AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780039731.01

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MsG0780039731.01.T01 AT5G40405 25.217 345 183 8 33 375 135 406 1.61e-30 126
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MsG0780039731.01.T01 AT1G13410 32.979 470 226 7 91 552 47 435 3.45e-93 293
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MsG0780039731.01.T01 AT5G06540 27.937 383 193 10 1 375 108 415 2.79e-31 129
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MsG0780039731.01.T01 AT5G19020 28.339 554 299 18 30 535 65 568 1.98e-49 182
MsG0780039731.01.T01 AT5G19020 28.963 328 180 8 167 486 34 316 8.17e-32 130
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MsG0780039731.01.T01 AT4G21065 24.232 293 180 4 7 259 117 407 1.20e-21 99.4
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MsG0780039731.01.T01 AT2G03880 28.922 204 128 5 7 200 257 453 2.92e-15 79.3
MsG0780039731.01.T01 AT2G03880 26.238 202 129 5 310 503 60 249 6.33e-11 65.5
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MsG0780039731.01.T01 AT5G40410 30.888 518 289 10 54 553 16 482 4.03e-82 268
MsG0780039731.01.T01 AT5G40410 26.781 407 221 9 6 372 29 398 4.88e-29 122
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MsG0780039731.01.T01 AT5G40400 21.408 355 254 9 75 411 240 587 1.69e-12 70.9
MsG0780039731.01.T01 AT5G40400 22.118 425 299 13 139 539 238 654 2.85e-12 70.1
MsG0780039731.01.T01 AT3G22670 24.934 377 233 9 110 462 155 505 1.03e-15 80.5
MsG0780039731.01.T01 AT3G22670 21.771 271 182 7 247 494 169 432 2.02e-12 70.1
MsG0780039731.01.T01 AT5G65820 21.563 371 223 9 203 548 211 538 1.10e-15 80.9
MsG0780039731.01.T01 AT3G49730 24.296 284 172 7 197 469 187 438 1.26e-15 80.5
MsG0780039731.01.T01 AT3G49730 22.464 414 276 17 7 387 165 566 5.41e-12 68.9
MsG0780039731.01.T01 AT3G49730 22.807 399 266 15 51 419 177 563 1.08e-11 68.2
MsG0780039731.01.T01 AT3G53170 23.841 302 211 8 205 488 174 474 1.43e-15 80.1
MsG0780039731.01.T01 AT3G53170 23.841 302 211 8 205 488 174 474 1.43e-15 80.1

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sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CAAGATACCACACTTCTTTC+TGG 0.139886 7:+68220763 None:intergenic
TTATGTTCGGAATGGAATTT+TGG 0.142033 7:-68221040 MsG0780039731.01.T01:CDS
GAGAACTAGGTTTGGGTAAT+TGG 0.180635 7:-68220189 MsG0780039731.01.T01:CDS
AATCTCTTGTTGCCATTTCT+TGG 0.191404 7:+68220056 None:intergenic
CACATCCGGATTAGCATTTC+AGG 0.213040 7:-68220142 MsG0780039731.01.T01:CDS
GAGCCCCATGCAGGAATTTA+TGG 0.217588 7:-68219749 MsG0780039731.01.T01:CDS
TCCTATAACACATTGATTTC+CGG 0.231046 7:-68220028 MsG0780039731.01.T01:CDS
GCTGTCTTGACAAAATAATT+TGG 0.242776 7:+68220541 None:intergenic
GGAAGGATGGTGACAAAGTT+AGG 0.277939 7:-68219589 MsG0780039731.01.T01:CDS
CTTGCTCATGTATTGAAATC+TGG 0.289783 7:-68221078 MsG0780039731.01.T01:CDS
TCTTGGAATGCAATGCTATC+AGG 0.290835 7:-68220745 MsG0780039731.01.T01:CDS
ACTTGGACCACCATGATTAC+TGG 0.299110 7:-68220838 MsG0780039731.01.T01:CDS
CCCGGAAATCAATGTGTTAT+AGG 0.303365 7:+68220027 None:intergenic
AACAATCTTATAGTTTCTTC+TGG 0.313981 7:+68220703 None:intergenic
ATGCAGTCATGCCGGATTAT+TGG 0.317803 7:-68219900 MsG0780039731.01.T01:CDS
CCTATAACACATTGATTTCC+GGG 0.330411 7:-68220027 MsG0780039731.01.T01:CDS
ATATCTTCTTGTTCATCTCT+TGG 0.332878 7:-68220622 MsG0780039731.01.T01:CDS
AAGGTTGAGCCACATAATTC+TGG 0.335160 7:-68219656 MsG0780039731.01.T01:CDS
GCCCAATGCATCTTTCTATT+CGG 0.341601 7:-68221139 MsG0780039731.01.T01:CDS
GATTGGAATGTGATGATATC+TGG 0.360856 7:-68220943 MsG0780039731.01.T01:CDS
TGCATTAATATTCCAAGAAA+TGG 0.370727 7:-68220068 MsG0780039731.01.T01:CDS
TAGGGATACAATGACAAAAC+AGG 0.375803 7:-68219570 MsG0780039731.01.T01:CDS
CTGTCTTGACAAAATAATTT+GGG 0.380195 7:+68220542 None:intergenic
CAATCTGCAACGGTTCTATC+AGG 0.380970 7:+68220961 None:intergenic
TTGACCTTCTTCCAATAATC+CGG 0.394024 7:+68219889 None:intergenic
TGCTGCAGCTAAACTGTTCA+AGG 0.394159 7:-68219675 MsG0780039731.01.T01:CDS
AGAACTAGGTTTGGGTAATT+GGG 0.398631 7:-68220188 MsG0780039731.01.T01:CDS
ATTGCCGGTTATACTCAAAA+TGG 0.400517 7:-68220319 MsG0780039731.01.T01:CDS
GTTACCCATGTTGTTTCGTC+TGG 0.403040 7:+68220649 None:intergenic
TATATGCTTCGGCTGGTAGA+TGG 0.410549 7:-68219610 MsG0780039731.01.T01:CDS
TTCAATGACATGCTTAGCTC+TGG 0.418179 7:-68220682 MsG0780039731.01.T01:CDS
CAGAAAGAAGTGTGGTATCT+TGG 0.424148 7:-68220762 MsG0780039731.01.T01:CDS
ATGCATTGGGCTTTATGTTA+CGG 0.424267 7:+68221151 None:intergenic
CACCTTGGAGAACTAGGTTT+GGG 0.424363 7:-68220196 MsG0780039731.01.T01:CDS
ATGTGATGATATCTGGATAC+TGG 0.430165 7:-68220936 MsG0780039731.01.T01:CDS
TGCTTGTATGATTGATATGT+TGG 0.431132 7:-68219825 MsG0780039731.01.T01:CDS
TGTGGACACCTTGGAGAACT+AGG 0.439103 7:-68220202 MsG0780039731.01.T01:CDS
AAAACCAGATGAGGTGACTA+TGG 0.446613 7:-68220242 MsG0780039731.01.T01:CDS
CTCACCATAGTCACCTCATC+TGG 0.452448 7:+68220238 None:intergenic
GATTACTGGGTATGCAAAGA+AGG 0.460239 7:-68220824 MsG0780039731.01.T01:CDS
TATGTAGGAATGTTATTACT+TGG 0.462348 7:-68220855 MsG0780039731.01.T01:CDS
TTCATAAACAAGTGGAACTC+GGG 0.464146 7:-68219703 MsG0780039731.01.T01:CDS
AATTGGGTGTGTACAAGTAT+AGG 0.464606 7:-68220459 MsG0780039731.01.T01:CDS
TCATGGAATTCGATGATTGC+CGG 0.467055 7:-68220334 MsG0780039731.01.T01:CDS
ATTCCTGCATGGGGCTCCAT+TGG 0.467678 7:+68219755 None:intergenic
CTTTGCATACCCAGTAATCA+TGG 0.470130 7:+68220828 None:intergenic
GTTGGGTCGAGCTGGTAGAT+TGG 0.475631 7:-68219807 MsG0780039731.01.T01:CDS
GCAATATAAGTTATGCGGTC+TGG 0.477121 7:+68219935 None:intergenic
GCTCTCTAACATATATGCTT+CGG 0.478826 7:-68219621 MsG0780039731.01.T01:CDS
TGTATCCTGAAATGCTAATC+CGG 0.479112 7:+68220137 None:intergenic
TTTCCATGTGATGGGTGAGC+AGG 0.479826 7:-68220881 MsG0780039731.01.T01:CDS
CAAGGCGATCAAGCTGTTTG+AGG 0.481403 7:-68220287 MsG0780039731.01.T01:CDS
ACACCTTGGAGAACTAGGTT+TGG 0.484290 7:-68220197 MsG0780039731.01.T01:CDS
GCTTGTATGATTGATATGTT+GGG 0.484767 7:-68219824 MsG0780039731.01.T01:CDS
AACCGAATAGAAAGATGCAT+TGG 0.486145 7:+68221137 None:intergenic
GAAGGATGGTGACAAAGTTA+GGG 0.486609 7:-68219588 MsG0780039731.01.T01:CDS
CAGGGAGTGAAGAAAACAAC+TGG 0.486989 7:-68219551 MsG0780039731.01.T01:CDS
TCCTCAAAGAAAATCACATC+CGG 0.490081 7:-68220156 MsG0780039731.01.T01:CDS
CTTGGACCACCATGATTACT+GGG 0.491011 7:-68220837 MsG0780039731.01.T01:CDS
ATGCCCATGCTCTGCAAACC+CGG 0.492197 7:+68220009 None:intergenic
TCAAAATGGCGAGTCATTCA+AGG 0.493336 7:-68220305 MsG0780039731.01.T01:CDS
CTGATAGAACCGTTGCAGAT+TGG 0.495815 7:-68220960 MsG0780039731.01.T01:CDS
AAGAGTAGGGGATTTACATT+CGG 0.502079 7:-68220398 MsG0780039731.01.T01:CDS
TCTTGCATATGCAGAAATCA+TGG 0.515029 7:+68220417 None:intergenic
CAAGCATAGTGGTCTACATC+GGG 0.521620 7:+68219842 None:intergenic
ATAGACCTATCGAGCTTGCT+AGG 0.527530 7:-68221002 MsG0780039731.01.T01:CDS
ATGATCGTGATCATTATGTT+CGG 0.528162 7:-68221053 MsG0780039731.01.T01:CDS
ATTTCCGGGTTTGCAGAGCA+TGG 0.529477 7:-68220013 MsG0780039731.01.T01:CDS
GTCGTCTAGCTTTCTGACAA+TGG 0.530707 7:+68220579 None:intergenic
TTTCCGGGTTTGCAGAGCAT+GGG 0.530985 7:-68220012 MsG0780039731.01.T01:CDS
ACGTAATTTCCAGAATTATG+TGG 0.532767 7:+68219647 None:intergenic
TTTCTGCATATGCAAGAGTA+GGG 0.532797 7:-68220411 MsG0780039731.01.T01:CDS
AAATCTTGTGTGCTGCCTCA+AGG 0.534437 7:+68220488 None:intergenic
CTTGGAATGCAATGCTATCA+GGG 0.534811 7:-68220744 MsG0780039731.01.T01:CDS
GGGTTTGCAGAGCATGGGCA+TGG 0.535259 7:-68220007 MsG0780039731.01.T01:CDS
ATTTCCATGTACTCAAGATG+TGG 0.535790 7:-68220106 MsG0780039731.01.T01:CDS
AGTATAGGAGTTCTGTTCCA+TGG 0.537705 7:-68220444 MsG0780039731.01.T01:CDS
CGTGATCATTATGTTCGGAA+TGG 0.537772 7:-68221048 MsG0780039731.01.T01:CDS
GCTCCCACATCTTGAGTACA+TGG 0.539564 7:+68220102 None:intergenic
ATGCCAATGGAGCCCCATGC+AGG 0.539835 7:-68219758 MsG0780039731.01.T01:CDS
ATTTCTGCATATGCAAGAGT+AGG 0.540661 7:-68220412 MsG0780039731.01.T01:CDS
GCAGAAATCATGGCATTCCA+TGG 0.540687 7:+68220427 None:intergenic
ACCGAATAGAAAGATGCATT+GGG 0.541110 7:+68221138 None:intergenic
AACAACTGGCTTGAGCTGGT+TGG 0.547091 7:-68219537 MsG0780039731.01.T01:CDS
CTTTGATAAGATGCCACAGC+GGG 0.547486 7:-68220365 MsG0780039731.01.T01:CDS
AAGCTCGATAGGTCTATACT+TGG 0.547537 7:+68221008 None:intergenic
TGCTATCAGGGTATGCTCAA+GGG 0.548190 7:-68220732 MsG0780039731.01.T01:CDS
AGATCCATAAATTCCTGCAT+GGG 0.551240 7:+68219745 None:intergenic
TATCTGGATACTGGAAATGC+GGG 0.551679 7:-68220927 MsG0780039731.01.T01:CDS
ATTCATAAACAAGTGGAACT+CGG 0.554917 7:-68219704 MsG0780039731.01.T01:CDS
TAGATCCATAAATTCCTGCA+TGG 0.556095 7:+68219744 None:intergenic
TGCAGAGCATGGGCATGGAA+TGG 0.556678 7:-68220002 MsG0780039731.01.T01:CDS
ATGCTATCAGGGTATGCTCA+AGG 0.559533 7:-68220733 MsG0780039731.01.T01:CDS
TCTTGACAAAATAATTTGGG+TGG 0.561844 7:+68220545 None:intergenic
AGAAAACAACTGGCTTGAGC+TGG 0.562742 7:-68219541 MsG0780039731.01.T01:CDS
ATTACTGGGTATGCAAAGAA+GGG 0.563468 7:-68220823 MsG0780039731.01.T01:CDS
AGTTTCCTAGCAAGCTCGAT+AGG 0.564823 7:+68220997 None:intergenic
CTACCTGCTCACCCATCACA+TGG 0.564940 7:+68220878 None:intergenic
TCTAACATATATGCTTCGGC+TGG 0.571456 7:-68219617 MsG0780039731.01.T01:CDS
CTAACTGCATGCAGTCATGC+CGG 0.575861 7:-68219908 MsG0780039731.01.T01:CDS
GCTATCAGGGTATGCTCAAG+GGG 0.578174 7:-68220731 MsG0780039731.01.T01:CDS
ATTGATATGTTGGGTCGAGC+TGG 0.586109 7:-68219815 MsG0780039731.01.T01:CDS
CTGGAAATGCGGGAATGAAG+AGG 0.590033 7:-68220917 MsG0780039731.01.T01:CDS
ATTGATTCAAAGCATGCCAA+TGG 0.592095 7:-68219771 MsG0780039731.01.T01:CDS
CAGAAAGCTAGACGACAGAG+TGG 0.594242 7:-68220572 MsG0780039731.01.T01:CDS
CTTGATATGCATGCAAAATG+TGG 0.602958 7:-68220514 MsG0780039731.01.T01:CDS
TCAAACCAGACGAAACAACA+TGG 0.605886 7:-68220654 MsG0780039731.01.T01:CDS
ATATCTGGATACTGGAAATG+CGG 0.609710 7:-68220928 MsG0780039731.01.T01:CDS
TGAAGATTCAAAACCAGATG+AGG 0.612897 7:-68220251 MsG0780039731.01.T01:CDS
TTTCCATGTACTCAAGATGT+GGG 0.614697 7:-68220105 MsG0780039731.01.T01:CDS
TGGGTGAGCAGGTAGTATGT+AGG 0.615290 7:-68220870 MsG0780039731.01.T01:CDS
CATGCCGGATTATTGGAAGA+AGG 0.618180 7:-68219893 MsG0780039731.01.T01:CDS
TTCTGCATATGCAAGAGTAG+GGG 0.618233 7:-68220410 MsG0780039731.01.T01:CDS
ACAAGCATAGTGGTCTACAT+CGG 0.623610 7:+68219841 None:intergenic
CATCACATTCCAATCTGCAA+CGG 0.629512 7:+68220951 None:intergenic
TTGATATGCATGCAAAATGT+GGG 0.630100 7:-68220513 MsG0780039731.01.T01:CDS
TGCTTCGGCTGGTAGATGGA+AGG 0.632057 7:-68219606 MsG0780039731.01.T01:CDS
TACTAGCATTCATAAACAAG+TGG 0.636014 7:-68219711 MsG0780039731.01.T01:CDS
TATCAATCATACAAGCATAG+TGG 0.639567 7:+68219831 None:intergenic
TACCCAAACCTAGTTCTCCA+AGG 0.640418 7:+68220194 None:intergenic
GATCCATAAATTCCTGCATG+GGG 0.642303 7:+68219746 None:intergenic
AGGGGAATTTGAAGACCGCA+AGG 0.651052 7:-68220804 MsG0780039731.01.T01:CDS
ACTAGGTTTGGGTAATTGGG+CGG 0.652415 7:-68220185 MsG0780039731.01.T01:CDS
CACAGCGGGATACTGTCTCA+TGG 0.653606 7:-68220351 MsG0780039731.01.T01:CDS
CAATGGACTCTGAAAGACAA+GGG 0.656551 7:+68220596 None:intergenic
TCATAAACAAGTGGAACTCG+GGG 0.662325 7:-68219702 MsG0780039731.01.T01:CDS
TTACTGGGTATGCAAAGAAG+GGG 0.668697 7:-68220822 MsG0780039731.01.T01:CDS
TCGGCTGGTAGATGGAAGGA+TGG 0.671828 7:-68219602 MsG0780039731.01.T01:CDS
AGGGATACAATGACAAAACA+GGG 0.672645 7:-68219569 MsG0780039731.01.T01:CDS
CAAAATGCCAGAAAGAAGTG+TGG 0.676476 7:-68220770 MsG0780039731.01.T01:CDS
GCTGTGGCATCTTATCAAAG+AGG 0.677525 7:+68220368 None:intergenic
GTATAGCAATATAAGTTATG+CGG 0.681912 7:+68219930 None:intergenic
TGCAAAATGTGGGAACCTTG+AGG 0.688675 7:-68220503 MsG0780039731.01.T01:CDS
CAAACCAGACGAAACAACAT+GGG 0.691763 7:-68220653 MsG0780039731.01.T01:CDS
ACAATGGACTCTGAAAGACA+AGG 0.696215 7:+68220595 None:intergenic
AGAAAGCTAGACGACAGAGT+GGG 0.702973 7:-68220571 MsG0780039731.01.T01:CDS
CATGAGACAGTATCCCGCTG+TGG 0.709072 7:+68220352 None:intergenic
TGCATACCCAGTAATCATGG+TGG 0.721201 7:+68220831 None:intergenic
TTTGTCAAAATACATCCTTG+CGG 0.737033 7:+68220789 None:intergenic
TCTTTGATAAGATGCCACAG+CGG 0.755962 7:-68220366 MsG0780039731.01.T01:CDS
CTATCAGGGTATGCTCAAGG+GGG 0.764505 7:-68220730 MsG0780039731.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
! AACAATCTTATAGTTTCTTC+TGG + Chr7:68219985-68220004 None:intergenic 25.0%
! CTGTCTTGACAAAATAATTT+GGG + Chr7:68220146-68220165 None:intergenic 25.0%
! GTATAGCAATATAAGTTATG+CGG + Chr7:68220758-68220777 None:intergenic 25.0%
! TATGTAGGAATGTTATTACT+TGG - Chr7:68219830-68219849 MsG0780039731.01.T01:CDS 25.0%
! TGCATTAATATTCCAAGAAA+TGG - Chr7:68220617-68220636 MsG0780039731.01.T01:CDS 25.0%
! TTGTCAAAAATGAAAGAAGA+CGG - Chr7:68220720-68220739 MsG0780039731.01.T01:CDS 25.0%
ACGTAATTTCCAGAATTATG+TGG + Chr7:68221041-68221060 None:intergenic 30.0%
ATATCTTCTTGTTCATCTCT+TGG - Chr7:68220063-68220082 MsG0780039731.01.T01:CDS 30.0%
ATGATCGTGATCATTATGTT+CGG - Chr7:68219632-68219651 MsG0780039731.01.T01:CDS 30.0%
ATTCATAAACAAGTGGAACT+CGG - Chr7:68220981-68221000 MsG0780039731.01.T01:CDS 30.0%
GCTGTCTTGACAAAATAATT+TGG + Chr7:68220147-68220166 None:intergenic 30.0%
GCTTGTATGATTGATATGTT+GGG - Chr7:68220861-68220880 MsG0780039731.01.T01:CDS 30.0%
TACTAGCATTCATAAACAAG+TGG - Chr7:68220974-68220993 MsG0780039731.01.T01:CDS 30.0%
TATCAATCATACAAGCATAG+TGG + Chr7:68220857-68220876 None:intergenic 30.0%
TCTTGACAAAATAATTTGGG+TGG + Chr7:68220143-68220162 None:intergenic 30.0%
TGCTTGTATGATTGATATGT+TGG - Chr7:68220860-68220879 MsG0780039731.01.T01:CDS 30.0%
TTGATATGCATGCAAAATGT+GGG - Chr7:68220172-68220191 MsG0780039731.01.T01:CDS 30.0%
TTTGTCAAAATACATCCTTG+CGG + Chr7:68219899-68219918 None:intergenic 30.0%
! TATGTTCGGAATGGAATTTT+GGG - Chr7:68219646-68219665 MsG0780039731.01.T01:CDS 30.0%
! TTATGTTCGGAATGGAATTT+TGG - Chr7:68219645-68219664 MsG0780039731.01.T01:CDS 30.0%
!! ACACAAGATTTTTGAGCAAT+TGG - Chr7:68220209-68220228 MsG0780039731.01.T01:CDS 30.0%
!! CACAAGATTTTTGAGCAATT+GGG - Chr7:68220210-68220229 MsG0780039731.01.T01:CDS 30.0%
!! TCCTATAACACATTGATTTC+CGG - Chr7:68220657-68220676 MsG0780039731.01.T01:CDS 30.0%
AACCGAATAGAAAGATGCAT+TGG + Chr7:68219551-68219570 None:intergenic 35.0%
AAGAGTAGGGGATTTACATT+CGG - Chr7:68220287-68220306 MsG0780039731.01.T01:CDS 35.0%
AATTGGGTGTGTACAAGTAT+AGG - Chr7:68220226-68220245 MsG0780039731.01.T01:CDS 35.0%
ACCGAATAGAAAGATGCATT+GGG + Chr7:68219550-68219569 None:intergenic 35.0%
AGAACTAGGTTTGGGTAATT+GGG - Chr7:68220497-68220516 MsG0780039731.01.T01:CDS 35.0%
AGATCCATAAATTCCTGCAT+GGG + Chr7:68220943-68220962 None:intergenic 35.0%
AGGGATACAATGACAAAACA+GGG - Chr7:68221116-68221135 MsG0780039731.01.T01:CDS 35.0%
ATATCTGGATACTGGAAATG+CGG - Chr7:68219757-68219776 MsG0780039731.01.T01:CDS 35.0%
ATGTGATGATATCTGGATAC+TGG - Chr7:68219749-68219768 MsG0780039731.01.T01:CDS 35.0%
ATTACTGGGTATGCAAAGAA+GGG - Chr7:68219862-68219881 MsG0780039731.01.T01:CDS 35.0%
ATTTCCATGTACTCAAGATG+TGG - Chr7:68220579-68220598 MsG0780039731.01.T01:CDS 35.0%
ATTTCTGCATATGCAAGAGT+AGG - Chr7:68220273-68220292 MsG0780039731.01.T01:CDS 35.0%
CTTGATATGCATGCAAAATG+TGG - Chr7:68220171-68220190 MsG0780039731.01.T01:CDS 35.0%
CTTGCTCATGTATTGAAATC+TGG - Chr7:68219607-68219626 MsG0780039731.01.T01:CDS 35.0%
GATTGGAATGTGATGATATC+TGG - Chr7:68219742-68219761 MsG0780039731.01.T01:CDS 35.0%
GCTCTCTAACATATATGCTT+CGG - Chr7:68221064-68221083 MsG0780039731.01.T01:CDS 35.0%
TAGATCCATAAATTCCTGCA+TGG + Chr7:68220944-68220963 None:intergenic 35.0%
TAGGGATACAATGACAAAAC+AGG - Chr7:68221115-68221134 MsG0780039731.01.T01:CDS 35.0%
TCCTCAAAGAAAATCACATC+CGG - Chr7:68220529-68220548 MsG0780039731.01.T01:CDS 35.0%
TCTTGCATATGCAGAAATCA+TGG + Chr7:68220271-68220290 None:intergenic 35.0%
TGAAGATTCAAAACCAGATG+AGG - Chr7:68220434-68220453 MsG0780039731.01.T01:CDS 35.0%
TGTATCCTGAAATGCTAATC+CGG + Chr7:68220551-68220570 None:intergenic 35.0%
TTCATAAACAAGTGGAACTC+GGG - Chr7:68220982-68221001 MsG0780039731.01.T01:CDS 35.0%
TTGACCTTCTTCCAATAATC+CGG + Chr7:68220799-68220818 None:intergenic 35.0%
TTTCCATGTACTCAAGATGT+GGG - Chr7:68220580-68220599 MsG0780039731.01.T01:CDS 35.0%
TTTCTGCATATGCAAGAGTA+GGG - Chr7:68220274-68220293 MsG0780039731.01.T01:CDS 35.0%
! AAGTAAGCTTTTCCATGTGA+TGG - Chr7:68219795-68219814 MsG0780039731.01.T01:CDS 35.0%
! AATCTCTTGTTGCCATTTCT+TGG + Chr7:68220632-68220651 None:intergenic 35.0%
! AGTAAGCTTTTCCATGTGAT+GGG - Chr7:68219796-68219815 MsG0780039731.01.T01:CDS 35.0%
! ATGCATTGGGCTTTATGTTA+CGG + Chr7:68219537-68219556 None:intergenic 35.0%
! ATTGATTCAAAGCATGCCAA+TGG - Chr7:68220914-68220933 MsG0780039731.01.T01:CDS 35.0%
! ATTGCCGGTTATACTCAAAA+TGG - Chr7:68220366-68220385 MsG0780039731.01.T01:CDS 35.0%
!! CCTATAACACATTGATTTCC+GGG - Chr7:68220658-68220677 MsG0780039731.01.T01:CDS 35.0%
AAAACCAGATGAGGTGACTA+TGG - Chr7:68220443-68220462 MsG0780039731.01.T01:CDS 40.0%
AAGCTCGATAGGTCTATACT+TGG + Chr7:68219680-68219699 None:intergenic 40.0%
AAGGTTGAGCCACATAATTC+TGG - Chr7:68221029-68221048 MsG0780039731.01.T01:CDS 40.0%
ACAAGCATAGTGGTCTACAT+CGG + Chr7:68220847-68220866 None:intergenic 40.0%
AGTATAGGAGTTCTGTTCCA+TGG - Chr7:68220241-68220260 MsG0780039731.01.T01:CDS 40.0%
CAAAATGCCAGAAAGAAGTG+TGG - Chr7:68219915-68219934 MsG0780039731.01.T01:CDS 40.0%
CAAACCAGACGAAACAACAT+GGG - Chr7:68220032-68220051 MsG0780039731.01.T01:CDS 40.0%
CAAGATACCACACTTCTTTC+TGG + Chr7:68219925-68219944 None:intergenic 40.0%
CATCACATTCCAATCTGCAA+CGG + Chr7:68219737-68219756 None:intergenic 40.0%
CCCGGAAATCAATGTGTTAT+AGG + Chr7:68220661-68220680 None:intergenic 40.0%
CGTGATCATTATGTTCGGAA+TGG - Chr7:68219637-68219656 MsG0780039731.01.T01:CDS 40.0%
CTTGGAATGCAATGCTATCA+GGG - Chr7:68219941-68219960 MsG0780039731.01.T01:CDS 40.0%
CTTTGCATACCCAGTAATCA+TGG + Chr7:68219860-68219879 None:intergenic 40.0%
GAAGGATGGTGACAAAGTTA+GGG - Chr7:68221097-68221116 MsG0780039731.01.T01:CDS 40.0%
GAGAACTAGGTTTGGGTAAT+TGG - Chr7:68220496-68220515 MsG0780039731.01.T01:CDS 40.0%
GATCCATAAATTCCTGCATG+GGG + Chr7:68220942-68220961 None:intergenic 40.0%
GATTACTGGGTATGCAAAGA+AGG - Chr7:68219861-68219880 MsG0780039731.01.T01:CDS 40.0%
GCAATATAAGTTATGCGGTC+TGG + Chr7:68220753-68220772 None:intergenic 40.0%
GCCCAATGCATCTTTCTATT+CGG - Chr7:68219546-68219565 MsG0780039731.01.T01:CDS 40.0%
TATCTGGATACTGGAAATGC+GGG - Chr7:68219758-68219777 MsG0780039731.01.T01:CDS 40.0%
TCAAAATGGCGAGTCATTCA+AGG - Chr7:68220380-68220399 MsG0780039731.01.T01:CDS 40.0%
TCAAACCAGACGAAACAACA+TGG - Chr7:68220031-68220050 MsG0780039731.01.T01:CDS 40.0%
TCATAAACAAGTGGAACTCG+GGG - Chr7:68220983-68221002 MsG0780039731.01.T01:CDS 40.0%
TCATGGAATTCGATGATTGC+CGG - Chr7:68220351-68220370 MsG0780039731.01.T01:CDS 40.0%
TCTAACATATATGCTTCGGC+TGG - Chr7:68221068-68221087 MsG0780039731.01.T01:CDS 40.0%
TCTTGGAATGCAATGCTATC+AGG - Chr7:68219940-68219959 MsG0780039731.01.T01:CDS 40.0%
TCTTTGATAAGATGCCACAG+CGG - Chr7:68220319-68220338 MsG0780039731.01.T01:CDS 40.0%
TTACTGGGTATGCAAAGAAG+GGG - Chr7:68219863-68219882 MsG0780039731.01.T01:CDS 40.0%
TTCAATGACATGCTTAGCTC+TGG - Chr7:68220003-68220022 MsG0780039731.01.T01:CDS 40.0%
TTCTGCATATGCAAGAGTAG+GGG - Chr7:68220275-68220294 MsG0780039731.01.T01:CDS 40.0%
! ACAATGGACTCTGAAAGACA+AGG + Chr7:68220093-68220112 None:intergenic 40.0%
! CAATGGACTCTGAAAGACAA+GGG + Chr7:68220092-68220111 None:intergenic 40.0%
! CAGAAAGAAGTGTGGTATCT+TGG - Chr7:68219923-68219942 MsG0780039731.01.T01:CDS 40.0%
! TCCGGATGTGATTTTCTTTG+AGG + Chr7:68220533-68220552 None:intergenic 40.0%
!! CTCGCCATTTTGAGTATAAC+CGG + Chr7:68220373-68220392 None:intergenic 40.0%
!! TCGGTTTTGATGAAATCTGC+TGG - Chr7:68219565-68219584 MsG0780039731.01.T01:CDS 40.0%
AAATCTTGTGTGCTGCCTCA+AGG + Chr7:68220200-68220219 None:intergenic 45.0%
ACACCTTGGAGAACTAGGTT+TGG - Chr7:68220488-68220507 MsG0780039731.01.T01:CDS 45.0%
ACTAGGTTTGGGTAATTGGG+CGG - Chr7:68220500-68220519 MsG0780039731.01.T01:CDS 45.0%
ACTTGGACCACCATGATTAC+TGG - Chr7:68219847-68219866 MsG0780039731.01.T01:CDS 45.0%
AGAAAGCTAGACGACAGAGT+GGG - Chr7:68220114-68220133 MsG0780039731.01.T01:CDS 45.0%
AGTTTCCTAGCAAGCTCGAT+AGG + Chr7:68219691-68219710 None:intergenic 45.0%
ATGCAGTCATGCCGGATTAT+TGG - Chr7:68220785-68220804 MsG0780039731.01.T01:CDS 45.0%
ATGCTATCAGGGTATGCTCA+AGG - Chr7:68219952-68219971 MsG0780039731.01.T01:CDS 45.0%
ATTGATATGTTGGGTCGAGC+TGG - Chr7:68220870-68220889 MsG0780039731.01.T01:CDS 45.0%
CAAGCATAGTGGTCTACATC+GGG + Chr7:68220846-68220865 None:intergenic 45.0%
CAATCTGCAACGGTTCTATC+AGG + Chr7:68219727-68219746 None:intergenic 45.0%
CACCTTGGAGAACTAGGTTT+GGG - Chr7:68220489-68220508 MsG0780039731.01.T01:CDS 45.0%
CAGGGAGTGAAGAAAACAAC+TGG - Chr7:68221134-68221153 MsG0780039731.01.T01:CDS 45.0%
CATGCCGGATTATTGGAAGA+AGG - Chr7:68220792-68220811 MsG0780039731.01.T01:CDS 45.0%
CTGATAGAACCGTTGCAGAT+TGG - Chr7:68219725-68219744 MsG0780039731.01.T01:CDS 45.0%
CTTGGACCACCATGATTACT+GGG - Chr7:68219848-68219867 MsG0780039731.01.T01:CDS 45.0%
CTTTGATAAGATGCCACAGC+GGG - Chr7:68220320-68220339 MsG0780039731.01.T01:CDS 45.0%
GCAGAAATCATGGCATTCCA+TGG + Chr7:68220261-68220280 None:intergenic 45.0%
GCTGTGGCATCTTATCAAAG+AGG + Chr7:68220320-68220339 None:intergenic 45.0%
GGAAGGATGGTGACAAAGTT+AGG - Chr7:68221096-68221115 MsG0780039731.01.T01:CDS 45.0%
TATATGCTTCGGCTGGTAGA+TGG - Chr7:68221075-68221094 MsG0780039731.01.T01:CDS 45.0%
TGCAAAATGTGGGAACCTTG+AGG - Chr7:68220182-68220201 MsG0780039731.01.T01:CDS 45.0%
TGCATACCCAGTAATCATGG+TGG + Chr7:68219857-68219876 None:intergenic 45.0%
TGCTATCAGGGTATGCTCAA+GGG - Chr7:68219953-68219972 MsG0780039731.01.T01:CDS 45.0%
TGCTGCAGCTAAACTGTTCA+AGG - Chr7:68221010-68221029 MsG0780039731.01.T01:CDS 45.0%
! ATAGACCTATCGAGCTTGCT+AGG - Chr7:68219683-68219702 MsG0780039731.01.T01:CDS 45.0%
! GTGAGTGTCTTTTCTGCTTG+TGG - Chr7:68220465-68220484 MsG0780039731.01.T01:CDS 45.0%
! TACCCAAACCTAGTTCTCCA+AGG + Chr7:68220494-68220513 None:intergenic 45.0%
! TTTTCTGCTTGTGGACACCT+TGG - Chr7:68220474-68220493 MsG0780039731.01.T01:CDS 45.0%
!! AGAAAACAACTGGCTTGAGC+TGG - Chr7:68221144-68221163 MsG0780039731.01.T01:CDS 45.0%
!! CACATCCGGATTAGCATTTC+AGG - Chr7:68220543-68220562 MsG0780039731.01.T01:CDS 45.0%
!! GTCGTCTAGCTTTCTGACAA+TGG + Chr7:68220109-68220128 None:intergenic 45.0%
!! GTTACCCATGTTGTTTCGTC+TGG + Chr7:68220039-68220058 None:intergenic 45.0%
AGGGGAATTTGAAGACCGCA+AGG - Chr7:68219881-68219900 MsG0780039731.01.T01:CDS 50.0%
ATTTCCGGGTTTGCAGAGCA+TGG - Chr7:68220672-68220691 MsG0780039731.01.T01:CDS 50.0%
CAAGGCGATCAAGCTGTTTG+AGG - Chr7:68220398-68220417 MsG0780039731.01.T01:CDS 50.0%
CAGAAAGCTAGACGACAGAG+TGG - Chr7:68220113-68220132 MsG0780039731.01.T01:CDS 50.0%
CTAACTGCATGCAGTCATGC+CGG - Chr7:68220777-68220796 MsG0780039731.01.T01:CDS 50.0%
CTATCAGGGTATGCTCAAGG+GGG - Chr7:68219955-68219974 MsG0780039731.01.T01:CDS 50.0%
CTCACCATAGTCACCTCATC+TGG + Chr7:68220450-68220469 None:intergenic 50.0%
CTGGAAATGCGGGAATGAAG+AGG - Chr7:68219768-68219787 MsG0780039731.01.T01:CDS 50.0%
GAGCCCCATGCAGGAATTTA+TGG - Chr7:68220936-68220955 MsG0780039731.01.T01:CDS 50.0%
GCTATCAGGGTATGCTCAAG+GGG - Chr7:68219954-68219973 MsG0780039731.01.T01:CDS 50.0%
GCTCCCACATCTTGAGTACA+TGG + Chr7:68220586-68220605 None:intergenic 50.0%
TGGGTGAGCAGGTAGTATGT+AGG - Chr7:68219815-68219834 MsG0780039731.01.T01:CDS 50.0%
TGTGGACACCTTGGAGAACT+AGG - Chr7:68220483-68220502 MsG0780039731.01.T01:CDS 50.0%
TTTCCGGGTTTGCAGAGCAT+GGG - Chr7:68220673-68220692 MsG0780039731.01.T01:CDS 50.0%
!! AACAACTGGCTTGAGCTGGT+TGG - Chr7:68221148-68221167 MsG0780039731.01.T01:CDS 50.0%
!! TTTCCATGTGATGGGTGAGC+AGG - Chr7:68219804-68219823 MsG0780039731.01.T01:CDS 50.0%
ATGCCCATGCTCTGCAAACC+CGG + Chr7:68220679-68220698 None:intergenic 55.0%
ATTCCTGCATGGGGCTCCAT+TGG + Chr7:68220933-68220952 None:intergenic 55.0%
CACAGCGGGATACTGTCTCA+TGG - Chr7:68220334-68220353 MsG0780039731.01.T01:CDS 55.0%
CATGAGACAGTATCCCGCTG+TGG + Chr7:68220336-68220355 None:intergenic 55.0%
CTACCTGCTCACCCATCACA+TGG + Chr7:68219810-68219829 None:intergenic 55.0%
GTTGGGTCGAGCTGGTAGAT+TGG - Chr7:68220878-68220897 MsG0780039731.01.T01:CDS 55.0%
TCGGCTGGTAGATGGAAGGA+TGG - Chr7:68221083-68221102 MsG0780039731.01.T01:CDS 55.0%
TGCAGAGCATGGGCATGGAA+TGG - Chr7:68220683-68220702 MsG0780039731.01.T01:CDS 55.0%
TGCTTCGGCTGGTAGATGGA+AGG - Chr7:68221079-68221098 MsG0780039731.01.T01:CDS 55.0%
ATGCCAATGGAGCCCCATGC+AGG - Chr7:68220927-68220946 MsG0780039731.01.T01:CDS 60.0%
GGGTTTGCAGAGCATGGGCA+TGG - Chr7:68220678-68220697 MsG0780039731.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 68219523 68221184 68219523 ID=MsG0780039731.01;Name=MsG0780039731.01
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Chr7 exon 68219523 68221184 68219523 ID=MsG0780039731.01.T01:exon:11802;Parent=MsG0780039731.01.T01
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Gene Sequence

>MsG0780039731.01.T01

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Protein sequence

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