AlfalfaGEDB | MsG0480023536.01

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0480023536.01

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TFs/TRs:

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Protein Kinases:

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Network:

Co-expression Network

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PPI

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MsG0480023536.01.T01	AT4G03290	33.803	142	86	3	336	469	6	147	8.58e-15	72.4
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MsG0480023536.01.T01	AT3G27580	32.680	153	97	4	30	180	182	330	9.51e-15	77.4
MsG0480023536.01.T01	AT2G41930	26.087	276	177	9	36	291	11	279	1.56e-14	75.5
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MsG0480023536.01.T01	AT5G57565	37.736	106	59	3	78	183	9	107	1.63e-14	70.9
MsG0480023536.01.T01	AT2G18170	25.000	292	174	10	34	288	36	319	1.66e-14	75.5
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MsG0480023536.01.T01	AT1G09840	25.862	290	163	11	36	286	89	365	2.54e-14	75.5
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MsG0480023536.01.T01	AT1G57870	26.101	318	175	14	15	288	65	366	3.16e-14	75.1
MsG0480023536.01.T01	AT1G57870	26.101	318	175	14	15	288	65	366	3.16e-14	75.1
MsG0480023536.01.T01	AT2G23070	27.830	212	99	7	135	306	230	427	3.68e-14	75.1
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MsG0480023536.01.T01	AT4G24740	24.924	329	162	12	36	288	1	320	8.68e-14	72.8
MsG0480023536.01.T01	AT4G24740	24.924	329	162	12	36	288	1	320	8.68e-14	72.8
MsG0480023536.01.T01	AT4G36450	24.399	291	174	11	34	288	36	316	9.85e-14	73.2
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MsG0480023536.01.T01	AT3G12690	31.373	153	99	3	30	180	185	333	1.86e-13	73.2
MsG0480023536.01.T01	AT3G12690	31.373	153	99	3	30	180	185	333	1.86e-13	73.2
MsG0480023536.01.T01	AT1G79640	24.908	273	184	10	28	288	11	274	1.94e-13	73.2
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MsG0480023536.01.T01	AT1G79640	24.908	273	184	10	28	288	11	274	1.99e-13	73.2
MsG0480023536.01.T01	AT1G79640	24.908	273	184	10	28	288	11	274	1.99e-13	73.2
MsG0480023536.01.T01	AT1G79640	24.908	273	184	10	28	288	11	274	2.00e-13	73.2
MsG0480023536.01.T01	AT4G24480	29.075	227	136	10	35	251	674	885	2.09e-13	73.6
MsG0480023536.01.T01	AT5G03730	30.952	210	130	8	35	237	556	757	2.23e-13	73.2
MsG0480023536.01.T01	AT5G03730	30.952	210	130	8	35	237	556	757	2.23e-13	73.2
MsG0480023536.01.T01	AT1G67890	29.808	208	125	7	32	230	489	684	2.40e-13	73.2

Find 122 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 340 sgRNAs with CRISPR-GE

CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence	on_target_score	Position	Region
AAGCTTAAAGCTACTGATTT+TGG	0.141405	4:+86600672	MsG0480023536.01.T01:CDS
TCATCTTGAATAACTCTTTC+AGG	0.187291	4:-86604107	None:intergenic
CCTTGATCATTTCATCAATA+TGG	0.211287	4:-86604700	None:intergenic
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AACAATAGATATGCAAAATT+TGG	0.281431	4:-86605237	None:intergenic
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TGCAGAAAAGCTTTCTCTTT+GGG	0.292459	4:-86600347	None:intergenic
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TACTGCTGTTCATATTGTTA+TGG	0.300303	4:+86600467	MsG0480023536.01.T01:CDS
ACTAAATTTAAGAGATGCTT+TGG	0.304213	4:+86605092	MsG0480023536.01.T01:CDS
TTGCAGAAAAGCTTTCTCTT+TGG	0.311059	4:-86600348	None:intergenic
AAGAAGATTATGAAGATGTT+TGG	0.337148	4:+86600370	MsG0480023536.01.T01:CDS
CAGTTTCAACGTTGTTTCAA+TGG	0.341838	4:+86600146	MsG0480023536.01.T01:exon
TGCGCTGTTAGCCTTGTTCT+CGG	0.359068	4:-86602320	None:intergenic
TGTTACCTTCTCTGTTCTGT+AGG	0.364408	4:-86600223	None:intergenic
GCGAGTAGGATCTGAACTTA+TGG	0.366687	4:+86604185	MsG0480023536.01.T01:CDS
GAAGTCTTGCGCAAGCTCTA+TGG	0.367709	4:+86601978	MsG0480023536.01.T01:CDS
TTCAATGTTATTGTTGGAGT+TGG	0.375641	4:-86600180	None:intergenic
GTCTGAAATCCAGGATCTAA+TGG	0.378940	4:+86604209	MsG0480023536.01.T01:CDS
AGAGATGCTTTGGGATTAGT+AGG	0.380685	4:+86605102	MsG0480023536.01.T01:CDS
AATCCTTCTCTGATGTTGTT+GGG	0.383422	4:+86601934	MsG0480023536.01.T01:CDS
TAGAGCTTGCGCAAGACTTC+CGG	0.385432	4:-86601975	None:intergenic
AAATACCTACCTGCCCAAAA+TGG	0.391517	4:-86602062	None:intergenic
TGAGATTTCACAAGCTTGTA+AGG	0.399671	4:+86604658	MsG0480023536.01.T01:CDS
GCAGAGTCGATAGGTTTATC+AGG	0.404499	4:-86602603	None:intergenic
CCACACGTTGTTAGAATTGA+AGG	0.405090	4:+86600429	MsG0480023536.01.T01:CDS
GCACTCCACACATCTGATTC+AGG	0.405441	4:-86602002	None:intergenic
AGAAAGGGCAATGGAGGGAT+AGG	0.409630	4:+86605048	MsG0480023536.01.T01:CDS
GGATCCAATCAAGTTATTGA+TGG	0.410400	4:+86605129	MsG0480023536.01.T01:CDS
AGGGCAATGGAGGGATAGGA+AGG	0.413566	4:+86605052	MsG0480023536.01.T01:CDS
CAGGCCACCAATTTCTTCCT+CGG	0.414830	4:-86604088	None:intergenic
GAATCCTTCTCTGATGTTGT+TGG	0.418020	4:+86601933	MsG0480023536.01.T01:CDS
ATAACCATCAATAACTTGAT+TGG	0.418673	4:-86605133	None:intergenic
CGGCTGTCCGAGGAAGAAAT+TGG	0.419201	4:+86604081	MsG0480023536.01.T01:CDS
AACTGTTCATTTAAATAAGC+TGG	0.427007	4:+86604565	MsG0480023536.01.T01:CDS
TGATTTGTGTGTGCATAGAT+AGG	0.429856	4:-86600295	None:intergenic
ACTGGTTTCAATGTTATTGT+TGG	0.441992	4:-86600186	None:intergenic
CATGTGGGGTAGACCAGGCC+TGG	0.447968	4:+86605313	MsG0480023536.01.T01:three_prime_UTR
TACAGAATGGGTCGAAAACT+TGG	0.449538	4:+86600252	MsG0480023536.01.T01:CDS
TCACAAGCTTGTAAGGACTT+TGG	0.451497	4:+86604665	MsG0480023536.01.T01:CDS
CTAAATTTAAGAGATGCTTT+GGG	0.451930	4:+86605093	MsG0480023536.01.T01:CDS
GAATCAGATGTGTGGAGTGC+TGG	0.452289	4:+86602005	MsG0480023536.01.T01:CDS
GGCCCCACACAACAAATTGC+AGG	0.455414	4:+86605395	MsG0480023536.01.T01:three_prime_UTR
TAAAATCTGTCGGAAGATCC+CGG	0.465234	4:-86602210	None:intergenic
AAACTTGGTCAAGGTCAATT+CGG	0.470137	4:+86600267	MsG0480023536.01.T01:CDS
ACATTTGATGAGTTAAAAGA+TGG	0.474189	4:+86604156	MsG0480023536.01.T01:CDS
TTATTGCATGAAAATTGAAA+TGG	0.476376	4:+86605374	MsG0480023536.01.T01:three_prime_UTR
ACTCTCTCGGTGTTATGCAT+AGG	0.481169	4:+86600601	MsG0480023536.01.T01:CDS
GTTACCTTCTCTGTTCTGTA+GGG	0.483419	4:-86600222	None:intergenic
CTCTCTCGGTGTTATGCATA+GGG	0.491837	4:+86600602	MsG0480023536.01.T01:CDS
TGGTCCATGTGGGGTAGACC+AGG	0.494417	4:+86605308	MsG0480023536.01.T01:three_prime_UTR
GTTGAATCTTGTCACTCTCT+CGG	0.496004	4:+86600588	MsG0480023536.01.T01:CDS
TATGAATAAACTGAAGAAGA+TGG	0.499187	4:+86602656	MsG0480023536.01.T01:CDS
AAAAGTGGGACAATTGACTA+TGG	0.503509	4:+86604527	MsG0480023536.01.T01:CDS
ATGCAGTAATGCACCAGGCC+TGG	0.504985	4:-86605326	None:intergenic
CCATATTGATGAAATGATCA+AGG	0.508225	4:+86604700	MsG0480023536.01.T01:CDS
AATAAGCGAAGGCTGACAAC+AGG	0.510214	4:-86604601	None:intergenic
ACTTATGGAGTCTGAAATCC+AGG	0.513992	4:+86604200	MsG0480023536.01.T01:CDS
GAACCTGCAATTTGTTGTGT+GGG	0.514024	4:-86605398	None:intergenic
GGGTCATTATAGTGAAAGAC+AGG	0.516296	4:+86600533	MsG0480023536.01.T01:CDS
TTTAAATAAGCTGGAGAGAG+AGG	0.516992	4:+86604574	MsG0480023536.01.T01:CDS
CAGGCGGATGTTGATAAAAG+TGG	0.519499	4:+86604512	MsG0480023536.01.T01:intron
TTCAGGCCACCCATGGATTG+TGG	0.520355	4:+86602566	MsG0480023536.01.T01:intron
ACAGCGCAAAGGATCTAATC+CGG	0.521316	4:+86602279	MsG0480023536.01.T01:CDS
TTACAGCATCCATTAGATCC+TGG	0.526716	4:-86604218	None:intergenic
AGCTTGTGAAATCTCATCAA+TGG	0.529800	4:-86604651	None:intergenic
GGTAACAGAGATATACAGAA+TGG	0.531087	4:+86600239	MsG0480023536.01.T01:CDS
TATCTTTAGTAGTAATCACT+TGG	0.533698	4:+86605153	MsG0480023536.01.T01:exon
CAGGCCTGGTCTACCCCACA+TGG	0.540078	4:-86605312	None:intergenic
TTTCTGTTTCAGGCCACCCA+TGG	0.540199	4:+86602559	MsG0480023536.01.T01:intron
AAAATCTGTCGGAAGATCCC+GGG	0.548224	4:-86602209	None:intergenic
GCTTTGGGATTAGTAGGCAA+TGG	0.555330	4:+86605108	MsG0480023536.01.T01:CDS
ATGATGAGAAAGGGCAATGG+AGG	0.559384	4:+86605042	MsG0480023536.01.T01:CDS
ATGTTGTCATCCACAATCCA+TGG	0.561673	4:-86602576	None:intergenic
TATAGTGAAAGACAGGCTGC+TGG	0.562082	4:+86600540	MsG0480023536.01.T01:CDS
GTATCAAAGAGAAAATTCTC+AGG	0.562283	4:-86600633	None:intergenic
CTGTCTGAAATGCTAGGCCA+AGG	0.564550	4:-86602260	None:intergenic
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CRISPR-GE

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	CAAGCATTACAATCAAGATA+TGG	-	Chr4:86601062-86601081	None:intergenic	30.0%
	CAATAAATTAACCTGGAAAG+TGG	-	Chr4:86601211-86601230	None:intergenic	30.0%
	CATATCAAACACAGAATAGT+AGG	-	Chr4:86602719-86602738	None:intergenic	30.0%
	CCATATTGATGAAATGATCA+AGG	+	Chr4:86604700-86604719	MsG0480023536.01.T01:CDS	30.0%
	CCTTGATCATTTCATCAATA+TGG	-	Chr4:86604703-86604722	None:intergenic	30.0%
	CTAAAGTGAATTTCTGTTTC+AGG	+	Chr4:86602549-86602568	MsG0480023536.01.T01:intron	30.0%
	GAAAAAGCAAAACAGGTTAA+AGG	+	Chr4:86602998-86603017	MsG0480023536.01.T01:intron	30.0%
	GTAACAGAGATATACAGAAT+GGG	+	Chr4:86600240-86600259	MsG0480023536.01.T01:CDS	30.0%
	GTATCAAAGAGAAAATTCTC+AGG	-	Chr4:86600636-86600655	None:intergenic	30.0%
	TAAAGGGGGAAAATAGTAAA+GGG	+	Chr4:86601487-86601506	MsG0480023536.01.T01:intron	30.0%
	TAAATCAGCAAATTGGTGAA+AGG	+	Chr4:86603857-86603876	MsG0480023536.01.T01:intron	30.0%
	TAACATTGAAACCAGTAACA+TGG	+	Chr4:86600193-86600212	MsG0480023536.01.T01:CDS	30.0%
	TAAGGAATTTATCTATCACG+AGG	-	Chr4:86604351-86604370	None:intergenic	30.0%
	TAAGGGATTTAGGGATTATT+TGG	+	Chr4:86600971-86600990	MsG0480023536.01.T01:intron	30.0%
	TACTGCTGTTCATATTGTTA+TGG	+	Chr4:86600467-86600486	MsG0480023536.01.T01:CDS	30.0%
	TCATCTTGAATAACTCTTTC+AGG	-	Chr4:86604110-86604129	None:intergenic	30.0%
	TGGATTCTTTGTGCTTAATT+TGG	+	Chr4:86600793-86600812	MsG0480023536.01.T01:intron	30.0%
	TGTTCTATGATTGCCATTAA+TGG	+	Chr4:86603142-86603161	MsG0480023536.01.T01:intron	30.0%
	TTAAACATGATTGTGTCTGT+TGG	+	Chr4:86604404-86604423	MsG0480023536.01.T01:intron	30.0%
	TTAAAGGGGGAAAATAGTAA+AGG	+	Chr4:86601486-86601505	MsG0480023536.01.T01:intron	30.0%
	TTCAATGTTATTGTTGGAGT+TGG	-	Chr4:86600183-86600202	None:intergenic	30.0%
!	ACTGGTTTCAATGTTATTGT+TGG	-	Chr4:86600189-86600208	None:intergenic	30.0%
!	ATCTTCCGACAGATTTTATT+AGG	+	Chr4:86602215-86602234	MsG0480023536.01.T01:CDS	30.0%
!	GAAACTGAAACTGTGTTTTT+CGG	-	Chr4:86600133-86600152	None:intergenic	30.0%
!	GGATTTCCATATCTTGATTT+TGG	+	Chr4:86603715-86603734	MsG0480023536.01.T01:intron	30.0%
!	GTAGGAGTATATACTGTAAA+AGG	+	Chr4:86601158-86601177	MsG0480023536.01.T01:intron	30.0%
!	GTGCTTAATTTGGTTGATTA+GGG	+	Chr4:86600803-86600822	MsG0480023536.01.T01:intron	30.0%
!	TACTTAACACCTGAAGTTTT+TGG	+	Chr4:86601574-86601593	MsG0480023536.01.T01:intron	30.0%
!	TCATGCAAATGAGTATTGTT+TGG	+	Chr4:86601786-86601805	MsG0480023536.01.T01:intron	30.0%
!	TCTTTGTTTACTTGATTCTG+AGG	+	Chr4:86601028-86601047	MsG0480023536.01.T01:intron	30.0%
!	TGATTTCTGGATGGAATTAA+GGG	+	Chr4:86600954-86600973	MsG0480023536.01.T01:intron	30.0%
!	TGTGCTTAATTTGGTTGATT+AGG	+	Chr4:86600802-86600821	MsG0480023536.01.T01:intron	30.0%
!	TTGATTTCTGGATGGAATTA+AGG	+	Chr4:86600953-86600972	MsG0480023536.01.T01:intron	30.0%
!	TTTGCAAGCAAATGTTTTGT+TGG	-	Chr4:86600322-86600341	None:intergenic	30.0%
!	TTTTGCATTAGGAGAGAAAA+GGG	+	Chr4:86600860-86600879	MsG0480023536.01.T01:intron	30.0%
!!	ATGTGAAAATTTTGTTGTGC+AGG	+	Chr4:86604987-86605006	MsG0480023536.01.T01:intron	30.0%
!!	GATTTTGATCAAGCATTTTC+CGG	-	Chr4:86602301-86602320	None:intergenic	30.0%
!!	TAGTTTGTAAGTACTGAGAT+AGG	+	Chr4:86603930-86603949	MsG0480023536.01.T01:intron	30.0%
!!	TTTGCCTTTTAGAAATTGGT+GGG	+	Chr4:86603344-86603363	MsG0480023536.01.T01:intron	30.0%
!!	TTTTAAGAAGGGAATCAAAC+AGG	-	Chr4:86602872-86602891	None:intergenic	30.0%
!!!	AAGCTTAAAGCTACTGATTT+TGG	+	Chr4:86600672-86600691	MsG0480023536.01.T01:CDS	30.0%
!!!	CACTTGCACCTTTAATTTTT+TGG	+	Chr4:86601086-86601105	MsG0480023536.01.T01:intron	30.0%
!!!	CTGTTTTTTATAAACCTGGT+AGG	+	Chr4:86600700-86600719	MsG0480023536.01.T01:intron	30.0%
!!!	TATTTTGACAAAGATGCTAG+TGG	+	Chr4:86604620-86604639	MsG0480023536.01.T01:CDS	30.0%
	AAAAGTGGGACAATTGACTA+TGG	+	Chr4:86604527-86604546	MsG0480023536.01.T01:CDS	35.0%
	AAAATAAGCCTTCGTGTCAA+TGG	-	Chr4:86603658-86603677	None:intergenic	35.0%
	AAACTTGGTCAAGGTCAATT+CGG	+	Chr4:86600267-86600286	MsG0480023536.01.T01:CDS	35.0%
	AAATTCCAACACTGAATGAC+TGG	-	Chr4:86601325-86601344	None:intergenic	35.0%
	AACAGTTGGATTATGTTCCA+TGG	+	Chr4:86603599-86603618	MsG0480023536.01.T01:intron	35.0%
	AACCTGCTTCTACCATAATA+TGG	-	Chr4:86601239-86601258	None:intergenic	35.0%
	AATAGGCCCTTAATATGAGA+CGG	+	Chr4:86603314-86603333	MsG0480023536.01.T01:intron	35.0%
	AATCCTTCTCTGATGTTGTT+GGG	+	Chr4:86601934-86601953	MsG0480023536.01.T01:CDS	35.0%
	AATGATCAAGGAAATTGACC+AGG	+	Chr4:86604712-86604731	MsG0480023536.01.T01:CDS	35.0%
	AATTCCAACACTGAATGACT+GGG	-	Chr4:86601324-86601343	None:intergenic	35.0%
	AGCTTGTGAAATCTCATCAA+TGG	-	Chr4:86604654-86604673	None:intergenic	35.0%
	ATCAGAATGCCAAAAACTTC+AGG	-	Chr4:86601586-86601605	None:intergenic	35.0%
	ATGATGATAAAAGCAGCACA+TGG	+	Chr4:86601127-86601146	MsG0480023536.01.T01:intron	35.0%
	CAAGCCTTAATTTAACCCAA+TGG	+	Chr4:86604278-86604297	MsG0480023536.01.T01:intron	35.0%
	CTATCCCACCAATTTCTAAA+AGG	-	Chr4:86603351-86603370	None:intergenic	35.0%
	GATTGCTACTAAGTATACTG+TGG	+	Chr4:86601603-86601622	MsG0480023536.01.T01:intron	35.0%
	GGATCCAATCAAGTTATTGA+TGG	+	Chr4:86605129-86605148	MsG0480023536.01.T01:CDS	35.0%
	GGATGGAATTAAGGGATTTA+GGG	+	Chr4:86600962-86600981	MsG0480023536.01.T01:intron	35.0%
	GGTAACAGAGATATACAGAA+TGG	+	Chr4:86600239-86600258	MsG0480023536.01.T01:CDS	35.0%
	TGAGATTTCACAAGCTTGTA+AGG	+	Chr4:86604658-86604677	MsG0480023536.01.T01:CDS	35.0%
	TGCAGAAAAGCTTTCTCTTT+GGG	-	Chr4:86600350-86600369	None:intergenic	35.0%
	TGGATGGAATTAAGGGATTT+AGG	+	Chr4:86600961-86600980	MsG0480023536.01.T01:intron	35.0%
	TGTTAAGTAAGGGACCAAAA+TGG	-	Chr4:86601563-86601582	None:intergenic	35.0%
	TTCCATATTATGGTAGAAGC+AGG	+	Chr4:86601234-86601253	MsG0480023536.01.T01:intron	35.0%
	TTGATCAAAATCCGAGAACA+AGG	+	Chr4:86602309-86602328	MsG0480023536.01.T01:CDS	35.0%
	TTGCAGAAAAGCTTTCTCTT+TGG	-	Chr4:86600351-86600370	None:intergenic	35.0%
	TTGTGTCATGTGAATGGATA+AGG	+	Chr4:86601344-86601363	MsG0480023536.01.T01:intron	35.0%
	TTTAAATAAGCTGGAGAGAG+AGG	+	Chr4:86604574-86604593	MsG0480023536.01.T01:CDS	35.0%
	TTTAATAGCACATCGCTTTC+TGG	-	Chr4:86601471-86601490	None:intergenic	35.0%
	TTTGCTGCAATGATGAGAAA+GGG	+	Chr4:86605033-86605052	MsG0480023536.01.T01:CDS	35.0%
	TTTGGTTGATTAGGGTTTAC+TGG	+	Chr4:86600811-86600830	MsG0480023536.01.T01:intron	35.0%
!	AAAGCGATGTGCTATTAAAG+GGG	+	Chr4:86601472-86601491	MsG0480023536.01.T01:intron	35.0%
!	AAGGAGGTGAACTTTTTGAT+AGG	+	Chr4:86600499-86600518	MsG0480023536.01.T01:CDS	35.0%
!	AATCATGTTTAAGGCCGAAA+AGG	-	Chr4:86604396-86604415	None:intergenic	35.0%
!	ACCCTTGCTTTGATAGTAAA+GGG	-	Chr4:86603530-86603549	None:intergenic	35.0%
!	ACTTCTATAATGGAGGCTAT+TGG	+	Chr4:86601437-86601456	MsG0480023536.01.T01:intron	35.0%
!	AGAAAGCGATGTGCTATTAA+AGG	+	Chr4:86601470-86601489	MsG0480023536.01.T01:intron	35.0%
!	ATGCTGTAAGTGTTTTCTTG+TGG	+	Chr4:86604232-86604251	MsG0480023536.01.T01:intron	35.0%
!	ATTGTTATGGAGCTTTGTGA+AGG	+	Chr4:86600480-86600499	MsG0480023536.01.T01:CDS	35.0%
!	ATTTGCTGCAATGATGAGAA+AGG	+	Chr4:86605032-86605051	MsG0480023536.01.T01:CDS	35.0%
!	CAGTTTCAACGTTGTTTCAA+TGG	+	Chr4:86600146-86600165	MsG0480023536.01.T01:exon	35.0%
!	GAAAGCGATGTGCTATTAAA+GGG	+	Chr4:86601471-86601490	MsG0480023536.01.T01:intron	35.0%
!	GGAATTTTGTGTCATGTGAA+TGG	+	Chr4:86601338-86601357	MsG0480023536.01.T01:intron	35.0%
!	GTAAGGTTTTTGCAAGGTTA+TGG	+	Chr4:86602524-86602543	MsG0480023536.01.T01:intron	35.0%
!	GTTTTCTCAACTGCCATTAT+TGG	+	Chr4:86603621-86603640	MsG0480023536.01.T01:intron	35.0%
!	GTTTTGCATTAGGAGAGAAA+AGG	+	Chr4:86600859-86600878	MsG0480023536.01.T01:intron	35.0%
!	GTTTTTGCTCACTTTATCCT+AGG	+	Chr4:86604047-86604066	MsG0480023536.01.T01:intron	35.0%
!	TACCCTTGCTTTGATAGTAA+AGG	-	Chr4:86603531-86603550	None:intergenic	35.0%
!	TGAATGTTTTTCCACTTTCC+AGG	+	Chr4:86601197-86601216	MsG0480023536.01.T01:intron	35.0%
!	TGATTTGTGTGTGCATAGAT+AGG	-	Chr4:86600298-86600317	None:intergenic	35.0%
!	TGCTGTAAGTGTTTTCTTGT+GGG	+	Chr4:86604233-86604252	MsG0480023536.01.T01:intron	35.0%
!!	AACGATGCGACTTTTTCTTA+AGG	-	Chr4:86604369-86604388	None:intergenic	35.0%
!!	GAAAATTTTGTTGTGCAGGA+TGG	+	Chr4:86604991-86605010	MsG0480023536.01.T01:intron	35.0%
!!	GGAAAGCATCTAACCAATAA+TGG	-	Chr4:86603637-86603656	None:intergenic	35.0%
!!	GTCAAAAGTATCTACATGGT+TGG	+	Chr4:86603571-86603590	MsG0480023536.01.T01:intron	35.0%
!!	GTTTGCCTTTTAGAAATTGG+TGG	+	Chr4:86603343-86603362	MsG0480023536.01.T01:intron	35.0%
!!	TGGAGTCAAAAGTATCTACA+TGG	+	Chr4:86603567-86603586	MsG0480023536.01.T01:intron	35.0%
!!	TTTACTTGATTCTGAGGTGT+TGG	+	Chr4:86601034-86601053	MsG0480023536.01.T01:intron	35.0%
!!!	TAGTCTTGTTTTCGTTCTGA+CGG	+	Chr4:86601852-86601871	MsG0480023536.01.T01:intron	35.0%
!!!	TATTATTTTTGGCACGTGAC+AGG	+	Chr4:86604493-86604512	MsG0480023536.01.T01:intron	35.0%
	AAAGATGGCTTAAAGCGAGT+AGG	+	Chr4:86604171-86604190	MsG0480023536.01.T01:CDS	40.0%
	AAATACCTACCTGCCCAAAA+TGG	-	Chr4:86602065-86602084	None:intergenic	40.0%
	AAATTGGTGGGATAGTTCAC+TGG	+	Chr4:86603356-86603375	MsG0480023536.01.T01:intron	40.0%
	AAGTAAGGGACCAAAATGGA+TGG	-	Chr4:86601559-86601578	None:intergenic	40.0%
	AATGAATGCAAAAGAGTCGG+CGG	+	Chr4:86604816-86604835	MsG0480023536.01.T01:intron	40.0%
	AATGGCAGTTGAGAAAACCA+TGG	-	Chr4:86603619-86603638	None:intergenic	40.0%
	AGAACTTCCTGTTTCCAGTA+AGG	-	Chr4:86603966-86603985	None:intergenic	40.0%
	AGCTTAGGATGCAAACAAAG+TGG	-	Chr4:86603883-86603902	None:intergenic	40.0%
	AGTAAGGGACCAAAATGGAT+GGG	-	Chr4:86601558-86601577	None:intergenic	40.0%
	ATGTTGTCATCCACAATCCA+TGG	-	Chr4:86602579-86602598	None:intergenic	40.0%
	CAGATACATAAGGATGCTTG+AGG	-	Chr4:86603910-86603929	None:intergenic	40.0%
	CCACACGTTGTTAGAATTGA+AGG	+	Chr4:86600429-86600448	MsG0480023536.01.T01:CDS	40.0%
	CCTTCAATTCTAACAACGTG+TGG	-	Chr4:86600432-86600451	None:intergenic	40.0%
	GAATCCTTCTCTGATGTTGT+TGG	+	Chr4:86601933-86601952	MsG0480023536.01.T01:CDS	40.0%
	GATAAAACTGCAGAGTCGAT+AGG	-	Chr4:86602615-86602634	None:intergenic	40.0%
	GCCCTTTACTATCAAAGCAA+GGG	+	Chr4:86603526-86603545	MsG0480023536.01.T01:intron	40.0%
	GGAACATAATCCAACTGTTC+TGG	-	Chr4:86603598-86603617	None:intergenic	40.0%
	GGGTCATTATAGTGAAAGAC+AGG	+	Chr4:86600533-86600552	MsG0480023536.01.T01:CDS	40.0%
	GTTACCTTCTCTGTTCTGTA+GGG	-	Chr4:86600225-86600244	None:intergenic	40.0%
	GTTGAATCTTGTCACTCTCT+CGG	+	Chr4:86600588-86600607	MsG0480023536.01.T01:CDS	40.0%
	TAAAATCTGTCGGAAGATCC+CGG	-	Chr4:86602213-86602232	None:intergenic	40.0%
	TACAGAATGGGTCGAAAACT+TGG	+	Chr4:86600252-86600271	MsG0480023536.01.T01:CDS	40.0%
	TAGAATTGAAGGAACGTACG+AGG	+	Chr4:86600440-86600459	MsG0480023536.01.T01:CDS	40.0%
	TAGGACATGTCATTCCTTAC+TGG	+	Chr4:86603949-86603968	MsG0480023536.01.T01:intron	40.0%
	TAGGGTAAAACCCATGTTAC+TGG	-	Chr4:86600207-86600226	None:intergenic	40.0%
	TCACAAGCTTGTAAGGACTT+TGG	+	Chr4:86604665-86604684	MsG0480023536.01.T01:CDS	40.0%
	TCACATTCAGAAACTGAACC+CGG	+	Chr4:86602191-86602210	MsG0480023536.01.T01:intron	40.0%
	TCTCCACATTGATCATGATG+TGG	+	Chr4:86605288-86605307	MsG0480023536.01.T01:three_prime_UTR	40.0%
	TCTTATGAATGCATTCCTCG+TGG	+	Chr4:86601734-86601753	MsG0480023536.01.T01:intron	40.0%
	TGTCATTCCTTACTGGAAAC+AGG	+	Chr4:86603956-86603975	MsG0480023536.01.T01:intron	40.0%
	TGTCTGTTGGATGATACATG+AGG	+	Chr4:86604417-86604436	MsG0480023536.01.T01:intron	40.0%
	TGTTACCTTCTCTGTTCTGT+AGG	-	Chr4:86600226-86600245	None:intergenic	40.0%
	TGTTGTCATCCACAATCCAT+GGG	-	Chr4:86602578-86602597	None:intergenic	40.0%
	TTACAGCATCCATTAGATCC+TGG	-	Chr4:86604221-86604240	None:intergenic	40.0%
	TTCATTGATCTGATTGGAGC+TGG	+	Chr4:86600773-86600792	MsG0480023536.01.T01:intron	40.0%
	TTTACCCTACAGAACAGAGA+AGG	+	Chr4:86600218-86600237	MsG0480023536.01.T01:CDS	40.0%
!	AAGCGATGTGCTATTAAAGG+GGG	+	Chr4:86601473-86601492	MsG0480023536.01.T01:intron	40.0%
!	ACTTATGGAGTCTGAAATCC+AGG	+	Chr4:86604200-86604219	MsG0480023536.01.T01:CDS	40.0%
!	AGGCGGATGTTGATAAAAGT+GGG	+	Chr4:86604513-86604532	MsG0480023536.01.T01:intron	40.0%
!	CTTGCTTTGATAGTAAAGGG+CGG	-	Chr4:86603527-86603546	None:intergenic	40.0%
!	GTCTGAAATCCAGGATCTAA+TGG	+	Chr4:86604209-86604228	MsG0480023536.01.T01:CDS	40.0%
!	TGTAAGTGTTTTCTTGTGGG+AGG	+	Chr4:86604236-86604255	MsG0480023536.01.T01:intron	40.0%
!	TTCGGTTCTTGATTTCTGGA+TGG	+	Chr4:86600945-86600964	MsG0480023536.01.T01:intron	40.0%
!	TTTTTCTGCCCCATCCATTT+TGG	+	Chr4:86601546-86601565	MsG0480023536.01.T01:intron	40.0%
!!	AAAGGGTGCTCACATGATAA+GGG	+	Chr4:86601504-86601523	MsG0480023536.01.T01:intron	40.0%
!!	AACCTGCAATTTGTTGTGTG+GGG	-	Chr4:86605400-86605419	None:intergenic	40.0%
!!	AGAACCTGCAATTTGTTGTG+TGG	-	Chr4:86605402-86605421	None:intergenic	40.0%
!!	AGAGATGCTTTGGGATTAGT+AGG	+	Chr4:86605102-86605121	MsG0480023536.01.T01:CDS	40.0%
!!	GAACCTGCAATTTGTTGTGT+GGG	-	Chr4:86605401-86605420	None:intergenic	40.0%
!!	TAAAGGGTGCTCACATGATA+AGG	+	Chr4:86601503-86601522	MsG0480023536.01.T01:intron	40.0%
!!	TGGAAACAGGAAGTTCTAAG+TGG	+	Chr4:86603969-86603988	MsG0480023536.01.T01:intron	40.0%
!!!	AGTCTTGTTTTCGTTCTGAC+GGG	+	Chr4:86601853-86601872	MsG0480023536.01.T01:intron	40.0%
	AAAATCTGTCGGAAGATCCC+GGG	-	Chr4:86602212-86602231	None:intergenic	45.0%
	AAACTTCGTTCAACCCAGAG+TGG	-	Chr4:86603763-86603782	None:intergenic	45.0%
	AAAGCAGCACATGGTGTCTT+TGG	+	Chr4:86601136-86601155	MsG0480023536.01.T01:intron	45.0%
	AACCCAGAGTGGAATGCATA+AGG	-	Chr4:86603752-86603771	None:intergenic	45.0%
	AATAAGCGAAGGCTGACAAC+AGG	-	Chr4:86604604-86604623	None:intergenic	45.0%
	ACAGCGCAAAGGATCTAATC+CGG	+	Chr4:86602279-86602298	MsG0480023536.01.T01:CDS	45.0%
	ACTATCAACCATAGTCCACG+AGG	-	Chr4:86601752-86601771	None:intergenic	45.0%
	ACTTCCGGTGCAACATAGTA+TGG	-	Chr4:86601963-86601982	None:intergenic	45.0%
	AGACTATGCAGTAATGCACC+AGG	-	Chr4:86605334-86605353	None:intergenic	45.0%
	AGTCCTTATGCATTCCACTC+TGG	+	Chr4:86603746-86603765	MsG0480023536.01.T01:intron	45.0%
	ATCATGATGTGGTCCATGTG+GGG	+	Chr4:86605299-86605318	MsG0480023536.01.T01:three_prime_UTR	45.0%
	ATGATGAGAAAGGGCAATGG+AGG	+	Chr4:86605042-86605061	MsG0480023536.01.T01:CDS	45.0%
	ATGATTGACACAGACAGCAG+TGG	+	Chr4:86604126-86604145	MsG0480023536.01.T01:CDS	45.0%
	ATGGACCTGAATCAGATGTG+TGG	+	Chr4:86601997-86602016	MsG0480023536.01.T01:CDS	45.0%
	ATGGGTCGAAAACTTGGTCA+AGG	+	Chr4:86600258-86600277	MsG0480023536.01.T01:CDS	45.0%
	CACATTCAGAAACTGAACCC+GGG	+	Chr4:86602192-86602211	MsG0480023536.01.T01:intron	45.0%
	CCACTAGCATGCTTTCACTA+GGG	-	Chr4:86604310-86604329	None:intergenic	45.0%
	CGCCCTTTACTATCAAAGCA+AGG	+	Chr4:86603525-86603544	MsG0480023536.01.T01:intron	45.0%
	CTTCCGGTGCAACATAGTAT+GGG	-	Chr4:86601962-86601981	None:intergenic	45.0%
	GAATCCCAGTCATTCAGTGT+TGG	+	Chr4:86601317-86601336	MsG0480023536.01.T01:intron	45.0%
	GATCATGATGTGGTCCATGT+GGG	+	Chr4:86605298-86605317	MsG0480023536.01.T01:three_prime_UTR	45.0%
	GATGCTTGAGGTTCAAGCTT+AGG	-	Chr4:86603898-86603917	None:intergenic	45.0%
	GATGCTTTCCATTGACACGA+AGG	+	Chr4:86603647-86603666	MsG0480023536.01.T01:intron	45.0%
	GCAATGATGAGAAAGGGCAA+TGG	+	Chr4:86605039-86605058	MsG0480023536.01.T01:CDS	45.0%
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	GCGAGTAGGATCTGAACTTA+TGG	+	Chr4:86604185-86604204	MsG0480023536.01.T01:CDS	45.0%
	GGACCACATCATGATCAATG+TGG	-	Chr4:86605294-86605313	None:intergenic	45.0%
	GTAAGGGACCAAAATGGATG+GGG	-	Chr4:86601557-86601576	None:intergenic	45.0%
	GTCCTTATGCATTCCACTCT+GGG	+	Chr4:86603747-86603766	MsG0480023536.01.T01:intron	45.0%
	TAGCATTTCAGACAGCGCAA+AGG	+	Chr4:86602268-86602287	MsG0480023536.01.T01:CDS	45.0%
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	TCACTAGGGCAAACTCCATT+GGG	-	Chr4:86604296-86604315	None:intergenic	45.0%
	TGATCATGATGTGGTCCATG+TGG	+	Chr4:86605297-86605316	MsG0480023536.01.T01:three_prime_UTR	45.0%
	TGATGAGAAAGGGCAATGGA+GGG	+	Chr4:86605043-86605062	MsG0480023536.01.T01:CDS	45.0%
	TTCACTAGGGCAAACTCCAT+TGG	-	Chr4:86604297-86604316	None:intergenic	45.0%
!	AATGCATTCCTCGTGGACTA+TGG	+	Chr4:86601741-86601760	MsG0480023536.01.T01:intron	45.0%
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!	CAGGCGGATGTTGATAAAAG+TGG	+	Chr4:86604512-86604531	MsG0480023536.01.T01:intron	45.0%
!	CCTAGTGAAAGCATGCTAGT+GGG	+	Chr4:86604308-86604327	MsG0480023536.01.T01:intron	45.0%
!	GTTATGGAGCTTTGTGAAGG+AGG	+	Chr4:86600483-86600502	MsG0480023536.01.T01:CDS	45.0%
!	TCGCATCGTTGTTGCCTTTT+CGG	+	Chr4:86604379-86604398	MsG0480023536.01.T01:intron	45.0%
!	TTGATTTTCAGTCCGAGCCT+TGG	+	Chr4:86602243-86602262	MsG0480023536.01.T01:CDS	45.0%
!	TTTGCGCTGTCTGAAATGCT+AGG	-	Chr4:86602269-86602288	None:intergenic	45.0%
!!	ACAGGAAGTTCTAAGTGGTC+TGG	+	Chr4:86603974-86603993	MsG0480023536.01.T01:intron	45.0%
!!	ACTCTCTCGGTGTTATGCAT+AGG	+	Chr4:86600601-86600620	MsG0480023536.01.T01:CDS	45.0%
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!!	GCTTTGGGATTAGTAGGCAA+TGG	+	Chr4:86605108-86605127	MsG0480023536.01.T01:CDS	45.0%
!!!	TATTTTTGGCACGTGACAGG+CGG	+	Chr4:86604496-86604515	MsG0480023536.01.T01:intron	45.0%
!!!	TAATAAGATTTTATTATTTT+TGG	+	Chr4:86604482-86604501	MsG0480023536.01.T01:intron	5.0%
	AGAAAGGGCAATGGAGGGAT+AGG	+	Chr4:86605048-86605067	MsG0480023536.01.T01:CDS	50.0%
	CAGCACATGGTGTCTTTGGT+AGG	+	Chr4:86601140-86601159	MsG0480023536.01.T01:intron	50.0%
	CAGGCCACCAATTTCTTCCT+CGG	-	Chr4:86604091-86604110	None:intergenic	50.0%
	CATGGTTGGACCAGAACAGT+TGG	+	Chr4:86603585-86603604	MsG0480023536.01.T01:intron	50.0%
	CCCACTAGCATGCTTTCACT+AGG	-	Chr4:86604311-86604330	None:intergenic	50.0%
	CTGTCCGAGGAAGAAATTGG+TGG	+	Chr4:86604084-86604103	MsG0480023536.01.T01:CDS	50.0%
	GAAGTCTTGCGCAAGCTCTA+TGG	+	Chr4:86601978-86601997	MsG0480023536.01.T01:CDS	50.0%
	GAATCAGATGTGTGGAGTGC+TGG	+	Chr4:86602005-86602024	MsG0480023536.01.T01:CDS	50.0%
	GAGCCCATACTATGTTGCAC+CGG	+	Chr4:86601956-86601975	MsG0480023536.01.T01:CDS	50.0%
	GCACTCCACACATCTGATTC+AGG	-	Chr4:86602005-86602024	None:intergenic	50.0%
	GCTCCCAACAACATCAGAGA+AGG	-	Chr4:86601940-86601959	None:intergenic	50.0%
	TACCTACCTGCCCAAAATGG+TGG	-	Chr4:86602062-86602081	None:intergenic	50.0%
	TAGAGCTTGCGCAAGACTTC+CGG	-	Chr4:86601978-86601997	None:intergenic	50.0%
	TGAAATGCTAGGCCAAGGCT+CGG	-	Chr4:86602258-86602277	None:intergenic	50.0%
	TGTCATCCACAATCCATGGG+TGG	-	Chr4:86602575-86602594	None:intergenic	50.0%
	TTTCTGTTTCAGGCCACCCA+TGG	+	Chr4:86602559-86602578	MsG0480023536.01.T01:intron	50.0%
!	AGTGAAAGCATGCTAGTGGG+AGG	+	Chr4:86604311-86604330	MsG0480023536.01.T01:intron	50.0%
!	CCCTAGTGAAAGCATGCTAG+TGG	+	Chr4:86604307-86604326	MsG0480023536.01.T01:intron	50.0%
!	CTGTCTGAAATGCTAGGCCA+AGG	-	Chr4:86602263-86602282	None:intergenic	50.0%
!!	AAGTGGGGTGCCACCATTTT+GGG	+	Chr4:86602049-86602068	MsG0480023536.01.T01:CDS	50.0%
!!	GGTAAGAGCATTGGATGCAC+TGG	+	Chr4:86603547-86603566	MsG0480023536.01.T01:intron	50.0%
!!	TAAGTGGGGTGCCACCATTT+TGG	+	Chr4:86602048-86602067	MsG0480023536.01.T01:CDS	50.0%
!!	TGCGCTGTTAGCCTTGTTCT+CGG	-	Chr4:86602323-86602342	None:intergenic	50.0%
	AGGGCAATGGAGGGATAGGA+AGG	+	Chr4:86605052-86605071	MsG0480023536.01.T01:CDS	55.0%
	ATGCAGTAATGCACCAGGCC+TGG	-	Chr4:86605329-86605348	None:intergenic	55.0%
	CGGCTGTCCGAGGAAGAAAT+TGG	+	Chr4:86604081-86604100	MsG0480023536.01.T01:CDS	55.0%
	GAGTCGGCGGAATCTGTCTT+TGG	+	Chr4:86604829-86604848	MsG0480023536.01.T01:intron	55.0%
	GGCCCCACACAACAAATTGC+AGG	+	Chr4:86605395-86605414	MsG0480023536.01.T01:three_prime_UTR	55.0%
!	TGCCACCATTTTGGGCAGGT+AGG	+	Chr4:86602057-86602076	MsG0480023536.01.T01:intron	55.0%
!	TTCAGGCCACCCATGGATTG+TGG	+	Chr4:86602566-86602585	MsG0480023536.01.T01:intron	55.0%
	TGGTCCATGTGGGGTAGACC+AGG	+	Chr4:86605308-86605327	MsG0480023536.01.T01:three_prime_UTR	60.0%
	CAGGCCTGGTCTACCCCACA+TGG	-	Chr4:86605315-86605334	None:intergenic	65.0%
	CATGTGGGGTAGACCAGGCC+TGG	+	Chr4:86605313-86605332	MsG0480023536.01.T01:three_prime_UTR	65.0%
!!	GGGGTGCCACCATTTTGGGC+AGG	+	Chr4:86602053-86602072	MsG0480023536.01.T01:CDS	65.0%

Chromosome	Type	Strat	End	Strand	Name
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Chr4	five_prime_UTR	86600079	86600164	86600079	ID=MsG0480023536.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0480023536.01.T01
Chr4	CDS	86600165	86600717	86600165	ID=MsG0480023536.01.T01:cds;Parent=MsG0480023536.01.T01
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Gene Sequence

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Protein sequence

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