AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180003804.01


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MsG0180003804.01.T01 AT5G07990 22.840 324 217 11 173 488 178 476 2.55e-14 75.9
MsG0180003804.01.T01 AT1G67110 30.405 148 96 3 356 502 364 505 2.64e-14 75.9
MsG0180003804.01.T01 AT1G01190 27.948 229 152 8 273 496 296 516 2.69e-14 75.9
MsG0180003804.01.T01 AT1G01190 27.948 229 152 8 273 496 301 521 3.15e-14 75.5
MsG0180003804.01.T01 AT5G35715 23.939 330 228 11 153 476 88 400 3.80e-14 75.1
MsG0180003804.01.T01 AT2G22330 26.562 192 135 5 286 476 314 500 5.83e-14 74.7
MsG0180003804.01.T01 AT2G22330 26.562 192 135 5 286 476 337 523 6.48e-14 74.7
MsG0180003804.01.T01 AT5G06900 26.074 349 219 15 142 480 146 465 6.59e-14 74.3
MsG0180003804.01.T01 AT2G30750 29.651 172 117 3 305 476 293 460 7.53e-14 74.3
MsG0180003804.01.T01 AT5G25120 22.460 374 254 12 122 486 121 467 8.81e-14 73.9
MsG0180003804.01.T01 AT5G24950 26.590 173 123 2 305 477 293 461 1.06e-13 73.9
MsG0180003804.01.T01 AT1G64930 27.184 206 138 6 308 507 309 508 1.40e-13 73.6
MsG0180003804.01.T01 AT4G37410 24.093 386 255 15 122 495 124 483 1.86e-13 73.2
MsG0180003804.01.T01 AT3G28740 26.587 252 158 8 234 482 242 469 2.72e-13 72.4
MsG0180003804.01.T01 AT4G37330 27.500 240 149 7 239 476 236 452 3.62e-13 72.0
MsG0180003804.01.T01 AT2G23190 22.616 367 241 11 140 497 188 520 4.15e-13 72.0
MsG0180003804.01.T01 AT1G16410 22.432 477 313 18 31 477 50 499 4.69e-13 72.0
MsG0180003804.01.T01 AT2G23220 22.449 343 239 8 140 481 159 475 4.72e-13 72.0
MsG0180003804.01.T01 AT1G66540 25.556 270 166 10 239 496 66 312 5.13e-13 70.5
MsG0180003804.01.T01 AT1G13080 24.151 265 190 7 219 483 101 354 5.16e-13 71.2
MsG0180003804.01.T01 AT1G66540 24.198 343 221 13 166 496 56 371 5.31e-13 71.2
MsG0180003804.01.T01 AT3G26270 24.173 393 259 14 98 476 99 466 6.45e-13 71.2
MsG0180003804.01.T01 AT3G26160 23.894 226 153 7 237 457 235 446 6.76e-13 71.2
MsG0180003804.01.T01 AT3G48270 23.864 176 121 3 305 476 286 452 9.32e-13 70.9
MsG0180003804.01.T01 AT3G26320 21.833 371 256 12 122 483 123 468 9.74e-13 70.9
MsG0180003804.01.T01 AT1G16400 22.059 476 316 20 31 477 49 498 1.06e-12 70.9
MsG0180003804.01.T01 AT2G27010 26.293 232 149 9 291 509 264 486 1.45e-12 70.1
MsG0180003804.01.T01 AT1G13080 24.151 265 190 7 219 483 219 472 1.51e-12 70.1
MsG0180003804.01.T01 AT3G48310 20.469 469 310 17 31 482 37 459 1.57e-12 70.1
MsG0180003804.01.T01 AT1G64900 25.794 252 176 6 264 508 258 505 1.78e-12 70.1
MsG0180003804.01.T01 AT5G47990 25.957 235 152 9 285 507 283 507 2.43e-12 69.7
MsG0180003804.01.T01 AT3G20120 29.050 179 105 7 295 463 159 325 2.52e-12 68.9
MsG0180003804.01.T01 AT3G20120 29.050 179 105 7 295 463 159 325 2.52e-12 68.9
MsG0180003804.01.T01 AT3G20120 29.050 179 105 7 295 463 159 325 2.52e-12 68.9
MsG0180003804.01.T01 AT3G20120 25.200 250 158 9 272 507 272 506 2.89e-12 69.3
MsG0180003804.01.T01 AT1G50520 23.342 377 244 16 147 507 163 510 3.00e-12 69.3
MsG0180003804.01.T01 AT3G26180 25.385 260 172 10 230 483 229 472 3.02e-12 69.3
MsG0180003804.01.T01 AT3G26180 25.571 219 147 7 271 483 130 338 3.73e-12 68.2
MsG0180003804.01.T01 AT2G42850 25.112 223 157 5 243 465 230 442 4.52e-12 68.6
MsG0180003804.01.T01 AT1G11610 26.636 214 150 4 273 483 258 467 7.38e-12 68.2
MsG0180003804.01.T01 AT4G15360 22.907 454 290 17 31 463 45 459 7.79e-12 68.2
MsG0180003804.01.T01 AT1G50560 25.114 219 139 8 295 501 300 505 9.31e-12 67.8
MsG0180003804.01.T01 AT2G25160 33.708 178 103 7 305 477 310 477 9.53e-12 67.8
MsG0180003804.01.T01 AT1G11610 26.636 214 150 4 273 483 258 467 1.06e-11 67.4
MsG0180003804.01.T01 AT3G26170 24.164 269 183 10 221 483 219 472 1.28e-11 67.4
MsG0180003804.01.T01 AT3G26200 24.277 346 230 13 122 457 120 443 1.34e-11 67.4
MsG0180003804.01.T01 AT3G26190 24.566 346 229 13 122 457 120 443 1.35e-11 67.4
MsG0180003804.01.T01 AT3G20110 24.681 235 160 7 252 480 246 469 2.00e-11 66.6
MsG0180003804.01.T01 AT2G02580 22.520 373 251 12 122 483 123 468 2.03e-11 66.6
MsG0180003804.01.T01 AT3G61880 24.645 211 145 7 272 476 293 495 2.34e-11 66.6
MsG0180003804.01.T01 AT5G36220 23.704 270 173 7 239 506 245 483 2.45e-11 66.2
MsG0180003804.01.T01 AT3G61880 24.528 212 146 7 272 477 293 496 2.88e-11 66.2
MsG0180003804.01.T01 AT5G04330 22.472 267 194 7 221 483 218 475 3.09e-11 66.2
MsG0180003804.01.T01 AT5G36220 23.704 270 173 7 239 506 99 337 3.21e-11 65.5
MsG0180003804.01.T01 AT3G20080 25.620 242 163 7 273 505 135 368 4.09e-11 65.1
MsG0180003804.01.T01 AT3G20080 25.620 242 163 7 273 505 135 368 4.09e-11 65.1
MsG0180003804.01.T01 AT3G20080 25.620 242 163 7 273 505 135 368 4.09e-11 65.1
MsG0180003804.01.T01 AT3G20080 25.620 242 163 7 273 505 135 368 4.09e-11 65.1
MsG0180003804.01.T01 AT3G20080 25.620 242 163 7 273 505 272 505 4.36e-11 65.9
MsG0180003804.01.T01 AT3G20080 25.620 242 163 7 273 505 272 505 4.36e-11 65.9
MsG0180003804.01.T01 AT5G25130 22.108 389 268 12 119 500 118 478 5.44e-11 65.5
MsG0180003804.01.T01 AT3G20100 23.048 269 178 10 249 507 259 508 5.67e-11 65.5
MsG0180003804.01.T01 AT4G22690 24.528 318 200 10 192 500 255 541 8.19e-11 64.7
MsG0180003804.01.T01 AT4G22710 24.579 297 193 9 213 500 236 510 8.45e-11 64.7
MsG0180003804.01.T01 AT5G25140 22.016 377 258 12 119 486 118 467 8.59e-11 64.7
MsG0180003804.01.T01 AT1G74110 22.072 444 322 14 73 507 108 536 9.39e-11 64.7

Find 97 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 116 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AGCATCTGCATTATTGTATT+TGG 0.098646 1:+68499017 MsG0180003804.01.T01:CDS
CTAAGATCACTAATCTTATT+TGG 0.151101 1:-68499059 None:intergenic
GAGTAAATTAACTTGGTATT+TGG 0.194985 1:-68499674 None:intergenic
ACTTCATTCCTAGTTGTTTA+TGG 0.198813 1:+68499138 MsG0180003804.01.T01:CDS
TATTTGGATTTGATCCTAAT+TGG 0.230599 1:+68499033 MsG0180003804.01.T01:CDS
GCGATGTGGTTAACGTTTAT+TGG 0.238352 1:-68498720 None:intergenic
ATCTTATTTGGAAGCCAATT+AGG 0.275411 1:-68499047 None:intergenic
CACATCGCAAGCAAGAATTT+TGG 0.283007 1:+68498735 MsG0180003804.01.T01:CDS
TGGGAAGGATGGAAGAAATA+TGG 0.301721 1:+68499708 MsG0180003804.01.T01:CDS
TCTTCATTTACATCTACTAT+TGG 0.341938 1:+68498520 MsG0180003804.01.T01:CDS
TCAGATACATCATTAATAAA+TGG 0.345893 1:-68498942 None:intergenic
ACAGAAGCCCTAGGGGTTAC+AGG 0.354307 1:-68499929 None:intergenic
TCCTCTTCTCTTTCCATACA+TGG 0.366109 1:-68498833 None:intergenic
AATTTACTCTTTGTATGCTA+TGG 0.370405 1:+68499688 MsG0180003804.01.T01:CDS
CTGCAGAAATGGTTTCTTGT+TGG 0.391077 1:+68499164 MsG0180003804.01.T01:CDS
TCAATTCTGATTCCCATGTA+TGG 0.406666 1:+68498820 MsG0180003804.01.T01:CDS
TACAGGACCTAGAAGTTGTA+TGG 0.412532 1:+68499823 MsG0180003804.01.T01:CDS
AAGTTCATAGCTTTCAATAC+AGG 0.418468 1:+68499806 MsG0180003804.01.T01:CDS
TGGTTGCAGCTGCCTTGTTA+TGG 0.421111 1:+68499876 MsG0180003804.01.T01:CDS
GTTTATGGAAGCTGCAGAAA+TGG 0.422474 1:+68499153 MsG0180003804.01.T01:CDS
TCCATGACGTTTCAAAACTA+AGG 0.425545 1:-68498637 None:intergenic
GTGCAGCAGCAGTGAAGAAA+TGG 0.426826 1:+68499277 MsG0180003804.01.T01:CDS
AAAATCTCTTATTGTGATAG+AGG 0.429045 1:+68499097 MsG0180003804.01.T01:CDS
GGGAAGGATGGAAGAAATAT+GGG 0.431334 1:+68499709 MsG0180003804.01.T01:CDS
GGAGGAACGTTTCGATTTGA+AGG 0.431858 1:+68498657 MsG0180003804.01.T01:CDS
GTGTATCACAACATGAGAAT+TGG 0.433383 1:+68499507 MsG0180003804.01.T01:CDS
GTTATGGAAGTTTCACATAC+AGG 0.433937 1:+68499892 MsG0180003804.01.T01:CDS
GTTTCAAAACTAAGGTGAAA+TGG 0.439823 1:-68498629 None:intergenic
CATCATTAATAAATGGTAGT+AGG 0.441729 1:-68498935 None:intergenic
GCGGTGAGATTATGCCGAAT+TGG 0.442265 1:+68498553 MsG0180003804.01.T01:CDS
ATACCAACTATTGGCCAATT+CGG 0.445066 1:-68498567 None:intergenic
TGTTTCATTCAATTCTCAAA+AGG 0.451412 1:+68498859 MsG0180003804.01.T01:CDS
TTACACTTTCATACAAGAAT+CGG 0.453389 1:-68499226 None:intergenic
GCACTGATGAAGGAAGGTTC+TGG 0.460855 1:+68499326 MsG0180003804.01.T01:CDS
ATTGCATTGATAAGCTCAAA+AGG 0.463041 1:-68499614 None:intergenic
TCGAATGAAACATGGCTTGA+AGG 0.466524 1:+68499958 MsG0180003804.01.T01:CDS
ACTTGCAAGATATCTTGAAT+AGG 0.468493 1:+68498982 MsG0180003804.01.T01:CDS
CTCTCTGATACCCATCTCTC+AGG 0.476597 1:-68499755 None:intergenic
GACAGTAGCATACCAACTAT+TGG 0.476797 1:-68498576 None:intergenic
CACTTAGTTCAAGTCTCAGT+TGG 0.476913 1:+68499417 MsG0180003804.01.T01:CDS
ATTAATGATGTATCTGAAGC+AGG 0.478589 1:+68498948 MsG0180003804.01.T01:CDS
TAGTTTCATTCAAATGAAGA+TGG 0.482291 1:+68499856 MsG0180003804.01.T01:CDS
ATTTACTCTTTGTATGCTAT+GGG 0.482323 1:+68499689 MsG0180003804.01.T01:CDS
CCTCTTCTCTTTCCATACAT+GGG 0.487601 1:-68498832 None:intergenic
ATGCCGAATTGGCCAATAGT+TGG 0.488003 1:+68498564 MsG0180003804.01.T01:CDS
AGTAGATGTAAATGAAGAAG+AGG 0.496608 1:-68498515 None:intergenic
TCAAGCCATGTTTCATTCGA+AGG 0.511506 1:-68499955 None:intergenic
CGTTTCGATTTGAAGGACCT+TGG 0.513496 1:+68498664 MsG0180003804.01.T01:CDS
ATGTGTATGATTCAATGTAT+TGG 0.516666 1:+68498477 MsG0180003804.01.T01:CDS
TAGAGGAAGTGCTATTCTAC+AGG 0.520423 1:+68499114 MsG0180003804.01.T01:CDS
GGAATTTAAGCCTGAGAGAT+GGG 0.521678 1:+68499745 MsG0180003804.01.T01:CDS
TGAGAATTGGATAACTTCAA+TGG 0.526252 1:+68499520 MsG0180003804.01.T01:CDS
CTTTGTAAAAGCACTGATGA+AGG 0.527955 1:+68499316 MsG0180003804.01.T01:CDS
TGTTTCAACTCATCCTATTG+TGG 0.531424 1:+68499451 MsG0180003804.01.T01:CDS
GAAGTTTCACATACAGGTGG+TGG 0.531835 1:+68499898 MsG0180003804.01.T01:CDS
GAAGGAAGGTTCTGGAAATG+AGG 0.542101 1:+68499334 MsG0180003804.01.T01:CDS
TTTGTATGCTATGGGAAGGA+TGG 0.542942 1:+68499697 MsG0180003804.01.T01:CDS
CAGAAGCCCTAGGGGTTACA+GGG 0.544544 1:-68499928 None:intergenic
CCCATGTATGGAAAGAGAAG+AGG 0.545701 1:+68498832 MsG0180003804.01.T01:CDS
TGGAATTTAAGCCTGAGAGA+TGG 0.546234 1:+68499744 MsG0180003804.01.T01:CDS
AAGGTCACCCTGTAACCCCT+AGG 0.554777 1:+68499921 MsG0180003804.01.T01:CDS
AAAGCTATGAACTTGTAAGA+TGG 0.556387 1:-68499797 None:intergenic
CGAAGGACAACAGAAGCCCT+AGG 0.558935 1:-68499938 None:intergenic
ATAAGCTCAAAAGGTACAGT+AGG 0.563619 1:-68499605 None:intergenic
GTAAAAGCACTGATGAAGGA+AGG 0.563972 1:+68499320 MsG0180003804.01.T01:CDS
GGAGGTAGACTAGCTTATCA+AGG 0.564942 1:-68499550 None:intergenic
TGCAGCTTCCATAAACAACT+AGG 0.568802 1:-68499146 None:intergenic
AATATGGGGAGAAGATTGCA+TGG 0.569835 1:+68499724 MsG0180003804.01.T01:CDS
ATACAAAGAGTAAATTAACT+TGG 0.571875 1:-68499681 None:intergenic
TGTATGATTCAATGTATTGG+AGG 0.574728 1:+68498480 MsG0180003804.01.T01:CDS
ACTCTTTGTATGCTATGGGA+AGG 0.574932 1:+68499693 MsG0180003804.01.T01:CDS
GTTGTCCTTCGAATGAAACA+TGG 0.578856 1:+68499950 MsG0180003804.01.T01:CDS
ACAGGACCTAGAAGTTGTAT+GGG 0.580284 1:+68499824 MsG0180003804.01.T01:CDS
GAAGGACAACAGAAGCCCTA+GGG 0.583414 1:-68499937 None:intergenic
TACAGTAGGATACAACCTCA+TGG 0.590015 1:-68499591 None:intergenic
GATAAGCTAGTCTACCTCCA+TGG 0.593821 1:+68499554 MsG0180003804.01.T01:CDS
ATCTACTATTGGCGACACAA+TGG 0.600932 1:+68498531 MsG0180003804.01.T01:CDS
TGGATTCACATATAGCTCCA+TGG 0.609113 1:-68499571 None:intergenic
GAAACATGGCTTGAAGGTCA+AGG 0.612274 1:+68499964 MsG0180003804.01.T01:CDS
GAGAGATGGGTATCAGAGAG+AGG 0.615310 1:+68499758 MsG0180003804.01.T01:CDS
AGGTCACCCTGTAACCCCTA+GGG 0.618514 1:+68499922 MsG0180003804.01.T01:CDS
AATAGTTGGTATGCTACTGT+CGG 0.619124 1:+68498578 MsG0180003804.01.T01:CDS
TACTATTGGCGACACAATGG+CGG 0.625190 1:+68498534 MsG0180003804.01.T01:CDS
TGGTCAAGAAAAGAAGTACA+AGG 0.628979 1:+68499184 MsG0180003804.01.T01:CDS
AAATCTGATATACTACCTAG+TGG 0.629278 1:+68499638 MsG0180003804.01.T01:CDS
GAATTGGATAACTTCAATGG+TGG 0.638480 1:+68499523 MsG0180003804.01.T01:CDS
TTTCACATACAGGTGGTGGA+AGG 0.639771 1:+68499902 MsG0180003804.01.T01:CDS
CAAAATTCTTGCTTGCGATG+TGG 0.640167 1:-68498734 None:intergenic
GGACTAACATTCTCTCCACT+AGG 0.648789 1:-68499653 None:intergenic
ATCTGAAGCAGGTACTGAGG+TGG 0.648911 1:+68498959 MsG0180003804.01.T01:CDS
ATGGAAGTTTCACATACAGG+TGG 0.670752 1:+68499895 MsG0180003804.01.T01:CDS
GGAAGGATGGAAGAAATATG+GGG 0.674772 1:+68499710 MsG0180003804.01.T01:CDS
TATGTGAAACTTCCATAACA+AGG 0.681788 1:-68499888 None:intergenic
AAGGACAACAGAAGCCCTAG+GGG 0.719502 1:-68499936 None:intergenic
TGTATCTGAAGCAGGTACTG+AGG 0.743513 1:+68498956 MsG0180003804.01.T01:CDS
GAGCTATATGTGAATCCATG+AGG 0.747282 1:+68499576 MsG0180003804.01.T01:CDS
ATTCACATATAGCTCCATGG+AGG 0.774024 1:-68499568 None:intergenic

CRISPR-GE

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!! CAAAAAATTCAAAAATTTCT+TGG - Chr1:68498788-68498807 None:intergenic 15.0%
!!! CAAGAAATTTTTGAATTTTT+TGG + Chr1:68498786-68498805 MsG0180003804.01.T01:CDS 15.0%
!! ATACAAAGAGTAAATTAACT+TGG - Chr1:68499684-68499703 None:intergenic 20.0%
!! TCAGATACATCATTAATAAA+TGG - Chr1:68498945-68498964 None:intergenic 20.0%
!!! GAAATTTTTGAATTTTTTGG+AGG + Chr1:68498789-68498808 MsG0180003804.01.T01:CDS 20.0%
! AAAATCTCTTATTGTGATAG+AGG + Chr1:68499097-68499116 MsG0180003804.01.T01:CDS 25.0%
! AATTTACTCTTTGTATGCTA+TGG + Chr1:68499688-68499707 MsG0180003804.01.T01:CDS 25.0%
! ATGTGTATGATTCAATGTAT+TGG + Chr1:68498477-68498496 MsG0180003804.01.T01:CDS 25.0%
! ATTTACTCTTTGTATGCTAT+GGG + Chr1:68499689-68499708 MsG0180003804.01.T01:CDS 25.0%
! CATCATTAATAAATGGTAGT+AGG - Chr1:68498938-68498957 None:intergenic 25.0%
! CTAAGATCACTAATCTTATT+TGG - Chr1:68499062-68499081 None:intergenic 25.0%
! TAGTTTCATTCAAATGAAGA+TGG + Chr1:68499856-68499875 MsG0180003804.01.T01:CDS 25.0%
! TATTTGGATTTGATCCTAAT+TGG + Chr1:68499033-68499052 MsG0180003804.01.T01:CDS 25.0%
! TCTTCATTTACATCTACTAT+TGG + Chr1:68498520-68498539 MsG0180003804.01.T01:CDS 25.0%
! TGTTTCATTCAATTCTCAAA+AGG + Chr1:68498859-68498878 MsG0180003804.01.T01:CDS 25.0%
! TTACACTTTCATACAAGAAT+CGG - Chr1:68499229-68499248 None:intergenic 25.0%
!! ATAATTTTTGCTTCCACAAT+AGG - Chr1:68499467-68499486 None:intergenic 25.0%
!! GAGTAAATTAACTTGGTATT+TGG - Chr1:68499677-68499696 None:intergenic 25.0%
!!! ATTTTTGAATTTTTTGGAGG+TGG + Chr1:68498792-68498811 MsG0180003804.01.T01:CDS 25.0%
AAAGCTATGAACTTGTAAGA+TGG - Chr1:68499800-68499819 None:intergenic 30.0%
AAATCTGATATACTACCTAG+TGG + Chr1:68499638-68499657 MsG0180003804.01.T01:CDS 30.0%
AAGTTCATAGCTTTCAATAC+AGG + Chr1:68499806-68499825 MsG0180003804.01.T01:CDS 30.0%
ACTTCATTCCTAGTTGTTTA+TGG + Chr1:68499138-68499157 MsG0180003804.01.T01:CDS 30.0%
ACTTGCAAGATATCTTGAAT+AGG + Chr1:68498982-68499001 MsG0180003804.01.T01:CDS 30.0%
AGCATCTGCATTATTGTATT+TGG + Chr1:68499017-68499036 MsG0180003804.01.T01:CDS 30.0%
AGTAGATGTAAATGAAGAAG+AGG - Chr1:68498518-68498537 None:intergenic 30.0%
GTTTCAAAACTAAGGTGAAA+TGG - Chr1:68498632-68498651 None:intergenic 30.0%
TATGTGAAACTTCCATAACA+AGG - Chr1:68499891-68499910 None:intergenic 30.0%
TGAGAATTGGATAACTTCAA+TGG + Chr1:68499520-68499539 MsG0180003804.01.T01:CDS 30.0%
TGTATGATTCAATGTATTGG+AGG + Chr1:68498480-68498499 MsG0180003804.01.T01:CDS 30.0%
! ATCTTATTTGGAAGCCAATT+AGG - Chr1:68499050-68499069 None:intergenic 30.0%
! ATTAATGATGTATCTGAAGC+AGG + Chr1:68498948-68498967 MsG0180003804.01.T01:CDS 30.0%
! ATTGCATTGATAAGCTCAAA+AGG - Chr1:68499617-68499636 None:intergenic 30.0%
!!! GCTTTTTTTGACTAGTTTGT+TGG - Chr1:68498905-68498924 None:intergenic 30.0%
ATACCAACTATTGGCCAATT+CGG - Chr1:68498570-68498589 None:intergenic 35.0%
GAATTGGATAACTTCAATGG+TGG + Chr1:68499523-68499542 MsG0180003804.01.T01:CDS 35.0%
GTGTATCACAACATGAGAAT+TGG + Chr1:68499507-68499526 MsG0180003804.01.T01:CDS 35.0%
GTTATGGAAGTTTCACATAC+AGG + Chr1:68499892-68499911 MsG0180003804.01.T01:CDS 35.0%
TCAATTCTGATTCCCATGTA+TGG + Chr1:68498820-68498839 MsG0180003804.01.T01:CDS 35.0%
TCCATGACGTTTCAAAACTA+AGG - Chr1:68498640-68498659 None:intergenic 35.0%
TGTTTCAACTCATCCTATTG+TGG + Chr1:68499451-68499470 MsG0180003804.01.T01:CDS 35.0%
! AATAGTTGGTATGCTACTGT+CGG + Chr1:68498578-68498597 MsG0180003804.01.T01:CDS 35.0%
! ATAAGCTCAAAAGGTACAGT+AGG - Chr1:68499608-68499627 None:intergenic 35.0%
! TCTCTTTTGTTAGCAGGTAA+TGG + Chr1:68499392-68499411 MsG0180003804.01.T01:CDS 35.0%
! TCTTTTCCCATACAACTTCT+AGG - Chr1:68499833-68499852 None:intergenic 35.0%
! TGGTCAAGAAAAGAAGTACA+AGG + Chr1:68499184-68499203 MsG0180003804.01.T01:CDS 35.0%
!! AAGCTTGTGTTTTTGAACCA+AGG - Chr1:68498684-68498703 None:intergenic 35.0%
!! AGCAAGAATTTTGGCAACTA+CGG + Chr1:68498744-68498763 MsG0180003804.01.T01:CDS 35.0%
!! CTTTGTAAAAGCACTGATGA+AGG + Chr1:68499316-68499335 MsG0180003804.01.T01:CDS 35.0%
!!! ACCTTAGTTTTGAAACGTCA+TGG + Chr1:68498636-68498655 MsG0180003804.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTAGTTTTGAAACGTCATGG+AGG + Chr1:68498639-68498658 MsG0180003804.01.T01:CDS 35.0%
AATATGGGGAGAAGATTGCA+TGG + Chr1:68499724-68499743 MsG0180003804.01.T01:CDS 40.0%
ACAGGACCTAGAAGTTGTAT+GGG + Chr1:68499824-68499843 MsG0180003804.01.T01:CDS 40.0%
ACTCTTTGTATGCTATGGGA+AGG + Chr1:68499693-68499712 MsG0180003804.01.T01:CDS 40.0%
ATCTACTATTGGCGACACAA+TGG + Chr1:68498531-68498550 MsG0180003804.01.T01:CDS 40.0%
ATGGAAGTTTCACATACAGG+TGG + Chr1:68499895-68499914 MsG0180003804.01.T01:CDS 40.0%
ATTCACATATAGCTCCATGG+AGG - Chr1:68499571-68499590 None:intergenic 40.0%
CAAAATTCTTGCTTGCGATG+TGG - Chr1:68498737-68498756 None:intergenic 40.0%
CACTTAGTTCAAGTCTCAGT+TGG + Chr1:68499417-68499436 MsG0180003804.01.T01:CDS 40.0%
CCTCTTCTCTTTCCATACAT+GGG - Chr1:68498835-68498854 None:intergenic 40.0%
CTGCAGAAATGGTTTCTTGT+TGG + Chr1:68499164-68499183 MsG0180003804.01.T01:CDS 40.0%
GACAGTAGCATACCAACTAT+TGG - Chr1:68498579-68498598 None:intergenic 40.0%
GAGCTATATGTGAATCCATG+AGG + Chr1:68499576-68499595 MsG0180003804.01.T01:CDS 40.0%
GCGATGTGGTTAACGTTTAT+TGG - Chr1:68498723-68498742 None:intergenic 40.0%
GGAAGGATGGAAGAAATATG+GGG + Chr1:68499710-68499729 MsG0180003804.01.T01:CDS 40.0%
GGAATTTAAGCCTGAGAGAT+GGG + Chr1:68499745-68499764 MsG0180003804.01.T01:CDS 40.0%
GGGAAGGATGGAAGAAATAT+GGG + Chr1:68499709-68499728 MsG0180003804.01.T01:CDS 40.0%
GTTGTCCTTCGAATGAAACA+TGG + Chr1:68499950-68499969 MsG0180003804.01.T01:CDS 40.0%
GTTTATGGAAGCTGCAGAAA+TGG + Chr1:68499153-68499172 MsG0180003804.01.T01:CDS 40.0%
TACAGGACCTAGAAGTTGTA+TGG + Chr1:68499823-68499842 MsG0180003804.01.T01:CDS 40.0%
TACAGTAGGATACAACCTCA+TGG - Chr1:68499594-68499613 None:intergenic 40.0%
TCAAGCCATGTTTCATTCGA+AGG - Chr1:68499958-68499977 None:intergenic 40.0%
TCCTCTTCTCTTTCCATACA+TGG - Chr1:68498836-68498855 None:intergenic 40.0%
TCGAATGAAACATGGCTTGA+AGG + Chr1:68499958-68499977 MsG0180003804.01.T01:CDS 40.0%
TGCAGCTTCCATAAACAACT+AGG - Chr1:68499149-68499168 None:intergenic 40.0%
TGGAATTTAAGCCTGAGAGA+TGG + Chr1:68499744-68499763 MsG0180003804.01.T01:CDS 40.0%
TGGATTCACATATAGCTCCA+TGG - Chr1:68499574-68499593 None:intergenic 40.0%
TGGGAAGGATGGAAGAAATA+TGG + Chr1:68499708-68499727 MsG0180003804.01.T01:CDS 40.0%
TTTGTATGCTATGGGAAGGA+TGG + Chr1:68499697-68499716 MsG0180003804.01.T01:CDS 40.0%
! CACATCGCAAGCAAGAATTT+TGG + Chr1:68498735-68498754 MsG0180003804.01.T01:CDS 40.0%
!! GTAAAAGCACTGATGAAGGA+AGG + Chr1:68499320-68499339 MsG0180003804.01.T01:CDS 40.0%
!! TAGAGGAAGTGCTATTCTAC+AGG + Chr1:68499114-68499133 MsG0180003804.01.T01:CDS 40.0%
!!! CAAGTCTCAGTTGGTTTTTC+TGG + Chr1:68499426-68499445 MsG0180003804.01.T01:CDS 40.0%
ATGCCGAATTGGCCAATAGT+TGG + Chr1:68498564-68498583 MsG0180003804.01.T01:CDS 45.0%
CCCATGTATGGAAAGAGAAG+AGG + Chr1:68498832-68498851 MsG0180003804.01.T01:CDS 45.0%
GAAACATGGCTTGAAGGTCA+AGG + Chr1:68499964-68499983 MsG0180003804.01.T01:CDS 45.0%
GAAGTTTCACATACAGGTGG+TGG + Chr1:68499898-68499917 MsG0180003804.01.T01:CDS 45.0%
GGACTAACATTCTCTCCACT+AGG - Chr1:68499656-68499675 None:intergenic 45.0%
TACTATTGGCGACACAATGG+CGG + Chr1:68498534-68498553 MsG0180003804.01.T01:CDS 45.0%
! CGTTTCGATTTGAAGGACCT+TGG + Chr1:68498664-68498683 MsG0180003804.01.T01:CDS 45.0%
! GATAAGCTAGTCTACCTCCA+TGG + Chr1:68499554-68499573 MsG0180003804.01.T01:CDS 45.0%
! GCACTCTCTCTTTTGTTAGC+AGG + Chr1:68499386-68499405 MsG0180003804.01.T01:CDS 45.0%
! GGAGGAACGTTTCGATTTGA+AGG + Chr1:68498657-68498676 MsG0180003804.01.T01:CDS 45.0%
! TGTATCTGAAGCAGGTACTG+AGG + Chr1:68498956-68498975 MsG0180003804.01.T01:CDS 45.0%
!! AATTTTGGCAACTACGGCAG+GGG + Chr1:68498750-68498769 MsG0180003804.01.T01:CDS 45.0%
!! AGAATTTTGGCAACTACGGC+AGG + Chr1:68498748-68498767 MsG0180003804.01.T01:CDS 45.0%
!! CTTGCTTTTCTCTTCGCGTT+TGG - Chr1:68499258-68499277 None:intergenic 45.0%
!! GAAGGAAGGTTCTGGAAATG+AGG + Chr1:68499334-68499353 MsG0180003804.01.T01:CDS 45.0%
!! GAATTTTGGCAACTACGGCA+GGG + Chr1:68498749-68498768 MsG0180003804.01.T01:CDS 45.0%
!! GGAGGTAGACTAGCTTATCA+AGG - Chr1:68499553-68499572 None:intergenic 45.0%
!! TTTCACATACAGGTGGTGGA+AGG + Chr1:68499902-68499921 MsG0180003804.01.T01:CDS 45.0%
AAGGACAACAGAAGCCCTAG+GGG - Chr1:68499939-68499958 None:intergenic 50.0%
CTCTCTGATACCCATCTCTC+AGG - Chr1:68499758-68499777 None:intergenic 50.0%
GAAGGACAACAGAAGCCCTA+GGG - Chr1:68499940-68499959 None:intergenic 50.0%
GAGAGATGGGTATCAGAGAG+AGG + Chr1:68499758-68499777 MsG0180003804.01.T01:CDS 50.0%
GCGGTGAGATTATGCCGAAT+TGG + Chr1:68498553-68498572 MsG0180003804.01.T01:CDS 50.0%
GTGCAGCAGCAGTGAAGAAA+TGG + Chr1:68499277-68499296 MsG0180003804.01.T01:CDS 50.0%
! GCACTGATGAAGGAAGGTTC+TGG + Chr1:68499326-68499345 MsG0180003804.01.T01:CDS 50.0%
! TGGTTGCAGCTGCCTTGTTA+TGG + Chr1:68499876-68499895 MsG0180003804.01.T01:CDS 50.0%
!! ATCTGAAGCAGGTACTGAGG+TGG + Chr1:68498959-68498978 MsG0180003804.01.T01:CDS 50.0%
!! ATTTTGGCAACTACGGCAGG+GGG + Chr1:68498751-68498770 MsG0180003804.01.T01:CDS 50.0%
AAGGTCACCCTGTAACCCCT+AGG + Chr1:68499921-68499940 MsG0180003804.01.T01:CDS 55.0%
ACAGAAGCCCTAGGGGTTAC+AGG - Chr1:68499932-68499951 None:intergenic 55.0%
AGGTCACCCTGTAACCCCTA+GGG + Chr1:68499922-68499941 MsG0180003804.01.T01:CDS 55.0%
CAGAAGCCCTAGGGGTTACA+GGG - Chr1:68499931-68499950 None:intergenic 55.0%
CGAAGGACAACAGAAGCCCT+AGG - Chr1:68499941-68499960 None:intergenic 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 68498477 68500006 68498477 ID=MsG0180003804.01;Name=MsG0180003804.01
Chr1 mRNA 68498477 68500006 68498477 ID=MsG0180003804.01.T01;Parent=MsG0180003804.01;Name=MsG0180003804.01.T01;_AED=0.37;_eAED=0.37;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|509
Chr1 exon 68498477 68500006 68498477 ID=MsG0180003804.01.T01:exon:51876;Parent=MsG0180003804.01.T01
Chr1 CDS 68498477 68500006 68498477 ID=MsG0180003804.01.T01:cds;Parent=MsG0180003804.01.T01
Gene Sequence

>MsG0180003804.01.T01

ATGTGTATGATTCAATGTATTGGAGGATTTGTAGCTATCCTCTTCTTCATTTACATCTACTATTGGCGACACAATGGCGGTGAGATTATGCCGAATTGGCCAATAGTTGGTATGCTACTGTCGGTGTTGCGTCATCTGTCAAATTTCAATGACCATTTCACCTTAGTTTTGAAACGTCATGGAGGAACGTTTCGATTTGAAGGACCTTGGTTCAAAAACACAAGCTTTATCGCTACTGCTGATCCAATAAACGTTAACCACATCGCAAGCAAGAATTTTGGCAACTACGGCAGGGGGTCTAATAACTTCCAAGAAATTTTTGAATTTTTTGGAGGTGGCATTGTCAATTCTGATTCCCATGTATGGAAAGAGAAGAGGACAATGTTTCATTCAATTCTCAAAAGGAAAAGCTTCAAGAACTTGTTCCAACAAACTAGTCAAAAAAAGCTTGAGAAATTCCTACTACCATTTATTAATGATGTATCTGAAGCAGGTACTGAGGTGGACTTGCAAGATATCTTGAATAGGTTCACTTTTGACAGCATCTGCATTATTGTATTTGGATTTGATCCTAATTGGCTTCCAAATAAGATTAGTGATCTTAGAGAAATTTCATATCAAAAATCTCTTATTGTGATAGAGGAAGTGCTATTCTACAGGAACTTCATTCCTAGTTGTTTATGGAAGCTGCAGAAATGGTTTCTTGTTGGTCAAGAAAAGAAGTACAAGGTAGCTCAAGAAAATCTTGACCGATTCTTGTATGAAAGTGTAACATTTGCCAAACGCGAAGAGAAAAGCAAGTGCAGCAGCAGTGAAGAAATGGATGAATGTTCTTTCAACTTTGTAAAAGCACTGATGAAGGAAGGTTCTGGAAATGAGGTAGTGAGTGAGAAGTATCTTAGAGACAATGCACTCTCTCTTTTGTTAGCAGGTAATGGCACACTTAGTTCAAGTCTCAGTTGGTTTTTCTGGCTTGTTTCAACTCATCCTATTGTGGAAGCAAAAATTATTCAAGAGATCAAAGATAATTGTGTATCACAACATGAGAATTGGATAACTTCAATGGTGGAAAGCCTTGATAAGCTAGTCTACCTCCATGGAGCTATATGTGAATCCATGAGGTTGTATCCTACTGTACCTTTTGAGCTTATCAATGCAATCAAATCTGATATACTACCTAGTGGAGAGAATGTTAGTCCAAATACCAAGTTAATTTACTCTTTGTATGCTATGGGAAGGATGGAAGAAATATGGGGAGAAGATTGCATGGAATTTAAGCCTGAGAGATGGGTATCAGAGAGAGGACTCATTATACATGTACCATCTTACAAGTTCATAGCTTTCAATACAGGACCTAGAAGTTGTATGGGAAAAGATCTTAGTTTCATTCAAATGAAGATGGTTGCAGCTGCCTTGTTATGGAAGTTTCACATACAGGTGGTGGAAGGTCACCCTGTAACCCCTAGGGCTTCTGTTGTCCTTCGAATGAAACATGGCTTGAAGGTCAAGGTTACTAAAAGATGCATTTGA

Protein sequence

>MsG0180003804.01.T01

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