AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar XinJiangDaYe / MS.gene061170


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Find 98 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 0 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
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TATTACTTGGAATACATCAT+AGG 0.501457 1.4:-78031071 None:intergenic
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GAATTTGTAGTTTGTTTGGA+TGG 0.549843 1.4:+78010844 MS.gene061170:intron
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CCGCTGGATCCTTCTTGCAG+TGG 0.564311 1.4:-78031243 None:intergenic
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TGGATGAGAAGACATCGCAC+TGG 0.653079 1.4:-78030907 None:intergenic
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GTGATGAAAATCAGACAACA+AGG 0.672906 1.4:+78029703 MS.gene061170:intron
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TGTTACGATGAACTTCGTGG+TGG 0.690772 1.4:+78010611 None:intergenic
ACTTGGTGAAGTTGTCACAA+TGG 0.709745 1.4:-78029948 None:intergenic
GTTGTCACAATGGTGAAAGG+TGG 0.719512 1.4:-78029938 None:intergenic
ATTATTATATCTAATCACGG+TGG 0.766922 1.4:+78010641 MS.gene061170:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content


Chromosome Type Strat End Strand Name
chr1.4 gene 78010618 78032270 78010618 ID=MS.gene061170
chr1.4 mRNA 78010618 78032270 78010618 ID=MS.gene061170.t1;Parent=MS.gene061170
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chr1.4 CDS 78010618 78010744 78010618 ID=cds.MS.gene061170.t1;Parent=MS.gene061170.t1
chr1.4 exon 78010854 78010936 78010854 ID=MS.gene061170.t1.exon2;Parent=MS.gene061170.t1
chr1.4 CDS 78010854 78010936 78010854 ID=cds.MS.gene061170.t1;Parent=MS.gene061170.t1
chr1.4 exon 78015039 78015168 78015039 ID=MS.gene061170.t1.exon3;Parent=MS.gene061170.t1
chr1.4 CDS 78015039 78015168 78015039 ID=cds.MS.gene061170.t1;Parent=MS.gene061170.t1
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