AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780035961.01

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Query id Subject id identity % alignment length mismatches gap openings q. start q. end s. start s. end e-value bit score
MsG0780035961.01.T01 AT4G33760 65.589 526 148 5 408 903 70 592 0.0 716
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Find 167 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 567 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
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AATATCTTATGAACCTTTAT+GGG 0.303143 7:-649319 MsG0780035961.01.T01:CDS
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CAACTACAGAGGATTTATTA+AGG 0.346842 7:-642275 MsG0780035961.01.T01:CDS
GAGGAATGACATTGAATTCA+TGG 0.347079 7:+649517 None:intergenic
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GCTATTTAAGCAAATGCTAA+TGG 0.395004 7:-643900 MsG0780035961.01.T01:CDS
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GCTGAAGCAATGAATAGATA+TGG 0.425444 7:-642873 MsG0780035961.01.T01:CDS
AATCCACAAAATTGAATGTC+TGG 0.427154 7:+642035 None:intergenic
AGAACTGAATTTGAGTACTT+TGG 0.427991 7:+642509 None:intergenic
CCTTGCATCGGCTCGTGCAT+TGG 0.433368 7:-641809 MsG0780035961.01.T01:CDS
TTAAATAGCTGAGGGCTTTG+TGG 0.433840 7:+643914 None:intergenic
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CCGACTCTCCAATGTTTAAG+TGG 0.440027 7:-642011 MsG0780035961.01.T01:CDS
TAAACGCGGCATACAACAAA+AGG 0.441824 7:-641635 MsG0780035961.01.T01:CDS
ATAGCCAAAGATATAACTCT+TGG 0.442634 7:-649290 MsG0780035961.01.T01:CDS
ACAGAGAATGCAAGATCATT+GGG 0.442968 7:+649897 None:intergenic
ATACTTTATGTCAGATTGGT+GGG 0.446432 7:-641675 MsG0780035961.01.T01:intron
AGACTTGACAACACCTTGAA+TGG 0.449424 7:+646837 None:intergenic
GAATCATTCCACTTAAACAT+TGG 0.449577 7:+642003 None:intergenic
ATTGATCGTCTTATTGGAGC+TGG 0.454583 7:-648907 MsG0780035961.01.T01:CDS
TCGTGCATTGGCTTATGTCA+TGG 0.459344 7:-641797 MsG0780035961.01.T01:CDS
ATCCACAACAACATGAAAAC+CGG 0.459416 7:-646799 MsG0780035961.01.T01:CDS
GATCTCAAAGTGAAAACGTT+AGG 0.460042 7:-649929 MsG0780035961.01.T01:CDS
ATAGACTCAATGGGACTTTG+AGG 0.460587 7:+649498 None:intergenic
AAGCAAATGCTAATGGTAGC+TGG 0.467850 7:-643893 MsG0780035961.01.T01:CDS
TTGCCAAATAAACTCTAATA+CGG 0.468400 7:+642178 None:intergenic
CATCGAGGTTGCTGCAAATG+AGG 0.476333 7:-646773 MsG0780035961.01.T01:CDS
AACTGTTTCTCCGACATTGT+TGG 0.476431 7:+647020 None:intergenic
CACACAACTAGATATGGAAA+TGG 0.477791 7:-643550 MsG0780035961.01.T01:CDS
TGCCAAAGATTCTCTTAAAG+AGG 0.482570 7:-646686 MsG0780035961.01.T01:CDS
AGAACTTGCTGTTAAAGGAC+CGG 0.486395 7:-648809 MsG0780035961.01.T01:intron
AATTTCGTTTGATGAACCTT+CGG 0.486684 7:-647101 MsG0780035961.01.T01:CDS
ATAAGGATGGAATTTGTCAT+TGG 0.489380 7:-649209 MsG0780035961.01.T01:CDS
CATGAGGAGAGATGTATCAT+TGG 0.490120 7:+649743 None:intergenic
CAGAAGTTGTTCATGAAATG+AGG 0.493887 7:+649798 None:intergenic
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CGAGACTGTAGGCATCTCAA+TGG 0.498709 7:-641608 MsG0780035961.01.T01:CDS
GAGTATGTTGTTGCCATTCA+AGG 0.502898 7:-646850 MsG0780035961.01.T01:CDS
AACTCGGAGTGAAGGAATCA+TGG 0.503554 7:-648963 MsG0780035961.01.T01:CDS
TTTCTCAAGATCGCGGAGAA+TGG 0.503840 7:-642437 MsG0780035961.01.T01:intron
TTTATTAAGGCGATGCTATG+TGG 0.510767 7:-642262 MsG0780035961.01.T01:CDS
TATACTTTATGTCAGATTGG+TGG 0.511613 7:-641676 MsG0780035961.01.T01:intron
TCTGATTCCTTGGAGTGTGG+TGG 0.511716 7:-642554 MsG0780035961.01.T01:CDS
AGGATGGAATTTGTCATTGG+TGG 0.517101 7:-649206 MsG0780035961.01.T01:CDS
GAGTCCTTGAAATCCATTCA+AGG 0.517296 7:+647064 None:intergenic
ATAAGGTGGCATAGACTCAA+TGG 0.517490 7:+649488 None:intergenic
TTCTCTGATTCCTTGGAGTG+TGG 0.517839 7:-642557 MsG0780035961.01.T01:CDS
TAATAACATGGACCTCAAAA+GGG 0.517865 7:+646660 None:intergenic
ACTTTATGTCAGATTGGTGG+GGG 0.518977 7:-641673 MsG0780035961.01.T01:intron
GCTTATGTCATGGTTTACAA+TGG 0.521268 7:-641787 MsG0780035961.01.T01:CDS
GCATCTGTAAATAAAACTCT+AGG 0.521483 7:-642201 MsG0780035961.01.T01:CDS
TGCAGCAACCTCGATGAAGC+CGG 0.521630 7:+646780 None:intergenic
GGAATCAGAGAAAACCTTGA+AGG 0.521670 7:+642568 None:intergenic
TCAGGATTTGGTGCAGTGAA+AGG 0.522281 7:+641844 None:intergenic
TAATGAAGAGTTGATCAGAA+AGG 0.523027 7:-643496 MsG0780035961.01.T01:intron
AGAGACAACATATCTTCTAA+AGG 0.525933 7:+643519 None:intergenic
TAACCTGAATAATGCCGGTA+TGG 0.527060 7:+646932 None:intergenic
TTGATAGCATAATGTGCGGC+TGG 0.530134 7:+646889 None:intergenic
AGCATTTGCTTAAATAGCTG+AGG 0.531601 7:+643905 None:intergenic
TACTTTATGTCAGATTGGTG+GGG 0.532670 7:-641674 MsG0780035961.01.T01:intron
GTCTCAAAGAATCCCTTGAA+TGG 0.533250 7:-647077 MsG0780035961.01.T01:CDS
TTATTAAGGCGATGCTATGT+GGG 0.533289 7:-642261 MsG0780035961.01.T01:CDS
GCTTCAGCATATGTAAGCCT+GGG 0.534696 7:+642888 None:intergenic
TTCTCCGCGATCTTGAGAAA+AGG 0.539797 7:+642440 None:intergenic
TCCAATAAGACGATCAATGT+TGG 0.540821 7:+648912 None:intergenic
TAAGGTGGCATAGACTCAAT+GGG 0.542886 7:+649489 None:intergenic
TGTAGGCATCTCAATGGAGC+AGG 0.544534 7:-641602 MsG0780035961.01.T01:CDS
TTTAAGTGAACTCGGAGTGA+AGG 0.545444 7:-648971 MsG0780035961.01.T01:CDS
AAATTGGGATACATATCTAA+AGG 0.547115 7:+649093 None:intergenic
AAGGAACGATTGTATAAGGA+TGG 0.550046 7:-649222 MsG0780035961.01.T01:CDS
ATATCTAGTTGTGTGAACTC+AGG 0.550270 7:+643558 None:intergenic
GCAAATAAAATCAGATCACT+TGG 0.551349 7:+642237 None:intergenic
TTCGACATCTTGGTGTGCAA+CGG 0.551549 7:-649362 MsG0780035961.01.T01:CDS
AGGAATGACATTGAATTCAT+GGG 0.552980 7:+649518 None:intergenic
TTTATTAAGTGAGGTGATGT+TGG 0.554769 7:-641515 MsG0780035961.01.T01:CDS
AATTACCAAATCCTTTCCCC+AGG 0.555111 7:-642905 MsG0780035961.01.T01:CDS
TAGCTGAGGGCTTTGTGGCA+AGG 0.556212 7:+643919 None:intergenic
CTCAATCTTAGAGACCATAC+CGG 0.558715 7:-646946 MsG0780035961.01.T01:CDS
AGTCCTTGAAATCCATTCAA+GGG 0.558919 7:+647065 None:intergenic
TGTTCCAAATCCATTTCAAG+AGG 0.561120 7:-649634 MsG0780035961.01.T01:CDS
TATCAATAACAATGTAAGAC+TGG 0.561174 7:-646872 MsG0780035961.01.T01:CDS
ATGGTCTCTAAGATTGAGAA+AGG 0.561339 7:+646951 None:intergenic
GATCAATTGCTACGATCTCA+TGG 0.564059 7:-649029 MsG0780035961.01.T01:CDS
GCATTTGCTTAAATAGCTGA+GGG 0.564155 7:+643906 None:intergenic
CCACTTAAACATTGGAGAGT+CGG 0.573150 7:+642011 None:intergenic
AAATCAATCTGCCGATAAGG+TGG 0.573370 7:+649474 None:intergenic
TGTCATGGTTTACAATGGGG+TGG 0.579334 7:-641782 MsG0780035961.01.T01:CDS
TGGGTTTGACCATGTTAGAG+AGG 0.579600 7:-649436 MsG0780035961.01.T01:CDS
CCAATGCACGAGCCGATGCA+AGG 0.580571 7:+641809 None:intergenic
CATGGTTTACAATGGGGTGG+AGG 0.582592 7:-641779 MsG0780035961.01.T01:intron
ATAAATGTTATCAAGTAGCA+AGG 0.584021 7:-643865 MsG0780035961.01.T01:intron
AATAACTCCACCACACTCCA+AGG 0.590280 7:+642547 None:intergenic
GAATTATCTTCCAACAATGT+CGG 0.594876 7:-647030 MsG0780035961.01.T01:CDS
TGTATTCATTAAGTGGTGAG+AGG 0.595973 7:-649680 MsG0780035961.01.T01:CDS
TCATGTGAGGTAACTAAGAA+CGG 0.597199 7:+646718 None:intergenic
ATATCTAAAGGTATGTCTAA+GGG 0.597378 7:+649105 None:intergenic
ATCCATACTTAATACTAAAG+CGG 0.599311 7:+642302 None:intergenic
GGGATTCTTTGAGACGCCGA+AGG 0.599443 7:+647085 None:intergenic
TGATTCAGAGCAGAGGCTTG+AGG 0.604099 7:-641986 MsG0780035961.01.T01:intron
GCATATGTAAGCCTGGGGAA+AGG 0.604864 7:+642894 None:intergenic
AAGTCATGAGACTTGATCCT+CGG 0.605546 7:+649714 None:intergenic
GAACTATCACTCGAACACAT+AGG 0.612772 7:+649246 None:intergenic
AGACATGAACGACCTTGCAT+CGG 0.613161 7:-641821 MsG0780035961.01.T01:CDS
TCTTCAAATAAGAGAGACCA+TGG 0.616398 7:+649822 None:intergenic
TAAGGAAGCAGACAGTGCAA+AGG 0.617107 7:-642468 MsG0780035961.01.T01:CDS
GGTGTTGTTTGTCTTCAACA+AGG 0.618027 7:-649570 MsG0780035961.01.T01:CDS
ATCGATGTCTTGATCTAAGG+AGG 0.622065 7:-644827 MsG0780035961.01.T01:CDS
AAGGAATAAGACTTGCATTG+TGG 0.623695 7:-649551 MsG0780035961.01.T01:CDS
AGAAGTTGTTCATGAAATGA+GGG 0.624438 7:+649799 None:intergenic
GAAATGCAACCCAGCCACAA+AGG 0.625466 7:+646995 None:intergenic
AGTGGAATGATTCAGAGCAG+AGG 0.625796 7:-641993 MsG0780035961.01.T01:CDS
GTTGCATTTCATCGATCACA+TGG 0.629172 7:-646982 MsG0780035961.01.T01:CDS
GGCAGTATCATCATCATGTG+AGG 0.636048 7:+646705 None:intergenic
GTGTTCGAGTGATAGTTCAA+AGG 0.638863 7:-649241 MsG0780035961.01.T01:CDS
TTAGATGTGCATACAAACCA+TGG 0.650318 7:-649839 MsG0780035961.01.T01:CDS
AGATATCTAAAAGATATACA+TGG 0.655456 7:-644750 MsG0780035961.01.T01:CDS
TGATCCTCGGTCTACACATG+AGG 0.661009 7:+649727 None:intergenic
TTATGTCATGGTTTACAATG+GGG 0.661648 7:-641785 MsG0780035961.01.T01:CDS
GATCAAATCTGGTATCTGGA+CGG 0.664712 7:+642844 None:intergenic
TATGGATCCTGCAACTACAG+AGG 0.666062 7:-642286 MsG0780035961.01.T01:CDS
GTATCATTGGAGTACGAGTG+AGG 0.666965 7:+649756 None:intergenic
TGTGCGGCTGGAAATTCATG+AGG 0.670684 7:+646901 None:intergenic
CTTTATGTCAGATTGGTGGG+GGG 0.671478 7:-641672 MsG0780035961.01.T01:intron
CTCTCCTCATGTGTAGACCG+AGG 0.678527 7:-649731 MsG0780035961.01.T01:CDS
CTTCAGCATATGTAAGCCTG+GGG 0.689625 7:+642889 None:intergenic
GCATTTCATCGATCACATGG+TGG 0.705121 7:-646979 MsG0780035961.01.T01:CDS
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CRISPR-GE

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AGAAGTTGTTCATGAAATGA+GGG + Chr7:641641-641660 None:intergenic 30.0%
AGAGACAACATATCTTCTAA+AGG + Chr7:647921-647940 None:intergenic 30.0%
AGCAATGAATAGATATGGTT+CGG - Chr7:648569-648588 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
AGGAATGACATTGAATTCAT+GGG + Chr7:641922-641941 None:intergenic 30.0%
AGTACTCAAATTCAGTTCTT+AGG - Chr7:648932-648951 MsG0780035961.01.T01:CDS 30.0%
ATAAGGATGGAATTTGTCAT+TGG - Chr7:642228-642247 MsG0780035961.01.T01:CDS 30.0%
ATACACACATAAGTATCATC+AGG - Chr7:643119-643138 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
ATACTTTATGTCAGATTGGT+GGG - Chr7:649762-649781 MsG0780035961.01.T01:CDS 30.0%
ATAGCCAAAGATATAACTCT+TGG - Chr7:642147-642166 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
ATGGCTTACCAATTGAATAA+AGG - Chr7:643499-643518 MsG0780035961.01.T01:CDS 30.0%
ATTGATGCTCAAAATTTCCA+GGG - Chr7:643698-643717 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
CAACTACAGAGGATTTATTA+AGG - Chr7:649162-649181 MsG0780035961.01.T01:CDS 30.0%
CAATAGACCTGTATTCTTTA+TGG - Chr7:648002-648021 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
CAATATCCCATAAAGAATAC+AGG + Chr7:648012-648031 None:intergenic 30.0%
CAGAGAATCATCAAAACTTA+AGG + Chr7:648090-648109 None:intergenic 30.0%
CTACCATTAAAAACAAACGA+TGG - Chr7:643528-643547 MsG0780035961.01.T01:CDS 30.0%
CTCAAAAATTGTATTGGAAG+AGG - Chr7:645348-645367 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
CTTACATCAATAATCACCAA+TGG - Chr7:643084-643103 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
CTTATGTCATGGTTTACAAT+GGG - Chr7:649651-649670 MsG0780035961.01.T01:CDS 30.0%
CTTGACTCAAAAGAATTCAA+TGG + Chr7:643624-643643 None:intergenic 30.0%
GAAAAACCATGACAAAATGA+TGG + Chr7:646043-646062 None:intergenic 30.0%
GAAGAAGAAGAAGAATATGT+CGG - Chr7:644298-644317 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
GAATCATTCCACTTAAACAT+TGG + Chr7:649437-649456 None:intergenic 30.0%
GAATCCAAAAAATGAAAGGA+AGG + Chr7:641834-641853 None:intergenic 30.0%
GAATTATCTTCCAACAATGT+CGG - Chr7:644407-644426 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
GACATTACAAACTTCAACAA+AGG + Chr7:646073-646092 None:intergenic 30.0%
GCAAATAAAATCAGATCACT+TGG + Chr7:649203-649222 None:intergenic 30.0%
GCATCTGTAAATAAAACTCT+AGG - Chr7:649236-649255 MsG0780035961.01.T01:CDS 30.0%
GCTATTTAAGCAAATGCTAA+TGG - Chr7:647537-647556 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
GTCTCAAAATAGCATAAAAC+TGG + Chr7:649051-649070 None:intergenic 30.0%
GTGTGAAATATAGAGGAAAA+TGG + Chr7:645512-645531 None:intergenic 30.0%
TAAAAATCAATCTGCCGATA+AGG + Chr7:641969-641988 None:intergenic 30.0%
TAAAATCACACTTAAGCATG+AGG + Chr7:646404-646423 None:intergenic 30.0%
TAAAGAATACAGGTCTATTG+TGG + Chr7:648002-648021 None:intergenic 30.0%
TAACATAAAATCCTCCTCAT+TGG - Chr7:645320-645339 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
TAATAACATGGACCTCAAAA+GGG + Chr7:644780-644799 None:intergenic 30.0%
TAATACCAAAAGCAGTCATT+TGG + Chr7:646470-646489 None:intergenic 30.0%
TATAAATGATGAAGAAGTGG+TGG - Chr7:648032-648051 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
TATACTTTATGTCAGATTGG+TGG - Chr7:649761-649780 MsG0780035961.01.T01:CDS 30.0%
TATTGATGCTCAAAATTTCC+AGG - Chr7:643697-643716 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
TGATGGAACTAAATAATCCT+GGG + Chr7:646870-646889 None:intergenic 30.0%
TGCAACGTTAGATTAAAAAC+TGG - Chr7:644108-644127 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
TGGAAGAAATAAAGGACAAT+GGG - Chr7:645264-645283 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
TTAATAACATGGACCTCAAA+AGG + Chr7:644781-644800 None:intergenic 30.0%
TTATGCCATGAATCAATCAA+TGG - Chr7:643480-643499 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
TTATGTCATGGTTTACAATG+GGG - Chr7:649652-649671 MsG0780035961.01.T01:CDS 30.0%
TTCAAAGGAACGATTGTATA+AGG - Chr7:642211-642230 MsG0780035961.01.T01:CDS 30.0%
TTCCGCTTTAGTATTAAGTA+TGG - Chr7:649133-649152 MsG0780035961.01.T01:CDS 30.0%
TTCTCCAAGAGTTATATCTT+TGG + Chr7:642154-642173 None:intergenic 30.0%
TTGATGGAACTAAATAATCC+TGG + Chr7:646871-646890 None:intergenic 30.0%
TTGTATCTTGGCTTATGTTA+TGG - Chr7:647643-647662 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
TTTAATCAAGTTTGACGATG+TGG - Chr7:646519-646538 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
TTTATTAAGTGAGGTGATGT+TGG - Chr7:649922-649941 MsG0780035961.01.T01:CDS 30.0%
TTTCTCTTATCATTCTCAAC+AGG + Chr7:643276-643295 None:intergenic 30.0%
! AAAGAAAGGCTTGTTTCAAT+TGG - Chr7:642674-642693 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
! ACATTTAGGGTTAAAACTGA+TGG - Chr7:648229-648248 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
! ATATAGATCTTTTGTGGATG+TGG - Chr7:648411-648430 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
! ATGTTGGCTGGAAAAATTTA+GGG - Chr7:649938-649957 MsG0780035961.01.T01:CDS 30.0%
! CATATCTAAAGGTATGTCTA+AGG + Chr7:642336-642355 None:intergenic 30.0%
! CATTTTGTCATGGTTTTTCA+TGG - Chr7:646044-646063 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
! GACACTTTTAACAAACATTG+TGG + Chr7:645651-645670 None:intergenic 30.0%
! GCAGGTTTTTCTTGAAATTA+AGG - Chr7:648503-648522 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
! GGCATTTATGAGATTTTGTA+TGG - Chr7:643720-643739 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
! GTTATTGATAGCATAATGTG+CGG + Chr7:644555-644574 None:intergenic 30.0%
! TAAGACTTTGTTTAGGAGTT+TGG + Chr7:645573-645592 None:intergenic 30.0%
! TAATGAAGAGTTGATCAGAA+AGG - Chr7:647941-647960 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
! TATTACATGTCTCCATGTTT+TGG + Chr7:644903-644922 None:intergenic 30.0%
! TATTACCAAATGACTGCTTT+TGG - Chr7:646462-646481 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
! TCTTTTTGTGAAAAGACACT+TGG - Chr7:642373-642392 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
! TGCAAACTCATGTAGTTTTT+GGG - Chr7:642900-642919 MsG0780035961.01.T01:CDS 30.0%
! TGTAAGGTATCCACATTTAA+GGG - Chr7:646115-646134 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
! TTAGAGTGTTTAACACTCTT+CGG - Chr7:643873-643892 MsG0780035961.01.T01:CDS 30.0%
! TTCCTCTTTAAGAGAATCTT+TGG + Chr7:644756-644775 None:intergenic 30.0%
! TTGCAAACTCATGTAGTTTT+TGG - Chr7:642899-642918 MsG0780035961.01.T01:CDS 30.0%
! TTGTAAGGTATCCACATTTA+AGG - Chr7:646114-646133 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
! TTTTCTTGAAATTAAGGGTG+TGG - Chr7:648509-648528 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
!! AAACCACAAAAGTACTATGA+AGG + Chr7:648654-648673 None:intergenic 30.0%
!! ACTAAAGAACTTGCTGTTAA+AGG - Chr7:642623-642642 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
!! ATTTCAAGGACTCATTTTTG+CGG - Chr7:644383-644402 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
!! CATAAAACTGGGTATTGATA+GGG + Chr7:649039-649058 None:intergenic 30.0%
!! CATTGAATTCTTTTGAGTCA+AGG - Chr7:643622-643641 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
!! GAGACATGTTTGTTATATTC+CGG - Chr7:649066-649085 MsG0780035961.01.T01:CDS 30.0%
!! GATCTGATTTTATTTGCAGT+TGG - Chr7:649206-649225 MsG0780035961.01.T01:CDS 30.0%
!! GTTTTAACCCTAAATGTCTA+AGG + Chr7:648226-648245 None:intergenic 30.0%
!! TTACTTTTCGCAGATGTTTT+CGG - Chr7:647829-647848 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
!! TTTTCCTCTTGAAATGGATT+TGG + Chr7:641810-641829 None:intergenic 30.0%
!!! AAAACAGTGTATTTTGGTGA+AGG + Chr7:644226-644245 None:intergenic 30.0%
!!! AGTAAACATCTTTTGAAGCT+GGG + Chr7:647168-647187 None:intergenic 30.0%
!!! CAGCAAGTTCTTTAGTTTTT+TGG + Chr7:642619-642638 None:intergenic 30.0%
!!! CATTTTTTCGGATCTTAGTT+TGG + Chr7:643943-643962 None:intergenic 30.0%
!!! CTAGTTTTAGTTCCAAAACA+TGG - Chr7:644888-644907 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
!!! CTTCAATTTCTGGTTTTGTA+AGG - Chr7:644930-644949 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
!!! GGTTTTGGAAAAAAAGAAGA+AGG - Chr7:645235-645254 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
!!! GTAGGGTTTGTTTTGATAAA+TGG - Chr7:645050-645069 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
!!! TAGTAAACATCTTTTGAAGC+TGG + Chr7:647169-647188 None:intergenic 30.0%
!!! TGTATTTTGGTGAAGGTTTA+AGG + Chr7:644219-644238 None:intergenic 30.0%
!!! TGTTTTAACCTGAATAATGC+CGG + Chr7:644513-644532 None:intergenic 30.0%
!!! TTGAAGTTGGTTTTTATTGC+AGG - Chr7:648485-648504 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
!!! TTGCTGTTTATGTTTTCTGA+GGG + Chr7:645925-645944 None:intergenic 30.0%
!!! TTTCTTGCTGTTTCAAGTTT+TGG - Chr7:646201-646220 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTTGATAAATGGGTTAGGA+GGG - Chr7:645060-645079 MsG0780035961.01.T01:intron 30.0%
AAAAAAGAAGAAGGAGAGAG+TGG - Chr7:645244-645263 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
AAACAAAGAACAAATCCCCA+AGG + Chr7:646336-646355 None:intergenic 35.0%
AAAGCAGATACCAACTTACA+TGG + Chr7:649304-649323 None:intergenic 35.0%
AACAGAGAATGCAAGATCAT+TGG + Chr7:641544-641563 None:intergenic 35.0%
AAGAAAAAAGGGTTAGGGTT+TGG - Chr7:644144-644163 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
AAGGAACGATTGTATAAGGA+TGG - Chr7:642215-642234 MsG0780035961.01.T01:CDS 35.0%
AAGGAATAAGACTTGCATTG+TGG - Chr7:641886-641905 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
AATAAATCCTCTGTAGTTGC+AGG + Chr7:649161-649180 None:intergenic 35.0%
AATATTGATCGTAGTGTGCA+GGG + Chr7:643243-643262 None:intergenic 35.0%
ACAGAGAATGCAAGATCATT+GGG + Chr7:641543-641562 None:intergenic 35.0%
ACATAAAATCCTCCTCATTG+GGG - Chr7:645322-645341 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
ACATTGAATTCATGGGTAGT+TGG + Chr7:641915-641934 None:intergenic 35.0%
ACTACGATCAATATTCAGAG+AGG - Chr7:643248-643267 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
AGACGATCAATGTTGGAAAA+TGG + Chr7:642521-642540 None:intergenic 35.0%
AGCAAAGATGAAGCAAATCT+AGG + Chr7:648798-648817 None:intergenic 35.0%
AGCATTTGCTTAAATAGCTG+AGG + Chr7:647535-647554 None:intergenic 35.0%
AGGCCGTATTAGAGTTTATT+TGG - Chr7:649256-649275 MsG0780035961.01.T01:CDS 35.0%
AGTCCTTGAAATCCATTCAA+GGG + Chr7:644375-644394 None:intergenic 35.0%
ATATCTAGTTGTGTGAACTC+AGG + Chr7:647882-647901 None:intergenic 35.0%
ATCCACAACAACATGAAAAC+CGG - Chr7:644638-644657 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
CAATTAAATTAAGGGACCAG+TGG - Chr7:648334-648353 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
CAATTAAGCCATGTTGAAGT+GGG - Chr7:648359-648378 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
CACAAGATTGAGAATAAACC+AGG + Chr7:645784-645803 None:intergenic 35.0%
CACACAACTAGATATGGAAA+TGG - Chr7:647887-647906 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
CAGAAGTTGTTCATGAAATG+AGG + Chr7:641642-641661 None:intergenic 35.0%
CATAACAAAATATTGCAGGG+AGG + Chr7:642955-642974 None:intergenic 35.0%
CATGTTAGAGTTTCCTTGTA+AGG + Chr7:643350-643369 None:intergenic 35.0%
CATTGAATTCATGGGTAGTT+GGG + Chr7:641914-641933 None:intergenic 35.0%
CTAAATACCTGGATTCTTGA+TGG + Chr7:646887-646906 None:intergenic 35.0%
CTGTATTGAATTGCCTTACA+AGG - Chr7:643334-643353 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
GAAATAAAGGACAATGGGAA+AGG - Chr7:645269-645288 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
GAGGAATGACATTGAATTCA+TGG + Chr7:641923-641942 None:intergenic 35.0%
GATCTCAAAGTGAAAACGTT+AGG - Chr7:641508-641527 MsG0780035961.01.T01:CDS 35.0%
GCATTTGCTTAAATAGCTGA+GGG + Chr7:647534-647553 None:intergenic 35.0%
GCTGAAGCAATGAATAGATA+TGG - Chr7:648564-648583 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
GCTTATGTCATGGTTTACAA+TGG - Chr7:649650-649669 MsG0780035961.01.T01:CDS 35.0%
GCTTGAAATCAGTTTGAAAG+TGG - Chr7:646174-646193 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
GGGGAACTCAAAAATTGTAT+TGG - Chr7:645342-645361 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
GTATATAGTTAGTGTGCCAT+TGG + Chr7:643103-643122 None:intergenic 35.0%
GTATCAGTCGCAAAATTGTA+AGG + Chr7:649732-649751 None:intergenic 35.0%
GTGGAAGAAATAAAGGACAA+TGG - Chr7:645263-645282 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
GTTCTACATTAATGCCATTG+AGG + Chr7:647198-647217 None:intergenic 35.0%
TACTGCATAATCGAAATCAC+TGG - Chr7:643208-643227 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
TACTTTATGTCAGATTGGTG+GGG - Chr7:649763-649782 MsG0780035961.01.T01:CDS 35.0%
TAGGGTTAAAACTGATGGAA+GGG - Chr7:648234-648253 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
TATAAAGATTGCGATGCAAC+TGG - Chr7:647778-647797 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
TATCTTGGCTTATGTTATGG+AGG - Chr7:647646-647665 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
TCAATTAAGCCATGTTGAAG+TGG - Chr7:648358-648377 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
TCATGTGAGGTAACTAAGAA+CGG + Chr7:644722-644741 None:intergenic 35.0%
TCCAACATTGATCGTCTTAT+TGG - Chr7:642524-642543 MsG0780035961.01.T01:CDS 35.0%
TCCAATAAGACGATCAATGT+TGG + Chr7:642528-642547 None:intergenic 35.0%
TCTAGATCAAATCTGGTATC+TGG + Chr7:648600-648619 None:intergenic 35.0%
TCTTCAAATAAGAGAGACCA+TGG + Chr7:641618-641637 None:intergenic 35.0%
TGAGTTCACACAACTAGATA+TGG - Chr7:647881-647900 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
TGCCAAAGATTCTCTTAAAG+AGG - Chr7:644751-644770 MsG0780035961.01.T01:CDS 35.0%
TGGCTATAAATCTCCCATAA+AGG + Chr7:642134-642153 None:intergenic 35.0%
TGGTCTACCTTAGACATTTA+GGG - Chr7:648216-648235 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
TGTATTCATTAAGTGGTGAG+AGG - Chr7:641757-641776 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
TGTGTGGATCTTGACAATAT+TGG + Chr7:646839-646858 None:intergenic 35.0%
TGTTATCAAGTAGCAAGGTA+TGG - Chr7:647577-647596 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
TGTTCCAAATCCATTTCAAG+AGG - Chr7:641803-641822 MsG0780035961.01.T01:CDS 35.0%
TTAGATGTGCATACAAACCA+TGG - Chr7:641598-641617 MsG0780035961.01.T01:CDS 35.0%
TTAGGGTTAAAACTGATGGA+AGG - Chr7:648233-648252 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
TTATTAAGGCGATGCTATGT+GGG - Chr7:649176-649195 MsG0780035961.01.T01:CDS 35.0%
TTGATGCTCAAAATTTCCAG+GGG - Chr7:643699-643718 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
TTGGTCTACCTTAGACATTT+AGG - Chr7:648215-648234 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
TTTATTAAGGCGATGCTATG+TGG - Chr7:649175-649194 MsG0780035961.01.T01:CDS 35.0%
TTTCTTTGGTTGCATGAGTT+AGG - Chr7:646255-646274 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
! AATCCCTTGAATGGATTTCA+AGG - Chr7:644369-644388 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
! ACACGTGATAATGATAATGC+GGG - Chr7:643987-644006 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
! ACTTTGTTTAGGAGTTTGGA+GGG + Chr7:645569-645588 None:intergenic 35.0%
! AGGTATCTGACATTTTCTCA+GGG - Chr7:648842-648861 MsG0780035961.01.T01:CDS 35.0%
! ATTGTATTGGAAGAGGGTTT+TGG - Chr7:645355-645374 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
! CTAGTTGACCATCTTCTTTT+TGG + Chr7:642577-642596 None:intergenic 35.0%
! GAAGGTTTTTCCTCTTGAAA+TGG + Chr7:641816-641835 None:intergenic 35.0%
! GACACGTGATAATGATAATG+CGG - Chr7:643986-644005 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
! GATGTTGGCTGGAAAAATTT+AGG - Chr7:649937-649956 MsG0780035961.01.T01:CDS 35.0%
! GCAAACTCATGTAGTTTTTG+GGG - Chr7:642901-642920 MsG0780035961.01.T01:CDS 35.0%
! GTAAGACCATCATTTTGTCA+TGG - Chr7:646034-646053 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
! GTAAGCCATTGATTGATTCA+TGG + Chr7:643488-643507 None:intergenic 35.0%
! GTAAGGTATCCACATTTAAG+GGG - Chr7:646116-646135 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
! TACTTTTCGCAGATGTTTTC+GGG - Chr7:647830-647849 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
! TATGCGTTATGTTCTGAACT+TGG - Chr7:643171-643190 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
! TGGACTAAACTCTTTGTTGT+TGG - Chr7:642494-642513 MsG0780035961.01.T01:CDS 35.0%
! TGTTGAATTTAGGGGTTGAT+AGG - Chr7:647133-647152 MsG0780035961.01.T01:CDS 35.0%
! TTAAAGAGGAAACCCTTTTG+AGG - Chr7:644765-644784 MsG0780035961.01.T01:CDS 35.0%
! TTTACCTTTTCTCAAGATCG+CGG - Chr7:648993-649012 MsG0780035961.01.T01:CDS 35.0%
! TTTAGTTCCATCAAGAATCC+AGG - Chr7:646877-646896 MsG0780035961.01.T01:CDS 35.0%
! TTTTGTGAAAAGACACTTGG+TGG - Chr7:642376-642395 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
!! ATGGTCTCTAAGATTGAGAA+AGG + Chr7:644489-644508 None:intergenic 35.0%
!! GCATAAAACTGGGTATTGAT+AGG + Chr7:649040-649059 None:intergenic 35.0%
!! GGACTAAACTCTTTGTTGTT+GGG - Chr7:642495-642514 MsG0780035961.01.T01:CDS 35.0%
!! GTAACACTAGCTTTAAGTCA+TGG + Chr7:645832-645851 None:intergenic 35.0%
!! TTTGATAAATGGGTTAGGAG+GGG - Chr7:645061-645080 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
!!! AGATATACATGGTTTTGTGG+AGG - Chr7:646698-646717 MsG0780035961.01.T01:CDS 35.0%
!!! CAACTGGCCATTTTTGTTTT+TGG - Chr7:647794-647813 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
!!! CTTGCTGTTTATGTTTTCTG+AGG + Chr7:645926-645945 None:intergenic 35.0%
!!! GAAGCAATGTTTTAAGGCAT+AGG - Chr7:643447-643466 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
!!! GTTTTGATAAATGGGTTAGG+AGG - Chr7:645059-645078 MsG0780035961.01.T01:intron 35.0%
AAACTCGCAAACAAAGCCTA+AGG + Chr7:645196-645215 None:intergenic 40.0%
AAATATTGCAGGGAGGAAAG+TGG + Chr7:642948-642967 None:intergenic 40.0%
AAATCAATCTGCCGATAAGG+TGG + Chr7:641966-641985 None:intergenic 40.0%
AACTCGCAAACAAAGCCTAA+GGG + Chr7:645195-645214 None:intergenic 40.0%
AAGCAAATGCTAATGGTAGC+TGG - Chr7:647544-647563 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
AAGTCATGAGACTTGATCCT+CGG + Chr7:641726-641745 None:intergenic 40.0%
AATATTGCAGGGAGGAAAGT+GGG + Chr7:642947-642966 None:intergenic 40.0%
AATTACCAAATCCTTTCCCC+AGG - Chr7:648532-648551 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
ACATGGCTTAATTGATCCAC+TGG + Chr7:648353-648372 None:intergenic 40.0%
ACGGAAGAAGTTGAAGAAAG+GGG - Chr7:648055-648074 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
ACTTAAGCATGAGGTGTACT+AGG + Chr7:646395-646414 None:intergenic 40.0%
ACTTTATGTCAGATTGGTGG+GGG - Chr7:649764-649783 MsG0780035961.01.T01:CDS 40.0%
AGACTTGACAACACCTTGAA+TGG + Chr7:644603-644622 None:intergenic 40.0%
AGGATGGAATTTGTCATTGG+TGG - Chr7:642231-642250 MsG0780035961.01.T01:CDS 40.0%
ATAAAGGACAATGGGAAAGG+AGG - Chr7:645272-645291 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
ATAAGGTGGCATAGACTCAA+TGG + Chr7:641952-641971 None:intergenic 40.0%
ATAGACTCAATGGGACTTTG+AGG + Chr7:641942-641961 None:intergenic 40.0%
ATCGATGTCTTGATCTAAGG+AGG - Chr7:646610-646629 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
CAAAATCTCATAAATGCCCC+TGG + Chr7:643718-643737 None:intergenic 40.0%
CATAAAATCCTCCTCATTGG+GGG - Chr7:645323-645342 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
CATGAGGAGAGATGTATCAT+TGG + Chr7:641697-641716 None:intergenic 40.0%
CATTAATGCCATTGAGGTGT+AGG + Chr7:647192-647211 None:intergenic 40.0%
CCACTTAAACATTGGAGAGT+CGG + Chr7:649429-649448 None:intergenic 40.0%
CGAGTTTAACTCAGTTGAGT+AGG - Chr7:644073-644092 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
CTAAGGTAGACCAACATTGT+AGG + Chr7:648209-648228 None:intergenic 40.0%
CTCAATCTTAGAGACCATAC+CGG - Chr7:644491-644510 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
GAACTATCACTCGAACACAT+AGG + Chr7:642194-642213 None:intergenic 40.0%
GAAGGGACCAAAACCTATAA+CGG - Chr7:648251-648270 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
GAATATTGATCGTAGTGTGC+AGG + Chr7:643244-643263 None:intergenic 40.0%
GACGGAAGAAGTTGAAGAAA+GGG - Chr7:648054-648073 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
GAGTATGTTGTTGCCATTCA+AGG - Chr7:644587-644606 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
GAGTCCTTGAAATCCATTCA+AGG + Chr7:644376-644395 None:intergenic 40.0%
GATCAAATCTGGTATCTGGA+CGG + Chr7:648596-648615 None:intergenic 40.0%
GATCAATTGCTACGATCTCA+TGG - Chr7:642408-642427 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
GATGATGCTTTGTGCACATA+TGG + Chr7:647240-647259 None:intergenic 40.0%
GGAATCAGAGAAAACCTTGA+AGG + Chr7:648872-648891 None:intergenic 40.0%
GGAGAGAGTGGAAGAAATAA+AGG - Chr7:645256-645275 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
GGTTATCATCTTCGACATCT+TGG - Chr7:642065-642084 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
GTCACATGAATTATGAAGCG+AGG - Chr7:647484-647503 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
GTCTCAAAGAATCCCTTGAA+TGG - Chr7:644360-644379 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
GTGTTCGAGTGATAGTTCAA+AGG - Chr7:642196-642215 MsG0780035961.01.T01:CDS 40.0%
GTTGCATTTCATCGATCACA+TGG - Chr7:644455-644474 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
GTTTACTACCTACACCTCAA+TGG - Chr7:647181-647200 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
GTTTGATCGACCATGTAAGT+TGG - Chr7:649291-649310 MsG0780035961.01.T01:CDS 40.0%
TAAACGCGGCATACAACAAA+AGG - Chr7:649802-649821 MsG0780035961.01.T01:CDS 40.0%
TAAAGGACAATGGGAAAGGA+GGG - Chr7:645273-645292 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
TAACCTGAATAATGCCGGTA+TGG + Chr7:644508-644527 None:intergenic 40.0%
TAAGGTGGCATAGACTCAAT+GGG + Chr7:641951-641970 None:intergenic 40.0%
TCGTTCATGTCTTCAGGATT+TGG + Chr7:649608-649627 None:intergenic 40.0%
TCTTAATTATGGGCTTGTGC+AGG - Chr7:649559-649578 MsG0780035961.01.T01:CDS 40.0%
TGTAAGGCTCGCAAGTTAAA+GGG + Chr7:649716-649735 None:intergenic 40.0%
TGTGGATACCTTACAAAGCA+AGG + Chr7:646110-646129 None:intergenic 40.0%
TTAAATAGCTGAGGGCTTTG+TGG + Chr7:647526-647545 None:intergenic 40.0%
TTGAGTCTATGCCACCTTAT+CGG - Chr7:641952-641971 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
TTGTAAGGCTCGCAAGTTAA+AGG + Chr7:649717-649736 None:intergenic 40.0%
TTTAAGTGAACTCGGAGTGA+AGG - Chr7:642466-642485 MsG0780035961.01.T01:CDS 40.0%
! AACTGTTTCTCCGACATTGT+TGG + Chr7:644420-644439 None:intergenic 40.0%
! AAGTCTGTTGGTTATTCTGG+TGG - Chr7:646226-646245 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
! AAGTTGCTCTATGACGCTTT+TGG - Chr7:646428-646447 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
! AATGATGAAGAAGTGGTGGA+CGG - Chr7:648036-648055 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
! AGGCCAGACATTCAATTTTG+TGG - Chr7:649399-649418 MsG0780035961.01.T01:CDS 40.0%
! AGTCTGTTGGTTATTCTGGT+GGG - Chr7:646227-646246 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
! ATTGATCGTCTTATTGGAGC+TGG - Chr7:642530-642549 MsG0780035961.01.T01:CDS 40.0%
! CAAGGTTTTCTCTGATTCCT+TGG - Chr7:648873-648892 MsG0780035961.01.T01:CDS 40.0%
! CAGGTATCTGACATTTTCTC+AGG - Chr7:648841-648860 MsG0780035961.01.T01:CDS 40.0%
! CATTTTGCTGCAGCATAATG+TGG - Chr7:646650-646669 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
! CCTCCTTCATAGTACTTTTG+TGG - Chr7:648648-648667 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
! CTTTGTTTAGGAGTTTGGAG+GGG + Chr7:645568-645587 None:intergenic 40.0%
! GAAAGGCTTGTTTCAATTGG+AGG - Chr7:642677-642696 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
! GACTTTGTTTAGGAGTTTGG+AGG + Chr7:645570-645589 None:intergenic 40.0%
! GCACTCTTTTCTCGAATAAG+TGG - Chr7:642044-642063 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
! GCTTTAAGTCATGGCAGTAA+AGG + Chr7:645823-645842 None:intergenic 40.0%
! GTGAAGTCTGTTGGTTATTC+TGG - Chr7:646223-646242 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
! TCAGAGGGTGTGAAATATAG+AGG + Chr7:645519-645538 None:intergenic 40.0%
! TTACATTAGTCTCGTACCCT+TGG - Chr7:645870-645889 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
!! AGAACTTGCTGTTAAAGGAC+CGG - Chr7:642628-642647 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
!! AGACACTTGGTGGTGTTTAA+TGG - Chr7:642386-642405 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
!! ATTTTAGTCTAACGTAGCCC+TGG - Chr7:645763-645782 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
!! CAAAAGGTTTTCGAGACTGT+AGG - Chr7:649818-649837 MsG0780035961.01.T01:CDS 40.0%
!! CAAGTTTTGGTGAAGTCTGT+TGG - Chr7:646214-646233 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
!! CCACAAAAGTACTATGAAGG+AGG + Chr7:648651-648670 None:intergenic 40.0%
!! GGTATCGATGTCTTGATCTA+AGG - Chr7:646607-646626 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
!! GGTGTTGTTTGTCTTCAACA+AGG - Chr7:641867-641886 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
!!! ATTTTTGAGTTCCCCCAATG+AGG + Chr7:645337-645356 None:intergenic 40.0%
!!! GCAATGTTTTAAGGCATAGG+AGG - Chr7:643450-643469 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
!!! TATTGGAAGAGGGTTTTGGA+GGG - Chr7:645359-645378 MsG0780035961.01.T01:intron 40.0%
AACACCTTCCCACTTCAACA+TGG + Chr7:648370-648389 None:intergenic 45.0%
AACTCGGAGTGAAGGAATCA+TGG - Chr7:642474-642493 MsG0780035961.01.T01:CDS 45.0%
AAGAGTTATTCTCACACCGC+AGG - Chr7:644187-644206 MsG0780035961.01.T01:intron 45.0%
AAGCATGAGGTGTACTAGGA+TGG + Chr7:646391-646410 None:intergenic 45.0%
AATAACTCCACCACACTCCA+AGG + Chr7:648893-648912 None:intergenic 45.0%
ACAAAGCCTAAGGGTCTGTT+TGG + Chr7:645186-645205 None:intergenic 45.0%
ACAGTATGCTGATAGCAGAC+CGG + Chr7:645993-646012 None:intergenic 45.0%
AGACATGAACGACCTTGCAT+CGG - Chr7:649616-649635 MsG0780035961.01.T01:CDS 45.0%
AGACCATACCGGCATTATTC+AGG - Chr7:644502-644521 MsG0780035961.01.T01:intron 45.0%
AGAGTTATTCTCACACCGCA+GGG - Chr7:644188-644207 MsG0780035961.01.T01:intron 45.0%
AGGCATGTCCTTGCTTTGTA+AGG - Chr7:646099-646118 MsG0780035961.01.T01:intron 45.0%
AGGTAGACCAACATTGTAGG+TGG + Chr7:648206-648225 None:intergenic 45.0%
AGTGGAATGATTCAGAGCAG+AGG - Chr7:649444-649463 MsG0780035961.01.T01:CDS 45.0%
ATCCACACAAGAAAGTTCCC+AGG - Chr7:646850-646869 MsG0780035961.01.T01:CDS 45.0%
ATCCTGGGAACTTTCTTGTG+TGG + Chr7:646855-646874 None:intergenic 45.0%
CAAAGCCTAAGGGTCTGTTT+GGG + Chr7:645185-645204 None:intergenic 45.0%
CCGACTCTCCAATGTTTAAG+TGG - Chr7:649426-649445 MsG0780035961.01.T01:CDS 45.0%
CTTCAGCATATGTAAGCCTG+GGG + Chr7:648551-648570 None:intergenic 45.0%
CTTTATGTCAGATTGGTGGG+GGG - Chr7:649765-649784 MsG0780035961.01.T01:CDS 45.0%
GCACATCGTACTTTGGTTGT+TGG - Chr7:646762-646781 MsG0780035961.01.T01:CDS 45.0%
GCATTTCATCGATCACATGG+TGG - Chr7:644458-644477 MsG0780035961.01.T01:intron 45.0%
GCTTCAGCATATGTAAGCCT+GGG + Chr7:648552-648571 None:intergenic 45.0%
GGACGGAAGAAGTTGAAGAA+AGG - Chr7:648053-648072 MsG0780035961.01.T01:intron 45.0%
GGCAGTATCATCATCATGTG+AGG + Chr7:644735-644754 None:intergenic 45.0%
GTATCATTGGAGTACGAGTG+AGG + Chr7:641684-641703 None:intergenic 45.0%
GTCTTCTGCACATCGTACTT+TGG - Chr7:646755-646774 MsG0780035961.01.T01:CDS 45.0%
TAAGCCATGTTGAAGTGGGA+AGG - Chr7:648363-648382 MsG0780035961.01.T01:intron 45.0%
TAAGGAAGCAGACAGTGCAA+AGG - Chr7:648969-648988 MsG0780035961.01.T01:CDS 45.0%
TATGGATCCTGCAACTACAG+AGG - Chr7:649151-649170 MsG0780035961.01.T01:CDS 45.0%
TCACAGCTTCCCCTTAAATG+TGG + Chr7:646128-646147 None:intergenic 45.0%
TGCTTCAGCATATGTAAGCC+TGG + Chr7:648553-648572 None:intergenic 45.0%
TGCTTTGTGTTGTGTGCCTT+GGG - Chr7:646317-646336 MsG0780035961.01.T01:intron 45.0%
TGGGTTTGACCATGTTAGAG+AGG - Chr7:642001-642020 MsG0780035961.01.T01:CDS 45.0%
TGTACTAGGATGGAGCAAAG+AGG + Chr7:646381-646400 None:intergenic 45.0%
TGTCATGGTTTACAATGGGG+TGG - Chr7:649655-649674 MsG0780035961.01.T01:CDS 45.0%
TTAAGTGAGGTGATGTTGGC+TGG - Chr7:649926-649945 MsG0780035961.01.T01:CDS 45.0%
TTCTCCGCGATCTTGAGAAA+AGG + Chr7:649000-649019 None:intergenic 45.0%
TTCTCTGATTCCTTGGAGTG+TGG - Chr7:648880-648899 MsG0780035961.01.T01:CDS 45.0%
TTTCTCAAGATCGCGGAGAA+TGG - Chr7:649000-649019 MsG0780035961.01.T01:CDS 45.0%
TTTCTCAGGGTCTTCCTTCA+AGG - Chr7:648855-648874 MsG0780035961.01.T01:CDS 45.0%
TTTGCGAGTTTAGAGGCGAA+GGG - Chr7:645205-645224 MsG0780035961.01.T01:intron 45.0%
! AATTTGAAGTTTGGGGGGCA+AGG - Chr7:643661-643680 MsG0780035961.01.T01:intron 45.0%
! AGGTTTAAGGTAGAACCCTG+CGG + Chr7:644206-644225 None:intergenic 45.0%
! TTCGACATCTTGGTGTGCAA+CGG - Chr7:642075-642094 MsG0780035961.01.T01:intron 45.0%
! TTGATAGCATAATGTGCGGC+TGG + Chr7:644551-644570 None:intergenic 45.0%
!! AGCCGGTTTTCATGTTGTTG+TGG + Chr7:644643-644662 None:intergenic 45.0%
!! ATAAATGGGTTAGGAGGGGA+GGG - Chr7:645065-645084 MsG0780035961.01.T01:intron 45.0%
!! GGCTTTGTTTGCGAGTTTAG+AGG - Chr7:645198-645217 MsG0780035961.01.T01:intron 45.0%
!! GTATTGGAAGAGGGTTTTGG+AGG - Chr7:645358-645377 MsG0780035961.01.T01:intron 45.0%
!! TCAGGATTTGGTGCAGTGAA+AGG + Chr7:649596-649615 None:intergenic 45.0%
!! TCGTGCATTGGCTTATGTCA+TGG - Chr7:649640-649659 MsG0780035961.01.T01:CDS 45.0%
!! TTGTGGAGGTACTATCCAGT+AGG - Chr7:646712-646731 MsG0780035961.01.T01:CDS 45.0%
!!! TATTTTAAATATCATTTTTT+CGG + Chr7:643955-643974 None:intergenic 5.0%
!!! TTTATTTTGTTTTATTTTAT+TGG - Chr7:647358-647377 MsG0780035961.01.T01:intron 5.0%
AAACAGTTCGCCTTTGTGGC+TGG - Chr7:644432-644451 MsG0780035961.01.T01:intron 50.0%
AACAGTTCGCCTTTGTGGCT+GGG - Chr7:644433-644452 MsG0780035961.01.T01:intron 50.0%
AATGGGAAAGGAGGGCTTTG+GGG - Chr7:645281-645300 MsG0780035961.01.T01:intron 50.0%
ACAATGGGAAAGGAGGGCTT+TGG - Chr7:645279-645298 MsG0780035961.01.T01:intron 50.0%
CAATGGGAAAGGAGGGCTTT+GGG - Chr7:645280-645299 MsG0780035961.01.T01:intron 50.0%
CATCGAGGTTGCTGCAAATG+AGG - Chr7:644664-644683 MsG0780035961.01.T01:intron 50.0%
CATGGTTTACAATGGGGTGG+AGG - Chr7:649658-649677 MsG0780035961.01.T01:CDS 50.0%
CGAGACTGTAGGCATCTCAA+TGG - Chr7:649829-649848 MsG0780035961.01.T01:CDS 50.0%
GAAATGCAACCCAGCCACAA+AGG + Chr7:644445-644464 None:intergenic 50.0%
GAGTTAGGTGCGAAGGAGTT+AGG - Chr7:646270-646289 MsG0780035961.01.T01:intron 50.0%
GCAAGGTCGTTCATGTCTTC+AGG + Chr7:649614-649633 None:intergenic 50.0%
GCATATGTAAGCCTGGGGAA+AGG + Chr7:648546-648565 None:intergenic 50.0%
GCTTTGTGTTGTGTGCCTTG+GGG - Chr7:646318-646337 MsG0780035961.01.T01:intron 50.0%
GGAGAAACAGTTCGCCTTTG+TGG - Chr7:644428-644447 MsG0780035961.01.T01:intron 50.0%
GTAAGCCTGGGGAAAGGATT+TGG + Chr7:648540-648559 None:intergenic 50.0%
GTGCTTCGCTGATACCTCTA+TGG + Chr7:644971-644990 None:intergenic 50.0%
GTGCTTTGTGTTGTGTGCCT+TGG - Chr7:646316-646335 MsG0780035961.01.T01:intron 50.0%
GTTGCATGAGTTAGGTGCGA+AGG - Chr7:646263-646282 MsG0780035961.01.T01:intron 50.0%
GTTTAGGAGTTTGGAGGGGA+GGG + Chr7:645564-645583 None:intergenic 50.0%
GTTTGCGAGTTTAGAGGCGA+AGG - Chr7:645204-645223 MsG0780035961.01.T01:intron 50.0%
TCTGATTCCTTGGAGTGTGG+TGG - Chr7:648883-648902 MsG0780035961.01.T01:CDS 50.0%
TGAGGATTGTTGGATCGTGC+AGG + Chr7:648127-648146 None:intergenic 50.0%
TGATCCTCGGTCTACACATG+AGG + Chr7:641713-641732 None:intergenic 50.0%
TGATTCAGAGCAGAGGCTTG+AGG - Chr7:649451-649470 MsG0780035961.01.T01:CDS 50.0%
TGTAGGCATCTCAATGGAGC+AGG - Chr7:649835-649854 MsG0780035961.01.T01:CDS 50.0%
TGTGCGGCTGGAAATTCATG+AGG + Chr7:644539-644558 None:intergenic 50.0%
TGTTTAGGAGTTTGGAGGGG+AGG + Chr7:645565-645584 None:intergenic 50.0%
TTTAGGAGTTTGGAGGGGAG+GGG + Chr7:645563-645582 None:intergenic 50.0%
! AAGTTCACCGACTGATGCCA+CGG - Chr7:645955-645974 MsG0780035961.01.T01:intron 50.0%
! CATGAAAACCGGCTTCATCG+AGG - Chr7:644649-644668 MsG0780035961.01.T01:intron 50.0%
! CTGTTGGTTATTCTGGTGGG+AGG - Chr7:646230-646249 MsG0780035961.01.T01:intron 50.0%
! TCTGGTGGGAGGCTTTTCTT+TGG - Chr7:646241-646260 MsG0780035961.01.T01:intron 50.0%
! TGGTGGACCACCTACAATGT+TGG - Chr7:648196-648215 MsG0780035961.01.T01:intron 50.0%
! TTTGAGTTCCCCCAATGAGG+AGG + Chr7:645334-645353 None:intergenic 50.0%
!! GATAAATGGGTTAGGAGGGG+AGG - Chr7:645064-645083 MsG0780035961.01.T01:intron 50.0%
AGCCTAAGGGTCTGTTTGGG+AGG + Chr7:645182-645201 None:intergenic 55.0%
CTCTCCTCATGTGTAGACCG+AGG - Chr7:641706-641725 MsG0780035961.01.T01:intron 55.0%
GATGGAGCAAAGAGGCAAGC+TGG + Chr7:646373-646392 None:intergenic 55.0%
GCCTAAGGGTCTGTTTGGGA+GGG + Chr7:645181-645200 None:intergenic 55.0%
GGCTCGCAAGTTAAAGGGAG+AGG + Chr7:649711-649730 None:intergenic 55.0%
TCCCTCCCAAACAGACCCTT+AGG - Chr7:645177-645196 MsG0780035961.01.T01:intron 55.0%
TGCAGCAACCTCGATGAAGC+CGG + Chr7:644660-644679 None:intergenic 55.0%
TTAGAGGCGAAGGGAGGAGA+GGG - Chr7:645214-645233 MsG0780035961.01.T01:intron 55.0%
TTTAGAGGCGAAGGGAGGAG+AGG - Chr7:645213-645232 MsG0780035961.01.T01:intron 55.0%
! AGTTCACCGACTGATGCCAC+GGG - Chr7:645956-645975 MsG0780035961.01.T01:intron 55.0%
! ATGGGAAAGGAGGGCTTTGG+GGG - Chr7:645282-645301 MsG0780035961.01.T01:intron 55.0%
! TAGCTGAGGGCTTTGTGGCA+AGG + Chr7:647521-647540 None:intergenic 55.0%
!! GGGATTCTTTGAGACGCCGA+AGG + Chr7:644355-644374 None:intergenic 55.0%
AGGGGAAGGGAGGGATTCAG+AGG + Chr7:645535-645554 None:intergenic 60.0%
CCAATGCACGAGCCGATGCA+AGG + Chr7:649631-649650 None:intergenic 60.0%
GCGAGTTTAGAGGCGAAGGG+AGG - Chr7:645208-645227 MsG0780035961.01.T01:intron 60.0%
GGGGAAGGGAGGGATTCAGA+GGG + Chr7:645534-645553 None:intergenic 60.0%
! GCGAAGGGAGGAGAGGGTTT+TGG - Chr7:645220-645239 MsG0780035961.01.T01:intron 60.0%
!! CCTTGCATCGGCTCGTGCAT+TGG - Chr7:649628-649647 MsG0780035961.01.T01:CDS 60.0%
!! TGGGAAAGGAGGGCTTTGGG+GGG - Chr7:645283-645302 MsG0780035961.01.T01:intron 60.0%
ACCGACTGATGCCACGGGTC+TGG - Chr7:645961-645980 MsG0780035961.01.T01:intron 65.0%
AGGAGTTTGGAGGGGAGGGG+AGG + Chr7:645560-645579 None:intergenic 65.0%
CCCAGACCCGTGGCATCAGT+CGG + Chr7:645965-645984 None:intergenic 65.0%
CCGACTGATGCCACGGGTCT+GGG - Chr7:645962-645981 MsG0780035961.01.T01:intron 65.0%
GAGTTTGGAGGGGAGGGGAG+GGG + Chr7:645558-645577 None:intergenic 65.0%
GGAGTTTGGAGGGGAGGGGA+GGG + Chr7:645559-645578 None:intergenic 65.0%
ACCGGAACAGCCCAGACCCG+TGG + Chr7:645975-645994 None:intergenic 70.0%
GCCACGGGTCTGGGCTGTTC+CGG - Chr7:645971-645990 MsG0780035961.01.T01:intron 70.0%
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GGGAGGGGAGGGGAGGGGAA+GGG + Chr7:645548-645567 None:intergenic 75.0%
GGGGAGGGGAGGGGAAGGGA+GGG + Chr7:645544-645563 None:intergenic 75.0%
TGGAGGGGAGGGGAGGGGAG+GGG + Chr7:645553-645572 None:intergenic 75.0%
! GGGGAGGGGAGGGGAGGGGA+AGG + Chr7:645549-645568 None:intergenic 80.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 641501 649958 641501 ID=MsG0780035961.01;Name=MsG0780035961.01
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Protein sequence

>MsG0780035961.01.T01

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