AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780040076.01

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MsG0780040076.01.T01 AT1G17240 28.643 199 106 2 97 260 470 667 2.71e-13 74.3
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MsG0780040076.01.T01 AT2G34930 25.750 567 311 20 195 675 114 656 1.32e-12 72.0
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MsG0780040076.01.T01 AT3G56370 30.114 528 280 11 149 675 74 513 4.24e-41 163
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MsG0780040076.01.T01 AT3G11010 35.119 168 108 1 509 675 28 195 1.55e-19 94.7
MsG0780040076.01.T01 AT3G11010 34.946 186 115 3 491 675 111 291 6.27e-18 89.4
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MsG0780040076.01.T01 AT1G71390 29.487 546 335 13 86 627 193 692 1.97e-45 175
MsG0780040076.01.T01 AT1G71390 26.726 782 389 23 61 747 69 761 2.30e-38 154
MsG0780040076.01.T01 AT1G71390 29.487 546 335 13 86 627 188 687 2.96e-45 175
MsG0780040076.01.T01 AT1G71390 26.726 782 389 23 61 747 64 756 4.47e-38 153
MsG0780040076.01.T01 AT5G61480 28.333 720 413 24 125 808 86 738 3.35e-45 176
MsG0780040076.01.T01 AT5G61480 26.891 595 349 13 60 628 68 602 5.11e-37 150
MsG0780040076.01.T01 AT5G61480 29.973 367 212 10 86 423 263 613 6.61e-29 124
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MsG0780040076.01.T01 AT3G23010 26.064 564 288 15 227 693 6 537 1.09e-25 113
MsG0780040076.01.T01 AT3G23010 25.564 399 246 11 85 442 153 541 8.29e-16 82.0
MsG0780040076.01.T01 AT3G23010 30.645 186 123 3 491 675 1 181 1.14e-13 75.1
MsG0780040076.01.T01 AT3G23010 23.056 373 243 9 337 700 43 380 9.29e-11 65.9
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MsG0780040076.01.T01 AT5G07180 29.057 530 293 10 98 627 3 449 2.03e-38 154
MsG0780040076.01.T01 AT5G07180 25.837 627 347 20 241 805 1 571 3.68e-38 153
MsG0780040076.01.T01 AT5G07180 32.817 323 213 4 81 402 34 353 4.83e-31 131
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MsG0780040076.01.T01 AT1G74180 25.483 777 359 24 27 676 28 711 3.76e-29 125
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MsG0780040076.01.T01 AT3G24900 25.616 730 374 23 64 675 65 743 3.21e-28 122
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MsG0780040076.01.T01 AT1G12460 27.934 426 224 10 408 806 102 471 1.11e-23 107
MsG0780040076.01.T01 AT1G12460 28.102 274 149 6 130 402 56 282 1.30e-11 68.9
MsG0780040076.01.T01 AT5G23400 26.765 609 325 18 30 603 35 557 5.30e-34 139
MsG0780040076.01.T01 AT5G23400 24.615 520 262 14 229 675 95 557 5.06e-20 95.5
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MsG0780040076.01.T01 AT3G47110 29.605 152 83 2 549 676 92 243 1.34e-11 68.9
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MsG0780040076.01.T01 AT2G19780 35.233 193 118 6 485 675 106 293 9.65e-16 80.9
MsG0780040076.01.T01 AT2G19780 32.161 199 108 5 490 665 137 331 5.31e-15 78.6
MsG0780040076.01.T01 AT2G19780 26.126 222 149 3 191 405 107 320 7.08e-12 68.6
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MsG0780040076.01.T01 AT1G58190 25.758 660 338 17 95 651 59 669 2.85e-30 128
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MsG0780040076.01.T01 AT5G49290 26.273 746 396 26 75 750 247 908 4.36e-30 128
MsG0780040076.01.T01 AT5G49290 26.923 728 395 22 19 675 6 667 7.59e-32 134
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MsG0780040076.01.T01 AT2G27060 25.048 519 280 16 326 774 130 609 2.59e-21 100
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MsG0780040076.01.T01 AT3G20820 38.125 160 95 3 517 675 131 287 8.76e-17 83.6
MsG0780040076.01.T01 AT3G20820 36.424 151 95 1 525 675 115 264 1.66e-15 79.7
MsG0780040076.01.T01 AT3G20820 33.990 203 104 7 205 404 115 290 5.81e-14 74.7
MsG0780040076.01.T01 AT3G20820 29.185 233 117 6 191 402 59 264 7.91e-11 65.1
MsG0780040076.01.T01 AT1G33670 31.579 266 144 5 28 258 28 290 1.68e-28 120
MsG0780040076.01.T01 AT1G33670 32.979 188 115 5 494 677 112 292 3.09e-15 79.7
MsG0780040076.01.T01 AT1G33670 34.848 198 114 6 205 395 116 305 1.32e-14 77.8
MsG0780040076.01.T01 AT1G33670 28.125 288 164 14 77 356 180 432 7.45e-12 68.9
MsG0780040076.01.T01 AT2G32660 26.710 614 313 21 122 696 4 519 2.42e-28 121
MsG0780040076.01.T01 AT2G32660 29.022 317 192 9 101 402 198 496 5.05e-23 104
MsG0780040076.01.T01 AT2G32660 26.463 393 200 12 88 402 91 472 6.09e-16 82.4
MsG0780040076.01.T01 AT2G32660 31.319 182 111 5 17 185 316 496 1.92e-11 68.2
MsG0780040076.01.T01 AT2G33050 25.191 786 416 25 1 696 1 704 2.52e-28 122
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MsG0780040076.01.T01 AT1G79620 28.571 245 158 8 170 402 99 338 1.83e-12 71.6
MsG0780040076.01.T01 AT1G79620 28.521 284 165 5 8 259 14 291 9.64e-22 101
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MsG0780040076.01.T01 AT1G29740 31.698 265 140 6 155 401 109 350 2.18e-18 90.9
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MsG0780040076.01.T01 AT4G28560 27.915 283 152 6 123 402 156 389 2.23e-18 89.4
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MsG0780040076.01.T01 AT2G16250 29.798 198 108 3 509 675 68 265 1.29e-11 68.9
MsG0780040076.01.T01 AT1G29750 32.536 209 111 3 491 675 128 330 2.34e-16 84.3
MsG0780040076.01.T01 AT1G29750 31.771 192 105 4 508 677 95 282 1.21e-15 82.0
MsG0780040076.01.T01 AT1G29750 30.169 295 171 11 110 402 114 375 5.94e-15 79.7
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MsG0780040076.01.T01 AT3G08680 32.227 211 126 7 555 755 85 288 2.56e-11 67.8
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MsG0780040076.01.T01 AT1G07650 31.088 193 122 4 74 259 165 353 4.15e-12 70.5
MsG0780040076.01.T01 AT1G60800 39.655 116 70 0 562 677 74 189 3.33e-13 73.9
MsG0780040076.01.T01 AT1G60800 29.834 181 122 4 6 185 11 187 5.95e-11 66.6
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MsG0780040076.01.T01 AT1G53730 31.000 200 109 7 62 261 62 232 5.77e-13 73.2
MsG0780040076.01.T01 AT1G28340 44.565 92 51 0 563 654 422 513 5.78e-13 73.2
MsG0780040076.01.T01 AT3G43740 34.014 147 64 2 566 679 74 220 1.16e-12 69.3
MsG0780040076.01.T01 AT3G43740 30.172 232 113 9 30 260 32 215 3.54e-12 67.8
MsG0780040076.01.T01 AT3G43740 44.048 84 47 0 544 627 130 213 1.27e-11 66.2
MsG0780040076.01.T01 AT4G31250 31.019 216 126 6 8 214 14 215 1.64e-12 71.6
MsG0780040076.01.T01 AT2G31880 40.310 129 72 4 60 185 73 199 1.75e-12 71.6
MsG0780040076.01.T01 AT3G24660 33.702 181 104 5 131 305 110 280 1.76e-12 71.6
MsG0780040076.01.T01 AT2G35620 30.830 253 151 6 567 805 78 320 1.99e-12 71.2
MsG0780040076.01.T01 AT2G35620 33.889 180 110 4 8 185 14 186 1.18e-11 68.6
MsG0780040076.01.T01 AT2G35620 30.830 253 151 6 567 805 78 320 1.99e-12 71.2
MsG0780040076.01.T01 AT2G35620 33.889 180 110 4 8 185 14 186 1.18e-11 68.6
MsG0780040076.01.T01 AT2G35620 30.830 253 151 6 567 805 78 320 1.99e-12 71.2
MsG0780040076.01.T01 AT2G35620 33.889 180 110 4 8 185 14 186 1.18e-11 68.6
MsG0780040076.01.T01 AT2G35620 30.830 253 151 6 567 805 78 320 1.99e-12 71.2
MsG0780040076.01.T01 AT2G35620 33.889 180 110 4 8 185 14 186 1.18e-11 68.6
MsG0780040076.01.T01 AT4G33430 35.669 157 54 2 566 675 72 228 2.32e-12 71.2
MsG0780040076.01.T01 AT4G33430 30.000 230 126 8 5 210 10 228 5.36e-11 66.6
MsG0780040076.01.T01 AT1G54475 46.491 114 59 1 585 696 19 132 2.40e-12 67.4
MsG0780040076.01.T01 AT4G22130 32.065 184 115 5 62 243 64 239 2.49e-12 71.2
MsG0780040076.01.T01 AT4G22130 24.157 356 195 8 526 808 61 414 2.55e-12 71.2
MsG0780040076.01.T01 AT3G50230 31.088 193 105 5 20 189 38 225 2.91e-12 70.9
MsG0780040076.01.T01 AT3G50230 31.088 193 105 5 20 189 26 213 3.53e-12 70.5
MsG0780040076.01.T01 AT1G11130 36.957 138 81 3 539 676 18 149 3.65e-12 70.5
MsG0780040076.01.T01 AT1G11130 36.957 138 81 3 539 676 96 227 4.30e-12 70.5
MsG0780040076.01.T01 AT5G48380 25.095 263 157 5 567 809 81 323 4.62e-12 70.1
MsG0780040076.01.T01 AT1G66150 28.761 226 111 6 83 265 216 434 6.77e-12 70.1
MsG0780040076.01.T01 AT1G10850 31.053 190 95 8 24 187 28 207 9.37e-12 69.3
MsG0780040076.01.T01 AT1G10850 31.313 198 120 5 478 666 26 216 3.12e-11 67.4
MsG0780040076.01.T01 AT1G27190 39.316 117 71 0 146 262 74 190 1.19e-11 68.9
MsG0780040076.01.T01 AT5G37450 38.095 126 74 4 86 210 8 130 1.32e-11 68.9
MsG0780040076.01.T01 AT5G37450 37.209 129 78 3 548 675 4 130 6.02e-11 66.6
MsG0780040076.01.T01 AT3G17640 27.622 286 144 9 1 261 1 248 1.94e-11 67.4
MsG0780040076.01.T01 AT3G17640 33.594 128 80 2 550 676 78 201 4.78e-11 66.2
MsG0780040076.01.T01 AT5G06820 34.228 149 95 2 526 674 59 204 2.15e-11 68.2
MsG0780040076.01.T01 AT1G68400 31.844 179 91 7 30 185 31 201 2.43e-11 67.8
MsG0780040076.01.T01 AT3G49750 37.209 129 80 1 496 624 56 183 2.57e-11 63.9
MsG0780040076.01.T01 AT1G60630 31.683 202 96 9 13 185 8 196 2.67e-11 67.8
MsG0780040076.01.T01 AT1G78980 33.557 149 83 4 533 675 87 225 5.10e-11 67.0
MsG0780040076.01.T01 AT4G03390 28.758 153 107 1 526 678 62 212 7.96e-11 66.2
MsG0780040076.01.T01 AT4G03390 28.758 153 107 1 526 678 62 212 7.96e-11 66.2
MsG0780040076.01.T01 AT3G03770 28.019 207 117 4 86 268 143 341 8.60e-11 66.2
MsG0780040076.01.T01 AT3G03770 28.019 207 117 4 86 268 143 341 8.60e-11 66.2
MsG0780040076.01.T01 AT3G03770 28.019 207 117 4 86 268 143 341 8.60e-11 66.2

Find 195 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 224 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CTAGATCACAACAATCTTTC+TGG 0.147951 7:-72766031 MsG0780040076.01.T01:CDS
AGTTTCTACATTTCCCAATT+TGG 0.179099 7:+72767319 None:intergenic
TTCTCTTAAGGTACTCAATT+TGG 0.186815 7:-72766941 MsG0780040076.01.T01:CDS
CATTCAAACCTTCCAATTCT+AGG 0.187148 7:+72766686 None:intergenic
CCTTCCAATTCTAGGAATTC+AGG 0.206858 7:+72766694 None:intergenic
AAACAATTACTTAGCTCATT+AGG 0.211793 7:+72767180 None:intergenic
TTTGGTGGATGGGAATATTT+TGG 0.222926 7:-72767286 MsG0780040076.01.T01:CDS
TCTATTCCTTTGAATGATTC+TGG 0.237793 7:-72767405 MsG0780040076.01.T01:CDS
ATCTGCCTTTGCAGCATCTT+CGG 0.258291 7:-72766825 MsG0780040076.01.T01:CDS
GTTTCATTCAACAATCTTTC+CGG 0.259288 7:-72765959 MsG0780040076.01.T01:CDS
TTCAGCATCCGGTATCTAAT+TGG 0.266122 7:-72765587 MsG0780040076.01.T01:CDS
CCTTTACCATTGTTCTTTGT+TGG 0.267851 7:-72766550 MsG0780040076.01.T01:CDS
GGTGGGTCTATGCGCACTTT+TGG 0.275586 7:-72765744 MsG0780040076.01.T01:CDS
TTGGAGGACAGTAGGTTTAG+AGG 0.277805 7:-72767090 MsG0780040076.01.T01:CDS
ATACCGGATGCTGAAATTTC+CGG 0.283204 7:+72765595 None:intergenic
GTGTTGTGCCTGAGAGTTTC+GGG 0.284446 7:-72766900 MsG0780040076.01.T01:CDS
AACAATTACTTAGCTCATTA+GGG 0.284841 7:+72767181 None:intergenic
CAACATAATTTCAAGACTTA+TGG 0.293284 7:+72766054 None:intergenic
AATATATCTGGCATGCTTCC+AGG 0.298546 7:-72766766 MsG0780040076.01.T01:CDS
AGTGATTGTGATTCATATAA+AGG 0.308759 7:-72765911 MsG0780040076.01.T01:CDS
GAGAATGCTTTCATCGGTTC+AGG 0.325148 7:-72766628 MsG0780040076.01.T01:CDS
CTAATTGGCACAGGTGGCTT+TGG 0.328992 7:-72765572 MsG0780040076.01.T01:CDS
TCTGCCTTTGCAGCATCTTC+GGG 0.329058 7:-72766824 MsG0780040076.01.T01:CDS
GGTGAGATTCCACACCAAAT+TGG 0.334766 7:-72767333 MsG0780040076.01.T01:CDS
AATATGAAATGGATGCTTCT+AGG 0.337518 7:-72766193 MsG0780040076.01.T01:CDS
CGGCGAGATTCCGGTGAGTT+TGG 0.345926 7:-72767625 MsG0780040076.01.T01:CDS
GTGTAGGAATCTAACTTTCT+TGG 0.347745 7:-72766875 MsG0780040076.01.T01:CDS
TTGGCACAGAATTATGTTAC+TGG 0.348185 7:-72766922 MsG0780040076.01.T01:CDS
CTAGGAGGAAACAATCTTAC+AGG 0.349374 7:-72766175 MsG0780040076.01.T01:CDS
CTAAGTAGGAATAATATATC+TGG 0.351870 7:-72766778 MsG0780040076.01.T01:CDS
TTTAAGTTTCCCAACTGATT+AGG 0.360721 7:+72766217 None:intergenic
TAGAAACTTGAGGACCCTTT+TGG 0.362180 7:-72767304 MsG0780040076.01.T01:CDS
CATCTTTCAAATTCTGCAAC+TGG 0.362286 7:-72767785 MsG0780040076.01.T01:CDS
CAAACCTGAATTCCTAGAAT+TGG 0.363924 7:-72766698 MsG0780040076.01.T01:CDS
CGGTCTTCGCGGCGGTGAAT+TGG 0.366730 7:-72767709 MsG0780040076.01.T01:CDS
TTCTTGACTGCAAGAGGAGC+TGG 0.369151 7:+72765833 None:intergenic
ATGGCATTTGACAAACTTGA+TGG 0.369501 7:+72766073 None:intergenic
CTTGAGGTTCTTGAGCTTCA+AGG 0.371876 7:-72767588 MsG0780040076.01.T01:CDS
GTCAGATTCGTGTTCTCTTA+AGG 0.373424 7:-72766953 MsG0780040076.01.T01:CDS
CTCGGCTTAGCAGCATTAGA+AGG 0.375390 7:-72765682 MsG0780040076.01.T01:CDS
GGTGGACGGTTGCCTGCTGC+TGG 0.376881 7:-72766979 MsG0780040076.01.T01:CDS
TTCGAATGATGGAGGTTTGT+TGG 0.377510 7:-72767109 MsG0780040076.01.T01:CDS
CTCGCCGGAAAACATGTTTC+CGG 0.381959 7:+72767641 None:intergenic
GAAGCAGGTGAGTCAAAGTA+TGG 0.387040 7:+72765860 None:intergenic
GTATCTCACAATTCGCTAAT+CGG 0.392579 7:-72766103 MsG0780040076.01.T01:CDS
CTCAATAATAATAAATTCAA+TGG 0.394936 7:-72766475 MsG0780040076.01.T01:CDS
GTGAAATCCCTCGTGAGATT+GGG 0.394977 7:-72767260 MsG0780040076.01.T01:CDS
AACATCTAGTTGAACAAGAT+TGG 0.398788 7:+72765979 None:intergenic
TCTGAACTGTCCGCATTTGA+TGG 0.401248 7:-72766350 MsG0780040076.01.T01:CDS
TTTGACTGGAAACAAATTAT+CGG 0.405911 7:-72766248 MsG0780040076.01.T01:CDS
GGTGAAATCCCTCGTGAGAT+TGG 0.407805 7:-72767261 MsG0780040076.01.T01:CDS
CGGTGAGTTTGGTGAATCTC+CGG 0.411054 7:-72767614 MsG0780040076.01.T01:CDS
GACCCTTCAAATCTTCTCTC+TGG 0.413104 7:-72767822 MsG0780040076.01.T01:CDS
CACGGCGTCACTTGCGGCGG+TGG 0.413239 7:-72767762 MsG0780040076.01.T01:CDS
GGTGTTGTGCCTGAGAGTTT+CGG 0.413401 7:-72766901 MsG0780040076.01.T01:CDS
TACAGTGTCCGCTTGTGCTT+TGG 0.421484 7:-72765765 MsG0780040076.01.T01:CDS
TCGCCGGAAAACATGTTTCC+GGG 0.424402 7:+72767642 None:intergenic
CTTGAGCTCTAACAATTTAG+TGG 0.426294 7:-72766851 MsG0780040076.01.T01:CDS
ATTCACATAGTCGTCGTAGA+TGG 0.426958 7:-72765811 MsG0780040076.01.T01:CDS
GGTGAGTCAAAGTATGGATC+AGG 0.429166 7:+72765866 None:intergenic
GTGACTGAACTTAATGTTAC+CGG 0.431301 7:-72767729 MsG0780040076.01.T01:CDS
CTGTCGTAACTCAATTCAAT+TGG 0.431495 7:+72765632 None:intergenic
AGAGGAGCTGGGAGAGAAGC+AGG 0.434048 7:+72765845 None:intergenic
TAGATCACAACAATCTTTCT+GGG 0.437143 7:-72766030 MsG0780040076.01.T01:CDS
GGTGAGTTTGGTGAATCTCC+GGG 0.443875 7:-72767613 MsG0780040076.01.T01:CDS
CTTCGGCGTCTTGATTTGAC+TGG 0.447062 7:-72766262 MsG0780040076.01.T01:CDS
TTCTGGGGAAATACCTCTAT+CGG 0.447202 7:-72766014 MsG0780040076.01.T01:CDS
CTAAGAGTATTGTCTCTTCC+CGG 0.448216 7:-72767660 MsG0780040076.01.T01:CDS
GACAGTGTGGTCACAACTAC+CGG 0.449328 7:-72765614 MsG0780040076.01.T01:CDS
GGATCAATTGAACCTGGTAT+AGG 0.450458 7:-72766298 MsG0780040076.01.T01:CDS
TGTGCTTACTGATTTGTATG+AGG 0.450664 7:-72767142 MsG0780040076.01.T01:CDS
TCAAAATAACTCATCTGAAA+AGG 0.450862 7:+72767543 None:intergenic
AAATATTCCCATCCACCAAA+AGG 0.452953 7:+72767289 None:intergenic
GTGATTGTGATTCATATAAA+GGG 0.454604 7:-72765910 MsG0780040076.01.T01:CDS
CTTCAAATCTTCTCTCTGGT+TGG 0.456064 7:-72767818 MsG0780040076.01.T01:CDS
CGCATAGTTGGTTCACACTC+AGG 0.457500 7:+72766395 None:intergenic
GTGAGATTCCACACCAAATT+GGG 0.457687 7:-72767332 MsG0780040076.01.T01:CDS
GATCACCGCGGTTCGAATGA+TGG 0.462402 7:-72767120 MsG0780040076.01.T01:CDS
TTGACTGGAAACAAATTATC+GGG 0.466425 7:-72766247 MsG0780040076.01.T01:CDS
AAAAGCAACAGCACTTCATA+AGG 0.469772 7:+72767039 None:intergenic
AGAAGAGACAATGCGTCGTT+GGG 0.473609 7:+72767870 None:intergenic
TAGGTGAGTTGGCATTTCTT+CGG 0.473833 7:-72766279 MsG0780040076.01.T01:CDS
GAGGTTTGTTGGAGGACAGT+AGG 0.476368 7:-72767098 MsG0780040076.01.T01:CDS
AATGCGTCGTTGGGAATTGA+AGG 0.482761 7:+72767879 None:intergenic
CTTAATGTTACCGGTCTTCG+CGG 0.483505 7:-72767720 MsG0780040076.01.T01:CDS
TGGGCGCCTCGAGCGAATCT+CGG 0.483592 7:-72767000 MsG0780040076.01.T01:CDS
GACGGTTGCCTGCTGCTGGA+TGG 0.486426 7:-72766975 MsG0780040076.01.T01:CDS
GTTTCTAGAAATAGCCTCAC+TGG 0.487219 7:-72767210 MsG0780040076.01.T01:CDS
ATTGAAGGCATTTGCGTGAT+GGG 0.489079 7:+72767902 None:intergenic
ATGGATCAGGGCAAGAGTGC+AGG 0.496266 7:+72765879 None:intergenic
GTCGTAGATGGAGGAAAGTA+AGG 0.499225 7:-72765799 MsG0780040076.01.T01:CDS
CAGTTTGAAACTAGTCGGTA+TGG 0.502245 7:+72766445 None:intergenic
TTCAAATTCTGCAACTGGCA+CGG 0.502612 7:-72767780 MsG0780040076.01.T01:CDS
CTTTATGGCAACAAGAAAAC+CGG 0.504652 7:+72765524 None:intergenic
GAGAAGAGACAATGCGTCGT+TGG 0.505002 7:+72767869 None:intergenic
GACAGTTCAGAAACAACGCT+TGG 0.505182 7:+72766362 None:intergenic
GGGAGAACTGCCTAATCAGT+TGG 0.505193 7:-72766227 MsG0780040076.01.T01:CDS
GTCAATCTACCAAGTTGGTA+AGG 0.506469 7:+72766145 None:intergenic
GTCACTTGCGGCGGTGGAGA+CGG 0.507903 7:-72767756 MsG0780040076.01.T01:CDS
CTACACATCCCGAAACTCTC+AGG 0.510611 7:+72766892 None:intergenic
TTCCAGGGTTTATGAAAGAA+AGG 0.513908 7:-72766750 MsG0780040076.01.T01:CDS
CAACCAGAGAGAAGATTTGA+AGG 0.514938 7:+72767819 None:intergenic
AACTGGCACGGCGTCACTTG+CGG 0.519882 7:-72767768 MsG0780040076.01.T01:CDS
AGTGTCCGCTTGTGCTTTGG+TGG 0.522479 7:-72765762 MsG0780040076.01.T01:CDS
GTTGGGAATTGAAGGATTGA+AGG 0.525210 7:+72767887 None:intergenic
GATTGAAGGCATTTGCGTGA+TGG 0.526177 7:+72767901 None:intergenic
TTTCTGGTGAAATTCCAAAT+GGG 0.527210 7:-72767485 MsG0780040076.01.T01:CDS
CAATGACCTCAAGACATTGT+CGG 0.527566 7:-72766422 MsG0780040076.01.T01:CDS
CACCTTTCTTTCATAAACCC+TGG 0.530289 7:+72766748 None:intergenic
GGCGAAATTCCTTACCAACT+TGG 0.530487 7:-72766154 MsG0780040076.01.T01:CDS
CTACCGGAAATTTCAGCATC+CGG 0.531484 7:-72765598 MsG0780040076.01.T01:CDS
CAATTCACCGCCGCGAAGAC+CGG 0.536326 7:+72767710 None:intergenic
GGAGAACTGCCTAATCAGTT+GGG 0.536548 7:-72766226 MsG0780040076.01.T01:CDS
TGATGTATTTCAATCTAAGT+AGG 0.539343 7:-72766792 MsG0780040076.01.T01:CDS
ATATATCTGGCATGCTTCCA+GGG 0.539550 7:-72766765 MsG0780040076.01.T01:CDS
GGGAAATCTCCCCGCATAGT+TGG 0.542153 7:+72766383 None:intergenic
CCTGAATTCCTAGAATTGGA+AGG 0.542254 7:-72766694 MsG0780040076.01.T01:CDS
TTCAATTGGAACAACTTGAA+AGG 0.542759 7:+72765646 None:intergenic
TGGTGAAATTCCAAATGGGT+TGG 0.544320 7:-72767481 MsG0780040076.01.T01:CDS
TGAGTGTGAACCAACTATGC+GGG 0.545574 7:-72766393 MsG0780040076.01.T01:CDS
GGAAGAGACAAAGCGTTTGA+AGG 0.547002 7:+72767845 None:intergenic
GAATCTGACCATCCAGCAGC+AGG 0.547328 7:+72766967 None:intergenic
CAATCACTCGGGTGTTGAAG+AGG 0.547415 7:+72765926 None:intergenic
CTCGAGCGAATCTCGGTGGA+CGG 0.549624 7:-72766993 MsG0780040076.01.T01:CDS
TGTGAATTCTTGACTGCAAG+AGG 0.550891 7:+72765827 None:intergenic
CCAACAAAGAACAATGGTAA+AGG 0.551663 7:+72766550 None:intergenic
AATATTCCCATCCACCAAAA+GGG 0.552408 7:+72767290 None:intergenic
TCTTGACTGCAAGAGGAGCT+GGG 0.552771 7:+72765834 None:intergenic
GAATGATGGAGGTTTGTTGG+AGG 0.553000 7:-72767106 MsG0780040076.01.T01:CDS
CACCTGTGCCAATTAGATAC+CGG 0.553922 7:+72765579 None:intergenic
TTTCAAGAGAATGCTTTCAT+CGG 0.554078 7:-72766634 MsG0780040076.01.T01:CDS
TGAACCTGGTATAGGTGAGT+TGG 0.554428 7:-72766290 MsG0780040076.01.T01:CDS
TTCAGGTTTGAGTGCAGCAA+GGG 0.554443 7:+72766711 None:intergenic
GAAAGAGCAGAAACCGATAG+AGG 0.556243 7:+72766001 None:intergenic
AACTGTTCAAGCTGAAGTCA+TGG 0.562310 7:+72766581 None:intergenic
ACAGTTCAGAAACAACGCTT+GGG 0.562390 7:+72766363 None:intergenic
CGGAGATTCACCAAACTCAC+CGG 0.565317 7:+72767615 None:intergenic
CTACATTTCCCAATTTGGTG+TGG 0.565800 7:+72767324 None:intergenic
CATTGCAGTTTGAAACTAGT+CGG 0.567079 7:+72766440 None:intergenic
TTGAGCTCTAACAATTTAGT+GGG 0.567122 7:-72766850 MsG0780040076.01.T01:CDS
ATCCGGTATCTAATTGGCAC+AGG 0.570201 7:-72765581 MsG0780040076.01.T01:CDS
GCGGCATACAATCAAATTGA+CGG 0.571186 7:-72766319 MsG0780040076.01.T01:CDS
GGGAAGTCAATCTACCAAGT+TGG 0.572658 7:+72766140 None:intergenic
AGAGAGAAGATTTGAAGGGT+CGG 0.577490 7:+72767824 None:intergenic
CTGAGAGTTTCGGGATGTGT+AGG 0.579062 7:-72766891 MsG0780040076.01.T01:CDS
CAGCATTAGAAGGCGAGAAG+TGG 0.584379 7:-72765672 MsG0780040076.01.T01:CDS
GTGTCCGCTTGTGCTTTGGT+GGG 0.585053 7:-72765761 MsG0780040076.01.T01:CDS
GCAGAAAGAGTAAACTTACT+CGG 0.585690 7:-72765700 MsG0780040076.01.T01:CDS
GGAACCCGAAGATGCTGCAA+AGG 0.588592 7:+72766820 None:intergenic
TAGACCCACCAAAGCACAAG+CGG 0.589062 7:+72765757 None:intergenic
TTGAAGAGGAGGAATATGAC+CGG 0.590592 7:+72765940 None:intergenic
GCTCAAGAACCTCAAGCCCC+CGG 0.591074 7:+72767595 None:intergenic
TTATATGAATCACAATCACT+CGG 0.591725 7:+72765914 None:intergenic
CGGTATCTAATTGGCACAGG+TGG 0.599989 7:-72765578 MsG0780040076.01.T01:CDS
TGCAGAATTTGAAAGATGAA+CGG 0.600123 7:+72767790 None:intergenic
CAAACTCACCGGAATCTCGC+CGG 0.601046 7:+72767626 None:intergenic
CAACTACCAGAATCATTCAA+AGG 0.601794 7:+72767399 None:intergenic
TTGGGAAATGTAGAAACTTG+AGG 0.602999 7:-72767314 MsG0780040076.01.T01:CDS
CACATAGTCGTCGTAGATGG+AGG 0.604289 7:-72765808 MsG0780040076.01.T01:CDS
ATTCAGGTTTGAGTGCAGCA+AGG 0.608406 7:+72766710 None:intergenic
CTAGAAATAGCCTCACTGGA+AGG 0.611228 7:-72767206 MsG0780040076.01.T01:CDS
GGTGAATTGGTGTCTGACAT+TGG 0.619414 7:-72767696 MsG0780040076.01.T01:CDS
TGGCACGGCGTCACTTGCGG+CGG 0.621469 7:-72767765 MsG0780040076.01.T01:CDS
GTGAGTTTGGTGAATCTCCG+GGG 0.623687 7:-72767612 MsG0780040076.01.T01:CDS
TGAGTTTGGTGAATCTCCGG+GGG 0.636960 7:-72767611 MsG0780040076.01.T01:CDS
TCACTCGGGTGTTGAAGAGG+AGG 0.642533 7:+72765929 None:intergenic
AACCAGAGAGAAGATTTGAA+GGG 0.642541 7:+72767820 None:intergenic
CACCGCGGTTCGAATGATGG+AGG 0.642835 7:-72767117 MsG0780040076.01.T01:CDS
GTGAGTCAAAGTATGGATCA+GGG 0.642851 7:+72765867 None:intergenic
TATATGAATCACAATCACTC+GGG 0.644104 7:+72765915 None:intergenic
AGATTGAAATACATCATACA+AGG 0.645904 7:+72766799 None:intergenic
TTACAAAGCAGAGCTATCAC+CGG 0.646019 7:-72765543 MsG0780040076.01.T01:CDS
AATGCCAACTCACCTATACC+AGG 0.652596 7:+72766286 None:intergenic
ATGGAGGAAAGTAAGGACTG+TGG 0.654958 7:-72765792 MsG0780040076.01.T01:CDS
TGAAATCCCTCGTGAGATTG+GGG 0.655220 7:-72767259 MsG0780040076.01.T01:CDS
ATGAAATGGATGCTTCTAGG+AGG 0.657055 7:-72766190 MsG0780040076.01.T01:CDS
ATTGACGGATCAATTGAACC+TGG 0.662066 7:-72766304 MsG0780040076.01.T01:CDS
AGATCACAACAATCTTTCTG+GGG 0.663776 7:-72766029 MsG0780040076.01.T01:CDS
GCGCCTCGAGCGAATCTCGG+TGG 0.664627 7:-72766997 MsG0780040076.01.T01:CDS
GAGATACATTCAAAACAACA+AGG 0.669084 7:+72766119 None:intergenic
TGAATTGAGTTACGACAGTG+TGG 0.670150 7:-72765627 MsG0780040076.01.T01:CDS
ACAACATCCCCAATCTCACG+AGG 0.670742 7:+72767252 None:intergenic
TTATCTCCAACAAAGAACAA+TGG 0.678888 7:+72766544 None:intergenic
GAGTGTGAACCAACTATGCG+GGG 0.679382 7:-72766392 MsG0780040076.01.T01:CDS
GGTTAACCGACAATGTCTTG+AGG 0.684679 7:+72766416 None:intergenic
AATGTTACCGGTCTTCGCGG+CGG 0.684850 7:-72767717 MsG0780040076.01.T01:CDS
GCTTCAAAATCCATCAAATG+CGG 0.686171 7:+72766340 None:intergenic
AACCTCCATCATTCGAACCG+CGG 0.687364 7:+72767115 None:intergenic
CTGAGTGTGAACCAACTATG+CGG 0.689399 7:-72766394 MsG0780040076.01.T01:CDS
AGAATTTGAAAGATGAACGG+TGG 0.689420 7:+72767793 None:intergenic
AGATACATTCAAAACAACAA+GGG 0.702552 7:+72766120 None:intergenic
CGTCCACCGAGATTCGCTCG+AGG 0.713230 7:+72766994 None:intergenic
CATTAGGGATCCTTCCAGTG+AGG 0.719945 7:+72767196 None:intergenic
CAACATCCCCAATCTCACGA+GGG 0.722612 7:+72767253 None:intergenic
GATTTGTATGAGGATCACCG+CGG 0.836421 7:-72767132 MsG0780040076.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! CTCAATAATAATAAATTCAA+TGG - Chr7:72767002-72767021 MsG0780040076.01.T01:CDS 15.0%
!! GAAACTTAAAAAATATGAAA+TGG - Chr7:72767273-72767292 MsG0780040076.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTGTCTAATAATCAATTTTC+TGG - Chr7:72766048-72766067 MsG0780040076.01.T01:CDS 20.0%
! AAACAATTACTTAGCTCATT+AGG + Chr7:72766300-72766319 None:intergenic 25.0%
! AACAATTACTTAGCTCATTA+GGG + Chr7:72766299-72766318 None:intergenic 25.0%
! AGATACATTCAAAACAACAA+GGG + Chr7:72767360-72767379 None:intergenic 25.0%
! AGATTGAAATACATCATACA+AGG + Chr7:72766681-72766700 None:intergenic 25.0%
! AGTGATTGTGATTCATATAA+AGG - Chr7:72767566-72767585 MsG0780040076.01.T01:CDS 25.0%
! CAACATAATTTCAAGACTTA+TGG + Chr7:72767426-72767445 None:intergenic 25.0%
! CTAAGTAGGAATAATATATC+TGG - Chr7:72766699-72766718 MsG0780040076.01.T01:CDS 25.0%
! GTGATTGTGATTCATATAAA+GGG - Chr7:72767567-72767586 MsG0780040076.01.T01:CDS 25.0%
! TCAAAATAACTCATCTGAAA+AGG + Chr7:72765937-72765956 None:intergenic 25.0%
! TGATGTATTTCAATCTAAGT+AGG - Chr7:72766685-72766704 MsG0780040076.01.T01:CDS 25.0%
! TTATATGAATCACAATCACT+CGG + Chr7:72767566-72767585 None:intergenic 25.0%
! TTTGACTGGAAACAAATTAT+CGG - Chr7:72767229-72767248 MsG0780040076.01.T01:CDS 25.0%
!! GTGAATTTAATGCTTTTGTT+GGG - Chr7:72766409-72766428 MsG0780040076.01.T01:CDS 25.0%
!! GTTTTTCTTGTTAATCTATC+TGG - Chr7:72765961-72765980 MsG0780040076.01.T01:CDS 25.0%
AACATCTAGTTGAACAAGAT+TGG + Chr7:72767501-72767520 None:intergenic 30.0%
AATATGAAATGGATGCTTCT+AGG - Chr7:72767284-72767303 MsG0780040076.01.T01:CDS 30.0%
AGTTTCTACATTTCCCAATT+TGG + Chr7:72766161-72766180 None:intergenic 30.0%
GAGATACATTCAAAACAACA+AGG + Chr7:72767361-72767380 None:intergenic 30.0%
GTTTCATTCAACAATCTTTC+CGG - Chr7:72767518-72767537 MsG0780040076.01.T01:CDS 30.0%
TAGATCACAACAATCTTTCT+GGG - Chr7:72767447-72767466 MsG0780040076.01.T01:CDS 30.0%
TATATGAATCACAATCACTC+GGG + Chr7:72767565-72767584 None:intergenic 30.0%
TCTATTCCTTTGAATGATTC+TGG - Chr7:72766072-72766091 MsG0780040076.01.T01:CDS 30.0%
TGCAGAATTTGAAAGATGAA+CGG + Chr7:72765690-72765709 None:intergenic 30.0%
TTATCTCCAACAAAGAACAA+TGG + Chr7:72766936-72766955 None:intergenic 30.0%
TTCAATTGGAACAACTTGAA+AGG + Chr7:72767834-72767853 None:intergenic 30.0%
TTGACTGGAAACAAATTATC+GGG - Chr7:72767230-72767249 MsG0780040076.01.T01:CDS 30.0%
TTTCAAGAGAATGCTTTCAT+CGG - Chr7:72766843-72766862 MsG0780040076.01.T01:CDS 30.0%
! GGTGAATTTAATGCTTTTGT+TGG - Chr7:72766408-72766427 MsG0780040076.01.T01:CDS 30.0%
! TTCAAGGAAACAACTTTTCA+GGG - Chr7:72765905-72765924 MsG0780040076.01.T01:CDS 30.0%
! TTCTCTTAAGGTACTCAATT+TGG - Chr7:72766536-72766555 MsG0780040076.01.T01:CDS 30.0%
! TTGAGCTCTAACAATTTAGT+GGG - Chr7:72766627-72766646 MsG0780040076.01.T01:CDS 30.0%
! TTTAAGTTTCCCAACTGATT+AGG + Chr7:72767263-72767282 None:intergenic 30.0%
! TTTCTGGTGAAATTCCAAAT+GGG - Chr7:72765992-72766011 MsG0780040076.01.T01:CDS 30.0%
!! TTTTCTGGTGAAATTCCAAA+TGG - Chr7:72765991-72766010 MsG0780040076.01.T01:CDS 30.0%
!!! CTTTCGCATAATTTTTTGAC+TGG - Chr7:72766123-72766142 MsG0780040076.01.T01:CDS 30.0%
!!! GTTGGTTTTTTCTAGGAATT+TGG - Chr7:72766014-72766033 MsG0780040076.01.T01:CDS 30.0%
AAAAGCAACAGCACTTCATA+AGG + Chr7:72766441-72766460 None:intergenic 35.0%
AAATATTCCCATCCACCAAA+AGG + Chr7:72766191-72766210 None:intergenic 35.0%
AACCAGAGAGAAGATTTGAA+GGG + Chr7:72765660-72765679 None:intergenic 35.0%
AATATTCCCATCCACCAAAA+GGG + Chr7:72766190-72766209 None:intergenic 35.0%
AGAATTTGAAAGATGAACGG+TGG + Chr7:72765687-72765706 None:intergenic 35.0%
AGATCACAACAATCTTTCTG+GGG - Chr7:72767448-72767467 MsG0780040076.01.T01:CDS 35.0%
ATGGCATTTGACAAACTTGA+TGG + Chr7:72767407-72767426 None:intergenic 35.0%
CAAACCTGAATTCCTAGAAT+TGG - Chr7:72766779-72766798 MsG0780040076.01.T01:CDS 35.0%
CAACTACCAGAATCATTCAA+AGG + Chr7:72766081-72766100 None:intergenic 35.0%
CATCTTTCAAATTCTGCAAC+TGG - Chr7:72765692-72765711 MsG0780040076.01.T01:CDS 35.0%
CATTCAAACCTTCCAATTCT+AGG + Chr7:72766794-72766813 None:intergenic 35.0%
CCAACAAAGAACAATGGTAA+AGG + Chr7:72766930-72766949 None:intergenic 35.0%
CCTTTACCATTGTTCTTTGT+TGG - Chr7:72766927-72766946 MsG0780040076.01.T01:CDS 35.0%
CTAGAAAAAACCAACCCATT+TGG + Chr7:72766009-72766028 None:intergenic 35.0%
CTAGATCACAACAATCTTTC+TGG - Chr7:72767446-72767465 MsG0780040076.01.T01:CDS 35.0%
CTGTCGTAACTCAATTCAAT+TGG + Chr7:72767848-72767867 None:intergenic 35.0%
GCAGAAAGAGTAAACTTACT+CGG - Chr7:72767777-72767796 MsG0780040076.01.T01:CDS 35.0%
GCTTCAAAATCCATCAAATG+CGG + Chr7:72767140-72767159 None:intergenic 35.0%
GTATCTCACAATTCGCTAAT+CGG - Chr7:72767374-72767393 MsG0780040076.01.T01:CDS 35.0%
GTGACTGAACTTAATGTTAC+CGG - Chr7:72765748-72765767 MsG0780040076.01.T01:CDS 35.0%
GTGTAGGAATCTAACTTTCT+TGG - Chr7:72766602-72766621 MsG0780040076.01.T01:CDS 35.0%
TTCCAGGGTTTATGAAAGAA+AGG - Chr7:72766727-72766746 MsG0780040076.01.T01:CDS 35.0%
TTGGCACAGAATTATGTTAC+TGG - Chr7:72766555-72766574 MsG0780040076.01.T01:CDS 35.0%
TTGGGAAATGTAGAAACTTG+AGG - Chr7:72766163-72766182 MsG0780040076.01.T01:CDS 35.0%
! CATTGCAGTTTGAAACTAGT+CGG + Chr7:72767040-72767059 None:intergenic 35.0%
! CTTCAAGGAAACAACTTTTC+AGG - Chr7:72765904-72765923 MsG0780040076.01.T01:CDS 35.0%
! CTTGAGCTCTAACAATTTAG+TGG - Chr7:72766626-72766645 MsG0780040076.01.T01:CDS 35.0%
!! TGTGCTTACTGATTTGTATG+AGG - Chr7:72766335-72766354 MsG0780040076.01.T01:CDS 35.0%
!! TTCAGCTTGAACAGTTTTGT+GGG - Chr7:72766903-72766922 MsG0780040076.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTGGTGGATGGGAATATTT+TGG - Chr7:72766191-72766210 MsG0780040076.01.T01:CDS 35.0%
!!! CAAATGGGTTGGTTTTTTCT+AGG - Chr7:72766007-72766026 MsG0780040076.01.T01:CDS 35.0%
!!! CTATCTGGTAATGCTTTTTC+TGG - Chr7:72765976-72765995 MsG0780040076.01.T01:CDS 35.0%
!!! GCATTTGATGGATTTTGAAG+CGG - Chr7:72767139-72767158 MsG0780040076.01.T01:CDS 35.0%
AACTGTTCAAGCTGAAGTCA+TGG + Chr7:72766899-72766918 None:intergenic 40.0%
AATATATCTGGCATGCTTCC+AGG - Chr7:72766711-72766730 MsG0780040076.01.T01:CDS 40.0%
ACAGTTCAGAAACAACGCTT+GGG + Chr7:72767117-72767136 None:intergenic 40.0%
AGAGAGAAGATTTGAAGGGT+CGG + Chr7:72765656-72765675 None:intergenic 40.0%
ATACCGGATGCTGAAATTTC+CGG + Chr7:72767885-72767904 None:intergenic 40.0%
ATATATCTGGCATGCTTCCA+GGG - Chr7:72766712-72766731 MsG0780040076.01.T01:CDS 40.0%
ATGAAATGGATGCTTCTAGG+AGG - Chr7:72767287-72767306 MsG0780040076.01.T01:CDS 40.0%
ATTCACATAGTCGTCGTAGA+TGG - Chr7:72767666-72767685 MsG0780040076.01.T01:CDS 40.0%
CAACCAGAGAGAAGATTTGA+AGG + Chr7:72765661-72765680 None:intergenic 40.0%
CAATGACCTCAAGACATTGT+CGG - Chr7:72767055-72767074 MsG0780040076.01.T01:CDS 40.0%
CACCTTTCTTTCATAAACCC+TGG + Chr7:72766732-72766751 None:intergenic 40.0%
CCTGAATTCCTAGAATTGGA+AGG - Chr7:72766783-72766802 MsG0780040076.01.T01:CDS 40.0%
CTAGGAGGAAACAATCTTAC+AGG - Chr7:72767302-72767321 MsG0780040076.01.T01:CDS 40.0%
CTTCAAATCTTCTCTCTGGT+TGG - Chr7:72765659-72765678 MsG0780040076.01.T01:CDS 40.0%
GCGGCATACAATCAAATTGA+CGG - Chr7:72767158-72767177 MsG0780040076.01.T01:CDS 40.0%
GGATCAATTGAACCTGGTAT+AGG - Chr7:72767179-72767198 MsG0780040076.01.T01:CDS 40.0%
GTCAGATTCGTGTTCTCTTA+AGG - Chr7:72766524-72766543 MsG0780040076.01.T01:CDS 40.0%
GTGAGATTCCACACCAAATT+GGG - Chr7:72766145-72766164 MsG0780040076.01.T01:CDS 40.0%
GTGAGTCAAAGTATGGATCA+GGG + Chr7:72767613-72767632 None:intergenic 40.0%
GTTGGGAATTGAAGGATTGA+AGG + Chr7:72765593-72765612 None:intergenic 40.0%
TGAATTGAGTTACGACAGTG+TGG - Chr7:72767850-72767869 MsG0780040076.01.T01:CDS 40.0%
TGGTGAAATTCCAAATGGGT+TGG - Chr7:72765996-72766015 MsG0780040076.01.T01:CDS 40.0%
TGTGAATTCTTGACTGCAAG+AGG + Chr7:72767653-72767672 None:intergenic 40.0%
TTACAAAGCAGAGCTATCAC+CGG - Chr7:72767934-72767953 MsG0780040076.01.T01:CDS 40.0%
TTCAAATTCTGCAACTGGCA+CGG - Chr7:72765697-72765716 MsG0780040076.01.T01:CDS 40.0%
TTCAGCATCCGGTATCTAAT+TGG - Chr7:72767890-72767909 MsG0780040076.01.T01:CDS 40.0%
TTGAAGAGGAGGAATATGAC+CGG + Chr7:72767540-72767559 None:intergenic 40.0%
! ATTGACGGATCAATTGAACC+TGG - Chr7:72767173-72767192 MsG0780040076.01.T01:CDS 40.0%
! CAGTTTGAAACTAGTCGGTA+TGG + Chr7:72767035-72767054 None:intergenic 40.0%
! CCTTCCAATTCTAGGAATTC+AGG + Chr7:72766786-72766805 None:intergenic 40.0%
! CTACATTTCCCAATTTGGTG+TGG + Chr7:72766156-72766175 None:intergenic 40.0%
! CTTCAGCTTGAACAGTTTTG+TGG - Chr7:72766902-72766921 MsG0780040076.01.T01:CDS 40.0%
! GTTTCTAGAAATAGCCTCAC+TGG - Chr7:72766267-72766286 MsG0780040076.01.T01:CDS 40.0%
! TAGAAACTTGAGGACCCTTT+TGG - Chr7:72766173-72766192 MsG0780040076.01.T01:CDS 40.0%
! TAGGTGAGTTGGCATTTCTT+CGG - Chr7:72767198-72767217 MsG0780040076.01.T01:CDS 40.0%
! TTCGAATGATGGAGGTTTGT+TGG - Chr7:72766368-72766387 MsG0780040076.01.T01:CDS 40.0%
! TTCTGGGGAAATACCTCTAT+CGG - Chr7:72767463-72767482 MsG0780040076.01.T01:CDS 40.0%
!! ATTGAAGGCATTTGCGTGAT+GGG + Chr7:72765578-72765597 None:intergenic 40.0%
!! CTAAGAGTATTGTCTCTTCC+CGG - Chr7:72765817-72765836 MsG0780040076.01.T01:CDS 40.0%
!! GTCAATCTACCAAGTTGGTA+AGG + Chr7:72767335-72767354 None:intergenic 40.0%
!! GTGGATGGGAATATTTTGGA+TGG - Chr7:72766195-72766214 MsG0780040076.01.T01:CDS 40.0%
!! TCAGCTTGAACAGTTTTGTG+GGG - Chr7:72766904-72766923 MsG0780040076.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTGAGTTTGCGGGTTTTGT+GGG - Chr7:72766458-72766477 MsG0780040076.01.T01:CDS 40.0%
!!! TGCTGTTGCTTTTGAGTTTG+CGG - Chr7:72766448-72766467 MsG0780040076.01.T01:CDS 40.0%
!!! TTTTGAGTTTGCGGGTTTTG+TGG - Chr7:72766457-72766476 MsG0780040076.01.T01:CDS 40.0%
AATGCCAACTCACCTATACC+AGG + Chr7:72767194-72767213 None:intergenic 45.0%
AATGCGTCGTTGGGAATTGA+AGG + Chr7:72765601-72765620 None:intergenic 45.0%
AGAAGAGACAATGCGTCGTT+GGG + Chr7:72765610-72765629 None:intergenic 45.0%
ATCCGGTATCTAATTGGCAC+AGG - Chr7:72767896-72767915 MsG0780040076.01.T01:CDS 45.0%
ATCTGCCTTTGCAGCATCTT+CGG - Chr7:72766652-72766671 MsG0780040076.01.T01:CDS 45.0%
ATGGAGGAAAGTAAGGACTG+TGG - Chr7:72767685-72767704 MsG0780040076.01.T01:CDS 45.0%
CACCTGTGCCAATTAGATAC+CGG + Chr7:72767901-72767920 None:intergenic 45.0%
CTACCGGAAATTTCAGCATC+CGG - Chr7:72767879-72767898 MsG0780040076.01.T01:CDS 45.0%
CTAGAAATAGCCTCACTGGA+AGG - Chr7:72766271-72766290 MsG0780040076.01.T01:CDS 45.0%
CTGAGTGTGAACCAACTATG+CGG - Chr7:72767083-72767102 MsG0780040076.01.T01:CDS 45.0%
CTTAATGTTACCGGTCTTCG+CGG - Chr7:72765757-72765776 MsG0780040076.01.T01:CDS 45.0%
CTTGAGGTTCTTGAGCTTCA+AGG - Chr7:72765889-72765908 MsG0780040076.01.T01:CDS 45.0%
GAAAGAGCAGAAACCGATAG+AGG + Chr7:72767479-72767498 None:intergenic 45.0%
GAAGCAGGTGAGTCAAAGTA+TGG + Chr7:72767620-72767639 None:intergenic 45.0%
GACAGTTCAGAAACAACGCT+TGG + Chr7:72767118-72767137 None:intergenic 45.0%
GACCCTTCAAATCTTCTCTC+TGG - Chr7:72765655-72765674 MsG0780040076.01.T01:CDS 45.0%
GATTTGTATGAGGATCACCG+CGG - Chr7:72766345-72766364 MsG0780040076.01.T01:CDS 45.0%
GGAGAACTGCCTAATCAGTT+GGG - Chr7:72767251-72767270 MsG0780040076.01.T01:CDS 45.0%
GGCGAAATTCCTTACCAACT+TGG - Chr7:72767323-72767342 MsG0780040076.01.T01:CDS 45.0%
GGGAAGTCAATCTACCAAGT+TGG + Chr7:72767340-72767359 None:intergenic 45.0%
GGTGAGATTCCACACCAAAT+TGG - Chr7:72766144-72766163 MsG0780040076.01.T01:CDS 45.0%
GGTGAGTCAAAGTATGGATC+AGG + Chr7:72767614-72767633 None:intergenic 45.0%
GGTTAACCGACAATGTCTTG+AGG + Chr7:72767064-72767083 None:intergenic 45.0%
GTCGTAGATGGAGGAAAGTA+AGG - Chr7:72767678-72767697 MsG0780040076.01.T01:CDS 45.0%
GTGAAATCCCTCGTGAGATT+GGG - Chr7:72766217-72766236 MsG0780040076.01.T01:CDS 45.0%
TCTGAACTGTCCGCATTTGA+TGG - Chr7:72767127-72767146 MsG0780040076.01.T01:CDS 45.0%
TGAAATCCCTCGTGAGATTG+GGG - Chr7:72766218-72766237 MsG0780040076.01.T01:CDS 45.0%
TGAACCTGGTATAGGTGAGT+TGG - Chr7:72767187-72767206 MsG0780040076.01.T01:CDS 45.0%
TGAGTGTGAACCAACTATGC+GGG - Chr7:72767084-72767103 MsG0780040076.01.T01:CDS 45.0%
TTGGAGGACAGTAGGTTTAG+AGG - Chr7:72766387-72766406 MsG0780040076.01.T01:CDS 45.0%
! AAACTTGAGGACCCTTTTGG+TGG - Chr7:72766176-72766195 MsG0780040076.01.T01:CDS 45.0%
! ATTCAGGTTTGAGTGCAGCA+AGG + Chr7:72766770-72766789 None:intergenic 45.0%
! CTTCCCGGAAACATGTTTTC+CGG - Chr7:72765832-72765851 MsG0780040076.01.T01:CDS 45.0%
! GGAAGAGACAAAGCGTTTGA+AGG + Chr7:72765635-72765654 None:intergenic 45.0%
! GGTGAATTGGTGTCTGACAT+TGG - Chr7:72765781-72765800 MsG0780040076.01.T01:CDS 45.0%
! TTCAGGTTTGAGTGCAGCAA+GGG + Chr7:72766769-72766788 None:intergenic 45.0%
!! GAATGATGGAGGTTTGTTGG+AGG - Chr7:72766371-72766390 MsG0780040076.01.T01:CDS 45.0%
!! GAGAATGCTTTCATCGGTTC+AGG - Chr7:72766849-72766868 MsG0780040076.01.T01:CDS 45.0%
!! GATTGAAGGCATTTGCGTGA+TGG + Chr7:72765579-72765598 None:intergenic 45.0%
!!! CGCACTTTTGGGATTAGTGT+TGG - Chr7:72767745-72767764 MsG0780040076.01.T01:CDS 45.0%
!!! GCTGTTGCTTTTGAGTTTGC+GGG - Chr7:72766449-72766468 MsG0780040076.01.T01:CDS 45.0%
AACCTCCATCATTCGAACCG+CGG + Chr7:72766365-72766384 None:intergenic 50.0%
ACAACATCCCCAATCTCACG+AGG + Chr7:72766228-72766247 None:intergenic 50.0%
CAACATCCCCAATCTCACGA+GGG + Chr7:72766227-72766246 None:intergenic 50.0%
CACATAGTCGTCGTAGATGG+AGG - Chr7:72767669-72767688 MsG0780040076.01.T01:CDS 50.0%
CAGCATTAGAAGGCGAGAAG+TGG - Chr7:72767805-72767824 MsG0780040076.01.T01:CDS 50.0%
CATTAGGGATCCTTCCAGTG+AGG + Chr7:72766284-72766303 None:intergenic 50.0%
CGGAGATTCACCAAACTCAC+CGG + Chr7:72765865-72765884 None:intergenic 50.0%
CGGTATCTAATTGGCACAGG+TGG - Chr7:72767899-72767918 MsG0780040076.01.T01:CDS 50.0%
CTAATTGGCACAGGTGGCTT+TGG - Chr7:72767905-72767924 MsG0780040076.01.T01:CDS 50.0%
CTACACATCCCGAAACTCTC+AGG + Chr7:72766588-72766607 None:intergenic 50.0%
CTCGCCGGAAAACATGTTTC+CGG + Chr7:72765839-72765858 None:intergenic 50.0%
CTCGGCTTAGCAGCATTAGA+AGG - Chr7:72767795-72767814 MsG0780040076.01.T01:CDS 50.0%
CTGAGAGTTTCGGGATGTGT+AGG - Chr7:72766586-72766605 MsG0780040076.01.T01:CDS 50.0%
GACAGTGTGGTCACAACTAC+CGG - Chr7:72767863-72767882 MsG0780040076.01.T01:CDS 50.0%
GAGAAGAGACAATGCGTCGT+TGG + Chr7:72765611-72765630 None:intergenic 50.0%
GAGTGTGAACCAACTATGCG+GGG - Chr7:72767085-72767104 MsG0780040076.01.T01:CDS 50.0%
GGGAGAACTGCCTAATCAGT+TGG - Chr7:72767250-72767269 MsG0780040076.01.T01:CDS 50.0%
GGTGAAATCCCTCGTGAGAT+TGG - Chr7:72766216-72766235 MsG0780040076.01.T01:CDS 50.0%
GTGTTGTGCCTGAGAGTTTC+GGG - Chr7:72766577-72766596 MsG0780040076.01.T01:CDS 50.0%
TACAGTGTCCGCTTGTGCTT+TGG - Chr7:72767712-72767731 MsG0780040076.01.T01:CDS 50.0%
TAGACCCACCAAAGCACAAG+CGG + Chr7:72767723-72767742 None:intergenic 50.0%
TCGCCGGAAAACATGTTTCC+GGG + Chr7:72765838-72765857 None:intergenic 50.0%
TCTGCCTTTGCAGCATCTTC+GGG - Chr7:72766653-72766672 MsG0780040076.01.T01:CDS 50.0%
TCTTGACTGCAAGAGGAGCT+GGG + Chr7:72767646-72767665 None:intergenic 50.0%
TTCTTGACTGCAAGAGGAGC+TGG + Chr7:72767647-72767666 None:intergenic 50.0%
! CATGTTTTCCGGCGAGATTC+CGG - Chr7:72765843-72765862 MsG0780040076.01.T01:CDS 50.0%
! CGCATAGTTGGTTCACACTC+AGG + Chr7:72767085-72767104 None:intergenic 50.0%
! CGGTGAGTTTGGTGAATCTC+CGG - Chr7:72765863-72765882 MsG0780040076.01.T01:CDS 50.0%
! CTTCGGCGTCTTGATTTGAC+TGG - Chr7:72767215-72767234 MsG0780040076.01.T01:CDS 50.0%
! GGTGAGTTTGGTGAATCTCC+GGG - Chr7:72765864-72765883 MsG0780040076.01.T01:CDS 50.0%
! GGTGTTGTGCCTGAGAGTTT+CGG - Chr7:72766576-72766595 MsG0780040076.01.T01:CDS 50.0%
! GTGAGTTTGGTGAATCTCCG+GGG - Chr7:72765865-72765884 MsG0780040076.01.T01:CDS 50.0%
! GTGGGTCTATGCGCACTTTT+GGG - Chr7:72767734-72767753 MsG0780040076.01.T01:CDS 50.0%
! TGAGTTTGGTGAATCTCCGG+GGG - Chr7:72765866-72765885 MsG0780040076.01.T01:CDS 50.0%
! TTGAGGACCCTTTTGGTGGA+TGG - Chr7:72766180-72766199 MsG0780040076.01.T01:CDS 50.0%
!! CAATCACTCGGGTGTTGAAG+AGG + Chr7:72767554-72767573 None:intergenic 50.0%
!! GAGGTTTGTTGGAGGACAGT+AGG - Chr7:72766379-72766398 MsG0780040076.01.T01:CDS 50.0%
!! TGAGGACCCTTTTGGTGGAT+GGG - Chr7:72766181-72766200 MsG0780040076.01.T01:CDS 50.0%
AATGTTACCGGTCTTCGCGG+CGG - Chr7:72765760-72765779 MsG0780040076.01.T01:CDS 55.0%
AGTGTCCGCTTGTGCTTTGG+TGG - Chr7:72767715-72767734 MsG0780040076.01.T01:CDS 55.0%
CAAACTCACCGGAATCTCGC+CGG + Chr7:72765854-72765873 None:intergenic 55.0%
GAATCTGACCATCCAGCAGC+AGG + Chr7:72766513-72766532 None:intergenic 55.0%
GATCACCGCGGTTCGAATGA+TGG - Chr7:72766357-72766376 MsG0780040076.01.T01:CDS 55.0%
GGAACCCGAAGATGCTGCAA+AGG + Chr7:72766660-72766679 None:intergenic 55.0%
GGGAAATCTCCCCGCATAGT+TGG + Chr7:72767097-72767116 None:intergenic 55.0%
GTGTCCGCTTGTGCTTTGGT+GGG - Chr7:72767716-72767735 MsG0780040076.01.T01:CDS 55.0%
! ATGGATCAGGGCAAGAGTGC+AGG + Chr7:72767601-72767620 None:intergenic 55.0%
! GGTGGGTCTATGCGCACTTT+TGG - Chr7:72767733-72767752 MsG0780040076.01.T01:CDS 55.0%
!! TCACTCGGGTGTTGAAGAGG+AGG + Chr7:72767551-72767570 None:intergenic 55.0%
AACTGGCACGGCGTCACTTG+CGG - Chr7:72765709-72765728 MsG0780040076.01.T01:CDS 60.0%
AGAGGAGCTGGGAGAGAAGC+AGG + Chr7:72767635-72767654 None:intergenic 60.0%
CAATTCACCGCCGCGAAGAC+CGG + Chr7:72765770-72765789 None:intergenic 60.0%
CACCGCGGTTCGAATGATGG+AGG - Chr7:72766360-72766379 MsG0780040076.01.T01:CDS 60.0%
CGGCGAGATTCCGGTGAGTT+TGG - Chr7:72765852-72765871 MsG0780040076.01.T01:CDS 60.0%
CTCGAGCGAATCTCGGTGGA+CGG - Chr7:72766484-72766503 MsG0780040076.01.T01:CDS 60.0%
GCTCAAGAACCTCAAGCCCC+CGG + Chr7:72765885-72765904 None:intergenic 60.0%
CGGTCTTCGCGGCGGTGAAT+TGG - Chr7:72765768-72765787 MsG0780040076.01.T01:CDS 65.0%
CGTCCACCGAGATTCGCTCG+AGG + Chr7:72766486-72766505 None:intergenic 65.0%
GACGGTTGCCTGCTGCTGGA+TGG - Chr7:72766502-72766521 MsG0780040076.01.T01:CDS 65.0%
GGTGAATCTCCGGGGGCTTG+AGG - Chr7:72765873-72765892 MsG0780040076.01.T01:CDS 65.0%
GTCACTTGCGGCGGTGGAGA+CGG - Chr7:72765721-72765740 MsG0780040076.01.T01:CDS 65.0%
TGGGCGCCTCGAGCGAATCT+CGG - Chr7:72766477-72766496 MsG0780040076.01.T01:CDS 65.0%
GCGCCTCGAGCGAATCTCGG+TGG - Chr7:72766480-72766499 MsG0780040076.01.T01:CDS 70.0%
GGTGGACGGTTGCCTGCTGC+TGG - Chr7:72766498-72766517 MsG0780040076.01.T01:CDS 70.0%
TGGCACGGCGTCACTTGCGG+CGG - Chr7:72765712-72765731 MsG0780040076.01.T01:CDS 70.0%
CACGGCGTCACTTGCGGCGG+TGG - Chr7:72765715-72765734 MsG0780040076.01.T01:CDS 75.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 72765526 72767973 72765526 ID=MsG0780040076.01;Name=MsG0780040076.01
Chr7 mRNA 72765526 72767973 72765526 ID=MsG0780040076.01.T01;Parent=MsG0780040076.01;Name=MsG0780040076.01.T01;_AED=0.26;_eAED=0.43;_QI=0|0|0|1|1|1|2|0|815
Chr7 exon 72765526 72767973 72765526 ID=MsG0780040076.01.T01:exon:12955;Parent=MsG0780040076.01.T01
Chr7 CDS 72765526 72767973 72765526 ID=MsG0780040076.01.T01:cds;Parent=MsG0780040076.01.T01
Gene Sequence

>MsG0780040076.01.T01

ATGGGTCATCATTTTCTTCATCTTCTTCTATGTCTTCTCTTCTTCACTACCCATCACGCAAATGCCTTCAATCCTTCAATTCCCAACGACGCATTGTCTCTTCTCACCTTCAAACGCTTTGTCTCTTCCGACCCTTCAAATCTTCTCTCTGGTTGGAGCCACCGTTCATCTTTCAAATTCTGCAACTGGCACGGCGTCACTTGCGGCGGTGGAGACGGTAGAGTGACTGAACTTAATGTTACCGGTCTTCGCGGCGGTGAATTGGTGTCTGACATTGGAGATTTGTCTGAGCTAAGAGTATTGTCTCTTCCCGGAAACATGTTTTCCGGCGAGATTCCGGTGAGTTTGGTGAATCTCCGGGGGCTTGAGGTTCTTGAGCTTCAAGGAAACAACTTTTCAGGGAAAGTGCCTTTTCAGATGAGTTATTTTGAATCAGTTTTTCTTGTTAATCTATCTGGTAATGCTTTTTCTGGTGAAATTCCAAATGGGTTGGTTTTTTCTAGGAATTTGGAAATTGTTGATTTGTCTAATAATCAATTTTCTGGTTCTATTCCTTTGAATGATTCTGGTAGTTGTGATTCTTTGAAGCATTTGAAACTTTCGCATAATTTTTTGACTGGTGAGATTCCACACCAAATTGGGAAATGTAGAAACTTGAGGACCCTTTTGGTGGATGGGAATATTTTGGATGGTGAAATCCCTCGTGAGATTGGGGATGTTGTTGAACTTAGAGTTCTTGATGTTTCTAGAAATAGCCTCACTGGAAGGATCCCTAATGAGCTAAGTAATTGTTTGAAATTGTCTGTGCTTGTGCTTACTGATTTGTATGAGGATCACCGCGGTTCGAATGATGGAGGTTTGTTGGAGGACAGTAGGTTTAGAGGTGAATTTAATGCTTTTGTTGGGAATATTCCTTATGAAGTGCTGTTGCTTTTGAGTTTGCGGGTTTTGTGGGCGCCTCGAGCGAATCTCGGTGGACGGTTGCCTGCTGCTGGATGGTCAGATTCGTGTTCTCTTAAGGTACTCAATTTGGCACAGAATTATGTTACTGGTGTTGTGCCTGAGAGTTTCGGGATGTGTAGGAATCTAACTTTCTTGGACTTGAGCTCTAACAATTTAGTGGGACATCTGCCTTTGCAGCATCTTCGGGTTCCTTGTATGATGTATTTCAATCTAAGTAGGAATAATATATCTGGCATGCTTCCAGGGTTTATGAAAGAAAGGTGTCGATCGAGTAGCACCCTTGCTGCACTCAAACCTGAATTCCTAGAATTGGAAGGTTTGAATGATGCATACTTTAACATTCGTTGTTTGAGATTTCAAGAGAATGCTTTCATCGGTTCAGGTTTTGAAGAGACTGTTGTCGTTCGCCATGACTTCAGCTTGAACAGTTTTGTGGGGCCTTTACCATTGTTCTTTGTTGGAGATAATCTTTTTACTGAAAATGAAAATTGTAACGTATCGTACATGTTGTCTCTCAATAATAATAAATTCAATGGAACACTTCCATACCGACTAGTTTCAAACTGCAATGACCTCAAGACATTGTCGGTTAACCTGAGTGTGAACCAACTATGCGGGGAGATTTCCCAAGCGTTGTTTCTGAACTGTCCGCATTTGATGGATTTTGAAGCGGCATACAATCAAATTGACGGATCAATTGAACCTGGTATAGGTGAGTTGGCATTTCTTCGGCGTCTTGATTTGACTGGAAACAAATTATCGGGAGAACTGCCTAATCAGTTGGGAAACTTAAAAAATATGAAATGGATGCTTCTAGGAGGAAACAATCTTACAGGCGAAATTCCTTACCAACTTGGTAGATTGACTTCCCTTGTTGTTTTGAATGTATCTCACAATTCGCTAATCGGAATAATTCCATCAAGTTTGTCAAATGCCATAAGTCTTGAAATTATGTTGCTAGATCACAACAATCTTTCTGGGGAAATACCTCTATCGGTTTCTGCTCTTTCCAATCTTGTTCAACTAGATGTTTCATTCAACAATCTTTCCGGTCATATTCCTCCTCTTCAACACCCGAGTGATTGTGATTCATATAAAGGGAATCAACACCTGCACTCTTGCCCTGATCCATACTTTGACTCACCTGCTTCTCTCCCAGCTCCTCTTGCAGTCAAGAATTCACATAGTCGTCGTAGATGGAGGAAAGTAAGGACTGTGGTTATTACAGTGTCCGCTTGTGCTTTGGTGGGTCTATGCGCACTTTTGGGATTAGTGTTGGTGATTTGTTGCAGAAAGAGTAAACTTACTCGGCTTAGCAGCATTAGAAGGCGAGAAGTGGTGACCTTTCAAGTTGTTCCAATTGAATTGAGTTACGACAGTGTGGTCACAACTACCGGAAATTTCAGCATCCGGTATCTAATTGGCACAGGTGGCTTTGGATCAACTTACAAAGCAGAGCTATCACCGGTTTTCTTGTTGCCATAA
Protein sequence

>MsG0780040076.01.T01

MGHHFLHLLLCLLFFTTHHANAFNPSIPNDALSLLTFKRFVSSDPSNLLSGWSHRSSFKFCNWHGVTCGGGDGRVTELNVTGLRGGELVSDIGDLSELRVLSLPGNMFSGEIPVSLVNLRGLEVLELQGNNFSGKVPFQMSYFESVFLVNLSGNAFSGEIPNGLVFSRNLEIVDLSNNQFSGSIPLNDSGSCDSLKHLKLSHNFLTGEIPHQIGKCRNLRTLLVDGNILDGEIPREIGDVVELRVLDVSRNSLTGRIPNELSNCLKLSVLVLTDLYEDHRGSNDGGLLEDSRFRGEFNAFVGNIPYEVLLLLSLRVLWAPRANLGGRLPAAGWSDSCSLKVLNLAQNYVTGVVPESFGMCRNLTFLDLSSNNLVGHLPLQHLRVPCMMYFNLSRNNISGMLPGFMKERCRSSSTLAALKPEFLELEGLNDAYFNIRCLRFQENAFIGSGFEETVVVRHDFSLNSFVGPLPLFFVGDNLFTENENCNVSYMLSLNNNKFNGTLPYRLVSNCNDLKTLSVNLSVNQLCGEISQALFLNCPHLMDFEAAYNQIDGSIEPGIGELAFLRRLDLTGNKLSGELPNQLGNLKNMKWMLLGGNNLTGEIPYQLGRLTSLVVLNVSHNSLIGIIPSSLSNAISLEIMLLDHNNLSGEIPLSVSALSNLVQLDVSFNNLSGHIPPLQHPSDCDSYKGNQHLHSCPDPYFDSPASLPAPLAVKNSHSRRRWRKVRTVVITVSACALVGLCALLGLVLVICCRKSKLTRLSSIRRREVVTFQVVPIELSYDSVVTTTGNFSIRYLIGTGGFGSTYKAELSPVFLLP*