AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0680035061.01

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MsG0680035061.01.T01 AT5G16640 36.111 144 92 0 1 144 357 500 1.25e-23 100
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MsG0680035061.01.T01 AT1G06710 28.261 184 116 1 1 168 479 662 1.63e-21 94.7
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MsG0680035061.01.T01 AT1G06710 25.630 238 132 3 1 195 298 533 1.83e-19 88.6
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MsG0680035061.01.T01 AT1G06710 27.861 201 110 4 3 168 777 977 7.35e-17 80.9
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MsG0680035061.01.T01 AT1G06580 29.918 244 154 3 3 230 182 424 2.48e-29 116
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MsG0680035061.01.T01 AT2G06000 32.609 184 121 3 4 185 205 387 9.05e-27 109
MsG0680035061.01.T01 AT2G06000 31.481 162 111 0 3 164 345 506 3.41e-25 104
MsG0680035061.01.T01 AT2G06000 32.335 167 112 1 3 168 239 405 2.01e-21 94.0
MsG0680035061.01.T01 AT2G06000 29.114 158 110 1 7 164 105 260 1.04e-11 65.1
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MsG0680035061.01.T01 AT2G31400 32.927 164 110 0 4 167 443 606 1.86e-27 112
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MsG0680035061.01.T01 AT2G31400 33.714 175 114 2 3 176 301 474 8.03e-24 101
MsG0680035061.01.T01 AT2G31400 25.604 207 147 3 4 204 373 578 2.62e-18 85.1
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MsG0680035061.01.T01 AT4G19440 31.351 185 124 1 1 182 514 698 5.19e-25 104
MsG0680035061.01.T01 AT4G19440 29.885 174 121 1 3 176 271 443 3.49e-24 102
MsG0680035061.01.T01 AT4G19440 29.461 241 124 4 3 205 376 608 4.77e-24 102
MsG0680035061.01.T01 AT4G19440 33.537 164 109 0 3 166 656 819 6.16e-24 101
MsG0680035061.01.T01 AT4G19440 30.682 176 121 1 1 176 619 793 8.24e-23 98.2
MsG0680035061.01.T01 AT4G19440 31.667 180 122 1 1 180 304 482 1.07e-22 98.2
MsG0680035061.01.T01 AT4G19440 30.588 170 117 1 3 172 586 754 4.03e-18 84.7
MsG0680035061.01.T01 AT4G19440 29.814 161 113 0 7 167 450 610 1.05e-17 83.2
MsG0680035061.01.T01 AT4G19440 24.519 208 151 4 1 205 235 439 1.16e-17 83.2
MsG0680035061.01.T01 AT4G19440 33.143 175 116 1 2 176 550 723 8.23e-26 107
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MsG0680035061.01.T01 AT4G19440 29.885 174 121 1 3 176 271 443 3.49e-24 102
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MsG0680035061.01.T01 AT5G61400 26.190 168 123 1 1 168 475 641 1.47e-11 65.1
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MsG0680035061.01.T01 AT1G30290 33.939 165 107 2 2 164 344 508 5.79e-25 104
MsG0680035061.01.T01 AT1G30290 23.438 192 147 0 3 194 452 643 1.16e-21 95.1
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MsG0680035061.01.T01 AT1G30290 28.902 173 122 1 3 175 522 693 2.31e-19 88.2
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MsG0680035061.01.T01 AT5G65820 24.402 209 117 6 4 173 356 562 6.53e-13 68.9
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MsG0680035061.01.T01 AT3G49730 26.389 216 157 2 3 217 304 518 4.18e-20 90.1
MsG0680035061.01.T01 AT3G49730 30.588 170 111 4 10 176 136 301 3.97e-18 84.3
MsG0680035061.01.T01 AT1G13040 29.480 173 121 1 4 176 324 495 4.89e-23 98.6
MsG0680035061.01.T01 AT1G13040 32.468 154 104 0 1 154 356 509 3.87e-19 87.4
MsG0680035061.01.T01 AT1G13040 27.711 166 118 2 4 168 289 453 2.63e-18 84.7
MsG0680035061.01.T01 AT1G13040 23.864 264 128 4 1 193 77 338 1.22e-17 82.8
MsG0680035061.01.T01 AT1G13040 27.500 240 157 5 4 227 219 457 1.67e-17 82.4
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MsG0680035061.01.T01 AT1G79490 28.723 188 129 2 3 190 346 528 4.43e-17 81.6
MsG0680035061.01.T01 AT1G79490 28.934 197 138 2 4 200 277 471 1.28e-16 80.1
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MsG0680035061.01.T01 AT3G14580 24.044 183 137 2 3 184 165 346 9.40e-17 79.7
MsG0680035061.01.T01 AT3G14580 26.250 160 118 0 3 162 235 394 1.97e-15 75.9
MsG0680035061.01.T01 AT3G14580 25.786 159 117 1 18 176 145 302 2.97e-12 66.6
MsG0680035061.01.T01 AT4G30825 29.167 168 119 0 2 169 730 897 1.83e-17 82.8
MsG0680035061.01.T01 AT1G11900 28.777 139 98 1 3 140 210 348 1.84e-17 81.6
MsG0680035061.01.T01 AT1G11900 24.272 206 152 4 26 228 163 367 5.27e-13 68.6
MsG0680035061.01.T01 AT1G11900 26.380 163 119 1 6 167 178 340 7.80e-11 62.4
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MsG0680035061.01.T01 AT5G62370 29.412 153 107 1 4 155 271 423 2.51e-16 79.3
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MsG0680035061.01.T01 AT5G27270 28.834 163 116 0 4 166 568 730 1.16e-16 80.1
MsG0680035061.01.T01 AT5G27270 24.699 166 125 0 3 168 16 181 1.46e-12 68.2
MsG0680035061.01.T01 AT5G27270 28.834 163 116 0 4 166 773 935 1.34e-16 80.1
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MsG0680035061.01.T01 AT3G53170 27.215 158 112 2 4 159 249 405 9.57e-13 68.2
MsG0680035061.01.T01 AT3G53170 28.571 161 112 3 3 161 142 301 3.73e-12 66.6
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MsG0680035061.01.T01 AT2G42920 25.000 200 107 3 4 168 191 382 5.05e-15 75.1
MsG0680035061.01.T01 AT5G39980 27.160 162 112 2 2 160 152 310 5.93e-15 75.1
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MsG0680035061.01.T01 AT5G39980 25.153 163 118 1 3 165 363 521 4.59e-14 72.4
MsG0680035061.01.T01 AT5G39980 23.026 152 117 0 1 152 186 337 2.09e-11 64.3
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MsG0680035061.01.T01 AT1G10910 28.834 163 115 1 3 164 199 361 1.76e-14 73.6
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MsG0680035061.01.T01 AT4G16390 27.381 168 121 1 4 170 279 446 1.39e-14 73.9
MsG0680035061.01.T01 AT4G16390 24.000 150 114 0 3 152 243 392 7.16e-13 68.9
MsG0680035061.01.T01 AT2G27800 28.000 175 117 2 3 168 243 417 1.45e-14 73.6
MsG0680035061.01.T01 AT2G27800 29.752 121 84 1 3 123 322 441 3.81e-12 66.2
MsG0680035061.01.T01 AT2G27800 26.923 156 108 3 3 155 286 438 9.19e-12 65.5
MsG0680035061.01.T01 AT1G10910 24.837 153 115 0 1 153 303 455 1.47e-14 73.9
MsG0680035061.01.T01 AT1G10910 28.834 163 115 1 3 164 199 361 2.16e-14 73.2
MsG0680035061.01.T01 AT1G10910 27.329 161 117 0 4 164 236 396 3.48e-11 63.9
MsG0680035061.01.T01 AT1G16830 25.000 160 120 0 3 162 210 369 1.72e-14 73.6
MsG0680035061.01.T01 AT1G16830 26.291 213 116 5 1 177 348 555 2.59e-12 67.0
MsG0680035061.01.T01 AT1G16830 24.390 164 121 1 3 166 280 440 9.00e-12 65.5
MsG0680035061.01.T01 AT1G16830 22.807 171 125 2 1 168 139 305 6.82e-11 62.8
MsG0680035061.01.T01 AT5G46580 24.528 212 123 4 1 176 252 462 2.58e-14 73.2
MsG0680035061.01.T01 AT1G80150 25.346 217 125 2 4 185 176 390 2.96e-14 72.4
MsG0680035061.01.T01 AT4G34830 27.703 148 105 1 7 152 539 686 3.61e-14 72.8
MsG0680035061.01.T01 AT4G34830 24.457 184 135 2 3 182 465 648 2.01e-13 70.9
MsG0680035061.01.T01 AT1G30610 25.967 181 118 2 3 168 541 720 4.02e-14 72.8
MsG0680035061.01.T01 AT1G30610 25.668 187 125 3 2 176 659 843 3.48e-13 70.1
MsG0680035061.01.T01 AT3G56030 25.301 166 121 1 7 169 127 292 4.30e-14 71.6
MsG0680035061.01.T01 AT1G73710 28.571 133 95 0 5 137 305 437 4.68e-14 72.4
MsG0680035061.01.T01 AT1G73710 28.846 156 111 0 4 159 514 669 1.53e-13 70.9
MsG0680035061.01.T01 AT1G73710 28.462 130 93 0 39 168 514 643 6.03e-13 69.3
MsG0680035061.01.T01 AT5G03560 24.444 135 101 1 11 144 203 337 4.71e-14 71.6
MsG0680035061.01.T01 AT5G03560 29.545 132 91 2 46 176 203 333 1.42e-12 67.4
MsG0680035061.01.T01 AT5G03560 24.444 135 101 1 11 144 203 337 4.71e-14 71.6
MsG0680035061.01.T01 AT5G03560 29.545 132 91 2 46 176 203 333 1.42e-12 67.4
MsG0680035061.01.T01 AT5G03560 24.444 135 101 1 11 144 203 337 4.71e-14 71.6
MsG0680035061.01.T01 AT5G03560 29.545 132 91 2 46 176 203 333 1.42e-12 67.4
MsG0680035061.01.T01 AT5G13770 26.136 176 129 1 5 180 423 597 6.80e-14 72.0
MsG0680035061.01.T01 AT5G48730 30.061 163 111 2 3 163 254 415 7.12e-14 71.6
MsG0680035061.01.T01 AT1G30610 26.590 173 111 2 3 160 541 712 8.11e-14 72.0
MsG0680035061.01.T01 AT1G26500 25.455 220 156 5 3 219 213 427 1.32e-13 70.9
MsG0680035061.01.T01 AT4G14050 25.368 272 166 9 9 274 224 464 1.83e-13 70.5
MsG0680035061.01.T01 AT4G14050 25.368 272 166 9 9 274 277 517 2.02e-13 70.5
MsG0680035061.01.T01 AT5G67570 27.160 162 115 3 3 162 339 499 3.04e-13 70.1
MsG0680035061.01.T01 AT4G36680 26.506 166 117 3 4 166 136 299 3.22e-13 69.7
MsG0680035061.01.T01 AT4G36680 24.675 154 111 2 1 152 170 320 2.28e-12 67.0
MsG0680035061.01.T01 AT3G46610 25.316 158 118 0 3 160 456 613 3.99e-13 69.7
MsG0680035061.01.T01 AT3G46610 25.316 158 118 0 3 160 456 613 3.99e-13 69.7
MsG0680035061.01.T01 AT1G11290 26.708 161 114 2 6 166 404 560 7.84e-13 68.9
MsG0680035061.01.T01 AT1G10270 23.494 166 125 2 3 166 178 343 8.80e-13 68.6
MsG0680035061.01.T01 AT1G10270 26.190 168 119 1 3 165 250 417 2.14e-12 67.4
MsG0680035061.01.T01 AT1G10270 23.952 167 127 0 2 168 433 599 1.01e-11 65.5
MsG0680035061.01.T01 AT3G53170 25.414 181 126 2 2 174 283 462 1.07e-12 68.2
MsG0680035061.01.T01 AT3G53170 28.571 161 112 3 3 161 142 301 3.05e-12 66.6
MsG0680035061.01.T01 AT5G15280 22.424 165 128 0 3 167 321 485 1.11e-12 68.6
MsG0680035061.01.T01 AT2G35130 26.966 178 126 4 3 178 223 398 1.41e-12 67.8
MsG0680035061.01.T01 AT2G35130 23.899 159 120 1 2 159 187 345 1.92e-12 67.4
MsG0680035061.01.T01 AT2G35130 23.864 176 133 1 3 178 364 538 4.09e-12 66.6
MsG0680035061.01.T01 AT2G35130 21.143 175 137 1 3 177 259 432 8.47e-12 65.5
MsG0680035061.01.T01 AT2G35130 22.396 192 114 2 3 159 294 485 2.86e-11 63.9
MsG0680035061.01.T01 AT5G27270 24.699 166 125 0 3 168 221 386 1.45e-12 68.2
MsG0680035061.01.T01 AT5G27270 24.699 166 125 0 3 168 221 386 1.54e-12 68.2
MsG0680035061.01.T01 AT3G23330 27.815 151 105 1 4 154 206 352 1.55e-12 67.8
MsG0680035061.01.T01 AT5G08305 25.373 201 108 3 4 168 173 367 1.56e-12 67.8
MsG0680035061.01.T01 AT5G36300 27.374 179 117 3 4 169 149 327 1.60e-12 67.0
MsG0680035061.01.T01 AT5G36300 27.545 167 106 4 9 160 84 250 1.69e-12 66.6
MsG0680035061.01.T01 AT1G43980 27.119 177 111 7 2 172 77 241 1.72e-12 67.8
MsG0680035061.01.T01 AT3G59040 23.494 166 124 1 3 168 245 407 1.72e-12 67.8
MsG0680035061.01.T01 AT3G59040 24.675 154 112 2 2 154 278 428 4.81e-12 66.2
MsG0680035061.01.T01 AT3G59040 25.000 152 114 0 3 154 312 463 1.43e-11 65.1
MsG0680035061.01.T01 AT3G23330 27.815 151 105 1 4 154 97 243 1.75e-12 67.8
MsG0680035061.01.T01 AT2G18520 25.000 200 141 5 2 195 133 329 2.03e-12 67.0
MsG0680035061.01.T01 AT2G18520 24.444 180 129 3 9 183 106 283 4.68e-12 66.2
MsG0680035061.01.T01 AT2G18520 22.727 198 115 2 1 164 170 363 2.46e-11 63.9
MsG0680035061.01.T01 AT3G59040 23.494 166 124 1 3 168 252 414 2.16e-12 67.4
MsG0680035061.01.T01 AT3G59040 24.675 154 112 2 2 154 285 435 5.86e-12 66.2
MsG0680035061.01.T01 AT3G59040 25.000 152 114 0 3 154 319 470 1.69e-11 64.7
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MsG0680035061.01.T01 AT4G21065 25.625 160 111 2 9 168 160 311 3.92e-12 66.6
MsG0680035061.01.T01 AT2G35130 23.864 176 133 1 3 178 367 541 4.13e-12 66.6
MsG0680035061.01.T01 AT2G35130 21.143 175 137 1 3 177 262 435 8.97e-12 65.5
MsG0680035061.01.T01 AT2G35130 27.072 181 125 5 3 178 223 401 1.31e-11 65.1
MsG0680035061.01.T01 AT2G35130 22.396 192 114 2 3 159 297 488 3.11e-11 63.9
MsG0680035061.01.T01 AT5G06540 23.121 173 124 3 4 176 182 345 4.22e-12 66.6
MsG0680035061.01.T01 AT2G35130 23.864 176 133 1 3 178 389 563 4.44e-12 66.6
MsG0680035061.01.T01 AT2G35130 21.143 175 137 1 3 177 284 457 9.37e-12 65.5
MsG0680035061.01.T01 AT2G35130 26.776 183 127 5 3 180 245 425 1.42e-11 65.1
MsG0680035061.01.T01 AT2G35130 22.396 192 114 2 3 159 319 510 3.43e-11 63.9
MsG0680035061.01.T01 AT3G21470 26.923 156 110 1 4 159 238 389 4.78e-12 66.2
MsG0680035061.01.T01 AT1G80150 25.157 159 118 1 7 164 143 301 8.17e-12 65.1
MsG0680035061.01.T01 AT3G23020 24.868 189 136 3 1 185 536 722 9.07e-12 65.9
MsG0680035061.01.T01 AT3G23020 24.528 159 120 0 6 164 506 664 3.60e-11 63.9
MsG0680035061.01.T01 AT3G22150 26.667 165 117 1 4 168 485 645 1.10e-11 65.5
MsG0680035061.01.T01 AT3G22150 26.667 165 117 1 4 168 485 645 1.10e-11 65.5
MsG0680035061.01.T01 AT3G49170 24.359 156 114 1 4 159 438 589 1.15e-11 65.5
MsG0680035061.01.T01 AT5G61370 25.731 171 120 1 1 164 239 409 1.42e-11 64.7
MsG0680035061.01.T01 AT3G16610 26.613 248 128 9 1 204 339 576 1.67e-11 64.7
MsG0680035061.01.T01 AT5G52850 24.219 256 168 7 9 258 567 802 2.19e-11 64.7
MsG0680035061.01.T01 AT3G06430 27.160 162 116 2 3 162 122 283 2.33e-11 64.3
MsG0680035061.01.T01 AT3G61360 27.215 158 111 3 3 158 208 363 2.73e-11 63.9
MsG0680035061.01.T01 AT3G61360 25.444 169 124 2 8 176 179 345 9.05e-11 62.4
MsG0680035061.01.T01 AT4G16835 24.176 182 127 5 4 183 318 490 4.43e-11 63.5
MsG0680035061.01.T01 AT1G09410 27.742 155 94 6 1 153 166 304 5.36e-11 63.2
MsG0680035061.01.T01 AT2G36730 28.824 170 113 4 4 172 178 340 5.73e-11 63.2
MsG0680035061.01.T01 AT1G04840 24.020 204 139 5 4 199 160 355 6.92e-11 62.8
MsG0680035061.01.T01 AT1G28690 27.485 171 113 5 2 168 234 397 8.76e-11 62.4
MsG0680035061.01.T01 AT1G14470 25.789 190 97 3 6 159 332 513 9.52e-11 62.4

Find 44 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 132 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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ACTTACAATTCTTTATTAGA+TGG 0.297529 6:+98364061 MsG0680035061.01.T01:CDS
ATGTATAATGTGATGATTAA+TGG 0.308256 6:+98364271 MsG0680035061.01.T01:CDS
TATAGTGTATGTATACATAT+TGG 0.309385 6:-98364155 None:intergenic
ATTGATGGACTTTGCAAATC+AGG 0.317950 6:+98363971 MsG0680035061.01.T01:CDS
ATTTGCAAAGTCCATCAATA+AGG 0.319545 6:-98363967 None:intergenic
CAGGGAGAATATCTGATGTT+TGG 0.333147 6:+98363990 MsG0680035061.01.T01:CDS
CCATTTCTTCTTTGCACAAT+TGG 0.334823 6:-98365940 None:intergenic
TATACATTCTAATATTTAGA+AGG 0.341563 6:-98364255 None:intergenic
ACATACAATTCCCTTATTGA+TGG 0.343996 6:+98363956 MsG0680035061.01.T01:CDS
TATCAGGATCTTCTATTTAA+GGG 0.363123 6:+98364229 MsG0680035061.01.T01:CDS
ACTTGATGCAAGACATGCTT+TGG 0.365400 6:+98366212 MsG0680035061.01.T01:CDS
GGATGCAGCAAGGGTCTATC+AGG 0.374072 6:+98364213 MsG0680035061.01.T01:CDS
AGGGAGAATATCTGATGTTT+GGG 0.377940 6:+98363991 MsG0680035061.01.T01:CDS
TGCAAGACATGCTTTGGAAT+TGG 0.380086 6:+98366218 MsG0680035061.01.T01:CDS
ATTAATGGGCTTTGTAAAGA+AGG 0.409709 6:+98364286 MsG0680035061.01.T01:CDS
GTTTCGTAAGTTACTGCATC+AGG 0.427932 6:-98364364 None:intergenic
CCAATTGTGCAAAGAAGAAA+TGG 0.429478 6:+98365940 MsG0680035061.01.T01:CDS
TGTATAATGTGATGATTAAT+GGG 0.432863 6:+98364272 MsG0680035061.01.T01:CDS
ATAGTGTATGTATACATATT+GGG 0.439537 6:-98364154 None:intergenic
AAAGAAGAAATGGCGGAAGC+TGG 0.447708 6:+98365950 MsG0680035061.01.T01:CDS
ATTGCATCACTTATCTCGTC+TGG 0.458810 6:-98365995 None:intergenic
TTGGATGTTGCAGAAAGAAA+AGG 0.471032 6:+98366152 MsG0680035061.01.T01:intron
GAATTGTATGTTACAGTGTC+AGG 0.471148 6:-98363944 None:intergenic
AAGAAGAAATGGCGGAAGCT+GGG 0.487627 6:+98365951 MsG0680035061.01.T01:CDS
TTTGCAAAGTCCATCAATAA+GGG 0.491649 6:-98363966 None:intergenic
TGCAATATCAGATCAACAAA+AGG 0.494458 6:+98366012 MsG0680035061.01.T01:CDS
TTGATGGACTTTGCAAATCA+GGG 0.505171 6:+98363972 MsG0680035061.01.T01:CDS
TTAATGGGCTTTGTAAAGAA+GGG 0.514597 6:+98364287 MsG0680035061.01.T01:CDS
GCGTTTGGCTGAAGACCATA+AGG 0.535802 6:+98366051 MsG0680035061.01.T01:CDS
ATAGATGAGATGCATGATAG+AGG 0.545633 6:+98364019 MsG0680035061.01.T01:CDS
TTGTAAGTGATTATGTCAGC+TGG 0.548174 6:-98364046 None:intergenic
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ACATTCTAATATTTAGAAGG+TGG 0.569457 6:-98364252 None:intergenic
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ATATCAGATCAACAAAAGGC+TGG 0.578847 6:+98366016 MsG0680035061.01.T01:CDS
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AAGACTTAAGGATGCAGCAA+GGG 0.614334 6:+98364204 MsG0680035061.01.T01:CDS
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CRISPR-GE

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!!! AATTAAAAAATGTTGATAAA+AGG - Chr6:98365369-98365350 None:intergenic 10.0%
!!! ATTTGTTATTATGAATTTTA+AGG + Chr6:98364499-98364518 MsG0680035061.01.T01:intron 10.0%
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! ACATTCTAATATTTAGAAGG+TGG - Chr6:98364255-98364274 None:intergenic 25.0%
! ACTAGAAATTTAGCAAACTT+GGG - Chr6:98364899-98364918 None:intergenic 25.0%
! ACTCATTTGTTTATAAGTAG+AGG - Chr6:98365546-98365565 None:intergenic 25.0%
! TAATGAAAAAATGATGCGTT+TGG - Chr6:98365406-98365425 None:intergenic 25.0%
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! TTGCTAAATAATCAAGTCAT+CGG - Chr6:98365714-98365733 None:intergenic 25.0%
!! GTTGATAAACTATGCAAAAA+TGG + Chr6:98364181-98364200 MsG0680035061.01.T01:CDS 25.0%
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!!! CTCATTTTGTTTATAAGTAG+AGG + Chr6:98365896-98365915 MsG0680035061.01.T01:intron 25.0%
!!! TTATGTTTTGATGACTCTTT+TGG + Chr6:98366129-98366148 MsG0680035061.01.T01:intron 25.0%
!!! TTATGTTTTGATGACTCTTT+TGG - Chr6:98366148-98366129 None:intergenic 25.0%
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AAGAGTCATCAAAACATAAG+TGG - Chr6:98365333-98365314 None:intergenic 30.0%
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GAGGAATTAATATAGCAAGT+AGG - Chr6:98365126-98365145 None:intergenic 30.0%
TCCAAGTTGCTAAATTTCTA+AGG + Chr6:98364961-98364980 MsG0680035061.01.T01:intron 30.0%
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TTTCCGTGTAATGAAAAAAC+TGG - Chr6:98366282-98366263 None:intergenic 30.0%
TTTGATATCAACTTCTAGTG+GGG + Chr6:98364828-98364847 MsG0680035061.01.T01:intron 30.0%
TTTGCAAAGTCCATCAATAA+GGG - Chr6:98363969-98363988 None:intergenic 30.0%
! CTTTTGATATCAACTTCTAG+TGG + Chr6:98364826-98364845 MsG0680035061.01.T01:intron 30.0%
!! ATTAATGGGCTTTGTAAAGA+AGG + Chr6:98364286-98364305 MsG0680035061.01.T01:CDS 30.0%
!! TTAATGGGCTTTGTAAAGAA+GGG + Chr6:98364287-98364306 MsG0680035061.01.T01:CDS 30.0%
!!! CCATTTTTTCTTTGCACAAT+TGG + Chr6:98365499-98365518 MsG0680035061.01.T01:intron 30.0%
AAGATCACACTTGATTTCGT+TGG + Chr6:98365688-98365707 MsG0680035061.01.T01:intron 35.0%
AAGATCACACTTGATTTCGT+TGG - Chr6:98365707-98365688 None:intergenic 35.0%
AGGGAGAATATCTGATGTTT+GGG + Chr6:98363991-98364010 MsG0680035061.01.T01:CDS 35.0%
ATAGATGAGATGCATGATAG+AGG + Chr6:98364019-98364038 MsG0680035061.01.T01:CDS 35.0%
ATATCAGATCAACAAAAGGC+TGG + Chr6:98366016-98366035 MsG0680035061.01.T01:CDS 35.0%
ATCTGCTTATATTAGTGGTG+AGG - Chr6:98364734-98364753 None:intergenic 35.0%
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CCAATTGTGCAAAGAAGAAA+TGG + Chr6:98365940-98365959 MsG0680035061.01.T01:CDS 35.0%
CCATTTCTTCTTTGCACAAT+TGG - Chr6:98365943-98365962 None:intergenic 35.0%
CGGGTAGAACAATAATAAGT+AGG - Chr6:98365591-98365610 None:intergenic 35.0%
CTTCATGAAATGATTGCTAG+AGG + Chr6:98364442-98364461 MsG0680035061.01.T01:CDS 35.0%
GAATTGTATGTTACAGTGTC+AGG - Chr6:98363947-98363966 None:intergenic 35.0%
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TGCAATATCAGAGCAACAAA+AGG - Chr6:98365430-98365449 None:intergenic 35.0%
TGGAGACTTATTTGTCTCTA+AGG - Chr6:98364945-98364964 None:intergenic 35.0%
TGGTGAAAAAATGATGCGTT+TGG + Chr6:98366036-98366055 MsG0680035061.01.T01:CDS 35.0%
TTAAGCTAATACCTCACCAA+GGG + Chr6:98364685-98364704 MsG0680035061.01.T01:intron 35.0%
TTCGTTGGTATGCAAATCTA+AGG - Chr6:98365738-98365757 None:intergenic 35.0%
TTGATATCAACTTCTAGTGG+GGG + Chr6:98364829-98364848 MsG0680035061.01.T01:intron 35.0%
TTGGATGTTGCAGAAAGAAA+AGG + Chr6:98366152-98366171 MsG0680035061.01.T01:intron 35.0%
TTGGATGTTGCAGAAAGAAA+AGG - Chr6:98366171-98366152 None:intergenic 35.0%
TTGTAAGTGATTATGTCAGC+TGG - Chr6:98364049-98364068 None:intergenic 35.0%
!! AAAGTAAATGGAGGGCATTT+CGG - Chr6:98365850-98365831 None:intergenic 35.0%
!! ATTCGTGCTTTGTTTGAAAG+CGG + Chr6:98364391-98364410 MsG0680035061.01.T01:CDS 35.0%
!! ATTGATGGACTTTGCAAATC+AGG + Chr6:98363971-98363990 MsG0680035061.01.T01:CDS 35.0%
!! GTCTTCCATTTTTGAGAGTA+AGG - Chr6:98364332-98364351 None:intergenic 35.0%
!! GTTTTGATGACTCTTTTGGT+TGG + Chr6:98366133-98366152 MsG0680035061.01.T01:intron 35.0%
!! GTTTTGATGACTCTTTTGGT+TGG - Chr6:98366152-98366133 None:intergenic 35.0%
!! TTGATGGACTTTGCAAATCA+GGG + Chr6:98363972-98363991 MsG0680035061.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTTCTTTTGAGGAAACCCT+TGG - Chr6:98364704-98364723 None:intergenic 35.0%
!!! CCTCCAGTTTTTTCATTACA+CGG + Chr6:98365174-98365193 MsG0680035061.01.T01:intron 35.0%
!!! CCTCCAGTTTTTTCATTACA+CGG - Chr6:98365193-98365174 None:intergenic 35.0%
AAGACTTAAGGATGCAGCAA+GGG + Chr6:98364204-98364223 MsG0680035061.01.T01:CDS 40.0%
AAGCGGCAAAAATGATAAGG+CGG + Chr6:98364408-98364427 MsG0680035061.01.T01:CDS 40.0%
ACTTGATGCAAGACATGCTT+TGG + Chr6:98366212-98366231 MsG0680035061.01.T01:CDS 40.0%
ACTTGATGCAAGACATGCTT+TGG - Chr6:98366231-98366212 None:intergenic 40.0%
ATTGCATCACTTATCTCGTC+TGG + Chr6:98365444-98365463 MsG0680035061.01.T01:intron 40.0%
ATTGCATCACTTATCTCGTC+TGG - Chr6:98365463-98365444 None:intergenic 40.0%
CAGGGAGAATATCTGATGTT+TGG + Chr6:98363990-98364009 MsG0680035061.01.T01:CDS 40.0%
CCGTGTAATGAAAAAACTGG+AGG + Chr6:98366266-98366285 MsG0680035061.01.T01:CDS 40.0%
CCGTGTAATGAAAAAACTGG+AGG - Chr6:98366285-98366266 None:intergenic 40.0%
CTCTCAAAAATGGAAGACAG+CGG + Chr6:98364334-98364353 MsG0680035061.01.T01:CDS 40.0%
GAAGCTGCAAGAAAAGTAAG+AGG - Chr6:98365145-98365164 None:intergenic 40.0%
GTTAAGCTAATACCTCACCA+AGG + Chr6:98364684-98364703 MsG0680035061.01.T01:intron 40.0%
GTTTCGTAAGTTACTGCATC+AGG - Chr6:98364367-98364386 None:intergenic 40.0%
TCACAAGAAAATGCATGACC+TGG + Chr6:98366182-98366201 MsG0680035061.01.T01:CDS 40.0%
TCACAAGAAAATGCATGACC+TGG - Chr6:98366201-98366182 None:intergenic 40.0%
TGCTAGAGGTTTACTCTAAG+AGG + Chr6:98364456-98364475 MsG0680035061.01.T01:intron 40.0%
TGGATTGTGCAAAAACCATC+AGG + Chr6:98364081-98364100 MsG0680035061.01.T01:CDS 40.0%
TTGGAGATAGAACAGCTGAA+AGG + Chr6:98366237-98366256 MsG0680035061.01.T01:CDS 40.0%
TTGGAGATAGAACAGCTGAA+AGG - Chr6:98366256-98366237 None:intergenic 40.0%
! AAAGAAAAAATGGCGGAAGC+TGG - Chr6:98365492-98365511 None:intergenic 40.0%
! AAGAAAAAATGGCGGAAGCT+GGG - Chr6:98365491-98365510 None:intergenic 40.0%
! TTGCATCAAGTCTTTTCACC+AGG + Chr6:98365240-98365259 MsG0680035061.01.T01:intron 40.0%
! TTGCATCAAGTCTTTTCACC+AGG - Chr6:98365259-98365240 None:intergenic 40.0%
!! AAGTAAATGGAGGGCATTTC+AGG + Chr6:98365832-98365851 MsG0680035061.01.T01:intron 40.0%
!! AAGTAAATGGAGGGCATTTC+GGG - Chr6:98365851-98365832 None:intergenic 40.0%
!! CAAAAACCATCAGGTTGACA+GGG + Chr6:98364090-98364109 MsG0680035061.01.T01:CDS 40.0%
!! TGCAAGACATGCTTTGGAAT+TGG + Chr6:98366218-98366237 MsG0680035061.01.T01:CDS 40.0%
!! TGCAAGACATGCTTTGGAAT+TGG - Chr6:98366237-98366218 None:intergenic 40.0%
GAAGACTTAAGGATGCAGCA+AGG + Chr6:98364203-98364222 MsG0680035061.01.T01:CDS 45.0%
! AAAGAAGAAATGGCGGAAGC+TGG + Chr6:98365950-98365969 MsG0680035061.01.T01:CDS 45.0%
! AAGAAGAAATGGCGGAAGCT+GGG + Chr6:98365951-98365970 MsG0680035061.01.T01:CDS 45.0%
! AGAAAAAATGGCGGAAGCTG+GGG - Chr6:98365490-98365509 None:intergenic 45.0%
!! GCAAAAACCATCAGGTTGAC+AGG + Chr6:98364089-98364108 MsG0680035061.01.T01:CDS 45.0%
!! TTTTGAGGAAACCCTTGGTG+AGG - Chr6:98364699-98364718 None:intergenic 45.0%
CAATTGCCCTGTCAACCTGA+TGG - Chr6:98364099-98364118 None:intergenic 50.0%
GCGTTTGGCTGAAGACCATA+AGG + Chr6:98366051-98366070 MsG0680035061.01.T01:CDS 50.0%
GCGTTTGGCTGAAGACCATA+AGG - Chr6:98366070-98366051 None:intergenic 50.0%
! AGAAGAAATGGCGGAAGCTG+GGG + Chr6:98365952-98365971 MsG0680035061.01.T01:CDS 50.0%
! GGTGTTGTGTGTGTCTGTAG+TGG - Chr6:98365075-98365094 None:intergenic 50.0%
GGATGCAGCAAGGGTCTATC+AGG + Chr6:98364213-98364232 MsG0680035061.01.T01:CDS 55.0%
! AAAAATGGCGGAAGCTGGGG+TGG - Chr6:98365487-98365506 None:intergenic 55.0%
! AGAAATGGCGGAAGCTGGGG+TGG + Chr6:98365955-98365974 MsG0680035061.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
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