AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780036113.01

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MsG0780036113.01.T01 AT5G61480 29.213 267 152 4 139 400 81 315 1.27e-20 98.2
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MsG0780036113.01.T01 AT5G65710 30.808 396 224 11 38 399 49 428 7.77e-34 140
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MsG0780036113.01.T01 AT2G02220 33.929 280 154 9 72 324 337 612 4.30e-23 106
MsG0780036113.01.T01 AT2G02220 31.325 249 136 4 137 382 74 290 2.94e-21 100
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MsG0780036113.01.T01 AT3G28040 31.565 377 203 7 87 410 169 543 6.10e-35 144
MsG0780036113.01.T01 AT3G28040 30.693 303 181 7 139 413 77 378 5.64e-26 115
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MsG0780036113.01.T01 AT3G11010 40.000 320 182 3 47 365 15 325 3.43e-45 175
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MsG0780036113.01.T01 AT1G73066 35.526 304 176 4 93 377 291 593 7.95e-39 153
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MsG0780036113.01.T01 AT1G61500 32.130 277 170 5 493 758 489 758 1.00e-41 164
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MsG0780036113.01.T01 AT3G23120 30.296 406 195 9 86 403 273 678 1.54e-26 116
MsG0780036113.01.T01 AT3G23120 31.429 315 173 10 102 399 410 698 3.12e-21 99.8
MsG0780036113.01.T01 AT3G23120 44.792 96 53 0 90 185 608 703 5.51e-12 70.1
MsG0780036113.01.T01 AT3G23120 28.571 252 138 7 91 324 471 698 4.06e-11 67.4
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MsG0780036113.01.T01 AT1G56120 34.304 309 175 6 89 373 67 371 1.04e-33 140
MsG0780036113.01.T01 AT1G51800 30.649 447 272 13 345 763 414 850 1.48e-40 161
MsG0780036113.01.T01 AT1G49730 32.486 354 202 10 390 726 213 546 1.49e-40 159
MsG0780036113.01.T01 AT4G23190 28.650 363 226 7 418 763 196 542 1.52e-40 158
MsG0780036113.01.T01 AT4G23190 28.650 363 226 7 418 763 196 542 1.52e-40 158
MsG0780036113.01.T01 AT1G26150 32.192 292 178 5 489 767 419 703 1.53e-40 160
MsG0780036113.01.T01 AT1G56120 41.284 218 119 4 490 704 682 893 1.61e-40 161
MsG0780036113.01.T01 AT1G56120 34.740 308 175 6 89 373 92 396 1.03e-33 140
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MsG0780036113.01.T01 AT2G30740 38.496 226 127 5 488 704 59 281 1.73e-40 153
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MsG0780036113.01.T01 AT4G21400 31.849 292 176 7 488 764 349 632 1.01e-39 157
MsG0780036113.01.T01 AT1G64210 25.824 546 319 16 252 763 81 574 1.03e-39 155
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MsG0780036113.01.T01 AT1G64210 42.742 124 69 2 180 303 81 202 4.37e-16 82.8
MsG0780036113.01.T01 AT1G64210 33.562 146 87 2 228 373 81 216 1.72e-11 68.2
MsG0780036113.01.T01 AT4G04490 30.726 358 217 8 422 763 260 602 1.05e-39 157
MsG0780036113.01.T01 AT4G23180 32.056 287 179 5 487 763 335 615 1.09e-39 157
MsG0780036113.01.T01 AT1G61420 30.537 298 187 7 493 777 487 777 1.10e-39 158
MsG0780036113.01.T01 AT4G21400 31.849 292 176 7 488 764 337 620 1.13e-39 157
MsG0780036113.01.T01 AT1G61420 30.537 298 187 7 493 777 489 779 1.14e-39 158
MsG0780036113.01.T01 AT1G61420 30.537 298 187 7 493 777 489 779 1.14e-39 158
MsG0780036113.01.T01 AT1G53440 30.678 339 209 8 435 763 612 934 1.16e-39 159
MsG0780036113.01.T01 AT1G53440 35.069 288 170 7 116 397 89 365 1.18e-36 149
MsG0780036113.01.T01 AT1G53440 33.333 273 154 8 175 424 100 367 1.79e-24 110
MsG0780036113.01.T01 AT1G53440 29.798 198 112 3 86 258 178 373 5.14e-15 80.1
MsG0780036113.01.T01 AT3G46290 30.542 406 243 12 387 763 356 751 1.22e-39 158
MsG0780036113.01.T01 AT4G02420 30.565 301 192 6 487 774 337 633 1.26e-39 156
MsG0780036113.01.T01 AT4G23190 31.724 290 179 5 418 701 274 550 1.28e-39 155
MsG0780036113.01.T01 AT1G11050 36.519 293 163 7 431 708 223 507 1.48e-39 155
MsG0780036113.01.T01 AT4G11470 31.206 282 175 5 496 765 340 614 1.53e-39 156
MsG0780036113.01.T01 AT5G06740 28.571 357 232 8 437 777 267 616 1.64e-39 156
MsG0780036113.01.T01 AT4G11470 31.206 282 175 5 496 765 335 609 1.65e-39 156
MsG0780036113.01.T01 AT5G06740 28.571 357 232 8 437 777 279 628 1.83e-39 156
MsG0780036113.01.T01 AT1G26150 37.004 227 138 3 489 714 419 641 1.85e-39 155
MsG0780036113.01.T01 AT1G51830 28.118 441 279 10 337 763 242 658 1.96e-39 156
MsG0780036113.01.T01 AT1G51830 28.118 441 279 10 337 763 235 651 2.07e-39 156
MsG0780036113.01.T01 AT4G23740 25.139 541 345 15 252 760 86 598 2.16e-39 155
MsG0780036113.01.T01 AT4G23740 37.879 132 80 2 115 245 68 198 3.42e-17 86.7
MsG0780036113.01.T01 AT4G23740 34.066 182 108 6 28 208 40 210 4.51e-14 76.6
MsG0780036113.01.T01 AT4G23740 35.938 128 79 3 151 276 80 206 5.28e-13 73.2
MsG0780036113.01.T01 AT4G23740 39.098 133 78 3 101 231 78 209 1.08e-12 72.0
MsG0780036113.01.T01 AT4G23740 35.938 128 79 3 175 300 80 206 1.07e-11 68.9
MsG0780036113.01.T01 AT4G23740 25.139 541 345 15 252 760 86 598 2.16e-39 155
MsG0780036113.01.T01 AT4G23740 37.879 132 80 2 115 245 68 198 3.42e-17 86.7
MsG0780036113.01.T01 AT4G23740 34.066 182 108 6 28 208 40 210 4.51e-14 76.6
MsG0780036113.01.T01 AT4G23740 35.938 128 79 3 151 276 80 206 5.28e-13 73.2
MsG0780036113.01.T01 AT4G23740 39.098 133 78 3 101 231 78 209 1.08e-12 72.0
MsG0780036113.01.T01 AT4G23740 35.938 128 79 3 175 300 80 206 1.07e-11 68.9
MsG0780036113.01.T01 AT4G03230 32.862 283 174 5 491 763 516 792 2.37e-39 157
MsG0780036113.01.T01 AT1G51820 27.778 468 299 12 308 763 403 843 2.41e-39 157
MsG0780036113.01.T01 AT4G03230 32.862 283 174 5 491 763 524 800 2.46e-39 157
MsG0780036113.01.T01 AT5G16900 28.151 476 272 14 311 767 418 842 2.63e-39 157
MsG0780036113.01.T01 AT5G16900 28.151 476 272 14 311 767 418 842 2.63e-39 157
MsG0780036113.01.T01 AT3G24540 30.503 318 203 7 467 773 152 462 2.64e-39 152
MsG0780036113.01.T01 AT4G03230 32.862 283 174 5 491 763 581 857 2.67e-39 157
MsG0780036113.01.T01 AT4G03230 32.862 283 174 5 491 763 581 857 2.67e-39 157
MsG0780036113.01.T01 AT4G03230 32.862 283 174 5 491 763 609 885 2.69e-39 157
MsG0780036113.01.T01 AT4G03230 32.862 283 174 5 491 763 523 799 2.73e-39 157
MsG0780036113.01.T01 AT4G03230 32.862 283 174 5 491 763 681 957 2.86e-39 157
MsG0780036113.01.T01 AT4G03230 32.862 283 174 5 491 763 681 957 2.86e-39 157
MsG0780036113.01.T01 AT1G49270 35.565 239 147 5 490 725 326 560 3.12e-39 155
MsG0780036113.01.T01 AT5G66790 32.639 288 179 5 490 765 304 588 3.14e-39 155
MsG0780036113.01.T01 AT2G42800 39.130 253 152 2 92 342 141 393 3.31e-39 152
MsG0780036113.01.T01 AT2G42800 38.491 265 144 7 141 399 123 374 2.38e-34 137
MsG0780036113.01.T01 AT4G23260 31.438 299 184 6 493 778 321 611 3.52e-39 155
MsG0780036113.01.T01 AT4G23260 31.438 299 184 6 493 778 332 622 3.81e-39 155
MsG0780036113.01.T01 AT1G06700 38.053 226 128 5 488 704 56 278 4.28e-39 149
MsG0780036113.01.T01 AT1G06700 38.053 226 128 5 488 704 56 278 4.28e-39 149
MsG0780036113.01.T01 AT1G06700 38.053 226 128 5 488 704 56 278 4.28e-39 149
MsG0780036113.01.T01 AT1G79620 32.168 286 175 7 489 763 627 904 4.72e-39 156
MsG0780036113.01.T01 AT1G79620 29.747 316 186 9 39 321 47 359 1.86e-29 126
MsG0780036113.01.T01 AT1G79620 32.117 274 173 5 115 380 73 341 1.04e-27 120
MsG0780036113.01.T01 AT1G79620 30.466 279 145 9 161 400 71 339 9.69e-21 98.6
MsG0780036113.01.T01 AT1G79620 34.752 141 90 2 87 226 221 360 1.22e-13 75.5
MsG0780036113.01.T01 AT3G18810 35.268 224 140 3 490 712 327 546 4.82e-39 155
MsG0780036113.01.T01 AT1G11330 31.142 289 189 3 496 777 518 803 4.93e-39 156
MsG0780036113.01.T01 AT1G61430 30.272 294 186 7 493 774 482 768 5.11e-39 155
MsG0780036113.01.T01 AT3G12610 33.948 271 165 4 124 390 95 355 5.28e-39 149
MsG0780036113.01.T01 AT3G12610 32.673 303 186 5 54 342 63 361 5.48e-39 149
MsG0780036113.01.T01 AT3G12610 33.498 203 113 4 223 403 98 300 6.19e-19 90.1
MsG0780036113.01.T01 AT1G11330 31.142 289 189 3 496 777 520 805 5.28e-39 156
MsG0780036113.01.T01 AT1G11330 37.019 208 126 2 496 701 520 724 5.58e-39 155

Find 139 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 195 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CGACATATTGTGAAGCTTTA+TGG 0.049784 7:-2820366 MsG0780036113.01.T01:CDS
GAGAGATTTGTTAAGGAAAT+TGG 0.078327 7:+2821405 None:intergenic
GTTAATTGATCAAAGTTAAA+TGG 0.174186 7:+2821477 None:intergenic
CGTATAACTATGTCATTATT+TGG 0.194445 7:+2819612 None:intergenic
ATGGCTGTGAAGTTTCTTTA+AGG 0.203339 7:+2820458 None:intergenic
TTCTCTCACAACAACCTTAA+TGG 0.206830 7:-2821651 MsG0780036113.01.T01:CDS
GAGAGATGACCAATTTCTTT+TGG 0.234319 7:+2822125 None:intergenic
ATATCTCTGATCGTTATAAT+TGG 0.264215 7:-2822307 MsG0780036113.01.T01:CDS
ATTACAAGACCATGACAATT+TGG 0.270847 7:+2820840 None:intergenic
GGTGAAATCCCTTCTTATAT+TGG 0.278194 7:-2820978 MsG0780036113.01.T01:CDS
TAGAATCAACTCTTGCAAAT+TGG 0.280318 7:+2821455 None:intergenic
ATAAGGTCAGTTAAACTATA+TGG 0.284150 7:-2822155 MsG0780036113.01.T01:CDS
AAAAGGGTCAACACTGTTAA+AGG 0.295944 7:-2820234 MsG0780036113.01.T01:CDS
GTGAGGTTTGTAAGGGATAT+AGG 0.300381 7:+2821549 None:intergenic
ACTATAGTTGCTGGAACTAT+TGG 0.311266 7:-2820054 MsG0780036113.01.T01:CDS
GGTTCCATTCCTCTTGAGTT+GGG 0.314289 7:-2821774 MsG0780036113.01.T01:CDS
ATTTAGAATGCCTTGTTATA+AGG 0.323338 7:-2822172 MsG0780036113.01.T01:CDS
AGTGATGACAATAAATCTTC+AGG 0.323618 7:+2819696 None:intergenic
ATCTCTAACAATTACATTCA+TGG 0.335840 7:-2821795 MsG0780036113.01.T01:CDS
GGTTCCACTCCTCATGAGTT+GGG 0.341872 7:-2821630 MsG0780036113.01.T01:CDS
CATGAGGAGTGGAACCATTA+AGG 0.350597 7:+2821637 None:intergenic
GGACATTTCATACAATTGTT+TGG 0.353968 7:-2820874 MsG0780036113.01.T01:CDS
TAAAACCTTCAAAGTAGTTA+TGG 0.354002 7:+2821358 None:intergenic
GGGACTATCCCAAAAGAAAT+TGG 0.364457 7:-2822134 MsG0780036113.01.T01:CDS
TAATAGAGAGAGATTTGTTA+AGG 0.364992 7:+2821398 None:intergenic
CATATCAAGATGAGTGAGTT+TGG 0.368634 7:+2822031 None:intergenic
TACCTCGCCTTCAAGAAAAT+TGG 0.375071 7:+2822076 None:intergenic
CAAAGACATCACAGAGAGAT+TGG 0.376131 7:+2820904 None:intergenic
ATTTCCCATAACTACTTTGA+AGG 0.381014 7:-2821363 MsG0780036113.01.T01:CDS
ATGTCTTACAATAATCTTGT+AGG 0.383879 7:-2822011 MsG0780036113.01.T01:CDS
TGTGACACACGTTTCATTGT+TGG 0.385025 7:+2819528 None:intergenic
TCCAATCGAACTATAGTTGC+TGG 0.386104 7:-2820063 MsG0780036113.01.T01:CDS
CAGGCTAGTGTTTGTGACTT+TGG 0.386315 7:-2820114 MsG0780036113.01.T01:CDS
TTAATTGATCAAAGTTAAAT+GGG 0.386535 7:+2821478 None:intergenic
AGACTAGGACTAGAAGAATA+AGG 0.387959 7:+2820709 None:intergenic
GTAACTTTGTGAGGTTTGTA+AGG 0.388353 7:+2821541 None:intergenic
GCAATCAACATATACCCTTC+GGG 0.390469 7:-2822248 MsG0780036113.01.T01:CDS
TTCAGTCACAACCTCATTAG+TGG 0.405025 7:-2820999 MsG0780036113.01.T01:CDS
GATACATCTCGATGCACTAT+TGG 0.407190 7:+2820168 None:intergenic
TGCATTGGAACAGGAGCATA+TGG 0.414248 7:-2820522 MsG0780036113.01.T01:CDS
TGCAGAGCTTGCCTATACTA+TGG 0.416061 7:-2819787 MsG0780036113.01.T01:intron
CTGTGATGTCTTTGATTATG+TGG 0.416452 7:-2820895 MsG0780036113.01.T01:CDS
TGGTTCCATTCCTCTTGAGT+TGG 0.416464 7:-2821775 MsG0780036113.01.T01:CDS
TGAGACATCTCAACTTCAAA+TGG 0.417982 7:-2822384 MsG0780036113.01.T01:CDS
AAAACCTTCAAAGTAGTTAT+GGG 0.418664 7:+2821359 None:intergenic
AAAGACATCACAGAGAGATT+GGG 0.419397 7:+2820905 None:intergenic
TTTCCTCCACTTAAATTTCA+CGG 0.420983 7:+2820254 None:intergenic
AGCAATCAACATATACCCTT+CGG 0.430541 7:-2822249 MsG0780036113.01.T01:CDS
GTTTAAATAAAGTTTGTCAA+TGG 0.435616 7:+2820953 None:intergenic
AAGATGGAACCTCTGCTTCA+TGG 0.435870 7:+2820439 None:intergenic
TTGAGATTTCTTAGTGAAGA+AGG 0.436209 7:+2821693 None:intergenic
AAGTGTGATGTGTATAGTTT+TGG 0.437562 7:-2819753 MsG0780036113.01.T01:CDS
TGAAATTTAAGTGGAGGAAA+AGG 0.440193 7:-2820251 MsG0780036113.01.T01:CDS
TCTTGTGTGGTGACGATGGC+TGG 0.440375 7:+2820775 None:intergenic
ATCTATCAATATATGGAGAA+AGG 0.443575 7:-2820312 MsG0780036113.01.T01:CDS
TTGAGGAACCCCAACTCAAA+AGG 0.445083 7:+2821333 None:intergenic
TCATATTTCTACTAACAAGT+TGG 0.450510 7:-2820658 MsG0780036113.01.T01:CDS
ATGAGATATTGCATTGGAAC+AGG 0.454703 7:-2820531 MsG0780036113.01.T01:CDS
TCCAGCAACTATAGTTCGAT+TGG 0.460209 7:+2820062 None:intergenic
CTGAAACTCTCATCGAAAGA+TGG 0.464990 7:+2820423 None:intergenic
TAAGGTCAGTTAAACTATAT+GGG 0.465110 7:-2822154 MsG0780036113.01.T01:CDS
TTCATTCACAGCCATAGTAT+AGG 0.471251 7:+2819776 None:intergenic
TGGTTCCACTCCTCATGAGT+TGG 0.472468 7:-2821631 MsG0780036113.01.T01:CDS
TTTAGATTTCCTAGGGAAGA+AGG 0.480122 7:+2821837 None:intergenic
TAACAAGGCATTCTAAATTG+TGG 0.484499 7:+2822177 None:intergenic
GCAAGTGCAATATTGAATAG+TGG 0.488065 7:-2822359 MsG0780036113.01.T01:CDS
TGTAATTGTTAGAGATGTCT+AGG 0.498482 7:+2821802 None:intergenic
ACTATGTCATTATTTGGAAG+TGG 0.499298 7:+2819618 None:intergenic
TTAAACAATAATAATCTCAC+TGG 0.499917 7:-2820936 MsG0780036113.01.T01:CDS
TCACTCAAAGGATTGCTCAA+TGG 0.501095 7:+2819483 None:intergenic
GGTTAGATACCTTCTTCCCT+AGG 0.501821 7:-2821846 MsG0780036113.01.T01:intron
TGCACTGAAATTTCACTCAA+AGG 0.502896 7:+2819471 None:intergenic
GTGATGACAATAAATCTTCA+GGG 0.506056 7:+2819697 None:intergenic
GTGGTGACGATGGCTGGAAT+TGG 0.506125 7:+2820781 None:intergenic
GAAATTTAAGTGGAGGAAAA+GGG 0.507828 7:-2820250 MsG0780036113.01.T01:CDS
CTTGCTAAACTCTGAGTGGC+AGG 0.509367 7:-2820133 MsG0780036113.01.T01:CDS
TTACAATAATCTTGTAGGCC+AGG 0.517510 7:-2822006 MsG0780036113.01.T01:intron
GTTCCATTCCTCTTGAGTTG+GGG 0.522272 7:-2821773 MsG0780036113.01.T01:CDS
CTATCTAACAATAGATTCAA+AGG 0.524718 7:-2821291 MsG0780036113.01.T01:intron
ATTTCATACAATTGTTTGGA+GGG 0.527441 7:-2820870 MsG0780036113.01.T01:CDS
TTCATTGTTGGTCGAGAACG+AGG 0.528233 7:+2819540 None:intergenic
AGACCATGACAATTTGGAAT+GGG 0.528871 7:+2820846 None:intergenic
TGTGCCTAGCATATGCTCAT+TGG 0.529467 7:+2822567 None:intergenic
CAAGGTATTGTAACTTTGTG+AGG 0.530287 7:+2821532 None:intergenic
CTATCTAACAATAGATTCAA+AGG 0.531538 7:-2821723 MsG0780036113.01.T01:CDS
AAGGGATTTCACCACTAATG+AGG 0.535123 7:+2820988 None:intergenic
AGTAGTTATGGGAAATGTCA+AGG 0.535232 7:+2821370 None:intergenic
ACTATTGGATATATAGCTCC+TGG 0.538272 7:-2820039 MsG0780036113.01.T01:intron
CTCTATCTTGTATGATGATG+TGG 0.539614 7:-2820280 MsG0780036113.01.T01:CDS
AATTGGAAAGGTTCCACGGA+TGG 0.541662 7:+2821422 None:intergenic
TCAATGGCGCCAATATAAGA+AGG 0.543183 7:+2820969 None:intergenic
TAACTTTGTGAGGTTTGTAA+GGG 0.544185 7:+2821542 None:intergenic
AAGGCAACAACCTTGCCACT+TGG 0.546601 7:+2820477 None:intergenic
GATTGGATGAATCATATTGA+AGG 0.546822 7:+2820079 None:intergenic
TAAAATTGTTAGAGATGTCA+AGG 0.550162 7:+2821514 None:intergenic
CATTTCATACAATTGTTTGG+AGG 0.550477 7:-2820871 MsG0780036113.01.T01:CDS
TGTAGTCGCACTTGAAACTT+TGG 0.550669 7:-2819730 MsG0780036113.01.T01:CDS
GTTCCACTCCTCATGAGTTG+GGG 0.554086 7:-2821629 MsG0780036113.01.T01:CDS
ACAAGTTAACTGTTGCAAGT+TGG 0.557352 7:+2822222 None:intergenic
AAGACCATGACAATTTGGAA+TGG 0.557923 7:+2820845 None:intergenic
ATTTGTTAAGGAAATTGGAA+AGG 0.558924 7:+2821410 None:intergenic
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CTAAATAACAATTCCATCCG+TGG 0.564792 7:-2821435 MsG0780036113.01.T01:CDS
TTATCTTCATCATGATTGCA+CGG 0.567590 7:-2820193 MsG0780036113.01.T01:CDS
GTCGCACTTGAAACTTTGGT+TGG 0.570877 7:-2819726 MsG0780036113.01.T01:CDS
AGGAAATTGGAAAGGTTCCA+CGG 0.571948 7:+2821418 None:intergenic
TGGTCTTGTAATAATAAACA+TGG 0.575111 7:-2820829 MsG0780036113.01.T01:CDS
AAACCCCAACTCAAGAGGAA+TGG 0.577468 7:+2821770 None:intergenic
TTTGACATGAGATATTGCAT+TGG 0.578977 7:-2820537 MsG0780036113.01.T01:CDS
TTTGTATATGGAATTATGAT+GGG 0.585035 7:-2820599 MsG0780036113.01.T01:CDS
TTGGTGAGATTGCCTAGTGA+AGG 0.586726 7:+2822050 None:intergenic
TTCAAGAACCCCAACTCATG+AGG 0.588558 7:+2821621 None:intergenic
GTGAGATTGCCTAGTGAAGG+AGG 0.589409 7:+2822053 None:intergenic
GTAGTTATGGGAAATGTCAA+GGG 0.590352 7:+2821371 None:intergenic
AAGACATCACAGAGAGATTG+GGG 0.600080 7:+2820906 None:intergenic
AGGACTAGAAGAATAAGGAT+CGG 0.609429 7:+2820714 None:intergenic
ATGACCAATGAGCATATGCT+AGG 0.610653 7:-2822571 MsG0780036113.01.T01:CDS
ATTGATCAAAGTTAAATGGG+AGG 0.612590 7:+2821481 None:intergenic
TTGCAAGTTGGAACCCCGAA+GGG 0.613262 7:+2822234 None:intergenic
CATAAAGCTTCACAATATGT+CGG 0.613764 7:+2820367 None:intergenic
TACAATGCACAATTACCAAG+TGG 0.619740 7:-2820492 MsG0780036113.01.T01:CDS
GGTCCCATTCCAAATTGTCA+TGG 0.622045 7:-2820849 MsG0780036113.01.T01:CDS
ACTTCACAGCCATGAAGCAG+AGG 0.625701 7:-2820448 MsG0780036113.01.T01:CDS
ATTTGAGAAGTGATAAGACT+AGG 0.628032 7:+2820694 None:intergenic
GGCGAGGTACCTCCTTCACT+AGG 0.631539 7:-2822062 MsG0780036113.01.T01:CDS
CAATGGCGCCAATATAAGAA+GGG 0.634252 7:+2820970 None:intergenic
GAACCCCAACTCATGAGGAG+TGG 0.636012 7:+2821626 None:intergenic
TGCACAATTACCAAGTGGCA+AGG 0.638010 7:-2820487 MsG0780036113.01.T01:CDS
GTTGCAAGTTGGAACCCCGA+AGG 0.638553 7:+2822233 None:intergenic
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CAATCAACATATACCCTTCG+GGG 0.663614 7:-2822247 MsG0780036113.01.T01:CDS
TAAGCATGCAAATGCTACCA+CGG 0.665989 7:+2819572 None:intergenic
GTGCAATATTGAATAGTGGA+TGG 0.667337 7:-2822355 MsG0780036113.01.T01:CDS
AAGCCGTGAAATTTAAGTGG+AGG 0.670747 7:-2820257 MsG0780036113.01.T01:CDS
ATATCTTGCTAAACTCTGAG+TGG 0.676612 7:-2820137 MsG0780036113.01.T01:CDS
CAATATTGAATAGTGGATGG+TGG 0.677640 7:-2822352 MsG0780036113.01.T01:CDS
TATTTGGAAGTGGAAGACGT+TGG 0.678619 7:+2819628 None:intergenic
GTTTAACTGACCTTATAACA+AGG 0.683399 7:+2822162 None:intergenic
TTGAAGTTGAGATGTCTCAG+TGG 0.725932 7:+2822388 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TAAATAAAAAAAAAATTGGA+AGG + Chr7:2820948-2820967 None:intergenic 10.0%
!!! TAATTTTCAATTATTTTCTT+TGG - Chr7:2822148-2822167 MsG0780036113.01.T01:CDS 10.0%
!!! TATTTAATTTCAAATTTCAT+TGG - Chr7:2819513-2819532 MsG0780036113.01.T01:CDS 10.0%
!!! TGTTTTATCTATATATATTT+TGG - Chr7:2822078-2822097 MsG0780036113.01.T01:CDS 10.0%
!! CTGCAAAAAAAAAAAAAAAA+AGG + Chr7:2819556-2819575 None:intergenic 15.0%
!! TTAATTGATCAAAGTTAAAT+GGG + Chr7:2820515-2820534 None:intergenic 15.0%
!!! AAACATTTATGTTATTTATG+TGG + Chr7:2822057-2822076 None:intergenic 15.0%
!!! AATTTAATATTTTTCTTGTG+TGG + Chr7:2821231-2821250 None:intergenic 15.0%
!!! ATCTCTTTTAACATTATTAT+TGG - Chr7:2820051-2820070 MsG0780036113.01.T01:CDS 15.0%
!!! GTTTTTTATCTATCAATATA+TGG - Chr7:2821671-2821690 MsG0780036113.01.T01:CDS 15.0%
!! ATATCAATGATTAATTTACC+AGG + Chr7:2821972-2821991 None:intergenic 20.0%
!! GTTAATTGATCAAAGTTAAA+TGG + Chr7:2820516-2820535 None:intergenic 20.0%
!! GTTTAAATAAAGTTTGTCAA+TGG + Chr7:2821040-2821059 None:intergenic 20.0%
!! TTAAACAATAATAATCTCAC+TGG - Chr7:2821054-2821073 MsG0780036113.01.T01:intron 20.0%
!! TTTGTATATGGAATTATGAT+GGG - Chr7:2821391-2821410 MsG0780036113.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATCTCTAACAATTTTATCAA+TGG - Chr7:2820483-2820502 MsG0780036113.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATTTTTTAGCAACCATAATT+TGG + Chr7:2820088-2820107 None:intergenic 20.0%
!!! TAATTGTTTTAGATTTCCTA+GGG + Chr7:2820163-2820182 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTGTATATGGAATTATGA+TGG - Chr7:2821390-2821409 MsG0780036113.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTTTTAGCAACCATAATTT+GGG + Chr7:2820087-2820106 None:intergenic 20.0%
! AAAACCTTCAAAGTAGTTAT+GGG + Chr7:2820634-2820653 None:intergenic 25.0%
! AACAGTATAAAGGTTGTTTA+TGG - Chr7:2819447-2819466 MsG0780036113.01.T01:CDS 25.0%
! AACTCAACAAAAACAAAGAA+TGG - Chr7:2821360-2821379 MsG0780036113.01.T01:CDS 25.0%
! ATAAGGTCAGTTAAACTATA+TGG - Chr7:2819835-2819854 MsG0780036113.01.T01:intron 25.0%
! ATATCTCTGATCGTTATAAT+TGG - Chr7:2819683-2819702 MsG0780036113.01.T01:CDS 25.0%
! ATCTATCAATATATGGAGAA+AGG - Chr7:2821678-2821697 MsG0780036113.01.T01:CDS 25.0%
! ATCTCTAACAATTACATTCA+TGG - Chr7:2820195-2820214 MsG0780036113.01.T01:CDS 25.0%
! ATGTCTTACAATAATCTTGT+AGG - Chr7:2819979-2819998 MsG0780036113.01.T01:intron 25.0%
! ATTTCATACAATTGTTTGGA+GGG - Chr7:2821120-2821139 MsG0780036113.01.T01:intron 25.0%
! CGTATAACTATGTCATTATT+TGG + Chr7:2822381-2822400 None:intergenic 25.0%
! CTATCTAACAATAGATTCAA+AGG - Chr7:2820267-2820286 MsG0780036113.01.T01:CDS 25.0%
! CTATCTTACAATATATTCGA+AGG - Chr7:2820123-2820142 MsG0780036113.01.T01:CDS 25.0%
! TAAAACCTTCAAAGTAGTTA+TGG + Chr7:2820635-2820654 None:intergenic 25.0%
! TAAAATTGTTAGAGATGTCA+AGG + Chr7:2820479-2820498 None:intergenic 25.0%
! TAAGGTCAGTTAAACTATAT+GGG - Chr7:2819836-2819855 MsG0780036113.01.T01:intron 25.0%
! TAATGTTAAAAGAGATGTCT+AGG + Chr7:2820047-2820066 None:intergenic 25.0%
!! ATGGAGTTATGTTTTGTATA+TGG - Chr7:2821379-2821398 MsG0780036113.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTTAGAATGCCTTGTTATA+AGG - Chr7:2819818-2819837 MsG0780036113.01.T01:intron 25.0%
!! ATTTGTTAAGGAAATTGGAA+AGG + Chr7:2820583-2820602 None:intergenic 25.0%
!! TCATATTTCTACTAACAAGT+TGG - Chr7:2821332-2821351 MsG0780036113.01.T01:CDS 25.0%
!! TTAATGTAGTGAGATTTTTG+AGG + Chr7:2820677-2820696 None:intergenic 25.0%
!!! CTAATTGTTTTAGATTTCCT+AGG + Chr7:2820164-2820183 None:intergenic 25.0%
!!! TAATAGAGAGAGATTTGTTA+AGG + Chr7:2820595-2820614 None:intergenic 25.0%
!!! TGGTCTTGTAATAATAAACA+TGG - Chr7:2821161-2821180 MsG0780036113.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTTTTTGCAGTTTGATTGT+GGG - Chr7:2819565-2819584 MsG0780036113.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTTTTTTGCAGTTTGATTG+TGG - Chr7:2819564-2819583 MsG0780036113.01.T01:CDS 25.0%
AAAAAGGCAATCCACATATT+TGG + Chr7:2819540-2819559 None:intergenic 30.0%
ACTATGTCATTATTTGGAAG+TGG + Chr7:2822375-2822394 None:intergenic 30.0%
AGTGATGACAATAAATCTTC+AGG + Chr7:2822297-2822316 None:intergenic 30.0%
ATTACAAGACCATGACAATT+TGG + Chr7:2821153-2821172 None:intergenic 30.0%
ATTGATCAAAGTTAAATGGG+AGG + Chr7:2820512-2820531 None:intergenic 30.0%
ATTTCATTGGTCCAAATATG+TGG - Chr7:2819526-2819545 MsG0780036113.01.T01:CDS 30.0%
ATTTCCCATAACTACTTTGA+AGG - Chr7:2820627-2820646 MsG0780036113.01.T01:CDS 30.0%
ATTTGAGAAGTGATAAGACT+AGG + Chr7:2821299-2821318 None:intergenic 30.0%
CATAAAGCTTCACAATATGT+CGG + Chr7:2821626-2821645 None:intergenic 30.0%
CATTTCATACAATTGTTTGG+AGG - Chr7:2821119-2821138 MsG0780036113.01.T01:intron 30.0%
CTAAGATTGTCTATTGAAAG+AGG + Chr7:2820012-2820031 None:intergenic 30.0%
GAAATTTAAGTGGAGGAAAA+GGG - Chr7:2821740-2821759 MsG0780036113.01.T01:CDS 30.0%
GATTGGATGAATCATATTGA+AGG + Chr7:2821914-2821933 None:intergenic 30.0%
GGACATTTCATACAATTGTT+TGG - Chr7:2821116-2821135 MsG0780036113.01.T01:intron 30.0%
GTAAATTATGGGAAATGTCA+AGG + Chr7:2820911-2820930 None:intergenic 30.0%
GTGATGACAATAAATCTTCA+GGG + Chr7:2822296-2822315 None:intergenic 30.0%
GTTTAACTGACCTTATAACA+AGG + Chr7:2819831-2819850 None:intergenic 30.0%
TAACTTTGTGAGGTTTGTAA+GGG + Chr7:2820451-2820470 None:intergenic 30.0%
TAGAATCAACTCTTGCAAAT+TGG + Chr7:2820538-2820557 None:intergenic 30.0%
TGAAATTTAAGTGGAGGAAA+AGG - Chr7:2821739-2821758 MsG0780036113.01.T01:CDS 30.0%
TGTAATTGTTAGAGATGTCT+AGG + Chr7:2820191-2820210 None:intergenic 30.0%
TTATCTTCATCATGATTGCA+CGG - Chr7:2821797-2821816 MsG0780036113.01.T01:CDS 30.0%
TTGAGATTTCCTAATGAAGA+AGG + Chr7:2820732-2820751 None:intergenic 30.0%
TTGAGATTTCTTAGTGAAGA+AGG + Chr7:2820300-2820319 None:intergenic 30.0%
TTTCCTCCACTTAAATTTCA+CGG + Chr7:2821739-2821758 None:intergenic 30.0%
TTTGACATGAGATATTGCAT+TGG - Chr7:2821453-2821472 MsG0780036113.01.T01:CDS 30.0%
! AAGTGTGATGTGTATAGTTT+TGG - Chr7:2822237-2822256 MsG0780036113.01.T01:CDS 30.0%
! AGAGATGACCAATTTCTTTT+GGG + Chr7:2819867-2819886 None:intergenic 30.0%
! CGTATCGATGAGTAAATTAT+GGG + Chr7:2820922-2820941 None:intergenic 30.0%
! CTAATGTAGTGAGATTTTTG+AGG + Chr7:2820821-2820840 None:intergenic 30.0%
! TAACAAGGCATTCTAAATTG+TGG + Chr7:2819816-2819835 None:intergenic 30.0%
! TTTTCTCACAATAGACTCAA+TGG - Chr7:2820843-2820862 MsG0780036113.01.T01:CDS 30.0%
!! GAGAGATTTGTTAAGGAAAT+TGG + Chr7:2820588-2820607 None:intergenic 30.0%
!!! AGGTTTTATTCCTTTTGAGT+TGG - Chr7:2820647-2820666 MsG0780036113.01.T01:CDS 30.0%
!!! GGTTTTATTCCTTTTGAGTT+GGG - Chr7:2820648-2820667 MsG0780036113.01.T01:CDS 30.0%
!!! GTTTTATTCCTTTTGAGTTG+GGG - Chr7:2820649-2820668 MsG0780036113.01.T01:CDS 30.0%
AAAAGGGTCAACACTGTTAA+AGG - Chr7:2821756-2821775 MsG0780036113.01.T01:CDS 35.0%
AAAGACATCACAGAGAGATT+GGG + Chr7:2821088-2821107 None:intergenic 35.0%
AAGACCATGACAATTTGGAA+TGG + Chr7:2821148-2821167 None:intergenic 35.0%
ACAAGTTAACTGTTGCAAGT+TGG + Chr7:2819771-2819790 None:intergenic 35.0%
ACTATAGTTGCTGGAACTAT+TGG - Chr7:2821936-2821955 MsG0780036113.01.T01:intron 35.0%
ACTATTGGATATATAGCTCC+TGG - Chr7:2821951-2821970 MsG0780036113.01.T01:intron 35.0%
AGACTAGGACTAGAAGAATA+AGG + Chr7:2821284-2821303 None:intergenic 35.0%
AGCAATCAACATATACCCTT+CGG - Chr7:2819741-2819760 MsG0780036113.01.T01:CDS 35.0%
AGGACTAGAAGAATAAGGAT+CGG + Chr7:2821279-2821298 None:intergenic 35.0%
AGTAGTTATGGGAAATGTCA+AGG + Chr7:2820623-2820642 None:intergenic 35.0%
ATATCTTGCTAAACTCTGAG+TGG - Chr7:2821853-2821872 MsG0780036113.01.T01:intron 35.0%
ATGAGATATTGCATTGGAAC+AGG - Chr7:2821459-2821478 MsG0780036113.01.T01:CDS 35.0%
ATGGCTGTGAAGTTTCTTTA+AGG + Chr7:2821535-2821554 None:intergenic 35.0%
CATATCAAGATGAGTGAGTT+TGG + Chr7:2819962-2819981 None:intergenic 35.0%
CGACATATTGTGAAGCTTTA+TGG - Chr7:2821624-2821643 MsG0780036113.01.T01:CDS 35.0%
CTAAATAACAATTCCATCCG+TGG - Chr7:2820555-2820574 MsG0780036113.01.T01:CDS 35.0%
CTATCTCACAACAACATTCA+AGG - Chr7:2820771-2820790 MsG0780036113.01.T01:CDS 35.0%
CTGTGATGTCTTTGATTATG+TGG - Chr7:2821095-2821114 MsG0780036113.01.T01:intron 35.0%
CTTGAATGTTGTTGTGAGAT+AGG + Chr7:2820773-2820792 None:intergenic 35.0%
GCAAGTGCAATATTGAATAG+TGG - Chr7:2819631-2819650 MsG0780036113.01.T01:CDS 35.0%
GGTGAAATCCCTTCTTATAT+TGG - Chr7:2821012-2821031 MsG0780036113.01.T01:intron 35.0%
GTAACTTTGTGAGGTTTGTA+AGG + Chr7:2820452-2820471 None:intergenic 35.0%
GTAGTTATGGGAAATGTCAA+GGG + Chr7:2820622-2820641 None:intergenic 35.0%
TACAATGCACAATTACCAAG+TGG - Chr7:2821498-2821517 MsG0780036113.01.T01:CDS 35.0%
TGAGACATCTCAACTTCAAA+TGG - Chr7:2819606-2819625 MsG0780036113.01.T01:CDS 35.0%
TGCACTGAAATTTCACTCAA+AGG + Chr7:2822522-2822541 None:intergenic 35.0%
TTACAATAATCTTGTAGGCC+AGG - Chr7:2819984-2820003 MsG0780036113.01.T01:intron 35.0%
TTAGCAACCATAATTTGGGA+GGG + Chr7:2820083-2820102 None:intergenic 35.0%
TTCATTCACAGCCATAGTAT+AGG + Chr7:2822217-2822236 None:intergenic 35.0%
TTCTCTCACAACAACCTTAA+TGG - Chr7:2820339-2820358 MsG0780036113.01.T01:CDS 35.0%
TTTAGATTTCCTAGGGAAGA+AGG + Chr7:2820156-2820175 None:intergenic 35.0%
TTTAGCAACCATAATTTGGG+AGG + Chr7:2820084-2820103 None:intergenic 35.0%
! AGACCATGACAATTTGGAAT+GGG + Chr7:2821147-2821166 None:intergenic 35.0%
! CTCTATCTTGTATGATGATG+TGG - Chr7:2821710-2821729 MsG0780036113.01.T01:CDS 35.0%
! GAGAGATGACCAATTTCTTT+TGG + Chr7:2819868-2819887 None:intergenic 35.0%
! GATATATTTTGCAACGATGC+TGG - Chr7:2819709-2819728 MsG0780036113.01.T01:CDS 35.0%
! GCGTATCGATGAGTAAATTA+TGG + Chr7:2820923-2820942 None:intergenic 35.0%
! GTGCAATATTGAATAGTGGA+TGG - Chr7:2819635-2819654 MsG0780036113.01.T01:CDS 35.0%
! TTGTCTGCCAATTTTCTTGA+AGG - Chr7:2819907-2819926 MsG0780036113.01.T01:intron 35.0%
!! CAAGGTATTGTAACTTTGTG+AGG + Chr7:2820461-2820480 None:intergenic 35.0%
!! CAATATTGAATAGTGGATGG+TGG - Chr7:2819638-2819657 MsG0780036113.01.T01:CDS 35.0%
AAGACATCACAGAGAGATTG+GGG + Chr7:2821087-2821106 None:intergenic 40.0%
AAGCCGTGAAATTTAAGTGG+AGG - Chr7:2821733-2821752 MsG0780036113.01.T01:CDS 40.0%
AAGGGATTTCACCACTAATG+AGG + Chr7:2821005-2821024 None:intergenic 40.0%
AGGAAATTGGAAAGGTTCCA+CGG + Chr7:2820575-2820594 None:intergenic 40.0%
ATGACCAATGAGCATATGCT+AGG - Chr7:2819419-2819438 MsG0780036113.01.T01:CDS 40.0%
CAAAGACATCACAGAGAGAT+TGG + Chr7:2821089-2821108 None:intergenic 40.0%
CAATCAACATATACCCTTCG+GGG - Chr7:2819743-2819762 MsG0780036113.01.T01:CDS 40.0%
CAATGGCGCCAATATAAGAA+GGG + Chr7:2821023-2821042 None:intergenic 40.0%
CTAGGCACACAACAGTATAA+AGG - Chr7:2819437-2819456 MsG0780036113.01.T01:CDS 40.0%
CTGAAACTCTCATCGAAAGA+TGG + Chr7:2821570-2821589 None:intergenic 40.0%
GAGGTTGTGACTGAAATCTA+CGG + Chr7:2820986-2821005 None:intergenic 40.0%
GATACATCTCGATGCACTAT+TGG + Chr7:2821825-2821844 None:intergenic 40.0%
GCAATCAACATATACCCTTC+GGG - Chr7:2819742-2819761 MsG0780036113.01.T01:CDS 40.0%
GGGACTATCCCAAAAGAAAT+TGG - Chr7:2819856-2819875 MsG0780036113.01.T01:intron 40.0%
GGTGAGATACCTTCTTCATT+AGG - Chr7:2820720-2820739 MsG0780036113.01.T01:CDS 40.0%
GTGAGGTTTGTAAGGGATAT+AGG + Chr7:2820444-2820463 None:intergenic 40.0%
TAAGCATGCAAATGCTACCA+CGG + Chr7:2822421-2822440 None:intergenic 40.0%
TACCTCGCCTTCAAGAAAAT+TGG + Chr7:2819917-2819936 None:intergenic 40.0%
TATTTGGAAGTGGAAGACGT+TGG + Chr7:2822365-2822384 None:intergenic 40.0%
TCAATGGCGCCAATATAAGA+AGG + Chr7:2821024-2821043 None:intergenic 40.0%
TCACTCAAAGGATTGCTCAA+TGG + Chr7:2822510-2822529 None:intergenic 40.0%
TCCAATCGAACTATAGTTGC+TGG - Chr7:2821927-2821946 MsG0780036113.01.T01:intron 40.0%
TCCAGCAACTATAGTTCGAT+TGG + Chr7:2821931-2821950 None:intergenic 40.0%
TGACATAATTCATGTTGCCG+TGG - Chr7:2822401-2822420 MsG0780036113.01.T01:CDS 40.0%
TGGAAGCCGTGAAATTTAAG+TGG - Chr7:2821730-2821749 MsG0780036113.01.T01:CDS 40.0%
TGTAGTCGCACTTGAAACTT+TGG - Chr7:2822260-2822279 MsG0780036113.01.T01:CDS 40.0%
TGTGACACACGTTTCATTGT+TGG + Chr7:2822465-2822484 None:intergenic 40.0%
TTCAAAAACCCCAACTCAAG+AGG + Chr7:2820228-2820247 None:intergenic 40.0%
TTCAGTCACAACCTCATTAG+TGG - Chr7:2820991-2821010 MsG0780036113.01.T01:CDS 40.0%
TTGAAGTTGAGATGTCTCAG+TGG + Chr7:2819605-2819624 None:intergenic 40.0%
!! TGTCTATTGAAAGAGGTACC+TGG + Chr7:2820005-2820024 None:intergenic 40.0%
!! TTTTTCTTGTGTGGTGACGA+TGG + Chr7:2821222-2821241 None:intergenic 40.0%
AAACCCCAACTCAAGAGGAA+TGG + Chr7:2820223-2820242 None:intergenic 45.0%
AAGATGGAACCTCTGCTTCA+TGG + Chr7:2821554-2821573 None:intergenic 45.0%
AATTGGAAAGGTTCCACGGA+TGG + Chr7:2820571-2820590 None:intergenic 45.0%
CAACCATAATTTGGGAGGGA+TGG + Chr7:2820079-2820098 None:intergenic 45.0%
CAGGCTAGTGTTTGTGACTT+TGG - Chr7:2821876-2821895 MsG0780036113.01.T01:intron 45.0%
CATGAGGAGTGGAACCATTA+AGG + Chr7:2820356-2820375 None:intergenic 45.0%
GAACGCCAACTCAAAAGGAA+GGG + Chr7:2820799-2820818 None:intergenic 45.0%
GGTCCCATTCCAAATTGTCA+TGG - Chr7:2821141-2821160 MsG0780036113.01.T01:intron 45.0%
GGTTAGATACCTTCTTCCCT+AGG - Chr7:2820144-2820163 MsG0780036113.01.T01:CDS 45.0%
GGTTCCATTCCTCTTGAGTT+GGG - Chr7:2820216-2820235 MsG0780036113.01.T01:CDS 45.0%
GTCGCACTTGAAACTTTGGT+TGG - Chr7:2822264-2822283 MsG0780036113.01.T01:CDS 45.0%
GTTCCATCCCTCCCAAATTA+TGG - Chr7:2820073-2820092 MsG0780036113.01.T01:CDS 45.0%
TGCACAATTACCAAGTGGCA+AGG - Chr7:2821503-2821522 MsG0780036113.01.T01:CDS 45.0%
TGCAGAGCTTGCCTATACTA+TGG - Chr7:2822203-2822222 MsG0780036113.01.T01:CDS 45.0%
TGGTTCCATTCCTCTTGAGT+TGG - Chr7:2820215-2820234 MsG0780036113.01.T01:CDS 45.0%
TGTGCCTAGCATATGCTCAT+TGG + Chr7:2819426-2819445 None:intergenic 45.0%
TTCAAGAACCCCAACTCATG+AGG + Chr7:2820372-2820391 None:intergenic 45.0%
TTCATTGTTGGTCGAGAACG+AGG + Chr7:2822453-2822472 None:intergenic 45.0%
TTGAGGAACCCCAACTCAAA+AGG + Chr7:2820660-2820679 None:intergenic 45.0%
TTGAGGAACGCCAACTCAAA+AGG + Chr7:2820804-2820823 None:intergenic 45.0%
TTGGTGAGATTGCCTAGTGA+AGG + Chr7:2819943-2819962 None:intergenic 45.0%
! GTTCCATTCCTCTTGAGTTG+GGG - Chr7:2820217-2820236 MsG0780036113.01.T01:CDS 45.0%
! TGCATTGGAACAGGAGCATA+TGG - Chr7:2821468-2821487 MsG0780036113.01.T01:CDS 45.0%
! TGCCAATTTTCTTGAAGGCG+AGG - Chr7:2819912-2819931 MsG0780036113.01.T01:intron 45.0%
!! AGGTTCCCTTCCTTTTGAGT+TGG - Chr7:2820791-2820810 MsG0780036113.01.T01:CDS 45.0%
!! TCAATAAATAAAAAAAAAAT+TGG + Chr7:2820952-2820971 None:intergenic 5.0%
AAGGCAACAACCTTGCCACT+TGG + Chr7:2821516-2821535 None:intergenic 50.0%
ACTTCACAGCCATGAAGCAG+AGG - Chr7:2821542-2821561 MsG0780036113.01.T01:CDS 50.0%
CTTGCTAAACTCTGAGTGGC+AGG - Chr7:2821857-2821876 MsG0780036113.01.T01:intron 50.0%
GGAACGCCAACTCAAAAGGA+AGG + Chr7:2820800-2820819 None:intergenic 50.0%
GGTTCCACTCCTCATGAGTT+GGG - Chr7:2820360-2820379 MsG0780036113.01.T01:CDS 50.0%
GTGAGATTGCCTAGTGAAGG+AGG + Chr7:2819940-2819959 None:intergenic 50.0%
GTTCCACTCCTCATGAGTTG+GGG - Chr7:2820361-2820380 MsG0780036113.01.T01:CDS 50.0%
TGGTTCCACTCCTCATGAGT+TGG - Chr7:2820359-2820378 MsG0780036113.01.T01:CDS 50.0%
! TTGCAAGTTGGAACCCCGAA+GGG + Chr7:2819759-2819778 None:intergenic 50.0%
GAACCCCAACTCATGAGGAG+TGG + Chr7:2820367-2820386 None:intergenic 55.0%
! GTGGTGACGATGGCTGGAAT+TGG + Chr7:2821212-2821231 None:intergenic 55.0%
! GTTGCAAGTTGGAACCCCGA+AGG + Chr7:2819760-2819779 None:intergenic 55.0%
! TCTTGTGTGGTGACGATGGC+TGG + Chr7:2821218-2821237 None:intergenic 55.0%
! GGCGAGGTACCTCCTTCACT+AGG - Chr7:2819928-2819947 MsG0780036113.01.T01:intron 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 2819419 2822593 2819419 ID=MsG0780036113.01;Name=MsG0780036113.01
Chr7 mRNA 2819419 2822593 2819419 ID=MsG0780036113.01.T01;Parent=MsG0780036113.01;Name=MsG0780036113.01.T01;_AED=0.24;_eAED=0.25;_QI=0|0|0|1|1|1|5|0|800
Chr7 exon 2822562 2822593 2822562 ID=MsG0780036113.01.T01:exon:2479;Parent=MsG0780036113.01.T01
Chr7 exon 2822007 2822436 2822007 ID=MsG0780036113.01.T01:exon:2478;Parent=MsG0780036113.01.T01
Chr7 exon 2821292 2821862 2821292 ID=MsG0780036113.01.T01:exon:2477;Parent=MsG0780036113.01.T01
Chr7 exon 2820040 2821023 2820040 ID=MsG0780036113.01.T01:exon:2476;Parent=MsG0780036113.01.T01
Chr7 exon 2819419 2819804 2819419 ID=MsG0780036113.01.T01:exon:2475;Parent=MsG0780036113.01.T01
Chr7 CDS 2822562 2822593 2822562 ID=MsG0780036113.01.T01:cds;Parent=MsG0780036113.01.T01
Chr7 CDS 2822007 2822436 2822007 ID=MsG0780036113.01.T01:cds;Parent=MsG0780036113.01.T01
Chr7 CDS 2821292 2821862 2821292 ID=MsG0780036113.01.T01:cds;Parent=MsG0780036113.01.T01
Chr7 CDS 2820040 2821023 2820040 ID=MsG0780036113.01.T01:cds;Parent=MsG0780036113.01.T01
Chr7 CDS 2819419 2819804 2819419 ID=MsG0780036113.01.T01:cds;Parent=MsG0780036113.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780036113.01.T01

ATGACCAATGAGCATATGCTAGGCACACAACATTTGATTGTGGGAACTCAATGTGCTGCCACTGAGACATCTCAACTTCAAATGGAAGCAAGTGCAATATTGAATAGTGGATGGTGGAACACGTCTGATGCACGCTTCAATATCTCTGATCGTTATAATTGGCATGATATATTTTGCAACGATGCTGGAAGCATAAAAGCAATCAACATATACCCTTCGGGGTTCCAACTTGCAACAGTTAACTTGTCTACTTTCAACTTTTCTAGTTTCCACAATTTAGAATGCCTTGTTATAAGGTCAGTTAAACTATATGGGACTATCCCAAAAGAAATTGGTCATCTCTCTAAGCTCACTCATCTTAATTTGTCTGCCAATTTTCTTGAAGGCGAGGTACCTCCTTCACTAGGCAATCTCACCAAACTCACTCATCTTGATATGTCTTACAATAATCTTGTAGGCCAGATACCTTCTTCCCTAGGAAATCTAAAACAATTAGAATACCTAGACATCTCTAACAATTACATTCATGGTTCCATTCCTCTTGAGTTGGGGTTTTTGAAAAATCTCACTTTCTTAGATCTATCTAACAATAGATTCAAAGGTGAGATACCTTCTTCACTAAGAAATCTCAAACAATTACAGAAGCTAGACTTCTCTCACAACAACCTTAATGGTTCCACTCCTCATGAGTTGGGGTTCTTGAAAAATCTCACTAGATTAGATCTATCTTACAATAGACTCAATAAAAACTTGCCTATATCCCTTACAAACCTCACAAAGTTACAATACCTTGACATCTCTAACAATTTTATCAATGGTTTCCTCCCATTTAACTTTGATCAATTAACCAATTTGCAAGAGTTGATTCTAAATAACAATTCCATCCGTGGAACCTTTCCAATTTCCTTAACAAATCTCTCTCTATTAGAAACCCTTGACATTTCCCATAACTACTTTGAAGGTTTTATTCCTTTTGAGTTGGGGTTCCTCAAAAATCTCACTACATTAAATCTATCTAACAATAGATTCAAAGATTTCAGTCACAACCTCATTAGTGGTGAAATCCCTTCTTATATTGGCGCCATTGACAAACTTTATTTAAACAATAATAATCTCACTGGAACAATTCCCCAATCTCTCTGTGATGTCTTTGATTATGTGGACATTTCATACAATTGTTTGGAGGGTCCCATTCCAAATTGTCATGGTCTTGTAATAATAAACATGGAAAACTCTGATGTATGTTCATTTAACCAATTCCAGCCATCGTCACCACACAAGAAAAATATTAAATTTAAGCACATTGTTGTCATTGCTCTTCCGATCCTTATTCTTCTAGTCCTAGTCTTATCACTTCTCAAATGCTTGAATCTTTATCATATTTCTACTAACAAGTTGGATGAAAACTCAACAAAAACAAAGAATGGAGTTATGTTTTGTATATGGAATTATGATGGGAAGATAGCATATGATGACATCATCAAAGCAACAGAAGACTTTGACATGAGATATTGCATTGGAACAGGAGCATATGGAAGTGTTTACAATGCACAATTACCAAGTGGCAAGGTTGTTGCCTTAAAGAAACTTCACAGCCATGAAGCAGAGGTTCCATCTTTCGATGAGAGTTTCAGAAATGAAGTGAGAATATTATCAGAAATAAAGCACCGACATATTGTGAAGCTTTATGGATTTTGCTTGCACAAAAGAATCATGTTTTTTATCTATCAATATATGGAGAAAGGAAGCTTGTTCTCTATCTTGTATGATGATGTGGAAGCCGTGAAATTTAAGTGGAGGAAAAGGGTCAACACTGTTAAAGGAGTTGCATTTGCTCTATCTTATCTTCATCATGATTGCACGGCTCCAATAGTGCATCGAGATGTATCTACTAGCAATATCTTGCTAAACTCTGAGTGGCAGGCTAGTGTTTGTGACTTTGGCACAACACGACTCCTTCAATATGATTCATCCAATCGAACTATAGTTGCTGGAACTATTGGATATATAGCTCCTGAGCTTGCCTATACTATGGCTGTGAATGAAAAGTGTGATGTGTATAGTTTTGGTGTAGTCGCACTTGAAACTTTGGTTGGAAGACACCCTGAAGATTTATTGTCATCACTTCAATCAACATCGATAAGAAGTGTCAAGCTATGTCAAGTATTAGACCAACGTCTTCCACTTCCAAATAATGACATAGTTATACGTGACATAATTCATGTTGCCGTGGTAGCATTTGCATGCTTAAATGTCAATCCTCGTTCTCGACCAACAATGAAACGTGTGTCACAAAGTTTTGTCACAGAGCTTACACCATTGAGCAATCCTTTGAGTGAAATTTCAGTGCAACAACTCATGAGTCAAGAACTCAAAGCAATATTTTATATTGCGAACCCTTGA
Protein sequence

>MsG0780036113.01.T01

MTNEHMLGTQHLIVGTQCAATETSQLQMEASAILNSGWWNTSDARFNISDRYNWHDIFCNDAGSIKAINIYPSGFQLATVNLSTFNFSSFHNLECLVIRSVKLYGTIPKEIGHLSKLTHLNLSANFLEGEVPPSLGNLTKLTHLDMSYNNLVGQIPSSLGNLKQLEYLDISNNYIHGSIPLELGFLKNLTFLDLSNNRFKGEIPSSLRNLKQLQKLDFSHNNLNGSTPHELGFLKNLTRLDLSYNRLNKNLPISLTNLTKLQYLDISNNFINGFLPFNFDQLTNLQELILNNNSIRGTFPISLTNLSLLETLDISHNYFEGFIPFELGFLKNLTTLNLSNNRFKDFSHNLISGEIPSYIGAIDKLYLNNNNLTGTIPQSLCDVFDYVDISYNCLEGPIPNCHGLVIINMENSDVCSFNQFQPSSPHKKNIKFKHIVVIALPILILLVLVLSLLKCLNLYHISTNKLDENSTKTKNGVMFCIWNYDGKIAYDDIIKATEDFDMRYCIGTGAYGSVYNAQLPSGKVVALKKLHSHEAEVPSFDESFRNEVRILSEIKHRHIVKLYGFCLHKRIMFFIYQYMEKGSLFSILYDDVEAVKFKWRKRVNTVKGVAFALSYLHHDCTAPIVHRDVSTSNILLNSEWQASVCDFGTTRLLQYDSSNRTIVAGTIGYIAPELAYTMAVNEKCDVYSFGVVALETLVGRHPEDLLSSLQSTSIRSVKLCQVLDQRLPLPNNDIVIRDIIHVAVVAFACLNVNPRSRPTMKRVSQSFVTELTPLSNPLSEISVQQLMSQELKAIFYIANP*