AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0180005278.01

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MsG0180005278.01.T01 AT1G34110 34.286 525 281 11 13 504 48 541 1.67e-54 206
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MsG0180005278.01.T01 AT4G36180 28.283 1089 547 34 13 886 49 1118 1.96e-80 282
MsG0180005278.01.T01 AT2G25790 28.467 959 538 26 7 882 46 939 1.19e-78 275
MsG0180005278.01.T01 AT1G12460 28.485 825 502 17 134 886 69 877 6.83e-78 271
MsG0180005278.01.T01 AT1G12460 32.723 382 218 8 63 410 93 469 2.07e-44 173
MsG0180005278.01.T01 AT1G12460 40.000 185 105 4 39 221 289 469 7.14e-26 115
MsG0180005278.01.T01 AT1G12460 31.157 337 174 8 34 317 139 470 3.18e-25 113
MsG0180005278.01.T01 AT3G47570 28.601 979 567 34 13 886 47 998 1.20e-76 270
MsG0180005278.01.T01 AT3G47570 30.563 373 186 11 4 340 258 593 1.25e-21 101
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MsG0180005278.01.T01 AT3G28890 36.934 287 146 7 251 505 96 379 2.06e-35 144
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MsG0180005278.01.T01 AT2G42290 28.492 179 97 5 21 197 56 205 1.50e-12 72.0
MsG0180005278.01.T01 AT2G42290 36.957 138 86 1 85 221 68 205 1.77e-12 71.6
MsG0180005278.01.T01 AT2G42290 29.730 222 122 6 181 394 68 263 8.60e-12 69.3
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MsG0180005278.01.T01 AT1G71390 30.330 455 277 10 82 505 243 688 4.91e-46 177
MsG0180005278.01.T01 AT1G71390 27.919 394 217 10 36 388 320 687 2.48e-31 132
MsG0180005278.01.T01 AT1G71390 33.566 286 159 5 226 506 102 361 1.60e-29 126
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MsG0180005278.01.T01 AT1G31420 27.551 196 91 2 20 214 60 205 2.62e-13 74.3
MsG0180005278.01.T01 AT1G31420 37.615 109 68 0 113 221 79 187 2.06e-11 68.2
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MsG0180005278.01.T01 AT3G08680 36.567 134 83 2 157 289 68 200 6.55e-11 66.6
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MsG0180005278.01.T01 AT2G15080 26.667 600 294 13 44 504 291 883 4.57e-37 151
MsG0180005278.01.T01 AT2G15080 28.008 532 312 11 55 517 202 731 1.40e-33 140
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MsG0180005278.01.T01 AT3G11010 29.771 524 267 16 69 504 282 792 3.68e-37 151
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MsG0180005278.01.T01 AT1G64210 34.595 185 104 8 13 192 43 215 2.57e-13 74.3
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MsG0180005278.01.T01 AT3G28450 36.937 111 69 1 113 222 83 193 1.38e-11 68.6
MsG0180005278.01.T01 AT3G28450 35.443 158 87 7 269 418 75 225 3.21e-11 67.4
MsG0180005278.01.T01 AT5G62710 29.225 568 330 20 370 882 32 582 1.30e-43 168
MsG0180005278.01.T01 AT5G62710 39.516 124 66 2 299 414 92 214 7.19e-14 75.9
MsG0180005278.01.T01 AT5G62710 35.417 144 89 3 297 437 66 208 8.07e-13 72.8
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MsG0180005278.01.T01 AT2G25470 28.797 632 320 20 10 519 59 682 7.05e-39 156
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MsG0180005278.01.T01 AT3G57830 40.141 142 82 2 81 221 67 206 2.22e-15 80.9
MsG0180005278.01.T01 AT5G16590 25.549 638 340 21 293 882 60 610 7.51e-41 160
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MsG0180005278.01.T01 AT1G58190 28.974 390 192 12 176 505 123 487 1.32e-22 104
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MsG0180005278.01.T01 AT1G69990 37.931 116 71 1 113 227 70 185 3.25e-12 70.9
MsG0180005278.01.T01 AT1G69990 34.146 123 73 3 274 393 67 184 1.72e-11 68.6
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MsG0180005278.01.T01 AT1G56120 23.759 947 559 28 22 882 91 960 1.37e-40 162
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MsG0180005278.01.T01 AT1G63430 28.327 526 331 16 328 828 74 578 2.41e-40 159
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MsG0180005278.01.T01 AT1G74170 29.872 549 320 17 30 522 187 726 2.43e-40 161
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MsG0180005278.01.T01 AT2G25470 32.544 338 211 9 39 370 391 717 1.19e-27 120
MsG0180005278.01.T01 AT2G25470 30.496 423 267 14 1 413 330 735 7.47e-27 118
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MsG0180005278.01.T01 AT1G56120 33.858 254 157 7 228 476 1 248 8.40e-21 99.0
MsG0180005278.01.T01 AT1G56120 29.644 253 145 5 166 413 9 233 1.18e-20 98.6
MsG0180005278.01.T01 AT1G56120 29.536 237 154 5 86 316 1 230 2.66e-18 90.9
MsG0180005278.01.T01 AT1G56120 30.435 230 157 2 63 289 1 230 6.46e-17 86.3
MsG0180005278.01.T01 AT1G07390 32.366 448 244 12 39 434 498 938 1.19e-38 156
MsG0180005278.01.T01 AT1G07390 28.119 537 307 21 17 503 76 583 3.74e-24 109
MsG0180005278.01.T01 AT3G20820 37.402 254 150 6 262 509 90 340 1.23e-38 148
MsG0180005278.01.T01 AT3G20820 37.037 243 139 6 202 434 97 335 1.39e-30 124
MsG0180005278.01.T01 AT3G20820 34.298 242 151 4 29 267 99 335 2.84e-28 117
MsG0180005278.01.T01 AT3G20820 35.882 170 103 4 31 198 171 336 1.52e-13 73.6
MsG0180005278.01.T01 AT2G23950 28.875 471 273 13 392 828 72 514 1.32e-38 152
MsG0180005278.01.T01 AT2G23950 37.391 115 70 1 298 410 73 187 2.94e-14 77.0
MsG0180005278.01.T01 AT2G23950 40.952 105 60 1 335 437 86 190 1.40e-13 74.7
MsG0180005278.01.T01 AT1G07390 32.366 448 244 12 39 434 527 967 1.98e-38 155
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MsG0180005278.01.T01 AT1G07390 29.358 545 293 19 39 504 130 661 2.81e-27 120
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MsG0180005278.01.T01 AT2G35620 40.000 120 69 1 271 390 72 188 5.58e-11 66.6
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MsG0180005278.01.T01 AT5G63710 40.351 114 64 2 292 405 53 162 6.85e-13 72.8
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MsG0180005278.01.T01 AT5G63710 26.981 467 300 12 438 882 115 562 1.60e-37 150
MsG0180005278.01.T01 AT5G63710 40.351 114 64 2 292 405 88 197 7.65e-13 72.8
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MsG0180005278.01.T01 AT5G49290 30.208 384 215 8 53 388 455 833 8.88e-25 111
MsG0180005278.01.T01 AT5G49290 29.032 248 136 6 49 267 597 833 1.33e-11 69.3
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MsG0180005278.01.T01 AT4G39270 25.678 627 382 20 177 763 70 652 1.17e-34 142
MsG0180005278.01.T01 AT4G39270 30.128 312 171 11 18 289 54 358 4.93e-23 105
MsG0180005278.01.T01 AT4G39270 25.678 627 382 20 177 763 70 652 1.17e-34 142
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MsG0180005278.01.T01 AT3G12610 30.677 251 117 5 24 243 120 344 5.02e-17 84.3
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MsG0180005278.01.T01 AT4G13880 25.954 262 155 6 274 507 88 338 9.84e-11 66.2
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MsG0180005278.01.T01 AT1G33590 30.049 203 111 6 359 530 89 291 5.02e-12 69.7
MsG0180005278.01.T01 AT1G33590 30.808 396 223 12 146 527 151 509 4.02e-34 138
MsG0180005278.01.T01 AT1G33590 27.594 424 251 12 17 410 90 487 1.20e-30 127
MsG0180005278.01.T01 AT1G33590 32.468 308 188 9 209 503 142 442 5.36e-28 119
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MsG0180005278.01.T01 AT1G51830 27.948 458 285 16 444 879 218 652 8.38e-34 139
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MsG0180005278.01.T01 AT5G10290 37.288 118 74 0 113 230 75 192 8.24e-12 69.3
MsG0180005278.01.T01 AT5G10290 33.495 206 98 8 1 202 41 211 2.36e-11 68.2
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MsG0180005278.01.T01 AT3G25020 27.191 559 289 22 18 505 59 570 4.69e-26 115
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MsG0180005278.01.T01 AT2G13790 36.691 139 85 3 298 435 74 210 3.12e-14 77.4
MsG0180005278.01.T01 AT2G13790 39.695 131 75 3 158 285 77 206 3.52e-12 70.5
MsG0180005278.01.T01 AT2G13790 32.222 180 92 6 13 192 56 205 6.32e-12 69.7
MsG0180005278.01.T01 AT2G13790 38.182 110 67 1 113 222 80 188 3.44e-11 67.4
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MsG0180005278.01.T01 AT4G39270 25.796 597 359 20 177 733 70 622 3.49e-32 134
MsG0180005278.01.T01 AT4G39270 30.128 312 171 11 18 289 54 358 5.87e-23 105
MsG0180005278.01.T01 AT4G39270 25.796 597 359 20 177 733 70 622 3.49e-32 134
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MsG0180005278.01.T01 AT1G51820 25.160 469 323 10 425 879 390 844 3.99e-32 135
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MsG0180005278.01.T01 AT5G14210 26.667 345 216 7 24 360 51 366 3.93e-21 99.8
MsG0180005278.01.T01 AT5G14210 34.118 170 105 3 53 219 205 370 2.84e-11 68.2
MsG0180005278.01.T01 AT1G55200 32.836 268 160 9 627 882 390 649 5.66e-32 133
MsG0180005278.01.T01 AT1G55200 32.836 268 160 9 627 882 390 649 5.66e-32 133
MsG0180005278.01.T01 AT1G55200 32.836 268 160 9 627 882 390 649 5.66e-32 133
MsG0180005278.01.T01 AT1G55200 32.836 268 160 9 627 882 390 649 5.66e-32 133
MsG0180005278.01.T01 AT5G67200 26.384 614 325 22 343 882 93 653 5.89e-32 133
MsG0180005278.01.T01 AT5G67200 38.686 137 81 2 274 410 74 207 1.16e-14 78.6
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MsG0180005278.01.T01 AT4G11490 31.488 289 175 8 610 882 312 593 2.06e-29 125
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MsG0180005278.01.T01 AT5G43020 31.515 165 102 5 13 174 55 211 7.76e-13 72.8
MsG0180005278.01.T01 AT5G48740 27.416 507 299 16 406 885 416 880 1.37e-28 124
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MsG0180005278.01.T01 AT3G53590 36.287 237 117 6 300 504 108 342 2.87e-27 119
MsG0180005278.01.T01 AT3G53590 32.011 353 191 11 15 360 52 362 1.01e-25 114
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MsG0180005278.01.T01 AT5G56790 32.593 270 158 10 627 882 401 660 2.78e-28 122
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MsG0180005278.01.T01 AT5G16900 26.509 464 280 13 442 882 417 842 5.22e-28 122
MsG0180005278.01.T01 AT5G16900 26.509 464 280 13 442 882 417 842 5.22e-28 122
MsG0180005278.01.T01 AT1G49730 26.902 368 231 11 539 885 281 631 5.49e-28 121
MsG0180005278.01.T01 AT4G23200 30.263 304 182 10 601 885 319 611 9.22e-28 120
MsG0180005278.01.T01 AT4G29240 32.950 261 165 7 152 407 110 365 9.59e-28 117
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MsG0180005278.01.T01 AT4G23130 27.083 336 208 11 567 882 294 612 1.23e-26 117
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MsG0180005278.01.T01 AT1G06840 26.542 373 228 11 530 882 548 894 2.14e-24 110
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MsG0180005278.01.T01 AT1G06840 28.344 314 196 8 17 325 59 348 4.98e-16 83.6
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MsG0180005278.01.T01 AT1G05700 29.362 235 154 4 658 882 607 839 1.71e-26 117
MsG0180005278.01.T01 AT1G21240 28.409 352 230 8 552 886 343 689 1.76e-26 116
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MsG0180005278.01.T01 AT4G23240 27.797 295 193 7 605 885 15 303 1.89e-26 112
MsG0180005278.01.T01 AT4G05200 27.078 373 232 12 527 882 287 636 2.00e-26 116
MsG0180005278.01.T01 AT3G15890 30.435 276 164 12 626 884 49 313 3.13e-26 112
MsG0180005278.01.T01 AT5G15730 29.293 297 191 9 596 886 96 379 3.21e-26 113
MsG0180005278.01.T01 AT5G15730 29.293 297 191 9 596 886 96 379 3.21e-26 113
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MsG0180005278.01.T01 AT5G49750 28.682 387 208 11 139 510 129 462 2.53e-25 111
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MsG0180005278.01.T01 AT4G00330 28.309 272 182 6 627 886 130 400 3.06e-25 109
MsG0180005278.01.T01 AT4G00960 29.536 237 146 7 659 882 8 236 3.12e-25 107
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MsG0180005278.01.T01 AT2G19780 35.047 214 130 6 86 293 111 321 1.85e-21 98.2
MsG0180005278.01.T01 AT2G19780 32.701 211 131 5 301 504 111 317 9.68e-19 90.1
MsG0180005278.01.T01 AT2G19780 30.736 231 144 6 272 494 109 331 9.58e-18 87.0
MsG0180005278.01.T01 AT4G03010 33.775 302 175 9 96 387 85 371 3.39e-25 109
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MsG0180005278.01.T01 AT4G03010 31.518 257 132 7 278 504 79 321 1.86e-20 95.1
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MsG0180005278.01.T01 AT4G22730 37.349 166 97 3 255 416 73 235 2.58e-18 89.7
MsG0180005278.01.T01 AT4G22730 34.483 174 107 2 101 267 56 229 3.57e-17 86.3
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MsG0180005278.01.T01 AT4G22730 37.423 163 77 2 226 388 92 229 5.29e-16 82.4
MsG0180005278.01.T01 AT4G22730 31.841 201 128 5 16 212 49 244 2.78e-14 77.0
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MsG0180005278.01.T01 AT1G53440 27.688 372 230 14 525 882 592 938 2.61e-22 103
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MsG0180005278.01.T01 AT1G53440 31.349 252 156 6 242 483 104 348 4.01e-21 100
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MsG0180005278.01.T01 AT1G56145 30.640 297 163 10 237 500 105 391 5.19e-25 112
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MsG0180005278.01.T01 AT1G56145 30.677 251 147 4 66 289 123 373 1.72e-22 104
MsG0180005278.01.T01 AT1G56145 22.670 397 248 10 524 882 607 982 8.72e-18 89.4
MsG0180005278.01.T01 AT1G56145 24.194 248 138 3 58 255 139 386 3.51e-11 67.8
MsG0180005278.01.T01 AT1G62440 31.169 231 153 4 161 388 106 333 5.25e-25 112
MsG0180005278.01.T01 AT1G62440 31.298 262 148 7 225 481 100 334 1.26e-20 98.2
MsG0180005278.01.T01 AT1G62440 28.571 266 154 8 248 505 97 334 2.37e-19 94.0
MsG0180005278.01.T01 AT1G62440 31.068 206 99 6 57 225 138 337 4.98e-17 86.7
MsG0180005278.01.T01 AT1G62440 31.390 223 145 6 73 289 113 333 6.45e-17 86.3
MsG0180005278.01.T01 AT1G56145 30.640 297 163 10 237 500 105 391 6.46e-25 112
MsG0180005278.01.T01 AT1G56145 33.083 266 157 5 251 504 95 351 9.27e-25 111
MsG0180005278.01.T01 AT1G56145 30.677 251 147 4 66 289 123 373 2.48e-22 103
MsG0180005278.01.T01 AT1G56145 24.324 370 248 9 524 882 607 955 6.77e-21 99.4
MsG0180005278.01.T01 AT1G56145 24.194 248 138 3 58 255 139 386 4.73e-11 67.4
MsG0180005278.01.T01 AT2G23200 28.622 283 175 8 624 886 496 771 6.61e-25 112
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MsG0180005278.01.T01 AT4G11470 31.933 238 148 6 660 885 384 619 6.94e-25 111
MsG0180005278.01.T01 AT1G21250 31.970 269 165 7 629 886 422 683 7.01e-25 111
MsG0180005278.01.T01 AT3G24550 27.181 298 196 7 600 882 262 553 7.72e-25 111
MsG0180005278.01.T01 AT3G23750 29.457 387 242 13 22 388 51 426 7.76e-25 112
MsG0180005278.01.T01 AT3G23750 29.517 393 232 11 158 519 63 441 3.32e-24 109
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MsG0180005278.01.T01 AT3G23750 28.395 243 142 6 300 512 62 302 3.32e-14 77.4
MsG0180005278.01.T01 AT3G23750 29.393 313 169 11 14 286 144 444 2.45e-11 68.2
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MsG0180005278.01.T01 AT1G56145 30.677 251 147 4 66 289 20 270 2.32e-22 103
MsG0180005278.01.T01 AT1G56145 24.194 372 246 10 524 882 504 852 2.88e-21 100
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Find 189 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 231 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
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AAGACTCAAAGTTTCCAATT+TGG 0.222196 1:+89560260 None:intergenic
TCCTCAGTTTCTAACTAAAA+TGG 0.226190 1:-89559362 MsG0180005278.01.T01:CDS
CTTCAGGCAAATAAGCTTTC+CGG 0.238960 1:-89560312 MsG0180005278.01.T01:CDS
CTTCAAATGAACAAGCTTAA+TGG 0.239300 1:-89559739 MsG0180005278.01.T01:CDS
CCTTGGAAGCTCCATGGTTT+TGG 0.239668 1:-89560418 MsG0180005278.01.T01:CDS
ATTAGGTTCATGCAAGAAAT+TGG 0.263262 1:-89559845 MsG0180005278.01.T01:CDS
CTTAGCACAGTCTTCATCTT+TGG 0.266998 1:+89557793 None:intergenic
TTCATCTTTGGTCTTGCATC+AGG 0.273337 1:+89557805 None:intergenic
GGGTCTATACCTTTAGATAT+TGG 0.275047 1:-89560291 MsG0180005278.01.T01:CDS
GGTTTGATACCTCCTGAATT+AGG 0.278341 1:-89559862 MsG0180005278.01.T01:CDS
TTAAGCCGTAATTCTCTTGA+TGG 0.286251 1:-89559667 MsG0180005278.01.T01:CDS
CTTGACACTGATTGATCTTC+AGG 0.291051 1:-89560328 MsG0180005278.01.T01:CDS
TGGAGAGGTCCAAAATTTCT+AGG 0.298530 1:+89559407 None:intergenic
TTCCCCTTCTTTCCTGCCCT+TGG 0.304828 1:+89559208 None:intergenic
TTCTTGCATGAACCTAATTC+AGG 0.307338 1:+89559850 None:intergenic
TCTCCAGAATTTCAAGCATT+TGG 0.320733 1:+89557854 None:intergenic
GGTTGGCATGGTCACCCTTC+TGG 0.322012 1:-89559137 MsG0180005278.01.T01:CDS
TAGAGTTACGTTCGACGTTT+CGG 0.330394 1:+89558952 None:intergenic
TCGCTTGAGGAGCCTCTAAT+TGG 0.332615 1:-89558539 MsG0180005278.01.T01:CDS
TTTCTGCATGGTTGTGCCTC+TGG 0.336008 1:-89558608 MsG0180005278.01.T01:CDS
CTCAATGACAATAACTTCAT+TGG 0.338936 1:-89560456 MsG0180005278.01.T01:CDS
GGGAGTCTTTGTGCGGTTGC+TGG 0.339627 1:-89558473 MsG0180005278.01.T01:CDS
AAAGAGAATGTGTATAGCTT+TGG 0.344003 1:-89558018 MsG0180005278.01.T01:CDS
AAACTAGTTGAAATATTTGC+AGG 0.344443 1:+89560000 None:intergenic
TGAAGTTGTGAAATCTGAAT+TGG 0.344476 1:+89559709 None:intergenic
GATGGAGATAAAAGGTCTTC+TGG 0.344701 1:+89560072 None:intergenic
TCCTGCCCTTGGAAAATTGT+TGG 0.345813 1:+89559219 None:intergenic
CCAGTTCCATGTATGTCAAT+TGG 0.349543 1:+89559902 None:intergenic
TTCAGGCAAATAAGCTTTCC+GGG 0.354114 1:-89560311 MsG0180005278.01.T01:CDS
CCTGCCCTTGGAAAATTGTT+GGG 0.355551 1:+89559220 None:intergenic
AATCTTAATGACAGATGAAT+TGG 0.358737 1:+89560704 None:intergenic
TTGCTGAGATTACCAAGTTC+TGG 0.359484 1:+89559778 None:intergenic
CGATGTCACTACACTGTTGC+AGG 0.359940 1:-89559108 MsG0180005278.01.T01:CDS
TCATTCTTCGATGTGCTTCA+TGG 0.365120 1:-89558701 MsG0180005278.01.T01:CDS
ACCGTCGTCCATTGGAAACT+TGG 0.366268 1:-89559572 MsG0180005278.01.T01:CDS
CTGACAGGGGAGATTCCTTT+GGG 0.366837 1:-89559949 MsG0180005278.01.T01:CDS
TTATCCAATAACAAGCTAAT+AGG 0.367330 1:-89560030 MsG0180005278.01.T01:CDS
TGTAAGGTTGTTTGACATAT+CGG 0.368716 1:+89559633 None:intergenic
CTATCAAACAATCATCTATC+AGG 0.368856 1:-89559319 MsG0180005278.01.T01:CDS
CTAGCTGTGATGGAGATAAA+AGG 0.369378 1:+89560064 None:intergenic
CCTGACAGGGGAGATTCCTT+TGG 0.371637 1:-89559950 MsG0180005278.01.T01:CDS
TTGTAACTCAACAGTTGATC+AGG 0.372065 1:+89560354 None:intergenic
AGTAATTTGTTGACACCAAA+TGG 0.373076 1:-89559022 MsG0180005278.01.T01:CDS
TATAAGGTTGTTATGCCATC+TGG 0.373300 1:-89558908 MsG0180005278.01.T01:CDS
TGAGTAGTCTTGATAAATTT+GGG 0.381062 1:-89558835 MsG0180005278.01.T01:CDS
TTTACTGGTGCTGTTCCTCT+TGG 0.391394 1:-89560153 MsG0180005278.01.T01:CDS
ATGTCAAGTGTTTCCAGTTC+AGG 0.395217 1:+89560549 None:intergenic
CTTATAGTAAGTTGAAAACT+TGG 0.396465 1:+89558925 None:intergenic
CTCAGCAGCAATCACTTTAG+TGG 0.396551 1:-89559463 MsG0180005278.01.T01:CDS
AGTGACTAAGGGAGCTGAAT+TGG 0.399875 1:-89557959 MsG0180005278.01.T01:CDS
ACCTTTCCATGTACATGGAT+TGG 0.404567 1:+89560743 None:intergenic
CCAAAGGAATCTCCCCTGTC+AGG 0.409905 1:+89559950 None:intergenic
AGTTTAGTCAGGTTGAGATT+GGG 0.412370 1:-89559982 MsG0180005278.01.T01:CDS
AAGATTGGAGAGAGTGTTCA+TGG 0.414715 1:+89560800 None:intergenic
TTTGACATATCGGATGGAAT+TGG 0.415997 1:+89559643 None:intergenic
GGCTCTATACCGTCGTCCAT+TGG 0.418703 1:-89559580 MsG0180005278.01.T01:CDS
GAAAGATTTCCAATATCTAA+AGG 0.419128 1:+89560282 None:intergenic
TAGTTTAGTCAGGTTGAGAT+TGG 0.419304 1:-89559983 MsG0180005278.01.T01:CDS
CCAATTGACATACATGGAAC+TGG 0.419556 1:-89559902 MsG0180005278.01.T01:CDS
AGAATTACGGCTTAAATTCA+AGG 0.419663 1:+89559675 None:intergenic
AGTCTTTCCTCTAATAGTCT+TGG 0.419819 1:-89560243 MsG0180005278.01.T01:CDS
TAGCTTTGGGGTGATTCTAC+TGG 0.420355 1:-89558004 MsG0180005278.01.T01:CDS
AGCATTGATATGCAGTTAGA+TGG 0.425669 1:-89560504 MsG0180005278.01.T01:CDS
TGGAAAACCTGCAGTGACTA+AGG 0.428311 1:-89557971 MsG0180005278.01.T01:CDS
TGTACATGGATTGGATTGTT+TGG 0.430156 1:+89560752 None:intergenic
AAGAGAATGTGTATAGCTTT+GGG 0.439434 1:-89558017 MsG0180005278.01.T01:CDS
ATTGCCACCAAGACTATTAG+AGG 0.439847 1:+89560236 None:intergenic
TTTGATCTGTGGATTCCATT+TGG 0.440679 1:+89559007 None:intergenic
ACCAGGGATGCTAAGAAGAT+TGG 0.441571 1:+89560785 None:intergenic
TCCAATCTTCTTAGCATCCC+TGG 0.444697 1:-89560786 MsG0180005278.01.T01:CDS
ATTGATCCTTCAAAGAGTAC+TGG 0.446462 1:-89558494 MsG0180005278.01.T01:CDS
CATCTTTGGTCTTGCATCAG+GGG 0.447165 1:+89557807 None:intergenic
CTTGCAAGTCAAGGAATGTA+AGG 0.452083 1:+89559617 None:intergenic
TTCAGTGGAAATGTGTTAAG+TGG 0.454124 1:-89560597 MsG0180005278.01.T01:CDS
GCATGAAAGACACTTTAGAT+TGG 0.455501 1:-89558676 MsG0180005278.01.T01:CDS
TCAATGACAATAACTTCATT+GGG 0.458939 1:-89560455 MsG0180005278.01.T01:CDS
GGCAACAGCTTCCATGACCT+TGG 0.459134 1:+89558973 None:intergenic
CATGCAGAAATAAACCCATC+TGG 0.461410 1:+89560651 None:intergenic
ATATTTCAACTAGTTTAGTC+AGG 0.461522 1:-89559993 MsG0180005278.01.T01:CDS
CATGAAAGACACTTTAGATT+GGG 0.464435 1:-89558675 MsG0180005278.01.T01:CDS
ATTTCGCCAAGAAGCTGAAC+TGG 0.464442 1:-89558877 MsG0180005278.01.T01:CDS
GGGAAAATTCCTACTAACCT+TGG 0.467137 1:-89560435 MsG0180005278.01.T01:CDS
AGACTCCCAGTACTCTTTGA+AGG 0.472278 1:+89558488 None:intergenic
TAATATATAAACATTGTTAG+TGG 0.474336 1:+89558745 None:intergenic
CTTTCCTCTAATAGTCTTGG+TGG 0.475773 1:-89560240 MsG0180005278.01.T01:CDS
TCATCTTTGGTCTTGCATCA+GGG 0.477600 1:+89557806 None:intergenic
ATGGAGCTTCCAAGGTTAGT+AGG 0.483476 1:+89560426 None:intergenic
TCAGCTCCCTTAGTCACTGC+AGG 0.487124 1:+89557964 None:intergenic
GATAGATCAAGGAGAAGTAT+TGG 0.488497 1:+89558584 None:intergenic
TTTCCAAGGGCAGGAAAGAA+GGG 0.489649 1:-89559211 MsG0180005278.01.T01:CDS
TGTTCAATATCACCAATTAG+AGG 0.497155 1:+89558527 None:intergenic
CACAACCATGCAGAAAATCT+AGG 0.498232 1:+89558615 None:intergenic
GTGACACCTTTCCATGTACA+TGG 0.498669 1:+89560738 None:intergenic
CGATACTCATGAGTGACATT+GGG 0.499489 1:+89560211 None:intergenic
TTGGTCCATCAAGAGAATTA+CGG 0.499557 1:+89559662 None:intergenic
CATTGATTTCTCCAAGGTCA+TGG 0.502337 1:-89558984 MsG0180005278.01.T01:CDS
CCTGATGGCTACATTTCTCC+AGG 0.505652 1:-89558449 MsG0180005278.01.T01:intron
TGATATGCAGTTAGATGGAA+TGG 0.506689 1:-89560499 MsG0180005278.01.T01:CDS
TGAAAACTTTGACCTTCCTC+AGG 0.508763 1:-89559053 MsG0180005278.01.T01:CDS
GGTGCATTGCCACCAGAACT+TGG 0.509839 1:-89559790 MsG0180005278.01.T01:CDS
CTTACATTCCTTGACTTGCA+AGG 0.510278 1:-89559616 MsG0180005278.01.T01:CDS
TGTGCGGTTGCTGGTCCTGA+TGG 0.513277 1:-89558464 MsG0180005278.01.T01:CDS
TGGGAAAGAGCTAGATGCAT+TGG 0.514252 1:-89558816 MsG0180005278.01.T01:CDS
ATAGCTGTTGGTGTGGCTCA+AGG 0.514360 1:-89558638 MsG0180005278.01.T01:CDS
CCTGGAGAAATGTAGCCATC+AGG 0.522805 1:+89558449 None:intergenic
CCAAAACCATGGAGCTTCCA+AGG 0.522924 1:+89560418 None:intergenic
GTTTAGTCAGGTTGAGATTG+GGG 0.524580 1:-89559981 MsG0180005278.01.T01:CDS
TTACATTCCTTGACTTGCAA+GGG 0.525562 1:-89559615 MsG0180005278.01.T01:CDS
ATTCTACTGGAATTGCTGAC+TGG 0.527845 1:-89557991 MsG0180005278.01.T01:CDS
GATGGGTTTATTTCTGCATG+TGG 0.530478 1:-89560648 MsG0180005278.01.T01:CDS
AGTTCAGGAAAACCATGAAA+AGG 0.532010 1:+89560564 None:intergenic
TACTAACCTTGGAAGCTCCA+TGG 0.534761 1:-89560424 MsG0180005278.01.T01:CDS
AACAATCCAATCCATGTACA+TGG 0.535060 1:-89560749 MsG0180005278.01.T01:CDS
TATAACTAAGATCCAAATAA+CGG 0.535883 1:+89560115 None:intergenic
CATCTGGGATAGAGCTCAGT+TGG 0.536043 1:+89560667 None:intergenic
GATTGTTCCCTTGCAAGTCA+AGG 0.538515 1:+89559608 None:intergenic
TCTACAAGCACTAGCTGTGA+TGG 0.538991 1:+89560054 None:intergenic
TTGGTGTCAACAAATTACTC+TGG 0.541649 1:+89559026 None:intergenic
TTATACGAGTTTCTCTCGAA+TGG 0.546453 1:-89558725 MsG0180005278.01.T01:CDS
TGTCAATTGGTTGTCACGAA+CGG 0.547988 1:+89559915 None:intergenic
CCGTCGTCCATTGGAAACTT+GGG 0.549672 1:-89559571 MsG0180005278.01.T01:CDS
GGGAGCTGAATTGGTAAAGT+GGG 0.550265 1:-89557950 MsG0180005278.01.T01:CDS
AGGGAGCTGAATTGGTAAAG+TGG 0.550487 1:-89557951 MsG0180005278.01.T01:CDS
TGACAACCAATTGACATACA+TGG 0.550828 1:-89559908 MsG0180005278.01.T01:CDS
ATCTTCTTAGCATCCCTGGT+TGG 0.552640 1:-89560782 MsG0180005278.01.T01:CDS
TGTAACTCAACAGTTGATCA+GGG 0.559347 1:+89560355 None:intergenic
CAAAGGAATCTCCCCTGTCA+GGG 0.559402 1:+89559951 None:intergenic
GCGATACTCATGAGTGACAT+TGG 0.566308 1:+89560210 None:intergenic
AATGCAATCTGTAGACTCAA+AGG 0.566770 1:+89559490 None:intergenic
AGGTTGTTTGACATATCGGA+TGG 0.567559 1:+89559637 None:intergenic
CAACTGAGCTCTATCCCAGA+TGG 0.569398 1:-89560666 MsG0180005278.01.T01:CDS
CACAAGCTGCTCCAAAACCA+TGG 0.569714 1:+89560407 None:intergenic
TCCAATCCATGTACATGGAA+AGG 0.571089 1:-89560744 MsG0180005278.01.T01:CDS
ATGTCTTTCAATAATTTGAG+TGG 0.574317 1:-89560528 MsG0180005278.01.T01:CDS
AATTTATCAAGACTACTCAC+TGG 0.574924 1:+89558839 None:intergenic
AAACTTATAGAAGTCCAACT+TGG 0.576140 1:-89559547 MsG0180005278.01.T01:CDS
TTGATCCTTCAAAGAGTACT+GGG 0.579203 1:-89558493 MsG0180005278.01.T01:CDS
ATGCAGAAATAAACCCATCT+GGG 0.585969 1:+89560652 None:intergenic
AGCAGATATAGTATAGCTGT+TGG 0.588684 1:-89558650 MsG0180005278.01.T01:CDS
GCGAAATAGATTGAACCAGA+TGG 0.589247 1:+89558893 None:intergenic
AGAAATCAATGTTTGATCTG+TGG 0.589689 1:+89558996 None:intergenic
TAATGACAGATGAATTGGTA+AGG 0.590594 1:+89560709 None:intergenic
TTGGCTGAGAATCAATTGAC+TGG 0.591030 1:-89559811 MsG0180005278.01.T01:CDS
ATCAAACATTGATTTCTCCA+AGG 0.596590 1:-89558990 MsG0180005278.01.T01:CDS
TTTAGTCAGGTTGAGATTGG+GGG 0.599823 1:-89559980 MsG0180005278.01.T01:CDS
TTGCATGAACCTAATTCAGG+AGG 0.599906 1:+89559853 None:intergenic
AACTGAGCTCTATCCCAGAT+GGG 0.602093 1:-89560665 MsG0180005278.01.T01:CDS
TTCCAAGGGCAGGAAAGAAG+GGG 0.603393 1:-89559210 MsG0180005278.01.T01:CDS
CCCAAGTTTCCAATGGACGA+CGG 0.609991 1:+89559571 None:intergenic
TATTATGCTGAAATCGCTTG+AGG 0.611074 1:-89558552 MsG0180005278.01.T01:CDS
GGAAAACCTGCAGTGACTAA+GGG 0.612525 1:-89557970 MsG0180005278.01.T01:CDS
TACTCTGGATGACCTGAGGA+AGG 0.619318 1:+89559041 None:intergenic
ATATAGTATAGCTGTTGGTG+TGG 0.620472 1:-89558645 MsG0180005278.01.T01:CDS
CTTGTATCGACTACAACGTA+CGG 0.623723 1:+89559277 None:intergenic
CTTGGAGAAAATAAGTTAAG+CGG 0.627766 1:-89559529 MsG0180005278.01.T01:CDS
GATGTCACTACACTGTTGCA+GGG 0.629392 1:-89559107 MsG0180005278.01.T01:CDS
TTCTTCGATGTGCTTCATGG+TGG 0.634018 1:-89558698 MsG0180005278.01.T01:CDS
GTTTGGTGATATTCCAACCA+GGG 0.634776 1:+89560769 None:intergenic
TCAGGAAAACCATGAAAAGG+AGG 0.635300 1:+89560567 None:intergenic
CTGAGATTACCAAGTTCTGG+TGG 0.638845 1:+89559781 None:intergenic
TACGTTGTAGTCGATACAAG+AGG 0.641380 1:-89559274 MsG0180005278.01.T01:CDS
GAAGCTGAACTGGTGCGACA+AGG 0.643243 1:-89558867 MsG0180005278.01.T01:CDS
AAGGAGAAGTATTGGACCAG+AGG 0.647975 1:+89558592 None:intergenic
TAGAAACTGAGGAATGTCAC+CGG 0.650700 1:+89559372 None:intergenic
TGTTTGGTGATATTCCAACC+AGG 0.653642 1:+89560768 None:intergenic
TCAAATGTGATGATTCCACT+AGG 0.655385 1:-89558779 MsG0180005278.01.T01:CDS
AATATCTAAAGGTATAGACC+CGG 0.656484 1:+89560293 None:intergenic
ACAACGTACGGAGGAAACTG+TGG 0.656988 1:+89559289 None:intergenic
GTGACATCGATACAACCAGA+AGG 0.666309 1:+89559122 None:intergenic
GAGTACTGGGAGTCTTTGTG+CGG 0.670649 1:-89558480 MsG0180005278.01.T01:CDS
AACTAAGATCCAAATAACGG+AGG 0.670678 1:+89560118 None:intergenic
TGGTGATATTGAACACTGCA+AGG 0.670751 1:-89558519 MsG0180005278.01.T01:CDS
GTGGACACAATATAGCCTAG+TGG 0.676547 1:+89558764 None:intergenic
TTGCAAGGGAACAATCTCAA+CGG 0.678229 1:-89559601 MsG0180005278.01.T01:CDS
TGACATCGATACAACCAGAA+GGG 0.692585 1:+89559123 None:intergenic
ATTCTCAGCCAAATTCAACA+AGG 0.696676 1:+89559822 None:intergenic
ACGGCTTCACAAGTACCCAA+AGG 0.701185 1:+89559934 None:intergenic
AGTAATTGCAATAAGAACAG+CGG 0.701557 1:+89559174 None:intergenic
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CRISPR-GE

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!! TAATATATAAACATTGTTAG+TGG + Chr1:89559827-89559846 None:intergenic 15.0%
!! TTATATTGTTTATCCATATA+GGG - Chr1:89560383-89560402 MsG0180005278.01.T01:CDS 15.0%
!! TTTATATAAGCTATATAAGT+TGG + Chr1:89560275-89560294 None:intergenic 15.0%
!! CTTATATTGTTTATCCATAT+AGG - Chr1:89560382-89560401 MsG0180005278.01.T01:CDS 20.0%
!! TATAACTAAGATCCAAATAA+CGG + Chr1:89558457-89558476 None:intergenic 20.0%
!! TGACTGTTTAAAAAAACTTA+TGG - Chr1:89560196-89560215 MsG0180005278.01.T01:CDS 20.0%
!!! ACCAACTTAGTAATTTTATT+AGG + Chr1:89560409-89560428 None:intergenic 20.0%
!!! GCTAATCTAAATAATTTTAC+TGG - Chr1:89558401-89558420 MsG0180005278.01.T01:intron 20.0%
!!! TTAAAGCTTTTAAATTTCAG+TGG - Chr1:89557957-89557976 MsG0180005278.01.T01:CDS 20.0%
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! GCCTAATAAAATTACTAAGT+TGG - Chr1:89560405-89560424 MsG0180005278.01.T01:CDS 25.0%
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! TATTGGAAATCTTTCCAAAT+TGG - Chr1:89558295-89558314 MsG0180005278.01.T01:intron 25.0%
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! TTATCCAATAACAAGCTAAT+AGG - Chr1:89558539-89558558 MsG0180005278.01.T01:CDS 25.0%
!! ATATTTCAACTAGTTTAGTC+AGG - Chr1:89558576-89558595 MsG0180005278.01.T01:CDS 25.0%
!! CAAGTTTTCAACTTACTATA+AGG - Chr1:89559645-89559664 MsG0180005278.01.T01:CDS 25.0%
!! CTTATAGTAAGTTGAAAACT+TGG + Chr1:89559647-89559666 None:intergenic 25.0%
!! CTTTCAAACAATGATTTTGA+TGG - Chr1:89558185-89558204 MsG0180005278.01.T01:intron 25.0%
!! TAATTTTATTAGGCCCTATA+TGG + Chr1:89560399-89560418 None:intergenic 25.0%
!! TACTTTTACTTGATAGATCA+AGG + Chr1:89559999-89560018 None:intergenic 25.0%
!! TGAGTAGTCTTGATAAATTT+GGG - Chr1:89559734-89559753 MsG0180005278.01.T01:CDS 25.0%
!! TTTGGTTAACCTAGAAATTT+TGG - Chr1:89559153-89559172 MsG0180005278.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTAACTTATTTTCTCCAAGT+TGG + Chr1:89559039-89559058 None:intergenic 25.0%
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AAACTTATAGAAGTCCAACT+TGG - Chr1:89559022-89559041 MsG0180005278.01.T01:CDS 30.0%
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AAGAGAATGTGTATAGCTTT+GGG - Chr1:89560552-89560571 MsG0180005278.01.T01:CDS 30.0%
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AGTAATTGCAATAAGAACAG+CGG + Chr1:89559398-89559417 None:intergenic 30.0%
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! GTGAGTAGTCTTGATAAATT+TGG - Chr1:89559733-89559752 MsG0180005278.01.T01:CDS 30.0%
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!!! AATTACTGCTGCTATTTTTG+TGG - Chr1:89559411-89559430 MsG0180005278.01.T01:CDS 30.0%
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AATGCAATCTGTAGACTCAA+AGG + Chr1:89559082-89559101 None:intergenic 35.0%
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TTGTAACTCAACAGTTGATC+AGG + Chr1:89558218-89558237 None:intergenic 35.0%
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! AAGTTTTCCCAAGTTTCCAA+TGG + Chr1:89559008-89559027 None:intergenic 35.0%
! AGAGAATGTGTATAGCTTTG+GGG - Chr1:89560553-89560572 MsG0180005278.01.T01:CDS 35.0%
! ATTGATCCTTCAAAGAGTAC+TGG - Chr1:89560075-89560094 MsG0180005278.01.T01:CDS 35.0%
! GATAGATCAAGGAGAAGTAT+TGG + Chr1:89559988-89560007 None:intergenic 35.0%
! TCCTAGCAGTTTTTCTGATT+TGG - Chr1:89559135-89559154 MsG0180005278.01.T01:CDS 35.0%
! TTTTCATGGTTTTCCTGAAC+TGG - Chr1:89558007-89558026 MsG0180005278.01.T01:CDS 35.0%
!! AGCATTGATATGCAGTTAGA+TGG - Chr1:89558065-89558084 MsG0180005278.01.T01:intron 35.0%
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!! TGTACATGGATTGGATTGTT+TGG + Chr1:89557820-89557839 None:intergenic 35.0%
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!!! GCCATTTTAGTTAGAAACTG+AGG + Chr1:89559211-89559230 None:intergenic 35.0%
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CCAGTTCCATGTATGTCAAT+TGG + Chr1:89558670-89558689 None:intergenic 40.0%
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TACGTTGTAGTCGATACAAG+AGG - Chr1:89559295-89559314 MsG0180005278.01.T01:CDS 40.0%
TAGAAACTGAGGAATGTCAC+CGG + Chr1:89559200-89559219 None:intergenic 40.0%
TAGAGTTACGTTCGACGTTT+CGG + Chr1:89559620-89559639 None:intergenic 40.0%
TCAGGAAAACCATGAAAAGG+AGG + Chr1:89558005-89558024 None:intergenic 40.0%
TCATTCTTCGATGTGCTTCA+TGG - Chr1:89559868-89559887 MsG0180005278.01.T01:CDS 40.0%
TCCAATCCATGTACATGGAA+AGG - Chr1:89557825-89557844 MsG0180005278.01.T01:CDS 40.0%
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TGACATCGATACAACCAGAA+GGG + Chr1:89559449-89559468 None:intergenic 40.0%
TGGAGAGGTCCAAAATTTCT+AGG + Chr1:89559165-89559184 None:intergenic 40.0%
TGGTGATATTGAACACTGCA+AGG - Chr1:89560050-89560069 MsG0180005278.01.T01:CDS 40.0%
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! TGTTTGGTGATATTCCAACC+AGG + Chr1:89557804-89557823 None:intergenic 40.0%
!! CATTGATTTCTCCAAGGTCA+TGG - Chr1:89559585-89559604 MsG0180005278.01.T01:CDS 40.0%
!! CTTACATTCCTTGACTTGCA+AGG - Chr1:89558953-89558972 MsG0180005278.01.T01:CDS 40.0%
!! CTTGTATCGACTACAACGTA+CGG + Chr1:89559295-89559314 None:intergenic 40.0%
!! GATGGGTTTATTTCTGCATG+TGG - Chr1:89557921-89557940 MsG0180005278.01.T01:CDS 40.0%
!! GTTTAGTCAGGTTGAGATTG+GGG - Chr1:89558588-89558607 MsG0180005278.01.T01:CDS 40.0%
!! TCATCTTTGGTCTTGCATCA+GGG + Chr1:89560766-89560785 None:intergenic 40.0%
!! TTCATCTTTGGTCTTGCATC+AGG + Chr1:89560767-89560786 None:intergenic 40.0%
!! TTTAGTCAGGTTGAGATTGG+GGG - Chr1:89558589-89558608 MsG0180005278.01.T01:CDS 40.0%
!!! ACTGCTGCTATTTTTGTGGT+TGG - Chr1:89559415-89559434 MsG0180005278.01.T01:CDS 40.0%
!!! GGTTTTTTGCCTCCTTTTCA+TGG - Chr1:89557993-89558012 MsG0180005278.01.T01:CDS 40.0%
!!! TGCTATTTTTGTGGTTGGCA+TGG - Chr1:89559420-89559439 MsG0180005278.01.T01:CDS 40.0%
AACTGAGCTCTATCCCAGAT+GGG - Chr1:89557904-89557923 MsG0180005278.01.T01:CDS 45.0%
ACCAGGGATGCTAAGAAGAT+TGG + Chr1:89557787-89557806 None:intergenic 45.0%
AGACTCCCAGTACTCTTTGA+AGG + Chr1:89560084-89560103 None:intergenic 45.0%
AGGGAGCTGAATTGGTAAAG+TGG - Chr1:89560618-89560637 MsG0180005278.01.T01:CDS 45.0%
AGTGACTAAGGGAGCTGAAT+TGG - Chr1:89560610-89560629 MsG0180005278.01.T01:CDS 45.0%
ATCTTCTTAGCATCCCTGGT+TGG - Chr1:89557787-89557806 MsG0180005278.01.T01:CDS 45.0%
ATGGAGCTTCCAAGGTTAGT+AGG + Chr1:89558146-89558165 None:intergenic 45.0%
ATTTCGCCAAGAAGCTGAAC+TGG - Chr1:89559692-89559711 MsG0180005278.01.T01:CDS 45.0%
CCTGCCCTTGGAAAATTGTT+GGG + Chr1:89559352-89559371 None:intergenic 45.0%
CTCAGCAGCAATCACTTTAG+TGG - Chr1:89559106-89559125 MsG0180005278.01.T01:CDS 45.0%
GATGTCACTACACTGTTGCA+GGG - Chr1:89559462-89559481 MsG0180005278.01.T01:CDS 45.0%
GATTGTTCCCTTGCAAGTCA+AGG + Chr1:89558964-89558983 None:intergenic 45.0%
GCGATACTCATGAGTGACAT+TGG + Chr1:89558362-89558381 None:intergenic 45.0%
GGAAAACCTGCAGTGACTAA+GGG - Chr1:89560599-89560618 MsG0180005278.01.T01:CDS 45.0%
GGGAGCTGAATTGGTAAAGT+GGG - Chr1:89560619-89560638 MsG0180005278.01.T01:CDS 45.0%
GTGACACCTTTCCATGTACA+TGG + Chr1:89557834-89557853 None:intergenic 45.0%
GTGACATCGATACAACCAGA+AGG + Chr1:89559450-89559469 None:intergenic 45.0%
GTGGACACAATATAGCCTAG+TGG + Chr1:89559808-89559827 None:intergenic 45.0%
TACTAACCTTGGAAGCTCCA+TGG - Chr1:89558145-89558164 MsG0180005278.01.T01:intron 45.0%
TCCAATCTTCTTAGCATCCC+TGG - Chr1:89557783-89557802 MsG0180005278.01.T01:CDS 45.0%
TCCTGCCCTTGGAAAATTGT+TGG + Chr1:89559353-89559372 None:intergenic 45.0%
TCTACAAGCACTAGCTGTGA+TGG + Chr1:89558518-89558537 None:intergenic 45.0%
TGGAAAACCTGCAGTGACTA+AGG - Chr1:89560598-89560617 MsG0180005278.01.T01:CDS 45.0%
TGGGAAAGAGCTAGATGCAT+TGG - Chr1:89559753-89559772 MsG0180005278.01.T01:CDS 45.0%
TTCTTCGATGTGCTTCATGG+TGG - Chr1:89559871-89559890 MsG0180005278.01.T01:CDS 45.0%
TTTCCAAGGGCAGGAAAGAA+GGG - Chr1:89559358-89559377 MsG0180005278.01.T01:CDS 45.0%
! CAAGGCCTAGATTTTCTGCA+TGG - Chr1:89559949-89559968 MsG0180005278.01.T01:CDS 45.0%
! CTGAGATTACCAAGTTCTGG+TGG + Chr1:89558791-89558810 None:intergenic 45.0%
! TTTTCCAAGGGCAGGAAAGA+AGG - Chr1:89559357-89559376 MsG0180005278.01.T01:CDS 45.0%
!! AAGGAGAAGTATTGGACCAG+AGG + Chr1:89559980-89559999 None:intergenic 45.0%
!! CATCTTTGGTCTTGCATCAG+GGG + Chr1:89560765-89560784 None:intergenic 45.0%
!! GTCACCGGAGAAGTTGTTTT+TGG + Chr1:89559185-89559204 None:intergenic 45.0%
!! TAGCTTTGGGGTGATTCTAC+TGG - Chr1:89560565-89560584 MsG0180005278.01.T01:CDS 45.0%
!! TTTACTGGTGCTGTTCCTCT+TGG - Chr1:89558416-89558435 MsG0180005278.01.T01:intron 45.0%
!!! CGGAGAAGTTGTTTTTGGAG+AGG + Chr1:89559180-89559199 None:intergenic 45.0%
ACAACGTACGGAGGAAACTG+TGG + Chr1:89559283-89559302 None:intergenic 50.0%
ACCGTCGTCCATTGGAAACT+TGG - Chr1:89558997-89559016 MsG0180005278.01.T01:CDS 50.0%
ACGGCTTCACAAGTACCCAA+AGG + Chr1:89558638-89558657 None:intergenic 50.0%
ATAGCTGTTGGTGTGGCTCA+AGG - Chr1:89559931-89559950 MsG0180005278.01.T01:CDS 50.0%
CAAAGGAATCTCCCCTGTCA+GGG + Chr1:89558621-89558640 None:intergenic 50.0%
CAACTGAGCTCTATCCCAGA+TGG - Chr1:89557903-89557922 MsG0180005278.01.T01:CDS 50.0%
CACAAGCTGCTCCAAAACCA+TGG + Chr1:89558165-89558184 None:intergenic 50.0%
CCAAAACCATGGAGCTTCCA+AGG + Chr1:89558154-89558173 None:intergenic 50.0%
CCCAAGTTTCCAATGGACGA+CGG + Chr1:89559001-89559020 None:intergenic 50.0%
CCGTCGTCCATTGGAAACTT+GGG - Chr1:89558998-89559017 MsG0180005278.01.T01:CDS 50.0%
CCTGATGGCTACATTTCTCC+AGG - Chr1:89560120-89560139 MsG0180005278.01.T01:CDS 50.0%
CCTGGAGAAATGTAGCCATC+AGG + Chr1:89560123-89560142 None:intergenic 50.0%
CGATGTCACTACACTGTTGC+AGG - Chr1:89559461-89559480 MsG0180005278.01.T01:CDS 50.0%
CTGACAGGGGAGATTCCTTT+GGG - Chr1:89558620-89558639 MsG0180005278.01.T01:CDS 50.0%
TACTCTGGATGACCTGAGGA+AGG + Chr1:89559531-89559550 None:intergenic 50.0%
TCGCTTGAGGAGCCTCTAAT+TGG - Chr1:89560030-89560049 MsG0180005278.01.T01:CDS 50.0%
TGGGGGAAAATTCCCTGACA+GGG - Chr1:89558606-89558625 MsG0180005278.01.T01:CDS 50.0%
TTCCAAGGGCAGGAAAGAAG+GGG - Chr1:89559359-89559378 MsG0180005278.01.T01:CDS 50.0%
TTGGGGGAAAATTCCCTGAC+AGG - Chr1:89558605-89558624 MsG0180005278.01.T01:CDS 50.0%
TTTCTGCATGGTTGTGCCTC+TGG - Chr1:89559961-89559980 MsG0180005278.01.T01:CDS 50.0%
! CATCTGGGATAGAGCTCAGT+TGG + Chr1:89557905-89557924 None:intergenic 50.0%
! CCCAACAATTTTCCAAGGGC+AGG - Chr1:89559349-89559368 MsG0180005278.01.T01:CDS 50.0%
! CCTTGGAAGCTCCATGGTTT+TGG - Chr1:89558151-89558170 MsG0180005278.01.T01:intron 50.0%
!! GAGTACTGGGAGTCTTTGTG+CGG - Chr1:89560089-89560108 MsG0180005278.01.T01:CDS 50.0%
!! GTATCGACTACAACGTACGG+AGG + Chr1:89559292-89559311 None:intergenic 50.0%
CCAAAGGAATCTCCCCTGTC+AGG + Chr1:89558622-89558641 None:intergenic 55.0%
CCTGACAGGGGAGATTCCTT+TGG - Chr1:89558619-89558638 MsG0180005278.01.T01:CDS 55.0%
GAAGCTGAACTGGTGCGACA+AGG - Chr1:89559702-89559721 MsG0180005278.01.T01:CDS 55.0%
GGCAACAGCTTCCATGACCT+TGG + Chr1:89559599-89559618 None:intergenic 55.0%
GGCTCTATACCGTCGTCCAT+TGG - Chr1:89558989-89559008 MsG0180005278.01.T01:CDS 55.0%
GGGGGAAAATTCCCTGACAG+GGG - Chr1:89558607-89558626 MsG0180005278.01.T01:CDS 55.0%
GGTGCATTGCCACCAGAACT+TGG - Chr1:89558779-89558798 MsG0180005278.01.T01:CDS 55.0%
GTCGCACCAGTTCAGCTTCT+TGG + Chr1:89559701-89559720 None:intergenic 55.0%
TCAGCTCCCTTAGTCACTGC+AGG + Chr1:89560608-89560627 None:intergenic 55.0%
TTCCCCTTCTTTCCTGCCCT+TGG + Chr1:89559364-89559383 None:intergenic 55.0%
GGGAGTCTTTGTGCGGTTGC+TGG - Chr1:89560096-89560115 MsG0180005278.01.T01:CDS 60.0%
GGTTGGCATGGTCACCCTTC+TGG - Chr1:89559432-89559451 MsG0180005278.01.T01:CDS 60.0%
TGTGCGGTTGCTGGTCCTGA+TGG - Chr1:89560105-89560124 MsG0180005278.01.T01:CDS 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr1 gene 89557771 89560820 89557771 ID=MsG0180005278.01;Name=MsG0180005278.01
Chr1 mRNA 89557771 89560820 89557771 ID=MsG0180005278.01.T01;Parent=MsG0180005278.01;Name=MsG0180005278.01.T01;_AED=0.36;_eAED=0.36;_QI=0|0|0|1|1|1|2|0|886
Chr1 exon 89558450 89560820 89558450 ID=MsG0180005278.01.T01:exon:47803;Parent=MsG0180005278.01.T01
Chr1 exon 89557771 89558060 89557771 ID=MsG0180005278.01.T01:exon:47802;Parent=MsG0180005278.01.T01
Chr1 CDS 89558450 89560820 89558450 ID=MsG0180005278.01.T01:cds;Parent=MsG0180005278.01.T01
Chr1 CDS 89557771 89558060 89557771 ID=MsG0180005278.01.T01:cds;Parent=MsG0180005278.01.T01
Gene Sequence

>MsG0180005278.01.T01

ATGAACACTCTCTCCAATCTTCTTAGCATCCCTGGTTGGAATATCACCAAACAATCCAATCCATGTACATGGAAAGGTGTCACTTGTGACCTTACCAATTCATCTGTCATTAAGATTGATGTTTCTAAGAACCAACTGAGCTCTATCCCAGATGGGTTTATTTCTGCATGTGGAAAGATTGAGAGTTTAAAGCTTTTAAATTTCAGTGGAAATGTGTTAAGTGGTTTTTTGCCTCCTTTTCATGGTTTTCCTGAACTGGAAACACTTGACATGTCTTTCAATAATTTGAGTGGAAGCATTGATATGCAGTTAGATGGAATGGTTAGTCTCAAATATCTTAATCTCAATGACAATAACTTCATTGGGAAAATTCCTACTAACCTTGGAAGCTCCATGGTTTTGGAGCAGCTTGTGCTTTCAAACAATGATTTTGATGGAACAATCCCTGATCAACTGTTGAGTTACAAAAACTTGACACTGATTGATCTTCAGGCAAATAAGCTTTCCGGGTCTATACCTTTAGATATTGGAAATCTTTCCAAATTGGAAACTTTGAGTCTTTCCTCTAATAGTCTTGGTGGCAATATCCCAATGTCACTCATGAGTATCGCAACACTAGTAAGATTTGCAGCTAATCTAAATAATTTTACTGGTGCTGTTCCTCTTGGAATTACAAAATTCCTCCGTTATTTGGATCTTAGTTATAATGATTTGTCTGAGTCTATTCCAGAAGACCTTTTATCTCCATCACAGCTAGTGCTTGTAGATTTATCCAATAACAAGCTAATAGGTCATGTGCCTGCAAATATTTCAACTAGTTTAGTCAGGTTGAGATTGGGGGAAAATTCCCTGACAGGGGAGATTCCTTTGGGTACTTGTGAAGCCGTTCGTGACAACCAATTGACATACATGGAACTGGAAAAAAATCAGTTGACAGGTTTGATACCTCCTGAATTAGGTTCATGCAAGAAATTGGCCTTGTTGAATTTGGCTGAGAATCAATTGACTGGTGCATTGCCACCAGAACTTGGTAATCTCAGCAATCTACAAGTCTTGAAGCTTCAAATGAACAAGCTTAATGGTACTATTCCAATTCAGATTTCACAACTTCAAAAATTGTCTACCTTGAATTTAAGCCGTAATTCTCTTGATGGACCAATTCCATCCGATATGTCAAACAACCTTACATTCCTTGACTTGCAAGGGAACAATCTCAACGGCTCTATACCGTCGTCCATTGGAAACTTGGGAAAACTTATAGAAGTCCAACTTGGAGAAAATAAGTTAAGCGGTGATATTCCAAAAATGCCTTTGAGTCTACAGATTGCATTGAATCTCAGCAGCAATCACTTTAGTGGAGCTATTCCTAGCAGTTTTTCTGATTTGGTTAACCTAGAAATTTTGGACCTCTCCAAAAACAACTTCTCCGGTGACATTCCTCAGTTTCTAACTAAAATGGCTGCATTGACACAGTTGCAACTATCAAACAATCATCTATCAGGTGAGCTTCCACAGTTTCCTCCGTACGTTGTAGTCGATACAAGAGGAAACAATGTCAGAAACAATAGTAATGTCTCACCCAACAATTTTCCAAGGGCAGGAAAGAAGGGGAAATCTGTTGTTGCCGCTGTTCTTATTGCAATTACTGCTGCTATTTTTGTGGTTGGCATGGTCACCCTTCTGGTTGTATCGATGTCACTACACTGTTGCAGGGTCAATGATGAACAAGTACAGTCAAGTGAAAGTGAAAACTTTGACCTTCCTCAGGTCATCCAGAGTAATTTGTTGACACCAAATGGAATCCACAGATCAAACATTGATTTCTCCAAGGTCATGGAAGCTGTTGCCGAAACGTCGAACGTAACTCTAAAAACCAAGTTTTCAACTTACTATAAGGTTGTTATGCCATCTGGTTCAATCTATTTCGCCAAGAAGCTGAACTGGTGCGACAAGGTATTTCCAGTGAGTAGTCTTGATAAATTTGGGAAAGAGCTAGATGCATTGGCAAAGTTGAACAATTCAAATGTGATGATTCCACTAGGCTATATTGTGTCCACTAACAATGTTTATATATTATACGAGTTTCTCTCGAATGGCTCATTCTTCGATGTGCTTCATGGTGGCATGAAAGACACTTTAGATTGGGCTAGCAGATATAGTATAGCTGTTGGTGTGGCTCAAGGCCTAGATTTTCTGCATGGTTGTGCCTCTGGTCCAATACTTCTCCTTGATCTATCAAGTAAAAGTATTATGCTGAAATCGCTTGAGGAGCCTCTAATTGGTGATATTGAACACTGCAAGGTGATTGATCCTTCAAAGAGTACTGGGAGTCTTTGTGCGGTTGCTGGTCCTGATGGCTACATTTCTCCAGCAGAGTATGCGTGCACAATGAAAGAGAATGTGTATAGCTTTGGGGTGATTCTACTGGAATTGCTGACTGGAAAACCTGCAGTGACTAAGGGAGCTGAATTGGTAAAGTGGGTTTTGCGTAATTCAAGAAATCAAGATTACATTCTTGATTTGAATGTCAGCAAAACATCACAGTCTGTTAGAAACCAAATGCTTGAAATTCTGGAGATTGCTCTTGTTTGTGTAAGCACATCCCCTGATGCAAGACCAAAGATGAAGACTGTGCTAAGAATGTTGCTGAATGCCAGATAA
Protein sequence

>MsG0180005278.01.T01

MNTLSNLLSIPGWNITKQSNPCTWKGVTCDLTNSSVIKIDVSKNQLSSIPDGFISACGKIESLKLLNFSGNVLSGFLPPFHGFPELETLDMSFNNLSGSIDMQLDGMVSLKYLNLNDNNFIGKIPTNLGSSMVLEQLVLSNNDFDGTIPDQLLSYKNLTLIDLQANKLSGSIPLDIGNLSKLETLSLSSNSLGGNIPMSLMSIATLVRFAANLNNFTGAVPLGITKFLRYLDLSYNDLSESIPEDLLSPSQLVLVDLSNNKLIGHVPANISTSLVRLRLGENSLTGEIPLGTCEAVRDNQLTYMELEKNQLTGLIPPELGSCKKLALLNLAENQLTGALPPELGNLSNLQVLKLQMNKLNGTIPIQISQLQKLSTLNLSRNSLDGPIPSDMSNNLTFLDLQGNNLNGSIPSSIGNLGKLIEVQLGENKLSGDIPKMPLSLQIALNLSSNHFSGAIPSSFSDLVNLEILDLSKNNFSGDIPQFLTKMAALTQLQLSNNHLSGELPQFPPYVVVDTRGNNVRNNSNVSPNNFPRAGKKGKSVVAAVLIAITAAIFVVGMVTLLVVSMSLHCCRVNDEQVQSSESENFDLPQVIQSNLLTPNGIHRSNIDFSKVMEAVAETSNVTLKTKFSTYYKVVMPSGSIYFAKKLNWCDKVFPVSSLDKFGKELDALAKLNNSNVMIPLGYIVSTNNVYILYEFLSNGSFFDVLHGGMKDTLDWASRYSIAVGVAQGLDFLHGCASGPILLLDLSSKSIMLKSLEEPLIGDIEHCKVIDPSKSTGSLCAVAGPDGYISPAEYACTMKENVYSFGVILLELLTGKPAVTKGAELVKWVLRNSRNQDYILDLNVSKTSQSVRNQMLEILEIALVCVSTSPDARPKMKTVLRMLLNAR*