AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0280009168.01

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MsG0280009168.01.T01 AT4G33990 23.846 390 210 13 1 354 144 482 2.71e-25 109
MsG0280009168.01.T01 AT4G33990 27.381 252 169 6 82 332 84 322 3.74e-21 96.7
MsG0280009168.01.T01 AT3G23330 34.031 382 244 3 49 426 238 615 2.23e-73 244
MsG0280009168.01.T01 AT3G23330 27.160 324 209 9 1 313 96 403 2.91e-30 124
MsG0280009168.01.T01 AT1G56690 36.885 366 222 4 63 425 244 603 2.28e-73 243
MsG0280009168.01.T01 AT1G56690 27.344 256 147 4 12 266 330 547 2.97e-22 100
MsG0280009168.01.T01 AT1G56690 27.354 223 147 4 57 278 52 260 6.31e-17 83.6
MsG0280009168.01.T01 AT1G56690 24.474 380 239 13 60 427 24 367 2.33e-15 79.0
MsG0280009168.01.T01 AT1G11290 35.616 365 227 4 66 426 350 710 2.89e-73 245
MsG0280009168.01.T01 AT1G11290 37.173 191 119 1 84 274 271 460 3.17e-33 133
MsG0280009168.01.T01 AT1G11290 36.264 182 111 2 83 262 169 347 1.44e-31 128
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MsG0280009168.01.T01 AT4G38010 36.697 327 192 8 89 411 244 559 1.38e-63 214
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MsG0280009168.01.T01 AT4G38010 25.581 215 142 6 35 231 276 490 2.75e-11 65.9
MsG0280009168.01.T01 AT2G36730 33.645 428 235 8 1 424 104 486 1.92e-63 213
MsG0280009168.01.T01 AT2G36730 27.273 242 138 8 99 326 62 279 2.95e-15 78.2
MsG0280009168.01.T01 AT4G39530 36.232 345 215 4 83 427 488 827 2.00e-63 219
MsG0280009168.01.T01 AT4G39530 30.876 217 143 2 52 262 145 360 7.49e-29 120
MsG0280009168.01.T01 AT4G39530 31.336 217 141 3 52 261 248 463 6.44e-28 117
MsG0280009168.01.T01 AT4G39530 32.692 208 117 6 83 272 78 280 9.76e-23 101
MsG0280009168.01.T01 AT4G39530 23.577 246 148 5 32 270 569 781 5.83e-14 74.7
MsG0280009168.01.T01 AT3G51320 32.500 400 259 5 1 399 109 498 2.73e-63 213
MsG0280009168.01.T01 AT1G32415 33.421 380 244 4 46 419 361 737 3.32e-63 217
MsG0280009168.01.T01 AT1G32415 31.624 234 149 4 57 284 204 432 1.17e-27 116
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MsG0280009168.01.T01 AT3G02330 27.425 299 178 8 83 355 315 600 1.19e-25 110
MsG0280009168.01.T01 AT3G02330 29.482 251 169 4 83 332 214 457 9.35e-25 107
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MsG0280009168.01.T01 AT3G21470 34.639 332 208 5 68 395 192 518 2.05e-60 205
MsG0280009168.01.T01 AT3G21470 28.652 178 115 5 156 332 51 217 1.14e-13 73.2
MsG0280009168.01.T01 AT1G68930 30.394 431 247 7 1 426 235 617 2.14e-60 209
MsG0280009168.01.T01 AT1G68930 25.982 331 238 4 28 358 123 446 1.27e-32 130
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MsG0280009168.01.T01 AT4G16470 29.577 426 255 6 4 428 102 483 2.31e-60 204
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MsG0280009168.01.T01 AT3G13770 31.977 344 197 4 84 426 188 495 3.33e-58 201
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MsG0280009168.01.T01 AT3G18840 23.342 377 218 9 3 333 118 469 2.10e-19 91.3
MsG0280009168.01.T01 AT3G18840 27.014 211 146 5 37 240 7 216 5.05e-17 84.0
MsG0280009168.01.T01 AT5G55740 29.054 444 269 7 22 423 379 818 4.69e-58 204
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MsG0280009168.01.T01 AT1G56570 33.237 346 222 6 81 423 245 584 4.47e-56 195
MsG0280009168.01.T01 AT1G56570 27.350 234 167 3 81 313 42 273 6.03e-22 99.0
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MsG0280009168.01.T01 AT3G05340 29.670 364 245 6 68 427 274 630 2.33e-54 191
MsG0280009168.01.T01 AT3G05340 29.437 231 152 6 81 307 87 310 5.10e-20 93.2
MsG0280009168.01.T01 AT3G05340 28.090 178 127 1 82 259 188 364 1.05e-17 85.9
MsG0280009168.01.T01 AT5G65570 29.167 432 252 10 1 427 258 640 2.39e-54 192
MsG0280009168.01.T01 AT5G65570 27.556 225 162 1 88 312 103 326 1.58e-24 107
MsG0280009168.01.T01 AT5G65570 25.497 302 200 6 52 331 164 462 6.97e-23 102
MsG0280009168.01.T01 AT5G13230 32.456 342 227 2 83 424 382 719 3.64e-54 193
MsG0280009168.01.T01 AT5G13230 24.024 333 235 7 38 364 233 553 5.55e-22 99.4
MsG0280009168.01.T01 AT5G13230 28.464 267 159 6 17 283 37 271 4.38e-19 90.5
MsG0280009168.01.T01 AT5G13230 26.966 178 128 2 82 258 482 658 3.88e-13 72.0
MsG0280009168.01.T01 AT3G63370 31.017 403 242 4 24 426 493 859 4.36e-54 193
MsG0280009168.01.T01 AT3G63370 30.864 243 154 6 94 331 126 359 3.14e-27 115
MsG0280009168.01.T01 AT3G63370 25.573 262 155 3 1 261 173 395 1.57e-24 107
MsG0280009168.01.T01 AT3G63370 25.792 221 152 2 63 272 299 518 1.65e-17 85.5
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MsG0280009168.01.T01 AT3G63370 31.017 403 242 4 24 426 493 859 4.97e-54 194
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MsG0280009168.01.T01 AT3G50420 29.412 204 141 3 78 279 227 429 8.69e-23 101
MsG0280009168.01.T01 AT3G50420 26.923 182 124 4 90 262 28 209 1.95e-14 75.9
MsG0280009168.01.T01 AT2G02750 26.835 395 269 6 9 396 230 611 8.53e-43 159
MsG0280009168.01.T01 AT2G02750 28.521 284 149 7 9 281 30 270 1.56e-21 97.8
MsG0280009168.01.T01 AT2G46050 30.183 328 213 5 74 395 266 583 3.36e-42 157
MsG0280009168.01.T01 AT2G46050 26.344 186 129 4 84 262 71 255 4.12e-13 71.6
MsG0280009168.01.T01 AT3G61170 25.971 489 256 9 3 426 220 667 1.10e-41 157
MsG0280009168.01.T01 AT3G61170 28.205 273 185 5 64 333 39 303 7.80e-31 125
MsG0280009168.01.T01 AT3G61170 23.020 404 228 9 1 381 116 459 2.30e-23 103
MsG0280009168.01.T01 AT1G22830 29.091 330 222 5 88 414 361 681 1.81e-41 156
MsG0280009168.01.T01 AT1G22830 25.697 323 215 4 1 312 175 483 1.52e-31 127
MsG0280009168.01.T01 AT1G22830 23.563 174 128 1 44 212 414 587 3.49e-17 84.3
MsG0280009168.01.T01 AT1G22830 23.144 229 144 3 37 265 102 298 3.57e-14 75.1
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MsG0280009168.01.T01 AT5G41170 23.158 285 204 5 43 313 167 450 3.70e-16 80.9
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MsG0280009168.01.T01 AT1G06710 23.940 401 226 13 1 387 439 774 4.16e-16 81.3
MsG0280009168.01.T01 AT1G06710 23.940 401 226 13 1 387 439 774 4.16e-16 81.3
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MsG0280009168.01.T01 AT5G15010 24.775 222 146 5 47 253 296 511 1.32e-11 67.0
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MsG0280009168.01.T01 AT1G51965 21.662 397 258 13 40 388 225 616 2.25e-11 66.2
MsG0280009168.01.T01 AT1G06580 19.219 333 252 6 46 366 1 328 3.24e-11 65.1
MsG0280009168.01.T01 AT1G06580 19.219 333 252 6 46 366 1 328 3.24e-11 65.1
MsG0280009168.01.T01 AT3G09060 21.194 335 239 8 48 366 179 504 3.33e-11 65.9
MsG0280009168.01.T01 AT3G09060 21.194 335 239 8 48 366 179 504 3.33e-11 65.9
MsG0280009168.01.T01 AT5G55840 19.529 297 190 5 48 332 403 662 4.24e-11 65.9
MsG0280009168.01.T01 AT5G55840 19.529 297 190 5 48 332 403 662 4.24e-11 65.9
MsG0280009168.01.T01 AT5G55840 19.529 297 190 5 48 332 363 622 4.27e-11 65.9
MsG0280009168.01.T01 AT5G28370 21.549 297 213 8 52 332 369 661 5.60e-11 65.1
MsG0280009168.01.T01 AT3G48810 22.316 354 250 7 1 339 307 650 6.08e-11 65.1
MsG0280009168.01.T01 AT5G28460 21.549 297 213 8 52 332 369 661 7.08e-11 64.7

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CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GCTTGGAATGCTATGATTTC+TGG 0.189906 2:-46796232 MsG0280009168.01.T01:CDS
ATTGATGGTTATGGTAAAAT+AGG 0.193261 2:-46796616 MsG0280009168.01.T01:CDS
CATTGTCATGTCGTTCTATT+GGG 0.237321 2:-46796766 MsG0280009168.01.T01:CDS
GCATTGTCATGTCGTTCTAT+TGG 0.276355 2:-46796767 MsG0280009168.01.T01:CDS
AGCTAGCGATGCTAATGTTT+GGG 0.290521 2:-46795930 MsG0280009168.01.T01:CDS
GGATGGTTCGCGAAGGTCTT+TGG 0.300739 2:-46796090 MsG0280009168.01.T01:CDS
TATCTTAGCCACAGCTTTAG+TGG 0.313834 2:-46796329 MsG0280009168.01.T01:CDS
CAGCTAGCGATGCTAATGTT+TGG 0.317409 2:-46795931 MsG0280009168.01.T01:CDS
GAGGTTTATCGAGGAGAAAA+TGG 0.338158 2:-46795963 MsG0280009168.01.T01:CDS
GCTAACTGCATGTGCTCACC+TGG 0.346093 2:-46796419 MsG0280009168.01.T01:CDS
TTGATGGTTATGGTAAAATA+GGG 0.348541 2:-46796615 MsG0280009168.01.T01:CDS
ACAGGAAATGTGCAGGTTGC+TGG 0.360405 2:-46795639 MsG0280009168.01.T01:CDS
CAGAGTTAGAAGTATGATTT+CGG 0.366584 2:-46795756 MsG0280009168.01.T01:CDS
GAGGGTGTTGTTTGATCAAA+TGG 0.390513 2:-46796671 MsG0280009168.01.T01:CDS
TTTATAAGAATATTAATGTT+GGG 0.418912 2:-46795883 MsG0280009168.01.T01:CDS
CTGCACATTTCCTGTGCTTG+TGG 0.425694 2:+46795647 None:intergenic
ATTTATAAGAATATTAATGT+TGG 0.426369 2:-46795884 MsG0280009168.01.T01:CDS
TTTCCTCGCATCACCGTTCA+AGG 0.426905 2:+46796204 None:intergenic
AGAAGTATGATTTCGGAAGC+TGG 0.437486 2:-46795749 MsG0280009168.01.T01:CDS
ACTAAAGCTGTGGCTAAGAT+AGG 0.439503 2:+46796331 None:intergenic
AGAAGGTATAAGTGCAGTGC+AGG 0.442178 2:+46796831 None:intergenic
GAAGTTGAAGAGTTTCTTGC+TGG 0.452457 2:-46795683 MsG0280009168.01.T01:CDS
GTGCGCTCACGCAGGGAATG+TGG 0.454495 2:-46796396 MsG0280009168.01.T01:CDS
TGGGAATGTATAGTTATTAA+CGG 0.455731 2:+46796867 None:intergenic
GCCTAATGAGACTACCTTTG+TGG 0.459480 2:-46796140 MsG0280009168.01.T01:CDS
TTGTGGACGGCGATGATTGA+TGG 0.468382 2:-46796631 MsG0280009168.01.T01:CDS
TAGTGAGTTTAGAGAAGTGT+TGG 0.473531 2:-46796503 MsG0280009168.01.T01:CDS
CACGCGTAATGCTCCGTACA+TGG 0.474130 2:+46796031 None:intergenic
CTGATAAGGATGTTGGAGCT+TGG 0.478842 2:-46796249 MsG0280009168.01.T01:CDS
TATAACATATATAGAGAAGC+TGG 0.482328 2:-46795797 MsG0280009168.01.T01:CDS
GGCTTTGGGTGAGTTACAAA+AGG 0.486172 2:-46796695 MsG0280009168.01.T01:CDS
TTGCTGGATTCAATATTCTC+AGG 0.490838 2:-46795623 MsG0280009168.01.T01:CDS
GCCACAAAGGTAGTCTCATT+AGG 0.495199 2:+46796139 None:intergenic
TTCAACAAATGATTGTTTGT+GGG 0.496733 2:-46796168 MsG0280009168.01.T01:CDS
TTTGTCTAGGTCTGGAATGG+TGG 0.497129 2:-46795996 MsG0280009168.01.T01:CDS
GGTATTTCTGATAAGGATGT+TGG 0.497613 2:-46796256 MsG0280009168.01.T01:CDS
GAAGTATGATTTCGGAAGCT+GGG 0.498893 2:-46795748 MsG0280009168.01.T01:CDS
TTTCAACAAATGATTGTTTG+TGG 0.505371 2:-46796169 MsG0280009168.01.T01:CDS
AGGGTGTTGTTTGATCAAAT+GGG 0.505854 2:-46796670 MsG0280009168.01.T01:CDS
TGCGCTCACGCAGGGAATGT+GGG 0.508743 2:-46796395 MsG0280009168.01.T01:CDS
GGAGCATTACGCGTGTGTTG+TGG 0.515268 2:-46796023 MsG0280009168.01.T01:CDS
GTCTAGGTCTGGAATGGTGG+AGG 0.521693 2:-46795993 MsG0280009168.01.T01:CDS
CTTATGCTAGGAGATTTGAC+CGG 0.522231 2:-46796366 MsG0280009168.01.T01:CDS
CATATATAGAGAAGCTGGGT+GGG 0.523154 2:-46795792 MsG0280009168.01.T01:CDS
AGGTTTATCGAGGAGAAAAT+GGG 0.529645 2:-46795962 MsG0280009168.01.T01:CDS
CACGACACAACATTTCTCTC+AGG 0.530210 2:+46796556 None:intergenic
CACCTGGGTGCGCTCACGCA+GGG 0.530358 2:-46796403 MsG0280009168.01.T01:CDS
ACGGCGATGATTGATGGTTA+TGG 0.530694 2:-46796625 MsG0280009168.01.T01:CDS
TGCGCTTCGAGTGTTATGAT+TGG 0.531478 2:-46796799 MsG0280009168.01.T01:CDS
TTTCTCCTCGATAAACCTCT+CGG 0.534801 2:+46795967 None:intergenic
GAATGCTATGATTTCTGGTG+TGG 0.535399 2:-46796227 MsG0280009168.01.T01:CDS
TCACCTGGGTGCGCTCACGC+AGG 0.540417 2:-46796404 MsG0280009168.01.T01:CDS
GAAGAGATGAGTGGTACTTA+CGG 0.542530 2:-46796061 MsG0280009168.01.T01:CDS
TACACGACAATGTTGCAAAA+CGG 0.547969 2:-46796895 None:intergenic
CACAAGCACAGGAAATGTGC+AGG 0.552494 2:-46795646 MsG0280009168.01.T01:CDS
TGTGTCGTGGAGTGCTATGA+TGG 0.553978 2:-46796542 MsG0280009168.01.T01:CDS
TGCTTGTACACACGCGAGGA+TGG 0.556243 2:-46796107 MsG0280009168.01.T01:CDS
TCGCGTGTGTACAAGCAGTA+AGG 0.557317 2:+46796113 None:intergenic
GTAACAAGTACAGAATCATT+CGG 0.558270 2:+46796445 None:intergenic
TGTGGCTAAGATAGGATTCG+AGG 0.567017 2:+46796339 None:intergenic
GTGCAGGATTTGATCAAAGG+TGG 0.568127 2:+46796847 None:intergenic
TCAATCTCATCCACAAGCAC+AGG 0.569633 2:-46795657 MsG0280009168.01.T01:CDS
AGATAGGATTCGAGGTTACC+CGG 0.570882 2:+46796347 None:intergenic
AGAAGCTGGGTGGGATGCAG+AGG 0.572547 2:-46795783 MsG0280009168.01.T01:CDS
GAAGCGCACTTCGAAGAAGA+AGG 0.576248 2:+46796814 None:intergenic
TGTGGGTGCATTCTTATGCT+AGG 0.576689 2:-46796378 MsG0280009168.01.T01:CDS
ATTTCTGGTGTGGCCTTGAA+CGG 0.577635 2:-46796217 MsG0280009168.01.T01:CDS
TTATGCTAGGAGATTTGACC+GGG 0.578429 2:-46796365 MsG0280009168.01.T01:CDS
GCAGTGCAGGATTTGATCAA+AGG 0.578907 2:+46796844 None:intergenic
ATAAACGCACTCACAACGTA+AGG 0.580912 2:+46796730 None:intergenic
TTTATCGAGGAGAAAATGGG+TGG 0.586896 2:-46795959 MsG0280009168.01.T01:CDS
GCTGGGATGAAGAAGAAACC+TGG 0.588856 2:-46795731 MsG0280009168.01.T01:CDS
TTAATGTTGGGAATAGAGTG+TGG 0.596474 2:-46795871 MsG0280009168.01.T01:CDS
CGGTGATGCGAGGAAATCGT+TGG 0.596667 2:-46796197 MsG0280009168.01.T01:CDS
TTCCCTGCGTGAGCGCACCC+AGG 0.599009 2:+46796401 None:intergenic
GGGTGAGTTACAAAAGGCGA+GGG 0.599526 2:-46796689 MsG0280009168.01.T01:CDS
TGGATTCAATATTCTCAGGA+TGG 0.599714 2:-46795619 MsG0280009168.01.T01:CDS
GTGGACATGTATTCGAAATG+TGG 0.600232 2:-46796310 MsG0280009168.01.T01:CDS
TGCAGGATTTGATCAAAGGT+GGG 0.606940 2:+46796848 None:intergenic
TTACGGAGTTGAGCCATGTA+CGG 0.609870 2:-46796044 MsG0280009168.01.T01:CDS
AGCAGTAAGGACAGCCACAA+AGG 0.611075 2:+46796126 None:intergenic
ACCTCGATTATACTGCATCC+AGG 0.612701 2:+46795713 None:intergenic
CTAACTGCATGTGCTCACCT+GGG 0.615654 2:-46796418 MsG0280009168.01.T01:CDS
GATATGGGCGTAGCTGATTG+TGG 0.616311 2:-46795836 MsG0280009168.01.T01:CDS
TGGTTATTTGAAGAGATGAG+TGG 0.619688 2:-46796070 MsG0280009168.01.T01:CDS
GGGTGTTGTTTGATCAAATG+GGG 0.623023 2:-46796669 MsG0280009168.01.T01:CDS
ATAACATATATAGAGAAGCT+GGG 0.623189 2:-46795796 MsG0280009168.01.T01:CDS
GGATGCAGTATAATCGAGGT+AGG 0.626649 2:-46795710 MsG0280009168.01.T01:CDS
ATTGTCATGTCGTTCTATTG+GGG 0.627723 2:-46796765 MsG0280009168.01.T01:CDS
TGGGTGAGTTACAAAAGGCG+AGG 0.631314 2:-46796690 MsG0280009168.01.T01:CDS
TGGACATGTATTCGAAATGT+GGG 0.631785 2:-46796309 MsG0280009168.01.T01:CDS
GGAAGCCGAGAGGTTTATCG+AGG 0.636017 2:-46795972 MsG0280009168.01.T01:CDS
GCTAGCGATGCTAATGTTTG+GGG 0.642143 2:-46795929 MsG0280009168.01.T01:CDS
ATACATGTCCACTAAAGCTG+TGG 0.642787 2:+46796321 None:intergenic
GTATTCGAAATGTGGGTGTG+TGG 0.645638 2:-46796302 MsG0280009168.01.T01:CDS
TGTTGTTTGATCAAATGGGG+AGG 0.648799 2:-46796666 MsG0280009168.01.T01:CDS
ACCTGGATGCAGTATAATCG+AGG 0.656446 2:-46795714 MsG0280009168.01.T01:CDS
ACATATATAGAGAAGCTGGG+TGG 0.667110 2:-46795793 MsG0280009168.01.T01:CDS
TGATGGTTATGGTAAAATAG+GGG 0.667623 2:-46796614 MsG0280009168.01.T01:CDS
CACGCGAGGATGGTTCGCGA+AGG 0.675305 2:-46796097 MsG0280009168.01.T01:CDS
TTACTGCTTGTACACACGCG+AGG 0.681317 2:-46796111 MsG0280009168.01.T01:CDS
TGGCCTTGAACGGTGATGCG+AGG 0.692001 2:-46796207 MsG0280009168.01.T01:CDS
CTGAGAGAAATGTTGTGTCG+TGG 0.693930 2:-46796555 MsG0280009168.01.T01:CDS
GAATGGTGGAGGAAGCCGAG+AGG 0.732280 2:-46795982 MsG0280009168.01.T01:CDS
GTCGTGGAGTGCTATGATGG+CGG 0.736349 2:-46796539 MsG0280009168.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! ATTTATAAGAATATTAATGT+TGG - Chr2:46796618-46796637 MsG0280009168.01.T01:CDS 10.0%
!! TTTATAAGAATATTAATGTT+GGG - Chr2:46796619-46796638 MsG0280009168.01.T01:CDS 10.0%
! ATAACATATATAGAGAAGCT+GGG - Chr2:46796706-46796725 MsG0280009168.01.T01:CDS 25.0%
! TATAACATATATAGAGAAGC+TGG - Chr2:46796705-46796724 MsG0280009168.01.T01:CDS 25.0%
! TGGGAATGTATAGTTATTAA+CGG + Chr2:46795638-46795657 None:intergenic 25.0%
! TTCAACAAATGATTGTTTGT+GGG - Chr2:46796334-46796353 MsG0280009168.01.T01:CDS 25.0%
! TTTCAACAAATGATTGTTTG+TGG - Chr2:46796333-46796352 MsG0280009168.01.T01:CDS 25.0%
!! ATTGATGGTTATGGTAAAAT+AGG - Chr2:46795886-46795905 MsG0280009168.01.T01:CDS 25.0%
!! TTGATGGTTATGGTAAAATA+GGG - Chr2:46795887-46795906 MsG0280009168.01.T01:CDS 25.0%
!!! TTTTGATGGTATTTCTGATA+AGG - Chr2:46796239-46796258 MsG0280009168.01.T01:CDS 25.0%
GTAACAAGTACAGAATCATT+CGG + Chr2:46796060-46796079 None:intergenic 30.0%
TGATGGTTATGGTAAAATAG+GGG - Chr2:46795888-46795907 MsG0280009168.01.T01:CDS 30.0%
TGGAAAAAGCTGATAGATAT+GGG - Chr2:46796651-46796670 MsG0280009168.01.T01:CDS 30.0%
! CAGAGTTAGAAGTATGATTT+CGG - Chr2:46796746-46796765 MsG0280009168.01.T01:CDS 30.0%
!!! TCTGCTTTATCTGTTTTTGA+TGG - Chr2:46796225-46796244 MsG0280009168.01.T01:CDS 30.0%
AGGTTTATCGAGGAGAAAAT+GGG - Chr2:46796540-46796559 MsG0280009168.01.T01:CDS 35.0%
ATTGTCATGTCGTTCTATTG+GGG - Chr2:46795737-46795756 MsG0280009168.01.T01:CDS 35.0%
CATTGTCATGTCGTTCTATT+GGG - Chr2:46795736-46795755 MsG0280009168.01.T01:CDS 35.0%
GTGGAAAAAGCTGATAGATA+TGG - Chr2:46796650-46796669 MsG0280009168.01.T01:CDS 35.0%
TGGACATGTATTCGAAATGT+GGG - Chr2:46796193-46796212 MsG0280009168.01.T01:CDS 35.0%
TGGATTCAATATTCTCAGGA+TGG - Chr2:46796883-46796902 MsG0280009168.01.T01:CDS 35.0%
TGGTTATTTGAAGAGATGAG+TGG - Chr2:46796432-46796451 MsG0280009168.01.T01:CDS 35.0%
TTAATGTTGGGAATAGAGTG+TGG - Chr2:46796631-46796650 MsG0280009168.01.T01:CDS 35.0%
TTGCTGGATTCAATATTCTC+AGG - Chr2:46796879-46796898 MsG0280009168.01.T01:CDS 35.0%
! GGTATTTCTGATAAGGATGT+TGG - Chr2:46796246-46796265 MsG0280009168.01.T01:CDS 35.0%
! TAGTGAGTTTAGAGAAGTGT+TGG - Chr2:46795999-46796018 MsG0280009168.01.T01:CDS 35.0%
! TGCGTTTATCGAGTTTTACT+CGG - Chr2:46795786-46795805 MsG0280009168.01.T01:CDS 35.0%
!! AGGGTGTTGTTTGATCAAAT+GGG - Chr2:46795832-46795851 MsG0280009168.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTTTAGAGATGCAGAGTGA+AGG - Chr2:46796027-46796046 MsG0280009168.01.T01:CDS 35.0%
!!! GAAAGATGTTGTTTTGTGGA+CGG - Chr2:46795858-46795877 MsG0280009168.01.T01:CDS 35.0%
ACATATATAGAGAAGCTGGG+TGG - Chr2:46796709-46796728 MsG0280009168.01.T01:CDS 40.0%
ACTAAAGCTGTGGCTAAGAT+AGG + Chr2:46796174-46796193 None:intergenic 40.0%
AGCTAGCGATGCTAATGTTT+GGG - Chr2:46796572-46796591 MsG0280009168.01.T01:CDS 40.0%
ATAAACGCACTCACAACGTA+AGG + Chr2:46795775-46795794 None:intergenic 40.0%
ATACATGTCCACTAAAGCTG+TGG + Chr2:46796184-46796203 None:intergenic 40.0%
CATATATAGAGAAGCTGGGT+GGG - Chr2:46796710-46796729 MsG0280009168.01.T01:CDS 40.0%
CTTATGCTAGGAGATTTGAC+CGG - Chr2:46796136-46796155 MsG0280009168.01.T01:CDS 40.0%
GAAGAGATGAGTGGTACTTA+CGG - Chr2:46796441-46796460 MsG0280009168.01.T01:CDS 40.0%
GAAGTATGATTTCGGAAGCT+GGG - Chr2:46796754-46796773 MsG0280009168.01.T01:CDS 40.0%
GAAGTTGAAGAGTTTCTTGC+TGG - Chr2:46796819-46796838 MsG0280009168.01.T01:CDS 40.0%
GAGGTTTATCGAGGAGAAAA+TGG - Chr2:46796539-46796558 MsG0280009168.01.T01:CDS 40.0%
GCATTGTCATGTCGTTCTAT+TGG - Chr2:46795735-46795754 MsG0280009168.01.T01:CDS 40.0%
GCTTGGAATGCTATGATTTC+TGG - Chr2:46796270-46796289 MsG0280009168.01.T01:CDS 40.0%
GTGGACATGTATTCGAAATG+TGG - Chr2:46796192-46796211 MsG0280009168.01.T01:CDS 40.0%
TGCAGGATTTGATCAAAGGT+GGG + Chr2:46795657-46795676 None:intergenic 40.0%
TTATGCTAGGAGATTTGACC+GGG - Chr2:46796137-46796156 MsG0280009168.01.T01:CDS 40.0%
TTTATCGAGGAGAAAATGGG+TGG - Chr2:46796543-46796562 MsG0280009168.01.T01:CDS 40.0%
TTTCTCCTCGATAAACCTCT+CGG + Chr2:46796538-46796557 None:intergenic 40.0%
! AGAAGTATGATTTCGGAAGC+TGG - Chr2:46796753-46796772 MsG0280009168.01.T01:CDS 40.0%
! ATCGAGTTTTACTCGGCTTT+GGG - Chr2:46795793-46795812 MsG0280009168.01.T01:CDS 40.0%
! GTGTTGTGGATCTTTTGTCT+AGG - Chr2:46796493-46796512 MsG0280009168.01.T01:CDS 40.0%
! TATCGAGTTTTACTCGGCTT+TGG - Chr2:46795792-46795811 MsG0280009168.01.T01:CDS 40.0%
! TATCTTAGCCACAGCTTTAG+TGG - Chr2:46796173-46796192 MsG0280009168.01.T01:CDS 40.0%
! TCTTTTGTCTAGGTCTGGAA+TGG - Chr2:46796503-46796522 MsG0280009168.01.T01:CDS 40.0%
! TGTTGTTTGATCAAATGGGG+AGG - Chr2:46795836-46795855 MsG0280009168.01.T01:CDS 40.0%
!! GAATGCTATGATTTCTGGTG+TGG - Chr2:46796275-46796294 MsG0280009168.01.T01:CDS 40.0%
!! GAGGGTGTTGTTTGATCAAA+TGG - Chr2:46795831-46795850 MsG0280009168.01.T01:CDS 40.0%
!! GGGTGTTGTTTGATCAAATG+GGG - Chr2:46795833-46795852 MsG0280009168.01.T01:CDS 40.0%
!!! GGAGGAAAGATGTTGTTTTG+TGG - Chr2:46795854-46795873 MsG0280009168.01.T01:CDS 40.0%
ACCTCGATTATACTGCATCC+AGG + Chr2:46796792-46796811 None:intergenic 45.0%
ACCTGGATGCAGTATAATCG+AGG - Chr2:46796788-46796807 MsG0280009168.01.T01:CDS 45.0%
AGATAGGATTCGAGGTTACC+CGG + Chr2:46796158-46796177 None:intergenic 45.0%
CACGACACAACATTTCTCTC+AGG + Chr2:46795949-46795968 None:intergenic 45.0%
CAGCTAGCGATGCTAATGTT+TGG - Chr2:46796571-46796590 MsG0280009168.01.T01:CDS 45.0%
CTGAGAGAAATGTTGTGTCG+TGG - Chr2:46795947-46795966 MsG0280009168.01.T01:CDS 45.0%
CTGATAAGGATGTTGGAGCT+TGG - Chr2:46796253-46796272 MsG0280009168.01.T01:CDS 45.0%
GCAGTGCAGGATTTGATCAA+AGG + Chr2:46795661-46795680 None:intergenic 45.0%
GCCACAAAGGTAGTCTCATT+AGG + Chr2:46796366-46796385 None:intergenic 45.0%
GCCTAATGAGACTACCTTTG+TGG - Chr2:46796362-46796381 MsG0280009168.01.T01:CDS 45.0%
GCTAGCGATGCTAATGTTTG+GGG - Chr2:46796573-46796592 MsG0280009168.01.T01:CDS 45.0%
GGATGCAGTATAATCGAGGT+AGG - Chr2:46796792-46796811 MsG0280009168.01.T01:CDS 45.0%
GTATTCGAAATGTGGGTGTG+TGG - Chr2:46796200-46796219 MsG0280009168.01.T01:CDS 45.0%
GTGCAGGATTTGATCAAAGG+TGG + Chr2:46795658-46795677 None:intergenic 45.0%
TCAATCTCATCCACAAGCAC+AGG - Chr2:46796845-46796864 MsG0280009168.01.T01:CDS 45.0%
TGCGCTTCGAGTGTTATGAT+TGG - Chr2:46795703-46795722 MsG0280009168.01.T01:CDS 45.0%
TGTGGCTAAGATAGGATTCG+AGG + Chr2:46796166-46796185 None:intergenic 45.0%
TGTGGGTGCATTCTTATGCT+AGG - Chr2:46796124-46796143 MsG0280009168.01.T01:CDS 45.0%
TTACGGAGTTGAGCCATGTA+CGG - Chr2:46796458-46796477 MsG0280009168.01.T01:CDS 45.0%
! ACGGCGATGATTGATGGTTA+TGG - Chr2:46795877-46795896 MsG0280009168.01.T01:CDS 45.0%
! AGAAGGTATAAGTGCAGTGC+AGG + Chr2:46795674-46795693 None:intergenic 45.0%
! GTGGATCTTTTGTCTAGGTC+TGG - Chr2:46796498-46796517 MsG0280009168.01.T01:CDS 45.0%
! TTTGTCTAGGTCTGGAATGG+TGG - Chr2:46796506-46796525 MsG0280009168.01.T01:CDS 45.0%
!! ATTTCTGGTGTGGCCTTGAA+CGG - Chr2:46796285-46796304 MsG0280009168.01.T01:CDS 45.0%
!! GGCTTTGGGTGAGTTACAAA+AGG - Chr2:46795807-46795826 MsG0280009168.01.T01:CDS 45.0%
ACAGGAAATGTGCAGGTTGC+TGG - Chr2:46796863-46796882 MsG0280009168.01.T01:CDS 50.0%
AGCAGTAAGGACAGCCACAA+AGG + Chr2:46796379-46796398 None:intergenic 50.0%
CACAAGCACAGGAAATGTGC+AGG - Chr2:46796856-46796875 MsG0280009168.01.T01:CDS 50.0%
CTAACTGCATGTGCTCACCT+GGG - Chr2:46796084-46796103 MsG0280009168.01.T01:CDS 50.0%
CTGCACATTTCCTGTGCTTG+TGG + Chr2:46796858-46796877 None:intergenic 50.0%
GAAGCGCACTTCGAAGAAGA+AGG + Chr2:46795691-46795710 None:intergenic 50.0%
GATATGGGCGTAGCTGATTG+TGG - Chr2:46796666-46796685 MsG0280009168.01.T01:CDS 50.0%
GCTGGGATGAAGAAGAAACC+TGG - Chr2:46796771-46796790 MsG0280009168.01.T01:CDS 50.0%
GGGTGAGTTACAAAAGGCGA+GGG - Chr2:46795813-46795832 MsG0280009168.01.T01:CDS 50.0%
TCGCGTGTGTACAAGCAGTA+AGG + Chr2:46796392-46796411 None:intergenic 50.0%
TGGGTGAGTTACAAAAGGCG+AGG - Chr2:46795812-46795831 MsG0280009168.01.T01:CDS 50.0%
TTACTGCTTGTACACACGCG+AGG - Chr2:46796391-46796410 MsG0280009168.01.T01:CDS 50.0%
TTGTGGACGGCGATGATTGA+TGG - Chr2:46795871-46795890 MsG0280009168.01.T01:CDS 50.0%
TTTCCTCGCATCACCGTTCA+AGG + Chr2:46796301-46796320 None:intergenic 50.0%
! TGTGTCGTGGAGTGCTATGA+TGG - Chr2:46795960-46795979 MsG0280009168.01.T01:CDS 50.0%
CACGCGTAATGCTCCGTACA+TGG + Chr2:46796474-46796493 None:intergenic 55.0%
CGGTGATGCGAGGAAATCGT+TGG - Chr2:46796305-46796324 MsG0280009168.01.T01:CDS 55.0%
GCTAACTGCATGTGCTCACC+TGG - Chr2:46796083-46796102 MsG0280009168.01.T01:CDS 55.0%
GGAAGCCGAGAGGTTTATCG+AGG - Chr2:46796530-46796549 MsG0280009168.01.T01:CDS 55.0%
GGATGGTTCGCGAAGGTCTT+TGG - Chr2:46796412-46796431 MsG0280009168.01.T01:CDS 55.0%
TGCTTGTACACACGCGAGGA+TGG - Chr2:46796395-46796414 MsG0280009168.01.T01:CDS 55.0%
! GGAGCATTACGCGTGTGTTG+TGG - Chr2:46796479-46796498 MsG0280009168.01.T01:CDS 55.0%
! GTCGTGGAGTGCTATGATGG+CGG - Chr2:46795963-46795982 MsG0280009168.01.T01:CDS 55.0%
! GTCTAGGTCTGGAATGGTGG+AGG - Chr2:46796509-46796528 MsG0280009168.01.T01:CDS 55.0%
AGAAGCTGGGTGGGATGCAG+AGG - Chr2:46796719-46796738 MsG0280009168.01.T01:CDS 60.0%
TGCGCTCACGCAGGGAATGT+GGG - Chr2:46796107-46796126 MsG0280009168.01.T01:CDS 60.0%
! GAATGGTGGAGGAAGCCGAG+AGG - Chr2:46796520-46796539 MsG0280009168.01.T01:CDS 60.0%
! TGGCCTTGAACGGTGATGCG+AGG - Chr2:46796295-46796314 MsG0280009168.01.T01:CDS 60.0%
CACGCGAGGATGGTTCGCGA+AGG - Chr2:46796405-46796424 MsG0280009168.01.T01:CDS 65.0%
GTGCGCTCACGCAGGGAATG+TGG - Chr2:46796106-46796125 MsG0280009168.01.T01:CDS 65.0%
CACCTGGGTGCGCTCACGCA+GGG - Chr2:46796099-46796118 MsG0280009168.01.T01:CDS 70.0%
TCACCTGGGTGCGCTCACGC+AGG - Chr2:46796098-46796117 MsG0280009168.01.T01:CDS 70.0%
TTCCCTGCGTGAGCGCACCC+AGG + Chr2:46796104-46796123 None:intergenic 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr2 gene 46795616 46796908 46795616 ID=MsG0280009168.01;Name=MsG0280009168.01
Chr2 mRNA 46795616 46796908 46795616 ID=MsG0280009168.01.T01;Parent=MsG0280009168.01;Name=MsG0280009168.01.T01;_AED=0.35;_eAED=0.35;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|430
Chr2 exon 46795616 46796908 46795616 ID=MsG0280009168.01.T01:exon:36801;Parent=MsG0280009168.01.T01
Chr2 CDS 46795616 46796908 46795616 ID=MsG0280009168.01.T01:cds;Parent=MsG0280009168.01.T01
Gene Sequence

>MsG0280009168.01.T01

ATGTTGCAAAACGGCATTGCCGTTAATAACTATACATTCCCACCTTTGATCAAATCCTGCACTGCACTTATACCTTCTTCTTCGAAGTGCGCTTCGAGTGTTATGATTGGTCGTTTAGTGCATTGTCATGTCGTTCTATTGGGGCTAACGAATGATCCTTACGTTGTGAGTGCGTTTATCGAGTTTTACTCGGCTTTGGGTGAGTTACAAAAGGCGAGGGTGTTGTTTGATCAAATGGGGAGGAAAGATGTTGTTTTGTGGACGGCGATGATTGATGGTTATGGTAAAATAGGGGATGTTGAAAGTGCGAGAGAGATGTTTGATGAAATGCCTGAGAGAAATGTTGTGTCGTGGAGTGCTATGATGGCGGCGTATTCTCGTGTTAGTGAGTTTAGAGAAGTGTTGGATTTGTTTTTAGAGATGCAGAGTGAAGGCGTGATGCCGAATGATTCTGTACTTGTTACTGTGCTAACTGCATGTGCTCACCTGGGTGCGCTCACGCAGGGAATGTGGGTGCATTCTTATGCTAGGAGATTTGACCGGGTAACCTCGAATCCTATCTTAGCCACAGCTTTAGTGGACATGTATTCGAAATGTGGGTGTGTGGAATCTGCTTTATCTGTTTTTGATGGTATTTCTGATAAGGATGTTGGAGCTTGGAATGCTATGATTTCTGGTGTGGCCTTGAACGGTGATGCGAGGAAATCGTTGGAGTTGTTTCAACAAATGATTGTTTGTGGGAATAAGCCTAATGAGACTACCTTTGTGGCTGTCCTTACTGCTTGTACACACGCGAGGATGGTTCGCGAAGGTCTTTGGTTATTTGAAGAGATGAGTGGTACTTACGGAGTTGAGCCATGTACGGAGCATTACGCGTGTGTTGTGGATCTTTTGTCTAGGTCTGGAATGGTGGAGGAAGCCGAGAGGTTTATCGAGGAGAAAATGGGTGGATTTGCAGCTAGCGATGCTAATGTTTGGGGTGCGATACTCAATGCGTGTAGAATTTATAAGAATATTAATGTTGGGAATAGAGTGTGGAAAAAGCTGATAGATATGGGCGTAGCTGATTGTGGTACTCATGTTCTTACATATAACATATATAGAGAAGCTGGGTGGGATGCAGAGGCAAACAGAGTTAGAAGTATGATTTCGGAAGCTGGGATGAAGAAGAAACCTGGATGCAGTATAATCGAGGTAGGTAATGAAGTTGAAGAGTTTCTTGCTGGTGATCAATCTCATCCACAAGCACAGGAAATGTGCAGGTTGCTGGATTCAATATTCTCAGGATGGTGA
Protein sequence

>MsG0280009168.01.T01

MLQNGIAVNNYTFPPLIKSCTALIPSSSKCASSVMIGRLVHCHVVLLGLTNDPYVVSAFIEFYSALGELQKARVLFDQMGRKDVVLWTAMIDGYGKIGDVESAREMFDEMPERNVVSWSAMMAAYSRVSEFREVLDLFLEMQSEGVMPNDSVLVTVLTACAHLGALTQGMWVHSYARRFDRVTSNPILATALVDMYSKCGCVESALSVFDGISDKDVGAWNAMISGVALNGDARKSLELFQQMIVCGNKPNETTFVAVLTACTHARMVREGLWLFEEMSGTYGVEPCTEHYACVVDLLSRSGMVEEAERFIEEKMGGFAASDANVWGAILNACRIYKNINVGNRVWKKLIDMGVADCGTHVLTYNIYREAGWDAEANRVRSMISEAGMKKKPGCSIIEVGNEVEEFLAGDQSHPQAQEMCRLLDSIFSGW*