AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0580029184.01

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MsG0580029184.01.T01 AT3G02130 28.615 975 572 30 58 993 258 1147 4.50e-80 284
MsG0580029184.01.T01 AT3G02130 28.054 663 421 20 5 622 26 677 2.05e-40 162
MsG0580029184.01.T01 AT1G71400 34.846 551 327 9 47 573 65 607 2.66e-77 271
MsG0580029184.01.T01 AT1G71400 27.381 504 268 11 66 478 254 750 7.57e-36 147
MsG0580029184.01.T01 AT1G71400 30.505 436 222 9 261 625 112 537 2.44e-34 142
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MsG0580029184.01.T01 AT1G12460 28.782 476 304 7 2 451 3 469 3.39e-44 173
MsG0580029184.01.T01 AT1G73066 33.923 622 368 11 5 621 10 593 4.99e-71 248
MsG0580029184.01.T01 AT1G73066 31.144 472 285 8 157 623 64 500 7.09e-52 193
MsG0580029184.01.T01 AT1G73066 31.071 280 147 2 68 301 315 594 5.80e-26 114
MsG0580029184.01.T01 AT5G51350 26.993 941 556 27 31 950 45 875 1.87e-70 253
MsG0580029184.01.T01 AT5G51350 27.193 228 127 6 432 622 42 267 2.58e-11 68.6
MsG0580029184.01.T01 AT3G05370 31.743 608 348 10 25 597 34 609 5.10e-65 236
MsG0580029184.01.T01 AT3G05370 26.498 434 265 7 64 472 373 777 6.13e-29 125
MsG0580029184.01.T01 AT3G05370 31.053 190 105 4 460 624 110 298 8.80e-12 70.1
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MsG0580029184.01.T01 AT1G71390 29.714 700 400 17 8 632 19 701 4.59e-60 221
MsG0580029184.01.T01 AT1G71390 28.700 446 258 11 92 487 296 731 4.27e-32 135
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MsG0580029184.01.T01 AT4G39400 30.885 531 312 12 30 533 296 798 1.67e-38 156
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MsG0580029184.01.T01 AT3G28890 30.198 606 353 12 25 597 41 609 2.30e-52 196
MsG0580029184.01.T01 AT3G28890 30.684 453 249 7 67 459 170 617 2.60e-40 160
MsG0580029184.01.T01 AT3G11010 29.331 658 344 15 25 575 42 685 2.34e-52 199
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MsG0580029184.01.T01 AT3G11010 35.379 277 168 3 331 607 139 404 4.19e-27 119
MsG0580029184.01.T01 AT3G11010 28.460 513 309 21 68 547 330 817 2.92e-22 103
MsG0580029184.01.T01 AT3G11010 36.082 194 109 5 430 621 117 297 4.00e-15 80.9
MsG0580029184.01.T01 AT3G11010 28.786 667 345 13 25 575 42 694 2.98e-52 199
MsG0580029184.01.T01 AT3G11010 28.931 636 359 15 71 618 222 852 1.79e-38 155
MsG0580029184.01.T01 AT3G11010 33.555 301 174 3 331 607 115 413 1.07e-29 127
MsG0580029184.01.T01 AT3G11010 28.460 513 309 21 68 547 339 826 3.56e-22 103
MsG0580029184.01.T01 AT3G11010 38.660 194 113 4 430 621 117 306 2.38e-20 97.8
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MsG0580029184.01.T01 AT4G13820 29.787 470 278 12 161 597 107 557 9.34e-35 143
MsG0580029184.01.T01 AT4G13820 30.769 455 280 13 181 622 103 535 4.49e-29 125
MsG0580029184.01.T01 AT4G13820 34.419 215 140 1 377 591 99 312 2.25e-20 97.4
MsG0580029184.01.T01 AT4G13820 28.613 346 216 14 86 420 393 718 8.78e-20 95.5
MsG0580029184.01.T01 AT2G13790 29.245 530 332 14 485 995 77 582 1.62e-51 192
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MsG0580029184.01.T01 AT3G05650 28.595 612 378 15 20 586 38 635 4.21e-48 186
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MsG0580029184.01.T01 AT3G05650 30.645 248 145 3 364 611 121 341 2.03e-22 104
MsG0580029184.01.T01 AT1G66830 26.087 690 371 22 359 986 63 675 5.79e-48 183
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MsG0580029184.01.T01 AT5G63710 27.163 497 315 11 512 991 97 563 9.85e-44 169
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MsG0580029184.01.T01 AT5G10020 26.182 592 342 14 24 577 25 559 9.75e-38 154
MsG0580029184.01.T01 AT5G10020 28.095 420 257 11 187 600 75 455 1.54e-27 121
MsG0580029184.01.T01 AT5G59260 32.591 359 202 13 642 989 295 624 2.86e-43 169
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MsG0580029184.01.T01 AT5G49290 30.357 448 255 14 75 502 448 858 2.36e-22 104
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MsG0580029184.01.T01 AT1G56120 32.766 235 152 5 364 597 1 230 1.14e-20 98.6
MsG0580029184.01.T01 AT1G56120 33.333 231 146 4 396 624 9 233 2.23e-20 97.8
MsG0580029184.01.T01 AT1G56120 32.000 225 126 3 80 280 13 234 7.72e-20 95.9
MsG0580029184.01.T01 AT1G56120 30.328 244 130 6 285 501 1 231 9.01e-19 92.4
MsG0580029184.01.T01 AT1G56120 31.980 197 128 3 67 262 48 239 4.59e-16 84.0
MsG0580029184.01.T01 AT5G59270 31.054 351 208 10 645 989 299 621 3.68e-41 162
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MsG0580029184.01.T01 AT5G59270 31.054 351 208 10 645 989 315 637 4.24e-41 162
MsG0580029184.01.T01 AT1G07390 27.941 680 366 19 57 635 300 956 4.74e-41 164
MsG0580029184.01.T01 AT1G07390 29.207 517 297 15 113 573 257 760 5.09e-32 135
MsG0580029184.01.T01 AT1G07390 25.446 672 355 28 54 622 38 666 3.75e-17 87.4
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MsG0580029184.01.T01 AT1G56145 33.106 293 166 9 625 908 613 884 1.99e-39 159
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MsG0580029184.01.T01 AT1G56145 32.636 239 153 5 75 307 126 362 6.90e-27 119
MsG0580029184.01.T01 AT1G56145 29.545 352 229 8 221 569 56 391 6.32e-25 112
MsG0580029184.01.T01 AT1G56145 32.046 259 147 4 339 573 120 373 7.19e-23 105
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MsG0580029184.01.T01 AT2G43700 31.003 329 194 10 653 974 264 566 2.58e-39 156
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MsG0580029184.01.T01 AT1G61500 31.421 366 207 12 641 989 406 744 1.21e-38 155
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MsG0580029184.01.T01 AT1G51810 31.481 378 215 10 555 912 300 653 2.85e-38 154
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MsG0580029184.01.T01 AT1G61360 34.007 297 158 9 636 909 336 617 4.07e-38 153
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MsG0580029184.01.T01 AT3G24982 29.430 649 354 21 59 622 194 823 1.35e-31 134
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MsG0580029184.01.T01 AT1G07560 31.842 380 207 13 561 913 417 771 1.96e-37 152
MsG0580029184.01.T01 AT2G18890 34.256 289 151 11 687 961 57 320 1.97e-37 144
MsG0580029184.01.T01 AT1G56145 31.111 315 170 9 625 908 613 911 1.99e-37 152
MsG0580029184.01.T01 AT1G56145 33.099 284 173 6 221 501 105 374 3.07e-28 123
MsG0580029184.01.T01 AT1G56145 32.707 266 175 4 367 631 99 361 2.10e-27 120
MsG0580029184.01.T01 AT1G56145 32.636 239 153 5 75 307 126 362 4.70e-27 119
MsG0580029184.01.T01 AT1G56145 29.545 352 229 8 221 569 56 391 2.94e-25 114
MsG0580029184.01.T01 AT1G56145 28.906 256 175 3 67 319 95 346 5.26e-23 106
MsG0580029184.01.T01 AT1G56145 32.046 259 147 4 339 573 120 373 6.08e-23 106
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MsG0580029184.01.T01 AT1G58190 27.534 661 396 20 24 621 40 680 3.84e-36 148
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MsG0580029184.01.T01 AT5G37450 39.231 130 75 4 148 276 4 130 3.66e-11 67.8
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MsG0580029184.01.T01 AT2G11520 36.293 259 129 9 671 912 190 429 4.68e-36 144
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MsG0580029184.01.T01 AT5G40170 27.594 424 232 19 261 631 91 492 1.71e-13 75.5
MsG0580029184.01.T01 AT1G61440 32.000 325 154 11 691 979 476 769 5.01e-36 147
MsG0580029184.01.T01 AT1G11410 33.333 303 167 10 694 989 495 769 5.03e-36 147
MsG0580029184.01.T01 AT5G37450 29.737 380 212 11 639 992 552 902 5.09e-36 148
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MsG0580029184.01.T01 AT5G35580 38.235 238 117 8 687 912 77 296 3.62e-35 141
MsG0580029184.01.T01 AT1G68690 34.661 251 142 5 667 913 346 578 3.65e-35 144
MsG0580029184.01.T01 AT3G02810 32.258 310 181 7 687 989 53 340 3.67e-35 142
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MsG0580029184.01.T01 AT3G23010 30.097 412 260 9 89 478 115 520 3.04e-33 137
MsG0580029184.01.T01 AT3G23010 29.584 409 250 7 66 459 140 525 1.87e-31 131
MsG0580029184.01.T01 AT3G23010 29.923 391 231 13 215 575 1 378 3.27e-27 118
MsG0580029184.01.T01 AT5G01020 32.239 335 184 11 668 989 42 346 4.97e-35 139
MsG0580029184.01.T01 AT2G25220 32.362 309 174 9 691 992 144 424 4.99e-35 139
MsG0580029184.01.T01 AT1G61610 31.126 302 169 9 687 979 514 785 5.41e-35 144
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MsG0580029184.01.T01 AT1G68690 33.333 264 154 5 653 912 332 577 5.87e-35 143
MsG0580029184.01.T01 AT2G28930 37.838 259 130 10 668 913 54 294 6.18e-35 139

Find 216 sgRNAs with CRISPR-Local

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CATATTGGCAATAACAATTT+TGG 0.049770 5:+93381428 MsG0580029184.01.T01:CDS
AAGAATATGAAGTTTGTTTA+AGG 0.108690 5:-93381405 None:intergenic
GATAGGTTGTAAATAGAATT+AGG 0.157411 5:-93381170 None:intergenic
ACTATTGCAAGAACTAATTT+TGG 0.168441 5:+93381502 MsG0580029184.01.T01:CDS
TTCAAAAGACCAACTTCTTT+TGG 0.172513 5:-93380810 None:intergenic
GGTAAGATTCCTATTGTTAT+TGG 0.182757 5:+93381761 MsG0580029184.01.T01:CDS
TGCATTTGGAAAATCAAAAT+TGG 0.187570 5:+93380703 MsG0580029184.01.T01:CDS
CAGCTTAATAAGTTGCTTCT+TGG 0.190638 5:+93380978 MsG0580029184.01.T01:CDS
GGTCCCATTCCCTCAGATTT+TGG 0.193505 5:+93381980 MsG0580029184.01.T01:CDS
TTCTTGCAAGTGTTATATTT+TGG 0.193936 5:-93381055 None:intergenic
TAATTCTTCCTACATGTTCT+AGG 0.193946 5:+93382359 MsG0580029184.01.T01:CDS
ATCAGTTGTCCAATTCTTTC+AGG 0.200309 5:-93381626 None:intergenic
TTTATCCTCATCATTGTTAT+TGG 0.204469 5:+93382421 MsG0580029184.01.T01:CDS
AATGTTTCCTTCTAATTTAT+TGG 0.211431 5:-93381819 None:intergenic
GGGAACAATACCACCTTCTT+TGG 0.215545 5:+93381016 MsG0580029184.01.T01:CDS
AAATTTGAAAGAGCTAAATT+TGG 0.223217 5:+93381121 MsG0580029184.01.T01:CDS
AGTTAATTCCTCCACCATTA+AGG 0.231835 5:+93383098 MsG0580029184.01.T01:CDS
ATTGCTAAAGACACCTATTA+TGG 0.232185 5:-93382281 None:intergenic
AATTGGAATGTTGAGGAATA+TGG 0.234378 5:+93381706 MsG0580029184.01.T01:CDS
TGTCACTGCAACTTCACTTA+TGG 0.252463 5:+93382303 MsG0580029184.01.T01:CDS
TACTGAGAAGGCTTTAAGTT+TGG 0.271301 5:-93381267 None:intergenic
ATATCCTATAGTTCCCTTAA+TGG 0.280923 5:-93383112 None:intergenic
AAACTTCATATTCTTCATAT+TGG 0.289807 5:+93381413 MsG0580029184.01.T01:CDS
CTCAACATTCCAATTGAATC+TGG 0.296437 5:-93381698 None:intergenic
GTTTGTGTATAGATTCAAAA+TGG 0.298033 5:-93382020 None:intergenic
TGCTTGAAAGGTCTAAGATT+TGG 0.306767 5:-93382165 None:intergenic
CCATACTAAGCCAAGTTAGA+TGG 0.307711 5:-93381577 None:intergenic
CTTCTGTTAGAGATGCTTAC+TGG 0.311174 5:+93383404 MsG0580029184.01.T01:CDS
CTTGGAGAAAACCAATTGTT+AGG 0.314550 5:+93381212 MsG0580029184.01.T01:CDS
ACTGAGAAGGCTTTAAGTTT+GGG 0.315312 5:-93381266 None:intergenic
GGCAATCTTACCAAGTTGTC+TGG 0.324297 5:+93381782 MsG0580029184.01.T01:CDS
CAAACATTTGGCTATCTAGA+AGG 0.329454 5:+93381920 MsG0580029184.01.T01:CDS
TGGAAGTATACCTTCCTTCT+TGG 0.329824 5:+93382123 MsG0580029184.01.T01:CDS
GCATCCTGATCCGACCAAAT+TGG 0.332617 5:-93382593 None:intergenic
GCATTTGGAAAATCAAAATT+GGG 0.334244 5:+93380704 MsG0580029184.01.T01:CDS
ATAGGTTGTAAATAGAATTA+GGG 0.338482 5:-93381169 None:intergenic
GAGAGTCTCTGTCTTGCATT+TGG 0.344135 5:+93380689 MsG0580029184.01.T01:CDS
AATCTCTTCATTTCTGTGAA+TGG 0.345539 5:+93380637 MsG0580029184.01.T01:CDS
ACAACATGTACAACAACAAA+TGG 0.346701 5:-93380500 None:intergenic
TGAGGGAATGGGACCGGTTA+AGG 0.349793 5:-93381972 None:intergenic
CAAATGTTTGATCAGGTATA+TGG 0.350320 5:-93381907 None:intergenic
TGGACCAATACCTCCAACTT+TGG 0.352517 5:+93381379 MsG0580029184.01.T01:CDS
ATGGCGGGTAATCAAATATA+TGG 0.355973 5:+93381596 MsG0580029184.01.T01:CDS
AGAAGGAATTCTTGATATAG+TGG 0.358148 5:+93383496 MsG0580029184.01.T01:CDS
GGACAACTGATTGGTCTAAC+AGG 0.361117 5:+93381638 MsG0580029184.01.T01:CDS
CAAAATTGGGGTGGTACTCT+TGG 0.362150 5:+93380717 MsG0580029184.01.T01:CDS
GGAAGAATACCTGAAAGAAT+TGG 0.363595 5:+93381617 MsG0580029184.01.T01:CDS
GGAAATGTTCCCTCATGGTT+TGG 0.365862 5:+93380945 MsG0580029184.01.T01:CDS
TATGGCGAGGTTCCCATAAT+AGG 0.366715 5:+93382268 MsG0580029184.01.T01:CDS
GTTGAGGAATATGGTAATAT+TGG 0.369063 5:+93381715 MsG0580029184.01.T01:CDS
TTGCAAGAAAACAAACTATC+TGG 0.371486 5:+93381740 MsG0580029184.01.T01:CDS
GGAAATATTCCAGATTCAAT+TGG 0.379571 5:+93381689 MsG0580029184.01.T01:CDS
CTGCATACCAATAAATTAGA+AGG 0.380559 5:+93381812 MsG0580029184.01.T01:CDS
ATCTCTTCATTTCTGTGAAT+GGG 0.380758 5:+93380638 MsG0580029184.01.T01:CDS
TACCAACTGCACCAGTCTTA+AGG 0.382063 5:+93380893 MsG0580029184.01.T01:CDS
GGAAGTATACCTTCCTTCTT+GGG 0.384399 5:+93382124 MsG0580029184.01.T01:CDS
GGATTAGCTAGGCTCATTCA+TGG 0.385276 5:+93383048 MsG0580029184.01.T01:CDS
CCATCTAACTTGGCTTAGTA+TGG 0.386072 5:+93381577 MsG0580029184.01.T01:CDS
TTCAACACCTTTACAACAAT+AGG 0.389020 5:-93382658 None:intergenic
GTCACTGCAACTTCACTTAT+GGG 0.391876 5:+93382304 MsG0580029184.01.T01:CDS
AACACTTGCAAGAAATCAAT+TGG 0.392143 5:+93381064 MsG0580029184.01.T01:CDS
TGTTCAAGTGTTGATTATAA+TGG 0.393310 5:+93382775 MsG0580029184.01.T01:CDS
CAAATTCCCAATGAACTTGC+TGG 0.394953 5:+93382055 MsG0580029184.01.T01:CDS
TCATCCAATTTGGTCGGATC+AGG 0.396467 5:+93382589 MsG0580029184.01.T01:CDS
TTGGGTTCAAATAATTTCTC+AGG 0.398568 5:+93381140 MsG0580029184.01.T01:CDS
TTGGTCGGATCAGGATGCTT+TGG 0.405963 5:+93382598 MsG0580029184.01.T01:CDS
TGGGTAACAATGATCTTTGT+GGG 0.408935 5:+93382323 MsG0580029184.01.T01:CDS
CATATACCTGATCAAACATT+TGG 0.409887 5:+93381908 MsG0580029184.01.T01:CDS
TTAGGATCTTAACAAGATTC+CGG 0.414083 5:-93382747 None:intergenic
TGAAAGACCTATTGTTGTAA+AGG 0.414623 5:+93382651 MsG0580029184.01.T01:CDS
CAACACTTGAACAACAAGTT+AGG 0.415059 5:-93382765 None:intergenic
TCCTCATCATTGTTATTGGC+GGG 0.415271 5:+93382425 MsG0580029184.01.T01:CDS
TTCTTGCAATAGTGTACAAT+TGG 0.415798 5:-93381492 None:intergenic
AGGAAATATACCACATGTCT+TGG 0.417330 5:+93381088 MsG0580029184.01.T01:CDS
TTGTCCAACAACTCCTTAAC+CGG 0.417893 5:+93381959 MsG0580029184.01.T01:CDS
CTAGTGATGTTTGCTAAAAT+AGG 0.420102 5:+93383587 MsG0580029184.01.T01:CDS
GGAACAATACCACCTTCTTT+GGG 0.421192 5:+93381017 MsG0580029184.01.T01:CDS
GTTAATTCCTCCACCATTAA+GGG 0.421425 5:+93383099 MsG0580029184.01.T01:CDS
GTAAGATTGCCAATAACAAT+AGG 0.423996 5:-93381770 None:intergenic
ATGAAGAAGAATTTCTTTGA+GGG 0.424115 5:+93381668 MsG0580029184.01.T01:CDS
AATTTGAAAGAGCTAAATTT+GGG 0.425726 5:+93381122 MsG0580029184.01.T01:CDS
TTGAAAGAAAAGTTTATCAA+TGG 0.429673 5:+93380585 MsG0580029184.01.T01:CDS
GTAGCCCACTTGGGAGACTT+TGG 0.432806 5:+93383027 MsG0580029184.01.T01:CDS
CAAACAACCAGCAAGTTCAT+TGG 0.436601 5:-93382062 None:intergenic
GGACCAATACCTCCAACTTT+GGG 0.437248 5:+93381380 MsG0580029184.01.T01:CDS
GAAAGAATTGGACAACTGAT+TGG 0.439711 5:+93381629 MsG0580029184.01.T01:CDS
ATCCTCATCATTGTTATTGG+CGG 0.443304 5:+93382424 MsG0580029184.01.T01:CDS
TTCCATGATGGAAGAGCATC+AGG 0.444702 5:-93380612 None:intergenic
AGATAGCCAAATGTTTGATC+AGG 0.444748 5:-93381914 None:intergenic
TATGAAGAAGAATTTCTTTG+AGG 0.445512 5:+93381667 MsG0580029184.01.T01:CDS
GTTCATGCCGAATGGGAGTC+TGG 0.449436 5:+93382825 MsG0580029184.01.T01:CDS
GATCCCAAAGTTGGAGGTAT+TGG 0.449758 5:-93381383 None:intergenic
TTCACCATGCAAATTGATGT+TGG 0.452120 5:-93380784 None:intergenic
GGTACTCTTGGACCATCCTT+AGG 0.453397 5:+93380729 MsG0580029184.01.T01:CDS
ATGGAAGAGAACCTAACAAT+TGG 0.457756 5:-93381223 None:intergenic
ATGGGTAACAATGATCTTTG+TGG 0.457881 5:+93382322 MsG0580029184.01.T01:CDS
CAGATAAAACCCAGACAACT+TGG 0.462494 5:-93381792 None:intergenic
TCCACCATTAAGGGAACTAT+AGG 0.464057 5:+93383108 MsG0580029184.01.T01:CDS
TGCTCTCTAAGAAACATAAG+AGG 0.464099 5:+93382383 MsG0580029184.01.T01:CDS
TTATAATGGTGAAGATTTCA+AGG 0.466826 5:+93382789 MsG0580029184.01.T01:CDS
AAATCAAGAGGTAAATTTGA+TGG 0.467911 5:-93381242 None:intergenic
AAACAACCAGCAAGTTCATT+GGG 0.471538 5:-93382061 None:intergenic
TTGCTAAAGACACCTATTAT+GGG 0.478859 5:-93382280 None:intergenic
TGTTGTGGAAAACAACATAA+AGG 0.479381 5:+93383559 MsG0580029184.01.T01:CDS
GGATTCTCAAGGGTGACATA+TGG 0.479954 5:+93382535 MsG0580029184.01.T01:CDS
TTGGATAACAATAGATTTGG+CGG 0.481590 5:+93381521 MsG0580029184.01.T01:CDS
AAGTTCATTGGGAATTTGAC+CGG 0.484687 5:-93382050 None:intergenic
CAGATTCAATTGGAATGTTG+AGG 0.485190 5:+93381699 MsG0580029184.01.T01:CDS
GTTACCAAAATCTGAGGGAA+TGG 0.486837 5:-93381984 None:intergenic
GGGACCGGTTAAGGAGTTGT+TGG 0.488017 5:-93381963 None:intergenic
CTTAAAGCCTTCTCAGTAGG+AGG 0.489173 5:+93381272 MsG0580029184.01.T01:CDS
GGAAATATACCACATGTCTT+GGG 0.490157 5:+93381089 MsG0580029184.01.T01:CDS
GTGAGGTTGGATATTGAAGA+AGG 0.490177 5:-93381317 None:intergenic
GAGAAAGGTTAGATTTCCTA+AGG 0.491609 5:-93380745 None:intergenic
GTGCAATATCTTAGAGTCCA+TGG 0.494071 5:-93381842 None:intergenic
TGGAGCAGCAAAGAGTTTCA+TGG 0.494585 5:+93382693 MsG0580029184.01.T01:CDS
GTGCAGTTGGTAAACTCAAA+AGG 0.497021 5:-93380882 None:intergenic
CTTTCCAACATCAATTTGCA+TGG 0.499582 5:+93380780 MsG0580029184.01.T01:CDS
ATATCATGGAACAGTTTCAA+TGG 0.501417 5:+93381359 MsG0580029184.01.T01:CDS
TTGTGAGCATTCGATGAGTA+GGG 0.501770 5:-93383631 None:intergenic
TTTGTGAGCATTCGATGAGT+AGG 0.504715 5:-93383632 None:intergenic
CAACTTATTAAGCTGCATCA+TGG 0.505719 5:-93380970 None:intergenic
GGTGTATTGCAAGATCGAAT+AGG 0.507626 5:+93381542 MsG0580029184.01.T01:CDS
TAGTGAAGTTATTGCTTGAA+AGG 0.507851 5:-93382177 None:intergenic
TTGAAAGGTCTAAGATTTGG+AGG 0.512590 5:-93382162 None:intergenic
TGATGACATGGTAGCCCACT+TGG 0.513635 5:+93383017 MsG0580029184.01.T01:CDS
CTATACACAAACAAGTTGTC+CGG 0.515206 5:+93382031 MsG0580029184.01.T01:CDS
CAGGGAGATATCTATAGCTA+TGG 0.518889 5:+93383377 MsG0580029184.01.T01:CDS
TTTAAGGATCCCAAAGTTGG+AGG 0.519174 5:-93381389 None:intergenic
TGAATCTCAATTTCATGCAA+AGG 0.520058 5:+93382890 MsG0580029184.01.T01:CDS
TTGTTTAAGGATCCCAAAGT+TGG 0.522842 5:-93381392 None:intergenic
CAAGATAATATCCTTAAGAC+TGG 0.523593 5:-93380904 None:intergenic
ATACCGCAATTCTGTGAGGT+TGG 0.524155 5:-93381330 None:intergenic
AGGTGGTATGGTATCACCAC+AGG 0.524921 5:+93383358 MsG0580029184.01.T01:intron
TACCTGATGCTCTTCCATCA+TGG 0.529686 5:+93380610 MsG0580029184.01.T01:CDS
CAACATGTACAACAACAAAT+GGG 0.532523 5:-93380499 None:intergenic
TGTAAGATGAAAATTCAAGA+AGG 0.533141 5:+93383479 MsG0580029184.01.T01:CDS
AGAATATGGATCAGGTGGTA+TGG 0.533923 5:+93383346 MsG0580029184.01.T01:intron
GCAATCTTACCAAGTTGTCT+GGG 0.534146 5:+93381783 MsG0580029184.01.T01:CDS
TTACCAAAATCTGAGGGAAT+GGG 0.536351 5:-93381983 None:intergenic
CCTCATCATTGTTATTGGCG+GGG 0.539423 5:+93382426 MsG0580029184.01.T01:CDS
ATCCTTAAGACTGGTGCAGT+TGG 0.539665 5:-93380895 None:intergenic
GTGGTTCCCTCCTACTGAGA+AGG 0.540362 5:-93381279 None:intergenic
CATACTAAGCCAAGTTAGAT+GGG 0.540603 5:-93381576 None:intergenic
CTTCATTTCTGTGAATGGGA+GGG 0.541557 5:+93380642 MsG0580029184.01.T01:CDS
AGAAGGAAGGTATACTTCCA+TGG 0.545965 5:-93382120 None:intergenic
GGTGAAATTCCAAAAGAAGT+TGG 0.546356 5:+93380801 MsG0580029184.01.T01:CDS
TGCTTTGGTTCTGTTTACAC+AGG 0.547006 5:+93382613 MsG0580029184.01.T01:CDS
CTTCAAGTTACCAAAATCTG+AGG 0.547037 5:-93381990 None:intergenic
AAGGTTAGATTTCCTAAGGA+TGG 0.548060 5:-93380741 None:intergenic
CTAACTTGGCTTAGTATGGC+GGG 0.550030 5:+93381581 MsG0580029184.01.T01:CDS
CTGAGAAGGCTTTAAGTTTG+GGG 0.551045 5:-93381265 None:intergenic
TGGGAGACTTTGGATTAGCT+AGG 0.551750 5:+93383037 MsG0580029184.01.T01:CDS
ATGGCGGAATGCAAAGCTCT+AGG 0.553074 5:+93382712 MsG0580029184.01.T01:CDS
GATGAAATATTTCCCAAAGA+AGG 0.553711 5:-93381029 None:intergenic
TAAGCAGAAGTTGCTCTGCT+AGG 0.556440 5:+93383682 MsG0580029184.01.T01:CDS
TATAGTTCCCTTAATGGTGG+AGG 0.561589 5:-93383106 None:intergenic
ATTGGATGATGAAAATCCAT+TGG 0.562302 5:-93382575 None:intergenic
CTCTAGGAAAGATTAAGCAC+CGG 0.563498 5:+93382728 MsG0580029184.01.T01:CDS
TCACAAAAGATGTTATCTGT+TGG 0.563725 5:-93383434 None:intergenic
ACTATAGGATATGTTCCTCC+TGG 0.564251 5:+93383123 MsG0580029184.01.T01:CDS
AATTAGAAGGAAACATTCCA+TGG 0.568143 5:+93381825 MsG0580029184.01.T01:CDS
CATTTGGAAAATCAAAATTG+GGG 0.568589 5:+93380705 MsG0580029184.01.T01:CDS
GATTTGGAGGGATCTTAATG+AGG 0.569618 5:-93382149 None:intergenic
TCTTCATTTCTGTGAATGGG+AGG 0.570309 5:+93380641 MsG0580029184.01.T01:CDS
GAGAGCAACCTAGAACATGT+AGG 0.574255 5:-93382367 None:intergenic
AAAATCTGAGGGAATGGGAC+CGG 0.575584 5:-93381978 None:intergenic
TCTTGGAGCTAATAATCTAG+TGG 0.579401 5:+93380995 MsG0580029184.01.T01:CDS
TGAAGAGATTCATTCCATGA+TGG 0.580667 5:-93380624 None:intergenic
TTAAGTTTGGGGAAATCAAG+AGG 0.582306 5:-93381254 None:intergenic
TCACTGGAAATGTTCCCTCA+TGG 0.582689 5:+93380940 MsG0580029184.01.T01:CDS
AAACTTAAAGCCTTCTCAGT+AGG 0.583392 5:+93381269 MsG0580029184.01.T01:CDS
CTTGCAAGAAATCAATTGGA+AGG 0.583853 5:+93381068 MsG0580029184.01.T01:CDS
AACACTAAATGATTGCAACT+TGG 0.585385 5:-93381864 None:intergenic
TCATCAAGAAGAACATTGCT+CGG 0.588858 5:-93382997 None:intergenic
TCCTATAGTTCCCTTAATGG+TGG 0.590318 5:-93383109 None:intergenic
TCTTAATGAGGATCCCAAGA+AGG 0.591588 5:-93382137 None:intergenic
TCGATGAGTAGGGAATTCTT+CGG 0.594088 5:-93383621 None:intergenic
CTTGGAGCTAATAATCTAGT+GGG 0.606140 5:+93380996 MsG0580029184.01.T01:CDS
TGAAAGGTCTAAGATTTGGA+GGG 0.610077 5:-93382161 None:intergenic
TTGGAAAATCAAAATTGGGG+TGG 0.610198 5:+93380708 MsG0580029184.01.T01:CDS
AATGAGGATCCCAAGAAGGA+AGG 0.612164 5:-93382133 None:intergenic
CGGTGAAGAAGGTAACTTCG+CGG 0.614117 5:-93382500 None:intergenic
GGGTAACAATGATCTTTGTG+GGG 0.615476 5:+93382324 MsG0580029184.01.T01:CDS
GAGTTACATGAAGCAACCAA+TGG 0.615634 5:+93382559 MsG0580029184.01.T01:CDS
GTTTCTAACAACAACTTGAG+TGG 0.615751 5:+93381884 MsG0580029184.01.T01:CDS
TTAAAGCCTTCTCAGTAGGA+GGG 0.617276 5:+93381273 MsG0580029184.01.T01:CDS
GAAATATTTCCCAAAGAAGG+TGG 0.617319 5:-93381026 None:intergenic
TCTAACTTGGCTTAGTATGG+CGG 0.618702 5:+93381580 MsG0580029184.01.T01:CDS
TCTCAACGTAGCTCATGCAT+TGG 0.629054 5:+93382924 MsG0580029184.01.T01:CDS
GACAACTTACCCAAGACATG+TGG 0.633306 5:-93381098 None:intergenic
TTCAAGTTACCAAAATCTGA+GGG 0.636936 5:-93381989 None:intergenic
CCCCGCCAATAACAATGATG+AGG 0.642662 5:-93382426 None:intergenic
TGTTCTTCTTGATGATGACA+TGG 0.656123 5:+93383005 MsG0580029184.01.T01:CDS
GTTAGATATTCTAGTTCACG+AGG 0.657011 5:-93382208 None:intergenic
CATGTAGGAAGAATTAATTG+AGG 0.657627 5:-93382352 None:intergenic
TAATCCAAAGTCTCCCAAGT+GGG 0.659314 5:-93383031 None:intergenic
GATGACATGGTAGCCCACTT+GGG 0.661293 5:+93383018 MsG0580029184.01.T01:CDS
AAGGAAACTTTCCGACCATG+TGG 0.662059 5:-93381298 None:intergenic
GTAGGAGGGAACCACATGGT+CGG 0.664267 5:+93381287 MsG0580029184.01.T01:CDS
TATCCAACCTCACAGAATTG+CGG 0.664726 5:+93381327 MsG0580029184.01.T01:CDS
GGTAACAATGATCTTTGTGG+GGG 0.666716 5:+93382325 MsG0580029184.01.T01:CDS
TGACGATCAAACACATGTTG+TGG 0.669562 5:+93383544 MsG0580029184.01.T01:CDS
CTCAGTAGGAGGGAACCACA+TGG 0.670551 5:+93381283 MsG0580029184.01.T01:CDS
ATCATGGAACCAAACCATGA+GGG 0.674112 5:-93380954 None:intergenic
CATCATGGAACCAAACCATG+AGG 0.686686 5:-93380955 None:intergenic
AGTCTGGAAAACATGTTGCA+TGG 0.689973 5:+93382841 MsG0580029184.01.T01:CDS
CAAAATACCGCAATTCTGTG+AGG 0.700056 5:-93381334 None:intergenic
CTAATCCAAAGTCTCCCAAG+TGG 0.703060 5:-93383032 None:intergenic
GGTGGTATGGTATCACCACA+GGG 0.719298 5:+93383359 MsG0580029184.01.T01:intron
GCAAGACAGAGACTCTCATG+TGG 0.721235 5:-93380683 None:intergenic
GAATGGGAGGGTGTTACATG+CGG 0.721549 5:+93380654 MsG0580029184.01.T01:CDS
GTGTTGAATCTTGAAACACG+TGG 0.724462 5:+93382673 MsG0580029184.01.T01:CDS
TAGCTATAGATATCTCCCTG+TGG 0.746367 5:-93383374 None:intergenic
TTAGATATTCTAGTTCACGA+GGG 0.747501 5:-93382207 None:intergenic
AGCAGCAAAGAGTTTCATGG+CGG 0.757418 5:+93382696 MsG0580029184.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! CAAAAATTTGAATATTTGAT+AGG - Chr5:93381190-93381209 None:intergenic 15.0%
!!! ATTCTTTAGAAAAGAAATTA+AGG - Chr5:93383311-93383330 None:intergenic 15.0%
!!! TTTTTAATATAATGAGATCA+AGG - Chr5:93383239-93383258 None:intergenic 15.0%
!! AAACTTCATATTCTTCATAT+TGG + Chr5:93381413-93381432 MsG0580029184.01.T01:CDS 20.0%
!! AAATTTGAAAGAGCTAAATT+TGG + Chr5:93381121-93381140 MsG0580029184.01.T01:CDS 20.0%
!! AATGTTTCCTTCTAATTTAT+TGG - Chr5:93381822-93381841 None:intergenic 20.0%
!! AATTTGAAAGAGCTAAATTT+GGG + Chr5:93381122-93381141 MsG0580029184.01.T01:CDS 20.0%
!! ATAGGTTGTAAATAGAATTA+GGG - Chr5:93381172-93381191 None:intergenic 20.0%
!! TTAGAAAAGAAATTAAGGAA+TGG - Chr5:93383306-93383325 None:intergenic 20.0%
!! TTGAAAGAAAAGTTTATCAA+TGG + Chr5:93380585-93380604 MsG0580029184.01.T01:CDS 20.0%
!!! AAGAATATGAAGTTTGTTTA+AGG - Chr5:93381408-93381427 None:intergenic 20.0%
!!! AATATTCAAATTTTTGTCCT+TGG + Chr5:93381194-93381213 MsG0580029184.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATATTGGCAATAACAATTTT+GGG + Chr5:93381429-93381448 MsG0580029184.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATTTTGGATAACAATAGATT+TGG + Chr5:93381518-93381537 MsG0580029184.01.T01:CDS 20.0%
!!! TAGCACATGAAATATTTTAA+AGG - Chr5:93383183-93383202 None:intergenic 20.0%
! AAATCAAGAGGTAAATTTGA+TGG - Chr5:93381245-93381264 None:intergenic 25.0%
! ATCATAGAAATAACTTTACC+AGG - Chr5:93383144-93383163 None:intergenic 25.0%
! ATGAAGAAGAATTTCTTTGA+GGG + Chr5:93381668-93381687 MsG0580029184.01.T01:CDS 25.0%
! CATTTGGAAAATCAAAATTG+GGG + Chr5:93380705-93380724 MsG0580029184.01.T01:CDS 25.0%
! GATAGGTTGTAAATAGAATT+AGG - Chr5:93381173-93381192 None:intergenic 25.0%
! GCATTTGGAAAATCAAAATT+GGG + Chr5:93380704-93380723 MsG0580029184.01.T01:CDS 25.0%
! GTTTGTGTATAGATTCAAAA+TGG - Chr5:93382023-93382042 None:intergenic 25.0%
! TATGAAGAAGAATTTCTTTG+AGG + Chr5:93381667-93381686 MsG0580029184.01.T01:CDS 25.0%
! TGCATTTGGAAAATCAAAAT+TGG + Chr5:93380703-93380722 MsG0580029184.01.T01:CDS 25.0%
! TGTAAGATGAAAATTCAAGA+AGG + Chr5:93383479-93383498 MsG0580029184.01.T01:CDS 25.0%
! TTATAATGGTGAAGATTTCA+AGG + Chr5:93382789-93382808 MsG0580029184.01.T01:CDS 25.0%
! TTTATCCTCATCATTGTTAT+TGG + Chr5:93382421-93382440 MsG0580029184.01.T01:CDS 25.0%
!! ACTATTGCAAGAACTAATTT+TGG + Chr5:93381502-93381521 MsG0580029184.01.T01:CDS 25.0%
!! CATATTGGCAATAACAATTT+TGG + Chr5:93381428-93381447 MsG0580029184.01.T01:CDS 25.0%
!! TTCTTGCAAGTGTTATATTT+TGG - Chr5:93381058-93381077 None:intergenic 25.0%
!! TTGTCTTTTAACAATCTCTA+TGG + Chr5:93382250-93382269 MsG0580029184.01.T01:CDS 25.0%
!!! TGTTCAAGTGTTGATTATAA+TGG + Chr5:93382775-93382794 MsG0580029184.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTGTTTTACAATAATCTCAC+TGG + Chr5:93380924-93380943 MsG0580029184.01.T01:CDS 25.0%
AACACTAAATGATTGCAACT+TGG - Chr5:93381867-93381886 None:intergenic 30.0%
AACACTTGCAAGAAATCAAT+TGG + Chr5:93381064-93381083 MsG0580029184.01.T01:CDS 30.0%
AAGGCTAATAAATTTGTGAG+AGG - Chr5:93383220-93383239 None:intergenic 30.0%
AATCTCTTCATTTCTGTGAA+TGG + Chr5:93380637-93380656 MsG0580029184.01.T01:CDS 30.0%
AATTAGAAGGAAACATTCCA+TGG + Chr5:93381825-93381844 MsG0580029184.01.T01:CDS 30.0%
AATTGGAATGTTGAGGAATA+TGG + Chr5:93381706-93381725 MsG0580029184.01.T01:CDS 30.0%
ACAACATGTACAACAACAAA+TGG - Chr5:93380503-93380522 None:intergenic 30.0%
AGAAGGAATTCTTGATATAG+TGG + Chr5:93383496-93383515 MsG0580029184.01.T01:CDS 30.0%
ATAGAAATAACTTTACCAGG+AGG - Chr5:93383141-93383160 None:intergenic 30.0%
ATATCATGGAACAGTTTCAA+TGG + Chr5:93381359-93381378 MsG0580029184.01.T01:CDS 30.0%
ATATCCTATAGTTCCCTTAA+TGG - Chr5:93383115-93383134 None:intergenic 30.0%
ATCTCTTCATTTCTGTGAAT+GGG + Chr5:93380638-93380657 MsG0580029184.01.T01:CDS 30.0%
ATTGCTAAAGACACCTATTA+TGG - Chr5:93382284-93382303 None:intergenic 30.0%
ATTGGATGATGAAAATCCAT+TGG - Chr5:93382578-93382597 None:intergenic 30.0%
CAAATGTTTGATCAGGTATA+TGG - Chr5:93381910-93381929 None:intergenic 30.0%
CAACATGTACAACAACAAAT+GGG - Chr5:93380502-93380521 None:intergenic 30.0%
CAAGATAATATCCTTAAGAC+TGG - Chr5:93380907-93380926 None:intergenic 30.0%
CATATACCTGATCAAACATT+TGG + Chr5:93381908-93381927 MsG0580029184.01.T01:CDS 30.0%
CATGTAGGAAGAATTAATTG+AGG - Chr5:93382355-93382374 None:intergenic 30.0%
CTGCATACCAATAAATTAGA+AGG + Chr5:93381812-93381831 MsG0580029184.01.T01:CDS 30.0%
GATGAAATATTTCCCAAAGA+AGG - Chr5:93381032-93381051 None:intergenic 30.0%
GGAAATATTCCAGATTCAAT+TGG + Chr5:93381689-93381708 MsG0580029184.01.T01:CDS 30.0%
GGTAAGATTCCTATTGTTAT+TGG + Chr5:93381761-93381780 MsG0580029184.01.T01:CDS 30.0%
GTAAGATTGCCAATAACAAT+AGG - Chr5:93381773-93381792 None:intergenic 30.0%
GTTGAGGAATATGGTAATAT+TGG + Chr5:93381715-93381734 MsG0580029184.01.T01:CDS 30.0%
TAATTCTTCCTACATGTTCT+AGG + Chr5:93382359-93382378 MsG0580029184.01.T01:CDS 30.0%
TAGTGAAGTTATTGCTTGAA+AGG - Chr5:93382180-93382199 None:intergenic 30.0%
TCACAAAAGATGTTATCTGT+TGG - Chr5:93383437-93383456 None:intergenic 30.0%
TCTAAAAACTGGATTCTCAA+GGG + Chr5:93382525-93382544 MsG0580029184.01.T01:CDS 30.0%
TGAAAGACCTATTGTTGTAA+AGG + Chr5:93382651-93382670 MsG0580029184.01.T01:CDS 30.0%
TGAATCTCAATTTCATGCAA+AGG + Chr5:93382890-93382909 MsG0580029184.01.T01:CDS 30.0%
TGTTGTGGAAAACAACATAA+AGG + Chr5:93383559-93383578 MsG0580029184.01.T01:CDS 30.0%
TTAGGATCTTAACAAGATTC+CGG - Chr5:93382750-93382769 None:intergenic 30.0%
TTCAACACCTTTACAACAAT+AGG - Chr5:93382661-93382680 None:intergenic 30.0%
TTCTTGCAATAGTGTACAAT+TGG - Chr5:93381495-93381514 None:intergenic 30.0%
TTGCAAGAAAACAAACTATC+TGG + Chr5:93381740-93381759 MsG0580029184.01.T01:CDS 30.0%
TTGCTAAAGACACCTATTAT+GGG - Chr5:93382283-93382302 None:intergenic 30.0%
TTGGATAACAATAGATTTGG+CGG + Chr5:93381521-93381540 MsG0580029184.01.T01:CDS 30.0%
TTGGGTTCAAATAATTTCTC+AGG + Chr5:93381140-93381159 MsG0580029184.01.T01:CDS 30.0%
! CTAGTGATGTTTGCTAAAAT+AGG + Chr5:93383587-93383606 MsG0580029184.01.T01:CDS 30.0%
! GTTGTTGCTTGAATAGAATA+TGG + Chr5:93383332-93383351 MsG0580029184.01.T01:intron 30.0%
! TGGATTTTCATCATCCAATT+TGG + Chr5:93382579-93382598 MsG0580029184.01.T01:CDS 30.0%
! TTCAAAAGACCAACTTCTTT+TGG - Chr5:93380813-93380832 None:intergenic 30.0%
! TTCAAGTTACCAAAATCTGA+GGG - Chr5:93381992-93382011 None:intergenic 30.0%
! TTGAGCAAGAACAATTTTCA+TGG + Chr5:93380852-93380871 MsG0580029184.01.T01:CDS 30.0%
! TTTTCATCATCCAATTTGGT+CGG + Chr5:93382583-93382602 MsG0580029184.01.T01:CDS 30.0%
!! AAGTTTGAGTTTTCTGAGAA+AGG - Chr5:93380763-93380782 None:intergenic 30.0%
!! AATAACAATTTTGGGAGTGA+AGG + Chr5:93381437-93381456 MsG0580029184.01.T01:CDS 30.0%
!! TGCAAGTGTTATATTTTGGA+GGG - Chr5:93381054-93381073 None:intergenic 30.0%
!! TTAGATATTCTAGTTCACGA+GGG - Chr5:93382210-93382229 None:intergenic 30.0%
!! TTGCAAGTGTTATATTTTGG+AGG - Chr5:93381055-93381074 None:intergenic 30.0%
!!! TGCGGTATTTTGATATATCA+TGG + Chr5:93381345-93381364 MsG0580029184.01.T01:CDS 30.0%
AAACAACCAGCAAGTTCATT+GGG - Chr5:93382064-93382083 None:intergenic 35.0%
AAACTTAAAGCCTTCTCAGT+AGG + Chr5:93381269-93381288 MsG0580029184.01.T01:CDS 35.0%
AAGGTTAGATTTCCTAAGGA+TGG - Chr5:93380744-93380763 None:intergenic 35.0%
AAGTTCATTGGGAATTTGAC+CGG - Chr5:93382053-93382072 None:intergenic 35.0%
AGATAGCCAAATGTTTGATC+AGG - Chr5:93381917-93381936 None:intergenic 35.0%
AGGAAATATACCACATGTCT+TGG + Chr5:93381088-93381107 MsG0580029184.01.T01:CDS 35.0%
AGTTAATTCCTCCACCATTA+AGG + Chr5:93383098-93383117 MsG0580029184.01.T01:CDS 35.0%
ATCAGTTGTCCAATTCTTTC+AGG - Chr5:93381629-93381648 None:intergenic 35.0%
ATGGAAGAGAACCTAACAAT+TGG - Chr5:93381226-93381245 None:intergenic 35.0%
ATGGGTAACAATGATCTTTG+TGG + Chr5:93382322-93382341 MsG0580029184.01.T01:CDS 35.0%
CAAACATTTGGCTATCTAGA+AGG + Chr5:93381920-93381939 MsG0580029184.01.T01:CDS 35.0%
CAACACTTGAACAACAAGTT+AGG - Chr5:93382768-93382787 None:intergenic 35.0%
CAACTTATTAAGCTGCATCA+TGG - Chr5:93380973-93380992 None:intergenic 35.0%
CAGATTCAATTGGAATGTTG+AGG + Chr5:93381699-93381718 MsG0580029184.01.T01:CDS 35.0%
CAGCTTAATAAGTTGCTTCT+TGG + Chr5:93380978-93380997 MsG0580029184.01.T01:CDS 35.0%
CATACTAAGCCAAGTTAGAT+GGG - Chr5:93381579-93381598 None:intergenic 35.0%
CTATACACAAACAAGTTGTC+CGG + Chr5:93382031-93382050 MsG0580029184.01.T01:CDS 35.0%
CTCAACATTCCAATTGAATC+TGG - Chr5:93381701-93381720 None:intergenic 35.0%
CTTGCAAGAAATCAATTGGA+AGG + Chr5:93381068-93381087 MsG0580029184.01.T01:CDS 35.0%
CTTGGAGAAAACCAATTGTT+AGG + Chr5:93381212-93381231 MsG0580029184.01.T01:CDS 35.0%
CTTGGAGCTAATAATCTAGT+GGG + Chr5:93380996-93381015 MsG0580029184.01.T01:CDS 35.0%
CTTTCCAACATCAATTTGCA+TGG + Chr5:93380780-93380799 MsG0580029184.01.T01:CDS 35.0%
GAAAGAATTGGACAACTGAT+TGG + Chr5:93381629-93381648 MsG0580029184.01.T01:CDS 35.0%
GAAATATTTCCCAAAGAAGG+TGG - Chr5:93381029-93381048 None:intergenic 35.0%
GAGAAAGGTTAGATTTCCTA+AGG - Chr5:93380748-93380767 None:intergenic 35.0%
GCTTGAATAGAATATGGATC+AGG + Chr5:93383338-93383357 MsG0580029184.01.T01:intron 35.0%
GGAAATATACCACATGTCTT+GGG + Chr5:93381089-93381108 MsG0580029184.01.T01:CDS 35.0%
GGAAGAATACCTGAAAGAAT+TGG + Chr5:93381617-93381636 MsG0580029184.01.T01:CDS 35.0%
GGTGAAATTCCAAAAGAAGT+TGG + Chr5:93380801-93380820 MsG0580029184.01.T01:CDS 35.0%
GTTAATTCCTCCACCATTAA+GGG + Chr5:93383099-93383118 MsG0580029184.01.T01:CDS 35.0%
GTTTCTAACAACAACTTGAG+TGG + Chr5:93381884-93381903 MsG0580029184.01.T01:CDS 35.0%
TCATCAAGAAGAACATTGCT+CGG - Chr5:93383000-93383019 None:intergenic 35.0%
TCTTGGAGCTAATAATCTAG+TGG + Chr5:93380995-93381014 MsG0580029184.01.T01:CDS 35.0%
TGAAGAGATTCATTCCATGA+TGG - Chr5:93380627-93380646 None:intergenic 35.0%
TGAATAGAATATGGATCAGG+TGG + Chr5:93383341-93383360 MsG0580029184.01.T01:intron 35.0%
TGGGTAACAATGATCTTTGT+GGG + Chr5:93382323-93382342 MsG0580029184.01.T01:CDS 35.0%
TTAAGTTTGGGGAAATCAAG+AGG - Chr5:93381257-93381276 None:intergenic 35.0%
TTACCAAAATCTGAGGGAAT+GGG - Chr5:93381986-93382005 None:intergenic 35.0%
TTCACCATGCAAATTGATGT+TGG - Chr5:93380787-93380806 None:intergenic 35.0%
TTGGAAAATCAAAATTGGGG+TGG + Chr5:93380708-93380727 MsG0580029184.01.T01:CDS 35.0%
TTGTTTAAGGATCCCAAAGT+TGG - Chr5:93381395-93381414 None:intergenic 35.0%
! ATCCTCATCATTGTTATTGG+CGG + Chr5:93382424-93382443 MsG0580029184.01.T01:CDS 35.0%
! CTCTAAAAACTGGATTCTCA+AGG + Chr5:93382524-93382543 MsG0580029184.01.T01:CDS 35.0%
! CTTCAAGTTACCAAAATCTG+AGG - Chr5:93381993-93382012 None:intergenic 35.0%
! TGAAAGGTCTAAGATTTGGA+GGG - Chr5:93382164-93382183 None:intergenic 35.0%
! TGCTCTCTAAGAAACATAAG+AGG + Chr5:93382383-93382402 MsG0580029184.01.T01:CDS 35.0%
! TGCTTGAAAGGTCTAAGATT+TGG - Chr5:93382168-93382187 None:intergenic 35.0%
! TTGAAAGGTCTAAGATTTGG+AGG - Chr5:93382165-93382184 None:intergenic 35.0%
! TTTTAACAATCTCTATGGCG+AGG + Chr5:93382255-93382274 MsG0580029184.01.T01:CDS 35.0%
!! ACTGAGAAGGCTTTAAGTTT+GGG - Chr5:93381269-93381288 None:intergenic 35.0%
!! ATGGCGGGTAATCAAATATA+TGG + Chr5:93381596-93381615 MsG0580029184.01.T01:CDS 35.0%
!! GAGAATCCAGTTTTTAGAGA+CGG - Chr5:93382523-93382542 None:intergenic 35.0%
!! GTTAGATATTCTAGTTCACG+AGG - Chr5:93382211-93382230 None:intergenic 35.0%
!! TACTGAGAAGGCTTTAAGTT+TGG - Chr5:93381270-93381289 None:intergenic 35.0%
!! TGTTCTTCTTGATGATGACA+TGG + Chr5:93383005-93383024 MsG0580029184.01.T01:CDS 35.0%
!! TTGCAGAGAAACTTTTTCCA+TGG + Chr5:93382103-93382122 MsG0580029184.01.T01:CDS 35.0%
!!! AAGAAGTTGGTCTTTTGAAG+AGG + Chr5:93380814-93380833 MsG0580029184.01.T01:CDS 35.0%
!!! CTAACAATTGGTTTTCTCCA+AGG - Chr5:93381214-93381233 None:intergenic 35.0%
!!! TTTTTGAGTTCATGCCGAAT+GGG + Chr5:93382818-93382837 MsG0580029184.01.T01:CDS 35.0%
ACTATAGGATATGTTCCTCC+TGG + Chr5:93383123-93383142 MsG0580029184.01.T01:CDS 40.0%
AGAATATGGATCAGGTGGTA+TGG + Chr5:93383346-93383365 MsG0580029184.01.T01:intron 40.0%
AGTCTGGAAAACATGTTGCA+TGG + Chr5:93382841-93382860 MsG0580029184.01.T01:CDS 40.0%
ATCATGGAACCAAACCATGA+GGG - Chr5:93380957-93380976 None:intergenic 40.0%
CAAAATACCGCAATTCTGTG+AGG - Chr5:93381337-93381356 None:intergenic 40.0%
CAAACAACCAGCAAGTTCAT+TGG - Chr5:93382065-93382084 None:intergenic 40.0%
CAAATTCCCAATGAACTTGC+TGG + Chr5:93382055-93382074 MsG0580029184.01.T01:CDS 40.0%
CAGATAAAACCCAGACAACT+TGG - Chr5:93381795-93381814 None:intergenic 40.0%
CAGGGAGATATCTATAGCTA+TGG + Chr5:93383377-93383396 MsG0580029184.01.T01:CDS 40.0%
CCATACTAAGCCAAGTTAGA+TGG - Chr5:93381580-93381599 None:intergenic 40.0%
CCATCTAACTTGGCTTAGTA+TGG + Chr5:93381577-93381596 MsG0580029184.01.T01:CDS 40.0%
CTTCATTTCTGTGAATGGGA+GGG + Chr5:93380642-93380661 MsG0580029184.01.T01:CDS 40.0%
CTTCTGTTAGAGATGCTTAC+TGG + Chr5:93383404-93383423 MsG0580029184.01.T01:CDS 40.0%
GAGTTACATGAAGCAACCAA+TGG + Chr5:93382559-93382578 MsG0580029184.01.T01:CDS 40.0%
GATTTGGAGGGATCTTAATG+AGG - Chr5:93382152-93382171 None:intergenic 40.0%
GCAATCTTACCAAGTTGTCT+GGG + Chr5:93381783-93381802 MsG0580029184.01.T01:CDS 40.0%
GGAACAATACCACCTTCTTT+GGG + Chr5:93381017-93381036 MsG0580029184.01.T01:CDS 40.0%
GGGTAACAATGATCTTTGTG+GGG + Chr5:93382324-93382343 MsG0580029184.01.T01:CDS 40.0%
GGTAACAATGATCTTTGTGG+GGG + Chr5:93382325-93382344 MsG0580029184.01.T01:CDS 40.0%
GGTGTATTGCAAGATCGAAT+AGG + Chr5:93381542-93381561 MsG0580029184.01.T01:CDS 40.0%
GTCACTGCAACTTCACTTAT+GGG + Chr5:93382304-93382323 MsG0580029184.01.T01:CDS 40.0%
GTGAGGTTGGATATTGAAGA+AGG - Chr5:93381320-93381339 None:intergenic 40.0%
GTGCAATATCTTAGAGTCCA+TGG - Chr5:93381845-93381864 None:intergenic 40.0%
GTGTTGAATCTTGAAACACG+TGG + Chr5:93382673-93382692 MsG0580029184.01.T01:CDS 40.0%
GTTACCAAAATCTGAGGGAA+TGG - Chr5:93381987-93382006 None:intergenic 40.0%
TAATCCAAAGTCTCCCAAGT+GGG - Chr5:93383034-93383053 None:intergenic 40.0%
TAGCTATAGATATCTCCCTG+TGG - Chr5:93383377-93383396 None:intergenic 40.0%
TATAGTTCCCTTAATGGTGG+AGG - Chr5:93383109-93383128 None:intergenic 40.0%
TATCCAACCTCACAGAATTG+CGG + Chr5:93381327-93381346 MsG0580029184.01.T01:CDS 40.0%
TCCACCATTAAGGGAACTAT+AGG + Chr5:93383108-93383127 MsG0580029184.01.T01:CDS 40.0%
TCCTATAGTTCCCTTAATGG+TGG - Chr5:93383112-93383131 None:intergenic 40.0%
TCGATGAGTAGGGAATTCTT+CGG - Chr5:93383624-93383643 None:intergenic 40.0%
TCTAACTTGGCTTAGTATGG+CGG + Chr5:93381580-93381599 MsG0580029184.01.T01:CDS 40.0%
TCTTAATGAGGATCCCAAGA+AGG - Chr5:93382140-93382159 None:intergenic 40.0%
TCTTCATTTCTGTGAATGGG+AGG + Chr5:93380641-93380660 MsG0580029184.01.T01:CDS 40.0%
TGACGATCAAACACATGTTG+TGG + Chr5:93383544-93383563 MsG0580029184.01.T01:CDS 40.0%
TGTCACTGCAACTTCACTTA+TGG + Chr5:93382303-93382322 MsG0580029184.01.T01:CDS 40.0%
TTAAAGCCTTCTCAGTAGGA+GGG + Chr5:93381273-93381292 MsG0580029184.01.T01:CDS 40.0%
TTGTCCAACAACTCCTTAAC+CGG + Chr5:93381959-93381978 MsG0580029184.01.T01:CDS 40.0%
TTGTGAGCATTCGATGAGTA+GGG - Chr5:93383634-93383653 None:intergenic 40.0%
TTTAAGGATCCCAAAGTTGG+AGG - Chr5:93381392-93381411 None:intergenic 40.0%
TTTGTGAGCATTCGATGAGT+AGG - Chr5:93383635-93383654 None:intergenic 40.0%
! ACTTTTCTGCCCATCTAACT+TGG + Chr5:93381567-93381586 MsG0580029184.01.T01:CDS 40.0%
! AGAAGGAAGGTATACTTCCA+TGG - Chr5:93382123-93382142 None:intergenic 40.0%
! ATGTTTTCCAGACTCCCATT+CGG - Chr5:93382835-93382854 None:intergenic 40.0%
! CGGGGTTTTTATATCTGTCA+TGG + Chr5:93382444-93382463 MsG0580029184.01.T01:CDS 40.0%
! CTCTAGGAAAGATTAAGCAC+CGG + Chr5:93382728-93382747 MsG0580029184.01.T01:CDS 40.0%
! GGAAGTATACCTTCCTTCTT+GGG + Chr5:93382124-93382143 MsG0580029184.01.T01:CDS 40.0%
! TCCTCATCATTGTTATTGGC+GGG + Chr5:93382425-93382444 MsG0580029184.01.T01:CDS 40.0%
! TCTTCACCGTCTCTAAAAAC+TGG + Chr5:93382514-93382533 MsG0580029184.01.T01:CDS 40.0%
! TGGAAGTATACCTTCCTTCT+TGG + Chr5:93382123-93382142 MsG0580029184.01.T01:CDS 40.0%
!! CTGAGAAGGCTTTAAGTTTG+GGG - Chr5:93381268-93381287 None:intergenic 40.0%
!! GTGCAGTTGGTAAACTCAAA+AGG - Chr5:93380885-93380904 None:intergenic 40.0%
!! GTTTTTAGAGACGGTGAAGA+AGG - Chr5:93382514-93382533 None:intergenic 40.0%
!! TGCTTTGGTTCTGTTTACAC+AGG + Chr5:93382613-93382632 MsG0580029184.01.T01:CDS 40.0%
!!! GTTTTTGAGTTCATGCCGAA+TGG + Chr5:93382817-93382836 MsG0580029184.01.T01:CDS 40.0%
AAAATCTGAGGGAATGGGAC+CGG - Chr5:93381981-93382000 None:intergenic 45.0%
AAGGAAACTTTCCGACCATG+TGG - Chr5:93381301-93381320 None:intergenic 45.0%
AATGAGGATCCCAAGAAGGA+AGG - Chr5:93382136-93382155 None:intergenic 45.0%
AGCAGCAAAGAGTTTCATGG+CGG + Chr5:93382696-93382715 MsG0580029184.01.T01:CDS 45.0%
ATACCGCAATTCTGTGAGGT+TGG - Chr5:93381333-93381352 None:intergenic 45.0%
ATCCTTAAGACTGGTGCAGT+TGG - Chr5:93380898-93380917 None:intergenic 45.0%
CAAAATTGGGGTGGTACTCT+TGG + Chr5:93380717-93380736 MsG0580029184.01.T01:CDS 45.0%
CATCATGGAACCAAACCATG+AGG - Chr5:93380958-93380977 None:intergenic 45.0%
CTAACTTGGCTTAGTATGGC+GGG + Chr5:93381581-93381600 MsG0580029184.01.T01:CDS 45.0%
CTAATCCAAAGTCTCCCAAG+TGG - Chr5:93383035-93383054 None:intergenic 45.0%
CTTAAAGCCTTCTCAGTAGG+AGG + Chr5:93381272-93381291 MsG0580029184.01.T01:CDS 45.0%
GACAACTTACCCAAGACATG+TGG - Chr5:93381101-93381120 None:intergenic 45.0%
GAGAGCAACCTAGAACATGT+AGG - Chr5:93382370-93382389 None:intergenic 45.0%
GAGAGTCTCTGTCTTGCATT+TGG + Chr5:93380689-93380708 MsG0580029184.01.T01:CDS 45.0%
GGAAATGTTCCCTCATGGTT+TGG + Chr5:93380945-93380964 MsG0580029184.01.T01:CDS 45.0%
GGACCAATACCTCCAACTTT+GGG + Chr5:93381380-93381399 MsG0580029184.01.T01:CDS 45.0%
GGATTCTCAAGGGTGACATA+TGG + Chr5:93382535-93382554 MsG0580029184.01.T01:CDS 45.0%
GGCAATCTTACCAAGTTGTC+TGG + Chr5:93381782-93381801 MsG0580029184.01.T01:CDS 45.0%
GGGAACAATACCACCTTCTT+TGG + Chr5:93381016-93381035 MsG0580029184.01.T01:CDS 45.0%
TACCAACTGCACCAGTCTTA+AGG + Chr5:93380893-93380912 MsG0580029184.01.T01:CDS 45.0%
TACCTGATGCTCTTCCATCA+TGG + Chr5:93380610-93380629 MsG0580029184.01.T01:CDS 45.0%
TATGGCGAGGTTCCCATAAT+AGG + Chr5:93382268-93382287 MsG0580029184.01.T01:CDS 45.0%
TCACTGGAAATGTTCCCTCA+TGG + Chr5:93380940-93380959 MsG0580029184.01.T01:CDS 45.0%
TCATCCAATTTGGTCGGATC+AGG + Chr5:93382589-93382608 MsG0580029184.01.T01:CDS 45.0%
TCTCAACGTAGCTCATGCAT+TGG + Chr5:93382924-93382943 MsG0580029184.01.T01:CDS 45.0%
TGGACCAATACCTCCAACTT+TGG + Chr5:93381379-93381398 MsG0580029184.01.T01:CDS 45.0%
TGGAGCAGCAAAGAGTTTCA+TGG + Chr5:93382693-93382712 MsG0580029184.01.T01:CDS 45.0%
! CCTCATCATTGTTATTGGCG+GGG + Chr5:93382426-93382445 MsG0580029184.01.T01:CDS 45.0%
! GATCCCAAAGTTGGAGGTAT+TGG - Chr5:93381386-93381405 None:intergenic 45.0%
!! GGACAACTGATTGGTCTAAC+AGG + Chr5:93381638-93381657 MsG0580029184.01.T01:CDS 45.0%
!! GGATTAGCTAGGCTCATTCA+TGG + Chr5:93383048-93383067 MsG0580029184.01.T01:CDS 45.0%
!! TGGGAGACTTTGGATTAGCT+AGG + Chr5:93383037-93383056 MsG0580029184.01.T01:CDS 45.0%
!! TTCCATGATGGAAGAGCATC+AGG - Chr5:93380615-93380634 None:intergenic 45.0%
AGGTGGTATGGTATCACCAC+AGG + Chr5:93383358-93383377 MsG0580029184.01.T01:intron 50.0%
CCCCGCCAATAACAATGATG+AGG - Chr5:93382429-93382448 None:intergenic 50.0%
CGGTGAAGAAGGTAACTTCG+CGG - Chr5:93382503-93382522 None:intergenic 50.0%
GATGACATGGTAGCCCACTT+GGG + Chr5:93383018-93383037 MsG0580029184.01.T01:CDS 50.0%
GCAAGACAGAGACTCTCATG+TGG - Chr5:93380686-93380705 None:intergenic 50.0%
GCATCCTGATCCGACCAAAT+TGG - Chr5:93382596-93382615 None:intergenic 50.0%
GGTACTCTTGGACCATCCTT+AGG + Chr5:93380729-93380748 MsG0580029184.01.T01:CDS 50.0%
GGTGGTATGGTATCACCACA+GGG + Chr5:93383359-93383378 MsG0580029184.01.T01:intron 50.0%
TGATGACATGGTAGCCCACT+TGG + Chr5:93383017-93383036 MsG0580029184.01.T01:CDS 50.0%
TTGGTCGGATCAGGATGCTT+TGG + Chr5:93382598-93382617 MsG0580029184.01.T01:CDS 50.0%
! ATGGCGGAATGCAAAGCTCT+AGG + Chr5:93382712-93382731 MsG0580029184.01.T01:CDS 50.0%
! GGTCCCATTCCCTCAGATTT+TGG + Chr5:93381980-93381999 MsG0580029184.01.T01:CDS 50.0%
!! GAATGGGAGGGTGTTACATG+CGG + Chr5:93380654-93380673 MsG0580029184.01.T01:CDS 50.0%
CTCAGTAGGAGGGAACCACA+TGG + Chr5:93381283-93381302 MsG0580029184.01.T01:CDS 55.0%
GGGACCGGTTAAGGAGTTGT+TGG - Chr5:93381966-93381985 None:intergenic 55.0%
GTAGCCCACTTGGGAGACTT+TGG + Chr5:93383027-93383046 MsG0580029184.01.T01:CDS 55.0%
GTAGGAGGGAACCACATGGT+CGG + Chr5:93381287-93381306 MsG0580029184.01.T01:CDS 55.0%
GTGGTTCCCTCCTACTGAGA+AGG - Chr5:93381282-93381301 None:intergenic 55.0%
GTTCATGCCGAATGGGAGTC+TGG + Chr5:93382825-93382844 MsG0580029184.01.T01:CDS 55.0%
TGAGGGAATGGGACCGGTTA+AGG - Chr5:93381975-93381994 None:intergenic 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr5 gene 93380492 93383703 93380492 ID=MsG0580029184.01;Name=MsG0580029184.01
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Gene Sequence

>MsG0580029184.01.T01

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Protein sequence

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