AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene09279

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
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TTCATCTTCTGGCAATATAA+TGG 0.352304 4.1:+14401675 None:intergenic
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AGGGGTGTTGAGACGGATCT+TGG 0.389004 4.1:+14402321 None:intergenic
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AGTGTGTAGTAAACAAATCT+TGG 0.405045 4.1:+14401769 None:intergenic
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CTTCTTTGTCTCCCATCCAT+AGG 0.419065 4.1:+14395315 None:intergenic
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CAGATTCCGATCGCCGGAAT+CGG 0.429202 4.1:+14407831 None:intergenic
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TATATTGCCAGAAGATGAAA+TGG 0.440744 4.1:-14401671 MS.gene09279:intron
ATTGCACATAAAGTTTCAAA+TGG 0.442525 4.1:+14402126 None:intergenic
CACATAAAGTTTCAAATGGA+GGG 0.442722 4.1:+14402130 None:intergenic
AGCTCTCTTTCTCTTCTTGT+GGG 0.443480 4.1:+14408065 None:intergenic
CGACAAACTGTCACGGTTGT+GGG 0.445047 4.1:+14402063 None:intergenic
TCGTTTCTCAACAAGTCATT+GGG 0.447263 4.1:-14407697 MS.gene09279:CDS
GGAACCAGCTACATTTAAAC+GGG 0.448779 4.1:-14402280 MS.gene09279:CDS
CCTAAGGTGAATGATATTGA+TGG 0.452041 4.1:-14401709 MS.gene09279:CDS
AAATGGGTATCCAACATTTA+GGG 0.453566 4.1:-14398833 MS.gene09279:intron
TGCAACAATCGAACCAAAAT+GGG 0.454256 4.1:-14398849 MS.gene09279:CDS
CGGCAGTTGCTTGCAAACTC+TGG 0.456983 4.1:+14398924 None:intergenic
TTCGGATCCTTCTCGAACTC+GGG 0.459230 4.1:+14402086 None:intergenic
CCTCAACCTTGCATATCAAT+TGG 0.459576 4.1:+14401998 None:intergenic
TAAGTGTGGTGGGATTTCAT+TGG 0.465833 4.1:-14402451 MS.gene09279:CDS
GCTAGCATGCTTGTGGATCA+AGG 0.466138 4.1:-14401931 MS.gene09279:CDS
TTAGCTGGGCCCATGTTATG+GGG 0.467497 4.1:-14402425 MS.gene09279:CDS
CTTCAAGGGGTGGGAGATGA+AGG 0.469388 4.1:-14401748 MS.gene09279:CDS
CCATCAATATCATTCACCTT+AGG 0.474137 4.1:+14401709 None:intergenic
GGGATCCAATGATCACCAAC+CGG 0.475921 4.1:+14402252 None:intergenic
ATGGCCAGGTCCAAACCGTT+CGG 0.477197 4.1:+14407974 None:intergenic
AATAATTGTACCCTAAATGT+TGG 0.477227 4.1:+14398823 None:intergenic
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GAAACTTCACTATCTTAAAG+TGG 0.479693 4.1:-14407951 MS.gene09279:CDS
GACGGATCTTGGAATGTTGA+AGG 0.485139 4.1:+14402332 None:intergenic
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GGAGGGGTTTGTTCAACACT+TGG 0.494342 4.1:+14402147 None:intergenic
AACAATTAAGAAAATAAAAG+AGG 0.494388 4.1:-14407894 MS.gene09279:CDS
TACATTTAAACGGGTTGACC+CGG 0.497184 4.1:-14402271 MS.gene09279:CDS
CCATAACATGGGCCCAGCTA+AGG 0.499246 4.1:+14402427 None:intergenic
TCAACCCGTTTAAATGTAGC+TGG 0.502437 4.1:+14402276 None:intergenic
AATGGCTTGCTATGATGGAT+TGG 0.507896 4.1:-14407736 MS.gene09279:CDS
TTGCGGCCGATTCCGGCGAT+CGG 0.508580 4.1:-14407837 MS.gene09279:CDS
GCACCAAAACTCTAGATGAA+TGG 0.514485 4.1:-14407754 MS.gene09279:CDS
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CAATCCGAACGGTTTGGACC+TGG 0.517626 4.1:-14407978 MS.gene09279:CDS
CCTTCAAGAATGCCTTGAGC+TGG 0.519652 4.1:-14395347 MS.gene09279:intron
ATTGCCCCTACCATTGGGGT+CGG 0.519926 4.1:+14402038 None:intergenic
TCCGACCCAGTGGCATGACC+TGG 0.523816 4.1:+14408010 None:intergenic
TTGCCCCTACCATTGGGGTC+GGG 0.524581 4.1:+14402039 None:intergenic
GCACATAAAGTTTCAAATGG+AGG 0.536084 4.1:+14402129 None:intergenic
AGAATGCCTTGAGCTGGCTG+TGG 0.536198 4.1:-14395341 MS.gene09279:CDS
GTCGACCAGATTCCGATCGC+CGG 0.538465 4.1:+14407825 None:intergenic
TACTACACACTTCAAGGGGT+GGG 0.539191 4.1:-14401757 MS.gene09279:CDS
GATCGCCGGAATCGGCCGCA+AGG 0.546043 4.1:+14407839 None:intergenic
TTGTTTACTACACACTTCAA+GGG 0.547045 4.1:-14401762 MS.gene09279:CDS
TAACTCAATTTAAGTGTGGT+GGG 0.547840 4.1:-14402461 MS.gene09279:CDS
TTGGGCCAGGTCATGCCACT+GGG 0.547919 4.1:-14408015 MS.gene09279:CDS
ATCGCCGGAATCGGCCGCAA+GGG 0.554171 4.1:+14407840 None:intergenic
CGACCCGACCCCAATGGTAG+GGG 0.554339 4.1:-14402042 MS.gene09279:CDS
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ACATAAAGTTTCAAATGGAG+GGG 0.558070 4.1:+14402131 None:intergenic
GCCAGGTCATGCCACTGGGT+CGG 0.558921 4.1:-14408011 MS.gene09279:CDS
GTAACTCAATTTAAGTGTGG+TGG 0.561280 4.1:-14402462 MS.gene09279:CDS
AAAATTAAGGGGTGTTGAGA+CGG 0.562724 4.1:+14402314 None:intergenic
TTTGACTCTGAGGCCGCACA+AGG 0.563433 4.1:-14407920 MS.gene09279:CDS
CTTAATTGTTAGGCCTTGTG+CGG 0.564584 4.1:+14407907 None:intergenic
TAGCTGGGCCCATGTTATGG+GGG 0.565629 4.1:-14402424 MS.gene09279:CDS
GTCGACCCGACCCCAATGGT+AGG 0.572588 4.1:-14402044 MS.gene09279:CDS
CCAATTGATATGCAAGGTTG+AGG 0.574004 4.1:-14401998 MS.gene09279:CDS
TCAGATTTCATCAACTTATG+GGG 0.579204 4.1:-14402387 MS.gene09279:CDS
TGGCTGTGGAAACCTATGGA+TGG 0.579232 4.1:-14395327 MS.gene09279:CDS
GGCTGTGGAAACCTATGGAT+GGG 0.579897 4.1:-14395326 MS.gene09279:CDS
CAGGTAACTCAATTTAAGTG+TGG 0.580586 4.1:-14402465 MS.gene09279:CDS
TCATTAGGGAGCTAGTTATG+TGG 0.584575 4.1:+14402196 None:intergenic
AGGTTTCCACAGCCAGCTCA+AGG 0.591414 4.1:+14395335 None:intergenic
ATGAAATCTGAAGCTGAATG+TGG 0.593595 4.1:+14402399 None:intergenic
TTTAAACGGGTTGACCCGGT+TGG 0.594712 4.1:-14402267 MS.gene09279:CDS
AGAACCTGCAACAAAATGGA+AGG 0.600774 4.1:+14407656 None:intergenic
GGATCCAATGATCACCAACC+GGG 0.601111 4.1:+14402253 None:intergenic
TTCGTCAAGTGCAATGATTG+TGG 0.601190 4.1:-14407800 MS.gene09279:CDS
CAATCATTGCACTTGACGAA+GGG 0.602139 4.1:+14407803 None:intergenic
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TTACTACACACTTCAAGGGG+TGG 0.606615 4.1:-14401758 MS.gene09279:CDS
GGTTTACTTCTTTGACTCTG+AGG 0.609658 4.1:-14407930 MS.gene09279:CDS
ACGGATCTTGGAATGTTGAA+GGG 0.614481 4.1:+14402333 None:intergenic
ACAATCATTGCACTTGACGA+AGG 0.615639 4.1:+14407802 None:intergenic
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TAGGGAGCTAGTTATGTGGA+AGG 0.620633 4.1:+14402200 None:intergenic
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TGCATAGCCCGAGTTCGAGA+AGG 0.625715 4.1:-14402093 MS.gene09279:CDS
TATCATTGCCCCTACCATTG+GGG 0.626014 4.1:+14402034 None:intergenic
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CRISPR-GE

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