AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780037281.01

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MsG0780037281.01.T01 AT1G09970 33.180 217 142 1 136 349 190 406 8.73e-20 95.1
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MsG0780037281.01.T01 AT1G76370 28.571 336 183 8 440 732 39 360 1.30e-30 124
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MsG0780037281.01.T01 AT5G16900 25.786 477 262 10 286 722 419 843 1.59e-30 129
MsG0780037281.01.T01 AT1G69990 25.523 478 279 12 194 670 70 471 1.82e-30 127
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MsG0780037281.01.T01 AT3G47090 33.484 221 141 5 111 326 404 623 5.73e-17 86.3
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MsG0780037281.01.T01 AT3G47090 26.909 275 165 5 111 349 132 406 1.81e-12 71.6
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MsG0780037281.01.T01 AT5G65240 27.513 378 233 10 267 641 98 437 1.66e-26 115
MsG0780037281.01.T01 AT3G21630 31.225 253 151 8 393 641 234 467 1.67e-26 115
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MsG0780037281.01.T01 AT2G17220 35.676 185 101 4 465 640 69 244 2.13e-26 112
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MsG0780037281.01.T01 AT1G63430 24.366 513 297 14 129 634 81 509 8.19e-25 110
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MsG0780037281.01.T01 AT1G74190 26.444 329 152 8 104 349 234 555 3.71e-13 73.9
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MsG0780037281.01.T01 AT5G59650 28.530 347 201 9 294 637 424 726 1.33e-24 110
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MsG0780037281.01.T01 AT1G56130 26.016 369 201 7 43 349 23 381 8.62e-24 108
MsG0780037281.01.T01 AT1G56130 32.500 200 108 5 451 642 665 845 2.88e-22 103
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MsG0780037281.01.T01 AT1G53430 33.480 227 129 4 146 351 62 287 4.01e-21 99.4
MsG0780037281.01.T01 AT1G53430 30.693 202 119 3 143 323 106 307 1.18e-17 88.2
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MsG0780037281.01.T01 AT5G54590 25.939 293 173 8 469 728 102 383 1.78e-22 101
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MsG0780037281.01.T01 AT1G11280 31.250 192 124 2 454 645 477 660 3.77e-22 102
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MsG0780037281.01.T01 AT1G61490 30.851 188 122 2 454 641 436 615 3.95e-22 102
MsG0780037281.01.T01 AT2G28930 32.432 185 105 5 464 637 51 226 4.07e-22 100
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MsG0780037281.01.T01 AT1G61370 27.682 289 161 8 470 718 489 769 4.38e-22 102
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MsG0780037281.01.T01 AT1G61490 30.851 188 122 2 454 641 462 641 4.71e-22 102
MsG0780037281.01.T01 AT1G61490 30.851 188 122 2 454 641 462 641 4.71e-22 102
MsG0780037281.01.T01 AT2G28930 32.432 185 105 5 464 637 54 229 4.91e-22 99.8
MsG0780037281.01.T01 AT1G66880 38.728 173 89 5 470 639 957 1115 4.93e-22 102
MsG0780037281.01.T01 AT4G05200 29.839 248 137 4 393 639 285 496 5.15e-22 101
MsG0780037281.01.T01 AT4G05200 29.839 248 137 4 393 639 303 514 5.61e-22 101
MsG0780037281.01.T01 AT3G15890 30.168 179 116 2 458 635 15 185 5.67e-22 99.0
MsG0780037281.01.T01 AT2G28930 32.432 185 105 5 464 637 62 237 6.01e-22 99.8
MsG0780037281.01.T01 AT2G15320 28.239 301 181 5 122 387 81 381 6.03e-22 99.0
MsG0780037281.01.T01 AT1G16130 34.706 170 103 1 468 637 402 563 6.80e-22 101
MsG0780037281.01.T01 AT1G11330 26.370 292 167 5 470 721 512 795 6.93e-22 101
MsG0780037281.01.T01 AT1G79620 35.319 235 135 5 119 339 75 306 7.01e-22 101
MsG0780037281.01.T01 AT1G79620 38.889 126 63 3 454 576 610 724 6.70e-15 79.3
MsG0780037281.01.T01 AT1G79620 32.026 153 95 5 151 296 210 360 5.78e-14 76.3
MsG0780037281.01.T01 AT1G79620 27.385 325 194 8 53 339 59 379 2.29e-13 74.3
MsG0780037281.01.T01 AT1G11330 26.370 292 167 5 470 721 510 793 7.34e-22 101
MsG0780037281.01.T01 AT5G47850 33.511 188 104 3 470 645 431 609 7.65e-22 101
MsG0780037281.01.T01 AT1G11350 23.262 374 217 8 393 721 435 783 7.84e-22 101
MsG0780037281.01.T01 AT1G79680 26.780 295 168 6 468 722 419 705 8.15e-22 101
MsG0780037281.01.T01 AT5G01020 27.244 312 166 11 470 733 57 355 1.03e-21 99.0
MsG0780037281.01.T01 AT1G61440 31.183 186 120 2 454 639 450 627 1.06e-21 101
MsG0780037281.01.T01 AT1G61500 31.000 200 130 2 445 644 454 645 1.09e-21 100
MsG0780037281.01.T01 AT1G61440 31.183 186 120 2 454 639 455 632 1.15e-21 100
MsG0780037281.01.T01 AT3G19300 25.862 290 164 7 468 718 314 591 1.18e-21 100
MsG0780037281.01.T01 AT1G61500 31.000 200 130 2 445 644 436 627 1.19e-21 100
MsG0780037281.01.T01 AT2G28590 34.682 173 103 4 470 640 86 250 1.22e-21 97.1
MsG0780037281.01.T01 AT2G42800 31.353 303 194 7 113 409 161 455 1.22e-21 99.4
MsG0780037281.01.T01 AT2G42800 29.775 356 203 10 34 357 43 383 4.02e-20 94.7
MsG0780037281.01.T01 AT2G42800 31.579 209 122 4 112 319 232 420 3.10e-12 70.1
MsG0780037281.01.T01 AT1G61500 31.414 191 123 2 454 644 468 650 1.29e-21 100
MsG0780037281.01.T01 AT3G26700 32.083 240 127 7 400 636 18 224 1.29e-21 98.2
MsG0780037281.01.T01 AT3G26700 32.083 240 127 7 400 636 18 224 1.29e-21 98.2
MsG0780037281.01.T01 AT3G26700 32.083 240 127 7 400 636 18 224 1.29e-21 98.2
MsG0780037281.01.T01 AT3G02880 25.934 455 290 16 210 639 62 494 1.35e-21 100
MsG0780037281.01.T01 AT1G54820 26.646 319 162 10 464 721 121 428 1.38e-21 99.0
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MsG0780037281.01.T01 AT3G59510 27.653 311 167 5 128 387 106 409 1.62e-21 98.2
MsG0780037281.01.T01 AT3G59510 31.418 261 152 5 107 366 108 342 1.74e-20 95.1
MsG0780037281.01.T01 AT5G66790 32.749 171 107 1 470 640 302 464 1.66e-21 100
MsG0780037281.01.T01 AT5G47070 35.885 209 116 8 447 648 54 251 1.70e-21 98.2
MsG0780037281.01.T01 AT1G79620 35.319 235 135 5 119 339 75 306 1.71e-21 100
MsG0780037281.01.T01 AT1G79620 32.026 153 95 5 151 296 210 360 9.01e-14 75.5
MsG0780037281.01.T01 AT4G23190 26.721 247 143 4 393 639 213 421 1.78e-21 99.8
MsG0780037281.01.T01 AT4G23190 26.721 247 143 4 393 639 213 421 1.78e-21 99.8
MsG0780037281.01.T01 AT3G26700 32.083 240 127 7 400 636 18 224 1.85e-21 96.7
MsG0780037281.01.T01 AT3G26700 32.083 240 127 7 400 636 18 224 1.85e-21 96.7
MsG0780037281.01.T01 AT5G11020 24.561 285 169 4 475 721 134 410 1.91e-21 98.2
MsG0780037281.01.T01 AT1G67520 27.358 318 178 9 361 642 113 413 2.10e-21 99.4
MsG0780037281.01.T01 AT4G23190 26.721 247 143 4 393 639 291 499 2.33e-21 99.8
MsG0780037281.01.T01 AT5G15730 24.126 286 161 7 470 717 104 371 2.35e-21 98.2
MsG0780037281.01.T01 AT5G15730 24.126 286 161 7 470 717 104 371 2.35e-21 98.2
MsG0780037281.01.T01 AT4G23190 26.613 248 143 4 393 639 290 499 2.38e-21 99.4
MsG0780037281.01.T01 AT5G11020 24.561 285 169 4 475 721 73 349 2.39e-21 97.1
MsG0780037281.01.T01 AT3G25490 36.095 169 98 3 470 637 96 255 2.55e-21 97.8
MsG0780037281.01.T01 AT1G49270 30.058 173 113 2 470 642 324 488 2.68e-21 99.8
MsG0780037281.01.T01 AT1G67520 27.358 318 178 9 361 642 307 607 3.08e-21 99.8

Find 107 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 281 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GTTTGGTTTCTTTAGGAATT+TGG 0.119051 7:-23037032 MsG0780037281.01.T01:CDS
CTTGGGTTTGTGGATATTTC+TGG 0.126391 7:-23036409 MsG0780037281.01.T01:CDS
TCCAAATTTGGTTAGTCTTT+TGG 0.157716 7:-23035235 MsG0780037281.01.T01:CDS
TAGCAGACATACCAAGATTT+TGG 0.175945 7:+23033831 None:intergenic
TTTGGTTTCTTTAGGAATTT+GGG 0.177338 7:-23037031 MsG0780037281.01.T01:CDS
GCTATCTTTGCTTGAAGTTT+TGG 0.193605 7:-23036983 MsG0780037281.01.T01:CDS
CCCAAAAGACTAACCAAATT+TGG 0.197818 7:+23035234 None:intergenic
AAAGCTTAACCATCCAAATT+TGG 0.204026 7:-23035247 MsG0780037281.01.T01:CDS
GACAAGGTTAAAAGGTTTAA+AGG 0.204354 7:-23037061 MsG0780037281.01.T01:CDS
GTTCCGGAAAGACAAAATTT+TGG 0.223083 7:-23036255 MsG0780037281.01.T01:CDS
ATTTCTGGTAACATGTTAAA+TGG 0.228034 7:-23036394 MsG0780037281.01.T01:CDS
ACAACATTGACAAGGTTAAA+AGG 0.234677 7:-23037069 MsG0780037281.01.T01:CDS
GCCTAATTTCTTTGAACCTT+TGG 0.253378 7:-23036857 MsG0780037281.01.T01:CDS
TTTGATTTGTCAACTTATAT+TGG 0.265468 7:-23035677 MsG0780037281.01.T01:CDS
GTCATTCAAGAGAGATTTAT+AGG 0.272357 7:-23036147 MsG0780037281.01.T01:CDS
GTTCTTAGTTTGGTTTCTTT+AGG 0.280913 7:-23037039 MsG0780037281.01.T01:CDS
ACCAAAGGTTCAAAGAAATT+AGG 0.289224 7:+23036856 None:intergenic
TGGCTTACTTCCTTCTTGTT+TGG 0.295924 7:-23036374 MsG0780037281.01.T01:CDS
TTCACCAATGTAGCTATCTT+TGG 0.309682 7:+23036925 None:intergenic
TATACCATAGTCACTTAGTT+TGG 0.310924 7:+23034005 None:intergenic
TTGTCACATAATGAATTATC+TGG 0.313037 7:-23036742 MsG0780037281.01.T01:CDS
GGTGAGATTCCTAGTCAATT+TGG 0.319592 7:-23036589 MsG0780037281.01.T01:CDS
AGAATCAATAGAGAAACTTT+TGG 0.325311 7:+23037098 None:intergenic
AGGTTTAAAGGTTCTTAGTT+TGG 0.337724 7:-23037049 MsG0780037281.01.T01:CDS
GATAGAAGAGTTGTTAGATT+TGG 0.353017 7:-23036340 MsG0780037281.01.T01:CDS
AATACCGTGACAACCGATTT+CGG 0.354387 7:+23036634 None:intergenic
CTCAAGTCTTGTTACAGTTA+AGG 0.355619 7:-23037317 MsG0780037281.01.T01:CDS
ACTAAAATGGTCTGATAGAT+TGG 0.379978 7:-23034142 MsG0780037281.01.T01:CDS
TATTGTAAAGAGTCTAGTTC+CGG 0.380184 7:-23036271 MsG0780037281.01.T01:CDS
TGAAGAGATCGAAAACATTC+AGG 0.381496 7:-23033971 MsG0780037281.01.T01:CDS
TTGTTATCTTGAACAATCTT+CGG 0.388605 7:+23036112 None:intergenic
GTTTATGAGTATGTGCAAAA+TGG 0.388906 7:-23035156 MsG0780037281.01.T01:CDS
GTAAAGGTTGAAAGTTTCAA+TGG 0.392204 7:-23037147 MsG0780037281.01.T01:CDS
CACTTTCTGATAAAATTCAT+AGG 0.402404 7:-23037005 MsG0780037281.01.T01:CDS
CACTAGATAAGGCACTAAAA+TGG 0.403311 7:-23034155 MsG0780037281.01.T01:CDS
TTTCCCAAACTAAGTGACTA+TGG 0.409088 7:-23034009 MsG0780037281.01.T01:CDS
CTAAAATGTGGAAGCAAGCT+TGG 0.413894 7:-23036427 MsG0780037281.01.T01:CDS
TCTAGAATTTGCAAAGAAGT+TGG 0.414884 7:+23037279 None:intergenic
AGAAGAGTTGTTAGATTTGG+TGG 0.420639 7:-23036337 MsG0780037281.01.T01:CDS
GATTATCGTACCCATTTGTC+AGG 0.425689 7:-23035132 MsG0780037281.01.T01:intron
ATACCATAGTCACTTAGTTT+GGG 0.426573 7:+23034006 None:intergenic
TGTGATACTAACCTGACAAA+TGG 0.429696 7:+23035121 None:intergenic
TTTCGTCGAATCGTCTTAGC+GGG 0.435360 7:-23036537 MsG0780037281.01.T01:CDS
TGGAAGCAAGCTTGGGTTTG+TGG 0.447212 7:-23036419 MsG0780037281.01.T01:CDS
AGGAACTGAATCCAAAATCT+TGG 0.448981 7:-23033842 MsG0780037281.01.T01:intron
GCTACCATTGATGCCGAAAT+CGG 0.463973 7:-23036647 MsG0780037281.01.T01:CDS
CAAGATAACAAATCAACAAC+GGG 0.464992 7:-23036100 MsG0780037281.01.T01:CDS
TAAAATGTGGAAGCAAGCTT+GGG 0.469088 7:-23036426 MsG0780037281.01.T01:CDS
ACAAAATCTCAAAGCTAAGT+TGG 0.469168 7:-23035280 MsG0780037281.01.T01:CDS
AGTAACTGAGCTCAAAATCA+TGG 0.477176 7:-23037187 MsG0780037281.01.T01:CDS
GAAGGACGAGATGAGGATTG+TGG 0.477572 7:+23032855 None:intergenic
GTGATACTAACCTGACAAAT+GGG 0.480142 7:+23035122 None:intergenic
TACAAAGGTAAACTAGAGAA+TGG 0.489315 7:-23035351 MsG0780037281.01.T01:CDS
TCGTCTTAGCGGGGTTCCTC+CGG 0.491803 7:-23036527 MsG0780037281.01.T01:CDS
ACCAATGTAGCTATCTTTGG+TGG 0.493022 7:+23036928 None:intergenic
CATAAACAAGATGAAGTTTG+TGG 0.493093 7:+23035172 None:intergenic
ACAACCGATTTCGGCATCAA+TGG 0.503125 7:+23036643 None:intergenic
CAAAGGACATCTTCAAAAGA+AGG 0.505568 7:+23032837 None:intergenic
AATCTGCATCTGCTGAGGCT+TGG 0.505712 7:+23032790 None:intergenic
TTGTCAACTTATATTGGTGA+AGG 0.505744 7:-23035671 MsG0780037281.01.T01:CDS
CACAAGCTACTCCAACTTGT+AGG 0.513935 7:-23035739 MsG0780037281.01.T01:CDS
GGACAATCATAAACATGTAA+AGG 0.516194 7:-23037163 MsG0780037281.01.T01:CDS
ATTGAAAAGTGCCTACAAGT+TGG 0.519634 7:+23035728 None:intergenic
GCAAAGAAGTTGGATACTCC+AGG 0.535911 7:+23037289 None:intergenic
GTAACTGAGCTCAAAATCAT+GGG 0.542782 7:-23037186 MsG0780037281.01.T01:CDS
ATATTTATATCTCAATCTTG+TGG 0.549684 7:-23037394 MsG0780037281.01.T01:CDS
AGTACTTACTTGCACTAGCA+AGG 0.550710 7:+23036062 None:intergenic
GTCAAAGAGAACAAAGAAGC+CGG 0.551355 7:+23036508 None:intergenic
TATATTGGTGAAGGATCTGT+AGG 0.551960 7:-23035662 MsG0780037281.01.T01:CDS
TCAGATGGAGGAATGCTACA+AGG 0.552898 7:+23037240 None:intergenic
AAAGACTAACCAAATTTGGA+TGG 0.557025 7:+23035238 None:intergenic
CTTTCGTCGAATCGTCTTAG+CGG 0.560100 7:-23036538 MsG0780037281.01.T01:CDS
TTAATGCTCAAATGCTCAGA+TGG 0.561566 7:+23037225 None:intergenic
ATAAACAAGATGAAGTTTGT+GGG 0.565531 7:+23035173 None:intergenic
TTCAAAAGAAGGACGAGATG+AGG 0.566187 7:+23032848 None:intergenic
GAAGTACTTTCCAAACAAGA+AGG 0.567877 7:+23036364 None:intergenic
TCCACCAAAGATAGCTACAT+TGG 0.569191 7:-23036929 MsG0780037281.01.T01:CDS
AACTTGTTTCTAAAACAACC+TGG 0.570575 7:+23034066 None:intergenic
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AATTCTCAAGCTCAAAAGCA+TGG 0.571029 7:-23036298 MsG0780037281.01.T01:CDS
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CRISPR-GE

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!!! CCAAATTTGGTTAGTCTTTT+GGG - Chr7:23034941-23034960 MsG0780037281.01.T01:intron 30.0%
!!! TCCAAATTTGGTTAGTCTTT+TGG - Chr7:23034940-23034959 MsG0780037281.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTCTCTTGCTTTTAGCTTT+CGG - Chr7:23033985-23034004 MsG0780037281.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTTTTTACAGGAGGTAAAC+TGG + Chr7:23036864-23036883 None:intergenic 30.0%
AAGTAAGCAAACACTCAGTT+TGG + Chr7:23036603-23036622 None:intergenic 35.0%
AATATGATACCTATGAGCCA+TGG + Chr7:23035455-23035474 None:intergenic 35.0%
AATTCTCAAGCTCAAAAGCA+TGG - Chr7:23033877-23033896 MsG0780037281.01.T01:intron 35.0%
ACAAACAGAAGACATCTTTG+AGG + Chr7:23036542-23036561 None:intergenic 35.0%
ACAGAAGCTAAACCAGAAAT+TGG - Chr7:23037025-23037044 MsG0780037281.01.T01:CDS 35.0%
AGAAGAGTTGTTAGATTTGG+TGG - Chr7:23033838-23033857 MsG0780037281.01.T01:intron 35.0%
AGCAACATAGTCAATCTTCA+TGG + Chr7:23036292-23036311 None:intergenic 35.0%
AGGAACTGAATCCAAAATCT+TGG - Chr7:23036333-23036352 MsG0780037281.01.T01:CDS 35.0%
AGTAACTGAGCTCAAAATCA+TGG - Chr7:23032988-23033007 MsG0780037281.01.T01:intron 35.0%
ATATGATACCTATGAGCCAT+GGG + Chr7:23035454-23035473 None:intergenic 35.0%
ATTAGCGAAAGATACTTTGG+AGG + Chr7:23036510-23036529 None:intergenic 35.0%
CAAAGGACATCTTCAAAAGA+AGG + Chr7:23037341-23037360 None:intergenic 35.0%
CCCAAAAGACTAACCAAATT+TGG + Chr7:23034944-23034963 None:intergenic 35.0%
CTGCATACTGTAAATTCCAA+AGG + Chr7:23037358-23037377 None:intergenic 35.0%
CTTAAATTTGGTCCCTCAAT+CGG + Chr7:23034753-23034772 None:intergenic 35.0%
GAATCTTCAAACTACAAGGA+TGG - Chr7:23036983-23037002 MsG0780037281.01.T01:CDS 35.0%
GAGAAAAACTACGACAATGA+TGG + Chr7:23033971-23033990 None:intergenic 35.0%
GCAACATAGTCAATCTTCAT+GGG + Chr7:23036291-23036310 None:intergenic 35.0%
GCATTTGAGCATTAAATGTG+AGG - Chr7:23032958-23032977 MsG0780037281.01.T01:CDS 35.0%
GCCTAATTTCTTTGAACCTT+TGG - Chr7:23033318-23033337 MsG0780037281.01.T01:intron 35.0%
GTAACTGAGCTCAAAATCAT+GGG - Chr7:23032989-23033008 MsG0780037281.01.T01:intron 35.0%
GTATCTTGTGTTAGTCAGTT+TGG - Chr7:23036483-23036502 MsG0780037281.01.T01:CDS 35.0%
GTCAATTTCAATCCGATTGA+GGG - Chr7:23034738-23034757 MsG0780037281.01.T01:intron 35.0%
GTGATACTAACCTGACAAAT+GGG + Chr7:23035056-23035075 None:intergenic 35.0%
GTTTGGTTACTAAATATGGG+AGG + Chr7:23036586-23036605 None:intergenic 35.0%
TAAAATGTGGAAGCAAGCTT+GGG - Chr7:23033749-23033768 MsG0780037281.01.T01:intron 35.0%
TAACTGAGCTCAAAATCATG+GGG - Chr7:23032990-23033009 MsG0780037281.01.T01:intron 35.0%
TAGTAAATTTCACGAGGCAT+GGG + Chr7:23035225-23035244 None:intergenic 35.0%
TATATTGGTGAAGGATCTGT+AGG - Chr7:23034513-23034532 MsG0780037281.01.T01:intron 35.0%
TCATCTAACAGAAAACCCTA+CGG + Chr7:23035601-23035620 None:intergenic 35.0%
TGAAGAGATCGAAAACATTC+AGG - Chr7:23036204-23036223 MsG0780037281.01.T01:CDS 35.0%
TGGAAAGAACAATCATTCCT+AGG + Chr7:23035553-23035572 None:intergenic 35.0%
TGTCAATTTCAATCCGATTG+AGG - Chr7:23034737-23034756 MsG0780037281.01.T01:intron 35.0%
TGTGATACTAACCTGACAAA+TGG + Chr7:23035057-23035076 None:intergenic 35.0%
TTAATGCTCAAATGCTCAGA+TGG + Chr7:23032953-23032972 None:intergenic 35.0%
TTACACACTGGAATTATACC+AGG - Chr7:23036091-23036110 MsG0780037281.01.T01:CDS 35.0%
TTAGTAAATTTCACGAGGCA+TGG + Chr7:23035226-23035245 None:intergenic 35.0%
TTCAACTCACCAAATTGACT+AGG + Chr7:23033598-23033617 None:intergenic 35.0%
TTCACCAATGTAGCTATCTT+TGG + Chr7:23033253-23033272 None:intergenic 35.0%
TTGAAAAGGATCGGTCAAAA+GGG - Chr7:23035635-23035654 MsG0780037281.01.T01:intron 35.0%
TTTCCCAAACTAAGTGACTA+TGG - Chr7:23036166-23036185 MsG0780037281.01.T01:CDS 35.0%
TTTGAAAAGGATCGGTCAAA+AGG - Chr7:23035634-23035653 MsG0780037281.01.T01:intron 35.0%
! AGACTCATTCTAACTGATTC+AGG + Chr7:23035758-23035777 None:intergenic 35.0%
! CACTAGATAAGGCACTAAAA+TGG - Chr7:23036020-23036039 MsG0780037281.01.T01:intron 35.0%
! CTTTTGTCACAACATTGACA+AGG - Chr7:23033098-23033117 MsG0780037281.01.T01:intron 35.0%
! GAAGTACTTTCCAAACAAGA+AGG + Chr7:23033814-23033833 None:intergenic 35.0%
! GCTATCTTTGCTTGAAGTTT+TGG - Chr7:23033192-23033211 MsG0780037281.01.T01:intron 35.0%
! GTTCCGGAAAGACAAAATTT+TGG - Chr7:23033920-23033939 MsG0780037281.01.T01:intron 35.0%
! TAGCAGACATACCAAGATTT+TGG + Chr7:23036347-23036366 None:intergenic 35.0%
! TCTATGTTTTGTACAGGCAA+AGG - Chr7:23036313-23036332 MsG0780037281.01.T01:CDS 35.0%
!! ATTGAAAAGTGCCTACAAGT+TGG + Chr7:23034450-23034469 None:intergenic 35.0%
!! CAAGTAAGTACTGAAGGTTA+AGG - Chr7:23034124-23034143 MsG0780037281.01.T01:CDS 35.0%
!! CTCAAGTCTTGTTACAGTTA+AGG - Chr7:23032858-23032877 MsG0780037281.01.T01:CDS 35.0%
!! CTTCTTTTGAAGATGTCCTT+TGG - Chr7:23037339-23037358 MsG0780037281.01.T01:CDS 35.0%
!! GCTTTATTTCAGCTGTACAA+AGG - Chr7:23034809-23034828 MsG0780037281.01.T01:intron 35.0%
!!! CTTCCACATTTTAGTTTCTG+TGG + Chr7:23033742-23033761 None:intergenic 35.0%
AACTGAGCTCAAAATCATGG+GGG - Chr7:23032991-23033010 MsG0780037281.01.T01:intron 40.0%
AATAGAATCTGCATCTGCTG+AGG + Chr7:23037393-23037412 None:intergenic 40.0%
ACCAATGTAGCTATCTTTGG+TGG + Chr7:23033250-23033269 None:intergenic 40.0%
AGTACTTACTTGCACTAGCA+AGG + Chr7:23034116-23034135 None:intergenic 40.0%
ATCTTGGTATGTCTGCTAAC+TGG - Chr7:23036349-23036368 MsG0780037281.01.T01:CDS 40.0%
ATTGCAACCTCAATATCGAC+TGG - Chr7:23034223-23034242 MsG0780037281.01.T01:intron 40.0%
CATCCTCTAATTCTTCCCTT+CGG + Chr7:23036683-23036702 None:intergenic 40.0%
CTAAAATGTGGAAGCAAGCT+TGG - Chr7:23033748-23033767 MsG0780037281.01.T01:intron 40.0%
CTTCATGGGATCAAGCATAA+TGG + Chr7:23036277-23036296 None:intergenic 40.0%
CTTGGGTTTGTGGATATTTC+TGG - Chr7:23033766-23033785 MsG0780037281.01.T01:intron 40.0%
GATCGTCTTCTTCATAGATC+TGG - Chr7:23035527-23035546 MsG0780037281.01.T01:intron 40.0%
GATTATCGTACCCATTTGTC+AGG - Chr7:23035043-23035062 MsG0780037281.01.T01:intron 40.0%
GCTGCTATAACTTCCTTTGA+AGG + Chr7:23035796-23035815 None:intergenic 40.0%
GGTGAGATTCCTAGTCAATT+TGG - Chr7:23033586-23033605 MsG0780037281.01.T01:intron 40.0%
GTAAAGTTGCGATGTAAACC+CGG - Chr7:23035293-23035312 MsG0780037281.01.T01:CDS 40.0%
GTAATGGTTTCCAGCGTAAT+AGG - Chr7:23034256-23034275 MsG0780037281.01.T01:intron 40.0%
GTAGTATGGTATCTAAACCC+TGG + Chr7:23035722-23035741 None:intergenic 40.0%
GTCAAAGAGAACAAAGAAGC+CGG + Chr7:23033670-23033689 None:intergenic 40.0%
GTGTAAAAAATGCACAGCCT+TGG + Chr7:23036077-23036096 None:intergenic 40.0%
TCCACCAAAGATAGCTACAT+TGG - Chr7:23033246-23033265 MsG0780037281.01.T01:intron 40.0%
TCCTACATACACTCCTTCAA+AGG - Chr7:23035780-23035799 MsG0780037281.01.T01:intron 40.0%
TGCAAAAGATATCTCACCCA+TGG - Chr7:23035435-23035454 MsG0780037281.01.T01:intron 40.0%
TGGCTTACTTCCTTCTTGTT+TGG - Chr7:23033801-23033820 MsG0780037281.01.T01:intron 40.0%
TTATATTGCGGACGCAATTG+CGG + Chr7:23034178-23034197 None:intergenic 40.0%
TTCAAAAGAAGGACGAGATG+AGG + Chr7:23037330-23037349 None:intergenic 40.0%
TTTCCATGATATCTCACCCA+TGG - Chr7:23035347-23035366 MsG0780037281.01.T01:CDS 40.0%
! AATACCGTGACAACCGATTT+CGG + Chr7:23033544-23033563 None:intergenic 40.0%
! ATTGTAGCTCATGAGTACTG+TGG + Chr7:23032829-23032848 None:intergenic 40.0%
! CCAAAAAGTGTGGTGAGATT+AGG + Chr7:23033466-23033485 None:intergenic 40.0%
! CCTAATCTCACCACACTTTT+TGG - Chr7:23033463-23033482 MsG0780037281.01.T01:intron 40.0%
! GCATCGTTTGATAGTCATGA+TGG - Chr7:23037206-23037225 MsG0780037281.01.T01:CDS 40.0%
! TCCTTTGAAGGAGTGTATGT+AGG + Chr7:23035784-23035803 None:intergenic 40.0%
! TTCTCCTTTCTCACTTGCTA+TGG + Chr7:23036751-23036770 None:intergenic 40.0%
!! CTAGTGCAAGTAAGTACTGA+AGG - Chr7:23034118-23034137 MsG0780037281.01.T01:CDS 40.0%
!! GGATCAAGCATAATGGACAA+AGG + Chr7:23036270-23036289 None:intergenic 40.0%
!! GTTACAGTTAAGGAAGTACC+TGG - Chr7:23032868-23032887 MsG0780037281.01.T01:CDS 40.0%
!! TATACGGAAGTATCAGCCAT+GGG + Chr7:23035366-23035385 None:intergenic 40.0%
!! TCTCCTTTCTCACTTGCTAT+GGG + Chr7:23036750-23036769 None:intergenic 40.0%
!!! AGATTTTGAGGTCTCTGCAA+CGG - Chr7:23034199-23034218 MsG0780037281.01.T01:intron 40.0%
!!! GCTGTGCATTTTTTACACAC+TGG - Chr7:23036079-23036098 MsG0780037281.01.T01:CDS 40.0%
AAAGAGAACAAAGAAGCCGG+AGG + Chr7:23033667-23033686 None:intergenic 45.0%
ATATCTCACCCATGGCTCAT+AGG - Chr7:23035443-23035462 MsG0780037281.01.T01:intron 45.0%
ATGCTCAAATGCTCAGATGG+AGG + Chr7:23032950-23032969 None:intergenic 45.0%
CACAAGCTACTCCAACTTGT+AGG - Chr7:23034436-23034455 MsG0780037281.01.T01:intron 45.0%
CAGATGGAGGAATGCTACAA+GGG + Chr7:23032937-23032956 None:intergenic 45.0%
CAGCAAGTTGTCAACACTAC+CGG + Chr7:23037251-23037270 None:intergenic 45.0%
CCTGTCGTTCACAAATCCAT+TGG + Chr7:23037187-23037206 None:intergenic 45.0%
CGCTGGAAACCATTACAATG+TGG + Chr7:23034252-23034271 None:intergenic 45.0%
CTTCTTCATAGATCTGGCCT+AGG - Chr7:23035533-23035552 MsG0780037281.01.T01:intron 45.0%
CTTTCGTCGAATCGTCTTAG+CGG - Chr7:23033637-23033656 MsG0780037281.01.T01:intron 45.0%
GATAACAAAGCTCGCAACCA+GGG - Chr7:23035702-23035721 MsG0780037281.01.T01:CDS 45.0%
GCAAAGAAGTTGGATACTCC+AGG + Chr7:23032889-23032908 None:intergenic 45.0%
GCTACCATTGATGCCGAAAT+CGG - Chr7:23033528-23033547 MsG0780037281.01.T01:intron 45.0%
TCAGATGGAGGAATGCTACA+AGG + Chr7:23032938-23032957 None:intergenic 45.0%
TCTAACAGAAAACCCTACGG+CGG + Chr7:23035598-23035617 None:intergenic 45.0%
TGGTGAAGGATCTGTAGGAA+AGG - Chr7:23034518-23034537 MsG0780037281.01.T01:intron 45.0%
TTCCACCACCATCGATACAA+TGG + Chr7:23034967-23034986 None:intergenic 45.0%
TTCTTTCTCTTGCAGCCGAA+GGG - Chr7:23036665-23036684 MsG0780037281.01.T01:CDS 45.0%
TTTCGTCGAATCGTCTTAGC+GGG - Chr7:23033638-23033657 MsG0780037281.01.T01:intron 45.0%
TTTCTTTCTCTTGCAGCCGA+AGG - Chr7:23036664-23036683 MsG0780037281.01.T01:CDS 45.0%
! ACAACCGATTTCGGCATCAA+TGG + Chr7:23033535-23033554 None:intergenic 45.0%
! CAGAGGATGGTTTGAGATTG+CGG + Chr7:23034284-23034303 None:intergenic 45.0%
! CCAATGGATTTGTGAACGAC+AGG - Chr7:23037184-23037203 MsG0780037281.01.T01:CDS 45.0%
! CTTTTGGGCCATTGTATCGA+TGG - Chr7:23034956-23034975 MsG0780037281.01.T01:intron 45.0%
! TTGGTGACAATGCTCCTCAA+TGG + Chr7:23035573-23035592 None:intergenic 45.0%
!! GTATACGGAAGTATCAGCCA+TGG + Chr7:23035367-23035386 None:intergenic 45.0%
!! TTATATAAATTATACAAAAT+AGG + Chr7:23034776-23034795 None:intergenic 5.0%
AATCTGCATCTGCTGAGGCT+TGG + Chr7:23037388-23037407 None:intergenic 50.0%
CAGCCATGGGTGAGATATCA+TGG + Chr7:23035353-23035372 None:intergenic 50.0%
CAGCCGAAGGGAAGAATTAG+AGG - Chr7:23036677-23036696 MsG0780037281.01.T01:CDS 50.0%
CGATAACAAAGCTCGCAACC+AGG - Chr7:23035701-23035720 MsG0780037281.01.T01:CDS 50.0%
GAAGGACGAGATGAGGATTG+TGG + Chr7:23037323-23037342 None:intergenic 50.0%
GACTGGAGGCCACATTGTAA+TGG - Chr7:23034240-23034259 MsG0780037281.01.T01:intron 50.0%
GATGCCGAAATCGGTTGTCA+CGG - Chr7:23033537-23033556 MsG0780037281.01.T01:intron 50.0%
GATTGCGGTTCCTATTACGC+TGG + Chr7:23034269-23034288 None:intergenic 50.0%
GGACCCATAGCAAGTGAGAA+AGG - Chr7:23036744-23036763 MsG0780037281.01.T01:CDS 50.0%
TGCACTAGCAAGGAGTTCAG+AGG + Chr7:23034106-23034125 None:intergenic 50.0%
TGGAAGCAAGCTTGGGTTTG+TGG - Chr7:23033756-23033775 MsG0780037281.01.T01:intron 50.0%
TTCGTCGAATCGTCTTAGCG+GGG - Chr7:23033639-23033658 MsG0780037281.01.T01:intron 50.0%
TTGTCGAATCACGACAGCAG+AGG + Chr7:23034301-23034320 None:intergenic 50.0%
! GCAACCTCAATATCGACTGG+AGG - Chr7:23034226-23034245 MsG0780037281.01.T01:intron 50.0%
! TTGGGCCATTGTATCGATGG+TGG - Chr7:23034959-23034978 MsG0780037281.01.T01:intron 50.0%
AGAAAACCCTACGGCGGCAT+TGG + Chr7:23035592-23035611 None:intergenic 55.0%
ATTGTCACCAATGCCGCCGT+AGG - Chr7:23035582-23035601 MsG0780037281.01.T01:intron 55.0%
CGAATCACGACAGCAGAGGA+TGG + Chr7:23034297-23034316 None:intergenic 55.0%
GTGGCCTCCAGTCGATATTG+AGG + Chr7:23034233-23034252 None:intergenic 55.0%
TGTGCCATCCACCCTTCCAA+GGG + Chr7:23035680-23035699 None:intergenic 55.0%
TTGTCACCAATGCCGCCGTA+GGG - Chr7:23035583-23035602 MsG0780037281.01.T01:intron 55.0%
! GGCCATTGTATCGATGGTGG+TGG - Chr7:23034962-23034981 MsG0780037281.01.T01:intron 55.0%
AATCCGAACACCGCCTCCCT+TGG - Chr7:23035661-23035680 MsG0780037281.01.T01:CDS 60.0%
ATCCACCCTTCCAAGGGAGG+CGG + Chr7:23035674-23035693 None:intergenic 60.0%
CTGTGCCATCCACCCTTCCA+AGG + Chr7:23035681-23035700 None:intergenic 60.0%
CTTCCAAGGGAGGCGGTGTT+CGG + Chr7:23035667-23035686 None:intergenic 60.0%
GAACACCGCCTCCCTTGGAA+GGG - Chr7:23035666-23035685 MsG0780037281.01.T01:CDS 60.0%
TCGTCTTAGCGGGGTTCCTC+CGG - Chr7:23033648-23033667 MsG0780037281.01.T01:intron 60.0%
TGCGGACGCAATTGCGGTTG+TGG + Chr7:23034172-23034191 None:intergenic 60.0%
CGAACACCGCCTCCCTTGGA+AGG - Chr7:23035665-23035684 MsG0780037281.01.T01:CDS 65.0%
GCCATCCACCCTTCCAAGGG+AGG + Chr7:23035677-23035696 None:intergenic 65.0%
GCCTCCCTTGGAAGGGTGGA+TGG - Chr7:23035673-23035692 MsG0780037281.01.T01:CDS 65.0%
CACCGCCTCCCTTGGAAGGG+TGG - Chr7:23035669-23035688 MsG0780037281.01.T01:CDS 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
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