 10 483 786 59 365 2.08e-49 180
MsG0380014902.01.T01 AT5G01550 34.530 362 196 11 442 786 312 649 2.11e-49 186
MsG0380014902.01.T01 AT4G11480 36.486 296 171 6 498 786 308 593 2.38e-49 185
MsG0380014902.01.T01 AT4G11480 36.486 296 171 6 498 786 311 596 2.43e-49 185
MsG0380014902.01.T01 AT3G49670 38.849 278 152 7 515 786 696 961 2.46e-49 188
MsG0380014902.01.T01 AT1G66880 39.934 303 155 9 495 786 953 1239 2.46e-49 189
MsG0380014902.01.T01 AT4G28670 35.826 321 175 8 483 788 303 607 2.47e-49 184
MsG0380014902.01.T01 AT5G16900 35.890 326 188 7 469 786 344 656 2.50e-49 185
MsG0380014902.01.T01 AT2G14510 34.211 342 202 7 451 786 507 831 2.56e-49 187
MsG0380014902.01.T01 AT2G30730 36.842 304 163 7 499 786 45 335 2.58e-49 177
MsG0380014902.01.T01 AT1G66930 35.549 346 188 11 459 786 503 831 2.59e-49 187
MsG0380014902.01.T01 AT1G70520 40.264 303 152 10 499 786 313 601 2.68e-49 185
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MsG0380014902.01.T01 AT4G35600 36.991 319 174 10 483 786 60 366 2.81e-49 179
MsG0380014902.01.T01 AT2G33170 34.628 309 171 8 497 787 805 1100 3.05e-49 188
MsG0380014902.01.T01 AT2G33170 34.628 309 171 8 497 787 805 1100 3.05e-49 188
MsG0380014902.01.T01 AT2G14510 34.211 342 202 7 451 786 515 839 3.19e-49 187
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MsG0380014902.01.T01 AT3G09830 37.975 316 162 10 489 784 62 363 3.40e-49 179
MsG0380014902.01.T01 AT3G09830 37.975 316 162 10 489 784 62 363 3.40e-49 179
MsG0380014902.01.T01 AT5G35960 36.508 315 171 10 476 782 102 395 3.49e-49 179
MsG0380014902.01.T01 AT1G66880 39.404 302 158 8 495 786 574 860 3.72e-49 187
MsG0380014902.01.T01 AT1G24030 40.417 240 129 6 499 727 50 286 3.73e-49 175
MsG0380014902.01.T01 AT1G51850 32.308 390 208 9 425 786 466 827 3.73e-49 187
MsG0380014902.01.T01 AT4G00960 41.589 214 117 4 498 703 43 256 3.93e-49 175
MsG0380014902.01.T01 AT1G61420 26.825 548 322 17 271 788 121 619 4.03e-49 184
MsG0380014902.01.T01 AT2G28960 34.234 333 176 7 475 786 532 842 4.11e-49 187
MsG0380014902.01.T01 AT1G51850 32.308 390 208 9 425 786 486 847 4.42e-49 187
MsG0380014902.01.T01 AT4G04500 35.503 338 192 8 465 789 299 623 4.84e-49 184
MsG0380014902.01.T01 AT1G78530 36.331 278 157 7 515 786 81 344 5.11e-49 177
MsG0380014902.01.T01 AT1G74490 39.088 307 153 12 496 786 76 364 5.43e-49 178

Find 166 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 195 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TCATAATTTGATCCCAATTT+AGG 0.072784 3:+62217279 None:intergenic
ACAAATTGTTGACCCTAAAT+TGG 0.139576 3:-62217292 MsG0380014902.01.T01:CDS
ACCGGTTGTTGGACTCTTTC+CGG 0.169484 3:+62217413 None:intergenic
TCTTCTTATTGCATGAAAAT+TGG 0.197129 3:+62218540 None:intergenic
GGAATAGTTGGTATCACTTT+TGG 0.226897 3:+62219021 None:intergenic
GTCATCAACATAACTATTAA+TGG 0.250817 3:-62217155 None:intergenic
ACTTTCATAACAAGTGATTA+TGG 0.251754 3:-62218809 MsG0380014902.01.T01:CDS
CTGGAGATTCAAGCGTTTAT+TGG 0.259864 3:-62218937 MsG0380014902.01.T01:CDS
ATGAACTTGATTGGAGTAAA+AGG 0.260939 3:-62217731 MsG0380014902.01.T01:CDS
CTTCATGTTTCTCCACTGAT+AGG 0.271505 3:+62219446 None:intergenic
CATAATTTGATCCCAATTTA+GGG 0.274308 3:+62217280 None:intergenic
CCGTTTAGTAACTGCGTCTT+TGG 0.276105 3:+62218350 None:intergenic
CAAATGCTCACATTGTTTAT+AGG 0.283025 3:+62218445 None:intergenic
TGCAGTTATGGTCCAATAAA+TGG 0.298751 3:-62218638 MsG0380014902.01.T01:CDS
TGCATATTGAAAACCCATTC+AGG 0.300381 3:+62217492 None:intergenic
AAATTATGATGTAAAGAAAA+TGG 0.304020 3:-62217265 MsG0380014902.01.T01:CDS
TTCATTTGATGAAAGATTAT+CGG 0.304163 3:+62217749 None:intergenic
CAGATCCTTTGCTTCTTGAT+TGG 0.304316 3:-62218913 MsG0380014902.01.T01:CDS
GAGTTTAACAGCTATGACTA+TGG 0.307220 3:-62218485 MsG0380014902.01.T01:CDS
GTTTAGAAAATTCAGTTATT+CGG 0.311555 3:-62218033 MsG0380014902.01.T01:CDS
GTTATTAATTATGCTATAAC+CGG 0.314041 3:+62218595 None:intergenic
TTTCATCAAATGAACTTGAT+TGG 0.314874 3:-62217740 MsG0380014902.01.T01:CDS
GATCCATGTACAATCATAAC+AGG 0.328163 3:-62218880 MsG0380014902.01.T01:CDS
GGTAGCAACATTAAATCGTT+TGG 0.328436 3:-62218858 MsG0380014902.01.T01:CDS
CTTGCTGAAGTTAGCATCAT+TGG 0.349560 3:-62217870 MsG0380014902.01.T01:CDS
GTCTTATGCTTCTTTCTAGT+AGG 0.354897 3:-62218128 MsG0380014902.01.T01:CDS
CTTAACCACATGAATTTGAT+AGG 0.357182 3:-62217843 MsG0380014902.01.T01:CDS
TTGGTTTGTTCGAGAAATAA+TGG 0.357343 3:-62218245 MsG0380014902.01.T01:CDS
TCACCAATGCTACCGTTGTT+TGG 0.359590 3:-62219318 MsG0380014902.01.T01:CDS
TGCACCCTTGAGACCAATCT+TGG 0.362726 3:+62218573 None:intergenic
AGAATTAGAAGTTGCTTGTT+GGG 0.366567 3:-62217319 MsG0380014902.01.T01:CDS
GTTTACGAGTACATGGAAAA+AGG 0.370953 3:-62217780 MsG0380014902.01.T01:CDS
AAAGGTTGGTAACATGGGTT+AGG 0.373930 3:-62217356 MsG0380014902.01.T01:CDS
GACATTGGCAAATGTTGCTT+TGG 0.384640 3:-62217241 MsG0380014902.01.T01:CDS
AATAGTTATGTTGATGACTT+AGG 0.385983 3:+62217160 None:intergenic
CCGAACAGCACTTGCAGTTA+TGG 0.390301 3:-62218650 MsG0380014902.01.T01:CDS
ATGCTTATTCATTCGCCATA+TGG 0.392410 3:-62219363 MsG0380014902.01.T01:CDS
CGACCTAAGGTTGCAGACTT+TGG 0.400700 3:-62217594 MsG0380014902.01.T01:CDS
AAAAGGTATCACATTGCTAT+AGG 0.400856 3:-62217714 MsG0380014902.01.T01:CDS
CATGTATTTGACAAGGTTGT+TGG 0.402189 3:+62218684 None:intergenic
TTTATCTTTGATTTGAATAC+CGG 0.402564 3:+62217395 None:intergenic
AAGAATTAGAAGTTGCTTGT+TGG 0.403138 3:-62217320 MsG0380014902.01.T01:CDS
CAAATTGTTGACCCTAAATT+GGG 0.405145 3:-62217291 MsG0380014902.01.T01:CDS
TTGCATGAAAATTGGAAGCT+TGG 0.407789 3:+62218548 None:intergenic
GCCCGCGGTGAATGTGCCTT+TGG 0.410306 3:+62219405 None:intergenic
GTAGCAACATTAAATCGTTT+GGG 0.412621 3:-62218857 MsG0380014902.01.T01:CDS
CTTATGTTTGCAAGTGGCTT+GGG 0.415415 3:-62218161 MsG0380014902.01.T01:CDS
GCTGGAGGAACCGTGTATAA+AGG 0.418258 3:-62217963 MsG0380014902.01.T01:CDS
CAAGAGAAGTGGTTAGTGTC+AGG 0.419337 3:-62218716 MsG0380014902.01.T01:CDS
TTTGGATGAGTATGTGTTTG+TGG 0.420530 3:+62219192 None:intergenic
TTATTTACATGAAGAGTGTT+TGG 0.422135 3:-62217673 MsG0380014902.01.T01:CDS
AGGTTACATGGCACCTGAAT+GGG 0.422465 3:-62217505 MsG0380014902.01.T01:CDS
TATGTTCTAGCATCAGCAAC+CGG 0.426766 3:-62218056 MsG0380014902.01.T01:CDS
CAGCTCCCCTTCCAATCTCT+TGG 0.428392 3:+62217982 None:intergenic
CAATAAACGCTTGAATCTCC+AGG 0.431984 3:+62218938 None:intergenic
GCTTATGTTTGCAAGTGGCT+TGG 0.432914 3:-62218162 MsG0380014902.01.T01:CDS
AAAGTGGATGTTTATAGCTA+TGG 0.438050 3:-62217459 MsG0380014902.01.T01:CDS
TTGATTTGAATACCGGTTGT+TGG 0.444743 3:+62217402 None:intergenic
GTCGGTTAAAATGAGGTTGC+CGG 0.448813 3:+62219237 None:intergenic
TGTCAAATACATGGAATTTG+TGG 0.450156 3:-62218674 MsG0380014902.01.T01:CDS
TCTTATGCTTCTTTCTAGTA+GGG 0.451421 3:-62218127 MsG0380014902.01.T01:CDS
CCCGCGGTGAATGTGCCTTT+GGG 0.452306 3:+62219406 None:intergenic
CAATCTAGTGTTGATAATCA+TGG 0.457966 3:-62218080 MsG0380014902.01.T01:CDS
GGTGTATCTTATTCAAGAAT+AGG 0.457999 3:-62218106 MsG0380014902.01.T01:CDS
ACGCAGGACAGTTCAATGTT+TGG 0.459237 3:-62219216 MsG0380014902.01.T01:CDS
GTTTGTCTAAGCTATTGAAC+AGG 0.460342 3:-62217572 MsG0380014902.01.T01:CDS
CAAGAGATTGGAAGGGGAGC+TGG 0.460714 3:-62217981 MsG0380014902.01.T01:CDS
TATGCAAATCACTTCTAAAG+TGG 0.465562 3:-62217475 MsG0380014902.01.T01:CDS
AGAGGGAAAACATAGATTGT+TGG 0.466819 3:-62217802 MsG0380014902.01.T01:CDS
CTCAGAGAGTACAAAACAAA+TGG 0.467575 3:-62219130 MsG0380014902.01.T01:CDS
CAATGCTACCGTTGTTTGGA+TGG 0.472931 3:-62219314 MsG0380014902.01.T01:CDS
TGACTCTGATTATCGACCTA+AGG 0.474926 3:-62217607 MsG0380014902.01.T01:CDS
CCAAAGACGCAGTTACTAAA+CGG 0.475296 3:-62218350 MsG0380014902.01.T01:CDS
CAAGAAACTCACTATCTCCT+TGG 0.479542 3:+62217889 None:intergenic
CTTCTCCGTCTTCTCTATGA+TGG 0.481236 3:-62218962 MsG0380014902.01.T01:CDS
GCATAATTAATAACCAAGAT+TGG 0.482210 3:-62218586 MsG0380014902.01.T01:CDS
GAGGTTACATGGCACCTGAA+TGG 0.482383 3:-62217506 MsG0380014902.01.T01:CDS
AAACCAAAGTCTGCAACCTT+AGG 0.483995 3:+62217591 None:intergenic
AGAAAATGTTCGTGTCTTCC+CGG 0.485039 3:-62218614 MsG0380014902.01.T01:CDS
CTCTGAACTTTGTCGAATGA+AGG 0.490074 3:+62218327 None:intergenic
GTGGTGTTGGAGATGATTAC+CGG 0.490359 3:-62217432 MsG0380014902.01.T01:CDS
CCATAACTGCAAGTGCTGTT+CGG 0.491424 3:+62218650 None:intergenic
TTCATGTTTCTCCACTGATA+GGG 0.492982 3:+62219447 None:intergenic
ATTGTTGGTTTACGAGTACA+TGG 0.493296 3:-62217787 MsG0380014902.01.T01:CDS
ACACTTTCCCTTCTTAATAC+CGG 0.493360 3:-62219256 MsG0380014902.01.T01:CDS
GTCATGAAAGGTTGGTAACA+TGG 0.494193 3:-62217362 MsG0380014902.01.T01:CDS
AATCGTGACCAACCAGTTAA+CGG 0.495903 3:-62219289 MsG0380014902.01.T01:CDS
AGAGTTATGTCATGAAAGGT+TGG 0.501476 3:-62217370 MsG0380014902.01.T01:CDS
AATAACCAAGATTGGTCTCA+AGG 0.502697 3:-62218578 MsG0380014902.01.T01:CDS
CAACAACCTTGTCAAATACA+TGG 0.503710 3:-62218683 MsG0380014902.01.T01:CDS
TGAGGTTGCCGGTATTAAGA+AGG 0.504470 3:+62219248 None:intergenic
TAGCTATGGAGTTGTGGTGT+TGG 0.510450 3:-62217445 MsG0380014902.01.T01:CDS
CATGAATTTGATAGGAATGT+GGG 0.511999 3:-62217835 MsG0380014902.01.T01:CDS
TTTAGCCAAGAGATTGGAAG+GGG 0.513238 3:-62217987 MsG0380014902.01.T01:CDS
CGTGTTTATAGCCGAAAACA+AGG 0.514429 3:-62218740 MsG0380014902.01.T01:CDS
CAATCAAGAAGCAAAGGATC+TGG 0.514935 3:+62218914 None:intergenic
AAGTGGCTTGGGCGGAATTG+AGG 0.516754 3:-62218150 MsG0380014902.01.T01:CDS
CATCCAAACAACGGTAGCAT+TGG 0.522130 3:+62219315 None:intergenic
TCGAGGGACAAGAGGTTACA+TGG 0.526801 3:-62217517 MsG0380014902.01.T01:CDS
CGTCTTCTCTATGATGGCCC+TGG 0.527004 3:-62218956 MsG0380014902.01.T01:CDS
GTAGCAGCTAGAGGAATAGT+TGG 0.531192 3:+62219009 None:intergenic
GAATTAAAACAAGCTACAGC+AGG 0.533151 3:-62218011 MsG0380014902.01.T01:CDS
CTTGACATAGCGAAATTGAA+AGG 0.533278 3:+62218397 None:intergenic
CAAATTTCTCGAGGATTCGA+GGG 0.535047 3:-62217533 MsG0380014902.01.T01:CDS
TGTTGCTTTGGATTGTGTAC+AGG 0.535359 3:-62217229 MsG0380014902.01.T01:CDS
ACCGGAAAGAGTCCAACAAC+CGG 0.537855 3:-62217414 MsG0380014902.01.T01:CDS
GAATAAGCATTCTCACCTAC+GGG 0.538135 3:+62219376 None:intergenic
TCAAATTTCTCGAGGATTCG+AGG 0.539667 3:-62217534 MsG0380014902.01.T01:CDS
AAGGTTGGTAACATGGGTTA+GGG 0.540156 3:-62217355 MsG0380014902.01.T01:CDS
TGTAAAGAAAATGGAGACAT+TGG 0.540325 3:-62217256 MsG0380014902.01.T01:CDS
ACAAACCAAGTTATCATACT+CGG 0.545957 3:+62218259 None:intergenic
CTGAAGTTAGCATCATTGGA+AGG 0.547538 3:-62217866 MsG0380014902.01.T01:CDS
ATTTCGCTATGTCAAGAACA+AGG 0.547793 3:-62218390 MsG0380014902.01.T01:CDS
AATCTAGTGTTGATAATCAT+GGG 0.548439 3:-62218079 MsG0380014902.01.T01:CDS
AAGAAGAGTTATGTCATGAA+AGG 0.554259 3:-62217374 MsG0380014902.01.T01:CDS
TGTTTATAGCTATGGAGTTG+TGG 0.557322 3:-62217451 MsG0380014902.01.T01:CDS
TGAATAAGCATTCTCACCTA+CGG 0.558455 3:+62219375 None:intergenic
ATGTGGGGTTATTGTGCAGA+GGG 0.561337 3:-62217819 MsG0380014902.01.T01:CDS
TACCCTGTTATGATTGTACA+TGG 0.562885 3:+62218877 None:intergenic
CCCAAAGGCACATTCACCGC+GGG 0.562907 3:-62219406 MsG0380014902.01.T01:CDS
ATTAGAAGTTGCTTGTTGGG+TGG 0.563873 3:-62217316 MsG0380014902.01.T01:CDS
TTCATGCTTATGTTTGCAAG+TGG 0.563902 3:-62218167 MsG0380014902.01.T01:CDS
ATGTTTGCAAGTGGCTTGGG+CGG 0.565504 3:-62218158 MsG0380014902.01.T01:CDS
CAAATTCCATGTATTTGACA+AGG 0.568334 3:+62218677 None:intergenic
CAAACCAAGTTATCATACTC+GGG 0.569174 3:+62218260 None:intergenic
ATGATAATTCAAATTTCTCG+AGG 0.570313 3:-62217542 MsG0380014902.01.T01:CDS
ACATGAATTTGATAGGAATG+TGG 0.576400 3:-62217836 MsG0380014902.01.T01:CDS
TCTTGCCAATCAAGAAGCAA+AGG 0.581173 3:+62218908 None:intergenic
ATGTTCTAGCATCAGCAACC+GGG 0.584915 3:-62218055 MsG0380014902.01.T01:CDS
GAGATTGGAAGGGGAGCTGG+AGG 0.585694 3:-62217978 MsG0380014902.01.T01:CDS
CATAGCTGTTAAACTCAACA+CGG 0.586176 3:+62218492 None:intergenic
CCTCTCAACAACTTGACTCA+TGG 0.586942 3:+62217185 None:intergenic
ATAACCAAGATTGGTCTCAA+GGG 0.590919 3:-62218577 MsG0380014902.01.T01:CDS
CTTCATTCGACAAAGTTCAG+AGG 0.592279 3:-62218326 MsG0380014902.01.T01:CDS
TCATGAAAGGTTGGTAACAT+GGG 0.594453 3:-62217361 MsG0380014902.01.T01:CDS
CAGGGCCATCATAGAGAAGA+CGG 0.596474 3:+62218957 None:intergenic
GAAAACAAGGGCAAGAGAAG+TGG 0.598975 3:-62218727 MsG0380014902.01.T01:CDS
TCGAGGATTCGAGGGACAAG+AGG 0.601003 3:-62217525 MsG0380014902.01.T01:CDS
TTATTAATTATGCTATAACC+GGG 0.610833 3:+62218596 None:intergenic
GAGGTTGCCGGTATTAAGAA+GGG 0.612434 3:+62219249 None:intergenic
AAGAGAAGTGGTTAGTGTCA+GGG 0.613956 3:-62218715 MsG0380014902.01.T01:CDS
TCGGGGAGGAGGGTATCTGT+TGG 0.614516 3:+62219079 None:intergenic
GTCCTGCGTCGGTTAAAATG+AGG 0.615642 3:+62219230 None:intergenic
CCATGAGTCAAGTTGTTGAG+AGG 0.621236 3:-62217185 MsG0380014902.01.T01:CDS
AACATTGAACTGTCCTGCGT+CGG 0.630457 3:+62219219 None:intergenic
TACATGAAGAGTGTTTGGAG+TGG 0.630614 3:-62217668 MsG0380014902.01.T01:CDS
AATGTGGGGTTATTGTGCAG+AGG 0.635239 3:-62217820 MsG0380014902.01.T01:CDS
ATGAATTTGATAGGAATGTG+GGG 0.637436 3:-62217834 MsG0380014902.01.T01:CDS
AATAAACGCTTGAATCTCCA+GGG 0.637532 3:+62218939 None:intergenic
ATAGCTGTTAAACTCAACAC+GGG 0.638438 3:+62218493 None:intergenic
TCAACAACTTGACTCATGGT+AGG 0.639051 3:+62217189 None:intergenic
AAACAACGGTAGCATTGGTG+AGG 0.644579 3:+62219320 None:intergenic
GACGTTATAGTCTCACCCAA+AGG 0.646989 3:-62219421 MsG0380014902.01.T01:CDS
ACATTCCTATCAAATTCATG+TGG 0.652006 3:+62217838 None:intergenic
AGATAAAATACCTTTATACA+CGG 0.653767 3:+62217953 None:intergenic
AAACCAAGTTATCATACTCG+GGG 0.657263 3:+62218261 None:intergenic
GTGTTTATAGCCGAAAACAA+GGG 0.669450 3:-62218739 MsG0380014902.01.T01:CDS
TCCCCGATCAAAATTTCACA+AGG 0.672982 3:-62219063 MsG0380014902.01.T01:CDS
ACCCAAAGGCACATTCACCG+CGG 0.679515 3:-62219407 MsG0380014902.01.T01:CDS
TTTCGCTATGTCAAGAACAA+GGG 0.679799 3:-62218389 MsG0380014902.01.T01:CDS
ATCCATGTACAATCATAACA+GGG 0.703497 3:-62218879 MsG0380014902.01.T01:CDS
CATTTGCATGACACAAACCA+AGG 0.704847 3:-62217906 MsG0380014902.01.T01:CDS
ACGATTTGCCATCCAAACAA+CGG 0.711581 3:+62219306 None:intergenic
ACCTACGGGATAAAAGCCCG+CGG 0.731791 3:+62219390 None:intergenic
AACCAAGTTATCATACTCGG+GGG 0.737906 3:+62218262 None:intergenic
TAGCTGTTAAACTCAACACG+GGG 0.810916 3:+62218494 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAATTATGATGTAAAGAAAA+TGG - Chr3:62219410-62219429 MsG0380014902.01.T01:CDS 15.0%
!! AGATAAAATACCTTTATACA+CGG + Chr3:62218725-62218744 None:intergenic 20.0%
!! GTTATTAATTATGCTATAAC+CGG + Chr3:62218083-62218102 None:intergenic 20.0%
!! GTTTAGAAAATTCAGTTATT+CGG - Chr3:62218642-62218661 MsG0380014902.01.T01:CDS 20.0%
!! TTATTAATTATGCTATAACC+GGG + Chr3:62218082-62218101 None:intergenic 20.0%
!! TTCATTTGATGAAAGATTAT+CGG + Chr3:62218929-62218948 None:intergenic 20.0%
!!! CAAAAACAACTTAAGTTTTT+TGG + Chr3:62217504-62217523 None:intergenic 20.0%
!!! GAGAAAACAATATTGTTTTT+TGG + Chr3:62218394-62218413 None:intergenic 20.0%
!!! GTTTATAGGTGTAATTTTTA+TGG + Chr3:62218219-62218238 None:intergenic 20.0%
!!! TTTATCTTTGATTTGAATAC+CGG + Chr3:62219283-62219302 None:intergenic 20.0%
! ACTTTCATAACAAGTGATTA+TGG - Chr3:62217866-62217885 MsG0380014902.01.T01:CDS 25.0%
! ATGATAATTCAAATTTCTCG+AGG - Chr3:62219133-62219152 MsG0380014902.01.T01:CDS 25.0%
! CATAATTTGATCCCAATTTA+GGG + Chr3:62219398-62219417 None:intergenic 25.0%
! GCATAATTAATAACCAAGAT+TGG - Chr3:62218089-62218108 MsG0380014902.01.T01:CDS 25.0%
! TCATAATTTGATCCCAATTT+AGG + Chr3:62219399-62219418 None:intergenic 25.0%
! TCTTCTTATTGCATGAAAAT+TGG + Chr3:62218138-62218157 None:intergenic 25.0%
! TTTCATCAAATGAACTTGAT+TGG - Chr3:62218935-62218954 MsG0380014902.01.T01:CDS 25.0%
!! ATAACTGAATTTTCTAAACC+CGG + Chr3:62218641-62218660 None:intergenic 25.0%
!! GAACATTTTCTACCATTTAT+TGG + Chr3:62218052-62218071 None:intergenic 25.0%
!!! AAACAAATGGTTCTATTTTG+TGG - Chr3:62217558-62217577 MsG0380014902.01.T01:CDS 25.0%
!!! AATAGTTATGTTGATGACTT+AGG + Chr3:62219518-62219537 None:intergenic 25.0%
!!! AATCTAGTGTTGATAATCAT+GGG - Chr3:62218596-62218615 MsG0380014902.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATACCTTGTGAAATTTTGAT+CGG + Chr3:62217618-62217637 None:intergenic 25.0%
!!! TAAGTTGTTTTTGTACGATA+CGG - Chr3:62217511-62217530 MsG0380014902.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTATTTACATGAAGAGTGTT+TGG - Chr3:62219002-62219021 MsG0380014902.01.T01:CDS 25.0%
AAAGTGGATGTTTATAGCTA+TGG - Chr3:62219216-62219235 MsG0380014902.01.T01:CDS 30.0%
AAGAAGAGTTATGTCATGAA+AGG - Chr3:62219301-62219320 MsG0380014902.01.T01:CDS 30.0%
AAGAATTAGAAGTTGCTTGT+TGG - Chr3:62219355-62219374 MsG0380014902.01.T01:CDS 30.0%
ACAAACCAAGTTATCATACT+CGG + Chr3:62218419-62218438 None:intergenic 30.0%
ACAAATTGTTGACCCTAAAT+TGG - Chr3:62219383-62219402 MsG0380014902.01.T01:CDS 30.0%
ACATGAATTTGATAGGAATG+TGG - Chr3:62218839-62218858 MsG0380014902.01.T01:CDS 30.0%
ACATTCCTATCAAATTCATG+TGG + Chr3:62218840-62218859 None:intergenic 30.0%
AGAATTAGAAGTTGCTTGTT+GGG - Chr3:62219356-62219375 MsG0380014902.01.T01:CDS 30.0%
ATCCATGTACAATCATAACA+GGG - Chr3:62217796-62217815 MsG0380014902.01.T01:CDS 30.0%
ATGAACTTGATTGGAGTAAA+AGG - Chr3:62218944-62218963 MsG0380014902.01.T01:CDS 30.0%
ATGAATTTGATAGGAATGTG+GGG - Chr3:62218841-62218860 MsG0380014902.01.T01:CDS 30.0%
CAAATGCTCACATTGTTTAT+AGG + Chr3:62218233-62218252 None:intergenic 30.0%
CAAATTCCATGTATTTGACA+AGG + Chr3:62218001-62218020 None:intergenic 30.0%
CAAATTGTTGACCCTAAATT+GGG - Chr3:62219384-62219403 MsG0380014902.01.T01:CDS 30.0%
CATGAATTTGATAGGAATGT+GGG - Chr3:62218840-62218859 MsG0380014902.01.T01:CDS 30.0%
CTTAACCACATGAATTTGAT+AGG - Chr3:62218832-62218851 MsG0380014902.01.T01:CDS 30.0%
GGTGTATCTTATTCAAGAAT+AGG - Chr3:62218569-62218588 MsG0380014902.01.T01:CDS 30.0%
GTAGCAACATTAAATCGTTT+GGG - Chr3:62217818-62217837 MsG0380014902.01.T01:CDS 30.0%
TACGTCAGTGAAAAAGAAAA+TGG - Chr3:62218475-62218494 MsG0380014902.01.T01:CDS 30.0%
TGTAAAGAAAATGGAGACAT+TGG - Chr3:62219419-62219438 MsG0380014902.01.T01:CDS 30.0%
TGTCAAATACATGGAATTTG+TGG - Chr3:62218001-62218020 MsG0380014902.01.T01:CDS 30.0%
! TATGCAAATCACTTCTAAAG+TGG - Chr3:62219200-62219219 MsG0380014902.01.T01:CDS 30.0%
! TCTTATGCTTCTTTCTAGTA+GGG - Chr3:62218548-62218567 MsG0380014902.01.T01:CDS 30.0%
!! AAAAGGTATCACATTGCTAT+AGG - Chr3:62218961-62218980 MsG0380014902.01.T01:CDS 30.0%
!! CAATCTAGTGTTGATAATCA+TGG - Chr3:62218595-62218614 MsG0380014902.01.T01:CDS 30.0%
!! TACCTTGTGAAATTTTGATC+GGG + Chr3:62217617-62217636 None:intergenic 30.0%
!! TTGGTTTGTTCGAGAAATAA+TGG - Chr3:62218430-62218449 MsG0380014902.01.T01:CDS 30.0%
!!! AAGTTGTTTTTGTACGATAC+GGG - Chr3:62217512-62217531 MsG0380014902.01.T01:CDS 30.0%
AAACCAAGTTATCATACTCG+GGG + Chr3:62218417-62218436 None:intergenic 35.0%
AATAAACGCTTGAATCTCCA+GGG + Chr3:62217739-62217758 None:intergenic 35.0%
ACACTTTCCCTTCTTAATAC+CGG - Chr3:62217419-62217438 MsG0380014902.01.T01:CDS 35.0%
AGAGGGAAAACATAGATTGT+TGG - Chr3:62218873-62218892 MsG0380014902.01.T01:CDS 35.0%
AGAGTTATGTCATGAAAGGT+TGG - Chr3:62219305-62219324 MsG0380014902.01.T01:CDS 35.0%
ATAGCTGTTAAACTCAACAC+GGG + Chr3:62218185-62218204 None:intergenic 35.0%
ATGCTTATTCATTCGCCATA+TGG - Chr3:62217312-62217331 MsG0380014902.01.T01:CDS 35.0%
ATTTCGCTATGTCAAGAACA+AGG - Chr3:62218285-62218304 MsG0380014902.01.T01:CDS 35.0%
CAAACCAAGTTATCATACTC+GGG + Chr3:62218418-62218437 None:intergenic 35.0%
CAACAACCTTGTCAAATACA+TGG - Chr3:62217992-62218011 MsG0380014902.01.T01:CDS 35.0%
CATAGCTGTTAAACTCAACA+CGG + Chr3:62218186-62218205 None:intergenic 35.0%
CATGTATTTGACAAGGTTGT+TGG + Chr3:62217994-62218013 None:intergenic 35.0%
CTTGACATAGCGAAATTGAA+AGG + Chr3:62218281-62218300 None:intergenic 35.0%
GAATTAAAACAAGCTACAGC+AGG - Chr3:62218664-62218683 MsG0380014902.01.T01:CDS 35.0%
GAGTTTAACAGCTATGACTA+TGG - Chr3:62218190-62218209 MsG0380014902.01.T01:CDS 35.0%
GATCCATGTACAATCATAAC+AGG - Chr3:62217795-62217814 MsG0380014902.01.T01:CDS 35.0%
GGTAGCAACATTAAATCGTT+TGG - Chr3:62217817-62217836 MsG0380014902.01.T01:CDS 35.0%
GTGTTTATAGCCGAAAACAA+GGG - Chr3:62217936-62217955 MsG0380014902.01.T01:CDS 35.0%
GTTTACGAGTACATGGAAAA+AGG - Chr3:62218895-62218914 MsG0380014902.01.T01:CDS 35.0%
GTTTGTCTAAGCTATTGAAC+AGG - Chr3:62219103-62219122 MsG0380014902.01.T01:CDS 35.0%
TACCCTGTTATGATTGTACA+TGG + Chr3:62217801-62217820 None:intergenic 35.0%
TGAATAAGCATTCTCACCTA+CGG + Chr3:62217303-62217322 None:intergenic 35.0%
TGCAGTTATGGTCCAATAAA+TGG - Chr3:62218037-62218056 MsG0380014902.01.T01:CDS 35.0%
TGCATATTGAAAACCCATTC+AGG + Chr3:62219186-62219205 None:intergenic 35.0%
TGTTTATAGCTATGGAGTTG+TGG - Chr3:62219224-62219243 MsG0380014902.01.T01:CDS 35.0%
TTCATGCTTATGTTTGCAAG+TGG - Chr3:62218508-62218527 MsG0380014902.01.T01:CDS 35.0%
TTCATGTTTCTCCACTGATA+GGG + Chr3:62217231-62217250 None:intergenic 35.0%
TTGCATGAAAATTGGAAGCT+TGG + Chr3:62218130-62218149 None:intergenic 35.0%
TTTCGCTATGTCAAGAACAA+GGG - Chr3:62218286-62218305 MsG0380014902.01.T01:CDS 35.0%
TTTGGATGAGTATGTGTTTG+TGG + Chr3:62217486-62217505 None:intergenic 35.0%
! AGACTTACGCTTGATTTTGA+TGG - Chr3:62217905-62217924 MsG0380014902.01.T01:CDS 35.0%
! ATCATCATTTTCCCTATCAG+TGG - Chr3:62217217-62217236 MsG0380014902.01.T01:CDS 35.0%
! CTCAGAGAGTACAAAACAAA+TGG - Chr3:62217545-62217564 MsG0380014902.01.T01:CDS 35.0%
! GTCTTATGCTTCTTTCTAGT+AGG - Chr3:62218547-62218566 MsG0380014902.01.T01:CDS 35.0%
! TTGATTTGAATACCGGTTGT+TGG + Chr3:62219276-62219295 None:intergenic 35.0%
! TTTTAGCCAAGAGATTGGAA+GGG - Chr3:62218687-62218706 MsG0380014902.01.T01:CDS 35.0%
!! AATAACCAAGATTGGTCTCA+AGG - Chr3:62218097-62218116 MsG0380014902.01.T01:CDS 35.0%
!! ACCTTGTGAAATTTTGATCG+GGG + Chr3:62217616-62217635 None:intergenic 35.0%
!! ATAACCAAGATTGGTCTCAA+GGG - Chr3:62218098-62218117 MsG0380014902.01.T01:CDS 35.0%
!! ATTGTTGGTTTACGAGTACA+TGG - Chr3:62218888-62218907 MsG0380014902.01.T01:CDS 35.0%
!! GAGTCAAGAAGTATGTTTTG+AGG + Chr3:62219054-62219073 None:intergenic 35.0%
!! GGAATAGTTGGTATCACTTT+TGG + Chr3:62217657-62217676 None:intergenic 35.0%
!! TATCACTTTTGGACGAAACA+AGG + Chr3:62217646-62217665 None:intergenic 35.0%
!! TCATGAAAGGTTGGTAACAT+GGG - Chr3:62219314-62219333 MsG0380014902.01.T01:CDS 35.0%
!!! GTGTTTTTGAGTGAACCATA+TGG + Chr3:62217330-62217349 None:intergenic 35.0%
AAAAAGCTTGTAGCAGCTAG+AGG + Chr3:62217678-62217697 None:intergenic 40.0%
AAACCAAAGTCTGCAACCTT+AGG + Chr3:62219087-62219106 None:intergenic 40.0%
AACCAAGTTATCATACTCGG+GGG + Chr3:62218416-62218435 None:intergenic 40.0%
AAGAGAAGTGGTTAGTGTCA+GGG - Chr3:62217960-62217979 MsG0380014902.01.T01:CDS 40.0%
AATCGTGACCAACCAGTTAA+CGG - Chr3:62217386-62217405 MsG0380014902.01.T01:CDS 40.0%
ACGATTTGCCATCCAAACAA+CGG + Chr3:62217372-62217391 None:intergenic 40.0%
AGAAAATGTTCGTGTCTTCC+CGG - Chr3:62218061-62218080 MsG0380014902.01.T01:CDS 40.0%
CAAATTTCTCGAGGATTCGA+GGG - Chr3:62219142-62219161 MsG0380014902.01.T01:CDS 40.0%
CAAGAAACTCACTATCTCCT+TGG + Chr3:62218789-62218808 None:intergenic 40.0%
CAATAAACGCTTGAATCTCC+AGG + Chr3:62217740-62217759 None:intergenic 40.0%
CAATCAAGAAGCAAAGGATC+TGG + Chr3:62217764-62217783 None:intergenic 40.0%
CAGATCCTTTGCTTCTTGAT+TGG - Chr3:62217762-62217781 MsG0380014902.01.T01:CDS 40.0%
CATTTGCATGACACAAACCA+AGG - Chr3:62218769-62218788 MsG0380014902.01.T01:CDS 40.0%
CCAAAGACGCAGTTACTAAA+CGG - Chr3:62218325-62218344 MsG0380014902.01.T01:CDS 40.0%
CGTGTTTATAGCCGAAAACA+AGG - Chr3:62217935-62217954 MsG0380014902.01.T01:CDS 40.0%
CTCTGAACTTTGTCGAATGA+AGG + Chr3:62218351-62218370 None:intergenic 40.0%
CTGAAGTTAGCATCATTGGA+AGG - Chr3:62218809-62218828 MsG0380014902.01.T01:CDS 40.0%
CTGGAGATTCAAGCGTTTAT+TGG - Chr3:62217738-62217757 MsG0380014902.01.T01:CDS 40.0%
CTTATGTTTGCAAGTGGCTT+GGG - Chr3:62218514-62218533 MsG0380014902.01.T01:CDS 40.0%
CTTCATGTTTCTCCACTGAT+AGG + Chr3:62217232-62217251 None:intergenic 40.0%
CTTCATTCGACAAAGTTCAG+AGG - Chr3:62218349-62218368 MsG0380014902.01.T01:CDS 40.0%
CTTGCTGAAGTTAGCATCAT+TGG - Chr3:62218805-62218824 MsG0380014902.01.T01:CDS 40.0%
GAATAAGCATTCTCACCTAC+GGG + Chr3:62217302-62217321 None:intergenic 40.0%
TAGCTGTTAAACTCAACACG+GGG + Chr3:62218184-62218203 None:intergenic 40.0%
TATGTTCTAGCATCAGCAAC+CGG - Chr3:62218619-62218638 MsG0380014902.01.T01:CDS 40.0%
TCAAATTTCTCGAGGATTCG+AGG - Chr3:62219141-62219160 MsG0380014902.01.T01:CDS 40.0%
TCAACAACTTGACTCATGGT+AGG + Chr3:62219489-62219508 None:intergenic 40.0%
TCCCCGATCAAAATTTCACA+AGG - Chr3:62217612-62217631 MsG0380014902.01.T01:CDS 40.0%
TCTTGCCAATCAAGAAGCAA+AGG + Chr3:62217770-62217789 None:intergenic 40.0%
TGACTCTGATTATCGACCTA+AGG - Chr3:62219068-62219087 MsG0380014902.01.T01:CDS 40.0%
TTTAGCCAAGAGATTGGAAG+GGG - Chr3:62218688-62218707 MsG0380014902.01.T01:CDS 40.0%
! ATTAGAAGTTGCTTGTTGGG+TGG - Chr3:62219359-62219378 MsG0380014902.01.T01:CDS 40.0%
! GACATTGGCAAATGTTGCTT+TGG - Chr3:62219434-62219453 MsG0380014902.01.T01:CDS 40.0%
!! AAAGGTTGGTAACATGGGTT+AGG - Chr3:62219319-62219338 MsG0380014902.01.T01:CDS 40.0%
!! AAGGTTGGTAACATGGGTTA+GGG - Chr3:62219320-62219339 MsG0380014902.01.T01:CDS 40.0%
!! GTCATGAAAGGTTGGTAACA+TGG - Chr3:62219313-62219332 MsG0380014902.01.T01:CDS 40.0%
!! GTTTTAGCCAAGAGATTGGA+AGG - Chr3:62218686-62218705 MsG0380014902.01.T01:CDS 40.0%
!! TACATGAAGAGTGTTTGGAG+TGG - Chr3:62219007-62219026 MsG0380014902.01.T01:CDS 40.0%
!! TGTTGCTTTGGATTGTGTAC+AGG - Chr3:62219446-62219465 MsG0380014902.01.T01:CDS 40.0%
!! TTGTGAAATTTTGATCGGGG+AGG + Chr3:62217613-62217632 None:intergenic 40.0%
!!! ACTTCTCTTGCCCTTGTTTT+CGG + Chr3:62217949-62217968 None:intergenic 40.0%
AACATTGAACTGTCCTGCGT+CGG + Chr3:62217459-62217478 None:intergenic 45.0%
AATGTGGGGTTATTGTGCAG+AGG - Chr3:62218855-62218874 MsG0380014902.01.T01:CDS 45.0%
ACGCAGGACAGTTCAATGTT+TGG - Chr3:62217459-62217478 MsG0380014902.01.T01:CDS 45.0%
AGGTTACATGGCACCTGAAT+GGG - Chr3:62219170-62219189 MsG0380014902.01.T01:CDS 45.0%
ATGTGGGGTTATTGTGCAGA+GGG - Chr3:62218856-62218875 MsG0380014902.01.T01:CDS 45.0%
ATGTTCTAGCATCAGCAACC+GGG - Chr3:62218620-62218639 MsG0380014902.01.T01:CDS 45.0%
CAAGAGAAGTGGTTAGTGTC+AGG - Chr3:62217959-62217978 MsG0380014902.01.T01:CDS 45.0%
CAATGCTACCGTTGTTTGGA+TGG - Chr3:62217361-62217380 MsG0380014902.01.T01:CDS 45.0%
CATCCAAACAACGGTAGCAT+TGG + Chr3:62217363-62217382 None:intergenic 45.0%
CCGTTTAGTAACTGCGTCTT+TGG + Chr3:62218328-62218347 None:intergenic 45.0%
CCTCTCAACAACTTGACTCA+TGG + Chr3:62219493-62219512 None:intergenic 45.0%
CTTCTCCGTCTTCTCTATGA+TGG - Chr3:62217713-62217732 MsG0380014902.01.T01:CDS 45.0%
GAAAACAAGGGCAAGAGAAG+TGG - Chr3:62217948-62217967 MsG0380014902.01.T01:CDS 45.0%
GACGTTATAGTCTCACCCAA+AGG - Chr3:62217254-62217273 MsG0380014902.01.T01:CDS 45.0%
GAGGTTGCCGGTATTAAGAA+GGG + Chr3:62217429-62217448 None:intergenic 45.0%
GCTTATGTTTGCAAGTGGCT+TGG - Chr3:62218513-62218532 MsG0380014902.01.T01:CDS 45.0%
GTAGCAGCTAGAGGAATAGT+TGG + Chr3:62217669-62217688 None:intergenic 45.0%
GTCGGTTAAAATGAGGTTGC+CGG + Chr3:62217441-62217460 None:intergenic 45.0%
TAGCTATGGAGTTGTGGTGT+TGG - Chr3:62219230-62219249 MsG0380014902.01.T01:CDS 45.0%
TCACCAATGCTACCGTTGTT+TGG - Chr3:62217357-62217376 MsG0380014902.01.T01:CDS 45.0%
TGAGGTTGCCGGTATTAAGA+AGG + Chr3:62217430-62217449 None:intergenic 45.0%
! AGCGTTTTCCGTTAACTGGT+TGG + Chr3:62217397-62217416 None:intergenic 45.0%
! CCATAACTGCAAGTGCTGTT+CGG + Chr3:62218028-62218047 None:intergenic 45.0%
! CCATGAGTCAAGTTGTTGAG+AGG - Chr3:62219490-62219509 MsG0380014902.01.T01:CDS 45.0%
! GTGGTGTTGGAGATGATTAC+CGG - Chr3:62219243-62219262 MsG0380014902.01.T01:CDS 45.0%
! GTTGAGCGTTTTCCGTTAAC+TGG + Chr3:62217401-62217420 None:intergenic 45.0%
!! AAACAACGGTAGCATTGGTG+AGG + Chr3:62217358-62217377 None:intergenic 45.0%
!! AACCTCATTTTAACCGACGC+AGG - Chr3:62217443-62217462 MsG0380014902.01.T01:CDS 45.0%
!! GAAATTTTGATCGGGGAGGA+GGG + Chr3:62217609-62217628 None:intergenic 45.0%
!! GCAGGTTTTAGCCAAGAGAT+TGG - Chr3:62218682-62218701 MsG0380014902.01.T01:CDS 45.0%
!! TGAAATTTTGATCGGGGAGG+AGG + Chr3:62217610-62217629 None:intergenic 45.0%
ACCGGAAAGAGTCCAACAAC+CGG - Chr3:62219261-62219280 MsG0380014902.01.T01:CDS 50.0%
ACCGGTTGTTGGACTCTTTC+CGG + Chr3:62219265-62219284 None:intergenic 50.0%
CAGGGCCATCATAGAGAAGA+CGG + Chr3:62217721-62217740 None:intergenic 50.0%
CCGAACAGCACTTGCAGTTA+TGG - Chr3:62218025-62218044 MsG0380014902.01.T01:CDS 50.0%
CGACCTAAGGTTGCAGACTT+TGG - Chr3:62219081-62219100 MsG0380014902.01.T01:CDS 50.0%
CTCCCCCGAGTATGATAACT+TGG - Chr3:62218411-62218430 MsG0380014902.01.T01:CDS 50.0%
GAGGTTACATGGCACCTGAA+TGG - Chr3:62219169-62219188 MsG0380014902.01.T01:CDS 50.0%
GCTGGAGGAACCGTGTATAA+AGG - Chr3:62218712-62218731 MsG0380014902.01.T01:CDS 50.0%
TCGAGGGACAAGAGGTTACA+TGG - Chr3:62219158-62219177 MsG0380014902.01.T01:CDS 50.0%
TGCACCCTTGAGACCAATCT+TGG + Chr3:62218105-62218124 None:intergenic 50.0%
! ATGTTTGCAAGTGGCTTGGG+CGG - Chr3:62218517-62218536 MsG0380014902.01.T01:CDS 50.0%
!! GTCCTGCGTCGGTTAAAATG+AGG + Chr3:62217448-62217467 None:intergenic 50.0%
ACCTACGGGATAAAAGCCCG+CGG + Chr3:62217288-62217307 None:intergenic 55.0%
CAAGAGATTGGAAGGGGAGC+TGG - Chr3:62218694-62218713 MsG0380014902.01.T01:CDS 55.0%
CAGCTCCCCTTCCAATCTCT+TGG + Chr3:62218696-62218715 None:intergenic 55.0%
CGTCTTCTCTATGATGGCCC+TGG - Chr3:62217719-62217738 MsG0380014902.01.T01:CDS 55.0%
TCGAGGATTCGAGGGACAAG+AGG - Chr3:62219150-62219169 MsG0380014902.01.T01:CDS 55.0%
! AAGTGGCTTGGGCGGAATTG+AGG - Chr3:62218525-62218544 MsG0380014902.01.T01:CDS 55.0%
! ACCCAAAGGCACATTCACCG+CGG - Chr3:62217268-62217287 MsG0380014902.01.T01:CDS 55.0%
CCCGCGGTGAATGTGCCTTT+GGG + Chr3:62217272-62217291 None:intergenic 60.0%
GAGATTGGAAGGGGAGCTGG+AGG - Chr3:62218697-62218716 MsG0380014902.01.T01:CDS 60.0%
! ACCGCGGGCTTTTATCCCGT+AGG - Chr3:62217284-62217303 MsG0380014902.01.T01:CDS 60.0%
! CCCAAAGGCACATTCACCGC+GGG - Chr3:62217269-62217288 MsG0380014902.01.T01:CDS 60.0%
!! TCGGGGAGGAGGGTATCTGT+TGG + Chr3:62217599-62217618 None:intergenic 60.0%
GCCCGCGGTGAATGTGCCTT+TGG + Chr3:62217273-62217292 None:intergenic 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 62217158 62219539 62217158 ID=MsG0380014902.01;Name=MsG0380014902.01
Chr3 mRNA 62217158 62219539 62217158 ID=MsG0380014902.01.T01;Parent=MsG0380014902.01;Name=MsG0380014902.01.T01;_AED=0.48;_eAED=0.48;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|793
Chr3 exon 62217158 62219539 62217158 ID=MsG0380014902.01.T01:exon:6522;Parent=MsG0380014902.01.T01
Chr3 CDS 62217158 62219539 62217158 ID=MsG0380014902.01.T01:cds;Parent=MsG0380014902.01.T01
Gene Sequence

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Protein sequence

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