AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780036516.01

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
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ATTCCACAGTATGTTCTTGT+TGG 0.400555 7:-9171056 MsG0780036516.01.T01:CDS
CTCTGTTGTATTCACACAAA+TGG 0.403468 7:-9171387 MsG0780036516.01.T01:CDS
GTTCTGTGCTCGGTGGTACA+AGG 0.406351 7:-9170766 MsG0780036516.01.T01:CDS
AGGCGATGCAATGAACAATA+AGG 0.411494 7:-9171345 MsG0780036516.01.T01:CDS
GGTATGTGGACGTTGGGTTT+CGG 0.415369 7:-9171957 MsG0780036516.01.T01:CDS
ATGGGAGTTGGCCTAGTTAT+CGG 0.422212 7:-9171176 MsG0780036516.01.T01:CDS
AACACGGACATGGTTGCTGC+TGG 0.422911 7:+9171305 None:intergenic
TCGTCAAGTTCTTGTTCCCT+TGG 0.427315 7:-9171246 MsG0780036516.01.T01:CDS
TGTTCATTACCGCAACCTAA+TGG 0.427677 7:+9172227 None:intergenic
ATAATAGTGCACAGCCAAAC+TGG 0.430741 7:+9171413 None:intergenic
TCAGCTGCTTCAATCTTGTC+AGG 0.436426 7:+9173064 None:intergenic
TGTATGGCTTCAATTTCTCT+TGG 0.439597 7:-9170945 MsG0780036516.01.T01:CDS
AAATTAAAATAGGTGATAGA+AGG 0.440132 7:-9172914 MsG0780036516.01.T01:intron
TCGTCGCTGCCGCTAGGAAG+TGG 0.444967 7:-9171824 MsG0780036516.01.T01:CDS
CGAAGTTGGTTCGTTGCAAA+CGG 0.447191 7:+9172202 None:intergenic
CAAAGAATGCCAGTGTTGCT+AGG 0.448186 7:+9172713 None:intergenic
TAAAGTTGGTCCTCCTTGGC+AGG 0.448949 7:+9171792 None:intergenic
TACCGAATAACTTGAATGTT+GGG 0.450616 7:-9170851 MsG0780036516.01.T01:CDS
TGCAACGAACCAACTTCGTT+GGG 0.450911 7:-9172197 MsG0780036516.01.T01:CDS
CTGGTGCAACGGAGTTTGTA+AGG 0.457926 7:-9171133 MsG0780036516.01.T01:CDS
TTGCAACGAACCAACTTCGT+TGG 0.459621 7:-9172198 MsG0780036516.01.T01:CDS
GAACCAACTTCGTTGGGAAC+AGG 0.460262 7:-9172191 MsG0780036516.01.T01:CDS
ACACTGGCATTCTTTGGAGT+TGG 0.461540 7:-9172706 MsG0780036516.01.T01:CDS
GCCTTGATTTCATTCTTAGC+AGG 0.466900 7:-9171909 MsG0780036516.01.T01:CDS
ATCATGTTAAAGTGGCAATT+GGG 0.474184 7:-9172889 MsG0780036516.01.T01:CDS
GATTCCGGTATGTGGACGTT+GGG 0.474446 7:-9171963 MsG0780036516.01.T01:CDS
AAAATTAAGTGGTAATCCTA+AGG 0.475355 7:-9171219 MsG0780036516.01.T01:CDS
CTCGTAAAGTTGGTCCTCCT+TGG 0.477703 7:+9171788 None:intergenic
ATAATAAACCAAAATGGTGT+TGG 0.477746 7:+9171989 None:intergenic
GATAAGCGAACTTCAAAGAA+TGG 0.480783 7:-9171195 MsG0780036516.01.T01:CDS
TCGAAGATATCGTTATGTTA+AGG 0.483894 7:-9171883 MsG0780036516.01.T01:CDS
TGTAGTGTCCTTGTATGTAC+TGG 0.486453 7:-9171275 MsG0780036516.01.T01:CDS
TCCTGCTAAGAATGAAATCA+AGG 0.489901 7:+9171908 None:intergenic
AACAATGTCAGCAAGTGGAC+TGG 0.495272 7:-9172625 MsG0780036516.01.T01:CDS
GGTCAGTTGGAATTCTTCAA+TGG 0.498058 7:-9171008 MsG0780036516.01.T01:CDS
ACCTGAATTACTCTTATGAC+AGG 0.498448 7:+9171849 None:intergenic
TCGTCTACGTGTTCTGTGCT+CGG 0.499189 7:-9170776 MsG0780036516.01.T01:CDS
TATATATTGACAAATAGAAT+AGG 0.502301 7:+9172168 None:intergenic
GGCCGTCAACCTCGTAAAGT+TGG 0.503324 7:+9171778 None:intergenic
AAGTTATTCGGTATCCATCC+CGG 0.505472 7:+9170861 None:intergenic
ATTATGAAGATTCCGGTATG+TGG 0.513063 7:-9171971 MsG0780036516.01.T01:CDS
CCCTTGGCCGGAAAATTAAG+TGG 0.513372 7:-9171230 MsG0780036516.01.T01:CDS
TTGATCAAACCATTAGGTTG+CGG 0.514440 7:-9172236 MsG0780036516.01.T01:CDS
ACATGTTATGCCGGGAGAGA+AGG 0.515883 7:-9171105 MsG0780036516.01.T01:CDS
AGAAGGAAATCATGTTAAAG+TGG 0.525334 7:-9172897 MsG0780036516.01.T01:CDS
TGTTGAGAATGATACCAGTT+TGG 0.526462 7:-9171427 MsG0780036516.01.T01:CDS
ATACCGAATAACTTGAATGT+TGG 0.527198 7:-9170852 MsG0780036516.01.T01:CDS
TTCTGTGCTCGGTGGTACAA+GGG 0.528036 7:-9170765 MsG0780036516.01.T01:CDS
ATCAAATTGATCAGCTCCAA+AGG 0.528289 7:+9172103 None:intergenic
GAAACCCAACGTCCACATAC+CGG 0.528818 7:+9171959 None:intergenic
TGAATGTTGGGCACATGGAT+TGG 0.529142 7:-9170839 MsG0780036516.01.T01:CDS
TAACTTGAATGTTGGGCACA+TGG 0.530856 7:-9170844 MsG0780036516.01.T01:CDS
GTGGCAATTGGGAAGAGTAA+AGG 0.531735 7:-9172878 MsG0780036516.01.T01:CDS
TATCGTTATGTTAAGGCGTG+TGG 0.532404 7:-9171876 MsG0780036516.01.T01:CDS
CTTTCTGCTTCCTTTGATGG+CGG 0.532701 7:+9171749 None:intergenic
TTGGGAAGAGTAAAGGAGGA+TGG 0.532777 7:-9172871 MsG0780036516.01.T01:CDS
AAGGGCGTCAATAACTTTGA+AGG 0.533090 7:-9170747 MsG0780036516.01.T01:CDS
AGGCCTGTTCCCAACGAAGT+TGG 0.534570 7:+9172188 None:intergenic
AAGGCTAAAACATGTTATGC+CGG 0.535790 7:-9171114 MsG0780036516.01.T01:CDS
CAACATGGACATTGAAGGAC+GGG 0.537006 7:-9171511 MsG0780036516.01.T01:CDS
TCGCAAACATTCCGATAACT+AGG 0.538544 7:+9171165 None:intergenic
AAAGAATGCCAGTGTTGCTA+GGG 0.541114 7:+9172714 None:intergenic
TTCCTTAGTGATTCTTATTG+GGG 0.541192 7:-9172571 MsG0780036516.01.T01:CDS
ATGGTTGCATTTGGATATGG+AGG 0.541387 7:-9172146 MsG0780036516.01.T01:CDS
TTACAGTACAAAGCCGCCAT+TGG 0.542281 7:+9171474 None:intergenic
AGGTCTTCGTCGCTGCCGCT+AGG 0.543408 7:-9171830 MsG0780036516.01.T01:CDS
AAATTAAGTGGTAATCCTAA+GGG 0.543683 7:-9171218 MsG0780036516.01.T01:CDS
GGCCATGAATCCGCCATCAA+AGG 0.545291 7:-9171759 MsG0780036516.01.T01:CDS
TTCCCCAATAAGAATCACTA+AGG 0.545318 7:+9172569 None:intergenic
TAATCAAGCCCTAGCAACAC+TGG 0.546374 7:-9172722 MsG0780036516.01.T01:CDS
GACCAACTTTACGAGGTTGA+CGG 0.548138 7:-9171780 MsG0780036516.01.T01:CDS
GGCAGCAACATGGACATTGA+AGG 0.550291 7:-9171516 MsG0780036516.01.T01:CDS
ATCAGCTCCAAAGGTTGCTA+AGG 0.551652 7:+9172112 None:intergenic
ATGTTTGCGATGGTTGCAGC+TGG 0.554672 7:-9171152 MsG0780036516.01.T01:CDS
AGAGAACTAGCCTTCTCTCC+CGG 0.556637 7:+9171095 None:intergenic
AGGCTAAAACATGTTATGCC+GGG 0.557548 7:-9171113 MsG0780036516.01.T01:CDS
ATAAGCGAACTTCAAAGAAT+GGG 0.559609 7:-9171194 MsG0780036516.01.T01:CDS
AACATATGTACCTTATATCG+TGG 0.561166 7:+9171715 None:intergenic
GCTGACATTGTTAGCAGCCT+CGG 0.566694 7:+9172636 None:intergenic
ATCGTTATGTTAAGGCGTGT+GGG 0.575039 7:-9171875 MsG0780036516.01.T01:CDS
TGAAGGACGGGAATGAATCT+GGG 0.576248 7:-9171499 MsG0780036516.01.T01:CDS
TTTGAAGGTAGTGTGAATCT+CGG 0.576329 7:-9170732 MsG0780036516.01.T01:CDS
GCAATTGGGAAGAGTAAAGG+AGG 0.579422 7:-9172875 MsG0780036516.01.T01:CDS
CACAGAACACGTAGACGACA+AGG 0.586767 7:+9170781 None:intergenic
GCTCCAAAGGTTGCTAAGGT+AGG 0.588042 7:+9172116 None:intergenic
GTCAGGATTGACAGTGTAGG+AGG 0.589139 7:+9173081 None:intergenic
AAAACTGCATACATCTTGCT+AGG 0.589781 7:-9172848 MsG0780036516.01.T01:intron
ACACGGACATGGTTGCTGCT+GGG 0.592604 7:+9171306 None:intergenic
TGGTTGCATTTGGATATGGA+GGG 0.593151 7:-9172145 MsG0780036516.01.T01:CDS
GGAATGAATCTGGGAACCAA+TGG 0.595523 7:-9171490 MsG0780036516.01.T01:CDS
ACTGCTAAAGGCGAAGAACC+GGG 0.601970 7:-9170879 MsG0780036516.01.T01:CDS
GTGATGACAGTCACTGCTAA+AGG 0.603223 7:-9170891 MsG0780036516.01.T01:CDS
GAACTTCAAAGAATGGGAGT+TGG 0.604352 7:-9171188 MsG0780036516.01.T01:CDS
TGTATGCAGATGTCACCAGC+AGG 0.605250 7:-9173112 MsG0780036516.01.T01:CDS
AGATTCCGGTATGTGGACGT+TGG 0.605482 7:-9171964 MsG0780036516.01.T01:CDS
GATGCAATGAACAATAAGGC+AGG 0.605589 7:-9171341 MsG0780036516.01.T01:CDS
GATAAAGTCCAGTACATACA+AGG 0.608027 7:+9171267 None:intergenic
TTGTACTGTAACTCAAGTTG+AGG 0.608294 7:-9171462 MsG0780036516.01.T01:CDS
GAGCACTTAGCGCTGCGAGG+AGG 0.608956 7:+9170808 None:intergenic
CTGCTAACAATGTCAGCAAG+TGG 0.612210 7:-9172630 MsG0780036516.01.T01:CDS
CAAGGAGGACCAACTTTACG+AGG 0.615767 7:-9171787 MsG0780036516.01.T01:CDS
TTCAATGGTCAAGCTCCCGA+TGG 0.619234 7:-9170993 MsG0780036516.01.T01:CDS
GTGGAATGTTGAACCTGCCA+AGG 0.619345 7:-9171805 MsG0780036516.01.T01:CDS
ATGAATCTGGGAACCAATGG+CGG 0.620228 7:-9171487 MsG0780036516.01.T01:CDS
ACATATATCAAACACGGACA+TGG 0.623018 7:+9171295 None:intergenic
TAGGAGGCGACAGATCCTGC+TGG 0.623105 7:+9173097 None:intergenic
AGTTATCGGAATGTTTGCGA+TGG 0.624323 7:-9171162 MsG0780036516.01.T01:CDS
CTAAAGGCGAAGAACCGGGA+TGG 0.629833 7:-9170875 MsG0780036516.01.T01:CDS
TGACAAGATTGAAGCAGCTG+AGG 0.632286 7:-9173062 MsG0780036516.01.T01:intron
CTTGTCAGGATTGACAGTGT+AGG 0.634509 7:+9173078 None:intergenic
ACATATGTACCTTATATCGT+GGG 0.636035 7:+9171716 None:intergenic
TCATGGACAAGGCAGCAACA+TGG 0.642174 7:-9171526 MsG0780036516.01.T01:CDS
GATGGTTGCAGCTGGTGCAA+CGG 0.642766 7:-9171144 MsG0780036516.01.T01:CDS
GCAACATGGACATTGAAGGA+CGG 0.645659 7:-9171512 MsG0780036516.01.T01:CDS
GTTGAGCAGATTCATGGACA+AGG 0.649007 7:-9171537 MsG0780036516.01.T01:intron
AATCAAGGCTATAATAGCAG+AGG 0.651729 7:+9171923 None:intergenic
AATTAAGTGGTAATCCTAAG+GGG 0.654690 7:-9171217 MsG0780036516.01.T01:CDS
GAATGTTGAACCTGCCAAGG+AGG 0.661909 7:-9171802 MsG0780036516.01.T01:CDS
TAAGAGCACTTAGCGCTGCG+AGG 0.667558 7:+9170805 None:intergenic
AAACTATGTTAGCAGCATGA+TGG 0.672075 7:-9170922 MsG0780036516.01.T01:CDS
TCTACGTGTTCTGTGCTCGG+TGG 0.678153 7:-9170773 MsG0780036516.01.T01:CDS
TGTGAATCTCGGAAGCCAAG+AGG 0.678778 7:-9170721 MsG0780036516.01.T01:CDS
TTCAACATTCCACTTCCTAG+CGG 0.680521 7:+9171815 None:intergenic
CCTCGGCACTGTCTTGACGA+AGG 0.687136 7:+9172653 None:intergenic
GCACCAACAAGAACATACTG+TGG 0.687478 7:+9171053 None:intergenic
GACACTACATATATCAAACA+CGG 0.688984 7:+9171289 None:intergenic
CCTTCGTCAAGACAGTGCCG+AGG 0.707927 7:-9172653 MsG0780036516.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATAAAAAAATAAATTAAAAT+AGG - Chr7:9170880-9170899 MsG0780036516.01.T01:CDS 0.0%
!! ATTCTATTTGTCAATATATA+TGG - Chr7:9171639-9171658 MsG0780036516.01.T01:intron 15.0%
!! TATATATTGACAAATAGAAT+AGG + Chr7:9171639-9171658 None:intergenic 15.0%
!! AAATTAAAATAGGTGATAGA+AGG - Chr7:9170890-9170909 MsG0780036516.01.T01:CDS 20.0%
!! ATCTTCATAATAAACCAAAA+TGG + Chr7:9171824-9171843 None:intergenic 20.0%
!! ATTGATCATGAATGAATAAA+TGG - Chr7:9171478-9171497 MsG0780036516.01.T01:CDS 20.0%
!! GAATCAAACAATTAATGATT+AGG + Chr7:9170990-9171009 None:intergenic 20.0%
!! TCATTATCATCATTTATACA+TGG - Chr7:9171011-9171030 MsG0780036516.01.T01:CDS 20.0%
!! TTAATTGTTCAACAACTATA+AGG + Chr7:9171451-9171470 None:intergenic 20.0%
!! TTGTAATTAAATGAACTAAG+TGG - Chr7:9171037-9171056 MsG0780036516.01.T01:CDS 20.0%
!!! GAGTTTAAAACTTATATCTT+GGG + Chr7:9172220-9172239 None:intergenic 20.0%
!!! TGAGTTTAAAACTTATATCT+TGG + Chr7:9172221-9172240 None:intergenic 20.0%
! AAAATTAAGTGGTAATCCTA+AGG - Chr7:9172585-9172604 MsG0780036516.01.T01:CDS 25.0%
! AAATTAAGTGGTAATCCTAA+GGG - Chr7:9172586-9172605 MsG0780036516.01.T01:CDS 25.0%
! ATAATAAACCAAAATGGTGT+TGG + Chr7:9171818-9171837 None:intergenic 25.0%
! ATTCCTTAGTGATTCTTATT+GGG - Chr7:9171232-9171251 MsG0780036516.01.T01:CDS 25.0%
! CAACTCAACATAGATATAAA+AGG + Chr7:9172251-9172270 None:intergenic 25.0%
! GTTAGTTAGTTAGTTATTCT+TGG - Chr7:9170764-9170783 MsG0780036516.01.T01:CDS 25.0%
! TCAATATATATGGTTGCATT+TGG - Chr7:9171649-9171668 MsG0780036516.01.T01:intron 25.0%
! TTGGTTTATTATGAAGATTC+CGG - Chr7:9171826-9171845 MsG0780036516.01.T01:CDS 25.0%
!! ATGTTTGGTGATATAATGTT+TGG - Chr7:9170853-9170872 MsG0780036516.01.T01:CDS 25.0%
!!! GTTTACATTTTTTCACTCTT+GGG - Chr7:9171206-9171225 MsG0780036516.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGTTTACATTTTTTCACTCT+TGG - Chr7:9171205-9171224 MsG0780036516.01.T01:CDS 25.0%
AACATATGTACCTTATATCG+TGG + Chr7:9172092-9172111 None:intergenic 30.0%
AATCATGTTAAAGTGGCAAT+TGG - Chr7:9170914-9170933 MsG0780036516.01.T01:CDS 30.0%
AATTAAGTGGTAATCCTAAG+GGG - Chr7:9172587-9172606 MsG0780036516.01.T01:CDS 30.0%
ACATATGTACCTTATATCGT+GGG + Chr7:9172091-9172110 None:intergenic 30.0%
AGAAGGAAATCATGTTAAAG+TGG - Chr7:9170907-9170926 MsG0780036516.01.T01:CDS 30.0%
ATAAGCGAACTTCAAAGAAT+GGG - Chr7:9172610-9172629 MsG0780036516.01.T01:CDS 30.0%
ATACCGAATAACTTGAATGT+TGG - Chr7:9172952-9172971 MsG0780036516.01.T01:intron 30.0%
ATATATGCATTCATTGATGC+AGG - Chr7:9171510-9171529 MsG0780036516.01.T01:CDS 30.0%
ATCATGTTAAAGTGGCAATT+GGG - Chr7:9170915-9170934 MsG0780036516.01.T01:CDS 30.0%
CATTCCTTAGTGATTCTTAT+TGG - Chr7:9171231-9171250 MsG0780036516.01.T01:CDS 30.0%
CTGTTATTGATCAAACCATT+AGG - Chr7:9171562-9171581 MsG0780036516.01.T01:intron 30.0%
GACACTACATATATCAAACA+CGG + Chr7:9172518-9172537 None:intergenic 30.0%
TACCGAATAACTTGAATGTT+GGG - Chr7:9172953-9172972 MsG0780036516.01.T01:intron 30.0%
TATATGCATTCATTGATGCA+GGG - Chr7:9171511-9171530 MsG0780036516.01.T01:CDS 30.0%
TATATGGTTGCATTTGGATA+TGG - Chr7:9171655-9171674 MsG0780036516.01.T01:intron 30.0%
TATCATTCTCAACACACATT+TGG + Chr7:9172371-9172390 None:intergenic 30.0%
TCGAAGATATCGTTATGTTA+AGG - Chr7:9171921-9171940 MsG0780036516.01.T01:CDS 30.0%
TTCCTTAGTGATTCTTATTG+GGG - Chr7:9171233-9171252 MsG0780036516.01.T01:CDS 30.0%
! AGGATTACCACTTAATTTTC+CGG + Chr7:9172584-9172603 None:intergenic 30.0%
! TCAGAAGTTTTTGTGTATGT+GGG - Chr7:9172775-9172794 MsG0780036516.01.T01:intron 30.0%
! TTCAGAAGTTTTTGTGTATG+TGG - Chr7:9172774-9172793 MsG0780036516.01.T01:intron 30.0%
! TTTTACTTTGCACTCAATGT+TGG - Chr7:9171781-9171800 MsG0780036516.01.T01:CDS 30.0%
AAAACTGCATACATCTTGCT+AGG - Chr7:9170956-9170975 MsG0780036516.01.T01:CDS 35.0%
AAACTATGTTAGCAGCATGA+TGG - Chr7:9172882-9172901 MsG0780036516.01.T01:CDS 35.0%
AAGGCTAAAACATGTTATGC+CGG - Chr7:9172690-9172709 MsG0780036516.01.T01:CDS 35.0%
AATCAAGGCTATAATAGCAG+AGG + Chr7:9171884-9171903 None:intergenic 35.0%
AATCTTTCTGCTTCCTTTGA+TGG + Chr7:9172061-9172080 None:intergenic 35.0%
ACATATATCAAACACGGACA+TGG + Chr7:9172512-9172531 None:intergenic 35.0%
ACCTGAATTACTCTTATGAC+AGG + Chr7:9171958-9171977 None:intergenic 35.0%
ATCAAATTGATCAGCTCCAA+AGG + Chr7:9171704-9171723 None:intergenic 35.0%
ATTATGAAGATTCCGGTATG+TGG - Chr7:9171833-9171852 MsG0780036516.01.T01:CDS 35.0%
ATTCATTGATGCAGGGTTTA+GGG - Chr7:9171518-9171537 MsG0780036516.01.T01:CDS 35.0%
ATTCCACAGTATGTTCTTGT+TGG - Chr7:9172748-9172767 MsG0780036516.01.T01:intron 35.0%
CTCTGTTGTATTCACACAAA+TGG - Chr7:9172417-9172436 MsG0780036516.01.T01:intron 35.0%
GATAAAGTCCAGTACATACA+AGG + Chr7:9172540-9172559 None:intergenic 35.0%
GATAAGCGAACTTCAAAGAA+TGG - Chr7:9172609-9172628 MsG0780036516.01.T01:CDS 35.0%
TAATTGACGAATCCTTCACT+TGG + Chr7:9170819-9170838 None:intergenic 35.0%
TCCTGCTAAGAATGAAATCA+AGG + Chr7:9171899-9171918 None:intergenic 35.0%
TCCTGTCATAAGAGTAATTC+AGG - Chr7:9171954-9171973 MsG0780036516.01.T01:CDS 35.0%
TGTATGGCTTCAATTTCTCT+TGG - Chr7:9172859-9172878 MsG0780036516.01.T01:CDS 35.0%
TGTTGAGAATGATACCAGTT+TGG - Chr7:9172377-9172396 MsG0780036516.01.T01:intron 35.0%
TTCCCCAATAAGAATCACTA+AGG + Chr7:9171238-9171257 None:intergenic 35.0%
TTTGAAGGTAGTGTGAATCT+CGG - Chr7:9173072-9173091 MsG0780036516.01.T01:CDS 35.0%
! ACTCTTTTCCAACACCATTT+TGG - Chr7:9171807-9171826 MsG0780036516.01.T01:CDS 35.0%
! CTTTGGAAGTTCACTTTGTA+TGG - Chr7:9172843-9172862 MsG0780036516.01.T01:intron 35.0%
! TCCAAAGCTTTTTATGCCAT+CGG + Chr7:9172830-9172849 None:intergenic 35.0%
! TGCCCAACATTCAAGTTATT+CGG + Chr7:9172958-9172977 None:intergenic 35.0%
! TTGATCAAACCATTAGGTTG+CGG - Chr7:9171568-9171587 MsG0780036516.01.T01:intron 35.0%
! TTGTACTGTAACTCAAGTTG+AGG - Chr7:9172342-9172361 MsG0780036516.01.T01:intron 35.0%
AAGTTATTCGGTATCCATCC+CGG + Chr7:9172946-9172965 None:intergenic 40.0%
AGGCGATGCAATGAACAATA+AGG - Chr7:9172459-9172478 MsG0780036516.01.T01:intron 40.0%
AGGCTAAAACATGTTATGCC+GGG - Chr7:9172691-9172710 MsG0780036516.01.T01:CDS 40.0%
AGTTATCGGAATGTTTGCGA+TGG - Chr7:9172642-9172661 MsG0780036516.01.T01:CDS 40.0%
ATAATAGTGCACAGCCAAAC+TGG + Chr7:9172394-9172413 None:intergenic 40.0%
ATCGTTATGTTAAGGCGTGT+GGG - Chr7:9171929-9171948 MsG0780036516.01.T01:CDS 40.0%
ATGGTTGCATTTGGATATGG+AGG - Chr7:9171658-9171677 MsG0780036516.01.T01:intron 40.0%
CATTCATTGATGCAGGGTTT+AGG - Chr7:9171517-9171536 MsG0780036516.01.T01:CDS 40.0%
CTTTCAGCTCTTCTTTGTTC+TGG - Chr7:9171277-9171296 MsG0780036516.01.T01:CDS 40.0%
GAACTTCAAAGAATGGGAGT+TGG - Chr7:9172616-9172635 MsG0780036516.01.T01:CDS 40.0%
GATGCAATGAACAATAAGGC+AGG - Chr7:9172463-9172482 MsG0780036516.01.T01:intron 40.0%
GCCTTGATTTCATTCTTAGC+AGG - Chr7:9171895-9171914 MsG0780036516.01.T01:CDS 40.0%
GGTCAGTTGGAATTCTTCAA+TGG - Chr7:9172796-9172815 MsG0780036516.01.T01:intron 40.0%
TAACTTGAATGTTGGGCACA+TGG - Chr7:9172960-9172979 MsG0780036516.01.T01:intron 40.0%
TATCGTTATGTTAAGGCGTG+TGG - Chr7:9171928-9171947 MsG0780036516.01.T01:CDS 40.0%
TCGCAAACATTCCGATAACT+AGG + Chr7:9172642-9172661 None:intergenic 40.0%
TGGTTGCATTTGGATATGGA+GGG - Chr7:9171659-9171678 MsG0780036516.01.T01:intron 40.0%
TGTAGTGTCCTTGTATGTAC+TGG - Chr7:9172529-9172548 MsG0780036516.01.T01:CDS 40.0%
TGTTCATTACCGCAACCTAA+TGG + Chr7:9171580-9171599 None:intergenic 40.0%
TTCAACATTCCACTTCCTAG+CGG + Chr7:9171992-9172011 None:intergenic 40.0%
! AAAGAATGCCAGTGTTGCTA+GGG + Chr7:9171093-9171112 None:intergenic 40.0%
! CCAAAGCTTTTTATGCCATC+GGG + Chr7:9172829-9172848 None:intergenic 40.0%
! GCTTCTCTTTTTGTCGAACA+AGG - Chr7:9172439-9172458 MsG0780036516.01.T01:intron 40.0%
! GGCTTTTGTCTTTGACATCA+TGG - Chr7:9171539-9171558 MsG0780036516.01.T01:intron 40.0%
! TCCTTCACTTGGTTCGAAAA+TGG + Chr7:9170808-9170827 None:intergenic 40.0%
! TTTTGTGTATGTGGGTCAGT+TGG - Chr7:9172783-9172802 MsG0780036516.01.T01:intron 40.0%
!! AAGGGCGTCAATAACTTTGA+AGG - Chr7:9173057-9173076 MsG0780036516.01.T01:intron 40.0%
!! TGTTGAGTTGAGCAGATTCA+TGG - Chr7:9172261-9172280 MsG0780036516.01.T01:CDS 40.0%
AACAATGTCAGCAAGTGGAC+TGG - Chr7:9171179-9171198 MsG0780036516.01.T01:CDS 45.0%
ATCAGCTCCAAAGGTTGCTA+AGG + Chr7:9171695-9171714 None:intergenic 45.0%
ATGAATCTGGGAACCAATGG+CGG - Chr7:9172317-9172336 MsG0780036516.01.T01:intron 45.0%
CAACATGGACATTGAAGGAC+GGG - Chr7:9172293-9172312 MsG0780036516.01.T01:intron 45.0%
CAACCTACCTTAGCAACCTT+TGG - Chr7:9171685-9171704 MsG0780036516.01.T01:intron 45.0%
CCCGATGGCATAAAAAGCTT+TGG - Chr7:9172826-9172845 MsG0780036516.01.T01:intron 45.0%
CTAGCAACACTGGCATTCTT+TGG - Chr7:9171092-9171111 MsG0780036516.01.T01:CDS 45.0%
CTGCTAACAATGTCAGCAAG+TGG - Chr7:9171174-9171193 MsG0780036516.01.T01:CDS 45.0%
CTTGACGAAGGACTCTTGTT+AGG + Chr7:9171142-9171161 None:intergenic 45.0%
CTTGTCAGGATTGACAGTGT+AGG + Chr7:9170729-9170748 None:intergenic 45.0%
CTTTCTGCTTCCTTTGATGG+CGG + Chr7:9172058-9172077 None:intergenic 45.0%
GACCAACTTTACGAGGTTGA+CGG - Chr7:9172024-9172043 MsG0780036516.01.T01:CDS 45.0%
GCAACATGGACATTGAAGGA+CGG - Chr7:9172292-9172311 MsG0780036516.01.T01:intron 45.0%
GCAATTGGGAAGAGTAAAGG+AGG - Chr7:9170929-9170948 MsG0780036516.01.T01:CDS 45.0%
GCACCAACAAGAACATACTG+TGG + Chr7:9172754-9172773 None:intergenic 45.0%
GGAATGAATCTGGGAACCAA+TGG - Chr7:9172314-9172333 MsG0780036516.01.T01:intron 45.0%
GTGATGACAGTCACTGCTAA+AGG - Chr7:9172913-9172932 MsG0780036516.01.T01:intron 45.0%
GTGGCAATTGGGAAGAGTAA+AGG - Chr7:9170926-9170945 MsG0780036516.01.T01:CDS 45.0%
GTTGAGCAGATTCATGGACA+AGG - Chr7:9172267-9172286 MsG0780036516.01.T01:CDS 45.0%
TAATCAAGCCCTAGCAACAC+TGG - Chr7:9171082-9171101 MsG0780036516.01.T01:CDS 45.0%
TCAGCTGCTTCAATCTTGTC+AGG + Chr7:9170743-9170762 None:intergenic 45.0%
TCGTCAAGTTCTTGTTCCCT+TGG - Chr7:9172558-9172577 MsG0780036516.01.T01:CDS 45.0%
TGAAGGACGGGAATGAATCT+GGG - Chr7:9172305-9172324 MsG0780036516.01.T01:intron 45.0%
TGAAGTTCGCTTATCCCCTT+AGG + Chr7:9172604-9172623 None:intergenic 45.0%
TGAATGTTGGGCACATGGAT+TGG - Chr7:9172965-9172984 MsG0780036516.01.T01:intron 45.0%
TGACAAGATTGAAGCAGCTG+AGG - Chr7:9170742-9170761 MsG0780036516.01.T01:CDS 45.0%
TGCAACGAACCAACTTCGTT+GGG - Chr7:9171607-9171626 MsG0780036516.01.T01:intron 45.0%
TTACAGTACAAAGCCGCCAT+TGG + Chr7:9172333-9172352 None:intergenic 45.0%
TTCTGCACTCCCACGATATA+AGG - Chr7:9172079-9172098 MsG0780036516.01.T01:CDS 45.0%
TTGAAGGACGGGAATGAATC+TGG - Chr7:9172304-9172323 MsG0780036516.01.T01:intron 45.0%
TTGCAACGAACCAACTTCGT+TGG - Chr7:9171606-9171625 MsG0780036516.01.T01:intron 45.0%
TTGGGAAGAGTAAAGGAGGA+TGG - Chr7:9170933-9170952 MsG0780036516.01.T01:CDS 45.0%
! ACCACTTAATTTTCCGGCCA+AGG + Chr7:9172578-9172597 None:intergenic 45.0%
! ATGGGAGTTGGCCTAGTTAT+CGG - Chr7:9172628-9172647 MsG0780036516.01.T01:CDS 45.0%
! CAAAGAATGCCAGTGTTGCT+AGG + Chr7:9171094-9171113 None:intergenic 45.0%
! CCACTTAATTTTCCGGCCAA+GGG + Chr7:9172577-9172596 None:intergenic 45.0%
!! ACACTGGCATTCTTTGGAGT+TGG - Chr7:9171098-9171117 MsG0780036516.01.T01:CDS 45.0%
!! CGAAGTTGGTTCGTTGCAAA+CGG + Chr7:9171605-9171624 None:intergenic 45.0%
!! CTTTGGAGTTGGAGTGAACT+TGG - Chr7:9171109-9171128 MsG0780036516.01.T01:CDS 45.0%
!! GCCATTTTCGAACCAAGTGA+AGG - Chr7:9170804-9170823 MsG0780036516.01.T01:CDS 45.0%
!! TTCCTTTGATGGCGGATTCA+TGG + Chr7:9172050-9172069 None:intergenic 45.0%
!! ATATATTAATAATATATGTT+TGG - Chr7:9170838-9170857 MsG0780036516.01.T01:CDS 5.0%
ACATGTTATGCCGGGAGAGA+AGG - Chr7:9172699-9172718 MsG0780036516.01.T01:CDS 50.0%
ACTGCTAAAGGCGAAGAACC+GGG - Chr7:9172925-9172944 MsG0780036516.01.T01:intron 50.0%
AGATTCCGGTATGTGGACGT+TGG - Chr7:9171840-9171859 MsG0780036516.01.T01:CDS 50.0%
ATGTTTGCGATGGTTGCAGC+TGG - Chr7:9172652-9172671 MsG0780036516.01.T01:CDS 50.0%
CAAGGAGGACCAACTTTACG+AGG - Chr7:9172017-9172036 MsG0780036516.01.T01:CDS 50.0%
CAAGTTCTTGTTCCCTTGGC+CGG - Chr7:9172562-9172581 MsG0780036516.01.T01:CDS 50.0%
CAATCGCTTCATCGTCCTCT+TGG + Chr7:9173101-9173120 None:intergenic 50.0%
CACAGAACACGTAGACGACA+AGG + Chr7:9173026-9173045 None:intergenic 50.0%
CACTGCTAAAGGCGAAGAAC+CGG - Chr7:9172924-9172943 MsG0780036516.01.T01:intron 50.0%
CCCTTGGCCGGAAAATTAAG+TGG - Chr7:9172574-9172593 MsG0780036516.01.T01:CDS 50.0%
CTGGTGCAACGGAGTTTGTA+AGG - Chr7:9172671-9172690 MsG0780036516.01.T01:CDS 50.0%
GAAACCCAACGTCCACATAC+CGG + Chr7:9171848-9171867 None:intergenic 50.0%
GAACCAACTTCGTTGGGAAC+AGG - Chr7:9171613-9171632 MsG0780036516.01.T01:intron 50.0%
GAATGTTGAACCTGCCAAGG+AGG - Chr7:9172002-9172021 MsG0780036516.01.T01:CDS 50.0%
GATTCCGGTATGTGGACGTT+GGG - Chr7:9171841-9171860 MsG0780036516.01.T01:CDS 50.0%
GCTCCAAAGGTTGCTAAGGT+AGG + Chr7:9171691-9171710 None:intergenic 50.0%
GCTGACATTGTTAGCAGCCT+CGG + Chr7:9171171-9171190 None:intergenic 50.0%
GGCAGCAACATGGACATTGA+AGG - Chr7:9172288-9172307 MsG0780036516.01.T01:intron 50.0%
GGTATGTGGACGTTGGGTTT+CGG - Chr7:9171847-9171866 MsG0780036516.01.T01:CDS 50.0%
GTCAGGATTGACAGTGTAGG+AGG + Chr7:9170726-9170745 None:intergenic 50.0%
GTGGAATGTTGAACCTGCCA+AGG - Chr7:9171999-9172018 MsG0780036516.01.T01:CDS 50.0%
TCATGGACAAGGCAGCAACA+TGG - Chr7:9172278-9172297 MsG0780036516.01.T01:intron 50.0%
TCGTCTACGTGTTCTGTGCT+CGG - Chr7:9173028-9173047 MsG0780036516.01.T01:intron 50.0%
TGTGAATCTCGGAAGCCAAG+AGG - Chr7:9173083-9173102 MsG0780036516.01.T01:CDS 50.0%
TTCAATGGTCAAGCTCCCGA+TGG - Chr7:9172811-9172830 MsG0780036516.01.T01:intron 50.0%
! CTCGTAAAGTTGGTCCTCCT+TGG + Chr7:9172019-9172038 None:intergenic 50.0%
! TAAAGTTGGTCCTCCTTGGC+AGG + Chr7:9172015-9172034 None:intergenic 50.0%
! TTCTGTGCTCGGTGGTACAA+GGG - Chr7:9173039-9173058 MsG0780036516.01.T01:intron 50.0%
!! AGAGAACTAGCCTTCTCTCC+CGG + Chr7:9172712-9172731 None:intergenic 50.0%
AACACGGACATGGTTGCTGC+TGG + Chr7:9172502-9172521 None:intergenic 55.0%
ACACGGACATGGTTGCTGCT+GGG + Chr7:9172501-9172520 None:intergenic 55.0%
AGGCCTGTTCCCAACGAAGT+TGG + Chr7:9171619-9171638 None:intergenic 55.0%
CTAAAGGCGAAGAACCGGGA+TGG - Chr7:9172929-9172948 MsG0780036516.01.T01:intron 55.0%
GATGGTTGCAGCTGGTGCAA+CGG - Chr7:9172660-9172679 MsG0780036516.01.T01:CDS 55.0%
GGCCATGAATCCGCCATCAA+AGG - Chr7:9172045-9172064 MsG0780036516.01.T01:CDS 55.0%
GGCCGTCAACCTCGTAAAGT+TGG + Chr7:9172029-9172048 None:intergenic 55.0%
TCTACGTGTTCTGTGCTCGG+TGG - Chr7:9173031-9173050 MsG0780036516.01.T01:intron 55.0%
! GTTCTGTGCTCGGTGGTACA+AGG - Chr7:9173038-9173057 MsG0780036516.01.T01:intron 55.0%
!! TAAGAGCACTTAGCGCTGCG+AGG + Chr7:9173002-9173021 None:intergenic 55.0%
CCTCGGCACTGTCTTGACGA+AGG + Chr7:9171154-9171173 None:intergenic 60.0%
CCTTCGTCAAGACAGTGCCG+AGG - Chr7:9171151-9171170 MsG0780036516.01.T01:CDS 60.0%
TAGGAGGCGACAGATCCTGC+TGG + Chr7:9170710-9170729 None:intergenic 60.0%
AGGTCTTCGTCGCTGCCGCT+AGG - Chr7:9171974-9171993 MsG0780036516.01.T01:CDS 65.0%
GAGCACTTAGCGCTGCGAGG+AGG + Chr7:9172999-9173018 None:intergenic 65.0%
TCGTCGCTGCCGCTAGGAAG+TGG - Chr7:9171980-9171999 MsG0780036516.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
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Gene Sequence

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Protein sequence

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