AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180001649.01

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MsG0180001649.01.T01 AT5G20480 32.450 151 100 2 7 157 470 618 6.27e-13 73.6
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MsG0180001649.01.T01 AT1G72300 31.568 491 297 8 4 475 200 670 6.26e-44 173
MsG0180001649.01.T01 AT1G72300 31.059 425 221 5 2 355 247 670 7.57e-35 144
MsG0180001649.01.T01 AT2G25790 31.250 912 504 19 1 906 71 865 7.42e-106 352
MsG0180001649.01.T01 AT3G02130 31.091 981 563 25 14 914 115 1062 2.99e-104 351
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MsG0180001649.01.T01 AT3G02130 31.091 981 563 25 14 914 132 1079 5.97e-104 350
MsG0180001649.01.T01 AT3G02130 29.422 571 346 17 82 618 128 675 2.08e-44 175
MsG0180001649.01.T01 AT3G28040 33.333 858 523 19 86 908 89 932 6.34e-104 348
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MsG0180001649.01.T01 AT3G28040 34.916 358 203 3 1 331 222 576 8.00e-43 169
MsG0180001649.01.T01 AT3G28040 37.363 182 108 2 3 184 416 591 8.24e-17 86.3
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MsG0180001649.01.T01 AT2G24130 37.647 170 101 3 432 596 64 233 2.40e-19 94.4
MsG0180001649.01.T01 AT2G24130 30.980 255 161 7 356 595 60 314 2.71e-14 78.2
MsG0180001649.01.T01 AT2G24130 32.176 864 513 17 72 913 82 894 2.81e-103 345
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MsG0180001649.01.T01 AT3G51740 31.699 306 208 1 147 451 95 400 2.47e-32 135
MsG0180001649.01.T01 AT3G51740 32.154 311 210 1 126 435 98 408 6.77e-32 134
MsG0180001649.01.T01 AT3G51740 39.683 189 113 1 3 190 215 403 3.70e-27 119
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MsG0180001649.01.T01 AT5G27060 31.135 652 356 15 1 571 216 855 1.82e-49 190
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MsG0180001649.01.T01 AT2G23950 38.462 104 64 0 180 283 84 187 1.05e-12 72.4
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MsG0180001649.01.T01 AT1G17240 32.321 560 313 12 3 542 170 683 9.44e-55 204
MsG0180001649.01.T01 AT1G17240 30.075 399 234 5 1 355 268 665 4.27e-29 125
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MsG0180001649.01.T01 AT3G11010 34.679 545 334 10 69 600 53 588 6.12e-60 221
MsG0180001649.01.T01 AT3G11010 29.930 715 396 15 1 616 105 813 3.36e-58 216
MsG0180001649.01.T01 AT3G11010 38.323 167 101 1 431 595 29 195 2.66e-20 97.4
MsG0180001649.01.T01 AT4G30520 33.700 454 261 12 459 905 78 498 2.82e-61 221
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MsG0180001649.01.T01 AT4G30520 44.118 102 57 0 86 187 89 190 5.81e-15 79.7
MsG0180001649.01.T01 AT4G30520 39.535 129 54 1 107 235 86 190 1.24e-14 79.0
MsG0180001649.01.T01 AT4G30520 42.857 105 60 0 59 163 86 190 3.20e-14 77.4
MsG0180001649.01.T01 AT4G30520 42.857 105 60 0 203 307 86 190 1.27e-13 75.5
MsG0180001649.01.T01 AT4G30520 41.584 101 59 0 400 500 91 191 2.37e-13 74.7
MsG0180001649.01.T01 AT4G30520 40.385 104 62 0 180 283 87 190 3.07e-13 74.3
MsG0180001649.01.T01 AT4G30520 44.211 95 53 0 21 115 96 190 7.58e-13 73.2
MsG0180001649.01.T01 AT4G30520 37.143 105 66 0 227 331 86 190 2.18e-11 68.2
MsG0180001649.01.T01 AT4G30520 39.560 91 55 0 1 91 100 190 9.06e-11 66.2
MsG0180001649.01.T01 AT3G11010 31.111 675 374 11 1 595 144 807 2.95e-61 226
MsG0180001649.01.T01 AT3G11010 33.276 586 363 15 4 574 123 695 2.31e-60 223
MsG0180001649.01.T01 AT3G11010 34.291 522 321 10 92 600 115 627 1.28e-56 212
MsG0180001649.01.T01 AT3G11010 33.971 209 111 3 431 612 92 300 2.83e-19 94.4
MsG0180001649.01.T01 AT3G23120 31.429 595 359 8 25 573 109 700 3.98e-61 223
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MsG0180001649.01.T01 AT3G23120 28.650 548 302 12 1 498 204 712 1.83e-43 170
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MsG0180001649.01.T01 AT3G25010 30.488 656 386 15 1 596 153 798 1.10e-54 206
MsG0180001649.01.T01 AT3G25010 32.700 526 326 16 81 593 137 647 2.16e-42 168
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MsG0180001649.01.T01 AT3G11010 34.291 522 321 10 92 600 52 564 3.53e-56 210
MsG0180001649.01.T01 AT3G11010 33.971 209 111 3 431 612 29 237 3.93e-19 93.6
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MsG0180001649.01.T01 AT3G25560 41.732 127 70 2 114 239 76 199 1.43e-15 81.6
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MsG0180001649.01.T01 AT3G28450 36.275 102 64 1 351 451 91 192 1.69e-11 68.6
MsG0180001649.01.T01 AT3G28450 33.103 145 83 3 61 197 89 227 1.99e-11 68.6
MsG0180001649.01.T01 AT3G28450 39.316 117 67 2 72 187 79 192 3.43e-11 67.8
MsG0180001649.01.T01 AT3G28450 35.043 117 71 2 367 480 83 197 7.62e-11 66.6
MsG0180001649.01.T01 AT2G33050 32.843 612 335 18 21 571 85 681 3.55e-59 218
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MsG0180001649.01.T01 AT3G25020 28.652 712 367 14 36 616 109 810 1.77e-51 196
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MsG0180001649.01.T01 AT4G13920 28.865 731 388 15 4 616 107 823 1.12e-58 218
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MsG0180001649.01.T01 AT4G13920 29.167 576 319 14 69 571 100 659 7.81e-41 163
MsG0180001649.01.T01 AT4G13920 37.500 200 114 4 405 593 68 267 3.37e-22 103
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MsG0180001649.01.T01 AT2G24230 29.446 343 227 10 61 397 78 411 1.89e-23 107
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MsG0180001649.01.T01 AT2G24230 31.381 239 152 6 369 597 18 254 4.63e-19 93.6
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MsG0180001649.01.T01 AT1G60800 39.286 112 68 0 4 115 9 120 8.77e-11 66.2
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MsG0180001649.01.T01 AT3G24900 31.776 642 347 17 1 571 170 791 2.99e-56 210
MsG0180001649.01.T01 AT3G24900 29.154 662 353 13 42 596 116 768 1.24e-48 187
MsG0180001649.01.T01 AT3G24900 28.571 693 320 17 4 523 101 791 1.41e-45 177
MsG0180001649.01.T01 AT2G01820 27.898 742 434 24 271 923 70 799 3.13e-56 211
MsG0180001649.01.T01 AT2G01820 29.491 373 228 13 7 356 70 430 8.25e-25 112
MsG0180001649.01.T01 AT2G01820 29.737 380 218 13 51 400 66 426 4.37e-24 109
MsG0180001649.01.T01 AT2G01820 27.913 369 237 12 127 475 70 429 1.71e-23 107
MsG0180001649.01.T01 AT2G01820 30.943 265 171 10 364 624 67 323 7.72e-18 89.7
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MsG0180001649.01.T01 AT1G60800 32.653 196 98 5 169 364 53 214 3.31e-11 67.8
MsG0180001649.01.T01 AT1G60800 39.286 112 68 0 4 115 76 187 9.53e-11 66.2
MsG0180001649.01.T01 AT3G24982 29.830 704 393 13 1 616 153 843 5.53e-56 210
MsG0180001649.01.T01 AT3G24982 30.134 521 320 14 106 593 138 647 1.67e-38 155
MsG0180001649.01.T01 AT4G33430 32.488 434 280 7 484 912 70 495 6.50e-56 205
MsG0180001649.01.T01 AT4G33430 43.443 122 65 1 223 344 73 190 7.88e-18 89.0
MsG0180001649.01.T01 AT4G33430 44.954 109 60 0 127 235 73 181 1.41e-17 88.2
MsG0180001649.01.T01 AT4G33430 45.872 109 59 0 31 139 73 181 2.21e-17 87.4
MsG0180001649.01.T01 AT4G33430 45.872 109 59 0 79 187 73 181 5.26e-17 86.3
MsG0180001649.01.T01 AT4G33430 43.119 109 62 0 175 283 73 181 1.53e-15 81.6
MsG0180001649.01.T01 AT4G33430 43.564 101 57 0 110 210 80 180 4.57e-15 80.1
MsG0180001649.01.T01 AT4G33430 39.823 113 68 0 460 572 70 182 1.31e-14 78.6
MsG0180001649.01.T01 AT4G33430 40.708 113 67 0 3 115 69 181 4.87e-14 76.6
MsG0180001649.01.T01 AT4G33430 39.806 103 62 0 206 308 80 182 2.90e-13 74.3
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MsG0180001649.01.T01 AT4G33430 40.351 114 68 0 411 524 69 182 4.02e-13 73.9
MsG0180001649.01.T01 AT4G33430 42.857 91 52 0 1 91 91 181 2.29e-12 71.2
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MsG0180001649.01.T01 AT1G66830 38.587 184 111 2 6 187 70 253 1.59e-23 107
MsG0180001649.01.T01 AT1G66830 35.514 214 130 4 77 283 41 253 2.03e-23 107
MsG0180001649.01.T01 AT1G66830 41.844 141 80 2 1 139 113 253 5.87e-19 92.8
MsG0180001649.01.T01 AT1G66830 33.854 192 125 2 189 378 61 252 9.94e-19 92.0
MsG0180001649.01.T01 AT1G66830 31.401 207 118 3 270 475 70 253 5.54e-14 76.6
MsG0180001649.01.T01 AT1G66830 34.078 179 114 4 348 523 76 253 6.97e-13 73.2
MsG0180001649.01.T01 AT1G66830 31.319 182 123 2 177 356 73 254 7.40e-13 73.2
MsG0180001649.01.T01 AT4G22730 29.623 584 327 16 392 906 53 621 1.64e-52 196
MsG0180001649.01.T01 AT4G22730 41.317 167 98 0 99 265 69 235 5.66e-28 121
MsG0180001649.01.T01 AT4G22730 39.247 186 108 2 31 214 73 255 1.75e-27 119
MsG0180001649.01.T01 AT4G22730 41.317 167 98 0 51 217 69 235 3.70e-27 119
MsG0180001649.01.T01 AT4G22730 42.331 163 94 0 79 241 73 235 5.42e-26 115
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MsG0180001649.01.T01 AT5G63710 44.444 81 45 0 59 139 101 181 5.71e-11 67.0
MsG0180001649.01.T01 AT5G63710 43.678 87 49 0 102 188 96 182 5.86e-11 67.0
MsG0180001649.01.T01 AT5G63710 37.600 125 66 3 247 367 97 213 8.85e-11 66.2
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MsG0180001649.01.T01 AT1G74180 36.842 228 121 6 348 572 105 312 2.20e-20 97.8
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MsG0180001649.01.T01 AT4G39270 29.245 318 186 7 18 329 117 401 1.07e-21 101
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MsG0180001649.01.T01 AT4G39270 30.669 538 314 16 363 853 127 652 1.22e-44 172
MsG0180001649.01.T01 AT4G39270 32.308 325 211 5 96 417 99 417 3.45e-31 131
MsG0180001649.01.T01 AT4G39270 31.058 293 171 5 44 331 92 358 2.06e-24 110
MsG0180001649.01.T01 AT4G39270 39.037 187 112 2 412 596 103 289 3.06e-24 109
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MsG0180001649.01.T01 AT4G39270 30.417 240 158 4 3 238 127 361 4.47e-21 99.4
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MsG0180001649.01.T01 AT5G18500 39.024 246 132 6 702 932 162 404 2.62e-44 168
MsG0180001649.01.T01 AT5G18500 39.024 246 132 6 702 932 162 404 2.62e-44 168
MsG0180001649.01.T01 AT5G18500 39.024 246 132 6 702 932 162 404 2.62e-44 168
MsG0180001649.01.T01 AT5G18500 39.024 246 132 6 702 932 162 404 2.62e-44 168
MsG0180001649.01.T01 AT1G70130 34.545 275 164 6 636 908 274 534 3.76e-44 171
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MsG0180001649.01.T01 AT2G42960 39.271 247 130 6 702 932 179 421 6.02e-44 167
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MsG0180001649.01.T01 AT5G42440 35.816 282 160 8 642 908 7 282 1.59e-43 162
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MsG0180001649.01.T01 AT1G56720 41.981 212 116 4 702 910 175 382 2.47e-43 165
MsG0180001649.01.T01 AT1G56720 41.981 212 116 4 702 910 175 382 2.47e-43 165
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MsG0180001649.01.T01 AT4G04510 40.724 221 118 4 690 906 327 538 3.61e-43 168
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MsG0180001649.01.T01 AT4G04570 36.402 239 140 5 699 929 341 575 7.20e-43 167
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MsG0180001649.01.T01 AT5G59270 32.963 270 166 6 641 908 312 568 8.17e-43 167
MsG0180001649.01.T01 AT4G23190 33.904 292 166 6 640 915 290 570 8.30e-43 166
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MsG0180001649.01.T01 AT1G61610 35.659 258 149 5 696 943 515 765 8.93e-43 169
MsG0180001649.01.T01 AT4G23130 36.752 234 133 3 696 917 330 560 9.39e-43 167
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MsG0180001649.01.T01 AT1G51820 30.534 393 240 8 531 907 141 516 1.05e-42 166
MsG0180001649.01.T01 AT4G23200 35.865 237 137 3 693 917 323 556 1.07e-42 166
MsG0180001649.01.T01 AT1G56120 38.376 271 149 8 644 910 637 893 1.07e-42 169
MsG0180001649.01.T01 AT1G56120 38.387 310 181 6 18 326 115 415 3.30e-38 155
MsG0180001649.01.T01 AT1G56120 34.091 308 199 3 44 351 93 396 1.39e-37 153
MsG0180001649.01.T01 AT1G56120 31.595 326 195 5 193 518 98 395 1.59e-34 143
MsG0180001649.01.T01 AT1G56120 36.882 263 138 5 1 238 122 381 2.45e-31 133
MsG0180001649.01.T01 AT1G56120 31.095 283 169 2 97 355 98 378 8.65e-30 128
MsG0180001649.01.T01 AT1G56120 29.003 331 185 4 241 571 98 378 9.62e-29 124
MsG0180001649.01.T01 AT1G56120 33.224 304 194 4 120 423 102 396 1.58e-28 124
MsG0180001649.01.T01 AT1G56120 27.596 337 207 7 334 637 98 430 1.06e-22 105
MsG0180001649.01.T01 AT1G56120 38.376 271 149 8 644 910 655 911 1.10e-42 169
MsG0180001649.01.T01 AT1G56120 37.931 319 188 6 18 335 90 399 4.19e-39 158
MsG0180001649.01.T01 AT1G56120 34.091 308 199 3 44 351 68 371 1.15e-37 153
MsG0180001649.01.T01 AT1G56120 31.595 326 195 4 193 518 73 370 1.57e-34 143
MsG0180001649.01.T01 AT1G56120 36.882 263 138 5 1 238 97 356 1.90e-31 133
MsG0180001649.01.T01 AT1G56120 31.095 283 169 2 97 355 73 353 7.89e-30 128
MsG0180001649.01.T01 AT1G56120 29.003 331 185 4 241 571 73 353 8.91e-29 125
MsG0180001649.01.T01 AT1G56120 33.224 304 194 4 120 423 77 371 1.57e-28 124
MsG0180001649.01.T01 AT1G56120 27.451 306 195 4 334 616 73 374 2.06e-21 101
MsG0180001649.01.T01 AT4G11530 36.287 237 136 3 693 917 339 572 1.11e-42 167
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MsG0180001649.01.T01 AT5G16900 31.750 400 225 10 507 903 415 769 1.13e-42 168
MsG0180001649.01.T01 AT4G23130 36.752 234 133 3 696 917 334 564 1.14e-42 166
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MsG0180001649.01.T01 AT2G25440 29.388 490 295 10 93 571 129 578 1.18e-42 166
MsG0180001649.01.T01 AT2G25440 28.916 498 303 13 45 522 129 595 5.26e-31 130
MsG0180001649.01.T01 AT2G25440 26.879 439 278 10 189 596 129 555 2.75e-27 119
MsG0180001649.01.T01 AT2G25440 27.521 476 282 13 4 475 162 578 7.94e-27 117
MsG0180001649.01.T01 AT2G25440 30.086 349 224 8 2 341 251 588 1.35e-22 104
MsG0180001649.01.T01 AT2G25440 28.030 396 248 10 1 378 201 577 2.44e-20 97.1
MsG0180001649.01.T01 AT2G25440 26.316 266 162 3 1 235 316 578 6.15e-11 67.0
MsG0180001649.01.T01 AT4G29990 30.952 420 236 14 509 923 412 782 1.44e-42 168
MsG0180001649.01.T01 AT1G07560 33.247 385 215 13 532 906 414 766 1.50e-42 168
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MsG0180001649.01.T01 AT2G25470 29.885 609 346 18 69 611 137 730 9.18e-40 159
MsG0180001649.01.T01 AT2G25470 29.709 515 298 13 1 459 213 719 1.72e-31 133
MsG0180001649.01.T01 AT2G25470 32.584 267 164 6 1 262 480 735 1.12e-19 95.5
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MsG0180001649.01.T01 AT4G32710 39.819 221 121 4 692 906 375 589 1.61e-42 167
MsG0180001649.01.T01 AT3G56100 32.576 396 223 8 367 737 106 482 1.81e-42 163
MsG0180001649.01.T01 AT3G56100 37.333 225 129 1 60 284 111 323 3.53e-30 126
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MsG0180001649.01.T01 AT3G56100 30.556 252 156 2 270 521 105 337 9.00e-26 113
MsG0180001649.01.T01 AT3G56100 37.156 218 125 1 150 355 105 322 4.04e-25 111
MsG0180001649.01.T01 AT3G56100 36.239 218 125 2 1 206 124 339 1.42e-23 106
MsG0180001649.01.T01 AT3G56100 32.589 224 139 1 252 475 111 322 2.45e-21 99.4
MsG0180001649.01.T01 AT3G56100 32.159 227 142 1 174 400 105 319 1.16e-17 87.8
MsG0180001649.01.T01 AT3G56100 38.060 134 83 0 460 593 103 236 6.54e-15 79.3
MsG0180001649.01.T01 AT3G56100 37.168 113 71 0 483 595 102 214 2.18e-12 71.2
MsG0180001649.01.T01 AT4G27290 37.339 233 132 3 697 918 456 685 2.08e-42 167
MsG0180001649.01.T01 AT2G43700 35.556 270 159 7 640 907 254 510 2.12e-42 165
MsG0180001649.01.T01 AT2G43700 35.556 270 159 7 640 907 254 510 2.12e-42 165
MsG0180001649.01.T01 AT2G43700 35.556 270 159 7 640 907 254 510 2.12e-42 165
MsG0180001649.01.T01 AT2G43700 35.556 270 159 7 640 907 254 510 2.12e-42 165
MsG0180001649.01.T01 AT1G56140 40.611 229 128 4 686 910 670 894 2.17e-42 168
MsG0180001649.01.T01 AT1G56140 38.376 271 163 2 17 286 113 380 1.24e-36 150
MsG0180001649.01.T01 AT1G56140 36.948 249 157 0 40 288 112 360 2.15e-34 143
MsG0180001649.01.T01 AT1G56140 33.677 291 185 3 44 331 92 377 2.21e-34 143
MsG0180001649.01.T01 AT1G56140 30.945 307 186 4 193 499 97 377 6.99e-33 138
MsG0180001649.01.T01 AT1G56140 37.452 259 160 1 4 262 124 380 9.29e-33 137
MsG0180001649.01.T01 AT1G56140 37.238 239 146 3 1 238 145 380 5.35e-32 135
MsG0180001649.01.T01 AT1G56140 33.579 271 177 2 136 406 112 379 9.04e-31 131
MsG0180001649.01.T01 AT1G56140 29.712 313 188 5 241 550 97 380 5.75e-30 129
MsG0180001649.01.T01 AT1G56140 30.662 287 170 3 334 596 97 378 6.28e-27 119
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MsG0180001649.01.T01 AT1G51790 30.046 436 259 14 505 935 410 804 3.30e-42 167
MsG0180001649.01.T01 AT1G61480 34.106 302 182 5 635 922 422 720 3.39e-42 166
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MsG0180001649.01.T01 AT4G23180 37.131 237 131 4 693 916 335 566 4.02e-42 165
MsG0180001649.01.T01 AT3G46420 30.046 436 231 10 532 962 412 778 4.10e-42 166
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MsG0180001649.01.T01 AT1G56130 37.356 174 105 2 18 190 12 182 2.85e-19 94.0
MsG0180001649.01.T01 AT1G56130 33.333 198 128 3 129 326 3 196 9.68e-17 85.9
MsG0180001649.01.T01 AT1G56130 31.579 190 127 2 391 580 1 187 3.76e-14 77.4
MsG0180001649.01.T01 AT1G56130 31.156 199 133 3 225 423 3 197 6.31e-13 73.6
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MsG0180001649.01.T01 AT1G56130 31.618 272 158 5 247 518 4 247 3.34e-25 113
MsG0180001649.01.T01 AT1G56130 35.814 215 110 3 1 190 22 233 1.43e-23 108
MsG0180001649.01.T01 AT1G56130 32.787 244 160 3 180 423 9 248 3.35e-22 103
MsG0180001649.01.T01 AT1G56130 30.040 253 151 2 388 616 1 251 1.29e-21 101
MsG0180001649.01.T01 AT1G56130 29.876 241 166 2 340 580 1 238 2.24e-20 97.8
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MsG0180001649.01.T01 AT1G56130 40.367 218 125 3 694 910 682 895 5.15e-42 167
MsG0180001649.01.T01 AT1G56130 37.979 287 172 4 18 303 115 396 1.18e-37 153
MsG0180001649.01.T01 AT1G56130 33.442 308 201 3 44 351 93 396 1.44e-36 150
MsG0180001649.01.T01 AT1G56130 31.288 326 196 5 193 518 98 395 4.97e-34 142
MsG0180001649.01.T01 AT1G56130 36.820 239 147 4 1 238 146 381 5.62e-31 132
MsG0180001649.01.T01 AT1G56130 33.444 302 192 4 122 423 104 396 1.02e-30 131
MsG0180001649.01.T01 AT1G56130 29.394 330 199 7 241 567 98 396 1.16e-28 124
MsG0180001649.01.T01 AT1G56130 30.545 275 188 2 306 580 115 386 3.31e-24 110
MsG0180001649.01.T01 AT1G56130 28.105 306 193 4 334 616 98 399 5.34e-24 109
MsG0180001649.01.T01 AT4G20450 31.300 377 233 8 532 903 432 787 5.51e-42 166
MsG0180001649.01.T01 AT5G53320 28.791 455 290 12 463 906 70 501 5.95e-42 163
MsG0180001649.01.T01 AT5G53320 33.529 170 107 3 27 195 66 230 2.58e-15 80.9
MsG0180001649.01.T01 AT5G53320 34.507 142 90 3 98 238 65 204 1.42e-13 75.1
MsG0180001649.01.T01 AT5G53320 34.507 142 90 2 194 334 65 204 4.21e-13 73.9
MsG0180001649.01.T01 AT5G53320 32.394 142 93 2 50 190 65 204 5.41e-13 73.6
MsG0180001649.01.T01 AT5G53320 35.669 157 92 4 349 502 54 204 1.21e-11 68.9
MsG0180001649.01.T01 AT5G53320 33.333 144 93 2 144 286 63 204 1.96e-11 68.6
MsG0180001649.01.T01 AT4G01330 41.706 211 118 4 702 910 158 365 6.17e-42 160
MsG0180001649.01.T01 AT5G01560 31.915 282 169 6 640 915 309 573 7.03e-42 164
MsG0180001649.01.T01 AT4G02630 39.151 212 123 4 702 910 158 366 7.35e-42 161
MsG0180001649.01.T01 AT5G59260 35.294 255 148 7 659 910 317 557 7.43e-42 164
MsG0180001649.01.T01 AT4G13810 28.929 560 315 18 46 547 1 535 8.03e-42 163
MsG0180001649.01.T01 AT4G13810 26.276 529 307 12 1 452 14 536 1.14e-32 135
MsG0180001649.01.T01 AT4G13810 24.754 509 328 12 142 618 1 486 4.85e-21 99.4
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MsG0180001649.01.T01 AT1G56145 37.449 243 140 4 1 238 141 376 1.45e-33 140
MsG0180001649.01.T01 AT1G56145 33.948 271 153 2 85 331 105 373 2.92e-32 136
MsG0180001649.01.T01 AT1G56145 35.385 260 164 3 4 262 120 376 2.48e-30 130
MsG0180001649.01.T01 AT1G56145 29.139 302 210 3 97 398 93 390 3.96e-29 126
MsG0180001649.01.T01 AT1G56145 27.358 318 181 4 254 571 106 373 3.75e-25 113
MsG0180001649.01.T01 AT1G56145 29.259 270 165 2 351 596 107 374 1.44e-21 101
MsG0180001649.01.T01 AT1G56145 28.384 229 164 0 367 595 99 327 2.60e-20 97.8
MsG0180001649.01.T01 AT1G56145 30.058 173 120 1 409 581 94 265 1.76e-16 85.1
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MsG0180001649.01.T01 AT2G25220 38.967 213 127 1 701 913 141 350 3.82e-41 157
MsG0180001649.01.T01 AT1G26150 37.768 233 131 4 696 918 420 648 4.17e-41 161
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MsG0180001649.01.T01 AT5G40170 28.706 425 270 12 213 612 109 525 2.22e-24 110
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MsG0180001649.01.T01 AT5G40170 34.615 156 98 4 436 588 91 245 4.17e-11 67.8
MsG0180001649.01.T01 AT1G69730 38.400 250 133 6 701 940 442 680 5.26e-41 162
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MsG0180001649.01.T01 AT4G34220 34.286 245 151 4 378 616 42 282 1.86e-25 113
MsG0180001649.01.T01 AT4G34220 34.951 206 112 4 68 252 73 277 2.42e-19 94.4
MsG0180001649.01.T01 AT4G34220 37.640 178 105 4 4 180 105 277 5.04e-15 80.1
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MsG0180001649.01.T01 AT5G60300 32.852 277 167 7 634 908 283 542 1.01e-40 161
MsG0180001649.01.T01 AT4G23160 33.929 280 160 7 652 917 310 578 1.02e-40 160
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MsG0180001649.01.T01 AT1G29730 35.426 223 141 2 110 331 110 330 1.59e-26 117
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MsG0180001649.01.T01 AT1G29730 34.468 235 147 4 4 237 172 400 1.01e-19 95.9
MsG0180001649.01.T01 AT1G29730 31.818 264 173 5 305 567 113 370 1.26e-19 95.5
MsG0180001649.01.T01 AT1G29730 29.368 269 183 4 321 588 105 367 2.88e-16 84.3
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MsG0180001649.01.T01 AT1G51805 29.897 388 239 9 531 903 404 773 1.26e-40 162
MsG0180001649.01.T01 AT3G45420 39.171 217 126 4 693 908 337 548 1.36e-40 160
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MsG0180001649.01.T01 AT5G05160 35.714 168 73 5 91 254 91 227 4.22e-12 70.5
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MsG0180001649.01.T01 AT2G30740 38.739 222 126 4 697 910 62 281 2.50e-40 153
MsG0180001649.01.T01 AT2G30740 38.739 222 126 4 697 910 62 281 2.50e-40 153
MsG0180001649.01.T01 AT2G30740 38.739 222 126 4 697 910 62 281 2.50e-40 153
MsG0180001649.01.T01 AT2G30740 38.739 222 126 4 697 910 62 281 2.50e-40 153
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MsG0180001649.01.T01 AT2G19230 28.062 449 260 15 507 951 415 804 2.50e-40 161
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MsG0180001649.01.T01 AT4G34440 37.872 235 131 5 694 919 300 528 2.50e-40 159
MsG0180001649.01.T01 AT4G03230 33.555 301 172 8 629 907 524 818 2.55e-40 161
MsG0180001649.01.T01 AT1G51860 29.381 388 237 10 532 903 269 635 2.70e-40 160
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MsG0180001649.01.T01 AT4G03230 33.555 301 172 8 629 907 496 790 2.82e-40 161
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MsG0180001649.01.T01 AT2G29000 31.551 374 234 6 532 903 408 761 4.19e-40 160
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MsG0180001649.01.T01 AT1G53430 40.726 248 129 2 18 248 73 319 3.71e-35 145
MsG0180001649.01.T01 AT1G53430 39.706 204 106 2 4 190 106 309 8.37e-29 125
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MsG0180001649.01.T01 AT1G53430 32.601 273 164 4 240 495 55 324 8.57e-25 112
MsG0180001649.01.T01 AT1G53430 32.558 258 153 4 360 597 52 308 5.96e-23 106
MsG0180001649.01.T01 AT1G61360 32.432 296 184 4 639 921 348 640 1.05e-39 158
MsG0180001649.01.T01 AT1G61360 32.432 296 184 4 639 921 348 640 1.05e-39 158
MsG0180001649.01.T01 AT1G61360 32.432 296 184 4 639 921 348 640 1.05e-39 158
MsG0180001649.01.T01 AT1G61500 31.068 309 177 8 633 921 404 696 1.11e-39 159
MsG0180001649.01.T01 AT2G48010 31.464 321 189 10 636 932 208 521 1.17e-39 157
MsG0180001649.01.T01 AT1G11340 31.707 287 170 4 637 906 437 714 1.20e-39 159
MsG0180001649.01.T01 AT1G16120 40.191 209 121 2 701 908 424 629 1.21e-39 158
MsG0180001649.01.T01 AT2G18470 33.829 269 161 6 696 954 274 535 1.21e-39 155
MsG0180001649.01.T01 AT1G53430 37.456 283 156 7 640 915 614 882 1.22e-39 159
MsG0180001649.01.T01 AT1G53430 36.462 277 168 4 31 304 95 366 8.59e-37 150
MsG0180001649.01.T01 AT1G53430 39.844 256 128 3 18 248 106 360 3.40e-34 142
MsG0180001649.01.T01 AT1G53430 32.131 305 177 5 96 398 88 364 2.05e-31 133
MsG0180001649.01.T01 AT1G53430 37.339 233 139 3 4 233 139 367 8.16e-30 128
MsG0180001649.01.T01 AT1G53430 31.861 317 204 7 132 445 76 383 1.93e-27 120
MsG0180001649.01.T01 AT1G53430 30.065 306 182 5 193 495 89 365 7.92e-26 115
MsG0180001649.01.T01 AT1G53430 30.868 311 187 6 240 550 88 370 1.16e-24 111
MsG0180001649.01.T01 AT1G53430 31.579 266 153 4 360 597 85 349 9.52e-23 105
MsG0180001649.01.T01 AT1G52290 35.780 218 135 3 694 910 131 344 1.24e-39 155
MsG0180001649.01.T01 AT5G20050 35.640 289 157 9 642 907 28 310 1.25e-39 153
MsG0180001649.01.T01 AT1G53440 37.918 269 151 6 640 906 612 866 1.27e-39 159
MsG0180001649.01.T01 AT1G53440 36.187 257 162 2 31 286 93 348 4.10e-35 145
MsG0180001649.01.T01 AT1G53440 34.661 251 160 4 1 249 111 359 1.45e-30 130
MsG0180001649.01.T01 AT1G53440 29.934 304 209 3 96 398 62 362 1.40e-28 124
MsG0180001649.01.T01 AT1G53440 30.000 310 189 4 223 531 93 375 2.31e-24 110
MsG0180001649.01.T01 AT1G53440 29.969 327 171 8 271 593 93 365 1.23e-22 105
MsG0180001649.01.T01 AT1G61360 32.432 296 184 4 639 921 429 721 1.27e-39 159
MsG0180001649.01.T01 AT4G11900 33.893 298 180 7 625 912 383 673 1.32e-39 158

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CATAGGTAATTTGATAAATT+TGG 0.070481 1:+24672456 MsG0180001649.01.T01:CDS
CTGTTAGCATTAATTGTTTA+TGG 0.081744 1:+24674059 MsG0180001649.01.T01:CDS
CATAGGTAATTTGATTAATT+TGG 0.090304 1:+24672168 MsG0180001649.01.T01:CDS
CGCAACATTGTGAAGTTATA+TGG 0.113959 1:+24674392 MsG0180001649.01.T01:CDS
CATAGGTAACTTGATCAATT+TGG 0.143311 1:+24672744 MsG0180001649.01.T01:CDS
CATAGGTAACTTGATCAATT+TGG 0.143311 1:+24672888 MsG0180001649.01.T01:CDS
CATAGGTAACTTAATCAATT+TGG 0.146973 1:+24672312 MsG0180001649.01.T01:CDS
CTTTGGTGTGTATCCAAATT+TGG 0.151007 1:+24673248 MsG0180001649.01.T01:CDS
TGTTCCCCTCAAACTTATTT+TGG 0.153125 1:-24673647 None:intergenic
CATAGGTAACTTGATCAATT+TGG 0.165617 1:+24672600 MsG0180001649.01.T01:CDS
ATCCAGCAAGAATGTTATTT+TGG 0.169839 1:+24674610 MsG0180001649.01.T01:CDS
TTCTTGCACTTTCCCCAATT+TGG 0.178997 1:-24673315 None:intergenic
TTGAAAATCTATTTGAAATA+TGG 0.186623 1:+24674147 MsG0180001649.01.T01:CDS
AAGTCCATGTATTCCAAATT+TGG 0.193505 1:-24673261 None:intergenic
GTAGCTCATGTCTCAGATTT+TGG 0.198676 1:+24674644 MsG0180001649.01.T01:CDS
ATGGTCATCTTTCTCCAAAT+TGG 0.199903 1:+24673301 MsG0180001649.01.T01:CDS
TCACAAGACTAACAAAATTT+TGG 0.202645 1:+24674004 MsG0180001649.01.T01:CDS
GAGCAATTCTTCAAACTCTT+TGG 0.223314 1:-24673168 None:intergenic
CTTTCAGAAAATAATCTTTC+CGG 0.242794 1:+24672490 MsG0180001649.01.T01:CDS
AGAAGTCATATTGGATGAAT+TGG 0.248380 1:-24674687 None:intergenic
TTGAGAAAAGATATAATTTA+CGG 0.250416 1:-24672981 None:intergenic
CAGAGAGTTCATTATCATTA+AGG 0.258987 1:-24672345 None:intergenic
GGACCAATTCCTTCCACTAT+TGG 0.260400 1:+24672655 MsG0180001649.01.T01:CDS
GGACCAATTCCTTTCACTAT+TGG 0.273295 1:+24672511 MsG0180001649.01.T01:CDS
ATGCTTCAATTGGAGCTCTT+TGG 0.275818 1:-24673905 None:intergenic
TTTGAAATATGGAGCTTTGA+TGG 0.292715 1:+24674158 MsG0180001649.01.T01:CDS
TGGTCATCTTTCTCCAAATT+GGG 0.300180 1:+24673302 MsG0180001649.01.T01:CDS
AATGAATAGGCTTATAGATT+TGG 0.300534 1:+24673032 MsG0180001649.01.T01:CDS
TTTGTTGCTCTGCCTAGTTC+TGG 0.306277 1:-24673387 None:intergenic
TCTTCCTGTTAAATTATTAT+CGG 0.311016 1:-24673358 None:intergenic
AAATGTGATGTGTTTAGTTT+TGG 0.313804 1:+24674925 MsG0180001649.01.T01:CDS
TGTTAGCATTAATTGTTTAT+GGG 0.331015 1:+24674060 MsG0180001649.01.T01:CDS
ATCATGATGCAGATAGAATA+AGG 0.334994 1:-24674558 None:intergenic
GGGAACATTCCTGTTGAGTT+TGG 0.340394 1:+24673663 MsG0180001649.01.T01:CDS
ATCCAAAATAACATTCTTGC+TGG 0.343575 1:-24674612 None:intergenic
TAACATATCAACAAAGCTTA+AGG 0.348298 1:-24673817 None:intergenic
GTTGAAGTCTCACTCTCTTA+AGG 0.349081 1:-24673194 None:intergenic
CTTTGGAAAGCTGTAATGTT+TGG 0.352098 1:-24673888 None:intergenic
CAAGAATTCATAAACCAAAA+AGG 0.357760 1:-24674438 None:intergenic
GTGAATTTGATTGGAATATG+AGG 0.359614 1:+24674507 MsG0180001649.01.T01:CDS
TTATTTGTCAATGCTTCAAT+TGG 0.367532 1:-24673915 None:intergenic
ATGTTTCTAAGTGATTTAAC+TGG 0.369063 1:-24673758 None:intergenic
TTTAACTGGCCAAGCATTGC+TGG 0.370234 1:-24673744 None:intergenic
ATCTCCGATAATAATTTAAC+AGG 0.372742 1:+24673354 MsG0180001649.01.T01:CDS
TTGACAACAAACATCTCATT+GGG 0.375318 1:+24674222 MsG0180001649.01.T01:CDS
TTTCCAATAGTGAAAGGAAT+TGG 0.376355 1:-24672514 None:intergenic
TTTCCGATGGTGGAAGGAAT+TGG 0.378321 1:-24672802 None:intergenic
GAAGTCATATTGGATGAATT+GGG 0.379546 1:-24674686 None:intergenic
TTTCCAACGGTGGAAGGAAT+TGG 0.380760 1:-24672946 None:intergenic
TCTTCAAACTCTTTGGAACT+AGG 0.381133 1:-24673161 None:intergenic
CTGGCCAAGCATTGCTGGTA+TGG 0.382921 1:-24673739 None:intergenic
AACAAGCTGGTGAATTTGAT+TGG 0.385484 1:+24674498 MsG0180001649.01.T01:CDS
AGGCAGAGCAACAAATTTAC+AGG 0.388830 1:+24673395 MsG0180001649.01.T01:CDS
TTTCCGATAGTGAAAGGAAT+TGG 0.389079 1:-24672226 None:intergenic
ATTGAAACTCTTGATCTTAG+TGG 0.392053 1:+24673699 MsG0180001649.01.T01:CDS
GCAACATTGTGAAGTTATAT+GGG 0.401509 1:+24674393 MsG0180001649.01.T01:CDS
TTTGACAACAAACATCTCAT+TGG 0.411113 1:+24674221 MsG0180001649.01.T01:CDS
CTCATTGGGGTTGGAGGACA+TGG 0.411451 1:+24674236 MsG0180001649.01.T01:CDS
GATATATCTCGATGAACAAT+AGG 0.416925 1:-24674590 None:intergenic
CTAGAGCCTTGCTCAACATC+TGG 0.417442 1:+24673966 MsG0180001649.01.T01:CDS
TTCAATTGGCCAAACTCAAC+AGG 0.425958 1:-24673672 None:intergenic
AACATATCAACAAAGCTTAA+GGG 0.429252 1:-24673816 None:intergenic
AATGCCATTGATAGATAAGT+TGG 0.430113 1:+24675050 MsG0180001649.01.T01:CDS
CAAATTTATCAAATTACCTA+TGG 0.430229 1:-24672455 None:intergenic
GAGATATTGTAACTTATTTG+TGG 0.436360 1:+24674986 MsG0180001649.01.T01:CDS
CTTAATGAAAATAGTCTCTC+TGG 0.438726 1:+24672922 MsG0180001649.01.T01:CDS
CTTTCACAAAATAGTCTCTC+TGG 0.438902 1:+24672634 MsG0180001649.01.T01:CDS
ATAAGCCTATTCATTTCTGT+TGG 0.441018 1:-24673024 None:intergenic
CAAATTGATTAAGTTACCTA+TGG 0.442680 1:-24672311 None:intergenic
TGCAATGATGCAATTTGTAT+AGG 0.443932 1:-24673528 None:intergenic
TATCCAATAGTGGAAGGAAT+TGG 0.447814 1:-24672658 None:intergenic
GCCTGCAAAAGAAGTCATAT+TGG 0.449260 1:-24674696 None:intergenic
TCAATTTGAAGTTCTTGTGC+AGG 0.451842 1:-24674128 None:intergenic
GGCTTGTGTGGTAATGTCTC+TGG 0.453293 1:+24673942 MsG0180001649.01.T01:CDS
ATATTCCAACAGAAATGAAT+AGG 0.455649 1:+24673019 MsG0180001649.01.T01:CDS
CTTTCACAAAATACTCTCTC+TGG 0.457222 1:+24672202 MsG0180001649.01.T01:CDS
CAAATTAATCAAATTACCTA+TGG 0.458126 1:-24672167 None:intergenic
TTTGAGCCAAAATAAGTTTG+AGG 0.462353 1:+24673641 MsG0180001649.01.T01:CDS
ATGTTTGTTGTCAAAATCTT+CGG 0.462670 1:-24674213 None:intergenic
CAAATTGATCAAGTTACCTA+TGG 0.462771 1:-24672599 None:intergenic
CTCTCACATAACAATCTCTC+TGG 0.463272 1:+24673786 MsG0180001649.01.T01:CDS
TTTCTGATAGTCGAAGGAAT+TGG 0.469770 1:-24672370 None:intergenic
CTTTCAAATAATAATCTCTC+TGG 0.472237 1:+24672778 MsG0180001649.01.T01:CDS
CAAATTGATCAAGTTACCTA+TGG 0.473242 1:-24672743 None:intergenic
CAAATTGATCAAGTTACCTA+TGG 0.473242 1:-24672887 None:intergenic
GAGTTTCAATAACATTCAAT+TGG 0.476442 1:-24673686 None:intergenic
TTGAAACTCTTGATCTTAGT+GGG 0.476861 1:+24673700 MsG0180001649.01.T01:CDS
TTGAGCCAAAATAAGTTTGA+GGG 0.478924 1:+24673642 MsG0180001649.01.T01:CDS
GGACCAATTCCTTCCACCGT+TGG 0.480523 1:+24672943 MsG0180001649.01.T01:CDS
GTTAAATTTCCGATAGTGAA+AGG 0.484125 1:-24672232 None:intergenic
ACTTCATTCATTACAAAATG+AGG 0.484177 1:+24674310 MsG0180001649.01.T01:CDS
CGGTGGCGTTCCGCATGTAA+AGG 0.484833 1:+24675114 MsG0180001649.01.T01:CDS
CAGAGAGATTATTATTTGAA+AGG 0.485708 1:-24672777 None:intergenic
TTGGAACTAGGCCTGTGAAC+TGG 0.489415 1:-24673149 None:intergenic
GTCAAATTTCTGATAGTCGA+AGG 0.490563 1:-24672376 None:intergenic
GGACCAATTCCTTTCACTAT+CGG 0.491913 1:+24672223 MsG0180001649.01.T01:CDS
CTTTATTCAAATGCTCTCAC+TGG 0.492733 1:+24672418 MsG0180001649.01.T01:CDS
TTGGAGTTGGACCCTCCAAC+TGG 0.494102 1:-24673869 None:intergenic
CTTAATGATAATGAACTCTC+TGG 0.498109 1:+24672346 MsG0180001649.01.T01:CDS
ACCTTTGGATATGCTGCTCC+AGG 0.502524 1:+24674719 MsG0180001649.01.T01:CDS
CTAGCTCTATCCCTCACTCT+AGG 0.502850 1:+24674029 MsG0180001649.01.T01:CDS
TACAAAGCAGAGTTGCCTAC+AGG 0.503101 1:+24674266 MsG0180001649.01.T01:CDS
GTCATATTTCCAATAGTGAA+AGG 0.504511 1:-24672520 None:intergenic
AAATAAGTTACAATATCTCC+AGG 0.507529 1:-24674982 None:intergenic
GTATCCAAATTTGGAATACA+TGG 0.507870 1:+24673257 MsG0180001649.01.T01:CDS
GGTTTATGAATTCTTGGAGA+AGG 0.509588 1:+24674445 MsG0180001649.01.T01:CDS
TATGGAAAGTGGAATTTGTC+CGG 0.510167 1:-24672581 None:intergenic
ATGGCATTATATCAAGTCTC+AGG 0.511731 1:-24675035 None:intergenic
TGCTTTCGTTAAATTTCCGA+TGG 0.513778 1:-24672815 None:intergenic
GTTTATGAATTCTTGGAGAA+GGG 0.514614 1:+24674446 MsG0180001649.01.T01:CDS
AAACATCTCATTGGGGTTGG+AGG 0.519615 1:+24674230 MsG0180001649.01.T01:CDS
CAATTAATGCTAACAGTAGC+AGG 0.520035 1:-24674052 None:intergenic
CTTAGTGGGAATTCTATGAA+TGG 0.521387 1:+24673714 MsG0180001649.01.T01:CDS
GGAAATATAACAGACAGCTT+TGG 0.521630 1:+24673231 MsG0180001649.01.T01:CDS
ATCAAGTTACCTATGGAAAG+TGG 0.522169 1:-24672592 None:intergenic
GTGTCCAACTTATCTATCAA+TGG 0.522570 1:-24675054 None:intergenic
GTTAAATTTCCGATGGTGGA+AGG 0.524021 1:-24672808 None:intergenic
AACAAACATCTCATTGGGGT+TGG 0.529685 1:+24674227 MsG0180001649.01.T01:CDS
TCAAATTACCTATGGATGGT+GGG 0.530677 1:-24672159 None:intergenic
TTGATTAAGTTACCTATGGA+AGG 0.539180 1:-24672307 None:intergenic
CCTCACAATATCTGTATCGG+TGG 0.539565 1:+24673096 MsG0180001649.01.T01:CDS
GTTGCACTTAACCAGTTCAC+AGG 0.541179 1:+24673138 MsG0180001649.01.T01:CDS
TTTATCAAATTACCTATGGA+AGG 0.541207 1:-24672451 None:intergenic
GGTCATCTTTCTCCAAATTG+GGG 0.541441 1:+24673303 MsG0180001649.01.T01:CDS
GTCATATTTCCAACGGTGGA+AGG 0.542512 1:-24672952 None:intergenic
ATTGCATCAACTAACTGCAT+TGG 0.543519 1:+24673545 MsG0180001649.01.T01:CDS
GGACCAATTCCTTCCACCAT+CGG 0.544747 1:+24672799 MsG0180001649.01.T01:CDS
CTTTACTCAAATGCTCTCAC+TGG 0.546338 1:+24672706 MsG0180001649.01.T01:CDS
ACGCCACCGTCTTGAACCAA+TGG 0.548038 1:-24675100 None:intergenic
GGAAGAATACCACCAGAACT+AGG 0.548390 1:+24673375 MsG0180001649.01.T01:CDS
TGATATATCTTACAACCAGT+TGG 0.553148 1:+24673854 MsG0180001649.01.T01:CDS
AATAGTGAAAGGAATTGGTC+CGG 0.553527 1:-24672509 None:intergenic
ATATCTCGATGAACAATAGG+AGG 0.553975 1:-24674587 None:intergenic
ATCAAATTACCTATGGATGG+TGG 0.554935 1:-24672160 None:intergenic
GTCATATATCCAATAGTGGA+AGG 0.555615 1:-24672664 None:intergenic
ACAACCTTCACAAAGTGTTA+CGG 0.557625 1:+24675011 MsG0180001649.01.T01:CDS
CAGATGTTGAGCAAGGCTCT+AGG 0.563152 1:-24673965 None:intergenic
GGAACCATACCAGCAATGCT+TGG 0.563492 1:+24673735 MsG0180001649.01.T01:CDS
AAAGCTGTAATGTTTGGAGT+TGG 0.563655 1:-24673882 None:intergenic
ACAAATAACAAAGGCTTGTG+TGG 0.563707 1:+24673930 MsG0180001649.01.T01:CDS
TATATCTTACAACCAGTTGG+AGG 0.566593 1:+24673857 MsG0180001649.01.T01:CDS
TTAATCAAATTACCTATGGA+TGG 0.569192 1:-24672163 None:intergenic
ATCAACAAAGCTTAAGGGAA+TGG 0.569719 1:-24673811 None:intergenic
GTCGAATTTCTGTCAAAGCA+TGG 0.570202 1:-24674367 None:intergenic
TTACCTCACAATATCTGTAT+CGG 0.574362 1:+24673093 MsG0180001649.01.T01:CDS
GTTGCTCTGCCTAGTTCTGG+TGG 0.574402 1:-24673384 None:intergenic
CTTGCAACAAATAATTTGAG+TGG 0.576244 1:+24673570 MsG0180001649.01.T01:CDS
TTGAAGGACAATGAACAAGC+TGG 0.579238 1:+24674485 MsG0180001649.01.T01:CDS
CAGTAGCAGGCCTAGAGTGA+GGG 0.580906 1:-24674039 None:intergenic
TGAATTTGATTGGAATATGA+GGG 0.581291 1:+24674508 MsG0180001649.01.T01:CDS
TTGATCAAGTTACCTATGGA+AGG 0.585103 1:-24672739 None:intergenic
TTGATCAAGTTACCTATGGA+AGG 0.589484 1:-24672883 None:intergenic
ATCAAATTACCTATGGAAGG+TGG 0.590379 1:-24672448 None:intergenic
TGAGCCAAAATAAGTTTGAG+GGG 0.592106 1:+24673643 MsG0180001649.01.T01:CDS
ACAGTAGCAGGCCTAGAGTG+AGG 0.592489 1:-24674040 None:intergenic
ATTAAGTTACCTATGGAAGG+TGG 0.598634 1:-24672304 None:intergenic
GAGTCAATCCCACCATCCAT+AGG 0.599000 1:+24672151 MsG0180001649.01.T01:CDS
GGACAAATTCCACCTTCCAT+AGG 0.599263 1:+24672295 MsG0180001649.01.T01:CDS
GGACAAATTCCACCTTCCAT+AGG 0.599263 1:+24672439 MsG0180001649.01.T01:CDS
GGACAAATTCCACCTTCCAT+AGG 0.599263 1:+24672871 MsG0180001649.01.T01:CDS
TTGCCACCAGATGTTGAGCA+AGG 0.599900 1:-24673972 None:intergenic
ACAGCTACAACTTGACCTGT+AGG 0.602183 1:-24674281 None:intergenic
GGACAAATTCCACTTTCCAT+AGG 0.603565 1:+24672583 MsG0180001649.01.T01:CDS
TTTCGTTAAATTTCCGATGG+TGG 0.607644 1:-24672812 None:intergenic
ATTCTTGGAGAAGGGTAGCA+TGG 0.617316 1:+24674454 MsG0180001649.01.T01:CDS
ATCAAGTTACCTATGGAAGG+TGG 0.621140 1:-24672880 None:intergenic
GAGCCTTGCTCAACATCTGG+TGG 0.627061 1:+24673969 MsG0180001649.01.T01:CDS
ATCTCGATGAACAATAGGAG+GGG 0.628946 1:-24674585 None:intergenic
CTCACAATATCTGTATCGGT+GGG 0.634679 1:+24673097 MsG0180001649.01.T01:CDS
ATATCTTACAACCAGTTGGA+GGG 0.634834 1:+24673858 MsG0180001649.01.T01:CDS
AGGTCCGTAACACTTTGTGA+AGG 0.636371 1:-24675015 None:intergenic
GAAGCATTGACAAATAACAA+AGG 0.643393 1:+24673921 MsG0180001649.01.T01:CDS
ACCTGGAGCAGCATATCCAA+AGG 0.646146 1:-24674720 None:intergenic
TATCTCGATGAACAATAGGA+GGG 0.654413 1:-24674586 None:intergenic
TACAGAACTTGCATACACAA+TGG 0.658091 1:+24674891 MsG0180001649.01.T01:intron
AATAAGTTACAATATCTCCA+GGG 0.667842 1:-24674981 None:intergenic
TGACAACAAACATCTCATTG+GGG 0.673919 1:+24674223 MsG0180001649.01.T01:CDS
CCACCGATACAGATATTGTG+AGG 0.682812 1:-24673096 None:intergenic
AAACCATTGGTTCAAGACGG+TGG 0.693991 1:+24675097 MsG0180001649.01.T01:CDS
CAACTGCAATCCTTTACATG+CGG 0.694706 1:-24675124 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! TTAAGTGATAATAATTTTTA+TGG + Chr1:24673282-24673301 MsG0180001649.01.T01:CDS 10.0%
!! TAAAAAAAAGAAAAGAAAAG+AGG - Chr1:24674751-24674770 None:intergenic 15.0%
!! TTGAGAAAAGATATAATTTA+CGG - Chr1:24672984-24673003 None:intergenic 15.0%
!!! CAAAATTATTTTCAGATAAA+TGG - Chr1:24673065-24673084 None:intergenic 15.0%
!!! TTATCTGAAAATAATTTTGT+TGG + Chr1:24673066-24673085 MsG0180001649.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTGAAAATCTATTTGAAATA+TGG + Chr1:24674147-24674166 MsG0180001649.01.T01:CDS 15.0%
!! CAAATTAATCAAATTACCTA+TGG - Chr1:24672170-24672189 None:intergenic 20.0%
!! CAAATTTATCAAATTACCTA+TGG - Chr1:24672458-24672477 None:intergenic 20.0%
!! CATAGGTAATTTGATAAATT+TGG + Chr1:24672456-24672475 MsG0180001649.01.T01:CDS 20.0%
!! CATAGGTAATTTGATTAATT+TGG + Chr1:24672168-24672187 MsG0180001649.01.T01:CDS 20.0%
!! TCTTCCTGTTAAATTATTAT+CGG - Chr1:24673361-24673380 None:intergenic 20.0%
!! TGTTAGCATTAATTGTTTAT+GGG + Chr1:24674060-24674079 MsG0180001649.01.T01:CDS 20.0%
!!! AATTATTATCGGAGATTTTT+AGG - Chr1:24673350-24673369 None:intergenic 20.0%
!!! TACATTTCATGTTTTGTTTA+TGG + Chr1:24674850-24674869 MsG0180001649.01.T01:intron 20.0%
!!! TTAAGTAACAATCATCTTTT+TGG + Chr1:24673498-24673517 MsG0180001649.01.T01:CDS 20.0%
! AAATAAGTTACAATATCTCC+AGG - Chr1:24674985-24675004 None:intergenic 25.0%
! AACATATCAACAAAGCTTAA+GGG - Chr1:24673819-24673838 None:intergenic 25.0%
! AATAAGTTACAATATCTCCA+GGG - Chr1:24674984-24675003 None:intergenic 25.0%
! AATGAATAGGCTTATAGATT+TGG + Chr1:24673032-24673051 MsG0180001649.01.T01:CDS 25.0%
! ACTTCATTCATTACAAAATG+AGG + Chr1:24674310-24674329 MsG0180001649.01.T01:CDS 25.0%
! ATATTCCAACAGAAATGAAT+AGG + Chr1:24673019-24673038 MsG0180001649.01.T01:CDS 25.0%
! ATCTCCGATAATAATTTAAC+AGG + Chr1:24673354-24673373 MsG0180001649.01.T01:CDS 25.0%
! CAAATTGATTAAGTTACCTA+TGG - Chr1:24672314-24672333 None:intergenic 25.0%
! CAAGAATTCATAAACCAAAA+AGG - Chr1:24674441-24674460 None:intergenic 25.0%
! CAGAGAGATTATTATTTGAA+AGG - Chr1:24672780-24672799 None:intergenic 25.0%
! CATAGGTAACTTAATCAATT+TGG + Chr1:24672312-24672331 MsG0180001649.01.T01:CDS 25.0%
! CTGTTAGCATTAATTGTTTA+TGG + Chr1:24674059-24674078 MsG0180001649.01.T01:CDS 25.0%
! CTTTCAAATAATAATCTCTC+TGG + Chr1:24672778-24672797 MsG0180001649.01.T01:CDS 25.0%
! CTTTCAGAAAATAATCTTTC+CGG + Chr1:24672490-24672509 MsG0180001649.01.T01:CDS 25.0%
! GAGATATTGTAACTTATTTG+TGG + Chr1:24674986-24675005 MsG0180001649.01.T01:CDS 25.0%
! GAGTTTCAATAACATTCAAT+TGG - Chr1:24673689-24673708 None:intergenic 25.0%
! TAACATATCAACAAAGCTTA+AGG - Chr1:24673820-24673839 None:intergenic 25.0%
! TGAATTTGATTGGAATATGA+GGG + Chr1:24674508-24674527 MsG0180001649.01.T01:CDS 25.0%
! TTAATCAAATTACCTATGGA+TGG - Chr1:24672166-24672185 None:intergenic 25.0%
! TTATTTGTCAATGCTTCAAT+TGG - Chr1:24673918-24673937 None:intergenic 25.0%
! TTTATCAAATTACCTATGGA+AGG - Chr1:24672454-24672473 None:intergenic 25.0%
!! ATGTTTCTAAGTGATTTAAC+TGG - Chr1:24673761-24673780 None:intergenic 25.0%
!! TCACAAGACTAACAAAATTT+TGG + Chr1:24674004-24674023 MsG0180001649.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTTGTCATATATCCAATAG+TGG - Chr1:24672671-24672690 None:intergenic 25.0%
!!! AAATGTGATGTGTTTAGTTT+TGG + Chr1:24674925-24674944 MsG0180001649.01.T01:CDS 25.0%
!!! AATGTGATGTGTTTAGTTTT+GGG + Chr1:24674926-24674945 MsG0180001649.01.T01:CDS 25.0%
!!! ATGTTTGTTGTCAAAATCTT+CGG - Chr1:24674216-24674235 None:intergenic 25.0%
!!! CAAGAATGTTATTTTGGATT+TGG + Chr1:24674616-24674635 MsG0180001649.01.T01:CDS 25.0%
!!! CTTTTTGGTTTATGAATTCT+TGG + Chr1:24674439-24674458 MsG0180001649.01.T01:CDS 25.0%
!!! TCTAAAAACTCTTGATTTGT+CGG + Chr1:24672114-24672133 MsG0180001649.01.T01:CDS 25.0%
AAAAACTTGGTATGTTGTCT+AGG + Chr1:24673604-24673623 MsG0180001649.01.T01:CDS 30.0%
AAAGAAAAGAGGAATTTACC+TGG - Chr1:24674740-24674759 None:intergenic 30.0%
AAGTCCATGTATTCCAAATT+TGG - Chr1:24673264-24673283 None:intergenic 30.0%
AATGCCATTGATAGATAAGT+TGG + Chr1:24675050-24675069 MsG0180001649.01.T01:CDS 30.0%
AGAAGTCATATTGGATGAAT+TGG - Chr1:24674690-24674709 None:intergenic 30.0%
ATAAGCCTATTCATTTCTGT+TGG - Chr1:24673027-24673046 None:intergenic 30.0%
ATCATGATGCAGATAGAATA+AGG - Chr1:24674561-24674580 None:intergenic 30.0%
ATCCAAAATAACATTCTTGC+TGG - Chr1:24674615-24674634 None:intergenic 30.0%
ATTGAAACTCTTGATCTTAG+TGG + Chr1:24673699-24673718 MsG0180001649.01.T01:CDS 30.0%
CAAATTGATCAAGTTACCTA+TGG - Chr1:24672602-24672621 None:intergenic 30.0%
CAGAGAGTTCATTATCATTA+AGG - Chr1:24672348-24672367 None:intergenic 30.0%
CATAGGTAACTTGATCAATT+TGG + Chr1:24672600-24672619 MsG0180001649.01.T01:CDS 30.0%
CTTAATGAAAATAGTCTCTC+TGG + Chr1:24672922-24672941 MsG0180001649.01.T01:CDS 30.0%
CTTGCAACAAATAATTTGAG+TGG + Chr1:24673570-24673589 MsG0180001649.01.T01:CDS 30.0%
GAAGTCATATTGGATGAATT+GGG - Chr1:24674689-24674708 None:intergenic 30.0%
GATATATCTCGATGAACAAT+AGG - Chr1:24674593-24674612 None:intergenic 30.0%
GCAACATTGTGAAGTTATAT+GGG + Chr1:24674393-24674412 MsG0180001649.01.T01:CDS 30.0%
GTCATATTTCCAATAGTGAA+AGG - Chr1:24672523-24672542 None:intergenic 30.0%
GTGAATTTGATTGGAATATG+AGG + Chr1:24674507-24674526 MsG0180001649.01.T01:CDS 30.0%
GTTAAATTTCCGATAGTGAA+AGG - Chr1:24672235-24672254 None:intergenic 30.0%
GTTTATGAATTCTTGGAGAA+GGG + Chr1:24674446-24674465 MsG0180001649.01.T01:CDS 30.0%
TGATATATCTTACAACCAGT+TGG + Chr1:24673854-24673873 MsG0180001649.01.T01:CDS 30.0%
TGCAATGATGCAATTTGTAT+AGG - Chr1:24673531-24673550 None:intergenic 30.0%
TTACCTCACAATATCTGTAT+CGG + Chr1:24673093-24673112 MsG0180001649.01.T01:CDS 30.0%
TTGAAACTCTTGATCTTAGT+GGG + Chr1:24673700-24673719 MsG0180001649.01.T01:CDS 30.0%
TTGACAACAAACATCTCATT+GGG + Chr1:24674222-24674241 MsG0180001649.01.T01:CDS 30.0%
TTGAGCCAAAATAAGTTTGA+GGG + Chr1:24673642-24673661 MsG0180001649.01.T01:CDS 30.0%
TTGATTAAGTTACCTATGGA+AGG - Chr1:24672310-24672329 None:intergenic 30.0%
TTTCCAATAGTGAAAGGAAT+TGG - Chr1:24672517-24672536 None:intergenic 30.0%
TTTGACAACAAACATCTCAT+TGG + Chr1:24674221-24674240 MsG0180001649.01.T01:CDS 30.0%
TTTGAGCCAAAATAAGTTTG+AGG + Chr1:24673641-24673660 MsG0180001649.01.T01:CDS 30.0%
! ACAACATACCAAGTTTTTCA+GGG - Chr1:24673602-24673621 None:intergenic 30.0%
! AGAGAGACTATTTTGTGAAA+GGG - Chr1:24672635-24672654 None:intergenic 30.0%
! CAGAGAGACTATTTTCATTA+AGG - Chr1:24672924-24672943 None:intergenic 30.0%
! CGGAAAGATTATTTTCTGAA+AGG - Chr1:24672492-24672511 None:intergenic 30.0%
! CTTAATGATAATGAACTCTC+TGG + Chr1:24672346-24672365 MsG0180001649.01.T01:CDS 30.0%
! CTTTTCTTAAATTCTCTCAC+CGG + Chr1:24672562-24672581 MsG0180001649.01.T01:CDS 30.0%
! GTATCCAAATTTGGAATACA+TGG + Chr1:24673257-24673276 MsG0180001649.01.T01:CDS 30.0%
! TTAACCTTGGAAATGCTTTT+TGG + Chr1:24674952-24674971 MsG0180001649.01.T01:CDS 30.0%
! TTTGAAATATGGAGCTTTGA+TGG + Chr1:24674158-24674177 MsG0180001649.01.T01:CDS 30.0%
! TTTTATTCAAATGCTCTCAC+TGG + Chr1:24672274-24672293 MsG0180001649.01.T01:CDS 30.0%
!! ATCCAGCAAGAATGTTATTT+TGG + Chr1:24674610-24674629 MsG0180001649.01.T01:CDS 30.0%
!! GAAGCATTGACAAATAACAA+AGG + Chr1:24673921-24673940 MsG0180001649.01.T01:CDS 30.0%
!! GAGTTTTGTCATATTTCCAA+CGG - Chr1:24672530-24672549 None:intergenic 30.0%
!!! TAGTTTTGGGATATTAACCT+TGG + Chr1:24674939-24674958 MsG0180001649.01.T01:CDS 30.0%
AACAAGCTGGTGAATTTGAT+TGG + Chr1:24674498-24674517 MsG0180001649.01.T01:CDS 35.0%
AATAGTGAAAGGAATTGGTC+CGG - Chr1:24672512-24672531 None:intergenic 35.0%
ACAAATAACAAAGGCTTGTG+TGG + Chr1:24673930-24673949 MsG0180001649.01.T01:CDS 35.0%
ATATCTCGATGAACAATAGG+AGG - Chr1:24674590-24674609 None:intergenic 35.0%
ATATCTTACAACCAGTTGGA+GGG + Chr1:24673858-24673877 MsG0180001649.01.T01:CDS 35.0%
ATCAAATTACCTATGGAAGG+TGG - Chr1:24672451-24672470 None:intergenic 35.0%
ATCAAATTACCTATGGATGG+TGG - Chr1:24672163-24672182 None:intergenic 35.0%
ATCAACAAAGCTTAAGGGAA+TGG - Chr1:24673814-24673833 None:intergenic 35.0%
ATCAAGTTACCTATGGAAAG+TGG - Chr1:24672595-24672614 None:intergenic 35.0%
ATGGCATTATATCAAGTCTC+AGG - Chr1:24675038-24675057 None:intergenic 35.0%
ATGGTCATCTTTCTCCAAAT+TGG + Chr1:24673301-24673320 MsG0180001649.01.T01:CDS 35.0%
ATTAAGTTACCTATGGAAGG+TGG - Chr1:24672307-24672326 None:intergenic 35.0%
ATTGCATCAACTAACTGCAT+TGG + Chr1:24673545-24673564 MsG0180001649.01.T01:CDS 35.0%
CAATTAATGCTAACAGTAGC+AGG - Chr1:24674055-24674074 None:intergenic 35.0%
CGCAACATTGTGAAGTTATA+TGG + Chr1:24674392-24674411 MsG0180001649.01.T01:CDS 35.0%
CTTAGTGGGAATTCTATGAA+TGG + Chr1:24673714-24673733 MsG0180001649.01.T01:CDS 35.0%
CTTCAACAAAAACAACTGAC+TGG + Chr1:24673210-24673229 MsG0180001649.01.T01:CDS 35.0%
CTTTATTCAAATGCTCTCAC+TGG + Chr1:24672418-24672437 MsG0180001649.01.T01:CDS 35.0%
CTTTCACAAAATACTCTCTC+TGG + Chr1:24672202-24672221 MsG0180001649.01.T01:CDS 35.0%
CTTTCACAAAATAGTCTCTC+TGG + Chr1:24672634-24672653 MsG0180001649.01.T01:CDS 35.0%
GAGCAATTCTTCAAACTCTT+TGG - Chr1:24673171-24673190 None:intergenic 35.0%
GGAAATATAACAGACAGCTT+TGG + Chr1:24673231-24673250 MsG0180001649.01.T01:CDS 35.0%
GGTTTATGAATTCTTGGAGA+AGG + Chr1:24674445-24674464 MsG0180001649.01.T01:CDS 35.0%
GTCAAATTTCTGATAGTCGA+AGG - Chr1:24672379-24672398 None:intergenic 35.0%
GTGTCCAACTTATCTATCAA+TGG - Chr1:24675057-24675076 None:intergenic 35.0%
TACAGAACTTGCATACACAA+TGG + Chr1:24674891-24674910 MsG0180001649.01.T01:intron 35.0%
TATATCTTACAACCAGTTGG+AGG + Chr1:24673857-24673876 MsG0180001649.01.T01:CDS 35.0%
TATCTCGATGAACAATAGGA+GGG - Chr1:24674589-24674608 None:intergenic 35.0%
TATGGAAAGTGGAATTTGTC+CGG - Chr1:24672584-24672603 None:intergenic 35.0%
TCAAATTACCTATGGATGGT+GGG - Chr1:24672162-24672181 None:intergenic 35.0%
TCTAACGCGAAAAATTCCAA+AGG + Chr1:24673440-24673459 MsG0180001649.01.T01:CDS 35.0%
TGACAACAAACATCTCATTG+GGG + Chr1:24674223-24674242 MsG0180001649.01.T01:CDS 35.0%
TGAGCCAAAATAAGTTTGAG+GGG + Chr1:24673643-24673662 MsG0180001649.01.T01:CDS 35.0%
TGCTTGAAGTTCGACAAAAA+AGG - Chr1:24674094-24674113 None:intergenic 35.0%
TGCTTTCGTTAAATTTCCGA+TGG - Chr1:24672818-24672837 None:intergenic 35.0%
TGGTCATCTTTCTCCAAATT+GGG + Chr1:24673302-24673321 MsG0180001649.01.T01:CDS 35.0%
TTGATCAAGTTACCTATGGA+AGG - Chr1:24672598-24672617 None:intergenic 35.0%
TTTCCGATAGTGAAAGGAAT+TGG - Chr1:24672229-24672248 None:intergenic 35.0%
TTTCGTTAAATTTCCGATGG+TGG - Chr1:24672815-24672834 None:intergenic 35.0%
TTTCTGATAGTCGAAGGAAT+TGG - Chr1:24672373-24672392 None:intergenic 35.0%
! AAAGCTGTAATGTTTGGAGT+TGG - Chr1:24673885-24673904 None:intergenic 35.0%
! ACAACCTTCACAAAGTGTTA+CGG + Chr1:24675011-24675030 MsG0180001649.01.T01:CDS 35.0%
! ATGGAGCTTTGATGGAAAAA+TGG + Chr1:24674166-24674185 MsG0180001649.01.T01:CDS 35.0%
! CAGAGAGACTATTTTGTGAA+AGG - Chr1:24672636-24672655 None:intergenic 35.0%
! CTTTGGAAAGCTGTAATGTT+TGG - Chr1:24673891-24673910 None:intergenic 35.0%
! CTTTGGTGTGTATCCAAATT+TGG + Chr1:24673248-24673267 MsG0180001649.01.T01:CDS 35.0%
! GACAACATACCAAGTTTTTC+AGG - Chr1:24673603-24673622 None:intergenic 35.0%
! GGACAAATTTTACCTTCCAT+AGG + Chr1:24672727-24672746 MsG0180001649.01.T01:CDS 35.0%
! GTCATATATCCAATAGTGGA+AGG - Chr1:24672667-24672686 None:intergenic 35.0%
! GTCTTGAACCAATGGTTTTT+GGG - Chr1:24675095-24675114 None:intergenic 35.0%
! TAGCATGGACAACATTTTGA+AGG + Chr1:24674469-24674488 MsG0180001649.01.T01:CDS 35.0%
! TATCCAATAGTGGAAGGAAT+TGG - Chr1:24672661-24672680 None:intergenic 35.0%
! TCAATTTGAAGTTCTTGTGC+AGG - Chr1:24674131-24674150 None:intergenic 35.0%
! TCCAATATGACTTCTTTTGC+AGG + Chr1:24674695-24674714 MsG0180001649.01.T01:CDS 35.0%
! TGTTCCCCTCAAACTTATTT+TGG - Chr1:24673650-24673669 None:intergenic 35.0%
! TTGGAATTTTTCGCGTTAGA+TGG - Chr1:24673440-24673459 None:intergenic 35.0%
! TTTTGTCATATTTCCAACGG+TGG - Chr1:24672959-24672978 None:intergenic 35.0%
! TTTTTCTCAAATGCTCTCAC+TGG + Chr1:24672850-24672869 MsG0180001649.01.T01:CDS 35.0%
!! ACATCGATTACACTCCTTTT+TGG + Chr1:24674424-24674443 MsG0180001649.01.T01:CDS 35.0%
!! CAAAAACCATTGGTTCAAGA+CGG + Chr1:24675094-24675113 MsG0180001649.01.T01:CDS 35.0%
!! CTTTCCAAAAAGCATTTCCA+AGG - Chr1:24674959-24674978 None:intergenic 35.0%
!! TCTTCAAACTCTTTGGAACT+AGG - Chr1:24673164-24673183 None:intergenic 35.0%
!!! CAGAGAGAGTATTTTGTGAA+AGG - Chr1:24672204-24672223 None:intergenic 35.0%
!!! GATAAGTTTTCTAGCTCCTT+TGG - Chr1:24673459-24673478 None:intergenic 35.0%
AACAAACATCTCATTGGGGT+TGG + Chr1:24674227-24674246 MsG0180001649.01.T01:CDS 40.0%
AGGCAGAGCAACAAATTTAC+AGG + Chr1:24673395-24673414 MsG0180001649.01.T01:CDS 40.0%
ATCAAGTTACCTATGGAAGG+TGG - Chr1:24672739-24672758 None:intergenic 40.0%
ATCTCGATGAACAATAGGAG+GGG - Chr1:24674588-24674607 None:intergenic 40.0%
ATGCTTCAATTGGAGCTCTT+TGG - Chr1:24673908-24673927 None:intergenic 40.0%
CAACTGCAATCCTTTACATG+CGG - Chr1:24675127-24675146 None:intergenic 40.0%
CCTACATACCCAAAAACCAT+TGG + Chr1:24675084-24675103 MsG0180001649.01.T01:CDS 40.0%
CTCTCACATAACAATCTCTC+TGG + Chr1:24673786-24673805 MsG0180001649.01.T01:CDS 40.0%
CTTTACTCAAATGCTCTCAC+TGG + Chr1:24672706-24672725 MsG0180001649.01.T01:CDS 40.0%
GCCTGCAAAAGAAGTCATAT+TGG - Chr1:24674699-24674718 None:intergenic 40.0%
GGACAAATTCCACTTTCCAT+AGG + Chr1:24672583-24672602 MsG0180001649.01.T01:CDS 40.0%
GGACCAATTCCTTTCACTAT+CGG + Chr1:24672223-24672242 MsG0180001649.01.T01:CDS 40.0%
GGACCAATTCCTTTCACTAT+TGG + Chr1:24672223-24672242 MsG0180001649.01.T01:CDS 40.0%
GGTCATCTTTCTCCAAATTG+GGG + Chr1:24673303-24673322 MsG0180001649.01.T01:CDS 40.0%
GTCGAATTTCTGTCAAAGCA+TGG - Chr1:24674370-24674389 None:intergenic 40.0%
GTTGAAGTCTCACTCTCTTA+AGG - Chr1:24673197-24673216 None:intergenic 40.0%
TTCAATTGGCCAAACTCAAC+AGG - Chr1:24673675-24673694 None:intergenic 40.0%
TTCTTGCACTTTCCCCAATT+TGG - Chr1:24673318-24673337 None:intergenic 40.0%
TTGAAGGACAATGAACAAGC+TGG + Chr1:24674485-24674504 MsG0180001649.01.T01:CDS 40.0%
! CGTCTTGAACCAATGGTTTT+TGG - Chr1:24675096-24675115 None:intergenic 40.0%
! CTCACAATATCTGTATCGGT+GGG + Chr1:24673097-24673116 MsG0180001649.01.T01:CDS 40.0%
! GTAGCTCATGTCTCAGATTT+TGG + Chr1:24674644-24674663 MsG0180001649.01.T01:CDS 40.0%
!! GTTAAATTTCCGATGGTGGA+AGG - Chr1:24672811-24672830 None:intergenic 40.0%
!!! CCAATGGTTTTTGGGTATGT+AGG - Chr1:24675087-24675106 None:intergenic 40.0%
AAACATCTCATTGGGGTTGG+AGG + Chr1:24674230-24674249 MsG0180001649.01.T01:CDS 45.0%
ACAGCTACAACTTGACCTGT+AGG - Chr1:24674284-24674303 None:intergenic 45.0%
AGGTCCGTAACACTTTGTGA+AGG - Chr1:24675018-24675037 None:intergenic 45.0%
ATTCTTGGAGAAGGGTAGCA+TGG + Chr1:24674454-24674473 MsG0180001649.01.T01:CDS 45.0%
CCACCGATACAGATATTGTG+AGG - Chr1:24673099-24673118 None:intergenic 45.0%
CCTCACAATATCTGTATCGG+TGG + Chr1:24673096-24673115 MsG0180001649.01.T01:CDS 45.0%
GGAAGAATACCACCAGAACT+AGG + Chr1:24673375-24673394 MsG0180001649.01.T01:CDS 45.0%
GGACAAATTCCACCTTCCAT+AGG + Chr1:24672295-24672314 MsG0180001649.01.T01:CDS 45.0%
GGACCAATTCCTTCCACTAT+TGG + Chr1:24672655-24672674 MsG0180001649.01.T01:CDS 45.0%
GGCTTCATCCCTGAAAAACT+TGG + Chr1:24673591-24673610 MsG0180001649.01.T01:CDS 45.0%
GGGAACATTCCTGTTGAGTT+TGG + Chr1:24673663-24673682 MsG0180001649.01.T01:CDS 45.0%
GTCATATTTCCAACGGTGGA+AGG - Chr1:24672955-24672974 None:intergenic 45.0%
GTTGCACTTAACCAGTTCAC+AGG + Chr1:24673138-24673157 MsG0180001649.01.T01:CDS 45.0%
TACAAAGCAGAGTTGCCTAC+AGG + Chr1:24674266-24674285 MsG0180001649.01.T01:CDS 45.0%
TTTCCAACGGTGGAAGGAAT+TGG - Chr1:24672949-24672968 None:intergenic 45.0%
TTTGTTGCTCTGCCTAGTTC+TGG - Chr1:24673390-24673409 None:intergenic 45.0%
! ACTTCTTTTGCAGGCACCTT+TGG + Chr1:24674704-24674723 MsG0180001649.01.T01:CDS 45.0%
! TTTAACTGGCCAAGCATTGC+TGG - Chr1:24673747-24673766 None:intergenic 45.0%
!! AAACCATTGGTTCAAGACGG+TGG + Chr1:24675097-24675116 MsG0180001649.01.T01:CDS 45.0%
!! TTTCCGATGGTGGAAGGAAT+TGG - Chr1:24672805-24672824 None:intergenic 45.0%
!!! ATGCTTTTTGGAAAGCACCC+TGG + Chr1:24674964-24674983 MsG0180001649.01.T01:CDS 45.0%
!!! TCTTTTTTTTATATTAATTA+AGG + Chr1:24674760-24674779 MsG0180001649.01.T01:intron 5.0%
ACCTGGAGCAGCATATCCAA+AGG - Chr1:24674723-24674742 None:intergenic 50.0%
ACCTTTGGATATGCTGCTCC+AGG + Chr1:24674719-24674738 MsG0180001649.01.T01:CDS 50.0%
CAGATGTTGAGCAAGGCTCT+AGG - Chr1:24673968-24673987 None:intergenic 50.0%
CTAGAGCCTTGCTCAACATC+TGG + Chr1:24673966-24673985 MsG0180001649.01.T01:CDS 50.0%
GAGTCAATCCCACCATCCAT+AGG + Chr1:24672151-24672170 MsG0180001649.01.T01:CDS 50.0%
GGAACCATACCAGCAATGCT+TGG + Chr1:24673735-24673754 MsG0180001649.01.T01:CDS 50.0%
GGACCAATTCCTTCCACCAT+CGG + Chr1:24672799-24672818 MsG0180001649.01.T01:CDS 50.0%
TTGCCACCAGATGTTGAGCA+AGG - Chr1:24673975-24673994 None:intergenic 50.0%
TTGGAACTAGGCCTGTGAAC+TGG - Chr1:24673152-24673171 None:intergenic 50.0%
! GGCTTGTGTGGTAATGTCTC+TGG + Chr1:24673942-24673961 MsG0180001649.01.T01:CDS 50.0%
!! CTAGCTCTATCCCTCACTCT+AGG + Chr1:24674029-24674048 MsG0180001649.01.T01:CDS 50.0%
ACAGTAGCAGGCCTAGAGTG+AGG - Chr1:24674043-24674062 None:intergenic 55.0%
ACGCCACCGTCTTGAACCAA+TGG - Chr1:24675103-24675122 None:intergenic 55.0%
CAGTAGCAGGCCTAGAGTGA+GGG - Chr1:24674042-24674061 None:intergenic 55.0%
CTCATTGGGGTTGGAGGACA+TGG + Chr1:24674236-24674255 MsG0180001649.01.T01:CDS 55.0%
GAGCCTTGCTCAACATCTGG+TGG + Chr1:24673969-24673988 MsG0180001649.01.T01:CDS 55.0%
GGACCAATTCCTTCCACCGT+TGG + Chr1:24672943-24672962 MsG0180001649.01.T01:CDS 55.0%
TTGGAGTTGGACCCTCCAAC+TGG - Chr1:24673872-24673891 None:intergenic 55.0%
! CTGGCCAAGCATTGCTGGTA+TGG - Chr1:24673742-24673761 None:intergenic 55.0%
!! GTTGCTCTGCCTAGTTCTGG+TGG - Chr1:24673387-24673406 None:intergenic 55.0%
CGGTGGCGTTCCGCATGTAA+AGG + Chr1:24675114-24675133 MsG0180001649.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 24672106 24675155 24672106 ID=MsG0180001649.01;Name=MsG0180001649.01
Chr1 mRNA 24672106 24675155 24672106 ID=MsG0180001649.01.T01;Parent=MsG0180001649.01;Name=MsG0180001649.01.T01;_AED=0.49;_eAED=0.49;_QI=0|0|0|1|1|0.5|2|0|964
Chr1 exon 24672106 24674740 24672106 ID=MsG0180001649.01.T01:exon:460;Parent=MsG0180001649.01.T01
Chr1 exon 24674896 24675155 24674896 ID=MsG0180001649.01.T01:exon:461;Parent=MsG0180001649.01.T01
Chr1 CDS 24672106 24674740 24672106 ID=MsG0180001649.01.T01:cds;Parent=MsG0180001649.01.T01
Chr1 CDS 24674896 24675155 24674896 ID=MsG0180001649.01.T01:cds;Parent=MsG0180001649.01.T01
Gene Sequence

>MsG0180001649.01.T01

ATGTCTAGTCTAAAAACTCTTGATTTGTCGGTTAACAATCTCTATGAGTCAATCCCACCATCCATAGGTAATTTGATTAATTTGGATACTATTGACCTTTCACAAAATACTCTCTCTGGACCAATTCCTTTCACTATCGGAAATTTAACGAAGCTAAGTGAATTGTATTTTTATTCAAATGCTCTCACTGGACAAATTCCACCTTCCATAGGTAACTTAATCAATTTGGATACTATTTACCTTAATGATAATGAACTCTCTGGACCAATTCCTTCGACTATCAGAAATTTGACAAAACTCAGTACATTATCTCTTTATTCAAATGCTCTCACTGGACAAATTCCACCTTCCATAGGTAATTTGATAAATTTGGATGCTATTGACCTTTCAGAAAATAATCTTTCCGGACCAATTCCTTTCACTATTGGAAATATGACAAAACTCAGTACACTGTCTCTTTTCTTAAATTCTCTCACCGGACAAATTCCACTTTCCATAGGTAACTTGATCAATTTGGATATTACTTCCCTTTCACAAAATAGTCTCTCTGGACCAATTCCTTCCACTATTGGATATATGACAAAACTCAATACACTACATCTTTACTCAAATGCTCTCACTGGACAAATTTTACCTTCCATAGGTAACTTGATCAATTTGGATACAATTGACCTTTCAAATAATAATCTCTCTGGACCAATTCCTTCCACCATCGGAAATTTAACGAAAGCAAGTGAATTATCATTTTTCTCAAATGCTCTCACTGGACAAATTCCACCTTCCATAGGTAACTTGATCAATTTGGATACTATTTACCTTAATGAAAATAGTCTCTCTGGACCAATTCCTTCCACCGTTGGAAATATGACAAAACTCCGTAAATTATATCTTTTCTCAAATTCTTTCAGTGAGAATATTCCAACAGAAATGAATAGGCTTATAGATTTGGAAGTACTCCATTTATCTGAAAATAATTTTGTTGGTCATTTACCTCACAATATCTGTATCGGTGGGAAGCTAAAAATGTTCACTGTTGCACTTAACCAGTTCACAGGCCTAGTTCCAAAGAGTTTGAAGAATTGCTCAAGCCTTAAGAGAGTGAGACTTCAACAAAAACAACTGACTGGAAATATAACAGACAGCTTTGGTGTGTATCCAAATTTGGAATACATGGACTTAAGTGATAATAATTTTTATGGTCATCTTTCTCCAAATTGGGGAAAGTGCAAGAATCTCACAAGCCTAAAAATCTCCGATAATAATTTAACAGGAAGAATACCACCAGAACTAGGCAGAGCAACAAATTTACAGGAGCTTAACTTGTCTTCAAACCATCTAACGCGAAAAATTCCAAAGGAGCTAGAAAACTTATCTTTGTTGATCAAACTCTCGTTAAGTAACAATCATCTTTTTGGAGAAGTTCCTATACAAATTGCATCATTGCATCAACTAACTGCATTGGAGCTTGCAACAAATAATTTGAGTGGCTTCATCCCTGAAAAACTTGGTATGTTGTCTAGGTTATTGCAGTTAAATTTGAGCCAAAATAAGTTTGAGGGGAACATTCCTGTTGAGTTTGGCCAATTGAATGTTATTGAAACTCTTGATCTTAGTGGGAATTCTATGAATGGAACCATACCAGCAATGCTTGGCCAGTTAAATCACTTAGAAACATTGAATCTCTCACATAACAATCTCTCTGGTACCATTCCCTTAAGCTTTGTTGATATGTTAAGCTTGACAACTGTTGATATATCTTACAACCAGTTGGAGGGTCCAACTCCAAACATTACAGCTTTCCAAAGAGCTCCAATTGAAGCATTGACAAATAACAAAGGCTTGTGTGGTAATGTCTCTGGCCTAGAGCCTTGCTCAACATCTGGTGGCAAATTTCATAATCACAAGACTAACAAAATTTTGGTGCTAGCTCTATCCCTCACTCTAGGCCTGCTACTGTTAGCATTAATTGTTTATGGGATCTCATACCTTTTTTGTCGAACTTCAAGCACAAAAGAATGCAAACCTGCACAAGAACTTCAAATTGAAAATCTATTTGAAATATGGAGCTTTGATGGAAAAATGGTGTATGAGAACATTATCGAAGCTACCGAAGATTTTGACAACAAACATCTCATTGGGGTTGGAGGACATGGAAATGTTTACAAAGCAGAGTTGCCTACAGGTCAAGTTGTAGCTGTGAAGAAACTTCATTCATTACAAAATGAGGAAATGTCTAATCTTAAAGCTTTCACAAATGAGATCCATGCTTTGACAGAAATTCGACATCGCAACATTGTGAAGTTATATGGGTTTTGTTCACATCGATTACACTCCTTTTTGGTTTATGAATTCTTGGAGAAGGGTAGCATGGACAACATTTTGAAGGACAATGAACAAGCTGGTGAATTTGATTGGAATATGAGGGTGAATATTATTAAAGATATAGCTAATGCCTTATTCTATCTGCATCATGATTGTTCCCCTCCTATTGTTCATCGAGATATATCCAGCAAGAATGTTATTTTGGATTTGGAATGTGTAGCTCATGTCTCAGATTTTGGAACATCTAAGTTTCTAAATCCCAATTCATCCAATATGACTTCTTTTGCAGGCACCTTTGGATATGCTGCTCCAGAACTTGCATACACAATGGAAGTAAATGAGAAATGTGATGTGTTTAGTTTTGGGATATTAACCTTGGAAATGCTTTTTGGAAAGCACCCTGGAGATATTGTAACTTATTTGTGGCAACAACCTTCACAAAGTGTTACGGACCTGAGACTTGATATAATGCCATTGATAGATAAGTTGGACACGCGTTCTCCTACATACCCAAAAACCATTGGTTCAAGACGGTGGCGTTCCGCATGTAAAGGATTGCAGTTGCTTGCTTAA
Protein sequence

>MsG0180001649.01.T01

MSSLKTLDLSVNNLYESIPPSIGNLINLDTIDLSQNTLSGPIPFTIGNLTKLSELYFYSNALTGQIPPSIGNLINLDTIYLNDNELSGPIPSTIRNLTKLSTLSLYSNALTGQIPPSIGNLINLDAIDLSENNLSGPIPFTIGNMTKLSTLSLFLNSLTGQIPLSIGNLINLDITSLSQNSLSGPIPSTIGYMTKLNTLHLYSNALTGQILPSIGNLINLDTIDLSNNNLSGPIPSTIGNLTKASELSFFSNALTGQIPPSIGNLINLDTIYLNENSLSGPIPSTVGNMTKLRKLYLFSNSFSENIPTEMNRLIDLEVLHLSENNFVGHLPHNICIGGKLKMFTVALNQFTGLVPKSLKNCSSLKRVRLQQKQLTGNITDSFGVYPNLEYMDLSDNNFYGHLSPNWGKCKNLTSLKISDNNLTGRIPPELGRATNLQELNLSSNHLTRKIPKELENLSLLIKLSLSNNHLFGEVPIQIASLHQLTALELATNNLSGFIPEKLGMLSRLLQLNLSQNKFEGNIPVEFGQLNVIETLDLSGNSMNGTIPAMLGQLNHLETLNLSHNNLSGTIPLSFVDMLSLTTVDISYNQLEGPTPNITAFQRAPIEALTNNKGLCGNVSGLEPCSTSGGKFHNHKTNKILVLALSLTLGLLLLALIVYGISYLFCRTSSTKECKPAQELQIENLFEIWSFDGKMVYENIIEATEDFDNKHLIGVGGHGNVYKAELPTGQVVAVKKLHSLQNEEMSNLKAFTNEIHALTEIRHRNIVKLYGFCSHRLHSFLVYEFLEKGSMDNILKDNEQAGEFDWNMRVNIIKDIANALFYLHHDCSPPIVHRDISSKNVILDLECVAHVSDFGTSKFLNPNSSNMTSFAGTFGYAAPELAYTMEVNEKCDVFSFGILTLEMLFGKHPGDIVTYLWQQPSQSVTDLRLDIMPLIDKLDTRSPTYPKTIGSRRWRSACKGLQLLA*