AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180004428.01


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MsG0180004428.01.T01 AT3G47110 33.333 435 253 7 887 1287 203 634 1.15e-40 165
MsG0180004428.01.T01 AT3G47110 36.017 236 149 2 1250 1484 86 320 2.86e-23 108
MsG0180004428.01.T01 AT3G47110 33.714 175 92 3 1362 1513 78 251 1.21e-14 80.5
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MsG0180004428.01.T01 AT5G06940 31.107 524 308 7 841 1361 30 503 1.64e-57 217
MsG0180004428.01.T01 AT5G06940 30.909 330 203 4 1199 1503 77 406 1.46e-30 132
MsG0180004428.01.T01 AT5G06940 34.091 220 125 5 1318 1525 81 292 1.66e-20 99.4
MsG0180004428.01.T01 AT2G25790 29.957 928 574 21 979 1888 70 939 3.87e-92 323
MsG0180004428.01.T01 AT2G25790 36.467 617 332 11 843 1455 31 591 2.39e-88 311
MsG0180004428.01.T01 AT5G25910 33.709 709 404 13 864 1524 46 736 5.84e-91 316
MsG0180004428.01.T01 AT1G56145 29.077 932 543 25 1006 1889 95 956 1.68e-90 319
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MsG0180004428.01.T01 AT2G13800 36.659 461 255 13 1441 1892 4 436 7.56e-67 235
MsG0180004428.01.T01 AT1G27190 33.840 526 291 16 1394 1888 77 576 1.66e-66 238
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MsG0180004428.01.T01 AT1G27190 40.833 120 70 1 1198 1316 73 192 1.46e-11 70.1
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MsG0180004428.01.T01 AT1G71390 31.700 694 361 16 955 1568 100 760 2.29e-62 230
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MsG0180004428.01.T01 AT1G17240 31.788 604 349 15 863 1408 69 667 2.53e-55 207
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MsG0180004428.01.T01 AT3G28890 33.032 554 303 10 1035 1527 87 633 9.36e-56 208
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MsG0180004428.01.T01 AT5G16900 35.153 458 267 13 1435 1888 411 842 2.15e-60 225
MsG0180004428.01.T01 AT1G51830 35.054 465 272 15 1443 1894 225 672 3.63e-60 221
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MsG0180004428.01.T01 AT1G51830 35.054 465 272 15 1443 1894 218 665 3.84e-60 221
MsG0180004428.01.T01 AT3G02880 33.391 575 303 20 1366 1888 66 612 4.64e-60 219
MsG0180004428.01.T01 AT3G02880 34.356 163 100 3 864 1025 47 203 3.49e-16 85.1
MsG0180004428.01.T01 AT3G02880 34.940 166 101 4 1058 1222 70 229 4.49e-13 75.1
MsG0180004428.01.T01 AT4G13920 28.645 775 429 15 867 1527 62 826 5.04e-60 224
MsG0180004428.01.T01 AT3G59110 38.926 298 167 6 1596 1890 178 463 5.24e-60 216
MsG0180004428.01.T01 AT1G51800 35.054 465 258 13 1441 1885 411 851 8.87e-60 224
MsG0180004428.01.T01 AT2G04300 33.991 456 261 14 1443 1885 379 807 1.19e-59 223
MsG0180004428.01.T01 AT1G51850 33.405 464 278 13 1435 1885 379 824 1.21e-59 223
MsG0180004428.01.T01 AT1G51850 33.405 464 278 13 1435 1885 399 844 1.47e-59 223
MsG0180004428.01.T01 AT3G24550 37.942 311 179 6 1581 1888 254 553 1.58e-59 218
MsG0180004428.01.T01 AT5G05160 31.544 596 305 22 1341 1888 73 613 1.76e-59 218
MsG0180004428.01.T01 AT3G17420 36.137 321 186 7 1573 1890 123 427 1.99e-59 213
MsG0180004428.01.T01 AT4G02010 38.770 374 192 12 1537 1888 297 655 2.82e-59 219
MsG0180004428.01.T01 AT2G04300 33.991 456 261 14 1443 1885 420 848 3.18e-59 222
MsG0180004428.01.T01 AT1G51890 34.077 493 263 17 1441 1909 345 799 8.50e-59 219
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MsG0180004428.01.T01 AT1G68690 39.932 293 160 7 1596 1884 365 645 2.63e-56 209
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MsG0180004428.01.T01 AT1G56720 37.542 301 167 7 1596 1890 167 452 4.27e-56 204
MsG0180004428.01.T01 AT1G56720 37.542 301 167 7 1596 1890 167 452 4.27e-56 204
MsG0180004428.01.T01 AT1G15530 35.032 314 189 4 1591 1902 344 644 4.45e-56 208
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MsG0180004428.01.T01 AT2G16250 33.784 222 141 2 874 1094 122 338 1.97e-23 108
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MsG0180004428.01.T01 AT2G32680 30.801 737 391 19 897 1524 84 810 5.80e-56 212
MsG0180004428.01.T01 AT2G32680 30.909 275 167 7 883 1142 523 789 1.27e-18 93.6
MsG0180004428.01.T01 AT4G23740 29.656 553 318 19 1385 1895 89 612 5.94e-56 207
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MsG0180004428.01.T01 AT2G26730 36.054 147 90 2 1147 1292 64 207 1.10e-12 73.9
MsG0180004428.01.T01 AT2G26730 35.172 145 88 3 931 1073 64 204 7.07e-12 71.2
MsG0180004428.01.T01 AT2G26730 35.338 133 82 2 1185 1316 78 207 1.07e-11 70.5
MsG0180004428.01.T01 AT2G26730 31.481 162 99 3 1245 1405 66 216 1.79e-11 69.7
MsG0180004428.01.T01 AT3G53380 38.033 305 166 8 1593 1888 361 651 1.59e-54 205
MsG0180004428.01.T01 AT4G02630 35.570 298 176 6 1597 1890 151 436 1.73e-54 199
MsG0180004428.01.T01 AT1G26150 43.460 237 123 4 1596 1830 418 645 1.75e-54 203
MsG0180004428.01.T01 AT3G25010 30.038 789 419 24 851 1524 41 811 1.79e-54 207
MsG0180004428.01.T01 AT5G10020 32.169 544 335 14 842 1361 25 558 1.81e-54 209
MsG0180004428.01.T01 AT5G10020 32.696 471 273 10 1025 1458 95 558 2.09e-47 187
MsG0180004428.01.T01 AT5G10020 27.211 294 177 12 1613 1890 773 1045 2.07e-16 86.3
MsG0180004428.01.T01 AT3G24900 30.759 738 391 18 897 1524 116 843 2.03e-54 207
MsG0180004428.01.T01 AT3G24900 27.381 588 339 14 887 1406 255 822 1.32e-32 139
MsG0180004428.01.T01 AT3G24900 25.283 530 287 10 885 1335 324 823 3.23e-22 105
MsG0180004428.01.T01 AT5G03140 33.158 380 225 8 1534 1902 300 661 2.11e-54 204
MsG0180004428.01.T01 AT1G52290 36.789 299 165 7 1596 1885 131 414 2.13e-54 199
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MsG0180004428.01.T01 AT1G56130 29.703 303 202 5 1170 1470 96 389 3.74e-26 118
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MsG0180004428.01.T01 AT2G30740 37.037 324 182 9 1574 1888 39 349 9.88e-53 190
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MsG0180004428.01.T01 AT4G21410 32.558 387 223 10 1529 1890 135 508 5.33e-52 194
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MsG0180004428.01.T01 AT2G47060 41.065 263 135 6 1596 1849 61 312 7.65e-52 188
MsG0180004428.01.T01 AT1G29720 38.127 299 162 7 1596 1888 661 942 7.70e-52 201
MsG0180004428.01.T01 AT1G29720 34.848 330 206 6 956 1284 93 414 2.79e-28 125
MsG0180004428.01.T01 AT1G29720 30.178 338 210 6 1166 1479 58 393 2.04e-24 112
MsG0180004428.01.T01 AT1G29720 32.841 271 156 5 887 1135 96 362 9.75e-24 110
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MsG0180004428.01.T01 AT5G59670 31.180 449 278 10 1442 1888 414 833 1.26e-51 198
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MsG0180004428.01.T01 AT5G18610 37.000 300 175 7 1594 1889 69 358 2.93e-50 187
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MsG0180004428.01.T01 AT2G43230 37.086 302 170 7 1596 1888 133 423 3.86e-50 185
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MsG0180004428.01.T01 AT3G53240 30.392 510 230 12 1071 1503 73 534 2.12e-34 144
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MsG0180004428.01.T01 AT3G53240 30.308 650 406 21 866 1486 2 633 5.50e-47 184
MsG0180004428.01.T01 AT3G53240 30.392 510 230 12 1071 1503 73 534 2.12e-34 144
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MsG0180004428.01.T01 AT1G55200 35.570 298 178 6 1593 1888 364 649 4.64e-50 191
MsG0180004428.01.T01 AT1G55200 35.570 298 178 6 1593 1888 364 649 4.64e-50 191
MsG0180004428.01.T01 AT1G55200 35.570 298 178 6 1593 1888 364 649 4.64e-50 191
MsG0180004428.01.T01 AT1G01540 40.000 235 130 5 1584 1816 131 356 5.39e-50 183
MsG0180004428.01.T01 AT4G23160 35.855 304 170 8 1595 1890 346 632 6.02e-50 191
MsG0180004428.01.T01 AT3G46370 31.317 463 266 14 1441 1885 325 753 8.88e-50 192
MsG0180004428.01.T01 AT3G46370 31.317 463 266 14 1441 1885 325 753 8.88e-50 192
MsG0180004428.01.T01 AT3G59700 32.979 376 215 11 1527 1893 267 614 9.51e-50 189
MsG0180004428.01.T01 AT1G29730 36.949 295 172 5 1596 1888 661 943 1.10e-49 194
MsG0180004428.01.T01 AT1G29730 35.887 248 132 3 992 1238 109 330 2.02e-27 122
MsG0180004428.01.T01 AT1G29730 36.803 269 159 6 969 1234 110 370 2.42e-27 122
MsG0180004428.01.T01 AT1G29730 31.889 323 187 7 1054 1348 99 416 4.90e-27 120
MsG0180004428.01.T01 AT1G29730 34.454 238 132 3 1290 1504 95 331 1.27e-25 116
MsG0180004428.01.T01 AT1G29730 30.476 315 193 8 1166 1479 41 330 4.89e-25 114
MsG0180004428.01.T01 AT1G29730 36.607 224 131 4 848 1070 117 330 1.35e-24 113
MsG0180004428.01.T01 AT1G29730 33.569 283 177 7 887 1166 124 398 1.44e-24 112
MsG0180004428.01.T01 AT1G07870 37.793 299 172 7 1594 1888 89 377 1.20e-49 186
MsG0180004428.01.T01 AT5G01020 37.716 289 167 8 1605 1888 66 346 1.20e-49 183
MsG0180004428.01.T01 AT2G25470 31.124 694 410 21 887 1524 175 856 1.27e-49 193
MsG0180004428.01.T01 AT2G25470 30.815 675 420 22 843 1486 17 675 2.63e-48 189
MsG0180004428.01.T01 AT2G25470 29.248 359 215 7 885 1214 487 835 2.24e-25 115
MsG0180004428.01.T01 AT2G25470 29.640 361 197 10 1172 1503 123 455 7.89e-20 97.4
MsG0180004428.01.T01 AT4G04540 36.735 294 164 7 1601 1890 317 592 1.38e-49 188
MsG0180004428.01.T01 AT2G28250 35.065 308 178 7 1595 1890 197 494 1.41e-49 187
MsG0180004428.01.T01 AT2G28250 35.065 308 178 7 1595 1890 197 494 1.41e-49 187
MsG0180004428.01.T01 AT2G28250 35.065 308 178 7 1595 1890 197 494 1.41e-49 187
MsG0180004428.01.T01 AT2G28250 35.065 308 178 7 1595 1890 197 494 1.41e-49 187
MsG0180004428.01.T01 AT2G28250 35.065 308 178 7 1595 1890 197 494 1.41e-49 187
MsG0180004428.01.T01 AT2G28250 35.065 308 178 7 1595 1890 197 494 1.41e-49 187
MsG0180004428.01.T01 AT1G53440 33.702 362 198 10 1542 1888 604 938 1.69e-49 193
MsG0180004428.01.T01 AT1G53440 29.023 348 213 5 1196 1537 87 406 1.74e-29 129
MsG0180004428.01.T01 AT1G53440 28.522 291 204 4 896 1185 75 362 3.68e-27 121
MsG0180004428.01.T01 AT1G53440 30.928 291 174 5 1161 1451 100 363 2.56e-26 118
MsG0180004428.01.T01 AT1G53440 30.464 302 156 6 959 1234 90 363 1.31e-25 116
MsG0180004428.01.T01 AT1G53440 28.986 276 170 3 887 1138 90 363 3.25e-21 102
MsG0180004428.01.T01 AT1G53440 29.798 198 100 5 1330 1504 68 249 3.31e-13 75.9
MsG0180004428.01.T01 AT4G17660 37.294 303 171 8 1596 1890 79 370 1.73e-49 182
MsG0180004428.01.T01 AT4G20450 32.075 477 260 16 1414 1888 431 845 1.82e-49 192
MsG0180004428.01.T01 AT2G02800 36.278 317 175 9 1582 1888 64 363 1.83e-49 183
MsG0180004428.01.T01 AT2G02800 36.278 317 175 9 1582 1888 64 363 1.83e-49 183
MsG0180004428.01.T01 AT1G77280 37.013 308 171 8 1587 1888 387 677 1.83e-49 190
MsG0180004428.01.T01 AT1G77280 37.013 308 171 8 1587 1888 387 677 1.83e-49 190
MsG0180004428.01.T01 AT1G20650 36.789 299 174 7 1594 1888 64 351 1.94e-49 181
MsG0180004428.01.T01 AT5G06740 34.295 312 171 7 1593 1889 315 607 2.16e-49 188
MsG0180004428.01.T01 AT2G25220 44.747 257 126 7 1603 1853 92 338 2.60e-49 181
MsG0180004428.01.T01 AT5G06740 34.295 312 171 7 1593 1889 327 619 3.31e-49 188
MsG0180004428.01.T01 AT3G13690 35.570 298 178 6 1593 1888 396 681 3.85e-49 189
MsG0180004428.01.T01 AT3G13690 35.570 298 178 6 1593 1888 396 681 3.85e-49 189
MsG0180004428.01.T01 AT3G13690 35.570 298 178 6 1593 1888 396 681 3.85e-49 189
MsG0180004428.01.T01 AT3G28690 37.124 299 172 7 1598 1888 16 306 4.04e-49 180
MsG0180004428.01.T01 AT2G25220 44.747 257 126 7 1603 1853 141 387 4.66e-49 182
MsG0180004428.01.T01 AT5G56460 35.669 314 188 7 1596 1902 64 370 4.95e-49 181
MsG0180004428.01.T01 AT1G70450 35.082 305 176 8 1596 1892 37 327 5.76e-49 180
MsG0180004428.01.T01 AT4G23140 35.855 304 170 8 1595 1890 338 624 6.04e-49 187
MsG0180004428.01.T01 AT5G58940 36.218 312 185 7 1593 1900 132 433 6.52e-49 182
MsG0180004428.01.T01 AT5G58940 36.218 312 185 7 1593 1900 132 433 6.52e-49 182
MsG0180004428.01.T01 AT5G58940 36.218 312 185 7 1593 1900 132 433 6.52e-49 182
MsG0180004428.01.T01 AT5G58940 36.218 312 185 7 1593 1900 132 433 6.52e-49 182
MsG0180004428.01.T01 AT1G52540 35.484 310 178 9 1596 1899 25 318 6.83e-49 179
MsG0180004428.01.T01 AT5G63940 35.505 307 177 9 1596 1896 350 641 7.72e-49 187
MsG0180004428.01.T01 AT3G23010 30.894 492 326 8 943 1427 6 490 7.81e-49 184
MsG0180004428.01.T01 AT3G23010 29.697 495 291 9 1036 1478 3 492 4.10e-40 157
MsG0180004428.01.T01 AT3G23010 27.379 515 318 13 896 1370 7 505 2.17e-35 143
MsG0180004428.01.T01 AT3G23010 35.974 303 186 5 1183 1481 6 304 1.03e-34 141
MsG0180004428.01.T01 AT3G23010 32.105 380 222 8 1134 1482 5 379 4.48e-32 133
MsG0180004428.01.T01 AT3G23010 29.043 303 165 4 1250 1503 1 302 1.43e-22 104
MsG0180004428.01.T01 AT4G21400 35.430 302 175 6 1596 1890 337 625 8.05e-49 187
MsG0180004428.01.T01 AT5G11020 38.889 288 161 8 1603 1888 136 410 8.36e-49 181
MsG0180004428.01.T01 AT1G52540 35.484 310 178 9 1596 1899 28 321 8.38e-49 178
MsG0180004428.01.T01 AT5G11020 38.889 288 161 8 1603 1888 75 349 8.85e-49 179
MsG0180004428.01.T01 AT1G49730 33.518 361 201 11 1552 1891 289 631 9.07e-49 187
MsG0180004428.01.T01 AT4G21400 35.430 302 175 6 1596 1890 349 637 9.09e-49 187
MsG0180004428.01.T01 AT1G14370 34.311 341 188 11 1582 1910 67 383 9.44e-49 181

Find 454 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 933 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ACCTTTCCCAATAACGTATT+TGG 0.118379 1:+77783758 None:intergenic
TTAGAAACATTTGGAGAATT+TGG 0.149322 1:+77783846 None:intergenic
TACCATTCCTACTGGATTTC+AGG 0.162624 1:-77785026 MsG0180004428.01.T01:CDS
TTTCATTCCAAATACGTTAT+TGG 0.165646 1:-77783765 MsG0180004428.01.T01:CDS
GCTTGGAAATTGTACAAATT+TGG 0.176736 1:-77785371 MsG0180004428.01.T01:CDS
ATCGAATTGGTTAATATAAA+AGG 0.176884 1:-77785160 MsG0180004428.01.T01:CDS
CTCAGCTATAATAAACTTTC+AGG 0.179332 1:-77784254 MsG0180004428.01.T01:CDS
GATAATTGGCAAAGGTTATT+TGG 0.182489 1:+77784875 None:intergenic
AGAAATATTGTGAAATTATA+TGG 0.189408 1:-77783579 MsG0180004428.01.T01:CDS
CAATTGTATGTTTCTGTATC+AGG 0.199796 1:+77793047 None:intergenic
ACAGATAATTTACATTATTA+TGG 0.209247 1:-77791043 MsG0180004428.01.T01:CDS
GGACATATTTGAGGCGTTTA+AGG 0.213661 1:-77788869 MsG0180004428.01.T01:CDS
TCTGCAGTTGTTGGTTCTTA+TGG 0.219523 1:-77783267 MsG0180004428.01.T01:CDS
ATGAGCGAAAACTCATTTAA+TGG 0.220405 1:-77784329 MsG0180004428.01.T01:CDS
GAAGCTCATGTTGGTGATTT+TGG 0.226486 1:-77783330 MsG0180004428.01.T01:CDS
TTCTCATACAATGATCTTAT+AGG 0.227018 1:-77784110 MsG0180004428.01.T01:CDS
TTCATTCCAAATACGTTATT+GGG 0.227474 1:-77783764 MsG0180004428.01.T01:CDS
CAACATCCTTGATGCAAAAT+TGG 0.228640 1:-77782207 MsG0180004428.01.T01:CDS
CATGCTTGGATAATTCTTAT+TGG 0.232865 1:-77794304 MsG0180004428.01.T01:intron
CATAGTCTTGGCTATAAGTT+TGG 0.235188 1:-77787555 MsG0180004428.01.T01:CDS
GTTGTTTCCTATGCTCTTAA+TGG 0.237736 1:-77795426 MsG0180004428.01.T01:CDS
TCTTGGAAACTCAACTCTTT+TGG 0.242579 1:+77783810 None:intergenic
GTTGAAGAAGGTGGCCTTAC+TGG 0.246517 1:-77790100 MsG0180004428.01.T01:CDS
AATCTCGTGGTCGGCCGCTT+TGG 0.249279 1:-77789691 MsG0180004428.01.T01:CDS
ATCTCTCTCTGCCTTGATCT+TGG 0.250220 1:-77787361 MsG0180004428.01.T01:CDS
CATGACGAATATCATAATTT+AGG 0.250231 1:+77794323 None:intergenic
ATCTCGTGGTCGGCCGCTTT+GGG 0.251517 1:-77789690 MsG0180004428.01.T01:CDS
AATGTTGTAAAGGCTATTTC+AGG 0.254892 1:+77793309 None:intergenic
TTTCTCAGTTAGAACTTCTT+AGG 0.254905 1:-77784424 MsG0180004428.01.T01:CDS
CTTTGCAATCTTCCTCAATT+AGG 0.261134 1:+77794076 None:intergenic
AATAAGATTCCCAAGTTTAG+AGG 0.262288 1:+77784223 None:intergenic
ACATCATCAAGTTAGATAAT+TGG 0.262557 1:+77784861 None:intergenic
TATGAAGGAATTGTAGCTTT+AGG 0.264884 1:-77789923 MsG0180004428.01.T01:CDS
TTCTTAGGAGAAGGCTTAAA+TGG 0.269093 1:-77789463 MsG0180004428.01.T01:CDS
TAAAGAAGCTATACCTTTAC+AGG 0.270648 1:-77785279 MsG0180004428.01.T01:CDS
GTACAATTTCCAAGCTCTTT+AGG 0.271728 1:+77785379 None:intergenic
TCTCTCTCTGCCTTGATCTT+GGG 0.272245 1:-77787360 MsG0180004428.01.T01:CDS
TATTGGAAACGTCGCTTCTT+AGG 0.272559 1:-77789478 MsG0180004428.01.T01:CDS
GGCTTTAATGCATTCTGTTC+AGG 0.274497 1:+77789836 None:intergenic
GGATCTTTGCCATCTTCTAT+TGG 0.282016 1:-77785604 MsG0180004428.01.T01:CDS
GAAAGTCTGTTAAAAGAGTT+TGG 0.282454 1:+77784152 None:intergenic
TGACATGCTTGAAGCATTAG+AGG 0.283722 1:-77790880 MsG0180004428.01.T01:CDS
TAGGCAGTTTAGTTGTAAAA+TGG 0.284877 1:+77784606 None:intergenic
TGTAAAGGTATAGCTTCTTT+AGG 0.286853 1:+77785281 None:intergenic
CAGGGTGATTTCTGCTAAAC+AGG 0.287108 1:-77787263 MsG0180004428.01.T01:CDS
ATGGTCAATAAGTATGTTAT+TGG 0.287156 1:+77783359 None:intergenic
GGTCGAATTCCTGTCGAAAT+TGG 0.291050 1:-77785748 MsG0180004428.01.T01:CDS
ATGAAGGAATTGTAGCTTTA+GGG 0.297375 1:-77789922 MsG0180004428.01.T01:CDS
TGGAAACTGTTCAAGTTTGC+AGG 0.298036 1:-77785800 MsG0180004428.01.T01:CDS
TTGATTGGTATTCCAGGTTT+AGG 0.299877 1:-77783461 MsG0180004428.01.T01:CDS
CCTGGTCCTAGGTCGTTTCA+TGG 0.300418 1:-77795453 MsG0180004428.01.T01:CDS
GTCTCAATGCTTACAAGTTC+TGG 0.300905 1:-77782080 MsG0180004428.01.T01:CDS
TTGAGTAAACCAAGTTCTTT+TGG 0.310038 1:+77785451 None:intergenic
ATTTACATTATTATGGATAA+TGG 0.311224 1:-77791036 MsG0180004428.01.T01:CDS
CCAGTCTTGATTGGTATTCC+AGG 0.311973 1:-77783467 MsG0180004428.01.T01:CDS
GTTGCATTGGTGAGATTGTT+TGG 0.316229 1:-77794397 MsG0180004428.01.T01:CDS
GCAACGAAAGTTTCATGAAT+TGG 0.318646 1:+77794415 None:intergenic
TCCTAGGTCGTTTCATGGTT+TGG 0.321573 1:-77795448 MsG0180004428.01.T01:CDS
AATTCCATAAGGAATATTTC+CGG 0.322031 1:+77784814 None:intergenic
CAGAAAGTAGGCAATTAAAA+TGG 0.327312 1:+77793983 None:intergenic
TACGCATGGGTCTTCACATT+TGG 0.333361 1:+77792466 None:intergenic
GTACATGGAAAAGGGAAGTT+TGG 0.334602 1:-77783517 MsG0180004428.01.T01:CDS
GACTTCGTAGGTACTTTATC+AGG 0.336124 1:-77784461 MsG0180004428.01.T01:CDS
CAGTTATGGAGTAGTCCTTT+TGG 0.338366 1:-77782333 MsG0180004428.01.T01:CDS
CTGTCTCAAAACACTTTCTC+TGG 0.340274 1:-77785841 MsG0180004428.01.T01:CDS
CAAGATTACATTGATGTTGT+AGG 0.342417 1:-77789391 MsG0180004428.01.T01:CDS
GATCAAGAAGGAAATCTAAA+AGG 0.343017 1:-77787963 MsG0180004428.01.T01:CDS
TTCAATGTGGTGAACTCATT+TGG 0.344722 1:+77785091 None:intergenic
GAAGGCTTAAATGGTGATAA+TGG 0.348591 1:-77789454 MsG0180004428.01.T01:CDS
ACATTTGAGAACATGGAATA+TGG 0.349524 1:-77793291 MsG0180004428.01.T01:CDS
ACTTCTTCAGAAGCTTCTTA+TGG 0.352260 1:+77789951 None:intergenic
CGCATAGTTGGGCGTCTAGA+AGG 0.353024 1:+77782110 None:intergenic
GGTGTGGCATGATATAATTT+TGG 0.354792 1:-77781644 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR
TCAAGGTTTCCAAGCTCCTT+TGG 0.360626 1:+77785307 None:intergenic
GGTTACATTCCACAAGAGTT+AGG 0.363460 1:-77784308 MsG0180004428.01.T01:CDS
ACGCTGGTAAAGAACATTTC+TGG 0.365600 1:+77789739 None:intergenic
AGGGTGCTAAGGGTGGCCTC+AGG 0.366484 1:-77794122 MsG0180004428.01.T01:CDS
CTCAAGGCATCTTTGTTTGA+AGG 0.368508 1:+77789988 None:intergenic
GATCTTTGCCATCTTCTATT+GGG 0.373757 1:-77785603 MsG0180004428.01.T01:CDS
TGAGGAGGAGGAAGTAGAAC+AGG 0.374648 1:-77789326 MsG0180004428.01.T01:intron
TGTAAAAGCTTGGAGAATCT+TGG 0.375211 1:-77785505 MsG0180004428.01.T01:CDS
TATTATTAGTGGAGTTTCAT+TGG 0.375372 1:-77783934 MsG0180004428.01.T01:CDS
GGAGAATTATGCAGCTTGTT+TGG 0.377729 1:-77781824 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR
ACAGGAATGGGAAGTAGATT+TGG 0.377821 1:-77788737 MsG0180004428.01.T01:CDS
TCAATGTAATCTTGAACATC+AGG 0.378932 1:+77789400 None:intergenic
CCGCGCCGAAATCTCAACTT+TGG 0.379251 1:-77783616 MsG0180004428.01.T01:CDS
AATTACAAGCTGCAAGTCTT+TGG 0.380847 1:-77784795 MsG0180004428.01.T01:CDS
CGATGATGATTGGTTTCCTT+TGG 0.382643 1:-77788890 MsG0180004428.01.T01:CDS
CTCACCGGAAATATTCCTTA+TGG 0.384281 1:-77784818 MsG0180004428.01.T01:CDS
CTCAATCACTCTAACGTAAT+CGG 0.386943 1:+77789883 None:intergenic
TATTACTCAGGTCATACAAT+TGG 0.387619 1:-77787673 MsG0180004428.01.T01:intron
GGAAATATTCCAAGGGAGAT+TGG 0.388868 1:-77785244 MsG0180004428.01.T01:CDS
ATATCATACTTGATTCACTA+TGG 0.390406 1:+77783547 None:intergenic
GAGAGGTTACCGATTTCTTT+AGG 0.390421 1:+77784587 None:intergenic
CTGATACAGAAACATACAAT+TGG 0.391148 1:-77793046 MsG0180004428.01.T01:CDS
CAACATGAGCTTCAAATTCA+TGG 0.391821 1:+77783340 None:intergenic
CGCGCCGAAATCTCAACTTT+GGG 0.394254 1:-77783615 MsG0180004428.01.T01:CDS
GAACAGTTTCCAATTTCCTT+TGG 0.394393 1:+77785811 None:intergenic
GATTCGTTAAGGAGGGAGTT+AGG 0.396811 1:-77794451 MsG0180004428.01.T01:CDS
TGGAGATCATTCTAATGCTT+TGG 0.399641 1:-77794052 MsG0180004428.01.T01:CDS
GGCTCTTTATCTTCCAGCAT+TGG 0.400240 1:-77785892 MsG0180004428.01.T01:CDS
GAAAGATTACCAATTTCATC+TGG 0.401842 1:+77785667 None:intergenic
TTTGGGTGGTGTGTGCTGAT+AGG 0.403151 1:-77781626 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR
ACTTGTTCGGAACAAGCATT+TGG 0.403714 1:-77794169 MsG0180004428.01.T01:CDS
TCTAAAGGTCATTCAACTAA+AGG 0.403798 1:-77794373 MsG0180004428.01.T01:CDS
TAATCCTAGGCTTGCAATCA+TGG 0.406114 1:+77783400 None:intergenic
GTATACCTTAGCAGATGCTT+GGG 0.406507 1:-77788809 MsG0180004428.01.T01:CDS
GTGGCTAAAGAAAATCATAA+AGG 0.407640 1:-77789861 MsG0180004428.01.T01:CDS
CTCTTCTTCTTCCTCTTCAA+CGG 0.407952 1:+77789661 None:intergenic
GATACAATCATCTTAACAAT+TGG 0.408525 1:-77786017 MsG0180004428.01.T01:CDS
AAGTACATGTTAGAAACATT+TGG 0.409140 1:+77783837 None:intergenic
TCAAATGATGGCATGGATGC+TGG 0.411727 1:-77787226 MsG0180004428.01.T01:CDS
CTCAACATTAATCAATTTGA+AGG 0.412753 1:-77785769 MsG0180004428.01.T01:CDS
ATAGCTTCTTTAGGACTTCA+AGG 0.413312 1:+77785290 None:intergenic
CTCTCTCTGCCTTGATCTTG+GGG 0.413360 1:-77787359 MsG0180004428.01.T01:CDS
TGGAGCAAATAGTCCACTTT+GGG 0.416277 1:-77784936 MsG0180004428.01.T01:CDS
TGGCTAAAGAAAATCATAAA+GGG 0.417296 1:-77789860 MsG0180004428.01.T01:CDS
CTCAGTTTCAGATCAGACTT+TGG 0.418813 1:-77787287 MsG0180004428.01.T01:CDS
TCCAGGTTTAGGATTGCTCT+TGG 0.419782 1:-77783450 MsG0180004428.01.T01:CDS
ATCTTGGTTTAACTCAAAAT+CGG 0.420503 1:-77785489 MsG0180004428.01.T01:CDS
CTCTGTTAGCATAGTTCTGT+TGG 0.423710 1:-77781786 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR
GCTCGAACCGGTCCGGTTCG+AGG 0.424342 1:+77795648 None:intergenic
AAGATTACATTGATGTTGTA+GGG 0.424654 1:-77789390 MsG0180004428.01.T01:CDS
TATCTTCATCCAGTCTTGAT+TGG 0.425216 1:-77783476 MsG0180004428.01.T01:CDS
CTCTTTCAGAACAAGTTAAC+CGG 0.425667 1:-77785121 MsG0180004428.01.T01:CDS
GTGTTATCAGCTACTCTAGA+AGG 0.426874 1:-77787906 MsG0180004428.01.T01:CDS
CTATTTGCTCCAAGTGCATA+AGG 0.427438 1:+77784947 None:intergenic
TTGGATCAGAATGAATTCAT+TGG 0.428255 1:-77784689 MsG0180004428.01.T01:CDS
TACAGAGGGAAAATACCTTA+TGG 0.430558 1:-77786064 MsG0180004428.01.T01:CDS
TCATGAAACTTTCGTTGCAT+TGG 0.431228 1:-77794410 MsG0180004428.01.T01:CDS
TTGCATTGGTGAGATTGTTT+GGG 0.433737 1:-77794396 MsG0180004428.01.T01:CDS
ACAGGTCGTATGTTTACTTA+AGG 0.434616 1:-77781668 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR
TACATGGAAAAGGGAAGTTT+GGG 0.435062 1:-77783516 MsG0180004428.01.T01:CDS
GTGAGATTGTTTGGGTCTAA+AGG 0.436042 1:-77794388 MsG0180004428.01.T01:CDS
ATAGTCTTGGCTATAAGTTT+GGG 0.438580 1:-77787554 MsG0180004428.01.T01:CDS
CTGGTTTGAGTCCTGGTCCT+AGG 0.439993 1:-77795464 MsG0180004428.01.T01:CDS
TAATTTGAAGGGGATGTAAG+TGG 0.442112 1:+77795683 None:intergenic
AATGGTTGTTATTGAGTTGA+AGG 0.442142 1:+77784189 None:intergenic
ACTAAACTGCCTAAAGAAAT+CGG 0.442402 1:-77784596 MsG0180004428.01.T01:CDS
TGATGAAGCAGATGAGGATG+AGG 0.443071 1:-77789344 MsG0180004428.01.T01:CDS
TCATAGGTGGTCACAGGAAT+GGG 0.445146 1:-77788749 MsG0180004428.01.T01:CDS
CATTGGACCCATTCCTCCAC+AGG 0.445342 1:-77784672 MsG0180004428.01.T01:CDS
AGTTAAGCGGTTTAATTTGA+AGG 0.447280 1:+77795671 None:intergenic
GTTTCCTTTGGACATATTTG+AGG 0.447679 1:-77788878 MsG0180004428.01.T01:CDS
ACTAAAGGTTTAGAGATACT+TGG 0.447828 1:-77794358 MsG0180004428.01.T01:CDS
GGACAAATACCCTCTAAACT+TGG 0.448396 1:-77784233 MsG0180004428.01.T01:CDS
TCTTCTTCTTCCTCTTCAAC+GGG 0.448974 1:+77789662 None:intergenic
GTTTGAAGGAAGTCTCCATT+GGG 0.451557 1:+77790002 None:intergenic
GAGACAACTTTACGCATAGT+TGG 0.451605 1:+77782098 None:intergenic
TGCTAACAAAGTGTTCTTGA+AGG 0.452186 1:-77794142 MsG0180004428.01.T01:CDS
ACATTTCTGGTTCCATCGAT+TGG 0.452894 1:+77789752 None:intergenic
GCATCCATGCCATCATTTGA+AGG 0.454328 1:+77787229 None:intergenic
CTGTCAACTCATTCCTGTAA+AGG 0.454339 1:+77785266 None:intergenic
AGCAGATGAGGATGAGGAGG+AGG 0.454688 1:-77789338 MsG0180004428.01.T01:CDS
GTGATATTGTGATATTATGC+AGG 0.456404 1:-77781764 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR
TGTTTGAAGGAAGTCTCCAT+TGG 0.456929 1:+77790001 None:intergenic
AAATGTGATGTATACAGTTA+TGG 0.456955 1:-77782347 MsG0180004428.01.T01:CDS
TTACCAACCTGTGGAGGAAT+GGG 0.458743 1:+77784665 None:intergenic
GATAGGTGGATGTAAAAGCT+TGG 0.459050 1:-77785515 MsG0180004428.01.T01:CDS
AGTTTGGGAGAGTTACTTCA+TGG 0.459620 1:-77783501 MsG0180004428.01.T01:CDS
TTAAGCTTCCCAATAGAAGA+TGG 0.459644 1:+77785595 None:intergenic
ATTGAGGAAGATTGCAAAGC+TGG 0.461029 1:-77794072 MsG0180004428.01.T01:CDS
CGCTGAGTTGCTTGGCATGA+TGG 0.461983 1:-77792512 MsG0180004428.01.T01:CDS
ATAGCTGCTGGTTTGAGTCC+TGG 0.462403 1:-77795471 MsG0180004428.01.T01:intron
AGACAACTTTACGCATAGTT+GGG 0.463318 1:+77782099 None:intergenic
TCGGGTAACAAAGGTCTTTG+TGG 0.463548 1:-77784038 MsG0180004428.01.T01:CDS
TAATTGCCTACTTTCTGTGC+AGG 0.463917 1:-77793977 MsG0180004428.01.T01:intron
TCTTTATCTTCCAGCATTGG+TGG 0.463981 1:-77785889 MsG0180004428.01.T01:CDS
CATGCTTTATCACCCACAAT+AGG 0.464238 1:+77781733 None:intergenic
CATGTTCTCAAATGTTGTAA+AGG 0.465556 1:+77793299 None:intergenic
AGGTGACATACCGATCGAAT+TGG 0.465603 1:-77785173 MsG0180004428.01.T01:CDS
TTCCTGTAAGTAACTCCAAA+AGG 0.465747 1:+77782318 None:intergenic
CAACATCAATTTCATGTAGT+AGG 0.465872 1:+77782183 None:intergenic
AATTATAGCTAGTCATTCAT+AGG 0.465985 1:-77781942 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR
TACAGTTACAGTTACAGTTA+CGG 0.467402 1:-77795708 MsG0180004428.01.T01:CDS
CAGTAGCTTCAACCACGTCT+TGG 0.467625 1:+77783793 None:intergenic
CACCACCTTGATCTAACAAA+TGG 0.467924 1:+77782285 None:intergenic
TATATAAATCCATCAGCATC+AGG 0.468220 1:+77790031 None:intergenic
GTGAATCAAACCACCAATGC+TGG 0.468775 1:+77785879 None:intergenic
TTACCAATTTCATCTGGAAA+AGG 0.469900 1:+77785673 None:intergenic
CCAGTCCATTTGTTAGATCA+AGG 0.470574 1:-77782290 MsG0180004428.01.T01:CDS
GGTACTTTATCAGGTGAGAT+AGG 0.472267 1:-77784452 MsG0180004428.01.T01:CDS
AATGCTTGTGAATGAATTGA+AGG 0.472351 1:-77789798 MsG0180004428.01.T01:CDS
TTATGCAGATGGATTCGTTA+AGG 0.473191 1:-77794462 MsG0180004428.01.T01:intron
GAAAGGTTTCCAATCTCCCT+TGG 0.474324 1:+77785235 None:intergenic
TATGGCGTAATGATTAAGTA+TGG 0.474720 1:-77788008 MsG0180004428.01.T01:CDS
ATTATGATATTCGTCATGCT+TGG 0.475108 1:-77794318 MsG0180004428.01.T01:CDS
AGTTCAGCCTCTTCTTGTAA+AGG 0.476651 1:+77790771 None:intergenic
TTTAGAGATACTTGGAGCTA+TGG 0.477423 1:-77794350 MsG0180004428.01.T01:CDS
TTGCAGCTTGTAATTCCATA+AGG 0.477471 1:+77784803 None:intergenic
TGAAGAACAAACCTCCTCAT+AGG 0.478258 1:-77788765 MsG0180004428.01.T01:CDS
TGGAAATTGTACAAATTTGG+AGG 0.478370 1:-77785368 MsG0180004428.01.T01:CDS
TCCTGAGATCATATTCTGTC+CGG 0.479009 1:+77785552 None:intergenic
TGCTCAAGATCATTGCCCGT+GGG 0.479090 1:+77790829 None:intergenic
TTTAAGTCTTTGCAAATTGG+TGG 0.479359 1:-77781890 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR
TTACAAGAAGAGGCTGAACT+TGG 0.479977 1:-77790768 MsG0180004428.01.T01:CDS
TTGGAGCAAATAGTCCACTT+TGG 0.480748 1:-77784937 MsG0180004428.01.T01:CDS
GCCTTACTGGAGAGCGCAAA+CGG 0.481001 1:-77790087 MsG0180004428.01.T01:CDS
AAATCTTTCTACAGTTGAGT+TGG 0.481210 1:-77784708 MsG0180004428.01.T01:CDS
CTCTCTATCAATCATCTCAA+TGG 0.482471 1:-77785049 MsG0180004428.01.T01:CDS
AGGATGATGCCGATGATGAT+TGG 0.484108 1:-77788900 MsG0180004428.01.T01:CDS
AAATCCGTGTCTGCAGTTGT+TGG 0.484182 1:-77783276 MsG0180004428.01.T01:CDS
CATTCACCTCCAAATAAACT+AGG 0.486551 1:-77783981 MsG0180004428.01.T01:CDS
GGAGGTCTACCTCAAGAGAT+AGG 0.486722 1:-77785532 MsG0180004428.01.T01:CDS
CTTCAAATTGATTAATGTTG+AGG 0.488175 1:+77785770 None:intergenic
TCCAAATACGTTATTGGGAA+AGG 0.489461 1:-77783759 MsG0180004428.01.T01:CDS
CCTCTTCGATAACAACTTGA+GGG 0.489500 1:-77784762 MsG0180004428.01.T01:CDS
GGGGATTTGCTGGTTATCGT+TGG 0.490592 1:+77790851 None:intergenic
TTAAGGAGGGAGTTAGGTGC+AGG 0.491523 1:-77794445 MsG0180004428.01.T01:CDS
GTTGTCGAAAAGATGCAATT+CGG 0.491749 1:+77785708 None:intergenic
ACCGGACTTTAGTGAGCTCA+TGG 0.491831 1:-77790800 MsG0180004428.01.T01:CDS
TTGAGGCGTTTAAGGAAATG+AGG 0.491957 1:-77788861 MsG0180004428.01.T01:CDS
CTCAATGGTACCATTCCTAC+TGG 0.492613 1:-77785034 MsG0180004428.01.T01:CDS
CTCATAGGTGGTCACAGGAA+TGG 0.492800 1:-77788750 MsG0180004428.01.T01:CDS
CTCTTCAACAACTCATTAAG+TGG 0.494146 1:-77784977 MsG0180004428.01.T01:CDS
TTTACCAACCTGTGGAGGAA+TGG 0.495980 1:+77784664 None:intergenic
CTTAGGGAAAACAATCTTCA+AGG 0.496396 1:-77785409 MsG0180004428.01.T01:CDS
GGTGAATGTGATGGTGACTT+TGG 0.497139 1:+77783996 None:intergenic
CTGAAGAAGTTGCAGTATGA+AGG 0.497200 1:-77789938 MsG0180004428.01.T01:CDS
ATAGGTGCAGCTATTATTAG+TGG 0.497867 1:-77783945 MsG0180004428.01.T01:CDS
TGTATACCTTAGCAGATGCT+TGG 0.498537 1:-77788810 MsG0180004428.01.T01:CDS
GTTAAGCGGTTTAATTTGAA+GGG 0.500541 1:+77795672 None:intergenic
CTTTACAACATTTGAGAACA+TGG 0.500631 1:-77793298 MsG0180004428.01.T01:CDS
ACCGTTTGCGCTCTCCAGTA+AGG 0.500952 1:+77790086 None:intergenic
CGATCTCTATTGCAACAGAA+AGG 0.501115 1:+77785218 None:intergenic
ACAAGTTTGTATAAATCAGA+AGG 0.501967 1:+77784731 None:intergenic
GGTGCTATACCTAAAGAGCT+TGG 0.503095 1:-77785388 MsG0180004428.01.T01:CDS
AGTGTTCTTGAAGGGTGCTA+AGG 0.503999 1:-77794133 MsG0180004428.01.T01:CDS
CAAGATGTCGCTGAGTTGCT+TGG 0.504075 1:-77792520 MsG0180004428.01.T01:CDS
TGCAATTTGCAAGGATGAGA+GGG 0.506861 1:+77784283 None:intergenic
ATGAGATTGATTATATTGCT+AGG 0.506892 1:-77790743 MsG0180004428.01.T01:intron
GGCAATAAAAGTTATGCAGA+AGG 0.507370 1:-77788716 MsG0180004428.01.T01:CDS
TGAAACAGATACGTTGAAGA+AGG 0.507790 1:-77790112 MsG0180004428.01.T01:intron
ATATCACGGTGAATAATCCT+AGG 0.507814 1:+77783387 None:intergenic
GCTTGAAGCATTAGAGGCTA+TGG 0.508398 1:-77790874 MsG0180004428.01.T01:CDS
TTGCATGGAATGAATCTCTC+AGG 0.508730 1:-77785913 MsG0180004428.01.T01:CDS
AGTTTATGATCTCCTAATTG+AGG 0.508876 1:-77794088 MsG0180004428.01.T01:CDS
ATCTCAGTTGATTCTTGACA+TGG 0.510125 1:+77782029 None:intergenic
ATTACTCAGGTCATACAATT+GGG 0.512330 1:-77787672 MsG0180004428.01.T01:intron
GGTAGAATTCCTTATGCACT+TGG 0.513783 1:-77784956 MsG0180004428.01.T01:CDS
CTGCATTTGAAAAGTTCCAT+AGG 0.514871 1:+77784515 None:intergenic
ATTGACAATCCTTCAAATGA+TGG 0.516346 1:-77787238 MsG0180004428.01.T01:CDS
TTTCAGATCAGACTTTGGAC+AGG 0.516371 1:-77787282 MsG0180004428.01.T01:CDS
CCATGAAACGACCTAGGACC+AGG 0.516577 1:+77795453 None:intergenic
CATCTAGTTCCCCAAGATCA+AGG 0.517160 1:+77787350 None:intergenic
AGGAAGGAAATACAGAGTAT+TGG 0.519082 1:-77789495 MsG0180004428.01.T01:CDS
TTCTTGCAGTACCGCTGCGT+TGG 0.520354 1:-77781845 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR
GGGTGCTAAGGGTGGCCTCA+GGG 0.521337 1:-77794121 MsG0180004428.01.T01:CDS
CAGATGCTTGGGGATGGACA+TGG 0.521819 1:-77788798 MsG0180004428.01.T01:CDS
TACTGGAGAGCGCAAACGGT+GGG 0.522806 1:-77790083 MsG0180004428.01.T01:CDS
GAATCAATTCCAAAGGAGCT+TGG 0.522942 1:-77785316 MsG0180004428.01.T01:CDS
AACCGCTTAACTCCTCGAAC+CGG 0.523138 1:-77795660 MsG0180004428.01.T01:CDS
ATATGAATTTATAAATACTC+TGG 0.523435 1:-77787862 MsG0180004428.01.T01:intron
AACTTGATGATGTTGAACTT+AGG 0.524502 1:-77784851 MsG0180004428.01.T01:CDS
TGAAGCAGATGAGGATGAGG+AGG 0.524641 1:-77789341 MsG0180004428.01.T01:CDS
GCCGGACAGAATATGATCTC+AGG 0.524960 1:-77785553 MsG0180004428.01.T01:CDS
GCGTCTAGAAGGAGAGTTGT+CGG 0.526476 1:+77782121 None:intergenic
ATGATTCCACACCTTGTGGT+TGG 0.526788 1:-77785987 MsG0180004428.01.T01:CDS
GAAAGCCGGCCAATTTCGAC+AGG 0.527311 1:+77785739 None:intergenic
CCTCTAGATCCTGATGCTGA+TGG 0.527945 1:-77790040 MsG0180004428.01.T01:CDS
GACAAATCAATCACCCAAAG+TGG 0.528178 1:+77784923 None:intergenic
GGAATTGTAGCTTTAGGGGA+TGG 0.529201 1:-77789917 MsG0180004428.01.T01:CDS
GAGAAGATACCTGCTCGAAC+CGG 0.529442 1:+77795636 None:intergenic
GATACCTGCTCGAACCGGTC+CGG 0.530718 1:+77795641 None:intergenic
CTGCAGACAACTCATAGTCT+TGG 0.531365 1:-77787567 MsG0180004428.01.T01:CDS
ATTATTATGGATAATGGTCA+TGG 0.532938 1:-77791030 MsG0180004428.01.T01:intron
TGCACCATGATTGCAAGCCT+AGG 0.534079 1:-77783404 MsG0180004428.01.T01:CDS
TTAACTCAAAATCGGATAAG+TGG 0.534348 1:-77785481 MsG0180004428.01.T01:CDS
TCCAAGAGCAATCCTAAACC+TGG 0.535018 1:+77783449 None:intergenic
AAACGTCGCTTCTTAGGAGA+AGG 0.535168 1:-77789472 MsG0180004428.01.T01:CDS
GGCTATTTCAGGTATTCCGC+AGG 0.537975 1:+77793320 None:intergenic
ATGGTTGTTATTGAGTTGAA+GGG 0.538610 1:+77784190 None:intergenic
ATTGATCTCACGCATAAAGC+TGG 0.539841 1:-77789518 MsG0180004428.01.T01:CDS
GTCATGTAGAGGAACTTGTT+CGG 0.540203 1:-77794182 MsG0180004428.01.T01:intron
TGTTGCCGTTGTGGCAGACT+TGG 0.541052 1:-77787323 MsG0180004428.01.T01:CDS
AGAGTGGTAAAGAAGGTAAA+GGG 0.541576 1:+77784087 None:intergenic
GTCAAGAAAGCTGAAGGTAG+AGG 0.542367 1:+77787594 None:intergenic
GACAAATACCCTCTAAACTT+GGG 0.542419 1:-77784232 MsG0180004428.01.T01:CDS
CATTCCTGTGACCACCTATG+AGG 0.543065 1:+77788751 None:intergenic
GTTATTGGGAAAGGTGGTAG+TGG 0.543203 1:-77783750 MsG0180004428.01.T01:CDS
ATTTCCTTCTTGATCAATGA+CGG 0.544402 1:+77787971 None:intergenic
CCTGGAATACCAATCAAGAC+TGG 0.544556 1:+77783467 None:intergenic
GTGGCAGACTTGGAGACCAC+GGG 0.546147 1:-77787313 MsG0180004428.01.T01:CDS
GAATTCCTGTCGAAATTGGC+CGG 0.547838 1:-77785744 MsG0180004428.01.T01:CDS
GCCTCTTCGATAACAACTTG+AGG 0.548228 1:-77784763 MsG0180004428.01.T01:CDS
GCAAGAATGTAAGCAAGAAG+TGG 0.549730 1:+77781861 None:intergenic
CTGCTCAAGATCATTGCCCG+TGG 0.549832 1:+77790828 None:intergenic
TGATACAGAAACATACAATT+GGG 0.550134 1:-77793045 MsG0180004428.01.T01:CDS
GTGTTCTTGAAGGGTGCTAA+GGG 0.550347 1:-77794132 MsG0180004428.01.T01:CDS
TGTGGGTGATAAAGCATGGT+TGG 0.550354 1:-77781728 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR
GTTGTTGAAGAGTTGAAGAG+AGG 0.550403 1:+77784988 None:intergenic
ATCCTGAAATCCAGTAGGAA+TGG 0.550904 1:+77785024 None:intergenic
GAGAACATGGAATATGGAGA+AGG 0.551432 1:-77793285 MsG0180004428.01.T01:intron
ATTCGGTTAAATTCGAAAGC+CGG 0.551757 1:+77785725 None:intergenic
GTGGAGTCTCTTGACTTGCA+TGG 0.551887 1:-77785928 MsG0180004428.01.T01:CDS
TGGATGGATGTCACTGATGC+AGG 0.551929 1:+77785954 None:intergenic
TCGTACGAGATGGAAGCTGC+TGG 0.553912 1:-77794024 MsG0180004428.01.T01:CDS
AAGATGCCTTGAGGAGAAGA+AGG 0.554455 1:-77789978 MsG0180004428.01.T01:CDS
CGAACCGGACCGGTTCGAGC+AGG 0.555306 1:-77795645 MsG0180004428.01.T01:CDS
CTTTACTTGAGAACAGTCTC+CGG 0.555521 1:-77795570 MsG0180004428.01.T01:intron
CTCAAGATCATTGCCCGTGG+GGG 0.555899 1:+77790831 None:intergenic
AGTTGACCTGCACAGAAAGT+AGG 0.557940 1:+77793971 None:intergenic
CTCAATAACAACCATTTGAG+TGG 0.559309 1:-77784182 MsG0180004428.01.T01:CDS
CCCTCAAGTTGTTATCGAAG+AGG 0.559770 1:+77784762 None:intergenic
TGCTTACAAGTTCTGGTCAA+CGG 0.561245 1:-77782073 MsG0180004428.01.T01:CDS
GGTGAAATACCAAAAGAACT+TGG 0.561445 1:-77785460 MsG0180004428.01.T01:CDS
TCCATGAGCTCACTAAAGTC+CGG 0.561703 1:+77790799 None:intergenic
AAAGAACTAAAAGTTGGCTA+TGG 0.561814 1:-77788026 MsG0180004428.01.T01:CDS
TCTTTATCAGAACAATCTTG+TGG 0.562468 1:-77785338 MsG0180004428.01.T01:CDS
CGTTGAAGAGGAAGAAGAAG+AGG 0.562849 1:-77789660 MsG0180004428.01.T01:intron
AGACTGATTAAGTTTCGAGC+CGG 0.562855 1:-77785571 MsG0180004428.01.T01:CDS
GATTGAACCTTTACAAGAAG+AGG 0.563858 1:-77790778 MsG0180004428.01.T01:CDS
ACCTTTCCAACCACAAGGTG+TGG 0.564767 1:+77785981 None:intergenic
TTTATATTAACCAATTCGAT+CGG 0.565282 1:+77785163 None:intergenic
CAAGAGACTCCACGACTGGA+TGG 0.566056 1:+77785938 None:intergenic
GTTGCAGGTGGATGAAGAGC+TGG 0.566712 1:-77789545 MsG0180004428.01.T01:intron
GAGATTCAATGCAATTTGCA+AGG 0.568521 1:+77784274 None:intergenic
AATGGAAATGCAATGGATGA+AGG 0.568839 1:-77789436 MsG0180004428.01.T01:CDS
CCTTAGCAGATGCTTGGGGA+TGG 0.569249 1:-77788804 MsG0180004428.01.T01:CDS
CTGGAAAAGGTCCAGAGAGT+TGG 0.569822 1:+77785686 None:intergenic
TATAGCTGCGCGCAAGATCA+CGG 0.570372 1:+77787623 None:intergenic
GAGAGGGAACCTAACTCTTG+TGG 0.571287 1:+77784299 None:intergenic
CAATCCTTCAAATGATGGCA+TGG 0.571720 1:-77787233 MsG0180004428.01.T01:CDS
ATGCAATTTGCAAGGATGAG+AGG 0.572459 1:+77784282 None:intergenic
TCTTATGGCTACATAGCCCC+TGG 0.572655 1:-77783252 MsG0180004428.01.T01:intron
ATAAGATTCCCAAGTTTAGA+GGG 0.572735 1:+77784224 None:intergenic
AAGAGTGGTAAAGAAGGTAA+AGG 0.573091 1:+77784086 None:intergenic
ACCTCCTCATAGGTGGTCAC+AGG 0.573478 1:-77788755 MsG0180004428.01.T01:CDS
ACGGCACAATCTCCGATAGT+TGG 0.574114 1:+77787642 None:intergenic
GATGGAAGCTGCTGGACGAA+TGG 0.574338 1:-77794016 MsG0180004428.01.T01:CDS
CTTTACAGGAATGAGTTGAC+AGG 0.574482 1:-77785265 MsG0180004428.01.T01:CDS
TTGGGTTCCTCCCGTTGAAG+AGG 0.576094 1:-77789672 MsG0180004428.01.T01:CDS
GGTAGACCTTCTTCTCCTCA+AGG 0.576489 1:+77789972 None:intergenic
TTCATCGCCATTAAGAGCAT+AGG 0.576915 1:+77795419 None:intergenic
ACGTGTAAAGAACTAAAAGT+TGG 0.577346 1:-77788032 MsG0180004428.01.T01:CDS
ATTTATATATTCAAACCCAA+TGG 0.578723 1:-77790017 MsG0180004428.01.T01:CDS
TTCTTGAAGGGTGCTAAGGG+TGG 0.579853 1:-77794129 MsG0180004428.01.T01:CDS
TTACATCCACCTATCTCTTG+AGG 0.580505 1:+77785523 None:intergenic
CTTAACTCCTCGAACCGGAC+CGG 0.580909 1:-77795655 MsG0180004428.01.T01:CDS
GTCTTGGCTATAAGTTTGGG+AGG 0.581497 1:-77787551 MsG0180004428.01.T01:intron
TGATCTTGAGCAGAAAATAC+CGG 0.581950 1:-77790818 MsG0180004428.01.T01:CDS
CAATGTAATCTTGAACATCA+GGG 0.582443 1:+77789401 None:intergenic
ACAGAATGCATTAAAGCCTA+AGG 0.584058 1:-77789831 MsG0180004428.01.T01:CDS
TTTGGAAATTTCGTACGAGA+TGG 0.584263 1:-77794034 MsG0180004428.01.T01:CDS
TCCACACCTTGTGGTTGGAA+AGG 0.585757 1:-77785982 MsG0180004428.01.T01:CDS
AGATTACATTGATGTTGTAG+GGG 0.587611 1:-77789389 MsG0180004428.01.T01:CDS
TCAAATGATTCCACACCTTG+TGG 0.587734 1:-77785991 MsG0180004428.01.T01:CDS
AAATACGTTATTGGGAAAGG+TGG 0.587986 1:-77783756 MsG0180004428.01.T01:CDS
TGGTGATAATGGAAATGCAA+TGG 0.588240 1:-77789443 MsG0180004428.01.T01:CDS
AGTTGACAGGAAATATTCCA+AGG 0.588375 1:-77785252 MsG0180004428.01.T01:CDS
GCAGATGGATTCGTTAAGGA+GGG 0.588702 1:-77794458 MsG0180004428.01.T01:intron
TTAAATTTACCAACCTGTGG+AGG 0.589412 1:+77784659 None:intergenic
TGCAGATGGATTCGTTAAGG+AGG 0.589694 1:-77794459 MsG0180004428.01.T01:intron
ATTGCTCTTGGAACTGCACA+AGG 0.589837 1:-77783438 MsG0180004428.01.T01:CDS
AACGCCTCAAATATGTCCAA+AGG 0.589906 1:+77788874 None:intergenic
CAAAGGAAACCAATCATCAT+CGG 0.590127 1:+77788891 None:intergenic
AATCGGTAACCTCTCTCAGT+TGG 0.591804 1:-77784579 MsG0180004428.01.T01:CDS
GGTCGTATGTTTACTTAAGG+TGG 0.591917 1:-77781665 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR
TTAAGCGGTTTAATTTGAAG+GGG 0.591930 1:+77795673 None:intergenic
TCCTGTGACCACCTATGAGG+AGG 0.592541 1:+77788754 None:intergenic
CCTTGATCTAACAAATGGAC+TGG 0.594222 1:+77782290 None:intergenic
CCATCAGCATCAGGATCTAG+AGG 0.596125 1:+77790040 None:intergenic
ACCAGCGTGTTCAGAAAGCA+AGG 0.597976 1:-77789724 MsG0180004428.01.T01:CDS
TGAAGGAATTGTAGCTTTAG+GGG 0.598298 1:-77789921 MsG0180004428.01.T01:CDS
GCACAAGGTTTACCAATCGA+TGG 0.599603 1:-77789764 MsG0180004428.01.T01:CDS
TCAAGTTAGATAATTGGCAA+AGG 0.599864 1:+77784867 None:intergenic
AGAATTGTCAAGAAAGCTGA+AGG 0.601296 1:+77787588 None:intergenic
TTGGGAGGGACACCAACTAT+CGG 0.601421 1:-77787654 MsG0180004428.01.T01:CDS
GGACCCATTCCTCCACAGGT+TGG 0.601883 1:-77784668 MsG0180004428.01.T01:CDS
TTAGGATCAAACAAACTCAC+CGG 0.601918 1:-77784833 MsG0180004428.01.T01:CDS
CCATCCCCAAGCATCTGCTA+AGG 0.602394 1:+77788804 None:intergenic
CTAGAGCTGACTCTTATGAC+AGG 0.602990 1:-77793007 MsG0180004428.01.T01:intron
TCAAGATCATTGCCCGTGGG+GGG 0.604541 1:+77790832 None:intergenic
TTCAGATCAGACTTTGGACA+GGG 0.605217 1:-77787281 MsG0180004428.01.T01:CDS
TATGTTTACTTAAGGTGGTG+TGG 0.605566 1:-77781660 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR
GGTAACATTCCCTCAGAAGT+CGG 0.605691 1:-77784380 MsG0180004428.01.T01:CDS
TCTTCTTCCTCTTCAACGGG+AGG 0.606461 1:+77789665 None:intergenic
AGATGCAGCTGTTGCCGTTG+TGG 0.606633 1:-77787332 MsG0180004428.01.T01:CDS
TCACGCATAAAGCTGGAGGA+AGG 0.607414 1:-77789511 MsG0180004428.01.T01:CDS
TGCTATAATTAAGAAATAGT+CGG 0.608921 1:-77788071 MsG0180004428.01.T01:intron
AGAGTTGAGTTTCCAAGACG+TGG 0.610814 1:-77783805 MsG0180004428.01.T01:CDS
GGTTTATCGATAACTTGTTG+CGG 0.612482 1:+77783867 None:intergenic
AACAGATACGTTGAAGAAGG+TGG 0.612521 1:-77790109 MsG0180004428.01.T01:intron
CATTTGTTAGATCAAGGTGG+TGG 0.613137 1:-77782284 MsG0180004428.01.T01:CDS
AGATGCTTGGGGATGGACAT+GGG 0.614332 1:-77788797 MsG0180004428.01.T01:CDS
AAACGGTGGGTGCCTCGAAG+TGG 0.614402 1:-77790070 MsG0180004428.01.T01:CDS
GCTAACAAAGTGTTCTTGAA+GGG 0.617170 1:-77794141 MsG0180004428.01.T01:CDS
GAATAAATCAATCTCGTGGT+CGG 0.617912 1:-77789700 MsG0180004428.01.T01:CDS
CATGAATTTGAAGCTCATGT+TGG 0.618116 1:-77783339 MsG0180004428.01.T01:CDS
CAGAAGTCGGAAAACTCTTG+CGG 0.619138 1:-77784367 MsG0180004428.01.T01:CDS
TCTTGTGGAATCAATTCCAA+AGG 0.619348 1:-77785323 MsG0180004428.01.T01:CDS
CAAATTAAATAGGCTACCTG+CGG 0.619906 1:-77793336 MsG0180004428.01.T01:intron
GTCCGGTTCGAGGAGTTAAG+CGG 0.620169 1:+77795658 None:intergenic
AAGTCAAGAGACTCCACGAC+TGG 0.620492 1:+77785934 None:intergenic
TGTAGGGGATGATGCAAAAG+AGG 0.623728 1:-77789374 MsG0180004428.01.T01:CDS
TGTGGCAGACTTGGAGACCA+CGG 0.624571 1:-77787314 MsG0180004428.01.T01:CDS
CTCAGGTCATACAATTGGGA+GGG 0.626997 1:-77787668 MsG0180004428.01.T01:intron
TTATTTGGAGGTGAATGTGA+TGG 0.627194 1:+77783987 None:intergenic
AGAACCAACAACTGCAGACA+CGG 0.627804 1:+77783272 None:intergenic
CAGTGACATCCATCCAGTCG+TGG 0.630992 1:-77785947 MsG0180004428.01.T01:CDS
TCTGGAGGGCTTAATACAGA+GGG 0.631258 1:-77786078 MsG0180004428.01.T01:CDS
GTGACTTTGGACAAGGGACA+AGG 0.632183 1:+77784009 None:intergenic
ACTCAGGTCATACAATTGGG+AGG 0.634186 1:-77787669 MsG0180004428.01.T01:intron
TTGCAGACCGCTTTATGACG+AGG 0.635470 1:-77787386 MsG0180004428.01.T01:intron
TGTTATTGGACTTGATATCA+CGG 0.636824 1:+77783373 None:intergenic
GGTCTCCAAGTCTGCCACAA+CGG 0.639161 1:+77787318 None:intergenic
TAAATGAGACCAACTGAGAG+AGG 0.639330 1:+77784570 None:intergenic
GCGGCCGTCATTGATCAAGA+AGG 0.643535 1:-77787975 MsG0180004428.01.T01:CDS
TGAAGATGATGAAGCAGATG+AGG 0.643572 1:-77789350 MsG0180004428.01.T01:CDS
TTACTGGAGAGCGCAAACGG+TGG 0.645299 1:-77790084 MsG0180004428.01.T01:CDS
GGCTAAAGAAAATCATAAAG+GGG 0.647563 1:-77789859 MsG0180004428.01.T01:CDS
GTGGTGGTGATCTTGTAACA+TGG 0.650184 1:-77782268 MsG0180004428.01.T01:CDS
GAGATGACCTCGTCATAAAG+CGG 0.653121 1:+77787379 None:intergenic
GGTAACAAAGGTCTTTGTGG+AGG 0.654552 1:-77784035 MsG0180004428.01.T01:CDS
GGTCTACCTCAAGAGATAGG+TGG 0.654595 1:-77785529 MsG0180004428.01.T01:CDS
ATTACGTTAGAGTGATTGAG+TGG 0.654982 1:-77789880 MsG0180004428.01.T01:CDS
ATCTGGAGGGCTTAATACAG+AGG 0.657950 1:-77786079 MsG0180004428.01.T01:CDS
TAAGGAGGGAGTTAGGTGCA+GGG 0.659596 1:-77794444 MsG0180004428.01.T01:CDS
AGGGTGATTTCTGCTAAACA+GGG 0.660207 1:-77787262 MsG0180004428.01.T01:CDS
GCTCAAGATCATTGCCCGTG+GGG 0.661048 1:+77790830 None:intergenic
CTCAGCGGCAATGACTTCGT+AGG 0.661523 1:-77784473 MsG0180004428.01.T01:CDS
AATGTAATCTTGAACATCAG+GGG 0.664266 1:+77789402 None:intergenic
CTTCAAACAAAGATGCCTTG+AGG 0.665499 1:-77789987 MsG0180004428.01.T01:CDS
TCAACGGGAGGAACCCAAAG+CGG 0.666771 1:+77789677 None:intergenic
AGAACAAACCTCCTCATAGG+TGG 0.666839 1:-77788762 MsG0180004428.01.T01:CDS
GATCTCACGCATAAAGCTGG+AGG 0.669561 1:-77789515 MsG0180004428.01.T01:CDS
GTCAAATCCTGAAATCCAGT+AGG 0.672376 1:+77785019 None:intergenic
TAATGGCGATGAACAAGCCG+CGG 0.672755 1:-77795409 MsG0180004428.01.T01:intron
GGACAGAATATGATCTCAGG+AGG 0.673204 1:-77785550 MsG0180004428.01.T01:CDS
GAACTCATTTGGAATCACGC+CGG 0.675321 1:+77785102 None:intergenic
AAGGAAGAACTAGAAGCACA+AGG 0.676402 1:-77789779 MsG0180004428.01.T01:CDS
ACCAAACCATGAAACGACCT+AGG 0.676899 1:+77795447 None:intergenic
GTTGACAGGAAATATTCCAA+GGG 0.679693 1:-77785251 MsG0180004428.01.T01:CDS
TGGTGGTGATCTTGTAACAT+GGG 0.679947 1:-77782267 MsG0180004428.01.T01:CDS
GAATGCATTAAAGCCTAAGG+CGG 0.680846 1:-77789828 MsG0180004428.01.T01:CDS
CTCTTCGATAACAACTTGAG+GGG 0.681293 1:-77784761 MsG0180004428.01.T01:CDS
TAAGTATGGTGATAATGCAG+CGG 0.682565 1:-77787994 MsG0180004428.01.T01:CDS
GTTTACACAAATCATCTCAG+TGG 0.687859 1:-77785625 MsG0180004428.01.T01:CDS
TGCATAATTCTCCAACGCAG+CGG 0.688272 1:+77781834 None:intergenic
TATACCTTAGCAGATGCTTG+GGG 0.690390 1:-77788808 MsG0180004428.01.T01:CDS
AGGAGAATAAATCAATCTCG+TGG 0.690806 1:-77789704 MsG0180004428.01.T01:CDS
TCATGAGATATATAACAACA+AGG 0.692209 1:+77783904 None:intergenic
GTGACACCTTTCCAACCACA+AGG 0.693966 1:+77785976 None:intergenic
GGGTGATTTCTGCTAAACAG+GGG 0.701939 1:-77787261 MsG0180004428.01.T01:CDS
CTATTGTGGGTGATAAAGCA+TGG 0.703087 1:-77781732 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR
GTCCATTTGTTAGATCAAGG+TGG 0.703316 1:-77782287 MsG0180004428.01.T01:CDS
ATCTGAAACTGAGATCCCCG+TGG 0.712322 1:+77787297 None:intergenic
TCCTTGCTTTCTGAACACGC+TGG 0.712889 1:+77789723 None:intergenic
TGTGATGGTGACTTTGGACA+AGG 0.713776 1:+77784002 None:intergenic
CTACAAAGACTTGATCTCAG+CGG 0.727364 1:-77784488 MsG0180004428.01.T01:CDS
GTGATGGTGACTTTGGACAA+GGG 0.741232 1:+77784003 None:intergenic
TGGCAGACTTGGAGACCACG+GGG 0.745351 1:-77787312 MsG0180004428.01.T01:CDS
AAACTTCATCAGTAGCCCTG+AGG 0.756054 1:+77794106 None:intergenic
CCAAAGTTGAGATTTCGGCG+CGG 0.795155 1:+77783616 None:intergenic

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAACATTTATAAAAATTTGA+TGG - Chr1:77790788-77790807 MsG0180004428.01.T01:CDS 10.0%
!! AAAGATATCAAAAAATTTAT+TGG + Chr1:77789800-77789819 None:intergenic 10.0%
!! ATACAAATAAAAATAATCAA+AGG + Chr1:77794508-77794527 None:intergenic 10.0%
!! ATTATAATAATTTCAATTTG+GGG + Chr1:77786657-77786676 None:intergenic 10.0%
!! CATTATAATAATTTCAATTT+GGG + Chr1:77786658-77786677 None:intergenic 10.0%
!! TCATTATAATAATTTCAATT+TGG + Chr1:77786659-77786678 None:intergenic 10.0%
!!! AATTAAATCTTTTATGTTAT+TGG - Chr1:77790859-77790878 MsG0180004428.01.T01:CDS 10.0%
!!! CTTTTATCAATTTTTATATT+AGG - Chr1:77790447-77790466 MsG0180004428.01.T01:intron 10.0%
!! AAAATATAAACTGTTGAATT+AGG + Chr1:77790719-77790738 None:intergenic 15.0%
!! AAATTATTATTCATAGAAAG+TGG - Chr1:77790961-77790980 MsG0180004428.01.T01:intron 15.0%
!! ACAGATAATTTACATTATTA+TGG - Chr1:77786202-77786221 MsG0180004428.01.T01:intron 15.0%
!! AGAAATATTGTGAAATTATA+TGG - Chr1:77793666-77793685 MsG0180004428.01.T01:intron 15.0%
!! ATATATACTACTATAATGAA+TGG + Chr1:77790473-77790492 None:intergenic 15.0%
!! ATATGAATTTATAAATACTC+TGG - Chr1:77789383-77789402 MsG0180004428.01.T01:CDS 15.0%
!! ATTAATAAATATTATGCAGA+TGG - Chr1:77782772-77782791 MsG0180004428.01.T01:intron 15.0%
!! ATTTACATTATTATGGATAA+TGG - Chr1:77786209-77786228 MsG0180004428.01.T01:intron 15.0%
!! CTTATTTACATAAGTTATTT+AGG - Chr1:77782345-77782364 MsG0180004428.01.T01:CDS 15.0%
!! GAATTCATTAGTATAAAATT+TGG - Chr1:77784865-77784884 MsG0180004428.01.T01:CDS 15.0%
!! GTAAATTTAAAAATTTGCAA+AGG - Chr1:77792599-77792618 MsG0180004428.01.T01:intron 15.0%
!! TAAAAATAGAAATATTGCAT+TGG + Chr1:77790379-77790398 None:intergenic 15.0%
!! TAATTGAGATATTCATAATT+TGG - Chr1:77789546-77789565 MsG0180004428.01.T01:intron 15.0%
!! TGAAATATCATAAAACTAAA+GGG - Chr1:77788822-77788841 MsG0180004428.01.T01:CDS 15.0%
!! TTACTTCTTTCAAATTAAAT+AGG - Chr1:77783899-77783918 MsG0180004428.01.T01:CDS 15.0%
!! TTATATATTAAAGATCAAGA+TGG + Chr1:77787656-77787675 None:intergenic 15.0%
!! TTTCATATCTCAATAAAAAT+GGG - Chr1:77783333-77783352 MsG0180004428.01.T01:CDS 15.0%
!!! AAAAAAAGTGTATCTAAAAT+TGG + Chr1:77794790-77794809 None:intergenic 15.0%
!!! AAGTTTGACTTTATTTTTTT+TGG - Chr1:77782208-77782227 MsG0180004428.01.T01:CDS 15.0%
!!! ACTTTCAAACTTTTTTATTT+TGG - Chr1:77786973-77786992 MsG0180004428.01.T01:intron 15.0%
!!! AGTTTGACTTTATTTTTTTT+GGG - Chr1:77782209-77782228 MsG0180004428.01.T01:CDS 15.0%
!!! CACATTTTTTTTTTTACTAT+AGG - Chr1:77786333-77786352 MsG0180004428.01.T01:intron 15.0%
!!! TAGCTTTTTTACTATTAAAA+TGG - Chr1:77783505-77783524 MsG0180004428.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTATTTTCATCTTTTTTTAC+TGG + Chr1:77788967-77788986 None:intergenic 15.0%
!!! TTTTTTTTTTTACTATAGGA+AGG - Chr1:77786337-77786356 MsG0180004428.01.T01:intron 15.0%
!! AAAAAAAAAAAAACTAGTCC+AGG + Chr1:77788567-77788586 None:intergenic 20.0%
!! AAATAAACTAGGAAAAAATC+TGG - Chr1:77793275-77793294 MsG0180004428.01.T01:intron 20.0%
!! AATTACGTATGAATATTGTT+CGG - Chr1:77784074-77784093 MsG0180004428.01.T01:CDS 20.0%
!! AATTGCTCAATAAATAGATT+GGG + Chr1:77783302-77783321 None:intergenic 20.0%
!! AGCAGATATATTGATATAAA+AGG - Chr1:77785305-77785324 MsG0180004428.01.T01:CDS 20.0%
!! ATAAGAAATACCAAATGTAA+TGG + Chr1:77788931-77788950 None:intergenic 20.0%
!! ATACAATGTGAAAAACAATA+TGG + Chr1:77783443-77783462 None:intergenic 20.0%
!! ATATCAAAAAATTTATTGGC+TGG + Chr1:77789796-77789815 None:intergenic 20.0%
!! ATCGAATTGGTTAATATAAA+AGG - Chr1:77792085-77792104 MsG0180004428.01.T01:intron 20.0%
!! ATGTTGAAATTCAATATTAG+AGG - Chr1:77794705-77794724 MsG0180004428.01.T01:intron 20.0%
!! ATTCAATTTAAGAAATCCAA+TGG + Chr1:77784636-77784655 None:intergenic 20.0%
!! ATTTATATATTCAAACCCAA+TGG - Chr1:77787228-77787247 MsG0180004428.01.T01:CDS 20.0%
!! CTGAAATATCATAAAACTAA+AGG - Chr1:77788821-77788840 MsG0180004428.01.T01:CDS 20.0%
!! GTAAAAAAAAAAATGTGTAC+TGG + Chr1:77786330-77786349 None:intergenic 20.0%
!! GTTTCATATCTCAATAAAAA+TGG - Chr1:77783332-77783351 MsG0180004428.01.T01:CDS 20.0%
!! TAAAATCTATACATTAAAGC+AGG + Chr1:77785667-77785686 None:intergenic 20.0%
!! TCTAGTATATATCAGTTAAT+GGG - Chr1:77787038-77787057 MsG0180004428.01.T01:intron 20.0%
!! TCTTATTGTCAAAATTCATT+AGG + Chr1:77794666-77794685 None:intergenic 20.0%
!! TGAAAAATCACAATCAAATA+TGG - Chr1:77794112-77794131 MsG0180004428.01.T01:CDS 20.0%
!! TGCTATAATTAAGAAATAGT+CGG - Chr1:77789174-77789193 MsG0180004428.01.T01:intron 20.0%
!! TTCAATTTAAGAAATCCAAT+GGG + Chr1:77784635-77784654 None:intergenic 20.0%
!! TTCATATCTCAATAAAAATG+GGG - Chr1:77783334-77783353 MsG0180004428.01.T01:CDS 20.0%
!! TTCTTAAATTGAATATTTCC+TGG - Chr1:77784642-77784661 MsG0180004428.01.T01:CDS 20.0%
!! TTGAGTAAAAGATAAATCAA+TGG + Chr1:77794532-77794551 None:intergenic 20.0%
!! TTTATATTAACCAATTCGAT+CGG + Chr1:77792085-77792104 None:intergenic 20.0%
!!! AAACTGTTTAAACTTTTTTG+TGG - Chr1:77788697-77788716 MsG0180004428.01.T01:intron 20.0%
!!! AAATCTTTTATGTTATTGGT+TGG - Chr1:77790863-77790882 MsG0180004428.01.T01:CDS 20.0%
!!! AGAATTTTATAGTATAACAC+TGG + Chr1:77786854-77786873 None:intergenic 20.0%
!!! AGATTTTTTCCTAGTTTATT+TGG + Chr1:77793276-77793295 None:intergenic 20.0%
!!! ATAAAATTTGGCCTTTTTAT+TGG - Chr1:77784877-77784896 MsG0180004428.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATACTTTTATTGCTTATTCT+TGG - Chr1:77786618-77786637 MsG0180004428.01.T01:intron 20.0%
!!! ATTTATATTTTGCATCTGTT+TGG - Chr1:77782418-77782437 MsG0180004428.01.T01:intron 20.0%
!!! CAGTTTTTATTTTATTCACA+TGG + Chr1:77788683-77788702 None:intergenic 20.0%
!!! CATTGTTGTATTTCTAATTA+AGG - Chr1:77794057-77794076 MsG0180004428.01.T01:CDS 20.0%
!!! CTATCAATAAAAGTTTTCTT+TGG - Chr1:77795729-77795748 MsG0180004428.01.T01:CDS 20.0%
!!! GAATTTTATAGTATAACACT+GGG + Chr1:77786853-77786872 None:intergenic 20.0%
!!! GTAAATTAAAGTATTCATAG+TGG + Chr1:77785401-77785420 None:intergenic 20.0%
!!! GTCATTTTTAGTTTTTATCA+AGG - Chr1:77786691-77786710 MsG0180004428.01.T01:intron 20.0%
!!! GTTTCATCAAATTATCTTTT+CGG - Chr1:77792700-77792719 MsG0180004428.01.T01:intron 20.0%
!!! TAATTAAGGTTTTAAACCAT+TGG - Chr1:77794071-77794090 MsG0180004428.01.T01:CDS 20.0%
!!! TATCAAAAAATTTATTGGCT+GGG + Chr1:77789795-77789814 None:intergenic 20.0%
!!! TATGATATTTTATGAGTACA+TGG - Chr1:77793713-77793732 MsG0180004428.01.T01:intron 20.0%
!!! TGAACAGATTTTTATTTTTC+AGG + Chr1:77784468-77784487 None:intergenic 20.0%
!!! TTATTTTTTTTGGGTATGTA+TGG - Chr1:77782218-77782237 MsG0180004428.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTGTCATTCAATTATTTTGT+TGG - Chr1:77792340-77792359 MsG0180004428.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTTAGAGAAAAATAGTTGT+GGG - Chr1:77795331-77795350 MsG0180004428.01.T01:intron 20.0%
!!! TTTTTAGAGAAAAATAGTTG+TGG - Chr1:77795330-77795349 MsG0180004428.01.T01:intron 20.0%
! AAACAAATTATGAGTGTGTT+TGG - Chr1:77783834-77783853 MsG0180004428.01.T01:CDS 25.0%
! AAATACAACAATGATTGTTG+AGG + Chr1:77794050-77794069 None:intergenic 25.0%
! AAATAGAGAAAATAGAGAAG+TGG + Chr1:77783994-77784013 None:intergenic 25.0%
! AAATGTGATGTATACAGTTA+TGG - Chr1:77794898-77794917 MsG0180004428.01.T01:intron 25.0%
! AAGATTACATTGATGTTGTA+GGG - Chr1:77787855-77787874 MsG0180004428.01.T01:intron 25.0%
! AAGTACATGTTAGAAACATT+TGG + Chr1:77793411-77793430 None:intergenic 25.0%
! AATAATAAACATCTTACGCA+TGG + Chr1:77784796-77784815 None:intergenic 25.0%
! AATATTAGTGACACTATTCT+TGG + Chr1:77786742-77786761 None:intergenic 25.0%
! AATGAATACAGCCAATAAAA+AGG + Chr1:77784891-77784910 None:intergenic 25.0%
! AATTATAGCTAGTCATTCAT+AGG - Chr1:77795303-77795322 MsG0180004428.01.T01:intron 25.0%
! AATTCCATAAGGAATATTTC+CGG + Chr1:77792434-77792453 None:intergenic 25.0%
! ACAAGTTTGTATAAATCAGA+AGG + Chr1:77792517-77792536 None:intergenic 25.0%
! ACATCATCAAGTTAGATAAT+TGG + Chr1:77792387-77792406 None:intergenic 25.0%
! ACTTGTATGATAAATGTTTG+TGG - Chr1:77782694-77782713 MsG0180004428.01.T01:intron 25.0%
! AGAAATATTGCATTGGAAAA+TGG + Chr1:77790372-77790391 None:intergenic 25.0%
! ATAACGCCTAAACTTAAATA+TGG - Chr1:77787672-77787691 MsG0180004428.01.T01:intron 25.0%
! ATAATAAACATCTTACGCAT+GGG + Chr1:77784795-77784814 None:intergenic 25.0%
! ATATCAGAATTTAAGAACCA+AGG + Chr1:77788636-77788655 None:intergenic 25.0%
! ATATCATACTTGATTCACTA+TGG + Chr1:77793701-77793720 None:intergenic 25.0%
! ATCTTGGTTTAACTCAAAAT+CGG - Chr1:77791756-77791775 MsG0180004428.01.T01:intron 25.0%
! ATGAGATTGATTATATTGCT+AGG - Chr1:77786502-77786521 MsG0180004428.01.T01:intron 25.0%
! ATGGTAAATGTAATTGTCTA+TGG - Chr1:77786234-77786253 MsG0180004428.01.T01:intron 25.0%
! ATGGTCAATAAGTATGTTAT+TGG + Chr1:77793889-77793908 None:intergenic 25.0%
! ATTACGTATGAATATTGTTC+GGG - Chr1:77784075-77784094 MsG0180004428.01.T01:CDS 25.0%
! ATTTAAATTCAGAAGTCATG+TGG - Chr1:77785638-77785657 MsG0180004428.01.T01:CDS 25.0%
! CAAATAAAAGCGAAAAACTA+GGG + Chr1:77790240-77790259 None:intergenic 25.0%
! CATGACGAATATCATAATTT+AGG + Chr1:77782925-77782944 None:intergenic 25.0%
! CTAAAGGATAGTTTATGAAA+CGG - Chr1:77781969-77781988 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR 25.0%
! CTCAACATTAATCAATTTGA+AGG - Chr1:77791476-77791495 MsG0180004428.01.T01:intron 25.0%
! CTTCAAATTGATTAATGTTG+AGG + Chr1:77791478-77791497 None:intergenic 25.0%
! GAACTTATAGAAACATCTTA+TGG - Chr1:77782104-77782123 MsG0180004428.01.T01:CDS 25.0%
! GAAGATATCGACAAATAAAA+AGG + Chr1:77784371-77784390 None:intergenic 25.0%
! GAATTGCTCAATAAATAGAT+TGG + Chr1:77783303-77783322 None:intergenic 25.0%
! GATACAATCATCTTAACAAT+TGG - Chr1:77791228-77791247 MsG0180004428.01.T01:intron 25.0%
! GCGTATCAGTTTATTTAAAA+TGG + Chr1:77783392-77783411 None:intergenic 25.0%
! GTAATATTATAACCTTCATG+CGG - Chr1:77790045-77790064 MsG0180004428.01.T01:CDS 25.0%
! GTCTAGTATATATCAGTTAA+TGG - Chr1:77787037-77787056 MsG0180004428.01.T01:intron 25.0%
! GTGTCAAACATATCTTATAT+TGG + Chr1:77782003-77782022 None:intergenic 25.0%
! TAAAAAACCCTTCAAATGAT+TGG - Chr1:77788009-77788028 MsG0180004428.01.T01:CDS 25.0%
! TAAAATAACAATCACTAGGT+AGG + Chr1:77786765-77786784 None:intergenic 25.0%
! TACTTAGAGTGGAATTAAAT+TGG + Chr1:77791027-77791046 None:intergenic 25.0%
! TATAAAAGATATCAGCAATG+AGG - Chr1:77785055-77785074 MsG0180004428.01.T01:CDS 25.0%
! TATAAGATATGTTTGACACT+TGG - Chr1:77782004-77782023 MsG0180004428.01.T01:exon 25.0%
! TATAGGATATCCATTACATT+TGG - Chr1:77788918-77788937 MsG0180004428.01.T01:intron 25.0%
! TATATTGTGAGAAAGATTCA+TGG - Chr1:77788858-77788877 MsG0180004428.01.T01:CDS 25.0%
! TATCACTACTATCTATGTAT+TGG - Chr1:77788884-77788903 MsG0180004428.01.T01:CDS 25.0%
! TATTATTAGTGGAGTTTCAT+TGG - Chr1:77793311-77793330 MsG0180004428.01.T01:CDS 25.0%
! TCAAATAAAAGCGAAAAACT+AGG + Chr1:77790241-77790260 None:intergenic 25.0%
! TCAATTTAAGAAATCCAATG+GGG + Chr1:77784634-77784653 None:intergenic 25.0%
! TCATATCTCAATAAAAATGG+GGG - Chr1:77783335-77783354 MsG0180004428.01.T01:CDS 25.0%
! TCATGAGATATATAACAACA+AGG + Chr1:77793344-77793363 None:intergenic 25.0%
! TCCTATTACACATTAATTCA+CGG + Chr1:77789109-77789128 None:intergenic 25.0%
! TGATACAGAAACATACAATT+GGG - Chr1:77784200-77784219 MsG0180004428.01.T01:CDS 25.0%
! TGATGGTTATGATTGATTAA+CGG - Chr1:77790805-77790824 MsG0180004428.01.T01:CDS 25.0%
! TGGCTAAAGAAAATCATAAA+GGG - Chr1:77787385-77787404 MsG0180004428.01.T01:intron 25.0%
! TGTGACTGTAAAATATGTTA+AGG - Chr1:77783705-77783724 MsG0180004428.01.T01:CDS 25.0%
! TTAGAAACATTTGGAGAATT+TGG + Chr1:77793402-77793421 None:intergenic 25.0%
! TTCATTCCAAATACGTTATT+GGG - Chr1:77793481-77793500 MsG0180004428.01.T01:intron 25.0%
! TTCTCATACAATGATCTTAT+AGG - Chr1:77793135-77793154 MsG0180004428.01.T01:intron 25.0%
! TTTCAAATTTCAATTAGCTG+TGG - Chr1:77783809-77783828 MsG0180004428.01.T01:CDS 25.0%
! TTTCATTCCAAATACGTTAT+TGG - Chr1:77793480-77793499 MsG0180004428.01.T01:intron 25.0%
!! AATAATTTCAATTTGGGGTT+TGG + Chr1:77786652-77786671 None:intergenic 25.0%
!! AGCTGAAAGAATTATTTTCA+TGG - Chr1:77786060-77786079 MsG0180004428.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTATTATGGATAATGGTCA+TGG - Chr1:77786215-77786234 MsG0180004428.01.T01:intron 25.0%
!! ATTTGACTTTGTTGTGAATT+TGG - Chr1:77790255-77790274 MsG0180004428.01.T01:intron 25.0%
!! ATTTTATGAGTACATGGAAA+AGG - Chr1:77793719-77793738 MsG0180004428.01.T01:intron 25.0%
!! CATGAACCATATTTAAGTTT+AGG + Chr1:77787681-77787700 None:intergenic 25.0%
!! GGAACAGTTTTTGTTAAAAA+AGG + Chr1:77794487-77794506 None:intergenic 25.0%
!! TAATCAAACTTGTTTACGTT+TGG - Chr1:77784691-77784710 MsG0180004428.01.T01:CDS 25.0%
!! TCTATCCACTACTATTATTT+TGG - Chr1:77790994-77791013 MsG0180004428.01.T01:intron 25.0%
!! TTATGTTGTTTATCCAAACA+AGG - Chr1:77782738-77782757 MsG0180004428.01.T01:intron 25.0%
!! TTTGAAATGATTAAATGCCT+TGG - Chr1:77788616-77788635 MsG0180004428.01.T01:intron 25.0%
!! TTTTATGAGTACATGGAAAA+GGG - Chr1:77793720-77793739 MsG0180004428.01.T01:intron 25.0%
!! TTTTTAAATTTACCAACCTG+TGG + Chr1:77792592-77792611 None:intergenic 25.0%
!!! AATCAGGATGATTTGTTTTT+TGG - Chr1:77788181-77788200 MsG0180004428.01.T01:intron 25.0%
!!! CAAAAACTTTTTCCACAAAA+GGG + Chr1:77785519-77785538 None:intergenic 25.0%
!!! CTAGGTATTGTTTTTATGTT+AGG - Chr1:77786520-77786539 MsG0180004428.01.T01:intron 25.0%
!!! CTTATTTTCATAAGCTCTAA+AGG - Chr1:77781953-77781972 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR 25.0%
!!! CTTATTTTTATAAGCTCTCT+AGG - Chr1:77782149-77782168 MsG0180004428.01.T01:CDS 25.0%
!!! GAATGAATAAACTCTGAAAT+CGG + Chr1:77788793-77788812 None:intergenic 25.0%
!!! GTGCAAATAGATTTTAATAG+TGG + Chr1:77794625-77794644 None:intergenic 25.0%
!!! GTTTTATTTAAGTTAGTGAC+TGG - Chr1:77783016-77783035 MsG0180004428.01.T01:intron 25.0%
!!! TTAGTACTTTTGAGACTATT+TGG - Chr1:77782079-77782098 MsG0180004428.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTCACTCAATGTTGTTTTAA+TGG + Chr1:77785122-77785141 None:intergenic 25.0%
!!! TTGCACATTTTTTAAGTTGT+AGG - Chr1:77794639-77794658 MsG0180004428.01.T01:intron 25.0%
!!! TTTATTTTATTCACATGGAG+AGG + Chr1:77788678-77788697 None:intergenic 25.0%
!!! TTTCTAGCTAGAAAAATTTC+AGG + Chr1:77786953-77786972 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTTTCCTAGTTTATTTGG+AGG + Chr1:77793273-77793292 None:intergenic 25.0%
AAACACAATTTACCATCACA+GGG + Chr1:77786788-77786807 None:intergenic 30.0%
AAACTGTTGAATTAGGCAAA+AGG + Chr1:77790712-77790731 None:intergenic 30.0%
AAAGAAAAAGAAGACACCAA+GGG + Chr1:77788130-77788149 None:intergenic 30.0%
AAAGAACTAAAAGTTGGCTA+TGG - Chr1:77789219-77789238 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
AAAGACTGAAGCATGTAAAA+GGG + Chr1:77783763-77783782 None:intergenic 30.0%
AAATCTTTCTACAGTTGAGT+TGG - Chr1:77792537-77792556 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
AAATGGAGATGCAGATATTT+AGG - Chr1:77783522-77783541 MsG0180004428.01.T01:CDS 30.0%
AAGGAAATGATCATATCTTG+TGG + Chr1:77786142-77786161 None:intergenic 30.0%
AATAAGATTCCCAAGTTTAG+AGG + Chr1:77793025-77793044 None:intergenic 30.0%
AATGCTTGTGAATGAATTGA+AGG - Chr1:77787447-77787466 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
AATGGAGATGCAGATATTTA+GGG - Chr1:77783523-77783542 MsG0180004428.01.T01:CDS 30.0%
AATGTAATCTTGAACATCAG+GGG + Chr1:77787846-77787865 None:intergenic 30.0%
ACAAAATGTTAGAGACTTTG+AGG - Chr1:77786007-77786026 MsG0180004428.01.T01:CDS 30.0%
ACATTTGAGAACATGGAATA+TGG - Chr1:77783954-77783973 MsG0180004428.01.T01:CDS 30.0%
ACGAAAATTCTACATATGGA+CGG - Chr1:77785846-77785865 MsG0180004428.01.T01:CDS 30.0%
ACGTGTAAAGAACTAAAAGT+TGG - Chr1:77789213-77789232 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
ACTAAACTGCCTAAAGAAAT+CGG - Chr1:77792649-77792668 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
ACTAAAGGTTTAGAGATACT+TGG - Chr1:77782887-77782906 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
ACTTGCCAAAATAATAGTAG+TGG + Chr1:77791002-77791021 None:intergenic 30.0%
AGATTACATTGATGTTGTAG+GGG - Chr1:77787856-77787875 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
AGGCTATATCAATCTAGAAA+AGG + Chr1:77784111-77784130 None:intergenic 30.0%
AGGGTAAAATAACAATCACT+AGG + Chr1:77786769-77786788 None:intergenic 30.0%
AGTGAATTTAAACATTACCG+CGG + Chr1:77781856-77781875 None:intergenic 30.0%
AGTTTATGATCTCCTAATTG+AGG - Chr1:77783157-77783176 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
ATAAGATTCCCAAGTTTAGA+GGG + Chr1:77793024-77793043 None:intergenic 30.0%
ATAATTTGGCTGTATTACTC+AGG - Chr1:77789560-77789579 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
ATGAGCGAAAACTCATTTAA+TGG - Chr1:77792916-77792935 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
ATGGTATACTTAGTAGTTGA+AGG - Chr1:77786079-77786098 MsG0180004428.01.T01:CDS 30.0%
ATTACTCAGGTCATACAATT+GGG - Chr1:77789573-77789592 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
ATTATGATATTCGTCATGCT+TGG - Chr1:77782927-77782946 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
ATTATTTGCATGTGCAAGTA+TGG - Chr1:77791088-77791107 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
ATTGAAAAACTTGACTGAGT+TGG - Chr1:77792171-77792190 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
ATTGACAATCCTTCAAATGA+TGG - Chr1:77790007-77790026 MsG0180004428.01.T01:CDS 30.0%
ATTTCAAACCAATTCAACAG+AGG + Chr1:77788604-77788623 None:intergenic 30.0%
ATTTCCTTCTTGATCAATGA+CGG + Chr1:77789277-77789296 None:intergenic 30.0%
CAACATCAATTTCATGTAGT+AGG + Chr1:77795065-77795084 None:intergenic 30.0%
CAAGATTACATTGATGTTGT+AGG - Chr1:77787854-77787873 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
CAATGTAATCTTGAACATCA+GGG + Chr1:77787847-77787866 None:intergenic 30.0%
CAGAAAGTAGGCAATTAAAA+TGG + Chr1:77783265-77783284 None:intergenic 30.0%
CATGCTTGGATAATTCTTAT+TGG - Chr1:77782941-77782960 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
CATGTTCTCAAATGTTGTAA+AGG + Chr1:77783949-77783968 None:intergenic 30.0%
CCTATTACACATTAATTCAC+GGG + Chr1:77789108-77789127 None:intergenic 30.0%
CCTGCATTAAATAGAAAGAA+AGG + Chr1:77787002-77787021 None:intergenic 30.0%
CCTTTCTTTCTATTTAATGC+AGG - Chr1:77786999-77787018 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
CTCAGCTATAATAAACTTTC+AGG - Chr1:77792991-77793010 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
CTGATACAGAAACATACAAT+TGG - Chr1:77784199-77784218 MsG0180004428.01.T01:CDS 30.0%
CTTATTTACATGAGCTCTTT+AGG - Chr1:77782555-77782574 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
CTTTACAACATTTGAGAACA+TGG - Chr1:77783947-77783966 MsG0180004428.01.T01:CDS 30.0%
GAAAGATTACCAATTTCATC+TGG + Chr1:77791581-77791600 None:intergenic 30.0%
GAAAGTCTGTTAAAAGAGTT+TGG + Chr1:77793096-77793115 None:intergenic 30.0%
GAATATTTCCTGGATTGAAT+TGG - Chr1:77784652-77784671 MsG0180004428.01.T01:CDS 30.0%
GAGCACTTAAAAACTTTGAA+GGG - Chr1:77785820-77785839 MsG0180004428.01.T01:CDS 30.0%
GATAATTGGCAAAGGTTATT+TGG + Chr1:77792373-77792392 None:intergenic 30.0%
GATCAAGAAGGAAATCTAAA+AGG - Chr1:77789282-77789301 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
GCACTTAACTTTAAGTCAAT+TGG - Chr1:77790650-77790669 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
GCTTGGAAATTGTACAAATT+TGG - Chr1:77791874-77791893 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
GGCTAAAGAAAATCATAAAG+GGG - Chr1:77787386-77787405 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
GGCTATATCAATCTAGAAAA+GGG + Chr1:77784110-77784129 None:intergenic 30.0%
GTGATATTGTGATATTATGC+AGG - Chr1:77795481-77795500 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
GTGGCTAAAGAAAATCATAA+AGG - Chr1:77787384-77787403 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
TAAAGAAAAAGAAGACACCA+AGG + Chr1:77788131-77788150 None:intergenic 30.0%
TAAAGAAGCTATACCTTTAC+AGG - Chr1:77791966-77791985 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
TACAGTTACAGTTACAGTTA+CGG - Chr1:77781531-77781550 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR 30.0%
TAGATATTTACGACCAAATC+CGG - Chr1:77786287-77786306 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
TAGGCAGTTTAGTTGTAAAA+TGG + Chr1:77792642-77792661 None:intergenic 30.0%
TAGTAGTTATCTAGTATCGT+AGG - Chr1:77782462-77782481 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
TATATAAATCCATCAGCATC+AGG + Chr1:77787217-77787236 None:intergenic 30.0%
TATGAAGGAATTGTAGCTTT+AGG - Chr1:77787322-77787341 MsG0180004428.01.T01:CDS 30.0%
TATGATAAGACTCTTGTAGT+TGG - Chr1:77789734-77789753 MsG0180004428.01.T01:CDS 30.0%
TATGGCGTAATGATTAAGTA+TGG - Chr1:77789237-77789256 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
TATTACTCAGGTCATACAAT+TGG - Chr1:77789572-77789591 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
TATTGGACTATTGGCAAAAT+AGG - Chr1:77786893-77786912 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
TCAAGTTAGATAATTGGCAA+AGG + Chr1:77792381-77792400 None:intergenic 30.0%
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TCATGTGTGACTTAAAAAAG+TGG - Chr1:77790751-77790770 MsG0180004428.01.T01:CDS 30.0%
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! TTTTCCCAAAGTTGAGATTT+CGG + Chr1:77793637-77793656 None:intergenic 30.0%
! TTTTGCCAATAGTCCAATAT+TGG + Chr1:77786892-77786911 None:intergenic 30.0%
!! AACTTGATGATGTTGAACTT+AGG - Chr1:77792394-77792413 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
!! AATGGTTGTTATTGAGTTGA+AGG + Chr1:77793059-77793078 None:intergenic 30.0%
!! ACTATCTATGTATTGGTTAG+TGG - Chr1:77788891-77788910 MsG0180004428.01.T01:CDS 30.0%
!! AGTTAAGCGGTTTAATTTGA+AGG + Chr1:77781577-77781596 None:intergenic 30.0%
!! ATCTCACTTTTATGTCCATA+AGG + Chr1:77791199-77791218 None:intergenic 30.0%
!! ATGGTTGTTATTGAGTTGAA+GGG + Chr1:77793058-77793077 None:intergenic 30.0%
!! CTTACATTTTGTTGCTTATG+TGG - Chr1:77786175-77786194 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
!! GACCATTTTAGCATATTGAA+TGG - Chr1:77784832-77784851 MsG0180004428.01.T01:CDS 30.0%
!! GCAAAAACTTTTTCCACAAA+AGG + Chr1:77785520-77785539 None:intergenic 30.0%
!! GGTTTTATACCAAAGGAAAT+TGG - Chr1:77791425-77791444 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
!! GTATCATTTTGTGTACTGAT+TGG - Chr1:77795676-77795695 MsG0180004428.01.T01:CDS 30.0%
!! GTTAAGCGGTTTAATTTGAA+GGG + Chr1:77781576-77781595 None:intergenic 30.0%
!! TATTGTTTTACTCCAACCTT+TGG - Chr1:77789025-77789044 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
!! TCTTCTTGACTTTTTAGAAG+TGG + Chr1:77788070-77788089 None:intergenic 30.0%
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!! TTAAGCGGTTTAATTTGAAG+GGG + Chr1:77781575-77781594 None:intergenic 30.0%
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!! TTTTGAAAGAGTGGTAAAGA+AGG + Chr1:77793168-77793187 None:intergenic 30.0%
!!! AAGTGTTTTGAGACAGATTT+AGG + Chr1:77791400-77791419 None:intergenic 30.0%
!!! ATTGTTATTTTACCCTGTGA+TGG - Chr1:77786773-77786792 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
!!! ATTTGTTTTTTGGACCTTGA+GGG - Chr1:77788191-77788210 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
!!! CTTCAAAGTTTTTAAGTGCT+CGG + Chr1:77785821-77785840 None:intergenic 30.0%
!!! GGTTTTAAGTCTTTGCAAAT+TGG - Chr1:77795352-77795371 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTCTCTGGTTTTATACCAA+AGG - Chr1:77791418-77791437 MsG0180004428.01.T01:intron 30.0%
AAAACATAACACAATCAGCC+AGG + Chr1:77783866-77783885 None:intergenic 35.0%
AAACTTCACTCAAACACTCA+CGG + Chr1:77788734-77788753 None:intergenic 35.0%
AAAGTAAAACTCCTCGTAGA+AGG + Chr1:77785699-77785718 None:intergenic 35.0%
AAATACGTTATTGGGAAAGG+TGG - Chr1:77793489-77793508 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
AAATGGGGGTAGAAACTATT+AGG - Chr1:77783349-77783368 MsG0180004428.01.T01:CDS 35.0%
AAGAAGAAACATCGTCAAAG+AGG - Chr1:77784989-77785008 MsG0180004428.01.T01:CDS 35.0%
AAGAAGATCAAGACGGAATA+TGG - Chr1:77788089-77788108 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
AAGAGTGGTAAAGAAGGTAA+AGG + Chr1:77793162-77793181 None:intergenic 35.0%
AAGTAGTTGTGTTAGCATGA+TGG - Chr1:77794550-77794569 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
AAGTGATGAATTTGACTGAC+TGG + Chr1:77790345-77790364 None:intergenic 35.0%
AAGTTAAGTGCAGTTTCAAC+TGG + Chr1:77790641-77790660 None:intergenic 35.0%
AATAAGCTGAACACAGCTTA+TGG + Chr1:77782331-77782350 None:intergenic 35.0%
AATGCACAAGGTTCTATTAG+AGG + Chr1:77791071-77791090 None:intergenic 35.0%
AATGGAAATGCAATGGATGA+AGG - Chr1:77787809-77787828 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
AATTACAAGCTGCAAGTCTT+TGG - Chr1:77792450-77792469 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
ACAGAATGCATTAAAGCCTA+AGG - Chr1:77787414-77787433 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
ACAGGTCGTATGTTTACTTA+AGG - Chr1:77795577-77795596 MsG0180004428.01.T01:CDS 35.0%
ACCTCAGATGTAGTTCATAA+TGG + Chr1:77784140-77784159 None:intergenic 35.0%
ACCTTTCCCAATAACGTATT+TGG + Chr1:77793490-77793509 None:intergenic 35.0%
ACTGATATATACTAGACCAG+CGG + Chr1:77787034-77787053 None:intergenic 35.0%
ACTTCTTCAGAAGCTTCTTA+TGG + Chr1:77787297-77787316 None:intergenic 35.0%
AGAAGAAACATCGTCAAAGA+GGG - Chr1:77784990-77785009 MsG0180004428.01.T01:CDS 35.0%
AGAATTGTCAAGAAAGCTGA+AGG + Chr1:77789660-77789679 None:intergenic 35.0%
AGACAACTTTACGCATAGTT+GGG + Chr1:77795149-77795168 None:intergenic 35.0%
AGACTATTTGGAAGAACTTG+AGG - Chr1:77782493-77782512 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
AGAGTGGTAAAGAAGGTAAA+GGG + Chr1:77793161-77793180 None:intergenic 35.0%
AGATATTTACGACCAAATCC+GGG - Chr1:77786288-77786307 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
AGATGGCAGACAAAAGAAAA+CGG + Chr1:77787639-77787658 None:intergenic 35.0%
AGATTACACTATGCTTGAAC+AGG + Chr1:77789490-77789509 None:intergenic 35.0%
AGGAAGGAAATACAGAGTAT+TGG - Chr1:77787750-77787769 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
AGGAGAATAAATCAATCTCG+TGG - Chr1:77787541-77787560 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
AGTACCCAATATTGGACTAT+TGG - Chr1:77786884-77786903 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
AGTGATGAATTTGACTGACT+GGG + Chr1:77790344-77790363 None:intergenic 35.0%
AGTTGACAGGAAATATTCCA+AGG - Chr1:77791993-77792012 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
ATAAGCTTAAACCCTTCTGA+TGG + Chr1:77790549-77790568 None:intergenic 35.0%
ATACATAACTTGAGAAACCC+CGG + Chr1:77781748-77781767 None:intergenic 35.0%
ATAGGTGCAGCTATTATTAG+TGG - Chr1:77793300-77793319 MsG0180004428.01.T01:CDS 35.0%
ATATCACGGTGAATAATCCT+AGG + Chr1:77793861-77793880 None:intergenic 35.0%
ATATCTTCACAGTCCATGTT+TGG - Chr1:77784383-77784402 MsG0180004428.01.T01:CDS 35.0%
ATCAAGATAGTTAGCTCCAA+TGG + Chr1:77794090-77794109 None:intergenic 35.0%
ATCCTCTTTCTTTGTACCTT+CGG - Chr1:77785880-77785899 MsG0180004428.01.T01:CDS 35.0%
ATCTCTGTAGTACCCAATAT+TGG - Chr1:77786876-77786895 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
ATGTATGATATGATAGCTGC+TGG - Chr1:77781762-77781781 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
ATGTGATGCAAATGTGATTG+AGG + Chr1:77794419-77794438 None:intergenic 35.0%
ATTAAACTATGCCAGGTGAT+AGG + Chr1:77784424-77784443 None:intergenic 35.0%
ATTACGTTAGAGTGATTGAG+TGG - Chr1:77787365-77787384 MsG0180004428.01.T01:CDS 35.0%
ATTCGGTTAAATTCGAAAGC+CGG + Chr1:77791523-77791542 None:intergenic 35.0%
ATTGAGTGAAGCTACAATAG+AGG - Chr1:77785132-77785151 MsG0180004428.01.T01:CDS 35.0%
CAAAGGAAACCAATCATCAT+CGG + Chr1:77788357-77788376 None:intergenic 35.0%
CAAATTAAATAGGCTACCTG+CGG - Chr1:77783909-77783928 MsG0180004428.01.T01:CDS 35.0%
CAACAAATCCAATTCAATCC+AGG + Chr1:77784663-77784682 None:intergenic 35.0%
CAACATCCTTGATGCAAAAT+TGG - Chr1:77795038-77795057 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
CAACATGAGCTTCAAATTCA+TGG + Chr1:77793908-77793927 None:intergenic 35.0%
CAAGAAGAAGAAGATCAAGA+CGG - Chr1:77788082-77788101 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
CATTCACCTCCAAATAAACT+AGG - Chr1:77793264-77793283 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
CCCGTGAATTAATGTGTAAT+AGG - Chr1:77789105-77789124 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
CGAAAATTCTACATATGGAC+GGG - Chr1:77785847-77785866 MsG0180004428.01.T01:CDS 35.0%
CGAGCACTTAAAAACTTTGA+AGG - Chr1:77785819-77785838 MsG0180004428.01.T01:CDS 35.0%
CGCCATTCAATATGCTAAAA+TGG + Chr1:77784837-77784856 None:intergenic 35.0%
CTAGGAAAAAATCTGGCTAT+AGG - Chr1:77793282-77793301 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
CTCAACTATTAAACTATGCC+AGG + Chr1:77784431-77784450 None:intergenic 35.0%
CTCAATAACAACCATTTGAG+TGG - Chr1:77793063-77793082 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
CTCAATCACTCTAACGTAAT+CGG + Chr1:77787365-77787384 None:intergenic 35.0%
CTCTAACTATACATTCCAGA+GGG - Chr1:77785224-77785243 MsG0180004428.01.T01:CDS 35.0%
CTCTCTATCAATCATCTCAA+TGG - Chr1:77792196-77792215 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
CTCTTCAACAACTCATTAAG+TGG - Chr1:77792268-77792287 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
CTCTTTCAGAACAAGTTAAC+CGG - Chr1:77792124-77792143 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
CTGCATTTGAAAAGTTCCAT+AGG + Chr1:77792733-77792752 None:intergenic 35.0%
CTGGCATAGTTTAATAGTTG+AGG - Chr1:77784429-77784448 MsG0180004428.01.T01:CDS 35.0%
CTTAGGGAAAACAATCTTCA+AGG - Chr1:77791836-77791855 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
CTTTGCAATCTTCCTCAATT+AGG + Chr1:77783172-77783191 None:intergenic 35.0%
GAAACACAATTTACCATCAC+AGG + Chr1:77786789-77786808 None:intergenic 35.0%
GAAAGACTGAAGCATGTAAA+AGG + Chr1:77783764-77783783 None:intergenic 35.0%
GAACAGTTTCCAATTTCCTT+TGG + Chr1:77791437-77791456 None:intergenic 35.0%
GAAGGCTTAAATGGTGATAA+TGG - Chr1:77787791-77787810 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
GAATAAATCAATCTCGTGGT+CGG - Chr1:77787545-77787564 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
GACAAATACCCTCTAAACTT+GGG - Chr1:77793013-77793032 MsG0180004428.01.T01:CDS 35.0%
GAGATTCAATGCAATTTGCA+AGG + Chr1:77792974-77792993 None:intergenic 35.0%
GATCTTTGCCATCTTCTATT+GGG - Chr1:77791642-77791661 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
GATTGAACCTTTACAAGAAG+AGG - Chr1:77786467-77786486 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
GCAACGAAAGTTTCATGAAT+TGG + Chr1:77782833-77782852 None:intergenic 35.0%
GGCAATAAAAGTTATGCAGA+AGG - Chr1:77788529-77788548 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
GGGCTTAAGGTTCATATTTA+TGG + Chr1:77785158-77785177 None:intergenic 35.0%
GGGTACGAAAATTCTACATA+TGG - Chr1:77785842-77785861 MsG0180004428.01.T01:CDS 35.0%
GGTGAAATACCAAAAGAACT+TGG - Chr1:77791785-77791804 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
GTACAATTTCCAAGCTCTTT+AGG + Chr1:77791869-77791888 None:intergenic 35.0%
GTCACACATGATTGATTGAT+TGG + Chr1:77790742-77790761 None:intergenic 35.0%
GTTGACAGGAAATATTCCAA+GGG - Chr1:77791994-77792013 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
GTTGTCGAAAAGATGCAATT+CGG + Chr1:77791540-77791559 None:intergenic 35.0%
GTTTACACAAATCATCTCAG+TGG - Chr1:77791620-77791639 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
GTTTAGATGATTGCTTACCA+GGG + Chr1:77794013-77794032 None:intergenic 35.0%
GTTTCCTTTGGACATATTTG+AGG - Chr1:77788367-77788386 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
GTTTCTATAGCTTTCGCATT+TGG - Chr1:77786804-77786823 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
TAAGCTTAAACCCTTCTGAT+GGG + Chr1:77790548-77790567 None:intergenic 35.0%
TAATTTGAAGGGGATGTAAG+TGG + Chr1:77781565-77781584 None:intergenic 35.0%
TACAGAGGGAAAATACCTTA+TGG - Chr1:77791181-77791200 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
TACATGGAAAAGGGAAGTTT+GGG - Chr1:77793729-77793748 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
TAGAGGTGAAGCTCATTAAT+GGG + Chr1:77791054-77791073 None:intergenic 35.0%
TATCGTGAAATTCAAGCTCA+AGG + Chr1:77788248-77788267 None:intergenic 35.0%
TATCTTCATCCAGTCTTGAT+TGG - Chr1:77793769-77793788 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
TATGTTTACTTAAGGTGGTG+TGG - Chr1:77795585-77795604 MsG0180004428.01.T01:CDS 35.0%
TCAGAATCAAACTCCAAACA+TGG + Chr1:77784399-77784418 None:intergenic 35.0%
TCATGAAACTTTCGTTGCAT+TGG - Chr1:77782835-77782854 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
TCCAAATACGTTATTGGGAA+AGG - Chr1:77793486-77793505 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
TCCAGTTAAACCACCTAATT+CGG + Chr1:77794170-77794189 None:intergenic 35.0%
TCCATTATGAACTACATCTG+AGG - Chr1:77784136-77784155 MsG0180004428.01.T01:CDS 35.0%
TCCTGTAAGGAAACAACTTT+AGG + Chr1:77788329-77788348 None:intergenic 35.0%
TCTCTAACTATACATTCCAG+AGG - Chr1:77785223-77785242 MsG0180004428.01.T01:CDS 35.0%
TCTTGTGGAATCAATTCCAA+AGG - Chr1:77791922-77791941 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
TGAAACAGATACGTTGAAGA+AGG - Chr1:77787133-77787152 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
TGATCTTGAGCAGAAAATAC+CGG - Chr1:77786427-77786446 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
TGGAGATCATTCTAATGCTT+TGG - Chr1:77783193-77783212 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
TGTAAAAGCTTGGAGAATCT+TGG - Chr1:77791740-77791759 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
TGTAGAGAGGATAAAGGAAA+AGG - Chr1:77787976-77787995 MsG0180004428.01.T01:CDS 35.0%
TGTTATCCTATGTCATGTAG+AGG - Chr1:77783052-77783071 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
TGTTTAGATGATTGCTTACC+AGG + Chr1:77794014-77794033 None:intergenic 35.0%
TTAAATTTACCAACCTGTGG+AGG + Chr1:77792589-77792608 None:intergenic 35.0%
TTAAGCTTCCCAATAGAAGA+TGG + Chr1:77791653-77791672 None:intergenic 35.0%
TTAGAGGTGAAGCTCATTAA+TGG + Chr1:77791055-77791074 None:intergenic 35.0%
TTAGGATCAAACAAACTCAC+CGG - Chr1:77792412-77792431 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
TTATTTGGAGGTGAATGTGA+TGG + Chr1:77793261-77793280 None:intergenic 35.0%
TTCAAAATTGCAAAGACTGC+TGG - Chr1:77790892-77790911 MsG0180004428.01.T01:CDS 35.0%
TTCAATGTGGTGAACTCATT+TGG + Chr1:77792157-77792176 None:intergenic 35.0%
TTCCACACATCTAAGTTTAG+TGG + Chr1:77790294-77790313 None:intergenic 35.0%
TTCCTGTAAGTAACTCCAAA+AGG + Chr1:77794930-77794949 None:intergenic 35.0%
TTCTTAGGAGAAGGCTTAAA+TGG - Chr1:77787782-77787801 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
TTCTTTACACATGTTCTGGT+TGG - Chr1:77788144-77788163 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
TTGATTGGTATTCCAGGTTT+AGG - Chr1:77793784-77793803 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
TTGCAGCTTGTAATTCCATA+AGG + Chr1:77792445-77792464 None:intergenic 35.0%
TTTAGAGATACTTGGAGCTA+TGG - Chr1:77782895-77782914 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
TTTAGATGATTGCTTACCAG+GGG + Chr1:77794012-77794031 None:intergenic 35.0%
TTTATTGCTTATTCTTGGCC+AGG - Chr1:77786623-77786642 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
TTTGGAAATTTCGTACGAGA+TGG - Chr1:77783211-77783230 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
! ACCTAAAGTTGTTTCCTTAC+AGG - Chr1:77788325-77788344 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
! ACTCTCATTTTCAGTCTATC+TGG - Chr1:77791149-77791168 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
! ACTGTTTTGCACGGAAAAAA+GGG - Chr1:77790072-77790091 MsG0180004428.01.T01:CDS 35.0%
! ATCAATAACTACGCCTTGTT+TGG + Chr1:77782754-77782773 None:intergenic 35.0%
! ATCGAACTAGTGAGATTTTC+AGG + Chr1:77794353-77794372 None:intergenic 35.0%
! ATCTCAGTTGATTCTTGACA+TGG + Chr1:77795219-77795238 None:intergenic 35.0%
! CATAATCTGTGTGAAAGTGT+TGG - Chr1:77785579-77785598 MsG0180004428.01.T01:CDS 35.0%
! CATAGTCTTGGCTATAAGTT+TGG - Chr1:77789690-77789709 MsG0180004428.01.T01:CDS 35.0%
! CATGAATTTGAAGCTCATGT+TGG - Chr1:77793906-77793925 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
! CCTTTTAACCAATGCCTTAA+GGG - Chr1:77790400-77790419 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
! CTATGGAACTTTTCAAATGC+AGG - Chr1:77792731-77792750 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
! CTCTCACATAACAACTTTTC+TGG - Chr1:77792844-77792863 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
! CTTGGAAACTCAACTCTTTT+GGG + Chr1:77793437-77793456 None:intergenic 35.0%
! GCAAATTTGAGATTGTTTGG+AGG - Chr1:77782273-77782292 MsG0180004428.01.T01:CDS 35.0%
! GCACTTAAAAACTTTGAAGG+GGG - Chr1:77785822-77785841 MsG0180004428.01.T01:CDS 35.0%
! GCTAACAAAGTGTTCTTGAA+GGG - Chr1:77783104-77783123 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
! GCTATTTCATCTTGTGTAGA+AGG - Chr1:77786109-77786128 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
! GGTGTGGCATGATATAATTT+TGG - Chr1:77795601-77795620 MsG0180004428.01.T01:CDS 35.0%
! GTTGTTTCCTATGCTCTTAA+TGG - Chr1:77781819-77781838 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
! GTTTTCGCTCATTTGTAGAT+CGG + Chr1:77792908-77792927 None:intergenic 35.0%
! TAACTTTTTGCTCAGTCCAA+AGG + Chr1:77789044-77789063 None:intergenic 35.0%
! TAAGTATGGTGATAATGCAG+CGG - Chr1:77789251-77789270 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
! TACTGTTTTGCACGGAAAAA+AGG - Chr1:77790071-77790090 MsG0180004428.01.T01:CDS 35.0%
! TCAATTGGTGTTCAACTTCA+TGG - Chr1:77790665-77790684 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
! TCATTTTCAGTCTATCTGGA+GGG - Chr1:77791153-77791172 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
! TCCTTTTAACCAATGCCTTA+AGG - Chr1:77790399-77790418 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
! TCTGGAATGTATAGTTAGAG+AGG + Chr1:77785224-77785243 None:intergenic 35.0%
! TCTTGGAAACTCAACTCTTT+TGG + Chr1:77793438-77793457 None:intergenic 35.0%
! TCTTTCCCTTGTTCTTTTTC+TGG + Chr1:77781647-77781666 None:intergenic 35.0%
! TGCTAACAAAGTGTTCTTGA+AGG - Chr1:77783103-77783122 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
! TGGCATGATATAATTTTGGG+TGG - Chr1:77795605-77795624 MsG0180004428.01.T01:CDS 35.0%
! TGGTTCAATCGATTCAACAA+TGG + Chr1:77794327-77794346 None:intergenic 35.0%
! TTATGCAGATGGATTCGTTA+AGG - Chr1:77782783-77782802 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
! TTGCATTGGTGAGATTGTTT+GGG - Chr1:77782849-77782868 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
! TTGGAATTTTGCCACTCAAA+TGG + Chr1:77793077-77793096 None:intergenic 35.0%
! TTTGAGGCATGCATTCTATA+GGG - Chr1:77786023-77786042 MsG0180004428.01.T01:CDS 35.0%
! TTTTCGGAGAATCTTCTTAC+AGG - Chr1:77792052-77792071 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
!! AATGCTAAAAAGTGCCCTTA+AGG + Chr1:77790417-77790436 None:intergenic 35.0%
!! AGTTAATGGGCTAATTGACT+CGG - Chr1:77787051-77787070 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
!! ATAGCAAGTACTGAAACAAG+TGG - Chr1:77782600-77782619 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
!! ATAGCTTCTTTAGGACTTCA+AGG + Chr1:77791958-77791977 None:intergenic 35.0%
!! CTCAGTCAAGTTTTTCAATG+TGG + Chr1:77792170-77792189 None:intergenic 35.0%
!! GGTTTATCGATAACTTGTTG+CGG + Chr1:77793381-77793400 None:intergenic 35.0%
!! TGAAGGAATTGTAGCTTTAG+GGG - Chr1:77787324-77787343 MsG0180004428.01.T01:CDS 35.0%
!! TGGTGATAATGGAAATGCAA+TGG - Chr1:77787802-77787821 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
!! TGGTTTGTTTAAATTCCGCT+AGG - Chr1:77784566-77784585 MsG0180004428.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTGGTTGGTGTTTTCAGTA+TGG + Chr1:77783658-77783677 None:intergenic 35.0%
!!! ACTTGCAATTTTTGGTGCTT+AGG - Chr1:77791819-77791838 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
!!! AGTGTTGAGTTTTGAAAGAG+TGG + Chr1:77793177-77793196 None:intergenic 35.0%
!!! CTTGCAATTTTTGGTGCTTA+GGG - Chr1:77791820-77791839 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
!!! GATTTGTTTTTTGGACCTTG+AGG - Chr1:77788190-77788209 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
!!! TCATGTTGGTGATTTTGGTT+TGG - Chr1:77793920-77793939 MsG0180004428.01.T01:intron 35.0%
AAAACAGTAGTACCGCATGA+AGG + Chr1:77790060-77790079 None:intergenic 40.0%
AAAAGCGAAAAACTAGGGAG+AGG + Chr1:77790235-77790254 None:intergenic 40.0%
AAACCACAATCCATGAAGCA+AGG + Chr1:77783682-77783701 None:intergenic 40.0%
AAACCATCATCAACTGAGAG+TGG + Chr1:77782995-77783014 None:intergenic 40.0%
AACAGATACGTTGAAGAAGG+TGG - Chr1:77787136-77787155 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
AACGCCTCAAATATGTCCAA+AGG + Chr1:77788374-77788393 None:intergenic 40.0%
AATATGGTTCATGTTGCAGG+TGG - Chr1:77787688-77787707 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
ACAATGCAAGTCATTCATGC+TGG + Chr1:77794741-77794760 None:intergenic 40.0%
ACCGAATTAGGTGGTTTAAC+TGG - Chr1:77794166-77794185 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
ACGCTGGTAAAGAACATTTC+TGG + Chr1:77787509-77787528 None:intergenic 40.0%
ACTTGTTCGGAACAAGCATT+TGG - Chr1:77783076-77783095 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
AGAAACCACCACTAGTAGTT+AGG + Chr1:77790927-77790946 None:intergenic 40.0%
AGAAGGCAAGTAACTTAACC+TGG - Chr1:77788546-77788565 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
AGACTGATTAAGTTTCGAGC+CGG - Chr1:77791674-77791693 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
AGATTGTTTGGAGGAACTTG+AGG - Chr1:77782282-77782301 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
AGCGAACCAGAAAAAGAACA+AGG - Chr1:77781638-77781657 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
AGCTAGCTGAAAACAGCTTA+TGG + Chr1:77782537-77782556 None:intergenic 40.0%
AGCTTACTTGTGAGACTCTT+TGG - Chr1:77781883-77781902 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
AGCTTCTTCAGACCATTACT+AGG + Chr1:77786930-77786949 None:intergenic 40.0%
AGGGTGATTTCTGCTAAACA+GGG - Chr1:77789983-77790002 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
AGTCATTCATGCTGGAGATT+TGG + Chr1:77794733-77794752 None:intergenic 40.0%
AGTTCAGCCTCTTCTTGTAA+AGG + Chr1:77786477-77786496 None:intergenic 40.0%
AGTTTGGGAGAGTTACTTCA+TGG - Chr1:77793744-77793763 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
ATAAAGCGGTCTGCAACATA+GGG + Chr1:77789855-77789874 None:intergenic 40.0%
ATATATACTAGACCAGCGGT+AGG + Chr1:77787030-77787049 None:intergenic 40.0%
ATCAAGACGGAATATGGTTG+AGG - Chr1:77788095-77788114 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
ATCCTGAAATCCAGTAGGAA+TGG + Chr1:77792224-77792243 None:intergenic 40.0%
ATGAATTTGACTGACTGGGT+TGG + Chr1:77790340-77790359 None:intergenic 40.0%
ATGCAATTTGCAAGGATGAG+AGG + Chr1:77792966-77792985 None:intergenic 40.0%
ATTGAGGAAGATTGCAAAGC+TGG - Chr1:77783173-77783192 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
ATTGATCTCACGCATAAAGC+TGG - Chr1:77787727-77787746 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
CAAAATCAGACCGAATTAGG+TGG - Chr1:77794157-77794176 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
CAAGCTTTCCTCTGTTGAAT+TGG - Chr1:77788593-77788612 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
CAAGTTCCTCTACATGACAT+AGG + Chr1:77783061-77783080 None:intergenic 40.0%
CAATCCATGAAGCAAGGATT+TGG + Chr1:77783676-77783695 None:intergenic 40.0%
CAATCCTTCAAATGATGGCA+TGG - Chr1:77790012-77790031 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
CACCACCTTGATCTAACAAA+TGG + Chr1:77794963-77794982 None:intergenic 40.0%
CACCACTAAACTTAGATGTG+TGG - Chr1:77790289-77790308 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
CATTCAAGAACACTGCATTG+AGG - Chr1:77784607-77784626 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
CCAAGATGTAGAGAGGATAA+AGG - Chr1:77787970-77787989 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
CCATCTTGACTTTAAGTCAG+TGG - Chr1:77790607-77790626 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
CCTCTTCGATAACAACTTGA+GGG - Chr1:77792483-77792502 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
CCTTGATCTAACAAATGGAC+TGG + Chr1:77794958-77794977 None:intergenic 40.0%
CCTTTATCCTCTCTACATCT+TGG + Chr1:77787973-77787992 None:intergenic 40.0%
CGATCTCTATTGCAACAGAA+AGG + Chr1:77792030-77792049 None:intergenic 40.0%
CTACAAAGACTTGATCTCAG+CGG - Chr1:77792757-77792776 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
CTATTTGCTCCAAGTGCATA+AGG + Chr1:77792301-77792320 None:intergenic 40.0%
CTCACCGGAAATATTCCTTA+TGG - Chr1:77792427-77792446 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
CTCAGTTTCAGATCAGACTT+TGG - Chr1:77789958-77789977 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
CTCTTCGATAACAACTTGAG+GGG - Chr1:77792484-77792503 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
CTCTTCTTCTTCCTCTTCAA+CGG + Chr1:77787587-77787606 None:intergenic 40.0%
CTGAAGAAGTTGCAGTATGA+AGG - Chr1:77787307-77787326 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
CTGGACTCCAATCATTTGAA+GGG + Chr1:77788019-77788038 None:intergenic 40.0%
CTGTCAACTCATTCCTGTAA+AGG + Chr1:77791982-77792001 None:intergenic 40.0%
CTGTCTCAAAACACTTTCTC+TGG - Chr1:77791404-77791423 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
CTTCAAACAAAGATGCCTTG+AGG - Chr1:77787258-77787277 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
CTTTACTTGAGAACAGTCTC+CGG - Chr1:77781675-77781694 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
GAATCAATTCCAAAGGAGCT+TGG - Chr1:77791929-77791948 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
GAATGCATTAAAGCCTAAGG+CGG - Chr1:77787417-77787436 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
GACAAAAGAAAACGGCATTC+AGG + Chr1:77787631-77787650 None:intergenic 40.0%
GACAAATCAATCACCCAAAG+TGG + Chr1:77792325-77792344 None:intergenic 40.0%
GACTTCGTAGGTACTTTATC+AGG - Chr1:77792784-77792803 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
GAGAACATGGAATATGGAGA+AGG - Chr1:77783960-77783979 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
GAGACAACTTTACGCATAGT+TGG + Chr1:77795150-77795169 None:intergenic 40.0%
GATAGGTGGATGTAAAAGCT+TGG - Chr1:77791730-77791749 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
GCAAGAATGTAAGCAAGAAG+TGG + Chr1:77795387-77795406 None:intergenic 40.0%
GCACATGCAAATAATGCACA+AGG + Chr1:77791083-77791102 None:intergenic 40.0%
GCATGACAGTTCTACAAACA+TGG + Chr1:77790202-77790221 None:intergenic 40.0%
GCGAACCAGAAAAAGAACAA+GGG - Chr1:77781639-77781658 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
GCTAAATTGTCGAACAACAG+TGG - Chr1:77784546-77784565 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
GGACAAATACCCTCTAAACT+TGG - Chr1:77793012-77793031 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
GGATCTTTGCCATCTTCTAT+TGG - Chr1:77791641-77791660 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
GGTACTTTATCAGGTGAGAT+AGG - Chr1:77792793-77792812 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
GGTAGAATTCCTTATGCACT+TGG - Chr1:77792289-77792308 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
GGTCGTATGTTTACTTAAGG+TGG - Chr1:77795580-77795599 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
GGTTACATTCCACAAGAGTT+AGG - Chr1:77792937-77792956 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
GTACATGGAAAAGGGAAGTT+TGG - Chr1:77793728-77793747 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
GTATACCTTAGCAGATGCTT+GGG - Chr1:77788436-77788455 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
GTCAAATCCTGAAATCCAGT+AGG + Chr1:77792229-77792248 None:intergenic 40.0%
GTCTCAATGCTTACAAGTTC+TGG - Chr1:77795165-77795184 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
GTCTCTAGTCGCAAATGTAA+TGG - Chr1:77783466-77783485 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
GTGAGATTGTTTGGGTCTAA+AGG - Chr1:77782857-77782876 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
GTGTTATCAGCTACTCTAGA+AGG - Chr1:77789339-77789358 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
GTTGAGGTATGATAATCCCT+TGG - Chr1:77788111-77788130 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
GTTGTTGAAGAGTTGAAGAG+AGG + Chr1:77792260-77792279 None:intergenic 40.0%
GTTTGAAGGAAGTCTCCATT+GGG + Chr1:77787246-77787265 None:intergenic 40.0%
TAAATGAGACCAACTGAGAG+AGG + Chr1:77792678-77792697 None:intergenic 40.0%
TAATCCTAGGCTTGCAATCA+TGG + Chr1:77793848-77793867 None:intergenic 40.0%
TAATTGCCTACTTTCTGTGC+AGG - Chr1:77783268-77783287 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
TACAAACATGGCAAGTTTCC+TGG + Chr1:77790190-77790209 None:intergenic 40.0%
TACCATTCCTACTGGATTTC+AGG - Chr1:77792219-77792238 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
TAGAGAACCAAGATGTAGAG+AGG - Chr1:77787963-77787982 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
TAGGTGGTTTAACTGGAAAC+TGG - Chr1:77794173-77794192 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
TAGTATAACACTGGGTCTAG+TGG + Chr1:77786845-77786864 None:intergenic 40.0%
TAGTGATACTTCCTTCTACG+AGG - Chr1:77785685-77785704 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
TATACCTTAGCAGATGCTTG+GGG - Chr1:77788437-77788456 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
TATATACTAGACCAGCGGTA+GGG + Chr1:77787029-77787048 None:intergenic 40.0%
TATTGGAAACGTCGCTTCTT+AGG - Chr1:77787767-77787786 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
TCAAATGATTCCACACCTTG+TGG - Chr1:77791254-77791273 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
TCAGACCATTACTAGGATTC+TGG + Chr1:77786923-77786942 None:intergenic 40.0%
TCCTCTTTCTTTGTACCTTC+GGG - Chr1:77785881-77785900 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
TCCTGAGATCATATTCTGTC+CGG + Chr1:77791696-77791715 None:intergenic 40.0%
TCTTAGCGCTTACAGTTGTT+GGG + Chr1:77785178-77785197 None:intergenic 40.0%
TCTTCTTCTTCCTCTTCAAC+GGG + Chr1:77787586-77787605 None:intergenic 40.0%
TGAAGAACAAACCTCCTCAT+AGG - Chr1:77788480-77788499 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
TGAAGATGATGAAGCAGATG+AGG - Chr1:77787895-77787914 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
TGACTTTAAGTCAGTGGATG+TGG - Chr1:77790613-77790632 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
TGCAATTTGCAAGGATGAGA+GGG + Chr1:77792965-77792984 None:intergenic 40.0%
TGGAGCAAATAGTCCACTTT+GGG - Chr1:77792309-77792328 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
TGTATACCTTAGCAGATGCT+TGG - Chr1:77788435-77788454 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
TGTTTGAAGGAAGTCTCCAT+TGG + Chr1:77787247-77787266 None:intergenic 40.0%
TTACAAGAAGAGGCTGAACT+TGG - Chr1:77786477-77786496 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
TTACATCCACCTATCTCTTG+AGG + Chr1:77791725-77791744 None:intergenic 40.0%
TTCAGATCAGACTTTGGACA+GGG - Chr1:77789964-77789983 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
TTCTCGTACTACACAGTACT+TGG + Chr1:77785784-77785803 None:intergenic 40.0%
TTGCATGGAATGAATCTCTC+AGG - Chr1:77791332-77791351 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
TTGGAGCAAATAGTCCACTT+TGG - Chr1:77792308-77792327 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
TTTCAGATCAGACTTTGGAC+AGG - Chr1:77789963-77789982 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
! AAGAGTTTTCCGACTTCTGA+GGG + Chr1:77792877-77792896 None:intergenic 40.0%
! AAGGAAGAACTAGAAGCACA+AGG - Chr1:77787466-77787485 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
! AATCCTTGCTTCATGGATTG+TGG - Chr1:77783676-77783695 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
! ATAGTCTTAGTAGCAGACTG+TGG + Chr1:77785271-77785290 None:intergenic 40.0%
! ATGAAAGGCTGAGTCTGTTT+TGG - Chr1:77788221-77788240 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
! CAGTTATGGAGTAGTCCTTT+TGG - Chr1:77794912-77794931 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
! CATTTGTTAGATCAAGGTGG+TGG - Chr1:77794961-77794980 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
! CCAGTCCATTTGTTAGATCA+AGG - Chr1:77794955-77794974 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
! CTCAAGGCATCTTTGTTTGA+AGG + Chr1:77787260-77787279 None:intergenic 40.0%
! CTCATTTTCAGTCTATCTGG+AGG - Chr1:77791152-77791171 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
! CTCTGTTAGCATAGTTCTGT+TGG - Chr1:77795459-77795478 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
! CTTTACAGGAATGAGTTGAC+AGG - Chr1:77791980-77791999 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
! GAGGAATGCTCACATTTTCA+AGG + Chr1:77785205-77785224 None:intergenic 40.0%
! GGACATATTTGAGGCGTTTA+AGG - Chr1:77788376-77788395 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
! GGACCTTTTCCAGATGAAAT+TGG - Chr1:77791569-77791588 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
! GGAGAATTATGCAGCTTGTT+TGG - Chr1:77795421-77795440 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
! GGCTTTAATGCATTCTGTTC+AGG + Chr1:77787412-77787431 None:intergenic 40.0%
! GTAGGTCCAATTTTGCATCA+AGG + Chr1:77795047-77795066 None:intergenic 40.0%
! GTCATGTAGAGGAACTTGTT+CGG - Chr1:77783063-77783082 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
! GTCCATTTGTTAGATCAAGG+TGG - Chr1:77794958-77794977 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
! GTTGCATTGGTGAGATTGTT+TGG - Chr1:77782848-77782867 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
! TACACATGTTCTGGTTGGTT+GGG - Chr1:77788149-77788168 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
! TCGGGAAGGTATGATTATAC+TGG - Chr1:77785911-77785930 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
! TCTACATCTTGGTTCTCTAC+TGG + Chr1:77787962-77787981 None:intergenic 40.0%
! TCTTTATCTTCCAGCATTGG+TGG - Chr1:77791356-77791375 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
! TGACATGCTTGAAGCATTAG+AGG - Chr1:77786365-77786384 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
! TGCTTACAAGTTCTGGTCAA+CGG - Chr1:77795172-77795191 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
! TGGAAACTGTTCAAGTTTGC+AGG - Chr1:77791445-77791464 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
! TGGTGGTGATCTTGTAACAT+GGG - Chr1:77794978-77794997 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
! TGTTGCCTTTTGCCAATTGT+TGG + Chr1:77784286-77784305 None:intergenic 40.0%
! TTACACATGTTCTGGTTGGT+TGG - Chr1:77788148-77788167 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
! TTCACTGGTTAGATTGATCC+CGG - Chr1:77794200-77794219 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
! TTCATCGCCATTAAGAGCAT+AGG + Chr1:77781829-77781848 None:intergenic 40.0%
! TTGAGGCGTTTAAGGAAATG+AGG - Chr1:77788384-77788403 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
! TTTTTGCTCAGTCCAAAGGT+TGG + Chr1:77789040-77789059 None:intergenic 40.0%
!! AAAAAGTGCCCTTAAGGCAT+TGG + Chr1:77790411-77790430 None:intergenic 40.0%
!! AATCTGTGTGAAAGTGTTGG+TGG - Chr1:77785582-77785601 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
!! ACATTTCTGGTTCCATCGAT+TGG + Chr1:77787496-77787515 None:intergenic 40.0%
!! ATTCCACTCTCAGTTGATGA+TGG - Chr1:77782989-77783008 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
!! CCACTGACTTAAAGTCAAGA+TGG + Chr1:77790610-77790629 None:intergenic 40.0%
!! CCCTTAAGGCATTGGTTAAA+AGG + Chr1:77790403-77790422 None:intergenic 40.0%
!! CGATGATGATTGGTTTCCTT+TGG - Chr1:77788355-77788374 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
!! CTTTGAGGCATGCATTCTAT+AGG - Chr1:77786022-77786041 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
!! GACTTTTTAGAAGTGGCAGA+GGG + Chr1:77788063-77788082 None:intergenic 40.0%
!! GAGAGGTTACCGATTTCTTT+AGG + Chr1:77792661-77792680 None:intergenic 40.0%
!! GTTAGTTTGTTGCATGTCCA+TGG - Chr1:77784260-77784279 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
!! TAATGGGAAGGTACTTAGAG+TGG + Chr1:77791038-77791057 None:intergenic 40.0%
!! TCTGCAGTTGTTGGTTCTTA+TGG - Chr1:77793978-77793997 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
!! TGACTTTTTAGAAGTGGCAG+AGG + Chr1:77788064-77788083 None:intergenic 40.0%
!! TTGAGCTACTTTCCCTTTTG+TGG - Chr1:77785504-77785523 MsG0180004428.01.T01:CDS 40.0%
!!! CTAGTGAGATTTTCAGGTCA+TGG + Chr1:77794347-77794366 None:intergenic 40.0%
!!! GAAGCTCATGTTGGTGATTT+TGG - Chr1:77793915-77793934 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
!!! GTCCTTTTGGAGTTACTTAC+AGG - Chr1:77794925-77794944 MsG0180004428.01.T01:intron 40.0%
AAACCCTTCTGATGGGAGTA+AGG + Chr1:77790541-77790560 None:intergenic 45.0%
AAACGTCGCTTCTTAGGAGA+AGG - Chr1:77787773-77787792 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
AAACTTCATCAGTAGCCCTG+AGG + Chr1:77783142-77783161 None:intergenic 45.0%
AAATCCGTGTCTGCAGTTGT+TGG - Chr1:77793969-77793988 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
AACCAGACTACAGTATGACC+GGG + Chr1:77794221-77794240 None:intergenic 45.0%
AAGATGCCTTGAGGAGAAGA+AGG - Chr1:77787267-77787286 MsG0180004428.01.T01:CDS 45.0%
AATCGGTAACCTCTCTCAGT+TGG - Chr1:77792666-77792685 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
ACAAAGAAAGAGGATCTCCG+TGG + Chr1:77785875-77785894 None:intergenic 45.0%
ACCAAACCATGAAACGACCT+AGG + Chr1:77781801-77781820 None:intergenic 45.0%
ACTCAGGTCATACAATTGGG+AGG - Chr1:77789576-77789595 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
ACTGTAGTCTGGTTGAAACG+CGG - Chr1:77794227-77794246 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
ACTTGCCTAACTACTAGTGG+TGG - Chr1:77790919-77790938 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
AGAACAAACCTCCTCATAGG+TGG - Chr1:77788483-77788502 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
AGAACCAACAACTGCAGACA+CGG + Chr1:77793976-77793995 None:intergenic 45.0%
AGAGTTGAGTTTCCAAGACG+TGG - Chr1:77793440-77793459 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
AGCTCTTCCTGAAACTGAAC+CGG + Chr1:77781697-77781716 None:intergenic 45.0%
AGGATGATGCCGATGATGAT+TGG - Chr1:77788345-77788364 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
AGGTGACATACCGATCGAAT+TGG - Chr1:77792072-77792091 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
AGTTGACCTGCACAGAAAGT+AGG + Chr1:77783277-77783296 None:intergenic 45.0%
ATCATCGGCATCATCCTGTA+AGG + Chr1:77788342-77788361 None:intergenic 45.0%
ATCTCTCTCTGCCTTGATCT+TGG - Chr1:77789884-77789903 MsG0180004428.01.T01:CDS 45.0%
ATCTGGAGGGCTTAATACAG+AGG - Chr1:77791166-77791185 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
ATGATTCCACACCTTGTGGT+TGG - Chr1:77791258-77791277 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
ATTGCTCTTGGAACTGCACA+AGG - Chr1:77793807-77793826 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
CAACCAGACTACAGTATGAC+CGG + Chr1:77794222-77794241 None:intergenic 45.0%
CAGAAGTCGGAAAACTCTTG+CGG - Chr1:77792878-77792897 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
CAGACTTGCCTAACTACTAG+TGG - Chr1:77790916-77790935 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
CAGGGTGATTTCTGCTAAAC+AGG - Chr1:77789982-77790001 MsG0180004428.01.T01:CDS 45.0%
CATAAAGCGGTCTGCAACAT+AGG + Chr1:77789856-77789875 None:intergenic 45.0%
CATGGCCAACAATTGGCAAA+AGG - Chr1:77784278-77784297 MsG0180004428.01.T01:CDS 45.0%
CCAACCAAATCCTTGCTTCA+TGG - Chr1:77783669-77783688 MsG0180004428.01.T01:CDS 45.0%
CCAGTCTTGATTGGTATTCC+AGG - Chr1:77793778-77793797 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
CCTGGAATACCAATCAAGAC+TGG + Chr1:77793781-77793800 None:intergenic 45.0%
CGTCAGAATCTTTCAACAGC+TGG + Chr1:77788038-77788057 None:intergenic 45.0%
CGTTGAAGAGGAAGAAGAAG+AGG - Chr1:77787585-77787604 MsG0180004428.01.T01:CDS 45.0%
CTCAATGGTACCATTCCTAC+TGG - Chr1:77792211-77792230 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
CTCAGGTCATACAATTGGGA+GGG - Chr1:77789577-77789596 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
CTCTTAGCGCTTACAGTTGT+TGG + Chr1:77785179-77785198 None:intergenic 45.0%
CTGCAACATAGGGGAAACAA+GGG + Chr1:77789845-77789864 None:intergenic 45.0%
CTGCAGACAACTCATAGTCT+TGG - Chr1:77789678-77789697 MsG0180004428.01.T01:CDS 45.0%
CTGGAAACTGGATAGTTCAC+TGG - Chr1:77794185-77794204 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
CTTGAGGGATCATGCATGAA+AGG - Chr1:77788206-77788225 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
CTTTCATGCATGATCCCTCA+AGG + Chr1:77788208-77788227 None:intergenic 45.0%
GAATTCCTGTCGAAATTGGC+CGG - Chr1:77791501-77791520 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
GAGATGACCTCGTCATAAAG+CGG + Chr1:77789869-77789888 None:intergenic 45.0%
GATTCGTTAAGGAGGGAGTT+AGG - Chr1:77782794-77782813 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
GCACAAGGTTTACCAATCGA+TGG - Chr1:77787481-77787500 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
GCAGACCAGAATCCTAGTAA+TGG - Chr1:77786915-77786934 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
GCATCCATGCCATCATTTGA+AGG + Chr1:77790019-77790038 None:intergenic 45.0%
GCCTCTTCGATAACAACTTG+AGG - Chr1:77792482-77792501 MsG0180004428.01.T01:CDS 45.0%
GCTGGACTCCAATCATTTGA+AGG + Chr1:77788020-77788039 None:intergenic 45.0%
GCTTACAGTTGTTGGGCTTA+AGG + Chr1:77785171-77785190 None:intergenic 45.0%
GGAAGTAGAACAGGTAGAAG+AGG - Chr1:77787928-77787947 MsG0180004428.01.T01:CDS 45.0%
GGACAGAATATGATCTCAGG+AGG - Chr1:77791695-77791714 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
GGCTCTTTATCTTCCAGCAT+TGG - Chr1:77791353-77791372 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
GGGTGATTTCTGCTAAACAG+GGG - Chr1:77789984-77790003 MsG0180004428.01.T01:CDS 45.0%
GGTAACAAAGGTCTTTGTGG+AGG - Chr1:77793210-77793229 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
GGTAACATTCCCTCAGAAGT+CGG - Chr1:77792865-77792884 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
GGTCGAATTCCTGTCGAAAT+TGG - Chr1:77791497-77791516 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
GGTGAAGCTCATTAATGGGA+AGG + Chr1:77791050-77791069 None:intergenic 45.0%
GTATTCATAGTGGCAGACAG+TGG + Chr1:77785391-77785410 None:intergenic 45.0%
GTCAAGAAAGCTGAAGGTAG+AGG + Chr1:77789654-77789673 None:intergenic 45.0%
GTCTTGGCTATAAGTTTGGG+AGG - Chr1:77789694-77789713 MsG0180004428.01.T01:CDS 45.0%
GTGAATCAAACCACCAATGC+TGG + Chr1:77791369-77791388 None:intergenic 45.0%
GTGTAGTACGAGAAGCTATC+AGG - Chr1:77785790-77785809 MsG0180004428.01.T01:CDS 45.0%
GTTATTGGGAAAGGTGGTAG+TGG - Chr1:77793495-77793514 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
TAAAGCGGTCTGCAACATAG+GGG + Chr1:77789854-77789873 None:intergenic 45.0%
TACGCATGGGTCTTCACATT+TGG + Chr1:77784782-77784801 None:intergenic 45.0%
TAGGCACTCGTGAGACTATT+TGG - Chr1:77782481-77782500 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
TCAAATGATGGCATGGATGC+TGG - Chr1:77790019-77790038 MsG0180004428.01.T01:CDS 45.0%
TCAAGGTTTCCAAGCTCCTT+TGG + Chr1:77791941-77791960 None:intergenic 45.0%
TCCAAGAGCAATCCTAAACC+TGG + Chr1:77793799-77793818 None:intergenic 45.0%
TCCACAGGGTTACTTAGTCA+CGG + Chr1:77785726-77785745 None:intergenic 45.0%
TCCATGAGCTCACTAAAGTC+CGG + Chr1:77786449-77786468 None:intergenic 45.0%
TCCTAGGTCGTTTCATGGTT+TGG - Chr1:77781797-77781816 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
TCGGGTAACAAAGGTCTTTG+TGG - Chr1:77793207-77793226 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
TCTCTCTCTGCCTTGATCTT+GGG - Chr1:77789885-77789904 MsG0180004428.01.T01:CDS 45.0%
TCTGCAACATAGGGGAAACA+AGG + Chr1:77789846-77789865 None:intergenic 45.0%
TCTGGAGGGCTTAATACAGA+GGG - Chr1:77791167-77791186 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
TGATGAAGCAGATGAGGATG+AGG - Chr1:77787901-77787920 MsG0180004428.01.T01:CDS 45.0%
TGATTCTGACTCCTATCACC+TGG - Chr1:77784410-77784429 MsG0180004428.01.T01:CDS 45.0%
TGCATAATTCTCCAACGCAG+CGG + Chr1:77795414-77795433 None:intergenic 45.0%
TGTAGGGGATGATGCAAAAG+AGG - Chr1:77787871-77787890 MsG0180004428.01.T01:CDS 45.0%
TTACCAACCTGTGGAGGAAT+GGG + Chr1:77792583-77792602 None:intergenic 45.0%
TTCAGGAAGAGCTCATGAAC+CGG - Chr1:77781704-77781723 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
TTGCATGTGCAAGTATGGAG+AGG - Chr1:77791093-77791112 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
TTTACCAACCTGTGGAGGAA+TGG + Chr1:77792584-77792603 None:intergenic 45.0%
TTTGCACGGAAAAAAGGGAG+TGG - Chr1:77790077-77790096 MsG0180004428.01.T01:CDS 45.0%
! AAACAAGGGAAAGCATGAGC+TGG + Chr1:77789831-77789850 None:intergenic 45.0%
! ACACATGTTCTGGTTGGTTG+GGG - Chr1:77788150-77788169 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
! ACTGGGTCTAGTGGACATAT+TGG + Chr1:77786836-77786855 None:intergenic 45.0%
! AGCATTTTACTAGCCGCCTT+AGG + Chr1:77787433-77787452 None:intergenic 45.0%
! ATAGCCTTACTCCCATCAGA+AGG - Chr1:77790534-77790553 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
! CAAGAGTTTTCCGACTTCTG+AGG + Chr1:77792878-77792897 None:intergenic 45.0%
! CATCTAGTTCCCCAAGATCA+AGG + Chr1:77789898-77789917 None:intergenic 45.0%
! CCATGAAGCAAGGATTTGGT+TGG + Chr1:77783672-77783691 None:intergenic 45.0%
! CCCTCAAGTTGTTATCGAAG+AGG + Chr1:77792486-77792505 None:intergenic 45.0%
! CTAGAGCTGACTCTTATGAC+AGG - Chr1:77784238-77784257 MsG0180004428.01.T01:CDS 45.0%
! CTTTTCGACAACCAACTCTC+TGG - Chr1:77791548-77791567 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
! CTTTTGCCAATTGTTGGCCA+TGG + Chr1:77784280-77784299 None:intergenic 45.0%
! GAACTCATTTGGAATCACGC+CGG + Chr1:77792146-77792165 None:intergenic 45.0%
! GCAGATGGATTCGTTAAGGA+GGG - Chr1:77782787-77782806 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
! GCTTGAAGCATTAGAGGCTA+TGG - Chr1:77786371-77786390 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
! GGTGAATGTGATGGTGACTT+TGG + Chr1:77793252-77793271 None:intergenic 45.0%
! GGTGCTATACCTAAAGAGCT+TGG - Chr1:77791857-77791876 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
! GTGATGGTGACTTTGGACAA+GGG + Chr1:77793245-77793264 None:intergenic 45.0%
! GTGGTGGTGATCTTGTAACA+TGG - Chr1:77794977-77794996 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
! TAGCCTTACTCCCATCAGAA+GGG - Chr1:77790535-77790554 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
! TCCAGGTTTAGGATTGCTCT+TGG - Chr1:77793795-77793814 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
! TGCAGATGGATTCGTTAAGG+AGG - Chr1:77782786-77782805 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
! TGCGGTACTACTGTTTTGCA+CGG - Chr1:77790063-77790082 MsG0180004428.01.T01:CDS 45.0%
! TGTCAAAGCATTCCCGGATT+TGG + Chr1:77786303-77786322 None:intergenic 45.0%
! TGTGATGGTGACTTTGGACA+AGG + Chr1:77793246-77793265 None:intergenic 45.0%
! TTATTGGCTGGGTTGGGTAA+CGG + Chr1:77789784-77789803 None:intergenic 45.0%
!! AGTGTTCTTGAAGGGTGCTA+AGG - Chr1:77783112-77783131 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
!! ATAGCTTTCGCATTTGGTGC+AGG - Chr1:77786810-77786829 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
!! GGAATTGTAGCTTTAGGGGA+TGG - Chr1:77787328-77787347 MsG0180004428.01.T01:CDS 45.0%
!! GTGTTCTTGAAGGGTGCTAA+GGG - Chr1:77783113-77783132 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
!! TGTGTGAAAGTGTTGGTGGT+GGG - Chr1:77785586-77785605 MsG0180004428.01.T01:CDS 45.0%
!!! AGAGGTGTTTTACCACTTCG+AGG + Chr1:77787190-77787209 None:intergenic 45.0%
!!! AGCTGCTTTTCGGGTAACAA+AGG - Chr1:77793198-77793217 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
!!! CTCAACACTCAGCTGCTTTT+CGG - Chr1:77793188-77793207 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
!!! CTTTTTCTGGTTCGCTTCTC+TGG + Chr1:77781634-77781653 None:intergenic 45.0%
!!! TCAACACTCAGCTGCTTTTC+GGG - Chr1:77793189-77793208 MsG0180004428.01.T01:intron 45.0%
!!! ATTATTTTAAATATTTTCTA+TGG - Chr1:77785477-77785496 MsG0180004428.01.T01:CDS 5.0%
AACCGCTTAACTCCTCGAAC+CGG - Chr1:77781585-77781604 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
AAGTCAAGAGACTCCACGAC+TGG + Chr1:77791314-77791333 None:intergenic 50.0%
ACAGTCTCCGGTTCAGTTTC+AGG - Chr1:77781687-77781706 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
ACCAGCGTGTTCAGAAAGCA+AGG - Chr1:77787521-77787540 MsG0180004428.01.T01:intron 50.0%
ACCGGACTTTAGTGAGCTCA+TGG - Chr1:77786445-77786464 MsG0180004428.01.T01:intron 50.0%
ACCTTTCCAACCACAAGGTG+TGG + Chr1:77791267-77791286 None:intergenic 50.0%
ACGGAGTGAGTCTCTAGACT+TGG + Chr1:77789765-77789784 None:intergenic 50.0%
ACGGCACAATCTCCGATAGT+TGG + Chr1:77789606-77789625 None:intergenic 50.0%
AGATGCTTGGGGATGGACAT+GGG - Chr1:77788448-77788467 MsG0180004428.01.T01:intron 50.0%
AGGTATGTGCTCACGATCTG+AGG + Chr1:77794467-77794486 None:intergenic 50.0%
ATAACCAGCAAATCCCCCCA+CGG - Chr1:77786400-77786419 MsG0180004428.01.T01:intron 50.0%
ATAGCAGCGCTATAGCCTAG+CGG + Chr1:77784584-77784603 None:intergenic 50.0%
ATCCCGGTCATACTGTAGTC+TGG - Chr1:77794216-77794235 MsG0180004428.01.T01:intron 50.0%
CAAGATGTCGCTGAGTTGCT+TGG - Chr1:77784725-77784744 MsG0180004428.01.T01:CDS 50.0%
CAGTAGCTTCAACCACGTCT+TGG + Chr1:77793455-77793474 None:intergenic 50.0%
CATTCCTGTGACCACCTATG+AGG + Chr1:77788497-77788516 None:intergenic 50.0%
CCAAAGTTGAGATTTCGGCG+CGG + Chr1:77793632-77793651 None:intergenic 50.0%
CCACAGGGTTACTTAGTCAC+GGG + Chr1:77785725-77785744 None:intergenic 50.0%
CCATCAGCATCAGGATCTAG+AGG + Chr1:77787208-77787227 None:intergenic 50.0%
CCTCTAGATCCTGATGCTGA+TGG - Chr1:77787205-77787224 MsG0180004428.01.T01:intron 50.0%
CGCGCCGAAATCTCAACTTT+GGG - Chr1:77793630-77793649 MsG0180004428.01.T01:intron 50.0%
CTACATATGGACGGGAACCA+CGG - Chr1:77785855-77785874 MsG0180004428.01.T01:CDS 50.0%
CTCATAGGTGGTCACAGGAA+TGG - Chr1:77788495-77788514 MsG0180004428.01.T01:intron 50.0%
CTCTCTCTGCCTTGATCTTG+GGG - Chr1:77789886-77789905 MsG0180004428.01.T01:CDS 50.0%
CTGGAAAAGGTCCAGAGAGT+TGG + Chr1:77791562-77791581 None:intergenic 50.0%
GACTAAGTAACCCTGTGGAC+TGG - Chr1:77785727-77785746 MsG0180004428.01.T01:CDS 50.0%
GAGAAGATACCTGCTCGAAC+CGG + Chr1:77781612-77781631 None:intergenic 50.0%
GAGAGGGAACCTAACTCTTG+TGG + Chr1:77792949-77792968 None:intergenic 50.0%
GATCTCACGCATAAAGCTGG+AGG - Chr1:77787730-77787749 MsG0180004428.01.T01:intron 50.0%
GCATGTCCATGGCCAACAAT+TGG - Chr1:77784271-77784290 MsG0180004428.01.T01:CDS 50.0%
GCCGGACAGAATATGATCTC+AGG - Chr1:77791692-77791711 MsG0180004428.01.T01:intron 50.0%
GCGTCTAGAAGGAGAGTTGT+CGG + Chr1:77795127-77795146 None:intergenic 50.0%
GGAGGTCTACCTCAAGAGAT+AGG - Chr1:77791713-77791732 MsG0180004428.01.T01:intron 50.0%
GGTAGACCTTCTTCTCCTCA+AGG + Chr1:77787276-77787295 None:intergenic 50.0%
GGTCTACCTCAAGAGATAGG+TGG - Chr1:77791716-77791735 MsG0180004428.01.T01:intron 50.0%
GTCTTTGTGTGGTTACCCTC+TGG + Chr1:77785242-77785261 None:intergenic 50.0%
GTGACACCTTTCCAACCACA+AGG + Chr1:77791272-77791291 None:intergenic 50.0%
GTGACTTTGGACAAGGGACA+AGG + Chr1:77793239-77793258 None:intergenic 50.0%
GTGTCTCTGTAGGCTGTTAG+TGG - Chr1:77785749-77785768 MsG0180004428.01.T01:CDS 50.0%
TAAGGAGGGAGTTAGGTGCA+GGG - Chr1:77782801-77782820 MsG0180004428.01.T01:intron 50.0%
TAATGGCGATGAACAAGCCG+CGG - Chr1:77781836-77781855 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
TACAGAGACACCAGTCCACA+GGG + Chr1:77785740-77785759 None:intergenic 50.0%
TAGTAGCAGACTGTGGTGTG+CGG + Chr1:77785264-77785283 None:intergenic 50.0%
TATAGCTGCGCGCAAGATCA+CGG + Chr1:77789625-77789644 None:intergenic 50.0%
TCACGCATAAAGCTGGAGGA+AGG - Chr1:77787734-77787753 MsG0180004428.01.T01:intron 50.0%
TCAGGAAGAGCTCATGAACC+GGG - Chr1:77781705-77781724 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
TCCACACCTTGTGGTTGGAA+AGG - Chr1:77791263-77791282 MsG0180004428.01.T01:intron 50.0%
TCCTTGCTTTCTGAACACGC+TGG + Chr1:77787525-77787544 None:intergenic 50.0%
TCTTATGGCTACATAGCCCC+TGG - Chr1:77793993-77794012 MsG0180004428.01.T01:CDS 50.0%
TCTTCTTCCTCTTCAACGGG+AGG + Chr1:77787583-77787602 None:intergenic 50.0%
TGAAGCAGATGAGGATGAGG+AGG - Chr1:77787904-77787923 MsG0180004428.01.T01:CDS 50.0%
TGAGGAGGAGGAAGTAGAAC+AGG - Chr1:77787919-77787938 MsG0180004428.01.T01:CDS 50.0%
TGCACCATGATTGCAAGCCT+AGG - Chr1:77793841-77793860 MsG0180004428.01.T01:intron 50.0%
TGCTCAAGATCATTGCCCGT+GGG + Chr1:77786419-77786438 None:intergenic 50.0%
TGGATGGATGTCACTGATGC+AGG + Chr1:77791294-77791313 None:intergenic 50.0%
TTAAGGAGGGAGTTAGGTGC+AGG - Chr1:77782800-77782819 MsG0180004428.01.T01:intron 50.0%
TTGCAGACCGCTTTATGACG+AGG - Chr1:77789859-77789878 MsG0180004428.01.T01:CDS 50.0%
TTGGGAGGGACACCAACTAT+CGG - Chr1:77789591-77789610 MsG0180004428.01.T01:intron 50.0%
! ACATGTTCTGGTTGGTTGGG+GGG - Chr1:77788152-77788171 MsG0180004428.01.T01:intron 50.0%
! ATCTGAAACTGAGATCCCCG+TGG + Chr1:77789951-77789970 None:intergenic 50.0%
! CACATGTTCTGGTTGGTTGG+GGG - Chr1:77788151-77788170 MsG0180004428.01.T01:intron 50.0%
! GCCCGAAGGTACAAAGAAAG+AGG + Chr1:77785885-77785904 None:intergenic 50.0%
! GGCTATTTCAGGTATTCCGC+AGG + Chr1:77783928-77783947 None:intergenic 50.0%
! GGCTTGTGTCAAAGCATTCC+CGG + Chr1:77786309-77786328 None:intergenic 50.0%
! GTTGAAGAAGGTGGCCTTAC+TGG - Chr1:77787145-77787164 MsG0180004428.01.T01:intron 50.0%
! TCTTTTCGGTCGAGTGCCTA+TGG - Chr1:77792714-77792733 MsG0180004428.01.T01:intron 50.0%
! TGTACCTTCGGGCATTGTGT+CGG - Chr1:77785892-77785911 MsG0180004428.01.T01:CDS 50.0%
! TTTGGGTGGTGTGTGCTGAT+AGG - Chr1:77795619-77795638 MsG0180004428.01.T01:CDS 50.0%
!! ATAGCTGCTGGTTTGAGTCC+TGG - Chr1:77781774-77781793 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
!! CAATTTGGGGTTTGGTGACC+TGG + Chr1:77786644-77786663 None:intergenic 50.0%
!! CTGTGTGAAAGTGTTGGTGG+TGG - Chr1:77785585-77785604 MsG0180004428.01.T01:CDS 50.0%
!! GAGTGTGTTTGGTCTTGACC+TGG - Chr1:77783845-77783864 MsG0180004428.01.T01:CDS 50.0%
!! GGGGATTTGCTGGTTATCGT+TGG + Chr1:77786397-77786416 None:intergenic 50.0%
!! GTGGAGTCTCTTGACTTGCA+TGG - Chr1:77791317-77791336 MsG0180004428.01.T01:intron 50.0%
!! GTGTGAAAGTGTTGGTGGTG+GGG - Chr1:77785587-77785606 MsG0180004428.01.T01:CDS 50.0%
!! TGACTGACTGGGTTGGTTGT+TGG + Chr1:77790333-77790352 None:intergenic 50.0%
!! TGTGAAAGTGTTGGTGGTGG+GGG - Chr1:77785588-77785607 MsG0180004428.01.T01:CDS 50.0%
!! TTCTTGAAGGGTGCTAAGGG+TGG - Chr1:77783116-77783135 MsG0180004428.01.T01:intron 50.0%
ACCGTTTGCGCTCTCCAGTA+AGG + Chr1:77787162-77787181 None:intergenic 55.0%
ACCTCCTCATAGGTGGTCAC+AGG - Chr1:77788490-77788509 MsG0180004428.01.T01:intron 55.0%
AGATGCAGCTGTTGCCGTTG+TGG - Chr1:77789913-77789932 MsG0180004428.01.T01:CDS 55.0%
AGCAGATGAGGATGAGGAGG+AGG - Chr1:77787907-77787926 MsG0180004428.01.T01:CDS 55.0%
CAAGAGACTCCACGACTGGA+TGG + Chr1:77791310-77791329 None:intergenic 55.0%
CACTGCATTGAGGTCCCCAT+TGG - Chr1:77784617-77784636 MsG0180004428.01.T01:CDS 55.0%
CAGATGCTTGGGGATGGACA+TGG - Chr1:77788447-77788466 MsG0180004428.01.T01:intron 55.0%
CAGTGACATCCATCCAGTCG+TGG - Chr1:77791298-77791317 MsG0180004428.01.T01:intron 55.0%
CATTGGACCCATTCCTCCAC+AGG - Chr1:77792573-77792592 MsG0180004428.01.T01:intron 55.0%
CCATCCCCAAGCATCTGCTA+AGG + Chr1:77788444-77788463 None:intergenic 55.0%
CCATGAAACGACCTAGGACC+AGG + Chr1:77781795-77781814 None:intergenic 55.0%
CCCGTGACTAAGTAACCCTG+TGG - Chr1:77785722-77785741 MsG0180004428.01.T01:CDS 55.0%
CCGCGCCGAAATCTCAACTT+TGG - Chr1:77793629-77793648 MsG0180004428.01.T01:intron 55.0%
CCTGGTCCTAGGTCGTTTCA+TGG - Chr1:77781792-77781811 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR 55.0%
CCTTAGCAGATGCTTGGGGA+TGG - Chr1:77788441-77788460 MsG0180004428.01.T01:intron 55.0%
CGCATAGTTGGGCGTCTAGA+AGG + Chr1:77795138-77795157 None:intergenic 55.0%
CGCTGAGTTGCTTGGCATGA+TGG - Chr1:77784733-77784752 MsG0180004428.01.T01:CDS 55.0%
CTACAGAGACACCAGTCCAC+AGG + Chr1:77785741-77785760 None:intergenic 55.0%
CTAGAACCGTGACTCAACCG+GGG - Chr1:77781728-77781747 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR 55.0%
CTCAAGATCATTGCCCGTGG+GGG + Chr1:77786417-77786436 None:intergenic 55.0%
CTCAGCGGCAATGACTTCGT+AGG - Chr1:77792772-77792791 MsG0180004428.01.T01:intron 55.0%
CTGCTCAAGATCATTGCCCG+TGG + Chr1:77786420-77786439 None:intergenic 55.0%
CTTAACTCCTCGAACCGGAC+CGG - Chr1:77781590-77781609 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR 55.0%
GAAAGCCGGCCAATTTCGAC+AGG + Chr1:77791509-77791528 None:intergenic 55.0%
GAGAAACCCCGGTTGAGTCA+CGG + Chr1:77781737-77781756 None:intergenic 55.0%
GATGGAAGCTGCTGGACGAA+TGG - Chr1:77783229-77783248 MsG0180004428.01.T01:intron 55.0%
GCGGCCGTCATTGATCAAGA+AGG - Chr1:77789270-77789289 MsG0180004428.01.T01:intron 55.0%
GCTAGAACCGTGACTCAACC+GGG - Chr1:77781727-77781746 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR 55.0%
GCTCAAGATCATTGCCCGTG+GGG + Chr1:77786418-77786437 None:intergenic 55.0%
GGCTAGAACCGTGACTCAAC+CGG - Chr1:77781726-77781745 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR 55.0%
GGTCTCCAAGTCTGCCACAA+CGG + Chr1:77789930-77789949 None:intergenic 55.0%
GTTGCAGGTGGATGAAGAGC+TGG - Chr1:77787700-77787719 MsG0180004428.01.T01:intron 55.0%
TAACCAGCAAATCCCCCCAC+GGG - Chr1:77786401-77786420 MsG0180004428.01.T01:intron 55.0%
TCAACGGGAGGAACCCAAAG+CGG + Chr1:77787571-77787590 None:intergenic 55.0%
TCAAGATCATTGCCCGTGGG+GGG + Chr1:77786416-77786435 None:intergenic 55.0%
TCCTGTGACCACCTATGAGG+AGG + Chr1:77788494-77788513 None:intergenic 55.0%
TCGTACGAGATGGAAGCTGC+TGG - Chr1:77783221-77783240 MsG0180004428.01.T01:intron 55.0%
TGTGGCAGACTTGGAGACCA+CGG - Chr1:77789931-77789950 MsG0180004428.01.T01:CDS 55.0%
TGTGGTGTGCGGTCTTTGTG+TGG + Chr1:77785253-77785272 None:intergenic 55.0%
TGTTGCCGTTGTGGCAGACT+TGG - Chr1:77789922-77789941 MsG0180004428.01.T01:CDS 55.0%
TTCTTGCAGTACCGCTGCGT+TGG - Chr1:77795400-77795419 MsG0180004428.01.T01:intron 55.0%
TTGGGTTCCTCCCGTTGAAG+AGG - Chr1:77787573-77787592 MsG0180004428.01.T01:CDS 55.0%
! CATGTTCTGGTTGGTTGGGG+GGG - Chr1:77788153-77788172 MsG0180004428.01.T01:intron 55.0%
! CTGGTTTGAGTCCTGGTCCT+AGG - Chr1:77781781-77781800 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR 55.0%
! GCCTTACTGGAGAGCGCAAA+CGG - Chr1:77787158-77787177 MsG0180004428.01.T01:intron 55.0%
! GTACCTTCGGGCATTGTGTC+GGG - Chr1:77785893-77785912 MsG0180004428.01.T01:CDS 55.0%
! GTCCGGTTCGAGGAGTTAAG+CGG + Chr1:77781590-77781609 None:intergenic 55.0%
! GTTGAGTCACGGTTCTAGCC+CGG + Chr1:77781726-77781745 None:intergenic 55.0%
! TACTGGAGAGCGCAAACGGT+GGG - Chr1:77787162-77787181 MsG0180004428.01.T01:intron 55.0%
! TTACTGGAGAGCGCAAACGG+TGG - Chr1:77787161-77787180 MsG0180004428.01.T01:intron 55.0%
!! CTGTGGACTGGTGTCTCTGT+AGG - Chr1:77785739-77785758 MsG0180004428.01.T01:CDS 55.0%
!! GGTGGGGGAGTGTTAAGGTT+AGG - Chr1:77785603-77785622 MsG0180004428.01.T01:CDS 55.0%
!! TTGGTGGTGGGGGAGTGTTA+AGG - Chr1:77785598-77785617 MsG0180004428.01.T01:CDS 55.0%
AAACGGTGGGTGCCTCGAAG+TGG - Chr1:77787175-77787194 MsG0180004428.01.T01:intron 60.0%
AATCTCGTGGTCGGCCGCTT+TGG - Chr1:77787554-77787573 MsG0180004428.01.T01:CDS 60.0%
CTTCCCGACACAATGCCCGA+AGG + Chr1:77785899-77785918 None:intergenic 60.0%
GATACCTGCTCGAACCGGTC+CGG + Chr1:77781607-77781626 None:intergenic 60.0%
GGACCCATTCCTCCACAGGT+TGG - Chr1:77792577-77792596 MsG0180004428.01.T01:intron 60.0%
GGTTGGGGGGGTTGACAATC+AGG - Chr1:77788165-77788184 MsG0180004428.01.T01:intron 60.0%
GTGGCAGACTTGGAGACCAC+GGG - Chr1:77789932-77789951 MsG0180004428.01.T01:CDS 60.0%
TGGCAGACTTGGAGACCACG+GGG - Chr1:77789933-77789952 MsG0180004428.01.T01:CDS 60.0%
! ATCTCGTGGTCGGCCGCTTT+GGG - Chr1:77787555-77787574 MsG0180004428.01.T01:CDS 60.0%
! CTTCGGGCATTGTGTCGGGA+AGG - Chr1:77785897-77785916 MsG0180004428.01.T01:CDS 60.0%
ATGCAGGCACACCCTACCGC+TGG - Chr1:77787015-77787034 MsG0180004428.01.T01:intron 65.0%
GGGTGCTAAGGGTGGCCTCA+GGG - Chr1:77783124-77783143 MsG0180004428.01.T01:intron 65.0%
TTGCCCGTGGGGGGATTTGC+TGG + Chr1:77786407-77786426 None:intergenic 65.0%
! AGGGTGCTAAGGGTGGCCTC+AGG - Chr1:77783123-77783142 MsG0180004428.01.T01:intron 65.0%
! GCTCGAACCGGTCCGGTTCG+AGG + Chr1:77781600-77781619 None:intergenic 70.0%
!! CGAACCGGACCGGTTCGAGC+AGG - Chr1:77781600-77781619 MsG0180004428.01.T01:three_prime_UTR 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 77781519 77795748 77781519 ID=MsG0180004428.01;Name=MsG0180004428.01
Chr1 mRNA 77781519 77795748 77781519 ID=MsG0180004428.01.T01;Parent=MsG0180004428.01;Name=MsG0180004428.01.T01;_AED=0.37;_eAED=0.40;_QI=0|0.56|0.52|1|1|1|17|497|1912
Chr1 exon 77781519 77782398 77781519 ID=MsG0180004428.01.T01:exon:15014;Parent=MsG0180004428.01.T01
Chr1 exon 77783253 77786104 77783253 ID=MsG0180004428.01.T01:exon:15013;Parent=MsG0180004428.01.T01
Chr1 exon 77787223 77787402 77787223 ID=MsG0180004428.01.T01:exon:15012;Parent=MsG0180004428.01.T01
Chr1 exon 77787552 77787685 77787552 ID=MsG0180004428.01.T01:exon:15011;Parent=MsG0180004428.01.T01
Chr1 exon 77787863 77788080 77787863 ID=MsG0180004428.01.T01:exon:15010;Parent=MsG0180004428.01.T01
Chr1 exon 77788713 77788920 77788713 ID=MsG0180004428.01.T01:exon:15009;Parent=MsG0180004428.01.T01
Chr1 exon 77789327 77789560 77789327 ID=MsG0180004428.01.T01:exon:15008;Parent=MsG0180004428.01.T01
Chr1 exon 77789661 77790126 77789661 ID=MsG0180004428.01.T01:exon:15007;Parent=MsG0180004428.01.T01
Chr1 exon 77790744 77790912 77790744 ID=MsG0180004428.01.T01:exon:15006;Parent=MsG0180004428.01.T01
Chr1 exon 77791031 77791065 77791031 ID=MsG0180004428.01.T01:exon:15005;Parent=MsG0180004428.01.T01
Chr1 exon 77792469 77792546 77792469 ID=MsG0180004428.01.T01:exon:15004;Parent=MsG0180004428.01.T01
Chr1 exon 77793008 77793080 77793008 ID=MsG0180004428.01.T01:exon:15003;Parent=MsG0180004428.01.T01
Chr1 exon 77793286 77793346 77793286 ID=MsG0180004428.01.T01:exon:15002;Parent=MsG0180004428.01.T01
Chr1 exon 77793978 77794195 77793978 ID=MsG0180004428.01.T01:exon:15001;Parent=MsG0180004428.01.T01
Chr1 exon 77794305 77794476 77794305 ID=MsG0180004428.01.T01:exon:15000;Parent=MsG0180004428.01.T01
Chr1 exon 77795410 77795489 77795410 ID=MsG0180004428.01.T01:exon:14999;Parent=MsG0180004428.01.T01
Chr1 exon 77795571 77795748 77795571 ID=MsG0180004428.01.T01:exon:14998;Parent=MsG0180004428.01.T01
Chr1 CDS 77795571 77795748 77795571 ID=MsG0180004428.01.T01:cds;Parent=MsG0180004428.01.T01
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