AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780036116.01

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MsG0780036116.01.T01 AT1G55610 32.018 228 126 5 79 282 517 739 3.01e-18 90.5
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MsG0780036116.01.T01 AT2G23950 38.000 100 62 0 144 243 88 187 5.10e-11 66.6
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MsG0780036116.01.T01 AT1G71400 26.996 263 122 3 96 288 506 768 2.10e-13 74.7
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MsG0780036116.01.T01 AT4G22130 31.361 169 112 3 156 324 75 239 4.27e-12 70.5
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MsG0780036116.01.T01 AT1G51890 31.757 444 255 16 373 785 408 834 9.36e-45 174
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MsG0780036116.01.T01 AT1G51850 30.416 457 276 13 351 785 407 843 1.37e-44 173
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MsG0780036116.01.T01 AT5G15730 34.296 277 172 6 512 787 106 373 1.57e-44 167
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MsG0780036116.01.T01 AT2G19230 31.250 480 252 19 324 785 416 835 1.98e-44 174
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MsG0780036116.01.T01 AT4G00330 34.812 293 173 6 509 787 106 394 2.68e-44 166
MsG0780036116.01.T01 AT1G61610 34.602 289 166 5 510 785 513 791 2.68e-44 172
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MsG0780036116.01.T01 AT4G21390 31.694 366 217 8 450 785 433 795 5.83e-44 171
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MsG0780036116.01.T01 AT2G42960 33.673 294 177 6 514 796 175 461 7.56e-44 166
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MsG0780036116.01.T01 AT4G27290 33.452 281 176 3 513 785 456 733 1.08e-43 170
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MsG0780036116.01.T01 AT1G61500 34.657 277 163 5 515 780 466 735 1.38e-43 170
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MsG0780036116.01.T01 AT1G34210 38.760 129 75 1 254 378 76 204 3.96e-15 80.1
MsG0780036116.01.T01 AT1G34210 43.119 109 62 0 183 291 77 185 5.95e-15 79.3
MsG0780036116.01.T01 AT1G34210 38.346 133 80 2 135 266 77 208 3.56e-14 77.0
MsG0780036116.01.T01 AT1G34210 34.615 130 80 3 42 171 61 185 5.40e-12 70.1
MsG0780036116.01.T01 AT1G34210 39.130 115 63 3 323 431 73 186 9.18e-11 65.9
MsG0780036116.01.T01 AT1G34210 35.971 278 165 6 518 785 301 575 1.83e-43 167
MsG0780036116.01.T01 AT1G34210 42.609 115 66 0 206 320 76 190 3.26e-17 86.7
MsG0780036116.01.T01 AT1G34210 40.602 133 78 1 152 284 70 201 6.87e-17 85.5
MsG0780036116.01.T01 AT1G34210 42.991 107 61 0 233 339 79 185 4.03e-16 83.2
MsG0780036116.01.T01 AT1G34210 46.789 109 58 0 111 219 77 185 4.21e-16 83.2
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MsG0780036116.01.T01 AT2G19190 31.498 454 258 18 353 785 417 838 3.70e-42 166
MsG0780036116.01.T01 AT1G51830 28.243 478 280 12 327 785 225 658 3.72e-42 164
MsG0780036116.01.T01 AT1G26150 34.014 294 170 7 511 789 419 703 3.78e-42 165
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MsG0780036116.01.T01 AT4G33430 36.646 161 77 4 179 315 69 228 4.28e-11 67.0
MsG0780036116.01.T01 AT1G24030 35.211 284 158 8 517 782 3 278 3.96e-42 156
MsG0780036116.01.T01 AT1G51805 28.947 456 270 12 368 785 403 842 4.06e-42 166
MsG0780036116.01.T01 AT5G59270 31.788 302 188 5 509 800 336 629 4.08e-42 164
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MsG0780036116.01.T01 AT1G29750 33.981 309 173 5 94 402 97 374 2.81e-35 145
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MsG0780036116.01.T01 AT1G56130 32.593 270 177 3 166 431 111 379 1.40e-31 133
MsG0780036116.01.T01 AT1G56130 33.921 227 143 3 213 433 110 335 3.95e-25 112
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MsG0780036116.01.T01 AT1G53430 33.096 281 156 4 75 332 50 321 9.78e-31 130
MsG0780036116.01.T01 AT2G23200 36.749 283 168 8 510 785 476 754 1.26e-41 164
MsG0780036116.01.T01 AT1G51880 30.687 466 262 16 351 793 433 860 1.29e-41 164
MsG0780036116.01.T01 AT4G04220 32.957 443 215 9 78 441 150 589 1.32e-41 164
MsG0780036116.01.T01 AT4G04220 36.667 360 167 9 129 430 104 460 7.40e-41 162
MsG0780036116.01.T01 AT4G04220 32.057 418 210 10 84 435 327 736 6.11e-35 143
MsG0780036116.01.T01 AT4G04220 33.058 363 199 8 107 430 326 683 2.88e-29 125
MsG0780036116.01.T01 AT4G04220 30.882 340 175 7 154 433 77 416 2.39e-27 119
MsG0780036116.01.T01 AT4G04220 32.042 284 132 5 84 309 468 748 1.03e-23 107
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MsG0780036116.01.T01 AT1G74170 32.937 252 138 8 197 433 135 370 6.97e-16 82.8
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MsG0780036116.01.T01 AT1G66880 36.237 287 164 9 510 785 578 856 8.42e-41 162
MsG0780036116.01.T01 AT1G66880 36.458 288 162 10 510 785 957 1235 8.90e-41 162
MsG0780036116.01.T01 AT3G20820 37.903 248 152 2 117 363 89 335 9.03e-41 154
MsG0780036116.01.T01 AT3G20820 40.090 222 132 1 94 315 115 335 9.16e-36 139
MsG0780036116.01.T01 AT3G20820 38.117 223 131 4 214 430 90 311 1.41e-32 130
MsG0780036116.01.T01 AT3G20820 35.081 248 152 4 190 430 90 335 2.60e-31 126
MsG0780036116.01.T01 AT3G20820 38.071 197 121 1 76 272 145 340 6.99e-31 125
MsG0780036116.01.T01 AT1G61380 33.213 277 169 5 451 723 424 688 9.77e-41 161
MsG0780036116.01.T01 AT2G28990 28.893 488 269 12 324 785 407 842 1.01e-40 161
MsG0780036116.01.T01 AT2G28990 28.893 488 269 12 324 785 407 842 1.01e-40 161
MsG0780036116.01.T01 AT3G45410 32.698 315 199 8 509 816 329 637 1.01e-40 160
MsG0780036116.01.T01 AT3G46290 33.430 344 202 11 462 785 415 751 1.05e-40 161
MsG0780036116.01.T01 AT4G23230 29.213 356 226 6 458 800 277 619 1.07e-40 159
MsG0780036116.01.T01 AT1G74170 35.417 384 194 10 96 430 466 844 1.30e-40 161
MsG0780036116.01.T01 AT1G74170 34.167 360 214 11 98 444 372 721 2.10e-37 151
MsG0780036116.01.T01 AT1G74170 31.084 489 230 15 78 468 169 648 1.38e-34 142
MsG0780036116.01.T01 AT1G74170 33.428 353 190 6 52 363 520 868 4.98e-34 141
MsG0780036116.01.T01 AT1G74170 31.078 399 208 10 78 410 472 869 2.83e-30 129
MsG0780036116.01.T01 AT1G74170 30.769 390 206 11 78 423 68 437 3.03e-23 106
MsG0780036116.01.T01 AT1G74170 32.937 252 138 8 197 433 67 302 1.09e-15 82.4
MsG0780036116.01.T01 AT1G26150 38.865 229 131 4 511 736 419 641 1.31e-40 159
MsG0780036116.01.T01 AT2G48010 33.053 357 204 11 452 785 209 553 1.36e-40 159
MsG0780036116.01.T01 AT4G05200 30.259 347 218 8 450 782 275 611 1.39e-40 159
MsG0780036116.01.T01 AT5G59260 31.922 307 191 8 509 805 342 640 1.42e-40 159
MsG0780036116.01.T01 AT1G61860 35.831 307 173 11 508 798 70 368 1.68e-40 154
MsG0780036116.01.T01 AT4G05200 30.259 347 218 8 450 782 293 629 1.95e-40 159
MsG0780036116.01.T01 AT1G34300 30.390 385 238 11 451 817 417 789 1.97e-40 160
MsG0780036116.01.T01 AT4G23180 32.042 284 183 4 509 785 335 615 2.05e-40 159

Find 132 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 152 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CGACATATTGTGAAGCTTTA+TGG 0.049784 7:-2870805 MsG0780036116.01.T01:CDS
CGTATAACTATGTAATTATT+TGG 0.194445 7:+2870091 None:intergenic
TCACTCAAAGAAATGCTTAA+TGG 0.218876 7:+2869962 None:intergenic
GAGAGATGACCAATTTCTTT+TGG 0.236802 7:+2872245 None:intergenic
CTATCTAACAATAGATTTAA+AGG 0.237074 7:-2872131 MsG0780036116.01.T01:CDS
CTATCTCACAATAGACTTAA+TGG 0.244178 7:-2871555 MsG0780036116.01.T01:CDS
GGTGAAATCCCTTCTTATAT+TGG 0.254330 7:-2871387 MsG0780036116.01.T01:CDS
ATCTCTCACAACAACCTTAA+TGG 0.255184 7:-2871627 MsG0780036116.01.T01:CDS
AAAAGGGTTAATACTGTTAA+AGG 0.270606 7:-2870673 MsG0780036116.01.T01:CDS
ATATATCTGATCGTTGTAAT+TGG 0.273916 7:-2872430 MsG0780036116.01.T01:CDS
ATCACGTCAGTTGAACTATA+TGG 0.275960 7:-2872275 MsG0780036116.01.T01:CDS
TGGAATTCAAGTGGAGAAAA+AGG 0.278185 7:-2870690 MsG0780036116.01.T01:CDS
GTATAAACCTGAAGACAATT+TGG 0.290559 7:+2871252 None:intergenic
ATTAGTAAATGGAAACAAAT+TGG 0.303104 7:+2871449 None:intergenic
ACTATAGTTGCTGGAACTAT+TGG 0.311266 7:-2870493 MsG0780036116.01.T01:CDS
ATATCTCACAACGACCTTAT+AGG 0.312097 7:-2871771 MsG0780036116.01.T01:CDS
GAAGTTAAATAATTAGTAAA+TGG 0.317256 7:+2871438 None:intergenic
GGTTCCATTCCTCTTGAGTT+GGG 0.330039 7:-2872038 MsG0780036116.01.T01:CDS
TCCCATTCCAAATTGTCTTC+AGG 0.330095 7:-2871259 MsG0780036116.01.T01:CDS
GGTCATATTCCTCTTGAGTT+GGG 0.331974 7:-2871894 MsG0780036116.01.T01:CDS
GGTTCCATTCCTCTTGAGTT+GGG 0.334776 7:-2871750 MsG0780036116.01.T01:CDS
GTCAGCTACCTCCTGAATTA+TGG 0.334911 7:-2872181 MsG0780036116.01.T01:CDS
GGGAAATCTCAAACAATTAC+AGG 0.343340 7:-2871802 MsG0780036116.01.T01:CDS
GATACATCTCTATGGACTAT+TGG 0.350041 7:+2870607 None:intergenic
GGACATTTCATACAATTGTT+TGG 0.353968 7:-2871286 MsG0780036116.01.T01:CDS
CATGAGGAATGGAACCATTA+AGG 0.355374 7:+2871613 None:intergenic
AGACTATGACTAGAATAATA+AGG 0.361016 7:+2871148 None:intergenic
AGCAATCAAAATAGACTCTT+GGG 0.363908 7:-2872369 MsG0780036116.01.T01:CDS
GGGACTATCCCAAAAGAAAT+TGG 0.364457 7:-2872254 MsG0780036116.01.T01:CDS
AGGAAATCTAAAACAATTAG+AGG 0.372988 7:-2871658 MsG0780036116.01.T01:CDS
AATAGACATTACAGAGAGAT+TGG 0.381668 7:+2871313 None:intergenic
ACTAGAAAATTTAAAACAAT+TGG 0.382039 7:-2872093 MsG0780036116.01.T01:CDS
TGTGACACACGTTTCATTGT+TGG 0.385025 7:+2870007 None:intergenic
TCCAATCGAACTATAGTTGC+TGG 0.386104 7:-2870502 MsG0780036116.01.T01:CDS
CAGGCTAGTGTTTGTGACTT+TGG 0.386315 7:-2870553 MsG0780036116.01.T01:CDS
AGGTGAGATACCTTCTTCAT+TGG 0.391640 7:-2871823 MsG0780036116.01.T01:CDS
TGCTACTAGATACATCTCTA+TGG 0.397295 7:+2870599 None:intergenic
GACATCTCATCAACTTCAAA+TGG 0.407683 7:-2872507 MsG0780036116.01.T01:CDS
CTTATTTGCAGTATGATTGT+GGG 0.410166 7:-2872551 None:intergenic
ATCTCTAGCAATTACATTCA+AGG 0.412682 7:-2872059 MsG0780036116.01.T01:CDS
TGCATTGGAACAGGAGCATA+TGG 0.414248 7:-2870961 MsG0780036116.01.T01:CDS
AAGCAATCAAAATAGACTCT+TGG 0.420759 7:-2872370 MsG0780036116.01.T01:CDS
CAAGAGGAATGGAACCTATA+AGG 0.421124 7:+2871757 None:intergenic
TACTAATTATTTAACTTCCA+TGG 0.429294 7:-2871433 MsG0780036116.01.T01:CDS
GGTGAGATACCTTCTTCATT+GGG 0.431196 7:-2871822 MsG0780036116.01.T01:CDS
AAGTGTGATGTATATAGTTT+TGG 0.441933 7:-2870232 MsG0780036116.01.T01:CDS
AGGTTCCATTCCTCTTGAGT+TGG 0.447790 7:-2872039 MsG0780036116.01.T01:CDS
AGGTTCCATTCCTCTTGAGT+TGG 0.452528 7:-2871751 MsG0780036116.01.T01:CDS
TCAATGTAGCCAATATAAGA+AGG 0.454030 7:+2871378 None:intergenic
ATGAGATATTGCATTGGAAC+AGG 0.454703 7:-2870970 MsG0780036116.01.T01:CDS
TCTTATTTGCAGTATGATTG+TGG 0.454951 7:-2872552 None:intergenic
ATAGACATTACAGAGAGATT+GGG 0.457747 7:+2871314 None:intergenic
ATCTCTAACAACGACATTGA+AGG 0.458267 7:-2871915 MsG0780036116.01.T01:CDS
TCCAGCAACTATAGTTCGAT+TGG 0.460209 7:+2870501 None:intergenic
ATCTCATATAATTTACTCAT+AGG 0.464336 7:-2871483 MsG0780036116.01.T01:CDS
CTTTAGTTGGAAGGCACCCT+GGG 0.466628 7:-2870192 MsG0780036116.01.T01:CDS
ACCTGAAGACAATTTGGAAT+GGG 0.475686 7:+2871258 None:intergenic
ATTATATCTTGCAACGAGGC+TGG 0.475733 7:-2872401 MsG0780036116.01.T01:CDS
AGGTCATATTCCTCTTGAGT+TGG 0.478583 7:-2871895 MsG0780036116.01.T01:CDS
TTTAGATTTCCTAGGGAAGA+AGG 0.480122 7:+2871669 None:intergenic
ACTATGTAATTATTTGGAAG+TGG 0.480370 7:+2870097 None:intergenic
TTGAGATTTCCCAATGAAGA+AGG 0.481985 7:+2871813 None:intergenic
TCACGTCAGTTGAACTATAT+GGG 0.482757 7:-2872274 MsG0780036116.01.T01:CDS
CGAAAACTCTCATCAAAAGA+TGG 0.484851 7:+2870862 None:intergenic
CTAAGTCACAACTTCATTAG+TGG 0.486214 7:-2871408 MsG0780036116.01.T01:CDS
ACTTTAGTTGGAAGGCACCC+TGG 0.486816 7:-2870193 MsG0780036116.01.T01:CDS
GTGGCACTTGAAACTTTAGT+TGG 0.497856 7:-2870205 MsG0780036116.01.T01:CDS
GTCATATTCCTCTTGAGTTG+GGG 0.498611 7:-2871893 MsG0780036116.01.T01:CDS
CACTTGAAACTTTAGTTGGA+AGG 0.502085 7:-2870201 MsG0780036116.01.T01:CDS
TTAAGCAATAATAATCTCAC+TGG 0.504110 7:-2871345 MsG0780036116.01.T01:CDS
GGTTGTTGTGAGAGATGTCT+AGG 0.505925 7:+2871634 None:intergenic
TGGTTCCATTCCTCATGAGT+TGG 0.507310 7:-2871607 MsG0780036116.01.T01:CDS
ATTGCTTAACTCTGAGTGGC+AGG 0.508639 7:-2870572 MsG0780036116.01.T01:CDS
ATCTATCAATACATGGAGAA+AGG 0.509230 7:-2870751 MsG0780036116.01.T01:CDS
GGTGAGATACCTTCCTCCCT+AGG 0.518801 7:-2871966 MsG0780036116.01.T01:CDS
TGTAATTGCTAGAGATGTCT+AGG 0.519375 7:+2872066 None:intergenic
GATTCTTCTGAGAAGTTGCA+TGG 0.522900 7:-2871093 MsG0780036116.01.T01:CDS
CTATCTAATAATAGATTCAA+AGG 0.524718 7:-2871699 MsG0780036116.01.T01:CDS
GGTGAGATACCTTCTTCCCT+AGG 0.525622 7:-2871678 MsG0780036116.01.T01:CDS
TCTCTGTAATGTCTATTATG+TGG 0.526595 7:-2871307 MsG0780036116.01.T01:CDS
ATTTCATACAATTGTTTGGA+GGG 0.527441 7:-2871282 MsG0780036116.01.T01:CDS
TTCATTGTTGGTCGAGAACG+AGG 0.528233 7:+2870019 None:intergenic
GTTCCATTCCTCTTGAGTTG+GGG 0.528362 7:-2872037 MsG0780036116.01.T01:CDS
CTATCTAACAATAGATTCAA+AGG 0.531538 7:-2871843 MsG0780036116.01.T01:CDS
CAATGTAGCCAATATAAGAA+GGG 0.532245 7:+2871379 None:intergenic
GTTCCATTCCTCTTGAGTTG+GGG 0.533100 7:-2871749 MsG0780036116.01.T01:CDS
ATTGTCTTCAGGTTTATACA+TGG 0.534529 7:-2871248 MsG0780036116.01.T01:CDS
ACTATTGGATATATTGCTCC+TGG 0.538272 7:-2870478 MsG0780036116.01.T01:intron
ACTTGACATAGTTTGAGACT+TGG 0.539910 7:+2870136 None:intergenic
ATGCTATAATAAAGAGTGGA+TGG 0.544099 7:-2872478 MsG0780036116.01.T01:CDS
GATTGGATGAATCATATTGA+AGG 0.546822 7:+2870518 None:intergenic
AACCTGAAGACAATTTGGAA+TGG 0.548637 7:+2871257 None:intergenic
TTTAGATTTCCTAGGGAGGA+AGG 0.549318 7:+2871957 None:intergenic
CATTTCATACAATTGTTTGG+AGG 0.550477 7:-2871283 MsG0780036116.01.T01:CDS
TTCATGAACCCCAACTCAAG+AGG 0.554852 7:+2871741 None:intergenic
AAGGCAACAACCTTGCCACT+TGG 0.561313 7:+2870916 None:intergenic
GTAAATTATATGAGATGTCA+AGG 0.565221 7:+2871490 None:intergenic
GTAAATGGAAACAAATTGGA+AGG 0.566011 7:+2871453 None:intergenic
TTGAGGAACCCCAACTCAAG+AGG 0.567476 7:+2871885 None:intergenic
GAACACCAACTCATGAGGAA+TGG 0.569124 7:+2871602 None:intergenic
GAACCCCAACTCAAGAGGAA+TGG 0.577468 7:+2871746 None:intergenic
AAACCCCAACTCAAGAGGAA+TGG 0.577468 7:+2872034 None:intergenic
CTCATCAAAAGATGGAACCT+CGG 0.577964 7:+2870870 None:intergenic
TTTGACATGAGATATTGCAT+TGG 0.578977 7:-2870976 MsG0780036116.01.T01:CDS
AGTGATGACAATAAATCCCC+AGG 0.580045 7:+2870175 None:intergenic
TTTGTATATGGAATTATGAT+GGG 0.585035 7:-2871038 MsG0780036116.01.T01:CDS
GCAAATGCTATAATAAAGAG+TGG 0.588024 7:-2872482 MsG0780036116.01.T01:CDS
TTCAAGAACACCAACTCATG+AGG 0.589212 7:+2871597 None:intergenic
AGCATATGGAAGTGTTTACA+AGG 0.595999 7:-2870947 MsG0780036116.01.T01:CDS
GAAGTTGTGACTTAGATCCA+TGG 0.597211 7:+2871416 None:intergenic
TAGAAGCTGTGGAATTCAAG+TGG 0.603611 7:-2870699 MsG0780036116.01.T01:CDS
CTATCTTACAATATACTCAA+AGG 0.607888 7:-2871987 MsG0780036116.01.T01:CDS
CATAAAGCTTCACAATATGT+CGG 0.613764 7:+2870806 None:intergenic
TAGACATTACAGAGAGATTG+GGG 0.617725 7:+2871315 None:intergenic
GTTCAACTGACGTGATAACA+AGG 0.627727 7:+2872282 None:intergenic
TTTAGCAACCATAATTCAGG+AGG 0.630081 7:+2872173 None:intergenic
CGATCAGATATATTGAAGAG+TGG 0.631354 7:+2872440 None:intergenic
TGCAGAGCTTGCATATACAA+TGG 0.635178 7:-2870266 MsG0780036116.01.T01:intron
GGCACAATTACCAAGTGGCA+AGG 0.640449 7:-2870926 MsG0780036116.01.T01:CDS
GCAATCAAAATAGACTCTTG+GGG 0.643047 7:-2872368 MsG0780036116.01.T01:CDS
ATATATTGCTTAACTCTGAG+TGG 0.650660 7:-2870576 MsG0780036116.01.T01:CDS
TGACATCATTCATGTTGCCG+TGG 0.653303 7:-2870068 MsG0780036116.01.T01:CDS
GTATGATGATGTAGAAGCTG+TGG 0.653898 7:-2870710 MsG0780036116.01.T01:CDS
ACTTCACGGCTATGAAGCCG+AGG 0.658344 7:-2870887 MsG0780036116.01.T01:CDS
GTGATGACAATAAATCCCCA+GGG 0.663800 7:+2870176 None:intergenic
TAAGCATGCAAATGCTACCA+CGG 0.665989 7:+2870051 None:intergenic
CTATAATAAAGAGTGGATGG+TGG 0.669513 7:-2872475 MsG0780036116.01.T01:CDS
TACAAGGCACAATTACCAAG+TGG 0.677587 7:-2870931 MsG0780036116.01.T01:CDS
TATTTGGAAGTGGAAGACGT+TGG 0.678619 7:+2870107 None:intergenic
TTTAGTTGGAAGGCACCCTG+GGG 0.725104 7:-2870191 MsG0780036116.01.T01:CDS
TGATATTATATCTTGCAACG+AGG 0.784477 7:-2872405 MsG0780036116.01.T01:CDS
AAGTTGATGAGATGTCACAG+TGG 0.845221 7:+2872514 None:intergenic

CRISPR-GE

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!! GAAGTTAAATAATTAGTAAA+TGG + Chr7:2871011-2871030 None:intergenic 15.0%
!!! ACTAGAAAATTTAAAACAAT+TGG - Chr7:2870353-2870372 MsG0780036116.01.T01:intron 15.0%
!!! TAATTTTCAATTACTTTCTT+TGG - Chr7:2872125-2872144 MsG0780036116.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTTAAATTTTCTAGTAAAGA+AGG + Chr7:2870348-2870367 None:intergenic 15.0%
!! ATCTCATATAATTTACTCAT+AGG - Chr7:2870963-2870982 MsG0780036116.01.T01:CDS 20.0%
!! ATTAGTAAATGGAAACAAAT+TGG + Chr7:2871000-2871019 None:intergenic 20.0%
!! CGTATAACTATGTAATTATT+TGG + Chr7:2872358-2872377 None:intergenic 20.0%
!! CTATCTAACAATAGATTTAA+AGG - Chr7:2870315-2870334 MsG0780036116.01.T01:intron 20.0%
!! CTATCTAATAATAGATTCAA+AGG - Chr7:2870747-2870766 MsG0780036116.01.T01:CDS 20.0%
!! GTAAGATTTGTAAGAAAAAT+AGG + Chr7:2870924-2870943 None:intergenic 20.0%
!! TTTGTATATGGAATTATGAT+GGG - Chr7:2871408-2871427 MsG0780036116.01.T01:CDS 20.0%
!!! TAATTGTTTTAGATTTCCTA+GGG + Chr7:2870499-2870518 None:intergenic 20.0%
!!! TACTAATTATTTAACTTCCA+TGG - Chr7:2871013-2871032 MsG0780036116.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTTGTATATGGAATTATGA+TGG - Chr7:2871407-2871426 MsG0780036116.01.T01:CDS 20.0%
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! AACTCAACAAAAACAAAGAA+TGG - Chr7:2871377-2871396 MsG0780036116.01.T01:CDS 25.0%
! ACTATGTAATTATTTGGAAG+TGG + Chr7:2872352-2872371 None:intergenic 25.0%
! AGACTATGACTAGAATAATA+AGG + Chr7:2871301-2871320 None:intergenic 25.0%
! ATATATCTGATCGTTGTAAT+TGG - Chr7:2870016-2870035 MsG0780036116.01.T01:CDS 25.0%
! ATATCAATGGTTAATTTACC+AGG + Chr7:2871989-2872008 None:intergenic 25.0%
! ATTTCATACAATTGTTTGGA+GGG - Chr7:2871164-2871183 MsG0780036116.01.T01:CDS 25.0%
! CTATCTAACAATAGATTCAA+AGG - Chr7:2870603-2870622 MsG0780036116.01.T01:CDS 25.0%
! CTATCTTACAATATACTCAA+AGG - Chr7:2870459-2870478 MsG0780036116.01.T01:intron 25.0%
! GTAAATTATATGAGATGTCA+AGG + Chr7:2870959-2870978 None:intergenic 25.0%
! TTAAGCAATAATAATCTCAC+TGG - Chr7:2871101-2871120 MsG0780036116.01.T01:CDS 25.0%
!! AAGTGTGATGTATATAGTTT+TGG - Chr7:2872214-2872233 MsG0780036116.01.T01:CDS 25.0%
!! AGGAAATCTAAAACAATTAG+AGG - Chr7:2870500-2870519 MsG0780036116.01.T01:CDS 25.0%
!! ATAAGAAAGTGAGATTTTTG+AGG + Chr7:2870581-2870600 None:intergenic 25.0%
!! ATGGAGATATGTTTTGTATA+TGG - Chr7:2871396-2871415 MsG0780036116.01.T01:CDS 25.0%
!! GAACATGTATGTTATTTATG+TGG + Chr7:2872080-2872099 None:intergenic 25.0%
!! GTTTTTGATCTATCAATACA+TGG - Chr7:2871688-2871707 MsG0780036116.01.T01:CDS 25.0%
!! TTGTCTTACAATTTTCTTGA+AGG - Chr7:2870243-2870262 MsG0780036116.01.T01:CDS 25.0%
!!! CTAATTGTTTTAGATTTCCT+AGG + Chr7:2870500-2870519 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTTTAGCAACCATAATTC+AGG + Chr7:2870279-2870298 None:intergenic 25.0%
AAGCAATCAAAATAGACTCT+TGG - Chr7:2870076-2870095 MsG0780036116.01.T01:CDS 30.0%
AATAGACATTACAGAGAGAT+TGG + Chr7:2871136-2871155 None:intergenic 30.0%
AGCAATCAAAATAGACTCTT+GGG - Chr7:2870077-2870096 MsG0780036116.01.T01:CDS 30.0%
ATAGACATTACAGAGAGATT+GGG + Chr7:2871135-2871154 None:intergenic 30.0%
ATATATTGCTTAACTCTGAG+TGG - Chr7:2871870-2871889 MsG0780036116.01.T01:CDS 30.0%
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ATCTCTAGCAATTACATTCA+AGG - Chr7:2870387-2870406 MsG0780036116.01.T01:intron 30.0%
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CAATGTAGCCAATATAAGAA+GGG + Chr7:2871070-2871089 None:intergenic 30.0%
CATAAAGCTTCACAATATGT+CGG + Chr7:2871643-2871662 None:intergenic 30.0%
CATTTCATACAATTGTTTGG+AGG - Chr7:2871163-2871182 MsG0780036116.01.T01:CDS 30.0%
CTATCTCACAATAGACTTAA+TGG - Chr7:2870891-2870910 MsG0780036116.01.T01:CDS 30.0%
GATTGGATGAATCATATTGA+AGG + Chr7:2871931-2871950 None:intergenic 30.0%
GATTTGTAAGAAAAATAGGC+AGG + Chr7:2870920-2870939 None:intergenic 30.0%
GCAAATGCTATAATAAAGAG+TGG - Chr7:2869964-2869983 MsG0780036116.01.T01:CDS 30.0%
GGACATTTCATACAATTGTT+TGG - Chr7:2871160-2871179 MsG0780036116.01.T01:CDS 30.0%
GTAAATGGAAACAAATTGGA+AGG + Chr7:2870996-2871015 None:intergenic 30.0%
GTATAAACCTGAAGACAATT+TGG + Chr7:2871197-2871216 None:intergenic 30.0%
GTGCATCATATAAAAATGAG+CGG + Chr7:2872039-2872058 None:intergenic 30.0%
GTTGCCTTAAAAAAACTTCA+CGG - Chr7:2871545-2871564 MsG0780036116.01.T01:CDS 30.0%
TCAATGTAGCCAATATAAGA+AGG + Chr7:2871071-2871090 None:intergenic 30.0%
TCACTCAAAGAAATGCTTAA+TGG + Chr7:2872487-2872506 None:intergenic 30.0%
TCTCTGTAATGTCTATTATG+TGG - Chr7:2871139-2871158 MsG0780036116.01.T01:CDS 30.0%
TGATATTATATCTTGCAACG+AGG - Chr7:2870041-2870060 MsG0780036116.01.T01:CDS 30.0%
TTTGACATGAGATATTGCAT+TGG - Chr7:2871470-2871489 MsG0780036116.01.T01:CDS 30.0%
! AGAGATGACCAATTTCTTTT+GGG + Chr7:2870203-2870222 None:intergenic 30.0%
! ATTGTCTTCAGGTTTATACA+TGG - Chr7:2871198-2871217 MsG0780036116.01.T01:CDS 30.0%
! TGTTCATTAGTTCTTCTTCA+TGG - Chr7:2872095-2872114 MsG0780036116.01.T01:CDS 30.0%
!!! ATAGCCGTGAAGTTTTTTTA+AGG + Chr7:2871552-2871571 None:intergenic 30.0%
!!! TGTATATAGTTTTGGTGTAG+TGG - Chr7:2872222-2872241 MsG0780036116.01.T01:CDS 30.0%
AACCTGAAGACAATTTGGAA+TGG + Chr7:2871192-2871211 None:intergenic 35.0%
ACTATAGTTGCTGGAACTAT+TGG - Chr7:2871953-2871972 MsG0780036116.01.T01:CDS 35.0%
ACTATTGGATATATTGCTCC+TGG - Chr7:2871968-2871987 MsG0780036116.01.T01:CDS 35.0%
ATATCTCACAACGACCTTAT+AGG - Chr7:2870675-2870694 MsG0780036116.01.T01:CDS 35.0%
ATCACGTCAGTTGAACTATA+TGG - Chr7:2870171-2870190 MsG0780036116.01.T01:CDS 35.0%
ATCTCTAACAACGACATTGA+AGG - Chr7:2870531-2870550 MsG0780036116.01.T01:CDS 35.0%
ATCTCTCACAACAACCTTAA+TGG - Chr7:2870819-2870838 MsG0780036116.01.T01:CDS 35.0%
ATGAGATATTGCATTGGAAC+AGG - Chr7:2871476-2871495 MsG0780036116.01.T01:CDS 35.0%
CACTTGAAACTTTAGTTGGA+AGG - Chr7:2872245-2872264 MsG0780036116.01.T01:CDS 35.0%
CGAAAACTCTCATCAAAAGA+TGG + Chr7:2871587-2871606 None:intergenic 35.0%
CGACATATTGTGAAGCTTTA+TGG - Chr7:2871641-2871660 MsG0780036116.01.T01:CDS 35.0%
CGATCAGATATATTGAAGAG+TGG + Chr7:2870009-2870028 None:intergenic 35.0%
CTAAGTCACAACTTCATTAG+TGG - Chr7:2871038-2871057 MsG0780036116.01.T01:CDS 35.0%
CTATAATAAAGAGTGGATGG+TGG - Chr7:2869971-2869990 MsG0780036116.01.T01:CDS 35.0%
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GCAATCAAAATAGACTCTTG+GGG - Chr7:2870078-2870097 MsG0780036116.01.T01:CDS 35.0%
GGAATTCAAGTGGAGAAAAA+GGG - Chr7:2871757-2871776 MsG0780036116.01.T01:CDS 35.0%
GGGAAATCTCAAACAATTAC+AGG - Chr7:2870644-2870663 MsG0780036116.01.T01:CDS 35.0%
GGTGAAATCCCTTCTTATAT+TGG - Chr7:2871059-2871078 MsG0780036116.01.T01:CDS 35.0%
TAGACATTACAGAGAGATTG+GGG + Chr7:2871134-2871153 None:intergenic 35.0%
TCACGTCAGTTGAACTATAT+GGG - Chr7:2870172-2870191 MsG0780036116.01.T01:CDS 35.0%
TGCTACTAGATACATCTCTA+TGG + Chr7:2871850-2871869 None:intergenic 35.0%
TGGAATTCAAGTGGAGAAAA+AGG - Chr7:2871756-2871775 MsG0780036116.01.T01:CDS 35.0%
TGTAATTGCTAGAGATGTCT+AGG + Chr7:2870383-2870402 None:intergenic 35.0%
TTGAGATTTCCCAATGAAGA+AGG + Chr7:2870636-2870655 None:intergenic 35.0%
TTTAGATTTCCTAGGGAAGA+AGG + Chr7:2870780-2870799 None:intergenic 35.0%
TTTAGCAACCATAATTCAGG+AGG + Chr7:2870276-2870295 None:intergenic 35.0%
! ACCTGAAGACAATTTGGAAT+GGG + Chr7:2871191-2871210 None:intergenic 35.0%
! ACTTGACATAGTTTGAGACT+TGG + Chr7:2872313-2872332 None:intergenic 35.0%
! GAGAGATGACCAATTTCTTT+TGG + Chr7:2870204-2870223 None:intergenic 35.0%
! GATACATCTCTATGGACTAT+TGG + Chr7:2871842-2871861 None:intergenic 35.0%
!! AGCATATGGAAGTGTTTACA+AGG - Chr7:2871499-2871518 MsG0780036116.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTGTTTTAGATTTCCTAGGG+AGG + Chr7:2870496-2870515 None:intergenic 35.0%
AGGTCATATTCCTCTTGAGT+TGG - Chr7:2870551-2870570 MsG0780036116.01.T01:CDS 40.0%
AGGTGAGATACCTTCTTCAT+TGG - Chr7:2870623-2870642 MsG0780036116.01.T01:CDS 40.0%
AGTGATGACAATAAATCCCC+AGG + Chr7:2872274-2872293 None:intergenic 40.0%
ATTATATCTTGCAACGAGGC+TGG - Chr7:2870045-2870064 MsG0780036116.01.T01:CDS 40.0%
CAAGAGGAATGGAACCTATA+AGG + Chr7:2870692-2870711 None:intergenic 40.0%
CATGAGGAATGGAACCATTA+AGG + Chr7:2870836-2870855 None:intergenic 40.0%
CTCATCAAAAGATGGAACCT+CGG + Chr7:2871579-2871598 None:intergenic 40.0%
GAAGTTGTGACTTAGATCCA+TGG + Chr7:2871033-2871052 None:intergenic 40.0%
GGGACTATCCCAAAAGAAAT+TGG - Chr7:2870192-2870211 MsG0780036116.01.T01:CDS 40.0%
GGTCATATTCCTCTTGAGTT+GGG - Chr7:2870552-2870571 MsG0780036116.01.T01:CDS 40.0%
GGTGAGATACCTTCTTCATT+GGG - Chr7:2870624-2870643 MsG0780036116.01.T01:CDS 40.0%
GTGATGACAATAAATCCCCA+GGG + Chr7:2872273-2872292 None:intergenic 40.0%
GTGGCACTTGAAACTTTAGT+TGG - Chr7:2872241-2872260 MsG0780036116.01.T01:CDS 40.0%
GTTCAACTGACGTGATAACA+AGG + Chr7:2870167-2870186 None:intergenic 40.0%
TAAGCATGCAAATGCTACCA+CGG + Chr7:2872398-2872417 None:intergenic 40.0%
TACAAGGCACAATTACCAAG+TGG - Chr7:2871515-2871534 MsG0780036116.01.T01:CDS 40.0%
TAGAAGCTGTGGAATTCAAG+TGG - Chr7:2871747-2871766 MsG0780036116.01.T01:CDS 40.0%
TATTTGGAAGTGGAAGACGT+TGG + Chr7:2872342-2872361 None:intergenic 40.0%
TCCAATCGAACTATAGTTGC+TGG - Chr7:2871944-2871963 MsG0780036116.01.T01:CDS 40.0%
TCCAGCAACTATAGTTCGAT+TGG + Chr7:2871948-2871967 None:intergenic 40.0%
TCCCATTCCAAATTGTCTTC+AGG - Chr7:2871187-2871206 MsG0780036116.01.T01:CDS 40.0%
TGCAGAGCTTGCATATACAA+TGG - Chr7:2872180-2872199 MsG0780036116.01.T01:CDS 40.0%
TGTGACACACGTTTCATTGT+TGG + Chr7:2872442-2872461 None:intergenic 40.0%
TTCAAAAACCCCAACTCAAG+AGG + Chr7:2870420-2870439 None:intergenic 40.0%
TTCAAGAACACCAACTCATG+AGG + Chr7:2870852-2870871 None:intergenic 40.0%
TTTAGATTTCCTAGGGAGGA+AGG + Chr7:2870492-2870511 None:intergenic 40.0%
! GATTCTTCTGAGAAGTTGCA+TGG - Chr7:2871353-2871372 MsG0780036116.01.T01:CDS 40.0%
! GTATGATGATGTAGAAGCTG+TGG - Chr7:2871736-2871755 MsG0780036116.01.T01:CDS 40.0%
! GTCATATTCCTCTTGAGTTG+GGG - Chr7:2870553-2870572 MsG0780036116.01.T01:CDS 40.0%
!! AAGTTGATGAGATGTCACAG+TGG + Chr7:2869935-2869954 None:intergenic 40.0%
AAACCCCAACTCAAGAGGAA+TGG + Chr7:2870415-2870434 None:intergenic 45.0%
AGGTTCCATTCCTCTTGAGT+TGG - Chr7:2870407-2870426 MsG0780036116.01.T01:intron 45.0%
ATTGCTTAACTCTGAGTGGC+AGG - Chr7:2871874-2871893 MsG0780036116.01.T01:CDS 45.0%
CAGGCTAGTGTTTGTGACTT+TGG - Chr7:2871893-2871912 MsG0780036116.01.T01:CDS 45.0%
GAACACCAACTCATGAGGAA+TGG + Chr7:2870847-2870866 None:intergenic 45.0%
GGTTCCATTCCTCTTGAGTT+GGG - Chr7:2870408-2870427 MsG0780036116.01.T01:intron 45.0%
GGTTGTTGTGAGAGATGTCT+AGG + Chr7:2870815-2870834 None:intergenic 45.0%
GTCAGCTACCTCCTGAATTA+TGG - Chr7:2870265-2870284 MsG0780036116.01.T01:intron 45.0%
TGACATCATTCATGTTGCCG+TGG - Chr7:2872378-2872397 MsG0780036116.01.T01:CDS 45.0%
TGGTTCCATTCCTCATGAGT+TGG - Chr7:2870839-2870858 MsG0780036116.01.T01:CDS 45.0%
TTCATGAACCCCAACTCAAG+AGG + Chr7:2870708-2870727 None:intergenic 45.0%
TTCATTGTTGGTCGAGAACG+AGG + Chr7:2872430-2872449 None:intergenic 45.0%
! GTTCCATTCCTCTTGAGTTG+GGG - Chr7:2870409-2870428 MsG0780036116.01.T01:intron 45.0%
! TGCATTGGAACAGGAGCATA+TGG - Chr7:2871485-2871504 MsG0780036116.01.T01:CDS 45.0%
AAGGCAACAACCTTGCCACT+TGG + Chr7:2871533-2871552 None:intergenic 50.0%
GAACCCCAACTCAAGAGGAA+TGG + Chr7:2870559-2870578 None:intergenic 50.0%
GGCACAATTACCAAGTGGCA+AGG - Chr7:2871520-2871539 MsG0780036116.01.T01:CDS 50.0%
GGTGAGATACCTTCTTCCCT+AGG - Chr7:2870768-2870787 MsG0780036116.01.T01:CDS 50.0%
TTGAGGAACCCCAACTCAAG+AGG + Chr7:2870564-2870583 None:intergenic 50.0%
!! ACTTTAGTTGGAAGGCACCC+TGG - Chr7:2872253-2872272 MsG0780036116.01.T01:CDS 50.0%
!! CTTTAGTTGGAAGGCACCCT+GGG - Chr7:2872254-2872273 MsG0780036116.01.T01:CDS 50.0%
!! TTTAGTTGGAAGGCACCCTG+GGG - Chr7:2872255-2872274 MsG0780036116.01.T01:CDS 50.0%
ACTTCACGGCTATGAAGCCG+AGG - Chr7:2871559-2871578 MsG0780036116.01.T01:CDS 55.0%
GGTGAGATACCTTCCTCCCT+AGG - Chr7:2870480-2870499 MsG0780036116.01.T01:CDS 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 2869907 2872561 2869907 ID=MsG0780036116.01;Name=MsG0780036116.01
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Chr7 exon 2870479 2872561 2870479 ID=MsG0780036116.01.T01:exon:2508;Parent=MsG0780036116.01.T01
Chr7 exon 2869907 2870283 2869907 ID=MsG0780036116.01.T01:exon:2507;Parent=MsG0780036116.01.T01
Chr7 CDS 2870479 2872561 2870479 ID=MsG0780036116.01.T01:cds;Parent=MsG0780036116.01.T01
Chr7 CDS 2869907 2870283 2869907 ID=MsG0780036116.01.T01:cds;Parent=MsG0780036116.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780036116.01.T01

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Protein sequence

>MsG0780036116.01.T01

MIVGTQCAATVTSHQLQMEANAIIKSGWWNTSDPLFNISDRCNWYDIISCNEAGSIKAIKIDSWGSQLATLNLSTFNLSTFNNLESLVITSVELYGTIPKEIGHLSKLTYLDLSYNFLEGQLPPELWLLKNLTFLHLSNNRFKGEIPSLLENLKQLVDLDISSNYIQGSIPLELGFLKNLTFLDLSYNILKGEIPSSLGNLKQLEKLNISNNDIEGHIPLELGFLKNLTFLYLSNNRFKGEIPSSLGNLKQLQELDISHNDLIGSIPLELGFMKNLTSLNLSNNRFKGEIPSSLGNLKQLEDLDISHNNLNGSIPHELVFLKNITTLDLSHNRLNGNLPIFLTNLTQLEYLDISYNLLIGTLPSNLFPFTNYLTSMDLSHNFISGEIPSYIGYIEKLNLSNNNLTGTIPQSLCNVYYVDISYNCLEGPIPNCLQVYTWSIENYDVCSYKKNNKLKLIVVIVILILIILVIVFLLLICLKRHHDSSEKLHGNSTKTKNGDMFCIWNYDGKIAYDDIIKATEDFDMRYCIGTGAYGSVYKAQLPSGKVVALKKLHGYEAEVPSFDESFRNEVRILSEIKHRHIVKLYGFCLHKRIMFLIYQYMEKGSLFSVLYDDVEAVEFKWRKRVNTVKGIAFALSYLHHDCTAPIVHRDVSSSNILLNSEWQASVCDFGTARLLQYDSSNRTIVAGTIGYIAPELAYTMAVNEKCDVYSFGVVALETLVGRHPGDLLSSLQSTSIPSLKLCQVLDQRLPLPNNYIVIRDIIHVAVVAFACLNDNPRSRPTMKRVSQSFVTELTPLSISLSEISVQQLMSEELKALFYI*