AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680035360.01

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MsG0680035360.01.T01 AT5G58940 32.013 303 183 7 28 317 134 426 1.59e-35 140
MsG0680035360.01.T01 AT5G58940 40.502 279 151 7 360 630 155 426 1.08e-53 191
MsG0680035360.01.T01 AT5G58940 32.013 303 183 7 28 317 134 426 1.59e-35 140
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MsG0680035360.01.T01 AT5G58940 32.013 303 183 7 28 317 134 426 1.59e-35 140
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MsG0680035360.01.T01 AT4G31110 36.789 299 174 7 25 315 437 728 2.56e-44 170
MsG0680035360.01.T01 AT5G02070 41.481 270 143 7 372 628 379 646 2.62e-50 186
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MsG0680035360.01.T01 AT4G34440 40.377 265 143 6 372 627 328 586 7.77e-50 184
MsG0680035360.01.T01 AT4G34440 31.058 293 189 4 29 314 300 586 2.52e-32 133
MsG0680035360.01.T01 AT1G51800 42.578 256 135 7 377 626 606 855 7.84e-50 187
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MsG0680035360.01.T01 AT2G28970 30.690 290 185 7 29 312 469 748 8.82e-29 122
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MsG0680035360.01.T01 AT1G70450 32.765 293 182 6 29 312 37 323 2.18e-33 132
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MsG0680035360.01.T01 AT1G51805 32.558 301 177 9 24 313 562 847 6.65e-30 126
MsG0680035360.01.T01 AT1G16260 40.299 268 148 6 372 631 406 669 1.51e-48 181
MsG0680035360.01.T01 AT1G16260 35.000 300 186 4 24 319 373 667 4.93e-39 154
MsG0680035360.01.T01 AT1G16260 40.299 268 148 6 372 631 406 669 1.51e-48 181
MsG0680035360.01.T01 AT1G16260 35.000 300 186 4 24 319 373 667 4.93e-39 154
MsG0680035360.01.T01 AT5G38560 42.804 271 132 10 372 626 355 618 1.54e-48 181
MsG0680035360.01.T01 AT5G38560 30.725 345 209 9 13 336 313 648 2.47e-36 145
MsG0680035360.01.T01 AT3G59110 37.548 261 153 5 372 626 206 462 1.65e-48 177
MsG0680035360.01.T01 AT3G59110 29.193 322 216 5 29 342 178 495 7.25e-35 139
MsG0680035360.01.T01 AT5G28680 41.445 263 139 7 372 626 537 792 2.03e-48 182
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MsG0680035360.01.T01 AT5G28680 41.445 263 139 7 372 626 537 792 2.03e-48 182
MsG0680035360.01.T01 AT5G28680 31.724 290 187 5 29 313 509 792 1.31e-29 125
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MsG0680035360.01.T01 AT1G56120 39.695 262 145 5 372 627 726 980 4.73e-47 179
MsG0680035360.01.T01 AT1G56120 33.904 292 178 5 29 314 698 980 2.86e-34 140
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MsG0680035360.01.T01 AT2G37050 31.366 322 203 10 15 327 579 891 8.08e-36 144
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MsG0680035360.01.T01 AT1G51850 31.186 295 189 7 24 313 563 848 1.10e-28 122
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MsG0680035360.01.T01 AT1G09440 35.632 261 158 5 372 626 173 429 6.30e-47 172
MsG0680035360.01.T01 AT1G09440 31.250 288 190 4 29 312 145 428 1.33e-33 134
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MsG0680035360.01.T01 AT2G18470 40.530 264 144 7 372 627 300 558 8.58e-47 175
MsG0680035360.01.T01 AT2G18470 30.565 301 191 6 22 314 268 558 2.69e-30 126
MsG0680035360.01.T01 AT2G18470 40.530 264 144 7 372 627 300 558 8.58e-47 175
MsG0680035360.01.T01 AT2G18470 30.565 301 191 6 22 314 268 558 2.69e-30 126
MsG0680035360.01.T01 AT1G70530 37.729 273 155 8 360 627 331 593 1.01e-46 175
MsG0680035360.01.T01 AT1G70530 28.713 303 200 6 18 314 301 593 3.32e-32 132
MsG0680035360.01.T01 AT5G47850 39.510 286 146 8 361 626 452 730 1.46e-46 176
MsG0680035360.01.T01 AT5G47850 31.111 315 184 8 22 312 424 729 4.99e-26 114
MsG0680035360.01.T01 AT5G24010 40.293 273 152 6 361 628 496 762 1.59e-46 176
MsG0680035360.01.T01 AT5G24010 31.081 296 187 6 30 317 478 764 3.67e-30 127
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MsG0680035360.01.T01 AT3G19300 32.698 315 189 7 11 313 292 595 1.65e-37 149
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MsG0680035360.01.T01 AT1G34210 29.831 295 192 6 29 314 293 581 5.18e-28 119
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MsG0680035360.01.T01 AT5G62230 29.758 289 190 6 28 312 587 866 1.84e-28 122
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MsG0680035360.01.T01 AT1G56130 32.302 291 186 5 28 314 681 964 2.01e-34 140
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MsG0680035360.01.T01 AT1G56720 31.944 288 188 4 29 312 167 450 3.47e-34 137
MsG0680035360.01.T01 AT1G56720 35.632 261 158 5 372 626 195 451 2.86e-45 168
MsG0680035360.01.T01 AT1G56720 31.944 288 188 4 29 312 167 450 3.47e-34 137
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MsG0680035360.01.T01 AT1G51790 37.643 263 152 8 369 626 590 845 3.09e-45 173
MsG0680035360.01.T01 AT1G51790 34.256 289 174 9 29 312 567 844 3.89e-34 139
MsG0680035360.01.T01 AT5G45780 39.350 277 151 8 361 628 264 532 3.96e-45 169
MsG0680035360.01.T01 AT5G45780 31.761 318 203 6 29 336 245 558 4.19e-37 146
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MsG0680035360.01.T01 AT5G18500 32.526 289 187 4 29 313 154 438 3.12e-33 134
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MsG0680035360.01.T01 AT2G28990 30.690 290 185 8 29 312 567 846 1.93e-29 125
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MsG0680035360.01.T01 AT2G02800 29.568 301 191 6 27 312 69 363 5.09e-32 129
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MsG0680035360.01.T01 AT3G46340 38.824 255 142 8 379 626 609 856 1.07e-43 168
MsG0680035360.01.T01 AT3G46340 31.922 307 185 11 12 309 561 852 1.82e-29 125
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MsG0680035360.01.T01 AT2G19230 40.856 257 137 8 378 626 591 840 1.34e-43 168
MsG0680035360.01.T01 AT2G19230 30.717 293 181 9 29 312 560 839 4.86e-28 120
MsG0680035360.01.T01 AT5G39000 40.226 266 143 8 372 626 534 794 1.82e-43 167
MsG0680035360.01.T01 AT5G39000 29.866 298 187 7 29 313 506 794 2.18e-28 121
MsG0680035360.01.T01 AT2G23200 39.313 262 146 5 372 626 504 759 1.92e-43 167
MsG0680035360.01.T01 AT2G23200 31.741 293 187 5 31 317 478 763 1.76e-28 122
MsG0680035360.01.T01 AT4G20450 38.989 277 140 9 356 626 593 846 1.92e-43 167
MsG0680035360.01.T01 AT4G20450 30.619 307 179 8 29 324 581 864 2.24e-31 131
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MsG0680035360.01.T01 AT2G13800 27.425 299 204 6 24 314 141 434 1.11e-26 114
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MsG0680035360.01.T01 AT5G37450 27.458 295 195 5 29 315 643 926 1.49e-25 113
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MsG0680035360.01.T01 AT1G55200 32.588 313 196 5 7 314 349 651 9.48e-36 143
MsG0680035360.01.T01 AT1G55200 37.091 275 156 7 360 627 387 651 5.48e-42 162
MsG0680035360.01.T01 AT1G55200 32.588 313 196 5 7 314 349 651 9.48e-36 143
MsG0680035360.01.T01 AT1G55200 37.091 275 156 7 360 627 387 651 5.48e-42 162
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MsG0680035360.01.T01 AT1G31420 37.354 257 150 5 375 626 325 575 1.13e-40 157
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MsG0680035360.01.T01 AT1G11050 37.226 274 151 7 372 627 311 581 1.15e-40 157
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MsG0680035360.01.T01 AT1G61440 29.043 303 203 6 16 312 453 749 5.97e-30 126
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MsG0680035360.01.T01 AT3G13690 30.994 342 213 7 7 335 381 712 1.87e-35 143
MsG0680035360.01.T01 AT3G13690 35.165 273 164 5 360 627 419 683 1.03e-39 156
MsG0680035360.01.T01 AT3G13690 30.994 342 213 7 7 335 381 712 1.87e-35 143
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MsG0680035360.01.T01 AT1G06700 25.503 298 207 8 29 315 56 349 2.40e-24 105
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MsG0680035360.01.T01 AT2G35620 27.397 292 194 5 29 313 292 572 2.57e-20 95.5
MsG0680035360.01.T01 AT2G35620 37.308 260 145 7 375 626 323 572 1.88e-39 153
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MsG0680035360.01.T01 AT2G35620 37.308 260 145 7 375 626 323 572 1.88e-39 153
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MsG0680035360.01.T01 AT5G07280 37.410 278 155 9 361 628 924 1192 1.95e-39 156
MsG0680035360.01.T01 AT5G07280 29.474 285 192 4 36 315 912 1192 1.26e-26 116
MsG0680035360.01.T01 AT2G17220 35.496 262 156 8 373 626 111 367 2.12e-39 150
MsG0680035360.01.T01 AT2G17220 31.579 304 181 9 27 312 72 366 1.08e-32 130
MsG0680035360.01.T01 AT2G30730 35.587 281 158 9 360 626 65 336 2.21e-39 148
MsG0680035360.01.T01 AT2G30730 26.510 298 200 9 29 313 45 336 4.53e-24 104
MsG0680035360.01.T01 AT2G17220 35.496 262 156 8 373 626 112 368 2.24e-39 150
MsG0680035360.01.T01 AT2G17220 31.494 308 184 9 27 316 73 371 1.25e-32 130
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MsG0680035360.01.T01 AT5G13160 35.517 290 165 11 350 625 79 360 1.38e-38 149
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MsG0680035360.01.T01 AT5G62710 36.111 252 148 6 382 626 304 549 1.42e-38 150
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MsG0680035360.01.T01 AT1G52290 42.391 184 100 3 372 551 159 340 1.45e-38 147
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MsG0680035360.01.T01 AT3G09830 29.878 328 204 10 29 340 72 389 3.46e-27 115
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MsG0680035360.01.T01 AT5G62710 36.508 252 147 7 382 626 338 583 2.29e-38 150
MsG0680035360.01.T01 AT5G62710 29.693 293 189 7 29 313 300 583 5.75e-21 97.8
MsG0680035360.01.T01 AT2G01820 37.132 272 152 9 372 629 601 867 2.33e-38 152
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MsG0680035360.01.T01 AT2G02220 37.591 274 159 6 361 628 741 1008 2.35e-38 152
MsG0680035360.01.T01 AT2G02220 29.795 292 195 5 29 315 722 1008 5.53e-28 120
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MsG0680035360.01.T01 AT1G61480 26.462 325 223 7 15 333 470 784 6.05e-27 117
MsG0680035360.01.T01 AT3G49670 37.906 277 158 8 361 630 697 966 3.03e-38 152
MsG0680035360.01.T01 AT3G49670 27.476 313 208 9 17 317 661 966 1.25e-22 103
MsG0680035360.01.T01 AT3G23750 37.226 274 152 10 373 633 595 861 3.05e-38 152
MsG0680035360.01.T01 AT3G23750 32.180 289 185 6 32 312 569 854 8.37e-31 129
MsG0680035360.01.T01 AT3G59350 34.982 283 161 9 360 628 136 409 3.09e-38 147
MsG0680035360.01.T01 AT3G59350 26.367 311 216 6 15 315 102 409 4.22e-26 112
MsG0680035360.01.T01 AT2G39110 33.591 259 159 7 380 628 120 375 3.41e-38 147
MsG0680035360.01.T01 AT2G39110 29.508 305 194 8 27 315 76 375 3.02e-23 103
MsG0680035360.01.T01 AT3G59350 34.982 283 161 9 360 628 121 394 3.64e-38 146
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MsG0680035360.01.T01 AT3G59350 34.982 283 161 9 360 628 121 394 3.64e-38 146
MsG0680035360.01.T01 AT3G59350 26.688 311 215 6 15 315 87 394 4.98e-26 111
MsG0680035360.01.T01 AT1G52310 34.221 263 160 9 373 626 285 543 3.73e-38 149
MsG0680035360.01.T01 AT1G52310 26.910 301 206 7 26 317 252 547 2.16e-26 114
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MsG0680035360.01.T01 AT1G29750 34.420 276 165 7 360 628 674 940 3.92e-38 152
MsG0680035360.01.T01 AT1G29750 26.752 314 220 5 6 315 633 940 4.06e-29 124
MsG0680035360.01.T01 AT5G42440 34.211 266 163 6 372 630 97 357 4.11e-38 145
MsG0680035360.01.T01 AT5G42440 28.276 290 198 5 29 313 69 353 4.80e-27 113
MsG0680035360.01.T01 AT4G04490 37.066 259 150 6 372 625 356 606 4.23e-38 150
MsG0680035360.01.T01 AT4G04490 30.000 280 183 5 37 312 336 606 5.03e-24 107
MsG0680035360.01.T01 AT1G09970 35.379 277 146 8 375 626 685 953 4.35e-38 152
MsG0680035360.01.T01 AT1G09970 27.679 336 200 12 17 319 634 959 3.24e-20 96.3
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MsG0680035360.01.T01 AT5G03320 35.659 258 154 7 380 628 111 365 4.54e-38 146
MsG0680035360.01.T01 AT5G03320 27.806 392 247 11 4 371 41 420 3.12e-29 121
MsG0680035360.01.T01 AT1G29750 34.420 276 165 7 360 628 689 955 4.64e-38 152
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MsG0680035360.01.T01 AT2G23950 33.796 216 134 3 29 240 287 497 3.63e-26 113
MsG0680035360.01.T01 AT1G75820 34.657 277 171 6 361 630 699 972 6.73e-38 151
MsG0680035360.01.T01 AT1G75820 26.543 324 200 11 15 312 656 967 4.26e-23 105
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MsG0680035360.01.T01 AT2G18890 30.631 222 142 6 23 236 50 267 6.46e-22 96.7
MsG0680035360.01.T01 AT1G74360 35.507 276 164 5 372 639 830 1099 9.40e-38 150
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MsG0680035360.01.T01 AT1G55610 36.949 295 154 10 350 622 847 1131 1.11e-37 150
MsG0680035360.01.T01 AT1G55610 27.759 299 198 7 29 316 847 1138 1.77e-20 97.1
MsG0680035360.01.T01 AT2G28940 36.538 260 149 8 381 628 135 390 1.18e-37 146
MsG0680035360.01.T01 AT2G28940 30.330 333 200 11 11 315 62 390 5.40e-28 118
MsG0680035360.01.T01 AT5G11020 35.271 258 153 8 375 625 99 349 1.29e-37 144
MsG0680035360.01.T01 AT5G11020 31.366 322 196 10 6 312 38 349 5.02e-33 131
MsG0680035360.01.T01 AT4G20270 38.028 284 151 12 361 632 717 987 1.44e-37 150
MsG0680035360.01.T01 AT4G20270 29.560 318 192 10 19 317 684 988 1.64e-28 122
MsG0680035360.01.T01 AT4G11900 37.354 257 151 6 372 622 553 805 1.46e-37 150
MsG0680035360.01.T01 AT4G11900 31.390 223 135 5 37 249 533 747 1.20e-24 110
MsG0680035360.01.T01 AT2G33170 35.472 265 154 6 372 622 835 1096 1.50e-37 150
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MsG0680035360.01.T01 AT2G33170 35.472 265 154 6 372 622 835 1096 1.50e-37 150
MsG0680035360.01.T01 AT2G33170 31.987 297 179 9 29 309 807 1096 4.83e-30 127
MsG0680035360.01.T01 AT1G07570 37.288 236 137 7 400 628 6 237 1.59e-37 141
MsG0680035360.01.T01 AT1G07570 29.958 237 157 5 85 316 6 238 2.86e-21 95.1

Find 124 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 250 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TTCTTTCATGAATTGATTAA+TGG 0.173858 6:+103223221 None:intergenic
AACTTGAGTCCTATGTTATT+TGG 0.179348 6:+103222491 None:intergenic
GAAAATGATGTTTATAGTTT+TGG 0.237525 6:-103224363 MsG0680035360.01.T01:CDS
CCTCAAGTCCTCAACCTTAC+AGG 0.247976 6:+103225631 None:intergenic
TGAGAATCTCCAGAGTTTCT+TGG 0.249378 6:-103226514 MsG0680035360.01.T01:five_prime_UTR
GTAAAGTTCTTCATTGGTTC+TGG 0.249847 6:-103222354 MsG0680035360.01.T01:three_prime_UTR
CTACGGCTGAGCTTGCATTT+TGG 0.255178 6:-103224167 MsG0680035360.01.T01:CDS
GAAAATCTGGTTTCACTTTA+CGG 0.258023 6:-103223171 MsG0680035360.01.T01:CDS
TCCGTCAAAGTTGCAGATTT+TGG 0.269115 6:-103222928 MsG0680035360.01.T01:CDS
GGCTCTGCCACTGTATATTA+TGG 0.295304 6:-103225456 MsG0680035360.01.T01:intron
TATGAGGTAATTTCAGTAAA+AGG 0.304434 6:-103224066 MsG0680035360.01.T01:intron
GGACTCTCGCGGTTACTTCC+AGG 0.318003 6:-103222907 MsG0680035360.01.T01:CDS
TGGGGTCCGGAGGGTTCGGC+AGG 0.324732 6:-103223614 MsG0680035360.01.T01:CDS
GATCAAGTCTCTTGTAGCTT+TGG 0.327132 6:+103224440 None:intergenic
TCTAGCACTTGTTCCATGTT+AGG 0.329976 6:+103224117 None:intergenic
ATCATCCATCGTGACATAAA+AGG 0.330954 6:-103222979 MsG0680035360.01.T01:CDS
GTGCCTTGCATTAAACTTGC+CGG 0.331351 6:+103222745 None:intergenic
TTGGAATATCTTCACTATAA+TGG 0.333600 6:-103224567 MsG0680035360.01.T01:CDS
AGTTGAAAACCAAGCTTTAG+TGG 0.335980 6:-103224250 MsG0680035360.01.T01:CDS
CATGGTTGGCCTGAGTCCCT+TGG 0.346712 6:+103222567 None:intergenic
TTGTCAAAGAAACTTGATAT+TGG 0.356607 6:-103224468 MsG0680035360.01.T01:CDS
TCATCATCTTGTTGATCTTA+AGG 0.364461 6:+103224193 None:intergenic
AGTGTCTAAAACCTGTTTCA+TGG 0.370556 6:+103222549 None:intergenic
TTTCTGGGGTCCGGAGGGTT+CGG 0.373898 6:-103223618 MsG0680035360.01.T01:CDS
CTTGTGTCAAAAGGCTTACT+TGG 0.377542 6:-103224390 MsG0680035360.01.T01:CDS
AAGGCATAAGCAAAGGGAAA+TGG 0.378076 6:-103222522 MsG0680035360.01.T01:CDS
GATCCAGATTACTATAAAAC+TGG 0.382774 6:-103222835 MsG0680035360.01.T01:CDS
GTCATAGTAAAGTTCTTCAT+TGG 0.394892 6:-103222360 MsG0680035360.01.T01:three_prime_UTR
TTTGGATAAACTCTTTGAAC+AGG 0.398161 6:-103222470 MsG0680035360.01.T01:three_prime_UTR
TCACCTGCATCATGAAAATC+TGG 0.406204 6:-103223184 MsG0680035360.01.T01:CDS
AGGCATAAGCAAAGGGAAAT+GGG 0.406354 6:-103222521 MsG0680035360.01.T01:CDS
GTTAGTAGCTTCTTCAAGTT+CGG 0.408622 6:+103223653 None:intergenic
ATGGTTGGCCTGAGTCCCTT+GGG 0.409594 6:+103222568 None:intergenic
AATAACATAGGACTCAAGTT+TGG 0.414149 6:-103222488 MsG0680035360.01.T01:exon
ATGTTCCGCTATCTGATATT+CGG 0.419880 6:+103224640 None:intergenic
TCCAAAATCTGCAACTTTGA+CGG 0.433484 6:+103222927 None:intergenic
CAAGGCGTTCGCAGTTTCAA+TGG 0.434167 6:+103223023 None:intergenic
GTGTACGAGTACATCTCTAA+TGG 0.435383 6:-103223114 MsG0680035360.01.T01:CDS
AAAAGCGACGTCTATAGCTT+TGG 0.439247 6:-103222799 MsG0680035360.01.T01:CDS
ATTGCAATATCTAATCTGTT+AGG 0.446401 6:+103224606 None:intergenic
ACTCAGGCCAACCATGAAAC+AGG 0.446500 6:-103222560 MsG0680035360.01.T01:CDS
ACCCCAGAAAAGTGTCAAAC+TGG 0.451802 6:+103223631 None:intergenic
TGAGCTTATATCATCGAAAC+CGG 0.457743 6:-103222764 MsG0680035360.01.T01:CDS
ACTCTTGCTGCTCATATTCA+AGG 0.458707 6:-103224663 MsG0680035360.01.T01:CDS
TCAGAATGAAGAAGAATGTC+TGG 0.461560 6:-103224292 MsG0680035360.01.T01:CDS
GGGTTCGGCAGGGTCTACTA+TGG 0.464144 6:-103223603 MsG0680035360.01.T01:CDS
ACTTGTCTTCATTGAAGCAT+TGG 0.466387 6:+103224820 None:intergenic
ATGTTAGGTCTTAATTCTTG+TGG 0.467607 6:+103224132 None:intergenic
CCAAGCTTTAGTGGAGCTGT+TGG 0.469527 6:-103224241 MsG0680035360.01.T01:CDS
TGATTAGGAAAACTTAAGAA+TGG 0.471562 6:-103224858 MsG0680035360.01.T01:intron
TACACGAATATGTGTCCAAC+GGG 0.473718 6:-103224686 MsG0680035360.01.T01:CDS
GGTTGAGGACTTGAGGCAAT+GGG 0.475185 6:-103225624 MsG0680035360.01.T01:exon
GACCCGGAACTTGTGTCAAA+AGG 0.476994 6:-103224399 MsG0680035360.01.T01:CDS
TGCAGTGTCCCAAGGGACTC+AGG 0.477919 6:-103222576 MsG0680035360.01.T01:CDS
CCAGAGTTTCTTGGTTCCCA+AGG 0.481009 6:-103226505 MsG0680035360.01.T01:intron
ATCTCCCTTGCTTTATGCCA+TGG 0.481228 6:+103224088 None:intergenic
AAAAGGAAGCAATATTCTGC+TGG 0.482538 6:-103222962 MsG0680035360.01.T01:CDS
CTGGACATTATTCTGAAGGT+TGG 0.483959 6:-103222335 MsG0680035360.01.T01:three_prime_UTR
ATAGCGGAACATCGTTAACT+TGG 0.494984 6:-103224629 MsG0680035360.01.T01:CDS
TATTGTGAGACATTACATTA+CGG 0.496844 6:+103224535 None:intergenic
CCTTGGGAACCAAGAAACTC+TGG 0.505372 6:+103226505 None:intergenic
ATCAATAAAACATAAAGCCT+CGG 0.508601 6:+103222438 None:intergenic
CTTCATGTAGTAAACTATCA+TGG 0.511295 6:-103223065 MsG0680035360.01.T01:CDS
GAAACATGGGTAACATTGCC+TGG 0.515182 6:+103222889 None:intergenic
CATTGAAACTGCGAACGCCT+TGG 0.519080 6:-103223022 MsG0680035360.01.T01:CDS
GGTTCTGGACATTATTCTGA+AGG 0.519718 6:-103222339 MsG0680035360.01.T01:three_prime_UTR
CTCTACAAGGCATAAGCAAA+GGG 0.524712 6:-103222528 MsG0680035360.01.T01:CDS
GAGCTGTTGGATCAAAGACT+TGG 0.532924 6:-103224228 MsG0680035360.01.T01:CDS
AACTCTTTGAACAGGTGCAC+GGG 0.533884 6:-103222462 MsG0680035360.01.T01:three_prime_UTR
GTAGACCCTGCCGAACCCTC+CGG 0.537735 6:+103223608 None:intergenic
CCAACAGCTCCACTAAAGCT+TGG 0.542512 6:+103224241 None:intergenic
AGGACTTGAGGCAATGGGGT+GGG 0.542954 6:-103225619 MsG0680035360.01.T01:exon
TCTAAAACCTGTTTCATGGT+TGG 0.546310 6:+103222553 None:intergenic
TGGATGTGCGACTCATCAAA+AGG 0.548309 6:-103224721 MsG0680035360.01.T01:CDS
CTCAAGTCCTCAACCTTACA+GGG 0.553761 6:+103225632 None:intergenic
AGGTTGAGGACTTGAGGCAA+TGG 0.555014 6:-103225625 MsG0680035360.01.T01:exon
ACTCTTACACAACATCTTCA+CGG 0.556675 6:-103223090 MsG0680035360.01.T01:CDS
TTGGTATATCTTCACGACTC+AGG 0.556830 6:-103223003 MsG0680035360.01.T01:CDS
TGAACAGGTGCACGGGTCCG+AGG 0.558204 6:-103222455 MsG0680035360.01.T01:three_prime_UTR
TCAGTGTGTGCAGTGTCCCA+AGG 0.560074 6:-103222584 MsG0680035360.01.T01:CDS
GGATGTGCAATGACCCTGTA+AGG 0.564030 6:-103225645 MsG0680035360.01.T01:five_prime_UTR
GGGATTCAACCAAATAACAT+AGG 0.564400 6:-103222500 MsG0680035360.01.T01:exon
GGGGTCCGGAGGGTTCGGCA+GGG 0.564854 6:-103223613 MsG0680035360.01.T01:CDS
CAGATTACTATAAAACTGGA+AGG 0.565872 6:-103222831 MsG0680035360.01.T01:CDS
CACATATTCGTGTACTAGCA+AGG 0.569119 6:+103224695 None:intergenic
CTACCGGAAAAGTTGAAACA+TGG 0.569707 6:+103222875 None:intergenic
CACATCCATAAATTGTAACA+AGG 0.569902 6:+103224736 None:intergenic
GAGGACTTGAGGCAATGGGG+TGG 0.579923 6:-103225620 MsG0680035360.01.T01:exon
AATCGATATAGCAAATGCAT+TGG 0.580457 6:-103224586 MsG0680035360.01.T01:CDS
CATAAAGCAAGGGAGATATG+AGG 0.581225 6:-103224082 MsG0680035360.01.T01:CDS
TCTCGTATTCTTGATCAGAA+AGG 0.581815 6:-103225477 MsG0680035360.01.T01:CDS
AAACTCTTTGAACAGGTGCA+CGG 0.584706 6:-103222463 MsG0680035360.01.T01:three_prime_UTR
TAGCTTCTTCAAGTTCGGCA+TGG 0.586573 6:+103223658 None:intergenic
ATGAGCAGCAAGAGTCCCGT+TGG 0.587314 6:+103224671 None:intergenic
ACAAGAATTAAGACCTAACA+TGG 0.592236 6:-103224130 MsG0680035360.01.T01:CDS
ATGTAAGCATGAGTTCCTAC+CGG 0.593048 6:+103222859 None:intergenic
ACTCTCCATGGCATAAAGCA+AGG 0.596458 6:-103224093 MsG0680035360.01.T01:CDS
AGATTGATCAAAATAATATG+TGG 0.598647 6:+103225497 None:intergenic
CAGTGTGTGCAGTGTCCCAA+GGG 0.599099 6:-103222583 MsG0680035360.01.T01:CDS
CAAGGAATTAGAGCTACTAG+TGG 0.604618 6:-103222677 MsG0680035360.01.T01:CDS
ACTCTACAAGGCATAAGCAA+AGG 0.608483 6:-103222529 MsG0680035360.01.T01:CDS
CTCTCCATGGCATAAAGCAA+GGG 0.610099 6:-103224092 MsG0680035360.01.T01:CDS
CTTCTTCAAGTTCGGCATGG+TGG 0.613054 6:+103223661 None:intergenic
ACTATGGTAAGAAGCTGCAA+AGG 0.613717 6:-103223587 MsG0680035360.01.T01:intron
TGTTTAGGAAAACTTAAAGA+CGG 0.614671 6:-103223288 MsG0680035360.01.T01:intron
TACCGGAAAAGTTGAAACAT+GGG 0.616013 6:+103222876 None:intergenic
TTGAGCAAGAGTAACACGCT+TGG 0.616602 6:+103222723 None:intergenic
GGCATAAGCAAAGGGAAATG+GGG 0.624156 6:-103222520 MsG0680035360.01.T01:CDS
AACAAGTTGTTATGTAGACC+CGG 0.625552 6:-103224415 MsG0680035360.01.T01:CDS
GAAAGCAGAATAAATCGAAG+TGG 0.625609 6:-103225551 MsG0680035360.01.T01:CDS
AAACCGGCAAGTTTAATGCA+AGG 0.640775 6:-103222748 MsG0680035360.01.T01:CDS
GCAATGACCCTGTAAGGTTG+AGG 0.642142 6:-103225639 MsG0680035360.01.T01:five_prime_UTR
CAACAAGATGATGACCGCTA+CGG 0.643108 6:-103224184 MsG0680035360.01.T01:CDS
AAATGCAAGCTCAGCCGTAG+CGG 0.650540 6:+103224170 None:intergenic
CCTGTAAGGTTGAGGACTTG+AGG 0.655484 6:-103225631 MsG0680035360.01.T01:five_prime_UTR
AATGAGTAAAATCTTAAACA+AGG 0.658845 6:-103222695 MsG0680035360.01.T01:CDS
GTACACGAATATGTGTCCAA+CGG 0.664921 6:-103224687 MsG0680035360.01.T01:CDS
CAAGTGCTAGAGACTCTCCA+TGG 0.675309 6:-103224105 MsG0680035360.01.T01:CDS
GTTGAGGACTTGAGGCAATG+GGG 0.679706 6:-103225623 MsG0680035360.01.T01:exon
AGATTACTATAAAACTGGAA+GGG 0.681438 6:-103222830 MsG0680035360.01.T01:CDS
CAAGGCCGAATATCAGATAG+CGG 0.686786 6:-103224645 MsG0680035360.01.T01:CDS
CTTCTTACCATAATATACAG+TGG 0.688389 6:+103225449 None:intergenic
AAAACTTAAAGACGGCAGAG+AGG 0.726033 6:-103223280 MsG0680035360.01.T01:CDS
TGAGTCGTGAAGATATACCA+AGG 0.733085 6:+103223005 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! GATTTTTTTTAGTAATTTTA+TGG + Chr6:103222658-103222677 None:intergenic 10.0%
!! AAAGATATTCTAAATTTAGT+CGG - Chr6:103222562-103222581 MsG0680035360.01.T01:CDS 15.0%
!! ATTTCATTGTATTTATGTTT+AGG - Chr6:103225524-103225543 MsG0680035360.01.T01:CDS 15.0%
!! TGTATTAATGTGTATATTAT+TGG + Chr6:103222541-103222560 None:intergenic 15.0%
!!! AAAATGATGTTTATAGTTTT+GGG - Chr6:103224465-103224484 MsG0680035360.01.T01:CDS 15.0%
!!! TATACAAATAGTATTGATAA+TGG - Chr6:103225410-103225429 MsG0680035360.01.T01:intron 15.0%
!!! TCATATATTCTATTTTGATT+AGG - Chr6:103223954-103223973 MsG0680035360.01.T01:intron 15.0%
!!! TTCTTTTAATAAAAATGTAG+TGG - Chr6:103226189-103226208 MsG0680035360.01.T01:intron 15.0%
!! AAAAACCTTGTTACAATTTA+TGG - Chr6:103224086-103224105 MsG0680035360.01.T01:CDS 20.0%
!! AAAAAGAATCGTATTACTAT+AGG + Chr6:103226525-103226544 None:intergenic 20.0%
!! AACATAAATACAATGAAATG+AGG + Chr6:103225523-103225542 None:intergenic 20.0%
!! AATGAGTAAAATCTTAAACA+AGG - Chr6:103226132-103226151 MsG0680035360.01.T01:intron 20.0%
!! ACTTGAATCTAAATACTATA+TGG + Chr6:103224967-103224986 None:intergenic 20.0%
!! AGATTGATCAAAATAATATG+TGG + Chr6:103223333-103223352 None:intergenic 20.0%
!! TAAATTGTAGTTCAATAACT+TGG - Chr6:103225302-103225321 MsG0680035360.01.T01:intron 20.0%
!! TAGCACAAAAATTTATATCA+AGG + Chr6:103224322-103224341 None:intergenic 20.0%
!! TATAAACCTTAAACTTTAAG+TGG - Chr6:103224994-103225013 MsG0680035360.01.T01:intron 20.0%
!! TTAACTTCAAACATTATCTA+TGG - Chr6:103223540-103223559 MsG0680035360.01.T01:intron 20.0%
!! TTCTTTCATGAATTGATTAA+TGG + Chr6:103225609-103225628 None:intergenic 20.0%
!! TTTACAGTTTCAATACATTT+GGG - Chr6:103222682-103222701 MsG0680035360.01.T01:CDS 20.0%
!!! AAAATGTTGAAGTATTTGAT+TGG - Chr6:103223645-103223664 MsG0680035360.01.T01:CDS 20.0%
!!! AAATGATGTTTATAGTTTTG+GGG - Chr6:103224466-103224485 MsG0680035360.01.T01:CDS 20.0%
!!! AATAGTATTGATAATGGAAA+TGG - Chr6:103225416-103225435 MsG0680035360.01.T01:intron 20.0%
!!! ATAAATTTTTGTGCTAAAGT+TGG - Chr6:103224326-103224345 MsG0680035360.01.T01:CDS 20.0%
!!! GAAAATGATGTTTATAGTTT+TGG - Chr6:103224464-103224483 MsG0680035360.01.T01:CDS 20.0%
!!! GACTTTTAAAAACATAAAAG+TGG - Chr6:103222908-103222927 MsG0680035360.01.T01:CDS 20.0%
!!! TAAGTAACATTTGAAGTTAA+CGG - Chr6:103223821-103223840 MsG0680035360.01.T01:intron 20.0%
!!! TAGATAATGTTTGAAGTTAA+CGG + Chr6:103223540-103223559 None:intergenic 20.0%
!!! TTTTTAATGAATAAACGACT+AGG + Chr6:103223905-103223924 None:intergenic 20.0%
! AAATAACTTCTACACATACT+AGG + Chr6:103223753-103223772 None:intergenic 25.0%
! AAATTCAAAGACCAAATTGA+AGG + Chr6:103223462-103223481 None:intergenic 25.0%
! AACTTTAAGTGGTAATAGAA+AGG - Chr6:103225005-103225024 MsG0680035360.01.T01:intron 25.0%
! AATAACTTCTACACATACTA+GGG + Chr6:103223752-103223771 None:intergenic 25.0%
! AGATTACTATAAAACTGGAA+GGG - Chr6:103225997-103226016 MsG0680035360.01.T01:intron 25.0%
! ATCAATAAAACATAAAGCCT+CGG + Chr6:103226392-103226411 None:intergenic 25.0%
! ATGTATTGAAACTGTAAACA+AGG + Chr6:103222680-103222699 None:intergenic 25.0%
! ATTGCAATATCTAATCTGTT+AGG + Chr6:103224224-103224243 None:intergenic 25.0%
! ATTGTAAGTAACTAATGAAC+AGG + Chr6:103222814-103222833 None:intergenic 25.0%
! CTATTACCACTTAAAGTTTA+AGG + Chr6:103225003-103225022 None:intergenic 25.0%
! GAAATGGTAATTATATGAAG+AGG - Chr6:103225432-103225451 MsG0680035360.01.T01:intron 25.0%
! GATTCAAAGTTGAGAAAAAA+AGG + Chr6:103223157-103223176 None:intergenic 25.0%
! GTTTACAGTTTCAATACATT+TGG - Chr6:103222681-103222700 MsG0680035360.01.T01:CDS 25.0%
! TATGAGGTAATTTCAGTAAA+AGG - Chr6:103224761-103224780 MsG0680035360.01.T01:CDS 25.0%
! TATTCTAAATTTAGTCGGTT+TGG - Chr6:103222567-103222586 MsG0680035360.01.T01:CDS 25.0%
! TATTGTGAGACATTACATTA+CGG + Chr6:103224295-103224314 None:intergenic 25.0%
! TGATTAGGAAAACTTAAGAA+TGG - Chr6:103223969-103223988 MsG0680035360.01.T01:intron 25.0%
! TGTTTAGGAAAACTTAAAGA+CGG - Chr6:103225539-103225558 MsG0680035360.01.T01:CDS 25.0%
! TTGGAATATCTTCACTATAA+TGG - Chr6:103224260-103224279 MsG0680035360.01.T01:CDS 25.0%
! TTGTCAAAGAAACTTGATAT+TGG - Chr6:103224359-103224378 MsG0680035360.01.T01:CDS 25.0%
! TTTGTAACTATCCTTCAATT+TGG - Chr6:103223448-103223467 MsG0680035360.01.T01:intron 25.0%
!! CTAGAGATTGTTAATGTTTT+AGG - Chr6:103225102-103225121 MsG0680035360.01.T01:intron 25.0%
!! CTATTCATTCATTCTTTTTC+AGG + Chr6:103223411-103223430 None:intergenic 25.0%
!! TTATATGAAGAGGTACAATA+AGG - Chr6:103225442-103225461 MsG0680035360.01.T01:intron 25.0%
!!! GGCTTTATGTTTTATTGATA+AGG - Chr6:103226393-103226412 MsG0680035360.01.T01:intron 25.0%
!!! TTCAACTTTTTTGCGTAAAA+GGG + Chr6:103224564-103224583 None:intergenic 25.0%
!!! TTTCAACTTTTTTGCGTAAA+AGG + Chr6:103224565-103224584 None:intergenic 25.0%
AAAAAGGGACAAAAGTTTGA+TGG + Chr6:103224806-103224825 None:intergenic 30.0%
AACTTGAGTCCTATGTTATT+TGG + Chr6:103226339-103226358 None:intergenic 30.0%
AATAACATAGGACTCAAGTT+TGG - Chr6:103226339-103226358 MsG0680035360.01.T01:intron 30.0%
AATAATCACGATGTCAATCT+AGG - Chr6:103222736-103222755 MsG0680035360.01.T01:CDS 30.0%
AATCGATATAGCAAATGCAT+TGG - Chr6:103224241-103224260 MsG0680035360.01.T01:CDS 30.0%
ACAAGAATTAAGACCTAACA+TGG - Chr6:103224697-103224716 MsG0680035360.01.T01:CDS 30.0%
ACACAACAAATTCAAGTGAA+CGG - Chr6:103223861-103223880 MsG0680035360.01.T01:intron 30.0%
ATGTTAGGTCTTAATTCTTG+TGG + Chr6:103224698-103224717 None:intergenic 30.0%
CACATCCATAAATTGTAACA+AGG + Chr6:103224094-103224113 None:intergenic 30.0%
CAGATTACTATAAAACTGGA+AGG - Chr6:103225996-103226015 MsG0680035360.01.T01:intron 30.0%
CTTCATGTAGTAAACTATCA+TGG - Chr6:103225762-103225781 MsG0680035360.01.T01:intron 30.0%
CTTCTTACCATAATATACAG+TGG + Chr6:103223381-103223400 None:intergenic 30.0%
GATCCAGATTACTATAAAAC+TGG - Chr6:103225992-103226011 MsG0680035360.01.T01:intron 30.0%
GTCATAGTAAAGTTCTTCAT+TGG - Chr6:103226467-103226486 MsG0680035360.01.T01:intron 30.0%
TCATCATCTTGTTGATCTTA+AGG + Chr6:103224637-103224656 None:intergenic 30.0%
TGGTAATTCAAAGTTCGATT+AGG + Chr6:103223032-103223051 None:intergenic 30.0%
TTCTCAACTTTGAATCATAG+AGG - Chr6:103223161-103223180 MsG0680035360.01.T01:CDS 30.0%
TTTGGATAAACTCTTTGAAC+AGG - Chr6:103226357-103226376 MsG0680035360.01.T01:intron 30.0%
! AAACTTTTGTCCCTTTTTGT+TGG - Chr6:103224808-103224827 MsG0680035360.01.T01:CDS 30.0%
! AACTTTTGTCCCTTTTTGTT+GGG - Chr6:103224809-103224828 MsG0680035360.01.T01:CDS 30.0%
! ATTGTAACAAGGTTTTTGTG+TGG + Chr6:103224083-103224102 None:intergenic 30.0%
! CGTAACATTTTATCAGAGTT+AGG + Chr6:103225055-103225074 None:intergenic 30.0%
! GAAAATCTGGTTTCACTTTA+CGG - Chr6:103225656-103225675 MsG0680035360.01.T01:intron 30.0%
! TAACATTTGAAGTTAACGGA+GGG - Chr6:103223825-103223844 MsG0680035360.01.T01:intron 30.0%
!! CTTCCAGTTTTATAGTAATC+TGG + Chr6:103225998-103226017 None:intergenic 30.0%
!!! TCGTATCACTTTTTGTTAGT+TGG - Chr6:103222371-103222390 MsG0680035360.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
AAAAGGAAGCAATATTCTGC+TGG - Chr6:103225865-103225884 MsG0680035360.01.T01:intron 35.0%
AACAAGTTGTTATGTAGACC+CGG - Chr6:103224412-103224431 MsG0680035360.01.T01:CDS 35.0%
ACTCTTACACAACATCTTCA+CGG - Chr6:103225737-103225756 MsG0680035360.01.T01:intron 35.0%
ACTTGTCTTCATTGAAGCAT+TGG + Chr6:103224010-103224029 None:intergenic 35.0%
ATCATCCATCGTGACATAAA+AGG - Chr6:103225848-103225867 MsG0680035360.01.T01:intron 35.0%
ATGTTCCGCTATCTGATATT+CGG + Chr6:103224190-103224209 None:intergenic 35.0%
CTCAAACTATTGTTCTTGAC+TGG + Chr6:103222957-103222976 None:intergenic 35.0%
GAAAGATCACAATAGACGTT+GGG - Chr6:103223485-103223504 MsG0680035360.01.T01:intron 35.0%
GAAAGCAGAATAAATCGAAG+TGG - Chr6:103223276-103223295 MsG0680035360.01.T01:CDS 35.0%
GGGATTCAACCAAATAACAT+AGG - Chr6:103226327-103226346 MsG0680035360.01.T01:intron 35.0%
GTTAAGCTAACCACAAATTC+AGG + Chr6:103222469-103222488 None:intergenic 35.0%
TAAAAGTGGTTGAGCTCAAA+TGG - Chr6:103222922-103222941 MsG0680035360.01.T01:CDS 35.0%
TACCGGAAAAGTTGAAACAT+GGG + Chr6:103225954-103225973 None:intergenic 35.0%
TAGTTTACTGATAAGTGAGC+AGG - Chr6:103224841-103224860 MsG0680035360.01.T01:CDS 35.0%
TATAGTACTGCCTGAATTTG+TGG - Chr6:103222456-103222475 MsG0680035360.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
TCAGAATGAAGAAGAATGTC+TGG - Chr6:103224535-103224554 MsG0680035360.01.T01:CDS 35.0%
TCCAAAATCTGCAACTTTGA+CGG + Chr6:103225903-103225922 None:intergenic 35.0%
TCCTAAAGATTCAGTCTGAA+GGG + Chr6:103223616-103223635 None:intergenic 35.0%
TCTCGTATTCTTGATCAGAA+AGG - Chr6:103223350-103223369 MsG0680035360.01.T01:intron 35.0%
TGAAAGATCACAATAGACGT+TGG - Chr6:103223484-103223503 MsG0680035360.01.T01:intron 35.0%
TGAGCTTATATCATCGAAAC+CGG - Chr6:103226063-103226082 MsG0680035360.01.T01:intron 35.0%
TGTTAGTTGGTTGCATAACT+TGG - Chr6:103222384-103222403 MsG0680035360.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
TGTTTAGAGATCGTAACGAA+TGG + Chr6:103225348-103225367 None:intergenic 35.0%
TTCCTAAAGATTCAGTCTGA+AGG + Chr6:103223617-103223636 None:intergenic 35.0%
! AAACCAGATTTTCATGATGC+AGG + Chr6:103225649-103225668 None:intergenic 35.0%
! AACCAGTTTGACACTTTTCT+GGG - Chr6:103225194-103225213 MsG0680035360.01.T01:intron 35.0%
! AGTGTCTAAAACCTGTTTCA+TGG + Chr6:103226281-103226300 None:intergenic 35.0%
! AGTTGAAAACCAAGCTTTAG+TGG - Chr6:103224577-103224596 MsG0680035360.01.T01:CDS 35.0%
! GTAACATTTGAAGTTAACGG+AGG - Chr6:103223824-103223843 MsG0680035360.01.T01:intron 35.0%
! GTCTTAACTCTCTTGTTTCT+AGG + Chr6:103223067-103223086 None:intergenic 35.0%
! GTTAGTAGCTTCTTCAAGTT+CGG + Chr6:103225177-103225196 None:intergenic 35.0%
! TAACCAGTTTGACACTTTTC+TGG - Chr6:103225193-103225212 MsG0680035360.01.T01:intron 35.0%
! TACCCATGTTTCAACTTTTC+CGG - Chr6:103225949-103225968 MsG0680035360.01.T01:intron 35.0%
! TCTAAAACCTGTTTCATGGT+TGG + Chr6:103226277-103226296 None:intergenic 35.0%
! TTTCTAGGAGAATGAACTCT+TGG + Chr6:103223052-103223071 None:intergenic 35.0%
! TTTTGTGTGGCATGTAGTTT+AGG + Chr6:103224070-103224089 None:intergenic 35.0%
!! GTAAAGTTCTTCATTGGTTC+TGG - Chr6:103226473-103226492 MsG0680035360.01.T01:intron 35.0%
!!! TGATGTTTATAGTTTTGGGG+TGG - Chr6:103224469-103224488 MsG0680035360.01.T01:CDS 35.0%
!!! TGGTTTTTTCTGTCTCTTCA+TGG + Chr6:103225589-103225608 None:intergenic 35.0%
AAAACTTAAAGACGGCAGAG+AGG - Chr6:103225547-103225566 MsG0680035360.01.T01:CDS 40.0%
AAAAGCGACGTCTATAGCTT+TGG - Chr6:103226028-103226047 MsG0680035360.01.T01:intron 40.0%
AAACCGGCAAGTTTAATGCA+AGG - Chr6:103226079-103226098 MsG0680035360.01.T01:intron 40.0%
AAACTCTTTGAACAGGTGCA+CGG - Chr6:103226364-103226383 MsG0680035360.01.T01:intron 40.0%
AAACTGTACTGTCAAGTGCA+GGG + Chr6:103224922-103224941 None:intergenic 40.0%
AAGGCATAAGCAAAGGGAAA+TGG - Chr6:103226305-103226324 MsG0680035360.01.T01:intron 40.0%
AATGACATGACAGTGTACGT+GGG - Chr6:103223581-103223600 MsG0680035360.01.T01:intron 40.0%
ACTATGGTAAGAAGCTGCAA+AGG - Chr6:103225240-103225259 MsG0680035360.01.T01:intron 40.0%
ACTCTACAAGGCATAAGCAA+AGG - Chr6:103226298-103226317 MsG0680035360.01.T01:intron 40.0%
ACTCTTGCTGCTCATATTCA+AGG - Chr6:103224164-103224183 MsG0680035360.01.T01:CDS 40.0%
AGGCATAAGCAAAGGGAAAT+GGG - Chr6:103226306-103226325 MsG0680035360.01.T01:intron 40.0%
ATGAGCCATACCCAACAAAA+AGG + Chr6:103224822-103224841 None:intergenic 40.0%
ATGTAAGCATGAGTTCCTAC+CGG + Chr6:103225971-103225990 None:intergenic 40.0%
CAAGGAATTAGAGCTACTAG+TGG - Chr6:103226150-103226169 MsG0680035360.01.T01:intron 40.0%
CACATATTCGTGTACTAGCA+AGG + Chr6:103224135-103224154 None:intergenic 40.0%
CATAAAGCAAGGGAGATATG+AGG - Chr6:103224745-103224764 MsG0680035360.01.T01:CDS 40.0%
CCTAAAGATTCAGTCTGAAG+GGG + Chr6:103223615-103223634 None:intergenic 40.0%
CGATGATTTGACAGTACACA+CGG + Chr6:103223781-103223800 None:intergenic 40.0%
CTACCGGAAAAGTTGAAACA+TGG + Chr6:103225955-103225974 None:intergenic 40.0%
CTCTACAAGGCATAAGCAAA+GGG - Chr6:103226299-103226318 MsG0680035360.01.T01:intron 40.0%
CTTGTGTCAAAAGGCTTACT+TGG - Chr6:103224437-103224456 MsG0680035360.01.T01:CDS 40.0%
GAACGGTGATTACAAGTTCA+GGG - Chr6:103223878-103223897 MsG0680035360.01.T01:intron 40.0%
GATCAAGTCTCTTGTAGCTT+TGG + Chr6:103224390-103224409 None:intergenic 40.0%
GATGATTTGACAGTACACAC+GGG + Chr6:103223780-103223799 None:intergenic 40.0%
GTACACGAATATGTGTCCAA+CGG - Chr6:103224140-103224159 MsG0680035360.01.T01:CDS 40.0%
GTGTACGAGTACATCTCTAA+TGG - Chr6:103225713-103225732 MsG0680035360.01.T01:intron 40.0%
TAAACTGTACTGTCAAGTGC+AGG + Chr6:103224923-103224942 None:intergenic 40.0%
TAATGACATGACAGTGTACG+TGG - Chr6:103223580-103223599 MsG0680035360.01.T01:intron 40.0%
TACACGAATATGTGTCCAAC+GGG - Chr6:103224141-103224160 MsG0680035360.01.T01:CDS 40.0%
TCACCTGCATCATGAAAATC+TGG - Chr6:103225643-103225662 MsG0680035360.01.T01:five_prime_UTR 40.0%
TCTAGCACTTGTTCCATGTT+AGG + Chr6:103224713-103224732 None:intergenic 40.0%
TGAACGGTGATTACAAGTTC+AGG - Chr6:103223877-103223896 MsG0680035360.01.T01:intron 40.0%
TGAGAATCTCCAGAGTTTCT+TGG - Chr6:103222313-103222332 MsG0680035360.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
TGAGAGCTGAGTTTGAATTC+TGG - Chr6:103222973-103222992 MsG0680035360.01.T01:CDS 40.0%
TGAGCCATACCCAACAAAAA+GGG + Chr6:103224821-103224840 None:intergenic 40.0%
TGAGTCGTGAAGATATACCA+AGG + Chr6:103225825-103225844 None:intergenic 40.0%
TGCACTTGACAGTACAGTTT+AGG - Chr6:103224922-103224941 MsG0680035360.01.T01:intron 40.0%
TTGCTGGCCGACAAAAATTT+GGG + Chr6:103224875-103224894 None:intergenic 40.0%
TTGGTATATCTTCACGACTC+AGG - Chr6:103225824-103225843 MsG0680035360.01.T01:intron 40.0%
! AAGCCTTTTGACACAAGTTC+CGG + Chr6:103224434-103224453 None:intergenic 40.0%
! ACCAGTTTGACACTTTTCTG+GGG - Chr6:103225195-103225214 MsG0680035360.01.T01:intron 40.0%
! ATAGCGGAACATCGTTAACT+TGG - Chr6:103224198-103224217 MsG0680035360.01.T01:CDS 40.0%
! CATGTTTCAACTTTTCCGGT+AGG - Chr6:103225953-103225972 MsG0680035360.01.T01:intron 40.0%
! CTGGACATTATTCTGAAGGT+TGG - Chr6:103226492-103226511 MsG0680035360.01.T01:intron 40.0%
! TCCGTCAAAGTTGCAGATTT+TGG - Chr6:103225899-103225918 MsG0680035360.01.T01:intron 40.0%
! TGCTTCCTTTTATGTCACGA+TGG + Chr6:103225856-103225875 None:intergenic 40.0%
! TTGTCCCTTTTTGTTGGGTA+TGG - Chr6:103224814-103224833 MsG0680035360.01.T01:CDS 40.0%
! TTTGTATTTTGCAACCCCAG+TGG - Chr6:103222775-103222794 MsG0680035360.01.T01:CDS 40.0%
!! GGTTCTGGACATTATTCTGA+AGG - Chr6:103226488-103226507 MsG0680035360.01.T01:intron 40.0%
!!! CAGGTTTTAGACACTCTACA+AGG - Chr6:103226286-103226305 MsG0680035360.01.T01:intron 40.0%
AACTCTTTGAACAGGTGCAC+GGG - Chr6:103226365-103226384 MsG0680035360.01.T01:intron 45.0%
AACTGTACTGTCAAGTGCAG+GGG + Chr6:103224921-103224940 None:intergenic 45.0%
ACAGAAAGTCTCACTCACCT+TGG + Chr6:103222342-103222361 None:intergenic 45.0%
ACCTACCAAGCTTCAACAAC+TGG + Chr6:103223698-103223717 None:intergenic 45.0%
ACTCTCCATGGCATAAAGCA+AGG - Chr6:103224734-103224753 MsG0680035360.01.T01:CDS 45.0%
ATCTCCCTTGCTTTATGCCA+TGG + Chr6:103224742-103224761 None:intergenic 45.0%
CAACAAGATGATGACCGCTA+CGG - Chr6:103224643-103224662 MsG0680035360.01.T01:CDS 45.0%
CAAGGCCGAATATCAGATAG+CGG - Chr6:103224182-103224201 MsG0680035360.01.T01:CDS 45.0%
CAGAAAGTCTCACTCACCTT+GGG + Chr6:103222341-103222360 None:intergenic 45.0%
CCCCTTCAGACTGAATCTTT+AGG - Chr6:103223612-103223631 MsG0680035360.01.T01:CDS 45.0%
CTCAAGTCCTCAACCTTACA+GGG + Chr6:103223198-103223217 None:intergenic 45.0%
CTCTCCATGGCATAAAGCAA+GGG - Chr6:103224735-103224754 MsG0680035360.01.T01:CDS 45.0%
GAAACATGGGTAACATTGCC+TGG + Chr6:103225941-103225960 None:intergenic 45.0%
GAGCTGTTGGATCAAAGACT+TGG - Chr6:103224599-103224618 MsG0680035360.01.T01:CDS 45.0%
GGCATAAGCAAAGGGAAATG+GGG - Chr6:103226307-103226326 MsG0680035360.01.T01:intron 45.0%
GGCTCTGCCACTGTATATTA+TGG - Chr6:103223371-103223390 MsG0680035360.01.T01:intron 45.0%
GTGCCTTGCATTAAACTTGC+CGG + Chr6:103226085-103226104 None:intergenic 45.0%
GTTGCTGGCCGACAAAAATT+TGG + Chr6:103224876-103224895 None:intergenic 45.0%
TGAAGCCAGTTGTTGAAGCT+TGG - Chr6:103223690-103223709 MsG0680035360.01.T01:CDS 45.0%
TGGATGTGCGACTCATCAAA+AGG - Chr6:103224106-103224125 MsG0680035360.01.T01:CDS 45.0%
TTGAGCAAGAGTAACACGCT+TGG + Chr6:103226107-103226126 None:intergenic 45.0%
! AATTTTTGTCGGCCAGCAAC+TGG - Chr6:103224876-103224895 MsG0680035360.01.T01:intron 45.0%
! AGCCTTTTGACACAAGTTCC+GGG + Chr6:103224433-103224452 None:intergenic 45.0%
! ATTTTTGTCGGCCAGCAACT+GGG - Chr6:103224877-103224896 MsG0680035360.01.T01:intron 45.0%
! CGCTTGGCCCAAATTTTTGT+CGG - Chr6:103224865-103224884 MsG0680035360.01.T01:intron 45.0%
! TAGCTTCTTCAAGTTCGGCA+TGG + Chr6:103225172-103225191 None:intergenic 45.0%
! TTGCAGATTTTGGACTCTCG+CGG - Chr6:103225909-103225928 MsG0680035360.01.T01:intron 45.0%
! TTTTGCAACCCCAGTGGAAA+AGG - Chr6:103222781-103222800 MsG0680035360.01.T01:CDS 45.0%
!! ACCCCAGAAAAGTGTCAAAC+TGG + Chr6:103225199-103225218 None:intergenic 45.0%
!!! TTTGACACTTTTCTGGGGTC+CGG - Chr6:103225200-103225219 MsG0680035360.01.T01:intron 45.0%
AAATGCAAGCTCAGCCGTAG+CGG + Chr6:103224660-103224679 None:intergenic 50.0%
ACTCAGGCCAACCATGAAAC+AGG - Chr6:103226267-103226286 MsG0680035360.01.T01:intron 50.0%
ACTGTACTGTCAAGTGCAGG+GGG + Chr6:103224920-103224939 None:intergenic 50.0%
AGGTTGAGGACTTGAGGCAA+TGG - Chr6:103223202-103223221 MsG0680035360.01.T01:CDS 50.0%
AGTTAGGCCAATTACGCGAG+CGG + Chr6:103225039-103225058 None:intergenic 50.0%
CAAGTGCTAGAGACTCTCCA+TGG - Chr6:103224722-103224741 MsG0680035360.01.T01:CDS 50.0%
CATTGAAACTGCGAACGCCT+TGG - Chr6:103225805-103225824 MsG0680035360.01.T01:intron 50.0%
CCAACAGCTCCACTAAAGCT+TGG + Chr6:103224589-103224608 None:intergenic 50.0%
CCAGAGTTTCTTGGTTCCCA+AGG - Chr6:103222322-103222341 MsG0680035360.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
CCTCAAGTCCTCAACCTTAC+AGG + Chr6:103223199-103223218 None:intergenic 50.0%
CCTGTAAGGTTGAGGACTTG+AGG - Chr6:103223196-103223215 MsG0680035360.01.T01:CDS 50.0%
CCTTGGGAACCAAGAAACTC+TGG + Chr6:103222325-103222344 None:intergenic 50.0%
GACCCGGAACTTGTGTCAAA+AGG - Chr6:103224428-103224447 MsG0680035360.01.T01:CDS 50.0%
GCAATGACCCTGTAAGGTTG+AGG - Chr6:103223188-103223207 MsG0680035360.01.T01:CDS 50.0%
GCCAGTTGTTGAAGCTTGGT+AGG - Chr6:103223694-103223713 MsG0680035360.01.T01:CDS 50.0%
GGATGTGCAATGACCCTGTA+AGG - Chr6:103223182-103223201 MsG0680035360.01.T01:CDS 50.0%
GGTTGAGGACTTGAGGCAAT+GGG - Chr6:103223203-103223222 MsG0680035360.01.T01:CDS 50.0%
GTTGAGGACTTGAGGCAATG+GGG - Chr6:103223204-103223223 MsG0680035360.01.T01:CDS 50.0%
TGATAAGTGAGCAGGTCGCT+TGG - Chr6:103224849-103224868 MsG0680035360.01.T01:CDS 50.0%
! AGGTTTAGCGCCTTTTCCAC+TGG + Chr6:103222794-103222813 None:intergenic 50.0%
! CAAGGCGTTCGCAGTTTCAA+TGG + Chr6:103225807-103225826 None:intergenic 50.0%
! CCAAGCTTTAGTGGAGCTGT+TGG - Chr6:103224586-103224605 MsG0680035360.01.T01:CDS 50.0%
! CTACGGCTGAGCTTGCATTT+TGG - Chr6:103224660-103224679 MsG0680035360.01.T01:CDS 50.0%
! CTTCTTCAAGTTCGGCATGG+TGG + Chr6:103225169-103225188 None:intergenic 50.0%
! GGTTTAGCGCCTTTTCCACT+GGG + Chr6:103222793-103222812 None:intergenic 50.0%
! GTTTAGCGCCTTTTCCACTG+GGG + Chr6:103222792-103222811 None:intergenic 50.0%
! TTTTTGTCGGCCAGCAACTG+GGG - Chr6:103224878-103224897 MsG0680035360.01.T01:intron 50.0%
AGGACTTGAGGCAATGGGGT+GGG - Chr6:103223208-103223227 MsG0680035360.01.T01:CDS 55.0%
ATGAGCAGCAAGAGTCCCGT+TGG + Chr6:103224159-103224178 None:intergenic 55.0%
CAGTGTGTGCAGTGTCCCAA+GGG - Chr6:103226244-103226263 MsG0680035360.01.T01:intron 55.0%
TCAGTGTGTGCAGTGTCCCA+AGG - Chr6:103226243-103226262 MsG0680035360.01.T01:intron 55.0%
! TTTTGTCGGCCAGCAACTGG+GGG - Chr6:103224879-103224898 MsG0680035360.01.T01:intron 55.0%
!! ATGGTTGGCCTGAGTCCCTT+GGG + Chr6:103226262-103226281 None:intergenic 55.0%
!!! ACACTTTTCTGGGGTCCGGA+GGG - Chr6:103225204-103225223 MsG0680035360.01.T01:intron 55.0%
GAGGACTTGAGGCAATGGGG+TGG - Chr6:103223207-103223226 MsG0680035360.01.T01:CDS 60.0%
GGACTCTCGCGGTTACTTCC+AGG - Chr6:103225920-103225939 MsG0680035360.01.T01:intron 60.0%
GGGTTCGGCAGGGTCTACTA+TGG - Chr6:103225224-103225243 MsG0680035360.01.T01:intron 60.0%
TCACCATACCCCCCAGTTGC+TGG + Chr6:103224891-103224910 None:intergenic 60.0%
TGCAGTGTCCCAAGGGACTC+AGG - Chr6:103226251-103226270 MsG0680035360.01.T01:intron 60.0%
TGTGCAGCCGCTCGCGTAAT+TGG - Chr6:103225029-103225048 MsG0680035360.01.T01:intron 60.0%
TTTGTCGGCCAGCAACTGGG+GGG - Chr6:103224880-103224899 MsG0680035360.01.T01:intron 60.0%
!! CATGGTTGGCCTGAGTCCCT+TGG + Chr6:103226263-103226282 None:intergenic 60.0%
!! TTTCTGGGGTCCGGAGGGTT+CGG - Chr6:103225209-103225228 MsG0680035360.01.T01:intron 60.0%
!!! GACACTTTTCTGGGGTCCGG+AGG - Chr6:103225203-103225222 MsG0680035360.01.T01:intron 60.0%
GTAGACCCTGCCGAACCCTC+CGG + Chr6:103225222-103225241 None:intergenic 65.0%
TGAACAGGTGCACGGGTCCG+AGG - Chr6:103226372-103226391 MsG0680035360.01.T01:intron 65.0%
CGGCCAGCAACTGGGGGGTA+TGG - Chr6:103224885-103224904 MsG0680035360.01.T01:intron 70.0%
GGGGTCCGGAGGGTTCGGCA+GGG - Chr6:103225214-103225233 MsG0680035360.01.T01:intron 75.0%
TGGGGTCCGGAGGGTTCGGC+AGG - Chr6:103225213-103225232 MsG0680035360.01.T01:intron 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 103222296 103226553 103222296 ID=MsG0680035360.01;Name=MsG0680035360.01
Chr6 mRNA 103222296 103226553 103222296 ID=MsG0680035360.01.T01;Parent=MsG0680035360.01;Name=MsG0680035360.01.T01;_AED=0.33;_eAED=0.37;_QI=88|0.5|0.8|1|0.75|0.6|5|205|639
Chr6 exon 103222296 103223303 103222296 ID=MsG0680035360.01.T01:exon:21118;Parent=MsG0680035360.01.T01
Chr6 exon 103223588 103223725 103223588 ID=MsG0680035360.01.T01:exon:21117;Parent=MsG0680035360.01.T01
Chr6 exon 103224067 103224873 103224067 ID=MsG0680035360.01.T01:exon:21116;Parent=MsG0680035360.01.T01
Chr6 exon 103225457 103225668 103225457 ID=MsG0680035360.01.T01:exon:21115;Parent=MsG0680035360.01.T01
Chr6 exon 103226506 103226553 103226506 ID=MsG0680035360.01.T01:exon:21114;Parent=MsG0680035360.01.T01
Chr6 five_prime_UTR 103226506 103226553 103226506 ID=MsG0680035360.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0680035360.01.T01
Chr6 five_prime_UTR 103225629 103225668 103225629 ID=MsG0680035360.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0680035360.01.T01
Chr6 CDS 103225457 103225628 103225457 ID=MsG0680035360.01.T01:cds;Parent=MsG0680035360.01.T01
Chr6 CDS 103224067 103224873 103224067 ID=MsG0680035360.01.T01:cds;Parent=MsG0680035360.01.T01
Chr6 CDS 103223588 103223725 103223588 ID=MsG0680035360.01.T01:cds;Parent=MsG0680035360.01.T01
Chr6 CDS 103222501 103223303 103222501 ID=MsG0680035360.01.T01:cds;Parent=MsG0680035360.01.T01
Chr6 three_prime_UTR 103222296 103222500 103222296 ID=MsG0680035360.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0680035360.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680035360.01.T01

ATGGGGTGGGATCTCTGTATGTGCAGCTGCTTCACTAGCACTTCTGACACATTTCGAAAGCAGAATAAATCGAAGTGGCAAATCTTCTCATATGAGCAACTTAGAAAAGCCACATATTATTTTGATCAATCTCGTATTCTTGATCAGAAAGGCTCTGCCACTGTATATTATGGAAAACTTAAGAATGGTTGTGAGATTGCAGTCCAATGCTTCAATGAAGACAAGTACAGCATGTTGAGACAGTTCATCGATGAAGCTGCATTCCTAAACTACATGCCACACAAAAACCTTGTTACAATTTATGGATGTGCGACTCATCAAAAGGAGTCCTTGCTAGTACACGAATATGTGTCCAACGGGACTCTTGCTGCTCATATTCAAGGCCGAATATCAGATAGCGGAACATCGTTAACTTGGCCTAACAGATTAGATATTGCAATCGATATAGCAAATGCATTGGAATATCTTCACTATAATGGCATTGTGCACCGTAATGTAATGTCTCACAATATTTTCCTTGATATAAATTTTTGTGCTAAAGTTGGTAACTTACATTTGTCAAAGAAACTTGATATTGGAGCAACCAAAGCTACAAGAGACTTGATCAGAACAAGTTGTTATGTAGACCCGGAACTTGTGTCAAAAGGCTTACTTGGTGTCGAAAATGATGTTTATAGTTTTGGGGTGGTGTTGTGTGAGCTTGTGTCATCTATGCTTGCAGAATATTATATTCAGAATGAAGAAGAATGTCTGGCAACCCTTTTACGCAAAAAAGTTGAAAACCAAGCTTTAGTGGAGCTGTTGGATCAAAGACTTGGCTTCGAATCAGACCTTAAGATCAACAAGATGATGACCGCTACGGCTGAGCTTGCATTTTGGTGTTTGAAATGTCCACAAGAATTAAGACCTAACATGGAACAAGTGCTAGAGACTCTCCATGGCATAAAGCAAGGGAGATATGAGGTAATTTCAGTAAAAGGCTCTTACTATGTAATTCATATGTCTCAGCTTTCAAAATCTTCCACCATGCCGAACTTGAAGAAGCTACTAACCAGTTTGACACTTTTCTGGGGTCCGGAGGGTTCGGCAGGGTCTACTATGGTAAGAAGCTGCAAAGGAAAACTTAAAGACGGCAGAGAGGTTGCAATAAAACGTTTCCATGAAGAGACAGAAAAAACCATTAATCAATTCATGAAAGAAATTGAGATCTTAAGTCACCTGCATCATGAAAATCTGGTTTCACTTTACGGCTGCAGTTCTCGTCATAGCAACAAGCACATGCTTGTGTACGAGTACATCTCTAATGGAACTCTTACACAACATCTTCACGGATCTTCATGTAGTAAACTATCATGGCTTACTAGATTGAATATTGCCATTGAAACTGCGAACGCCTTGGTATATCTTCACGACTCAGGTATCATCCATCGTGACATAAAAGGAAGCAATATTCTGCTGGATGAAAAATTTTCCGTCAAAGTTGCAGATTTTGGACTCTCGCGGTTACTTCCAGGCAATGTTACCCATGTTTCAACTTTTCCGGTAGGAACTCATGCTTACATTGATCCAGATTACTATAAAACTGGAAGGGTCAGTGAGAAAAGCGACGTCTATAGCTTTGGAGTGCTCTTATTTGAGCTTATATCATCGAAACCGGCAAGTTTAATGCAAGGCACCAAGCGTGTTACTCTTGCTCAATATGCAATGAGTAAAATCTTAAACAAGGAATTAGAGCTACTAGTGGATCAAAGTCTTCAAATTTCTTTTAATAAAAATGTAGTGGAAATGATAACAACAGTGACTGAGTTAGCATTTCAGTGTGTGCAGTGTCCCAAGGGACTCAGGCCAACCATGAAACAGGTTTTAGACACTCTACAAGGCATAAGCAAAGGGAAATGGGGATTCAACCAAATAACATAG
Protein sequence

>MsG0680035360.01.T01

MGWDLCMCSCFTSTSDTFRKQNKSKWQIFSYEQLRKATYYFDQSRILDQKGSATVYYGKLKNGCEIAVQCFNEDKYSMLRQFIDEAAFLNYMPHKNLVTIYGCATHQKESLLVHEYVSNGTLAAHIQGRISDSGTSLTWPNRLDIAIDIANALEYLHYNGIVHRNVMSHNIFLDINFCAKVGNLHLSKKLDIGATKATRDLIRTSCYVDPELVSKGLLGVENDVYSFGVVLCELVSSMLAEYYIQNEEECLATLLRKKVENQALVELLDQRLGFESDLKINKMMTATAELAFWCLKCPQELRPNMEQVLETLHGIKQGRYEVISVKGSYYVIHMSQLSKSSTMPNLKKLLTSLTLFWGPEGSAGSTMVRSCKGKLKDGREVAIKRFHEETEKTINQFMKEIEILSHLHHENLVSLYGCSSRHSNKHMLVYEYISNGTLTQHLHGSSCSKLSWLTRLNIAIETANALVYLHDSGIIHRDIKGSNILLDEKFSVKVADFGLSRLLPGNVTHVSTFPVGTHAYIDPDYYKTGRVSEKSDVYSFGVLLFELISSKPASLMQGTKRVTLAQYAMSKILNKELELLVDQSLQISFNKNVVEMITTVTELAFQCVQCPKGLRPTMKQVLDTLQGISKGKWGFNQIT*