AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0080048898.01

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MsG0080048898.01.T01 AT5G15980 23.248 314 221 9 71 370 266 573 1.55e-11 67.4
MsG0080048898.01.T01 AT3G05340 22.195 410 254 14 57 424 222 608 1.68e-12 70.5
MsG0080048898.01.T01 AT1G20230 24.000 225 166 2 229 453 176 395 1.72e-12 70.5
MsG0080048898.01.T01 AT4G33990 21.862 247 184 2 149 395 334 571 1.87e-12 70.5
MsG0080048898.01.T01 AT3G23330 22.903 310 220 8 132 437 103 397 1.89e-12 70.1
MsG0080048898.01.T01 AT3G46610 23.144 229 174 2 192 420 416 642 2.02e-12 70.1
MsG0080048898.01.T01 AT3G46610 23.529 204 154 2 231 433 418 620 6.68e-12 68.6
MsG0080048898.01.T01 AT3G46610 23.144 229 174 2 192 420 416 642 2.02e-12 70.1
MsG0080048898.01.T01 AT3G46610 23.529 204 154 2 231 433 418 620 6.68e-12 68.6
MsG0080048898.01.T01 AT3G23330 23.188 276 194 7 132 404 212 472 2.02e-12 70.1
MsG0080048898.01.T01 AT4G33990 21.862 247 184 2 149 395 327 564 2.05e-12 70.5
MsG0080048898.01.T01 AT1G68930 21.204 382 207 12 198 506 178 538 2.05e-12 70.1
MsG0080048898.01.T01 AT3G56030 22.535 213 158 4 202 410 128 337 2.07e-12 68.9
MsG0080048898.01.T01 AT3G25970 23.874 222 154 4 248 465 355 565 2.32e-12 70.1
MsG0080048898.01.T01 AT4G21300 26.882 186 122 4 165 349 548 720 2.47e-12 70.1
MsG0080048898.01.T01 AT1G68930 21.204 382 207 12 198 506 204 564 2.51e-12 70.1
MsG0080048898.01.T01 AT1G19520 21.450 331 241 6 68 390 360 679 2.92e-12 69.7
MsG0080048898.01.T01 AT1G19520 20.521 307 238 4 187 492 337 638 1.58e-11 67.4
MsG0080048898.01.T01 AT5G02830 24.460 278 181 11 233 490 300 568 3.11e-12 69.7
MsG0080048898.01.T01 AT5G36300 23.984 246 169 7 160 393 13 252 4.09e-12 67.4
MsG0080048898.01.T01 AT1G06270 23.019 265 160 7 201 460 101 326 4.54e-12 67.8
MsG0080048898.01.T01 AT1G06270 23.003 313 219 11 186 481 5 312 6.52e-12 67.4
MsG0080048898.01.T01 AT5G48910 20.643 373 261 8 136 493 71 423 4.62e-12 68.9
MsG0080048898.01.T01 AT3G18970 27.586 174 118 4 233 403 218 386 4.70e-12 68.6
MsG0080048898.01.T01 AT3G18970 27.315 216 142 7 160 371 217 421 8.06e-12 67.8
MsG0080048898.01.T01 AT4G21705 25.670 261 190 4 229 487 120 378 4.81e-12 68.6
MsG0080048898.01.T01 AT5G39680 23.962 313 183 12 88 361 233 529 4.82e-12 68.9
MsG0080048898.01.T01 AT2G04860 21.673 263 195 4 176 437 360 612 4.92e-12 68.9
MsG0080048898.01.T01 AT3G58590 19.826 459 328 16 57 507 282 708 5.11e-12 68.9
MsG0080048898.01.T01 AT2G33760 22.008 259 180 7 161 417 105 343 5.32e-12 68.6
MsG0080048898.01.T01 AT3G14730 23.902 205 151 3 270 474 125 324 5.40e-12 68.9
MsG0080048898.01.T01 AT4G38010 26.609 233 156 6 140 370 283 502 5.61e-12 68.6
MsG0080048898.01.T01 AT4G38010 21.702 235 166 5 237 465 241 463 1.30e-11 67.4
MsG0080048898.01.T01 AT5G04780 22.308 390 266 14 57 434 128 492 6.47e-12 68.6
MsG0080048898.01.T01 AT3G18840 24.430 307 207 9 174 468 24 317 6.64e-12 68.6
MsG0080048898.01.T01 AT3G18840 24.430 307 207 9 174 468 24 317 6.64e-12 68.6
MsG0080048898.01.T01 AT4G13650 19.118 340 254 7 127 465 427 746 7.22e-12 68.6
MsG0080048898.01.T01 AT5G47460 21.831 284 202 7 159 441 51 315 8.38e-12 68.2
MsG0080048898.01.T01 AT2G22070 19.187 443 316 14 63 496 188 597 8.58e-12 68.2
MsG0080048898.01.T01 AT3G13880 18.539 356 235 7 198 511 112 454 9.45e-12 68.2
MsG0080048898.01.T01 AT1G74630 20.408 245 177 4 179 423 172 398 9.82e-12 68.2
MsG0080048898.01.T01 AT1G13410 26.943 193 124 5 198 387 120 298 9.83e-12 67.8
MsG0080048898.01.T01 AT3G05240 23.121 173 124 2 234 406 250 413 9.92e-12 67.8
MsG0080048898.01.T01 AT1G74630 20.408 245 177 4 179 423 157 383 1.03e-11 67.8
MsG0080048898.01.T01 AT4G14050 22.526 293 210 6 173 460 88 368 1.04e-11 67.8
MsG0080048898.01.T01 AT4G14050 22.526 293 210 6 173 460 141 421 1.16e-11 67.8
MsG0080048898.01.T01 AT2G27610 19.595 296 212 6 222 507 308 587 1.32e-11 67.8
MsG0080048898.01.T01 AT5G50390 23.529 238 166 5 234 467 258 483 1.36e-11 67.8
MsG0080048898.01.T01 AT3G47840 23.611 288 199 10 130 412 379 650 1.40e-11 67.4
MsG0080048898.01.T01 AT3G26630 27.184 206 143 4 234 437 215 415 1.48e-11 67.0
MsG0080048898.01.T01 AT3G26540 26.111 180 123 4 229 407 423 593 1.70e-11 67.4
MsG0080048898.01.T01 AT1G06143 22.848 302 183 9 203 503 225 477 1.77e-11 67.0
MsG0080048898.01.T01 AT3G02490 20.207 386 260 9 61 403 250 630 1.88e-11 67.0
MsG0080048898.01.T01 AT1G09220 25.000 200 133 5 198 389 188 378 2.40e-11 66.6
MsG0080048898.01.T01 AT1G34160 27.108 166 112 3 222 385 179 337 2.52e-11 66.6
MsG0080048898.01.T01 AT1G34160 27.703 148 101 2 222 367 226 369 2.56e-11 66.6

Find 14 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 146 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ATTGGTTTAATTAAAACTAT+AGG 0.316260 contig522end:+12200 MsG0080048898.01.T01:intergenic
CAAGCACGGTGGTGCGGCGG+CGG 0.402949 contig522end:+12032 MsG0080048898.01.T01:intergenic
GGCGGTGCTTGTGGCGTCGC+GGG 0.408178 contig522end:+12050 MsG0080048898.01.T01:intergenic
GCTTGTGGCGTCGCGGGTGG+TGG 0.414876 contig522end:+12056 MsG0080048898.01.T01:intergenic
TGTGGCGTCGCGGGTGGTGG+CGG 0.443369 contig522end:+12059 MsG0080048898.01.T01:intergenic
TGGTGCGGCGGCGGTGCTTG+TGG 0.505165 contig522end:+12041 MsG0080048898.01.T01:intergenic
CGGCGGTGCTTGTGGCGTCG+CGG 0.510496 contig522end:+12049 MsG0080048898.01.T01:intergenic
GGTGCTTGTGGCGTCGCGGG+TGG 0.530571 contig522end:+12053 MsG0080048898.01.T01:intergenic
GCGGGTGGTGGCGGTGCTCG+TGG 0.566190 contig522end:+12068 MsG0080048898.01.T01:intergenic
ACCACCGTGCTTGTTTCGTG+AGG 0.593679 contig522end:-12022 MsG0080048898.01.T01:intron
AAACAAGCACGGTGGTGCGG+CGG 0.610789 contig522end:+12029 MsG0080048897.01.T01:intergenic
ACGAAACAAGCACGGTGGTG+CGG 0.620842 contig522end:+12026 MsG0080048897.01.T01:intergenic
CTAACCTCACGAAACAAGCA+CGG 0.670261 contig522end:+12018 MsG0080048897.01.T01:intergenic
ACCTCACGAAACAAGCACGG+TGG 0.774514 contig522end:+12021 MsG0080048897.01.T01:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATTGAATTTATGAAAAATAA+TGG - contig522end:11244-11263 MsG0080048898.01.T01:CDS 10.0%
!!! TGAATTTTGATTAAAAAAAT+TGG + contig522end:10021-10040 MsG0080048898.01.T01:intergenic 10.0%
!! ATATTGAAAATGCATACATT+TGG + contig522end:10956-10975 MsG0080048898.01.T01:intergenic 20.0%
!!! ACTTACAATGTTTTGATTAA+TGG - contig522end:11181-11200 MsG0080048898.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTTAACTACATGATTCAAT+TGG + contig522end:10275-10294 MsG0080048898.01.T01:intergenic 20.0%
! AACAATGAGTGAATAGTATT+AGG + contig522end:10252-10271 MsG0080048898.01.T01:intergenic 25.0%
! ATCAAAACATTGTAAGTAAG+CGG + contig522end:11178-11197 MsG0080048898.01.T01:intergenic 25.0%
! TGCGTTGAAAATATTTAACA+TGG - contig522end:10586-10605 MsG0080048898.01.T01:CDS 25.0%
!! ATATTTTGCATTGAAATGAC+AGG - contig522end:10308-10327 MsG0080048898.01.T01:exon 25.0%
!! TGTATGCATTTTCAATATCT+TGG - contig522end:10958-10977 MsG0080048898.01.T01:CDS 25.0%
!!! AAAGGTTTTGTAAAGTTAAG+AGG + contig522end:10449-10468 MsG0080048898.01.T01:intergenic 25.0%
AACATGGTATCTGAACAAAA+GGG - contig522end:10602-10621 MsG0080048898.01.T01:CDS 30.0%
AATGAAGGAAAATGAATGTC+AGG - contig522end:11462-11481 MsG0080048898.01.T01:CDS 30.0%
AATTACCTACTCAACATTGA+TGG - contig522end:11069-11088 MsG0080048898.01.T01:CDS 30.0%
ACGAACCAATAATTCATTAG+AGG + contig522end:11710-11729 MsG0080048898.01.T01:intergenic 30.0%
AGAGTTGCTTAAAGAAATGA+AGG - contig522end:11447-11466 MsG0080048898.01.T01:CDS 30.0%
AGGAAGGCAAATAAGTTATT+AGG - contig522end:11646-11665 MsG0080048898.01.T01:CDS 30.0%
ATTCATTAGAGGTAGCATAA+TGG + contig522end:11699-11718 MsG0080048898.01.T01:intergenic 30.0%
ATTTGAACAAAGGTAGTTAC+AGG - contig522end:11587-11606 MsG0080048898.01.T01:CDS 30.0%
CTTTGATCAATTTCTTCTCT+AGG - contig522end:11401-11420 MsG0080048898.01.T01:CDS 30.0%
CTTTGCAATTAGTCACTTAA+AGG - contig522end:12138-12157 MsG0080048898.01.T01:exon 30.0%
GCTGAGTAATTGAATACATT+AGG + contig522end:11277-11296 MsG0080048898.01.T01:intergenic 30.0%
GTTGAGTAGGTAATTACATT+AGG + contig522end:11064-11083 MsG0080048898.01.T01:intergenic 30.0%
TAACATGGTATCTGAACAAA+AGG - contig522end:10601-10620 MsG0080048898.01.T01:CDS 30.0%
TGCATTCAGATAAATTGCAA+TGG - contig522end:11988-12007 MsG0080048898.01.T01:intron 30.0%
TGCTACCTCTAATGAATTAT+TGG - contig522end:11702-11721 MsG0080048898.01.T01:CDS 30.0%
TTAAAGAATCACACACAATG+TGG - contig522end:12013-12032 MsG0080048898.01.T01:intron 30.0%
TTCATTAGAGGTAGCATAAT+GGG + contig522end:11698-11717 MsG0080048898.01.T01:intergenic 30.0%
TTGAAGTTGTCAAAGAAATG+AGG - contig522end:11020-11039 MsG0080048898.01.T01:CDS 30.0%
! AATATTTTCAACGCATGTTG+CGG + contig522end:10581-10600 MsG0080048898.01.T01:intergenic 30.0%
! ATCAATTTCTTCTCTAGGAA+TGG - contig522end:11406-11425 MsG0080048898.01.T01:CDS 30.0%
! GAAATTGATCAAAGAAGTGT+AGG + contig522end:11395-11414 MsG0080048898.01.T01:intergenic 30.0%
! TCTATTGGTTGATTCAAATC+AGG - contig522end:10877-10896 MsG0080048898.01.T01:CDS 30.0%
! TTTTGAGCTACTTGATGAAT+TGG - contig522end:11864-11883 MsG0080048898.01.T01:exon 30.0%
!! ATTATTGGTTCGTCTTTGTA+AGG - contig522end:11717-11736 MsG0080048898.01.T01:CDS 30.0%
!! GTTTGAACTTTTTGAGGAAA+TGG - contig522end:11126-11145 MsG0080048898.01.T01:CDS 30.0%
!! TGATTCAAATCAGGTTGATT+TGG - contig522end:10886-10905 MsG0080048898.01.T01:CDS 30.0%
AAAACCCTAGCATGGTAAAA+AGG + contig522end:10216-10235 MsG0080048897.01.T01:intergenic 35.0%
AAAATCTGAAAACCCTAGCA+TGG + contig522end:10224-10243 MsG0080048897.01.T01:intergenic 35.0%
AAGATGCAGATAGTGATGAT+CGG + contig522end:12121-12140 MsG0080048898.01.T01:intergenic 35.0%
AAGTTAAGAGGTGATATCCA+TGG + contig522end:10437-10456 MsG0080048898.01.T01:intergenic 35.0%
AGACAAGAGCTAATAGCTTT+CGG + contig522end:10854-10873 MsG0080048898.01.T01:intergenic 35.0%
CAAGGTGTGTATTTGAACAA+AGG - contig522end:11577-11596 MsG0080048898.01.T01:CDS 35.0%
CTTATAAACTAGACTCCTCT+TGG + contig522end:10933-10952 MsG0080048898.01.T01:intergenic 35.0%
GAAGCTTGTAAGTTTCATGA+GGG - contig522end:10725-10744 MsG0080048898.01.T01:CDS 35.0%
GCAATGCAAAATGATGTGTT+TGG - contig522end:11909-11928 MsG0080048898.01.T01:intron 35.0%
GTGGTAACTATAGACTTCTT+TGG - contig522end:12032-12051 MsG0080048898.01.T01:exon 35.0%
GTTACGTTCAATGTGATACT+TGG - contig522end:11493-11512 MsG0080048898.01.T01:CDS 35.0%
TAACTCAAAACTGTGAGTTG+AGG - contig522end:11626-11645 MsG0080048898.01.T01:CDS 35.0%
TAGCTCTTGTCTCAATCTAT+TGG - contig522end:10862-10881 MsG0080048898.01.T01:CDS 35.0%
TAGGAATGGACAAATTGATG+AGG - contig522end:11420-11439 MsG0080048898.01.T01:CDS 35.0%
TCATTAGAGGTAGCATAATG+GGG + contig522end:11697-11716 MsG0080048898.01.T01:intergenic 35.0%
TGAAGCTTGTAAGTTTCATG+AGG - contig522end:10724-10743 MsG0080048898.01.T01:CDS 35.0%
TTTCTCAAGCAATATCTGCT+TGG - contig522end:11932-11951 MsG0080048898.01.T01:intron 35.0%
! ATGAAGCATTACTCGAAATG+TGG - contig522end:10764-10783 MsG0080048898.01.T01:CDS 35.0%
! CTTACCTTTTTACCATGCTA+GGG - contig522end:10209-10228 MsG0080048898.01.T01:exon 35.0%
! GTGAAGTACCATTGCAAAAA+GGG - contig522end:10980-10999 MsG0080048898.01.T01:CDS 35.0%
! TCTTACCTTTTTACCATGCT+AGG - contig522end:10208-10227 MsG0080048898.01.T01:exon 35.0%
! TGAAGTACCATTGCAAAAAG+GGG - contig522end:10981-11000 MsG0080048898.01.T01:CDS 35.0%
!! CTATTTGACTTGGTGGATAT+GGG - contig522end:11769-11788 MsG0080048898.01.T01:CDS 35.0%
!! TATTTGACTTGGTGGATATG+GGG - contig522end:11770-11789 MsG0080048898.01.T01:CDS 35.0%
!! TCTATTTGACTTGGTGGATA+TGG - contig522end:11768-11787 MsG0080048898.01.T01:CDS 35.0%
!!! AGAAGCGTTTGAACTTTTTG+AGG - contig522end:11120-11139 MsG0080048898.01.T01:CDS 35.0%
!!! ATTAATGGATTTTGCCGTGA+AGG - contig522end:11196-11215 MsG0080048898.01.T01:CDS 35.0%
!!! CAACTCACAGTTTTGAGTTA+AGG + contig522end:11626-11645 MsG0080048898.01.T01:intergenic 35.0%
!!! TTAATGGATTTTGCCGTGAA+GGG - contig522end:11197-11216 MsG0080048898.01.T01:CDS 35.0%
ACATTGTAAGTAAGCGGATC+AGG + contig522end:11172-11191 MsG0080048898.01.T01:intergenic 40.0%
ACCTACTCAACATTGATGGA+TGG - contig522end:11073-11092 MsG0080048898.01.T01:CDS 40.0%
ACGTTCAATGTGATACTTGG+AGG - contig522end:11496-11515 MsG0080048898.01.T01:CDS 40.0%
AGATGCAGATAGTGATGATC+GGG + contig522end:12120-12139 MsG0080048898.01.T01:intergenic 40.0%
ATCATCATTTGCCTAGGTGA+AGG + contig522end:11961-11980 MsG0080048898.01.T01:intergenic 40.0%
CAAACCCTCTACTTAGCATT+AGG + contig522end:11672-11691 MsG0080048898.01.T01:intergenic 40.0%
CCTCATCAAATCTACCTTCT+CGG + contig522end:11528-11547 MsG0080048898.01.T01:intergenic 40.0%
CTAGGCAAATGATGATACAG+AGG - contig522end:11965-11984 MsG0080048898.01.T01:intron 40.0%
CTCTGTATCATCATTTGCCT+AGG + contig522end:11967-11986 MsG0080048898.01.T01:intergenic 40.0%
CTGATGCAAAACTCGATCAA+CGG + contig522end:10696-10715 MsG0080048898.01.T01:intergenic 40.0%
TAGGCCTAATGCTAAGTAGA+GGG - contig522end:11665-11684 MsG0080048898.01.T01:CDS 40.0%
TCCATCCATCAATGTTGAGT+AGG + contig522end:11077-11096 MsG0080048898.01.T01:intergenic 40.0%
TGGTTCGTCTTTGTAAGGAA+GGG - contig522end:11722-11741 MsG0080048898.01.T01:CDS 40.0%
TGTATTCAATTACTCAGCCC+TGG - contig522end:11279-11298 MsG0080048898.01.T01:CDS 40.0%
TTAGGCCTAATGCTAAGTAG+AGG - contig522end:11664-11683 MsG0080048898.01.T01:CDS 40.0%
TTCAAATACACACCTTGCTG+TGG + contig522end:11574-11593 MsG0080048898.01.T01:intergenic 40.0%
TTTACATAGTCCATCCACCA+GGG + contig522end:11299-11318 MsG0080048898.01.T01:intergenic 40.0%
! AAAACCCCTTTTGCATCTTG+CGG + contig522end:11331-11350 MsG0080048898.01.T01:intergenic 40.0%
! AATTGCTATTGCATGCCAAG+AGG - contig522end:10915-10934 MsG0080048898.01.T01:CDS 40.0%
! AGTTCCCAAGAATCAAGTTG+TGG + contig522end:11802-11821 MsG0080048898.01.T01:intergenic 40.0%
! ATGGATGGACTTTGTCGAAA+TGG - contig522end:11088-11107 MsG0080048898.01.T01:CDS 40.0%
! CAATATCCCCCTTTTTGCAA+TGG + contig522end:10991-11010 MsG0080048898.01.T01:intergenic 40.0%
! GAAGTACCATTGCAAAAAGG+GGG - contig522end:10982-11001 MsG0080048898.01.T01:CDS 40.0%
! GGGTCAAGTTTAGGTTCTAA+AGG + contig522end:10467-10486 MsG0080048898.01.T01:intergenic 40.0%
! GGTGAAGTACCATTGCAAAA+AGG - contig522end:10979-10998 MsG0080048898.01.T01:CDS 40.0%
! TCAAAACTGTGAGTTGAGGA+AGG - contig522end:11630-11649 MsG0080048898.01.T01:CDS 40.0%
! TCAAATACACACCTTGCTGT+GGG + contig522end:11573-11592 MsG0080048898.01.T01:intergenic 40.0%
! TTGGTTCGTCTTTGTAAGGA+AGG - contig522end:11721-11740 MsG0080048898.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTTGAGGAAATGGTCTCGA+AGG - contig522end:11135-11154 MsG0080048898.01.T01:CDS 40.0%
AAATCATTGTCGCGGAAACG+AGG - contig522end:10495-10514 MsG0080048898.01.T01:CDS 45.0%
ACCTCCTGAAATCATTGTCG+CGG - contig522end:10487-10506 MsG0080048898.01.T01:CDS 45.0%
ATTCAATTACTCAGCCCTGG+TGG - contig522end:11282-11301 MsG0080048898.01.T01:CDS 45.0%
ATTGAGAAACTCCCACAGCA+AGG - contig522end:11559-11578 MsG0080048898.01.T01:CDS 45.0%
CATGGCAATGAAGAAGCTGA+AGG + contig522end:10419-10438 MsG0080048898.01.T01:intergenic 45.0%
CCAGCCACAACTTGATTCTT+GGG - contig522end:11795-11814 MsG0080048898.01.T01:CDS 45.0%
CCGAGAAGGTAGATTTGATG+AGG - contig522end:11525-11544 MsG0080048898.01.T01:CDS 45.0%
CGACAATGATTTCAGGAGGT+GGG + contig522end:10487-10506 MsG0080048898.01.T01:intergenic 45.0%
CTAACCTCACGAAACAAGCA+CGG + contig522end:10185-10204 MsG0080048898.01.T01:intergenic 45.0%
CTTCAGCTTCTTCATTGCCA+TGG - contig522end:10417-10436 MsG0080048898.01.T01:CDS 45.0%
CTTTACATAGTCCATCCACC+AGG + contig522end:11300-11319 MsG0080048898.01.T01:intergenic 45.0%
GAAACCGCAAGATGCAAAAG+GGG - contig522end:11324-11343 MsG0080048898.01.T01:CDS 45.0%
GAAGTGTAGGTCATTGCATC+AGG + contig522end:11382-11401 MsG0080048898.01.T01:intergenic 45.0%
GAGCTAATAGCTTTCGGAGA+TGG + contig522end:10848-10867 MsG0080048898.01.T01:intergenic 45.0%
GGAAACCGCAAGATGCAAAA+GGG - contig522end:11323-11342 MsG0080048898.01.T01:CDS 45.0%
GTTTCCGCGACAATGATTTC+AGG + contig522end:10494-10513 MsG0080048898.01.T01:intergenic 45.0%
TCCAGCCACAACTTGATTCT+TGG - contig522end:11794-11813 MsG0080048898.01.T01:CDS 45.0%
TCGTCTTTGTAAGGAAGGGA+TGG - contig522end:11726-11745 MsG0080048898.01.T01:CDS 45.0%
TTGGCTGAGATGAAGAGTTC+TGG - contig522end:11349-11368 MsG0080048898.01.T01:CDS 45.0%
! GCAAGATGCAAAAGGGGTTT+TGG - contig522end:11330-11349 MsG0080048898.01.T01:CDS 45.0%
!! CAAATCAGGTTGATTTGGCG+CGG - contig522end:10891-10910 MsG0080048898.01.T01:CDS 45.0%
!! GGTGGATGGACTATGTAAAG+CGG - contig522end:11300-11319 MsG0080048898.01.T01:CDS 45.0%
!! GTGGATGGACTATGTAAAGC+GGG - contig522end:11301-11320 MsG0080048898.01.T01:CDS 45.0%
!! TGGATGGACTATGTAAAGCG+GGG - contig522end:11302-11321 MsG0080048898.01.T01:CDS 45.0%
AATTACTCAGCCCTGGTGGA+TGG - contig522end:11286-11305 MsG0080048898.01.T01:CDS 50.0%
AGGTAGATTTGATGAGGCGC+TGG - contig522end:11531-11550 MsG0080048898.01.T01:CDS 50.0%
CTGCTTGGAATCCTTCACCT+AGG - contig522end:11947-11966 MsG0080048898.01.T01:intron 50.0%
GCGACAATGATTTCAGGAGG+TGG + contig522end:10488-10507 MsG0080048898.01.T01:intergenic 50.0%
GGGAAACCGCAAGATGCAAA+AGG - contig522end:11322-11341 MsG0080048898.01.T01:CDS 50.0%
TCAGGAGGTGGGTCAAGTTT+AGG + contig522end:10476-10495 MsG0080048898.01.T01:intergenic 50.0%
TCCGCGACAATGATTTCAGG+AGG + contig522end:10491-10510 MsG0080048898.01.T01:intergenic 50.0%
TCTCAGCAATTCACTGCTGC+AGG - contig522end:10372-10391 MsG0080048898.01.T01:CDS 50.0%
TGCTGCGGCTCTATTTGACT+TGG - contig522end:11759-11778 MsG0080048898.01.T01:CDS 50.0%
! CCCAAGAATCAAGTTGTGGC+TGG + contig522end:11798-11817 MsG0080048898.01.T01:intergenic 50.0%
! GAAGCTGAAGGCACACAGTA+AGG + contig522end:10407-10426 MsG0080048898.01.T01:intergenic 50.0%
!! TGCGGCTCTATTTGACTTGG+TGG - contig522end:11762-11781 MsG0080048898.01.T01:CDS 50.0%
ACCACCGTGCTTGTTTCGTG+AGG - contig522end:10178-10197 MsG0080048898.01.T01:exon 55.0%
ACCTCACGAAACAAGCACGG+TGG + contig522end:10182-10201 MsG0080048898.01.T01:intergenic 55.0%
ACGAAACAAGCACGGTGGTG+CGG + contig522end:10177-10196 MsG0080048898.01.T01:intergenic 55.0%
CGCGATCAGCTTTCCCTTCA+CGG + contig522end:11213-11232 MsG0080048898.01.T01:intergenic 55.0%
GATGGTTGACGATGCTGCTG+CGG - contig522end:11744-11763 MsG0080048898.01.T01:CDS 55.0%
AAACAAGCACGGTGGTGCGG+CGG + contig522end:10174-10193 MsG0080048897.01.T01:intergenic 60.0%
CTTGGAGGCTTGTGCCGAGA+AGG - contig522end:11511-11530 MsG0080048898.01.T01:CDS 60.0%
CAAGCACGGTGGTGCGGCGG+CGG + contig522end:10171-10190 MsG0080048898.01.T01:intergenic 75.0%
CGGCGGTGCTTGTGGCGTCG+CGG + contig522end:10154-10173 MsG0080048898.01.T01:intergenic 75.0%
GCTTGTGGCGTCGCGGGTGG+TGG + contig522end:10147-10166 MsG0080048898.01.T01:intergenic 75.0%
GGCGGTGCTTGTGGCGTCGC+GGG + contig522end:10153-10172 MsG0080048898.01.T01:intergenic 75.0%
GGTGCTTGTGGCGTCGCGGG+TGG + contig522end:10150-10169 MsG0080048898.01.T01:intergenic 75.0%
TGGTGCGGCGGCGGTGCTTG+TGG + contig522end:10162-10181 MsG0080048898.01.T01:intergenic 75.0%
! TGTGGCGTCGCGGGTGGTGG+CGG + contig522end:10144-10163 MsG0080048898.01.T01:intergenic 75.0%
!!! GCGGGTGGTGGCGGTGCTCG+TGG + contig522end:10135-10154 MsG0080048898.01.T01:intergenic 80.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
contig522end gene 10001 12221 10001 ID=MsG0080048898.01;
contig522end mRNA 10001 12221 10001 ID=MsG0080048898.01.T01;Parent=MsG0080048898.01
contig522end exon 10001 11892 10001 ID=MsG0080048898.01.T01.exon;Parent=MsG0080048898.01.T01
contig522end CDS 10319 11857 10319 ID=MsG0080048898.01.T01.cds;Parent=MsG0080048898.01.T01
contig522end exon 12023 12221 12023 ID=MsG0080048898.01.T01.exon;Parent=MsG0080048898.01.T01
Gene Sequence

>MsG0080048898.01.T01

ATGAAATTCTCAGCAATTCACTGCTGCAGGCACATGCAACCTTACTGTGTGCCTTCAGCTTCTTCATTGCCATGGATATCACCTCTTAACTTTACAAAACCTTTAGAACCTAAACTTGACCCACCTCCTGAAATCATTGTCGCGGAAACGAGGAAGAAGAGTAAATATATTACTCATGATGTTGCTATTAATTTGATCAAACGAGAGAAAGATCCGCAACATGCGTTGAAAATATTTAACATGGTATCTGAACAAAAGGGTTTTAATCACAACAATGCTACTTATGCGACGATTTTACAAAAGCTTGCTCAGTTTAAGAAGTTTCAAGCCGTTGATCGAGTTTTGCATCAGATGACTTATGAAGCTTGTAAGTTTCATGAGGGTGTATTTATTAATCTCATGAAGCATTACTCGAAATGTGGTTTTCATGAGAAAGTGTTTGATGCGTTTTTTTCTATTCAGACAATTGTTCGTGAAAAGCCATCTCCGAAAGCTATTAGCTCTTGTCTCAATCTATTGGTTGATTCAAATCAGGTTGATTTGGCGCGGAAATTGCTATTGCATGCCAAGAGGAGTCTAGTTTATAAGCCAAATGTATGCATTTTCAATATCTTGGTGAAGTACCATTGCAAAAAGGGGGATATTGATTCTGCTTTTGAAGTTGTCAAAGAAATGAGGAAATCTAAGCATTCATATCCTAATGTAATTACCTACTCAACATTGATGGATGGACTTTGTCGAAATGGAAGACTCAAAGAAGCGTTTGAACTTTTTGAGGAAATGGTCTCGAAGGATCAGATTGTGCCTGATCCGCTTACTTACAATGTTTTGATTAATGGATTTTGCCGTGAAGGGAAAGCTGATCGCGCTAGAAATGTTATTGAATTTATGAAAAATAATGGTTGCTGTCCTAATGTATTCAATTACTCAGCCCTGGTGGATGGACTATGTAAAGCGGGGAAACCGCAAGATGCAAAAGGGGTTTTGGCTGAGATGAAGAGTTCTGGTTTGAAACCTGATGCAATGACCTACACTTCTTTGATCAATTTCTTCTCTAGGAATGGACAAATTGATGAGGCTATAGAGTTGCTTAAAGAAATGAAGGAAAATGAATGTCAGGCTGATACTGTTACGTTCAATGTGATACTTGGAGGCTTGTGCCGAGAAGGTAGATTTGATGAGGCGCTGGATATGATTGAGAAACTCCCACAGCAAGGTGTGTATTTGAACAAAGGTAGTTACAGGATTGTACTAAATTCCTTAACTCAAAACTGTGAGTTGAGGAAGGCAAATAAGTTATTAGGCCTAATGCTAAGTAGAGGGTTTGTACCCCATTATGCTACCTCTAATGAATTATTGGTTCGTCTTTGTAAGGAAGGGATGGTTGACGATGCTGCTGCGGCTCTATTTGACTTGGTGGATATGGGGTTCCAGCCACAACTTGATTCTTGGGAACTTTTAATTGACTTAATCTGCAGAGACAGAAAATTGTTGTATGTTTTTGAGCTACTTGATGAATTGGTGACAACAAATTCTTGA
Protein sequence

>MsG0080048898.01.T01

MKFSAIHCCRHMQPYCVPSASSLPWISPLNFTKPLEPKLDPPPEIIVAETRKKSKYITHDVAINLIKREKDPQHALKIFNMVSEQKGFNHNNATYATILQKLAQFKKFQAVDRVLHQMTYEACKFHEGVFINLMKHYSKCGFHEKVFDAFFSIQTIVREKPSPKAISSCLNLLVDSNQVDLARKLLLHAKRSLVYKPNVCIFNILVKYHCKKGDIDSAFEVVKEMRKSKHSYPNVITYSTLMDGLCRNGRLKEAFELFEEMVSKDQIVPDPLTYNVLINGFCREGKADRARNVIEFMKNNGCCPNVFNYSALVDGLCKAGKPQDAKGVLAEMKSSGLKPDAMTYTSLINFFSRNGQIDEAIELLKEMKENECQADTVTFNVILGGLCREGRFDEALDMIEKLPQQGVYLNKGSYRIVLNSLTQNCELRKANKLLGLMLSRGFVPHYATSNELLVRLCKEGMVDDAAAALFDLVDMGFQPQLDSWELLIDLICRDRKLLYVFELLDELVTTNS*