AlfalfaGEDB | MsG0780036127.01

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780036127.01

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Find 206 sgRNAs with CRISPR-Local

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
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CATGAGGAATGGAACCTTTA+AGG	0.141017	7:+3146290	None:intergenic
GATTGCCTTTCTTATTATTT+GGG	0.170602	7:-3147967	MsG0780036127.01.T01:CDS
ATCTCTTTGAACAATATTAA+TGG	0.178313	7:-3146448	MsG0780036127.01.T01:CDS
ATAGCCGTGAAGTTTCTTTA+AGG	0.187232	7:+3145313	None:intergenic
TTGTCTCACAATCATCTTAT+AGG	0.199397	7:-3147456	MsG0780036127.01.T01:CDS
GGTTCCATTCCTCATGATTT+GGG	0.221469	7:-3146139	MsG0780036127.01.T01:CDS
ATTTCTACTTAATTGCAATT+TGG	0.240591	7:+3145988	None:intergenic
ATCTCTCACAACAACCTTAA+AGG	0.242258	7:-3146304	MsG0780036127.01.T01:CDS
GTAAGATTTGTAAGAAAATT+AGG	0.245874	7:+3146058	None:intergenic
GAGAGATGACCAATTTCTTT+TGG	0.248374	7:+3147642	None:intergenic
GTATAAATCTGAGGACAATT+TGG	0.248956	7:+3145689	None:intergenic
ATATCTCTGATCGTTGTAAT+TGG	0.255341	7:-3147833	MsG0780036127.01.T01:CDS
TTTGTCTCACAATCATCTTT+TGG	0.256224	7:-3146953	MsG0780036127.01.T01:CDS
ATCAGTAAATGGAGACAAAT+TGG	0.273713	7:+3145889	None:intergenic
TTGTCTCACAATTCTCTTGT+AGG	0.280010	7:-3146592	MsG0780036127.01.T01:CDS
TTGTCTCACAATTCTCTTGT+AGG	0.280010	7:-3147168	MsG0780036127.01.T01:CDS
TTGTCTCACAATTCTCTTGT+AGG	0.290544	7:-3147024	MsG0780036127.01.T01:CDS
TTGTCTCACAATTCTCTTGT+AGG	0.290544	7:-3147528	MsG0780036127.01.T01:CDS
AGGTTCCATTCCTCATGATT+TGG	0.290600	7:-3146140	MsG0780036127.01.T01:CDS
GTGGCACTTGAAACTTTAAT+TGG	0.291586	7:-3144625	MsG0780036127.01.T01:CDS
AAAAGGGTCAACACTATTAA+AGG	0.292606	7:-3145089	MsG0780036127.01.T01:CDS
TGCAGAGCTTGCTTATACTA+TGG	0.293366	7:-3144686	MsG0780036127.01.T01:intron
TTGTCTCACAATTCTCTTGT+AGG	0.295801	7:-3146664	MsG0780036127.01.T01:CDS
TTGTCTCACAATTCTCTTGT+AGG	0.295801	7:-3146736	MsG0780036127.01.T01:CDS
TTGTCTCACAATTCTCTTGT+AGG	0.295801	7:-3146808	MsG0780036127.01.T01:CDS
TTGTCTCACAATTCTCTTGT+AGG	0.295801	7:-3146880	MsG0780036127.01.T01:CDS
TTGTCTCACAATTCTCTTGT+AGG	0.295801	7:-3147240	MsG0780036127.01.T01:CDS
TTGTCTCACAATTCTCTTGT+AGG	0.295801	7:-3147312	MsG0780036127.01.T01:CDS
TTGTCTCACAATTCTCTTGT+AGG	0.295801	7:-3147384	MsG0780036127.01.T01:CDS
ACTATAGTTGCTGGAACTAT+TGG	0.311266	7:-3144909	MsG0780036127.01.T01:CDS
TTCAGTCACAACCTCATTAA+TGG	0.313472	7:-3145848	MsG0780036127.01.T01:CDS
AGGAAATCTAAAACAATTAC+AGG	0.317108	7:-3146191	MsG0780036127.01.T01:CDS
GGGACTATTCCAAAAGAAAT+TGG	0.318327	7:-3147651	MsG0780036127.01.T01:CDS
GGTGAAATCCCTTCTCATAT+TGG	0.331988	7:-3145827	MsG0780036127.01.T01:CDS
AGGAAATCTCAAACAATTAC+AGG	0.332970	7:-3146335	MsG0780036127.01.T01:CDS
GAAGTATCATAATCAGTAAA+TGG	0.334850	7:+3145878	None:intergenic
AACATAGTTGGGCCATCTAA+TGG	0.350082	7:-3142920	MsG0780036127.01.T01:CDS
GGACATTTCATACAATTGTT+TGG	0.353968	7:-3145723	MsG0780036127.01.T01:CDS
ATCTCGCACAACGACCTTAC+AGG	0.358649	7:-3146160	MsG0780036127.01.T01:CDS
CATAGACATTACAGAGAGAT+TGG	0.368545	7:+3145753	None:intergenic
GTTGCAGAACAGAACTTTCC+AGG	0.381277	7:+3142950	None:intergenic
AGACTAGGACTAGAATAATA+AGG	0.383848	7:+3145558	None:intergenic
TCCAATCGAACTATAGTTGC+TGG	0.386104	7:-3144918	MsG0780036127.01.T01:CDS
CAGGCTAGTGTTTGTGACTT+TGG	0.386315	7:-3144969	MsG0780036127.01.T01:CDS
GGTTCCATTCCTCATGAGTT+GGG	0.387312	7:-3146283	MsG0780036127.01.T01:CDS
AGTGATGACAATATATCTTC+AGG	0.392263	7:+3144595	None:intergenic
TTGCTAGTGAAGGAGGTTCC+AGG	0.392658	7:+3147001	None:intergenic
TTGCTAGTGAAGGAGGTTCC+AGG	0.392658	7:+3147505	None:intergenic
TTGAACCAGAATTTCTTTAC+CGG	0.401062	7:+3142862	None:intergenic
GATACATCTCGATGCACTAT+TGG	0.407190	7:+3145023	None:intergenic
TGCATTGGAACAGGAGCATA+TGG	0.414248	7:-3145377	MsG0780036127.01.T01:CDS
GACATCTCATCAACTTCAAA+TGG	0.416741	7:-3147910	MsG0780036127.01.T01:CDS
GTAGGGGCCAAGGTTGGAAT+TGG	0.421897	7:+3145630	None:intergenic
AAGTGTGATGTGTATAGTTT+TGG	0.437562	7:-3144652	MsG0780036127.01.T01:CDS
GAACGATTAAATCCATTAGA+TGG	0.440535	7:+3142908	None:intergenic
CGTTTAACCAATTCCAACCT+TGG	0.444058	7:-3145637	MsG0780036127.01.T01:CDS
TGTCTAAGATTATCTATTGA+AGG	0.445959	7:+3146487	None:intergenic
GCAACTCAATCAAACATAGT+TGG	0.447490	7:-3142932	MsG0780036127.01.T01:CDS
GAAATATCTTGCAACGATGA+TGG	0.451064	7:-3147807	MsG0780036127.01.T01:CDS
AAGGTAATGCTGATAATGTT+GGG	0.452199	7:-3143120	MsG0780036127.01.T01:CDS
ATGAGATATTGCATTGGAAC+AGG	0.454703	7:-3145386	MsG0780036127.01.T01:CDS
TGGAATTCAAGTGGAGGAAA+AGG	0.457259	7:-3145106	MsG0780036127.01.T01:CDS
ATAGACATTACAGAGAGATT+GGG	0.457747	7:+3145754	None:intergenic
TCCAGCAACTATAGTTCGAT+TGG	0.460209	7:+3144917	None:intergenic
GCAAATGCTATAATAAATAG+TGG	0.464914	7:-3147885	MsG0780036127.01.T01:CDS
ATCTGAGGACAATTTGGAAT+GGG	0.469195	7:+3145695	None:intergenic
TCACAATTCTCTTGTAGGCC+TGG	0.469445	7:-3147019	MsG0780036127.01.T01:CDS
TCACAATTCTCTTGTAGGCC+TGG	0.469445	7:-3147523	MsG0780036127.01.T01:CDS
CAACTCAATCAAACATAGTT+GGG	0.470643	7:-3142931	MsG0780036127.01.T01:CDS
CACTTGAAACTTTAATTGGA+AGG	0.479100	7:-3144621	MsG0780036127.01.T01:CDS
TTTAGATTTCCTAGGGAAGA+AGG	0.480122	7:+3146202	None:intergenic
CTATCTCACAATAGACTCAA+TGG	0.480404	7:-3146088	MsG0780036127.01.T01:CDS
CAAATCAAGATGAGTGAGCT+TGG	0.481352	7:+3146540	None:intergenic
CAAATCAAGATGAGTGAGCT+TGG	0.481352	7:+3147116	None:intergenic
AACTTAACAACAACAAAGAA+TGG	0.494121	7:-3145485	MsG0780036127.01.T01:CDS
TTAGAGAGATTTGCTAGTGA+AGG	0.497072	7:+3146631	None:intergenic
TTAGAGAGATTTGCTAGTGA+AGG	0.497072	7:+3146703	None:intergenic
TTAGAGAGATTTGCTAGTGA+AGG	0.497072	7:+3146775	None:intergenic
TTAGAGAGATTTGCTAGTGA+AGG	0.497072	7:+3146847	None:intergenic
TTAGAGAGATTTGCTAGTGA+AGG	0.497072	7:+3146919	None:intergenic
TTAGAGAGATTTGCTAGTGA+AGG	0.497072	7:+3146991	None:intergenic
TTAGAGAGATTTGCTAGTGA+AGG	0.497072	7:+3147063	None:intergenic
TTAGAGAGATTTGCTAGTGA+AGG	0.497072	7:+3147207	None:intergenic
TTAGAGAGATTTGCTAGTGA+AGG	0.497072	7:+3147351	None:intergenic
TTAGAGAGATTTGCTAGTGA+AGG	0.497072	7:+3147423	None:intergenic
TTAGAGAGATTTGCTAGTGA+AGG	0.497072	7:+3147495	None:intergenic
TTAGAGAGATTTGCTAGTGA+AGG	0.497072	7:+3147567	None:intergenic
GAAGGTAATGCTGATAATGT+TGG	0.499295	7:-3143121	MsG0780036127.01.T01:intron
CTAAAACTGTCATCAAAAGA+TGG	0.499509	7:+3145278	None:intergenic
ATTGCCTTTCTTATTATTTG+GGG	0.502450	7:-3147966	MsG0780036127.01.T01:CDS
TACTGATTATGATACTTCCA+TGG	0.502502	7:-3145873	MsG0780036127.01.T01:CDS
TTAAGCAATAATAATCTCAC+TGG	0.504110	7:-3145785	MsG0780036127.01.T01:CDS
GATTTGTAAGAAAATTAGGC+AGG	0.504397	7:+3146062	None:intergenic
CTTGCTAAACTCTGAGTGGC+AGG	0.509367	7:-3144988	MsG0780036127.01.T01:CDS
CAAACCCCAAATAATAAGAA+AGG	0.513632	7:+3147962	None:intergenic
GTGATGACAATATATCTTCA+GGG	0.515114	7:+3144596	None:intergenic
TTGCTAGTGAAGGCGGTACA+TGG	0.516631	7:+3147289	None:intergenic
CTGTAATGTCTATGATTATG+TGG	0.517142	7:-3145744	MsG0780036127.01.T01:CDS
AGGTTCCATTCCTCATGAGT+TGG	0.517908	7:-3146284	MsG0780036127.01.T01:CDS
GTTGCCTTAAAGAAACTTCA+CGG	0.522621	7:-3145317	MsG0780036127.01.T01:CDS
AAGGGATTTCACCATTAATG+AGG	0.524205	7:+3145837	None:intergenic
GAGAGATTTGCTAGTGAAGG+AGG	0.524298	7:+3146994	None:intergenic
GAGAGATTTGCTAGTGAAGG+AGG	0.524298	7:+3147498	None:intergenic
ATTTCATACAATTGTTTGGA+GGG	0.527441	7:-3145719	MsG0780036127.01.T01:CDS
CATGAGGAATGGAACCTGTA+AGG	0.527722	7:+3146146	None:intergenic
TTGTTCCTTGTATAAATCTG+AGG	0.530690	7:+3145680	None:intergenic
GGTGAGATACCTTCTTCGCT+AGG	0.531169	7:-3146355	MsG0780036127.01.T01:CDS
GAGAGATTTGCTAGTGAAGG+AGG	0.533670	7:+3146634	None:intergenic
GAGAGATTTGCTAGTGAAGG+AGG	0.533670	7:+3146706	None:intergenic
GAGAGATTTGCTAGTGAAGG+AGG	0.533670	7:+3146778	None:intergenic
GAGAGATTTGCTAGTGAAGG+AGG	0.533670	7:+3146850	None:intergenic
GAGAGATTTGCTAGTGAAGG+AGG	0.533670	7:+3146922	None:intergenic
GAGAGATTTGCTAGTGAAGG+AGG	0.533670	7:+3147066	None:intergenic
GAGAGATTTGCTAGTGAAGG+AGG	0.533670	7:+3147210	None:intergenic
GAGAGATTTGCTAGTGAAGG+AGG	0.533670	7:+3147354	None:intergenic
GAGAGATTTGCTAGTGAAGG+AGG	0.533670	7:+3147426	None:intergenic
GAGAGATTTGCTAGTGAAGG+AGG	0.533670	7:+3147570	None:intergenic
GTTCCATCCCTCCCGAATTG+TGG	0.533771	7:-3146426	MsG0780036127.01.T01:CDS
TCACAATCATCTTATAGGCC+TGG	0.534963	7:-3147451	MsG0780036127.01.T01:CDS
TTTCCTCCACTTGAATTCCA+CGG	0.535830	7:+3145109	None:intergenic
TTGAGATTTCCTAGCGAAGA+AGG	0.536222	7:+3146346	None:intergenic
GTAAATTGTGGGAAATGTCA+AGG	0.537285	7:+3145930	None:intergenic
TTGGAGAGATTTGCTAGTGA+AGG	0.537496	7:+3146559	None:intergenic
TTGGAGAGATTTGCTAGTGA+AGG	0.537496	7:+3147135	None:intergenic
ACTATTGGATATATAGCTCC+TGG	0.538272	7:-3144894	MsG0780036127.01.T01:intron
CAACCACAATTCGGGAGGGA+TGG	0.540323	7:+3146423	None:intergenic
TGGTGGAACACTTCTGATGT+AGG	0.540405	7:-3147861	MsG0780036127.01.T01:CDS
AATTCAAAGAAGAAGTTGCA+TGG	0.541884	7:-3145509	MsG0780036127.01.T01:CDS
ATATATCAATACATGGAGAA+AGG	0.544341	7:-3145167	MsG0780036127.01.T01:CDS
AAGTTGAGAATTTGAAAACT+CGG	0.545310	7:-3142997	MsG0780036127.01.T01:CDS
GAAAATTATATGAGATGTCA+AGG	0.545379	7:+3146023	None:intergenic
TTGCTAGTGAAGGAGGTACC+AGG	0.546060	7:+3146929	None:intergenic
GATTGGATGAATCATATTGA+AGG	0.546822	7:+3144934	None:intergenic
TTGCTAGTGAAGGAGGTACC+AGG	0.547313	7:+3147433	None:intergenic
TTGCTAGTGAAGGAGGTACC+TGG	0.548665	7:+3147073	None:intergenic
TTGCTAGTGAAGGAGGTACC+TGG	0.548665	7:+3147577	None:intergenic
TCTTGTGTAGGGGCCAAGGT+TGG	0.549634	7:+3145624	None:intergenic
CATTTCATACAATTGTTTGG+AGG	0.550477	7:-3145720	MsG0780036127.01.T01:CDS
ATAGTTGAGAGTAGACAAGT+TGG	0.550516	7:+3147728	None:intergenic
TAAGTAGAAATTCCATCGGT+GGG	0.551160	7:-3145976	MsG0780036127.01.T01:CDS
TTAGAGAGATTTGCTAGTGA+AGG	0.553302	7:+3147279	None:intergenic
ATGTCTTACAATAGATTCAA+AGG	0.555488	7:-3146376	MsG0780036127.01.T01:CDS
GAACCCCAAATCATGAGGAA+TGG	0.556706	7:+3146135	None:intergenic
ATGTCTTACAATAGAATCAC+AGG	0.557817	7:-3146232	MsG0780036127.01.T01:CDS
ATTTCCCACAATTTACTCAT+CGG	0.558199	7:-3145923	MsG0780036127.01.T01:CDS
TTCAAGAACCCCAAATCATG+AGG	0.559326	7:+3146130	None:intergenic
CTGACCGATGAGTAAATTGT+GGG	0.559779	7:+3145919	None:intergenic
GCTGACCGATGAGTAAATTG+TGG	0.559853	7:+3145918	None:intergenic
GTTCCATTCCTCATGATTTG+GGG	0.560301	7:-3146138	MsG0780036127.01.T01:CDS
AATCTGAGGACAATTTGGAA+TGG	0.561265	7:+3145694	None:intergenic
ACCGTGAAATATGAAAATCC+TGG	0.561681	7:-3142968	MsG0780036127.01.T01:CDS
TAAATTGTGGGAAATGTCAA+GGG	0.567258	7:+3145931	None:intergenic
GGAATTCAAGTGGAGGAAAA+GGG	0.568872	7:-3145105	MsG0780036127.01.T01:CDS
GAACCCCAACTCATGAGGAA+TGG	0.571420	7:+3146279	None:intergenic
TTGCTAGTGAAGGAGGTACA+TGG	0.571598	7:+3146641	None:intergenic
TTGCTAGTGAAGGAGGTACA+TGG	0.571598	7:+3146713	None:intergenic
TTGCTAGTGAAGGAGGTACA+TGG	0.571598	7:+3146785	None:intergenic
TTGCTAGTGAAGGAGGTACA+TGG	0.571598	7:+3146857	None:intergenic
TTGCTAGTGAAGGAGGTACA+TGG	0.571598	7:+3147217	None:intergenic
TTGCTAGTGAAGGAGGTACA+TGG	0.571598	7:+3147361	None:intergenic
TAGTTGAGAGTAGACAAGTT+GGG	0.571824	7:+3147729	None:intergenic
GAGAGATTTGCTAGTGAAGG+AGG	0.572520	7:+3146562	None:intergenic
GAGAGATTTGCTAGTGAAGG+AGG	0.572520	7:+3147138	None:intergenic
GTTCCATTCCTCATGAGTTG+GGG	0.575300	7:-3146282	MsG0780036127.01.T01:CDS
ATGCTATAATAAATAGTGGA+TGG	0.575808	7:-3147881	MsG0780036127.01.T01:CDS
AGATCAAGTTGAACGATATG+TGG	0.576260	7:-3143096	MsG0780036127.01.T01:CDS
TTTGACATGAGATATTGCAT+TGG	0.578977	7:-3145392	MsG0780036127.01.T01:CDS
TTCAAGAACCCCAACTCATG+AGG	0.579089	7:+3146274	None:intergenic
TATCTATTGAAGGAGGTACC+TGG	0.579342	7:+3146497	None:intergenic
ATTCAAAGAAGAAGTTGCAT+GGG	0.581365	7:-3145508	MsG0780036127.01.T01:CDS
TTTGTATATGGAATTATGAT+GGG	0.585035	7:-3145454	MsG0780036127.01.T01:CDS
GGCGAGATACCTTCTTCCCT+AGG	0.588927	7:-3146211	MsG0780036127.01.T01:CDS
GTAAATGGAGACAAATTGGA+AGG	0.590025	7:+3145893	None:intergenic
AGGTAATGCTGATAATGTTG+GGG	0.590800	7:-3143119	MsG0780036127.01.T01:CDS
AGCATATGGAAGTGTTTACA+AGG	0.595999	7:-3145363	MsG0780036127.01.T01:CDS
TCACAATTCTCTTGTAGGTG+AGG	0.598671	7:-3146587	MsG0780036127.01.T01:CDS
TCACAATTCTCTTGTAGGTG+AGG	0.598671	7:-3147163	MsG0780036127.01.T01:CDS
CTAAGATTATCTATTGAAGG+AGG	0.611660	7:+3146490	None:intergenic
GAGAGATTTGCTAGTGAAGG+CGG	0.611909	7:+3147282	None:intergenic
AGGACTAGAATAATAAGGAT+CGG	0.612691	7:+3145563	None:intergenic
CTATAATAAATAGTGGATGG+TGG	0.613726	7:-3147878	MsG0780036127.01.T01:CDS
TAGAAGCCGTGGAATTCAAG+TGG	0.614242	7:-3145115	MsG0780036127.01.T01:CDS
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CRISPR-GE

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	CTATCTCACAATAGACTCAA+TGG	-	Chr7:3144743-3144762	MsG0780036127.01.T01:intron	35.0%
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	TCACTCAAAGGAATGCTTAA+TGG	+	Chr7:3146452-3146471	None:intergenic	35.0%
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	TGCACTGAAATTTCACTCAA+AGG	+	Chr7:3146464-3146483	None:intergenic	35.0%
	TTAAGTAGAAATTCCATCGG+TGG	-	Chr7:3144854-3144873	MsG0780036127.01.T01:intron	35.0%
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	TTGTCTCACAATTCTCTTGT+AGG	-	Chr7:3143303-3143322	MsG0780036127.01.T01:intron	35.0%
	TTTAGATTTCCTAGGGAAGA+AGG	+	Chr7:3144632-3144651	None:intergenic	35.0%
!	AGGTAATGCTGATAATGTTG+GGG	-	Chr7:3147712-3147731	MsG0780036127.01.T01:CDS	35.0%
!	ATCTGAGGACAATTTGGAAT+GGG	+	Chr7:3145139-3145158	None:intergenic	35.0%
!	CATAATTCTGCTTCTTTTGC+CGG	-	Chr7:3147950-3147969	MsG0780036127.01.T01:CDS	35.0%
!	GAAGGTAATGCTGATAATGT+TGG	-	Chr7:3147710-3147729	MsG0780036127.01.T01:CDS	35.0%
!	GAGAGATGACCAATTTCTTT+TGG	+	Chr7:3143192-3143211	None:intergenic	35.0%
!	TAACAATTTTCTTGAAGGCC+AGG	-	Chr7:3143236-3143255	MsG0780036127.01.T01:intron	35.0%
!	TTTTGCCGGTAAAGAAATTC+TGG	-	Chr7:3147964-3147983	MsG0780036127.01.T01:CDS	35.0%
!!	AGATCAAGTTGAACGATATG+TGG	-	Chr7:3147735-3147754	MsG0780036127.01.T01:CDS	35.0%
!!	AGCATATGGAAGTGTTTACA+AGG	-	Chr7:3145468-3145487	MsG0780036127.01.T01:CDS	35.0%
!!	CACTTGAAATTTTTCTGGCA+AGG	+	Chr7:3147307-3147326	None:intergenic	35.0%
!!	TGTGTCACAAAGTTTTGTCA+CGG	-	Chr7:3146418-3146437	MsG0780036127.01.T01:CDS	35.0%
!!	TTAGAGAGATTTGCTAGTGA+AGG	+	Chr7:3143267-3143286	None:intergenic	35.0%
!!!	TGTGTATAGTTTTGGTGTAG+TGG	-	Chr7:3146187-3146206	MsG0780036127.01.T01:CDS	35.0%
!!!	TTTTGGAATAGTCCCTTCAA+GGG	+	Chr7:3143175-3143194	None:intergenic	35.0%
	AACATAGTTGGGCCATCTAA+TGG	-	Chr7:3147911-3147930	MsG0780036127.01.T01:CDS	40.0%
	ACCACTTTATGAGACAGAGA+TGG	+	Chr7:3147218-3147237	None:intergenic	40.0%
	ACCATCTCTGTCTCATAAAG+TGG	-	Chr7:3147214-3147233	MsG0780036127.01.T01:CDS	40.0%
	ACTACGTCGTTATTTGGAAG+TGG	+	Chr7:3146317-3146336	None:intergenic	40.0%
	AGGTTCCATTCCTCATGATT+TGG	-	Chr7:3144691-3144710	MsG0780036127.01.T01:intron	40.0%
	CAAATCAAGATGAGTGAGCT+TGG	+	Chr7:3143286-3143305	None:intergenic	40.0%
	CATGAGGAATGGAACCTTTA+AGG	+	Chr7:3144544-3144563	None:intergenic	40.0%
	CGTTTAACCAATTCCAACCT+TGG	-	Chr7:3145194-3145213	MsG0780036127.01.T01:CDS	40.0%
	CTGACCGATGAGTAAATTGT+GGG	+	Chr7:3144915-3144934	None:intergenic	40.0%
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	GGAATTCAAGTGGAGGAAAA+GGG	-	Chr7:3145726-3145745	MsG0780036127.01.T01:CDS	40.0%
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	TAAGCATGCAAATGCAACCA+CGG	+	Chr7:3146363-3146382	None:intergenic	40.0%
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	TCCAGCAACTATAGTTCGAT+TGG	+	Chr7:3145917-3145936	None:intergenic	40.0%
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	TGTGACACACGTTTCATTGT+TGG	+	Chr7:3146407-3146426	None:intergenic	40.0%
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	TTGAGATTTCCTAGCGAAGA+AGG	+	Chr7:3144488-3144507	None:intergenic	40.0%
	TTTCCTCCACTTGAATTCCA+CGG	+	Chr7:3145725-3145744	None:intergenic	40.0%
!	TCCTGTTCTTTTAGCCACTA+TGG	-	Chr7:3147430-3147449	MsG0780036127.01.T01:CDS	40.0%
!	TGCAGAGCTTGCTTATACTA+TGG	-	Chr7:3146145-3146164	MsG0780036127.01.T01:CDS	40.0%
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!!!	CTTTTGGAATAGTCCCTTCA+AGG	+	Chr7:3143176-3143195	None:intergenic	40.0%
	AAGGCAACAACCTTTCCACA+TGG	+	Chr7:3145502-3145521	None:intergenic	45.0%
	AGAGAAAGTTACCCCCTTGA+AGG	-	Chr7:3143159-3143178	MsG0780036127.01.T01:intron	45.0%
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	CATGAGGAATGGAACCTGTA+AGG	+	Chr7:3144688-3144707	None:intergenic	45.0%
	GAACCCCAAATCATGAGGAA+TGG	+	Chr7:3144699-3144718	None:intergenic	45.0%
	GAGAAAGTTACCCCCTTGAA+GGG	-	Chr7:3143160-3143179	MsG0780036127.01.T01:intron	45.0%
	GAGCCAAAACTGTAGCTGAA+CGG	-	Chr7:3147395-3147414	MsG0780036127.01.T01:CDS	45.0%
	GCCATAGTGGCTAAAAGAAC+AGG	+	Chr7:3147434-3147453	None:intergenic	45.0%
	GCTGACCGATGAGTAAATTG+TGG	+	Chr7:3144916-3144935	None:intergenic	45.0%
	GGCACAATTACCATGTGGAA+AGG	-	Chr7:3145489-3145508	MsG0780036127.01.T01:CDS	45.0%
	GGTTCCATTCCTCATGAGTT+GGG	-	Chr7:3144548-3144567	MsG0780036127.01.T01:intron	45.0%
	GTTCCATTCCTCATGAGTTG+GGG	-	Chr7:3144549-3144568	MsG0780036127.01.T01:intron	45.0%
	GTTGCAGAACAGAACTTTCC+AGG	+	Chr7:3147884-3147903	None:intergenic	45.0%
	TAGAAGCCGTGGAATTCAAG+TGG	-	Chr7:3145716-3145735	MsG0780036127.01.T01:CDS	45.0%
	TATTTGGAAGTGGAAGACGC+GGG	+	Chr7:3146307-3146326	None:intergenic	45.0%
	TCACAATTCTCTTGTAGGCC+TGG	-	Chr7:3143308-3143327	MsG0780036127.01.T01:intron	45.0%
	TGGTGGAACACTTCTGATGT+AGG	-	Chr7:3142970-3142989	MsG0780036127.01.T01:CDS	45.0%
	TTAGCAACCACAATTCGGGA+GGG	+	Chr7:3144415-3144434	None:intergenic	45.0%
	TTCAAGAACCCCAACTCATG+AGG	+	Chr7:3144560-3144579	None:intergenic	45.0%
	TTCATTGTTGGTCGAGAACG+AGG	+	Chr7:3146395-3146414	None:intergenic	45.0%
	TTGGAATAGTCCCTTCAAGG+GGG	+	Chr7:3143173-3143192	None:intergenic	45.0%
	TTTAGCAACCACAATTCGGG+AGG	+	Chr7:3144416-3144435	None:intergenic	45.0%
!	GTATGATGATGTAGAAGCCG+TGG	-	Chr7:3145705-3145724	MsG0780036127.01.T01:CDS	45.0%
!	TCACAATCATCTTTTGGGCC+TGG	-	Chr7:3143884-3143903	MsG0780036127.01.T01:intron	45.0%
!	TGATGTGCAGTTTCAAGTGC+AGG	-	Chr7:3147336-3147355	MsG0780036127.01.T01:CDS	45.0%
!	TGCATTGGAACAGGAGCATA+TGG	-	Chr7:3145454-3145473	MsG0780036127.01.T01:CDS	45.0%
!	TGCTGATGGTGCCAATATTC+CGG	-	Chr7:3147454-3147473	MsG0780036127.01.T01:CDS	45.0%
!	TTGCTAGTGAAGGAGGTACA+TGG	+	Chr7:3143473-3143492	None:intergenic	45.0%
!	TTTTTCTTGTGTAGGGGCCA+AGG	+	Chr7:3145214-3145233	None:intergenic	45.0%
!!	GAGAGATTTGCTAGTGAAGG+AGG	+	Chr7:3143264-3143283	None:intergenic	45.0%
!!	GAGAGATTTGCTAGTGAAGG+CGG	+	Chr7:3143264-3143283	None:intergenic	45.0%
	AAGCCGTGGAATTCAAGTGG+AGG	-	Chr7:3145719-3145738	MsG0780036127.01.T01:CDS	50.0%
	AATTGGAAAGAGCCCACCGA+TGG	+	Chr7:3144870-3144889	None:intergenic	50.0%
	ACTTCACGGCTATGAAGCAG+AGG	-	Chr7:3145528-3145547	MsG0780036127.01.T01:CDS	50.0%
	ATCTCGCACAACGACCTTAC+AGG	-	Chr7:3144671-3144690	MsG0780036127.01.T01:CDS	50.0%
	CTTGCTAAACTCTGAGTGGC+AGG	-	Chr7:3145843-3145862	MsG0780036127.01.T01:CDS	50.0%
	GAACCCCAACTCATGAGGAA+TGG	+	Chr7:3144555-3144574	None:intergenic	50.0%
	GAGGTTGTGACTGAAGTCCA+TGG	+	Chr7:3144978-3144997	None:intergenic	50.0%
	GGTGAGATACCTTCTTCGCT+AGG	-	Chr7:3144476-3144495	MsG0780036127.01.T01:intron	50.0%
	TTAGCCACTATGGCTGCTGA+TGG	-	Chr7:3147440-3147459	MsG0780036127.01.T01:CDS	50.0%
	TTGCTAGTGAAGGAGGTTCC+AGG	+	Chr7:3143329-3143348	None:intergenic	50.0%
	TTGCTAGTGAAGGCGGTACA+TGG	+	Chr7:3143545-3143564	None:intergenic	50.0%
!	TGTGCAGTTTCAAGTGCAGG+TGG	-	Chr7:3147339-3147358	MsG0780036127.01.T01:CDS	50.0%
!!	TTGCTAGTGAAGGAGGTACC+AGG	+	Chr7:3143257-3143276	None:intergenic	50.0%
!!	TTGCTAGTGAAGGAGGTACC+TGG	+	Chr7:3143257-3143276	None:intergenic	50.0%
	CAACCACAATTCGGGAGGGA+TGG	+	Chr7:3144411-3144430	None:intergenic	55.0%
	GGCGAGATACCTTCTTCCCT+AGG	-	Chr7:3144620-3144639	MsG0780036127.01.T01:CDS	55.0%
	GTAGGGGCCAAGGTTGGAAT+TGG	+	Chr7:3145204-3145223	None:intergenic	55.0%
	GTTCCATCCCTCCCGAATTG+TGG	-	Chr7:3144405-3144424	MsG0780036127.01.T01:intron	55.0%
	TCTTGTGTAGGGGCCAAGGT+TGG	+	Chr7:3145210-3145229	None:intergenic	55.0%
	GGCACCATCAGCAGCCATAG+TGG	+	Chr7:3147447-3147466	None:intergenic	60.0%

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Chr7	gene	3142859	3147994	3142859	ID=MsG0780036127.01;Name=MsG0780036127.01
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