AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0580028177.01


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MsG0580028177.01.T01 AT4G23190 40.741 567 238 10 2 510 44 570 1.29e-131 396
MsG0580028177.01.T01 AT4G21400 40.492 610 247 12 1 548 128 683 2.91e-131 398
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MsG0580028177.01.T01 AT4G23270 39.794 583 258 11 1 548 121 645 3.28e-124 379
MsG0580028177.01.T01 AT4G23270 39.792 578 255 11 1 543 121 640 5.61e-123 375
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MsG0580028177.01.T01 AT4G23320 42.857 476 189 9 70 511 54 480 4.04e-118 358
MsG0580028177.01.T01 AT4G11470 37.879 594 274 10 1 548 122 666 5.24e-118 363
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MsG0580028177.01.T01 AT4G23320 42.857 476 189 9 70 511 75 501 1.46e-117 358
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MsG0580028177.01.T01 AT4G23250 38.527 584 231 12 1 511 123 651 3.79e-112 357
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MsG0580028177.01.T01 AT1G61370 40.146 411 165 7 142 510 429 800 6.22e-84 278
MsG0580028177.01.T01 AT1G61390 41.235 405 157 8 142 506 277 640 6.61e-84 274
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MsG0580028177.01.T01 AT1G61490 41.353 399 157 7 144 506 397 754 7.14e-84 277
MsG0580028177.01.T01 AT1G11303 39.801 402 153 7 144 502 434 789 9.54e-84 278
MsG0580028177.01.T01 AT1G67520 41.918 365 139 7 185 515 236 561 9.74e-84 272
MsG0580028177.01.T01 AT1G61440 40.099 404 170 7 141 511 414 778 1.12e-83 277
MsG0580028177.01.T01 AT1G61490 41.353 399 157 7 144 506 423 780 1.22e-83 277
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MsG0580028177.01.T01 AT1G61400 41.220 410 160 9 140 511 429 795 1.75e-83 276
MsG0580028177.01.T01 AT1G65790 39.498 438 217 10 134 540 422 842 2.43e-83 277
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MsG0580028177.01.T01 AT1G67520 42.373 354 132 6 195 515 276 590 2.68e-83 271
MsG0580028177.01.T01 AT1G11300 39.372 414 155 8 133 501 426 788 3.27e-83 276
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MsG0580028177.01.T01 AT1G11300 44.807 337 111 4 195 501 482 773 4.92e-83 275
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MsG0580028177.01.T01 AT4G11900 40.144 416 164 8 130 501 448 822 2.21e-82 275
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MsG0580028177.01.T01 AT4G03230 36.501 463 195 10 97 503 460 879 2.96e-81 273
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MsG0580028177.01.T01 AT4G03230 36.501 463 195 10 97 503 560 979 1.98e-80 272
MsG0580028177.01.T01 AT1G61550 39.951 408 162 6 134 501 410 774 1.99e-80 268
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MsG0580028177.01.T01 AT1G61500 40.506 395 158 6 146 506 430 781 1.07e-79 266
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MsG0580028177.01.T01 AT1G61360 39.903 411 158 9 142 505 340 708 5.79e-77 258
MsG0580028177.01.T01 AT1G61360 39.903 411 158 9 142 505 421 789 2.21e-76 258
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MsG0580028177.01.T01 AT1G56130 34.152 407 189 6 131 506 476 834 1.33e-63 224
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MsG0580028177.01.T01 AT4G23210 33.036 448 195 9 1 383 120 527 8.54e-59 204
MsG0580028177.01.T01 AT1G07650 32.243 428 212 8 149 544 598 979 1.53e-58 210
MsG0580028177.01.T01 AT1G07650 32.243 428 212 8 149 544 630 1011 1.83e-58 210
MsG0580028177.01.T01 AT1G07650 32.243 428 212 8 149 544 624 1005 2.20e-58 210
MsG0580028177.01.T01 AT1G16670 34.072 361 167 6 184 509 17 341 9.40e-58 197
MsG0580028177.01.T01 AT5G40380 33.163 392 171 9 61 416 178 514 7.85e-57 199
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MsG0580028177.01.T01 AT5G06740 31.655 417 209 9 122 501 257 634 3.16e-56 200
MsG0580028177.01.T01 AT3G14840 36.905 336 134 6 190 490 655 947 9.22e-56 202
MsG0580028177.01.T01 AT1G53420 33.671 395 174 7 127 486 554 895 1.74e-55 201
MsG0580028177.01.T01 AT1G29740 35.864 382 209 11 128 504 615 965 3.79e-55 201
MsG0580028177.01.T01 AT1G29740 35.864 382 209 11 128 504 615 965 6.90e-55 200
MsG0580028177.01.T01 AT4G32300 33.086 405 192 10 165 532 446 808 4.19e-53 193
MsG0580028177.01.T01 AT1G29720 31.714 391 193 7 190 548 656 1004 4.75e-53 194
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MsG0580028177.01.T01 AT5G18610 30.946 349 171 7 195 511 71 381 3.97e-43 161
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MsG0580028177.01.T01 AT1G78530 31.842 380 179 10 145 486 7 344 1.71e-42 155
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MsG0580028177.01.T01 AT1G34210 30.618 356 174 8 170 490 266 583 4.48e-42 160
MsG0580028177.01.T01 AT4G34500 33.220 295 189 4 195 488 133 420 4.65e-42 157
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MsG0580028177.01.T01 AT4G11900 36.486 296 105 6 130 382 448 703 9.04e-42 160
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MsG0580028177.01.T01 AT1G66920 28.967 397 194 9 149 501 234 586 1.02e-41 159
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MsG0580028177.01.T01 AT4G13190 36.576 257 96 4 188 414 52 271 2.25e-41 151
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MsG0580028177.01.T01 AT1G55200 30.675 326 155 5 195 489 367 652 2.46e-41 158
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MsG0580028177.01.T01 AT1G66920 29.114 395 192 9 151 501 244 594 3.92e-41 157
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MsG0580028177.01.T01 AT1G55610 30.147 408 184 10 137 485 768 1133 4.24e-41 159
MsG0580028177.01.T01 AT4G02420 30.286 350 168 9 167 483 312 618 4.82e-41 157
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MsG0580028177.01.T01 AT3G45430 29.504 383 187 11 146 496 288 619 5.31e-41 157
MsG0580028177.01.T01 AT5G10520 31.714 350 195 10 155 486 98 421 5.53e-41 154
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MsG0580028177.01.T01 AT2G28590 34.892 278 110 6 184 427 75 315 9.18e-41 150
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MsG0580028177.01.T01 AT5G40380 30.337 356 157 9 62 381 179 479 1.74e-40 153
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MsG0580028177.01.T01 AT3G16030 39.352 216 64 2 195 381 536 713 3.32e-40 155
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MsG0580028177.01.T01 AT2G35620 29.765 383 248 8 130 507 222 588 3.40e-40 154
MsG0580028177.01.T01 AT2G35620 29.765 383 248 8 130 507 222 588 3.40e-40 154
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MsG0580028177.01.T01 AT3G13690 30.061 326 157 5 195 489 399 684 3.61e-40 155
MsG0580028177.01.T01 AT4G28350 28.877 374 181 9 149 486 295 619 3.66e-40 155
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MsG0580028177.01.T01 AT5G65700 29.781 366 166 7 187 515 677 988 3.67e-40 156
MsG0580028177.01.T01 AT3G08870 31.373 357 168 8 183 505 341 654 4.59e-40 155
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MsG0580028177.01.T01 AT3G08870 31.373 357 168 8 183 505 362 675 5.15e-40 155
MsG0580028177.01.T01 AT5G57670 32.215 298 182 6 195 488 255 536 5.19e-40 153
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MsG0580028177.01.T01 AT1G70450 29.909 331 159 7 194 490 36 327 1.18e-39 149
MsG0580028177.01.T01 AT2G18890 38.667 225 121 5 195 414 56 268 1.19e-39 145
MsG0580028177.01.T01 AT1G24030 34.317 271 154 6 164 430 44 294 1.30e-39 148
MsG0580028177.01.T01 AT2G37710 28.804 368 185 9 149 483 292 615 1.36e-39 153
MsG0580028177.01.T01 AT1G52540 30.814 344 157 8 195 501 28 327 1.88e-39 147
MsG0580028177.01.T01 AT1G52540 30.814 344 157 8 195 501 25 324 1.89e-39 147
MsG0580028177.01.T01 AT2G13800 29.855 345 170 7 180 490 130 436 2.06e-39 150
MsG0580028177.01.T01 AT2G13800 29.855 345 170 7 180 490 130 436 2.06e-39 150
MsG0580028177.01.T01 AT1G70110 30.513 390 189 9 183 540 321 660 2.23e-39 152
MsG0580028177.01.T01 AT5G61480 30.026 383 244 9 121 491 632 1002 2.31e-39 154
MsG0580028177.01.T01 AT2G01950 31.642 335 148 5 194 483 825 1123 2.35e-39 154
MsG0580028177.01.T01 AT5G01560 32.283 381 204 14 146 507 308 653 2.56e-39 152
MsG0580028177.01.T01 AT5G55830 28.030 396 207 10 136 496 297 649 2.84e-39 152
MsG0580028177.01.T01 AT5G49660 30.707 368 208 11 148 491 594 938 2.88e-39 154
MsG0580028177.01.T01 AT5G63710 30.028 353 224 7 144 486 188 527 3.80e-39 151
MsG0580028177.01.T01 AT5G63710 30.028 353 224 7 144 486 188 527 3.80e-39 151
MsG0580028177.01.T01 AT5G63710 30.028 353 224 7 144 486 224 563 5.79e-39 151
MsG0580028177.01.T01 AT5G63710 30.028 353 224 7 144 486 223 562 6.63e-39 150
MsG0580028177.01.T01 AT1G66980 30.321 343 162 8 194 501 777 1077 1.00e-38 152
MsG0580028177.01.T01 AT1G66980 30.321 343 162 8 194 501 794 1094 1.11e-38 152
MsG0580028177.01.T01 AT3G49670 29.759 373 175 8 187 522 673 995 1.20e-38 152
MsG0580028177.01.T01 AT1G66980 30.321 343 162 8 194 501 823 1123 1.20e-38 152
MsG0580028177.01.T01 AT3G15890 31.024 332 150 7 195 490 27 315 1.39e-38 145
MsG0580028177.01.T01 AT1G24030 37.069 232 133 5 203 430 4 226 1.45e-38 144
MsG0580028177.01.T01 AT3G02130 29.396 364 174 9 155 483 808 1123 1.51e-38 152
MsG0580028177.01.T01 AT1G66980 30.321 343 162 8 194 501 821 1121 1.59e-38 151
MsG0580028177.01.T01 AT2G13800 29.855 345 170 7 180 490 247 553 1.67e-38 149
MsG0580028177.01.T01 AT2G13800 29.855 345 170 7 180 490 247 553 1.67e-38 149
MsG0580028177.01.T01 AT3G02130 29.396 364 174 9 155 483 825 1140 1.69e-38 151
MsG0580028177.01.T01 AT5G20050 27.708 397 198 11 147 492 36 394 1.82e-38 147
MsG0580028177.01.T01 AT4G18250 28.103 427 207 12 146 532 306 672 1.98e-38 150
MsG0580028177.01.T01 AT5G37450 31.677 322 143 6 195 483 416 693 2.00e-38 150
MsG0580028177.01.T01 AT5G56790 28.614 332 166 5 195 495 378 669 2.44e-38 150
MsG0580028177.01.T01 AT5G37450 31.677 322 143 6 195 483 595 872 3.84e-38 150
MsG0580028177.01.T01 AT4G29050 28.899 436 215 14 148 546 287 664 4.11e-38 149
MsG0580028177.01.T01 AT5G37450 31.677 322 143 6 195 483 619 896 4.28e-38 150
MsG0580028177.01.T01 AT2G32800 30.601 366 161 10 195 501 105 436 4.41e-38 150
MsG0580028177.01.T01 AT2G32800 25.301 332 171 7 194 486 519 812 2.44e-26 114
MsG0580028177.01.T01 AT5G37450 31.677 322 143 6 195 483 643 920 4.58e-38 150
MsG0580028177.01.T01 AT4G29050 28.899 436 215 14 148 546 301 678 5.05e-38 149
MsG0580028177.01.T01 AT5G35370 28.873 426 198 13 126 491 428 808 5.17e-38 150
MsG0580028177.01.T01 AT3G59700 27.390 387 201 10 139 490 272 613 7.08e-38 148
MsG0580028177.01.T01 AT5G60270 26.065 399 212 8 124 489 266 614 7.08e-38 148
MsG0580028177.01.T01 AT3G59750 30.334 389 187 11 139 490 237 578 9.08e-38 147
MsG0580028177.01.T01 AT2G26290 30.347 346 160 8 184 488 62 367 9.56e-38 144
MsG0580028177.01.T01 AT1G75820 27.806 392 197 8 136 488 625 969 9.89e-38 149
MsG0580028177.01.T01 AT1G54820 27.296 392 196 11 164 514 105 448 9.91e-38 145
MsG0580028177.01.T01 AT3G28690 29.091 330 153 5 195 483 14 303 1.04e-37 143
MsG0580028177.01.T01 AT1G70250 26.950 423 227 10 144 530 402 778 1.05e-37 149
MsG0580028177.01.T01 AT2G28250 30.159 378 205 8 193 544 196 540 1.06e-37 147
MsG0580028177.01.T01 AT2G28250 30.159 378 205 8 193 544 196 540 1.06e-37 147
MsG0580028177.01.T01 AT2G28250 30.159 378 205 8 193 544 196 540 1.06e-37 147
MsG0580028177.01.T01 AT2G28250 30.159 378 205 8 193 544 196 540 1.06e-37 147
MsG0580028177.01.T01 AT2G28250 30.159 378 205 8 193 544 196 540 1.06e-37 147
MsG0580028177.01.T01 AT2G28250 30.159 378 205 8 193 544 196 540 1.06e-37 147
MsG0580028177.01.T01 AT4G32000 30.194 361 219 11 146 495 68 406 1.10e-37 144
MsG0580028177.01.T01 AT4G32000 30.278 360 219 11 146 495 68 405 1.20e-37 144
MsG0580028177.01.T01 AT5G38250 27.930 401 202 9 154 520 268 615 1.41e-37 147
MsG0580028177.01.T01 AT2G17220 31.765 340 154 8 184 483 62 363 1.47e-37 144
MsG0580028177.01.T01 AT5G59260 27.764 407 218 5 160 537 310 669 1.48e-37 147
MsG0580028177.01.T01 AT1G78530 32.899 307 129 8 145 416 7 271 1.52e-37 140
MsG0580028177.01.T01 AT1G67000 28.395 405 196 11 145 501 496 854 1.61e-37 148
MsG0580028177.01.T01 AT2G17220 31.765 340 154 8 184 483 63 364 1.73e-37 143
MsG0580028177.01.T01 AT3G28690 29.091 330 153 5 195 483 63 352 1.75e-37 144
MsG0580028177.01.T01 AT1G66930 28.342 374 201 9 146 501 282 606 2.10e-37 147
MsG0580028177.01.T01 AT5G39000 33.000 300 177 6 194 483 505 790 2.35e-37 147
MsG0580028177.01.T01 AT3G59740 27.083 432 231 12 120 515 251 634 2.46e-37 147
MsG0580028177.01.T01 AT1G35710 31.487 343 212 11 147 482 789 1115 2.54e-37 148
MsG0580028177.01.T01 AT4G13190 34.601 263 133 4 237 497 42 267 2.75e-37 140
MsG0580028177.01.T01 AT5G38240 28.756 386 228 9 148 520 221 572 2.79e-37 145
MsG0580028177.01.T01 AT5G16000 28.061 392 199 8 138 490 240 587 3.35e-37 146
MsG0580028177.01.T01 AT1G66930 27.295 403 199 9 146 501 282 637 3.78e-37 146
MsG0580028177.01.T01 AT4G22130 30.031 323 155 6 194 483 241 525 4.26e-37 145
MsG0580028177.01.T01 AT5G38240 28.756 386 228 9 148 520 267 618 4.61e-37 145
MsG0580028177.01.T01 AT5G39020 30.688 378 220 12 137 500 432 781 4.66e-37 147
MsG0580028177.01.T01 AT1G06700 30.868 311 188 5 186 483 47 343 4.66e-37 141
MsG0580028177.01.T01 AT1G06700 30.868 311 188 5 186 483 47 343 4.66e-37 141
MsG0580028177.01.T01 AT1G06700 30.868 311 188 5 186 483 47 343 4.66e-37 141
MsG0580028177.01.T01 AT5G65710 30.831 373 211 14 145 486 630 986 5.17e-37 147
MsG0580028177.01.T01 AT2G11520 28.571 322 159 5 193 482 211 493 5.50e-37 144
MsG0580028177.01.T01 AT5G38240 28.756 386 228 9 148 520 285 636 6.03e-37 145
MsG0580028177.01.T01 AT1G66930 27.295 403 199 9 146 501 491 846 6.22e-37 146
MsG0580028177.01.T01 AT1G79620 28.316 392 197 8 136 483 580 931 6.35e-37 147
MsG0580028177.01.T01 AT3G28690 29.091 330 153 5 195 483 114 403 6.87e-37 143
MsG0580028177.01.T01 AT1G79620 28.316 392 197 8 136 483 554 905 7.74e-37 146
MsG0580028177.01.T01 AT2G23950 32.110 327 142 7 125 416 215 496 9.40e-37 143
MsG0580028177.01.T01 AT3G62220 28.531 354 189 4 176 500 38 356 1.04e-36 140
MsG0580028177.01.T01 AT3G62220 28.531 354 189 4 176 500 38 356 1.04e-36 140

Find 110 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 182 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TACTCAAACCGGTCGATATT+TGG 0.118610 5:-76189255 MsG0580028177.01.T01:CDS
TACACCTGATATAAGTTATT+TGG 0.128391 5:-76189037 MsG0580028177.01.T01:CDS
TCTTCCCACAACCGCATTTC+TGG 0.150659 5:+76186723 None:intergenic
CTATATATATCTTGAAAATT+TGG 0.165524 5:+76189072 None:intergenic
AGTCTTGACTACTTCATATT+TGG 0.179196 5:-76187778 MsG0580028177.01.T01:CDS
TCTAATTGTGCTTTCTTTGT+AGG 0.208037 5:+76187640 None:intergenic
CCCAATTGTTATTATTGTTT+TGG 0.225245 5:-76188593 MsG0580028177.01.T01:CDS
GTATGATATTATGCTCTTCT+TGG 0.232355 5:+76189659 None:intergenic
TCCATCTTGTTGTGTAAATA+AGG 0.262573 5:-76188977 MsG0580028177.01.T01:CDS
CGAAATTTGGTTAGGTTACT+TGG 0.293146 5:-76187856 MsG0580028177.01.T01:intron
AAACTTGGCGAAGGTGGATT+TGG 0.303649 5:-76188275 MsG0580028177.01.T01:CDS
CTTTGCATGTAGCGGGTATA+TGG 0.312060 5:-76187279 MsG0580028177.01.T01:intron
AAATCAGATGTCTTCAGTTT+TGG 0.317093 5:-76187221 MsG0580028177.01.T01:CDS
AAATGCTACAAAATCATTAA+AGG 0.319128 5:-76187610 MsG0580028177.01.T01:CDS
CCGGTCGATATTTGGACTAA+TGG 0.325169 5:-76189247 MsG0580028177.01.T01:CDS
GCTAGAATCTAACGAGGATA+TGG 0.328105 5:+76186621 None:intergenic
ATCTTAGATATGAAAATTAT+AGG 0.329769 5:-76188924 MsG0580028177.01.T01:CDS
ACCAAAACAATAATAACAAT+TGG 0.333543 5:+76188592 None:intergenic
TCCACATCTGTTGCATTGAA+TGG 0.343286 5:+76189195 None:intergenic
ATCATGAGATGCATTCATAT+TGG 0.343535 5:-76186882 MsG0580028177.01.T01:CDS
CTGTTTATGCAAGACTTTGC+AGG 0.345018 5:+76186529 None:intergenic
TGGATTTGGAGCTGTTTATC+AGG 0.356864 5:-76188261 MsG0580028177.01.T01:intron
CATCATTGTGCTGATGAAAA+TGG 0.365601 5:-76189540 MsG0580028177.01.T01:five_prime_UTR
CAAAGAAAGCACAATTAGAT+TGG 0.369321 5:-76187636 MsG0580028177.01.T01:CDS
ACACCTGATATAAGTTATTT+GGG 0.369443 5:-76189036 MsG0580028177.01.T01:CDS
AGACAACTGCGGCAATCATT+TGG 0.370015 5:+76189360 None:intergenic
TTTGGGTTGCAATCAATGTT+TGG 0.376524 5:-76189019 MsG0580028177.01.T01:CDS
CGGTTGTGGGAAGAGAATTC+AGG 0.378532 5:-76186714 MsG0580028177.01.T01:CDS
AATGCAGGTTCTGAAGGTAT+AGG 0.381374 5:+76186774 None:intergenic
GAAGCCTCGTTTACTGATAC+TGG 0.382181 5:+76186654 None:intergenic
GACGAGTGCCACTATTCTTT+AGG 0.383756 5:+76187171 None:intergenic
CAACCCAAATAACTTATATC+AGG 0.388373 5:+76189033 None:intergenic
AATTGGGATTGCTATGATAA+TGG 0.390609 5:+76188609 None:intergenic
TGTAGCTAAAAGACCAACTA+TGG 0.402334 5:-76186838 MsG0580028177.01.T01:CDS
CACTCGTCATGGGGAAATTA+CGG 0.403256 5:-76187156 MsG0580028177.01.T01:CDS
ATGCAGGTTCTGAAGGTATA+GGG 0.405372 5:+76186775 None:intergenic
AATGCTAAGATATCAGATTT+CGG 0.412069 5:-76187490 MsG0580028177.01.T01:CDS
TTCTCTGATTCTAATAAACT+TGG 0.412226 5:-76188290 MsG0580028177.01.T01:CDS
GAAAATACAAGTAGAGTTGT+TGG 0.417559 5:-76187433 MsG0580028177.01.T01:CDS
GTCTTCCAGAAATGCGGTTG+TGG 0.417812 5:-76186728 MsG0580028177.01.T01:CDS
GAGGAAGTGTGATTGGTTGA+TGG 0.427684 5:+76188880 None:intergenic
TCTGTTGCATTGAATGGATT+CGG 0.431895 5:+76189201 None:intergenic
TATGCTACAAGAAATGTAAC+AGG 0.433176 5:-76189096 MsG0580028177.01.T01:CDS
ATGATGGAGTAAAATCTGTC+TGG 0.433186 5:+76189557 None:intergenic
CTAGTTCTTGAGATTATAAG+TGG 0.449332 5:-76187194 MsG0580028177.01.T01:CDS
TCTAATAAACTTGGCGAAGG+TGG 0.467758 5:-76188281 MsG0580028177.01.T01:CDS
ACTTGCAGGCATGGAAAAGT+TGG 0.467966 5:-76186965 MsG0580028177.01.T01:intron
GACAAGTGATTGCCGTCAAA+AGG 0.474529 5:-76187952 MsG0580028177.01.T01:intron
CCAAAACAATAATAACAATT+GGG 0.475351 5:+76188593 None:intergenic
AAAGAAAGCACAATTAGATT+GGG 0.479117 5:-76187635 MsG0580028177.01.T01:CDS
AGAATAGTGGCACTCGTCAT+GGG 0.479586 5:-76187166 MsG0580028177.01.T01:CDS
ACCGTAGGTGATTTCTGTGT+TGG 0.486279 5:+76189455 None:intergenic
ATCTCCTCTGCATAATCCTA+TGG 0.493395 5:+76189389 None:intergenic
CTTGAACTGTTGTATAGTGA+TGG 0.497491 5:+76186912 None:intergenic
TCTGAAGGTATAGGGAGAGT+GGG 0.499063 5:+76186783 None:intergenic
CTAATTTCATCATCTTCTGA+AGG 0.506555 5:+76188368 None:intergenic
ACCTTGAGAGGAAGTGTGAT+TGG 0.506833 5:+76188873 None:intergenic
GCATGCTGCGTTACTCAAAC+CGG 0.507966 5:-76189266 MsG0580028177.01.T01:CDS
AGTAAAATCTGTCTGGGCTA+TGG 0.508143 5:+76189564 None:intergenic
GGTTTCTACAATTTCACTCA+TGG 0.510097 5:-76189435 MsG0580028177.01.T01:five_prime_UTR
GTAACACATGGAGATAATCA+TGG 0.510787 5:-76186463 MsG0580028177.01.T01:three_prime_UTR
AAGAATAGTGGCACTCGTCA+TGG 0.513573 5:-76187167 MsG0580028177.01.T01:CDS
TTGAACAAAATACAATGTCA+TGG 0.519141 5:-76186567 MsG0580028177.01.T01:three_prime_UTR
GATAAGTACAAACAAGTGGT+AGG 0.520873 5:-76189174 MsG0580028177.01.T01:CDS
TCTTCCAGAAATGCGGTTGT+GGG 0.531220 5:-76186727 MsG0580028177.01.T01:CDS
TACTGGAGCTGATTTAGTTG+TGG 0.536320 5:+76186671 None:intergenic
ATAAGTGGCCTAAAGAATAG+TGG 0.538758 5:-76187179 MsG0580028177.01.T01:CDS
TTCTGAAGGTATAGGGAGAG+TGG 0.539265 5:+76186782 None:intergenic
CCATTAGTCCAAATATCGAC+CGG 0.539276 5:+76189247 None:intergenic
GTTGAATTGTAATGACTCAA+AGG 0.543225 5:+76188343 None:intergenic
GGTTGTGGGAAGAGAATTCA+GGG 0.543644 5:-76186713 MsG0580028177.01.T01:CDS
AGAATATATCATATATATGT+CGG 0.545592 5:-76186438 MsG0580028177.01.T01:three_prime_UTR
ATGTTATTATTATGACAAAG+AGG 0.552860 5:+76189605 None:intergenic
AGTACAATGGTAGCCATAGT+TGG 0.554393 5:+76186825 None:intergenic
ACCTTATTTACACAACAAGA+TGG 0.556744 5:+76188976 None:intergenic
GGGCTATGGTTTCATAACAT+AGG 0.557835 5:+76189578 None:intergenic
ACCAATCACACTTCCTCTCA+AGG 0.561526 5:-76188874 MsG0580028177.01.T01:intron
TTCAACTTACATACCTTGAG+AGG 0.565178 5:+76188861 None:intergenic
TCTCCATGCATTACATACTC+AGG 0.567447 5:+76187254 None:intergenic
TGCAGGCATGGAAAAGTTGG+AGG 0.569310 5:-76186962 MsG0580028177.01.T01:intron
TCCATTCAATGCAACAGATG+TGG 0.571462 5:-76189196 MsG0580028177.01.T01:CDS
TCATATCTAAGATTACAACT+TGG 0.572411 5:+76188934 None:intergenic
TGATGGAGTAAAATCTGTCT+GGG 0.572710 5:+76189558 None:intergenic
ATCTTGTTGTGTAAATAAGG+TGG 0.575636 5:-76188974 MsG0580028177.01.T01:CDS
CATGGCAAGACTAGTTCTTG+TGG 0.586346 5:-76187467 MsG0580028177.01.T01:CDS
GATTCTAATAAACTTGGCGA+AGG 0.600921 5:-76188284 MsG0580028177.01.T01:CDS
GCATGGAAAAGTTGGAGGGA+AGG 0.604808 5:-76186957 MsG0580028177.01.T01:CDS
ATCATTAAAGGTATTGCTCG+AGG 0.609745 5:-76187598 MsG0580028177.01.T01:CDS
ATAAGTACAAACAAGTGGTA+GGG 0.611952 5:-76189173 MsG0580028177.01.T01:CDS
TCCAACACAGAAATCACCTA+CGG 0.614685 5:-76189456 MsG0580028177.01.T01:five_prime_UTR
AGTGAAATTGTAGAAACCGT+AGG 0.619169 5:+76189440 None:intergenic
GAATAGTGGCACTCGTCATG+GGG 0.628059 5:-76187165 MsG0580028177.01.T01:CDS
GAGTTGATAAAAGTGTGTTG+AGG 0.645556 5:+76189484 None:intergenic
GCACCTGAGTATGTAATGCA+TGG 0.647591 5:-76187257 MsG0580028177.01.T01:CDS
TCTTGTTGTGTAAATAAGGT+GGG 0.648169 5:-76188973 MsG0580028177.01.T01:CDS
GCTACTTATCAGAAGTACAA+TGG 0.649365 5:+76186812 None:intergenic
TGTTGTGTAAATAAGGTGGG+TGG 0.653782 5:-76188970 MsG0580028177.01.T01:CDS
GCAGGCATGGAAAAGTTGGA+GGG 0.655671 5:-76186961 MsG0580028177.01.T01:intron
TGTGGATAAGTACAAACAAG+TGG 0.656488 5:-76189178 MsG0580028177.01.T01:CDS
GTTGTGTAAATAAGGTGGGT+GGG 0.657511 5:-76188969 MsG0580028177.01.T01:CDS
AACGACAAAGTATACGCCAT+AGG 0.658531 5:-76189405 MsG0580028177.01.T01:five_prime_UTR
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TTGAGAATCTATGTAACACA+TGG 0.661675 5:-76186475 MsG0580028177.01.T01:three_prime_UTR
GACTACGTGTGAAGAAACCA+AGG 0.684170 5:-76188543 MsG0580028177.01.T01:CDS
AGCTCCAGTATCAGTAAACG+AGG 0.684312 5:-76186658 MsG0580028177.01.T01:CDS
TAAGATATCAGATTTCGGCA+TGG 0.693772 5:-76187485 MsG0580028177.01.T01:CDS
AACTAAGCTAGAATCTAACG+AGG 0.694027 5:+76186615 None:intergenic
TTGAATTGTTAAGACAACTG+CGG 0.716571 5:+76189349 None:intergenic
TACGCCATAGGATTATGCAG+AGG 0.720990 5:-76189393 MsG0580028177.01.T01:five_prime_UTR
TCGTCATGGGGAAATTACGG+AGG 0.732451 5:-76187153 MsG0580028177.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! TAATAAAATATTTTACTGTA+CGG - Chr5:76188085-76188104 MsG0580028177.01.T01:intron 10.0%
!! AGAATATATCATATATATGT+CGG - Chr5:76189660-76189679 MsG0580028177.01.T01:five_prime_UTR 15.0%
!! ATCTTAGATATGAAAATTAT+AGG - Chr5:76187174-76187193 MsG0580028177.01.T01:CDS 15.0%
!! CTATATATATCTTGAAAATT+TGG + Chr5:76187029-76187048 None:intergenic 15.0%
!! TAAAATATCAATGTAAAGAT+TGG + Chr5:76187412-76187431 None:intergenic 15.0%
!! TTTACATGATTTAAATTCAT+CGG + Chr5:76188764-76188783 None:intergenic 15.0%
!!! ATATTTTATTAATCTTGACA+AGG - Chr5:76187424-76187443 MsG0580028177.01.T01:intron 15.0%
!!! TTTTTTCTGTTTTCATTTAT+CGG - Chr5:76188788-76188807 MsG0580028177.01.T01:intron 15.0%
!!! TTTTTTGTTCTTTCTTATTT+TGG - Chr5:76187682-76187701 MsG0580028177.01.T01:CDS 15.0%
!! AAATGCTACAAAATCATTAA+AGG - Chr5:76188488-76188507 MsG0580028177.01.T01:intron 20.0%
!! AAGAATGAATTAATCTTTGA+TGG - Chr5:76188205-76188224 MsG0580028177.01.T01:intron 20.0%
!! ACCAAAACAATAATAACAAT+TGG + Chr5:76187509-76187528 None:intergenic 20.0%
!! AGTGATAATAAATTCATGTT+TGG + Chr5:76187609-76187628 None:intergenic 20.0%
!! ATGTTATTATTATGACAAAG+AGG + Chr5:76186496-76186515 None:intergenic 20.0%
!! CCAAAACAATAATAACAATT+GGG + Chr5:76187508-76187527 None:intergenic 20.0%
!!! AAAAAAAAATTGTTTGGGTT+CGG - Chr5:76187938-76187957 MsG0580028177.01.T01:intron 20.0%
!!! TATTTTGTTCAAAACATTGA+TGG + Chr5:76189523-76189542 None:intergenic 20.0%
!!! TTGAACATGATATTTTCTAT+AGG + Chr5:76187343-76187362 None:intergenic 20.0%
! AACAGTTATGTTGCATATAT+AGG + Chr5:76187658-76187677 None:intergenic 25.0%
! AACTGTGACATGATTATATT+GGG - Chr5:76188012-76188031 MsG0580028177.01.T01:intron 25.0%
! AATGCTAAGATATCAGATTT+CGG - Chr5:76188608-76188627 MsG0580028177.01.T01:CDS 25.0%
! ACACCTGATATAAGTTATTT+GGG - Chr5:76187062-76187081 MsG0580028177.01.T01:intron 25.0%
! GAAAATATCATGTTCAAGTA+TGG - Chr5:76187346-76187365 MsG0580028177.01.T01:intron 25.0%
! GATTCGGAATAGAAAAATAA+GGG + Chr5:76186884-76186903 None:intergenic 25.0%
! TAAACTTCAACATCGAAATT+TGG - Chr5:76188229-76188248 MsG0580028177.01.T01:intron 25.0%
! TAACTGTGACATGATTATAT+TGG - Chr5:76188011-76188030 MsG0580028177.01.T01:intron 25.0%
! TACACCTGATATAAGTTATT+TGG - Chr5:76187061-76187080 MsG0580028177.01.T01:intron 25.0%
! TTCTCTGATTCTAATAAACT+TGG - Chr5:76187808-76187827 MsG0580028177.01.T01:CDS 25.0%
! TTGAACAAAATACAATGTCA+TGG - Chr5:76189531-76189550 MsG0580028177.01.T01:five_prime_UTR 25.0%
!! AAAGAAAGCACAATTAGATT+GGG - Chr5:76188463-76188482 MsG0580028177.01.T01:intron 25.0%
!! AAGGATTTTCAAATTTGTGT+AGG - Chr5:76187443-76187462 MsG0580028177.01.T01:CDS 25.0%
!! AAGTAGTCAAGACTTTTATT+GGG + Chr5:76188314-76188333 None:intergenic 25.0%
!! TCATATCTAAGATTACAACT+TGG + Chr5:76187167-76187186 None:intergenic 25.0%
!! TTTTCAAATTTGTGTAGGAA+AGG - Chr5:76187448-76187467 MsG0580028177.01.T01:CDS 25.0%
!!! CCCAATTGTTATTATTGTTT+TGG - Chr5:76187505-76187524 MsG0580028177.01.T01:CDS 25.0%
!!! TAATGTGTTATTGACTTCTA+AGG + Chr5:76187313-76187332 None:intergenic 25.0%
!!! TCTTATTTTGGTACAAACTA+TGG - Chr5:76187694-76187713 MsG0580028177.01.T01:CDS 25.0%
AAACTAATCAAAGTGAGTCT+AGG - Chr5:76187579-76187598 MsG0580028177.01.T01:CDS 30.0%
AACTAATCAAAGTGAGTCTA+GGG - Chr5:76187580-76187599 MsG0580028177.01.T01:CDS 30.0%
AATTGGGATTGCTATGATAA+TGG + Chr5:76187492-76187511 None:intergenic 30.0%
ACTGTGACATGATTATATTG+GGG - Chr5:76188013-76188032 MsG0580028177.01.T01:intron 30.0%
AGTCTTGACTACTTCATATT+TGG - Chr5:76188320-76188339 MsG0580028177.01.T01:CDS 30.0%
ATAAGTACAAACAAGTGGTA+GGG - Chr5:76186925-76186944 MsG0580028177.01.T01:CDS 30.0%
ATCATGAGATGCATTCATAT+TGG - Chr5:76189216-76189235 MsG0580028177.01.T01:CDS 30.0%
ATTAAAACTGTGAACATGGA+AGG + Chr5:76187266-76187285 None:intergenic 30.0%
CAACCCAAATAACTTATATC+AGG + Chr5:76187068-76187087 None:intergenic 30.0%
CTAATTTCATCATCTTCTGA+AGG + Chr5:76187733-76187752 None:intergenic 30.0%
CTATAATACTTTGCATGTAG+CGG - Chr5:76188811-76188830 MsG0580028177.01.T01:intron 30.0%
GAAAATACAAGTAGAGTTGT+TGG - Chr5:76188665-76188684 MsG0580028177.01.T01:intron 30.0%
GGATTCGGAATAGAAAAATA+AGG + Chr5:76186885-76186904 None:intergenic 30.0%
GTATGATATTATGCTCTTCT+TGG + Chr5:76186442-76186461 None:intergenic 30.0%
GTTGAATTGTAATGACTCAA+AGG + Chr5:76187758-76187777 None:intergenic 30.0%
TAGAGTGAATATATACTTGC+AGG - Chr5:76189119-76189138 MsG0580028177.01.T01:CDS 30.0%
TATAATACTTTGCATGTAGC+GGG - Chr5:76188812-76188831 MsG0580028177.01.T01:intron 30.0%
TATGCTACAAGAAATGTAAC+AGG - Chr5:76187002-76187021 MsG0580028177.01.T01:intron 30.0%
TCTAATTGTGCTTTCTTTGT+AGG + Chr5:76188461-76188480 None:intergenic 30.0%
TCTTAAATTCTAGATCTCCT+TGG + Chr5:76188189-76188208 None:intergenic 30.0%
TGTCCAAACATGACAAAATT+TGG - Chr5:76188059-76188078 MsG0580028177.01.T01:intron 30.0%
TTCAACATCGAAATTTGGTT+AGG - Chr5:76188234-76188253 MsG0580028177.01.T01:intron 30.0%
TTGAATTGTTAAGACAACTG+CGG + Chr5:76186752-76186771 None:intergenic 30.0%
TTGAGAATCTATGTAACACA+TGG - Chr5:76189623-76189642 MsG0580028177.01.T01:five_prime_UTR 30.0%
! AAATCAGATGTCTTCAGTTT+TGG - Chr5:76188877-76188896 MsG0580028177.01.T01:CDS 30.0%
! ACAATTAGTCGTGTCTTTTT+AGG - Chr5:76188108-76188127 MsG0580028177.01.T01:intron 30.0%
! ACCTTATTTACACAACAAGA+TGG + Chr5:76187125-76187144 None:intergenic 30.0%
! ATAAAAAATGCAGGTTCTGA+AGG + Chr5:76189333-76189352 None:intergenic 30.0%
! ATCTTGTTGTGTAAATAAGG+TGG - Chr5:76187124-76187143 MsG0580028177.01.T01:intron 30.0%
! CAAAGAAAGCACAATTAGAT+TGG - Chr5:76188462-76188481 MsG0580028177.01.T01:intron 30.0%
! CAATTAGTCGTGTCTTTTTA+GGG - Chr5:76188109-76188128 MsG0580028177.01.T01:intron 30.0%
! CTAGTTCTTGAGATTATAAG+TGG - Chr5:76188904-76188923 MsG0580028177.01.T01:CDS 30.0%
! GAAGTAGTCAAGACTTTTAT+TGG + Chr5:76188315-76188334 None:intergenic 30.0%
! TAGCCAAATTTTGTCATGTT+TGG + Chr5:76188065-76188084 None:intergenic 30.0%
! TCCATCTTGTTGTGTAAATA+AGG - Chr5:76187121-76187140 MsG0580028177.01.T01:intron 30.0%
! TCTTGTTGTGTAAATAAGGT+GGG - Chr5:76187125-76187144 MsG0580028177.01.T01:intron 30.0%
!! TTCCATGTTCACAGTTTTAA+TGG - Chr5:76187265-76187284 MsG0580028177.01.T01:CDS 30.0%
!!! TACTTGGTTTTACTATCGAA+GGG - Chr5:76188258-76188277 MsG0580028177.01.T01:intron 30.0%
!!! TCACTTTGATTAGTTTTCCT+TGG + Chr5:76187575-76187594 None:intergenic 30.0%
!!! TTACTTGGTTTTACTATCGA+AGG - Chr5:76188257-76188276 MsG0580028177.01.T01:intron 30.0%
!!! TTCAGAACCTGCATTTTTTA+TGG - Chr5:76189332-76189351 MsG0580028177.01.T01:five_prime_UTR 30.0%
AACTAAGCTAGAATCTAACG+AGG + Chr5:76189486-76189505 None:intergenic 35.0%
AGTAAACATTGATGCAGAAG+TGG - Chr5:76189049-76189068 MsG0580028177.01.T01:CDS 35.0%
AGTGAAATTGTAGAAACCGT+AGG + Chr5:76186661-76186680 None:intergenic 35.0%
ATAAGTGGCCTAAAGAATAG+TGG - Chr5:76188919-76188938 MsG0580028177.01.T01:CDS 35.0%
CACCATTAAAACTGTGAACA+TGG + Chr5:76187270-76187289 None:intergenic 35.0%
CGAAATTTGGTTAGGTTACT+TGG - Chr5:76188242-76188261 MsG0580028177.01.T01:intron 35.0%
CTACTGTCCATAAAAAATGC+AGG + Chr5:76189342-76189361 None:intergenic 35.0%
CTTGAACTGTTGTATAGTGA+TGG + Chr5:76189189-76189208 None:intergenic 35.0%
GATAAGTACAAACAAGTGGT+AGG - Chr5:76186924-76186943 MsG0580028177.01.T01:CDS 35.0%
GATTCTAATAAACTTGGCGA+AGG - Chr5:76187814-76187833 MsG0580028177.01.T01:CDS 35.0%
GGTTTCTACAATTTCACTCA+TGG - Chr5:76186663-76186682 MsG0580028177.01.T01:CDS 35.0%
GTAACACATGGAGATAATCA+TGG - Chr5:76189635-76189654 MsG0580028177.01.T01:five_prime_UTR 35.0%
TAAGATATCAGATTTCGGCA+TGG - Chr5:76188613-76188632 MsG0580028177.01.T01:CDS 35.0%
TGAATATATACTTGCAGGCA+TGG - Chr5:76189124-76189143 MsG0580028177.01.T01:CDS 35.0%
TGATGGAGTAAAATCTGTCT+GGG + Chr5:76186543-76186562 None:intergenic 35.0%
TGTAGCTAAAAGACCAACTA+TGG - Chr5:76189260-76189279 MsG0580028177.01.T01:CDS 35.0%
TGTGGATAAGTACAAACAAG+TGG - Chr5:76186920-76186939 MsG0580028177.01.T01:CDS 35.0%
TTAAAAACTGAAGCTGCAAC+TGG - Chr5:76186963-76186982 MsG0580028177.01.T01:intron 35.0%
TTCAACTTACATACCTTGAG+AGG + Chr5:76187240-76187259 None:intergenic 35.0%
! AGGTGTTTTCTATCTTCATG+AGG - Chr5:76188520-76188539 MsG0580028177.01.T01:intron 35.0%
! ATGATGGAGTAAAATCTGTC+TGG + Chr5:76186544-76186563 None:intergenic 35.0%
! CATCATTGTGCTGATGAAAA+TGG - Chr5:76186558-76186577 MsG0580028177.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
! CATTTTCATCAGCACAATGA+TGG + Chr5:76186560-76186579 None:intergenic 35.0%
! GCTACTTATCAGAAGTACAA+TGG + Chr5:76189289-76189308 None:intergenic 35.0%
! TCTGTTGCATTGAATGGATT+CGG + Chr5:76186900-76186919 None:intergenic 35.0%
!! ATCATTAAAGGTATTGCTCG+AGG - Chr5:76188500-76188519 MsG0580028177.01.T01:intron 35.0%
!! GAGTTGATAAAAGTGTGTTG+AGG + Chr5:76186617-76186636 None:intergenic 35.0%
!! GTCTTTTAGCTACATTGTCT+TGG + Chr5:76189254-76189273 None:intergenic 35.0%
!! TTTGGGTTGCAATCAATGTT+TGG - Chr5:76187079-76187098 MsG0580028177.01.T01:intron 35.0%
AAAAGGTTGTCCGTGAATTC+TGG - Chr5:76188163-76188182 MsG0580028177.01.T01:intron 40.0%
AACGACAAAGTATACGCCAT+AGG - Chr5:76186693-76186712 MsG0580028177.01.T01:CDS 40.0%
ACCAAAAAGAAGCGATTGGT+TGG - Chr5:76186799-76186818 MsG0580028177.01.T01:CDS 40.0%
AGTAAAATCTGTCTGGGCTA+TGG + Chr5:76186537-76186556 None:intergenic 40.0%
AGTACAATGGTAGCCATAGT+TGG + Chr5:76189276-76189295 None:intergenic 40.0%
ATCTCCTCTGCATAATCCTA+TGG + Chr5:76186712-76186731 None:intergenic 40.0%
CATGTTCAAGTATGGTCGTA+GGG - Chr5:76187354-76187373 MsG0580028177.01.T01:intron 40.0%
CATTGATGCAGAAGTGGAAA+TGG - Chr5:76189055-76189074 MsG0580028177.01.T01:CDS 40.0%
CCAAACCAAAAAGAAGCGAT+TGG - Chr5:76186795-76186814 MsG0580028177.01.T01:CDS 40.0%
CCATTAGTCCAAATATCGAC+CGG + Chr5:76186854-76186873 None:intergenic 40.0%
CTGTTTATGCAAGACTTTGC+AGG + Chr5:76189572-76189591 None:intergenic 40.0%
GCTAGAATCTAACGAGGATA+TGG + Chr5:76189480-76189499 None:intergenic 40.0%
GGGCTATGGTTTCATAACAT+AGG + Chr5:76186523-76186542 None:intergenic 40.0%
GTTGTGTAAATAAGGTGGGT+GGG - Chr5:76187129-76187148 MsG0580028177.01.T01:intron 40.0%
TACTCAAACCGGTCGATATT+TGG - Chr5:76186843-76186862 MsG0580028177.01.T01:CDS 40.0%
TCATGTTCAAGTATGGTCGT+AGG - Chr5:76187353-76187372 MsG0580028177.01.T01:intron 40.0%
TCCAACACAGAAATCACCTA+CGG - Chr5:76186642-76186661 MsG0580028177.01.T01:CDS 40.0%
TCCACATCTGTTGCATTGAA+TGG + Chr5:76186906-76186925 None:intergenic 40.0%
TCCATTCAATGCAACAGATG+TGG - Chr5:76186902-76186921 MsG0580028177.01.T01:CDS 40.0%
TCTAATAAACTTGGCGAAGG+TGG - Chr5:76187817-76187836 MsG0580028177.01.T01:CDS 40.0%
TCTCCATGCATTACATACTC+AGG + Chr5:76188847-76188866 None:intergenic 40.0%
TGACATGATTATATTGGGGC+AGG - Chr5:76188017-76188036 MsG0580028177.01.T01:intron 40.0%
TGTTGTGTAAATAAGGTGGG+TGG - Chr5:76187128-76187147 MsG0580028177.01.T01:intron 40.0%
! ATTCACGGACAACCTTTTGA+CGG + Chr5:76188161-76188180 None:intergenic 40.0%
! TACTGGAGCTGATTTAGTTG+TGG + Chr5:76189430-76189449 None:intergenic 40.0%
! TCCAACCAATCGCTTCTTTT+TGG + Chr5:76186803-76186822 None:intergenic 40.0%
! TGGATTTGGAGCTGTTTATC+AGG - Chr5:76187837-76187856 MsG0580028177.01.T01:CDS 40.0%
!! AATGCAGGTTCTGAAGGTAT+AGG + Chr5:76189327-76189346 None:intergenic 40.0%
!! ATGCAGGTTCTGAAGGTATA+GGG + Chr5:76189326-76189345 None:intergenic 40.0%
!!! CCAATCGCTTCTTTTTGGTT+TGG + Chr5:76186798-76186817 None:intergenic 40.0%
!!! TTTTAGGGTACGCTCTCTAA+TGG - Chr5:76188124-76188143 MsG0580028177.01.T01:intron 40.0%
AAGAATAGTGGCACTCGTCA+TGG - Chr5:76188931-76188950 MsG0580028177.01.T01:CDS 45.0%
ACCAATCACACTTCCTCTCA+AGG - Chr5:76187224-76187243 MsG0580028177.01.T01:CDS 45.0%
ACCGTAGGTGATTTCTGTGT+TGG + Chr5:76186646-76186665 None:intergenic 45.0%
ACTTGCAGGCATGGAAAAGT+TGG - Chr5:76189133-76189152 MsG0580028177.01.T01:CDS 45.0%
AGAATAGTGGCACTCGTCAT+GGG - Chr5:76188932-76188951 MsG0580028177.01.T01:CDS 45.0%
AGACAACTGCGGCAATCATT+TGG + Chr5:76186741-76186760 None:intergenic 45.0%
AGCTCCAGTATCAGTAAACG+AGG - Chr5:76189440-76189459 MsG0580028177.01.T01:five_prime_UTR 45.0%
ATCTCCTTGGCCAGAATTCA+CGG + Chr5:76188176-76188195 None:intergenic 45.0%
CACTCGTCATGGGGAAATTA+CGG - Chr5:76188942-76188961 MsG0580028177.01.T01:CDS 45.0%
CCGGTCGATATTTGGACTAA+TGG - Chr5:76186851-76186870 MsG0580028177.01.T01:CDS 45.0%
CGAGAAGTCTTCCAGAAATG+CGG - Chr5:76189364-76189383 MsG0580028177.01.T01:five_prime_UTR 45.0%
GAAGCCTCGTTTACTGATAC+TGG + Chr5:76189447-76189466 None:intergenic 45.0%
GACAAGTGATTGCCGTCAAA+AGG - Chr5:76188146-76188165 MsG0580028177.01.T01:intron 45.0%
GACTACGTGTGAAGAAACCA+AGG - Chr5:76187555-76187574 MsG0580028177.01.T01:CDS 45.0%
GCACCTGAGTATGTAATGCA+TGG - Chr5:76188841-76188860 MsG0580028177.01.T01:intron 45.0%
GGTTGTGGGAAGAGAATTCA+GGG - Chr5:76189385-76189404 MsG0580028177.01.T01:five_prime_UTR 45.0%
TACGCCATAGGATTATGCAG+AGG - Chr5:76186705-76186724 MsG0580028177.01.T01:CDS 45.0%
TCAAGTATGGTCGTAGGGTT+TGG - Chr5:76187359-76187378 MsG0580028177.01.T01:intron 45.0%
TCTTCCAGAAATGCGGTTGT+GGG - Chr5:76189371-76189390 MsG0580028177.01.T01:five_prime_UTR 45.0%
! AAACTTGGCGAAGGTGGATT+TGG - Chr5:76187823-76187842 MsG0580028177.01.T01:CDS 45.0%
! ACCTTGAGAGGAAGTGTGAT+TGG + Chr5:76187228-76187247 None:intergenic 45.0%
! CATGGCAAGACTAGTTCTTG+TGG - Chr5:76188631-76188650 MsG0580028177.01.T01:CDS 45.0%
! GACGAGTGCCACTATTCTTT+AGG + Chr5:76188930-76188949 None:intergenic 45.0%
! GAGGAAGTGTGATTGGTTGA+TGG + Chr5:76187221-76187240 None:intergenic 45.0%
! GTCGTAGGGTTTGGTTGTTT+GGG - Chr5:76187368-76187387 MsG0580028177.01.T01:intron 45.0%
! TCTGAAGGTATAGGGAGAGT+GGG + Chr5:76189318-76189337 None:intergenic 45.0%
! TTCTGAAGGTATAGGGAGAG+TGG + Chr5:76189319-76189338 None:intergenic 45.0%
!! CTTTGCATGTAGCGGGTATA+TGG - Chr5:76188819-76188838 MsG0580028177.01.T01:intron 45.0%
!! TAAAAAATACTATAATTATA+GGG + Chr5:76187918-76187937 None:intergenic 5.0%
!! TTAAAAAATACTATAATTAT+AGG + Chr5:76187919-76187938 None:intergenic 5.0%
!!! GAATTTATTTTTATTTTTTT+TGG - Chr5:76188726-76188745 MsG0580028177.01.T01:intron 5.0%
!!! TTTTAAAAAAAAAATTGTTT+GGG - Chr5:76187933-76187952 MsG0580028177.01.T01:intron 5.0%
!!! TTTTTAAAAAAAAAATTGTT+TGG - Chr5:76187932-76187951 MsG0580028177.01.T01:intron 5.0%
CGGTTGTGGGAAGAGAATTC+AGG - Chr5:76189384-76189403 MsG0580028177.01.T01:five_prime_UTR 50.0%
GAATAGTGGCACTCGTCATG+GGG - Chr5:76188933-76188952 MsG0580028177.01.T01:CDS 50.0%
GCAGGCATGGAAAAGTTGGA+GGG - Chr5:76189137-76189156 MsG0580028177.01.T01:CDS 50.0%
GCATGCTGCGTTACTCAAAC+CGG - Chr5:76186832-76186851 MsG0580028177.01.T01:CDS 50.0%
GCATGGAAAAGTTGGAGGGA+AGG - Chr5:76189141-76189160 MsG0580028177.01.T01:CDS 50.0%
GTCTTCCAGAAATGCGGTTG+TGG - Chr5:76189370-76189389 MsG0580028177.01.T01:five_prime_UTR 50.0%
TCGTCATGGGGAAATTACGG+AGG - Chr5:76188945-76188964 MsG0580028177.01.T01:CDS 50.0%
TCTTCCCACAACCGCATTTC+TGG + Chr5:76189378-76189397 None:intergenic 50.0%
TGCAGGCATGGAAAAGTTGG+AGG - Chr5:76189136-76189155 MsG0580028177.01.T01:CDS 50.0%
TTGTCCGTGAATTCTGGCCA+AGG - Chr5:76188169-76188188 MsG0580028177.01.T01:intron 50.0%
! GGTCGTAGGGTTTGGTTGTT+TGG - Chr5:76187367-76187386 MsG0580028177.01.T01:intron 50.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr5 gene 76186436 76189684 76186436 ID=MsG0580028177.01;Name=MsG0580028177.01
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Chr5 exon 76186436 76186979 76186436 ID=MsG0580028177.01.T01:exon:24007;Parent=MsG0580028177.01.T01
Chr5 exon 76187139 76187289 76187139 ID=MsG0580028177.01.T01:exon:24006;Parent=MsG0580028177.01.T01
Chr5 exon 76187427 76187864 76187427 ID=MsG0580028177.01.T01:exon:24005;Parent=MsG0580028177.01.T01
Chr5 exon 76187953 76187990 76187953 ID=MsG0580028177.01.T01:exon:24004;Parent=MsG0580028177.01.T01
Chr5 exon 76188262 76188392 76188262 ID=MsG0580028177.01.T01:exon:24003;Parent=MsG0580028177.01.T01
Chr5 exon 76188530 76188655 76188530 ID=MsG0580028177.01.T01:exon:24002;Parent=MsG0580028177.01.T01
Chr5 exon 76188875 76189684 76188875 ID=MsG0580028177.01.T01:exon:24001;Parent=MsG0580028177.01.T01
Chr5 five_prime_UTR 76189287 76189684 76189287 ID=MsG0580028177.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0580028177.01.T01
Chr5 CDS 76188875 76189286 76188875 ID=MsG0580028177.01.T01:cds;Parent=MsG0580028177.01.T01
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Chr5 three_prime_UTR 76186436 76186628 76186436 ID=MsG0580028177.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0580028177.01.T01
Gene Sequence

>MsG0580028177.01.T01

ATGCTGCGTTACTCAAACCGGTCGATATTTGGACTAATGGAAAAATACCCTTATTTTTCTATTCCGAATCCATTCAATGCAACAGATGTGGATAAGTACAAACAAGTGGTAGGGAAATTGTTGTATGATTTAAAAACTGAAGCTGCAACTGGTGATTCTATGAAAAAATATGCTACAAGAAATGTAACAGGTCCAAATTTTCAAGATATATATAGTCTAATGCAGTGTACACCTGATATAAGTTATTTGGGTTGCAATCAATGTTTGGATCAAGCTATAGCTAGTCTTCCATCTTGTTGTGTAAATAAGGTGGGTGGGAGAGCTATTAGACCAAGTTGTAATCTTAGATATGAAAATTATAGGTTCTATGAACTTAACGCTCAACCATCAACCAATCACACTTCCTCTCAAGGAAAGGATCACACATCAAGAACTGCCATTATCATAGCAATCCCAATTGTTATTATTGTTTTGGTGATCTGTTTCATCTGCATTTATCTACGACTACGTGTGAAGAAACCAAGGAAAACTAATCAAATTCCTTCAGAAGATGATGAAATTAGAACCTTTGAGTCATTACAATTCAACTTTGACACTATAAAAGTTGCTACAAATGATTTCTCTGATTCTAATAAACTTGGCGAAGGTGGATTTGGAGCTGTTTATCAGGGTACGCTCTCTAATGGACAAGTGATTGCCGTCAAAAGGTTACTTGGTTTTACTATCGAAGGGAGAGAAAGACTACTAGTCTATGAATTTGTTCCCAATAAAAGTCTTGACTACTTCATATTTGGTATACTTAAAATTTCATCGTCATTAGATTGTTGCTCTATTATTCAACTTTGTTTCATGATAAAGACTGACTTTCAAGATAGCTTAAATGTGCATGACTTTGTTGTATATGTAGATCCTACAAAGAAAGCACAATTAGATTGGGAAAAATGCTACAAAATCATTAAAGGTATTGCTCGAGGTGTTTTCTATCTTCATGAGGATTCTCGACTACGCATTATACACTGTGATCTCAAAGCAAGCAATATTCTCTTAGATGAAAACATGAATGCTAAGATATCAGATTTCGGCATGGCAAGACTAGTTCTTGTGGATCAAACACAAGAAAATACAAGTAGAGTTGTTGGAACTTACGGGTATATGGCACCTGAGTATGTAATGCATGGAGAATTTTCAGTAAAATCAGATGTCTTCAGTTTTGGTGTACTAGTTCTTGAGATTATAAGTGGCCTAAAGAATAGTGGCACTCGTCATGGGGAAATTACGGAGGATCTATTGAGCTTTGCATGGAAAAGTTGGAGGGAAGGAACAGCGACAAATGTTATAGATCCATCACTATACAACAGTTCAAGAAATGAAATCATGAGATGCATTCATATTGGTTTACTTTGTGTCCAAGACAATGTAGCTAAAAGACCAACTATGGCTACCATTGTACTTCTGATAAGTAGCAATTCTCCCACTCTCCCTATACCTTCAGAACCTGCATTTTTTATGGACAGTAGAACGAGAAGTCTTCCAGAAATGCGGTTGTGGGAAGAGAATTCAGGGACAACGAGATCTAGTCAATCCACAACTAAATCAGCTCCAGTATCAGTAAACGAGGCTTCATTTACTGATCCATATCCTCGTTAG

Protein sequence

>MsG0580028177.01.T01

MLRYSNRSIFGLMEKYPYFSIPNPFNATDVDKYKQVVGKLLYDLKTEAATGDSMKKYATRNVTGPNFQDIYSLMQCTPDISYLGCNQCLDQAIASLPSCCVNKVGGRAIRPSCNLRYENYRFYELNAQPSTNHTSSQGKDHTSRTAIIIAIPIVIIVLVICFICIYLRLRVKKPRKTNQIPSEDDEIRTFESLQFNFDTIKVATNDFSDSNKLGEGGFGAVYQGTLSNGQVIAVKRLLGFTIEGRERLLVYEFVPNKSLDYFIFGILKISSSLDCCSIIQLCFMIKTDFQDSLNVHDFVVYVDPTKKAQLDWEKCYKIIKGIARGVFYLHEDSRLRIIHCDLKASNILLDENMNAKISDFGMARLVLVDQTQENTSRVVGTYGYMAPEYVMHGEFSVKSDVFSFGVLVLEIISGLKNSGTRHGEITEDLLSFAWKSWREGTATNVIDPSLYNSSRNEIMRCIHIGLLCVQDNVAKRPTMATIVLLISSNSPTLPIPSEPAFFMDSRTRSLPEMRLWEENSGTTRSSQSTTKSAPVSVNEASFTDPYPR*