AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0580028179.01


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MsG0580028179.01.T01 AT1G67520 54.430 316 139 4 201 512 276 590 1.18e-112 347
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MsG0580028179.01.T01 AT1G61420 49.591 367 174 6 144 503 422 784 5.56e-110 346
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MsG0580028179.01.T01 AT4G23210 43.889 360 171 6 45 380 175 527 2.09e-88 282
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MsG0580028179.01.T01 AT1G07650 38.802 384 225 5 154 533 630 1007 8.79e-78 264
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MsG0580028179.01.T01 AT3G24550 41.554 296 166 4 193 483 260 553 8.14e-71 239
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MsG0580028179.01.T01 AT3G16030 61.236 178 69 0 201 378 536 713 1.29e-69 238
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MsG0580028179.01.T01 AT2G42960 43.509 285 152 6 206 485 176 456 5.82e-69 230
MsG0580028179.01.T01 AT2G42960 43.509 285 152 6 206 485 176 456 5.82e-69 230
MsG0580028179.01.T01 AT2G42960 43.509 285 152 6 206 485 176 456 5.82e-69 230
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MsG0580028179.01.T01 AT5G18500 41.489 282 162 3 206 485 159 439 1.89e-65 220
MsG0580028179.01.T01 AT5G18500 41.489 282 162 3 206 485 159 439 1.89e-65 220
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MsG0580028179.01.T01 AT1G56720 39.437 284 165 5 206 485 172 452 4.26e-64 217
MsG0580028179.01.T01 AT1G56720 39.437 284 165 5 206 485 172 452 4.26e-64 217
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MsG0580028179.01.T01 AT1G71830 39.355 310 182 5 185 489 274 582 1.98e-63 218
MsG0580028179.01.T01 AT4G02410 36.620 355 211 7 133 483 282 626 1.99e-63 219
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MsG0580028179.01.T01 AT5G24080 34.492 374 228 9 144 510 338 701 2.40e-63 221
MsG0580028179.01.T01 AT3G25560 37.097 372 218 8 127 488 221 586 2.58e-63 218
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MsG0580028179.01.T01 AT3G25560 37.097 372 218 8 127 488 222 587 2.60e-63 218
MsG0580028179.01.T01 AT3G02810 40.803 299 167 6 203 495 54 348 2.63e-63 217
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MsG0580028179.01.T01 AT4G23160 43.354 316 158 8 1 302 720 1028 2.75e-63 224
MsG0580028179.01.T01 AT1G78530 37.318 343 202 6 153 489 15 350 2.99e-63 211
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MsG0580028179.01.T01 AT2G18470 38.235 306 177 5 185 483 256 556 3.00e-63 218
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MsG0580028179.01.T01 AT3G13690 40.636 283 164 4 203 483 401 681 7.55e-61 214
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MsG0580028179.01.T01 AT3G45430 36.490 359 207 11 130 484 272 613 1.61e-59 209
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MsG0580028179.01.T01 AT2G43700 32.000 400 239 13 124 517 235 607 1.15e-56 200
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MsG0580028179.01.T01 AT2G43700 31.750 400 240 12 124 517 259 631 1.65e-56 200
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MsG0580028179.01.T01 AT4G29050 36.499 337 201 9 153 483 301 630 2.12e-56 201
MsG0580028179.01.T01 AT5G01560 36.782 348 184 9 151 484 308 633 2.46e-56 200
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MsG0580028179.01.T01 AT5G63930 34.699 366 216 10 134 483 656 1014 4.25e-56 203
MsG0580028179.01.T01 AT1G21250 31.630 411 236 6 94 485 297 681 4.54e-56 200
MsG0580028179.01.T01 AT5G37450 41.135 282 156 4 203 480 597 872 4.68e-56 202
MsG0580028179.01.T01 AT4G18250 32.474 388 235 11 159 534 305 677 4.80e-56 199
MsG0580028179.01.T01 AT1G21230 33.239 355 210 4 150 485 334 680 4.85e-56 200
MsG0580028179.01.T01 AT3G59740 35.450 378 217 9 120 487 251 611 5.09e-56 199
MsG0580028179.01.T01 AT3G28690 34.870 347 192 8 203 531 16 346 5.49e-56 192
MsG0580028179.01.T01 AT5G37450 41.489 282 155 4 203 480 621 896 5.50e-56 202
MsG0580028179.01.T01 AT5G63930 34.426 366 217 10 134 483 720 1078 6.74e-56 202
MsG0580028179.01.T01 AT5G37450 41.489 282 155 4 203 480 645 920 6.88e-56 202
MsG0580028179.01.T01 AT4G04960 34.870 347 204 9 149 480 278 617 8.51e-56 199
MsG0580028179.01.T01 AT1G31420 34.646 381 231 11 131 504 222 591 8.79e-56 197
MsG0580028179.01.T01 AT1G31420 34.646 381 231 11 131 504 222 591 8.79e-56 197
MsG0580028179.01.T01 AT3G28690 34.870 347 192 8 203 531 65 395 1.00e-55 193
MsG0580028179.01.T01 AT1G52540 35.673 342 191 9 166 498 6 327 1.02e-55 191
MsG0580028179.01.T01 AT2G39660 35.860 343 196 7 203 531 57 389 1.11e-55 192
MsG0580028179.01.T01 AT1G74490 37.377 305 181 7 186 483 63 364 1.28e-55 192
MsG0580028179.01.T01 AT5G11020 36.271 295 178 4 203 495 131 417 1.34e-55 193
MsG0580028179.01.T01 AT1G07570 34.463 354 188 8 168 483 3 350 1.35e-55 192
MsG0580028179.01.T01 AT1G07570 34.463 354 188 8 168 483 3 350 1.35e-55 192
MsG0580028179.01.T01 AT1G07570 34.463 354 188 8 168 483 3 350 1.35e-55 192
MsG0580028179.01.T01 AT5G35580 37.898 314 166 8 206 496 69 376 1.38e-55 194
MsG0580028179.01.T01 AT1G21240 33.811 349 218 3 149 485 340 687 1.40e-55 199
MsG0580028179.01.T01 AT5G11020 36.271 295 178 4 203 495 70 356 1.44e-55 191
MsG0580028179.01.T01 AT5G35580 37.898 314 166 8 206 496 81 388 1.70e-55 194
MsG0580028179.01.T01 AT1G70110 38.538 301 177 6 188 485 321 616 2.69e-55 197
MsG0580028179.01.T01 AT5G11020 36.271 295 178 4 203 495 93 379 2.78e-55 191
MsG0580028179.01.T01 AT5G11020 36.271 295 178 4 203 495 97 383 2.83e-55 191
MsG0580028179.01.T01 AT5G18910 35.314 303 185 6 185 483 162 457 3.64e-55 194
MsG0580028179.01.T01 AT2G32800 37.846 325 172 9 203 498 107 430 4.65e-55 199
MsG0580028179.01.T01 AT2G32800 33.220 295 185 6 200 483 519 812 5.17e-43 164
MsG0580028179.01.T01 AT1G07570 36.170 329 185 7 174 483 39 361 4.75e-55 191
MsG0580028179.01.T01 AT5G20050 33.978 362 209 10 148 483 31 388 4.93e-55 192
MsG0580028179.01.T01 AT2G05940 35.922 309 178 6 206 496 80 386 5.01e-55 192
MsG0580028179.01.T01 AT1G52540 37.748 302 172 7 206 498 30 324 5.07e-55 189
MsG0580028179.01.T01 AT4G28350 35.988 339 194 10 154 483 295 619 5.76e-55 196
MsG0580028179.01.T01 AT3G55450 37.338 308 175 7 192 483 39 344 7.16e-55 190
MsG0580028179.01.T01 AT3G28690 34.870 347 192 8 203 531 116 446 7.84e-55 192
MsG0580028179.01.T01 AT1G61590 35.913 323 164 5 188 485 74 378 7.96e-55 191
MsG0580028179.01.T01 AT5G15080 40.927 259 141 3 182 430 111 367 8.40e-55 192
MsG0580028179.01.T01 AT1G15530 39.041 292 169 6 196 483 344 630 9.37e-55 196
MsG0580028179.01.T01 AT5G15730 36.918 279 163 5 203 480 106 372 9.47e-55 191
MsG0580028179.01.T01 AT5G15730 36.918 279 163 5 203 480 106 372 9.47e-55 191
MsG0580028179.01.T01 AT4G32000 33.973 365 220 10 142 495 53 407 1.09e-54 190
MsG0580028179.01.T01 AT5G38990 39.223 283 167 4 206 483 518 800 1.15e-54 198
MsG0580028179.01.T01 AT5G42440 34.188 351 213 8 149 483 4 352 1.16e-54 188
MsG0580028179.01.T01 AT2G43690 39.175 291 152 9 209 487 297 574 1.52e-54 194
MsG0580028179.01.T01 AT4G32000 33.243 367 219 9 142 495 53 406 1.52e-54 189
MsG0580028179.01.T01 AT3G55450 37.338 308 175 7 192 483 76 381 1.65e-54 190
MsG0580028179.01.T01 AT5G15730 36.918 279 161 6 203 480 106 370 1.99e-54 190
MsG0580028179.01.T01 AT2G47060 38.621 290 170 4 201 483 61 349 2.05e-54 188
MsG0580028179.01.T01 AT2G47060 38.621 290 170 4 201 483 61 349 2.05e-54 188
MsG0580028179.01.T01 AT2G11520 35.915 284 178 4 199 479 211 493 2.34e-54 191
MsG0580028179.01.T01 AT2G23950 38.849 278 156 7 144 413 225 496 2.50e-54 192
MsG0580028179.01.T01 AT5G38280 37.417 302 177 8 210 504 330 626 2.50e-54 194
MsG0580028179.01.T01 AT3G45410 37.061 313 188 7 203 510 332 640 2.73e-54 194
MsG0580028179.01.T01 AT2G17220 38.944 303 172 6 190 480 62 363 2.73e-54 189
MsG0580028179.01.T01 AT5G38280 37.417 302 177 8 210 504 330 626 2.99e-54 194
MsG0580028179.01.T01 AT2G17220 38.944 303 172 6 190 480 63 364 3.17e-54 189
MsG0580028179.01.T01 AT2G43690 39.175 291 152 9 209 487 333 610 3.27e-54 194
MsG0580028179.01.T01 AT2G43690 39.175 291 152 9 209 487 333 610 3.27e-54 194
MsG0580028179.01.T01 AT2G25220 37.884 293 173 4 205 495 89 374 4.27e-54 187
MsG0580028179.01.T01 AT1G06840 33.875 369 229 6 117 480 533 891 4.58e-54 197
MsG0580028179.01.T01 AT3G46290 33.065 372 224 8 158 510 416 781 5.83e-54 196
MsG0580028179.01.T01 AT2G25220 38.047 297 173 5 203 495 134 423 6.05e-54 188
MsG0580028179.01.T01 AT2G25220 37.884 293 173 4 205 495 143 428 6.71e-54 188
MsG0580028179.01.T01 AT5G03320 38.356 292 165 6 206 484 74 363 7.31e-54 188
MsG0580028179.01.T01 AT5G03320 38.356 292 165 6 206 484 74 363 7.31e-54 188
MsG0580028179.01.T01 AT2G37050 35.475 358 208 8 141 479 520 873 7.35e-54 196
MsG0580028179.01.T01 AT1G16130 37.276 279 173 2 206 483 409 686 8.10e-54 194
MsG0580028179.01.T01 AT1G69790 43.439 221 109 4 203 412 63 278 8.33e-54 186

Find 123 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 184 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TACTCAAACCGGTCGATATT+TGG 0.150219 5:-76215559 MsG0580028179.01.T01:CDS
CTATATATATCTTGAAAATT+TGG 0.165524 5:+76215256 None:intergenic
AGTCTTGACTACTTCATATT+TGG 0.179196 5:-76214032 MsG0580028179.01.T01:intron
AATGCTAAGATTTCAGATTT+TGG 0.184117 5:-76213744 MsG0580028179.01.T01:CDS
ATCTCCTTGGCCAGAATTAA+TGG 0.197448 5:+76214178 None:intergenic
AAAAGGTTGTCCATTAATTC+TGG 0.238255 5:-76214188 MsG0580028179.01.T01:CDS
TCCAATTGCTATTATAGTTT+TGG 0.248090 5:-76214735 MsG0580028179.01.T01:CDS
TTCCATCTTGTTGTGAAAAT+AGG 0.263641 5:-76215162 MsG0580028179.01.T01:CDS
CTCAGAATCTAACGAGAATA+TGG 0.270882 5:+76212812 None:intergenic
CCCACAGCTTCATCTCTTGA+AGG 0.275765 5:+76212920 None:intergenic
GACGAATGCAACTATTCTTT+TGG 0.276814 5:+76213451 None:intergenic
AAACTCGGGGAAGGCGGATT+TGG 0.281684 5:-76214431 MsG0580028179.01.T01:CDS
CAATCCAAGTAACTTATATC+AGG 0.299571 5:+76215217 None:intergenic
TTTGGCTTGTAGCGGATATA+TGG 0.300033 5:-76213559 MsG0580028179.01.T01:intron
CATGGCAAGACTAATTCTAT+TGG 0.310652 5:-76213721 MsG0580028179.01.T01:CDS
AAATCAGATGTCTTTAGTTT+TGG 0.317093 5:-76213501 MsG0580028179.01.T01:CDS
ATCTTAGATATGAACGTTAT+AGG 0.319662 5:-76215108 MsG0580028179.01.T01:CDS
GACAAGCGATCGCTGTTAAA+AGG 0.331116 5:-76214205 MsG0580028179.01.T01:CDS
CAACTCTACTTGTATTTGCT+TGG 0.337991 5:+76213691 None:intergenic
CTTGGATTGCAATATATGTT+TGG 0.340904 5:-76215203 MsG0580028179.01.T01:CDS
ATCATGAGATGCATTCATAT+TGG 0.343535 5:-76213075 MsG0580028179.01.T01:CDS
AGCCTCATTTATTGATTCTC+TGG 0.361541 5:+76212847 None:intergenic
TAAATTCCGGTGTTGATGTT+TGG 0.366965 5:+76214124 None:intergenic
TTTCAGGGTGGGCTCTCTAA+TGG 0.367012 5:-76214227 MsG0580028179.01.T01:intron
TGTTTGTAATATAACTAGTA+TGG 0.368100 5:-76212691 MsG0580028179.01.T01:three_prime_UTR
AACTCTACTTGTATTTGCTT+GGG 0.376437 5:+76213692 None:intergenic
AGACAACTGCAGCAATCATT+TGG 0.376506 5:+76215664 None:intergenic
CGGAATTTAGTTAGACTACT+TGG 0.376655 5:-76214110 MsG0580028179.01.T01:CDS
AAGCTGTGGGAAGAGAATTC+AGG 0.380179 5:-76212907 MsG0580028179.01.T01:CDS
TCTTAAATTCTTTATCTCCT+TGG 0.380554 5:+76214165 None:intergenic
TGAAGAAAGCACAATTAGAT+TGG 0.382700 5:-76213890 MsG0580028179.01.T01:CDS
AAGTAGGTGGTGGTGGCAGC+GGG 0.384281 5:+76215065 None:intergenic
CGGATTTGGAGCTGTATATC+AGG 0.386434 5:-76214417 MsG0580028179.01.T01:intron
CCATATTGTGCTGATGATAA+TGG 0.394341 5:-76215844 MsG0580028179.01.T01:five_prime_UTR
GTCTTCTAGCTATGTTGTCT+TGG 0.395755 5:+76213040 None:intergenic
CCATTATCATCAGCACAATA+TGG 0.400261 5:+76215844 None:intergenic
TATGCTACCGCAAATGTAAC+AGG 0.404045 5:-76215400 MsG0580028179.01.T01:intron
ACCAAAACTATAATAGCAAT+TGG 0.407645 5:+76214734 None:intergenic
TACATACATACCTTTGTGAT+TGG 0.409638 5:+76215033 None:intergenic
GAAGTAGGTGGTGGTGGCAG+CGG 0.409795 5:+76215064 None:intergenic
GGTGGTGGCAGCGGGTGCAC+TGG 0.414456 5:+76215073 None:intergenic
GCAAATACAAGTAGAGTTGT+TGG 0.417195 5:-76213687 MsG0580028179.01.T01:CDS
TACCCCTGATATAAGTTACT+TGG 0.422718 5:-76215221 MsG0580028179.01.T01:CDS
CTCTGGAGCTGATTTACTTG+TGG 0.430447 5:+76212864 None:intergenic
GTATGGAGAACCTGTGTACT+TGG 0.438823 5:-76212674 MsG0580028179.01.T01:three_prime_UTR
AGAATAGTTGCATTCGTCGC+GGG 0.441132 5:-76213446 MsG0580028179.01.T01:CDS
TATGTATGATATTATGCTCT+TGG 0.444313 5:+76215962 None:intergenic
ACCTGCAGGCATGGAGAAGT+TGG 0.446902 5:-76213158 MsG0580028179.01.T01:intron
CAAGTAGTCTAACTAAATTC+CGG 0.459353 5:+76214111 None:intergenic
CATTCGTCGCGGGGAAAATA+CGG 0.464544 5:-76213436 MsG0580028179.01.T01:CDS
CTGGTTCTTGAGATTATAAG+TGG 0.465708 5:-76213474 MsG0580028179.01.T01:CDS
TATACTACCTGTTACATTTG+CGG 0.467865 5:+76215393 None:intergenic
ATCTCCTCTGCATTATCCTA+TGG 0.471043 5:+76215693 None:intergenic
TCTAATTGTGCTTTCTTCAG+TGG 0.471690 5:+76213894 None:intergenic
GATGGTGAAGTAGGTGGTGG+TGG 0.485656 5:+76215058 None:intergenic
GAAGAAAGCACAATTAGATT+GGG 0.485937 5:-76213889 MsG0580028179.01.T01:CDS
ACCGTAGGTGATTTCTGTGT+TGG 0.486279 5:+76215759 None:intergenic
ATACCTTTGTGATTGGTAGA+TGG 0.490616 5:+76215040 None:intergenic
ATACTAGTTATATTACAAAC+AGG 0.494791 5:+76212693 None:intergenic
TCCGCTTAATGCAACGGATG+TGG 0.505370 5:-76215500 MsG0580028179.01.T01:CDS
AGCTGTGGGAAGAGAATTCA+GGG 0.505726 5:-76212906 MsG0580028179.01.T01:CDS
GCATGCTGCGTTACTCAAAC+CGG 0.507966 5:-76215570 MsG0580028179.01.T01:CDS
ATTTCTTCATCATCTTCTGT+AGG 0.509713 5:+76214527 None:intergenic
GGTTTCTACAATTTCACTCA+TGG 0.510097 5:-76215739 MsG0580028179.01.T01:five_prime_UTR
TCCACATCCGTTGCATTAAG+CGG 0.512016 5:+76215499 None:intergenic
AGCAACTTGTAAAGTGTCAA+AGG 0.512407 5:+76214478 None:intergenic
TGATTGGTAGATGGTGAAGT+AGG 0.516631 5:+76215049 None:intergenic
CCGGTCGATATTTGGACGAA+TGG 0.516997 5:-76215551 MsG0580028179.01.T01:CDS
TAGCATTCATATCTTCGTCT+AGG 0.526547 5:+76213760 None:intergenic
AAGCGCTACAAAATCATTCA+AGG 0.531474 5:-76213864 MsG0580028179.01.T01:CDS
TTCTCTGATTCTAATAAACT+CGG 0.532339 5:-76214446 MsG0580028179.01.T01:CDS
GGACGAATGGAATCAGCACC+TGG 0.537506 5:-76215538 MsG0580028179.01.T01:CDS
TGTTGTGAAAATAGGATAGG+TGG 0.539457 5:-76215154 MsG0580028179.01.T01:CDS
TCTAATAAACTCGGGGAAGG+CGG 0.543778 5:-76214437 MsG0580028179.01.T01:CDS
TTGTCCATTAATTCTGGCCA+AGG 0.545165 5:-76214182 MsG0580028179.01.T01:CDS
GCAACTTGTAAAGTGTCAAA+GGG 0.549806 5:+76214479 None:intergenic
AATCCAAGTAACTTATATCA+GGG 0.552456 5:+76215218 None:intergenic
ATGTTATTATTATGACAAAG+AGG 0.552860 5:+76215911 None:intergenic
TCTCTGATTCTAATAAACTC+GGG 0.556630 5:-76214445 MsG0580028179.01.T01:CDS
CTCCAGAGAATCAATAAATG+AGG 0.557118 5:-76212849 MsG0580028179.01.T01:exon
GTTGTGAAAATAGGATAGGT+GGG 0.560932 5:-76215153 MsG0580028179.01.T01:CDS
GGGCTGTGGTTTCATAACAT+AGG 0.564187 5:+76215884 None:intergenic
AGGCGTTCTTTACCTTCATG+AGG 0.566306 5:-76213832 MsG0580028179.01.T01:CDS
TCTCCATGCATTACATACTC+AGG 0.567447 5:+76213534 None:intergenic
CATGAGTACAATGGTAGCCA+TGG 0.574469 5:+76213014 None:intergenic
GGGTAATTGTAATGACTCAA+AGG 0.575022 5:+76214499 None:intergenic
GGATTCCGCATAGATAATCC+AGG 0.576496 5:+76215520 None:intergenic
CCATTCGTCCAAATATCGAC+CGG 0.576919 5:+76215551 None:intergenic
GAATAGTTGCATTCGTCGCG+GGG 0.579935 5:-76213445 MsG0580028179.01.T01:CDS
TCATATCTAAGATTGCAACT+TGG 0.589426 5:+76215118 None:intergenic
GCATGGAGAAGTTGGAGGGA+AGG 0.592177 5:-76213150 MsG0580028179.01.T01:CDS
TGCAGGCATGGAGAAGTTGG+AGG 0.595070 5:-76213155 MsG0580028179.01.T01:intron
AATTGGAATTGCTATGATGA+TGG 0.595850 5:+76214751 None:intergenic
TGTTGCTTGCTTTGAGATCG+CGG 0.597137 5:+76213787 None:intergenic
GCGGAATCCGCTTAATGCAA+CGG 0.597433 5:-76215506 MsG0580028179.01.T01:CDS
TCTTGTTGTGAAAATAGGAT+AGG 0.597997 5:-76215157 MsG0580028179.01.T01:CDS
GCCTTCAAGAGATGAAGCTG+TGG 0.599770 5:-76212921 MsG0580028179.01.T01:CDS
AGTACAATGGTAGCCATGGT+TGG 0.612894 5:+76213018 None:intergenic
GTAGATGGTGAAGTAGGTGG+TGG 0.613579 5:+76215055 None:intergenic
TCCAACACAGAAATCACCTA+CGG 0.614685 5:-76215760 MsG0580028179.01.T01:five_prime_UTR
CTCTGATTCTAATAAACTCG+GGG 0.615794 5:-76214444 MsG0580028179.01.T01:CDS
AGTGAAATTGTAGAAACCGT+AGG 0.619169 5:+76215744 None:intergenic
TAATGGCCAAACATCAACAC+CGG 0.623614 5:-76214130 MsG0580028179.01.T01:CDS
ATCATTCAAGGTATTGCTCG+AGG 0.629553 5:-76213852 MsG0580028179.01.T01:CDS
GATTCTAATAAACTCGGGGA+AGG 0.633138 5:-76214440 MsG0580028179.01.T01:CDS
CAGGTTCTGAAGGTATAGAG+AGG 0.634263 5:+76212971 None:intergenic
TTGGTAGATGGTGAAGTAGG+TGG 0.638514 5:+76215052 None:intergenic
GCAGGCATGGAGAAGTTGGA+GGG 0.643269 5:-76213154 MsG0580028179.01.T01:intron
GAGTTGATAAAAGTGTGTTG+AGG 0.645556 5:+76215788 None:intergenic
CCTTCAAGAGATGAAGCTGT+GGG 0.647061 5:-76212920 MsG0580028179.01.T01:CDS
GCACCTGAGTATGTAATGCA+TGG 0.647591 5:-76213537 MsG0580028179.01.T01:CDS
GCAGTCGAGAATCCTCATGA+AGG 0.647842 5:+76213820 None:intergenic
AACGACAAAGTATACGCCAT+AGG 0.658531 5:-76215709 MsG0580028179.01.T01:five_prime_UTR
CATAGCTAGAAGACCAACCA+TGG 0.659419 5:-76213031 MsG0580028179.01.T01:CDS
AGGTTCTGAAGGTATAGAGA+GGG 0.663480 5:+76212972 None:intergenic
GCTACTTAGCATGAGTACAA+TGG 0.663723 5:+76213005 None:intergenic
ATCCAAGTAACTTATATCAG+GGG 0.669749 5:+76215219 None:intergenic
CAGCACCTGGATTATCTATG+CGG 0.680028 5:-76215525 MsG0580028179.01.T01:CDS
AAGAATAGTTGCATTCGTCG+CGG 0.689807 5:-76213447 MsG0580028179.01.T01:CDS
GATCATCTCTCCAAGTACAC+AGG 0.691073 5:+76212664 None:intergenic
TCACCATCTACCAATCACAA+AGG 0.703837 5:-76215043 MsG0580028179.01.T01:intron
TACGCCATAGGATAATGCAG+AGG 0.720990 5:-76215697 MsG0580028179.01.T01:five_prime_UTR
TCGTCGCGGGGAAAATACGG+AGG 0.727990 5:-76213433 MsG0580028179.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! CTATATATATCTTGAAAATT+TGG + Chr5:76213345-76213364 None:intergenic 15.0%
!! TAACAAACAATAATGAATAA+AGG + Chr5:76215214-76215233 None:intergenic 15.0%
!!! ACATTTATATTTCTATTAAC+AGG - Chr5:76213318-76213337 MsG0580028179.01.T01:intron 15.0%
!!! TTTCTTTAACTTGTTAATTT+TGG - Chr5:76214273-76214292 MsG0580028179.01.T01:intron 15.0%
!!! TTTTTCTTTTTTACAAACTA+TGG - Chr5:76214035-76214054 MsG0580028179.01.T01:CDS 15.0%
!! AAGTACTAAAAGTAAGTTTA+AGG - Chr5:76213938-76213957 MsG0580028179.01.T01:intron 20.0%
!! AATAGTTATGTTGCATATAT+AGG + Chr5:76214016-76214035 None:intergenic 20.0%
!! AGTGATAAAAATTTCATGTT+TGG + Chr5:76213967-76213986 None:intergenic 20.0%
!! AGTTCTTATAAATCTTAACA+AGG - Chr5:76213782-76213801 MsG0580028179.01.T01:CDS 20.0%
!! ATACTAGTTATATTACAAAC+AGG + Chr5:76215908-76215927 None:intergenic 20.0%
!! ATGTTATTATTATGACAAAG+AGG + Chr5:76212690-76212709 None:intergenic 20.0%
!! TGTTTGTAATATAACTAGTA+TGG - Chr5:76215907-76215926 MsG0580028179.01.T01:five_prime_UTR 20.0%
!! TTACTAGCAATGTAAATTTA+TGG + Chr5:76215342-76215361 None:intergenic 20.0%
!!! ACAATTTTTTCGATTCTTTA+TGG + Chr5:76215252-76215271 None:intergenic 20.0%
!!! ATAATGATGATGAAAATTGA+AGG + Chr5:76213653-76213672 None:intergenic 20.0%
!!! ATTCATTATTGTTTGTTATG+AGG - Chr5:76215216-76215235 MsG0580028179.01.T01:CDS 20.0%
!!! TATTTTGTTCAATACATTGA+TGG + Chr5:76215828-76215847 None:intergenic 20.0%
!!! TTACTTTTAGTACTTTCATT+TGG + Chr5:76213933-76213952 None:intergenic 20.0%
! AATCCAAGTAACTTATATCA+GGG + Chr5:76213383-76213402 None:intergenic 25.0%
! ACCAAAACTATAATAGCAAT+TGG + Chr5:76213867-76213886 None:intergenic 25.0%
! AGAATCGAAAAAATTGTAGA+TGG - Chr5:76215255-76215274 MsG0580028179.01.T01:CDS 25.0%
! ATCTTAGATATGAACGTTAT+AGG - Chr5:76213490-76213509 MsG0580028179.01.T01:CDS 25.0%
! CAGAGTTTAAAAATATGGTT+GGG - Chr5:76215282-76215301 MsG0580028179.01.T01:intron 25.0%
! GATAAAAATTTCATGTTTGG+AGG + Chr5:76213964-76213983 None:intergenic 25.0%
! GTTAGCAGAGTTTAAAAATA+TGG - Chr5:76215277-76215296 MsG0580028179.01.T01:intron 25.0%
! TATGTATGATATTATGCTCT+TGG + Chr5:76212639-76212658 None:intergenic 25.0%
! TCTTAAATTCTTTATCTCCT+TGG + Chr5:76214436-76214455 None:intergenic 25.0%
! TTCTCTGATTCTAATAAACT+CGG - Chr5:76214152-76214171 MsG0580028179.01.T01:CDS 25.0%
! TTGATTAAATATATACCTGC+AGG - Chr5:76215426-76215445 MsG0580028179.01.T01:CDS 25.0%
! TTTAAAAATATGGTTGGGAA+TGG - Chr5:76215287-76215306 MsG0580028179.01.T01:intron 25.0%
!! AAGTAGTCAAGACTTTTATT+GGG + Chr5:76214560-76214579 None:intergenic 25.0%
!! AATGCTAAGATTTCAGATTT+TGG - Chr5:76214854-76214873 MsG0580028179.01.T01:intron 25.0%
!!! AAATCAGATGTCTTTAGTTT+TGG - Chr5:76215097-76215116 MsG0580028179.01.T01:CDS 25.0%
!!! AGTTCTAGAGTTAAAAGATA+TGG - Chr5:76213732-76213751 MsG0580028179.01.T01:CDS 25.0%
!!! TAAGAATGAAGTGCTTTTAA+TGG - Chr5:76214451-76214470 MsG0580028179.01.T01:CDS 25.0%
!!! TACTTGGTTTTACTATTGAA+GGG - Chr5:76214504-76214523 MsG0580028179.01.T01:CDS 25.0%
!!! TCCAATTGCTATTATAGTTT+TGG - Chr5:76213863-76213882 MsG0580028179.01.T01:CDS 25.0%
AAAAGGTTGTCCATTAATTC+TGG - Chr5:76214410-76214429 MsG0580028179.01.T01:intron 30.0%
AACATAACCTAACACTTACT+AGG + Chr5:76214939-76214958 None:intergenic 30.0%
AACTCTACTTGTATTTGCTT+GGG + Chr5:76214909-76214928 None:intergenic 30.0%
AATTGGAATTGCTATGATGA+TGG + Chr5:76213850-76213869 None:intergenic 30.0%
AGTCTTGACTACTTCATATT+TGG - Chr5:76214566-76214585 MsG0580028179.01.T01:intron 30.0%
ATCATGAGATGCATTCATAT+TGG - Chr5:76215523-76215542 MsG0580028179.01.T01:CDS 30.0%
ATCCAAGTAACTTATATCAG+GGG + Chr5:76213382-76213401 None:intergenic 30.0%
ATTTCTTCATCATCTTCTGT+AGG + Chr5:76214074-76214093 None:intergenic 30.0%
CAAGTAGTCTAACTAAATTC+CGG + Chr5:76214490-76214509 None:intergenic 30.0%
CAATCCAAGTAACTTATATC+AGG + Chr5:76213384-76213403 None:intergenic 30.0%
CTACTATCCATAAAAAATGC+AGG + Chr5:76215649-76215668 None:intergenic 30.0%
CTTGGATTGCAATATATGTT+TGG - Chr5:76213395-76213414 MsG0580028179.01.T01:intron 30.0%
GCAGAGTTTAAAAATATGGT+TGG - Chr5:76215281-76215300 MsG0580028179.01.T01:intron 30.0%
TACATACATACCTTTGTGAT+TGG + Chr5:76213568-76213587 None:intergenic 30.0%
TATACTACCTGTTACATTTG+CGG + Chr5:76213208-76213227 None:intergenic 30.0%
TCTCTGATTCTAATAAACTC+GGG - Chr5:76214153-76214172 MsG0580028179.01.T01:CDS 30.0%
TTATCACTCTGTTATGAACA+TGG - Chr5:76213979-76213998 MsG0580028179.01.T01:intron 30.0%
TTGCTAGTAAACATTGATGT+AGG - Chr5:76215352-76215371 MsG0580028179.01.T01:intron 30.0%
! ATAAAAAATGCAGGTTCTGA+AGG + Chr5:76215640-76215659 None:intergenic 30.0%
! ATCCTATTTTCACAACAAGA+TGG + Chr5:76213441-76213460 None:intergenic 30.0%
! GAAGAAAGCACAATTAGATT+GGG - Chr5:76214709-76214728 MsG0580028179.01.T01:CDS 30.0%
! GAAGTAGTCAAGACTTTTAT+TGG + Chr5:76214561-76214580 None:intergenic 30.0%
! TCATATCTAAGATTGCAACT+TGG + Chr5:76213483-76213502 None:intergenic 30.0%
! TCTTGTTGTGAAAATAGGAT+AGG - Chr5:76213441-76213460 MsG0580028179.01.T01:CDS 30.0%
! TGAAGAAAGCACAATTAGAT+TGG - Chr5:76214708-76214727 MsG0580028179.01.T01:CDS 30.0%
! TTCCATCTTGTTGTGAAAAT+AGG - Chr5:76213436-76213455 MsG0580028179.01.T01:CDS 30.0%
!! AAGGATTTTCTGATTTGTGT+AGG - Chr5:76213801-76213820 MsG0580028179.01.T01:CDS 30.0%
!! TAAGATTTCAGATTTTGGCA+TGG - Chr5:76214859-76214878 MsG0580028179.01.T01:intron 30.0%
!! TTTTCTGATTTGTGTAGGTA+AGG - Chr5:76213806-76213825 MsG0580028179.01.T01:CDS 30.0%
!!! CTACTTGGTTTTACTATTGA+AGG - Chr5:76214503-76214522 MsG0580028179.01.T01:CDS 30.0%
!!! TTCAGAACCTGCATTTTTTA+TGG - Chr5:76215639-76215658 MsG0580028179.01.T01:five_prime_UTR 30.0%
AAGCGCTACAAAATCATTCA+AGG - Chr5:76214734-76214753 MsG0580028179.01.T01:CDS 35.0%
AGTAAACATTGATGTAGGAG+TGG - Chr5:76215357-76215376 MsG0580028179.01.T01:intron 35.0%
AGTGAAATTGTAGAAACCGT+AGG + Chr5:76212857-76212876 None:intergenic 35.0%
ATACCTTTGTGATTGGTAGA+TGG + Chr5:76213561-76213580 None:intergenic 35.0%
ATGGAGTAAAAACATCTGTC+TGG + Chr5:76212738-76212757 None:intergenic 35.0%
CAACTCTACTTGTATTTGCT+TGG + Chr5:76214910-76214929 None:intergenic 35.0%
CATGGCAAGACTAATTCTAT+TGG - Chr5:76214877-76214896 MsG0580028179.01.T01:intron 35.0%
CATTTACGCGCAACAATATT+TGG - Chr5:76215021-76215040 MsG0580028179.01.T01:intron 35.0%
CCATTATCATCAGCACAATA+TGG + Chr5:76212757-76212776 None:intergenic 35.0%
CGGAATTTAGTTAGACTACT+TGG - Chr5:76214488-76214507 MsG0580028179.01.T01:CDS 35.0%
CTCAGAATCTAACGAGAATA+TGG + Chr5:76215789-76215808 None:intergenic 35.0%
CTCCAGAGAATCAATAAATG+AGG - Chr5:76215749-76215768 MsG0580028179.01.T01:five_prime_UTR 35.0%
CTCTGATTCTAATAAACTCG+GGG - Chr5:76214154-76214173 MsG0580028179.01.T01:CDS 35.0%
CTTTCATGATAGCTAAAACG+CGG - Chr5:76214658-76214677 MsG0580028179.01.T01:intron 35.0%
GCAAATACAAGTAGAGTTGT+TGG - Chr5:76214911-76214930 MsG0580028179.01.T01:intron 35.0%
GGGTAATTGTAATGACTCAA+AGG + Chr5:76214102-76214121 None:intergenic 35.0%
GGTTTCTACAATTTCACTCA+TGG - Chr5:76212859-76212878 MsG0580028179.01.T01:CDS 35.0%
GTTGCATATATAGGTGAAAC+AGG + Chr5:76214007-76214026 None:intergenic 35.0%
GTTGTGAAAATAGGATAGGT+GGG - Chr5:76213445-76213464 MsG0580028179.01.T01:CDS 35.0%
TAAATATATACCTGCAGGCA+TGG - Chr5:76215431-76215450 MsG0580028179.01.T01:CDS 35.0%
TACCCCTGATATAAGTTACT+TGG - Chr5:76213377-76213396 MsG0580028179.01.T01:intron 35.0%
TAGCATTCATATCTTCGTCT+AGG + Chr5:76214841-76214860 None:intergenic 35.0%
TCTAATTGTGCTTTCTTCAG+TGG + Chr5:76214707-76214726 None:intergenic 35.0%
TGGAGTAAAAACATCTGTCT+GGG + Chr5:76212737-76212756 None:intergenic 35.0%
TGTTGTGAAAATAGGATAGG+TGG - Chr5:76213444-76213463 MsG0580028179.01.T01:CDS 35.0%
TTGAAAAATCAAGCTGCAAC+TGG - Chr5:76213159-76213178 MsG0580028179.01.T01:intron 35.0%
TTTCATGATAGCTAAAACGC+GGG - Chr5:76214659-76214678 MsG0580028179.01.T01:intron 35.0%
! AGCAACTTGTAAAGTGTCAA+AGG + Chr5:76214123-76214142 None:intergenic 35.0%
! CCATATTGTGCTGATGATAA+TGG - Chr5:76212754-76212773 MsG0580028179.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
! CTGGTTCTTGAGATTATAAG+TGG - Chr5:76215124-76215143 MsG0580028179.01.T01:CDS 35.0%
! GACGAATGCAACTATTCTTT+TGG + Chr5:76215150-76215169 None:intergenic 35.0%
! GCAACTTGTAAAGTGTCAAA+GGG + Chr5:76214122-76214141 None:intergenic 35.0%
!! AGCCTCATTTATTGATTCTC+TGG + Chr5:76215754-76215773 None:intergenic 35.0%
!! CAACAATATTTGGCTTGTAG+CGG - Chr5:76215031-76215050 MsG0580028179.01.T01:intron 35.0%
!! GAGTTGATAAAAGTGTGTTG+AGG + Chr5:76212813-76212832 None:intergenic 35.0%
!! TAAATTCCGGTGTTGATGTT+TGG + Chr5:76214477-76214496 None:intergenic 35.0%
!!! TGTCTTTAGTTTTGGTGTTC+TGG - Chr5:76215105-76215124 MsG0580028179.01.T01:CDS 35.0%
AACGACAAAGTATACGCCAT+AGG - Chr5:76212889-76212908 MsG0580028179.01.T01:CDS 40.0%
AAGAATAGTTGCATTCGTCG+CGG - Chr5:76215151-76215170 MsG0580028179.01.T01:CDS 40.0%
ACCAAAAAGAAGCGATTGGT+TGG - Chr5:76212995-76213014 MsG0580028179.01.T01:CDS 40.0%
AGACAACTGCAGCAATCATT+TGG + Chr5:76212937-76212956 None:intergenic 40.0%
ATCTCCTCTGCATTATCCTA+TGG + Chr5:76212908-76212927 None:intergenic 40.0%
ATCTCCTTGGCCAGAATTAA+TGG + Chr5:76214423-76214442 None:intergenic 40.0%
CATTGATGTAGGAGTGGAAA+TGG - Chr5:76215363-76215382 MsG0580028179.01.T01:intron 40.0%
CCAAACCAAAAAGAAGCGAT+TGG - Chr5:76212991-76213010 MsG0580028179.01.T01:CDS 40.0%
GATTCTAATAAACTCGGGGA+AGG - Chr5:76214158-76214177 MsG0580028179.01.T01:CDS 40.0%
GCTACTTAGCATGAGTACAA+TGG + Chr5:76215596-76215615 None:intergenic 40.0%
GTTGGAACCTAGTAAGTGTT+AGG - Chr5:76214929-76214948 MsG0580028179.01.T01:intron 40.0%
TAATGGCCAAACATCAACAC+CGG - Chr5:76214468-76214487 MsG0580028179.01.T01:CDS 40.0%
TACTCAAACCGGTCGATATT+TGG - Chr5:76213039-76213058 MsG0580028179.01.T01:CDS 40.0%
TATGCTACCGCAAATGTAAC+AGG - Chr5:76213198-76213217 MsG0580028179.01.T01:intron 40.0%
TCACCATCTACCAATCACAA+AGG - Chr5:76213555-76213574 MsG0580028179.01.T01:intron 40.0%
TCCAACACAGAAATCACCTA+CGG - Chr5:76212838-76212857 MsG0580028179.01.T01:exon 40.0%
TCTCCATGCATTACATACTC+AGG + Chr5:76215067-76215086 None:intergenic 40.0%
TGATTGGTAGATGGTGAAGT+AGG + Chr5:76213552-76213571 None:intergenic 40.0%
TTGTCCATTAATTCTGGCCA+AGG - Chr5:76214416-76214435 MsG0580028179.01.T01:intron 40.0%
! GTCTTCTAGCTATGTTGTCT+TGG + Chr5:76215561-76215580 None:intergenic 40.0%
! TCCAACCAATCGCTTCTTTT+TGG + Chr5:76212999-76213018 None:intergenic 40.0%
!! AGGTTCTGAAGGTATAGAGA+GGG + Chr5:76215629-76215648 None:intergenic 40.0%
!! ATCATTCAAGGTATTGCTCG+AGG - Chr5:76214746-76214765 MsG0580028179.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTGGCTTGTAGCGGATATA+TGG - Chr5:76215039-76215058 MsG0580028179.01.T01:intron 40.0%
!!! CCAATCGCTTCTTTTTGGTT+TGG + Chr5:76212994-76213013 None:intergenic 40.0%
AAAAACATCTGTCTGGGCTG+TGG + Chr5:76212731-76212750 None:intergenic 45.0%
AAGCTGTGGGAAGAGAATTC+AGG - Chr5:76215691-76215710 MsG0580028179.01.T01:five_prime_UTR 45.0%
ACCGTAGGTGATTTCTGTGT+TGG + Chr5:76212842-76212861 None:intergenic 45.0%
AGAATAGTTGCATTCGTCGC+GGG - Chr5:76215152-76215171 MsG0580028179.01.T01:CDS 45.0%
AGCTGTGGGAAGAGAATTCA+GGG - Chr5:76215692-76215711 MsG0580028179.01.T01:five_prime_UTR 45.0%
AGGCGTTCTTTACCTTCATG+AGG - Chr5:76214766-76214785 MsG0580028179.01.T01:CDS 45.0%
AGTACAATGGTAGCCATGGT+TGG + Chr5:76215583-76215602 None:intergenic 45.0%
CAGCACCTGGATTATCTATG+CGG - Chr5:76213073-76213092 MsG0580028179.01.T01:CDS 45.0%
CATAGCTAGAAGACCAACCA+TGG - Chr5:76215567-76215586 MsG0580028179.01.T01:CDS 45.0%
CATGAGTACAATGGTAGCCA+TGG + Chr5:76215587-76215606 None:intergenic 45.0%
CCATTCGTCCAAATATCGAC+CGG + Chr5:76213050-76213069 None:intergenic 45.0%
CCTTCAAGAGATGAAGCTGT+GGG - Chr5:76215678-76215697 MsG0580028179.01.T01:five_prime_UTR 45.0%
CTTCTGTAGGAACTGAGATG+TGG + Chr5:76214061-76214080 None:intergenic 45.0%
GACAAGCGATCGCTGTTAAA+AGG - Chr5:76214393-76214412 MsG0580028179.01.T01:intron 45.0%
GATCATCTCTCCAAGTACAC+AGG + Chr5:76215937-76215956 None:intergenic 45.0%
GCACCTGAGTATGTAATGCA+TGG - Chr5:76215061-76215080 MsG0580028179.01.T01:CDS 45.0%
GGATTCCGCATAGATAATCC+AGG + Chr5:76213081-76213100 None:intergenic 45.0%
GGGCTGTGGTTTCATAACAT+AGG + Chr5:76212717-76212736 None:intergenic 45.0%
GTATGGAGAACCTGTGTACT+TGG - Chr5:76215924-76215943 MsG0580028179.01.T01:five_prime_UTR 45.0%
TACGCCATAGGATAATGCAG+AGG - Chr5:76212901-76212920 MsG0580028179.01.T01:CDS 45.0%
TCCACATCCGTTGCATTAAG+CGG + Chr5:76213102-76213121 None:intergenic 45.0%
TCTAATAAACTCGGGGAAGG+CGG - Chr5:76214161-76214180 MsG0580028179.01.T01:CDS 45.0%
TTGGTAGATGGTGAAGTAGG+TGG + Chr5:76213549-76213568 None:intergenic 45.0%
! ACAACTAGTCGCGTCTTTTC+AGG - Chr5:76214355-76214374 MsG0580028179.01.T01:intron 45.0%
! CAACTAGTCGCGTCTTTTCA+GGG - Chr5:76214356-76214375 MsG0580028179.01.T01:intron 45.0%
! CGGATTTGGAGCTGTATATC+AGG - Chr5:76214181-76214200 MsG0580028179.01.T01:CDS 45.0%
!! CAGGTTCTGAAGGTATAGAG+AGG + Chr5:76215630-76215649 None:intergenic 45.0%
!! CTCTGGAGCTGATTTACTTG+TGG + Chr5:76215737-76215756 None:intergenic 45.0%
!! TGTTGCTTGCTTTGAGATCG+CGG + Chr5:76214814-76214833 None:intergenic 45.0%
CATTCGTCGCGGGGAAAATA+CGG - Chr5:76215162-76215181 MsG0580028179.01.T01:CDS 50.0%
CCCACAGCTTCATCTCTTGA+AGG + Chr5:76215681-76215700 None:intergenic 50.0%
CCGGTCGATATTTGGACGAA+TGG - Chr5:76213047-76213066 MsG0580028179.01.T01:CDS 50.0%
GAATAGTTGCATTCGTCGCG+GGG - Chr5:76215153-76215172 MsG0580028179.01.T01:CDS 50.0%
GCAGTCGAGAATCCTCATGA+AGG + Chr5:76214781-76214800 None:intergenic 50.0%
GCATGCTGCGTTACTCAAAC+CGG - Chr5:76213028-76213047 MsG0580028179.01.T01:CDS 50.0%
GCCTTCAAGAGATGAAGCTG+TGG - Chr5:76215677-76215696 MsG0580028179.01.T01:five_prime_UTR 50.0%
GCGGAATCCGCTTAATGCAA+CGG - Chr5:76213092-76213111 MsG0580028179.01.T01:CDS 50.0%
GTAGATGGTGAAGTAGGTGG+TGG + Chr5:76213546-76213565 None:intergenic 50.0%
TCCGCTTAATGCAACGGATG+TGG - Chr5:76213098-76213117 MsG0580028179.01.T01:CDS 50.0%
! TTTCAGGGTGGGCTCTCTAA+TGG - Chr5:76214371-76214390 MsG0580028179.01.T01:intron 50.0%
!! TAGTCGCGTCTTTTCAGGGT+GGG - Chr5:76214360-76214379 MsG0580028179.01.T01:intron 50.0%
ACCTGCAGGCATGGAGAAGT+TGG - Chr5:76215440-76215459 MsG0580028179.01.T01:CDS 55.0%
GCAGGCATGGAGAAGTTGGA+GGG - Chr5:76215444-76215463 MsG0580028179.01.T01:CDS 55.0%
GCATGGAGAAGTTGGAGGGA+AGG - Chr5:76215448-76215467 MsG0580028179.01.T01:CDS 55.0%
GGACGAATGGAATCAGCACC+TGG - Chr5:76213060-76213079 MsG0580028179.01.T01:CDS 55.0%
TCCAACTTCTCCATGCCTGC+AGG + Chr5:76215444-76215463 None:intergenic 55.0%
TGCAGGCATGGAGAAGTTGG+AGG - Chr5:76215443-76215462 MsG0580028179.01.T01:CDS 55.0%
! AAACTCGGGGAAGGCGGATT+TGG - Chr5:76214167-76214186 MsG0580028179.01.T01:CDS 55.0%
! GATGGTGAAGTAGGTGGTGG+TGG + Chr5:76213543-76213562 None:intergenic 55.0%
!! CTAGTCGCGTCTTTTCAGGG+TGG - Chr5:76214359-76214378 MsG0580028179.01.T01:intron 55.0%
TCGTCGCGGGGAAAATACGG+AGG - Chr5:76215165-76215184 MsG0580028179.01.T01:CDS 60.0%
!! AAGTAGGTGGTGGTGGCAGC+GGG + Chr5:76213536-76213555 None:intergenic 60.0%
!! GAAGTAGGTGGTGGTGGCAG+CGG + Chr5:76213537-76213556 None:intergenic 60.0%
! GGTGGTGGCAGCGGGTGCAC+TGG + Chr5:76213528-76213547 None:intergenic 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr5 gene 76212633 76215987 76212633 ID=MsG0580028179.01;Name=MsG0580028179.01
Chr5 mRNA 76212633 76215987 76212633 ID=MsG0580028179.01.T01;Parent=MsG0580028179.01;Name=MsG0580028179.01.T01;_AED=0.41;_eAED=0.41;_QI=397|1|1|1|1|1|8|222|534
Chr5 exon 76212633 76213172 76212633 ID=MsG0580028179.01.T01:exon:24022;Parent=MsG0580028179.01.T01
Chr5 exon 76213419 76213569 76213419 ID=MsG0580028179.01.T01:exon:24021;Parent=MsG0580028179.01.T01
Chr5 exon 76213681 76213918 76213681 ID=MsG0580028179.01.T01:exon:24020;Parent=MsG0580028179.01.T01
Chr5 exon 76214033 76214243 76214033 ID=MsG0580028179.01.T01:exon:24019;Parent=MsG0580028179.01.T01
Chr5 exon 76214418 76214551 76214418 ID=MsG0580028179.01.T01:exon:24018;Parent=MsG0580028179.01.T01
Chr5 exon 76214672 76214797 76214672 ID=MsG0580028179.01.T01:exon:24017;Parent=MsG0580028179.01.T01
Chr5 exon 76215044 76215280 76215044 ID=MsG0580028179.01.T01:exon:24016;Parent=MsG0580028179.01.T01
Chr5 exon 76215401 76215987 76215401 ID=MsG0580028179.01.T01:exon:24015;Parent=MsG0580028179.01.T01
Chr5 five_prime_UTR 76215591 76215987 76215591 ID=MsG0580028179.01.T01:five_prime_utr;Parent=MsG0580028179.01.T01
Chr5 CDS 76215401 76215590 76215401 ID=MsG0580028179.01.T01:cds;Parent=MsG0580028179.01.T01
Chr5 CDS 76215044 76215280 76215044 ID=MsG0580028179.01.T01:cds;Parent=MsG0580028179.01.T01
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Chr5 CDS 76212855 76213172 76212855 ID=MsG0580028179.01.T01:cds;Parent=MsG0580028179.01.T01
Chr5 three_prime_UTR 76212633 76212854 76212633 ID=MsG0580028179.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0580028179.01.T01
Gene Sequence

>MsG0580028179.01.T01

ATGCTGCGTTACTCAAACCGGTCGATATTTGGACGAATGGAATCAGCACCTGGATTATCTATGCGGAATCCGCTTAATGCAACGGATGTGGATAATTACAATAAAGTATTGAGCAAATTGTTATATGATTTGAAAAATCAAGCTGCAACTGGTGATTCTATGAAAAAATATGCTACCGCAAATGTAACAGGTCCAAATTTTCAAGATATATATAGTCTCATGCAGTGTACCCCTGATATAAGTTACTTGGATTGCAATATATGTTTGGCTCAAGCTATAGCTAGTCTTCCATCTTGTTGTGAAAATAGGATAGGTGGGAGAGTTATTAGACCAAGTTGCAATCTTAGATATGAACGTTATAGGTTCTATGAACTTCCAGTGCACCCGCTGCCACCACCACCTACTTCACCATCTACCAATCACAAAGGTAAGGATCACAAATCAAGAACTTCCATCATCATAGCAATTCCAATTGCTATTATAGTTTTGGTTCTCTGTTTCATCTGCATCTATTTACGACTACGAGTGAAGAAACCAAATGAAAGTACTAAAATTCCTACAGAAGATGATGAAGAAATTATAACCTTTGAGTCATTACAATTACCCTTTGACACTTTACAAGTTGCTACAAATGACTTCTCTGATTCTAATAAACTCGGGGAAGGCGGATTTGGAGCTGTATATCAGGGTGGGCTCTCTAATGGACAAGCGATCGCTGTTAAAAGGTTGTCCATTAATTCTGGCCAAGGAGATAAAGAATTTAAGAATGAAGTGCTTTTAATGGCCAAACATCAACACCGGAATTTAGTTAGACTACTTGGTTTTACTATTGAAGGGAGAGAAAGACTACTTGTCTATGAATTTATTCCCAATAAAAGTCTTGACTACTTCATATTTGATCCACTGAAGAAAGCACAATTAGATTGGGATAAGCGCTACAAAATCATTCAAGGTATTGCTCGAGGCGTTCTTTACCTTCATGAGGATTCTCGACTGCGTATTATACACCGCGATCTCAAAGCAAGCAACATTCTCCTAGACGAAGATATGAATGCTAAGATTTCAGATTTTGGCATGGCAAGACTAATTCTATTGGATCAAACCCAAGCAAATACAAGTAGAGTTGTTGGAACCTACGGATATATGGCACCTGAGTATGTAATGCATGGAGAATTTTCAGTGAAATCAGATGTCTTTAGTTTTGGTGTTCTGGTTCTTGAGATTATAAGTGGCCAAAAGAATAGTTGCATTCGTCGCGGGGAAAATACGGAGGATCTATTGAGCTTTGCATGGAGAAGTTGGAGGGAAGGAACAGCTGCAAATATTATCGATTCATCACTATACAACAGTTCAAGAAATGAAATCATGAGATGCATTCATATTGGTTTACTTTGCGTCCAAGACAACATAGCTAGAAGACCAACCATGGCTACCATTGTACTCATGCTAAGTAGCTATTCTCTCACCCTCTCTATACCTTCAGAACCTGCATTTTTTATGGATAGTAGAACTAGAAGCCTTCAAGAGATGAAGCTGTGGGAAGAGAATTCAGGGACAACAAGATCGAGTCAATCCACAAGTAAATCAGCTCCAGAGAATCAATAA

Protein sequence

>MsG0580028179.01.T01

MLRYSNRSIFGRMESAPGLSMRNPLNATDVDNYNKVLSKLLYDLKNQAATGDSMKKYATANVTGPNFQDIYSLMQCTPDISYLDCNICLAQAIASLPSCCENRIGGRVIRPSCNLRYERYRFYELPVHPLPPPPTSPSTNHKGKDHKSRTSIIIAIPIAIIVLVLCFICIYLRLRVKKPNESTKIPTEDDEEIITFESLQLPFDTLQVATNDFSDSNKLGEGGFGAVYQGGLSNGQAIAVKRLSINSGQGDKEFKNEVLLMAKHQHRNLVRLLGFTIEGRERLLVYEFIPNKSLDYFIFDPLKKAQLDWDKRYKIIQGIARGVLYLHEDSRLRIIHRDLKASNILLDEDMNAKISDFGMARLILLDQTQANTSRVVGTYGYMAPEYVMHGEFSVKSDVFSFGVLVLEIISGQKNSCIRRGENTEDLLSFAWRSWREGTAANIIDSSLYNSSRNEIMRCIHIGLLCVQDNIARRPTMATIVLMLSSYSLTLSIPSEPAFFMDSRTRSLQEMKLWEENSGTTRSSQSTSKSAPENQ*