AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680035722.01

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MsG0680035722.01.T01 AT5G45260 32.148 675 394 17 168 795 172 829 2.84e-73 268
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MsG0680035722.01.T01 AT5G45050 31.643 572 339 12 145 674 3 564 3.51e-71 261
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MsG0680035722.01.T01 AT4G36150 27.582 823 480 23 166 909 234 1019 8.35e-67 247
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MsG0680035722.01.T01 AT5G46490 31.703 511 274 11 17 465 65 562 3.82e-65 233
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MsG0680035722.01.T01 AT5G45060 40.994 161 84 5 1 161 1 150 1.85e-22 105
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MsG0680035722.01.T01 AT1G27180 34.078 179 93 7 8 180 4 163 7.71e-21 100
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MsG0680035722.01.T01 AT4G16990 31.770 469 249 10 12 431 1 447 2.31e-57 214
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MsG0680035722.01.T01 AT4G16990 31.278 454 241 10 27 431 16 447 2.14e-53 202
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MsG0680035722.01.T01 AT4G12020 28.336 607 355 15 20 573 668 1247 2.41e-52 202
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MsG0680035722.01.T01 AT1G17615 31.638 354 182 4 20 321 15 360 3.00e-50 183
MsG0680035722.01.T01 AT1G66090 30.127 395 213 7 20 359 26 412 5.01e-50 184
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MsG0680035722.01.T01 AT5G45220 37.725 167 102 2 20 186 331 495 5.19e-24 108
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MsG0680035722.01.T01 AT4G09435 27.517 298 173 9 528 790 28 317 4.86e-15 79.7
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MsG0680035722.01.T01 AT4G09435 27.517 298 173 9 528 790 28 317 7.07e-15 79.3
MsG0680035722.01.T01 AT5G35450 25.424 354 213 16 83 403 92 427 2.22e-14 79.0
MsG0680035722.01.T01 AT5G35450 25.424 354 213 16 83 403 92 427 2.22e-14 79.0
MsG0680035722.01.T01 AT1G51480 26.144 306 191 11 136 415 131 427 2.32e-14 78.6
MsG0680035722.01.T01 AT1G61105 34.615 104 64 1 18 121 27 126 2.07e-13 70.5
MsG0680035722.01.T01 AT5G05400 24.851 503 319 19 135 606 153 627 4.09e-13 74.7
MsG0680035722.01.T01 AT5G44920 31.544 149 91 3 22 161 13 159 4.51e-13 71.2
MsG0680035722.01.T01 AT5G05400 25.106 470 304 17 168 606 6 458 9.16e-13 73.2
MsG0680035722.01.T01 AT5G05400 25.106 470 304 17 168 606 6 458 9.16e-13 73.2
MsG0680035722.01.T01 AT5G48620 24.792 480 269 24 142 550 162 620 1.07e-12 73.2
MsG0680035722.01.T01 AT5G48620 24.792 480 269 24 142 550 162 620 1.07e-12 73.2
MsG0680035722.01.T01 AT5G48620 24.792 480 269 24 142 550 162 620 1.07e-12 73.2
MsG0680035722.01.T01 AT5G48620 24.792 480 269 24 142 550 162 620 1.07e-12 73.2
MsG0680035722.01.T01 AT5G48620 24.792 480 269 24 142 550 162 620 1.07e-12 73.2
MsG0680035722.01.T01 AT5G48620 24.792 480 269 24 142 550 162 620 1.07e-12 73.2
MsG0680035722.01.T01 AT1G12290 26.176 340 204 15 94 403 53 375 1.13e-12 73.2
MsG0680035722.01.T01 AT1G12290 26.176 340 204 15 94 403 53 375 1.13e-12 73.2
MsG0680035722.01.T01 AT1G12290 26.176 340 204 15 94 403 53 375 1.13e-12 73.2
MsG0680035722.01.T01 AT1G12290 26.176 340 204 15 94 403 95 417 1.18e-12 73.2
MsG0680035722.01.T01 AT3G50950 25.150 334 202 13 95 403 115 425 1.36e-12 72.8
MsG0680035722.01.T01 AT3G50950 25.150 334 202 13 95 403 115 425 1.36e-12 72.8
MsG0680035722.01.T01 AT4G27220 27.049 244 168 5 167 403 133 373 1.46e-12 72.8
MsG0680035722.01.T01 AT4G27220 27.049 244 168 5 167 403 141 381 1.51e-12 72.8
MsG0680035722.01.T01 AT5G63020 26.316 266 175 9 160 410 164 423 2.09e-12 72.4
MsG0680035722.01.T01 AT1G12280 27.381 252 165 9 171 410 179 424 3.74e-12 71.6
MsG0680035722.01.T01 AT5G43470 26.207 290 168 12 142 403 162 433 4.21e-12 71.2
MsG0680035722.01.T01 AT5G43470 26.207 290 168 12 142 403 162 433 4.21e-12 71.2
MsG0680035722.01.T01 AT5G43470 26.207 290 168 12 142 403 162 433 4.21e-12 71.2
MsG0680035722.01.T01 AT5G43470 26.207 290 168 12 142 403 162 433 4.21e-12 71.2
MsG0680035722.01.T01 AT5G44920 35.455 110 69 2 22 131 13 120 7.42e-12 67.4
MsG0680035722.01.T01 AT3G07040 22.873 529 330 20 170 630 195 713 1.04e-11 70.1
MsG0680035722.01.T01 AT4G10780 23.019 265 184 6 164 424 169 417 1.47e-11 69.7
MsG0680035722.01.T01 AT4G10780 23.019 265 184 6 164 424 169 417 1.51e-11 69.7
MsG0680035722.01.T01 AT1G59620 26.667 300 186 12 127 403 7 295 1.66e-11 69.3
MsG0680035722.01.T01 AT4G23510 28.485 165 103 4 11 162 1 163 1.78e-11 68.9
MsG0680035722.01.T01 AT4G23510 28.485 165 103 4 11 162 1 163 1.91e-11 68.9
MsG0680035722.01.T01 AT4G23510 28.485 165 103 4 11 162 1 163 2.11e-11 68.9
MsG0680035722.01.T01 AT3G14470 23.183 509 345 18 131 608 165 658 2.29e-11 68.9
MsG0680035722.01.T01 AT3G14470 23.183 509 345 18 131 608 165 658 2.29e-11 68.9
MsG0680035722.01.T01 AT4G26090 24.701 251 171 6 171 410 178 421 4.88e-11 67.8

Find 229 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 343 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CAAACTTGTATATTTAAATT+TGG 0.143373 6:-111224417 MsG0680035722.01.T01:CDS
CGAGATTCCTATCATGAATT+TGG 0.157554 6:-111223870 MsG0680035722.01.T01:CDS
AAAGCTTGTTTACTTGAATT+TGG 0.161669 6:-111224801 MsG0680035722.01.T01:CDS
TGTTCCCTCTCACCCAATTT+TGG 0.166405 6:+111224257 None:intergenic
TCTTCCCAATTTGAGAAAAT+TGG 0.173572 6:-111225020 MsG0680035722.01.T01:CDS
CTACCTGTGTTGAAATTATT+AGG 0.186356 6:-111222191 MsG0680035722.01.T01:CDS
TCGCTAGAGAGATTAAATTT+AGG 0.198810 6:-111224482 MsG0680035722.01.T01:CDS
TATGAGTAATTATCAAAATT+TGG 0.208664 6:-111225978 MsG0680035722.01.T01:CDS
ATCATGTAATCTATAAAATT+TGG 0.208792 6:+111226339 None:intergenic
GGCTCCGATGTGTAAGATTA+TGG 0.218139 6:-111223718 MsG0680035722.01.T01:CDS
GAGATGAATGATTCTTGTTC+TGG 0.245682 6:+111223669 None:intergenic
CGCTAGAGAGATTAAATTTA+GGG 0.249966 6:-111224481 MsG0680035722.01.T01:CDS
AGACCTCCATTTAGAATTAC+TGG 0.264813 6:+111223936 None:intergenic
CTTCCTTCTCCTACCACTAT+TGG 0.269747 6:-111224362 MsG0680035722.01.T01:CDS
GATGAAAGTGTAACAGAAAA+TGG 0.279945 6:-111222941 MsG0680035722.01.T01:CDS
TTGTTATTGTCATGCATAAT+AGG 0.280334 6:+111224071 None:intergenic
CGAAAGCAAAGTGGGATTTA+TGG 0.291184 6:-111226932 MsG0680035722.01.T01:CDS
CAAATTTAAATATACAAGTT+TGG 0.295972 6:+111224418 None:intergenic
CACTAAATCGATGACATATT+TGG 0.302540 6:+111226386 None:intergenic
AATGATTCTTGTTCTGGTCT+TGG 0.307907 6:+111223675 None:intergenic
CCTTCTGATTCTGTGATAAC+AGG 0.311582 6:+111222812 None:intergenic
CAATGTTAAGATGGAGAATA+TGG 0.312766 6:-111225522 MsG0680035722.01.T01:intron
CCATTAGCAATTAAAGTATT+GGG 0.313792 6:-111225923 MsG0680035722.01.T01:CDS
CAACTAATTTGATACGAAAT+AGG 0.316689 6:-111226237 MsG0680035722.01.T01:CDS
GAGTTTCAACCTGACACTTT+TGG 0.322073 6:-111223585 MsG0680035722.01.T01:CDS
GATCAATTCTACAAGTTCAT+TGG 0.325920 6:+111225198 None:intergenic
CAAGCAAAGAGCCAAGAAAA+TGG 0.333210 6:-111225574 MsG0680035722.01.T01:CDS
CGAAAGTGTTTAACAATTCA+AGG 0.334985 6:-111224694 MsG0680035722.01.T01:CDS
ATCAATTCTACAAGTTCATT+GGG 0.337215 6:+111225199 None:intergenic
CCCAATACTTTAATTGCTAA+TGG 0.337379 6:+111225923 None:intergenic
AATTTGAATGTCGTCAAAAT+AGG 0.338644 6:+111224169 None:intergenic
TACCTGTGTTGAAATTATTA+GGG 0.339369 6:-111222190 MsG0680035722.01.T01:CDS
GATGTGTTTGTCACCTTTAG+AGG 0.341774 6:-111227235 MsG0680035722.01.T01:CDS
CAACAATCACATATCGATAA+TGG 0.345394 6:-111222890 MsG0680035722.01.T01:CDS
ACCATTAGCAATTAAAGTAT+TGG 0.348541 6:-111225924 MsG0680035722.01.T01:CDS
TTCCTTCTCCTACCACTATT+GGG 0.348921 6:-111224361 MsG0680035722.01.T01:CDS
GTGGAGTTGGATCCATCTAT+TGG 0.351554 6:-111224833 MsG0680035722.01.T01:CDS
GTGGAGTTGGATCCATCTAT+TGG 0.351554 6:-111224905 MsG0680035722.01.T01:CDS
GAATCTTGAGCGGTTAGATT+TGG 0.354491 6:-111224945 MsG0680035722.01.T01:CDS
ATTGTTCCAGTAATTCTAAA+TGG 0.362826 6:-111223942 MsG0680035722.01.T01:CDS
TTTGGAACATTGCAAGTTGT+TGG 0.364378 6:-111224399 MsG0680035722.01.T01:CDS
CAATGAGATTGATGCTAGTT+TGG 0.365513 6:-111222646 MsG0680035722.01.T01:CDS
TGTGGATTTCATGCTGATAT+TGG 0.365713 6:-111225701 MsG0680035722.01.T01:CDS
GCATCAATCTCATTGCTATC+TGG 0.367078 6:+111222654 None:intergenic
ATTTGTGGGATGGGAGGAAT+AGG 0.368214 6:-111226439 MsG0680035722.01.T01:CDS
TATTGAAATGCATTCTTTGT+TGG 0.373807 6:-111225630 MsG0680035722.01.T01:CDS
ATGTGATTGTTGTTCATCTT+CGG 0.387355 6:+111222901 None:intergenic
GTATTGGGCTCATTCTTGTT+TGG 0.389812 6:-111225908 MsG0680035722.01.T01:CDS
GGATAACACTAATCTTCAAC+AGG 0.391318 6:-111227140 MsG0680035722.01.T01:CDS
TGTGGATCAAGTTGAACAAT+TGG 0.391724 6:-111226179 MsG0680035722.01.T01:CDS
ACTCTCACAAGGTGTCAATA+TGG 0.400031 6:-111226871 MsG0680035722.01.T01:CDS
GTTGATAGTGTTCGTGCTAT+AGG 0.400789 6:-111226463 MsG0680035722.01.T01:intron
GAAGATATGTGAATGCGTTA+AGG 0.404856 6:-111227008 MsG0680035722.01.T01:CDS
GTATGGAGGTGAAGAGTTGC+GGG 0.408987 6:-111223809 MsG0680035722.01.T01:CDS
AACAGCATATCTAATTCTAA+TGG 0.409732 6:-111222278 MsG0680035722.01.T01:CDS
ACACCTTGTGAGAGTCTTGT+TGG 0.415088 6:+111226879 None:intergenic
AATAGGCAGGGTAGGGTTGT+TGG 0.415703 6:+111224186 None:intergenic
TCATTGGGGTGAAAATTTGA+TGG 0.420208 6:+111225214 None:intergenic
AAAATTTGATGGCAAATACT+TGG 0.420717 6:+111225225 None:intergenic
ATGGATGATACAATGCATTC+AGG 0.422194 6:-111224213 MsG0680035722.01.T01:CDS
GACATTCAAATTGTTATTCC+AGG 0.424179 6:-111224158 MsG0680035722.01.T01:CDS
AAATCTAACCGCTCAAGATT+CGG 0.424404 6:+111224947 None:intergenic
AATTTCTTTGAAAGACTCCT+TGG 0.425326 6:+111225277 None:intergenic
TGGGTGAGAGGGAACATTGC+AGG 0.426081 6:-111224250 MsG0680035722.01.T01:CDS
GAGATACTGAATTATGCTAA+TGG 0.426623 6:-111225950 MsG0680035722.01.T01:CDS
GCGTCGTGAATGGTTAGGTT+CGG 0.427506 6:-111226143 MsG0680035722.01.T01:CDS
GTAGCAGCCTCATACAACTA+TGG 0.427597 6:-111225168 MsG0680035722.01.T01:CDS
CTTGTTCATTTGAATTTGAA+AGG 0.429278 6:-111224869 MsG0680035722.01.T01:CDS
AGCATACCAAACAACATATT+CGG 0.430271 6:-111224758 MsG0680035722.01.T01:CDS
TGTAATGATTGTATATTTGA+TGG 0.431826 6:+111226263 None:intergenic
CTAAGACCGAATATGTTGTT+TGG 0.432671 6:+111224752 None:intergenic
CGAAGATAGAGGACGTTGAT+CGG 0.434045 6:+111224630 None:intergenic
GCTCCGATGTGTAAGATTAT+GGG 0.434959 6:-111223717 MsG0680035722.01.T01:CDS
GACAATAACAATGATATCAT+AGG 0.436157 6:-111224059 MsG0680035722.01.T01:CDS
CCTGAGGGAAGCGTGAATAA+AGG 0.440001 6:-111222600 MsG0680035722.01.T01:intron
GAAGATAGAGGACGTTGATC+GGG 0.440123 6:+111224631 None:intergenic
ATTCAATTGCATAAGGAACT+TGG 0.440163 6:+111224513 None:intergenic
AAACAATGTGTGAGCCTTGT+TGG 0.441124 6:+111224569 None:intergenic
CTCTGATTGTTGATCCAACT+TGG 0.443481 6:+111224125 None:intergenic
CAAATTCATGATAGGAATCT+CGG 0.445632 6:+111223871 None:intergenic
TCTTTGTTCCCTCCCAATAG+TGG 0.446013 6:+111224349 None:intergenic
TCGAGCAATCGAAGGATCTC+AGG 0.446504 6:-111227092 MsG0680035722.01.T01:CDS
AGTGGGGAGTATCGCTGGTT+GGG 0.448604 6:-111226831 MsG0680035722.01.T01:CDS
GAGCATATATTGAAAGGGTA+TGG 0.456423 6:-111226091 MsG0680035722.01.T01:CDS
CGTCGTGAATGGTTAGGTTC+GGG 0.458296 6:-111226142 MsG0680035722.01.T01:CDS
AAGATATGTGAATGCGTTAA+GGG 0.459150 6:-111227007 MsG0680035722.01.T01:CDS
CCTTTATTCACGCTTCCCTC+AGG 0.461809 6:+111222600 None:intergenic
TGAAGATGAGTTGCTGCTGC+TGG 0.462687 6:+111227291 None:intergenic
GGATCAACATCATAGAAAAC+AGG 0.462692 6:+111226965 None:intergenic
TTCACTATATTTCAAAACTA+CGG 0.462810 6:+111225381 None:intergenic
CGTAAACATTCAATTGCATA+AGG 0.466100 6:+111224506 None:intergenic
CTTTGCTTTCGCACCTCAGA+AGG 0.466344 6:+111226944 None:intergenic
GAGATTGATGCTAGTTTGGC+TGG 0.466531 6:-111222642 MsG0680035722.01.T01:CDS
GATGAATCATGAAAATTCCT+TGG 0.471650 6:-111223739 MsG0680035722.01.T01:CDS
ATTAGATATGCTGTTGGTCT+CGG 0.472282 6:+111222286 None:intergenic
AATTATTAGGGATGTGGGTA+CGG 0.472505 6:-111222178 MsG0680035722.01.T01:CDS
ATTTCTTTGAAAGACTCCTT+GGG 0.472834 6:+111225278 None:intergenic
ATCAGCCACTTCAACGGTAG+AGG 0.475866 6:+111222961 None:intergenic
CAAATCCTACTTGAAACTCT+TGG 0.476222 6:-111226295 MsG0680035722.01.T01:CDS
TGTAAGATTATGGGAATTGA+AGG 0.478297 6:-111223708 MsG0680035722.01.T01:CDS
TTTGTTAGAAGTCCAATAGA+TGG 0.478833 6:+111224821 None:intergenic
TTTGTTAGAAGTCCAATAGA+TGG 0.478833 6:+111224893 None:intergenic
TGAAGAGTTGCGGGTATCGT+TGG 0.484573 6:-111223800 MsG0680035722.01.T01:CDS
GCGAGTATCGTCACCTCTAA+AGG 0.484893 6:+111227222 None:intergenic
TGTGAATGCGTTAAGGGATC+GGG 0.486797 6:-111227001 MsG0680035722.01.T01:CDS
GTTCGTGCTATAGGAATTTG+TGG 0.487187 6:-111226454 MsG0680035722.01.T01:CDS
CGACAAAATCAAGTCACCTA+TGG 0.488286 6:-111223908 MsG0680035722.01.T01:CDS
AAATTCATGATAGGAATCTC+GGG 0.491247 6:+111223872 None:intergenic
TCGATTGCTCGAAGAAGCTC+AGG 0.493540 6:+111227103 None:intergenic
TGAATGTCGTCAAAATAGGC+AGG 0.496533 6:+111224173 None:intergenic
ATGTGAATGCGTTAAGGGAT+CGG 0.496761 6:-111227002 MsG0680035722.01.T01:CDS
ATCTTAGATTACTCATCAGC+AGG 0.497186 6:-111225324 MsG0680035722.01.T01:CDS
ATGTATAAACCTTGTGGAGT+TGG 0.499161 6:-111224918 MsG0680035722.01.T01:CDS
TCTTCAATCTGTGCTGCGAC+AGG 0.499501 6:+111222323 None:intergenic
AGAAATGAGCATATATTGAA+AGG 0.499614 6:-111226097 MsG0680035722.01.T01:CDS
GATGAAAAGCACTCTCGATA+AGG 0.499918 6:+111224005 None:intergenic
GAAGAGTTGCGGGTATCGTT+GGG 0.500191 6:-111223799 MsG0680035722.01.T01:CDS
GTAATGATTGTATATTTGAT+GGG 0.502136 6:+111226264 None:intergenic
AAATAGCTGTGCGTCGTGAA+TGG 0.502774 6:-111226153 MsG0680035722.01.T01:CDS
CAAGAAAATGGAGCAGGTTG+TGG 0.505275 6:-111225562 MsG0680035722.01.T01:CDS
GGTATGGAGGTGAAGAGTTG+CGG 0.509927 6:-111223810 MsG0680035722.01.T01:CDS
ACAATTCTACAATGTTAAGA+TGG 0.511973 6:-111225531 MsG0680035722.01.T01:CDS
AAATAGGCTAAGTCGTGAAA+AGG 0.513205 6:-111226221 MsG0680035722.01.T01:CDS
GAAATGAGCATATATTGAAA+GGG 0.515471 6:-111226096 MsG0680035722.01.T01:CDS
CATTCTTTGTTGGCAGAGCT+AGG 0.524026 6:-111225620 MsG0680035722.01.T01:CDS
TGTTGAAATTATTAGGGATG+TGG 0.524612 6:-111222184 MsG0680035722.01.T01:CDS
CTATGATGTTGATCCTTCTG+AGG 0.525723 6:-111226957 MsG0680035722.01.T01:CDS
TCGAAGAAGCTCAGGACCTA+TGG 0.526695 6:+111227111 None:intergenic
CAAGTTTGGAAAGCTTCCTC+AGG 0.528626 6:+111224432 None:intergenic
CTAATAATTTCAACACAGGT+AGG 0.534208 6:+111222192 None:intergenic
ACATTCATAACATCATCATC+TGG 0.534540 6:+111225836 None:intergenic
AAGAGCCAAGAAAATGGAGC+AGG 0.535330 6:-111225568 MsG0680035722.01.T01:CDS
CGATGAATGGTGAGGCAACA+TGG 0.537363 6:+111224601 None:intergenic
CTTCAACAGGGTGAGTCCAT+AGG 0.537460 6:-111227127 MsG0680035722.01.T01:CDS
CTTGAGCGGTTAGATTTGGA+AGG 0.537468 6:-111224941 MsG0680035722.01.T01:CDS
AACAAAGATGACTGGACCAC+AGG 0.542430 6:-111224299 MsG0680035722.01.T01:CDS
CCTTCTGATTCTTGATAATG+TGG 0.543639 6:-111226197 MsG0680035722.01.T01:CDS
AGGCAAAACAACCCTTGCTA+TGG 0.543876 6:-111226419 MsG0680035722.01.T01:CDS
TGCTATAGGAATTTGTGGGA+TGG 0.544410 6:-111226449 MsG0680035722.01.T01:CDS
TGATTCTGTGATAACAGGGA+TGG 0.544556 6:+111222817 None:intergenic
ATGTGTAAACCTTGTGGAGT+TGG 0.544816 6:-111224846 MsG0680035722.01.T01:CDS
TACTCATCAGCAGGAAAGGT+GGG 0.547005 6:-111225315 MsG0680035722.01.T01:CDS
CATGGTCCATTCGAAGATAG+AGG 0.547508 6:+111224619 None:intergenic
GTCGTCAAAATAGGCAGGGT+AGG 0.548609 6:+111224178 None:intergenic
GCTATAGGAATTTGTGGGAT+GGG 0.549360 6:-111226448 MsG0680035722.01.T01:CDS
ATCGTATGAACAAAGATGAC+TGG 0.550155 6:-111224307 MsG0680035722.01.T01:CDS
TTTGATGGCAAATACTTGGA+AGG 0.551280 6:+111225229 None:intergenic
GGTCATATAAAGCCATAGCA+AGG 0.553483 6:+111226407 None:intergenic
TTGGTCGTAATGTGACTGAA+TGG 0.553787 6:-111225889 MsG0680035722.01.T01:CDS
TTCATTCAAGCACCATGTTG+AGG 0.554286 6:+111227036 None:intergenic
CTATGCCAAGAGTTTCAAGT+AGG 0.556567 6:+111226290 None:intergenic
TTGTCCAAAATTGGGTGAGA+GGG 0.556777 6:-111224261 MsG0680035722.01.T01:CDS
AGATTACTCATCAGCAGGAA+AGG 0.556898 6:-111225319 MsG0680035722.01.T01:CDS
TTCTCCTACCACTATTGGGA+GGG 0.557718 6:-111224357 MsG0680035722.01.T01:CDS
GATTCATCCTGATTCAAAAG+TGG 0.558107 6:+111226046 None:intergenic
TCAAACCTCTACCGTTGAAG+TGG 0.560216 6:-111222966 MsG0680035722.01.T01:CDS
CAGGAAGTAAAATACCAAGT+TGG 0.565557 6:-111224139 MsG0680035722.01.T01:CDS
TTTATGTTGCAGTCTTCTCA+AGG 0.566175 6:-111227069 MsG0680035722.01.T01:CDS
AAGAAAGAAGAAACAACAGA+TGG 0.573213 6:-111223627 MsG0680035722.01.T01:CDS
TTGGATCAACAATCAGAGCA+TGG 0.575105 6:-111224120 MsG0680035722.01.T01:CDS
ATTGTCCAAAATTGGGTGAG+AGG 0.577943 6:-111224262 MsG0680035722.01.T01:CDS
GATTCTGTGATAACAGGGAT+GGG 0.581883 6:+111222818 None:intergenic
CTTCTGATTCTGTGATAACA+GGG 0.582404 6:+111222813 None:intergenic
TCGTCAAAATAGGCAGGGTA+GGG 0.582517 6:+111224179 None:intergenic
AAGTGATGATTTCTCTCCTG+AGG 0.583026 6:-111222616 MsG0680035722.01.T01:CDS
CTGAGGTGCGAAAGCAAAGT+GGG 0.583979 6:-111226940 MsG0680035722.01.T01:CDS
AAGTGGGGAGTATCGCTGGT+TGG 0.584234 6:-111226832 MsG0680035722.01.T01:CDS
TTGGAAAGCTTCCTCAGGCT+AGG 0.585608 6:+111224437 None:intergenic
TTTGAAATATAGTGAAGAGG+TGG 0.586711 6:-111225374 MsG0680035722.01.T01:CDS
TGTTCCCTCCCAATAGTGGT+AGG 0.587915 6:+111224353 None:intergenic
ATAGGAATTTGTGGGATGGG+AGG 0.587948 6:-111226445 MsG0680035722.01.T01:CDS
AATTCTAATGGACAAACAGA+AGG 0.588577 6:-111222266 MsG0680035722.01.T01:CDS
GTGGTAGGAGAAGGAAGTTG+AGG 0.588904 6:+111224368 None:intergenic
AATCTTACACATCGGAGCCA+AGG 0.588970 6:+111223722 None:intergenic
CTAGAGAGATTAAATTTAGG+GGG 0.591964 6:-111224479 MsG0680035722.01.T01:CDS
ATCACATATCGATAATGGAA+AGG 0.592304 6:-111222885 MsG0680035722.01.T01:CDS
CAACGTCCTCTATCTTCGAA+TGG 0.592401 6:-111224625 MsG0680035722.01.T01:CDS
ATTAGAATTAGATATGCTGT+TGG 0.592709 6:+111222280 None:intergenic
CTCACAAGGTGTCAATATGG+AGG 0.594304 6:-111226868 MsG0680035722.01.T01:CDS
GAGCTTCTTCGAGCAATCGA+AGG 0.594602 6:-111227100 MsG0680035722.01.T01:CDS
CTCCCAATAGTGGTAGGAGA+AGG 0.595456 6:+111224359 None:intergenic
CCACATTATCAAGAATCAGA+AGG 0.595484 6:+111226197 None:intergenic
GTTGAAATTATTAGGGATGT+GGG 0.596951 6:-111222183 MsG0680035722.01.T01:CDS
AGTGATGATTTCTCTCCTGA+GGG 0.599206 6:-111222615 MsG0680035722.01.T01:CDS
ACAACAGATGGATCACAAGA+AGG 0.601219 6:-111223615 MsG0680035722.01.T01:CDS
CAAACAGAAGGCTCGAGTGA+AGG 0.602195 6:-111222254 MsG0680035722.01.T01:CDS
TGCTTACTAGATTATAGCAA+CGG 0.602395 6:+111224777 None:intergenic
TGGATCAACAATCAGAGCAT+GGG 0.603011 6:-111224119 MsG0680035722.01.T01:CDS
GGAACTATGCTTCCTCAACA+TGG 0.603254 6:-111227048 MsG0680035722.01.T01:CDS
GCTGTGCGTCGTGAATGGTT+AGG 0.605338 6:-111226148 MsG0680035722.01.T01:CDS
TTACTCATCAGCAGGAAAGG+TGG 0.606087 6:-111225316 MsG0680035722.01.T01:CDS
TTGGAGCCGAAAACGATGAA+TGG 0.606242 6:+111224588 None:intergenic
GTCATATAAAGCCATAGCAA+GGG 0.610148 6:+111226408 None:intergenic
GTTCCAGTAATTCTAAATGG+AGG 0.610687 6:-111223939 MsG0680035722.01.T01:CDS
CTTCTCCTACCACTATTGGG+AGG 0.613152 6:-111224358 MsG0680035722.01.T01:CDS
GGAAGGATGTATAAACCTTG+TGG 0.615150 6:-111224924 MsG0680035722.01.T01:CDS
CACATTATCAAGAATCAGAA+GGG 0.615373 6:+111226198 None:intergenic
TAATAATTTCAACACAGGTA+GGG 0.616110 6:+111222193 None:intergenic
AGATTACATGATGGTCCACT+CGG 0.616364 6:-111226328 MsG0680035722.01.T01:CDS
ATCCCTAATAATTTCAACAC+AGG 0.617793 6:+111222188 None:intergenic
ACTTTCATCAGCCACTTCAA+CGG 0.619646 6:+111222955 None:intergenic
TATTAGGGATGTGGGTACGG+AGG 0.621024 6:-111222175 MsG0680035722.01.T01:CDS
TTCGTGCTATAGGAATTTGT+GGG 0.624349 6:-111226453 MsG0680035722.01.T01:CDS
ATTGAAAATGATCAATCCTG+TGG 0.627451 6:+111224283 None:intergenic
TAATGATTGTATATTTGATG+GGG 0.627592 6:+111226265 None:intergenic
GCACTCTCGATAAGGTGCCA+AGG 0.630764 6:+111224013 None:intergenic
CCTGTTATCACAGAATCAGA+AGG 0.632285 6:-111222812 MsG0680035722.01.T01:intron
TATATTGAAAGGGTATGGAG+TGG 0.637220 6:-111226086 MsG0680035722.01.T01:CDS
GAGAGTTTCCGAATCTTGAG+CGG 0.637648 6:-111224955 MsG0680035722.01.T01:CDS
GAATGTCGTCAAAATAGGCA+GGG 0.637882 6:+111224174 None:intergenic
TGTCGCAGCACAGATTGAAG+AGG 0.640548 6:-111222321 MsG0680035722.01.T01:CDS
TCTGAGGTGCGAAAGCAAAG+TGG 0.643874 6:-111226941 MsG0680035722.01.T01:CDS
GCTAGAGAGATTAAATTTAG+GGG 0.644263 6:-111224480 MsG0680035722.01.T01:CDS
TCACAAGGTGTCAATATGGA+GGG 0.645083 6:-111226867 MsG0680035722.01.T01:CDS
GAAAGGATGTGTAAACCTTG+TGG 0.651728 6:-111224852 MsG0680035722.01.T01:CDS
AATTCATGATAGGAATCTCG+GGG 0.657442 6:+111223873 None:intergenic
TTGTGACACTACCTAGCCTG+AGG 0.661368 6:-111224448 MsG0680035722.01.T01:CDS
GGAATATCACAAGAAGCCCA+AGG 0.665445 6:-111225294 MsG0680035722.01.T01:CDS
CTTGAAGATCTAAATATGTG+TGG 0.666848 6:-111224725 MsG0680035722.01.T01:CDS
CAAGGTGTCAATATGGAGGG+AGG 0.670014 6:-111226864 MsG0680035722.01.T01:CDS
TAGATGGATCCAACTCCACA+AGG 0.674201 6:+111224837 None:intergenic
TAGATGGATCCAACTCCACA+AGG 0.674201 6:+111224909 None:intergenic
ATTCCCATAATCTTACACAT+CGG 0.675926 6:+111223714 None:intergenic
GACTGAATGGAAGAGTGCGT+TGG 0.679667 6:-111225876 MsG0680035722.01.T01:CDS
GCCGAAAACGATGAATGGTG+AGG 0.689533 6:+111224593 None:intergenic
TCAATTCTACAAGTTCATTG+GGG 0.690502 6:+111225200 None:intergenic
ATTCCAACAAGACTCTCACA+AGG 0.714048 6:-111226882 MsG0680035722.01.T01:CDS
GATAACACTAATCTTCAACA+GGG 0.770824 6:-111227139 MsG0680035722.01.T01:CDS
ATTCATGATAGGAATCTCGG+GGG 0.776291 6:+111223874 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! ATTTATAGTTTTGATAAAAA+TGG + Chr6:111224005-111224024 None:intergenic 10.0%
!!! TAAGTAATTTATAGTTTTTT+TGG - Chr6:111222673-111222692 MsG0680035722.01.T01:CDS 10.0%
!!! TTTATAAAGTTTTCTTTTTT+GGG - Chr6:111225982-111226001 MsG0680035722.01.T01:CDS 10.0%
!!! TTTTATAAAGTTTTCTTTTT+TGG - Chr6:111225981-111226000 MsG0680035722.01.T01:CDS 10.0%
!! ACAATTTAATGTAATCATAT+TGG - Chr6:111226091-111226110 MsG0680035722.01.T01:CDS 15.0%
!! ATCATGTAATCTATAAAATT+TGG + Chr6:111223131-111223150 None:intergenic 15.0%
!! CAAACTTGTATATTTAAATT+TGG - Chr6:111225050-111225069 MsG0680035722.01.T01:intron 15.0%
!! CAAATTTAAATATACAAGTT+TGG + Chr6:111225052-111225071 None:intergenic 15.0%
!! TATGAGTAATTATCAAAATT+TGG - Chr6:111223489-111223508 MsG0680035722.01.T01:intron 15.0%
!! TCAAACAATAATGAATATAT+TGG - Chr6:111222895-111222914 MsG0680035722.01.T01:CDS 15.0%
!! TTACATAAAATTGATTGATT+CGG + Chr6:111227033-111227052 None:intergenic 15.0%
!!! AAATTTTATAGATTACATGA+TGG - Chr6:111223130-111223149 MsG0680035722.01.T01:intron 15.0%
!!! ATTATAGTTTTCTTTAACTT+TGG - Chr6:111227074-111227093 MsG0680035722.01.T01:CDS 15.0%
!!! TCAAATATTTTTTTTGAACA+AGG + Chr6:111225951-111225970 None:intergenic 15.0%
!!! TCATTTTCTTAAATTAGTAT+TGG + Chr6:111226070-111226089 None:intergenic 15.0%
!!! TTTTTTTGGTAGTAAATATA+AGG - Chr6:111222687-111222706 MsG0680035722.01.T01:intron 15.0%
!! AAAAACATTCTAAATTGTTG+TGG - Chr6:111223748-111223767 MsG0680035722.01.T01:CDS 20.0%
!! CTAAAAACATTTCTGTATTT+CGG - Chr6:111222305-111222324 MsG0680035722.01.T01:CDS 20.0%
!! GTAATGATTGTATATTTGAT+GGG + Chr6:111223206-111223225 None:intergenic 20.0%
!! TAAAAACATTTCTGTATTTC+GGG - Chr6:111222306-111222325 MsG0680035722.01.T01:CDS 20.0%
!! TAATGATTGTATATTTGATG+GGG + Chr6:111223205-111223224 None:intergenic 20.0%
!! TGTAATGATTGTATATTTGA+TGG + Chr6:111223207-111223226 None:intergenic 20.0%
!! TTCACTATATTTCAAAACTA+CGG + Chr6:111224089-111224108 None:intergenic 20.0%
!!! AACATTGTAGAATTGTTTTT+TGG + Chr6:111223932-111223951 None:intergenic 20.0%
!!! ACTGAATTTTATAATTTACC+GGG - Chr6:111226351-111226370 MsG0680035722.01.T01:CDS 20.0%
!!! AGAAATGTTTTTAGTTTCAA+GGG + Chr6:111222299-111222318 None:intergenic 20.0%
!!! ATTTTCAATTGTCCAAAATT+GGG - Chr6:111225198-111225217 MsG0680035722.01.T01:CDS 20.0%
!!! GACTGAATTTTATAATTTAC+CGG - Chr6:111226350-111226369 MsG0680035722.01.T01:CDS 20.0%
!!! TAAAGCATTGCAAAATATAA+AGG + Chr6:111224049-111224068 None:intergenic 20.0%
!!! TCTTATCTTTTCTAGATTTT+TGG + Chr6:111224485-111224504 None:intergenic 20.0%
!!! TTTATATTTTGCAATGCTTT+AGG - Chr6:111224048-111224067 MsG0680035722.01.T01:CDS 20.0%
! AACAGCATATCTAATTCTAA+TGG - Chr6:111227189-111227208 MsG0680035722.01.T01:CDS 25.0%
! AACGGAAAGGAAATATTATT+CGG + Chr6:111226765-111226784 None:intergenic 25.0%
! AATTTGAATGTCGTCAAAAT+AGG + Chr6:111225301-111225320 None:intergenic 25.0%
! ACAATTCTACAATGTTAAGA+TGG - Chr6:111223936-111223955 MsG0680035722.01.T01:CDS 25.0%
! ACCATTAGCAATTAAAGTAT+TGG - Chr6:111223543-111223562 MsG0680035722.01.T01:intron 25.0%
! AGAAATGAGCATATATTGAA+AGG - Chr6:111223370-111223389 MsG0680035722.01.T01:intron 25.0%
! ATCAATTCTACAAGTTCATT+GGG + Chr6:111224271-111224290 None:intergenic 25.0%
! ATCTCTTACAATCAAAGTAA+TGG - Chr6:111224394-111224413 MsG0680035722.01.T01:CDS 25.0%
! ATTAGAATTAGATATGCTGT+TGG + Chr6:111227190-111227209 None:intergenic 25.0%
! ATTGTTCCAGTAATTCTAAA+TGG - Chr6:111225525-111225544 MsG0680035722.01.T01:CDS 25.0%
! CAACTAATTTGATACGAAAT+AGG - Chr6:111223230-111223249 MsG0680035722.01.T01:intron 25.0%
! CTTGTTCATTTGAATTTGAA+AGG - Chr6:111224598-111224617 MsG0680035722.01.T01:CDS 25.0%
! GAAATGAGCATATATTGAAA+GGG - Chr6:111223371-111223390 MsG0680035722.01.T01:intron 25.0%
! GACAATAACAATGATATCAT+AGG - Chr6:111225408-111225427 MsG0680035722.01.T01:intron 25.0%
! GTAAATATAAGGTGAAAAGA+TGG - Chr6:111222698-111222717 MsG0680035722.01.T01:intron 25.0%
! GTGTTTCAAAAGATTTAGTT+GGG - Chr6:111222933-111222952 MsG0680035722.01.T01:CDS 25.0%
! TAATAATTTCAACACAGGTA+GGG + Chr6:111227277-111227296 None:intergenic 25.0%
! TACCTGTGTTGAAATTATTA+GGG - Chr6:111227277-111227296 MsG0680035722.01.T01:CDS 25.0%
! TATTGAAATGCATTCTTTGT+TGG - Chr6:111223837-111223856 MsG0680035722.01.T01:CDS 25.0%
! TCAGTTACATCTATTAATAG+AGG + Chr6:111227102-111227121 None:intergenic 25.0%
! TCATTAACCAAAATTCATTG+AGG + Chr6:111226924-111226943 None:intergenic 25.0%
! TCGCTTTCATAATTTACATA+TGG - Chr6:111226716-111226735 MsG0680035722.01.T01:intron 25.0%
! TGTGTTTCAAAAGATTTAGT+TGG - Chr6:111222932-111222951 MsG0680035722.01.T01:CDS 25.0%
!! AAAATTTGATGGCAAATACT+TGG + Chr6:111224245-111224264 None:intergenic 25.0%
!! AAAGCTTGTTTACTTGAATT+TGG - Chr6:111224666-111224685 MsG0680035722.01.T01:CDS 25.0%
!! AATTTTATAATTTACCGGGT+GGG - Chr6:111226355-111226374 MsG0680035722.01.T01:CDS 25.0%
!! AGATCCAATTTTCTCAAATT+GGG + Chr6:111224454-111224473 None:intergenic 25.0%
!! ATGATGTCTTTCAATTGTTT+TGG + Chr6:111227056-111227075 None:intergenic 25.0%
!! ATTACACAATCATTTGCTTT+TGG - Chr6:111222976-111222995 MsG0680035722.01.T01:CDS 25.0%
!! CATTTTCAATTGTCCAAAAT+TGG - Chr6:111225197-111225216 MsG0680035722.01.T01:CDS 25.0%
!! CATTTTTCCAAATTCATGAT+AGG + Chr6:111225607-111225626 None:intergenic 25.0%
!! CCATTAGCAATTAAAGTATT+GGG - Chr6:111223544-111223563 MsG0680035722.01.T01:intron 25.0%
!! GTTTCATAGACAACATTTTA+AGG - Chr6:111226429-111226448 MsG0680035722.01.T01:CDS 25.0%
!! TCTTTGTTCATGTTTTACAA+AGG + Chr6:111222566-111222585 None:intergenic 25.0%
!! TTGTTATTGTCATGCATAAT+AGG + Chr6:111225399-111225418 None:intergenic 25.0%
!!! AATGAATTTTGACATTGTTG+AGG - Chr6:111225623-111225642 MsG0680035722.01.T01:CDS 25.0%
!!! AGAAATTACGATATTTTGAG+TGG - Chr6:111224206-111224225 MsG0680035722.01.T01:CDS 25.0%
!!! AGTTTTGAAATATAGTGAAG+AGG - Chr6:111224090-111224109 MsG0680035722.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATGAATTTTGACATTGTTGA+GGG - Chr6:111225624-111225643 MsG0680035722.01.T01:CDS 25.0%
!!! CAGAAATGTTTTTAGTTTCA+AGG + Chr6:111222300-111222319 None:intergenic 25.0%
!!! GAAATTACGATATTTTGAGT+GGG - Chr6:111224207-111224226 MsG0680035722.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTGCTTGTTTTTTCAACAAT+AGG - Chr6:111223710-111223729 MsG0680035722.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTAAAAATCCAAAAGTGTC+AGG + Chr6:111225894-111225913 None:intergenic 25.0%
AAAGTAATGGCTAACTTTGT+TGG - Chr6:111224407-111224426 MsG0680035722.01.T01:CDS 30.0%
AAATTCATGATAGGAATCTC+GGG + Chr6:111225598-111225617 None:intergenic 30.0%
AAGAAAGAAGAAACAACAGA+TGG - Chr6:111225840-111225859 MsG0680035722.01.T01:CDS 30.0%
AAGATATGTGAATGCGTTAA+GGG - Chr6:111222460-111222479 MsG0680035722.01.T01:intron 30.0%
AATTGTATGAAACACTGACA+CGG - Chr6:111226007-111226026 MsG0680035722.01.T01:CDS 30.0%
ACAAAAACAAGATGATCATC+GGG + Chr6:111227254-111227273 None:intergenic 30.0%
ACAACTATGGAAAAACAAGA+AGG - Chr6:111224312-111224331 MsG0680035722.01.T01:CDS 30.0%
ACATTCATAACATCATCATC+TGG + Chr6:111223634-111223653 None:intergenic 30.0%
ACATTGTCATCTACTTGAAA+CGG + Chr6:111226783-111226802 None:intergenic 30.0%
ACTCCAAATATTTGTTCTAG+AGG + Chr6:111222767-111222786 None:intergenic 30.0%
AGCATACCAAACAACATATT+CGG - Chr6:111224709-111224728 MsG0680035722.01.T01:CDS 30.0%
ATCCCTAATAATTTCAACAC+AGG + Chr6:111227282-111227301 None:intergenic 30.0%
ATTCAATTGCATAAGGAACT+TGG + Chr6:111224957-111224976 None:intergenic 30.0%
ATTCCCATAATCTTACACAT+CGG + Chr6:111225756-111225775 None:intergenic 30.0%
ATTGAAAATGATCAATCCTG+TGG + Chr6:111225187-111225206 None:intergenic 30.0%
CAAATTCATGATAGGAATCT+CGG + Chr6:111225599-111225618 None:intergenic 30.0%
CAACAATCACATATCGATAA+TGG - Chr6:111226577-111226596 MsG0680035722.01.T01:intron 30.0%
CAATGTTAAGATGGAGAATA+TGG - Chr6:111223945-111223964 MsG0680035722.01.T01:CDS 30.0%
CACATTATCAAGAATCAGAA+GGG + Chr6:111223272-111223291 None:intergenic 30.0%
CACTAAATCGATGACATATT+TGG + Chr6:111223084-111223103 None:intergenic 30.0%
CCCAATACTTTAATTGCTAA+TGG + Chr6:111223547-111223566 None:intergenic 30.0%
CGCTAGAGAGATTAAATTTA+GGG - Chr6:111224986-111225005 MsG0680035722.01.T01:CDS 30.0%
CGTAAACATTCAATTGCATA+AGG + Chr6:111224964-111224983 None:intergenic 30.0%
CTAATAATTTCAACACAGGT+AGG + Chr6:111227278-111227297 None:intergenic 30.0%
CTACCTGTGTTGAAATTATT+AGG - Chr6:111227276-111227295 MsG0680035722.01.T01:CDS 30.0%
CTAGAGAGATTAAATTTAGG+GGG - Chr6:111224988-111225007 MsG0680035722.01.T01:CDS 30.0%
CTTGAAGATCTAAATATGTG+TGG - Chr6:111224742-111224761 MsG0680035722.01.T01:CDS 30.0%
GACAAAAACAAGATGATCAT+CGG + Chr6:111227255-111227274 None:intergenic 30.0%
GAGATACTGAATTATGCTAA+TGG - Chr6:111223517-111223536 MsG0680035722.01.T01:intron 30.0%
GATAACACTAATCTTCAACA+GGG - Chr6:111222328-111222347 MsG0680035722.01.T01:CDS 30.0%
GATCAATTCTACAAGTTCAT+TGG + Chr6:111224272-111224291 None:intergenic 30.0%
GATGAATCATGAAAATTCCT+TGG - Chr6:111225728-111225747 MsG0680035722.01.T01:CDS 30.0%
GCTAGAGAGATTAAATTTAG+GGG - Chr6:111224987-111225006 MsG0680035722.01.T01:CDS 30.0%
GTACAATATCATGCAATATG+TGG + Chr6:111226989-111227008 None:intergenic 30.0%
GTTGAAATTATTAGGGATGT+GGG - Chr6:111227284-111227303 MsG0680035722.01.T01:CDS 30.0%
TCAATTCTACAAGTTCATTG+GGG + Chr6:111224270-111224289 None:intergenic 30.0%
TCGCTAGAGAGATTAAATTT+AGG - Chr6:111224985-111225004 MsG0680035722.01.T01:CDS 30.0%
TCTTCCCAATTTGAGAAAAT+TGG - Chr6:111224447-111224466 MsG0680035722.01.T01:CDS 30.0%
TGCTTACTAGATTATAGCAA+CGG + Chr6:111224693-111224712 None:intergenic 30.0%
TGTAAGATTATGGGAATTGA+AGG - Chr6:111225759-111225778 MsG0680035722.01.T01:CDS 30.0%
TGTTGAAATTATTAGGGATG+TGG - Chr6:111227283-111227302 MsG0680035722.01.T01:CDS 30.0%
TTTGTTAGAAGTCCAATAGA+TGG + Chr6:111224577-111224596 None:intergenic 30.0%
! AATTCTAATGGACAAACAGA+AGG - Chr6:111227201-111227220 MsG0680035722.01.T01:CDS 30.0%
! AATTTCTTTGAAAGACTCCT+TGG + Chr6:111224193-111224212 None:intergenic 30.0%
! ATGTGATTGTTGTTCATCTT+CGG + Chr6:111226569-111226588 None:intergenic 30.0%
! ATGTTGTGTAGTATTTTCCT+TGG - Chr6:111225437-111225456 MsG0680035722.01.T01:intron 30.0%
! ATTTCTTTGAAAGACTCCTT+GGG + Chr6:111224192-111224211 None:intergenic 30.0%
! ATTTTATAATTTACCGGGTG+GGG - Chr6:111226356-111226375 MsG0680035722.01.T01:CDS 30.0%
! GAACAACTTTTTGAACTTTC+TGG - Chr6:111222843-111222862 MsG0680035722.01.T01:CDS 30.0%
! GAATTTTATAATTTACCGGG+TGG - Chr6:111226354-111226373 MsG0680035722.01.T01:CDS 30.0%
! GACATTCAAATTGTTATTCC+AGG - Chr6:111225309-111225328 MsG0680035722.01.T01:CDS 30.0%
! GAGATCCAATTTTCTCAAAT+TGG + Chr6:111224455-111224474 None:intergenic 30.0%
! GATGAAAGTGTAACAGAAAA+TGG - Chr6:111226526-111226545 MsG0680035722.01.T01:intron 30.0%
! TGTTTTTCCATAGTTGTATG+AGG + Chr6:111224309-111224328 None:intergenic 30.0%
! TTGTGAAGTTGAACTTTTGT+AGG + Chr6:111225707-111225726 None:intergenic 30.0%
! TTTGAAATATAGTGAAGAGG+TGG - Chr6:111224093-111224112 MsG0680035722.01.T01:CDS 30.0%
!! ATCACATATCGATAATGGAA+AGG - Chr6:111226582-111226601 MsG0680035722.01.T01:intron 30.0%
!! CGAAAGTGTTTAACAATTCA+AGG - Chr6:111224773-111224792 MsG0680035722.01.T01:CDS 30.0%
!! TGAATTTTGACATTGTTGAG+GGG - Chr6:111225625-111225644 MsG0680035722.01.T01:CDS 30.0%
!! TGCTGCAATTAAGTTTTGAT+GGG - Chr6:111223653-111223672 MsG0680035722.01.T01:CDS 30.0%
!! TTGCCTCTAGAACAAATATT+TGG - Chr6:111222761-111222780 MsG0680035722.01.T01:intron 30.0%
!!! ATTAAGTTTTGATGGGCTAA+AGG - Chr6:111223660-111223679 MsG0680035722.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTCTAGATTTTTGGAGTGA+CGG + Chr6:111224477-111224496 None:intergenic 30.0%
!!! TTTTTTCAACAATAGGAACG+TGG - Chr6:111223717-111223736 MsG0680035722.01.T01:CDS 30.0%
AAATAGGCTAAGTCGTGAAA+AGG - Chr6:111223246-111223265 MsG0680035722.01.T01:intron 35.0%
AAATCTAACCGCTCAAGATT+CGG + Chr6:111224523-111224542 None:intergenic 35.0%
AATGATTCTTGTTCTGGTCT+TGG + Chr6:111225795-111225814 None:intergenic 35.0%
AATTATTAGGGATGTGGGTA+CGG - Chr6:111227289-111227308 MsG0680035722.01.T01:CDS 35.0%
AATTCATGATAGGAATCTCG+GGG + Chr6:111225597-111225616 None:intergenic 35.0%
ATATTGGATATCTTGTCCCT+GGG - Chr6:111226107-111226126 MsG0680035722.01.T01:CDS 35.0%
ATCGTATGAACAAAGATGAC+TGG - Chr6:111225160-111225179 MsG0680035722.01.T01:CDS 35.0%
ATCTTAGATTACTCATCAGC+AGG - Chr6:111224143-111224162 MsG0680035722.01.T01:CDS 35.0%
ATGGATGATACAATGCATTC+AGG - Chr6:111225254-111225273 MsG0680035722.01.T01:CDS 35.0%
ATGTATAAACCTTGTGGAGT+TGG - Chr6:111224549-111224568 MsG0680035722.01.T01:CDS 35.0%
CAAATCCTACTTGAAACTCT+TGG - Chr6:111223172-111223191 MsG0680035722.01.T01:intron 35.0%
CAATGAGATTGATGCTAGTT+TGG - Chr6:111226821-111226840 MsG0680035722.01.T01:CDS 35.0%
CAGGAAGTAAAATACCAAGT+TGG - Chr6:111225328-111225347 MsG0680035722.01.T01:CDS 35.0%
CCACATTATCAAGAATCAGA+AGG + Chr6:111223273-111223292 None:intergenic 35.0%
CGAGATTCCTATCATGAATT+TGG - Chr6:111225597-111225616 MsG0680035722.01.T01:CDS 35.0%
CTAAGACCGAATATGTTGTT+TGG + Chr6:111224718-111224737 None:intergenic 35.0%
CTTCTGATTCTGTGATAACA+GGG + Chr6:111226657-111226676 None:intergenic 35.0%
GAAGATATGTGAATGCGTTA+AGG - Chr6:111222459-111222478 MsG0680035722.01.T01:intron 35.0%
GAATTCAACGATATGTCAAC+AGG + Chr6:111226202-111226221 None:intergenic 35.0%
GAGATGAATGATTCTTGTTC+TGG + Chr6:111225801-111225820 None:intergenic 35.0%
GAGCATATATTGAAAGGGTA+TGG - Chr6:111223376-111223395 MsG0680035722.01.T01:intron 35.0%
GATTCATCCTGATTCAAAAG+TGG + Chr6:111223424-111223443 None:intergenic 35.0%
GGATAACACTAATCTTCAAC+AGG - Chr6:111222327-111222346 MsG0680035722.01.T01:CDS 35.0%
GGATCAACATCATAGAAAAC+AGG + Chr6:111222505-111222524 None:intergenic 35.0%
GTCATATAAAGCCATAGCAA+GGG + Chr6:111223062-111223081 None:intergenic 35.0%
GTTCCAGTAATTCTAAATGG+AGG - Chr6:111225528-111225547 MsG0680035722.01.T01:CDS 35.0%
TCATTGGGGTGAAAATTTGA+TGG + Chr6:111224256-111224275 None:intergenic 35.0%
TGTCTATGAAACACAGATAC+TGG + Chr6:111226421-111226440 None:intergenic 35.0%
TGTGGATTTCATGCTGATAT+TGG - Chr6:111223766-111223785 MsG0680035722.01.T01:CDS 35.0%
TTCGTGCTATAGGAATTTGT+GGG - Chr6:111223014-111223033 MsG0680035722.01.T01:intron 35.0%
TTTATGTTGCAGTCTTCTCA+AGG - Chr6:111222398-111222417 MsG0680035722.01.T01:intron 35.0%
! AGACCTCCATTTAGAATTAC+TGG + Chr6:111225534-111225553 None:intergenic 35.0%
! ATTAGATATGCTGTTGGTCT+CGG + Chr6:111227184-111227203 None:intergenic 35.0%
! CAACTTGGTATTTTACTTCC+TGG + Chr6:111225330-111225349 None:intergenic 35.0%
! TATATTGAAAGGGTATGGAG+TGG - Chr6:111223381-111223400 MsG0680035722.01.T01:intron 35.0%
! TTTGATGGCAAATACTTGGA+AGG + Chr6:111224241-111224260 None:intergenic 35.0%
! TTTGGAACATTGCAAGTTGT+TGG - Chr6:111225068-111225087 MsG0680035722.01.T01:intron 35.0%
! TTTTATAATTTACCGGGTGG+GGG - Chr6:111226357-111226376 MsG0680035722.01.T01:CDS 35.0%
! TTTTTAATCTCTCCAGCTTG+TGG + Chr6:111222869-111222888 None:intergenic 35.0%
!! CAAAGTTCCACTTTTGAATC+AGG - Chr6:111223414-111223433 MsG0680035722.01.T01:intron 35.0%
!! CAATCATTTGCTTTTGGACT+CGG - Chr6:111222982-111223001 MsG0680035722.01.T01:intron 35.0%
!! CCTTCTGATTCTTGATAATG+TGG - Chr6:111223270-111223289 MsG0680035722.01.T01:intron 35.0%
!! GAATTTTGACATTGTTGAGG+GGG - Chr6:111225626-111225645 MsG0680035722.01.T01:CDS 35.0%
!! GTGCTGCAATTAAGTTTTGA+TGG - Chr6:111223652-111223671 MsG0680035722.01.T01:CDS 35.0%
!! TGTGGATCAAGTTGAACAAT+TGG - Chr6:111223288-111223307 MsG0680035722.01.T01:intron 35.0%
!!! GGGGGTTTTAAATTTGTGTT+AGG - Chr6:111226375-111226394 MsG0680035722.01.T01:CDS 35.0%
AAAACACTGAGTTTCTGTCC+TGG + Chr6:111222733-111222752 None:intergenic 40.0%
AAGTGATGATTTCTCTCCTG+AGG - Chr6:111226851-111226870 MsG0680035722.01.T01:CDS 40.0%
ACAACAGATGGATCACAAGA+AGG - Chr6:111225852-111225871 MsG0680035722.01.T01:CDS 40.0%
ACTTTCATCAGCCACTTCAA+CGG + Chr6:111226515-111226534 None:intergenic 40.0%
AGATTACATGATGGTCCACT+CGG - Chr6:111223139-111223158 MsG0680035722.01.T01:intron 40.0%
AGATTACTCATCAGCAGGAA+AGG - Chr6:111224148-111224167 MsG0680035722.01.T01:CDS 40.0%
AGTGATGATTTCTCTCCTGA+GGG - Chr6:111226852-111226871 MsG0680035722.01.T01:CDS 40.0%
ATGTGAATGCGTTAAGGGAT+CGG - Chr6:111222465-111222484 MsG0680035722.01.T01:intron 40.0%
ATGTGTAAACCTTGTGGAGT+TGG - Chr6:111224621-111224640 MsG0680035722.01.T01:CDS 40.0%
ATTCATGATAGGAATCTCGG+GGG + Chr6:111225596-111225615 None:intergenic 40.0%
ATTCCAACAAGACTCTCACA+AGG - Chr6:111222585-111222604 MsG0680035722.01.T01:intron 40.0%
ATTGTCCAAAATTGGGTGAG+AGG - Chr6:111225205-111225224 MsG0680035722.01.T01:CDS 40.0%
CAAAATTCATTGAGGCAAGC+AGG + Chr6:111226916-111226935 None:intergenic 40.0%
CAAGCAAAGAGCCAAGAAAA+TGG - Chr6:111223893-111223912 MsG0680035722.01.T01:CDS 40.0%
CATATTGGATATCTTGTCCC+TGG - Chr6:111226106-111226125 MsG0680035722.01.T01:CDS 40.0%
CCTGTTATCACAGAATCAGA+AGG - Chr6:111226655-111226674 MsG0680035722.01.T01:intron 40.0%
CCTTCTGATTCTGTGATAAC+AGG + Chr6:111226658-111226677 None:intergenic 40.0%
CGAAAGCAAAGTGGGATTTA+TGG - Chr6:111222535-111222554 MsG0680035722.01.T01:intron 40.0%
CGACAAAATCAAGTCACCTA+TGG - Chr6:111225559-111225578 MsG0680035722.01.T01:CDS 40.0%
CGGATCGTGTAGAAAATGAA+AGG + Chr6:111227013-111227032 None:intergenic 40.0%
CTATGATGTTGATCCTTCTG+AGG - Chr6:111222510-111222529 MsG0680035722.01.T01:intron 40.0%
CTCTGATTGTTGATCCAACT+TGG + Chr6:111225345-111225364 None:intergenic 40.0%
GAAAGGATGTGTAAACCTTG+TGG - Chr6:111224615-111224634 MsG0680035722.01.T01:CDS 40.0%
GAATCTTGAGCGGTTAGATT+TGG - Chr6:111224522-111224541 MsG0680035722.01.T01:CDS 40.0%
GAATGTCGTCAAAATAGGCA+GGG + Chr6:111225296-111225315 None:intergenic 40.0%
GATGTGTTTGTCACCTTTAG+AGG - Chr6:111222232-111222251 MsG0680035722.01.T01:CDS 40.0%
GATTCTGTGATAACAGGGAT+GGG + Chr6:111226652-111226671 None:intergenic 40.0%
GCATCAATCTCATTGCTATC+TGG + Chr6:111226816-111226835 None:intergenic 40.0%
GCTATAGGAATTTGTGGGAT+GGG - Chr6:111223019-111223038 MsG0680035722.01.T01:intron 40.0%
GCTCCGATGTGTAAGATTAT+GGG - Chr6:111225750-111225769 MsG0680035722.01.T01:CDS 40.0%
GGAAGGATGTATAAACCTTG+TGG - Chr6:111224543-111224562 MsG0680035722.01.T01:CDS 40.0%
GGTCATATAAAGCCATAGCA+AGG + Chr6:111223063-111223082 None:intergenic 40.0%
GTATTGGGCTCATTCTTGTT+TGG - Chr6:111223559-111223578 MsG0680035722.01.T01:intron 40.0%
GTCATCTACTTGAAACGGAA+AGG + Chr6:111226778-111226797 None:intergenic 40.0%
GTTCGTGCTATAGGAATTTG+TGG - Chr6:111223013-111223032 MsG0680035722.01.T01:intron 40.0%
TGAAACACAGATACTGGACA+CGG + Chr6:111226415-111226434 None:intergenic 40.0%
TGAATGTCGTCAAAATAGGC+AGG + Chr6:111225297-111225316 None:intergenic 40.0%
TGATTCTGTGATAACAGGGA+TGG + Chr6:111226653-111226672 None:intergenic 40.0%
TGCTATAGGAATTTGTGGGA+TGG - Chr6:111223018-111223037 MsG0680035722.01.T01:intron 40.0%
TGGATCAACAATCAGAGCAT+GGG - Chr6:111225348-111225367 MsG0680035722.01.T01:CDS 40.0%
TTCATTCAAGCACCATGTTG+AGG + Chr6:111222434-111222453 None:intergenic 40.0%
TTCCTTCTCCTACCACTATT+GGG - Chr6:111225106-111225125 MsG0680035722.01.T01:intron 40.0%
TTGGATCAACAATCAGAGCA+TGG - Chr6:111225347-111225366 MsG0680035722.01.T01:CDS 40.0%
TTGGTCGTAATGTGACTGAA+TGG - Chr6:111223578-111223597 MsG0680035722.01.T01:CDS 40.0%
TTGTCCAAAATTGGGTGAGA+GGG - Chr6:111225206-111225225 MsG0680035722.01.T01:CDS 40.0%
! AAACAATGTGTGAGCCTTGT+TGG + Chr6:111224901-111224920 None:intergenic 40.0%
! ACAAATTTAAAACCCCCACC+CGG + Chr6:111226372-111226391 None:intergenic 40.0%
! ACCAACCAATGCTTTTCCTT+TGG - Chr6:111226147-111226166 MsG0680035722.01.T01:CDS 40.0%
! ACTCTCACAAGGTGTCAATA+TGG - Chr6:111222596-111222615 MsG0680035722.01.T01:intron 40.0%
! CCAACCAATGCTTTTCCTTT+GGG - Chr6:111226148-111226167 MsG0680035722.01.T01:CDS 40.0%
! CTATGCCAAGAGTTTCAAGT+AGG + Chr6:111223180-111223199 None:intergenic 40.0%
! CTGCTTGCCTCAATGAATTT+TGG - Chr6:111226914-111226933 MsG0680035722.01.T01:CDS 40.0%
! GAGTTTCAACCTGACACTTT+TGG - Chr6:111225882-111225901 MsG0680035722.01.T01:CDS 40.0%
! TCACAAGGTGTCAATATGGA+GGG - Chr6:111222600-111222619 MsG0680035722.01.T01:intron 40.0%
!! GACAAGAGAGATTGTTTCTG+CGG + Chr6:111226274-111226293 None:intergenic 40.0%
!! GATGAAAAGCACTCTCGATA+AGG + Chr6:111225465-111225484 None:intergenic 40.0%
!! GTTGATAGTGTTCGTGCTAT+AGG - Chr6:111223004-111223023 MsG0680035722.01.T01:intron 40.0%
!!! TCGAGAGTGCTTTTCATCTA+TGG - Chr6:111225467-111225486 MsG0680035722.01.T01:intron 40.0%
!!! TTTTGATGGGCTAAAGGAGA+CGG - Chr6:111223666-111223685 MsG0680035722.01.T01:CDS 40.0%
AAATAGCTGTGCGTCGTGAA+TGG - Chr6:111223314-111223333 MsG0680035722.01.T01:intron 45.0%
AACAAAGATGACTGGACCAC+AGG - Chr6:111225168-111225187 MsG0680035722.01.T01:CDS 45.0%
AAGAGCCAAGAAAATGGAGC+AGG - Chr6:111223899-111223918 MsG0680035722.01.T01:CDS 45.0%
AATCTTACACATCGGAGCCA+AGG + Chr6:111225748-111225767 None:intergenic 45.0%
AGGCAAAACAACCCTTGCTA+TGG - Chr6:111223048-111223067 MsG0680035722.01.T01:intron 45.0%
ATAGGAATTTGTGGGATGGG+AGG - Chr6:111223022-111223041 MsG0680035722.01.T01:intron 45.0%
ATTGTTGAGGGGGAAGGTTT+GGG - Chr6:111225636-111225655 MsG0680035722.01.T01:CDS 45.0%
ATTTGTGGGATGGGAGGAAT+AGG - Chr6:111223028-111223047 MsG0680035722.01.T01:intron 45.0%
CAACGTCCTCTATCTTCGAA+TGG - Chr6:111224842-111224861 MsG0680035722.01.T01:CDS 45.0%
CAAGAAAATGGAGCAGGTTG+TGG - Chr6:111223905-111223924 MsG0680035722.01.T01:CDS 45.0%
CAAGTTTGGAAAGCTTCCTC+AGG + Chr6:111225038-111225057 None:intergenic 45.0%
CATGGTCCATTCGAAGATAG+AGG + Chr6:111224851-111224870 None:intergenic 45.0%
CATTCTTTGTTGGCAGAGCT+AGG - Chr6:111223847-111223866 MsG0680035722.01.T01:CDS 45.0%
CGAAGATAGAGGACGTTGAT+CGG + Chr6:111224840-111224859 None:intergenic 45.0%
CTTCCTTCTCCTACCACTAT+TGG - Chr6:111225105-111225124 MsG0680035722.01.T01:intron 45.0%
CTTGAGCGGTTAGATTTGGA+AGG - Chr6:111224526-111224545 MsG0680035722.01.T01:CDS 45.0%
GAAGATAGAGGACGTTGATC+GGG + Chr6:111224839-111224858 None:intergenic 45.0%
GAGAGTTTCCGAATCTTGAG+CGG - Chr6:111224512-111224531 MsG0680035722.01.T01:CDS 45.0%
GGAACTATGCTTCCTCAACA+TGG - Chr6:111222419-111222438 MsG0680035722.01.T01:intron 45.0%
GGAATATCACAAGAAGCCCA+AGG - Chr6:111224173-111224192 MsG0680035722.01.T01:CDS 45.0%
GGCTCCGATGTGTAAGATTA+TGG - Chr6:111225749-111225768 MsG0680035722.01.T01:CDS 45.0%
GGGGGAAGTAGATTATCCAT+AGG + Chr6:111225578-111225597 None:intergenic 45.0%
GTAGCAGCCTCATACAACTA+TGG - Chr6:111224299-111224318 MsG0680035722.01.T01:CDS 45.0%
GTGGAGTTGGATCCATCTAT+TGG - Chr6:111224562-111224581 MsG0680035722.01.T01:CDS 45.0%
TACTCATCAGCAGGAAAGGT+GGG - Chr6:111224152-111224171 MsG0680035722.01.T01:CDS 45.0%
TAGATGGATCCAACTCCACA+AGG + Chr6:111224561-111224580 None:intergenic 45.0%
TCAAACCTCTACCGTTGAAG+TGG - Chr6:111226501-111226520 MsG0680035722.01.T01:intron 45.0%
TCGTCAAAATAGGCAGGGTA+GGG + Chr6:111225291-111225310 None:intergenic 45.0%
TCTTTGTTCCCTCCCAATAG+TGG + Chr6:111225121-111225140 None:intergenic 45.0%
TGTGAATGCGTTAAGGGATC+GGG - Chr6:111222466-111222485 MsG0680035722.01.T01:intron 45.0%
TTACTCATCAGCAGGAAAGG+TGG - Chr6:111224151-111224170 MsG0680035722.01.T01:CDS 45.0%
TTCTCCTACCACTATTGGGA+GGG - Chr6:111225110-111225129 MsG0680035722.01.T01:intron 45.0%
TTGGAGCCGAAAACGATGAA+TGG + Chr6:111224882-111224901 None:intergenic 45.0%
TTTGACATTGTTGAGGGGGA+AGG - Chr6:111225630-111225649 MsG0680035722.01.T01:CDS 45.0%
! ACACCTTGTGAGAGTCTTGT+TGG + Chr6:111222591-111222610 None:intergenic 45.0%
! CACAACCTGCTCCATTTTCT+TGG + Chr6:111223907-111223926 None:intergenic 45.0%
! CTCACAAGGTGTCAATATGG+AGG - Chr6:111222599-111222618 MsG0680035722.01.T01:intron 45.0%
! GAGATTGATGCTAGTTTGGC+TGG - Chr6:111226825-111226844 MsG0680035722.01.T01:CDS 45.0%
! GCCTCACCATTCATCGTTTT+CGG - Chr6:111224873-111224892 MsG0680035722.01.T01:CDS 45.0%
! TGTTCCCTCTCACCCAATTT+TGG + Chr6:111225213-111225232 None:intergenic 45.0%
!! AGGGAGGCTCTAGAAAAAGT+GGG - Chr6:111222619-111222638 MsG0680035722.01.T01:CDS 45.0%
!! ATTTGCTTTTGTGCACCGAG+TGG + Chr6:111223157-111223176 None:intergenic 45.0%
!! CCCAAAGGAAAAGCATTGGT+TGG + Chr6:111226151-111226170 None:intergenic 45.0%
!! GCAGGAGCATGACATTTTCA+TGG - Chr6:111225235-111225254 MsG0680035722.01.T01:CDS 45.0%
AAAAGATGGTGCACGAGTCC+AGG - Chr6:111222712-111222731 MsG0680035722.01.T01:intron 50.0%
AATAGGCAGGGTAGGGTTGT+TGG + Chr6:111225284-111225303 None:intergenic 50.0%
ATCAGCCACTTCAACGGTAG+AGG + Chr6:111226509-111226528 None:intergenic 50.0%
ATCTTGTCCCTGGGTAGAAC+TGG - Chr6:111226116-111226135 MsG0680035722.01.T01:CDS 50.0%
CAAACAGAAGGCTCGAGTGA+AGG - Chr6:111227213-111227232 MsG0680035722.01.T01:CDS 50.0%
CAAACTCCCAGTTCTACCCA+GGG + Chr6:111226126-111226145 None:intergenic 50.0%
CATTGTTGAGGGGGAAGGTT+TGG - Chr6:111225635-111225654 MsG0680035722.01.T01:CDS 50.0%
CCTTTATTCACGCTTCCCTC+AGG + Chr6:111226870-111226889 None:intergenic 50.0%
CGATGAATGGTGAGGCAACA+TGG + Chr6:111224869-111224888 None:intergenic 50.0%
CGTCGTGAATGGTTAGGTTC+GGG - Chr6:111223325-111223344 MsG0680035722.01.T01:intron 50.0%
CTCCCAATAGTGGTAGGAGA+AGG + Chr6:111225111-111225130 None:intergenic 50.0%
CTGAGGTGCGAAAGCAAAGT+GGG - Chr6:111222527-111222546 MsG0680035722.01.T01:intron 50.0%
CTTCAACAGGGTGAGTCCAT+AGG - Chr6:111222340-111222359 MsG0680035722.01.T01:CDS 50.0%
CTTCTCCTACCACTATTGGG+AGG - Chr6:111225109-111225128 MsG0680035722.01.T01:intron 50.0%
CTTTGCTTTCGCACCTCAGA+AGG + Chr6:111222526-111222545 None:intergenic 50.0%
GAGCTTCTTCGAGCAATCGA+AGG - Chr6:111222367-111222386 MsG0680035722.01.T01:intron 50.0%
GCCGAAAACGATGAATGGTG+AGG + Chr6:111224877-111224896 None:intergenic 50.0%
GCGTCGTGAATGGTTAGGTT+CGG - Chr6:111223324-111223343 MsG0680035722.01.T01:intron 50.0%
GGTATGGAGGTGAAGAGTTG+CGG - Chr6:111225657-111225676 MsG0680035722.01.T01:CDS 50.0%
GTATGGAGGTGAAGAGTTGC+GGG - Chr6:111225658-111225677 MsG0680035722.01.T01:CDS 50.0%
GTCGTCAAAATAGGCAGGGT+AGG + Chr6:111225292-111225311 None:intergenic 50.0%
GTGGTAGGAGAAGGAAGTTG+AGG + Chr6:111225102-111225121 None:intergenic 50.0%
TATTAGGGATGTGGGTACGG+AGG - Chr6:111227292-111227311 MsG0680035722.01.T01:CDS 50.0%
TCGAAGAAGCTCAGGACCTA+TGG + Chr6:111222359-111222378 None:intergenic 50.0%
TCGAGCAATCGAAGGATCTC+AGG - Chr6:111222375-111222394 MsG0680035722.01.T01:intron 50.0%
TCGATTGCTCGAAGAAGCTC+AGG + Chr6:111222367-111222386 None:intergenic 50.0%
TCTTCAATCTGTGCTGCGAC+AGG + Chr6:111227147-111227166 None:intergenic 50.0%
TCTTGTCCCTGGGTAGAACT+GGG - Chr6:111226117-111226136 MsG0680035722.01.T01:CDS 50.0%
TGAAGATGAGTTGCTGCTGC+TGG + Chr6:111222179-111222198 None:intergenic 50.0%
TGTCGCAGCACAGATTGAAG+AGG - Chr6:111227146-111227165 MsG0680035722.01.T01:CDS 50.0%
TGTTCCCTCCCAATAGTGGT+AGG + Chr6:111225117-111225136 None:intergenic 50.0%
TTGGAAAGCTTCCTCAGGCT+AGG + Chr6:111225033-111225052 None:intergenic 50.0%
TTGTGACACTACCTAGCCTG+AGG - Chr6:111225019-111225038 MsG0680035722.01.T01:CDS 50.0%
! CAAGGTGTCAATATGGAGGG+AGG - Chr6:111222603-111222622 MsG0680035722.01.T01:CDS 50.0%
! CATCGTTTTCGGCTCCAACA+AGG - Chr6:111224884-111224903 MsG0680035722.01.T01:CDS 50.0%
! CCTGAGGGAAGCGTGAATAA+AGG - Chr6:111226867-111226886 MsG0680035722.01.T01:CDS 50.0%
! GAAGAGTTGCGGGTATCGTT+GGG - Chr6:111225668-111225687 MsG0680035722.01.T01:CDS 50.0%
! GACTGAATGGAAGAGTGCGT+TGG - Chr6:111223591-111223610 MsG0680035722.01.T01:CDS 50.0%
! GCGAGTATCGTCACCTCTAA+AGG + Chr6:111222248-111222267 None:intergenic 50.0%
! TCTGAGGTGCGAAAGCAAAG+TGG - Chr6:111222526-111222545 MsG0680035722.01.T01:intron 50.0%
! TGAACTTTCTGGCCACAAGC+TGG - Chr6:111222854-111222873 MsG0680035722.01.T01:CDS 50.0%
! TGAAGAGTTGCGGGTATCGT+TGG - Chr6:111225667-111225686 MsG0680035722.01.T01:CDS 50.0%
!! GAAAAAGTGGGGAGTATCGC+TGG - Chr6:111222631-111222650 MsG0680035722.01.T01:CDS 50.0%
!! GAGGGAGGCTCTAGAAAAAG+TGG - Chr6:111222618-111222637 MsG0680035722.01.T01:CDS 50.0%
!! GGGAGGCTCTAGAAAAAGTG+GGG - Chr6:111222620-111222639 MsG0680035722.01.T01:CDS 50.0%
CACAGATACTGGACACGGCA+CGG + Chr6:111226410-111226429 None:intergenic 55.0%
CACGGACACATGAGTCGACA+CGG - Chr6:111226025-111226044 MsG0680035722.01.T01:CDS 55.0%
CCAAACTCCCAGTTCTACCC+AGG + Chr6:111226127-111226146 None:intergenic 55.0%
CCTGGGTAGAACTGGGAGTT+TGG - Chr6:111226124-111226143 MsG0680035722.01.T01:CDS 55.0%
GCTGTGCGTCGTGAATGGTT+AGG - Chr6:111223319-111223338 MsG0680035722.01.T01:intron 55.0%
TGAGGGGGAAGGTTTGGGTA+TGG - Chr6:111225641-111225660 MsG0680035722.01.T01:CDS 55.0%
TGGGTGAGAGGGAACATTGC+AGG - Chr6:111225217-111225236 MsG0680035722.01.T01:CDS 55.0%
! GCACTCTCGATAAGGTGCCA+AGG + Chr6:111225457-111225476 None:intergenic 55.0%
!! AAGTGGGGAGTATCGCTGGT+TGG - Chr6:111222635-111222654 MsG0680035722.01.T01:CDS 55.0%
!! AGTGGGGAGTATCGCTGGTT+GGG - Chr6:111222636-111222655 MsG0680035722.01.T01:CDS 55.0%
GGGGGAAGGTTTGGGTATGG+AGG - Chr6:111225644-111225663 MsG0680035722.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 111222172 111227317 111222172 ID=MsG0680035722.01;Name=MsG0680035722.01
Chr6 mRNA 111222172 111227317 111222172 ID=MsG0680035722.01.T01;Parent=MsG0680035722.01;Name=MsG0680035722.01.T01;_AED=0.48;_eAED=0.48;_QI=0|0|0|1|1|1|7|0|1224
Chr6 exon 111226818 111227317 111226818 ID=MsG0680035722.01.T01:exon:14948;Parent=MsG0680035722.01.T01
Chr6 exon 111225523 111226477 111225523 ID=MsG0680035722.01.T01:exon:14947;Parent=MsG0680035722.01.T01
Chr6 exon 111225156 111225419 111225156 ID=MsG0680035722.01.T01:exon:14946;Parent=MsG0680035722.01.T01
Chr6 exon 111223576 111225044 111223576 ID=MsG0680035722.01.T01:exon:14945;Parent=MsG0680035722.01.T01
Chr6 exon 111222813 111222997 111222813 ID=MsG0680035722.01.T01:exon:14944;Parent=MsG0680035722.01.T01
Chr6 exon 111222601 111222696 111222601 ID=MsG0680035722.01.T01:exon:14943;Parent=MsG0680035722.01.T01
Chr6 exon 111222172 111222377 111222172 ID=MsG0680035722.01.T01:exon:14942;Parent=MsG0680035722.01.T01
Chr6 CDS 111226818 111227317 111226818 ID=MsG0680035722.01.T01:cds;Parent=MsG0680035722.01.T01
Chr6 CDS 111225523 111226477 111225523 ID=MsG0680035722.01.T01:cds;Parent=MsG0680035722.01.T01
Chr6 CDS 111225156 111225419 111225156 ID=MsG0680035722.01.T01:cds;Parent=MsG0680035722.01.T01
Chr6 CDS 111223576 111225044 111223576 ID=MsG0680035722.01.T01:cds;Parent=MsG0680035722.01.T01
Chr6 CDS 111222813 111222997 111222813 ID=MsG0680035722.01.T01:cds;Parent=MsG0680035722.01.T01
Chr6 CDS 111222601 111222696 111222601 ID=MsG0680035722.01.T01:cds;Parent=MsG0680035722.01.T01
Chr6 CDS 111222172 111222377 111222172 ID=MsG0680035722.01.T01:cds;Parent=MsG0680035722.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680035722.01.T01

ATGGCCAGCAGCAGCAACTCATCTTCAGCTCTTGTGACTTCTTCAAGAAGAAATTATTACGATGTGTTTGTCACCTTTAGAGGTGACGATACTCGCAACAATTTCGCTGATTTTCTTTTTGATGCCCTTGAAACTAAAAACATTTCTGTATTTCGGGATAACACTAATCTTCAACAGGGTGAGTCCATAGGTCCTGAGCTTCTTCGAGCAATCGAAGGATCTCAGGTTTATGTTGCAGTCTTCTCAAGGAACTATGCTTCCTCAACATGGTGCTTGAATGAATTAGAGAAGATATGTGAATGCGTTAAGGGATCGGGAAAACATGTTCTTCCTGTTTTCTATGATGTTGATCCTTCTGAGGTGCGAAAGCAAAGTGGGATTTATGGTAAAGCCTTTGTAAAACATGAACAAAGATTCCAACAAGACTCTCACAAGGTGTCAATATGGAGGGAGGCTCTAGAAAAAGTGGGGAGTATCGCTGGTTGGGATCTACGTGAAAATGTTCGTGCTATAGGAATTTGTGGGATGGGAGGAATAGGCAAAACAACCCTTGCTATGGCTTTATATGACCAAATATGTCATCGATTTAGTGCATCATGTTTTATTGATGATGTAACCAAATTTTATAGATTACATGATGGTCCACTCGGTGCACAAAAGCAAATCCTACTTGAAACTCTTGGCATAGAACCCCATCAAATATACAATCATTACAGAGCAACTAATTTGATACGAAATAGGCTAAGTCGTGAAAAGGCCCTTCTGATTCTTGATAATGTGGATCAAGTTGAACAATTGGAAAAAATAGCTGTGCGTCGTGAATGGTTAGGTTCGGGTAGTAGAATCATTATCATTTCTAGAAATGAGCATATATTGAAAGGGTATGGAGTGGATGAAGTTTACAAAGTTCCACTTTTGAATCAGGATGAATCTCACAAGTTATTTTGTCGAAAAGCTTTCAAAGTTGAGAAAATTATTATGAGTAATTATCAAAATTTGGCAGATGAGATACTGAATTATGCTAATGGTTTACCATTAGCAATTAAAGTATTGGGCTCATTCTTGTTTGGTCGTAATGTGACTGAATGGAAGAGTGCGTTGGCTAGATTGAGAGAAAGTCCAGATGATGATGTTATGAATGTGCTGCAATTAAGTTTTGATGGGCTAAAGGAGACGGAAAAAGAAATATATCTTGATATTGCTTGTTTTTTCAACAATAGGAACGTGGAATATGTTAAAAACATTCTAAATTGTTGTGGATTTCATGCTGATATTGGATTAAAAGTTCTCATCGAGAAATCACTTATAAGTATTAAGAATAGAGATATTGAAATGCATTCTTTGTTGGCAGAGCTAGGCAGAAAAATTGTGCAAAATAGTTCAAGCAAAGAGCCAAGAAAATGGAGCAGGTTGTGGTCCAAAAAACAATTCTACAATGTTAAGATGGAGAATATGGAAAAGCATGTTGAAGCCGTAGTTTTGAAATATAGTGAAGAGGTGGACGTTGAACAATTGTCAAAAATGAGTAATCTTAGATTACTCATCAGCAGGAAAGGTGGGAATATCACAAGAAGCCCAAGGAGTCTTTCAAAGAAATTACGATATTTTGAGTGGGTACGATATCCTTCCAAGTATTTGCCATCAAATTTTCACCCCAATGAACTTGTAGAATTGATCTTGAAGAGTAGCAGCCTCATACAACTATGGAAAAACAAGAAGTATCTTCCCAATTTGAGAAAATTGGATCTCCGTCACTCCAAAAATCTAGAAAAGATAAGAGATTTTAGAGAGTTTCCGAATCTTGAGCGGTTAGATTTGGAAGGATGTATAAACCTTGTGGAGTTGGATCCATCTATTGGACTTCTAACAAAGCTTGTTCATTTGAATTTGAAAGGATGTGTAAACCTTGTGGAGTTGGATCCATCTATTGGACTTCTAACAAAGCTTGTTTACTTGAATTTGGACCGTTGCTATAATCTAGTAAGCATACCAAACAACATATTCGGTCTTAGCTCTCTTGAAGATCTAAATATGTGTGGCTGTAGTTCGAAAGTGTTTAACAATTCAAGGCATTTGATGAAGCATGACATAAATGAAAGTGCAGCACATTCCCGATCAACGTCCTCTATCTTCGAATGGACCATGTTGCCTCACCATTCATCGTTTTCGGCTCCAACAAGGCTCACACATTGTTTGCGTAAAGTTGACATTAGCTTTTGCAATCTAAGCCAAGTTCCTTATGCAATTGAATGTTTACGCTCGCTAGAGAGATTAAATTTAGGGGGAAACAATTTTGTGACACTACCTAGCCTGAGGAAGCTTTCCAAACTTGTATATTTAAATTTGGAACATTGCAAGTTGTTGGAATCTTTGCCTCAACTTCCTTCTCCTACCACTATTGGGAGGGAACAAAGACTGTACTACAAGATTGATCATCGTATGAACAAAGATGACTGGACCACAGGATTGATCATTTTCAATTGTCCAAAATTGGGTGAGAGGGAACATTGCAGGAGCATGACATTTTCATGGATGATACAATGCATTCAGGAAAACCAACAACCCTACCCTGCCTATTTTGACGACATTCAAATTGTTATTCCAGGAAGTAAAATACCAAGTTGGATCAACAATCAGAGCATGGGTCATTCAATACTAATAGATGAATCTCCTATTATGCATGACAATAACAATGATATCATAGGCTTTGTATGTTGTGTAGTATTTTCCTTGGCACCTTATCGAGAGTGCTTTTCATCTATGGAACTAGTTTTCAATCATAAGATTTTTAACAGTGTGATTGTTCCAGTAATTCTAAATGGAGGTCTTGTTACGACAAAATCAAGTCACCTATGGATAATCTACTTCCCCCGAGATTCCTATCATGAATTTGGAAAAATGAATTTTGACATTGTTGAGGGGGAAGGTTTGGGTATGGAGGTGAAGAGTTGCGGGTATCGTTGGGTATGTAAACAAGACCTACAAAAGTTCAACTTCACAATGATGAATCATGAAAATTCCTTGGCTCCGATGTGTAAGATTATGGGAATTGAAGGCGAGACACAACCAAGACCAGAACAAGAATCATTCATCTCAAAAGTCATAACTACTTTGAAGAAAGAAGAAACAACAGATGGATCACAAGAAGGTCACAAAGAGTTTCAACCTGACACTTTTGGATTTTTAAAAAAAAAATCTCAAACCTCTACCGTTGAAGTGGCTGATGAAAGTGTAACAGAAAATGGAGTTGATCAAATTGTTGCCGAAGATGAACAACAATCACATATCGATAATGGAAAGGAAGAAGTTTCAGCTGCAACACAGACAGATAGTGATGCAGTTGAGCCCATCCCTGTTATCACAGAATCAGAAGATGACAATGTTGAAGATGTTCCAGATAGCAATGAGATTGATGCTAGTTTGGCTGGACAAAGTGATGATTTCTCTCCTGAGGGAAGCGTGAATAAAGATGTAACTGAAGAAGTGCAAGAAGAACAAACACCTGTCGCAGCACAGATTGAAGAGGTTGCAATTGCATCCGAGACCAACAGCATATCTAATTCTAATGGACAAACAGAAGGCTCGAGTGAAGGTTTCAGTTTCAGTCGCCCGATGATCATCTTGTTTTTGTCCCTACCTGTGTTGAAATTATTAGGGATGTGGGTACGGAGGTGA
Protein sequence

>MsG0680035722.01.T01

MASSSNSSSALVTSSRRNYYDVFVTFRGDDTRNNFADFLFDALETKNISVFRDNTNLQQGESIGPELLRAIEGSQVYVAVFSRNYASSTWCLNELEKICECVKGSGKHVLPVFYDVDPSEVRKQSGIYGKAFVKHEQRFQQDSHKVSIWREALEKVGSIAGWDLRENVRAIGICGMGGIGKTTLAMALYDQICHRFSASCFIDDVTKFYRLHDGPLGAQKQILLETLGIEPHQIYNHYRATNLIRNRLSREKALLILDNVDQVEQLEKIAVRREWLGSGSRIIIISRNEHILKGYGVDEVYKVPLLNQDESHKLFCRKAFKVEKIIMSNYQNLADEILNYANGLPLAIKVLGSFLFGRNVTEWKSALARLRESPDDDVMNVLQLSFDGLKETEKEIYLDIACFFNNRNVEYVKNILNCCGFHADIGLKVLIEKSLISIKNRDIEMHSLLAELGRKIVQNSSSKEPRKWSRLWSKKQFYNVKMENMEKHVEAVVLKYSEEVDVEQLSKMSNLRLLISRKGGNITRSPRSLSKKLRYFEWVRYPSKYLPSNFHPNELVELILKSSSLIQLWKNKKYLPNLRKLDLRHSKNLEKIRDFREFPNLERLDLEGCINLVELDPSIGLLTKLVHLNLKGCVNLVELDPSIGLLTKLVYLNLDRCYNLVSIPNNIFGLSSLEDLNMCGCSSKVFNNSRHLMKHDINESAAHSRSTSSIFEWTMLPHHSSFSAPTRLTHCLRKVDISFCNLSQVPYAIECLRSLERLNLGGNNFVTLPSLRKLSKLVYLNLEHCKLLESLPQLPSPTTIGREQRLYYKIDHRMNKDDWTTGLIIFNCPKLGEREHCRSMTFSWMIQCIQENQQPYPAYFDDIQIVIPGSKIPSWINNQSMGHSILIDESPIMHDNNNDIIGFVCCVVFSLAPYRECFSSMELVFNHKIFNSVIVPVILNGGLVTTKSSHLWIIYFPRDSYHEFGKMNFDIVEGEGLGMEVKSCGYRWVCKQDLQKFNFTMMNHENSLAPMCKIMGIEGETQPRPEQESFISKVITTLKKEETTDGSQEGHKEFQPDTFGFLKKKSQTSTVEVADESVTENGVDQIVAEDEQQSHIDNGKEEVSAATQTDSDAVEPIPVITESEDDNVEDVPDSNEIDASLAGQSDDFSPEGSVNKDVTEEVQEEQTPVAAQIEEVAIASETNSISNSNGQTEGSSEGFSFSRPMIILFLSLPVLKLLGMWVRR*