AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780039054.01


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MsG0780039054.01.T01 AT1G13040 23.301 412 231 15 206 578 91 456 2.67e-11 67.4
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MsG0780039054.01.T01 AT1G53330 25.523 239 161 5 229 466 46 268 2.39e-11 66.6
MsG0780039054.01.T01 AT1G11900 25.658 152 111 2 332 482 193 343 2.76e-11 66.2
MsG0780039054.01.T01 AT3G12770 23.571 280 187 7 197 476 258 510 2.92e-11 67.4
MsG0780039054.01.T01 AT4G01400 24.034 233 156 3 172 404 137 348 3.04e-11 67.0
MsG0780039054.01.T01 AT3G62470 22.330 309 216 9 169 476 207 492 3.43e-11 67.0
MsG0780039054.01.T01 AT4G32430 20.293 409 289 15 230 612 239 636 4.06e-11 67.0
MsG0780039054.01.T01 AT4G32430 20.293 409 289 15 230 612 107 504 4.36e-11 66.6
MsG0780039054.01.T01 AT1G11290 25.867 375 210 14 230 576 301 635 4.60e-11 67.0
MsG0780039054.01.T01 AT1G28690 25.893 224 149 7 347 563 171 384 4.94e-11 66.2
MsG0780039054.01.T01 AT3G62540 22.330 309 216 8 169 476 207 492 6.91e-11 66.2
MsG0780039054.01.T01 AT5G14820 22.330 309 216 8 169 476 206 491 7.46e-11 65.9
MsG0780039054.01.T01 AT5G08310 22.973 370 234 13 226 590 434 757 8.57e-11 66.2
MsG0780039054.01.T01 AT5G08310 22.973 370 234 13 226 590 434 757 8.57e-11 66.2
MsG0780039054.01.T01 AT1G55890 25.818 275 172 11 357 610 115 378 8.69e-11 65.1
MsG0780039054.01.T01 AT5G62370 23.684 228 160 1 270 497 240 453 9.26e-11 65.9

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CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CAGAATTTATGAGAATAATT+TGG 0.111853 7:-57345654 MsG0780039054.01.T01:CDS
TTCATTATGTCGAAACAAAA+TGG 0.184081 7:-57347886 MsG0780039054.01.T01:CDS
TCATTTCCTCATACATGTTT+AGG 0.210039 7:+57347264 None:intergenic
ACTTTGGAATATGGAGTTAA+TGG 0.229796 7:-57346754 MsG0780039054.01.T01:CDS
CATTTCCTCATACATGTTTA+GGG 0.274127 7:+57347265 None:intergenic
TTACCTGCAAGCATTTAAAA+TGG 0.297728 7:+57346495 None:intergenic
GATTCCTACTAGTGTGTTAT+AGG 0.300448 7:+57347211 None:intergenic
GCTGCTGGTGGCAGGGGCAA+TGG 0.303168 7:-57348231 MsG0780039054.01.T01:CDS
CAGCAGCATGAGAATGATTT+AGG 0.309569 7:+57345549 None:intergenic
CTTGTGCAATGGTTCATTCA+TGG 0.313963 7:-57345926 MsG0780039054.01.T01:CDS
CCATCGCCAACTTTGGAATA+TGG 0.315302 7:-57346763 MsG0780039054.01.T01:CDS
TGCTGCTGCTGCTGGTGGCA+GGG 0.317141 7:-57348238 MsG0780039054.01.T01:CDS
AGAATTTATGAGAATAATTT+GGG 0.318356 7:-57345653 MsG0780039054.01.T01:CDS
GCTGCTGCTGCTGGTGGCAG+GGG 0.321664 7:-57348237 MsG0780039054.01.T01:CDS
ATCAGTGAGGGCATTATAAA+AGG 0.324575 7:+57346189 None:intergenic
TGAGAATAATTTGGGAAGAT+TGG 0.326773 7:-57345645 MsG0780039054.01.T01:CDS
TGCATATTCCTCCACTTTGC+TGG 0.334585 7:-57348196 MsG0780039054.01.T01:CDS
TACGCGGCCAAGATGCATTC+TGG 0.356042 7:-57348120 MsG0780039054.01.T01:CDS
AGAGTTCAAGATGGCAAGAT+TGG 0.364420 7:-57346935 MsG0780039054.01.T01:CDS
CGAATGGTCACTTTCTTGCT+TGG 0.367394 7:-57345976 MsG0780039054.01.T01:CDS
GCTGAAAATGTGACAACATT+TGG 0.368783 7:+57346517 None:intergenic
GAATTGTACGTTATCACATT+AGG 0.373336 7:+57347648 None:intergenic
TGGTTGAGATGCATCAATTA+TGG 0.373512 7:+57346783 None:intergenic
GACCTCCTGCCAGAAAATTC+AGG 0.375752 7:+57348150 None:intergenic
AGATGTCGTCGAAGAGAGTT+TGG 0.384228 7:-57347351 MsG0780039054.01.T01:CDS
GAGTAGTTTGGTGGAGGGGT+TGG 0.387497 7:+57348465 None:intergenic
TCATTGATGCTGGGGCGAAA+GGG 0.388367 7:-57347623 MsG0780039054.01.T01:CDS
ATTCGCCTTTCCACACATTT+CGG 0.397854 7:+57345994 None:intergenic
TATGTTGCTTATAGCAATGA+TGG 0.401814 7:-57346842 MsG0780039054.01.T01:CDS
GCTGTTGAAGCACTCCTAAA+TGG 0.404276 7:-57345692 MsG0780039054.01.T01:CDS
GCACTGTAAGTGACCACATT+TGG 0.405146 7:+57347328 None:intergenic
GCACTGTGAGCATGTTTGTT+TGG 0.406403 7:+57348081 None:intergenic
TCGCCTCCTATGCTTATTGA+TGG 0.410728 7:-57346697 MsG0780039054.01.T01:CDS
CAAAATGGGAGGGTTGATAA+AGG 0.412260 7:-57347871 MsG0780039054.01.T01:CDS
TCTAGGTGCAGCAGGGAGTA+AGG 0.416560 7:+57348443 None:intergenic
GAGTTGAACGTGACCACATT+TGG 0.417693 7:+57346805 None:intergenic
TCAGAGACGCGGAGCTGAAA+TGG 0.422776 7:-57346036 MsG0780039054.01.T01:intron
CCTTTCTGTTTGCGCATCGA+AGG 0.423272 7:-57347514 MsG0780039054.01.T01:CDS
TGTTCAGGTCCATGAGTAGC+TGG 0.425595 7:-57347680 MsG0780039054.01.T01:intron
ATCGAAGGGCATGTGGGAAA+TGG 0.430341 7:-57347499 MsG0780039054.01.T01:CDS
TACAATTCAATCATTGATGC+TGG 0.432368 7:-57347633 MsG0780039054.01.T01:CDS
ATCTCAACCATCGCCAACTT+TGG 0.433764 7:-57346770 MsG0780039054.01.T01:CDS
GCTGCTGCTGTTGCTGAAGT+AGG 0.435745 7:-57348282 MsG0780039054.01.T01:CDS
TTCAAAATCCGGTCCTCCCC+AGG 0.439378 7:+57346658 None:intergenic
TTGGGAAGATTGGTGTCTCC+TGG 0.444594 7:-57345635 MsG0780039054.01.T01:CDS
GGTGGCAGGGGCAATGGCAG+AGG 0.446103 7:-57348225 MsG0780039054.01.T01:CDS
TTACATATGAACATAAGTTA+TGG 0.446806 7:-57347987 MsG0780039054.01.T01:CDS
ATCATTGATGCTGGGGCGAA+AGG 0.448222 7:-57347624 MsG0780039054.01.T01:CDS
ATTTATATGCTAAAAGAGTT+CGG 0.449333 7:-57347949 MsG0780039054.01.T01:CDS
GCAACAGCAGCAGCGGCTAA+AGG 0.453898 7:+57348291 None:intergenic
TAAGGAGTAGTTTGGTGGAG+GGG 0.454956 7:+57348461 None:intergenic
TAGGGCATCTTCCAAGAGGT+TGG 0.459897 7:+57347283 None:intergenic
TTAACTCCATATTCCAAAGT+TGG 0.461250 7:+57346757 None:intergenic
GCAGGGAGTAAGGAGTAGTT+TGG 0.461808 7:+57348453 None:intergenic
TGGGTTACAGAGAACAAGTA+TGG 0.463418 7:-57346270 MsG0780039054.01.T01:intron
TCATTATGTCGAAACAAAAT+GGG 0.464595 7:-57347885 MsG0780039054.01.T01:CDS
CGCCTCCTATGCTTATTGAT+GGG 0.465929 7:-57346696 MsG0780039054.01.T01:CDS
TCAGCATGTCTAGGTGCAGC+AGG 0.467545 7:+57348435 None:intergenic
CCCGGACAAAAGAGCATTGT+AGG 0.468764 7:+57347106 None:intergenic
TAGAACGTTTATGAGTACTA+TGG 0.471327 7:+57348364 None:intergenic
GCTCGAACATCTTCAAAATC+CGG 0.475411 7:+57346647 None:intergenic
GGAAGGAAGGCAATCAAGAT+TGG 0.475550 7:-57348175 MsG0780039054.01.T01:CDS
TTGTGGTGCTGCTTGTGCAA+TGG 0.477215 7:-57345937 MsG0780039054.01.T01:CDS
CTTAGCTTTCTGTTCAAAGC+TGG 0.479374 7:-57348042 MsG0780039054.01.T01:CDS
ACTGCATGGCTGACACATCC+TGG 0.482732 7:-57345602 MsG0780039054.01.T01:CDS
TATGCTGTGGCACTTTGGTC+AGG 0.483371 7:-57346167 MsG0780039054.01.T01:intron
AAGGTGAACCGATGCCATTT+AGG 0.484786 7:+57345678 None:intergenic
AGTAAGGAGTAGTTTGGTGG+AGG 0.489908 7:+57348459 None:intergenic
GCTGAAATGGTTGTAATTGA+AGG 0.491512 7:-57346023 MsG0780039054.01.T01:CDS
TTAGTGCTATGATTGGCTCT+TGG 0.492024 7:-57347840 MsG0780039054.01.T01:intron
CTTTCTGTTTGCGCATCGAA+GGG 0.495145 7:-57347513 MsG0780039054.01.T01:CDS
GAATTGTAAGTAAGCCGATC+TGG 0.496260 7:+57347540 None:intergenic
AGAATAAGCCTGGGGAGGAC+CGG 0.503360 7:-57346666 MsG0780039054.01.T01:CDS
GGGAGTAAGGAGTAGTTTGG+TGG 0.506229 7:+57348456 None:intergenic
AAGTTAGTTAGTGCTATGAT+TGG 0.506810 7:-57347847 MsG0780039054.01.T01:CDS
GTAAGGAGTAGTTTGGTGGA+GGG 0.508291 7:+57348460 None:intergenic
GTAGGAATCTACGCGAAGCT+CGG 0.510999 7:-57347197 MsG0780039054.01.T01:CDS
CTGGAGAAGTGCTGACTGCA+TGG 0.511008 7:-57345616 MsG0780039054.01.T01:CDS
CCAAGAGGTTGGCTTGGCAT+AGG 0.511880 7:+57347294 None:intergenic
ACTGATATGCTGTGGCACTT+TGG 0.515757 7:-57346172 MsG0780039054.01.T01:CDS
CCTCCACTTTGCTGGAAGGA+AGG 0.516706 7:-57348188 MsG0780039054.01.T01:CDS
GTGTCCTATAACACACTAGT+AGG 0.517471 7:-57347215 MsG0780039054.01.T01:CDS
CATCTTCCAAGAGGTTGGCT+TGG 0.517849 7:+57347288 None:intergenic
CCTATGCCAAGCCAACCTCT+TGG 0.519116 7:-57347294 MsG0780039054.01.T01:CDS
CATGCAGTCAGCACTTCTCC+AGG 0.520562 7:+57345617 None:intergenic
AGATGCCCTAAACATGTATG+AGG 0.521546 7:-57347270 MsG0780039054.01.T01:CDS
GTTCAGGTCCATGAGTAGCT+GGG 0.522519 7:-57347679 MsG0780039054.01.T01:intron
CGGCATTCCAGAATGCATCT+TGG 0.524738 7:+57348113 None:intergenic
GTTCGATGAAATCATGCGTA+TGG 0.525929 7:-57346230 MsG0780039054.01.T01:CDS
CTTATAGCAATGATGGAGAA+AGG 0.526682 7:-57346835 MsG0780039054.01.T01:CDS
ACAATTCAATCATTGATGCT+GGG 0.529311 7:-57347632 MsG0780039054.01.T01:CDS
TGGGAGAAGGAACATTGAAA+AGG 0.530253 7:-57345714 MsG0780039054.01.T01:intron
TACAACTCCCCAGCTACTCA+TGG 0.531220 7:+57347671 None:intergenic
TAAAAGGCAGACGAAGTTGA+AGG 0.532758 7:+57346205 None:intergenic
CATGCCATGCTTGCCATACC+CGG 0.533123 7:+57347088 None:intergenic
TGTTTGTTTGGAGTCACCCT+CGG 0.534188 7:+57348093 None:intergenic
GCCTCCTATGCTTATTGATG+GGG 0.539346 7:-57346695 MsG0780039054.01.T01:CDS
TATTCCTCCACTTTGCTGGA+AGG 0.543957 7:-57348192 MsG0780039054.01.T01:CDS
CATTGATGCTGGGGCGAAAG+GGG 0.544104 7:-57347622 MsG0780039054.01.T01:CDS
TCACAGTGCTGCGGCTGACG+AGG 0.548183 7:-57348067 MsG0780039054.01.T01:CDS
AGCAGCAGCAACACTTCCAT+TGG 0.549894 7:+57348257 None:intergenic
GATCCTTACTTCACAAACAT+AGG 0.554228 7:+57345861 None:intergenic
TTCAGGTCCATGAGTAGCTG+GGG 0.555746 7:-57347678 MsG0780039054.01.T01:intron
TTGTCCGGGTATGGCAAGCA+TGG 0.562253 7:-57347092 MsG0780039054.01.T01:CDS
GCCCCATCAATAAGCATAGG+AGG 0.564423 7:+57346694 None:intergenic
ACCGTTGGTCTTCGTCGTCT+AGG 0.565116 7:-57348338 MsG0780039054.01.T01:CDS
CTGAAATGGTTGTAATTGAA+GGG 0.565604 7:-57346022 MsG0780039054.01.T01:CDS
ACAAGCGAATCGAAAACTCC+AGG 0.568804 7:+57345584 None:intergenic
CCATATTCCAAAGTTGGCGA+TGG 0.570685 7:+57346763 None:intergenic
CCAACGGCATAATGCCAGAT+CGG 0.572820 7:-57347554 MsG0780039054.01.T01:CDS
GGTCACTTACAGTGCAATGA+TGG 0.573958 7:-57347320 MsG0780039054.01.T01:CDS
CCTTCGATGCGCAAACAGAA+AGG 0.574233 7:+57347514 None:intergenic
GATCTGCATCTGATGTCTTG+TGG 0.574762 7:-57345954 MsG0780039054.01.T01:CDS
TTTGCGCATCGAAGGGCATG+TGG 0.576722 7:-57347506 MsG0780039054.01.T01:CDS
CAGATAAAGAAGAATAGAAG+TGG 0.577265 7:-57346601 MsG0780039054.01.T01:CDS
TATTGAGACGTGCAAAGAGA+TGG 0.582475 7:-57347159 MsG0780039054.01.T01:CDS
CCGATCTGGCATTATGCCGT+TGG 0.584083 7:+57347554 None:intergenic
TGAAATGTTTCAGGAAGCGA+TGG 0.586072 7:-57346968 MsG0780039054.01.T01:intron
TACGATGAAATGATAGCCAA+CGG 0.589466 7:-57347570 MsG0780039054.01.T01:CDS
CAATTCAATCATTGATGCTG+GGG 0.590962 7:-57347631 MsG0780039054.01.T01:CDS
TTGCCTTCCTTCCAGCAAAG+TGG 0.593308 7:+57348185 None:intergenic
TTATTCTCATAAATTCTGAA+AGG 0.593975 7:+57345659 None:intergenic
TTATGTCGAAACAAAATGGG+AGG 0.594963 7:-57347882 MsG0780039054.01.T01:CDS
CTCTATCAATACAAACAGAT+CGG 0.597407 7:+57347237 None:intergenic
CCTTCCTTCCAGCAAAGTGG+AGG 0.599956 7:+57348188 None:intergenic
GTTGCTGAAGTAGGTGCCAA+TGG 0.601689 7:-57348273 MsG0780039054.01.T01:CDS
CAGGAGGTCAACGCGGTACG+CGG 0.602960 7:-57348136 MsG0780039054.01.T01:CDS
AGACGCCGAAATGTGTGGAA+AGG 0.607515 7:-57345999 MsG0780039054.01.T01:CDS
AAGGGAGACGCCGAAATGTG+TGG 0.607661 7:-57346004 MsG0780039054.01.T01:CDS
TGCAAAGAGATGGAGAGAAG+TGG 0.607676 7:-57347149 MsG0780039054.01.T01:CDS
CAGCATGTCTAGGTGCAGCA+GGG 0.608718 7:+57348436 None:intergenic
TAAAGGTGCAGAGTGTGAGT+TGG 0.609746 7:+57348308 None:intergenic
GAAGCACTCCTAAATGGCAT+CGG 0.612367 7:-57345686 MsG0780039054.01.T01:CDS
GAAGAGAGTTTGGCCAAATG+TGG 0.616037 7:-57347341 MsG0780039054.01.T01:CDS
TATTGAGTGAAATGGACCAC+AGG 0.618682 7:-57347467 MsG0780039054.01.T01:CDS
ATATGAACATAAGTTATGGA+AGG 0.619771 7:-57347983 MsG0780039054.01.T01:CDS
TACTTCAGCAACAGCAGCAG+CGG 0.628294 7:+57348284 None:intergenic
AAAGCCCCATCAATAAGCAT+AGG 0.632516 7:+57346691 None:intergenic
AGATGCATTCTGGAATGCCG+AGG 0.632932 7:-57348110 MsG0780039054.01.T01:CDS
GTGCCACAGCATATCAGTGA+GGG 0.634708 7:+57346177 None:intergenic
GAAATGTGTGGAAAGGCGAA+TGG 0.634942 7:-57345992 MsG0780039054.01.T01:CDS
AGAGCAGGATAATCATGTGA+TGG 0.635358 7:+57345524 None:intergenic
AAGACAAACAGTGCATATTG+TGG 0.638168 7:-57346573 MsG0780039054.01.T01:CDS
GAAAGGAATAAAGCCAAATG+TGG 0.641924 7:-57346818 MsG0780039054.01.T01:CDS
TATGTCGAAACAAAATGGGA+GGG 0.643664 7:-57347881 MsG0780039054.01.T01:CDS
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GATGCATTCTGGAATGCCGA+GGG 0.647748 7:-57348109 MsG0780039054.01.T01:CDS
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CRISPR-GE

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!! ATTTATATGCTAAAAGAGTT+CGG - Chr7:57346042-57346061 MsG0780039054.01.T01:intron 20.0%
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GCTGAAAATGTGACAACATT+TGG + Chr7:57347477-57347496 None:intergenic 35.0%
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TGGTTGAGATGCATCAATTA+TGG + Chr7:57347211-57347230 None:intergenic 35.0%
TTATGTCGAAACAAAATGGG+AGG - Chr7:57346109-57346128 MsG0780039054.01.T01:intron 35.0%
! CACAGTAAAATAATGGGAGA+AGG - Chr7:57348264-57348283 MsG0780039054.01.T01:CDS 35.0%
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!! AAGCACTGTGTATTCCTTTT+CGG - Chr7:57346237-57346256 MsG0780039054.01.T01:CDS 35.0%
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!! TTTTTCAATCGGATGGTCAA+TGG + Chr7:57347274-57347293 None:intergenic 35.0%
AAAGCCCCATCAATAAGCAT+AGG + Chr7:57347303-57347322 None:intergenic 40.0%
AGAGCAGGATAATCATGTGA+TGG + Chr7:57348470-57348489 None:intergenic 40.0%
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AGATGCCCTAAACATGTATG+AGG - Chr7:57346721-57346740 MsG0780039054.01.T01:CDS 40.0%
ATATTTGGACACCCTGTGTA+AGG - Chr7:57346581-57346600 MsG0780039054.01.T01:CDS 40.0%
ATTCGCCTTTCCACACATTT+CGG + Chr7:57348000-57348019 None:intergenic 40.0%
CAGCAGCATGAGAATGATTT+AGG + Chr7:57348445-57348464 None:intergenic 40.0%
CATCTCTTTGAATACCCTTC+TGG + Chr7:57346625-57346644 None:intergenic 40.0%
CTGCCTATGTTTGTGAAGTA+AGG - Chr7:57348127-57348146 MsG0780039054.01.T01:CDS 40.0%
CTTGTGCAATGGTTCATTCA+TGG - Chr7:57348065-57348084 MsG0780039054.01.T01:CDS 40.0%
GAATTGTAAGTAAGCCGATC+TGG + Chr7:57346454-57346473 None:intergenic 40.0%
GCTCGAACATCTTCAAAATC+CGG + Chr7:57347347-57347366 None:intergenic 40.0%
GGGGAGATTAATCTTGCTTT+AGG - Chr7:57346181-57346200 MsG0780039054.01.T01:CDS 40.0%
GTGTCCTATAACACACTAGT+AGG - Chr7:57346776-57346795 MsG0780039054.01.T01:CDS 40.0%
GTTCGATGAAATCATGCGTA+TGG - Chr7:57347761-57347780 MsG0780039054.01.T01:intron 40.0%
TAAAAGGCAGACGAAGTTGA+AGG + Chr7:57347789-57347808 None:intergenic 40.0%
TAAGGCAGGCCAAATTGATT+TGG - Chr7:57346599-57346618 MsG0780039054.01.T01:CDS 40.0%
TATTGAGACGTGCAAAGAGA+TGG - Chr7:57346832-57346851 MsG0780039054.01.T01:CDS 40.0%
TATTGAGTGAAATGGACCAC+AGG - Chr7:57346524-57346543 MsG0780039054.01.T01:CDS 40.0%
TGAAATGTTTCAGGAAGCGA+TGG - Chr7:57347023-57347042 MsG0780039054.01.T01:intron 40.0%
TGAACAAATCCACAGCATCA+GGG + Chr7:57346297-57346316 None:intergenic 40.0%
TGGGAGAAGGAACATTGAAA+AGG - Chr7:57348277-57348296 MsG0780039054.01.T01:CDS 40.0%
TGGGTTACAGAGAACAAGTA+TGG - Chr7:57347721-57347740 MsG0780039054.01.T01:intron 40.0%
TTGAAAGAGCTAGGCTTGAA+GGG - Chr7:57346209-57346228 MsG0780039054.01.T01:CDS 40.0%
TTTGAAAGAGCTAGGCTTGA+AGG - Chr7:57346208-57346227 MsG0780039054.01.T01:CDS 40.0%
! ACCTACAATGCTCTTTTGTC+CGG - Chr7:57346884-57346903 MsG0780039054.01.T01:CDS 40.0%
! ACTCCGCTTGTTTGATAATC+AGG - Chr7:57347672-57347691 MsG0780039054.01.T01:CDS 40.0%
! ATTAGTGCTTTTGGCCGAAA+TGG - Chr7:57346265-57346284 MsG0780039054.01.T01:intron 40.0%
! CTTAGCTTTCTGTTCAAAGC+TGG - Chr7:57345949-57345968 MsG0780039054.01.T01:CDS 40.0%
! TTAGTGCTATGATTGGCTCT+TGG - Chr7:57346151-57346170 MsG0780039054.01.T01:intron 40.0%
! TTAGTGCTTTTGGCCGAAAT+GGG - Chr7:57346266-57346285 MsG0780039054.01.T01:intron 40.0%
!! AGATTGGCTCCTGAATTTTC+TGG - Chr7:57345832-57345851 MsG0780039054.01.T01:intron 40.0%
!! ATAAACGTTCTAGAGACCGT+TGG - Chr7:57345638-57345657 MsG0780039054.01.T01:CDS 40.0%
!! CAAAATGGGAGGGTTGATAA+AGG - Chr7:57346120-57346139 MsG0780039054.01.T01:intron 40.0%
!! CAGCCATTTTAAATGCTTGC+AGG - Chr7:57347493-57347512 MsG0780039054.01.T01:CDS 40.0%
!! CCAAATTGATTTGGCCAGAA+GGG - Chr7:57346608-57346627 MsG0780039054.01.T01:CDS 40.0%
!! TGTTTTTGACATCAGAGACG+CGG - Chr7:57347944-57347963 MsG0780039054.01.T01:CDS 40.0%
!! TTGTAGCATTTTAACCGGCT+GGG - Chr7:57348236-57348255 MsG0780039054.01.T01:CDS 40.0%
AATTTGGCCTGCCTTACACA+GGG + Chr7:57346595-57346614 None:intergenic 45.0%
ACAAGCGAATCGAAAACTCC+AGG + Chr7:57348410-57348429 None:intergenic 45.0%
ACTGATATGCTGTGGCACTT+TGG - Chr7:57347819-57347838 MsG0780039054.01.T01:intron 45.0%
AGATGTCGTCGAAGAGAGTT+TGG - Chr7:57346640-57346659 MsG0780039054.01.T01:CDS 45.0%
AGCACTAATCATGGCCGAAA+AGG + Chr7:57346254-57346273 None:intergenic 45.0%
ATCTCAACCATCGCCAACTT+TGG - Chr7:57347221-57347240 MsG0780039054.01.T01:CDS 45.0%
CCATATTCCAAAGTTGGCGA+TGG + Chr7:57347231-57347250 None:intergenic 45.0%
CCCTTCTGGCCAAATCAATT+TGG + Chr7:57346611-57346630 None:intergenic 45.0%
CGCCTCCTATGCTTATTGAT+GGG - Chr7:57347295-57347314 MsG0780039054.01.T01:CDS 45.0%
CTGAACAAATCCACAGCATC+AGG + Chr7:57346298-57346317 None:intergenic 45.0%
CTTTCTGTTTGCGCATCGAA+GGG - Chr7:57346478-57346497 MsG0780039054.01.T01:intron 45.0%
GAAATGTGTGGAAAGGCGAA+TGG - Chr7:57347999-57348018 MsG0780039054.01.T01:CDS 45.0%
GAAGAGAGTTTGGCCAAATG+TGG - Chr7:57346650-57346669 MsG0780039054.01.T01:CDS 45.0%
GAGTTGAACGTGACCACATT+TGG + Chr7:57347189-57347208 None:intergenic 45.0%
GATCTGCATCTGATGTCTTG+TGG - Chr7:57348037-57348056 MsG0780039054.01.T01:CDS 45.0%
GCACTGTAAGTGACCACATT+TGG + Chr7:57346666-57346685 None:intergenic 45.0%
GCACTGTGAGCATGTTTGTT+TGG + Chr7:57345913-57345932 None:intergenic 45.0%
GCCTCCTATGCTTATTGATG+GGG - Chr7:57347296-57347315 MsG0780039054.01.T01:CDS 45.0%
GGAAGGAAGGCAATCAAGAT+TGG - Chr7:57345816-57345835 MsG0780039054.01.T01:intron 45.0%
GGTCACTTACAGTGCAATGA+TGG - Chr7:57346671-57346690 MsG0780039054.01.T01:CDS 45.0%
TATTCCTCCACTTTGCTGGA+AGG - Chr7:57345799-57345818 MsG0780039054.01.T01:intron 45.0%
TCGCCTCCTATGCTTATTGA+TGG - Chr7:57347294-57347313 MsG0780039054.01.T01:CDS 45.0%
TGCAAAGAGATGGAGAGAAG+TGG - Chr7:57346842-57346861 MsG0780039054.01.T01:CDS 45.0%
TGCATATTCCTCCACTTTGC+TGG - Chr7:57345795-57345814 MsG0780039054.01.T01:intron 45.0%
TGTAACCCATCAACAGTCCA+TGG + Chr7:57347710-57347729 None:intergenic 45.0%
! AAGGTGAACCGATGCCATTT+AGG + Chr7:57348316-57348335 None:intergenic 45.0%
! AATGCTCTTTTGTCCGGGTA+TGG - Chr7:57346890-57346909 MsG0780039054.01.T01:CDS 45.0%
! AGTAAGGAGTAGTTTGGTGG+AGG + Chr7:57345535-57345554 None:intergenic 45.0%
! ATTGGCTCTTGGTAGGTTAG+GGG - Chr7:57346162-57346181 MsG0780039054.01.T01:intron 45.0%
! CCTACAATGCTCTTTTGTCC+GGG - Chr7:57346885-57346904 MsG0780039054.01.T01:CDS 45.0%
! CGAATGGTCACTTTCTTGCT+TGG - Chr7:57348015-57348034 MsG0780039054.01.T01:CDS 45.0%
! CGTAACCATGGACTGTTGAT+GGG - Chr7:57347702-57347721 MsG0780039054.01.T01:intron 45.0%
! CTGATGCTGTGGATTTGTTC+AGG - Chr7:57346296-57346315 MsG0780039054.01.T01:intron 45.0%
! GAAGCACTCCTAAATGGCAT+CGG - Chr7:57348305-57348324 MsG0780039054.01.T01:CDS 45.0%
! GATTGGCTCTTGGTAGGTTA+GGG - Chr7:57346161-57346180 MsG0780039054.01.T01:intron 45.0%
! GCTGTTGAAGCACTCCTAAA+TGG - Chr7:57348299-57348318 MsG0780039054.01.T01:CDS 45.0%
! GGCTTTTCAGAATAAGCCTG+GGG - Chr7:57347317-57347336 MsG0780039054.01.T01:CDS 45.0%
! GGGCTTTTCAGAATAAGCCT+GGG - Chr7:57347316-57347335 MsG0780039054.01.T01:CDS 45.0%
! GTAAGGAGTAGTTTGGTGGA+GGG + Chr7:57345534-57345553 None:intergenic 45.0%
! TAAAGGTGCAGAGTGTGAGT+TGG + Chr7:57345686-57345705 None:intergenic 45.0%
! TAAGGAGTAGTTTGGTGGAG+GGG + Chr7:57345533-57345552 None:intergenic 45.0%
! TCGGCCATGATTAGTGCTTT+TGG - Chr7:57346256-57346275 MsG0780039054.01.T01:CDS 45.0%
! TGATTGGCTCTTGGTAGGTT+AGG - Chr7:57346160-57346179 MsG0780039054.01.T01:intron 45.0%
! TGCTATGATTGGCTCTTGGT+AGG - Chr7:57346155-57346174 MsG0780039054.01.T01:intron 45.0%
! TGTTTAGGGCATCTTCCAAG+AGG + Chr7:57346715-57346734 None:intergenic 45.0%
! TGTTTGTTTGGAGTCACCCT+CGG + Chr7:57345901-57345920 None:intergenic 45.0%
! TTTTCAGAATAAGCCTGGGG+AGG - Chr7:57347320-57347339 MsG0780039054.01.T01:CDS 45.0%
!! CCATCGCCAACTTTGGAATA+TGG - Chr7:57347228-57347247 MsG0780039054.01.T01:CDS 45.0%
!! GAGGCGATTTTTCAATCGGA+TGG + Chr7:57347281-57347300 None:intergenic 45.0%
!! GCCAAATTGATTTGGCCAGA+AGG - Chr7:57346607-57346626 MsG0780039054.01.T01:CDS 45.0%
!! GTTGTAGCATTTTAACCGGC+TGG - Chr7:57348235-57348254 MsG0780039054.01.T01:CDS 45.0%
!! TCGGCCAAAAGCACTAATCA+TGG + Chr7:57346263-57346282 None:intergenic 45.0%
!! TGTAGCATTTTAACCGGCTG+GGG - Chr7:57348237-57348256 MsG0780039054.01.T01:CDS 45.0%
AGACGCCGAAATGTGTGGAA+AGG - Chr7:57347992-57348011 MsG0780039054.01.T01:CDS 50.0%
AGAGCTAGGCTTGAAGGGTA+TGG - Chr7:57346214-57346233 MsG0780039054.01.T01:CDS 50.0%
AGCAGCAGCAACACTTCCAT+TGG + Chr7:57345737-57345756 None:intergenic 50.0%
AGTGCCACAGCATATCAGTG+AGG + Chr7:57347818-57347837 None:intergenic 50.0%
ATCATTGATGCTGGGGCGAA+AGG - Chr7:57346367-57346386 MsG0780039054.01.T01:intron 50.0%
ATGCCCTCACTGATATGCTG+TGG - Chr7:57347811-57347830 MsG0780039054.01.T01:intron 50.0%
CAAACATGCTCACAGTGCTG+CGG - Chr7:57345915-57345934 MsG0780039054.01.T01:CDS 50.0%
CAATTTGGCCTGCCTTACAC+AGG + Chr7:57346596-57346615 None:intergenic 50.0%
CATCGGAAACAATACGCCTG+TGG + Chr7:57346543-57346562 None:intergenic 50.0%
CCAACGGCATAATGCCAGAT+CGG - Chr7:57346437-57346456 MsG0780039054.01.T01:intron 50.0%
CCTTCGATGCGCAAACAGAA+AGG + Chr7:57346480-57346499 None:intergenic 50.0%
CCTTTCTGTTTGCGCATCGA+AGG - Chr7:57346477-57346496 MsG0780039054.01.T01:intron 50.0%
CGGCATTCCAGAATGCATCT+TGG + Chr7:57345881-57345900 None:intergenic 50.0%
GACCTCCTGCCAGAAAATTC+AGG + Chr7:57345844-57345863 None:intergenic 50.0%
GCAGGGAGTAAGGAGTAGTT+TGG + Chr7:57345541-57345560 None:intergenic 50.0%
GCCCCATCAATAAGCATAGG+AGG + Chr7:57347300-57347319 None:intergenic 50.0%
GGGAGTAAGGAGTAGTTTGG+TGG + Chr7:57345538-57345557 None:intergenic 50.0%
GTAGGAATCTACGCGAAGCT+CGG - Chr7:57346794-57346813 MsG0780039054.01.T01:CDS 50.0%
GTGCCACAGCATATCAGTGA+GGG + Chr7:57347817-57347836 None:intergenic 50.0%
GTTCAGGTCCATGAGTAGCT+GGG - Chr7:57346312-57346331 MsG0780039054.01.T01:intron 50.0%
GTTGCTGAAGTAGGTGCCAA+TGG - Chr7:57345718-57345737 MsG0780039054.01.T01:intron 50.0%
TACAACTCCCCAGCTACTCA+TGG + Chr7:57346323-57346342 None:intergenic 50.0%
TACTTCAGCAACAGCAGCAG+CGG + Chr7:57345710-57345729 None:intergenic 50.0%
TATGCTGTGGCACTTTGGTC+AGG - Chr7:57347824-57347843 MsG0780039054.01.T01:intron 50.0%
TCAGGTGTATGGCGTAACCA+TGG - Chr7:57347690-57347709 MsG0780039054.01.T01:intron 50.0%
TCATTGATGCTGGGGCGAAA+GGG - Chr7:57346368-57346387 MsG0780039054.01.T01:intron 50.0%
TGTTCAGGTCCATGAGTAGC+TGG - Chr7:57346311-57346330 MsG0780039054.01.T01:intron 50.0%
TTCAGGTCCATGAGTAGCTG+GGG - Chr7:57346313-57346332 MsG0780039054.01.T01:intron 50.0%
TTGCCTTCCTTCCAGCAAAG+TGG + Chr7:57345809-57345828 None:intergenic 50.0%
TTTACTGTGCTTACCCCAGC+CGG + Chr7:57348253-57348272 None:intergenic 50.0%
! ATCGAAGGGCATGTGGGAAA+TGG - Chr7:57346492-57346511 MsG0780039054.01.T01:intron 50.0%
! CATCTTCCAAGAGGTTGGCT+TGG + Chr7:57346706-57346725 None:intergenic 50.0%
! GCGTAACCATGGACTGTTGA+TGG - Chr7:57347701-57347720 MsG0780039054.01.T01:intron 50.0%
! GGGGCTTTTCAGAATAAGCC+TGG - Chr7:57347315-57347334 MsG0780039054.01.T01:CDS 50.0%
! TAGGGCATCTTCCAAGAGGT+TGG + Chr7:57346711-57346730 None:intergenic 50.0%
! TTGGGAAGATTGGTGTCTCC+TGG - Chr7:57348356-57348375 MsG0780039054.01.T01:CDS 50.0%
!! AGATGCATTCTGGAATGCCG+AGG - Chr7:57345881-57345900 MsG0780039054.01.T01:CDS 50.0%
!! CAGCTTGCTGCAGAAAAAGC+TGG - Chr7:57347366-57347385 MsG0780039054.01.T01:CDS 50.0%
!! CCCGGACAAAAGAGCATTGT+AGG + Chr7:57346888-57346907 None:intergenic 50.0%
!! CTCCTGAATTTTCTGGCAGG+AGG - Chr7:57345839-57345858 MsG0780039054.01.T01:intron 50.0%
!! GATGCATTCTGGAATGCCGA+GGG - Chr7:57345882-57345901 MsG0780039054.01.T01:CDS 50.0%
!! TGGCTCCTGAATTTTCTGGC+AGG - Chr7:57345836-57345855 MsG0780039054.01.T01:intron 50.0%
!! TTGTGGTGCTGCTTGTGCAA+TGG - Chr7:57348054-57348073 MsG0780039054.01.T01:CDS 50.0%
AAGGGAGACGCCGAAATGTG+TGG - Chr7:57347987-57348006 MsG0780039054.01.T01:CDS 55.0%
ACTGCATGGCTGACACATCC+TGG - Chr7:57348389-57348408 MsG0780039054.01.T01:CDS 55.0%
AGAATAAGCCTGGGGAGGAC+CGG - Chr7:57347325-57347344 MsG0780039054.01.T01:CDS 55.0%
CAGCATGTCTAGGTGCAGCA+GGG + Chr7:57345558-57345577 None:intergenic 55.0%
CATGCAGTCAGCACTTCTCC+AGG + Chr7:57348377-57348396 None:intergenic 55.0%
CATGCCATGCTTGCCATACC+CGG + Chr7:57346906-57346925 None:intergenic 55.0%
CATTGATGCTGGGGCGAAAG+GGG - Chr7:57346369-57346388 MsG0780039054.01.T01:intron 55.0%
CCGATCTGGCATTATGCCGT+TGG + Chr7:57346440-57346459 None:intergenic 55.0%
CCTATGCCAAGCCAACCTCT+TGG - Chr7:57346697-57346716 MsG0780039054.01.T01:CDS 55.0%
CCTCCACTTTGCTGGAAGGA+AGG - Chr7:57345803-57345822 MsG0780039054.01.T01:intron 55.0%
CCTTCCTTCCAGCAAAGTGG+AGG + Chr7:57345806-57345825 None:intergenic 55.0%
GCCTAGACGACGAAGACCAA+CGG + Chr7:57345657-57345676 None:intergenic 55.0%
GCTGCTGCTGTTGCTGAAGT+AGG - Chr7:57345709-57345728 MsG0780039054.01.T01:CDS 55.0%
TACGCGGCCAAGATGCATTC+TGG - Chr7:57345871-57345890 MsG0780039054.01.T01:CDS 55.0%
TCAGAGACGCGGAGCTGAAA+TGG - Chr7:57347955-57347974 MsG0780039054.01.T01:CDS 55.0%
TCAGCATGTCTAGGTGCAGC+AGG + Chr7:57345559-57345578 None:intergenic 55.0%
TCTAGGTGCAGCAGGGAGTA+AGG + Chr7:57345551-57345570 None:intergenic 55.0%
TTCAAAATCCGGTCCTCCCC+AGG + Chr7:57347336-57347355 None:intergenic 55.0%
TTGGACACCCTGTGTAAGGC+AGG - Chr7:57346585-57346604 MsG0780039054.01.T01:CDS 55.0%
TTGTCCGGGTATGGCAAGCA+TGG - Chr7:57346899-57346918 MsG0780039054.01.T01:CDS 55.0%
! GAGTAGTTTGGTGGAGGGGT+TGG + Chr7:57345529-57345548 None:intergenic 55.0%
! TTGCGCATCGAAGGGCATGT+GGG - Chr7:57346486-57346505 MsG0780039054.01.T01:intron 55.0%
! TTTCTGGCAGGAGGTCAACG+CGG - Chr7:57345848-57345867 MsG0780039054.01.T01:intron 55.0%
! TTTGCGCATCGAAGGGCATG+TGG - Chr7:57346485-57346504 MsG0780039054.01.T01:intron 55.0%
!! ACCGTTGGTCTTCGTCGTCT+AGG - Chr7:57345653-57345672 MsG0780039054.01.T01:CDS 55.0%
!! CATCAGGGAAGCGCCCATTT+CGG + Chr7:57346282-57346301 None:intergenic 55.0%
!! CCAAGAGGTTGGCTTGGCAT+AGG + Chr7:57346700-57346719 None:intergenic 55.0%
!! CTGGAGAAGTGCTGACTGCA+TGG - Chr7:57348375-57348394 MsG0780039054.01.T01:CDS 55.0%
GCAACAGCAGCAGCGGCTAA+AGG + Chr7:57345703-57345722 None:intergenic 60.0%
CAGGAGGTCAACGCGGTACG+CGG - Chr7:57345855-57345874 MsG0780039054.01.T01:intron 65.0%
GTTGCTGCTGCTGCTGCTGC+TGG - Chr7:57345745-57345764 MsG0780039054.01.T01:intron 65.0%
TCACAGTGCTGCGGCTGACG+AGG - Chr7:57345924-57345943 MsG0780039054.01.T01:CDS 65.0%
TGCTGCTGCTGCTGGTGGCA+GGG - Chr7:57345753-57345772 MsG0780039054.01.T01:intron 65.0%
TGGGCGCTTCCCTGATGCTG+TGG - Chr7:57346285-57346304 MsG0780039054.01.T01:intron 65.0%
CTGCTGCTGCTGCTGGTGGC+AGG - Chr7:57345752-57345771 MsG0780039054.01.T01:intron 70.0%
GCTGCTGCTGCTGCTGCTGG+TGG - Chr7:57345748-57345767 MsG0780039054.01.T01:intron 70.0%
GCTGCTGCTGCTGGTGGCAG+GGG - Chr7:57345754-57345773 MsG0780039054.01.T01:intron 70.0%
GCTGCTGGTGGCAGGGGCAA+TGG - Chr7:57345760-57345779 MsG0780039054.01.T01:intron 70.0%
GGTGGCAGGGGCAATGGCAG+AGG - Chr7:57345766-57345785 MsG0780039054.01.T01:intron 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 57345514 57348499 57345514 ID=MsG0780039054.01;Name=MsG0780039054.01
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Chr7 exon 57347841 57348499 57347841 ID=MsG0780039054.01.T01:exon:8320;Parent=MsG0780039054.01.T01
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Chr7 exon 57346499 57346977 57346499 ID=MsG0780039054.01.T01:exon:8317;Parent=MsG0780039054.01.T01
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Chr7 exon 57345870 57346054 57345870 ID=MsG0780039054.01.T01:exon:8315;Parent=MsG0780039054.01.T01
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Chr7 CDS 57345514 57345730 57345514 ID=MsG0780039054.01.T01:cds;Parent=MsG0780039054.01.T01
Gene Sequence

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Protein sequence

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