AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0580024720.01

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MsG0580024720.01.T01 AT3G54980 23.404 235 150 4 12 222 350 578 1.53e-12 68.6
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MsG0580024720.01.T01 AT3G54980 24.034 233 143 3 24 229 501 726 5.47e-19 88.2
MsG0580024720.01.T01 AT3G54980 26.275 255 161 5 19 266 602 836 5.63e-19 87.8
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MsG0580024720.01.T01 AT3G60050 26.027 219 135 4 7 220 187 383 9.54e-11 62.8
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MsG0580024720.01.T01 AT4G34830 24.581 179 121 2 28 206 428 592 9.59e-14 72.4
MsG0580024720.01.T01 AT4G34830 24.176 182 128 2 12 193 620 791 1.74e-12 68.6
MsG0580024720.01.T01 AT4G34830 25.263 190 129 3 9 195 474 653 2.71e-11 65.1
MsG0580024720.01.T01 AT5G62370 25.698 179 123 1 35 213 546 714 5.18e-15 76.3
MsG0580024720.01.T01 AT5G62370 22.925 253 174 4 19 266 565 801 3.47e-14 73.6
MsG0580024720.01.T01 AT5G62370 27.419 186 124 3 12 196 248 423 4.94e-13 70.1
MsG0580024720.01.T01 AT3G21470 26.768 198 119 4 20 195 258 451 5.33e-15 75.9
MsG0580024720.01.T01 AT1G73710 29.878 164 99 2 63 226 297 444 7.04e-15 75.9
MsG0580024720.01.T01 AT1G73710 28.144 167 106 3 31 197 510 662 1.91e-12 68.6
MsG0580024720.01.T01 AT1G73710 26.286 175 119 1 20 194 534 698 3.58e-11 64.7
MsG0580024720.01.T01 AT1G73710 26.174 149 98 2 60 208 506 642 5.33e-11 63.9
MsG0580024720.01.T01 AT4G01570 26.068 234 128 3 1 199 289 512 1.64e-14 74.7
MsG0580024720.01.T01 AT4G01570 27.746 173 110 3 14 185 611 769 5.25e-13 70.1
MsG0580024720.01.T01 AT4G01570 29.252 147 88 3 65 205 242 378 1.11e-11 65.9
MsG0580024720.01.T01 AT1G71060 25.000 188 131 1 6 193 167 344 1.94e-14 73.9
MsG0580024720.01.T01 AT1G71060 24.719 178 121 2 20 197 321 485 5.07e-13 69.7
MsG0580024720.01.T01 AT1G71060 23.841 151 105 2 27 177 258 398 4.62e-11 63.9
MsG0580024720.01.T01 AT3G61360 26.496 234 145 5 3 226 133 349 5.50e-14 72.8
MsG0580024720.01.T01 AT3G53170 24.876 201 126 5 35 226 214 398 6.22e-14 72.4
MsG0580024720.01.T01 AT1G02420 28.177 181 114 3 11 191 157 321 6.30e-14 72.4
MsG0580024720.01.T01 AT5G61370 27.014 211 121 5 27 227 234 421 8.56e-14 72.0
MsG0580024720.01.T01 AT2G03880 28.571 189 84 5 30 185 188 358 9.84e-14 72.0
MsG0580024720.01.T01 AT5G39980 21.790 257 136 7 1 195 226 479 1.07e-13 72.0
MsG0580024720.01.T01 AT5G39980 28.387 155 101 2 24 178 178 322 7.42e-13 69.3
MsG0580024720.01.T01 AT5G39980 23.077 156 110 1 24 179 353 498 4.77e-11 63.9
MsG0580024720.01.T01 AT5G37570 31.902 163 89 5 33 195 173 313 1.50e-13 71.6
MsG0580024720.01.T01 AT5G37570 31.902 163 89 5 33 195 173 313 1.50e-13 71.6
MsG0580024720.01.T01 AT5G02830 29.730 148 90 3 35 178 334 471 2.18e-13 71.2
MsG0580024720.01.T01 AT2G15980 27.607 163 110 2 1 162 316 471 3.79e-13 70.1
MsG0580024720.01.T01 AT2G15980 29.231 130 82 1 31 160 276 395 5.41e-11 63.5
MsG0580024720.01.T01 AT2G36240 25.253 198 138 1 1 198 228 415 6.50e-13 69.3
MsG0580024720.01.T01 AT2G36240 26.347 167 108 3 39 202 160 314 1.38e-11 65.5
MsG0580024720.01.T01 AT1G11630 27.273 198 128 2 23 220 169 350 7.03e-13 68.9
MsG0580024720.01.T01 AT5G46580 24.352 193 129 2 8 193 221 403 7.71e-13 69.3
MsG0580024720.01.T01 AT5G46580 23.711 194 134 2 4 193 185 368 9.77e-11 63.2
MsG0580024720.01.T01 AT4G01030 30.588 170 103 4 27 196 252 406 7.86e-13 69.3
MsG0580024720.01.T01 AT5G36300 21.354 192 149 2 6 196 55 245 8.00e-13 68.2
MsG0580024720.01.T01 AT2G27800 26.596 188 119 4 15 193 224 401 8.77e-13 68.9
MsG0580024720.01.T01 AT3G60040 29.104 134 85 1 48 181 701 824 9.81e-13 69.3
MsG0580024720.01.T01 AT3G60040 29.104 134 85 1 48 181 702 825 9.90e-13 69.3
MsG0580024720.01.T01 AT3G60040 29.104 134 85 1 48 181 482 605 1.04e-12 68.9
MsG0580024720.01.T01 AT4G33990 29.240 171 101 5 27 195 477 629 1.23e-12 68.9
MsG0580024720.01.T01 AT4G33990 29.240 171 101 5 27 195 470 622 1.23e-12 68.9
MsG0580024720.01.T01 AT4G39620 24.194 186 121 2 35 220 207 372 1.52e-12 68.6
MsG0580024720.01.T01 AT4G39620 24.194 186 121 2 35 220 207 372 1.52e-12 68.2
MsG0580024720.01.T01 AT1G16830 22.549 204 134 1 27 206 99 302 1.91e-12 68.2
MsG0580024720.01.T01 AT1G80880 22.564 195 129 5 38 231 226 399 2.00e-12 68.2
MsG0580024720.01.T01 AT1G80880 22.564 195 129 5 38 231 226 399 2.00e-12 68.2
MsG0580024720.01.T01 AT1G80880 22.564 195 129 5 38 231 226 399 2.00e-12 68.2
MsG0580024720.01.T01 AT5G46680 25.098 255 175 6 14 266 96 336 2.01e-12 67.8
MsG0580024720.01.T01 AT5G46680 24.713 174 121 3 20 193 67 230 3.48e-12 67.0
MsG0580024720.01.T01 AT5G46680 25.381 197 130 6 4 196 191 374 6.06e-11 63.5
MsG0580024720.01.T01 AT3G17370 23.267 202 115 2 24 199 2 189 2.14e-12 65.9
MsG0580024720.01.T01 AT5G27270 28.502 207 132 5 20 226 207 397 2.21e-12 68.2
MsG0580024720.01.T01 AT1G05600 27.119 177 117 4 22 196 319 485 2.26e-12 67.8
MsG0580024720.01.T01 AT1G05600 27.119 177 117 4 22 196 319 485 2.26e-12 67.8
MsG0580024720.01.T01 AT1G05600 27.119 177 117 4 22 196 319 485 2.26e-12 67.8
MsG0580024720.01.T01 AT4G14050 25.778 225 136 7 20 228 221 430 2.34e-12 67.8
MsG0580024720.01.T01 AT4G14050 25.778 225 136 7 20 228 168 377 2.54e-12 67.8
MsG0580024720.01.T01 AT5G27270 28.502 207 132 5 20 226 207 397 2.70e-12 67.8
MsG0580024720.01.T01 AT5G27270 28.502 207 132 5 20 226 207 397 2.76e-12 67.8
MsG0580024720.01.T01 AT3G02650 24.242 165 115 1 36 200 372 526 2.78e-12 67.8
MsG0580024720.01.T01 AT3G48250 35.789 95 61 0 99 193 388 482 3.10e-12 67.4
MsG0580024720.01.T01 AT2G38420 20.879 182 134 1 16 197 231 402 3.18e-12 67.4
MsG0580024720.01.T01 AT5G27270 28.502 207 132 5 20 226 2 192 3.48e-12 67.4
MsG0580024720.01.T01 AT5G27270 28.502 207 132 5 20 226 2 192 3.48e-12 67.4
MsG0580024720.01.T01 AT4G30825 26.115 157 106 1 26 182 758 904 3.63e-12 67.4
MsG0580024720.01.T01 AT4G30825 24.000 175 122 2 22 196 720 883 1.09e-11 66.2
MsG0580024720.01.T01 AT3G26782 28.313 166 101 4 31 195 317 465 4.04e-12 67.4
MsG0580024720.01.T01 AT3G13160 19.487 195 141 2 32 226 173 351 6.38e-12 66.2
MsG0580024720.01.T01 AT5G43820 21.364 220 152 4 20 237 205 405 8.76e-12 66.2
MsG0580024720.01.T01 AT2G33760 29.730 148 90 2 31 178 137 270 9.58e-12 65.9
MsG0580024720.01.T01 AT2G34400 25.532 235 127 7 20 215 217 442 1.26e-11 65.9
MsG0580024720.01.T01 AT2G40240 25.157 159 109 1 39 197 110 258 1.29e-11 65.1
MsG0580024720.01.T01 AT5G47360 30.597 134 79 2 31 160 195 318 1.34e-11 65.5
MsG0580024720.01.T01 AT5G47360 25.281 178 119 3 34 207 128 295 8.68e-11 62.8
MsG0580024720.01.T01 AT2G28050 23.977 171 120 1 27 197 272 432 1.87e-11 65.1
MsG0580024720.01.T01 AT5G18390 30.928 97 67 0 100 196 201 297 2.27e-11 64.7
MsG0580024720.01.T01 AT5G18390 25.373 201 125 3 19 194 200 400 4.85e-11 63.5
MsG0580024720.01.T01 AT3G25210 25.517 145 98 1 52 196 204 338 2.78e-11 64.3
MsG0580024720.01.T01 AT2G40720 26.506 166 104 4 31 195 607 755 3.20e-11 64.7
MsG0580024720.01.T01 AT3G46610 23.529 187 133 3 20 206 442 618 5.94e-11 63.5
MsG0580024720.01.T01 AT3G46610 23.529 187 133 3 20 206 442 618 5.94e-11 63.5
MsG0580024720.01.T01 AT1G19520 25.962 104 77 0 92 195 395 498 6.26e-11 63.5
MsG0580024720.01.T01 AT1G60770 25.316 158 107 2 38 194 125 272 6.92e-11 63.2
MsG0580024720.01.T01 AT4G16390 25.000 204 137 3 22 225 196 383 6.95e-11 63.5

Find 51 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 70 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ATCTAAAATTACTATTGATA+TGG 0.213233 5:+8770943 MsG0580024720.01.T01:CDS
TCATTATGATCGTCAATTTC+AGG 0.283773 5:-8771109 None:intergenic
CCTTTCTCATTTGTTGCATC+AGG 0.296306 5:-8770409 None:intergenic
GTCTACAACATTCTAATTGA+TGG 0.315413 5:+8770235 MsG0580024720.01.T01:CDS
TTGTAGACAAAGGTGTTTCT+TGG 0.327050 5:-8770220 None:intergenic
TGCACTCATGACGAAGATTA+TGG 0.339273 5:+8771175 MsG0580024720.01.T01:CDS
AAACACTTCAAAGCCTTCTC+TGG 0.345126 5:-8770782 None:intergenic
GGCTCGGAGAGGTGATGTTT+GGG 0.373207 5:+8770376 MsG0580024720.01.T01:CDS
GGGCTCGGAGAGGTGATGTT+TGG 0.375735 5:+8770375 MsG0580024720.01.T01:CDS
TTGAAGGCTTGTTGCAAGTC+AGG 0.387212 5:+8770145 MsG0580024720.01.T01:CDS
AAAAGATGTTTCCTCCTGAT+TGG 0.387808 5:+8771038 MsG0580024720.01.T01:CDS
ATAAATGCTTGTTGTAAAGC+TGG 0.402473 5:+8770470 MsG0580024720.01.T01:CDS
GCTCAATCATACATTTATAG+TGG 0.411732 5:+8770890 MsG0580024720.01.T01:CDS
TCTAAAATTACTATTGATAT+GGG 0.440243 5:+8770944 MsG0580024720.01.T01:CDS
TTCACAACATTGAAGAATGA+TGG 0.441017 5:+8770088 MsG0580024720.01.T01:CDS
TAAATGCTTGTTGTAAAGCT+GGG 0.451013 5:+8770471 MsG0580024720.01.T01:CDS
CACCACTCTTATACATGGTT+GGG 0.451624 5:+8770745 MsG0580024720.01.T01:CDS
GAAGTGTAGGTATGGATATC+CGG 0.456270 5:-8770443 None:intergenic
GAGAAAGGAAGGCGTTCAAC+CGG 0.463828 5:+8770424 MsG0580024720.01.T01:CDS
AACACAGGTTATCGAAGAAA+TGG 0.469400 5:+8770688 MsG0580024720.01.T01:CDS
AACATTGAAGAATGATGGCC+TGG 0.469498 5:+8770093 MsG0580024720.01.T01:CDS
TACGTATGAGGCATTGTTGA+AGG 0.471089 5:+8770129 MsG0580024720.01.T01:CDS
ACACCACTCTTATACATGGT+TGG 0.473121 5:+8770744 MsG0580024720.01.T01:CDS
TCTACAACATTCTAATTGAT+GGG 0.482674 5:+8770236 MsG0580024720.01.T01:CDS
CAATGGTACACTGCTCTGTC+TGG 0.483065 5:-8770833 None:intergenic
TTTGAAGATATGAAAGTGGC+TGG 0.484546 5:+8770803 MsG0580024720.01.T01:CDS
GTCATCGTTATCGCTTTCAC+TGG 0.489772 5:-8771152 None:intergenic
TTGTAAAGCTGGGGATATGC+AGG 0.502692 5:+8770481 MsG0580024720.01.T01:CDS
TTATAAAAGAAGTGTAGGTA+TGG 0.509551 5:-8770451 None:intergenic
ATATTATGTGATGTCCAATC+AGG 0.512026 5:-8771052 None:intergenic
ATATGGGAACTGCAGTTCAC+TGG 0.534149 5:+8770960 MsG0580024720.01.T01:CDS
GATTGATGTATATACGTATG+AGG 0.544377 5:+8770117 MsG0580024720.01.T01:CDS
TTGCGCAAAATTGAAAGAAG+TGG 0.551640 5:+8770992 MsG0580024720.01.T01:CDS
CGCAAAATTGAAAGAAGTGG+AGG 0.553587 5:+8770995 MsG0580024720.01.T01:CDS
CCTGATGCAACAAATGAGAA+AGG 0.554728 5:+8770409 MsG0580024720.01.T01:CDS
ACCTACACCACTCTTATACA+TGG 0.566851 5:+8770740 MsG0580024720.01.T01:CDS
TTGTGAGAGAGAACAGATTG+TGG 0.570330 5:-8770027 None:intergenic
ACGTATATACATCAATCTCC+AGG 0.575505 5:-8770111 None:intergenic
CAATGTTGTGAAATACTGAA+AGG 0.580045 5:-8770077 None:intergenic
ATGCAACAAATGAGAAAGGA+AGG 0.585821 5:+8770413 MsG0580024720.01.T01:CDS
AGCATTTATAAAAGAAGTGT+AGG 0.592448 5:-8770456 None:intergenic
AAATGCTTGTTGTAAAGCTG+GGG 0.598452 5:+8770472 MsG0580024720.01.T01:CDS
AATTAGAATGTTGTAGACAA+AGG 0.598506 5:-8770230 None:intergenic
ACCATGTATAAGAGTGGTGT+AGG 0.603446 5:-8770741 None:intergenic
TTATGTGATGTCCAATCAGG+AGG 0.633853 5:-8771049 None:intergenic
GCAAAGATGTCATAAGACAA+TGG 0.646519 5:-8770850 None:intergenic
AGCCCAACCATGTATAAGAG+TGG 0.654995 5:-8770747 None:intergenic
AATGTATGATTGAGCAACGG+TGG 0.663341 5:-8770882 None:intergenic
ATAAATGTATGATTGAGCAA+CGG 0.680417 5:-8770885 None:intergenic
TGTGTGCCAGAATGCAACAC+AGG 0.702990 5:+8770673 MsG0580024720.01.T01:intron
ATCGAAGAAATGGAAGCACG+TGG 0.749016 5:+8770698 MsG0580024720.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATAAATATAATTACTTATGA+AGG + Chr5:8770515-8770534 MsG0580024720.01.T01:intron 10.0%
!! TAAATATAATTACTTATGAA+GGG + Chr5:8770516-8770535 MsG0580024720.01.T01:intron 10.0%
!! AAGAATATATAACTAAATGT+TGG - Chr5:8770317-8770336 None:intergenic 15.0%
!! AGTTATATATTCTTCAATAA+TGG + Chr5:8770323-8770342 MsG0580024720.01.T01:intron 15.0%
!! TAAAATGTTTGTCAAATTAT+TGG + Chr5:8770630-8770649 MsG0580024720.01.T01:intron 15.0%
!!! ATCTAAAATTACTATTGATA+TGG + Chr5:8770943-8770962 MsG0580024720.01.T01:CDS 15.0%
!!! TCTAAAATTACTATTGATAT+GGG + Chr5:8770944-8770963 MsG0580024720.01.T01:CDS 15.0%
!!! ATTCTGTTTTACTTTTTAGT+TGG + Chr5:8770354-8770373 MsG0580024720.01.T01:intron 20.0%
!!! TTCTGTTTTACTTTTTAGTT+GGG + Chr5:8770355-8770374 MsG0580024720.01.T01:intron 20.0%
! AATTAGAATGTTGTAGACAA+AGG - Chr5:8770233-8770252 None:intergenic 25.0%
! ATAAATGTATGATTGAGCAA+CGG - Chr5:8770888-8770907 None:intergenic 25.0%
! TCTACAACATTCTAATTGAT+GGG + Chr5:8770236-8770255 MsG0580024720.01.T01:CDS 25.0%
!! AGCATTTATAAAAGAAGTGT+AGG - Chr5:8770459-8770478 None:intergenic 25.0%
!! TTATAAAAGAAGTGTAGGTA+TGG - Chr5:8770454-8770473 None:intergenic 25.0%
ATATTATGTGATGTCCAATC+AGG - Chr5:8771055-8771074 None:intergenic 30.0%
CAATGTTGTGAAATACTGAA+AGG - Chr5:8770080-8770099 None:intergenic 30.0%
GATTGATGTATATACGTATG+AGG + Chr5:8770117-8770136 MsG0580024720.01.T01:CDS 30.0%
GCTCAATCATACATTTATAG+TGG + Chr5:8770890-8770909 MsG0580024720.01.T01:CDS 30.0%
GTCTACAACATTCTAATTGA+TGG + Chr5:8770235-8770254 MsG0580024720.01.T01:CDS 30.0%
TCATTATGATCGTCAATTTC+AGG - Chr5:8771112-8771131 None:intergenic 30.0%
TTCACAACATTGAAGAATGA+TGG + Chr5:8770088-8770107 MsG0580024720.01.T01:CDS 30.0%
! CGTTTAAGTTATTAGTAAGC+TGG + Chr5:8770572-8770591 MsG0580024720.01.T01:intron 30.0%
!! ATAAATGCTTGTTGTAAAGC+TGG + Chr5:8770470-8770489 MsG0580024720.01.T01:CDS 30.0%
!! TAAATGCTTGTTGTAAAGCT+GGG + Chr5:8770471-8770490 MsG0580024720.01.T01:CDS 30.0%
!!! GTGTTTTGAAGATATGAAAG+TGG + Chr5:8770799-8770818 MsG0580024720.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTTTACTTTTTAGTTGGGCT+CGG + Chr5:8770360-8770379 MsG0580024720.01.T01:intron 30.0%
AAAAGATGTTTCCTCCTGAT+TGG + Chr5:8771038-8771057 MsG0580024720.01.T01:CDS 35.0%
AACACAGGTTATCGAAGAAA+TGG + Chr5:8770688-8770707 MsG0580024720.01.T01:CDS 35.0%
ACGTATATACATCAATCTCC+AGG - Chr5:8770114-8770133 None:intergenic 35.0%
ATGCAACAAATGAGAAAGGA+AGG + Chr5:8770413-8770432 MsG0580024720.01.T01:CDS 35.0%
GCAAAGATGTCATAAGACAA+TGG - Chr5:8770853-8770872 None:intergenic 35.0%
TTGCGCAAAATTGAAAGAAG+TGG + Chr5:8770992-8771011 MsG0580024720.01.T01:CDS 35.0%
TTTGAAGATATGAAAGTGGC+TGG + Chr5:8770803-8770822 MsG0580024720.01.T01:CDS 35.0%
! AGGAGGAAACATCTTTTGTA+GGG - Chr5:8771035-8771054 None:intergenic 35.0%
! CATTTCTTTTGTGACAGCTA+GGG - Chr5:8770185-8770204 None:intergenic 35.0%
! TCATTTCTTTTGTGACAGCT+AGG - Chr5:8770186-8770205 None:intergenic 35.0%
!! AAATGCTTGTTGTAAAGCTG+GGG + Chr5:8770472-8770491 MsG0580024720.01.T01:CDS 35.0%
!! TTGTAGACAAAGGTGTTTCT+TGG - Chr5:8770223-8770242 None:intergenic 35.0%
AAACACTTCAAAGCCTTCTC+TGG - Chr5:8770785-8770804 None:intergenic 40.0%
AACATTGAAGAATGATGGCC+TGG + Chr5:8770093-8770112 MsG0580024720.01.T01:CDS 40.0%
AATGTATGATTGAGCAACGG+TGG - Chr5:8770885-8770904 None:intergenic 40.0%
ACACCACTCTTATACATGGT+TGG + Chr5:8770744-8770763 MsG0580024720.01.T01:CDS 40.0%
ACCATGTATAAGAGTGGTGT+AGG - Chr5:8770744-8770763 None:intergenic 40.0%
ACCTACACCACTCTTATACA+TGG + Chr5:8770740-8770759 MsG0580024720.01.T01:CDS 40.0%
CACCACTCTTATACATGGTT+GGG + Chr5:8770745-8770764 MsG0580024720.01.T01:CDS 40.0%
CCTGATGCAACAAATGAGAA+AGG + Chr5:8770409-8770428 MsG0580024720.01.T01:CDS 40.0%
CGCAAAATTGAAAGAAGTGG+AGG + Chr5:8770995-8771014 MsG0580024720.01.T01:CDS 40.0%
GAAGTGTAGGTATGGATATC+CGG - Chr5:8770446-8770465 None:intergenic 40.0%
TGCACTCATGACGAAGATTA+TGG + Chr5:8771175-8771194 MsG0580024720.01.T01:CDS 40.0%
TTATGTGATGTCCAATCAGG+AGG - Chr5:8771052-8771071 None:intergenic 40.0%
TTGTGAGAGAGAACAGATTG+TGG - Chr5:8770030-8770049 None:intergenic 40.0%
! CAGGAGGAAACATCTTTTGT+AGG - Chr5:8771036-8771055 None:intergenic 40.0%
! CCTTTCTCATTTGTTGCATC+AGG - Chr5:8770412-8770431 None:intergenic 40.0%
! TAAGAGTGGTGTAGGTTTTG+AGG - Chr5:8770736-8770755 None:intergenic 40.0%
!! TACGTATGAGGCATTGTTGA+AGG + Chr5:8770129-8770148 MsG0580024720.01.T01:CDS 40.0%
AGCCCAACCATGTATAAGAG+TGG - Chr5:8770750-8770769 None:intergenic 45.0%
ATATGGGAACTGCAGTTCAC+TGG + Chr5:8770960-8770979 MsG0580024720.01.T01:CDS 45.0%
CGATAACCTGTGTTGCATTC+TGG - Chr5:8770682-8770701 None:intergenic 45.0%
GTCATCGTTATCGCTTTCAC+TGG - Chr5:8771155-8771174 None:intergenic 45.0%
TTGTAAAGCTGGGGATATGC+AGG + Chr5:8770481-8770500 MsG0580024720.01.T01:CDS 45.0%
! ATCGAAGAAATGGAAGCACG+TGG + Chr5:8770698-8770717 MsG0580024720.01.T01:CDS 45.0%
!! TTGAAGGCTTGTTGCAAGTC+AGG + Chr5:8770145-8770164 MsG0580024720.01.T01:CDS 45.0%
!!! GTGGTGTAGGTTTTGAGGTT+TGG - Chr5:8770731-8770750 None:intergenic 45.0%
CAATGGTACACTGCTCTGTC+TGG - Chr5:8770836-8770855 None:intergenic 50.0%
TGTGTGCCAGAATGCAACAC+AGG + Chr5:8770673-8770692 MsG0580024720.01.T01:intron 50.0%
!! GAGAAAGGAAGGCGTTCAAC+CGG + Chr5:8770424-8770443 MsG0580024720.01.T01:CDS 50.0%
!!! CTTTTTAGTTGGGCTCGGAG+AGG + Chr5:8770365-8770384 MsG0580024720.01.T01:intron 50.0%
!!! TCGTGCTGCTTTTCCAGAGA+AGG + Chr5:8770769-8770788 MsG0580024720.01.T01:CDS 50.0%
GGCTCGGAGAGGTGATGTTT+GGG + Chr5:8770376-8770395 MsG0580024720.01.T01:CDS 55.0%
GGGCTCGGAGAGGTGATGTT+TGG + Chr5:8770375-8770394 MsG0580024720.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr5 gene 8770019 8771219 8770019 ID=MsG0580024720.01;Name=MsG0580024720.01
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Chr5 exon 8770019 8770287 8770019 ID=MsG0580024720.01.T01:exon:26380;Parent=MsG0580024720.01.T01
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Gene Sequence

>MsG0580024720.01.T01

ATCTGTTTCCACAATCTGTTCTCTCTCACAATCTGTTCTTCTCTTTCATGCGCTAGTGCCTTTCAGTATTTCACAACATTGAAGAATGATGGCCTGGAGATTGATGTATATACGTATGAGGCATTGTTGAAGGCTTGTTGCAAGTCAGGCAGAATGCAGAGTGCCCTAGCTGTCACAAAAGAAATGAGTGCGAAAAAGATTCCAAGAAACACCTTTGTCTACAACATTCTAATTGATGGGTATGATATGAATAGTTTACATCTGACAGATTGGGCTCGGAGAGGTGATGTTTGGGAAGCTTCAGACCTGATGCAACAAATGAGAAAGGAAGGCGTTCAACCGGATATCCATACCTACACTTCTTTTATAAATGCTTGTTGTAAAGCTGGGGATATGCAGAATGCAACACAGGTTATCGAAGAAATGGAAGCACGTGGTATAAAACCAAACCTCAAAACCTACACCACTCTTATACATGGTTGGGCTCGTGCTGCTTTTCCAGAGAAGGCTTTGAAGTGTTTTGAAGATATGAAAGTGGCTGGATTGAAACCAGACAGAGCAGTGTACCATTGTCTTATGACATCTTTGCTATCAAGAGCCACCGTTGCTCAATCATACATTTATAGTGGACTCTTGTCTATATGTAGAGAGATGATAGAATCTAAAATTACTATTGATATGGGAACTGCAGTTCACTGGTCGAGATGTTTGCGCAAAATTGAAAGAAGTGGAGGAGAACTGACTGAAGCCCTACAAAAGATGTTTCCTCCTGATTGGACATCACATAATATTCTTGTTGTTAACTGTGAAATAGAAACTGCTGATCCTGAAATTGACGATCATAATGACGATGATATTGTATATTATTCCAGTGAAAGCGATAACGATGACTGCACTCATGACGAAGATTATGGTCATGATATGTCAGACACGTGA
Protein sequence

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ICFHNLFSLTICSSLSCASAFQYFTTLKNDGLEIDVYTYEALLKACCKSGRMQSALAVTKEMSAKKIPRNTFVYNILIDGYDMNSLHLTDWARRGDVWEASDLMQQMRKEGVQPDIHTYTSFINACCKAGDMQNATQVIEEMEARGIKPNLKTYTTLIHGWARAAFPEKALKCFEDMKVAGLKPDRAVYHCLMTSLLSRATVAQSYIYSGLLSICREMIESKITIDMGTAVHWSRCLRKIERSGGELTEALQKMFPPDWTSHNILVVNCEIETADPEIDDHNDDDIVYYSSESDNDDCTHDEDYGHDMSDT*