AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880047337.01


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MsG0880047337.01.T01 AT1G51800 40.071 282 152 7 87 362 585 855 2.29e-53 195
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MsG0880047337.01.T01 AT5G10290 37.864 309 168 8 65 362 270 565 1.27e-52 189
MsG0880047337.01.T01 AT3G46760 36.452 310 179 6 73 381 38 330 1.28e-52 182
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MsG0880047337.01.T01 AT2G25220 44.958 238 119 5 73 307 134 362 1.62e-52 183
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MsG0880047337.01.T01 AT1G49730 35.097 359 207 9 73 423 347 687 1.87e-52 190
MsG0880047337.01.T01 AT2G02220 40.559 286 155 7 82 362 731 1006 1.88e-52 193
MsG0880047337.01.T01 AT4G23240 37.710 297 165 8 73 361 16 300 1.98e-52 182
MsG0880047337.01.T01 AT1G24030 46.479 213 100 5 72 277 49 254 2.29e-52 179
MsG0880047337.01.T01 AT1G79680 36.522 345 198 9 72 411 420 748 2.31e-52 191
MsG0880047337.01.T01 AT1G11130 38.944 303 164 8 66 362 478 765 2.76e-52 191
MsG0880047337.01.T01 AT5G62710 40.493 284 155 7 83 362 310 583 2.84e-52 188
MsG0880047337.01.T01 AT4G31100 40.203 296 163 8 72 362 431 717 2.95e-52 191
MsG0880047337.01.T01 AT4G23280 39.672 305 166 10 63 361 322 614 3.20e-52 189
MsG0880047337.01.T01 AT1G51890 38.217 314 156 8 73 361 560 860 3.51e-52 192
MsG0880047337.01.T01 AT5G60270 39.189 296 160 8 73 361 329 611 3.65e-52 189
MsG0880047337.01.T01 AT4G20450 38.908 293 149 8 73 362 581 846 3.92e-52 191
MsG0880047337.01.T01 AT1G69730 35.043 351 204 9 72 413 434 769 4.50e-52 191
MsG0880047337.01.T01 AT5G01550 39.000 300 164 8 77 371 371 656 4.96e-52 189
MsG0880047337.01.T01 AT4G29990 39.726 292 162 6 73 362 564 843 5.92e-52 191
MsG0880047337.01.T01 AT1G21230 38.047 297 172 6 72 365 395 682 6.23e-52 189
MsG0880047337.01.T01 AT4G11490 37.201 293 172 7 73 361 309 593 6.61e-52 188
MsG0880047337.01.T01 AT4G02410 36.610 295 166 7 75 361 345 626 6.74e-52 188
MsG0880047337.01.T01 AT1G11350 38.644 295 170 6 70 361 497 783 7.21e-52 190
MsG0880047337.01.T01 AT4G21410 38.006 321 177 12 78 386 225 535 7.29e-52 186
MsG0880047337.01.T01 AT5G16000 38.000 300 169 9 69 362 296 584 8.06e-52 187
MsG0880047337.01.T01 AT5G53890 40.878 296 162 6 73 364 742 1028 8.09e-52 191
MsG0880047337.01.T01 AT4G04540 37.069 348 188 11 32 374 311 632 9.23e-52 188
MsG0880047337.01.T01 AT4G23190 36.860 293 171 7 72 358 259 543 1.03e-51 186
MsG0880047337.01.T01 AT4G23190 36.860 293 171 7 72 358 259 543 1.03e-51 186
MsG0880047337.01.T01 AT5G59650 41.365 249 140 5 117 362 612 857 1.28e-51 190
MsG0880047337.01.T01 AT5G59650 41.365 249 140 5 117 362 604 849 1.38e-51 190
MsG0880047337.01.T01 AT2G23950 43.496 246 123 8 65 305 279 513 1.45e-51 185
MsG0880047337.01.T01 AT5G59670 38.225 293 166 7 73 362 554 834 1.45e-51 190
MsG0880047337.01.T01 AT5G59670 38.225 293 166 7 73 362 554 834 1.45e-51 190
MsG0880047337.01.T01 AT4G23150 37.809 283 165 6 78 357 329 603 1.47e-51 187
MsG0880047337.01.T01 AT2G37710 38.014 292 170 7 73 361 335 618 1.59e-51 187
MsG0880047337.01.T01 AT5G49770 41.732 254 137 5 115 362 657 905 1.63e-51 190
MsG0880047337.01.T01 AT1G48210 43.697 238 117 5 77 305 60 289 1.86e-51 179
MsG0880047337.01.T01 AT1G48210 43.697 238 117 5 77 305 60 289 1.86e-51 179
MsG0880047337.01.T01 AT1G48210 43.697 238 117 5 77 305 60 289 1.86e-51 179
MsG0880047337.01.T01 AT3G08760 36.826 334 198 8 40 367 132 458 1.93e-51 185
MsG0880047337.01.T01 AT3G08760 36.826 334 198 8 40 367 132 458 1.93e-51 185
MsG0880047337.01.T01 AT3G08760 36.826 334 198 8 40 367 132 458 1.93e-51 185
MsG0880047337.01.T01 AT3G19300 37.884 293 164 6 73 361 316 594 3.15e-51 186
MsG0880047337.01.T01 AT3G45430 37.942 311 168 8 73 373 332 627 3.31e-51 186
MsG0880047337.01.T01 AT3G45430 37.942 311 168 8 73 373 332 627 3.31e-51 186
MsG0880047337.01.T01 AT3G45430 37.942 311 168 8 73 373 332 627 3.31e-51 186
MsG0880047337.01.T01 AT3G25490 37.217 309 179 7 63 365 83 382 3.58e-51 181
MsG0880047337.01.T01 AT4G11530 36.860 293 173 7 73 361 340 624 4.01e-51 186
MsG0880047337.01.T01 AT4G23190 36.860 293 171 7 72 358 337 621 4.60e-51 186
MsG0880047337.01.T01 AT4G23130 44.915 236 116 7 59 290 320 545 4.76e-51 184
MsG0880047337.01.T01 AT4G21410 38.006 321 177 12 78 386 350 660 4.78e-51 186
MsG0880047337.01.T01 AT5G49760 40.067 297 160 6 72 362 618 902 5.17e-51 189
MsG0880047337.01.T01 AT1G61420 38.000 300 165 9 70 364 331 614 5.83e-51 186

Find 118 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 168 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AATGCAAAACTCTCTGATTT+TGG 0.150273 8:-84857807 MsG0880047337.01.T01:CDS
GTGATTTAAGTGGATGTTTA+TGG 0.213179 8:+84856884 None:intergenic
AAACACCAAAGGAGAGAAAA+AGG 0.248046 8:-84857115 MsG0880047337.01.T01:CDS
TGTCTAGGTGCTATATTAAA+TGG 0.270775 8:+84859238 None:intergenic
TAGACTGAGGTTGTGTTTCT+TGG 0.294608 8:-84858287 MsG0880047337.01.T01:CDS
GGCTGTTAAGCTCTTAGATT+TGG 0.297629 8:-84858545 MsG0880047337.01.T01:CDS
TCAGAAAGCCAAGGAAATTA+AGG 0.310328 8:-84856787 MsG0880047337.01.T01:CDS
GACATTGTAGGTCTATTTCT+TGG 0.331218 8:+84857260 None:intergenic
ATGAGTGATGTGTATAGTTT+TGG 0.335406 8:-84857491 MsG0880047337.01.T01:CDS
ATAATAAGATGCTTTGGCTT+AGG 0.345412 8:+84857035 None:intergenic
TCCACTAGATTCTGTTCTCT+TGG 0.351696 8:+84857413 None:intergenic
TAAAGGTTTCATTGATGATA+AGG 0.354928 8:-84858596 MsG0880047337.01.T01:CDS
TTTCTTGGTGAAGGAGGGTT+TGG 0.355769 8:-84858628 MsG0880047337.01.T01:CDS
TTACCTGTCATGATATATTC+AGG 0.358728 8:+84857708 None:intergenic
CTTAATTTCCTTAATTTCCT+TGG 0.360747 8:+84856779 None:intergenic
AAGGGTTTAAGACTTTATAA+AGG 0.368668 8:+84859121 None:intergenic
TGAAGAAGAACATAGACTTT+TGG 0.376618 8:-84858219 MsG0880047337.01.T01:CDS
CAACACCTTGTGAAGTTGAT+TGG 0.377887 8:-84858251 MsG0880047337.01.T01:CDS
TAATAAGATGCTTTGGCTTA+GGG 0.380486 8:+84857036 None:intergenic
GTTCTCTTGGAGCTATTAAC+TGG 0.384190 8:-84857464 MsG0880047337.01.T01:CDS
AGATGTGGTTGTGGAAGGTT+TGG 0.395278 8:+84859007 None:intergenic
AGAAGATCTTTCAATTTCTC+TGG 0.396363 8:-84858722 MsG0880047337.01.T01:CDS
TTTAAGTAATTGATTAATCA+AGG 0.401123 8:+84856518 None:intergenic
GGGTTTGGACCTGTTCATAA+AGG 0.403551 8:-84858613 MsG0880047337.01.T01:CDS
TTATCAATAATAAGATGCTT+TGG 0.404262 8:+84857029 None:intergenic
TAGGTCTATTTCTTGGCCTA+TGG 0.405035 8:+84857267 None:intergenic
AAAATTGCTGTTGGAGCAAA+AGG 0.411778 8:-84858008 MsG0880047337.01.T01:CDS
ACATGTGTGTCATCTCCTTC+AGG 0.417488 8:+84857768 None:intergenic
AAGGAGAAGAAAAGGGAAAA+TGG 0.418158 8:-84856949 MsG0880047337.01.T01:CDS
GATCTTTCAATTTCTCTGGC+AGG 0.423726 8:-84858718 MsG0880047337.01.T01:CDS
TTGGCTTTCTGATGTAATAG+AGG 0.428036 8:+84856798 None:intergenic
AGCTTAACAGCCACAGGTTG+AGG 0.430695 8:+84858556 None:intergenic
TCGTAAACTAAGCAGAATAA+TGG 0.431550 8:-84857363 MsG0880047337.01.T01:CDS
ATACACCTAAGGAGAAGAAA+AGG 0.434355 8:-84856957 MsG0880047337.01.T01:CDS
TCAATGAAACCTTTATGAAC+AGG 0.437899 8:+84858604 None:intergenic
CTTATCAATGTTTAAGCCAT+AGG 0.438236 8:-84857283 MsG0880047337.01.T01:CDS
GTGTAAACAAACGGACCTAT+TGG 0.439204 8:+84857191 None:intergenic
TATAGATATGTATTATTATG+TGG 0.443040 8:+84859080 None:intergenic
TAAGACTTTATAAAGGAAAG+AGG 0.450773 8:+84859128 None:intergenic
ACTAGATTCTGTTCTCTTGG+TGG 0.455972 8:+84857416 None:intergenic
AGAACAGAATCTAGTGGAAT+GGG 0.458568 8:-84857408 MsG0880047337.01.T01:CDS
TCTGAAAGTGTTGTGGCACT+TGG 0.458934 8:+84858742 None:intergenic
TGATTCTCTAAGCTTCCTCT+TGG 0.460893 8:+84858182 None:intergenic
ATTGATGATAAGGTTAGAGC+TGG 0.467497 8:-84858586 MsG0880047337.01.T01:CDS
CAATTAACAGTGTATGATCT+TGG 0.467579 8:+84856736 None:intergenic
ATATCATCAAAATCTTTAAG+AGG 0.467858 8:+84857215 None:intergenic
AGCAAGAAAAGCAGCTGCAT+TGG 0.472499 8:-84857306 MsG0880047337.01.T01:CDS
GAATACTGTCCTTCAAGCCT+TGG 0.473647 8:+84857338 None:intergenic
TAGAGAGATGTGGTTGTGGA+AGG 0.476918 8:+84859002 None:intergenic
AATAGGTCCGTTTGTTTACA+CGG 0.478736 8:-84857189 MsG0880047337.01.T01:CDS
TTGAAATCTCTATAGATGAC+TGG 0.478934 8:+84857957 None:intergenic
TCATTATTACTAACATCAGT+TGG 0.487731 8:+84857164 None:intergenic
GATGTGGTTGTGGAAGGTTT+GGG 0.490596 8:+84859008 None:intergenic
ATAGATATGTATTATTATGT+GGG 0.503134 8:+84859081 None:intergenic
ATCTTTCAATTTCTCTGGCA+GGG 0.503631 8:-84858717 MsG0880047337.01.T01:CDS
GTTAAGCTCTTAGATTTGGA+TGG 0.506036 8:-84858541 MsG0880047337.01.T01:CDS
ATAATGGATCCAAGGCTTGA+AGG 0.506287 8:-84857347 MsG0880047337.01.T01:CDS
ATCAGCATGCTTTCCATGCT+AGG 0.507630 8:+84856632 None:intergenic
ACAAGAATGAAAATTGCTGT+TGG 0.508199 8:-84858017 MsG0880047337.01.T01:CDS
GATGTAATAGAGGAGGTATC+TGG 0.509076 8:+84856808 None:intergenic
GAGAACAGAATCTAGTGGAA+TGG 0.514804 8:-84857409 MsG0880047337.01.T01:CDS
TCAAGGTCATAGAGAATGGC+TGG 0.520008 8:-84858515 MsG0880047337.01.T01:intron
GTACTCAAGGTCATAGAGAA+TGG 0.520425 8:-84858519 MsG0880047337.01.T01:CDS
TTTATGTATATAATATAGAA+GGG 0.522598 8:+84859276 None:intergenic
GATATAGAGAGATGTGGTTG+TGG 0.525317 8:+84858998 None:intergenic
TCAAATGAGGGACAACAAAG+TGG 0.527387 8:-84856847 MsG0880047337.01.T01:CDS
AGGGTGGTTGTTGTTTGCAT+AGG 0.527930 8:+84859295 None:intergenic
AAGGAGAAGTGGAAATTCAA+TGG 0.528765 8:-84856656 MsG0880047337.01.T01:CDS
TGAAGGACAGTATTCTGAGA+TGG 0.531993 8:-84857330 MsG0880047337.01.T01:CDS
TCTAAGAGCTTAACAGCCAC+AGG 0.537109 8:+84858550 None:intergenic
AAGACTTTATAAAGGAAAGA+GGG 0.539644 8:+84859129 None:intergenic
ACATGTTTCAACTAGAGTGA+TGG 0.543928 8:-84857751 MsG0880047337.01.T01:CDS
GTTGGAACCGTGTAAACAAA+CGG 0.548535 8:+84857182 None:intergenic
TCAAGCTGTTATCAGGGTGA+AGG 0.549295 8:-84858868 MsG0880047337.01.T01:CDS
CATGTTTCAACTAGAGTGAT+GGG 0.555418 8:-84857750 MsG0880047337.01.T01:CDS
GCACCTGAATATATCATGAC+AGG 0.558972 8:-84857711 MsG0880047337.01.T01:intron
GAAGGACAGTATTCTGAGAT+GGG 0.560023 8:-84857329 MsG0880047337.01.T01:CDS
TTAACCACGGTAGACATTGT+AGG 0.562416 8:+84857248 None:intergenic
TTAGATTTGGATGGTACTCA+AGG 0.567670 8:-84858532 MsG0880047337.01.T01:CDS
GGTTGTGGAAGGTTTGGGAT+AGG 0.567967 8:+84859013 None:intergenic
ATACTAGTATGTCAATGAGC+TGG 0.570628 8:-84856710 MsG0880047337.01.T01:CDS
TACACCTAAGGAGAAGAAAA+GGG 0.571327 8:-84856956 MsG0880047337.01.T01:CDS
ACTAGAGTGATGGGCACTCA+AGG 0.575066 8:-84857741 MsG0880047337.01.T01:CDS
GAAATTCAATGGTCCTAGCA+TGG 0.576298 8:-84856645 MsG0880047337.01.T01:exon
AACTGATGTTAGTAATAATG+AGG 0.577584 8:-84857162 MsG0880047337.01.T01:CDS
TAAGCAGAATAATGGATCCA+AGG 0.579041 8:-84857355 MsG0880047337.01.T01:CDS
AAACAAAGACAAAGGAGAAG+TGG 0.583658 8:-84856667 MsG0880047337.01.T01:CDS
AGAATATTATGATACACCTA+AGG 0.588629 8:-84856968 MsG0880047337.01.T01:CDS
TGATTGATGCAAAACTTGCT+TGG 0.591856 8:+84858943 None:intergenic
TTACGAGCATCGTTTAACAC+TGG 0.595989 8:+84857380 None:intergenic
TCTATTACATCAGAAAGCCA+AGG 0.600551 8:-84856796 MsG0880047337.01.T01:CDS
TTGGCAAAAGATGGTCCTGA+AGG 0.606825 8:-84857783 MsG0880047337.01.T01:CDS
ATGTATATAATATAGAAGGG+TGG 0.608210 8:+84859279 None:intergenic
CGCTACTATTGAAACACCAA+AGG 0.609115 8:-84857126 MsG0880047337.01.T01:CDS
GTGGATGTTTATGGCCATTG+TGG 0.610101 8:+84856893 None:intergenic
AAAACAAAATCATCAAATGA+GGG 0.610821 8:-84856859 MsG0880047337.01.T01:CDS
ACCAAGAGAACAGAATCTAG+TGG 0.610898 8:-84857414 MsG0880047337.01.T01:CDS
GAGCTCAAGATCATTACTCA+AGG 0.612894 8:-84858667 MsG0880047337.01.T01:CDS
TATGTATTATTATGTGGGGA+TGG 0.613147 8:+84859086 None:intergenic
TGGCTTCAAGCAAATAAAGT+CGG 0.620372 8:-84856690 MsG0880047337.01.T01:CDS
GCTTTCTGATGTAATAGAGG+AGG 0.623825 8:+84856801 None:intergenic
GATATTCAACATCGTTACCA+TGG 0.624391 8:-84858043 MsG0880047337.01.T01:CDS
GTCATCTATAGAGATTTCAA+AGG 0.633845 8:-84857954 MsG0880047337.01.T01:CDS
CATCATCATCATCGCCACAA+TGG 0.638195 8:-84856907 MsG0880047337.01.T01:CDS
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AATGTAGATATAGAGAGATG+TGG 0.641971 8:+84858992 None:intergenic
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ACAGAGGAAAATTTCAACAC+GGG 0.645186 8:-84859196 MsG0880047337.01.T01:five_prime_UTR
AAGATCTTCTGAAAGTGTTG+TGG 0.647471 8:+84858735 None:intergenic
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AACAGAGGAAAATTTCAACA+CGG 0.677209 8:-84859197 MsG0880047337.01.T01:five_prime_UTR
AATATCCAATCAACTTCACA+AGG 0.680273 8:+84858246 None:intergenic
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AGGTTCAAGAGTGTTAACCA+CGG 0.764784 8:+84857235 None:intergenic

CRISPR-GE

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!!! TTTTCTTAATTTGTTTTTTT+TGG - Chr8:84857716-84857735 MsG0880047337.01.T01:CDS 10.0%
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!! TTTAAGTAATTGATTAATCA+AGG + Chr8:84859279-84859298 None:intergenic 15.0%
!!! TCAATTTTATTTCAACATAT+AGG - Chr8:84858267-84858286 MsG0880047337.01.T01:CDS 15.0%
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!!! TCATTTGATGATTTTGTTTT+TGG + Chr8:84858935-84858954 None:intergenic 20.0%
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! ATGTATATAATATAGAAGGG+TGG + Chr8:84856518-84856537 None:intergenic 25.0%
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! GATGTGAAATGTAAACATAA+TGG + Chr8:84858148-84858167 None:intergenic 25.0%
! TAAGACTTTATAAAGGAAAG+AGG + Chr8:84856669-84856688 None:intergenic 25.0%
! TCATTATTACTAACATCAGT+TGG + Chr8:84858633-84858652 None:intergenic 25.0%
!! AAGGGTTTAAGACTTTATAA+AGG + Chr8:84856676-84856695 None:intergenic 25.0%
!! TAAAGGTTTCATTGATGATA+AGG - Chr8:84857198-84857217 MsG0880047337.01.T01:CDS 25.0%
!! TTCTCTTCAAGTAATTTTCT+TGG - Chr8:84857151-84857170 MsG0880047337.01.T01:CDS 25.0%
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!!! ATATTTTCAAGCTGTTATCA+GGG - Chr8:84856920-84856939 MsG0880047337.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTGTTTTTGGTGATTTAAG+TGG + Chr8:84858923-84858942 None:intergenic 25.0%
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AATGTAGATATAGAGAGATG+TGG + Chr8:84856805-84856824 None:intergenic 30.0%
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GTCATCTATAGAGATTTCAA+AGG - Chr8:84857840-84857859 MsG0880047337.01.T01:intron 30.0%
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! TGTCTAGGTGCTATATTAAA+TGG + Chr8:84856559-84856578 None:intergenic 30.0%
!! GATATTTTCAAGCTGTTATC+AGG - Chr8:84856919-84856938 MsG0880047337.01.T01:CDS 30.0%
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!! TCTTTTGATTATTGGTGTCT+AGG + Chr8:84856574-84856593 None:intergenic 30.0%
!!! GTTTCTTTTGTTGTTGCTTT+AGG + Chr8:84856965-84856984 None:intergenic 30.0%
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AAACACCAAAGGAGAGAAAA+AGG - Chr8:84858679-84858698 MsG0880047337.01.T01:CDS 35.0%
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AACACCAAAGGAGAGAAAAA+GGG - Chr8:84858680-84858699 MsG0880047337.01.T01:CDS 35.0%
AAGGAGAAGAAAAGGGAAAA+TGG - Chr8:84858845-84858864 MsG0880047337.01.T01:CDS 35.0%
AAGGAGAAGTGGAAATTCAA+TGG - Chr8:84859138-84859157 MsG0880047337.01.T01:five_prime_UTR 35.0%
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AATGTATCATCTCTGGATCT+AGG - Chr8:84857926-84857945 MsG0880047337.01.T01:intron 35.0%
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ATACACCTAAGGAGAAGAAA+AGG - Chr8:84858837-84858856 MsG0880047337.01.T01:CDS 35.0%
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GTATATGAGTATTTGCCAAG+AGG - Chr8:84857597-84857616 MsG0880047337.01.T01:intron 35.0%
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TGGCTTCAAGCAAATAAAGT+CGG - Chr8:84859104-84859123 MsG0880047337.01.T01:five_prime_UTR 35.0%
TTAGACACATTGCTTAAGTC+TGG + Chr8:84858170-84858189 None:intergenic 35.0%
TTAGATTTGGATGGTACTCA+AGG - Chr8:84857262-84857281 MsG0880047337.01.T01:CDS 35.0%
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! GACATTGTAGGTCTATTTCT+TGG + Chr8:84858537-84858556 None:intergenic 35.0%
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!! TAAGCAGAATAATGGATCCA+AGG - Chr8:84858439-84858458 MsG0880047337.01.T01:intron 35.0%
!!! AAAACTCTCTGATTTTGGCT+TGG - Chr8:84857992-84858011 MsG0880047337.01.T01:CDS 35.0%
!!! TAGTTTTGGAGTTGTTCTCT+TGG - Chr8:84858317-84858336 MsG0880047337.01.T01:intron 35.0%
ACCAAGAGAACAGAATCTAG+TGG - Chr8:84858380-84858399 MsG0880047337.01.T01:intron 40.0%
ACTAGATTCTGTTCTCTTGG+TGG + Chr8:84858381-84858400 None:intergenic 40.0%
CAAATGAGGGACAACAAAGT+GGG - Chr8:84858948-84858967 MsG0880047337.01.T01:five_prime_UTR 40.0%
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GAGAACAGAATCTAGTGGAA+TGG - Chr8:84858385-84858404 MsG0880047337.01.T01:intron 40.0%
GAGCTCAAGATCATTACTCA+AGG - Chr8:84857127-84857146 MsG0880047337.01.T01:CDS 40.0%
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GCACCTGAATATATCATGAC+AGG - Chr8:84858083-84858102 MsG0880047337.01.T01:intron 40.0%
GCTTTCTGATGTAATAGAGG+AGG + Chr8:84858996-84859015 None:intergenic 40.0%
GGCTGTTAAGCTCTTAGATT+TGG - Chr8:84857249-84857268 MsG0880047337.01.T01:CDS 40.0%
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GTACTCAAGGTCATAGAGAA+TGG - Chr8:84857275-84857294 MsG0880047337.01.T01:CDS 40.0%
GTGTAAACAAACGGACCTAT+TGG + Chr8:84858606-84858625 None:intergenic 40.0%
GTGTTTGTCGTGTCATACAT+CGG + Chr8:84857386-84857405 None:intergenic 40.0%
GTTCTCTTGGAGCTATTAAC+TGG - Chr8:84858330-84858349 MsG0880047337.01.T01:intron 40.0%
GTTCTGATGACAATAGACTG+AGG - Chr8:84857494-84857513 MsG0880047337.01.T01:CDS 40.0%
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TATGTGGGGATGGTGAAAAA+TGG + Chr8:84856701-84856720 None:intergenic 40.0%
TCAAATGAGGGACAACAAAG+TGG - Chr8:84858947-84858966 MsG0880047337.01.T01:five_prime_UTR 40.0%
TCCACTAGATTCTGTTCTCT+TGG + Chr8:84858384-84858403 None:intergenic 40.0%
TGATTCTCTAAGCTTCCTCT+TGG + Chr8:84857615-84857634 None:intergenic 40.0%
TTAACCACGGTAGACATTGT+AGG + Chr8:84858549-84858568 None:intergenic 40.0%
! CAACACCTTGTGAAGTTGAT+TGG - Chr8:84857543-84857562 MsG0880047337.01.T01:intron 40.0%
! CTTTCCCTTTTTCTCTCCTT+TGG + Chr8:84858687-84858706 None:intergenic 40.0%
! TAGGTCTATTTCTTGGCCTA+TGG + Chr8:84858530-84858549 None:intergenic 40.0%
! TGAAGGACAGTATTCTGAGA+TGG - Chr8:84858464-84858483 MsG0880047337.01.T01:intron 40.0%
! TTACGAGCATCGTTTAACAC+TGG + Chr8:84858417-84858436 None:intergenic 40.0%
!! AGGTTCAAGAGTGTTAACCA+CGG + Chr8:84858562-84858581 None:intergenic 40.0%
!! ATAATGGATCCAAGGCTTGA+AGG - Chr8:84858447-84858466 MsG0880047337.01.T01:intron 40.0%
!! GAAGGACAGTATTCTGAGAT+GGG - Chr8:84858465-84858484 MsG0880047337.01.T01:intron 40.0%
!! GATGTAATAGAGGAGGTATC+TGG + Chr8:84858989-84859008 None:intergenic 40.0%
!!! GATTTTGGCTTGGCAAAAGA+TGG - Chr8:84858002-84858021 MsG0880047337.01.T01:CDS 40.0%
ACATGTGTGTCATCTCCTTC+AGG + Chr8:84858029-84858048 None:intergenic 45.0%
AGATGTGGTTGTGGAAGGTT+TGG + Chr8:84856790-84856809 None:intergenic 45.0%
AGCAAGAAAAGCAGCTGCAT+TGG - Chr8:84858488-84858507 MsG0880047337.01.T01:intron 45.0%
ATCAGCATGCTTTCCATGCT+AGG + Chr8:84859165-84859184 None:intergenic 45.0%
CATCATCATCATCGCCACAA+TGG - Chr8:84858887-84858906 MsG0880047337.01.T01:CDS 45.0%
GAATACTGTCCTTCAAGCCT+TGG + Chr8:84858459-84858478 None:intergenic 45.0%
GATGTGGTTGTGGAAGGTTT+GGG + Chr8:84856789-84856808 None:intergenic 45.0%
GGGTTTGGACCTGTTCATAA+AGG - Chr8:84857181-84857200 MsG0880047337.01.T01:CDS 45.0%
GTGGATGTTTATGGCCATTG+TGG + Chr8:84858904-84858923 None:intergenic 45.0%
TAGACCTACAATGTCTACCG+TGG - Chr8:84858542-84858561 MsG0880047337.01.T01:CDS 45.0%
TAGAGAGATGTGGTTGTGGA+AGG + Chr8:84856795-84856814 None:intergenic 45.0%
TCAAGCTGTTATCAGGGTGA+AGG - Chr8:84856926-84856945 MsG0880047337.01.T01:CDS 45.0%
TCAAGGTCATAGAGAATGGC+TGG - Chr8:84857279-84857298 MsG0880047337.01.T01:CDS 45.0%
TCTAAGAGCTTAACAGCCAC+AGG + Chr8:84857247-84857266 None:intergenic 45.0%
TGGTAGAAGATCAGTCGACA+AGG - Chr8:84858350-84858369 MsG0880047337.01.T01:intron 45.0%
TTGGCAAAAGATGGTCCTGA+AGG - Chr8:84858011-84858030 MsG0880047337.01.T01:CDS 45.0%
TTTCTTGGTGAAGGAGGGTT+TGG - Chr8:84857166-84857185 MsG0880047337.01.T01:CDS 45.0%
!! TCTGAAAGTGTTGTGGCACT+TGG + Chr8:84857055-84857074 None:intergenic 45.0%
!! TATATTATATACATAAAAAA+AGG - Chr8:84856524-84856543 MsG0880047337.01.T01:three_prime_UTR 5.0%
AGCTTAACAGCCACAGGTTG+AGG + Chr8:84857241-84857260 None:intergenic 50.0%
TGGACTTGAACCTCAACCTG+TGG - Chr8:84857228-84857247 MsG0880047337.01.T01:CDS 50.0%
! GGTTGTGGAAGGTTTGGGAT+AGG + Chr8:84856784-84856803 None:intergenic 50.0%
!! ACTAGAGTGATGGGCACTCA+AGG - Chr8:84858053-84858072 MsG0880047337.01.T01:intron 50.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 84856502 84859314 84856502 ID=MsG0880047337.01;Name=MsG0880047337.01
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Chr8 exon 84856502 84857527 84856502 ID=MsG0880047337.01.T01:exon:19521;Parent=MsG0880047337.01.T01
Chr8 exon 84857712 84857835 84857712 ID=MsG0880047337.01.T01:exon:19520;Parent=MsG0880047337.01.T01
Chr8 exon 84857932 84858065 84857932 ID=MsG0880047337.01.T01:exon:19519;Parent=MsG0880047337.01.T01
Chr8 exon 84858171 84858306 84858171 ID=MsG0880047337.01.T01:exon:19518;Parent=MsG0880047337.01.T01
Chr8 exon 84858516 84859314 84858516 ID=MsG0880047337.01.T01:exon:19517;Parent=MsG0880047337.01.T01
Chr8 five_prime_UTR 84858918 84859314 84858918 ID=MsG0880047337.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0880047337.01.T01
Chr8 CDS 84858516 84858917 84858516 ID=MsG0880047337.01.T01:cds;Parent=MsG0880047337.01.T01
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Chr8 three_prime_UTR 84856502 84856649 84856502 ID=MsG0880047337.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0880047337.01.T01
Gene Sequence

>MsG0880047337.01.T01

ATGAAAATCACGTGGAAATCGATATTTTCAAGCTGTTATCAGGGTGAAGGTGAGTACACTTCACCTAAAGCAACAACAAAAGAAACATCAACAAAAGTTGTTGCTACAAAGACAAGTTCTTTTAACAGAATATCTCTCACGGATCTGAGTTTTCCAAGTGCCACAACACTTTCAGAAGATCTTTCAATTTCTCTGGCAGGGTCTAATCTCTATGTTTTTACACTAGCTGAGCTCAAGATCATTACTCAAGGTTTCTCTTCAAGTAATTTTCTTGGTGAAGGAGGGTTTGGACCTGTTCATAAAGGTTTCATTGATGATAAGGTTAGAGCTGGACTTGAACCTCAACCTGTGGCTGTTAAGCTCTTAGATTTGGATGGTACTCAAGGTCATAGAGAATGGCTGACTGAGGTTGTGTTTCTTGGTCAACTGAGACATCAACACCTTGTGAAGTTGATTGGATATTGCTGTGAAGAAGAACATAGACTTTTGGTATATGAGTATTTGCCAAGAGGAAGCTTAGAGAATCAATTATTTAAAAGATATTCAACATCGTTACCATGGTCAACAAGAATGAAAATTGCTGTTGGAGCAAAAGGTCTAGCTTTTTTACATGATGCAAAGAAACCAGTCATCTATAGAGATTTCAAAGGATCAAATATCTTATTAGACTCCGACTATAATGCAAAACTCTCTGATTTTGGCTTGGCAAAAGATGGTCCTGAAGGAGATGACACACATGTTTCAACTAGAGTGATGGGCACTCAAGGTTATGCTGCACCTGAATATATCATGACAGGACATTTGACAGCAATGAGTGATGTGTATAGTTTTGGAGTTGTTCTCTTGGAGCTATTAACTGGTAGAAGATCAGTCGACAAGGTACGTCCACCAAGAGAACAGAATCTAGTGGAATGGGCTAGACCAGTGTTAAACGATGCTCGTAAACTAAGCAGAATAATGGATCCAAGGCTTGAAGGACAGTATTCTGAGATGGGAGCAAGAAAAGCAGCTGCATTGGCTTATCAATGTTTAAGCCATAGGCCAAGAAATAGACCTACAATGTCTACCGTGGTTAACACTCTTGAACCTCTTAAAGATTTTGATGATATGCCAATAGGTCCGTTTGTTTACACGGTTCCAACTGATGTTAGTAATAATGAGGTGCAAAAAGAAAGCGCTACTATTGAAACACCAAAGGAGAGAAAAAGGGAAAGTAGTAGTAGTACTAGCACTCATCATCGTAGAAATCAAGATGTCAATAATAGCCCTAAGCCAAAGCATCTTATTATTGATAATAACAATAATGAAGTACTAGTACATAAAAAGATGGAGAAGAATATTATGATACACCTAAGGAGAAGAAAAGGGAAAATGGTCATCGTCATAGAAGTCATCATCATCATCATCGCCACAATGGCCATAAACATCCACTTAAATCACCAAAAACAAAATCATCAAATGAGGGACAACAAAGTGGGTCACACTCACACTCACCAGATACCTCCTCTATTACATCAGAAAGCCAAGGAAATTAAGGAAATTAAGTATAGTTTAGTAGAGACGTACCAAGATCATACACTGTTAATTGTATATACTAGTATGTCAATGAGCTGGCTTCAAGCAAATAAAGTCGGAAACAAAGACAAAGGAGAAGTGGAAATTCAATGGTCCTAG

Protein sequence

>MsG0880047337.01.T01

MKITWKSIFSSCYQGEGEYTSPKATTKETSTKVVATKTSSFNRISLTDLSFPSATTLSEDLSISLAGSNLYVFTLAELKIITQGFSSSNFLGEGGFGPVHKGFIDDKVRAGLEPQPVAVKLLDLDGTQGHREWLTEVVFLGQLRHQHLVKLIGYCCEEEHRLLVYEYLPRGSLENQLFKRYSTSLPWSTRMKIAVGAKGLAFLHDAKKPVIYRDFKGSNILLDSDYNAKLSDFGLAKDGPEGDDTHVSTRVMGTQGYAAPEYIMTGHLTAMSDVYSFGVVLLELLTGRRSVDKVRPPREQNLVEWARPVLNDARKLSRIMDPRLEGQYSEMGARKAAALAYQCLSHRPRNRPTMSTVVNTLEPLKDFDDMPIGPFVYTVPTDVSNNEVQKESATIETPKERKRESSSSTSTHHRRNQDVNNSPKPKHLIIDNNNNEVLVHKKMEKNIMIHLRRRKGKMVIVIEVIIIIIATMAINIHLNHQKQNHQMRDNKVGHTHTHQIPPLLHQKAKEIKEIKYSLVETYQDHTLLIVYTSMSMSWLQANKVGNKDKGEVEIQWS*