AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0480022607.01

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MsG0480022607.01.T01 AT3G45430 36.471 595 334 15 59 630 49 622 5.55e-104 332
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MsG0480022607.01.T01 AT5G01550 30.803 685 391 16 1 629 1 658 8.35e-97 314
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MsG0480022607.01.T01 AT2G43700 31.366 593 358 14 64 628 18 589 7.63e-89 291
MsG0480022607.01.T01 AT2G43700 31.366 593 358 14 64 628 18 589 7.63e-89 291
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MsG0480022607.01.T01 AT3G45440 33.798 645 369 17 59 677 101 713 7.22e-86 285
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MsG0480022607.01.T01 AT1G56120 37.831 415 218 10 273 666 628 1023 1.19e-74 260
MsG0480022607.01.T01 AT1G56120 37.831 415 218 10 273 666 646 1041 1.31e-74 260
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MsG0480022607.01.T01 AT1G53430 36.364 407 234 6 283 686 609 993 2.89e-71 251
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MsG0480022607.01.T01 AT4G11480 39.308 318 171 6 333 636 302 611 9.54e-67 232
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MsG0480022607.01.T01 AT4G23220 41.281 281 158 4 337 613 324 601 1.61e-66 231
MsG0480022607.01.T01 AT1G09440 41.176 289 165 3 338 623 145 431 1.99e-66 226
MsG0480022607.01.T01 AT1G09440 41.176 289 165 3 338 623 145 431 1.99e-66 226
MsG0480022607.01.T01 AT4G23280 39.319 323 185 8 303 620 298 614 2.37e-66 231
MsG0480022607.01.T01 AT4G21400 37.802 373 196 10 298 655 301 652 2.40e-66 231
MsG0480022607.01.T01 AT4G11460 40.767 287 166 3 337 620 333 618 2.44e-66 232
MsG0480022607.01.T01 AT1G11300 38.904 365 200 10 273 627 430 781 2.45e-66 234
MsG0480022607.01.T01 AT1G01540 41.176 289 165 4 338 623 142 428 2.83e-66 226
MsG0480022607.01.T01 AT4G21410 35.606 396 231 9 275 658 155 538 3.27e-66 228
MsG0480022607.01.T01 AT4G11460 40.690 290 165 3 337 620 333 621 4.42e-66 231
MsG0480022607.01.T01 AT3G28690 40.461 304 164 6 338 629 14 312 5.75e-66 222
MsG0480022607.01.T01 AT3G59110 41.958 286 161 3 338 620 178 461 6.28e-66 226
MsG0480022607.01.T01 AT4G23240 35.484 372 216 7 270 636 265 617 6.35e-66 230
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MsG0480022607.01.T01 AT2G42960 42.308 286 160 3 338 620 171 454 3.63e-65 224
MsG0480022607.01.T01 AT2G42960 42.308 286 160 3 338 620 171 454 3.63e-65 224
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MsG0480022607.01.T01 AT4G23190 35.068 365 220 8 279 634 207 563 5.09e-65 226
MsG0480022607.01.T01 AT1G53420 38.973 331 185 5 296 620 576 895 5.59e-65 232
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MsG0480022607.01.T01 AT1G67520 40.446 314 178 6 338 646 276 585 6.14e-65 226
MsG0480022607.01.T01 AT3G16030 40.575 313 177 6 338 645 515 823 8.67e-65 230
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MsG0480022607.01.T01 AT4G23270 40.550 291 167 4 334 620 310 598 1.58e-64 226
MsG0480022607.01.T01 AT4G02630 42.069 290 162 4 338 623 150 437 1.68e-64 222
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MsG0480022607.01.T01 AT1G52290 36.391 327 193 4 334 655 127 443 4.54e-64 221
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MsG0480022607.01.T01 AT1G56720 37.920 327 194 5 338 657 167 491 5.49e-64 221
MsG0480022607.01.T01 AT1G56720 37.920 327 194 5 338 657 167 491 5.49e-64 221
MsG0480022607.01.T01 AT1G56720 37.920 327 194 5 338 657 167 491 5.49e-64 221
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MsG0480022607.01.T01 AT1G55200 39.867 301 177 4 332 630 361 659 1.05e-63 224
MsG0480022607.01.T01 AT1G55200 39.867 301 177 4 332 630 361 659 1.05e-63 224
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MsG0480022607.01.T01 AT3G13690 40.000 305 179 4 332 634 393 695 2.66e-63 224
MsG0480022607.01.T01 AT3G13690 40.000 305 179 4 332 634 393 695 2.66e-63 224
MsG0480022607.01.T01 AT5G15080 38.689 305 172 5 336 629 128 428 3.38e-63 218
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MsG0480022607.01.T01 AT4G21400 35.162 401 196 10 298 655 275 654 1.95e-62 221
MsG0480022607.01.T01 AT1G56145 35.598 368 193 8 281 620 631 982 2.24e-62 225
MsG0480022607.01.T01 AT3G24550 37.377 305 176 5 338 633 268 566 2.49e-62 220
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MsG0480022607.01.T01 AT5G18500 40.138 289 168 3 338 623 154 440 3.16e-62 216
MsG0480022607.01.T01 AT5G18500 40.138 289 168 3 338 623 154 440 3.16e-62 216
MsG0480022607.01.T01 AT5G18500 40.138 289 168 3 338 623 154 440 3.16e-62 216
MsG0480022607.01.T01 AT5G18500 40.138 289 168 3 338 623 154 440 3.16e-62 216
MsG0480022607.01.T01 AT1G29740 37.500 336 192 6 286 620 629 947 3.83e-62 225
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MsG0480022607.01.T01 AT1G34210 36.615 325 185 7 307 620 265 579 4.17e-62 219
MsG0480022607.01.T01 AT5G40380 41.121 321 169 10 337 648 302 611 5.30e-62 219
MsG0480022607.01.T01 AT1G07870 38.835 309 180 5 332 632 85 392 5.33e-62 213
MsG0480022607.01.T01 AT1G68690 33.687 377 211 5 278 620 278 649 6.39e-62 220
MsG0480022607.01.T01 AT1G68690 33.687 377 211 5 278 620 278 649 6.39e-62 220
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MsG0480022607.01.T01 AT2G18470 37.457 291 174 4 338 623 272 559 4.16e-59 211
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MsG0480022607.01.T01 AT5G18610 40.753 292 167 4 338 624 71 361 9.12e-59 207
MsG0480022607.01.T01 AT5G16900 40.972 288 161 7 336 620 375 656 9.59e-59 211
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MsG0480022607.01.T01 AT1G51870 36.592 358 209 9 273 621 452 800 1.26e-58 213
MsG0480022607.01.T01 AT5G37450 36.261 353 208 7 277 620 531 875 1.35e-58 214
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MsG0480022607.01.T01 AT1G70530 35.588 340 205 6 284 620 263 591 1.63e-58 209
MsG0480022607.01.T01 AT1G61490 39.100 289 171 4 343 628 457 743 2.14e-58 211
MsG0480022607.01.T01 AT1G61490 39.100 289 171 4 343 628 457 743 2.14e-58 211
MsG0480022607.01.T01 AT5G13160 39.726 292 170 4 338 624 74 364 2.19e-58 204
MsG0480022607.01.T01 AT4G27290 38.909 275 162 5 343 613 458 730 2.22e-58 211
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MsG0480022607.01.T01 AT1G61490 39.100 289 171 4 343 628 483 769 2.30e-58 211
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MsG0480022607.01.T01 AT1G61390 34.644 407 232 15 242 628 405 797 1.10e-57 210
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MsG0480022607.01.T01 AT1G61430 39.446 289 168 6 343 627 459 744 4.16e-56 205
MsG0480022607.01.T01 AT2G29000 39.175 291 168 5 333 620 550 834 4.84e-56 206
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MsG0480022607.01.T01 AT2G28250 38.742 302 171 7 337 625 197 497 6.37e-56 200
MsG0480022607.01.T01 AT2G28250 38.742 302 171 7 337 625 197 497 6.37e-56 200
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MsG0480022607.01.T01 AT2G28250 38.742 302 171 7 337 625 197 497 6.37e-56 200
MsG0480022607.01.T01 AT1G26970 37.584 298 169 7 336 620 69 362 6.50e-56 196
MsG0480022607.01.T01 AT1G61380 35.119 336 201 7 298 627 295 619 7.78e-56 202
MsG0480022607.01.T01 AT2G21480 34.637 358 208 7 276 613 436 787 8.53e-56 205
MsG0480022607.01.T01 AT1G29730 40.672 268 153 3 300 565 593 856 9.05e-56 205
MsG0480022607.01.T01 AT1G51860 33.410 437 255 14 198 621 440 853 1.06e-55 205
MsG0480022607.01.T01 AT1G61400 34.078 358 213 8 284 627 438 786 1.28e-55 204
MsG0480022607.01.T01 AT5G11020 34.584 373 219 10 270 626 53 416 1.31e-55 196
MsG0480022607.01.T01 AT5G11020 34.584 373 219 10 270 626 19 382 1.32e-55 195
MsG0480022607.01.T01 AT1G70520 37.419 310 174 6 338 637 313 612 1.38e-55 201
MsG0480022607.01.T01 AT1G24030 36.474 329 196 9 305 622 29 355 1.41e-55 194
MsG0480022607.01.T01 AT1G61610 46.759 216 111 3 338 550 513 727 1.60e-55 202
MsG0480022607.01.T01 AT4G32000 37.075 294 179 5 336 626 158 448 1.61e-55 197
MsG0480022607.01.T01 AT4G00340 37.201 293 173 5 336 620 449 738 1.63e-55 203
MsG0480022607.01.T01 AT4G00340 37.201 293 173 5 336 620 470 759 1.66e-55 203
MsG0480022607.01.T01 AT5G11020 34.670 349 209 8 293 626 11 355 1.71e-55 194
MsG0480022607.01.T01 AT1G07570 37.209 301 169 7 336 620 65 361 1.79e-55 196
MsG0480022607.01.T01 AT5G11020 34.584 373 219 10 270 626 15 378 1.93e-55 194
MsG0480022607.01.T01 AT2G19230 39.057 297 170 6 330 620 548 839 1.94e-55 205
MsG0480022607.01.T01 AT1G61380 34.835 333 206 6 298 627 442 766 2.14e-55 203
MsG0480022607.01.T01 AT3G21340 38.356 292 171 5 333 621 577 862 2.15e-55 204
MsG0480022607.01.T01 AT1G07570 37.209 301 169 7 336 620 54 350 2.28e-55 195
MsG0480022607.01.T01 AT1G07570 37.209 301 169 7 336 620 54 350 2.28e-55 195
MsG0480022607.01.T01 AT1G07570 37.209 301 169 7 336 620 54 350 2.28e-55 195
MsG0480022607.01.T01 AT5G01950 38.305 295 167 5 333 620 524 810 2.42e-55 204
MsG0480022607.01.T01 AT1G61550 38.596 285 170 4 346 627 485 767 2.70e-55 202
MsG0480022607.01.T01 AT1G61420 38.194 288 173 4 343 627 489 774 2.73e-55 203
MsG0480022607.01.T01 AT1G61420 38.194 288 173 4 343 627 489 774 2.73e-55 203
MsG0480022607.01.T01 AT2G19230 39.116 294 168 6 333 620 550 838 2.77e-55 203
MsG0480022607.01.T01 AT3G02810 37.793 299 176 5 332 622 46 342 2.77e-55 198
MsG0480022607.01.T01 AT1G61420 38.194 288 173 4 343 627 487 772 3.06e-55 202
MsG0480022607.01.T01 AT2G02220 34.916 358 212 6 279 621 655 1006 3.41e-55 204
MsG0480022607.01.T01 AT4G04510 35.511 352 205 10 291 630 280 621 3.46e-55 200
MsG0480022607.01.T01 AT2G07180 38.176 296 164 9 338 620 78 367 3.49e-55 195
MsG0480022607.01.T01 AT2G07180 38.176 296 164 9 338 620 78 367 3.49e-55 195
MsG0480022607.01.T01 AT1G66150 38.832 291 161 8 343 621 581 866 3.99e-55 204
MsG0480022607.01.T01 AT4G04510 35.511 352 205 10 291 630 278 619 4.01e-55 200
MsG0480022607.01.T01 AT2G28970 40.070 287 163 6 337 620 433 713 4.28e-55 201
MsG0480022607.01.T01 AT2G23200 37.193 285 175 4 340 622 478 760 4.41e-55 202
MsG0480022607.01.T01 AT4G28670 35.873 315 180 7 338 643 319 620 4.49e-55 199
MsG0480022607.01.T01 AT3G46290 32.764 351 211 7 282 613 404 748 4.51e-55 202
MsG0480022607.01.T01 AT1G11340 48.325 209 104 3 343 548 576 783 4.86e-55 202
MsG0480022607.01.T01 AT5G01020 37.329 292 172 6 338 620 57 346 4.88e-55 194
MsG0480022607.01.T01 AT3G46420 39.927 273 155 5 348 617 531 797 5.75e-55 202
MsG0480022607.01.T01 AT2G28970 40.070 287 163 6 337 620 468 748 5.76e-55 201
MsG0480022607.01.T01 AT5G62710 32.295 353 218 6 294 628 207 556 6.06e-55 198
MsG0480022607.01.T01 AT2G13800 35.517 290 181 4 336 620 144 432 6.25e-55 196
MsG0480022607.01.T01 AT2G13800 35.517 290 181 4 336 620 144 432 6.25e-55 196
MsG0480022607.01.T01 AT5G62710 32.295 353 218 6 294 628 241 590 8.32e-55 198
MsG0480022607.01.T01 AT5G01950 38.305 295 167 5 333 620 609 895 9.28e-55 202
MsG0480022607.01.T01 AT5G01950 38.305 295 167 5 333 620 609 895 9.28e-55 202
MsG0480022607.01.T01 AT5G01950 38.305 295 167 5 333 620 609 895 9.28e-55 202
MsG0480022607.01.T01 AT5G01950 38.305 295 167 5 333 620 609 895 9.28e-55 202
MsG0480022607.01.T01 AT1G61480 38.144 291 175 4 333 620 479 767 9.30e-55 201
MsG0480022607.01.T01 AT1G24030 37.179 312 185 8 320 622 32 341 1.28e-54 191
MsG0480022607.01.T01 AT4G11900 35.890 365 219 10 272 627 457 815 1.35e-54 201
MsG0480022607.01.T01 AT4G23180 46.009 213 109 4 340 548 338 548 1.35e-54 197
MsG0480022607.01.T01 AT4G11900 35.890 365 219 10 272 627 388 746 1.37e-54 200
MsG0480022607.01.T01 AT2G01820 38.276 290 165 7 343 621 578 864 1.47e-54 202
MsG0480022607.01.T01 AT3G23750 39.860 286 162 6 343 620 571 854 1.68e-54 202
MsG0480022607.01.T01 AT4G21230 35.294 374 207 11 273 637 269 616 1.69e-54 198
MsG0480022607.01.T01 AT1G76360 38.614 303 160 8 336 620 149 443 1.77e-54 194
MsG0480022607.01.T01 AT1G24650 38.434 281 159 8 343 613 540 816 1.90e-54 201
MsG0480022607.01.T01 AT2G37050 32.065 368 226 8 263 615 513 871 2.25e-54 201
MsG0480022607.01.T01 AT5G38990 35.374 294 181 4 336 622 511 802 2.80e-54 201
MsG0480022607.01.T01 AT1G79620 35.329 334 199 8 298 618 577 906 2.86e-54 201

Find 144 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 170 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
AAAATCAAAGTTTGGTTAAA+TGG 0.081227 4:+74605734 MsG0480022607.01.T01:CDS
AATGCAAAACTTGGAAATTT+TGG 0.100933 4:+74605880 MsG0480022607.01.T01:CDS
CTACCTGATTGGGTTGAATT+TGG 0.195643 4:+74605127 MsG0480022607.01.T01:CDS
AGATGGAATCACCTTCTATT+TGG 0.211174 4:+74604754 MsG0480022607.01.T01:CDS
TTGAGCCTTAAGGTTTATTA+TGG 0.212641 4:-74606067 None:intergenic
CTTATTGAAGGCCTATTATT+AGG 0.215084 4:-74606240 None:intergenic
AATTCAAACACAAACTCTTC+TGG 0.221424 4:+74606420 MsG0480022607.01.T01:CDS
GAGTACATGGGAGAGGATTT+TGG 0.221869 4:+74605388 MsG0480022607.01.T01:CDS
TCTGAACCACTTATGCTAAA+TGG 0.231414 4:-74606366 None:intergenic
TGGAATAGGTAGTGGAAAAT+TGG 0.236352 4:-74604783 None:intergenic
CTTCAGCAACAGGATTGTTT+TGG 0.236885 4:+74605155 MsG0480022607.01.T01:CDS
TCTGCATATGTATACTTCTT+TGG 0.242112 4:-74605424 None:intergenic
TACATATTGTTGAGTGGGTT+TGG 0.243883 4:+74606100 MsG0480022607.01.T01:CDS
GAGGATTTGGAGGTGTTTAT+AGG 0.246257 4:+74605497 MsG0480022607.01.T01:CDS
CTTCCTGTGGTAGCACATTC+TGG 0.247597 4:-74605976 None:intergenic
GAAACAGATGTGTATAGTTT+TGG 0.260490 4:+74606009 MsG0480022607.01.T01:CDS
ATTCAAAACTATTTCATGTT+TGG 0.280071 4:+74604651 MsG0480022607.01.T01:CDS
ACATATTGTTGAGTGGGTTT+GGG 0.286404 4:+74606101 MsG0480022607.01.T01:CDS
AGGATTTGGAGGTGTTTATA+GGG 0.299955 4:+74605498 MsG0480022607.01.T01:CDS
TTCAAAACTATTTCATGTTT+GGG 0.302172 4:+74604652 MsG0480022607.01.T01:CDS
AAATCAAAGTTTGGTTAAAT+GGG 0.307615 4:+74605735 MsG0480022607.01.T01:CDS
AAACTAGGTCAAGGAGGATT+TGG 0.329079 4:+74605484 MsG0480022607.01.T01:CDS
GTGTGCTTCAAAATCTAAAC+TGG 0.329809 4:-74605215 None:intergenic
GGAATAGGTAGTGGAAAATT+GGG 0.330613 4:-74604782 None:intergenic
GTTGGTGTCATGAAAGAAAA+AGG 0.332441 4:+74605656 MsG0480022607.01.T01:CDS
GTATGATGATTGTTGGTCTT+TGG 0.340045 4:+74606202 MsG0480022607.01.T01:CDS
ACTCTTATGTTGCTATTAAG+AGG 0.356632 4:+74605539 MsG0480022607.01.T01:CDS
ATAGGACTAGCATTGGGATT+AGG 0.363672 4:+74605265 MsG0480022607.01.T01:CDS
CTCATCCTGATCCTAATAAT+AGG 0.372805 4:+74606229 MsG0480022607.01.T01:CDS
AGCAGGGACTTTGGGATACA+TGG 0.375096 4:+74605951 MsG0480022607.01.T01:CDS
ACCTCGTGAGTTGGAGGACT+TGG 0.376307 4:-74604598 None:intergenic
TGAATAGCTTGTCTTATTGA+AGG 0.377245 4:-74606252 None:intergenic
ATTCAAACACAAACTCTTCT+GGG 0.381320 4:+74606421 MsG0480022607.01.T01:CDS
TTTGGCTTCACTTCAGCAAC+AGG 0.384853 4:+74605145 MsG0480022607.01.T01:CDS
TGAGCCTTAAGGTTTATTAT+GGG 0.390633 4:-74606066 None:intergenic
TACAGCTTTAGCAGGGACTT+TGG 0.393804 4:+74605942 MsG0480022607.01.T01:CDS
ACAGCTTTAGCAGGGACTTT+GGG 0.394568 4:+74605943 MsG0480022607.01.T01:CDS
TTGTCATAGTTGAAATTTAA+CGG 0.395906 4:-74604518 None:intergenic
CCCAATGCTAGTCCTATAAC+AGG 0.401787 4:-74605259 None:intergenic
TGTTATATTTGCATGAAGAA+TGG 0.405828 4:+74605797 MsG0480022607.01.T01:CDS
CCAAGAGATGGAAGTGGTAT+TGG 0.411152 4:+74604803 MsG0480022607.01.T01:CDS
AATTTAAGTGTCACCTTCAC+AGG 0.412285 4:+74605043 MsG0480022607.01.T01:CDS
GTTATATTTGCATGAAGAAT+GGG 0.412581 4:+74605798 MsG0480022607.01.T01:CDS
ACAACTCCATTTAGCATAAG+TGG 0.414328 4:+74606360 MsG0480022607.01.T01:CDS
TAAGAGAAGTCCTACCTGAT+TGG 0.414479 4:+74605116 MsG0480022607.01.T01:CDS
CCACTTCCATCTCTTGGAAT+AGG 0.418381 4:-74604797 None:intergenic
CTAGCATTGGGATTAGGAAT+TGG 0.424156 4:+74605271 MsG0480022607.01.T01:CDS
AAAATCTAAACTGGAGTTGA+AGG 0.425839 4:-74605206 None:intergenic
AGCATAAGTGGTTCAGAGAA+AGG 0.426721 4:+74606372 MsG0480022607.01.T01:CDS
AGAAAACCCCTTTGTGGCTG+TGG 0.428973 4:+74604868 MsG0480022607.01.T01:CDS
AACCCAATGGTTCACTAGCT+TGG 0.430519 4:+74604973 MsG0480022607.01.T01:CDS
AGATTCACATCAAGGGATAA+AGG 0.438195 4:+74605570 MsG0480022607.01.T01:CDS
TCAGAGTTTAATGCAAAACT+TGG 0.438536 4:+74605871 MsG0480022607.01.T01:CDS
AAGCCAAATTCAACCCAATC+AGG 0.440278 4:-74605130 None:intergenic
ATGAAATACATATTGTTGAG+TGG 0.440525 4:+74606094 MsG0480022607.01.T01:CDS
TGAATGTCTAAACTTCCATT+TGG 0.440684 4:-74605703 None:intergenic
CCAATACCACTTCCATCTCT+TGG 0.443338 4:-74604803 None:intergenic
GCAGTTGATCCAAGACTAGA+TGG 0.444208 4:+74606153 MsG0480022607.01.T01:CDS
AAGAGAAGTCCTACCTGATT+GGG 0.447613 4:+74605117 MsG0480022607.01.T01:CDS
CGTCCAAGCTAGTGAACCAT+TGG 0.450053 4:-74604976 None:intergenic
TGAAATACATATTGTTGAGT+GGG 0.452301 4:+74606095 MsG0480022607.01.T01:CDS
TTGATACCTTTGTTAATACA+TGG 0.455755 4:+74604894 MsG0480022607.01.T01:CDS
AAAACCCATAATAAACCTTA+AGG 0.462701 4:+74606062 MsG0480022607.01.T01:CDS
GAAGGCCTATTATTAGGATC+AGG 0.463761 4:-74606234 None:intergenic
ATTGGGGTGTGCCAAATAGA+AGG 0.464220 4:-74604765 None:intergenic
TTTCAGTTGTGTTGTGGAAG+AGG 0.467298 4:+74605326 MsG0480022607.01.T01:CDS
ATCAAGTGTATGATGATTGT+TGG 0.482670 4:+74606195 MsG0480022607.01.T01:CDS
AGGTGATTCCATCTGAATGA+TGG 0.483823 4:-74604745 None:intergenic
CTTTCTCGTACCTCGTGAGT+TGG 0.485903 4:-74604607 None:intergenic
CACAAAAGAAAACCCCTTTG+TGG 0.486405 4:+74604862 MsG0480022607.01.T01:CDS
CCTGTACCAACATATCTTGA+GGG 0.487584 4:+74606321 MsG0480022607.01.T01:CDS
CCATCTCTTGGAATAGGTAG+TGG 0.489201 4:-74604791 None:intergenic
CCCTCAAGATATGTTGGTAC+AGG 0.494915 4:-74606321 None:intergenic
GAAGGTGACACTTAAATTGT+TGG 0.495353 4:-74605038 None:intergenic
TCTCGTACCTCGTGAGTTGG+AGG 0.498183 4:-74604604 None:intergenic
GCATTGGGATTAGGAATTGG+TGG 0.498956 4:+74605274 MsG0480022607.01.T01:CDS
GGCATACTTGATGAAAGATT+AGG 0.499952 4:-74606300 None:intergenic
TGGTGAATTTGAAGAGTACA+TGG 0.500387 4:+74605375 MsG0480022607.01.T01:CDS
GCACAAACTACAGCTTTAGC+AGG 0.508409 4:+74605934 MsG0480022607.01.T01:CDS
ATCTAGTGCAATTGATCGGT+TGG 0.508945 4:+74605638 MsG0480022607.01.T01:CDS
TCAAAATCTCCATCTAGTCT+TGG 0.509236 4:-74606162 None:intergenic
ACCTGTTATAGGACTAGCAT+TGG 0.509283 4:+74605258 MsG0480022607.01.T01:CDS
CATATTGTTGAGTGGGTTTG+GGG 0.509763 4:+74606102 MsG0480022607.01.T01:CDS
ATCAAATTCCACAGCCACAA+AGG 0.515723 4:-74604876 None:intergenic
TCAAATTCCACAGCCACAAA+GGG 0.515941 4:-74604875 None:intergenic
CCACTACCTATTCCAAGAGA+TGG 0.517614 4:+74604791 MsG0480022607.01.T01:CDS
GTCCAAGCTAGTGAACCATT+GGG 0.518127 4:-74604975 None:intergenic
AGAATAGAGAAGCGACATAG+AGG 0.519456 4:-74606475 None:intergenic
GGTGATTCCATCTGAATGAT+GGG 0.525949 4:-74604744 None:intergenic
CTAGGTCAAGGAGGATTTGG+AGG 0.526045 4:+74605487 MsG0480022607.01.T01:CDS
GGATTTGGAGGTGTTTATAG+GGG 0.526695 4:+74605499 MsG0480022607.01.T01:CDS
CCTGTTATAGGACTAGCATT+GGG 0.528049 4:+74605259 MsG0480022607.01.T01:CDS
GTCTTATTTCAGTTGTGTTG+TGG 0.529123 4:+74605320 MsG0480022607.01.T01:CDS
AAAGAAAGTGAAGAGGAAGA+TGG 0.534581 4:+74605355 MsG0480022607.01.T01:CDS
AACAAAACCCATCATTCAGA+TGG 0.537584 4:+74604737 MsG0480022607.01.T01:CDS
AGGTTTGTGGACCATGCAAA+AGG 0.538489 4:+74605910 MsG0480022607.01.T01:CDS
GTATATGAGTACATGCCAAA+TGG 0.547649 4:+74605688 MsG0480022607.01.T01:CDS
ATTTGAAGAGTACATGGGAG+AGG 0.548298 4:+74605381 MsG0480022607.01.T01:CDS
AAAAGCAAGTAACATCATGT+TGG 0.549295 4:+74605846 MsG0480022607.01.T01:CDS
GGAGTTGTGAATGAATTCAA+AGG 0.549837 4:-74606345 None:intergenic
GTTACTTTAGAGATAGCTTG+TGG 0.555052 4:+74606036 MsG0480022607.01.T01:CDS
GAATAGAGAAGCGACATAGA+GGG 0.555406 4:-74606474 None:intergenic
GCCTGTACCAACATATCTTG+AGG 0.556451 4:+74606320 MsG0480022607.01.T01:CDS
CTCTTATGTTGCTATTAAGA+GGG 0.556811 4:+74605540 MsG0480022607.01.T01:CDS
ATATACAATAGCTAGAGGCT+TGG 0.557375 4:+74605765 MsG0480022607.01.T01:CDS
TGATACCTTTGTTAATACAT+GGG 0.558571 4:+74604895 MsG0480022607.01.T01:CDS
GTGGAAGAAAGAAAGTGAAG+AGG 0.559394 4:+74605348 MsG0480022607.01.T01:CDS
GAGTTGTGAATGAATTCAAA+GGG 0.560651 4:-74606344 None:intergenic
GTATCAGAAGATTCACATCA+AGG 0.566705 4:+74605562 MsG0480022607.01.T01:CDS
AAAGGGCCCTCAAGATATGT+TGG 0.572210 4:-74606327 None:intergenic
CAGTTGTGTTGTGGAAGAGG+TGG 0.575925 4:+74605329 MsG0480022607.01.T01:CDS
TTCACTAGCTTGGACGAAAG+AGG 0.576826 4:+74604983 MsG0480022607.01.T01:CDS
GGATCCTACATATGATCATG+TGG 0.577792 4:+74604916 MsG0480022607.01.T01:CDS
GTTTACTACTACAACTTCTG+AGG 0.579955 4:+74606443 MsG0480022607.01.T01:CDS
GTTGGAGGACTTGGTTGTCA+TGG 0.582879 4:-74604589 None:intergenic
AATCAAAGTTTGGTTAAATG+GGG 0.589896 4:+74605736 MsG0480022607.01.T01:CDS
GATGAACATAAACTAGGTCA+AGG 0.590441 4:+74605475 MsG0480022607.01.T01:CDS
TTCTTTACTAGCTCTTCCTG+TGG 0.603132 4:-74605989 None:intergenic
TATCAGAAGATTCACATCAA+GGG 0.604813 4:+74605563 MsG0480022607.01.T01:CDS
GACACTTAAATTGTTGGACA+TGG 0.604989 4:-74605032 None:intergenic
CGAAATCTAGTGCAATTGAT+CGG 0.605365 4:+74605634 MsG0480022607.01.T01:CDS
ATCCCCACATGATCATATGT+AGG 0.607740 4:-74604920 None:intergenic
GCTCCAGAATGTGCTACCAC+AGG 0.610890 4:+74605973 MsG0480022607.01.T01:CDS
CCTATTCCAAGAGATGGAAG+TGG 0.611488 4:+74604797 MsG0480022607.01.T01:CDS
CTTGATGAAAGATTAGGCAT+CGG 0.612414 4:-74606294 None:intergenic
ATATTGTTGAGTGGGTTTGG+GGG 0.615622 4:+74606103 MsG0480022607.01.T01:CDS
AGGAACATACTCTTAGGTCA+TGG 0.615629 4:+74605182 MsG0480022607.01.T01:CDS
GAATAGGTAGTGGAAAATTG+GGG 0.617955 4:-74604781 None:intergenic
TTCAAAGATGAACATAAACT+AGG 0.620533 4:+74605469 MsG0480022607.01.T01:CDS
GATCCTACATATGATCATGT+GGG 0.624142 4:+74604917 MsG0480022607.01.T01:CDS
TTTGAAGCACACAAAGACGA+AGG 0.637414 4:+74605226 MsG0480022607.01.T01:CDS
GTTGTTGCATAACGATGCCA+TGG 0.637517 4:-74604420 None:intergenic
GTTAGATATACAATAGCTAG+AGG 0.638725 4:+74605760 MsG0480022607.01.T01:CDS
CAAATTCAACCCAATCAGGT+AGG 0.640214 4:-74605126 None:intergenic
AGGTACGAGAAAGACAGCAT+AGG 0.643321 4:+74604617 MsG0480022607.01.T01:CDS
GGTGAATTTGAAGAGTACAT+GGG 0.650285 4:+74605376 MsG0480022607.01.T01:CDS
ATCCTACATATGATCATGTG+GGG 0.653246 4:+74604918 MsG0480022607.01.T01:CDS
GCTCTTCTTACACAACCCAA+TGG 0.658320 4:+74604960 MsG0480022607.01.T01:CDS
AGGATCCCATGTATTAACAA+AGG 0.660583 4:-74604900 None:intergenic
CACAAACTACAGCTTTAGCA+GGG 0.662987 4:+74605935 MsG0480022607.01.T01:CDS
GTTATCTCGATAACCTGTGA+AGG 0.678036 4:-74605056 None:intergenic
GAACATAAACTAGGTCAAGG+AGG 0.688015 4:+74605478 MsG0480022607.01.T01:CDS
CAAATTCCACAGCCACAAAG+GGG 0.688652 4:-74604874 None:intergenic
ACCAAGTCCTCCAACTCACG+AGG 0.689123 4:+74604597 MsG0480022607.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! TAAAAATTATTAGCAAGTTA+AGG + Chr4:74605608-74605627 MsG0480022607.01.T01:CDS 15.0%
!! AAAATCAAAGTTTGGTTAAA+TGG + Chr4:74605734-74605753 MsG0480022607.01.T01:CDS 20.0%
!! AAATCAAAGTTTGGTTAAAT+GGG + Chr4:74605735-74605754 MsG0480022607.01.T01:CDS 20.0%
!! ATTCAAAACTATTTCATGTT+TGG + Chr4:74604651-74604670 MsG0480022607.01.T01:CDS 20.0%
!! TTCAAAACTATTTCATGTTT+GGG + Chr4:74604652-74604671 MsG0480022607.01.T01:CDS 20.0%
!! TTGTCATAGTTGAAATTTAA+CGG - Chr4:74604521-74604540 None:intergenic 20.0%
!!! TCTTTTCAAAAATCAAAGTT+TGG + Chr4:74605726-74605745 MsG0480022607.01.T01:CDS 20.0%
! AAAACCCATAATAAACCTTA+AGG + Chr4:74606062-74606081 MsG0480022607.01.T01:CDS 25.0%
! AATCAAAGTTTGGTTAAATG+GGG + Chr4:74605736-74605755 MsG0480022607.01.T01:CDS 25.0%
! ATGAAATACATATTGTTGAG+TGG + Chr4:74606094-74606113 MsG0480022607.01.T01:CDS 25.0%
! GTTATATTTGCATGAAGAAT+GGG + Chr4:74605798-74605817 MsG0480022607.01.T01:CDS 25.0%
! TGAAATACATATTGTTGAGT+GGG + Chr4:74606095-74606114 MsG0480022607.01.T01:CDS 25.0%
! TGATACCTTTGTTAATACAT+GGG + Chr4:74604895-74604914 MsG0480022607.01.T01:CDS 25.0%
! TGTTATATTTGCATGAAGAA+TGG + Chr4:74605797-74605816 MsG0480022607.01.T01:CDS 25.0%
! TTCAAAGATGAACATAAACT+AGG + Chr4:74605469-74605488 MsG0480022607.01.T01:CDS 25.0%
! TTGATACCTTTGTTAATACA+TGG + Chr4:74604894-74604913 MsG0480022607.01.T01:CDS 25.0%
!! AATGCAAAACTTGGAAATTT+TGG + Chr4:74605880-74605899 MsG0480022607.01.T01:CDS 25.0%
!!! ACACATGCTTTAAATTTTTC+AGG + Chr4:74604557-74604576 MsG0480022607.01.T01:CDS 25.0%
AAAAGCAAGTAACATCATGT+TGG + Chr4:74605846-74605865 MsG0480022607.01.T01:CDS 30.0%
AAAATCTAAACTGGAGTTGA+AGG - Chr4:74605209-74605228 None:intergenic 30.0%
AATTCAAACACAAACTCTTC+TGG + Chr4:74606420-74606439 MsG0480022607.01.T01:CDS 30.0%
ATCAAGTGTATGATGATTGT+TGG + Chr4:74606195-74606214 MsG0480022607.01.T01:CDS 30.0%
ATTCAAACACAAACTCTTCT+GGG + Chr4:74606421-74606440 MsG0480022607.01.T01:CDS 30.0%
CTTATTGAAGGCCTATTATT+AGG - Chr4:74606243-74606262 None:intergenic 30.0%
GAGTTGTGAATGAATTCAAA+GGG - Chr4:74606347-74606366 None:intergenic 30.0%
GTTAGATATACAATAGCTAG+AGG + Chr4:74605760-74605779 MsG0480022607.01.T01:CDS 30.0%
TATCAGAAGATTCACATCAA+GGG + Chr4:74605563-74605582 MsG0480022607.01.T01:CDS 30.0%
TCAGAGTTTAATGCAAAACT+TGG + Chr4:74605871-74605890 MsG0480022607.01.T01:CDS 30.0%
TCTGCATATGTATACTTCTT+TGG - Chr4:74605427-74605446 None:intergenic 30.0%
TGAATGTCTAAACTTCCATT+TGG - Chr4:74605706-74605725 None:intergenic 30.0%
TGAGCCTTAAGGTTTATTAT+GGG - Chr4:74606069-74606088 None:intergenic 30.0%
TTGAGCCTTAAGGTTTATTA+TGG - Chr4:74606070-74606089 None:intergenic 30.0%
! ACTCTTATGTTGCTATTAAG+AGG + Chr4:74605539-74605558 MsG0480022607.01.T01:CDS 30.0%
! CTCTTATGTTGCTATTAAGA+GGG + Chr4:74605540-74605559 MsG0480022607.01.T01:CDS 30.0%
! GAAACAGATGTGTATAGTTT+TGG + Chr4:74606009-74606028 MsG0480022607.01.T01:CDS 30.0%
! GGGTTTTCTTTTGTGTAATT+TGG - Chr4:74604857-74604876 None:intergenic 30.0%
! TGAATAGCTTGTCTTATTGA+AGG - Chr4:74606255-74606274 None:intergenic 30.0%
! TTTCATTTTCTTGAGCCTTA+AGG - Chr4:74606080-74606099 None:intergenic 30.0%
!!! ATTGGTGGATTCATTTTGAT+TGG + Chr4:74605289-74605308 MsG0480022607.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTGGAAATTTTGGTTTAGCA+AGG + Chr4:74605890-74605909 MsG0480022607.01.T01:CDS 30.0%
AAAGAAAGTGAAGAGGAAGA+TGG + Chr4:74605355-74605374 MsG0480022607.01.T01:CDS 35.0%
AACAAAACCCATCATTCAGA+TGG + Chr4:74604737-74604756 MsG0480022607.01.T01:CDS 35.0%
AATTTAAGTGTCACCTTCAC+AGG + Chr4:74605043-74605062 MsG0480022607.01.T01:CDS 35.0%
ACAACTCCATTTAGCATAAG+TGG + Chr4:74606360-74606379 MsG0480022607.01.T01:CDS 35.0%
AGATGGAATCACCTTCTATT+TGG + Chr4:74604754-74604773 MsG0480022607.01.T01:CDS 35.0%
AGATTCACATCAAGGGATAA+AGG + Chr4:74605570-74605589 MsG0480022607.01.T01:CDS 35.0%
AGGATCCCATGTATTAACAA+AGG - Chr4:74604903-74604922 None:intergenic 35.0%
ATATACAATAGCTAGAGGCT+TGG + Chr4:74605765-74605784 MsG0480022607.01.T01:CDS 35.0%
ATCCTACATATGATCATGTG+GGG + Chr4:74604918-74604937 MsG0480022607.01.T01:CDS 35.0%
CGAAATCTAGTGCAATTGAT+CGG + Chr4:74605634-74605653 MsG0480022607.01.T01:CDS 35.0%
CTCATCCTGATCCTAATAAT+AGG + Chr4:74606229-74606248 MsG0480022607.01.T01:CDS 35.0%
CTTGATGAAAGATTAGGCAT+CGG - Chr4:74606297-74606316 None:intergenic 35.0%
GAAGGTGACACTTAAATTGT+TGG - Chr4:74605041-74605060 None:intergenic 35.0%
GACACTTAAATTGTTGGACA+TGG - Chr4:74605035-74605054 None:intergenic 35.0%
GATCCTACATATGATCATGT+GGG + Chr4:74604917-74604936 MsG0480022607.01.T01:CDS 35.0%
GATGAACATAAACTAGGTCA+AGG + Chr4:74605475-74605494 MsG0480022607.01.T01:CDS 35.0%
GGAGTTGTGAATGAATTCAA+AGG - Chr4:74606348-74606367 None:intergenic 35.0%
GGCATACTTGATGAAAGATT+AGG - Chr4:74606303-74606322 None:intergenic 35.0%
GTATATGAGTACATGCCAAA+TGG + Chr4:74605688-74605707 MsG0480022607.01.T01:CDS 35.0%
GTATCAGAAGATTCACATCA+AGG + Chr4:74605562-74605581 MsG0480022607.01.T01:CDS 35.0%
GTGTGCTTCAAAATCTAAAC+TGG - Chr4:74605218-74605237 None:intergenic 35.0%
GTTTACTACTACAACTTCTG+AGG + Chr4:74606443-74606462 MsG0480022607.01.T01:CDS 35.0%
TCAAAATCTCCATCTAGTCT+TGG - Chr4:74606165-74606184 None:intergenic 35.0%
TCTGAACCACTTATGCTAAA+TGG - Chr4:74606369-74606388 None:intergenic 35.0%
! ACATATTGTTGAGTGGGTTT+GGG + Chr4:74606101-74606120 MsG0480022607.01.T01:CDS 35.0%
! CATGTGTTTTGTCACTACTA+AGG - Chr4:74604544-74604563 None:intergenic 35.0%
! GGTGAATTTGAAGAGTACAT+GGG + Chr4:74605376-74605395 MsG0480022607.01.T01:CDS 35.0%
! GTTACTTTAGAGATAGCTTG+TGG + Chr4:74606036-74606055 MsG0480022607.01.T01:CDS 35.0%
! TACATATTGTTGAGTGGGTT+TGG + Chr4:74606100-74606119 MsG0480022607.01.T01:CDS 35.0%
! TGGTGAATTTGAAGAGTACA+TGG + Chr4:74605375-74605394 MsG0480022607.01.T01:CDS 35.0%
! TTCAGCAACAGGATTGTTTT+GGG + Chr4:74605156-74605175 MsG0480022607.01.T01:CDS 35.0%
!! ACTAGATGGAGATTTTGAAG+AGG + Chr4:74606167-74606186 MsG0480022607.01.T01:CDS 35.0%
!! AGGATTTGGAGGTGTTTATA+GGG + Chr4:74605498-74605517 MsG0480022607.01.T01:CDS 35.0%
!! GAATAGGTAGTGGAAAATTG+GGG - Chr4:74604784-74604803 None:intergenic 35.0%
!! GGAATAGGTAGTGGAAAATT+GGG - Chr4:74604785-74604804 None:intergenic 35.0%
!! GTATGATGATTGTTGGTCTT+TGG + Chr4:74606202-74606221 MsG0480022607.01.T01:CDS 35.0%
!! GTCTTATTTCAGTTGTGTTG+TGG + Chr4:74605320-74605339 MsG0480022607.01.T01:CDS 35.0%
!! GTTGGTGTCATGAAAGAAAA+AGG + Chr4:74605656-74605675 MsG0480022607.01.T01:CDS 35.0%
!! TGGAATAGGTAGTGGAAAAT+TGG - Chr4:74604786-74604805 None:intergenic 35.0%
!!! TGAATGATGGGTTTTGTTGA+GGG - Chr4:74604735-74604754 None:intergenic 35.0%
!!! TTTTGGTTTAGCAAGGTTTG+TGG + Chr4:74605897-74605916 MsG0480022607.01.T01:CDS 35.0%
AAACTAGGTCAAGGAGGATT+TGG + Chr4:74605484-74605503 MsG0480022607.01.T01:CDS 40.0%
AAGAGAAGTCCTACCTGATT+GGG + Chr4:74605117-74605136 MsG0480022607.01.T01:CDS 40.0%
AAGCCAAATTCAACCCAATC+AGG - Chr4:74605133-74605152 None:intergenic 40.0%
AGAATAGAGAAGCGACATAG+AGG - Chr4:74606478-74606497 None:intergenic 40.0%
AGCATAAGTGGTTCAGAGAA+AGG + Chr4:74606372-74606391 MsG0480022607.01.T01:CDS 40.0%
AGGAACATACTCTTAGGTCA+TGG + Chr4:74605182-74605201 MsG0480022607.01.T01:CDS 40.0%
AGGTGATTCCATCTGAATGA+TGG - Chr4:74604748-74604767 None:intergenic 40.0%
ATCAAATTCCACAGCCACAA+AGG - Chr4:74604879-74604898 None:intergenic 40.0%
ATCCCCACATGATCATATGT+AGG - Chr4:74604923-74604942 None:intergenic 40.0%
ATCTAGTGCAATTGATCGGT+TGG + Chr4:74605638-74605657 MsG0480022607.01.T01:CDS 40.0%
CAAATTCAACCCAATCAGGT+AGG - Chr4:74605129-74605148 None:intergenic 40.0%
CACAAAAGAAAACCCCTTTG+TGG + Chr4:74604862-74604881 MsG0480022607.01.T01:CDS 40.0%
CACAAAGACGAAGGAAAAAC+AGG + Chr4:74605235-74605254 MsG0480022607.01.T01:CDS 40.0%
CCTGTACCAACATATCTTGA+GGG + Chr4:74606321-74606340 MsG0480022607.01.T01:CDS 40.0%
GAACATAAACTAGGTCAAGG+AGG + Chr4:74605478-74605497 MsG0480022607.01.T01:CDS 40.0%
GAAGGCCTATTATTAGGATC+AGG - Chr4:74606237-74606256 None:intergenic 40.0%
GAATAGAGAAGCGACATAGA+GGG - Chr4:74606477-74606496 None:intergenic 40.0%
GGAAAAACAGGACCTGTTAT+AGG + Chr4:74605247-74605266 MsG0480022607.01.T01:CDS 40.0%
GGATCCTACATATGATCATG+TGG + Chr4:74604916-74604935 MsG0480022607.01.T01:CDS 40.0%
GGTGATTCCATCTGAATGAT+GGG - Chr4:74604747-74604766 None:intergenic 40.0%
GTGGAAGAAAGAAAGTGAAG+AGG + Chr4:74605348-74605367 MsG0480022607.01.T01:CDS 40.0%
GTTATCTCGATAACCTGTGA+AGG - Chr4:74605059-74605078 None:intergenic 40.0%
TAAGAGAAGTCCTACCTGAT+TGG + Chr4:74605116-74605135 MsG0480022607.01.T01:CDS 40.0%
TCAAATTCCACAGCCACAAA+GGG - Chr4:74604878-74604897 None:intergenic 40.0%
TTTCAGTTGTGTTGTGGAAG+AGG + Chr4:74605326-74605345 MsG0480022607.01.T01:CDS 40.0%
! ACCTGTTATAGGACTAGCAT+TGG + Chr4:74605258-74605277 MsG0480022607.01.T01:CDS 40.0%
! ATAGGACTAGCATTGGGATT+AGG + Chr4:74605265-74605284 MsG0480022607.01.T01:CDS 40.0%
! ATATTGTTGAGTGGGTTTGG+GGG + Chr4:74606103-74606122 MsG0480022607.01.T01:CDS 40.0%
! ATTTGAAGAGTACATGGGAG+AGG + Chr4:74605381-74605400 MsG0480022607.01.T01:CDS 40.0%
! CACAAACTACAGCTTTAGCA+GGG + Chr4:74605935-74605954 MsG0480022607.01.T01:CDS 40.0%
! CATATTGTTGAGTGGGTTTG+GGG + Chr4:74606102-74606121 MsG0480022607.01.T01:CDS 40.0%
! CCTGTTATAGGACTAGCATT+GGG + Chr4:74605259-74605278 MsG0480022607.01.T01:CDS 40.0%
! CTAGCATTGGGATTAGGAAT+TGG + Chr4:74605271-74605290 MsG0480022607.01.T01:CDS 40.0%
! CTTCAGCAACAGGATTGTTT+TGG + Chr4:74605155-74605174 MsG0480022607.01.T01:CDS 40.0%
! TTCTTTACTAGCTCTTCCTG+TGG - Chr4:74605992-74606011 None:intergenic 40.0%
! TTTGAAGCACACAAAGACGA+AGG + Chr4:74605226-74605245 MsG0480022607.01.T01:CDS 40.0%
!! CTACCTGATTGGGTTGAATT+TGG + Chr4:74605127-74605146 MsG0480022607.01.T01:CDS 40.0%
!! GAGGATTTGGAGGTGTTTAT+AGG + Chr4:74605497-74605516 MsG0480022607.01.T01:CDS 40.0%
!! GGATTTGGAGGTGTTTATAG+GGG + Chr4:74605499-74605518 MsG0480022607.01.T01:CDS 40.0%
!! TAGTTTGTGCACCTTTTGCA+TGG - Chr4:74605924-74605943 None:intergenic 40.0%
!! TCAGCAACAGGATTGTTTTG+GGG + Chr4:74605157-74605176 MsG0480022607.01.T01:CDS 40.0%
!!! CTGAATGATGGGTTTTGTTG+AGG - Chr4:74604736-74604755 None:intergenic 40.0%
AAAGGGCCCTCAAGATATGT+TGG - Chr4:74606330-74606349 None:intergenic 45.0%
AACCCAATGGTTCACTAGCT+TGG + Chr4:74604973-74604992 MsG0480022607.01.T01:CDS 45.0%
AGGTACGAGAAAGACAGCAT+AGG + Chr4:74604617-74604636 MsG0480022607.01.T01:CDS 45.0%
AGGTTTGTGGACCATGCAAA+AGG + Chr4:74605910-74605929 MsG0480022607.01.T01:CDS 45.0%
ATTGGGGTGTGCCAAATAGA+AGG - Chr4:74604768-74604787 None:intergenic 45.0%
CAAATTCCACAGCCACAAAG+GGG - Chr4:74604877-74604896 None:intergenic 45.0%
CCAAGAGATGGAAGTGGTAT+TGG + Chr4:74604803-74604822 MsG0480022607.01.T01:CDS 45.0%
CCAATACCACTTCCATCTCT+TGG - Chr4:74604806-74604825 None:intergenic 45.0%
CCACTACCTATTCCAAGAGA+TGG + Chr4:74604791-74604810 MsG0480022607.01.T01:CDS 45.0%
CCACTTCCATCTCTTGGAAT+AGG - Chr4:74604800-74604819 None:intergenic 45.0%
CCATCTCTTGGAATAGGTAG+TGG - Chr4:74604794-74604813 None:intergenic 45.0%
CCCAATGCTAGTCCTATAAC+AGG - Chr4:74605262-74605281 None:intergenic 45.0%
CCCTCAAGATATGTTGGTAC+AGG - Chr4:74606324-74606343 None:intergenic 45.0%
CCTATTCCAAGAGATGGAAG+TGG + Chr4:74604797-74604816 MsG0480022607.01.T01:CDS 45.0%
GCAGTTGATCCAAGACTAGA+TGG + Chr4:74606153-74606172 MsG0480022607.01.T01:CDS 45.0%
GCATTGGGATTAGGAATTGG+TGG + Chr4:74605274-74605293 MsG0480022607.01.T01:CDS 45.0%
GCCTGTACCAACATATCTTG+AGG + Chr4:74606320-74606339 MsG0480022607.01.T01:CDS 45.0%
GCTCTTCTTACACAACCCAA+TGG + Chr4:74604960-74604979 MsG0480022607.01.T01:CDS 45.0%
GTCCAAGCTAGTGAACCATT+GGG - Chr4:74604978-74604997 None:intergenic 45.0%
! ACAGCTTTAGCAGGGACTTT+GGG + Chr4:74605943-74605962 MsG0480022607.01.T01:CDS 45.0%
! GAGTACATGGGAGAGGATTT+TGG + Chr4:74605388-74605407 MsG0480022607.01.T01:CDS 45.0%
! GCACAAACTACAGCTTTAGC+AGG + Chr4:74605934-74605953 MsG0480022607.01.T01:CDS 45.0%
! TACAGCTTTAGCAGGGACTT+TGG + Chr4:74605942-74605961 MsG0480022607.01.T01:CDS 45.0%
! TTCACTAGCTTGGACGAAAG+AGG + Chr4:74604983-74605002 MsG0480022607.01.T01:CDS 45.0%
! TTTGGCTTCACTTCAGCAAC+AGG + Chr4:74605145-74605164 MsG0480022607.01.T01:CDS 45.0%
! TTTGGGGGCTTTATGGAAGA+GGG + Chr4:74606118-74606137 MsG0480022607.01.T01:CDS 45.0%
!! ATGGGAGAGGATTTTGGAAG+AGG + Chr4:74605394-74605413 MsG0480022607.01.T01:CDS 45.0%
!! TGGGAGAGGATTTTGGAAGA+GGG + Chr4:74605395-74605414 MsG0480022607.01.T01:CDS 45.0%
!!! AGCAACAGGATTGTTTTGGG+GGG + Chr4:74605159-74605178 MsG0480022607.01.T01:CDS 45.0%
!!! CAGCAACAGGATTGTTTTGG+GGG + Chr4:74605158-74605177 MsG0480022607.01.T01:CDS 45.0%
AGAAAACCCCTTTGTGGCTG+TGG + Chr4:74604868-74604887 MsG0480022607.01.T01:CDS 50.0%
CAGTTGTGTTGTGGAAGAGG+TGG + Chr4:74605329-74605348 MsG0480022607.01.T01:CDS 50.0%
CGTCCAAGCTAGTGAACCAT+TGG - Chr4:74604979-74604998 None:intergenic 50.0%
CTAGGTCAAGGAGGATTTGG+AGG + Chr4:74605487-74605506 MsG0480022607.01.T01:CDS 50.0%
CTTCCTGTGGTAGCACATTC+TGG - Chr4:74605979-74605998 None:intergenic 50.0%
CTTTCTCGTACCTCGTGAGT+TGG - Chr4:74604610-74604629 None:intergenic 50.0%
! GTTGGAGGACTTGGTTGTCA+TGG - Chr4:74604592-74604611 None:intergenic 50.0%
! GTTTGGGGGCTTTATGGAAG+AGG + Chr4:74606117-74606136 MsG0480022607.01.T01:CDS 50.0%
!! AGCAGGGACTTTGGGATACA+TGG + Chr4:74605951-74605970 MsG0480022607.01.T01:CDS 50.0%
!! GAGGATTTTGGAAGAGGGAC+AGG + Chr4:74605400-74605419 MsG0480022607.01.T01:CDS 50.0%
!!! AACAGGATTGTTTTGGGGGG+AGG + Chr4:74605162-74605181 MsG0480022607.01.T01:CDS 50.0%
ACCAAGTCCTCCAACTCACG+AGG + Chr4:74604597-74604616 MsG0480022607.01.T01:CDS 55.0%
GCTCCAGAATGTGCTACCAC+AGG + Chr4:74605973-74605992 MsG0480022607.01.T01:CDS 55.0%
GGGGGGAGGAACATACTCTT+AGG + Chr4:74605176-74605195 MsG0480022607.01.T01:CDS 55.0%
! ACCTCGTGAGTTGGAGGACT+TGG - Chr4:74604601-74604620 None:intergenic 55.0%
! GAGTGGGTTTGGGGGCTTTA+TGG + Chr4:74606111-74606130 MsG0480022607.01.T01:CDS 55.0%
! TCTCGTACCTCGTGAGTTGG+AGG - Chr4:74604607-74604626 None:intergenic 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr4 gene 74604422 74606503 74604422 ID=MsG0480022607.01;Name=MsG0480022607.01
Chr4 mRNA 74604422 74606503 74604422 ID=MsG0480022607.01.T01;Parent=MsG0480022607.01;Name=MsG0480022607.01.T01;_AED=0.48;_eAED=0.48;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|693
Chr4 exon 74604422 74606503 74604422 ID=MsG0480022607.01.T01:exon:22923;Parent=MsG0480022607.01.T01
Chr4 CDS 74604422 74606503 74604422 ID=MsG0480022607.01.T01:cds;Parent=MsG0480022607.01.T01
Gene Sequence

>MsG0480022607.01.T01

ATGGCATCGTTATGCAACAACTACATGAAAACTCATCGTTTTGCTTTCTTTCATGTAACACTATCATTCTTGCTTCTTGTAACATTTCATGCAGCTCCGTTAAATTTCAACTATGACAACCTTAGTAGTGACAAAACACATGCTTTAAATTTTTCAGGTGATGTCGACCATGACAACCAAGTCCTCCAACTCACGAGGTACGAGAAAGACAGCATAGGTAGAGTCACATATTCAAAACTATTTCATGTTTGGGACATAAATACAAGTGAAGTCACAGATTTTACTACTCGTTTCTCATTTACTATCAACACCCTCAACAAAACCCATCATTCAGATGGAATCACCTTCTATTTGGCACACCCCAATTTTCCACTACCTATTCCAAGAGATGGAAGTGGTATTGGTCTCATGAGCAGTGTTCAATTAGCTACTCCAAATTACACAAAAGAAAACCCCTTTGTGGCTGTGGAATTTGATACCTTTGTTAATACATGGGATCCTACATATGATCATGTGGGGATTGATGTTAATTCAATCAGCTCTTCTTACACAACCCAATGGTTCACTAGCTTGGACGAAAGAGGATATGATGTTGATGTTAGTTACAATTCCATGTCCAACAATTTAAGTGTCACCTTCACAGGTTATCGAGATAACAACACAATCGAACAGAATTTGTTTCAAATTGTCAATCTAAGAGAAGTCCTACCTGATTGGGTTGAATTTGGCTTCACTTCAGCAACAGGATTGTTTTGGGGGGAGGAACATACTCTTAGGTCATGGTCCTTCAACTCCAGTTTAGATTTTGAAGCACACAAAGACGAAGGAAAAACAGGACCTGTTATAGGACTAGCATTGGGATTAGGAATTGGTGGATTCATTTTGATTGGTGTATTGAGTCTTATTTCAGTTGTGTTGTGGAAGAGGTGGAAGAAAGAAAGTGAAGAGGAAGATGGTGAATTTGAAGAGTACATGGGAGAGGATTTTGGAAGAGGGACAGGACCAAAGAAGTATACATATGCAGAATTAGCACAAGCAGCTAATAATTTCAAAGATGAACATAAACTAGGTCAAGGAGGATTTGGAGGTGTTTATAGGGGTTTTCTTAAAGACACAAACTCTTATGTTGCTATTAAGAGGGTATCAGAAGATTCACATCAAGGGATAAAGGAGTTCGCATCAGAAGTAAAAATTATTAGCAAGTTAAGGCATCGAAATCTAGTGCAATTGATCGGTTGGTGTCATGAAAGAAAAAGGCTTTTACTTGTATATGAGTACATGCCAAATGGAAGTTTAGACATTCATCTTTTCAAAAATCAAAGTTTGGTTAAATGGGGTGTTAGATATACAATAGCTAGAGGCTTGGCTTCTGCATTGTTATATTTGCATGAAGAATGGGAACAATGTGTTGTACATAGAGACATAAAAGCAAGTAACATCATGTTGGATTCAGAGTTTAATGCAAAACTTGGAAATTTTGGTTTAGCAAGGTTTGTGGACCATGCAAAAGGTGCACAAACTACAGCTTTAGCAGGGACTTTGGGATACATGGCTCCAGAATGTGCTACCACAGGAAGAGCTAGTAAAGAAACAGATGTGTATAGTTTTGGAATAGTTACTTTAGAGATAGCTTGTGGAAGAAAACCCATAATAAACCTTAAGGCTCAAGAAAATGAAATACATATTGTTGAGTGGGTTTGGGGGCTTTATGGAAGAGGGAGAATTCTTGAAGCAGTTGATCCAAGACTAGATGGAGATTTTGAAGAGGAGCAAATCAAGTGTATGATGATTGTTGGTCTTTGGTGTGCTCATCCTGATCCTAATAATAGGCCTTCAATAAGACAAGCTATTCAAGTGCTTAATTTTGAAGCTCCGATGCCTAATCTTTCATCAAGTATGCCTGTACCAACATATCTTGAGGGCCCTTTGAATTCATTCACAACTCCATTTAGCATAAGTGGTTCAGAGAAAGGTCAAAGCAAGAATATAATAAACTTTAATTCAAACACAAACTCTTCTGGGTTTACTACTACAACTTCTGAGGATGTTTCTCCCTCTATGTCGCTTCTCTATTCTAGATAA
Protein sequence

>MsG0480022607.01.T01

MASLCNNYMKTHRFAFFHVTLSFLLLVTFHAAPLNFNYDNLSSDKTHALNFSGDVDHDNQVLQLTRYEKDSIGRVTYSKLFHVWDINTSEVTDFTTRFSFTINTLNKTHHSDGITFYLAHPNFPLPIPRDGSGIGLMSSVQLATPNYTKENPFVAVEFDTFVNTWDPTYDHVGIDVNSISSSYTTQWFTSLDERGYDVDVSYNSMSNNLSVTFTGYRDNNTIEQNLFQIVNLREVLPDWVEFGFTSATGLFWGEEHTLRSWSFNSSLDFEAHKDEGKTGPVIGLALGLGIGGFILIGVLSLISVVLWKRWKKESEEEDGEFEEYMGEDFGRGTGPKKYTYAELAQAANNFKDEHKLGQGGFGGVYRGFLKDTNSYVAIKRVSEDSHQGIKEFASEVKIISKLRHRNLVQLIGWCHERKRLLLVYEYMPNGSLDIHLFKNQSLVKWGVRYTIARGLASALLYLHEEWEQCVVHRDIKASNIMLDSEFNAKLGNFGLARFVDHAKGAQTTALAGTLGYMAPECATTGRASKETDVYSFGIVTLEIACGRKPIINLKAQENEIHIVEWVWGLYGRGRILEAVDPRLDGDFEEEQIKCMMIVGLWCAHPDPNNRPSIRQAIQVLNFEAPMPNLSSSMPVPTYLEGPLNSFTTPFSISGSEKGQSKNIINFNSNTNSSGFTTTTSEDVSPSMSLLYSR*