AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0880044206.01

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MsG0880044206.01.T01 AT1G61430 34.864 806 446 25 46 809 38 806 5.10e-114 365
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MsG0880044206.01.T01 AT1G61360 35.859 739 407 25 89 786 2 714 1.14e-111 357
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MsG0880044206.01.T01 AT4G23320 45.721 409 197 4 399 803 136 523 7.64e-109 343
MsG0880044206.01.T01 AT4G23220 46.617 399 184 7 387 775 245 624 1.35e-108 347
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MsG0880044206.01.T01 AT4G00960 52.665 319 139 7 465 775 32 346 1.61e-107 335
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MsG0880044206.01.T01 AT1G70740 43.697 357 184 5 461 802 21 375 1.23e-91 295
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MsG0880044206.01.T01 AT4G11900 34.694 588 294 21 119 653 152 702 2.01e-83 281
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MsG0880044206.01.T01 AT1G07650 38.660 388 206 5 392 774 605 965 2.01e-78 273
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MsG0880044206.01.T01 AT1G29730 43.631 314 173 3 475 787 661 971 5.88e-73 258
MsG0880044206.01.T01 AT1G29750 45.017 291 159 1 475 765 654 943 1.40e-72 257
MsG0880044206.01.T01 AT1G29750 45.017 291 159 1 475 765 669 958 1.72e-72 257
MsG0880044206.01.T01 AT1G61860 43.151 292 158 4 473 759 71 359 3.29e-72 242
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MsG0880044206.01.T01 AT5G59270 39.583 288 165 5 475 759 340 621 1.87e-61 220
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MsG0880044206.01.T01 AT3G13690 41.017 295 164 5 469 759 393 681 2.07e-61 221
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MsG0880044206.01.T01 AT1G70110 40.391 307 176 4 460 765 320 620 4.39e-61 219
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MsG0880044206.01.T01 AT4G21400 44.944 267 107 6 416 653 301 556 2.97e-58 208
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MsG0880044206.01.T01 AT1G52540 34.539 304 195 2 473 774 26 327 7.28e-58 201
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MsG0880044206.01.T01 AT3G25560 38.438 320 185 6 442 759 273 582 2.96e-57 207
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MsG0880044206.01.T01 AT1G34210 40.328 305 168 6 464 759 280 579 5.19e-57 207
MsG0880044206.01.T01 AT2G39360 40.357 280 160 3 480 756 480 755 6.59e-57 209
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MsG0880044206.01.T01 AT5G57670 39.000 300 164 5 472 764 252 539 8.23e-57 205
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MsG0880044206.01.T01 AT1G15530 37.762 286 173 4 475 759 349 630 9.24e-57 206
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MsG0880044206.01.T01 AT4G02010 36.095 338 200 4 473 796 366 701 9.90e-57 207
MsG0880044206.01.T01 AT1G79620 32.010 403 244 8 371 756 516 905 1.08e-56 211
MsG0880044206.01.T01 AT5G01020 37.037 324 181 7 456 759 26 346 1.24e-56 200
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MsG0880044206.01.T01 AT5G63710 34.259 432 227 13 365 759 116 527 1.31e-56 204
MsG0880044206.01.T01 AT1G79620 32.010 403 244 8 371 756 542 931 1.32e-56 210
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MsG0880044206.01.T01 AT2G13800 41.156 294 161 5 473 759 261 549 1.40e-56 205
MsG0880044206.01.T01 AT2G23950 34.973 366 209 6 400 759 226 568 1.47e-56 206
MsG0880044206.01.T01 AT4G29050 35.933 359 193 9 412 765 310 636 1.51e-56 206
MsG0880044206.01.T01 AT5G01540 35.556 360 196 6 407 762 311 638 2.78e-56 206
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MsG0880044206.01.T01 AT5G38990 40.702 285 166 3 475 756 513 797 3.59e-56 208
MsG0880044206.01.T01 AT1G07570 34.270 356 211 6 418 759 15 361 3.65e-56 199
MsG0880044206.01.T01 AT2G17220 36.086 327 183 7 453 759 46 366 3.81e-56 199
MsG0880044206.01.T01 AT2G17220 36.086 327 183 7 453 759 47 367 4.40e-56 199
MsG0880044206.01.T01 AT5G63710 34.180 433 228 13 364 759 150 562 4.77e-56 204
MsG0880044206.01.T01 AT1G07570 37.624 303 171 5 471 759 52 350 5.02e-56 198
MsG0880044206.01.T01 AT1G07570 37.624 303 171 5 471 759 52 350 5.02e-56 198
MsG0880044206.01.T01 AT1G07570 37.624 303 171 5 471 759 52 350 5.02e-56 198
MsG0880044206.01.T01 AT2G23200 37.261 314 183 6 477 787 478 780 5.83e-56 207
MsG0880044206.01.T01 AT1G24030 34.337 332 203 7 441 759 10 339 6.15e-56 196
MsG0880044206.01.T01 AT5G56790 38.983 295 170 5 469 759 372 660 7.93e-56 204
MsG0880044206.01.T01 AT5G63710 34.180 433 228 13 364 759 151 563 8.32e-56 203
MsG0880044206.01.T01 AT5G60280 39.456 294 166 7 475 765 327 611 9.27e-56 204
MsG0880044206.01.T01 AT5G61350 38.194 288 173 2 473 756 511 797 9.80e-56 206
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MsG0880044206.01.T01 AT5G28680 33.520 358 222 3 409 756 437 788 1.13e-55 206
MsG0880044206.01.T01 AT2G18470 43.636 220 121 2 469 688 266 482 1.43e-55 201
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MsG0880044206.01.T01 AT3G55450 36.513 304 174 6 472 760 46 345 2.30e-55 196
MsG0880044206.01.T01 AT5G54380 33.894 357 225 3 409 756 423 777 2.39e-55 205
MsG0880044206.01.T01 AT4G35030 36.066 305 193 2 461 764 79 382 2.53e-55 197
MsG0880044206.01.T01 AT4G35030 36.066 305 193 2 461 764 79 382 2.53e-55 197
MsG0880044206.01.T01 AT4G35030 36.066 305 193 2 461 764 79 382 2.53e-55 197
MsG0880044206.01.T01 AT4G35030 36.066 305 193 2 461 764 79 382 2.53e-55 197
MsG0880044206.01.T01 AT1G18390 35.912 362 214 8 406 760 261 611 2.97e-55 202
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MsG0880044206.01.T01 AT1G24030 35.836 293 179 5 474 759 63 353 6.19e-55 194
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MsG0880044206.01.T01 AT5G60270 38.889 306 178 6 475 776 329 629 8.09e-55 201
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MsG0880044206.01.T01 AT2G43700 36.301 292 181 4 475 765 300 587 8.75e-55 200
MsG0880044206.01.T01 AT2G43700 36.301 292 181 4 475 765 300 587 8.75e-55 200
MsG0880044206.01.T01 AT2G28930 34.463 354 208 7 471 804 64 413 9.98e-55 195
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MsG0880044206.01.T01 AT2G16750 36.808 307 185 5 455 759 246 545 1.61e-53 196
MsG0880044206.01.T01 AT2G16750 36.808 307 185 5 455 759 246 545 1.61e-53 196
MsG0880044206.01.T01 AT1G69790 36.455 299 174 4 472 759 58 351 1.66e-53 190
MsG0880044206.01.T01 AT1G69790 36.455 299 174 4 472 759 69 362 1.71e-53 191
MsG0880044206.01.T01 AT5G63940 35.374 294 189 1 473 766 348 640 1.82e-53 198
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MsG0880044206.01.T01 AT5G35960 34.796 319 195 7 473 788 120 428 2.90e-53 191
MsG0880044206.01.T01 AT2G43690 36.644 292 180 4 475 765 289 576 3.41e-53 196
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MsG0880044206.01.T01 AT5G03320 35.535 318 174 5 470 767 64 370 4.17e-53 191
MsG0880044206.01.T01 AT4G00330 36.842 285 171 5 475 752 107 389 4.27e-53 190
MsG0880044206.01.T01 AT4G00330 36.842 285 171 5 475 752 107 389 4.27e-53 190

Find 153 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 229 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
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GTTGTTGCATTGTCTTTATT+TGG 0.275207 8:-37612253 None:intergenic
TCACCAGGTTCCCTACAATT+TGG 0.280630 8:-37612205 None:intergenic
AACCCGAAAATTTCTGATTT+CGG 0.283693 8:+37613984 MsG0880044206.01.T01:CDS
CACTTATTAACCTCCCCTTC+GGG 0.285500 8:-37612048 None:intergenic
ATGTTCAATTCACCTTCTTT+TGG 0.286063 8:-37611851 None:intergenic
TCTACCTCATATGAATTAGA+AGG 0.288376 8:+37614672 MsG0880044206.01.T01:CDS
TTTAGAACACAGCTTGGATT+TGG 0.302853 8:-37611393 None:intergenic
AGTATACTCTTTGTCCCGTT+TGG 0.307016 8:-37611683 None:intergenic
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TGATTATCCAACAGATAGTT+TGG 0.332867 8:+37611718 MsG0880044206.01.T01:CDS
TTCGACACAAGACGTTGATT+TGG 0.334356 8:+37612393 MsG0880044206.01.T01:CDS
AAGTCTGATGTTTATAGCTT+TGG 0.343013 8:+37614202 MsG0880044206.01.T01:CDS
TTTGGATATACTTATGGTTA+TGG 0.345159 8:+37611300 MsG0880044206.01.T01:CDS
CAGGATGTATATACTATTCA+TGG 0.345213 8:+37612368 MsG0880044206.01.T01:CDS
AGGCTATGGACCTGTTTATA+AGG 0.351844 8:+37612984 MsG0880044206.01.T01:CDS
TGCTAGCCTTCAAGTCTCTA+TGG 0.357812 8:-37613938 None:intergenic
GTATAGTCAATGCAGGTAAA+AGG 0.359581 8:+37612605 MsG0880044206.01.T01:intron
ATGTAGATAAGAAAAGTAAA+AGG 0.372077 8:+37612803 MsG0880044206.01.T01:intron
GTATACTCTTTGTCCCGTTT+GGG 0.372360 8:-37611682 None:intergenic
GTAGAATAGGTGTCGGTGTC+TGG 0.372367 8:-37614639 None:intergenic
GATCGCCCACTAAACCTAAT+AGG 0.372931 8:+37614280 MsG0880044206.01.T01:CDS
TTCACGACTTCAGGGAATCT+TGG 0.379357 8:+37613307 MsG0880044206.01.T01:intron
TAAGAAAAGTAAAAGGAAGC+AGG 0.382772 8:+37612810 MsG0880044206.01.T01:CDS
TTTGATGTCATAGGATTCAT+TGG 0.391068 8:-37612857 None:intergenic
AACAGGACATAATTGGTCAT+TGG 0.393190 8:+37611772 MsG0880044206.01.T01:CDS
TTGTTGAAGCACAAAGTTAC+CGG 0.404103 8:-37611654 None:intergenic
GGCGAATAATAAATACTAAC+TGG 0.406931 8:-37611593 None:intergenic
TGGTGAGTATCAACAGTTAC+TGG 0.409395 8:+37614404 MsG0880044206.01.T01:CDS
GCAGGGTAAGAGCATTGATT+TGG 0.409397 8:+37612828 MsG0880044206.01.T01:CDS
CGTTACATACCATGGGAATT+CGG 0.409492 8:-37612463 None:intergenic
TTCAAGATCTTTGATGTCAT+AGG 0.412120 8:-37612866 None:intergenic
TGTTAAGTTACCTTATAAAC+AGG 0.413287 8:-37612994 None:intergenic
AATCATCCATAGAGACTTGA+AGG 0.414779 8:+37613932 MsG0880044206.01.T01:CDS
TATATACTTTGAACTTTCGC+TGG 0.419205 8:-37611941 None:intergenic
GCATGGGAGCTATGGAATAA+TGG 0.422415 8:+37614384 MsG0880044206.01.T01:CDS
CAGGTGAACTTAGTCTTGAA+TGG 0.422700 8:+37611825 MsG0880044206.01.T01:CDS
GACGAGGAAACAACTTCTAA+AGG 0.423899 8:+37614615 MsG0880044206.01.T01:CDS
CTATGTCCCAACAATCCTAT+TGG 0.426255 8:-37614048 None:intergenic
ACATGTCTGCATTTGCAACT+TGG 0.430147 8:-37612135 None:intergenic
CGAAAGTTCAAAGTATATAT+CGG 0.433548 8:+37611945 MsG0880044206.01.T01:CDS
AATCAACAGTTAACACCAAT+AGG 0.434687 8:+37614033 MsG0880044206.01.T01:CDS
TTCAACAACTTCACCCAAAC+GGG 0.438551 8:+37611669 MsG0880044206.01.T01:CDS
AACTGCTGAATATATGTCAA+TGG 0.438952 8:-37611516 None:intergenic
GGGAGGAAATACCAAATTGT+AGG 0.441428 8:+37612194 MsG0880044206.01.T01:CDS
GTTAACACCAATAGGATTGT+TGG 0.441453 8:+37614041 MsG0880044206.01.T01:CDS
GTTGCATTCATGAAGAAGAA+AGG 0.441551 8:+37613456 MsG0880044206.01.T01:CDS
ACATGTCCTATTAGGTTTAG+TGG 0.441564 8:-37614286 None:intergenic
TTGGTCATTGGTTTCACGGT+TGG 0.442171 8:+37611784 MsG0880044206.01.T01:CDS
ATGCACCTTTGCACTTCATC+GGG 0.442364 8:-37614453 None:intergenic
ACGAGGAAACAACTTCTAAA+GGG 0.444292 8:+37614616 MsG0880044206.01.T01:CDS
ATGCAGGTAAAAGGAAGATA+TGG 0.448269 8:+37612614 MsG0880044206.01.T01:intron
AATGCACCTTTGCACTTCAT+CGG 0.451794 8:-37614454 None:intergenic
AAGAAGGTGAATTGAACATA+AGG 0.453064 8:+37611855 MsG0880044206.01.T01:CDS
CTTCAGGGAATCTTGGCAAC+AGG 0.460269 8:+37613314 MsG0880044206.01.T01:intron
TTAACACCAATAGGATTGTT+GGG 0.461126 8:+37614042 MsG0880044206.01.T01:CDS
TCACTTATTAACCTCCCCTT+CGG 0.463150 8:-37612049 None:intergenic
TTTCCCTTCTAATTCATATG+AGG 0.464845 8:-37614676 None:intergenic
ATAATTGGTCATTGGTTTCA+CGG 0.466041 8:+37611780 MsG0880044206.01.T01:CDS
TTGCTTCTTGAAATTATTTG+TGG 0.466270 8:+37614229 MsG0880044206.01.T01:CDS
AGAAATTGCTGTCGTAGAAT+AGG 0.473676 8:-37614652 None:intergenic
AAGTTAGGACAGGGAGGCTA+TGG 0.474937 8:+37612970 MsG0880044206.01.T01:CDS
ACAAATCTTGTACAACTACT+TGG 0.476240 8:+37613431 MsG0880044206.01.T01:CDS
AGATCTTGAAGATGATTTCA+AGG 0.477563 8:+37612879 MsG0880044206.01.T01:CDS
TTGGTCCCAACGATGAAGTT+AGG 0.483437 8:+37611737 MsG0880044206.01.T01:CDS
GGGAGGTTAATAAGTGATGC+TGG 0.483913 8:+37612055 MsG0880044206.01.T01:CDS
GCAAGTGCAGACATGTGTTA+TGG 0.485542 8:+37612091 MsG0880044206.01.T01:CDS
TAACGCCTAACTTCATCGTT+GGG 0.488392 8:-37611742 None:intergenic
CTTCAACAACTTCACCCAAA+CGG 0.488894 8:+37611668 MsG0880044206.01.T01:CDS
AAGAAAAGTAAAAGGAAGCA+GGG 0.491639 8:+37612811 MsG0880044206.01.T01:CDS
CCGAACAGGCATGGGAGCTA+TGG 0.492345 8:+37614376 MsG0880044206.01.T01:intron
GAAAATTTCTGATTTCGGTA+TGG 0.496269 8:+37613989 MsG0880044206.01.T01:CDS
GGATATACTTATGGTTATGG+TGG 0.498616 8:+37611303 MsG0880044206.01.T01:CDS
ACCTGAAAACAAGTTAGGAC+AGG 0.498655 8:+37612960 MsG0880044206.01.T01:CDS
TGTTGAACAAATTCCTTCCA+TGG 0.501370 8:-37614179 None:intergenic
TGGAGAAATTGTAATTGCTA+TGG 0.503484 8:+37612319 MsG0880044206.01.T01:CDS
GTTATAAGTAGTGGTGTTGA+CGG 0.505996 8:+37611461 MsG0880044206.01.T01:CDS
GCAAATGCAGACATGTGTTA+TGG 0.507637 8:+37612142 MsG0880044206.01.T01:CDS
GAATGCCGGTCTTCTTGGTA+AGG 0.513088 8:-37614571 None:intergenic
GTTACCGGTATCTAATATAG+TGG 0.513498 8:-37611639 None:intergenic
ACGGGACAAAGAGTATACTA+TGG 0.513941 8:+37611687 MsG0880044206.01.T01:CDS
GTTCTATCTTTAGACTACTC+TGG 0.515082 8:+37611536 MsG0880044206.01.T01:CDS
AGAAGTTGTTTCCTCGTCAA+AGG 0.515373 8:-37614610 None:intergenic
TATGGATATAAAAGTGATGA+AGG 0.516096 8:+37612109 MsG0880044206.01.T01:CDS
CATTCAAGACTAAGTTCACC+TGG 0.516458 8:-37611824 None:intergenic
GGAAAAGCGGCAAAGTGCAT+TGG 0.517449 8:+37611876 MsG0880044206.01.T01:CDS
CAATCATCGTAACCATTGGC+AGG 0.517886 8:-37612283 None:intergenic
TTAACGCCTAACTTCATCGT+TGG 0.518151 8:-37611743 None:intergenic
AGTGGAAAACTCAAAAGTAA+TGG 0.518235 8:+37611902 MsG0880044206.01.T01:CDS
AGGTGAACTTAGTCTTGAAT+GGG 0.518955 8:+37611826 MsG0880044206.01.T01:CDS
CATGTCCTATTAGGTTTAGT+GGG 0.520871 8:-37614285 None:intergenic
ACAGTGTCGTTGGTTGGTTG+AGG 0.522071 8:-37611614 None:intergenic
AGACTAAGTTCACCTGGAGT+TGG 0.526828 8:-37611818 None:intergenic
CTACCTCATATGAATTAGAA+GGG 0.530780 8:+37614673 MsG0880044206.01.T01:CDS
GATCTTGAAGATGATTTCAA+GGG 0.533388 8:+37612880 MsG0880044206.01.T01:CDS
ACAAATGTGTCACTTAATGT+TGG 0.534437 8:-37614429 None:intergenic
GGCAAAGTGCATTGGAAAAG+TGG 0.534792 8:+37611884 MsG0880044206.01.T01:CDS
TGATAGCGAAGAAGCTCACT+TGG 0.535260 8:+37611439 MsG0880044206.01.T01:CDS
GGGTAAGAGCATTGATTTGG+CGG 0.536411 8:+37612831 MsG0880044206.01.T01:CDS
ATATATGCGAAACAAAAGCT+TGG 0.537359 8:+37613493 MsG0880044206.01.T01:CDS
AACATCTGGACAAGGAATTG+TGG 0.543307 8:+37613367 MsG0880044206.01.T01:CDS
GGAGGAAATACCAAATTGTA+GGG 0.543532 8:+37612195 MsG0880044206.01.T01:CDS
GTTGGGACCAAACTATCTGT+TGG 0.551103 8:-37611725 None:intergenic
TTGGAATTCAATGTATCACC+TGG 0.553573 8:-37611374 None:intergenic
CTTGAATGGGAACCAAAAGA+AGG 0.556769 8:+37611839 MsG0880044206.01.T01:CDS
CTTGCAATCATCGTAACCAT+TGG 0.556963 8:-37612287 None:intergenic
GCCTTGTTTAGAACACAGCT+TGG 0.561218 8:-37611399 None:intergenic
GTGTTGACGGCGCTGTAGTG+TGG 0.562794 8:+37611474 MsG0880044206.01.T01:CDS
ATGATTGCAAGATGAGATGT+TGG 0.562795 8:+37612299 MsG0880044206.01.T01:CDS
CACAACCTTACCAAGAAGAC+CGG 0.565143 8:+37614566 MsG0880044206.01.T01:CDS
GCTCACTTGGTTATAAGTAG+TGG 0.576693 8:+37611452 MsG0880044206.01.T01:CDS
GGTAAAAGGAAGATATGGAT+AGG 0.577160 8:+37612619 MsG0880044206.01.T01:intron
ATACCAAATTGTAGGGAACC+TGG 0.577204 8:+37612202 MsG0880044206.01.T01:CDS
ACAAATGATAGTTTGAAGCC+AGG 0.577293 8:+37611356 MsG0880044206.01.T01:CDS
ACTGCTGAATATATGTCAAT+GGG 0.580559 8:-37611515 None:intergenic
GATATAACATCTGACATCGT+AGG 0.584538 8:-37614519 None:intergenic
CGATGGTTCATATCCCCGAA+GGG 0.587867 8:+37612034 MsG0880044206.01.T01:CDS
TATAGTGGCCACAGTGTCGT+TGG 0.590787 8:-37611624 None:intergenic
GTGGCCACTATATTAGATAC+CGG 0.593196 8:+37611635 MsG0880044206.01.T01:CDS
GCTCATTCACTACCAACTCC+AGG 0.596640 8:+37611806 MsG0880044206.01.T01:CDS
GTGGCCACAGTGTCGTTGGT+TGG 0.601245 8:-37611620 None:intergenic
TCTCCAGAATATGCCATGGA+AGG 0.612435 8:+37614166 MsG0880044206.01.T01:CDS
TGCTGTCGTAGAATAGGTGT+CGG 0.613816 8:-37614646 None:intergenic
TCCAAGCTGTGTTCTAAACA+AGG 0.614404 8:+37611398 MsG0880044206.01.T01:CDS
TCTCTTCTAACATAGAATGC+CGG 0.615963 8:-37614585 None:intergenic
GGTTCATATCCCCGAAGGGG+AGG 0.623567 8:+37612038 MsG0880044206.01.T01:CDS
TGTTATGGATATAATAGCGA+CGG 0.627056 8:+37612157 MsG0880044206.01.T01:CDS
TTGTTCCCGATGAAGTGCAA+AGG 0.627943 8:+37614448 MsG0880044206.01.T01:CDS
AAGATGAGAAGTTTATACGA+TGG 0.633455 8:+37612017 MsG0880044206.01.T01:CDS
CATGTCTCCAGAATATGCCA+TGG 0.633456 8:+37614162 MsG0880044206.01.T01:CDS
ATAATCGACGGAATTTCTCA+AGG 0.635422 8:+37613876 MsG0880044206.01.T01:CDS
ACTTATTAACCTCCCCTTCG+GGG 0.636358 8:-37612047 None:intergenic
AAATCACCTCCGAATTCCCA+TGG 0.639305 8:+37612454 MsG0880044206.01.T01:CDS
CCTGAAAACAAGTTAGGACA+GGG 0.640924 8:+37612961 MsG0880044206.01.T01:CDS
ACAACAGATGAACCTGCCAA+TGG 0.642991 8:+37612271 MsG0880044206.01.T01:CDS
ACGATGGTTCATATCCCCGA+AGG 0.645610 8:+37612033 MsG0880044206.01.T01:CDS
GAATTGAACATAAGGAAAAG+CGG 0.650621 8:+37611863 MsG0880044206.01.T01:CDS
GTACATTATTGTGTCTAACA+AGG 0.657526 8:+37611967 MsG0880044206.01.T01:CDS
TCGGGTTCATATTCTCATCG+AGG 0.661474 8:-37613968 None:intergenic
TATGGATATAATAGCGACGG+AGG 0.663722 8:+37612160 MsG0880044206.01.T01:CDS
ATGGATATAAAAGTGATGAA+GGG 0.665400 8:+37612110 MsG0880044206.01.T01:CDS
AAGCGTCTGAACATAATCGA+CGG 0.675691 8:+37613864 MsG0880044206.01.T01:CDS
ATGGATATAATAGCGACGGA+GGG 0.684749 8:+37612161 MsG0880044206.01.T01:CDS
GTGCAAAGGTGCATTCACGT+TGG 0.698310 8:+37614462 MsG0880044206.01.T01:CDS
TAGAAGAGAGACCTTTGACG+AGG 0.699359 8:+37614599 MsG0880044206.01.T01:CDS
TACATACCATGGGAATTCGG+AGG 0.702697 8:-37612460 None:intergenic
GATGGTTCATATCCCCGAAG+GGG 0.706287 8:+37612035 MsG0880044206.01.T01:CDS
TCAACCAACCAACGACACTG+TGG 0.713235 8:+37611616 MsG0880044206.01.T01:CDS
GAAAACAAGTTAGGACAGGG+AGG 0.741293 8:+37612964 MsG0880044206.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAAAAAAGATAGGAAATAAA+GGG - Chr8:37612776-37612795 None:intergenic 15.0%
!! AAATAAAGAAACAAATTGTT+TGG + Chr8:37611282-37611301 MsG0880044206.01.T01:CDS 15.0%
!! CATAACAAATAAAAAAAGAT+AGG - Chr8:37612786-37612805 None:intergenic 15.0%
!! TAAAAAAAGATAGGAAATAA+AGG - Chr8:37612777-37612796 None:intergenic 15.0%
!! TCAAAATAGAATTTCAAAAT+AGG + Chr8:37611564-37611583 MsG0880044206.01.T01:CDS 15.0%
!!! AATGTGGTAATTTTTTTTAA+TGG + Chr8:37613088-37613107 MsG0880044206.01.T01:intron 15.0%
!!! GAATTATATAGTAATTTTAC+AGG + Chr8:37612349-37612368 MsG0880044206.01.T01:CDS 15.0%
!!! TGAGATTATTAACTAAATTT+TGG + Chr8:37614128-37614147 MsG0880044206.01.T01:intron 15.0%
!!! TTTTAGCTATAAATCAATTT+TGG + Chr8:37612918-37612937 MsG0880044206.01.T01:CDS 15.0%
!! AAATATGGAAAAACTTAGTT+AGG - Chr8:37613640-37613659 None:intergenic 20.0%
!! AAATTGTTTGGATATACTTA+TGG + Chr8:37611294-37611313 MsG0880044206.01.T01:CDS 20.0%
!! AACAAAACAAAAAAACTAAG+TGG - Chr8:37612580-37612599 None:intergenic 20.0%
!! ATCAATAAAAAGGTAAAAAC+AGG - Chr8:37614092-37614111 None:intergenic 20.0%
!! ATGTAGATAAGAAAAGTAAA+AGG + Chr8:37612803-37612822 MsG0880044206.01.T01:intron 20.0%
!! CATAAAACATGATATTTACT+TGG - Chr8:37613712-37613731 None:intergenic 20.0%
!! GTTTAATAAAATTAGGAACA+AGG - Chr8:37614355-37614374 None:intergenic 20.0%
!! TCAATAAAAAGGTAAAAACA+GGG - Chr8:37614091-37614110 None:intergenic 20.0%
!! TTGTGTAATCATCAATAAAA+AGG - Chr8:37614102-37614121 None:intergenic 20.0%
!!! AAGTTTTTCCATATTTATTG+TGG + Chr8:37613644-37613663 MsG0880044206.01.T01:intron 20.0%
!!! ACTTGGTTATTTTTTAAGTT+AGG - Chr8:37613695-37613714 None:intergenic 20.0%
!!! ATTTTAATTAGATAGATTGC+AGG + Chr8:37612495-37612514 MsG0880044206.01.T01:intron 20.0%
!!! TAATTTTTTTTAATGGTTGG+CGG + Chr8:37613095-37613114 MsG0880044206.01.T01:intron 20.0%
!!! TGCATATTTTTGTTTCTTTT+TGG - Chr8:37612698-37612717 None:intergenic 20.0%
!!! TGGTAATTTTTTTTAATGGT+TGG + Chr8:37613092-37613111 MsG0880044206.01.T01:intron 20.0%
! AAAAGACTTTCAAAAACATC+TGG + Chr8:37613353-37613372 MsG0880044206.01.T01:CDS 25.0%
! AAAATTTAGACGTATTTCCT+TGG - Chr8:37613280-37613299 None:intergenic 25.0%
! AAACAAAAATATGCACTTCA+AGG + Chr8:37612703-37612722 MsG0880044206.01.T01:CDS 25.0%
! AATATATATGCATTGCTTTC+AGG + Chr8:37613134-37613153 MsG0880044206.01.T01:intron 25.0%
! AGAAAACATAAATGCCATTA+TGG - Chr8:37613760-37613779 None:intergenic 25.0%
! ATAAAATTAGGAACAAGGAA+TGG - Chr8:37614350-37614369 None:intergenic 25.0%
! ATGGATATAAAAGTGATGAA+GGG + Chr8:37612110-37612129 MsG0880044206.01.T01:CDS 25.0%
! CCAAACAAATGTTAATAATG+TGG + Chr8:37613072-37613091 MsG0880044206.01.T01:intron 25.0%
! CCACATTATTAACATTTGTT+TGG - Chr8:37613075-37613094 None:intergenic 25.0%
! CGAAAGTTCAAAGTATATAT+CGG + Chr8:37611945-37611964 MsG0880044206.01.T01:CDS 25.0%
! GTTCGGAGTTTAATAAAATT+AGG - Chr8:37614362-37614381 None:intergenic 25.0%
! TATGGATATAAAAGTGATGA+AGG + Chr8:37612109-37612128 MsG0880044206.01.T01:CDS 25.0%
! TGAACTATCCACAATAAATA+TGG - Chr8:37613655-37613674 None:intergenic 25.0%
! TGTGGAATTCAAAAATGAAT+TGG + Chr8:37613385-37613404 MsG0880044206.01.T01:CDS 25.0%
! TGTTAAGTTACCTTATAAAC+AGG - Chr8:37612997-37613016 None:intergenic 25.0%
! TTGCTTCTTGAAATTATTTG+TGG + Chr8:37614229-37614248 MsG0880044206.01.T01:CDS 25.0%
! TTTGGATATACTTATGGTTA+TGG + Chr8:37611300-37611319 MsG0880044206.01.T01:CDS 25.0%
! TTTGTCATAGAAAACCATAA+TGG + Chr8:37613743-37613762 MsG0880044206.01.T01:intron 25.0%
!! AATTTTATTAAACTCCGAAC+AGG + Chr8:37614362-37614381 MsG0880044206.01.T01:intron 25.0%
!! ATACCGAAATCAGAAATTTT+CGG - Chr8:37613990-37614009 None:intergenic 25.0%
!! TTTTACATACATGTCCTATT+AGG - Chr8:37614297-37614316 None:intergenic 25.0%
!!! ATTTTTGTTTCTTTTTGGCT+AGG - Chr8:37612693-37612712 None:intergenic 25.0%
!!! CTATGCATTTTAAGAGATAA+TGG - Chr8:37613190-37613209 None:intergenic 25.0%
AACAAAAAAACTAAGTGGTG+CGG - Chr8:37612575-37612594 None:intergenic 30.0%
AACCCGAAAATTTCTGATTT+CGG + Chr8:37613984-37614003 MsG0880044206.01.T01:CDS 30.0%
AACTGCTGAATATATGTCAA+TGG - Chr8:37611519-37611538 None:intergenic 30.0%
AAGAAAAGTAAAAGGAAGCA+GGG + Chr8:37612811-37612830 MsG0880044206.01.T01:CDS 30.0%
AAGAAGGTGAATTGAACATA+AGG + Chr8:37611855-37611874 MsG0880044206.01.T01:CDS 30.0%
AAGATAGGAAATAAAGGGAT+TGG - Chr8:37612771-37612790 None:intergenic 30.0%
AAGATGAGAAGTTTATACGA+TGG + Chr8:37612017-37612036 MsG0880044206.01.T01:CDS 30.0%
AAGTCTGATGTTTATAGCTT+TGG + Chr8:37614202-37614221 MsG0880044206.01.T01:CDS 30.0%
AATCAACAGTTAACACCAAT+AGG + Chr8:37614033-37614052 MsG0880044206.01.T01:CDS 30.0%
ACAAATCTTGTACAACTACT+TGG + Chr8:37613431-37613450 MsG0880044206.01.T01:CDS 30.0%
ACTGCTGAATATATGTCAAT+GGG - Chr8:37611518-37611537 None:intergenic 30.0%
AGATCTTGAAGATGATTTCA+AGG + Chr8:37612879-37612898 MsG0880044206.01.T01:CDS 30.0%
AGCTTGGATTTCTATCTATT+TGG + Chr8:37613509-37613528 MsG0880044206.01.T01:CDS 30.0%
AGTGGAAAACTCAAAAGTAA+TGG + Chr8:37611902-37611921 MsG0880044206.01.T01:CDS 30.0%
ATACTAAACGTTACATACCA+TGG - Chr8:37612474-37612493 None:intergenic 30.0%
ATATATGCGAAACAAAAGCT+TGG + Chr8:37613493-37613512 MsG0880044206.01.T01:CDS 30.0%
ATCGAAAAACAGGACATAAT+TGG + Chr8:37611765-37611784 MsG0880044206.01.T01:CDS 30.0%
CAAGAAAAAAGTTACTAGAC+TGG + Chr8:37613838-37613857 MsG0880044206.01.T01:CDS 30.0%
CAGGATGTATATACTATTCA+TGG + Chr8:37612368-37612387 MsG0880044206.01.T01:CDS 30.0%
CTACCTCATATGAATTAGAA+GGG + Chr8:37614673-37614692 MsG0880044206.01.T01:CDS 30.0%
GAAAATTTCTGATTTCGGTA+TGG + Chr8:37613989-37614008 MsG0880044206.01.T01:CDS 30.0%
GAATTGAACATAAGGAAAAG+CGG + Chr8:37611863-37611882 MsG0880044206.01.T01:CDS 30.0%
GATCTTGAAGATGATTTCAA+GGG + Chr8:37612880-37612899 MsG0880044206.01.T01:CDS 30.0%
GGCGAATAATAAATACTAAC+TGG - Chr8:37611596-37611615 None:intergenic 30.0%
GTACATTATTGTGTCTAACA+AGG + Chr8:37611967-37611986 MsG0880044206.01.T01:CDS 30.0%
GTTGTTGCATTGTCTTTATT+TGG - Chr8:37612256-37612275 None:intergenic 30.0%
TAAGAAAAGTAAAAGGAAGC+AGG + Chr8:37612810-37612829 MsG0880044206.01.T01:CDS 30.0%
TACTAAACGTTACATACCAT+GGG - Chr8:37612473-37612492 None:intergenic 30.0%
TATATACTTTGAACTTTCGC+TGG - Chr8:37611944-37611963 None:intergenic 30.0%
TCTACCTCATATGAATTAGA+AGG + Chr8:37614672-37614691 MsG0880044206.01.T01:CDS 30.0%
TGATTATCCAACAGATAGTT+TGG + Chr8:37611718-37611737 MsG0880044206.01.T01:CDS 30.0%
TGGAGAAATTGTAATTGCTA+TGG + Chr8:37612319-37612338 MsG0880044206.01.T01:CDS 30.0%
TGTTATGGATATAATAGCGA+CGG + Chr8:37612157-37612176 MsG0880044206.01.T01:CDS 30.0%
TTAACACCAATAGGATTGTT+GGG + Chr8:37614042-37614061 MsG0880044206.01.T01:CDS 30.0%
TTCAAGATCTTTGATGTCAT+AGG - Chr8:37612869-37612888 None:intergenic 30.0%
TTTCCCTTCTAATTCATATG+AGG - Chr8:37614679-37614698 None:intergenic 30.0%
TTTGATGTCATAGGATTCAT+TGG - Chr8:37612860-37612879 None:intergenic 30.0%
! ATGTTCAATTCACCTTCTTT+TGG - Chr8:37611854-37611873 None:intergenic 30.0%
! ATTTGGTGAGAATATGTTGA+AGG + Chr8:37613526-37613545 MsG0880044206.01.T01:intron 30.0%
! TACCGAAATCAGAAATTTTC+GGG - Chr8:37613989-37614008 None:intergenic 30.0%
! TTTTCACCTGAAAACAAGTT+AGG + Chr8:37612955-37612974 MsG0880044206.01.T01:CDS 30.0%
! TTTTTGTGTATAGTCAATGC+AGG + Chr8:37612598-37612617 MsG0880044206.01.T01:intron 30.0%
!! AACCATACAAAAAGTATCCA+AGG + Chr8:37613260-37613279 MsG0880044206.01.T01:intron 30.0%
!! ACAAATGTGTCACTTAATGT+TGG - Chr8:37614432-37614451 None:intergenic 30.0%
!! ATAATTGGTCATTGGTTTCA+CGG + Chr8:37611780-37611799 MsG0880044206.01.T01:CDS 30.0%
!! ATCAATTTTGGAAGCAACTA+TGG + Chr8:37612930-37612949 MsG0880044206.01.T01:CDS 30.0%
!! GAGATTTTTCAGAAAAAGGT+GGG + Chr8:37612226-37612245 MsG0880044206.01.T01:CDS 30.0%
!! TAACTAAATTTTGGTGCAGT+GGG + Chr8:37614137-37614156 MsG0880044206.01.T01:intron 30.0%
!! TGAGATTTTTCAGAAAAAGG+TGG + Chr8:37612225-37612244 MsG0880044206.01.T01:CDS 30.0%
!! TGGTGAGATTTTTCAGAAAA+AGG + Chr8:37612222-37612241 MsG0880044206.01.T01:CDS 30.0%
!! TTAACTAAATTTTGGTGCAG+TGG + Chr8:37614136-37614155 MsG0880044206.01.T01:intron 30.0%
!! TTCCTTGGATACTTTTTGTA+TGG - Chr8:37613265-37613284 None:intergenic 30.0%
!! TTTTTCTGAAAAATCTCACC+AGG - Chr8:37612223-37612242 None:intergenic 30.0%
!!! AAATAATAGCTTTTTCGCCT+TGG + Chr8:37612420-37612439 MsG0880044206.01.T01:CDS 30.0%
!!! GCTTTCAGGTATTTTTAGTA+TGG + Chr8:37613148-37613167 MsG0880044206.01.T01:intron 30.0%
AACAGGACATAATTGGTCAT+TGG + Chr8:37611772-37611791 MsG0880044206.01.T01:CDS 35.0%
AATCATCCATAGAGACTTGA+AGG + Chr8:37613932-37613951 MsG0880044206.01.T01:CDS 35.0%
ACAAAAAAACTAAGTGGTGC+GGG - Chr8:37612574-37612593 None:intergenic 35.0%
ACATGTCCTATTAGGTTTAG+TGG - Chr8:37614289-37614308 None:intergenic 35.0%
ACGAGGAAACAACTTCTAAA+GGG + Chr8:37614616-37614635 MsG0880044206.01.T01:CDS 35.0%
AGAAATTGCTGTCGTAGAAT+AGG - Chr8:37614655-37614674 None:intergenic 35.0%
ATAATCGACGGAATTTCTCA+AGG + Chr8:37613876-37613895 MsG0880044206.01.T01:CDS 35.0%
ATGATTGCAAGATGAGATGT+TGG + Chr8:37612299-37612318 MsG0880044206.01.T01:CDS 35.0%
ATGCAGGTAAAAGGAAGATA+TGG + Chr8:37612614-37612633 MsG0880044206.01.T01:intron 35.0%
CATGTCCTATTAGGTTTAGT+GGG - Chr8:37614288-37614307 None:intergenic 35.0%
CTTTCAAAAACATCTGGACA+AGG + Chr8:37613359-37613378 MsG0880044206.01.T01:CDS 35.0%
GATATAACATCTGACATCGT+AGG - Chr8:37614522-37614541 None:intergenic 35.0%
GGAGGAAATACCAAATTGTA+GGG + Chr8:37612195-37612214 MsG0880044206.01.T01:CDS 35.0%
GGATATACTTATGGTTATGG+TGG + Chr8:37611303-37611322 MsG0880044206.01.T01:CDS 35.0%
GGTAAAAGGAAGATATGGAT+AGG + Chr8:37612619-37612638 MsG0880044206.01.T01:intron 35.0%
GTATAGTCAATGCAGGTAAA+AGG + Chr8:37612605-37612624 MsG0880044206.01.T01:intron 35.0%
GTTAACACCAATAGGATTGT+TGG + Chr8:37614041-37614060 MsG0880044206.01.T01:CDS 35.0%
GTTACCGGTATCTAATATAG+TGG - Chr8:37611642-37611661 None:intergenic 35.0%
GTTCTATCTTTAGACTACTC+TGG + Chr8:37611536-37611555 MsG0880044206.01.T01:CDS 35.0%
GTTGCATTCATGAAGAAGAA+AGG + Chr8:37613456-37613475 MsG0880044206.01.T01:CDS 35.0%
TCTCTTCTAACATAGAATGC+CGG - Chr8:37614588-37614607 None:intergenic 35.0%
TGTTGAACAAATTCCTTCCA+TGG - Chr8:37614182-37614201 None:intergenic 35.0%
TTAGGCGTTAATCGAAAAAC+AGG + Chr8:37611755-37611774 MsG0880044206.01.T01:CDS 35.0%
TTGGAATTCAATGTATCACC+TGG - Chr8:37611377-37611396 None:intergenic 35.0%
TTGTTGAAGCACAAAGTTAC+CGG - Chr8:37611657-37611676 None:intergenic 35.0%
! AATATGCACTTCAAGGTACT+TGG + Chr8:37612710-37612729 MsG0880044206.01.T01:intron 35.0%
! ACAAATGATAGTTTGAAGCC+AGG + Chr8:37611356-37611375 MsG0880044206.01.T01:CDS 35.0%
! AGGGATTGGATTTTGTACAT+AGG - Chr8:37612757-37612776 None:intergenic 35.0%
! GATTGGATTTTGTACATAGG+TGG - Chr8:37612754-37612773 None:intergenic 35.0%
! GTTATAAGTAGTGGTGTTGA+CGG + Chr8:37611461-37611480 MsG0880044206.01.T01:CDS 35.0%
! TTGGTATTTCCTCCCATTTT+TGG - Chr8:37612189-37612208 None:intergenic 35.0%
! TTTAGAACACAGCTTGGATT+TGG - Chr8:37611396-37611415 None:intergenic 35.0%
! TTTCTTGTTTCACGACTTCA+GGG + Chr8:37613299-37613318 MsG0880044206.01.T01:intron 35.0%
!! AGGTGAACTTAGTCTTGAAT+GGG + Chr8:37611826-37611845 MsG0880044206.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTTCTTGTTTCACGACTTC+AGG + Chr8:37613298-37613317 MsG0880044206.01.T01:intron 35.0%
!!! TGATTTTGTTGGCTTTACCA+AGG - Chr8:37612440-37612459 None:intergenic 35.0%
AACATCTGGACAAGGAATTG+TGG + Chr8:37613367-37613386 MsG0880044206.01.T01:CDS 40.0%
AAGCGTCTGAACATAATCGA+CGG + Chr8:37613864-37613883 MsG0880044206.01.T01:CDS 40.0%
AATGCACCTTTGCACTTCAT+CGG - Chr8:37614457-37614476 None:intergenic 40.0%
ACATGTCTGCATTTGCAACT+TGG - Chr8:37612138-37612157 None:intergenic 40.0%
ACCTGAAAACAAGTTAGGAC+AGG + Chr8:37612960-37612979 MsG0880044206.01.T01:CDS 40.0%
AGGCTATGGACCTGTTTATA+AGG + Chr8:37612984-37613003 MsG0880044206.01.T01:CDS 40.0%
AGTATACTCTTTGTCCCGTT+TGG - Chr8:37611686-37611705 None:intergenic 40.0%
ATACCAAATTGTAGGGAACC+TGG + Chr8:37612202-37612221 MsG0880044206.01.T01:CDS 40.0%
ATGGATATAATAGCGACGGA+GGG + Chr8:37612161-37612180 MsG0880044206.01.T01:CDS 40.0%
ATTAAACTCCGAACAGGCAT+GGG + Chr8:37614368-37614387 MsG0880044206.01.T01:intron 40.0%
ATTCCTTCCATGGCATATTC+TGG - Chr8:37614172-37614191 None:intergenic 40.0%
CATTCAAGACTAAGTTCACC+TGG - Chr8:37611827-37611846 None:intergenic 40.0%
CCTGAAAACAAGTTAGGACA+GGG + Chr8:37612961-37612980 MsG0880044206.01.T01:CDS 40.0%
CGTTACATACCATGGGAATT+CGG - Chr8:37612466-37612485 None:intergenic 40.0%
CTATGTCCCAACAATCCTAT+TGG - Chr8:37614051-37614070 None:intergenic 40.0%
CTTCAACAACTTCACCCAAA+CGG + Chr8:37611668-37611687 MsG0880044206.01.T01:CDS 40.0%
CTTGAATGGGAACCAAAAGA+AGG + Chr8:37611839-37611858 MsG0880044206.01.T01:CDS 40.0%
CTTGCAATCATCGTAACCAT+TGG - Chr8:37612290-37612309 None:intergenic 40.0%
GACGAGGAAACAACTTCTAA+AGG + Chr8:37614615-37614634 MsG0880044206.01.T01:CDS 40.0%
GCAAATGCAGACATGTGTTA+TGG + Chr8:37612142-37612161 MsG0880044206.01.T01:CDS 40.0%
GCTCACTTGGTTATAAGTAG+TGG + Chr8:37611452-37611471 MsG0880044206.01.T01:CDS 40.0%
GGGAGGAAATACCAAATTGT+AGG + Chr8:37612194-37612213 MsG0880044206.01.T01:CDS 40.0%
GTATACTCTTTGTCCCGTTT+GGG - Chr8:37611685-37611704 None:intergenic 40.0%
GTGGCCACTATATTAGATAC+CGG + Chr8:37611635-37611654 MsG0880044206.01.T01:CDS 40.0%
TAACGCCTAACTTCATCGTT+GGG - Chr8:37611745-37611764 None:intergenic 40.0%
TATGGATATAATAGCGACGG+AGG + Chr8:37612160-37612179 MsG0880044206.01.T01:CDS 40.0%
TATTAAACTCCGAACAGGCA+TGG + Chr8:37614367-37614386 MsG0880044206.01.T01:intron 40.0%
TCACTTATTAACCTCCCCTT+CGG - Chr8:37612052-37612071 None:intergenic 40.0%
TGGTGAGTATCAACAGTTAC+TGG + Chr8:37614404-37614423 MsG0880044206.01.T01:CDS 40.0%
TTAACGCCTAACTTCATCGT+TGG - Chr8:37611746-37611765 None:intergenic 40.0%
TTCAACAACTTCACCCAAAC+GGG + Chr8:37611669-37611688 MsG0880044206.01.T01:CDS 40.0%
! ACGGGACAAAGAGTATACTA+TGG + Chr8:37611687-37611706 MsG0880044206.01.T01:CDS 40.0%
! AGAAGTTGTTTCCTCGTCAA+AGG - Chr8:37614613-37614632 None:intergenic 40.0%
! GAATTCGGAGGTGATTTTGT+TGG - Chr8:37612451-37612470 None:intergenic 40.0%
! TCCAAGCTGTGTTCTAAACA+AGG + Chr8:37611398-37611417 MsG0880044206.01.T01:CDS 40.0%
! TTCGACACAAGACGTTGATT+TGG + Chr8:37612393-37612412 MsG0880044206.01.T01:CDS 40.0%
!! CAGGTGAACTTAGTCTTGAA+TGG + Chr8:37611825-37611844 MsG0880044206.01.T01:CDS 40.0%
AAATCACCTCCGAATTCCCA+TGG + Chr8:37612454-37612473 MsG0880044206.01.T01:CDS 45.0%
ACAACAGATGAACCTGCCAA+TGG + Chr8:37612271-37612290 MsG0880044206.01.T01:CDS 45.0%
ACATAGAATGCCGGTCTTCT+TGG - Chr8:37614579-37614598 None:intergenic 45.0%
ACTTATTAACCTCCCCTTCG+GGG - Chr8:37612050-37612069 None:intergenic 45.0%
AGACTAAGTTCACCTGGAGT+TGG - Chr8:37611821-37611840 None:intergenic 45.0%
ATGCACCTTTGCACTTCATC+GGG - Chr8:37614456-37614475 None:intergenic 45.0%
CAATCATCGTAACCATTGGC+AGG - Chr8:37612286-37612305 None:intergenic 45.0%
CACAACCTTACCAAGAAGAC+CGG + Chr8:37614566-37614585 MsG0880044206.01.T01:CDS 45.0%
CACTTATTAACCTCCCCTTC+GGG - Chr8:37612051-37612070 None:intergenic 45.0%
CATGTCTCCAGAATATGCCA+TGG + Chr8:37614162-37614181 MsG0880044206.01.T01:CDS 45.0%
GAAAACAAGTTAGGACAGGG+AGG + Chr8:37612964-37612983 MsG0880044206.01.T01:CDS 45.0%
GATCGCCCACTAAACCTAAT+AGG + Chr8:37614280-37614299 MsG0880044206.01.T01:CDS 45.0%
GCAAGTGCAGACATGTGTTA+TGG + Chr8:37612091-37612110 MsG0880044206.01.T01:CDS 45.0%
GCATGGGAGCTATGGAATAA+TGG + Chr8:37614384-37614403 MsG0880044206.01.T01:CDS 45.0%
GGCAAAGTGCATTGGAAAAG+TGG + Chr8:37611884-37611903 MsG0880044206.01.T01:CDS 45.0%
GGGAGGTTAATAAGTGATGC+TGG + Chr8:37612055-37612074 MsG0880044206.01.T01:CDS 45.0%
GTTGGGACCAAACTATCTGT+TGG - Chr8:37611728-37611747 None:intergenic 45.0%
TACATACCATGGGAATTCGG+AGG - Chr8:37612463-37612482 None:intergenic 45.0%
TAGAAGAGAGACCTTTGACG+AGG + Chr8:37614599-37614618 MsG0880044206.01.T01:CDS 45.0%
TCACCAGGTTCCCTACAATT+TGG - Chr8:37612208-37612227 None:intergenic 45.0%
TCGGGTTCATATTCTCATCG+AGG - Chr8:37613971-37613990 None:intergenic 45.0%
TCTCCAGAATATGCCATGGA+AGG + Chr8:37614166-37614185 MsG0880044206.01.T01:CDS 45.0%
TGCTGTCGTAGAATAGGTGT+CGG - Chr8:37614649-37614668 None:intergenic 45.0%
TTCACGACTTCAGGGAATCT+TGG + Chr8:37613307-37613326 MsG0880044206.01.T01:intron 45.0%
TTGGTCCCAACGATGAAGTT+AGG + Chr8:37611737-37611756 MsG0880044206.01.T01:CDS 45.0%
TTGTTCCCGATGAAGTGCAA+AGG + Chr8:37614448-37614467 MsG0880044206.01.T01:CDS 45.0%
! TGATAGCGAAGAAGCTCACT+TGG + Chr8:37611439-37611458 MsG0880044206.01.T01:CDS 45.0%
!! GCAGGGTAAGAGCATTGATT+TGG + Chr8:37612828-37612847 MsG0880044206.01.T01:CDS 45.0%
!! GCCTTGTTTAGAACACAGCT+TGG - Chr8:37611402-37611421 None:intergenic 45.0%
!! GGGTAAGAGCATTGATTTGG+CGG + Chr8:37612831-37612850 MsG0880044206.01.T01:CDS 45.0%
!! TGCTAGCCTTCAAGTCTCTA+TGG - Chr8:37613941-37613960 None:intergenic 45.0%
!! TTGGTCATTGGTTTCACGGT+TGG + Chr8:37611784-37611803 MsG0880044206.01.T01:CDS 45.0%
!!! CCCTGTCCTAACTTGTTTTC+AGG - Chr8:37612964-37612983 None:intergenic 45.0%
AAGTTAGGACAGGGAGGCTA+TGG + Chr8:37612970-37612989 MsG0880044206.01.T01:CDS 50.0%
ACGATGGTTCATATCCCCGA+AGG + Chr8:37612033-37612052 MsG0880044206.01.T01:CDS 50.0%
CGATGGTTCATATCCCCGAA+GGG + Chr8:37612034-37612053 MsG0880044206.01.T01:CDS 50.0%
CTTCAGGGAATCTTGGCAAC+AGG + Chr8:37613314-37613333 MsG0880044206.01.T01:intron 50.0%
GAATGCCGGTCTTCTTGGTA+AGG - Chr8:37614574-37614593 None:intergenic 50.0%
GATGGTTCATATCCCCGAAG+GGG + Chr8:37612035-37612054 MsG0880044206.01.T01:CDS 50.0%
GCTCATTCACTACCAACTCC+AGG + Chr8:37611806-37611825 MsG0880044206.01.T01:CDS 50.0%
GGAAAAGCGGCAAAGTGCAT+TGG + Chr8:37611876-37611895 MsG0880044206.01.T01:CDS 50.0%
TATAGTGGCCACAGTGTCGT+TGG - Chr8:37611627-37611646 None:intergenic 50.0%
TCAACCAACCAACGACACTG+TGG + Chr8:37611616-37611635 MsG0880044206.01.T01:CDS 50.0%
! ACAGTGTCGTTGGTTGGTTG+AGG - Chr8:37611617-37611636 None:intergenic 50.0%
! GTGCAAAGGTGCATTCACGT+TGG + Chr8:37614462-37614481 MsG0880044206.01.T01:CDS 50.0%
!! GTAGAATAGGTGTCGGTGTC+TGG - Chr8:37614642-37614661 None:intergenic 50.0%
CCATAGCTCCCATGCCTGTT+CGG - Chr8:37614379-37614398 None:intergenic 55.0%
!! CGACGGAGGGTGCCAAAAAT+GGG + Chr8:37612174-37612193 MsG0880044206.01.T01:CDS 55.0%
CCGAACAGGCATGGGAGCTA+TGG + Chr8:37614376-37614395 MsG0880044206.01.T01:intron 60.0%
GGTTCATATCCCCGAAGGGG+AGG + Chr8:37612038-37612057 MsG0880044206.01.T01:CDS 60.0%
! GTGGCCACAGTGTCGTTGGT+TGG - Chr8:37611623-37611642 None:intergenic 60.0%
! GTGTTGACGGCGCTGTAGTG+TGG + Chr8:37611474-37611493 MsG0880044206.01.T01:CDS 60.0%
!! CGGAGGGTGCCAAAAATGGG+AGG + Chr8:37612177-37612196 MsG0880044206.01.T01:CDS 60.0%
!! GCGACGGAGGGTGCCAAAAA+TGG + Chr8:37612173-37612192 MsG0880044206.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr8 gene 37611269 37614704 37611269 ID=MsG0880044206.01;Name=MsG0880044206.01
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Chr8 exon 37612620 37612724 37612620 ID=MsG0880044206.01.T01:exon:4945;Parent=MsG0880044206.01.T01
Chr8 exon 37612809 37613005 37612809 ID=MsG0880044206.01.T01:exon:4944;Parent=MsG0880044206.01.T01
Chr8 exon 37613320 37613530 37613320 ID=MsG0880044206.01.T01:exon:4943;Parent=MsG0880044206.01.T01
Chr8 exon 37613829 37614069 37613829 ID=MsG0880044206.01.T01:exon:4942;Parent=MsG0880044206.01.T01
Chr8 exon 37614156 37614306 37614156 ID=MsG0880044206.01.T01:exon:4941;Parent=MsG0880044206.01.T01
Chr8 exon 37614384 37614704 37614384 ID=MsG0880044206.01.T01:exon:4940;Parent=MsG0880044206.01.T01
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Chr8 CDS 37614384 37614704 37614384 ID=MsG0880044206.01.T01:cds;Parent=MsG0880044206.01.T01
Gene Sequence

>MsG0880044206.01.T01

ATGCTAAGCTTTAAAATAAAGAAACAAATTGTTTGGATATACTTATGGTTATGGTGGAGTACTACTAGTAGTATTTGTGTTAAAGCAACAAATGATAGTTTGAAGCCAGGTGATACATTGAATTCCAAATCCAAGCTGTGTTCTAAACAAGGCAAGTTTTGTTTGTATTTTGATAGCGAAGAAGCTCACTTGGTTATAAGTAGTGGTGTTGACGGCGCTGTAGTGTGGATGTACGATAGAAATCAACCCATTGACATATATTCAGCAGTTCTATCTTTAGACTACTCTGGTGTGCTCAAAATAGAATTTCAAAATAGGAATCTACCAGTTAGTATTTATTATTCGCCTCAACCAACCAACGACACTGTGGCCACTATATTAGATACCGGTAACTTTGTGCTTCAACAACTTCACCCAAACGGGACAAAGAGTATACTATGGCAGAGTTTTGATTATCCAACAGATAGTTTGGTCCCAACGATGAAGTTAGGCGTTAATCGAAAAACAGGACATAATTGGTCATTGGTTTCACGGTTGGCTCATTCACTACCAACTCCAGGTGAACTTAGTCTTGAATGGGAACCAAAAGAAGGTGAATTGAACATAAGGAAAAGCGGCAAAGTGCATTGGAAAAGTGGAAAACTCAAAAGTAATGGAATATTCGAGAACATTCCAGCGAAAGTTCAAAGTATATATCGGTACATTATTGTGTCTAACAAGGATGAAGATTCTTTTGCTTTCGAAGTTAAAGATGAGAAGTTTATACGATGGTTCATATCCCCGAAGGGGAGGTTAATAAGTGATGCTGGAAGCACTGCTAATGCAAGTGCAGACATGTGTTATGGATATAAAAGTGATGAAGGGTGCCAAGTTGCAAATGCAGACATGTGTTATGGATATAATAGCGACGGAGGGTGCCAAAAATGGGAGGAAATACCAAATTGTAGGGAACCTGGTGAGATTTTTCAGAAAAAGGTGGGAAGACCAAATAAAGACAATGCAACAACAGATGAACCTGCCAATGGTTACGATGATTGCAAGATGAGATGTTGGAGAAATTGTAATTGCTATGGATTTGAAGAATTATATAGTAATTTTACAGGATGTATATACTATTCATGGAATTCGACACAAGACGTTGATTTGGACAAAAATAATAGCTTTTTCGCCTTGGTAAAGCCAACAAAATCACCTCCGAATTCCCATGGTAAAAGGAAGATATGGATAGGTGCTGCAATCGCAGCTGCTTTACTCATAGTATGCTCACTTATTTTATTCCTAGCCAAAAAGAAACAAAAATATGCACTTCAAGATAAGAAAAGTAAAAGGAAGCAGGGTAAGAGCATTGATTTGGCGGACACCAATGAATCCTATGACATCAAAGATCTTGAAGATGATTTCAAGGGACATGATATAAAAGTTTTTAGCTATAAATCAATTTTGGAAGCAACTATGGACTTTTCACCTGAAAACAAGTTAGGACAGGGAGGCTATGGACCTGTTTATAAGGGAATCTTGGCAACAGGACAAGAAGTTGCTGTAAAAAGACTTTCAAAAACATCTGGACAAGGAATTGTGGAATTCAAAAATGAATTGGCATTGATATGTGAACTTCAACACACAAATCTTGTACAACTACTTGGTTGTTGCATTCATGAAGAAGAAAGGATTCTAATTTACGAATATATGCGAAACAAAAGCTTGGATTTCTATCTATTTGAAGATTGTACAAGAAAAAAGTTACTAGACTGGAAGAAGCGTCTGAACATAATCGACGGAATTTCTCAAGGACTACTCTATCTTCATAAGTACTCAAGACTCAAAATCATCCATAGAGACTTGAAGGCTAGCAACATACTCCTCGATGAGAATATGAACCCGAAAATTTCTGATTTCGGTATGGCAAGAATGTTCACACAACAAGAATCAACAGTTAACACCAATAGGATTGTTGGGACATATGGGTACATGTCTCCAGAATATGCCATGGAAGGAATTTGTTCAACAAAGTCTGATGTTTATAGCTTTGGAGTGTTGCTTCTTGAAATTATTTGTGGAAGAAAAAACAATAGCTTCTATGATGTTGATCGCCCACTAAACCTAATAGGACATGCATGGGAGCTATGGAATAATGGTGAGTATCAACAGTTACTGGATCCAACATTAAGTGACACATTTGTTCCCGATGAAGTGCAAAGGTGCATTCACGTTGGTCTCTTATGTGTACAACAATATGCTAATGATCGACCTACGATGTCAGATGTTATATCAATGTTAACAAACAAATATGAACTCACAACCTTACCAAGAAGACCGGCATTCTATGTTAGAAGAGAGACCTTTGACGAGGAAACAACTTCTAAAGGGCCAGACACCGACACCTATTCTACGACAGCAATTTCTACCTCATATGAATTAGAAGGGAAAATATAA
Protein sequence

>MsG0880044206.01.T01

MLSFKIKKQIVWIYLWLWWSTTSSICVKATNDSLKPGDTLNSKSKLCSKQGKFCLYFDSEEAHLVISSGVDGAVVWMYDRNQPIDIYSAVLSLDYSGVLKIEFQNRNLPVSIYYSPQPTNDTVATILDTGNFVLQQLHPNGTKSILWQSFDYPTDSLVPTMKLGVNRKTGHNWSLVSRLAHSLPTPGELSLEWEPKEGELNIRKSGKVHWKSGKLKSNGIFENIPAKVQSIYRYIIVSNKDEDSFAFEVKDEKFIRWFISPKGRLISDAGSTANASADMCYGYKSDEGCQVANADMCYGYNSDGGCQKWEEIPNCREPGEIFQKKVGRPNKDNATTDEPANGYDDCKMRCWRNCNCYGFEELYSNFTGCIYYSWNSTQDVDLDKNNSFFALVKPTKSPPNSHGKRKIWIGAAIAAALLIVCSLILFLAKKKQKYALQDKKSKRKQGKSIDLADTNESYDIKDLEDDFKGHDIKVFSYKSILEATMDFSPENKLGQGGYGPVYKGILATGQEVAVKRLSKTSGQGIVEFKNELALICELQHTNLVQLLGCCIHEEERILIYEYMRNKSLDFYLFEDCTRKKLLDWKKRLNIIDGISQGLLYLHKYSRLKIIHRDLKASNILLDENMNPKISDFGMARMFTQQESTVNTNRIVGTYGYMSPEYAMEGICSTKSDVYSFGVLLLEIICGRKNNSFYDVDRPLNLIGHAWELWNNGEYQQLLDPTLSDTFVPDEVQRCIHVGLLCVQQYANDRPTMSDVISMLTNKYELTTLPRRPAFYVRRETFDEETTSKGPDTDTYSTTAISTSYELEGKI*