AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680032306.01

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MsG0680032306.01.T01 AT1G58190 27.249 767 420 18 199 833 1 761 5.95e-55 204
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MsG0680032306.01.T01 AT3G05360 28.378 222 124 5 553 745 109 324 9.54e-11 66.2
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MsG0680032306.01.T01 AT5G49290 25.547 548 288 15 88 597 126 591 3.47e-19 93.2
MsG0680032306.01.T01 AT5G49290 27.586 435 256 20 44 452 209 610 2.62e-12 71.2
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MsG0680032306.01.T01 AT2G33170 29.283 642 366 21 37 644 135 722 3.08e-44 173
MsG0680032306.01.T01 AT2G33170 27.917 480 320 10 288 755 85 550 2.92e-33 139
MsG0680032306.01.T01 AT2G33080 28.816 642 391 19 112 741 102 689 8.62e-53 197
MsG0680032306.01.T01 AT2G33080 27.329 644 306 26 7 544 101 688 7.66e-24 108
MsG0680032306.01.T01 AT2G33080 28.571 399 239 15 352 745 116 473 3.79e-20 96.3
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MsG0680032306.01.T01 AT3G23010 28.697 568 328 19 95 632 5 525 1.10e-29 125
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MsG0680032306.01.T01 AT1G55610 25.796 628 320 20 36 606 176 714 5.65e-30 128
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MsG0680032306.01.T01 AT3G28890 29.487 546 322 20 60 572 94 609 2.87e-24 109
MsG0680032306.01.T01 AT3G28890 32.390 318 177 9 462 750 99 407 5.92e-24 108
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MsG0680032306.01.T01 AT5G65700 30.449 601 317 17 214 779 95 629 4.93e-45 176
MsG0680032306.01.T01 AT5G65700 28.623 552 351 15 16 547 64 592 3.27e-29 125
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MsG0680032306.01.T01 AT4G08850 27.983 461 267 16 2 428 234 663 4.61e-21 99.8
MsG0680032306.01.T01 AT4G08850 29.947 571 335 14 248 764 125 684 1.22e-44 174
MsG0680032306.01.T01 AT4G08850 26.383 705 385 22 30 697 58 665 2.45e-37 151
MsG0680032306.01.T01 AT4G08850 28.200 461 266 16 2 428 234 663 8.91e-21 99.0
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MsG0680032306.01.T01 AT1G08590 27.839 546 355 13 87 607 102 633 4.04e-32 135
MsG0680032306.01.T01 AT1G08590 28.391 553 337 16 2 547 97 597 2.22e-29 126
MsG0680032306.01.T01 AT1G08590 31.629 313 186 5 457 745 76 384 2.59e-29 126
MsG0680032306.01.T01 AT1G08590 28.325 406 240 11 3 406 242 598 6.45e-15 79.7
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MsG0680032306.01.T01 AT5G23400 32.673 303 193 8 439 738 114 408 1.50e-18 90.9
MsG0680032306.01.T01 AT5G23400 39.474 114 67 2 653 765 155 267 8.11e-12 69.3
MsG0680032306.01.T01 AT1G65380 30.492 610 349 19 213 773 74 657 1.43e-37 151
MsG0680032306.01.T01 AT1G65380 28.752 553 350 18 3 546 118 635 1.96e-23 106
MsG0680032306.01.T01 AT1G65380 27.430 463 242 16 1 448 252 635 1.55e-14 78.2
MsG0680032306.01.T01 AT1G65380 28.629 248 144 8 66 306 416 637 2.47e-11 68.2
MsG0680032306.01.T01 AT1G12460 28.868 433 257 10 393 790 96 512 2.05e-37 151
MsG0680032306.01.T01 AT1G12460 31.088 386 223 13 255 607 81 456 7.35e-25 111
MsG0680032306.01.T01 AT1G12460 30.928 291 174 6 465 743 74 349 7.49e-23 105
MsG0680032306.01.T01 AT1G12460 26.077 418 244 14 85 499 114 469 7.30e-15 79.7
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MsG0680032306.01.T01 AT2G25470 27.839 546 309 16 37 547 216 711 7.84e-24 108
MsG0680032306.01.T01 AT2G25470 27.933 537 283 20 251 745 123 597 9.23e-21 98.6
MsG0680032306.01.T01 AT2G25470 29.179 329 155 15 1 325 452 706 2.12e-11 68.2
MsG0680032306.01.T01 AT1G74360 28.463 657 391 21 139 759 86 699 2.48e-37 152
MsG0680032306.01.T01 AT1G74360 31.739 460 269 17 389 824 112 550 2.30e-35 145
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MsG0680032306.01.T01 AT2G24130 33.032 221 124 7 3 218 405 606 8.99e-11 66.2
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MsG0680032306.01.T01 AT5G20480 27.273 528 306 15 133 597 66 578 5.79e-27 118
MsG0680032306.01.T01 AT5G20480 27.799 536 302 15 2 501 117 603 5.58e-24 109
MsG0680032306.01.T01 AT5G51350 27.368 570 314 17 237 767 70 578 3.81e-31 132
MsG0680032306.01.T01 AT5G51350 28.900 391 218 10 363 743 46 386 2.82e-25 113
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MsG0680032306.01.T01 AT1G74200 29.044 272 140 8 399 623 11 276 8.07e-20 91.7
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MsG0680032306.01.T01 AT2G13800 46.591 88 46 1 460 547 96 182 6.32e-12 69.7
MsG0680032306.01.T01 AT2G13800 40.351 114 66 2 483 596 71 182 8.84e-11 65.9
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MsG0680032306.01.T01 AT5G49780 27.119 295 173 8 338 595 90 379 7.53e-11 66.6
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MsG0680032306.01.T01 AT3G25670 29.167 264 153 10 473 718 127 374 5.55e-14 75.9
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MsG0680032306.01.T01 AT1G69990 43.363 113 61 2 656 767 91 201 6.00e-14 76.3
MsG0680032306.01.T01 AT1G29720 26.979 341 194 9 404 700 73 402 8.04e-14 76.3
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MsG0680032306.01.T01 AT4G28380 30.769 221 124 7 535 743 95 298 5.27e-13 72.4
MsG0680032306.01.T01 AT4G28380 29.557 203 115 7 392 592 142 318 1.39e-12 70.9
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MsG0680032306.01.T01 AT4G28380 26.792 265 163 7 479 741 85 320 1.79e-11 67.4
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MsG0680032306.01.T01 AT4G33430 41.584 101 59 0 656 756 94 194 3.43e-13 73.9
MsG0680032306.01.T01 AT4G33430 45.455 88 48 0 460 547 94 181 2.05e-12 71.2
MsG0680032306.01.T01 AT3G50230 41.176 119 68 1 653 771 121 237 1.34e-13 75.1
MsG0680032306.01.T01 AT3G50230 41.176 119 68 1 653 771 133 249 1.38e-13 75.1
MsG0680032306.01.T01 AT3G25560 35.484 124 77 3 484 605 83 205 3.11e-13 73.9
MsG0680032306.01.T01 AT3G03770 28.467 274 139 5 472 744 119 336 3.79e-13 73.9
MsG0680032306.01.T01 AT3G03770 28.467 274 139 5 472 744 119 336 3.79e-13 73.9
MsG0680032306.01.T01 AT3G03770 28.467 274 139 5 472 744 119 336 3.79e-13 73.9
MsG0680032306.01.T01 AT1G10850 36.434 129 79 3 653 780 117 243 4.29e-13 73.6
MsG0680032306.01.T01 AT3G57830 30.808 198 98 4 659 817 97 294 6.16e-13 72.4
MsG0680032306.01.T01 AT3G57830 30.058 173 115 3 431 597 35 207 2.45e-11 67.4
MsG0680032306.01.T01 AT2G26730 36.429 140 65 3 653 771 90 226 6.28e-13 73.2
MsG0680032306.01.T01 AT4G06744 27.602 221 125 5 530 746 118 307 7.11e-13 72.0
MsG0680032306.01.T01 AT3G57830 30.808 198 98 4 659 817 97 294 8.38e-13 72.8
MsG0680032306.01.T01 AT3G57830 30.058 173 115 3 431 597 35 207 3.38e-11 67.4
MsG0680032306.01.T01 AT3G57830 30.808 198 98 4 659 817 97 294 8.38e-13 72.8
MsG0680032306.01.T01 AT3G57830 30.058 173 115 3 431 597 35 207 3.38e-11 67.4
MsG0680032306.01.T01 AT2G42290 29.808 208 102 5 656 819 93 300 9.84e-13 72.4
MsG0680032306.01.T01 AT2G42290 34.591 159 98 4 444 597 49 206 2.17e-12 71.2
MsG0680032306.01.T01 AT5G25550 23.292 322 190 5 433 754 78 342 9.98e-13 71.6
MsG0680032306.01.T01 AT5G25550 26.016 246 163 8 361 598 99 333 1.92e-11 67.8
MsG0680032306.01.T01 AT1G06840 29.858 211 143 5 389 596 84 292 1.09e-12 72.4
MsG0680032306.01.T01 AT2G15300 36.709 158 72 4 463 596 105 258 1.57e-12 72.0
MsG0680032306.01.T01 AT2G15300 35.211 142 86 4 465 605 83 219 5.43e-12 70.1
MsG0680032306.01.T01 AT5G16000 34.959 123 78 2 484 605 83 204 2.88e-12 70.9
MsG0680032306.01.T01 AT5G16000 38.938 113 59 2 656 768 107 209 1.32e-11 68.9
MsG0680032306.01.T01 AT5G16000 47.059 85 45 0 465 549 112 196 3.05e-11 67.4
MsG0680032306.01.T01 AT3G17640 26.710 307 156 11 399 700 77 319 3.05e-12 69.7
MsG0680032306.01.T01 AT1G11130 32.749 171 109 4 379 547 60 226 3.09e-12 70.9
MsG0680032306.01.T01 AT1G11130 38.235 136 75 4 463 596 98 226 4.33e-11 67.4
MsG0680032306.01.T01 AT3G08680 33.696 184 96 5 656 817 94 273 3.40e-12 70.5
MsG0680032306.01.T01 AT3G08680 33.696 184 96 5 656 817 94 273 3.40e-12 70.5
MsG0680032306.01.T01 AT5G49750 26.266 316 211 10 292 593 126 433 3.66e-12 70.1
MsG0680032306.01.T01 AT5G37450 26.866 268 154 7 465 721 84 320 5.07e-12 70.5
MsG0680032306.01.T01 AT4G18760 38.281 128 78 1 463 590 217 343 7.13e-12 68.9
MsG0680032306.01.T01 AT5G20690 41.441 111 64 1 656 765 121 231 8.67e-12 69.3
MsG0680032306.01.T01 AT5G10290 44.248 113 62 1 487 599 75 186 1.08e-11 68.9
MsG0680032306.01.T01 AT5G10290 38.406 138 79 3 651 784 91 226 2.78e-11 67.8
MsG0680032306.01.T01 AT5G10290 44.248 113 62 1 487 599 75 186 1.08e-11 68.9
MsG0680032306.01.T01 AT5G10290 38.406 138 79 3 651 784 91 226 2.78e-11 67.8
MsG0680032306.01.T01 AT2G35620 36.667 120 75 1 477 596 68 186 1.12e-11 68.9
MsG0680032306.01.T01 AT2G35620 36.667 120 75 1 477 596 68 186 1.12e-11 68.9
MsG0680032306.01.T01 AT2G35620 36.667 120 75 1 477 596 68 186 1.12e-11 68.9
MsG0680032306.01.T01 AT2G35620 36.667 120 75 1 477 596 68 186 1.12e-11 68.9
MsG0680032306.01.T01 AT2G02780 30.570 193 109 3 460 631 133 321 1.20e-11 68.9
MsG0680032306.01.T01 AT2G02780 31.674 221 96 4 532 752 133 298 1.73e-11 68.6
MsG0680032306.01.T01 AT2G02780 30.570 193 109 3 460 631 133 321 1.21e-11 68.9
MsG0680032306.01.T01 AT2G02780 31.651 218 94 4 535 752 136 298 1.63e-11 68.6
MsG0680032306.01.T01 AT4G33970 25.532 235 157 5 513 741 141 363 1.21e-11 68.9
MsG0680032306.01.T01 AT1G11130 36.842 133 79 3 416 547 20 148 1.30e-11 68.9
MsG0680032306.01.T01 AT1G11130 38.235 136 75 4 463 596 20 148 3.36e-11 67.4
MsG0680032306.01.T01 AT3G42880 31.746 189 119 4 656 841 116 297 1.35e-11 68.6
MsG0680032306.01.T01 AT3G49750 34.028 144 89 3 599 741 46 184 1.38e-11 64.7
MsG0680032306.01.T01 AT2G02780 30.570 193 109 3 460 631 133 321 1.38e-11 68.9
MsG0680032306.01.T01 AT2G02780 31.651 218 94 4 535 752 136 298 1.63e-11 68.6
MsG0680032306.01.T01 AT2G15880 26.132 287 170 8 458 738 108 358 2.13e-11 68.2
MsG0680032306.01.T01 AT5G63710 37.719 114 69 1 658 771 97 208 2.21e-11 68.2
MsG0680032306.01.T01 AT1G78980 32.948 173 86 5 388 560 92 234 2.40e-11 68.2
MsG0680032306.01.T01 AT1G60800 35.032 157 91 3 441 597 43 188 2.50e-11 67.8
MsG0680032306.01.T01 AT5G63710 37.719 114 69 1 658 771 96 207 2.58e-11 67.8
MsG0680032306.01.T01 AT3G02880 32.768 177 96 4 653 807 89 264 2.64e-11 67.8
MsG0680032306.01.T01 AT5G67200 26.718 262 138 7 617 825 57 317 2.80e-11 67.8
MsG0680032306.01.T01 AT5G63710 37.719 114 69 1 658 771 61 172 2.91e-11 67.4
MsG0680032306.01.T01 AT5G63710 37.719 114 69 1 658 771 61 172 2.91e-11 67.4
MsG0680032306.01.T01 AT1G53730 36.486 148 82 4 61 207 96 232 3.25e-11 67.8
MsG0680032306.01.T01 AT1G53730 36.486 148 82 4 61 207 96 232 3.28e-11 67.8
MsG0680032306.01.T01 AT1G60800 40.541 111 65 1 487 597 12 121 4.28e-11 67.0
MsG0680032306.01.T01 AT5G35390 36.567 134 79 3 653 785 120 248 5.02e-11 67.0
MsG0680032306.01.T01 AT5G53320 36.508 126 77 3 479 604 87 209 7.57e-11 66.2
MsG0680032306.01.T01 AT2G23300 36.207 116 70 2 484 599 125 236 8.25e-11 66.2
MsG0680032306.01.T01 AT1G48480 35.119 168 84 7 656 808 123 280 8.35e-11 66.2
MsG0680032306.01.T01 AT5G05160 36.424 151 63 5 458 601 92 216 9.34e-11 65.9

Find 136 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 170 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
TGAATCAAATCTGCAATTTC+TGG 0.147546 6:+38152902 None:intergenic
TTCTGGTATGTCAGTGTTAA+AGG 0.188313 6:-38153989 MsG0680032306.01.T01:CDS
GCATTTATCCAAAATGATTT+AGG 0.191867 6:+38154306 None:intergenic
CTGACATTCGGATTTATTAT+TGG 0.199085 6:-38152518 MsG0680032306.01.T01:CDS
TCGGATTTATTATTGGCTTT+TGG 0.200739 6:-38152511 MsG0680032306.01.T01:CDS
TGTAGTGTCCTTAGTGTAAT+TGG 0.205693 6:+38154057 None:intergenic
CATTGAGATTTACCCGAAAT+TGG 0.205713 6:-38153939 MsG0680032306.01.T01:CDS
CTCACCACTGAAGCTGTTAT+TGG 0.244097 6:+38154257 None:intergenic
TCTCTCAATATTCTCATCTT+TGG 0.245040 6:-38154139 MsG0680032306.01.T01:CDS
AAAAGGTGGCACCCAATTTC+GGG 0.248196 6:+38153927 None:intergenic
CAGATAAATGATTATTAAAA+AGG 0.255806 6:+38153524 None:intergenic
TAGAAGGTCTCATTCCTTAT+TGG 0.269811 6:-38153291 MsG0680032306.01.T01:CDS
ATAATGTTCCAGAGTGGTTT+TGG 0.275593 6:-38153792 MsG0680032306.01.T01:CDS
TTGGTCTTACATTTCCTAAA+TGG 0.279516 6:-38153870 MsG0680032306.01.T01:CDS
CAATCTTAATCAAGCGTTCT+TGG 0.281168 6:-38152475 MsG0680032306.01.T01:CDS
TTGAGAGAAAATAGTTTAGA+AGG 0.282124 6:-38153307 MsG0680032306.01.T01:CDS
GAAAAGGTGGCACCCAATTT+CGG 0.282376 6:+38153926 None:intergenic
TTGTCACATAATCAATTATA+TGG 0.284789 6:-38152719 MsG0680032306.01.T01:CDS
AATTCACTTCCAATCCAATA+AGG 0.289061 6:+38153277 None:intergenic
ATCCATTGCATCAAACTCTT+TGG 0.311980 6:-38154340 MsG0680032306.01.T01:CDS
ATCAAGGATAGAAAGAGAAT+TGG 0.313186 6:+38154815 None:intergenic
GGGAAAATTCCATCAAATAT+TGG 0.315363 6:-38152842 MsG0680032306.01.T01:CDS
TTACAAAGGAATCACTTCTT+TGG 0.327790 6:-38153232 MsG0680032306.01.T01:CDS
TAACTGTGTGCAGTTCATTA+AGG 0.327849 6:+38153342 None:intergenic
CTCTCAATATTCTCATCTTT+GGG 0.327890 6:-38154138 MsG0680032306.01.T01:CDS
AGACTTAGTTCTCTCAGTTT+TGG 0.328759 6:+38154900 None:intergenic
TCATGCTTAGGTATAATTCT+TGG 0.342867 6:+38154187 None:intergenic
TGTTGTGCATAACCCACATT+TGG 0.343440 6:+38153043 None:intergenic
CTCTCATTTAACAATCTATC+TGG 0.350022 6:-38153160 MsG0680032306.01.T01:CDS
CTGTGCCATAACCATGTGAT+AGG 0.353969 6:+38154688 None:intergenic
CATCGATTTGATTCATGCTT+AGG 0.361675 6:+38154175 None:intergenic
GTTAGCTTTCCAATATTTGA+TGG 0.367837 6:+38152833 None:intergenic
CAAGTTCATGAACAACTTAG+TGG 0.375553 6:-38152438 MsG0680032306.01.T01:CDS
GAAGATAATCTTGATCTTTG+TGG 0.380288 6:-38152647 MsG0680032306.01.T01:CDS
GAGTTAGACCTCAGTTCTAA+TGG 0.390304 6:-38154486 MsG0680032306.01.T01:CDS
AGGGAAGATTCCTACTTCAA+TGG 0.397287 6:-38153431 MsG0680032306.01.T01:CDS
TTGTCACGAAATAAGTTGTT+TGG 0.398345 6:-38152791 MsG0680032306.01.T01:CDS
CCTATATTGTGCAGCTGAAA+AGG 0.404002 6:+38153910 None:intergenic
AATTGCAGATTTGATTCAAT+TGG 0.409494 6:-38152897 MsG0680032306.01.T01:CDS
CTGGACGAATTCCAGATTGT+TGG 0.410063 6:-38153504 MsG0680032306.01.T01:CDS
GATAAACTCTCCAACTGAAA+TGG 0.412235 6:+38154360 None:intergenic
ACCACGGAACCTTGGAGAAA+TGG 0.412367 6:+38153631 None:intergenic
CACAGTGATGAACTCGCTTC+AGG 0.415183 6:-38154670 MsG0680032306.01.T01:CDS
AGAATTGGAAAAGTTGAACT+TGG 0.420661 6:+38154830 None:intergenic
CCTTGGAGAAATGGTGGAAC+AGG 0.420987 6:+38153640 None:intergenic
TTGAAATTACTCCAACAATC+TGG 0.422908 6:+38153493 None:intergenic
AACTTATGTTTGACACCCAT+TGG 0.423863 6:+38154757 None:intergenic
AAGGTCAAGCTCAACAAGAT+TGG 0.427027 6:+38154734 None:intergenic
AATGGTATAAATGCAGTGTT+AGG 0.428292 6:-38153556 MsG0680032306.01.T01:CDS
ATTGAGATTTACCCGAAATT+GGG 0.431125 6:-38153938 MsG0680032306.01.T01:CDS
GGGAAGATTCCTACTTCAAT+GGG 0.431476 6:-38153430 MsG0680032306.01.T01:CDS
CGTCATCTTTGATATTCCAA+TGG 0.432645 6:-38154773 MsG0680032306.01.T01:CDS
TGTGTTCAACAACAATGTAT+TGG 0.441339 6:-38152978 MsG0680032306.01.T01:CDS
GATGAGAATATTGAGAGATC+AGG 0.447677 6:+38154144 None:intergenic
AGTATCTAGCACATCTAGAT+AGG 0.449094 6:+38154214 None:intergenic
CCTCCCCTATCACATGGTTA+TGG 0.453108 6:-38154693 MsG0680032306.01.T01:CDS
GGATTGAGATCATGCAATCT+TGG 0.455152 6:-38153889 MsG0680032306.01.T01:CDS
GTCATCTTTGATATTCCAAT+GGG 0.459119 6:-38154772 MsG0680032306.01.T01:CDS
GGTCTCATTCCTTATTGGAT+TGG 0.462255 6:-38153286 MsG0680032306.01.T01:CDS
GTTGTGCATAACCCACATTT+GGG 0.463283 6:+38153044 None:intergenic
GATCTTGATATTTCGAATGC+TGG 0.464539 6:-38153823 MsG0680032306.01.T01:CDS
AAATTTGAAGAATTGTTTGA+AGG 0.467464 6:+38154541 None:intergenic
TTCGATTTCCAATTACACTA+AGG 0.477353 6:-38154065 MsG0680032306.01.T01:CDS
CATATCAAATAATAAATTGA+AGG 0.477404 6:-38154640 MsG0680032306.01.T01:CDS
TTCCAAAGAGTTTGATGCAA+TGG 0.479075 6:+38154338 None:intergenic
TTATCAAGAAACGACTTCAC+AGG 0.486068 6:-38152863 MsG0680032306.01.T01:CDS
GCTCCAAGTGGTTGTTAGAA+AGG 0.490930 6:+38154715 None:intergenic
CTCAGTTCTAATGGAATCAC+TGG 0.495269 6:-38154477 MsG0680032306.01.T01:CDS
CTTGTAAAGTTGTGTGTTGA+AGG 0.502286 6:-38152617 MsG0680032306.01.T01:CDS
ATGAGTTCAAACTCATTAAG+TGG 0.504497 6:-38154033 MsG0680032306.01.T01:CDS
CTTTGTAGTTGTGTACTCGT+TGG 0.504655 6:+38152689 None:intergenic
TAGTAGCTTGCCATTTCAGT+TGG 0.505630 6:-38154370 MsG0680032306.01.T01:CDS
CACTGAAGCTGTTATTGGAC+AGG 0.512996 6:+38154262 None:intergenic
CAAGTCTATCTCAAATAGAC+TGG 0.518509 6:-38152757 MsG0680032306.01.T01:CDS
GATCAATAACCACGGAACCT+TGG 0.520158 6:+38153623 None:intergenic
TGCATCAAACTCTTTGGAAG+GGG 0.521076 6:-38154334 MsG0680032306.01.T01:CDS
CCTGTTCCACCATTTCTCCA+AGG 0.521311 6:-38153640 MsG0680032306.01.T01:CDS
AAATAATAAATTGAAGGGTG+TGG 0.523569 6:-38154634 MsG0680032306.01.T01:CDS
TGCAGTTCATTAAGGCGAAA+GGG 0.526905 6:+38153350 None:intergenic
CAATTTACGTGAAATGCAGA+TGG 0.527221 6:-38152412 MsG0680032306.01.T01:CDS
TCTATTTGAGATAGACTTGG+AGG 0.531477 6:+38152761 None:intergenic
TGATATGAATGCAGAAAGGT+CGG 0.531976 6:+38154446 None:intergenic
GACGATTTGCTTCTCAATCG+TGG 0.532680 6:-38152554 MsG0680032306.01.T01:CDS
GCAAGTGATCCCATTGAAGT+AGG 0.539027 6:+38153421 None:intergenic
AATAGTTGGTTGCAAATGGT+TGG 0.539432 6:-38154930 None:intergenic
ATCAAATCTGCAATTTCTGG+TGG 0.539434 6:+38152905 None:intergenic
TCGAAATATCAAGATCCTGC+AGG 0.539760 6:+38153830 None:intergenic
CATCAAACTCTTTGGAAGGG+GGG 0.541087 6:-38154332 MsG0680032306.01.T01:CDS
TGACCTTTCTAACAACCACT+TGG 0.541417 6:-38154718 MsG0680032306.01.T01:CDS
TGTAGATAGCAAAGGTCAGT+TGG 0.543360 6:+38153202 None:intergenic
TTTCATCAAATAAATTGGAA+GGG 0.544846 6:-38153663 MsG0680032306.01.T01:CDS
ATTGCATCAAACTCTTTGGA+AGG 0.548058 6:-38154336 MsG0680032306.01.T01:CDS
GTTGAACTTGGATTGACTCA+AGG 0.551390 6:+38154842 None:intergenic
TTGCATCAAACTCTTTGGAA+GGG 0.551437 6:-38154335 MsG0680032306.01.T01:CDS
AAGATTATCTTCGTAACTTG+AGG 0.551517 6:+38152658 None:intergenic
AATGAATAAAATGATCAGAA+AGG 0.552929 6:+38154865 None:intergenic
GACTTCAAGCATTACTGTTG+AGG 0.562449 6:-38153396 MsG0680032306.01.T01:CDS
CATCGCTTTGAGATAATGAC+AGG 0.563987 6:-38153067 MsG0680032306.01.T01:CDS
ATTGTTTGAAATGTTGATGT+CGG 0.567200 6:+38153744 None:intergenic
ACCATTTCTCCAAGGTTCCG+TGG 0.569966 6:-38153632 MsG0680032306.01.T01:CDS
AATTGAATGCATTCTTGACA+TGG 0.572667 6:-38153015 MsG0680032306.01.T01:CDS
CAGTCTATTTGAGATAGACT+TGG 0.573618 6:+38152758 None:intergenic
ACACACAACTTTACAAGTGG+TGG 0.574700 6:+38152623 None:intergenic
AATTTACGTGAAATGCAGAT+GGG 0.575742 6:-38152411 MsG0680032306.01.T01:CDS
AGTTTAGCCCAAAACCACTC+TGG 0.578381 6:+38153784 None:intergenic
ATATCAAATAATAAATTGAA+GGG 0.579013 6:-38154639 MsG0680032306.01.T01:CDS
TCAATGATATGAATGCAGAA+AGG 0.582042 6:+38154442 None:intergenic
CTGTCCAATAACAGCTTCAG+TGG 0.582044 6:-38154261 MsG0680032306.01.T01:CDS
GTGCAGTTCATTAAGGCGAA+AGG 0.582389 6:+38153349 None:intergenic
CTATTTGAGATAGACTTGGA+GGG 0.584593 6:+38152762 None:intergenic
ATTTCAAACAATAATCTCAA+AGG 0.587769 6:-38153733 MsG0680032306.01.T01:CDS
TATCAAGAAACGACTTCACA+GGG 0.588912 6:-38152862 MsG0680032306.01.T01:CDS
AATGCATTCTTGACATGGAA+AGG 0.590497 6:-38153010 MsG0680032306.01.T01:CDS
GATAATGACAGGCCCAAATG+TGG 0.593259 6:-38153056 MsG0680032306.01.T01:CDS
GATATGAATGCAGAAAGGTC+GGG 0.599588 6:+38154447 None:intergenic
GTGCCATAACCATGTGATAG+GGG 0.602537 6:+38154690 None:intergenic
TCAACACACAACTTTACAAG+TGG 0.603126 6:+38152620 None:intergenic
GCATCAAACTCTTTGGAAGG+GGG 0.605490 6:-38154333 MsG0680032306.01.T01:CDS
CTGAGTGGAAAGATTCATGA+AGG 0.605606 6:-38154393 MsG0680032306.01.T01:CDS
TGTGCCATAACCATGTGATA+GGG 0.615494 6:+38154689 None:intergenic
TTGTAAAGTTGTGTGTTGAA+GGG 0.617616 6:-38152616 MsG0680032306.01.T01:CDS
ACGGAACCTTGGAGAAATGG+TGG 0.625552 6:+38153634 None:intergenic
CAGTGATTCCATTAGAACTG+AGG 0.630355 6:+38154478 None:intergenic
CTAAGCATGAATCAAATCGA+TGG 0.630915 6:-38154174 MsG0680032306.01.T01:CDS
ATATTGTGCAGCTGAAAAGG+TGG 0.640072 6:+38153913 None:intergenic
ATAATGACAGGCCCAAATGT+GGG 0.643816 6:-38153055 MsG0680032306.01.T01:CDS
ATTTACGTGAAATGCAGATG+GGG 0.650016 6:-38152410 MsG0680032306.01.T01:CDS
CCATAACCATGTGATAGGGG+AGG 0.657677 6:+38154693 None:intergenic
TTTGGACAGATCAATAACCA+CGG 0.671265 6:+38153615 None:intergenic
CTTTCTGATAATAAGCTGAG+TGG 0.672433 6:-38154408 MsG0680032306.01.T01:CDS
TTGGAGCCTCCCCTATCACA+TGG 0.672579 6:-38154699 MsG0680032306.01.T01:CDS
TTTCAGATAATGTTCCAGAG+TGG 0.683961 6:-38153798 MsG0680032306.01.T01:CDS
TTTACGTGAAATGCAGATGG+GGG 0.697585 6:-38152409 MsG0680032306.01.T01:CDS
GAGGAACAATAGCTTAACAG+AGG 0.704792 6:-38153377 MsG0680032306.01.T01:CDS
GTGATAGGGGAGGCTCCAAG+TGG 0.712006 6:+38154703 None:intergenic
CAAATCAAGAGAGTCAAGTG+AGG 0.722314 6:+38152811 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATATCAAATAATAAATTGAA+GGG - Chr6:38152673-38152692 MsG0680032306.01.T01:CDS 10.0%
!!! AAATTTTTCATCAAATAAAT+TGG - Chr6:38153644-38153663 MsG0680032306.01.T01:CDS 10.0%
!!! ATTTCTAAAAATAGATTAAA+CGG - Chr6:38153207-38153226 MsG0680032306.01.T01:CDS 10.0%
!! CAGATAAATGATTATTAAAA+AGG + Chr6:38153791-38153810 None:intergenic 15.0%
!! CATATCAAATAATAAATTGA+AGG - Chr6:38152672-38152691 MsG0680032306.01.T01:CDS 15.0%
!!! CTTTTTAATAATCATTTATC+TGG - Chr6:38153789-38153808 MsG0680032306.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTTCTAAAAATAGATTAAAC+GGG - Chr6:38153208-38153227 MsG0680032306.01.T01:CDS 15.0%
!! AAATTTGAAGAATTGTTTGA+AGG + Chr6:38152774-38152793 None:intergenic 20.0%
!! AATGAATAAAATGATCAGAA+AGG + Chr6:38152450-38152469 None:intergenic 20.0%
!! ATTTCAAACAATAATCTCAA+AGG - Chr6:38153579-38153598 MsG0680032306.01.T01:CDS 20.0%
!! TTGTCACATAATCAATTATA+TGG - Chr6:38154593-38154612 MsG0680032306.01.T01:CDS 20.0%
!! TTTCATCAAATAAATTGGAA+GGG - Chr6:38153649-38153668 MsG0680032306.01.T01:CDS 20.0%
!!! AGAATCAGAGAATTTATTTT+TGG + Chr6:38153718-38153737 None:intergenic 20.0%
!!! AGTGAAATTTTTAATGCATT+TGG + Chr6:38154186-38154205 None:intergenic 20.0%
!!! ATACCATTTTCACATAAAAA+TGG + Chr6:38153744-38153763 None:intergenic 20.0%
!!! ATTCCATTTTTATGTGAAAA+TGG - Chr6:38153738-38153757 MsG0680032306.01.T01:CDS 20.0%
!!! GTGAAATTTTTAATGCATTT+GGG + Chr6:38154185-38154204 None:intergenic 20.0%
!!! TACAAATTTTAAGCTTACAA+AGG - Chr6:38154066-38154085 MsG0680032306.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTCTAAAAATAGATTAAACG+GGG - Chr6:38153209-38153228 MsG0680032306.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTTCATCAAATAAATTGGA+AGG - Chr6:38153648-38153667 MsG0680032306.01.T01:CDS 20.0%
! AAATAATAAATTGAAGGGTG+TGG - Chr6:38152678-38152697 MsG0680032306.01.T01:CDS 25.0%
! AATTGCAGATTTGATTCAAT+TGG - Chr6:38154415-38154434 MsG0680032306.01.T01:CDS 25.0%
! GCATTTATCCAAAATGATTT+AGG + Chr6:38153009-38153028 None:intergenic 25.0%
! TTGAGAGAAAATAGTTTAGA+AGG - Chr6:38154005-38154024 MsG0680032306.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTCTTCAAATTTTGTCTAG+TGG - Chr6:38152781-38152800 MsG0680032306.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTGTTTGAAATGTTGATGT+CGG + Chr6:38153571-38153590 None:intergenic 25.0%
!! TTTTACATAAGTCTGACATT+CGG - Chr6:38154782-38154801 MsG0680032306.01.T01:CDS 25.0%
!!! AAACAGTTTTAAAGAACGTA+AGG + Chr6:38152731-38152750 None:intergenic 25.0%
AAGATTATCTTCGTAACTTG+AGG + Chr6:38154657-38154676 None:intergenic 30.0%
AATGGTATAAATGCAGTGTT+AGG - Chr6:38153756-38153775 MsG0680032306.01.T01:CDS 30.0%
AATTCACTTCCAATCCAATA+AGG + Chr6:38154038-38154057 None:intergenic 30.0%
AATTGAATGCATTCTTGACA+TGG - Chr6:38154297-38154316 MsG0680032306.01.T01:CDS 30.0%
AATTTACGTGAAATGCAGAT+GGG - Chr6:38154901-38154920 MsG0680032306.01.T01:CDS 30.0%
AGAATTGGAAAAGTTGAACT+TGG + Chr6:38152485-38152504 None:intergenic 30.0%
ATCAAGGATAGAAAGAGAAT+TGG + Chr6:38152500-38152519 None:intergenic 30.0%
ATGAGTTCAAACTCATTAAG+TGG - Chr6:38153279-38153298 MsG0680032306.01.T01:CDS 30.0%
ATTGAGATTTACCCGAAATT+GGG - Chr6:38153374-38153393 MsG0680032306.01.T01:CDS 30.0%
CTCTCAATATTCTCATCTTT+GGG - Chr6:38153174-38153193 MsG0680032306.01.T01:CDS 30.0%
CTCTCATTTAACAATCTATC+TGG - Chr6:38154152-38154171 MsG0680032306.01.T01:CDS 30.0%
CTGACATTCGGATTTATTAT+TGG - Chr6:38154794-38154813 MsG0680032306.01.T01:CDS 30.0%
GAAGATAATCTTGATCTTTG+TGG - Chr6:38154665-38154684 MsG0680032306.01.T01:CDS 30.0%
GGGAAAATTCCATCAAATAT+TGG - Chr6:38154470-38154489 MsG0680032306.01.T01:CDS 30.0%
GTCATCTTTGATATTCCAAT+GGG - Chr6:38152540-38152559 MsG0680032306.01.T01:CDS 30.0%
TCAATGATATGAATGCAGAA+AGG + Chr6:38152873-38152892 None:intergenic 30.0%
TCATGCTTAGGTATAATTCT+TGG + Chr6:38153128-38153147 None:intergenic 30.0%
TCTCTCAATATTCTCATCTT+TGG - Chr6:38153173-38153192 MsG0680032306.01.T01:CDS 30.0%
TGAATCAAATCTGCAATTTC+TGG + Chr6:38154413-38154432 None:intergenic 30.0%
TGTGTTCAACAACAATGTAT+TGG - Chr6:38154334-38154353 MsG0680032306.01.T01:CDS 30.0%
TTACAAAGGAATCACTTCTT+TGG - Chr6:38154080-38154099 MsG0680032306.01.T01:CDS 30.0%
TTCGATTTCCAATTACACTA+AGG - Chr6:38153247-38153266 MsG0680032306.01.T01:CDS 30.0%
TTGAAATTACTCCAACAATC+TGG + Chr6:38153822-38153841 None:intergenic 30.0%
TTGTAAAGTTGTGTGTTGAA+GGG - Chr6:38154696-38154715 MsG0680032306.01.T01:CDS 30.0%
TTGTCACGAAATAAGTTGTT+TGG - Chr6:38154521-38154540 MsG0680032306.01.T01:CDS 30.0%
! GAATGTTTTGTAGATAGCAA+AGG + Chr6:38154121-38154140 None:intergenic 30.0%
! TTTTGTGTCTGAATCCATTT+AGG + Chr6:38153459-38153478 None:intergenic 30.0%
!! GTTAGCTTTCCAATATTTGA+TGG + Chr6:38154482-38154501 None:intergenic 30.0%
!! TTGGTCTTACATTTCCTAAA+TGG - Chr6:38153442-38153461 MsG0680032306.01.T01:CDS 30.0%
!!! CGATTTTTGACTTGAAGATT+TGG + Chr6:38153612-38153631 None:intergenic 30.0%
!!! CGGATTTATTATTGGCTTTT+GGG - Chr6:38154802-38154821 MsG0680032306.01.T01:CDS 30.0%
!!! GGATTTATTATTGGCTTTTG+GGG - Chr6:38154803-38154822 MsG0680032306.01.T01:CDS 30.0%
!!! TCGGATTTATTATTGGCTTT+TGG - Chr6:38154801-38154820 MsG0680032306.01.T01:CDS 30.0%
AACTTATGTTTGACACCCAT+TGG + Chr6:38152558-38152577 None:intergenic 35.0%
AATGCATTCTTGACATGGAA+AGG - Chr6:38154302-38154321 MsG0680032306.01.T01:CDS 35.0%
ACACTGACATACCAGAAAAA+TGG + Chr6:38153320-38153339 None:intergenic 35.0%
ACTCAAAAAGCTTCAACACA+AGG - Chr6:38154212-38154231 MsG0680032306.01.T01:CDS 35.0%
AGTATCTAGCACATCTAGAT+AGG + Chr6:38153101-38153120 None:intergenic 35.0%
ATCCATTGCATCAAACTCTT+TGG - Chr6:38152972-38152991 MsG0680032306.01.T01:CDS 35.0%
ATTGCATCAAACTCTTTGGA+AGG - Chr6:38152976-38152995 MsG0680032306.01.T01:CDS 35.0%
ATTTACGTGAAATGCAGATG+GGG - Chr6:38154902-38154921 MsG0680032306.01.T01:CDS 35.0%
CAAGTCTATCTCAAATAGAC+TGG - Chr6:38154555-38154574 MsG0680032306.01.T01:CDS 35.0%
CAAGTTCATGAACAACTTAG+TGG - Chr6:38154874-38154893 MsG0680032306.01.T01:CDS 35.0%
CAATCTTAATCAAGCGTTCT+TGG - Chr6:38154837-38154856 MsG0680032306.01.T01:CDS 35.0%
CAATTTACGTGAAATGCAGA+TGG - Chr6:38154900-38154919 MsG0680032306.01.T01:CDS 35.0%
CATTGAGATTTACCCGAAAT+TGG - Chr6:38153373-38153392 MsG0680032306.01.T01:CDS 35.0%
CGTCATCTTTGATATTCCAA+TGG - Chr6:38152539-38152558 MsG0680032306.01.T01:CDS 35.0%
CTAAGCATGAATCAAATCGA+TGG - Chr6:38153138-38153157 MsG0680032306.01.T01:CDS 35.0%
CTTGTAAAGTTGTGTGTTGA+AGG - Chr6:38154695-38154714 MsG0680032306.01.T01:CDS 35.0%
CTTTCTGATAATAAGCTGAG+TGG - Chr6:38152904-38152923 MsG0680032306.01.T01:CDS 35.0%
GATAAACTCTCCAACTGAAA+TGG + Chr6:38152955-38152974 None:intergenic 35.0%
GATCTTGATATTTCGAATGC+TGG - Chr6:38153489-38153508 MsG0680032306.01.T01:CDS 35.0%
GATGAGAATATTGAGAGATC+AGG + Chr6:38153171-38153190 None:intergenic 35.0%
TAACTGTGTGCAGTTCATTA+AGG + Chr6:38153973-38153992 None:intergenic 35.0%
TAGAAGGTCTCATTCCTTAT+TGG - Chr6:38154021-38154040 MsG0680032306.01.T01:CDS 35.0%
TATCAAGAAACGACTTCACA+GGG - Chr6:38154450-38154469 MsG0680032306.01.T01:CDS 35.0%
TCAACACACAACTTTACAAG+TGG + Chr6:38154695-38154714 None:intergenic 35.0%
TCTTCCCTGAAAAATTGTTG+TGG + Chr6:38153869-38153888 None:intergenic 35.0%
TGATATGAATGCAGAAAGGT+CGG + Chr6:38152869-38152888 None:intergenic 35.0%
TGTAGTGTCCTTAGTGTAAT+TGG + Chr6:38153258-38153277 None:intergenic 35.0%
TTATCAAGAAACGACTTCAC+AGG - Chr6:38154449-38154468 MsG0680032306.01.T01:CDS 35.0%
TTCCAAAGAGTTTGATGCAA+TGG + Chr6:38152977-38152996 None:intergenic 35.0%
TTCTGGTATGTCAGTGTTAA+AGG - Chr6:38153323-38153342 MsG0680032306.01.T01:CDS 35.0%
TTTCAGATAATGTTCCAGAG+TGG - Chr6:38153514-38153533 MsG0680032306.01.T01:CDS 35.0%
TTTGGACAGATCAATAACCA+CGG + Chr6:38153700-38153719 None:intergenic 35.0%
! ATAATGTTCCAGAGTGGTTT+TGG - Chr6:38153520-38153539 MsG0680032306.01.T01:CDS 35.0%
! ATCAAATCTGCAATTTCTGG+TGG + Chr6:38154410-38154429 None:intergenic 35.0%
! CAGTCTATTTGAGATAGACT+TGG + Chr6:38154557-38154576 None:intergenic 35.0%
! CTATTTGAGATAGACTTGGA+GGG + Chr6:38154553-38154572 None:intergenic 35.0%
! TAATGTTCCAGAGTGGTTTT+GGG - Chr6:38153521-38153540 MsG0680032306.01.T01:CDS 35.0%
! TCTATTTGAGATAGACTTGG+AGG + Chr6:38154554-38154573 None:intergenic 35.0%
! TGAGCCACAACAATTTTTCA+GGG - Chr6:38153862-38153881 MsG0680032306.01.T01:CDS 35.0%
! TTGAGCCACAACAATTTTTC+AGG - Chr6:38153861-38153880 MsG0680032306.01.T01:CDS 35.0%
! TTGCATCAAACTCTTTGGAA+GGG - Chr6:38152977-38152996 MsG0680032306.01.T01:CDS 35.0%
!! AGACTTAGTTCTCTCAGTTT+TGG + Chr6:38152415-38152434 None:intergenic 35.0%
!! ATCTCTGACTTCCATTTTTC+TGG - Chr6:38153306-38153325 MsG0680032306.01.T01:CDS 35.0%
!! CATCGATTTGATTCATGCTT+AGG + Chr6:38153140-38153159 None:intergenic 35.0%
!! TCGTTTTGAACTTCTGCTTT+TGG + Chr6:38154737-38154756 None:intergenic 35.0%
!!! AGTTGTTTTGAGAGAGATCA+AGG + Chr6:38152516-38152535 None:intergenic 35.0%
AAGGTCAAGCTCAACAAGAT+TGG + Chr6:38152581-38152600 None:intergenic 40.0%
ACACACAACTTTACAAGTGG+TGG + Chr6:38154692-38154711 None:intergenic 40.0%
AGGGAAGATTCCTACTTCAA+TGG - Chr6:38153881-38153900 MsG0680032306.01.T01:CDS 40.0%
ATAATGACAGGCCCAAATGT+GGG - Chr6:38154257-38154276 MsG0680032306.01.T01:CDS 40.0%
ATATTGTGCAGCTGAAAAGG+TGG + Chr6:38153402-38153421 None:intergenic 40.0%
CAAATCAAGAGAGTCAAGTG+AGG + Chr6:38154504-38154523 None:intergenic 40.0%
CAGTGATTCCATTAGAACTG+AGG + Chr6:38152837-38152856 None:intergenic 40.0%
CCTATATTGTGCAGCTGAAA+AGG + Chr6:38153405-38153424 None:intergenic 40.0%
CTGAGTGGAAAGATTCATGA+AGG - Chr6:38152919-38152938 MsG0680032306.01.T01:CDS 40.0%
CTTTGTAGTTGTGTACTCGT+TGG + Chr6:38154626-38154645 None:intergenic 40.0%
GACTTCAAGCATTACTGTTG+AGG - Chr6:38153916-38153935 MsG0680032306.01.T01:CDS 40.0%
GAGGAACAATAGCTTAACAG+AGG - Chr6:38153935-38153954 MsG0680032306.01.T01:CDS 40.0%
GATATGAATGCAGAAAGGTC+GGG + Chr6:38152868-38152887 None:intergenic 40.0%
GGATTGAGATCATGCAATCT+TGG - Chr6:38153423-38153442 MsG0680032306.01.T01:CDS 40.0%
GGGAAGATTCCTACTTCAAT+GGG - Chr6:38153882-38153901 MsG0680032306.01.T01:CDS 40.0%
GGTCTCATTCCTTATTGGAT+TGG - Chr6:38154026-38154045 MsG0680032306.01.T01:CDS 40.0%
GTTGTGCATAACCCACATTT+GGG + Chr6:38154271-38154290 None:intergenic 40.0%
TCAGACACAAAAATACCTGC+AGG - Chr6:38153467-38153486 MsG0680032306.01.T01:CDS 40.0%
TCGAAATATCAAGATCCTGC+AGG + Chr6:38153485-38153504 None:intergenic 40.0%
TGACCTTTCTAACAACCACT+TGG - Chr6:38152594-38152613 MsG0680032306.01.T01:CDS 40.0%
TGCAGTTCATTAAGGCGAAA+GGG + Chr6:38153965-38153984 None:intergenic 40.0%
TGTAGATAGCAAAGGTCAGT+TGG + Chr6:38154113-38154132 None:intergenic 40.0%
TGTGCCATAACCATGTGATA+GGG + Chr6:38152626-38152645 None:intergenic 40.0%
TGTTGTGCATAACCCACATT+TGG + Chr6:38154272-38154291 None:intergenic 40.0%
TTTACGTGAAATGCAGATGG+GGG - Chr6:38154903-38154922 MsG0680032306.01.T01:CDS 40.0%
! CCTTTTCAGCTGCACAATAT+AGG - Chr6:38153402-38153421 MsG0680032306.01.T01:CDS 40.0%
! CTCAGTTCTAATGGAATCAC+TGG - Chr6:38152835-38152854 MsG0680032306.01.T01:CDS 40.0%
! GAGTTAGACCTCAGTTCTAA+TGG - Chr6:38152826-38152845 MsG0680032306.01.T01:CDS 40.0%
! GGGGGATTCCTAAATCATTT+TGG - Chr6:38152998-38153017 MsG0680032306.01.T01:CDS 40.0%
! GTTGAACTTGGATTGACTCA+AGG + Chr6:38152473-38152492 None:intergenic 40.0%
! TAGTAGCTTGCCATTTCAGT+TGG - Chr6:38152942-38152961 MsG0680032306.01.T01:CDS 40.0%
! TGCATCAAACTCTTTGGAAG+GGG - Chr6:38152978-38152997 MsG0680032306.01.T01:CDS 40.0%
!! CATCGCTTTGAGATAATGAC+AGG - Chr6:38154245-38154264 MsG0680032306.01.T01:CDS 40.0%
!!! ATTGGCTTTTGGGGAGTATT+TGG - Chr6:38154812-38154831 MsG0680032306.01.T01:CDS 40.0%
AAAAGGTGGCACCCAATTTC+GGG + Chr6:38153388-38153407 None:intergenic 45.0%
AGTTTAGCCCAAAACCACTC+TGG + Chr6:38153531-38153550 None:intergenic 45.0%
CACTGAAGCTGTTATTGGAC+AGG + Chr6:38153053-38153072 None:intergenic 45.0%
CTCACCACTGAAGCTGTTAT+TGG + Chr6:38153058-38153077 None:intergenic 45.0%
CTGGACGAATTCCAGATTGT+TGG - Chr6:38153808-38153827 MsG0680032306.01.T01:CDS 45.0%
CTGTCCAATAACAGCTTCAG+TGG - Chr6:38153051-38153070 MsG0680032306.01.T01:CDS 45.0%
CTGTGCCATAACCATGTGAT+AGG + Chr6:38152627-38152646 None:intergenic 45.0%
GAAAAGGTGGCACCCAATTT+CGG + Chr6:38153389-38153408 None:intergenic 45.0%
GATAATGACAGGCCCAAATG+TGG - Chr6:38154256-38154275 MsG0680032306.01.T01:CDS 45.0%
GATCAATAACCACGGAACCT+TGG + Chr6:38153692-38153711 None:intergenic 45.0%
GCAAGTGATCCCATTGAAGT+AGG + Chr6:38153894-38153913 None:intergenic 45.0%
GCTCCAAGTGGTTGTTAGAA+AGG + Chr6:38152600-38152619 None:intergenic 45.0%
GTGCAGTTCATTAAGGCGAA+AGG + Chr6:38153966-38153985 None:intergenic 45.0%
GTGCCATAACCATGTGATAG+GGG + Chr6:38152625-38152644 None:intergenic 45.0%
! CATCAAACTCTTTGGAAGGG+GGG - Chr6:38152980-38152999 MsG0680032306.01.T01:CDS 45.0%
! GACGATTTGCTTCTCAATCG+TGG - Chr6:38154758-38154777 MsG0680032306.01.T01:CDS 45.0%
! GCATCAAACTCTTTGGAAGG+GGG - Chr6:38152979-38152998 MsG0680032306.01.T01:CDS 45.0%
!!! TCTGCTTTTGGTTCATGTGC+TGG + Chr6:38154725-38154744 None:intergenic 45.0%
AAATGCAGATGGGGGCTCAA+CGG - Chr6:38154911-38154930 MsG0680032306.01.T01:CDS 50.0%
ACCACGGAACCTTGGAGAAA+TGG + Chr6:38153684-38153703 None:intergenic 50.0%
ACCATTTCTCCAAGGTTCCG+TGG - Chr6:38153680-38153699 MsG0680032306.01.T01:CDS 50.0%
ACGGAACCTTGGAGAAATGG+TGG + Chr6:38153681-38153700 None:intergenic 50.0%
CACAGTGATGAACTCGCTTC+AGG - Chr6:38152642-38152661 MsG0680032306.01.T01:CDS 50.0%
CCATAACCATGTGATAGGGG+AGG + Chr6:38152622-38152641 None:intergenic 50.0%
CCTCCCCTATCACATGGTTA+TGG - Chr6:38152619-38152638 MsG0680032306.01.T01:CDS 50.0%
CCTGTTCCACCATTTCTCCA+AGG - Chr6:38153672-38153691 MsG0680032306.01.T01:CDS 50.0%
! CCTTGGAGAAATGGTGGAAC+AGG + Chr6:38153675-38153694 None:intergenic 50.0%
TTGGAGCCTCCCCTATCACA+TGG - Chr6:38152613-38152632 MsG0680032306.01.T01:CDS 55.0%
GTGATAGGGGAGGCTCCAAG+TGG + Chr6:38152612-38152631 None:intergenic 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr6 gene 38152397 38154937 38152397 ID=MsG0680032306.01;Name=MsG0680032306.01
Chr6 mRNA 38152397 38154937 38152397 ID=MsG0680032306.01.T01;Parent=MsG0680032306.01;Name=MsG0680032306.01.T01;_AED=0.48;_eAED=0.48;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|846
Chr6 exon 38152397 38154937 38152397 ID=MsG0680032306.01.T01:exon:20867;Parent=MsG0680032306.01.T01
Chr6 CDS 38152397 38154937 38152397 ID=MsG0680032306.01.T01:cds;Parent=MsG0680032306.01.T01
Gene Sequence

>MsG0680032306.01.T01

ATGGTTGGTAAGTTACCAAAACTGAGAGAACTAAGTCTAAGTAATTGTAACCTTTCTGATCATTTTATTCATTCCTTGAGTCAATCCAAGTTCAACTTTTCCAATTCTCTTTCTATCCTTGATCTCTCTCAAAACAACTTTGCGTCATCTTTGATATTCCAATGGGTGTCAAACATAAGTTCCAATCTTGTTGAGCTTGACCTTTCTAACAACCACTTGGAGCCTCCCCTATCACATGGTTATGGCACAGTGATGAACTCGCTTCAGGTACTTGACATATCAAATAATAAATTGAAGGGTGTGGCATTTAAATCTTTCATGAATTTATGTGCCTTACGTTCTTTAAAACTGTTTCGAAACAATTTCACAGAAGACCTTCAAACAATTCTTCAAATTTTGTCTAGTGGTTGTGTTAGAAACTCACTTCAAGAGTTAGACCTCAGTTCTAATGGAATCACTGGAACACTACCCGACCTTTCTGCATTCATATCATTGAAAACATTGTATCTTTCTGATAATAAGCTGAGTGGAAAGATTCATGAAGGTAGTAGCTTGCCATTTCAGTTGGAGAGTTTATCCATTGCATCAAACTCTTTGGAAGGGGGGATTCCTAAATCATTTTGGATAAATGCATGTAAGTTGAAATCATTGTACCTGTCCAATAACAGCTTCAGTGGTGAGCTTCAAGTATTAATTAATCACCTATCTAGATGTGCTAGATACTCACTCCAAGAATTATACCTAAGCATGAATCAAATCGATGGCACACTACCTGATCTCTCAATATTCTCATCTTTGGGAATATTCGATATTTCTAAAAATAGATTAAACGGGGAGATATTTGATGATATTCGATTTCCAATTACACTAAGGACACTACAAATGAGTTCAAACTCATTAAGTGGTGTGATCTCTGACTTCCATTTTTCTGGTATGTCAGTGTTAAAGGAATTAGACTTGTCTGACAATTCACTAGCATTGAGATTTACCCGAAATTGGGTGCCACCTTTTCAGCTGCACAATATAGGATTGAGATCATGCAATCTTGGTCTTACATTTCCTAAATGGATTCAGACACAAAAATACCTGCAGGATCTTGATATTTCGAATGCTGGAATTTCAGATAATGTTCCAGAGTGGTTTTGGGCTAAACTATCATCACAACAGTGCACCGACATCAACATTTCAAACAATAATCTCAAAGGATCAATTCCAAATCTTCAAGTCAAAAATCGTTGTTCTTATTTAAATTTTTCATCAAATAAATTGGAAGGGCCTGTTCCACCATTTCTCCAAGGTTCCGTGGTTATTGATCTGTCCAAAAATAAATTCTCTGATTCTATTCCATTTTTATGTGAAAATGGTATAAATGCAGTGTTAGGTCAATTTGACCTTTTTAATAATCATTTATCTGGACGAATTCCAGATTGTTGGAGTAATTTCAAGTCATTAGTTTATCTAGATTTGAGCCACAACAATTTTTCAGGGAAGATTCCTACTTCAATGGGATCACTTGCAAGACTTCAAGCATTACTGTTGAGGAACAATAGCTTAACAGAGGAGATCCCTTTCGCCTTAATGAACTGCACACAGTTAGTAATGCTTGATTTGAGAGAAAATAGTTTAGAAGGTCTCATTCCTTATTGGATTGGAAGTGAATTAAAAGATCTACAAATTTTAAGCTTACAAAGGAATCACTTCTTTGGAAGTTTACCAACTGACCTTTGCTATCTACAAAACATTCAACTTTTTGATCTCTCATTTAACAATCTATCTGGACGAATTCCCAAATGCATTAAAAATTTCACTTTAATGACTCAAAAAGCTTCAACACAAGGTTTTACAGATCATCGCTTTGAGATAATGACAGGCCCAAATGTGGGTTATGCACAACAATATGAATTGAATGCATTCTTGACATGGAAAGGTGTAGAACATGTGTTCAACAACAATGTATTGGTTCTTCTAAAAGTCATAGATCTCTCAAGCAATCATTTTTCAGAAGAGATTCCACCAGAAATTGCAGATTTGATTCAATTGGTCTCATTGAATTTATCAAGAAACGACTTCACAGGGAAAATTCCATCAAATATTGGAAAGCTAACCTCACTTGACTCTCTTGATTTGTCACGAAATAAGTTGTTTGGTTCAATCCCTCCAAGTCTATCTCAAATAGACTGGCTTAGTGTGTTAGATTTGTCACATAATCAATTATATGGAGAGATTCCAACGAGTACACAACTACAAAGTTTCAATGCCTCAAGTTACGAAGATAATCTTGATCTTTGTGGACCACCACTTGTAAAGTTGTGTGTTGAAGGGAAACCAGCACATGAACCAAAAGCAGAAGTTCAAAACGATGACGATTTGCTTCTCAATCGTGGATTTTACATAAGTCTGACATTCGGATTTATTATTGGCTTTTGGGGAGTATTTGGCTCAATCTTAATCAAGCGTTCTTGGAGACATGTTTATTTCAAGTTCATGAACAACTTAGTGGATACAATTTACGTGAAATGCAGATGGGGGCTCAACGGTTAA
Protein sequence

>MsG0680032306.01.T01

MVGKLPKLRELSLSNCNLSDHFIHSLSQSKFNFSNSLSILDLSQNNFASSLIFQWVSNISSNLVELDLSNNHLEPPLSHGYGTVMNSLQVLDISNNKLKGVAFKSFMNLCALRSLKLFRNNFTEDLQTILQILSSGCVRNSLQELDLSSNGITGTLPDLSAFISLKTLYLSDNKLSGKIHEGSSLPFQLESLSIASNSLEGGIPKSFWINACKLKSLYLSNNSFSGELQVLINHLSRCARYSLQELYLSMNQIDGTLPDLSIFSSLGIFDISKNRLNGEIFDDIRFPITLRTLQMSSNSLSGVISDFHFSGMSVLKELDLSDNSLALRFTRNWVPPFQLHNIGLRSCNLGLTFPKWIQTQKYLQDLDISNAGISDNVPEWFWAKLSSQQCTDINISNNNLKGSIPNLQVKNRCSYLNFSSNKLEGPVPPFLQGSVVIDLSKNKFSDSIPFLCENGINAVLGQFDLFNNHLSGRIPDCWSNFKSLVYLDLSHNNFSGKIPTSMGSLARLQALLLRNNSLTEEIPFALMNCTQLVMLDLRENSLEGLIPYWIGSELKDLQILSLQRNHFFGSLPTDLCYLQNIQLFDLSFNNLSGRIPKCIKNFTLMTQKASTQGFTDHRFEIMTGPNVGYAQQYELNAFLTWKGVEHVFNNNVLVLLKVIDLSSNHFSEEIPPEIADLIQLVSLNLSRNDFTGKIPSNIGKLTSLDSLDLSRNKLFGSIPPSLSQIDWLSVLDLSHNQLYGEIPTSTQLQSFNASSYEDNLDLCGPPLVKLCVEGKPAHEPKAEVQNDDDLLLNRGFYISLTFGFIIGFWGVFGSILIKRSWRHVYFKFMNNLVDTIYVKCRWGLNG*