AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780039043.01

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MsG0780039043.01.T01 AT5G55840 24.062 320 207 2 217 501 723 1041 1.74e-19 94.7
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MsG0780039043.01.T01 AT1G19720 26.316 228 162 3 217 443 422 644 7.65e-14 76.3
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MsG0780039043.01.T01 AT5G39350 21.647 425 275 12 199 583 206 612 5.10e-18 89.7
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MsG0780039043.01.T01 AT1G53330 25.911 247 182 1 317 562 46 292 2.58e-23 103
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MsG0780039043.01.T01 AT1G25360 19.905 422 291 10 250 670 221 596 8.26e-18 89.0
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MsG0780039043.01.T01 AT2G20540 23.305 236 169 5 217 450 179 404 1.32e-13 75.1
MsG0780039043.01.T01 AT2G20540 20.053 379 216 8 215 522 44 406 3.93e-12 70.5
MsG0780039043.01.T01 AT1G80880 26.860 242 172 2 266 507 277 513 2.42e-22 102
MsG0780039043.01.T01 AT1G80880 25.556 270 161 7 299 562 211 446 7.31e-19 91.7
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MsG0780039043.01.T01 AT2G44880 20.395 456 302 13 252 683 87 505 1.64e-17 87.8
MsG0780039043.01.T01 AT2G44880 23.207 474 308 19 235 687 4 442 1.42e-12 72.0
MsG0780039043.01.T01 AT2G44880 20.395 456 302 13 252 683 86 504 1.66e-17 87.8
MsG0780039043.01.T01 AT2G44880 23.207 474 308 19 235 687 3 441 1.42e-12 72.0
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MsG0780039043.01.T01 AT2G44880 20.614 456 301 13 252 683 46 464 1.74e-17 87.4
MsG0780039043.01.T01 AT2G44880 23.932 351 227 14 352 687 76 401 2.66e-12 70.9
MsG0780039043.01.T01 AT1G59720 23.967 363 237 15 226 573 96 434 1.76e-17 87.8
MsG0780039043.01.T01 AT5G08305 23.864 352 245 8 223 573 24 353 1.87e-17 87.4
MsG0780039043.01.T01 AT5G08305 20.408 392 292 9 249 638 74 447 2.98e-16 83.6
MsG0780039043.01.T01 AT1G16480 22.829 403 273 9 198 583 355 736 1.94e-17 88.2
MsG0780039043.01.T01 AT1G16480 21.705 387 253 6 250 595 312 689 1.53e-15 82.0
MsG0780039043.01.T01 AT1G16480 20.253 237 180 3 304 539 26 254 6.72e-12 70.1
MsG0780039043.01.T01 AT2G44880 20.395 456 302 13 252 683 89 507 1.94e-17 87.4
MsG0780039043.01.T01 AT2G44880 23.013 478 312 19 231 687 2 444 1.33e-12 72.0
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MsG0780039043.01.T01 AT3G03580 21.763 363 260 9 216 572 310 654 1.81e-12 72.0
MsG0780039043.01.T01 AT3G61170 22.989 348 250 6 217 563 266 596 5.65e-16 83.2
MsG0780039043.01.T01 AT3G61170 22.030 404 244 11 215 572 162 540 5.95e-14 76.6
MsG0780039043.01.T01 AT3G61170 21.204 382 229 10 250 583 92 449 7.44e-12 69.7
MsG0780039043.01.T01 AT4G37380 23.636 330 190 10 227 517 78 384 6.21e-16 82.8
MsG0780039043.01.T01 AT5G08490 21.748 492 274 13 248 687 263 695 6.36e-16 82.8
MsG0780039043.01.T01 AT5G08490 21.748 492 274 13 248 687 263 695 6.36e-16 82.8
MsG0780039043.01.T01 AT5G08490 21.748 492 274 13 248 687 263 695 6.36e-16 82.8
MsG0780039043.01.T01 AT2G36730 24.746 295 173 7 243 536 143 389 7.54e-16 82.0
MsG0780039043.01.T01 AT2G36730 22.039 304 187 9 307 573 101 391 4.52e-11 67.0
MsG0780039043.01.T01 AT1G17630 20.213 470 352 8 213 671 89 546 8.71e-16 82.4
MsG0780039043.01.T01 AT1G17630 20.359 501 327 14 205 670 150 613 3.08e-15 80.9
MsG0780039043.01.T01 AT1G17630 20.213 470 352 8 213 671 89 546 8.71e-16 82.4
MsG0780039043.01.T01 AT1G17630 20.359 501 327 14 205 670 150 613 3.08e-15 80.9
MsG0780039043.01.T01 AT5G08490 21.704 493 273 14 248 687 263 695 8.90e-16 82.8
MsG0780039043.01.T01 AT5G08490 20.205 292 192 6 323 583 474 755 1.87e-12 72.0
MsG0780039043.01.T01 AT5G08490 21.704 493 273 14 248 687 263 695 8.90e-16 82.8
MsG0780039043.01.T01 AT5G08490 20.205 292 192 6 323 583 474 755 1.87e-12 72.0
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MsG0780039043.01.T01 AT5G08510 24.483 290 206 5 286 574 50 327 1.02e-15 81.6
MsG0780039043.01.T01 AT5G08510 23.052 308 190 5 216 522 120 381 8.12e-15 79.0
MsG0780039043.01.T01 AT3G46790 22.449 392 283 8 177 561 78 455 1.08e-15 82.0

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CAGAATTTATGAGAATAATT+TGG 0.111853 7:-57214964 MsG0780039043.01.T01:CDS
TCATTTCTTCGTACAGGTTT+AGG 0.178956 7:+57216581 None:intergenic
TTCATTATGTCGAAACAAAA+TGG 0.184081 7:-57217204 MsG0780039043.01.T01:CDS
GTTTACTTATAACACATATT+TGG 0.196579 7:-57216743 MsG0780039043.01.T01:CDS
GTAGAGTAAGTTAGCGTATT+TGG 0.198786 7:+57216331 None:intergenic
CCCTTCTGGCCAAATCAATT+TGG 0.229345 7:+57216701 None:intergenic
GTTGAGAATGAGAATGATTT+AGG 0.239114 7:+57214859 None:intergenic
GTGGTGGTGCTGCTGGTGGC+AGG 0.260369 7:-57217557 MsG0780039043.01.T01:CDS
ACTTTGGAATATGGAGTAAA+TGG 0.272942 7:-57216070 MsG0780039043.01.T01:CDS
CACTAAAGGTGAAATGTTTC+AGG 0.273239 7:-57216293 MsG0780039043.01.T01:CDS
GATTCCTACTAGTGTGTTAT+AGG 0.288669 7:+57216528 None:intergenic
TTACCTGCAAGCATTTAAAA+TGG 0.297728 7:+57215811 None:intergenic
CATTTCTTCGTACAGGTTTA+GGG 0.301660 7:+57216582 None:intergenic
TTGTAGCATTCTAACTGGTT+GGG 0.304353 7:-57215066 MsG0780039043.01.T01:intron
ATTTATATGCTAAAAGAGTT+TGG 0.312541 7:-57217267 MsG0780039043.01.T01:CDS
CTTGTGCAATGGTTCATTCA+TGG 0.313963 7:-57215238 MsG0780039043.01.T01:CDS
TCGGCCATGATTAGTGCTTT+TGG 0.314395 7:-57217051 MsG0780039043.01.T01:CDS
CCATCGCCAACTTTGGAATA+TGG 0.315302 7:-57216079 MsG0780039043.01.T01:CDS
ATCAGTGAGGGAATTATAAA+AGG 0.315861 7:+57215504 None:intergenic
AGAATTTATGAGAATAATTT+GGG 0.318356 7:-57214963 MsG0780039043.01.T01:CDS
GCTCCGCTTGTTTGATAATC+AGG 0.321412 7:-57215635 MsG0780039043.01.T01:CDS
TGAGAATAATTTGGGAAGAT+TGG 0.326773 7:-57214955 MsG0780039043.01.T01:CDS
ATCATTGATGCTGGGGCAAA+AGG 0.339365 7:-57216940 MsG0780039043.01.T01:CDS
GCTGCTGGTGGCAGGGGCAA+TGG 0.345945 7:-57217549 MsG0780039043.01.T01:CDS
ATTGGCACTCTTGGTAGGTT+AGG 0.346431 7:-57217147 MsG0780039043.01.T01:CDS
AGTAAGGAGTGGTTTGGTGG+AGG 0.348812 7:+57217786 None:intergenic
GCTGGTGGTGGTGGTGCTGC+TGG 0.352952 7:-57217564 MsG0780039043.01.T01:CDS
GGTGGTGCTGCTGGTGGCAG+GGG 0.355426 7:-57217555 MsG0780039043.01.T01:CDS
TACGCGGCCAAGATGCATTC+TGG 0.356042 7:-57217438 MsG0780039043.01.T01:CDS
TTGATGCTGTGGATTTGTTC+AGG 0.357740 7:-57217011 MsG0780039043.01.T01:CDS
GGGGAGATTAATCTTGCTTT+GGG 0.357886 7:-57217126 MsG0780039043.01.T01:CDS
GCTGCTGCTGCTGGTGGTGG+TGG 0.358161 7:-57217573 MsG0780039043.01.T01:CDS
GTAAGGAGTGGTTTGGTGGA+GGG 0.361052 7:+57217787 None:intergenic
GGGAGAAGGAACATTGAAAA+AGG 0.361304 7:-57215024 MsG0780039043.01.T01:CDS
AGGGGAGATTAATCTTGCTT+TGG 0.363967 7:-57217127 MsG0780039043.01.T01:CDS
AGAGTTCAAGATGGCAAGAT+TGG 0.364420 7:-57216251 MsG0780039043.01.T01:CDS
TAAGGAGTGGTTTGGTGGAG+GGG 0.368687 7:+57217788 None:intergenic
GCTGAAAATGTGACAACATT+TGG 0.368783 7:+57215833 None:intergenic
CGAATGGTCAATTTCTTGCT+TGG 0.372995 7:-57215288 MsG0780039043.01.T01:CDS
GAATTGTACGTTATCACATT+AGG 0.373336 7:+57216964 None:intergenic
TGGTTGAGATGCATCAATTA+TGG 0.373512 7:+57216099 None:intergenic
GGGTAAGCACAGTAAAATAA+TGG 0.373922 7:-57215045 MsG0780039043.01.T01:CDS
GGACCACAGGCGTATTGTTC+CGG 0.374269 7:-57216770 MsG0780039043.01.T01:CDS
AGATGTCGTCGAAGAGAGTT+TGG 0.374598 7:-57216669 MsG0780039043.01.T01:CDS
GACCTCCTGCCAGAAAATTC+AGG 0.375752 7:+57217468 None:intergenic
ATCTTCCAAGAGGTTGGCCT+TGG 0.376026 7:+57216606 None:intergenic
GAGTGGTTTGGTGGAGGGGT+TGG 0.385564 7:+57217792 None:intergenic
TAAGGCAGGCCAAATTGATT+TGG 0.386084 7:-57216710 MsG0780039043.01.T01:CDS
GTTGTAGCATTCTAACTGGT+TGG 0.388230 7:-57215067 MsG0780039043.01.T01:intron
TCATTGATGCTGGGGCAAAA+GGG 0.391406 7:-57216939 MsG0780039043.01.T01:CDS
TGGTGGTGCTGCTGGTGGCA+GGG 0.394727 7:-57217556 MsG0780039043.01.T01:CDS
ATTCGCCTTTCCACACATTT+CGG 0.397854 7:+57215306 None:intergenic
TATGTTGCTTATAGCAATGA+TGG 0.401814 7:-57216158 MsG0780039043.01.T01:CDS
GCACTGTAAGTGACCACATT+TGG 0.405146 7:+57216646 None:intergenic
GCACTGTGAGCATGTTTGTT+TGG 0.406403 7:+57217399 None:intergenic
GCTGCTGCTGTTGCTGAAGT+AGG 0.408656 7:-57217609 MsG0780039043.01.T01:CDS
TCGCCTCCTATGCTTATTGA+TGG 0.410728 7:-57216013 MsG0780039043.01.T01:CDS
TTCAAAATCCGGTCCTCCCC+TGG 0.411797 7:+57215974 None:intergenic
CATCTCTTCGAATACCCTTC+TGG 0.412017 7:+57216687 None:intergenic
CAAAATGGGAGGGTTGATAA+AGG 0.412260 7:-57217189 MsG0780039043.01.T01:CDS
CATCAAGGAAGCGCCCATTT+CGG 0.414288 7:+57217028 None:intergenic
TCTAGGAGCAGCAGGGAGTA+AGG 0.416560 7:+57217770 None:intergenic
GAGTTGAACGTGACCACATT+TGG 0.417693 7:+57216121 None:intergenic
GGGAGTAAGGAGTGGTTTGG+TGG 0.421188 7:+57217783 None:intergenic
TTTACTCCATATTCCAAAGT+TGG 0.421449 7:+57216073 None:intergenic
TCAGAGACGCGGAGCTGAAA+TGG 0.422776 7:-57215348 MsG0780039043.01.T01:intron
CCTTTCTGTTTGCGCATCGA+AGG 0.423272 7:-57216830 MsG0780039043.01.T01:CDS
TTGGCACTCTTGGTAGGTTA+GGG 0.424388 7:-57217146 MsG0780039043.01.T01:CDS
TTTGAAAGAGCTAGGCTTGA+AGG 0.425464 7:-57217099 MsG0780039043.01.T01:CDS
TGTTCAGGTCCATGAGTAGC+TGG 0.425595 7:-57216996 MsG0780039043.01.T01:CDS
ATCGAAGGGCATGTGGGAAA+TGG 0.430341 7:-57216815 MsG0780039043.01.T01:CDS
TACAATTCAATCATTGATGC+TGG 0.432368 7:-57216949 MsG0780039043.01.T01:CDS
ATCTCAACCATCGCCAACTT+TGG 0.433764 7:-57216086 MsG0780039043.01.T01:CDS
TTGTTTGATAATCAGGTGTA+TGG 0.439886 7:-57215628 MsG0780039043.01.T01:CDS
TCAGCATGTCTAGGAGCAGC+AGG 0.441756 7:+57217762 None:intergenic
GCTGTTGAAGCACTCCTTAA+CGG 0.443152 7:-57215002 MsG0780039043.01.T01:CDS
TTGGGAAGATTGGTGTCTCC+TGG 0.444594 7:-57214945 MsG0780039043.01.T01:CDS
TTACATATGAACATAAGTTA+TGG 0.446806 7:-57217305 MsG0780039043.01.T01:CDS
CTATGCCAAGGCCAACCTCT+TGG 0.447898 7:-57216611 MsG0780039043.01.T01:CDS
CTTAGCTTTCTGTTAAAAGC+TGG 0.449531 7:-57217360 MsG0780039043.01.T01:CDS
ATATTTGGACACCTTGTGTA+AGG 0.453940 7:-57216728 MsG0780039043.01.T01:CDS
GGTAAGCACAGTAAAATAAT+GGG 0.454249 7:-57215044 MsG0780039043.01.T01:CDS
GGAGCTTCATTTCTTCGTAC+AGG 0.457032 7:+57216575 None:intergenic
AGTGCTGCTGCTGCTGGTGG+TGG 0.457032 7:-57217576 MsG0780039043.01.T01:CDS
TAGGGCATCTTCCAAGAGGT+TGG 0.459897 7:+57216600 None:intergenic
GGTGGCAGGGGCAATGGCAG+AGG 0.460111 7:-57217543 MsG0780039043.01.T01:CDS
TGGGTTACAGAGAACAAGTA+TGG 0.463418 7:-57215585 MsG0780039043.01.T01:CDS
TCATTATGTCGAAACAAAAT+GGG 0.464595 7:-57217203 MsG0780039043.01.T01:CDS
CGCCTCCTATGCTTATTGAT+GGG 0.465929 7:-57216012 MsG0780039043.01.T01:CDS
CCCGGACAAAAGAGCATTGT+AGG 0.468764 7:+57216423 None:intergenic
ATCAGACACATTCAATATGA+AGG 0.469888 7:+57214807 None:intergenic
AGTGCTATGATTGGCACTCT+TGG 0.472598 7:-57217156 MsG0780039043.01.T01:CDS
AATAAAAGTGCTGCTGCTGC+TGG 0.472734 7:-57217582 MsG0780039043.01.T01:CDS
GCTCGAACATCTTCAAAATC+CGG 0.475411 7:+57215963 None:intergenic
TTGTGGTGCTGCTTGTGCAA+TGG 0.477215 7:-57215249 MsG0780039043.01.T01:CDS
GGAAGGAAGGCAATCAAGAT+TGG 0.477990 7:-57217493 MsG0780039043.01.T01:CDS
CGTAACCAATGGACTGTTGA+TGG 0.480343 7:-57215605 MsG0780039043.01.T01:CDS
GCAACAGCAGCAGCAGCTAA+AGG 0.481618 7:+57217618 None:intergenic
AGAGCTAGGCTTGAAGGGTA+TGG 0.483223 7:-57217093 MsG0780039043.01.T01:CDS
TATGCTGTGGCACTTTGGTC+AGG 0.483371 7:-57215482 MsG0780039043.01.T01:intron
AAGACTGTTTGAAGAGATGA+AGG 0.483843 7:-57216368 MsG0780039043.01.T01:CDS
AGCACTAATCATGGCCGAAA+AGG 0.488580 7:+57217056 None:intergenic
TGTAGCATTCTAACTGGTTG+GGG 0.490078 7:-57215065 MsG0780039043.01.T01:intron
GCTGAAATGGTTGTAATTGA+AGG 0.491512 7:-57215335 MsG0780039043.01.T01:CDS
CTTTCTGTTTGCGCATCGAA+GGG 0.495145 7:-57216829 MsG0780039043.01.T01:CDS
GGTGGTGGTGGTGCTGCTGG+TGG 0.495630 7:-57217561 MsG0780039043.01.T01:CDS
GAATTGTAAGTAAGCCGATC+TGG 0.496260 7:+57216856 None:intergenic
TGCAAAGAGATGGAGAGAAC+TGG 0.501428 7:-57216466 MsG0780039043.01.T01:CDS
TTGCCTTCCTTCCAGAAAAG+TGG 0.501823 7:+57217503 None:intergenic
AGAATAAGCCAGGGGAGGAC+CGG 0.503360 7:-57215982 MsG0780039043.01.T01:CDS
ATTGTTGGTCTTCGTCGTCT+AGG 0.505140 7:-57217665 MsG0780039043.01.T01:CDS
AAGTTAGTTAGTGCTATGAT+TGG 0.505557 7:-57217165 MsG0780039043.01.T01:CDS
TTGGACACCTTGTGTAAGGC+AGG 0.509956 7:-57216724 MsG0780039043.01.T01:CDS
CTGGAGAAGTGCTGACTGCA+TGG 0.511008 7:-57214926 MsG0780039043.01.T01:CDS
GCAGGGAGTAAGGAGTGGTT+TGG 0.511467 7:+57217780 None:intergenic
ATAAACGTCCTAGAGATTGT+TGG 0.513816 7:-57217680 MsG0780039043.01.T01:CDS
ACTGATATGCTGTGGCACTT+TGG 0.515757 7:-57215487 MsG0780039043.01.T01:CDS
AAGGTGAACCCATGCCGTTA+AGG 0.516446 7:+57214988 None:intergenic
GTGTCCTATAACACACTAGT+AGG 0.517471 7:-57216532 MsG0780039043.01.T01:CDS
CATGCAGTCAGCACTTCTCC+AGG 0.520562 7:+57214927 None:intergenic
TGGGATTGTTTGAAAGAGCT+AGG 0.521127 7:-57217107 MsG0780039043.01.T01:CDS
GTTCAGGTCCATGAGTAGCT+GGG 0.522519 7:-57216995 MsG0780039043.01.T01:CDS
CGGCATTCCAGAATGCATCT+TGG 0.524738 7:+57217431 None:intergenic
CTTATAGCAATGATGGAGAA+AGG 0.526682 7:-57216151 MsG0780039043.01.T01:CDS
GCCAAATTGATTTGGCCAGA+AGG 0.528041 7:-57216702 MsG0780039043.01.T01:CDS
ACAATTCAATCATTGATGCT+GGG 0.529311 7:-57216948 MsG0780039043.01.T01:CDS
ACTGCATGGCTGACTCAACC+TGG 0.529912 7:-57214912 MsG0780039043.01.T01:CDS
CCAAATTGATTTGGCCAGAA+GGG 0.530494 7:-57216701 MsG0780039043.01.T01:CDS
TACAACTCCCCAGCTACTCA+TGG 0.531220 7:+57216987 None:intergenic
TAAAAGGCAGACGAAGTTGA+AGG 0.532758 7:+57215520 None:intergenic
CATGCCATGCTTGCCATACC+CGG 0.533123 7:+57216405 None:intergenic
TGTTTGTTTGGAGTCACCCT+CGG 0.534188 7:+57217411 None:intergenic
CTATGATTGGCACTCTTGGT+AGG 0.534679 7:-57217152 MsG0780039043.01.T01:CDS
GCCTCCTATGCTTATTGATG+GGG 0.539346 7:-57216011 MsG0780039043.01.T01:CDS
TCGGCCAAAAGCACTAATCA+TGG 0.541479 7:+57217047 None:intergenic
GTGTTATAAGTAAACACATC+CGG 0.542812 7:+57216751 None:intergenic
TGGGCGCTTCCTTGATGCTG+TGG 0.543457 7:-57217022 MsG0780039043.01.T01:CDS
TTGAAAGAGCTAGGCTTGAA+GGG 0.547653 7:-57217098 MsG0780039043.01.T01:CDS
TCACAGTGCTGCGGCTGACG+AGG 0.548183 7:-57217385 MsG0780039043.01.T01:CDS
ATGATCGATATGTACACTAA+AGG 0.552565 7:-57216307 MsG0780039043.01.T01:CDS
CATTGATGCTGGGGCAAAAG+GGG 0.552849 7:-57216938 MsG0780039043.01.T01:CDS
GATCCTTACTTCACAAACAT+AGG 0.554228 7:+57215173 None:intergenic
TTCAGGTCCATGAGTAGCTG+GGG 0.555746 7:-57216994 MsG0780039043.01.T01:CDS
TGAAGCACTCCTTAACGGCA+TGG 0.556075 7:-57214997 MsG0780039043.01.T01:CDS
TTGTCCGGGTATGGCAAGCA+TGG 0.562253 7:-57216409 MsG0780039043.01.T01:CDS
TATTGAGAAGTGCAAAGAGA+TGG 0.563627 7:-57216476 MsG0780039043.01.T01:CDS
GCCCCATCAATAAGCATAGG+AGG 0.564423 7:+57216010 None:intergenic
CTGAAATGGTTGTAATTGAA+GGG 0.565604 7:-57215334 MsG0780039043.01.T01:CDS
CCATATTCCAAAGTTGGCGA+TGG 0.570685 7:+57216079 None:intergenic
GAAGCACTCCTTAACGGCAT+GGG 0.571219 7:-57214996 MsG0780039043.01.T01:CDS
CACAGTAAAATAATGGGAGA+AGG 0.571635 7:-57215038 MsG0780039043.01.T01:CDS
CCAACGGCATAATGCCAGAT+CGG 0.572820 7:-57216870 MsG0780039043.01.T01:CDS
GGTCACTTACAGTGCAATGA+TGG 0.573958 7:-57216638 MsG0780039043.01.T01:CDS
CCTTCGATGCGCAAACAGAA+AGG 0.574233 7:+57216830 None:intergenic
GATCTGCATCTGATGTCTTG+TGG 0.574762 7:-57215266 MsG0780039043.01.T01:CDS
GTTCGATGAAATCATGCGCA+TGG 0.574949 7:-57215545 MsG0780039043.01.T01:CDS
TTTGCGCATCGAAGGGCATG+TGG 0.576722 7:-57216822 MsG0780039043.01.T01:CDS
CAGATAAAGAAGAATAGAAG+TGG 0.577265 7:-57215917 MsG0780039043.01.T01:CDS
CAATTCAATCATTGATGCTG+GGG 0.581379 7:-57216947 MsG0780039043.01.T01:CDS
GTAACCCATCAACAGTCCAT+TGG 0.583881 7:+57215600 None:intergenic
CCGATCTGGCATTATGCCGT+TGG 0.584083 7:+57216870 None:intergenic
CAGGTGTATGGCGTAACCAA+TGG 0.585578 7:-57215616 MsG0780039043.01.T01:CDS
TGAAATGTTTCAGGAAGCGA+TGG 0.586072 7:-57216284 MsG0780039043.01.T01:CDS
CTACGCAGCTTGAAAACACC+AGG 0.589513 7:+57214837 None:intergenic
TTATTCTCATAAATTCTGAA+AGG 0.593975 7:+57214969 None:intergenic
TTATGTCGAAACAAAATGGG+AGG 0.594963 7:-57217200 MsG0780039043.01.T01:CDS
AATCATTCTCATTCTCAACC+TGG 0.598385 7:-57214855 MsG0780039043.01.T01:CDS
TGAACAAATCCACAGCATCA+AGG 0.598906 7:+57217013 None:intergenic
CAGGAGGTCAACGCGGTACG+CGG 0.602960 7:-57217454 MsG0780039043.01.T01:CDS
ACTTACAGTGCAATGATGGA+TGG 0.606528 7:-57216634 MsG0780039043.01.T01:CDS
TATGATGAAATGATAGCCAA+CGG 0.606536 7:-57216886 MsG0780039043.01.T01:CDS
AGACGCCGAAATGTGTGGAA+AGG 0.607515 7:-57215311 MsG0780039043.01.T01:CDS
AAGGGAGACGCCGAAATGTG+TGG 0.607661 7:-57215316 MsG0780039043.01.T01:CDS
TAAAGGTGCAGAGTGTGAGT+TGG 0.609746 7:+57217635 None:intergenic
CTCTATCAAGACAAACAGAT+CGG 0.610820 7:+57216554 None:intergenic
CAGCATGTCTAGGAGCAGCA+GGG 0.613056 7:+57217763 None:intergenic
GAAGAGAGTTTGGCCAAATG+TGG 0.616037 7:-57216659 MsG0780039043.01.T01:CDS
CCTTCCTTCCAGAAAAGTGG+AGG 0.617578 7:+57217506 None:intergenic
AAAAGTGCTGCTGCTGCTGG+TGG 0.618536 7:-57217579 MsG0780039043.01.T01:CDS
TATTGAGTGAAATGGACCAC+AGG 0.618682 7:-57216783 MsG0780039043.01.T01:CDS
ATATGAACATAAGTTATGGA+AGG 0.619771 7:-57217301 MsG0780039043.01.T01:CDS
GACGAAGACCAACAATCTCT+AGG 0.621136 7:+57217672 None:intergenic
TCAGACACATTCAATATGAA+GGG 0.630744 7:+57214808 None:intergenic
AAAGCCCCATCAATAAGCAT+AGG 0.632516 7:+57216007 None:intergenic
AGATGCATTCTGGAATGCCG+AGG 0.632932 7:-57217428 MsG0780039043.01.T01:CDS
ACACCTGATTATCAAACAAG+CGG 0.633065 7:+57215632 None:intergenic
AATTTGGCCTGCCTTACACA+AGG 0.634462 7:+57216717 None:intergenic
TGGCACTCTTGGTAGGTTAG+GGG 0.634687 7:-57217145 MsG0780039043.01.T01:CDS
GTGCCACAGCATATCAGTGA+GGG 0.634708 7:+57215492 None:intergenic
GTAACCAATGGACTGTTGAT+GGG 0.634765 7:-57215604 MsG0780039043.01.T01:CDS
GAAATGTGTGGAAAGGCGAA+TGG 0.634942 7:-57215304 MsG0780039043.01.T01:CDS
AAGACAAACAGTGCATATTG+TGG 0.638168 7:-57215889 MsG0780039043.01.T01:CDS
GAAAGGAATAAAGCCAAATG+TGG 0.641924 7:-57216134 MsG0780039043.01.T01:CDS
GAGCAGCAGGGAGTAAGGAG+TGG 0.642962 7:+57217775 None:intergenic
TGTTTGAAGAGATGAAGGCA+CGG 0.643459 7:-57216363 MsG0780039043.01.T01:CDS
TATGTCGAAACAAAATGGGA+GGG 0.643664 7:-57217199 MsG0780039043.01.T01:CDS
GATGCATTCTGGAATGCCGA+GGG 0.647748 7:-57217427 MsG0780039043.01.T01:CDS
TTGCGCATCGAAGGGCATGT+GGG 0.648600 7:-57216821 MsG0780039043.01.T01:CDS
TGTTTATAGAGAGTTCAAGA+TGG 0.649322 7:-57216260 MsG0780039043.01.T01:CDS
ACAAGCGAATCGAAAACACC+AGG 0.660747 7:+57214894 None:intergenic
GGTTTAGGGCATCTTCCAAG+AGG 0.661178 7:+57216596 None:intergenic
ATTCCCTCACTGATATGCTG+TGG 0.661195 7:-57215495 MsG0780039043.01.T01:CDS
TGTTATTGACATCAGAGACG+CGG 0.700835 7:-57215359 MsG0780039043.01.T01:intron
CAAACATGCTCACAGTGCTG+CGG 0.703611 7:-57217394 MsG0780039043.01.T01:CDS
TTTCTGGCAGGAGGTCAACG+CGG 0.711932 7:-57217461 MsG0780039043.01.T01:CDS
CATCCGGAACAATACGCCTG+TGG 0.722398 7:+57216767 None:intergenic
AATGATGGATGGCTATGCCA+AGG 0.731798 7:-57216623 MsG0780039043.01.T01:CDS
AGTGCCACAGCATATCAGTG+AGG 0.740287 7:+57215491 None:intergenic
TAGGACGTTTATGAGTACTG+TGG 0.743829 7:+57217691 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! TTTTATTGTTTTCATTTAAT+TGG - Chr7:57217489-57217508 MsG0780039043.01.T01:CDS 10.0%
!! AGAATTTATGAGAATAATTT+GGG - Chr7:57217659-57217678 MsG0780039043.01.T01:CDS 15.0%
!! GAAAACAATAAAAAATTCAT+AGG + Chr7:57217482-57217501 None:intergenic 15.0%
!! ATTTATATGCTAAAAGAGTT+TGG - Chr7:57215355-57215374 MsG0780039043.01.T01:intron 20.0%
!! CAAATTATATGGTTTGAAAA+TGG + Chr7:57216909-57216928 None:intergenic 20.0%
!! CAGAATTTATGAGAATAATT+TGG - Chr7:57217658-57217677 MsG0780039043.01.T01:CDS 20.0%
!! GTTTACTTATAACACATATT+TGG - Chr7:57215879-57215898 MsG0780039043.01.T01:CDS 20.0%
!! TCAAAAATTATTGAGTGAAA+TGG - Chr7:57215831-57215850 MsG0780039043.01.T01:CDS 20.0%
!! TCAAAATGGATCAAATTATA+TGG + Chr7:57216920-57216939 None:intergenic 20.0%
!! TTACATATGAACATAAGTTA+TGG - Chr7:57215317-57215336 MsG0780039043.01.T01:CDS 20.0%
!! TTATTCTCATAAATTCTGAA+AGG + Chr7:57217656-57217675 None:intergenic 20.0%
! ATAGATACACTATGCAAAAA+CGG - Chr7:57216423-57216442 MsG0780039043.01.T01:CDS 25.0%
! ATATGAACATAAGTTATGGA+AGG - Chr7:57215321-57215340 MsG0780039043.01.T01:CDS 25.0%
! CAAAACTAGCAAATTACTAA+TGG + Chr7:57217178-57217197 None:intergenic 25.0%
! TCATTATGTCGAAACAAAAT+GGG - Chr7:57215419-57215438 MsG0780039043.01.T01:intron 25.0%
! TTCATTATGTCGAAACAAAA+TGG - Chr7:57215418-57215437 MsG0780039043.01.T01:intron 25.0%
!!! GTCTAATGTTTTGTTGATTT+TGG + Chr7:57214904-57214923 None:intergenic 25.0%
AAGTTAGTTAGTGCTATGAT+TGG - Chr7:57215457-57215476 MsG0780039043.01.T01:intron 30.0%
ACAATTCAATCATTGATGCT+GGG - Chr7:57215674-57215693 MsG0780039043.01.T01:CDS 30.0%
ATCAGTGAGGGAATTATAAA+AGG + Chr7:57217121-57217140 None:intergenic 30.0%
ATGATCGATATGTACACTAA+AGG - Chr7:57216315-57216334 MsG0780039043.01.T01:CDS 30.0%
CAGATAAAGAAGAATAGAAG+TGG - Chr7:57216705-57216724 MsG0780039043.01.T01:CDS 30.0%
CTGAAATGGTTGTAATTGAA+GGG - Chr7:57217288-57217307 MsG0780039043.01.T01:CDS 30.0%
GAATTGTACGTTATCACATT+AGG + Chr7:57215661-57215680 None:intergenic 30.0%
GGTAAGCACAGTAAAATAAT+GGG - Chr7:57217578-57217597 MsG0780039043.01.T01:CDS 30.0%
GTGTTATAAGTAAACACATC+CGG + Chr7:57215874-57215893 None:intergenic 30.0%
GTTGAGAATGAGAATGATTT+AGG + Chr7:57217766-57217785 None:intergenic 30.0%
TACAATTCAATCATTGATGC+TGG - Chr7:57215673-57215692 MsG0780039043.01.T01:CDS 30.0%
TAGATACACTATGCAAAAAC+GGG - Chr7:57216424-57216443 MsG0780039043.01.T01:CDS 30.0%
TATGATGAAATGATAGCCAA+CGG - Chr7:57215736-57215755 MsG0780039043.01.T01:intron 30.0%
TGAGAATAATTTGGGAAGAT+TGG - Chr7:57217667-57217686 MsG0780039043.01.T01:CDS 30.0%
TGTTTATAGAGAGTTCAAGA+TGG - Chr7:57216362-57216381 MsG0780039043.01.T01:CDS 30.0%
TTACCTGCAAGCATTTAAAA+TGG + Chr7:57216814-57216833 None:intergenic 30.0%
TTTACTCCATATTCCAAAGT+TGG + Chr7:57216552-57216571 None:intergenic 30.0%
! TATGTTGCTTATAGCAATGA+TGG - Chr7:57216464-57216483 MsG0780039043.01.T01:CDS 30.0%
! TTATGATTTTCAGCATGTCT+AGG + Chr7:57214872-57214891 None:intergenic 30.0%
! TTGTTTGATAATCAGGTGTA+TGG - Chr7:57216994-57217013 MsG0780039043.01.T01:CDS 30.0%
!! ACTTTGGAATATGGAGTAAA+TGG - Chr7:57216552-57216571 MsG0780039043.01.T01:CDS 30.0%
!! TTGCATAGTTCTCTTTTTCA+AGG - Chr7:57217416-57217435 MsG0780039043.01.T01:CDS 30.0%
!! TTTTGTTGTAGCATTCTAAC+TGG - Chr7:57217551-57217570 MsG0780039043.01.T01:CDS 30.0%
AAGACAAACAGTGCATATTG+TGG - Chr7:57216733-57216752 MsG0780039043.01.T01:CDS 35.0%
AAGACTGTTTGAAGAGATGA+AGG - Chr7:57216254-57216273 MsG0780039043.01.T01:CDS 35.0%
AATCATTCTCATTCTCAACC+TGG - Chr7:57217767-57217786 MsG0780039043.01.T01:CDS 35.0%
ACACCTGATTATCAAACAAG+CGG + Chr7:57216993-57217012 None:intergenic 35.0%
ACTAGCAAATTACTAATGGC+TGG + Chr7:57217174-57217193 None:intergenic 35.0%
ATAAACGTCCTAGAGATTGT+TGG - Chr7:57214942-57214961 MsG0780039043.01.T01:CDS 35.0%
ATATTTGGACACCTTGTGTA+AGG - Chr7:57215894-57215913 MsG0780039043.01.T01:CDS 35.0%
CAATTCAATCATTGATGCTG+GGG - Chr7:57215675-57215694 MsG0780039043.01.T01:CDS 35.0%
CACTAAAGGTGAAATGTTTC+AGG - Chr7:57216329-57216348 MsG0780039043.01.T01:CDS 35.0%
CATTTCTTCGTACAGGTTTA+GGG + Chr7:57216043-57216062 None:intergenic 35.0%
CTCTATCAAGACAAACAGAT+CGG + Chr7:57216071-57216090 None:intergenic 35.0%
GAAAGGAATAAAGCCAAATG+TGG - Chr7:57216488-57216507 MsG0780039043.01.T01:CDS 35.0%
GATCCTTACTTCACAAACAT+AGG + Chr7:57217452-57217471 None:intergenic 35.0%
GATTCCTACTAGTGTGTTAT+AGG + Chr7:57216097-57216116 None:intergenic 35.0%
GCTGAAAATGTGACAACATT+TGG + Chr7:57216792-57216811 None:intergenic 35.0%
GCTGAAATGGTTGTAATTGA+AGG - Chr7:57217287-57217306 MsG0780039043.01.T01:CDS 35.0%
GGGTAAGCACAGTAAAATAA+TGG - Chr7:57217577-57217596 MsG0780039043.01.T01:CDS 35.0%
GTAGAGTAAGTTAGCGTATT+TGG + Chr7:57216294-57216313 None:intergenic 35.0%
TATGTCGAAACAAAATGGGA+GGG - Chr7:57215423-57215442 MsG0780039043.01.T01:intron 35.0%
TCATTTCTTCGTACAGGTTT+AGG + Chr7:57216044-57216063 None:intergenic 35.0%
TGGTTGAGATGCATCAATTA+TGG + Chr7:57216526-57216545 None:intergenic 35.0%
TTATGTCGAAACAAAATGGG+AGG - Chr7:57215422-57215441 MsG0780039043.01.T01:intron 35.0%
TTGTAGCATTCTAACTGGTT+GGG - Chr7:57217556-57217575 MsG0780039043.01.T01:CDS 35.0%
! CACAGTAAAATAATGGGAGA+AGG - Chr7:57217584-57217603 MsG0780039043.01.T01:CDS 35.0%
! CTTAGCTTTCTGTTAAAAGC+TGG - Chr7:57215262-57215281 MsG0780039043.01.T01:CDS 35.0%
! CTTATAGCAATGATGGAGAA+AGG - Chr7:57216471-57216490 MsG0780039043.01.T01:CDS 35.0%
! TATTGAGAAGTGCAAAGAGA+TGG - Chr7:57216146-57216165 MsG0780039043.01.T01:CDS 35.0%
!! AAGCACTGTGTATTCCTTTT+CGG - Chr7:57215552-57215571 MsG0780039043.01.T01:CDS 35.0%
!! ACTATGCAAAAACGGGTTAA+TGG - Chr7:57216431-57216450 MsG0780039043.01.T01:CDS 35.0%
!! ATAGGAGGCGATTTTTCAAT+CGG + Chr7:57216600-57216619 None:intergenic 35.0%
!! TTTTTCAATCGGATGGTCAA+TGG + Chr7:57216589-57216608 None:intergenic 35.0%
AAAGCCCCATCAATAAGCAT+AGG + Chr7:57216618-57216637 None:intergenic 40.0%
AGAGTTCAAGATGGCAAGAT+TGG - Chr7:57216371-57216390 MsG0780039043.01.T01:CDS 40.0%
AGGGGAGATTAATCTTGCTT+TGG - Chr7:57215495-57215514 MsG0780039043.01.T01:CDS 40.0%
ATTCGCCTTTCCACACATTT+CGG + Chr7:57217319-57217338 None:intergenic 40.0%
CGAATGGTCAATTTCTTGCT+TGG - Chr7:57217334-57217353 MsG0780039043.01.T01:CDS 40.0%
CTGCCTATGTTTGTGAAGTA+AGG - Chr7:57217446-57217465 MsG0780039043.01.T01:CDS 40.0%
CTTGTGCAATGGTTCATTCA+TGG - Chr7:57217384-57217403 MsG0780039043.01.T01:CDS 40.0%
GAATTGTAAGTAAGCCGATC+TGG + Chr7:57215769-57215788 None:intergenic 40.0%
GCTCGAACATCTTCAAAATC+CGG + Chr7:57216662-57216681 None:intergenic 40.0%
GGGAGAAGGAACATTGAAAA+AGG - Chr7:57217598-57217617 MsG0780039043.01.T01:CDS 40.0%
GGGGAGATTAATCTTGCTTT+GGG - Chr7:57215496-57215515 MsG0780039043.01.T01:CDS 40.0%
GTGTCCTATAACACACTAGT+AGG - Chr7:57216090-57216109 MsG0780039043.01.T01:CDS 40.0%
GTTGTAGCATTCTAACTGGT+TGG - Chr7:57217555-57217574 MsG0780039043.01.T01:CDS 40.0%
TAAAAGGCAGACGAAGTTGA+AGG + Chr7:57217105-57217124 None:intergenic 40.0%
TAAGGCAGGCCAAATTGATT+TGG - Chr7:57215912-57215931 MsG0780039043.01.T01:CDS 40.0%
TATTGAGTGAAATGGACCAC+AGG - Chr7:57215839-57215858 MsG0780039043.01.T01:CDS 40.0%
TGAAATGTTTCAGGAAGCGA+TGG - Chr7:57216338-57216357 MsG0780039043.01.T01:CDS 40.0%
TGAACAAATCCACAGCATCA+AGG + Chr7:57215612-57215631 None:intergenic 40.0%
TGGGATTGTTTGAAAGAGCT+AGG - Chr7:57215515-57215534 MsG0780039043.01.T01:CDS 40.0%
TGGGTTACAGAGAACAAGTA+TGG - Chr7:57217037-57217056 MsG0780039043.01.T01:CDS 40.0%
TGTAGCATTCTAACTGGTTG+GGG - Chr7:57217557-57217576 MsG0780039043.01.T01:CDS 40.0%
TGTTATTGACATCAGAGACG+CGG - Chr7:57217263-57217282 MsG0780039043.01.T01:CDS 40.0%
TGTTTGAAGAGATGAAGGCA+CGG - Chr7:57216259-57216278 MsG0780039043.01.T01:CDS 40.0%
TTGAAAGAGCTAGGCTTGAA+GGG - Chr7:57215524-57215543 MsG0780039043.01.T01:CDS 40.0%
TTTGAAAGAGCTAGGCTTGA+AGG - Chr7:57215523-57215542 MsG0780039043.01.T01:CDS 40.0%
! ACCTACAATGCTCTTTTGTC+CGG - Chr7:57216198-57216217 MsG0780039043.01.T01:CDS 40.0%
! ACTTACAGTGCAATGATGGA+TGG - Chr7:57215988-57216007 MsG0780039043.01.T01:CDS 40.0%
! ATTAGTGCTTTTGGCCGAAA+TGG - Chr7:57215580-57215599 MsG0780039043.01.T01:CDS 40.0%
! TAGGACGTTTATGAGTACTG+TGG + Chr7:57214934-57214953 None:intergenic 40.0%
! TTAGTGCTTTTGGCCGAAAT+GGG - Chr7:57215581-57215600 MsG0780039043.01.T01:CDS 40.0%
! TTGATGCTGTGGATTTGTTC+AGG - Chr7:57215611-57215630 MsG0780039043.01.T01:CDS 40.0%
!! AGATTGGCTCCTGAATTTTC+TGG - Chr7:57215145-57215164 MsG0780039043.01.T01:intron 40.0%
!! CAAAATGGGAGGGTTGATAA+AGG - Chr7:57215433-57215452 MsG0780039043.01.T01:intron 40.0%
!! CAGCCATTTTAAATGCTTGC+AGG - Chr7:57216808-57216827 MsG0780039043.01.T01:CDS 40.0%
!! CCAAATTGATTTGGCCAGAA+GGG - Chr7:57215921-57215940 MsG0780039043.01.T01:CDS 40.0%
!! GTAACCAATGGACTGTTGAT+GGG - Chr7:57217018-57217037 MsG0780039043.01.T01:CDS 40.0%
!! TATTCCTCCACTTTTCTGGA+AGG - Chr7:57215112-57215131 MsG0780039043.01.T01:intron 40.0%
!! TGCATATTCCTCCACTTTTC+TGG - Chr7:57215108-57215127 MsG0780039043.01.T01:intron 40.0%
AATTTGGCCTGCCTTACACA+AGG + Chr7:57215908-57215927 None:intergenic 45.0%
ACAAGCGAATCGAAAACACC+AGG + Chr7:57217731-57217750 None:intergenic 45.0%
ACTGATATGCTGTGGCACTT+TGG - Chr7:57217135-57217154 MsG0780039043.01.T01:CDS 45.0%
AGATGTCGTCGAAGAGAGTT+TGG - Chr7:57215953-57215972 MsG0780039043.01.T01:CDS 45.0%
AGCACTAATCATGGCCGAAA+AGG + Chr7:57215569-57215588 None:intergenic 45.0%
AGTGCTATGATTGGCACTCT+TGG - Chr7:57215466-57215485 MsG0780039043.01.T01:intron 45.0%
ATCATTGATGCTGGGGCAAA+AGG - Chr7:57215682-57215701 MsG0780039043.01.T01:intron 45.0%
ATCTCAACCATCGCCAACTT+TGG - Chr7:57216536-57216555 MsG0780039043.01.T01:CDS 45.0%
ATTCCCTCACTGATATGCTG+TGG - Chr7:57217127-57217146 MsG0780039043.01.T01:CDS 45.0%
ATTGGCACTCTTGGTAGGTT+AGG - Chr7:57215475-57215494 MsG0780039043.01.T01:intron 45.0%
CATCTCTTCGAATACCCTTC+TGG + Chr7:57215938-57215957 None:intergenic 45.0%
CCATATTCCAAAGTTGGCGA+TGG + Chr7:57216546-57216565 None:intergenic 45.0%
CCCTTCTGGCCAAATCAATT+TGG + Chr7:57215924-57215943 None:intergenic 45.0%
CGCCTCCTATGCTTATTGAT+GGG - Chr7:57216610-57216629 MsG0780039043.01.T01:CDS 45.0%
CTATGATTGGCACTCTTGGT+AGG - Chr7:57215470-57215489 MsG0780039043.01.T01:intron 45.0%
CTTTCTGTTTGCGCATCGAA+GGG - Chr7:57215793-57215812 MsG0780039043.01.T01:intron 45.0%
GAAATGTGTGGAAAGGCGAA+TGG - Chr7:57217318-57217337 MsG0780039043.01.T01:CDS 45.0%
GAAGAGAGTTTGGCCAAATG+TGG - Chr7:57215963-57215982 MsG0780039043.01.T01:CDS 45.0%
GACGAAGACCAACAATCTCT+AGG + Chr7:57214953-57214972 None:intergenic 45.0%
GAGTTGAACGTGACCACATT+TGG + Chr7:57216504-57216523 None:intergenic 45.0%
GATCTGCATCTGATGTCTTG+TGG - Chr7:57217356-57217375 MsG0780039043.01.T01:CDS 45.0%
GCACTGTAAGTGACCACATT+TGG + Chr7:57215979-57215998 None:intergenic 45.0%
GCACTGTGAGCATGTTTGTT+TGG + Chr7:57215226-57215245 None:intergenic 45.0%
GCCTCCTATGCTTATTGATG+GGG - Chr7:57216611-57216630 MsG0780039043.01.T01:CDS 45.0%
GGAAGGAAGGCAATCAAGAT+TGG - Chr7:57215129-57215148 MsG0780039043.01.T01:intron 45.0%
GGAGCTTCATTTCTTCGTAC+AGG + Chr7:57216050-57216069 None:intergenic 45.0%
GGTCACTTACAGTGCAATGA+TGG - Chr7:57215984-57216003 MsG0780039043.01.T01:CDS 45.0%
GTAACCCATCAACAGTCCAT+TGG + Chr7:57217025-57217044 None:intergenic 45.0%
GTTCGATGAAATCATGCGCA+TGG - Chr7:57217077-57217096 MsG0780039043.01.T01:CDS 45.0%
TCATTGATGCTGGGGCAAAA+GGG - Chr7:57215683-57215702 MsG0780039043.01.T01:intron 45.0%
TCGCCTCCTATGCTTATTGA+TGG - Chr7:57216609-57216628 MsG0780039043.01.T01:CDS 45.0%
TGCAAAGAGATGGAGAGAAC+TGG - Chr7:57216156-57216175 MsG0780039043.01.T01:CDS 45.0%
TTGCAGCGACTGCATCAAAA+TGG + Chr7:57216934-57216953 None:intergenic 45.0%
TTGCCTTCCTTCCAGAAAAG+TGG + Chr7:57215122-57215141 None:intergenic 45.0%
TTGGCACTCTTGGTAGGTTA+GGG - Chr7:57215476-57215495 MsG0780039043.01.T01:intron 45.0%
! AATGCTCTTTTGTCCGGGTA+TGG - Chr7:57216204-57216223 MsG0780039043.01.T01:CDS 45.0%
! AGCAGCAGCAGCACTTTTAT+TGG + Chr7:57215041-57215060 None:intergenic 45.0%
! CCTACAATGCTCTTTTGTCC+GGG - Chr7:57216199-57216218 MsG0780039043.01.T01:CDS 45.0%
! GCTCCGCTTGTTTGATAATC+AGG - Chr7:57216987-57217006 MsG0780039043.01.T01:CDS 45.0%
! GCTGTTGAAGCACTCCTTAA+CGG - Chr7:57217620-57217639 MsG0780039043.01.T01:CDS 45.0%
! GGCTTTTCAGAATAAGCCAG+GGG - Chr7:57216632-57216651 MsG0780039043.01.T01:CDS 45.0%
! GGGCTTTTCAGAATAAGCCA+GGG - Chr7:57216631-57216650 MsG0780039043.01.T01:CDS 45.0%
! TAAAGGTGCAGAGTGTGAGT+TGG + Chr7:57214990-57215009 None:intergenic 45.0%
! TCGGCCATGATTAGTGCTTT+TGG - Chr7:57215571-57215590 MsG0780039043.01.T01:CDS 45.0%
! TGTTTGTTTGGAGTCACCCT+CGG + Chr7:57215214-57215233 None:intergenic 45.0%
! TTTTCAGAATAAGCCAGGGG+AGG - Chr7:57216635-57216654 MsG0780039043.01.T01:CDS 45.0%
!! AATAAAAGTGCTGCTGCTGC+TGG - Chr7:57215040-57215059 MsG0780039043.01.T01:CDS 45.0%
!! AATGATGGATGGCTATGCCA+AGG - Chr7:57215999-57216018 MsG0780039043.01.T01:CDS 45.0%
!! ATTGTTGGTCTTCGTCGTCT+AGG - Chr7:57214957-57214976 MsG0780039043.01.T01:CDS 45.0%
!! CCATCGCCAACTTTGGAATA+TGG - Chr7:57216543-57216562 MsG0780039043.01.T01:CDS 45.0%
!! CGTAACCAATGGACTGTTGA+TGG - Chr7:57217017-57217036 MsG0780039043.01.T01:CDS 45.0%
!! GAGGCGATTTTTCAATCGGA+TGG + Chr7:57216596-57216615 None:intergenic 45.0%
!! GCCAAATTGATTTGGCCAGA+AGG - Chr7:57215920-57215939 MsG0780039043.01.T01:CDS 45.0%
!! TCGGCCAAAAGCACTAATCA+TGG + Chr7:57215578-57215597 None:intergenic 45.0%
AAGGTGAACCCATGCCGTTA+AGG + Chr7:57217637-57217656 None:intergenic 50.0%
AGACGCCGAAATGTGTGGAA+AGG - Chr7:57217311-57217330 MsG0780039043.01.T01:CDS 50.0%
AGAGCTAGGCTTGAAGGGTA+TGG - Chr7:57215529-57215548 MsG0780039043.01.T01:CDS 50.0%
AGTGCCACAGCATATCAGTG+AGG + Chr7:57217134-57217153 None:intergenic 50.0%
CAAACATGCTCACAGTGCTG+CGG - Chr7:57215228-57215247 MsG0780039043.01.T01:CDS 50.0%
CAGGTGTATGGCGTAACCAA+TGG - Chr7:57217006-57217025 MsG0780039043.01.T01:CDS 50.0%
CATTGATGCTGGGGCAAAAG+GGG - Chr7:57215684-57215703 MsG0780039043.01.T01:intron 50.0%
CCAACGGCATAATGCCAGAT+CGG - Chr7:57215752-57215771 MsG0780039043.01.T01:intron 50.0%
CCTTCCTTCCAGAAAAGTGG+AGG + Chr7:57215119-57215138 None:intergenic 50.0%
CCTTCGATGCGCAAACAGAA+AGG + Chr7:57215795-57215814 None:intergenic 50.0%
CCTTTCTGTTTGCGCATCGA+AGG - Chr7:57215792-57215811 MsG0780039043.01.T01:intron 50.0%
CGGCATTCCAGAATGCATCT+TGG + Chr7:57215194-57215213 None:intergenic 50.0%
CTACGCAGCTTGAAAACACC+AGG + Chr7:57217788-57217807 None:intergenic 50.0%
GACCTCCTGCCAGAAAATTC+AGG + Chr7:57215157-57215176 None:intergenic 50.0%
GCCCCATCAATAAGCATAGG+AGG + Chr7:57216615-57216634 None:intergenic 50.0%
GTGCCACAGCATATCAGTGA+GGG + Chr7:57217133-57217152 None:intergenic 50.0%
GTTCAGGTCCATGAGTAGCT+GGG - Chr7:57215627-57215646 MsG0780039043.01.T01:CDS 50.0%
TACAACTCCCCAGCTACTCA+TGG + Chr7:57215638-57215657 None:intergenic 50.0%
TATGCTGTGGCACTTTGGTC+AGG - Chr7:57217140-57217159 MsG0780039043.01.T01:CDS 50.0%
TGGCACTCTTGGTAGGTTAG+GGG - Chr7:57215477-57215496 MsG0780039043.01.T01:intron 50.0%
TGTTCAGGTCCATGAGTAGC+TGG - Chr7:57215626-57215645 MsG0780039043.01.T01:CDS 50.0%
TTCAGGTCCATGAGTAGCTG+GGG - Chr7:57215628-57215647 MsG0780039043.01.T01:CDS 50.0%
TTGGACACCTTGTGTAAGGC+AGG - Chr7:57215898-57215917 MsG0780039043.01.T01:CDS 50.0%
! ATCGAAGGGCATGTGGGAAA+TGG - Chr7:57215807-57215826 MsG0780039043.01.T01:intron 50.0%
! GAAGCACTCCTTAACGGCAT+GGG - Chr7:57217626-57217645 MsG0780039043.01.T01:CDS 50.0%
! GGGGCTTTTCAGAATAAGCC+AGG - Chr7:57216630-57216649 MsG0780039043.01.T01:CDS 50.0%
! GGTTTAGGGCATCTTCCAAG+AGG + Chr7:57216029-57216048 None:intergenic 50.0%
! TAGGGCATCTTCCAAGAGGT+TGG + Chr7:57216025-57216044 None:intergenic 50.0%
! TGAAGCACTCCTTAACGGCA+TGG - Chr7:57217625-57217644 MsG0780039043.01.T01:CDS 50.0%
! TTGGGAAGATTGGTGTCTCC+TGG - Chr7:57217677-57217696 MsG0780039043.01.T01:CDS 50.0%
!! AGATGCATTCTGGAATGCCG+AGG - Chr7:57215194-57215213 MsG0780039043.01.T01:CDS 50.0%
!! AGTAAGGAGTGGTTTGGTGG+AGG + Chr7:57214839-57214858 None:intergenic 50.0%
!! ATCTTCCAAGAGGTTGGCCT+TGG + Chr7:57216019-57216038 None:intergenic 50.0%
!! CAGCTTGCTGCAGAAAAAGC+TGG - Chr7:57216681-57216700 MsG0780039043.01.T01:CDS 50.0%
!! CATCAAGGAAGCGCCCATTT+CGG + Chr7:57215597-57215616 None:intergenic 50.0%
!! CCCGGACAAAAGAGCATTGT+AGG + Chr7:57216202-57216221 None:intergenic 50.0%
!! CCTCCACTTTTCTGGAAGGA+AGG - Chr7:57215116-57215135 MsG0780039043.01.T01:intron 50.0%
!! CTCCTGAATTTTCTGGCAGG+AGG - Chr7:57215152-57215171 MsG0780039043.01.T01:intron 50.0%
!! GATGCATTCTGGAATGCCGA+GGG - Chr7:57215195-57215214 MsG0780039043.01.T01:CDS 50.0%
!! GTAAGGAGTGGTTTGGTGGA+GGG + Chr7:57214838-57214857 None:intergenic 50.0%
!! TAAGGAGTGGTTTGGTGGAG+GGG + Chr7:57214837-57214856 None:intergenic 50.0%
!! TGGCTCCTGAATTTTCTGGC+AGG - Chr7:57215149-57215168 MsG0780039043.01.T01:intron 50.0%
!! TTGTGGTGCTGCTTGTGCAA+TGG - Chr7:57217373-57217392 MsG0780039043.01.T01:CDS 50.0%
AAGGGAGACGCCGAAATGTG+TGG - Chr7:57217306-57217325 MsG0780039043.01.T01:CDS 55.0%
AGAATAAGCCAGGGGAGGAC+CGG - Chr7:57216640-57216659 MsG0780039043.01.T01:CDS 55.0%
CAGCATGTCTAGGAGCAGCA+GGG + Chr7:57214862-57214881 None:intergenic 55.0%
CATCCGGAACAATACGCCTG+TGG + Chr7:57215858-57215877 None:intergenic 55.0%
CATGCAGTCAGCACTTCTCC+AGG + Chr7:57217698-57217717 None:intergenic 55.0%
CATGCCATGCTTGCCATACC+CGG + Chr7:57216220-57216239 None:intergenic 55.0%
CCGATCTGGCATTATGCCGT+TGG + Chr7:57215755-57215774 None:intergenic 55.0%
CTATGCCAAGGCCAACCTCT+TGG - Chr7:57216011-57216030 MsG0780039043.01.T01:CDS 55.0%
GCAACAGCAGCAGCAGCTAA+AGG + Chr7:57215007-57215026 None:intergenic 55.0%
GCAGGGAGTAAGGAGTGGTT+TGG + Chr7:57214845-57214864 None:intergenic 55.0%
GCTGCTGCTGTTGCTGAAGT+AGG - Chr7:57215013-57215032 MsG0780039043.01.T01:CDS 55.0%
GGACCACAGGCGTATTGTTC+CGG - Chr7:57215852-57215871 MsG0780039043.01.T01:CDS 55.0%
TACGCGGCCAAGATGCATTC+TGG - Chr7:57215184-57215203 MsG0780039043.01.T01:CDS 55.0%
TCAGAGACGCGGAGCTGAAA+TGG - Chr7:57217274-57217293 MsG0780039043.01.T01:CDS 55.0%
TCAGCATGTCTAGGAGCAGC+AGG + Chr7:57214863-57214882 None:intergenic 55.0%
TCTAGGAGCAGCAGGGAGTA+AGG + Chr7:57214855-57214874 None:intergenic 55.0%
TTCAAAATCCGGTCCTCCCC+TGG + Chr7:57216651-57216670 None:intergenic 55.0%
TTGTCCGGGTATGGCAAGCA+TGG - Chr7:57216213-57216232 MsG0780039043.01.T01:CDS 55.0%
! ACTGCATGGCTGACTCAACC+TGG - Chr7:57217710-57217729 MsG0780039043.01.T01:CDS 55.0%
! GGGAGTAAGGAGTGGTTTGG+TGG + Chr7:57214842-57214861 None:intergenic 55.0%
! TTGCGCATCGAAGGGCATGT+GGG - Chr7:57215801-57215820 MsG0780039043.01.T01:intron 55.0%
! TTTCTGGCAGGAGGTCAACG+CGG - Chr7:57215161-57215180 MsG0780039043.01.T01:intron 55.0%
! TTTGCGCATCGAAGGGCATG+TGG - Chr7:57215800-57215819 MsG0780039043.01.T01:intron 55.0%
!! AAAAGTGCTGCTGCTGCTGG+TGG - Chr7:57215043-57215062 MsG0780039043.01.T01:CDS 55.0%
!! CTGGAGAAGTGCTGACTGCA+TGG - Chr7:57217696-57217715 MsG0780039043.01.T01:CDS 55.0%
GAGCAGCAGGGAGTAAGGAG+TGG + Chr7:57214850-57214869 None:intergenic 60.0%
TGGGCGCTTCCTTGATGCTG+TGG - Chr7:57215600-57215619 MsG0780039043.01.T01:CDS 60.0%
!! GAGTGGTTTGGTGGAGGGGT+TGG + Chr7:57214833-57214852 None:intergenic 60.0%
CAGGAGGTCAACGCGGTACG+CGG - Chr7:57215168-57215187 MsG0780039043.01.T01:intron 65.0%
TCACAGTGCTGCGGCTGACG+AGG - Chr7:57215237-57215256 MsG0780039043.01.T01:CDS 65.0%
! AGTGCTGCTGCTGCTGGTGG+TGG - Chr7:57215046-57215065 MsG0780039043.01.T01:CDS 65.0%
!! TGGTGGTGCTGCTGGTGGCA+GGG - Chr7:57215066-57215085 MsG0780039043.01.T01:intron 65.0%
GCTGCTGGTGGCAGGGGCAA+TGG - Chr7:57215073-57215092 MsG0780039043.01.T01:intron 70.0%
GGTGGCAGGGGCAATGGCAG+AGG - Chr7:57215079-57215098 MsG0780039043.01.T01:intron 70.0%
!! GCTGCTGCTGCTGGTGGTGG+TGG - Chr7:57215049-57215068 MsG0780039043.01.T01:CDS 70.0%
!! GCTGGTGGTGGTGGTGCTGC+TGG - Chr7:57215058-57215077 MsG0780039043.01.T01:CDS 70.0%
!! GGTGGTGCTGCTGGTGGCAG+GGG - Chr7:57215067-57215086 MsG0780039043.01.T01:intron 70.0%
!! GGTGGTGGTGGTGCTGCTGG+TGG - Chr7:57215061-57215080 MsG0780039043.01.T01:CDS 70.0%
!! GTGGTGGTGCTGCTGGTGGC+AGG - Chr7:57215065-57215084 MsG0780039043.01.T01:intron 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 57214818 57217826 57214818 ID=MsG0780039043.01;Name=MsG0780039043.01
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Chr7 exon 57215815 57217826 57215815 ID=MsG0780039043.01.T01:exon:8280;Parent=MsG0780039043.01.T01
Chr7 exon 57215483 57215699 57215483 ID=MsG0780039043.01.T01:exon:8279;Parent=MsG0780039043.01.T01
Chr7 exon 57215182 57215366 57215182 ID=MsG0780039043.01.T01:exon:8278;Parent=MsG0780039043.01.T01
Chr7 exon 57214818 57215082 57214818 ID=MsG0780039043.01.T01:exon:8277;Parent=MsG0780039043.01.T01
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Chr7 CDS 57215182 57215366 57215182 ID=MsG0780039043.01.T01:cds;Parent=MsG0780039043.01.T01
Chr7 CDS 57214818 57215082 57214818 ID=MsG0780039043.01.T01:cds;Parent=MsG0780039043.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780039043.01.T01

ATGACTTCTACACCAACCCCTCCACCAAACCACTCCTTACTCCCTGCTGCTCCTAGACATGCTGAAAATCATAAACACAATCACCAAAATCAACAAAACATTAGACATAGTCACCACAGTACTCATAAACGTCCTAGAGATTGTTGGTCTTCGTCGTCTAGGCACTATTCCAACTCACACTCTGCACCTTTAGCTGCTGCTGCTGTTGCTGAAGTAGGTGCCAATAAAAGTGCTGCTGCTGCTGGTGGTGGTGGTGCTGCTGGTGGCAGGGGCAATGGCAGAGGAAGAGCTGCATATTCCTCCACTTTTCTGGAAGGAAGGCAATCAAGATTGGCTCCTGAATTTTCTGGCAGGAGGTCAACGCGGTACGCGGCCAAGATGCATTCTGGAATGCCGAGGGTGACTCCAAACAAACATGCTCACAGTGCTGCGGCTGACGAGGCACTTAGCTTTCTGTTAAAAGCTGGTAACAATGTTGCTGCTATTGATAATGTTTTTATTACATATGAACATAAGTTATGGAAGGTTGAAGATTATATTTATATGCTAAAAGAGTTTGGTAATACTCGTAGTCTTTTGCATGCTACAAAGTGTTTTGATTTCATTATGTCGAAACAAAATGGGAGGGTTGATAAAGGTAAGTTAGTTAGTGCTATGATTGGCACTCTTGGTAGGTTAGGGGAGATTAATCTTGCTTTGGGATTGTTTGAAAGAGCTAGGCTTGAAGGGTATGGAAGCACTGTGTATTCCTTTTCGGCCATGATTAGTGCTTTTGGCCGAAATGGGCGCTTCCTTGATGCTGTGGATTTGTTCAGGTCCATGAGTAGCTGGGGAGTTGTACCTAATGTGATAACGTACAATTCAATCATTGATGCTGGGGCAAAAGGGGAAGTGAGTTTTGATGTAGTTGTTAAGTTTTATGATGAAATGATAGCCAACGGCATAATGCCAGATCGGCTTACTTACAATTCACTCCTTTCTGTTTGCGCATCGAAGGGCATGTGGGAAATGGCTCAAAAATTATTGAGTGAAATGGACCACAGGCGTATTGTTCCGGATGTGTTTACTTATAACACATATTTGGACACCTTGTGTAAGGCAGGCCAAATTGATTTGGCCAGAAGGGTATTCGAAGAGATGTCGTCGAAGAGAGTTTGGCCAAATGTGGTCACTTACAGTGCAATGATGGATGGCTATGCCAAGGCCAACCTCTTGGAAGATGCCCTAAACCTGTACGAAGAAATGAAGCTCCGATCTGTTTGTCTTGATAGAGTGTCCTATAACACACTAGTAGGAATCTACTCGAAGCTCGACAATCTTGATGAAGCTATTGAGAAGTGCAAAGAGATGGAGAGAACTGGAATCAACAGAGATGTAGTAACCTACAATGCTCTTTTGTCCGGGTATGGCAAGCATGGCATGTATGATGAAGTTAGAAGACTGTTTGAAGAGATGAAGGCACGGAATATATATCCAAATACGCTAACTTACTCTACAATGATCGATATGTACACTAAAGGTGAAATGTTTCAGGAAGCGATGGATGTTTATAGAGAGTTCAAGATGGCAAGATTGGAGATTGATGTCGTCTTTTATAGTGCAATCATAGATACACTATGCAAAAACGGGTTAATGGAGTCTTCTATTATGTTGCTTATAGCAATGATGGAGAAAGGAATAAAGCCAAATGTGGTCACGTTCAACTCCATAATTGATGCATCTCAACCATCGCCAACTTTGGAATATGGAGTAAATGGATCTTCTGATGCCATTGACCATCCGATTGAAAAATCGCCTCCTATGCTTATTGATGGGGCTTTTCAGAATAAGCCAGGGGAGGACCGGATTTTGAAGATGTTCGAGCAGCTTGCTGCAGAAAAAGCTGGTCAGATAAAGAAGAATAGAAGTGGACGACAAGACAAACAGTGCATATTGTGGCTCTTTCAAAAAATGCATGAGCTGAACATTAAACCAAATGTTGTCACATTTTCAGCCATTTTAAATGCTTGCAGTCGCTGCAATTCATATGAAGATGCTTCACTGCTGTTAGACACGCTCCGCTTGTTTGATAATCAGGTGTATGGCGTAACCAATGGACTGTTGATGGGTTACAGAGAACAAGTATGGTTTAGTGCTGAGACTCTGTTCGATGAAATCATGCGCATGGATCCTTCAACTTCGTCTGCCTTTTATAATTCCCTCACTGATATGCTGTGGCACTTTGGTCAGAGACGCGGAGCTGAAATGGTTGTAATTGAAGGGAGACGCCGAAATGTGTGGAAAGGCGAATGGTCAATTTCTTGCTTGGATCTGCATCTGATGTCTTGTGGTGCTGCTTGTGCAATGGTTCATTCATGGTTGCTCAGTTTGCATAGTTCTCTTTTTCAAGGCATTCAACTGCCTATGTTTGTGAACATTCTAACTGGTTGGGGTAAGCACAGTAAAATAATGGGAGAAGGAACATTGAAAAAGGCTGTTGAAGCACTCCTTAACGGCATGGGTTCACCTTTCAGAATTTATGAGAATAATTTGGGAAGATTGGTGTCTCCTGGAGAAGTGCTGACTGCATGGCTGACTCAACCTGGTGTTTTCGATTCGCTTGTTCTGTATGATGTCCTAAATCATTCTCATTCTCAACCTGGTGTTTTCAAGCTGCGTAGCACTGACCCTTCATATTGA
Protein sequence

>MsG0780039043.01.T01

MTSTPTPPPNHSLLPAAPRHAENHKHNHQNQQNIRHSHHSTHKRPRDCWSSSSRHYSNSHSAPLAAAAVAEVGANKSAAAAGGGGAAGGRGNGRGRAAYSSTFLEGRQSRLAPEFSGRRSTRYAAKMHSGMPRVTPNKHAHSAAADEALSFLLKAGNNVAAIDNVFITYEHKLWKVEDYIYMLKEFGNTRSLLHATKCFDFIMSKQNGRVDKGKLVSAMIGTLGRLGEINLALGLFERARLEGYGSTVYSFSAMISAFGRNGRFLDAVDLFRSMSSWGVVPNVITYNSIIDAGAKGEVSFDVVVKFYDEMIANGIMPDRLTYNSLLSVCASKGMWEMAQKLLSEMDHRRIVPDVFTYNTYLDTLCKAGQIDLARRVFEEMSSKRVWPNVVTYSAMMDGYAKANLLEDALNLYEEMKLRSVCLDRVSYNTLVGIYSKLDNLDEAIEKCKEMERTGINRDVVTYNALLSGYGKHGMYDEVRRLFEEMKARNIYPNTLTYSTMIDMYTKGEMFQEAMDVYREFKMARLEIDVVFYSAIIDTLCKNGLMESSIMLLIAMMEKGIKPNVVTFNSIIDASQPSPTLEYGVNGSSDAIDHPIEKSPPMLIDGAFQNKPGEDRILKMFEQLAAEKAGQIKKNRSGRQDKQCILWLFQKMHELNIKPNVVTFSAILNACSRCNSYEDASLLLDTLRLFDNQVYGVTNGLLMGYREQVWFSAETLFDEIMRMDPSTSSAFYNSLTDMLWHFGQRRGAEMVVIEGRRRNVWKGEWSISCLDLHLMSCGAACAMVHSWLLSLHSSLFQGIQLPMFVNILTGWGKHSKIMGEGTLKKAVEALLNGMGSPFRIYENNLGRLVSPGEVLTAWLTQPGVFDSLVLYDVLNHSHSQPGVFKLRSTDPSY*