AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0780040079.01

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MsG0780040079.01.T01 AT1G68690 36.552 290 165 7 66 344 365 646 2.93e-49 184
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MsG0780040079.01.T01 AT5G24010 32.295 353 216 6 31 377 454 789 6.21e-49 185
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MsG0780040079.01.T01 AT2G19130 35.034 294 179 7 66 352 483 771 3.28e-43 168
MsG0780040079.01.T01 AT1G29740 36.042 283 172 5 66 343 665 943 3.33e-43 168
MsG0780040079.01.T01 AT4G20450 34.824 313 188 8 47 354 566 867 3.39e-43 168
MsG0780040079.01.T01 AT3G13380 34.014 294 189 3 64 352 844 1137 4.33e-43 168
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MsG0780040079.01.T01 AT5G10290 34.228 298 183 6 64 354 276 567 4.51e-43 165
MsG0780040079.01.T01 AT3G21340 35.526 304 176 8 60 354 576 868 5.03e-43 167
MsG0780040079.01.T01 AT1G01540 37.168 226 132 5 64 283 140 361 5.46e-43 160
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MsG0780040079.01.T01 AT4G00960 33.574 277 175 5 74 343 52 326 2.94e-41 155
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MsG0780040079.01.T01 AT4G04570 34.708 291 171 6 65 347 335 614 3.32e-41 160
MsG0780040079.01.T01 AT4G03230 32.660 297 194 3 51 343 505 799 3.35e-41 162
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MsG0780040079.01.T01 AT4G03230 32.441 299 196 3 49 343 561 857 3.36e-41 162
MsG0780040079.01.T01 AT1G51940 33.225 307 176 6 66 351 329 627 3.51e-41 160
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MsG0780040079.01.T01 AT4G03230 32.441 299 196 3 49 343 661 957 3.56e-41 162
MsG0780040079.01.T01 AT4G03230 32.441 299 196 3 49 343 661 957 3.56e-41 162
MsG0780040079.01.T01 AT4G11460 33.916 286 181 6 65 343 333 617 3.59e-41 160
MsG0780040079.01.T01 AT5G11020 30.000 360 231 10 13 358 8 360 3.59e-41 155
MsG0780040079.01.T01 AT1G11330 31.615 291 193 3 57 343 501 789 3.96e-41 161
MsG0780040079.01.T01 AT1G11330 31.615 291 193 3 57 343 503 791 3.99e-41 161
MsG0780040079.01.T01 AT4G11470 34.812 293 166 8 65 343 326 607 4.03e-41 160
MsG0780040079.01.T01 AT1G56120 36.842 285 165 7 66 343 680 956 4.06e-41 162
MsG0780040079.01.T01 AT3G14840 34.397 282 179 4 66 343 660 939 4.48e-41 162
MsG0780040079.01.T01 AT5G16000 32.033 359 220 11 5 353 247 591 4.50e-41 159
MsG0780040079.01.T01 AT1G56120 36.842 285 165 7 66 343 698 974 4.55e-41 162
MsG0780040079.01.T01 AT1G61420 30.699 329 220 5 15 338 433 758 4.65e-41 161
MsG0780040079.01.T01 AT1G61420 30.699 329 220 5 15 338 433 758 4.65e-41 161
MsG0780040079.01.T01 AT4G11470 34.812 293 166 8 65 343 331 612 4.94e-41 160
MsG0780040079.01.T01 AT5G60300 32.993 294 184 7 62 349 328 614 5.07e-41 160
MsG0780040079.01.T01 AT5G60300 32.993 294 184 7 62 349 328 614 5.07e-41 160
MsG0780040079.01.T01 AT1G56120 36.842 285 165 7 66 343 532 808 5.18e-41 161
MsG0780040079.01.T01 AT4G23180 31.208 298 199 3 54 347 324 619 5.43e-41 160
MsG0780040079.01.T01 AT4G21380 35.192 287 177 4 68 347 516 800 5.91e-41 161
MsG0780040079.01.T01 AT4G11530 31.419 296 196 4 57 347 331 624 6.39e-41 159
MsG0780040079.01.T01 AT5G60300 32.993 294 184 7 62 349 328 614 6.59e-41 160
MsG0780040079.01.T01 AT4G04540 35.395 291 169 6 65 347 311 590 7.22e-41 159
MsG0780040079.01.T01 AT5G11020 30.000 360 231 10 13 358 69 421 7.24e-41 155
MsG0780040079.01.T01 AT5G11020 30.000 360 231 10 13 358 31 383 7.56e-41 154
MsG0780040079.01.T01 AT1G56145 31.884 345 212 8 3 343 626 951 7.59e-41 161
MsG0780040079.01.T01 AT5G11020 30.000 360 231 10 13 358 35 387 7.98e-41 154
MsG0780040079.01.T01 AT4G00970 33.562 292 171 8 13 293 284 563 8.19e-41 158
MsG0780040079.01.T01 AT4G23180 35.656 244 151 3 54 293 324 565 8.74e-41 158
MsG0780040079.01.T01 AT4G23140 31.250 336 211 6 16 347 303 622 8.87e-41 159
MsG0780040079.01.T01 AT1G51890 35.179 307 166 10 64 355 494 782 8.92e-41 160
MsG0780040079.01.T01 AT4G00330 32.639 288 178 6 65 340 106 389 8.96e-41 154
MsG0780040079.01.T01 AT4G00330 32.639 288 178 6 65 340 106 389 8.96e-41 154
MsG0780040079.01.T01 AT1G56145 31.884 345 212 8 3 343 523 848 9.49e-41 160
MsG0780040079.01.T01 AT1G51890 35.179 307 166 10 64 355 558 846 9.80e-41 160
MsG0780040079.01.T01 AT4G04540 35.395 291 169 6 65 347 340 619 9.92e-41 159
MsG0780040079.01.T01 AT1G61500 34.940 249 156 3 66 310 479 725 1.03e-40 160
MsG0780040079.01.T01 AT1G61500 34.940 249 156 3 66 310 484 730 1.15e-40 160
MsG0780040079.01.T01 AT4G04570 38.605 215 126 3 65 275 171 383 1.20e-40 154
MsG0780040079.01.T01 AT1G61500 34.940 249 156 3 66 310 461 707 1.21e-40 160
MsG0780040079.01.T01 AT1G24650 37.600 250 134 6 40 279 516 753 1.25e-40 160
MsG0780040079.01.T01 AT1G70130 30.293 307 201 6 65 364 321 621 1.28e-40 159
MsG0780040079.01.T01 AT2G35620 33.526 346 206 9 4 343 240 567 1.31e-40 157
MsG0780040079.01.T01 AT2G35620 33.526 346 206 9 4 343 240 567 1.31e-40 157

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Find 388 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CATCTTCTTGTTCAAGTTCT+TGG 0.077902 7:+72810815 None:intergenic
CAATTGTTTCTGATCTTAAA+AGG 0.149825 7:-72816188 MsG0780040079.01.T01:five_prime_UTR
GGACTTCATGTTGTTGAATT+TGG 0.175952 7:+72810836 None:intergenic
TTGATTGGAGAAGGGAAATT+TGG 0.199660 7:-72815099 MsG0780040079.01.T01:CDS
CGGAATCTCGTAACTCTTAT+TGG 0.200553 7:-72814716 MsG0780040079.01.T01:CDS
TCCGCCTATCGAGCTGAATT+TGG 0.266846 7:+72810431 None:intergenic
AAGACGCGTGAGGGTACTTT+TGG 0.271554 7:+72810708 None:intergenic
CGATGAAAACTTCATTTCTA+AGG 0.278500 7:-72814166 MsG0780040079.01.T01:CDS
TTCGCCAAACAAGTGTTTCT+AGG 0.292902 7:-72815343 MsG0780040079.01.T01:CDS
ATATGAAAATGCTTCCTAAA+AGG 0.298967 7:+72816222 None:intergenic
ATGCACCAATTGCATCAAAA+TGG 0.317533 7:+72816106 None:intergenic
GGATATCGATAATACTTATA+TGG 0.333200 7:-72815376 MsG0780040079.01.T01:CDS
TTGCGTCGGGTTGTAGAACT+TGG 0.338813 7:+72810764 None:intergenic
CCTACTGTTAATAAGATGTT+TGG 0.347651 7:-72813376 MsG0780040079.01.T01:CDS
CTAGCCAGAGTTGAAATTGT+AGG 0.352455 7:-72814117 MsG0780040079.01.T01:CDS
AGAGCGATGTATATAGCTTT+GGG 0.354988 7:-72813931 MsG0780040079.01.T01:CDS
AAATCTCTTGCAGCAATAAT+AGG 0.355167 7:-72815428 MsG0780040079.01.T01:CDS
TCGAATTCGCGAGAGACATT+GGG 0.376298 7:+72810931 None:intergenic
TGCTTGATCACTTCCTGTAT+AGG 0.385220 7:+72810073 None:intergenic
ACAGAGATGAGATCAAAGAT+AGG 0.385250 7:+72810595 None:intergenic
GCAGGTCTTCTTTCACTTGA+AGG 0.386993 7:+72813351 None:intergenic
ATTTCTAAGGTCGCAGATGC+AGG 0.388449 7:-72814153 MsG0780040079.01.T01:CDS
GAAATTCTTATGCACCAAAC+GGG 0.399897 7:+72814209 None:intergenic
AAGAGCGATGTATATAGCTT+TGG 0.406234 7:-72813932 MsG0780040079.01.T01:CDS
TGCGATGAGCTACGTGGAAA+TGG 0.407410 7:-72813331 MsG0780040079.01.T01:CDS
TCACTCTCTGAGTCCCCGTT+TGG 0.420092 7:-72814223 MsG0780040079.01.T01:CDS
CAGCTTGATGCTGCTGAGAA+TGG 0.421109 7:-72810214 MsG0780040079.01.T01:CDS
GACACCGCGACGCTTCTTGA+TGG 0.422310 7:+72815035 None:intergenic
TGTTCGGTTCGCGTTGGAGA+GGG 0.424472 7:-72810110 MsG0780040079.01.T01:CDS
GAACTTGGGTTAGGATATTA+CGG 0.425270 7:+72810779 None:intergenic
TCCAAACACCAATCAAAATC+TGG 0.429035 7:-72813858 MsG0780040079.01.T01:CDS
TTATTTCGTCGCGCCAATGT+TGG 0.443852 7:-72810388 MsG0780040079.01.T01:CDS
GGCTTATGTTCGGTTCGCGT+TGG 0.445916 7:-72810116 MsG0780040079.01.T01:CDS
TGATGCAATTGGTGCATATG+AGG 0.447154 7:-72816100 MsG0780040079.01.T01:five_prime_UTR
GAGACATTGGGGCTTGTTGA+TGG 0.451757 7:+72810943 None:intergenic
TTAAAATGAGGGAAAATAAA+CGG 0.452191 7:+72810487 None:intergenic
AGGTTTCTGCAAAGTGTCAT+TGG 0.452846 7:-72816025 MsG0780040079.01.T01:five_prime_UTR
TCACGGACGCTGTTTGCGTC+GGG 0.453831 7:+72810751 None:intergenic
TTGGGGCTTGTTGATGGTGT+TGG 0.453904 7:+72810949 None:intergenic
ATATACGAATATGTGCCTAA+TGG 0.462869 7:-72814662 MsG0780040079.01.T01:CDS
GAATTCGATCTCGCTATTCA+AGG 0.464116 7:-72810916 MsG0780040079.01.T01:CDS
TACAATAATTGATCAAAGAA+TGG 0.464156 7:-72813436 MsG0780040079.01.T01:CDS
AGCTGCAGGTGCAGTGGCAT+TGG 0.465408 7:-72815402 MsG0780040079.01.T01:CDS
ATCGAATTCGCGAGAGACAT+TGG 0.465657 7:+72810930 None:intergenic
AATTGTTTCTGATCTTAAAA+GGG 0.466669 7:-72816187 MsG0780040079.01.T01:five_prime_UTR
TGACTTGAGACGCTTCCATT+AGG 0.466881 7:+72814647 None:intergenic
TACAAGGGTTTACTTCAAGA+TGG 0.471067 7:-72815069 MsG0780040079.01.T01:CDS
TTCACGGACGCTGTTTGCGT+CGG 0.471730 7:+72810750 None:intergenic
AAGTCCTAGAAACACTTGTT+TGG 0.472259 7:+72815339 None:intergenic
CGGGTTGTAGAACTTGGGTT+AGG 0.476545 7:+72810770 None:intergenic
GCGTCGCGGTGTCACAAGTC+AGG 0.477148 7:-72815025 MsG0780040079.01.T01:CDS
GTCATTGGTAAATGTATCAC+AGG 0.479969 7:-72816010 MsG0780040079.01.T01:five_prime_UTR
CAATCAAAATCTGGTCGAAT+CGG 0.480573 7:-72813849 MsG0780040079.01.T01:intron
AACTGCGGTGGAAGGCGATA+AGG 0.481900 7:-72810137 MsG0780040079.01.T01:CDS
GGTTCGCGTTGGAGAGGGGA+AGG 0.483116 7:-72810105 MsG0780040079.01.T01:CDS
GTTTCCACACATGCTTCGAT+TGG 0.486994 7:-72810310 MsG0780040079.01.T01:CDS
CTTCCACCGCAGTTTGAAGC+CGG 0.494662 7:+72810146 None:intergenic
GAAATTTGGTGAGGTTTACA+AGG 0.495651 7:-72815085 MsG0780040079.01.T01:CDS
AGTTGCAAATGCGAGATACT+AGG 0.495755 7:-72815176 MsG0780040079.01.T01:CDS
GTGCGGATTTCGTTGTAAGA+AGG 0.497093 7:+72810892 None:intergenic
TGAAATCAAAATAATGAGGC+AGG 0.498155 7:+72815976 None:intergenic
TGAAATTCTTATGCACCAAA+CGG 0.503613 7:+72814208 None:intergenic
TTCCGCAGGGTATTAAAATG+AGG 0.505020 7:+72810475 None:intergenic
TTGCATTAGCGAGAGTTTCA+CGG 0.505189 7:+72810734 None:intergenic
AGCTCGATAGGCGGAAATGC+CGG 0.507912 7:-72810423 MsG0780040079.01.T01:CDS
GTTGGATGTATAATAGTAGT+TGG 0.511033 7:-72815498 MsG0780040079.01.T01:five_prime_UTR
ACAAGGGTTTACTTCAAGAT+GGG 0.511273 7:-72815068 MsG0780040079.01.T01:CDS
AATGAACTTGACAACAATGA+TGG 0.511841 7:-72813283 MsG0780040079.01.T01:CDS
GCAATAATAGGAGGAGCTGC+AGG 0.513800 7:-72815416 MsG0780040079.01.T01:CDS
GGATGTTGTGTGGTTGAAGA+GGG 0.514198 7:+72810857 None:intergenic
ATAGCTCAAGGTGCCGCTAA+AGG 0.518751 7:-72814464 MsG0780040079.01.T01:intron
AATTAGACAAAGATGTGAAG+TGG 0.522665 7:+72810657 None:intergenic
AATCAGAGAAACTATTCCGC+AGG 0.523148 7:+72810461 None:intergenic
GCAGGTGCAGTGGCATTGGT+AGG 0.523827 7:-72815398 MsG0780040079.01.T01:CDS
TTTGTGAAATCAAAATAATG+AGG 0.524110 7:+72815972 None:intergenic
TGCATATGAGGGAAGAAAGA+GGG 0.527012 7:-72816088 MsG0780040079.01.T01:five_prime_UTR
GATAGTGAAGAACAATCTAC+AGG 0.529769 7:+72810568 None:intergenic
GTTTCTAGGACTTCAGAGAC+AGG 0.530029 7:-72815329 MsG0780040079.01.T01:CDS
AAGGGATAGACATCCTATAC+AGG 0.530329 7:-72810086 MsG0780040079.01.T01:CDS
AGCGTCTCAAGTCACTTGTA+TGG 0.531375 7:-72814638 MsG0780040079.01.T01:intron
CGGCTTCAAACTGCGGTGGA+AGG 0.533909 7:-72810145 MsG0780040079.01.T01:CDS
TTGAAGAGGGATTTGAATCA+TGG 0.534665 7:+72810870 None:intergenic
TTGCAAAGGATCACCTTTAG+CGG 0.535065 7:+72814451 None:intergenic
TAGATTTACAGCTGAAGGCA+TGG 0.540671 7:-72813409 MsG0780040079.01.T01:CDS
GTTCGGTTCGCGTTGGAGAG+GGG 0.540961 7:-72810109 MsG0780040079.01.T01:CDS
CAGAGATGAGATCAAAGATA+GGG 0.545303 7:+72810596 None:intergenic
ATCTTTCATCTATTCAACAT+CGG 0.547257 7:-72814736 MsG0780040079.01.T01:CDS
ATTTCCACGTAGCTCATCGC+AGG 0.560748 7:+72813333 None:intergenic
ATAATTGATCAAAGAATGGA+GGG 0.561469 7:-72813432 MsG0780040079.01.T01:CDS
ACAGAGGGCGCAACCAACAT+TGG 0.562214 7:+72810375 None:intergenic
TGCGTCGGGTTGTAGAACTT+GGG 0.562983 7:+72810765 None:intergenic
GTTCGCGTTGGAGAGGGGAA+GGG 0.563875 7:-72810104 MsG0780040079.01.T01:CDS
TGTGCCTACAATTTCAACTC+TGG 0.563910 7:+72814113 None:intergenic
TAACACTATTGATAGTCTTG+TGG 0.568395 7:-72810170 MsG0780040079.01.T01:CDS
CTACAATTTCAACTCTGGCT+AGG 0.568810 7:+72814118 None:intergenic
GTGCATATGAGGGAAGAAAG+AGG 0.569260 7:-72816089 MsG0780040079.01.T01:five_prime_UTR
AAGTCAGGAATTTGTTGATG+AGG 0.572752 7:-72815010 MsG0780040079.01.T01:intron
TTTCTAAGGTCGCAGATGCA+GGG 0.572785 7:-72814152 MsG0780040079.01.T01:CDS
CGAATTCGCGAGAGACATTG+GGG 0.575018 7:+72810932 None:intergenic
AGATGTTTGTTACCTTGTGA+AGG 0.575678 7:+72815296 None:intergenic
CTATTGATAGTCTTGTGGAC+CGG 0.577981 7:-72810165 MsG0780040079.01.T01:CDS
GAAATAAACGAATTCTATGC+CGG 0.578412 7:+72810404 None:intergenic
CAGGTGCAGTGGCATTGGTA+GGG 0.581405 7:-72815397 MsG0780040079.01.T01:CDS
GAGGGTAGATTTACAGCTGA+AGG 0.581948 7:-72813414 MsG0780040079.01.T01:CDS
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CRISPR-GE

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!!! TATTTCATCTTTATAATTTT+TGG + Chr7:72813722-72813741 None:intergenic 10.0%
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!!! TTTTTTCTTCTCTTTTGAAA+AGG + Chr7:72816007-72816026 None:intergenic 20.0%
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! ATAGTGATTCTAATATGCAT+TGG + Chr7:72812623-72812642 None:intergenic 25.0%
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! ATCTTTCATCTATTCAACAT+CGG - Chr7:72811527-72811546 MsG0780040079.01.T01:intron 25.0%
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! CATACATATATTTGAGGAAT+GGG + Chr7:72814232-72814251 None:intergenic 25.0%
! GGATATCGATAATACTTATA+TGG - Chr7:72810887-72810906 MsG0780040079.01.T01:CDS 25.0%
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! TATTTCCACTGTAATTTACA+TGG - Chr7:72814891-72814910 MsG0780040079.01.T01:intron 25.0%
! TCAAAAGAGAAGAAAAAAGA+AGG - Chr7:72816009-72816028 MsG0780040079.01.T01:five_prime_UTR 25.0%
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! TGATTGAAATTGAAGAGTTA+GGG + Chr7:72815219-72815238 None:intergenic 25.0%
! TTAAGCAACTGTTCAAAAAT+CGG + Chr7:72816232-72816251 None:intergenic 25.0%
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!!! TAATTTACATGGTTTTGAAG+TGG - Chr7:72814902-72814921 MsG0780040079.01.T01:intron 25.0%
!!! TGTTCTGAGAAATGAAAATT+AGG + Chr7:72815287-72815306 None:intergenic 25.0%
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!!! TTTTTAGTCTATAGATGAAG+TGG + Chr7:72813884-72813903 None:intergenic 25.0%
!!! TTTTTATTGTTTTGGAGTTC+AGG - Chr7:72810743-72810762 MsG0780040079.01.T01:CDS 25.0%
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AATTAGACAAAGATGTGAAG+TGG + Chr7:72815609-72815628 None:intergenic 30.0%
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CCTACTGTTAATAAGATGTT+TGG - Chr7:72812887-72812906 MsG0780040079.01.T01:intron 30.0%
CGATGAAAACTTCATTTCTA+AGG - Chr7:72812097-72812116 MsG0780040079.01.T01:intron 30.0%
GAAATAAACGAATTCTATGC+CGG + Chr7:72815862-72815881 None:intergenic 30.0%
GACAAAAATTTGATTGGAGA+AGG - Chr7:72811155-72811174 MsG0780040079.01.T01:intron 30.0%
GAGAAGAAAAAAGAAGGAAT+TGG - Chr7:72816015-72816034 MsG0780040079.01.T01:five_prime_UTR 30.0%
GATGGGCAATTAAACTAAAA+GGG + Chr7:72814195-72814214 None:intergenic 30.0%
GTGATTGAAATTGAAGAGTT+AGG + Chr7:72815220-72815239 None:intergenic 30.0%
GTTAATATGACAGTGAAGAT+TGG - Chr7:72813286-72813305 MsG0780040079.01.T01:CDS 30.0%
GTTGGATGTATAATAGTAGT+TGG - Chr7:72810765-72810784 MsG0780040079.01.T01:CDS 30.0%
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TAGTTTGAATTCAAAGCCAT+TGG + Chr7:72813439-72813458 None:intergenic 30.0%
TATACAGTTAACAAAGCTAG+AGG - Chr7:72816283-72816302 MsG0780040079.01.T01:five_prime_UTR 30.0%
TATTCACTTTACAGCAGAAA+GGG - Chr7:72813570-72813589 MsG0780040079.01.T01:intron 30.0%
TCGAAATAGAATATAGTCAC+AGG + Chr7:72811669-72811688 None:intergenic 30.0%
TGAAATCAAAATAATGAGGC+AGG + Chr7:72810290-72810309 None:intergenic 30.0%
TGAAATTCTTATGCACCAAA+CGG + Chr7:72812058-72812077 None:intergenic 30.0%
TGTAATTTACCTTGTGAATG+TGG + Chr7:72815191-72815210 None:intergenic 30.0%
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! AAATTTGGTGAGGTTTACAA+GGG - Chr7:72811179-72811198 MsG0780040079.01.T01:intron 30.0%
! ATTTTCCCCTAATGATTTTC+TGG - Chr7:72813216-72813235 MsG0780040079.01.T01:intron 30.0%
! CTTTTGGCATAAAGCAATTT+GGG - Chr7:72813466-72813485 MsG0780040079.01.T01:CDS 30.0%
! GAAACTGTAGATTGTTTTCT+TGG + Chr7:72811579-72811598 None:intergenic 30.0%
! GATTTTTGAACAGTTGCTTA+AGG - Chr7:72816231-72816250 MsG0780040079.01.T01:five_prime_UTR 30.0%
! GTTCATACTATTTTCTATGC+AGG - Chr7:72812005-72812024 MsG0780040079.01.T01:intron 30.0%
! TAACACTATTGATAGTCTTG+TGG - Chr7:72816093-72816112 MsG0780040079.01.T01:five_prime_UTR 30.0%
! TACTATTTTCTATGCAGGTT+TGG - Chr7:72812010-72812029 MsG0780040079.01.T01:intron 30.0%
! TAGTTTTCTTTCTGAATGAC+AGG - Chr7:72811283-72811302 MsG0780040079.01.T01:intron 30.0%
! TGATGGGCAATTAAACTAAA+AGG + Chr7:72814196-72814215 None:intergenic 30.0%
! TTCGATTGGATTTTTGTCAA+TGG - Chr7:72815967-72815986 MsG0780040079.01.T01:intron 30.0%
! TTTTCCCCTAATGATTTTCT+GGG - Chr7:72813217-72813236 MsG0780040079.01.T01:intron 30.0%
!! ATAGTCTTATATTGGACCAA+TGG - Chr7:72813420-72813439 MsG0780040079.01.T01:CDS 30.0%
!! ATTTTCTCTTCATAGTTCTG+AGG - Chr7:72811392-72811411 MsG0780040079.01.T01:intron 30.0%
!! TGAAACCATTTTGATGCAAT+TGG - Chr7:72810152-72810171 MsG0780040079.01.T01:CDS 30.0%
!!! ATTTTGATTGGTGTTTGGAT+GGG + Chr7:72812404-72812423 None:intergenic 30.0%
!!! TATCCCTTGTTTTTTTTCCT+GGG - Chr7:72813170-72813189 MsG0780040079.01.T01:intron 30.0%
!!! TCTTTTGACTTATTAGTCCA+TGG - Chr7:72814941-72814960 MsG0780040079.01.T01:intron 30.0%
!!! TTTTCTCTTCATAGTTCTGA+GGG - Chr7:72811393-72811412 MsG0780040079.01.T01:intron 30.0%
AAAGTGAAACTGTTTGACCA+TGG + Chr7:72814961-72814980 None:intergenic 35.0%
AAATTCTTATGCACCAAACG+GGG + Chr7:72812056-72812075 None:intergenic 35.0%
AAGAGAAGAAAACTGATACC+AGG + Chr7:72811861-72811880 None:intergenic 35.0%
AAGAGCGATGTATATAGCTT+TGG - Chr7:72812331-72812350 MsG0780040079.01.T01:intron 35.0%
AAGTCCTAGAAACACTTGTT+TGG + Chr7:72810927-72810946 None:intergenic 35.0%
AATTTACCTTGTGAATGTGG+AGG + Chr7:72815188-72815207 None:intergenic 35.0%
ACAAGGGTTTACTTCAAGAT+GGG - Chr7:72811195-72811214 MsG0780040079.01.T01:intron 35.0%
ACACTGGATAGTGATATAGT+CGG + Chr7:72812480-72812499 None:intergenic 35.0%
ACAGAGATGAGATCAAAGAT+AGG + Chr7:72815671-72815690 None:intergenic 35.0%
ACCAAATGACTGAAAGTCTT+AGG + Chr7:72811923-72811942 None:intergenic 35.0%
ACTTGCTTCCATGTTAAGAT+AGG - Chr7:72814368-72814387 MsG0780040079.01.T01:intron 35.0%
AGAGCGATGTATATAGCTTT+GGG - Chr7:72812332-72812351 MsG0780040079.01.T01:intron 35.0%
AGGATTTGGAGATTTCACAT+TGG + Chr7:72814027-72814046 None:intergenic 35.0%
ATATGACAGTGAAGATTGGT+TGG - Chr7:72813290-72813309 MsG0780040079.01.T01:CDS 35.0%
ATGAACCCCAGAAAATCATT+AGG + Chr7:72813226-72813245 None:intergenic 35.0%
ATGATTGTTGAGTCTCATAG+TGG + Chr7:72812664-72812683 None:intergenic 35.0%
ATGCACCAATTGCATCAAAA+TGG + Chr7:72810160-72810179 None:intergenic 35.0%
ATTCTAATGGTGATTCACAC+TGG + Chr7:72812496-72812515 None:intergenic 35.0%
CAATCAAAATCTGGTCGAAT+CGG - Chr7:72812414-72812433 MsG0780040079.01.T01:intron 35.0%
CACATTAATGTGCCAAAAAC+TGG - Chr7:72813673-72813692 MsG0780040079.01.T01:intron 35.0%
CAGAGATGAGATCAAAGATA+GGG + Chr7:72815670-72815689 None:intergenic 35.0%
CCAAATTGCTTTATGCCAAA+AGG + Chr7:72813468-72813487 None:intergenic 35.0%
GAAAAAAGAAGGAATTGGCT+AGG - Chr7:72816020-72816039 MsG0780040079.01.T01:five_prime_UTR 35.0%
GAAATTCCTCTGCATCATTA+GGG + Chr7:72811035-72811054 None:intergenic 35.0%
GAAATTCTTATGCACCAAAC+GGG + Chr7:72812057-72812076 None:intergenic 35.0%
GACCACAAAATTGCAAAAAG+GGG + Chr7:72814052-72814071 None:intergenic 35.0%
GACTAGGTTCATAATATGAC+TGG - Chr7:72813511-72813530 MsG0780040079.01.T01:intron 35.0%
GATAGTGAAGAACAATCTAC+AGG + Chr7:72815698-72815717 None:intergenic 35.0%
GGAATTTCATTACATGCAGT+TGG - Chr7:72811047-72811066 MsG0780040079.01.T01:intron 35.0%
GGACCACAAAATTGCAAAAA+GGG + Chr7:72814053-72814072 None:intergenic 35.0%
GGACTTCATGTTGTTGAATT+TGG + Chr7:72815430-72815449 None:intergenic 35.0%
GGATGTATAATAGTAGTTGG+TGG - Chr7:72810768-72810787 MsG0780040079.01.T01:CDS 35.0%
GTATTCACTTTACAGCAGAA+AGG - Chr7:72813569-72813588 MsG0780040079.01.T01:intron 35.0%
GTCATTGGTAAATGTATCAC+AGG - Chr7:72810253-72810272 MsG0780040079.01.T01:CDS 35.0%
TAAAACTACTGCAATTGAGG+TGG + Chr7:72815020-72815039 None:intergenic 35.0%
TACAAGGGTTTACTTCAAGA+TGG - Chr7:72811194-72811213 MsG0780040079.01.T01:intron 35.0%
TACAATGTGTTAGGTGAAAG+AGG - Chr7:72810663-72810682 MsG0780040079.01.T01:CDS 35.0%
TCATAAGCTGTATCACATTG+CGG + Chr7:72815725-72815744 None:intergenic 35.0%
TCCAAACACCAATCAAAATC+TGG - Chr7:72812405-72812424 MsG0780040079.01.T01:intron 35.0%
TCCTAAGACTTTCAGTCATT+TGG - Chr7:72811919-72811938 MsG0780040079.01.T01:intron 35.0%
TGAAAATGCTTCCTAAAAGG+TGG + Chr7:72810041-72810060 None:intergenic 35.0%
TGAAATTCCTCTGCATCATT+AGG + Chr7:72811036-72811055 None:intergenic 35.0%
TGAACCCCAGAAAATCATTA+GGG + Chr7:72813225-72813244 None:intergenic 35.0%
TGTTGAATTTGGATGTTGTG+TGG + Chr7:72815419-72815438 None:intergenic 35.0%
TTGAAGAGGGATTTGAATCA+TGG + Chr7:72815396-72815415 None:intergenic 35.0%
TTGATTGGAGAAGGGAAATT+TGG - Chr7:72811164-72811183 MsG0780040079.01.T01:intron 35.0%
TTTGTGAATTACATAGGGCT+AGG - Chr7:72813107-72813126 MsG0780040079.01.T01:intron 35.0%
! ACAAACACGATCAAAAGTGT+CGG + Chr7:72812717-72812736 None:intergenic 35.0%
! ACATCTTTAGCTTCAAACTC+GGG - Chr7:72813822-72813841 MsG0780040079.01.T01:intron 35.0%
! AGATGTTTGTTACCTTGTGA+AGG + Chr7:72810970-72810989 None:intergenic 35.0%
! CATCTTCTTGTTCAAGTTCT+TGG + Chr7:72815451-72815470 None:intergenic 35.0%
! CCTTTTGGCATAAAGCAATT+TGG - Chr7:72813465-72813484 MsG0780040079.01.T01:CDS 35.0%
! GAAATTTGGTGAGGTTTACA+AGG - Chr7:72811178-72811197 MsG0780040079.01.T01:intron 35.0%
! GAACTTGGGTTAGGATATTA+CGG + Chr7:72815487-72815506 None:intergenic 35.0%
! GACATCTTTAGCTTCAAACT+CGG - Chr7:72813821-72813840 MsG0780040079.01.T01:intron 35.0%
! GTCGACATTTTTACTCTACT+TGG - Chr7:72814103-72814122 MsG0780040079.01.T01:CDS 35.0%
! TTGATTTTCGTGATCAGCAT+TGG - Chr7:72810214-72810233 MsG0780040079.01.T01:CDS 35.0%
! TTTCCCCTAATGATTTTCTG+GGG - Chr7:72813218-72813237 MsG0780040079.01.T01:intron 35.0%
! TTTTGCTGGAATTGTTGAGT+GGG - Chr7:72812359-72812378 MsG0780040079.01.T01:intron 35.0%
! TTTTTGCTGGAATTGTTGAG+TGG - Chr7:72812358-72812377 MsG0780040079.01.T01:intron 35.0%
!! AAGTCAGGAATTTGTTGATG+AGG - Chr7:72811253-72811272 MsG0780040079.01.T01:intron 35.0%
!! AGAGATTTTGACATCTGGTA+TGG + Chr7:72810823-72810842 None:intergenic 35.0%
!! CATAGCTTTAAGCATAGACA+AGG + Chr7:72811949-72811968 None:intergenic 35.0%
!! TTTTGATTGGTGTTTGGATG+GGG + Chr7:72812403-72812422 None:intergenic 35.0%
!!! AATGCTCACTGATTTTGCAA+AGG + Chr7:72811829-72811848 None:intergenic 35.0%
!!! ACCAGATTTTGATTGGTGTT+TGG + Chr7:72812409-72812428 None:intergenic 35.0%
!!! AGACAGAGAGGTTTTTTTCT+GGG - Chr7:72809989-72810008 MsG0780040079.01.T01:CDS 35.0%
!!! CTATCCCTTGTTTTTTTTCC+TGG - Chr7:72813169-72813188 MsG0780040079.01.T01:intron 35.0%
!!! CTCTTTTTTCTCTCTAATGC+AGG - Chr7:72812773-72812792 MsG0780040079.01.T01:intron 35.0%
!!! GATTTTGATTGGTGTTTGGA+TGG + Chr7:72812405-72812424 None:intergenic 35.0%
!!! GTGGATTTTGGTTTGAAGTT+AGG + Chr7:72814495-72814514 None:intergenic 35.0%
!!! TATTGTTTTGGAGTTCAGGT+TGG - Chr7:72810747-72810766 MsG0780040079.01.T01:CDS 35.0%
!!! TGGCTTTGATTTTCCTTTGA+AGG - Chr7:72811727-72811746 MsG0780040079.01.T01:intron 35.0%
!!! TTGAATTCTAGCTTTTCTCG+AGG + Chr7:72811766-72811785 None:intergenic 35.0%
!!! TTTACATGGTTTTGAAGTGG+TGG - Chr7:72814905-72814924 MsG0780040079.01.T01:intron 35.0%
AAAGCAATTTGGGAAGGTGA+TGG - Chr7:72813476-72813495 MsG0780040079.01.T01:intron 40.0%
AAATCCAATCGAAGCATGTG+TGG + Chr7:72815960-72815979 None:intergenic 40.0%
AAATGCTTCCTAAAAGGTGG+TGG + Chr7:72810038-72810057 None:intergenic 40.0%
AACACCAAATTCAGCTCGAT+AGG - Chr7:72815828-72815847 MsG0780040079.01.T01:intron 40.0%
AAGGCGATAAGGCTTATGTT+CGG - Chr7:72816137-72816156 MsG0780040079.01.T01:five_prime_UTR 40.0%
AAGGGATAGACATCCTATAC+AGG - Chr7:72816177-72816196 MsG0780040079.01.T01:five_prime_UTR 40.0%
AATAGGTCAGATCGGTCTTT+AGG + Chr7:72814875-72814894 None:intergenic 40.0%
AATCAGAGAAACTATTCCGC+AGG + Chr7:72815805-72815824 None:intergenic 40.0%
AATTGAGGTGGAGAAAGAGA+TGG + Chr7:72815008-72815027 None:intergenic 40.0%
ACAGTGGAAATAGGTCAGAT+CGG + Chr7:72814883-72814902 None:intergenic 40.0%
AGAAAGAGATGGAATAGTGG+TGG + Chr7:72814997-72815016 None:intergenic 40.0%
AGAGAAATTACTCAGGTGCA+AGG + Chr7:72812205-72812224 None:intergenic 40.0%
AGTACAAAGAAGAGACAGAG+AGG - Chr7:72809977-72809996 MsG0780040079.01.T01:CDS 40.0%
AGTTGCAAATGCGAGATACT+AGG - Chr7:72811087-72811106 MsG0780040079.01.T01:intron 40.0%
ATAGGTCAGATCGGTCTTTA+GGG + Chr7:72814874-72814893 None:intergenic 40.0%
ATATGACTGGGAATTGCTGA+TGG - Chr7:72813524-72813543 MsG0780040079.01.T01:intron 40.0%
ATCAGAGAAACTATTCCGCA+GGG + Chr7:72815804-72815823 None:intergenic 40.0%
ATCTATAGCTGTTGTCACTG+CGG - Chr7:72815925-72815944 MsG0780040079.01.T01:intron 40.0%
CAAAATTGCAAAAAGGGGCA+AGG + Chr7:72814047-72814066 None:intergenic 40.0%
CATAGACTCTCAATAGCTCA+AGG - Chr7:72811787-72811806 MsG0780040079.01.T01:intron 40.0%
CCACTTTGACATATGTGACA+TGG - Chr7:72814139-72814158 MsG0780040079.01.T01:CDS 40.0%
CCATGTCACATATGTCAAAG+TGG + Chr7:72814142-72814161 None:intergenic 40.0%
CGGAATCTCGTAACTCTTAT+TGG - Chr7:72811547-72811566 MsG0780040079.01.T01:intron 40.0%
CTACAATTTCAACTCTGGCT+AGG + Chr7:72812148-72812167 None:intergenic 40.0%
CTAGCCAGAGTTGAAATTGT+AGG - Chr7:72812146-72812165 MsG0780040079.01.T01:intron 40.0%
GAACCCCAGAAAATCATTAG+GGG + Chr7:72813224-72813243 None:intergenic 40.0%
GAATTCGATCTCGCTATTCA+AGG - Chr7:72815347-72815366 MsG0780040079.01.T01:CDS 40.0%
GAATTTCAAGGTGAGTTGCT+TGG + Chr7:72813610-72813629 None:intergenic 40.0%
GATGCAATTGGTGCATATGA+GGG - Chr7:72810164-72810183 MsG0780040079.01.T01:CDS 40.0%
GCAAAATCAGTGAGCATTTG+TGG - Chr7:72811831-72811850 MsG0780040079.01.T01:intron 40.0%
GCACAAGAAAACTTTGCAGA+CGG + Chr7:72811692-72811711 None:intergenic 40.0%
GGGACCACAAAATTGCAAAA+AGG + Chr7:72814054-72814073 None:intergenic 40.0%
GTCATGCAAGATGATACCAA+TGG + Chr7:72810439-72810458 None:intergenic 40.0%
TAGATTTACAGCTGAAGGCA+TGG - Chr7:72812854-72812873 MsG0780040079.01.T01:intron 40.0%
TAGTTTCCCTAATGATGCAG+AGG - Chr7:72811026-72811045 MsG0780040079.01.T01:intron 40.0%
TATGACTGGGAATTGCTGAT+GGG - Chr7:72813525-72813544 MsG0780040079.01.T01:intron 40.0%
TATGTCAAAGTGGCATTACG+TGG + Chr7:72814132-72814151 None:intergenic 40.0%
TCTCTTGCAGCAATAATAGG+AGG - Chr7:72810838-72810857 MsG0780040079.01.T01:CDS 40.0%
TGAAGGAGTTAAGGAGTTGA+AGG + Chr7:72815141-72815160 None:intergenic 40.0%
TGATGCAATTGGTGCATATG+AGG - Chr7:72810163-72810182 MsG0780040079.01.T01:CDS 40.0%
TGCATATGAGGGAAGAAAGA+GGG - Chr7:72810175-72810194 MsG0780040079.01.T01:CDS 40.0%
TGCTTGATCACTTCCTGTAT+AGG + Chr7:72816193-72816212 None:intergenic 40.0%
TGGAGAAAGAGATGGAATAG+TGG + Chr7:72815000-72815019 None:intergenic 40.0%
TGGCATAAAGCAATTTGGGA+AGG - Chr7:72813470-72813489 MsG0780040079.01.T01:CDS 40.0%
TGGCCCAGGAAAAAAAACAA+GGG + Chr7:72813176-72813195 None:intergenic 40.0%
TGTGCCTACAATTTCAACTC+TGG + Chr7:72812153-72812172 None:intergenic 40.0%
TGTGCTCTTGCTGATAATTG+TGG - Chr7:72811707-72811726 MsG0780040079.01.T01:intron 40.0%
TTACATGCAGTTGGAAGACA+TGG - Chr7:72811056-72811075 MsG0780040079.01.T01:intron 40.0%
TTCGCCAAACAAGTGTTTCT+AGG - Chr7:72810920-72810939 MsG0780040079.01.T01:CDS 40.0%
TTGCAAAGGATCACCTTTAG+CGG + Chr7:72811815-72811834 None:intergenic 40.0%
TTGCATTAGCGAGAGTTTCA+CGG + Chr7:72815532-72815551 None:intergenic 40.0%
TTGGCCCAGGAAAAAAAACA+AGG + Chr7:72813177-72813196 None:intergenic 40.0%
TTTGCACGTCAGAGACTATA+AGG - Chr7:72814614-72814633 MsG0780040079.01.T01:intron 40.0%
! AGGTTTCTGCAAAGTGTCAT+TGG - Chr7:72810238-72810257 MsG0780040079.01.T01:CDS 40.0%
! ATGTCTGGTACTGAGCATTA+GGG + Chr7:72812567-72812586 None:intergenic 40.0%
! CATCTTTAGCTTCAAACTCG+GGG - Chr7:72813823-72813842 MsG0780040079.01.T01:intron 40.0%
! GAGCGATGTATATAGCTTTG+GGG - Chr7:72812333-72812352 MsG0780040079.01.T01:intron 40.0%
! GGTTTTCATTGCTTACAGAG+TGG - Chr7:72810010-72810029 MsG0780040079.01.T01:CDS 40.0%
! TAATTGGCTTCCGAGAGTAA+CGG + Chr7:72813021-72813040 None:intergenic 40.0%
! TCCGCAGGGTATTAAAATGA+GGG + Chr7:72815790-72815809 None:intergenic 40.0%
! TGCCCCTTTTTGCAATTTTG+TGG - Chr7:72814047-72814066 MsG0780040079.01.T01:intron 40.0%
! TTCCGCAGGGTATTAAAATG+AGG + Chr7:72815791-72815810 None:intergenic 40.0%
!! AACCATGAAGAGTGTTCTCT+GGG + Chr7:72815050-72815069 None:intergenic 40.0%
!! CGATTCGACCAGATTTTGAT+TGG + Chr7:72812416-72812435 None:intergenic 40.0%
!! CTATTGATAGTCTTGTGGAC+CGG - Chr7:72816098-72816117 MsG0780040079.01.T01:five_prime_UTR 40.0%
!! CTGCAAGAGATTTTGACATC+TGG + Chr7:72810828-72810847 None:intergenic 40.0%
!! GCATGGTTTGTTAGACTATC+AGG - Chr7:72813643-72813662 MsG0780040079.01.T01:intron 40.0%
!! TAACCATGAAGAGTGTTCTC+TGG + Chr7:72815051-72815070 None:intergenic 40.0%
!! TCCCTCATTTTAATACCCTG+CGG - Chr7:72815786-72815805 MsG0780040079.01.T01:intron 40.0%
!! TCTTCATAGTTCTGAGGGAT+TGG - Chr7:72811398-72811417 MsG0780040079.01.T01:intron 40.0%
!! TTTCTAGGACTTCAGAGACA+GGG - Chr7:72810935-72810954 MsG0780040079.01.T01:CDS 40.0%
!! TTTTCGTGATCAGCATTGGA+AGG - Chr7:72810218-72810237 MsG0780040079.01.T01:CDS 40.0%
!!! GAGACAGAGAGGTTTTTTTC+TGG - Chr7:72809988-72810007 MsG0780040079.01.T01:CDS 40.0%
!!! TAGCTTTGGGGTATTTTTGC+TGG - Chr7:72812345-72812364 MsG0780040079.01.T01:intron 40.0%
!!! TTTTGGGGTCTAATTACAGC+TGG + Chr7:72813705-72813724 None:intergenic 40.0%
AAGAAGAAACAAGACGCGTG+AGG + Chr7:72815568-72815587 None:intergenic 45.0%
AAGCCACCAAGAAATGGTGA+GGG + Chr7:72814674-72814693 None:intergenic 45.0%
AATGCTCAGTACCAGACATC+TGG - Chr7:72812568-72812587 MsG0780040079.01.T01:intron 45.0%
ACCAAATTCAGCTCGATAGG+CGG - Chr7:72815831-72815850 MsG0780040079.01.T01:intron 45.0%
AGAACACCAACCGTTACTCT+CGG - Chr7:72813008-72813027 MsG0780040079.01.T01:intron 45.0%
AGAAGAAACAAGACGCGTGA+GGG + Chr7:72815567-72815586 None:intergenic 45.0%
AGCGTCTCAAGTCACTTGTA+TGG - Chr7:72811625-72811644 MsG0780040079.01.T01:intron 45.0%
AGGAAGTGATCAAGCAACTG+AGG - Chr7:72816197-72816216 MsG0780040079.01.T01:five_prime_UTR 45.0%
ATACAGTTGCGAGTACACAG+AGG + Chr7:72815907-72815926 None:intergenic 45.0%
ATATGAGGGAAGAAAGAGGG+AGG - Chr7:72810178-72810197 MsG0780040079.01.T01:CDS 45.0%
ATCGAATTCGCGAGAGACAT+TGG + Chr7:72815336-72815355 None:intergenic 45.0%
ATGCATCACGATCTCTTGCA+GGG - Chr7:72812282-72812301 MsG0780040079.01.T01:intron 45.0%
GAGGAATGGGGAATTGAAGA+GGG + Chr7:72814219-72814238 None:intergenic 45.0%
GAGGGATTTGAATCATGGTG+CGG + Chr7:72815391-72815410 None:intergenic 45.0%
GAGGGTAGATTTACAGCTGA+AGG - Chr7:72812849-72812868 MsG0780040079.01.T01:intron 45.0%
GCAGGTCTTCTTTCACTTGA+AGG + Chr7:72812915-72812934 None:intergenic 45.0%
GGAATTGCTGATGGGAGAAT+TGG - Chr7:72813533-72813552 MsG0780040079.01.T01:intron 45.0%
GGATGTTGTGTGGTTGAAGA+GGG + Chr7:72815409-72815428 None:intergenic 45.0%
GTGCATATGAGGGAAGAAAG+AGG - Chr7:72810174-72810193 MsG0780040079.01.T01:CDS 45.0%
GTGCGGATTTCGTTGTAAGA+AGG + Chr7:72815374-72815393 None:intergenic 45.0%
GTTACCTTGTGAAGGATCAG+AGG + Chr7:72810962-72810981 None:intergenic 45.0%
GTTTCCACACATGCTTCGAT+TGG - Chr7:72815953-72815972 MsG0780040079.01.T01:intron 45.0%
TAAGCCACCAAGAAATGGTG+AGG + Chr7:72814675-72814694 None:intergenic 45.0%
TACAGTTGCGAGTACACAGA+GGG + Chr7:72815906-72815925 None:intergenic 45.0%
TAGGTCAGATCGGTCTTTAG+GGG + Chr7:72814873-72814892 None:intergenic 45.0%
TCACTTTACAGCAGAAAGGG+AGG - Chr7:72813573-72813592 MsG0780040079.01.T01:intron 45.0%
TCGAATTCGCGAGAGACATT+GGG + Chr7:72815335-72815354 None:intergenic 45.0%
TGACTTGAGACGCTTCCATT+AGG + Chr7:72811619-72811638 None:intergenic 45.0%
TGAGGAATGGGGAATTGAAG+AGG + Chr7:72814220-72814239 None:intergenic 45.0%
TGCAAAAAGGGGCAAGGATT+TGG + Chr7:72814041-72814060 None:intergenic 45.0%
TGGATGTTGTGTGGTTGAAG+AGG + Chr7:72815410-72815429 None:intergenic 45.0%
TTATTTCGTCGCGCCAATGT+TGG - Chr7:72815875-72815894 MsG0780040079.01.T01:intron 45.0%
TTCCCAGAGAACACTCTTCA+TGG - Chr7:72815045-72815064 MsG0780040079.01.T01:CDS 45.0%
! ACAGTGAAGATTGGTTGGTG+TGG - Chr7:72813295-72813314 MsG0780040079.01.T01:CDS 45.0%
! AGATACTAGGCGTTTTGCGA+TGG - Chr7:72811100-72811119 MsG0780040079.01.T01:intron 45.0%
! AGCTGGCTACATCCAGTTTT+TGG + Chr7:72813688-72813707 None:intergenic 45.0%
! GATGTCTGGTACTGAGCATT+AGG + Chr7:72812568-72812587 None:intergenic 45.0%
! GGAAGAAAGAGGGAGGTTTT+TGG - Chr7:72810185-72810204 MsG0780040079.01.T01:CDS 45.0%
! TGGAGAAGGGAAATTTGGTG+AGG - Chr7:72811169-72811188 MsG0780040079.01.T01:intron 45.0%
! TGTCTGGTACTGAGCATTAG+GGG + Chr7:72812566-72812585 None:intergenic 45.0%
! TTCTGAGGGATTGGAGCTAA+AGG - Chr7:72811407-72811426 MsG0780040079.01.T01:intron 45.0%
! TTGTTGACTAGCGCCTTCAA+AGG + Chr7:72811743-72811762 None:intergenic 45.0%
!! ATTTCTAAGGTCGCAGATGC+AGG - Chr7:72812110-72812129 MsG0780040079.01.T01:intron 45.0%
!! GTTTCTAGGACTTCAGAGAC+AGG - Chr7:72810934-72810953 MsG0780040079.01.T01:CDS 45.0%
!! TTTCTAAGGTCGCAGATGCA+GGG - Chr7:72812111-72812130 MsG0780040079.01.T01:intron 45.0%
!! TAAATAAATAAATAAAAAGA+AGG - Chr7:72813052-72813071 MsG0780040079.01.T01:intron 5.0%
AACCCCTCACCATTTCTTGG+TGG - Chr7:72814668-72814687 MsG0780040079.01.T01:CDS 50.0%
AACTCCACACTCCAGATGTC+TGG + Chr7:72812582-72812601 None:intergenic 50.0%
AGCCACCAAGAAATGGTGAG+GGG + Chr7:72814673-72814692 None:intergenic 50.0%
ATACAACTGCTCATTGGCCC+AGG + Chr7:72813190-72813209 None:intergenic 50.0%
ATTTCCACGTAGCTCATCGC+AGG + Chr7:72812933-72812952 None:intergenic 50.0%
CAGCTTGATGCTGCTGAGAA+TGG - Chr7:72816049-72816068 MsG0780040079.01.T01:five_prime_UTR 50.0%
CATGCAGTTGGAAGACATGG+TGG - Chr7:72811059-72811078 MsG0780040079.01.T01:intron 50.0%
CATGCATCACGATCTCTTGC+AGG - Chr7:72812281-72812300 MsG0780040079.01.T01:intron 50.0%
CCAAACCCCTCACCATTTCT+TGG - Chr7:72814665-72814684 MsG0780040079.01.T01:CDS 50.0%
CCAAGAAATGGTGAGGGGTT+TGG + Chr7:72814668-72814687 None:intergenic 50.0%
CCTCTTCCTCCACATTCACA+AGG - Chr7:72815179-72815198 MsG0780040079.01.T01:CDS 50.0%
CCTTGTGAATGTGGAGGAAG+AGG + Chr7:72815182-72815201 None:intergenic 50.0%
CGAATTCGCGAGAGACATTG+GGG + Chr7:72815334-72815353 None:intergenic 50.0%
CGGGTTGTAGAACTTGGGTT+AGG + Chr7:72815496-72815515 None:intergenic 50.0%
GAGTGTGGAGTTTGCAGTGT+TGG - Chr7:72812590-72812609 MsG0780040079.01.T01:intron 50.0%
GCAATAATAGGAGGAGCTGC+AGG - Chr7:72810847-72810866 MsG0780040079.01.T01:CDS 50.0%
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GGGGAATTGAAGAGGGTGAT+GGG + Chr7:72814212-72814231 None:intergenic 50.0%
GGGTTTGGCTAACATGCATG+AGG + Chr7:72814653-72814672 None:intergenic 50.0%
GTGAGCATTTGTGGCTTTCC+TGG - Chr7:72811840-72811859 MsG0780040079.01.T01:intron 50.0%
GTTGCGTGGTGAAGGAGTTA+AGG + Chr7:72815150-72815169 None:intergenic 50.0%
TCCGCCTATCGAGCTGAATT+TGG + Chr7:72815835-72815854 None:intergenic 50.0%
TGCGATGAGCTACGTGGAAA+TGG - Chr7:72812932-72812951 MsG0780040079.01.T01:intron 50.0%
TGGGGAATTGAAGAGGGTGA+TGG + Chr7:72814213-72814232 None:intergenic 50.0%
TGTGAATGTGGAGGAAGAGG+AGG + Chr7:72815179-72815198 None:intergenic 50.0%
! AGTACCAGACATCTGGAGTG+TGG - Chr7:72812575-72812594 MsG0780040079.01.T01:intron 50.0%
! TCAGATCGGTCTTTAGGGGT+TGG + Chr7:72814869-72814888 None:intergenic 50.0%
! TGCGTCGGGTTGTAGAACTT+GGG + Chr7:72815501-72815520 None:intergenic 50.0%
! TTGCGTCGGGTTGTAGAACT+TGG + Chr7:72815502-72815521 None:intergenic 50.0%
!! ATAGCTCAAGGTGCCGCTAA+AGG - Chr7:72811799-72811818 MsG0780040079.01.T01:intron 50.0%
!! GAGACATTGGGGCTTGTTGA+TGG + Chr7:72815323-72815342 None:intergenic 50.0%
!! TTGGGAAGGTGATGGAGAGT+GGG - Chr7:72813484-72813503 MsG0780040079.01.T01:intron 50.0%
!! TTGGGGCTTGTTGATGGTGT+TGG + Chr7:72815317-72815336 None:intergenic 50.0%
!! TTTGGGAAGGTGATGGAGAG+TGG - Chr7:72813483-72813502 MsG0780040079.01.T01:intron 50.0%
!!! AAGACGCGTGAGGGTACTTT+TGG + Chr7:72815558-72815577 None:intergenic 50.0%
!!! AGACGCGTGAGGGTACTTTT+GGG + Chr7:72815557-72815576 None:intergenic 50.0%
AACTGCGGTGGAAGGCGATA+AGG - Chr7:72816126-72816145 MsG0780040079.01.T01:five_prime_UTR 55.0%
AAGACCTGCGATGAGCTACG+TGG - Chr7:72812926-72812945 MsG0780040079.01.T01:intron 55.0%
AGCTCGATAGGCGGAAATGC+CGG - Chr7:72815840-72815859 MsG0780040079.01.T01:intron 55.0%
ATGGAGAGTGGGGACAGACT+AGG - Chr7:72813495-72813514 MsG0780040079.01.T01:intron 55.0%
GAATGTGGAGGAAGAGGAGG+TGG + Chr7:72815176-72815195 None:intergenic 55.0%
GGGTCCTCTGATCCTTCACA+AGG - Chr7:72810955-72810974 MsG0780040079.01.T01:CDS 55.0%
TCACTCTCTGAGTCCCCGTT+TGG - Chr7:72812040-72812059 MsG0780040079.01.T01:intron 55.0%
TGGCTTCCGAGAGTAACGGT+TGG + Chr7:72813017-72813036 None:intergenic 55.0%
TTCACGGACGCTGTTTGCGT+CGG + Chr7:72815516-72815535 None:intergenic 55.0%
! ACAGAGGGCGCAACCAACAT+TGG + Chr7:72815891-72815910 None:intergenic 55.0%
! ATGTTCGGTTCGCGTTGGAG+AGG - Chr7:72816152-72816171 MsG0780040079.01.T01:five_prime_UTR 55.0%
! CTTCCACCGCAGTTTGAAGC+CGG + Chr7:72816120-72816139 None:intergenic 55.0%
! GAGTGGCACCACCACCTTTT+AGG - Chr7:72810027-72810046 MsG0780040079.01.T01:CDS 55.0%
! GGCTTATGTTCGGTTCGCGT+TGG - Chr7:72816147-72816166 MsG0780040079.01.T01:five_prime_UTR 55.0%
! TGTGGACCGGCTTCAAACTG+CGG - Chr7:72816111-72816130 MsG0780040079.01.T01:five_prime_UTR 55.0%
! TGTTCGGTTCGCGTTGGAGA+GGG - Chr7:72816153-72816172 MsG0780040079.01.T01:five_prime_UTR 55.0%
!! CAGGTGCAGTGGCATTGGTA+GGG - Chr7:72810866-72810885 MsG0780040079.01.T01:CDS 55.0%
!! GTAGCCATCAAGAAGCGTCG+CGG - Chr7:72811224-72811243 MsG0780040079.01.T01:intron 55.0%
!! TGGGAAGGTGATGGAGAGTG+GGG - Chr7:72813485-72813504 MsG0780040079.01.T01:intron 55.0%
AGAGGAGGTGGAACGTTGCG+TGG + Chr7:72815164-72815183 None:intergenic 60.0%
AGCTGCAGGTGCAGTGGCAT+TGG - Chr7:72810861-72810880 MsG0780040079.01.T01:CDS 60.0%
CGGCTTCAAACTGCGGTGGA+AGG - Chr7:72816118-72816137 MsG0780040079.01.T01:five_prime_UTR 60.0%
GACACCGCGACGCTTCTTGA+TGG + Chr7:72811231-72811250 None:intergenic 60.0%
GGTGGAACGTTGCGTGGTGA+AGG + Chr7:72815158-72815177 None:intergenic 60.0%
GTTCGCGTTGGAGAGGGGAA+GGG - Chr7:72816159-72816178 MsG0780040079.01.T01:five_prime_UTR 60.0%
TCACGGACGCTGTTTGCGTC+GGG + Chr7:72815515-72815534 None:intergenic 60.0%
! GTTCGGTTCGCGTTGGAGAG+GGG - Chr7:72816154-72816173 MsG0780040079.01.T01:five_prime_UTR 60.0%
!! GCAGGTGCAGTGGCATTGGT+AGG - Chr7:72810865-72810884 MsG0780040079.01.T01:CDS 60.0%
AGGAGGAGCTGCAGGTGCAG+TGG - Chr7:72810855-72810874 MsG0780040079.01.T01:CDS 65.0%
GGTTCGCGTTGGAGAGGGGA+AGG - Chr7:72816158-72816177 MsG0780040079.01.T01:five_prime_UTR 65.0%
! GGACCGGCTTCAAACTGCGG+TGG - Chr7:72816114-72816133 MsG0780040079.01.T01:five_prime_UTR 65.0%
!! GCGTCGCGGTGTCACAAGTC+AGG - Chr7:72811238-72811257 MsG0780040079.01.T01:intron 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr7 gene 72809934 72816351 72809934 ID=MsG0780040079.01;Name=MsG0780040079.01
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Chr7 exon 72809934 72810982 72809934 ID=MsG0780040079.01.T01:exon:12987;Parent=MsG0780040079.01.T01
Chr7 exon 72813283 72813490 72813283 ID=MsG0780040079.01.T01:exon:12986;Parent=MsG0780040079.01.T01
Chr7 exon 72813850 72813982 72813850 ID=MsG0780040079.01.T01:exon:12985;Parent=MsG0780040079.01.T01
Chr7 exon 72814072 72814258 72814072 ID=MsG0780040079.01.T01:exon:12984;Parent=MsG0780040079.01.T01
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Chr7 exon 72814639 72814765 72814639 ID=MsG0780040079.01.T01:exon:12982;Parent=MsG0780040079.01.T01
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Chr7 exon 72815309 72815520 72815309 ID=MsG0780040079.01.T01:exon:12980;Parent=MsG0780040079.01.T01
Chr7 exon 72815970 72816351 72815970 ID=MsG0780040079.01.T01:exon:12979;Parent=MsG0780040079.01.T01
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