AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880046019.01


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MsG0880046019.01.T01 AT2G23290 49.515 103 50 2 14 116 13 113 4.48e-26 105
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MsG0880046019.01.T01 AT3G50060 47.664 107 54 2 10 116 2 106 1.65e-25 103
MsG0880046019.01.T01 AT3G46130 55.696 79 35 0 44 122 18 96 2.23e-25 101
MsG0880046019.01.T01 AT5G49620 46.721 122 50 2 8 115 22 142 2.26e-25 103
MsG0880046019.01.T01 AT3G09230 46.667 105 54 2 14 118 55 157 1.18e-24 102
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MsG0880046019.01.T01 AT3G46130 55.844 77 34 0 46 122 10 86 1.28e-24 99.4
MsG0880046019.01.T01 AT2G39880 49.074 108 52 3 9 116 46 150 4.57e-24 100
MsG0880046019.01.T01 AT3G55730 48.544 103 51 2 14 116 56 156 1.12e-23 100
MsG0880046019.01.T01 AT1G69560 40.650 123 66 3 9 131 102 217 1.85e-23 98.6
MsG0880046019.01.T01 AT1G69560 40.650 123 66 3 9 131 118 233 2.13e-23 98.6
MsG0880046019.01.T01 AT1G17950 43.689 103 56 2 14 116 5 105 6.70e-23 95.1
MsG0880046019.01.T01 AT3G27785 43.519 108 59 2 9 116 184 289 8.39e-23 97.8
MsG0880046019.01.T01 AT5G17800 40.708 113 65 2 14 126 93 203 1.05e-22 96.3
MsG0880046019.01.T01 AT5G58850 39.496 119 69 3 11 129 102 217 1.18e-22 97.4
MsG0880046019.01.T01 AT2G25230 43.925 107 58 2 9 115 21 125 1.59e-22 94.0
MsG0880046019.01.T01 AT5G40360 39.655 116 67 3 12 127 156 268 2.54e-22 95.5
MsG0880046019.01.T01 AT1G22640 61.290 62 24 0 59 120 1 62 4.60e-22 91.7
MsG0880046019.01.T01 AT5G14750 51.282 78 38 0 59 136 1 78 1.27e-21 89.0
MsG0880046019.01.T01 AT5G14750 51.282 78 38 0 59 136 1 78 1.27e-21 89.0
MsG0880046019.01.T01 AT5G11050 38.983 118 68 3 11 128 102 215 3.11e-21 93.2
MsG0880046019.01.T01 AT1G26780 41.748 103 58 2 14 116 98 198 1.54e-20 89.4
MsG0880046019.01.T01 AT1G73410 43.590 117 58 3 14 130 6 114 1.65e-20 88.6
MsG0880046019.01.T01 AT4G18770 38.596 114 67 3 9 122 212 322 1.66e-20 91.3
MsG0880046019.01.T01 AT1G73410 42.857 119 60 3 14 132 6 116 2.56e-20 87.0
MsG0880046019.01.T01 AT1G26780 41.748 103 58 2 14 116 98 198 2.76e-20 90.1
MsG0880046019.01.T01 AT4G33450 37.795 127 73 3 9 135 14 134 4.76e-20 87.4
MsG0880046019.01.T01 AT5G02320 41.346 104 59 2 14 117 127 228 1.16e-19 89.4
MsG0880046019.01.T01 AT5G02320 41.346 104 59 2 14 117 127 228 1.16e-19 89.4
MsG0880046019.01.T01 AT5G02320 41.346 104 59 2 14 117 67 168 1.18e-19 89.0
MsG0880046019.01.T01 AT1G71030 52.239 67 32 0 52 118 5 71 1.21e-19 84.7
MsG0880046019.01.T01 AT1G71030 52.239 67 32 0 52 118 19 85 1.42e-19 85.1
MsG0880046019.01.T01 AT3G23250 59.322 59 24 0 59 117 1 59 6.69e-19 84.0
MsG0880046019.01.T01 AT3G09370 39.806 103 60 2 14 116 135 235 1.36e-18 86.3
MsG0880046019.01.T01 AT3G09370 39.806 103 60 2 14 116 130 230 1.38e-18 85.9
MsG0880046019.01.T01 AT3G09370 39.806 103 60 2 14 116 143 243 1.43e-18 85.9
MsG0880046019.01.T01 AT5G40430 38.318 107 63 2 9 115 49 152 3.28e-18 82.8
MsG0880046019.01.T01 AT3G29020 35.537 121 71 3 14 134 65 178 7.86e-18 81.3
MsG0880046019.01.T01 AT3G29020 35.537 121 71 3 14 134 67 180 9.68e-18 82.0
MsG0880046019.01.T01 AT2G37630 39.167 120 66 4 13 130 3 117 1.23e-17 82.4
MsG0880046019.01.T01 AT2G02820 33.333 186 103 7 17 195 33 204 8.67e-17 79.7
MsG0880046019.01.T01 AT2G02820 33.889 180 110 5 17 195 33 204 1.12e-16 80.5
MsG0880046019.01.T01 AT2G02820 33.889 180 110 5 17 195 33 204 1.16e-16 80.1
MsG0880046019.01.T01 AT1G66380 43.902 82 45 1 12 93 8 88 1.42e-16 74.3
MsG0880046019.01.T01 AT5G11510 36.538 104 64 2 14 117 81 182 3.22e-16 79.3
MsG0880046019.01.T01 AT5G11510 36.538 104 64 2 14 117 81 182 3.29e-16 79.3
MsG0880046019.01.T01 AT5G11510 36.538 104 64 2 14 117 81 182 3.29e-16 79.3
MsG0880046019.01.T01 AT5G11510 36.538 104 64 2 14 117 81 182 3.29e-16 79.3
MsG0880046019.01.T01 AT5G11510 36.538 104 64 2 14 117 81 182 3.38e-16 79.3
MsG0880046019.01.T01 AT4G32730 36.538 104 64 2 14 117 87 188 4.47e-16 79.0
MsG0880046019.01.T01 AT4G32730 36.538 104 64 2 14 117 87 188 5.05e-16 79.0
MsG0880046019.01.T01 AT4G32730 36.538 104 64 2 14 117 87 188 5.05e-16 79.0
MsG0880046019.01.T01 AT4G32730 36.538 104 64 2 14 117 87 188 5.05e-16 79.0
MsG0880046019.01.T01 AT4G32730 36.538 104 64 2 14 117 87 188 5.05e-16 79.0
MsG0880046019.01.T01 AT1G14350 41.000 100 57 2 17 116 28 125 5.98e-15 75.1
MsG0880046019.01.T01 AT1G14350 41.000 100 57 2 17 116 28 125 5.98e-15 75.1
MsG0880046019.01.T01 AT4G00540 35.780 109 67 2 11 117 100 207 1.29e-14 73.9
MsG0880046019.01.T01 AT4G00540 35.780 109 67 2 11 117 98 205 1.82e-14 73.6
MsG0880046019.01.T01 AT5G39700 34.579 107 67 3 15 121 57 160 2.23e-12 65.1
MsG0880046019.01.T01 AT5G59780 51.020 49 24 0 74 122 4 52 6.78e-11 60.5
MsG0880046019.01.T01 AT4G25560 54.000 50 23 0 72 121 3 52 8.53e-11 61.2

Find 65 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 98 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CAGAGAAACTCCCATGTTTA+AGG 0.105822 8:+67751136 None:intergenic
TAAGTCAAACTCCAAATTAT+TGG 0.179502 8:-67750579 MsG0880046019.01.T01:CDS
CAATTATTGTTTGCATTTAC+TGG 0.222820 8:+67750445 None:intergenic
GTTAATGTTGGCCAATAATT+TGG 0.238151 8:+67750568 None:intergenic
ATGGAAGAAGGATTTGTTAA+TGG 0.243504 8:+67750520 None:intergenic
CTTCCTTGAGGTTATAATCT+TGG 0.267387 8:+67750497 None:intergenic
TTTGAGGAGTCTATGTTCTA+TGG 0.268269 8:-67750190 MsG0880046019.01.T01:CDS
CAAAAGAGAGAGTGGAAATT+TGG 0.272570 8:-67750620 MsG0880046019.01.T01:CDS
CAAAGATATGTTATTGCGTT+TGG 0.274512 8:+67750161 None:intergenic
GGAAATTTGGTATGGCCTAT+TGG 0.297060 8:-67750607 MsG0880046019.01.T01:CDS
TGCAGCCTCTATGTCAATAT+TGG 0.301610 8:-67751093 MsG0880046019.01.T01:CDS
TTGAGTTTGGAGTCTTCTTC+AGG 0.302136 8:+67751470 None:intergenic
TGGTAATTGTGCTGCTATAA+TGG 0.306665 8:+67750765 None:intergenic
TTGAATATAAGCTTTGAGTT+TGG 0.322389 8:+67751457 None:intergenic
TTAATGTTGTTCATTGTAGA+TGG 0.330981 8:+67750376 None:intergenic
AAAGCTTATATTCAACAAAA+TGG 0.331738 8:-67751449 MsG0880046019.01.T01:CDS
ATAGCCCTGCCAAAGAAAAT+AGG 0.363795 8:-67751410 MsG0880046019.01.T01:intron
TTCTTTGATTCACTCACCTC+TGG 0.367442 8:-67750266 MsG0880046019.01.T01:CDS
AGGATTTGTTAATGGAATGT+TGG 0.377441 8:+67750528 None:intergenic
AAAATGGTACAGGTGGTAAC+TGG 0.380014 8:-67751433 MsG0880046019.01.T01:CDS
GGATTTGTTAATGGAATGTT+GGG 0.403473 8:+67750529 None:intergenic
CTTCTTGAATCATTGTTTGT+TGG 0.429284 8:+67750221 None:intergenic
TTCGACAGAAAGCAGTAGTT+GGG 0.430932 8:-67750299 MsG0880046019.01.T01:CDS
CTTGAATCATTGTTTGTTGG+TGG 0.431197 8:+67750224 None:intergenic
GTTTGACTTATAAATCCAAT+AGG 0.433737 8:+67750592 None:intergenic
TCGATCCATCTAGTTGTTGC+TGG 0.434759 8:+67750329 None:intergenic
GTGAACCAGCAACAACTAGA+TGG 0.463303 8:-67750334 MsG0880046019.01.T01:CDS
ATGAACAACATTAACTCTGC+AGG 0.465971 8:-67750367 MsG0880046019.01.T01:CDS
AAACTCCCATGTTTAAGGTT+CGG 0.471976 8:+67751141 None:intergenic
CTTCGACAGAAAGCAGTAGT+TGG 0.473110 8:-67750300 MsG0880046019.01.T01:CDS
ATAATGATATAAAGAACTAC+TGG 0.487898 8:-67750732 MsG0880046019.01.T01:CDS
CTTGAGGTTATAATCTTGGA+TGG 0.506957 8:+67750501 None:intergenic
TTATAATCTTGGATGGAAGA+AGG 0.509483 8:+67750508 None:intergenic
GACAATACAATTGATCTTGT+GGG 0.512990 8:+67750398 None:intergenic
CCATGGACCTCTCTTGACAT+TGG 0.513019 8:+67751496 None:intergenic
CAAGAGATCAAAAGAGAGAG+TGG 0.517355 8:-67750628 MsG0880046019.01.T01:CDS
GGACAATACAATTGATCTTG+TGG 0.518373 8:+67750397 None:intergenic
TATATTCAACAAAATGGTAC+AGG 0.524200 8:-67751443 MsG0880046019.01.T01:CDS
GAGTCTTCTTCAGGTGACCA+TGG 0.533921 8:+67751479 None:intergenic
CTTCGTCCGAACCTTAAACA+TGG 0.548167 8:-67751147 MsG0880046019.01.T01:CDS
ATATCATTATCCGTTCGTCC+TGG 0.550639 8:+67750745 None:intergenic
TGCTTCCAATATTGACATAG+AGG 0.551050 8:+67751088 None:intergenic
GAGAGAGTGGAAATTTGGTA+TGG 0.559360 8:-67750615 MsG0880046019.01.T01:CDS
TCTATGTCAATATTGGAAGC+AGG 0.567684 8:-67751086 MsG0880046019.01.T01:intron
TAGTTGTTGCTGGTTCACAT+AGG 0.573296 8:+67750339 None:intergenic
GAATTGTGTTGTGTTAATGT+TGG 0.574707 8:+67750556 None:intergenic
CATCCAAGATTATAACCTCA+AGG 0.576005 8:-67750500 MsG0880046019.01.T01:CDS
CATAGAATTCAACTTCCTTG+AGG 0.578012 8:+67750485 None:intergenic
TTCGTCCGAACCTTAAACAT+GGG 0.578642 8:-67751146 MsG0880046019.01.T01:CDS
CCTCTGGCTTCTGATTATGA+AGG 0.581688 8:-67750250 MsG0880046019.01.T01:CDS
GTGGTGTAGTAGGCCTCAAA+AGG 0.584070 8:-67751206 MsG0880046019.01.T01:intron
ATTATAGCAGCACAATTACC+AGG 0.591935 8:-67750763 MsG0880046019.01.T01:CDS
CTGGCTTCTGATTATGAAGG+TGG 0.596371 8:-67750247 MsG0880046019.01.T01:CDS
TGAACAACATTAACTCTGCA+GGG 0.604678 8:-67750366 MsG0880046019.01.T01:CDS
AGAAACTGTTAACAAAGCAA+AGG 0.607039 8:-67750693 MsG0880046019.01.T01:CDS
ACTGTTAACAAAGCAAAGGA+AGG 0.613799 8:-67750689 MsG0880046019.01.T01:CDS
AGCACAATTACCAGGACGAA+CGG 0.615114 8:-67750755 MsG0880046019.01.T01:CDS
ATTCAACAAAATGGTACAGG+TGG 0.616659 8:-67751440 MsG0880046019.01.T01:CDS
ACATTGGCTTTGTCACAACA+AGG 0.629228 8:+67751512 None:intergenic
GTAGTAGGCCTCAAAAGGTG+TGG 0.648093 8:-67751201 MsG0880046019.01.T01:intron
GACAAAGCCAATGTCAAGAG+AGG 0.653176 8:-67751503 MsG0880046019.01.T01:CDS
TGTGGGAAGTAAATGTCACA+TGG 0.656330 8:+67750415 None:intergenic
TCGACAGAAAGCAGTAGTTG+GGG 0.694483 8:-67750298 MsG0880046019.01.T01:CDS
CCTTCATAATCAGAAGCCAG+AGG 0.715118 8:+67750250 None:intergenic
CCAATGTCAAGAGAGGTCCA+TGG 0.735503 8:-67751496 MsG0880046019.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! AATTAAATTCAATATTGATT+AGG - Chr8:67750650-67750669 MsG0880046019.01.T01:CDS 10.0%
!!! TCAAAAACTTAAATAATTTT+TGG + Chr8:67750449-67750468 None:intergenic 10.0%
!!! TTGAGAATTAATTTCATTTT+TGG - Chr8:67750465-67750484 MsG0880046019.01.T01:CDS 15.0%
!! AAAGCTTATATTCAACAAAA+TGG - Chr8:67750246-67750265 MsG0880046019.01.T01:CDS 20.0%
!! AGAAAAATAACATAAACCTA+AGG + Chr8:67750360-67750379 None:intergenic 20.0%
!! ATAATGATATAAAGAACTAC+TGG - Chr8:67750963-67750982 MsG0880046019.01.T01:intron 20.0%
!!! AATTAATTTCATTTTTGGTG+TGG - Chr8:67750470-67750489 MsG0880046019.01.T01:CDS 20.0%
! CAATTATTGTTTGCATTTAC+TGG + Chr8:67751253-67751272 None:intergenic 25.0%
! TAAGTCAAACTCCAAATTAT+TGG - Chr8:67751116-67751135 MsG0880046019.01.T01:CDS 25.0%
! TATATTCAACAAAATGGTAC+AGG - Chr8:67750252-67750271 MsG0880046019.01.T01:CDS 25.0%
! TTAATGTTGTTCATTGTAGA+TGG + Chr8:67751322-67751341 None:intergenic 25.0%
!! ACAACAATACCTATTTTCTT+TGG + Chr8:67750297-67750316 None:intergenic 25.0%
!! GTTTGACTTATAAATCCAAT+AGG + Chr8:67751106-67751125 None:intergenic 25.0%
!!! TCAAGAAGATTTTACTTTTG+AGG - Chr8:67751489-67751508 MsG0880046019.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTACGATACATTAGTCTTTT+TGG - Chr8:67750789-67750808 MsG0880046019.01.T01:intron 25.0%
!!! TTGAATATAAGCTTTGAGTT+TGG + Chr8:67750241-67750260 None:intergenic 25.0%
ACCATTTATGTTAAATCCGT+TGG + Chr8:67750849-67750868 None:intergenic 30.0%
AGAAACTGTTAACAAAGCAA+AGG - Chr8:67751002-67751021 MsG0880046019.01.T01:intron 30.0%
CAGATAGATGGATATATGTA+TGG + Chr8:67750417-67750436 None:intergenic 30.0%
CATACATATATCCATCTATC+TGG - Chr8:67750415-67750434 MsG0880046019.01.T01:CDS 30.0%
CTTCTTGAATCATTGTTTGT+TGG + Chr8:67751477-67751496 None:intergenic 30.0%
GAATTGTGTTGTGTTAATGT+TGG + Chr8:67751142-67751161 None:intergenic 30.0%
GACAATACAATTGATCTTGT+GGG + Chr8:67751300-67751319 None:intergenic 30.0%
GTTAATGTTGGCCAATAATT+TGG + Chr8:67751130-67751149 None:intergenic 30.0%
TATTCTGACATTTGTTCCTT+AGG - Chr8:67750341-67750360 MsG0880046019.01.T01:CDS 30.0%
TTATAATCTTGGATGGAAGA+AGG + Chr8:67751190-67751209 None:intergenic 30.0%
! AATACCTATTTTCTTTGGCA+GGG + Chr8:67750292-67750311 None:intergenic 30.0%
! ACCAACGGATTTAACATAAA+TGG - Chr8:67750845-67750864 MsG0880046019.01.T01:intron 30.0%
!! AGGATTTGTTAATGGAATGT+TGG + Chr8:67751170-67751189 None:intergenic 30.0%
!! ATGGAAGAAGGATTTGTTAA+TGG + Chr8:67751178-67751197 None:intergenic 30.0%
!! GGATTTGTTAATGGAATGTT+GGG + Chr8:67751169-67751188 None:intergenic 30.0%
ACTGTTAACAAAGCAAAGGA+AGG - Chr8:67751006-67751025 MsG0880046019.01.T01:intron 35.0%
AGCTTAACTCATAACACCAA+CGG - Chr8:67750830-67750849 MsG0880046019.01.T01:intron 35.0%
ATGAACAACATTAACTCTGC+AGG - Chr8:67751328-67751347 MsG0880046019.01.T01:intron 35.0%
ATTATAGCAGCACAATTACC+AGG - Chr8:67750932-67750951 MsG0880046019.01.T01:intron 35.0%
ATTCAACAAAATGGTACAGG+TGG - Chr8:67750255-67750274 MsG0880046019.01.T01:CDS 35.0%
CAAAAGAGAGAGTGGAAATT+TGG - Chr8:67751075-67751094 MsG0880046019.01.T01:intron 35.0%
CATAGAATTCAACTTCCTTG+AGG + Chr8:67751213-67751232 None:intergenic 35.0%
CATCCAAGATTATAACCTCA+AGG - Chr8:67751195-67751214 MsG0880046019.01.T01:CDS 35.0%
CCATAAATGAACTATCGTCA+AGG + Chr8:67750881-67750900 None:intergenic 35.0%
CCTTGACGATAGTTCATTTA+TGG - Chr8:67750878-67750897 MsG0880046019.01.T01:intron 35.0%
CTTCCTTGAGGTTATAATCT+TGG + Chr8:67751201-67751220 None:intergenic 35.0%
CTTGAGGTTATAATCTTGGA+TGG + Chr8:67751197-67751216 None:intergenic 35.0%
GAAAAAGTTGTCGTCTTAGA+TGG - Chr8:67750516-67750535 MsG0880046019.01.T01:CDS 35.0%
GGACAATACAATTGATCTTG+TGG + Chr8:67751301-67751320 None:intergenic 35.0%
TCTATGTCAATATTGGAAGC+AGG - Chr8:67750609-67750628 MsG0880046019.01.T01:CDS 35.0%
TGAACAACATTAACTCTGCA+GGG - Chr8:67751329-67751348 MsG0880046019.01.T01:intron 35.0%
TGCTTCCAATATTGACATAG+AGG + Chr8:67750610-67750629 None:intergenic 35.0%
TGGTTCATAAACCAGATAGA+TGG + Chr8:67750429-67750448 None:intergenic 35.0%
TTTGAGGAGTCTATGTTCTA+TGG - Chr8:67751505-67751524 MsG0880046019.01.T01:CDS 35.0%
! AAACTCCCATGTTTAAGGTT+CGG + Chr8:67750557-67750576 None:intergenic 35.0%
! CAATACCTATTTTCTTTGGC+AGG + Chr8:67750293-67750312 None:intergenic 35.0%
! CTCTTTTGATCTCTTGGTTT+TGG + Chr8:67751063-67751082 None:intergenic 35.0%
! CTTGAATCATTGTTTGTTGG+TGG + Chr8:67751474-67751493 None:intergenic 35.0%
! TGGTAATTGTGCTGCTATAA+TGG + Chr8:67750933-67750952 None:intergenic 35.0%
!! AACTTTTTCCACACCTTTTG+AGG + Chr8:67750505-67750524 None:intergenic 35.0%
!!! AGTCTTTTTGGTTAGACTCT+CGG - Chr8:67750801-67750820 MsG0880046019.01.T01:intron 35.0%
!!! CTTGGTTTTGGTTGAAAACT+TGG + Chr8:67751051-67751070 None:intergenic 35.0%
AAAATGGTACAGGTGGTAAC+TGG - Chr8:67750262-67750281 MsG0880046019.01.T01:CDS 40.0%
ATAGCCCTGCCAAAGAAAAT+AGG - Chr8:67750285-67750304 MsG0880046019.01.T01:CDS 40.0%
ATATCATTATCCGTTCGTCC+TGG + Chr8:67750953-67750972 None:intergenic 40.0%
CAAGAGATCAAAAGAGAGAG+TGG - Chr8:67751067-67751086 MsG0880046019.01.T01:intron 40.0%
CAGAGAAACTCCCATGTTTA+AGG + Chr8:67750562-67750581 None:intergenic 40.0%
CATTACATTCTCATACGTGC+AGG - Chr8:67750903-67750922 MsG0880046019.01.T01:intron 40.0%
CGTATAAGACTCATATGAGC+CGG + Chr8:67750723-67750742 None:intergenic 40.0%
GAGAGAGTGGAAATTTGGTA+TGG - Chr8:67751080-67751099 MsG0880046019.01.T01:intron 40.0%
GGAAATTTGGTATGGCCTAT+TGG - Chr8:67751088-67751107 MsG0880046019.01.T01:CDS 40.0%
TGCAGCCTCTATGTCAATAT+TGG - Chr8:67750602-67750621 MsG0880046019.01.T01:CDS 40.0%
TGTGGGAAGTAAATGTCACA+TGG + Chr8:67751283-67751302 None:intergenic 40.0%
TTCGACAGAAAGCAGTAGTT+GGG - Chr8:67751396-67751415 MsG0880046019.01.T01:intron 40.0%
TTCGTCCGAACCTTAAACAT+GGG - Chr8:67750549-67750568 MsG0880046019.01.T01:CDS 40.0%
TTCTTTGATTCACTCACCTC+TGG - Chr8:67751429-67751448 MsG0880046019.01.T01:CDS 40.0%
! CACTCTCTCTTTTGATCTCT+TGG + Chr8:67751069-67751088 None:intergenic 40.0%
! CGGCTCATATGAGTCTTATA+CGG - Chr8:67750721-67750740 MsG0880046019.01.T01:CDS 40.0%
! TTGAGTTTGGAGTCTTCTTC+AGG + Chr8:67750228-67750247 None:intergenic 40.0%
!! ACATTGGCTTTGTCACAACA+AGG + Chr8:67750186-67750205 None:intergenic 40.0%
!! TAGTTGTTGCTGGTTCACAT+AGG + Chr8:67751359-67751378 None:intergenic 40.0%
!!! CATTTTTGGTGTGGTGTAGT+AGG - Chr8:67750479-67750498 MsG0880046019.01.T01:CDS 40.0%
AGCACAATTACCAGGACGAA+CGG - Chr8:67750940-67750959 MsG0880046019.01.T01:intron 45.0%
CCTTCATAATCAGAAGCCAG+AGG + Chr8:67751448-67751467 None:intergenic 45.0%
CTGGCTTCTGATTATGAAGG+TGG - Chr8:67751448-67751467 MsG0880046019.01.T01:CDS 45.0%
CTTCGACAGAAAGCAGTAGT+TGG - Chr8:67751395-67751414 MsG0880046019.01.T01:intron 45.0%
CTTCGTCCGAACCTTAAACA+TGG - Chr8:67750548-67750567 MsG0880046019.01.T01:CDS 45.0%
GACAAAGCCAATGTCAAGAG+AGG - Chr8:67750192-67750211 MsG0880046019.01.T01:CDS 45.0%
GTGAACCAGCAACAACTAGA+TGG - Chr8:67751361-67751380 MsG0880046019.01.T01:intron 45.0%
TACATTCTCATACGTGCAGG+TGG - Chr8:67750906-67750925 MsG0880046019.01.T01:intron 45.0%
TCGACAGAAAGCAGTAGTTG+GGG - Chr8:67751397-67751416 MsG0880046019.01.T01:intron 45.0%
TCGATCCATCTAGTTGTTGC+TGG + Chr8:67751369-67751388 None:intergenic 45.0%
! CCTCTGGCTTCTGATTATGA+AGG - Chr8:67751445-67751464 MsG0880046019.01.T01:CDS 45.0%
AAGACTCATATGAGCCGGCA+AGG + Chr8:67750718-67750737 None:intergenic 50.0%
AGACTCATATGAGCCGGCAA+GGG + Chr8:67750717-67750736 None:intergenic 50.0%
CCAATGTCAAGAGAGGTCCA+TGG - Chr8:67750199-67750218 MsG0880046019.01.T01:CDS 50.0%
CCATGGACCTCTCTTGACAT+TGG + Chr8:67750202-67750221 None:intergenic 50.0%
GAGTCTTCTTCAGGTGACCA+TGG + Chr8:67750219-67750238 None:intergenic 50.0%
GTAGTAGGCCTCAAAAGGTG+TGG - Chr8:67750494-67750513 MsG0880046019.01.T01:CDS 50.0%
GTGGTGTAGTAGGCCTCAAA+AGG - Chr8:67750489-67750508 MsG0880046019.01.T01:CDS 50.0%
CTCCTACAAGTCTCCCTTGC+CGG - Chr8:67750701-67750720 MsG0880046019.01.T01:CDS 55.0%
AGCCGGCAAGGGAGACTTGT+AGG + Chr8:67750706-67750725 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 67750171 67751546 67750171 ID=MsG0880046019.01;Name=MsG0880046019.01
Chr8 mRNA 67750171 67751546 67750171 ID=MsG0880046019.01.T01;Parent=MsG0880046019.01;Name=MsG0880046019.01.T01;_AED=0.30;_eAED=0.33;_QI=0|0|0|1|1|1|3|0|295
Chr8 exon 67751411 67751546 67751411 ID=MsG0880046019.01.T01:exon:32549;Parent=MsG0880046019.01.T01
Chr8 exon 67751087 67751216 67751087 ID=MsG0880046019.01.T01:exon:32548;Parent=MsG0880046019.01.T01
Chr8 exon 67750171 67750792 67750171 ID=MsG0880046019.01.T01:exon:32547;Parent=MsG0880046019.01.T01
Chr8 CDS 67751411 67751546 67751411 ID=MsG0880046019.01.T01:cds;Parent=MsG0880046019.01.T01
Chr8 CDS 67751087 67751216 67751087 ID=MsG0880046019.01.T01:cds;Parent=MsG0880046019.01.T01
Chr8 CDS 67750171 67750792 67750171 ID=MsG0880046019.01.T01:cds;Parent=MsG0880046019.01.T01
Gene Sequence

>MsG0880046019.01.T01

ATGGGAAGAGCTCCTTGTTGTGACAAAGCCAATGTCAAGAGAGGTCCATGGTCACCTGAAGAAGACTCCAAACTCAAAGCTTATATTCAACAAAATGGTACAGGTGGTAACTGGATAGCCCTGCCAAAGAAAATAGGCCTCAAAAGGTGTGGAAAAAGTTGTCGTCTTAGATGGCTAAATTATCTTCGTCCGAACCTTAAACATGGGAGTTTCTCTGAAGAAGAAGACAACATTATTTGCAGCCTCTATGTCAATATTGGAAGCAGGTGGTCCATTATAGCAGCACAATTACCAGGACGAACGGATAATGATATAAAGAACTACTGGAACACGAAGTTGAAGAAGAAACTGTTAACAAAGCAAAGGAAGGAGCAACAATCTCAAGCTCGCCAAGTTTTCAACCAAAACCAAGAGATCAAAAGAGAGAGTGGAAATTTGGTATGGCCTATTGGATTTATAAGTCAAACTCCAAATTATTGGCCAACATTAACACAACACAATTCATTTCCCAACATTCCATTAACAAATCCTTCTTCCATCCAAGATTATAACCTCAAGGAAGTTGAATTCTATGATAATCATCAACTGCAGCCAGTAAATGCAAACAATAATTGTCAATATCCATGTGACATTTACTTCCCACAAGATCAATTGTATTGTCCATCTACAATGAACAACATTAACTCTGCAGGGTTGACCTATGTGAACCAGCAACAACTAGATGGATCGATCTCGACTTCGACAGAAAGCAGTAGTTGGGGAGATATGAGTTCTTTGATTCACTCACCTCTGGCTTCTGATTATGAAGGTGGCCACCAACAAACAATGATTCAAGAAGATTTTACTTTTGAGGAGTCTATGTTCTATGGAATGATCCAAACGCAATAA

Protein sequence

>MsG0880046019.01.T01

MGRAPCCDKANVKRGPWSPEEDSKLKAYIQQNGTGGNWIALPKKIGLKRCGKSCRLRWLNYLRPNLKHGSFSEEEDNIICSLYVNIGSRWSIIAAQLPGRTDNDIKNYWNTKLKKKLLTKQRKEQQSQARQVFNQNQEIKRESGNLVWPIGFISQTPNYWPTLTQHNSFPNIPLTNPSSIQDYNLKEVEFYDNHQLQPVNANNNCQYPCDIYFPQDQLYCPSTMNNINSAGLTYVNQQQLDGSISTSTESSSWGDMSSLIHSPLASDYEGGHQQTMIQEDFTFEESMFYGMIQTQ*