AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0480021448.01


Query id Subject id identity % alignment length mismatches gap openings q. start q. end s. start s. end e-value bit score
Query id Subject id identity % alignment length mismatches gap openings q. start q. end s. start s. end e-value bit score
MsG0480021448.01.T01 AT2G21060 56.796 206 66 2 3 201 12 201 1.35e-42 142
MsG0480021448.01.T01 AT4G36020 44.601 213 97 3 1 197 6 213 4.27e-40 137
MsG0480021448.01.T01 AT4G36020 43.519 216 103 3 1 200 6 218 8.56e-40 138
MsG0480021448.01.T01 AT4G36020 43.519 216 103 3 1 200 6 218 8.56e-40 138
MsG0480021448.01.T01 AT2G17870 50.000 194 73 3 2 195 7 176 2.96e-35 126
MsG0480021448.01.T01 AT4G38680 53.991 213 62 2 3 198 8 201 5.19e-33 117

Find 105 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 107 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GGCTATGGTGGAGGTGGTTA+TGG 0.209520 4:+57963626 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGTGGTGGAGGTGGTGGTTA+TGG 0.245413 4:+57963587 MsG0480021448.01.T01:CDS
TATGGAGGAGGTGGTGGTTA+TGG 0.270427 4:+57963644 MsG0480021448.01.T01:CDS
AGGTATGGAGGTGGTGGTGG+TGG 0.283884 4:+57963779 MsG0480021448.01.T01:CDS
TATGGTGGTGGTGGAAGAGG+TGG 0.295052 4:+57963662 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGCCGTGGAGGAGGCGGTGG+TGG 0.304119 4:+57963686 MsG0480021448.01.T01:CDS
ATGAGTGGGTCAAAATTAAC+TGG 0.306323 4:+57963278 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGTGGTGGAGGCGGTGGCGG+TGG 0.308457 4:+57963794 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGAGGTGGTGGTGGTGGAGG+CGG 0.310865 4:+57963785 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGTTACGGTGGTGGCGGTTA+TGG 0.316775 4:+57963566 MsG0480021448.01.T01:CDS
TATGGAGGTGGTGGTGGTGG+AGG 0.332904 4:+57963782 MsG0480021448.01.T01:CDS
CCTGATGGTGCTTCTGTTCA+AGG 0.337236 4:+57963491 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGCGGTTATGGTGGTGGAGG+TGG 0.338413 4:+57963578 MsG0480021448.01.T01:CDS
TTCAATGATCAGAAGGGGTT+TGG 0.339445 4:+57963314 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGTGGTGGTGGAGGCGGTGG+CGG 0.349687 4:+57963791 MsG0480021448.01.T01:CDS
CGCGGAGGCGGTGGCGGTGG+AGG 0.352586 4:+57963521 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGAAGAGGAGGTGGTGGCTA+TGG 0.357145 4:+57963611 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGTGGTGGTGGTGGAGGCGG+TGG 0.359516 4:+57963788 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGAAGGTATGGAGGTGGTGG+TGG 0.365647 4:+57963776 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGTGGCGGTGGAAGGTATGG+AGG 0.384868 4:+57963767 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGTGGTGGCGGTGGAAGGTA+TGG 0.387598 4:+57963764 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGTTATGGTGGTGGTGGAAG+AGG 0.389445 4:+57963659 MsG0480021448.01.T01:CDS
AACTCCTCACTTCCATCATC+AGG 0.391515 4:-57963347 None:intergenic
GGTGGTTATGGAGGAGGTGG+TGG 0.392511 4:+57963638 MsG0480021448.01.T01:CDS
TGTACCAGCGGTGGAGGTGG+TGG 0.393098 4:+57963749 MsG0480021448.01.T01:CDS
TGCTACAGCTGTGGTGAATC+TGG 0.396062 4:+57963821 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGAGGTGGTGGTTATGGTGG+TGG 0.397534 4:+57963650 MsG0480021448.01.T01:CDS
TGGTGGTGGTGGAAGAGGTG+GGG 0.399416 4:+57963664 MsG0480021448.01.T01:CDS
AGACGCGGAGGCGGTGGCGG+TGG 0.401671 4:+57963518 MsG0480021448.01.T01:CDS
ATGGTGGTGGTGGAAGAGGT+GGG 0.402824 4:+57963663 MsG0480021448.01.T01:CDS
AGCGGTGGAGGTGGTGGCGG+TGG 0.408716 4:+57963755 MsG0480021448.01.T01:CDS
TCGAGACGCGGAGGCGGTGG+CGG 0.417231 4:+57963515 MsG0480021448.01.T01:CDS
GAACGTGGTGGTGGTGGTTA+CGG 0.418432 4:+57963551 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGTGGTGGTGGAAGAGGTGG+GGG 0.422868 4:+57963665 MsG0480021448.01.T01:CDS
AGAGGAGGTGGTGGCTATGG+TGG 0.424510 4:+57963614 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGAGGTGGTTATGGAGGAGG+TGG 0.426099 4:+57963635 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGTTATGGTGGAAGAGGAGG+TGG 0.427128 4:+57963602 MsG0480021448.01.T01:CDS
TGTTACAACTGTGGTGAATC+TGG 0.428449 4:+57963710 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGTGGAGGTGGTGGTTATGG+TGG 0.432658 4:+57963590 MsG0480021448.01.T01:CDS
TTTGCAAGAGATTGTCCAAC+AGG 0.433866 4:+57963848 MsG0480021448.01.T01:CDS
AATTAACTGGGAAGGTGAAA+TGG 0.440654 4:+57963291 MsG0480021448.01.T01:CDS
TCCAAGGCTGTTAGTGTGAC+TGG 0.440806 4:+57963467 MsG0480021448.01.T01:CDS
GTGGAGGTGGTGGCGGTGGA+AGG 0.441131 4:+57963759 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGTTATGGTGGTGGAGGTGG+TGG 0.444295 4:+57963581 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGAGGCGGTGGCGGTGGAGG+TGG 0.446329 4:+57963524 MsG0480021448.01.T01:CDS
AGGGAGTGTACCAGCGGTGG+AGG 0.448006 4:+57963743 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGTGGTGGCTATGGTGGAGG+TGG 0.448867 4:+57963620 MsG0480021448.01.T01:CDS
ACCAGCGGTGGAGGTGGTGG+CGG 0.451970 4:+57963752 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGAGGAGGTGGTGGTTATGG+TGG 0.453646 4:+57963647 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGTGGTGGCGGTTATGGTGG+TGG 0.454112 4:+57963572 MsG0480021448.01.T01:CDS
TATGGTGGAGGTGGTTATGG+AGG 0.464167 4:+57963629 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGATCGAGACGCGGAGGCGG+TGG 0.464328 4:+57963512 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGTGGAAGGTATGGAGGTGG+TGG 0.464973 4:+57963773 MsG0480021448.01.T01:CDS
GAGTGTACCAGCGGTGGAGG+TGG 0.465774 4:+57963746 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGTGGTGGTGGTTACGGTGG+TGG 0.466074 4:+57963557 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGTGGTGGTTATGGTGGTGG+TGG 0.466088 4:+57963653 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGCGGTGGAAGGTATGGAGG+TGG 0.466630 4:+57963770 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGTGGTTATGAACGTGGTGG+TGG 0.470130 4:+57963542 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGTTATGAACGTGGTGGTGG+TGG 0.471310 4:+57963545 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGATTCATCACCCCTGATGA+TGG 0.483119 4:+57963335 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGTGGAGGTGGTTATGGAGG+AGG 0.484229 4:+57963632 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGAGGTGGTGGCTATGGTGG+AGG 0.490451 4:+57963617 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGTGGTGGTTACGGTGGTGG+CGG 0.491692 4:+57963560 MsG0480021448.01.T01:CDS
ACCGCCACCACCTCCACCGC+TGG 0.498982 4:-57963753 None:intergenic
CTTCAACGAGCGCTGCCTGT+TGG 0.500201 4:-57963863 None:intergenic
CATCAGTCTGGATCTGAGAT+TGG 0.500424 4:-57963379 None:intergenic
TATGGTGGAAGAGGAGGTGG+TGG 0.507234 4:+57963605 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGTGGCGGTTATGGTGGTGG+AGG 0.507909 4:+57963575 MsG0480021448.01.T01:CDS
TCCAGTCACACTAACAGCCT+TGG 0.511590 4:-57963468 None:intergenic
GAGAACGGAATCCATCAGTC+TGG 0.513134 4:-57963391 None:intergenic
CCTTGAACAGAAGCACCATC+AGG 0.525346 4:-57963491 None:intergenic
GGTGGTGGTTATGGTGGAAG+AGG 0.528058 4:+57963596 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGTGGTTATGGTGGAAGAGG+AGG 0.530270 4:+57963599 MsG0480021448.01.T01:CDS
TACGGTGGTGGCGGTTATGG+TGG 0.535417 4:+57963569 MsG0480021448.01.T01:CDS
CAAGGATCGAGACGCGGAGG+CGG 0.550280 4:+57963509 MsG0480021448.01.T01:CDS
AAAATTCAATTCATCATGAG+TGG 0.553878 4:+57963263 None:intergenic
GTTAGTGTGACTGGACCTGA+TGG 0.557938 4:+57963476 MsG0480021448.01.T01:CDS
CAATCTCAGATCCAGACTGA+TGG 0.559889 4:+57963380 MsG0480021448.01.T01:CDS
ATCCACCACCGCCTCCTCCA+CGG 0.561523 4:-57963688 None:intergenic
GGATTCCGTTCTCTTGCTGA+AGG 0.562087 4:+57963401 MsG0480021448.01.T01:CDS
GAAATGGTTCAATGATCAGA+AGG 0.565831 4:+57963307 MsG0480021448.01.T01:CDS
CGTGGTGGTGGTGGTTACGG+TGG 0.581197 4:+57963554 MsG0480021448.01.T01:CDS
ACTCCTCACTTCCATCATCA+GGG 0.589005 4:-57963346 None:intergenic
GCAAGGGAGTGTACCAGCGG+TGG 0.606856 4:+57963740 MsG0480021448.01.T01:CDS
CTGTGGTGAATCTGGCCACA+TGG 0.607505 4:+57963718 MsG0480021448.01.T01:CDS
GTGAATCTGGCCACATGGCA+AGG 0.610638 4:+57963723 MsG0480021448.01.T01:CDS
ATTCACCTTCAGCAAGAGAA+CGG 0.616654 4:-57963406 None:intergenic
TGATAACGATGGAAGATCCA+AGG 0.617668 4:+57963451 MsG0480021448.01.T01:CDS
TGAATCTGGCCACATGGCAA+GGG 0.618787 4:+57963724 MsG0480021448.01.T01:CDS
AAATGGTTCAATGATCAGAA+GGG 0.619071 4:+57963308 MsG0480021448.01.T01:CDS
CACCCCTGATGATGGAAGTG+AGG 0.619233 4:+57963343 MsG0480021448.01.T01:CDS
AATGGTTCAATGATCAGAAG+GGG 0.619776 4:+57963309 MsG0480021448.01.T01:CDS
TGGGTCAAAATTAACTGGGA+AGG 0.622767 4:+57963283 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGTGGAAGCTGCTACAGCTG+TGG 0.625709 4:+57963812 MsG0480021448.01.T01:CDS
AAATTCAATTCATCATGAGT+GGG 0.626143 4:+57963264 None:intergenic
CAGATTGAGTCTGATAACGA+TGG 0.643460 4:+57963440 MsG0480021448.01.T01:CDS
CTCCTCACTTCCATCATCAG+GGG 0.654781 4:-57963345 None:intergenic
TGAGTGGGTCAAAATTAACT+GGG 0.660344 4:+57963279 MsG0480021448.01.T01:CDS
ATGGCAAGGGAGTGTACCAG+CGG 0.661029 4:+57963737 MsG0480021448.01.T01:CDS
TGGTACACTCCCTTGCCATG+TGG 0.662957 4:-57963733 None:intergenic
GTTCAAGGATCGAGACGCGG+AGG 0.675795 4:+57963506 MsG0480021448.01.T01:CDS
TCTGTTCAAGGATCGAGACG+CGG 0.700237 4:+57963503 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGTGGAGGTGGTTATGAACG+TGG 0.702193 4:+57963536 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGAGGTGGTTATGAACGTGG+TGG 0.730284 4:+57963539 MsG0480021448.01.T01:CDS
GGTGGTGGATGTTACAACTG+TGG 0.753886 4:+57963701 MsG0480021448.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
AAATGGTTCAATGATCAGAA+GGG + Chr4:57963308-57963327 MsG0480021448.01.T01:CDS 30.0%
AATGGTTCAATGATCAGAAG+GGG + Chr4:57963309-57963328 MsG0480021448.01.T01:CDS 35.0%
AATTAACTGGGAAGGTGAAA+TGG + Chr4:57963291-57963310 MsG0480021448.01.T01:CDS 35.0%
ATGAGTGGGTCAAAATTAAC+TGG + Chr4:57963278-57963297 MsG0480021448.01.T01:CDS 35.0%
GAAATGGTTCAATGATCAGA+AGG + Chr4:57963307-57963326 MsG0480021448.01.T01:CDS 35.0%
TGAGTGGGTCAAAATTAACT+GGG + Chr4:57963279-57963298 MsG0480021448.01.T01:CDS 35.0%
ATTCACCTTCAGCAAGAGAA+CGG - Chr4:57963409-57963428 None:intergenic 40.0%
TGGGTCAAAATTAACTGGGA+AGG + Chr4:57963283-57963302 MsG0480021448.01.T01:CDS 40.0%
TGTTACAACTGTGGTGAATC+TGG + Chr4:57963710-57963729 MsG0480021448.01.T01:CDS 40.0%
TTCAATGATCAGAAGGGGTT+TGG + Chr4:57963314-57963333 MsG0480021448.01.T01:CDS 40.0%
TTTGCAAGAGATTGTCCAAC+AGG + Chr4:57963848-57963867 MsG0480021448.01.T01:CDS 40.0%
! CAGATTGAGTCTGATAACGA+TGG + Chr4:57963440-57963459 MsG0480021448.01.T01:CDS 40.0%
! TGATAACGATGGAAGATCCA+AGG + Chr4:57963451-57963470 MsG0480021448.01.T01:CDS 40.0%
AACTCCTCACTTCCATCATC+AGG - Chr4:57963350-57963369 None:intergenic 45.0%
ACTCCTCACTTCCATCATCA+GGG - Chr4:57963349-57963368 None:intergenic 45.0%
CAATCTCAGATCCAGACTGA+TGG + Chr4:57963380-57963399 MsG0480021448.01.T01:CDS 45.0%
! CATCAGTCTGGATCTGAGAT+TGG - Chr4:57963382-57963401 None:intergenic 45.0%
CTCCTCACTTCCATCATCAG+GGG - Chr4:57963348-57963367 None:intergenic 50.0%
GAGAACGGAATCCATCAGTC+TGG - Chr4:57963394-57963413 None:intergenic 50.0%
GGATTCATCACCCCTGATGA+TGG + Chr4:57963335-57963354 MsG0480021448.01.T01:CDS 50.0%
GGATTCCGTTCTCTTGCTGA+AGG + Chr4:57963401-57963420 MsG0480021448.01.T01:CDS 50.0%
GTTAGTGTGACTGGACCTGA+TGG + Chr4:57963476-57963495 MsG0480021448.01.T01:CDS 50.0%
TCCAAGGCTGTTAGTGTGAC+TGG + Chr4:57963467-57963486 MsG0480021448.01.T01:CDS 50.0%
TCCAGTCACACTAACAGCCT+TGG - Chr4:57963471-57963490 None:intergenic 50.0%
TCTGTTCAAGGATCGAGACG+CGG + Chr4:57963503-57963522 MsG0480021448.01.T01:CDS 50.0%
TGAATCTGGCCACATGGCAA+GGG + Chr4:57963724-57963743 MsG0480021448.01.T01:CDS 50.0%
TGCTACAGCTGTGGTGAATC+TGG + Chr4:57963821-57963840 MsG0480021448.01.T01:CDS 50.0%
! CCTGATGGTGCTTCTGTTCA+AGG + Chr4:57963491-57963510 MsG0480021448.01.T01:CDS 50.0%
! TATGGAGGAGGTGGTGGTTA+TGG + Chr4:57963644-57963663 MsG0480021448.01.T01:CDS 50.0%
! TATGGTGGAGGTGGTTATGG+AGG + Chr4:57963629-57963648 MsG0480021448.01.T01:CDS 50.0%
!! CCTTGAACAGAAGCACCATC+AGG - Chr4:57963494-57963513 None:intergenic 50.0%
!! GGTGGTGGATGTTACAACTG+TGG + Chr4:57963701-57963720 MsG0480021448.01.T01:CDS 50.0%
CTGTGGTGAATCTGGCCACA+TGG + Chr4:57963718-57963737 MsG0480021448.01.T01:CDS 55.0%
GGAGGTGGTTATGAACGTGG+TGG + Chr4:57963539-57963558 MsG0480021448.01.T01:CDS 55.0%
GGTGGAGGTGGTTATGAACG+TGG + Chr4:57963536-57963555 MsG0480021448.01.T01:CDS 55.0%
GGTGGTTATGAACGTGGTGG+TGG + Chr4:57963542-57963561 MsG0480021448.01.T01:CDS 55.0%
GTGAATCTGGCCACATGGCA+AGG + Chr4:57963723-57963742 MsG0480021448.01.T01:CDS 55.0%
TGGTACACTCCCTTGCCATG+TGG - Chr4:57963736-57963755 None:intergenic 55.0%
! ATGGCAAGGGAGTGTACCAG+CGG + Chr4:57963737-57963756 MsG0480021448.01.T01:CDS 55.0%
! GGCTATGGTGGAGGTGGTTA+TGG + Chr4:57963626-57963645 MsG0480021448.01.T01:CDS 55.0%
! GGTGGTGGTTATGGTGGAAG+AGG + Chr4:57963596-57963615 MsG0480021448.01.T01:CDS 55.0%
! GGTGGTTATGGTGGAAGAGG+AGG + Chr4:57963599-57963618 MsG0480021448.01.T01:CDS 55.0%
! GGTTATGGTGGAAGAGGAGG+TGG + Chr4:57963602-57963621 MsG0480021448.01.T01:CDS 55.0%
! TATGGTGGAAGAGGAGGTGG+TGG + Chr4:57963605-57963624 MsG0480021448.01.T01:CDS 55.0%
!! ATGGTGGTGGTGGAAGAGGT+GGG + Chr4:57963663-57963682 MsG0480021448.01.T01:CDS 55.0%
!! CACCCCTGATGATGGAAGTG+AGG + Chr4:57963343-57963362 MsG0480021448.01.T01:CDS 55.0%
!! GAACGTGGTGGTGGTGGTTA+CGG + Chr4:57963551-57963570 MsG0480021448.01.T01:CDS 55.0%
!! GGTTATGAACGTGGTGGTGG+TGG + Chr4:57963545-57963564 MsG0480021448.01.T01:CDS 55.0%
!! GGTTATGGTGGTGGTGGAAG+AGG + Chr4:57963659-57963678 MsG0480021448.01.T01:CDS 55.0%
!! TATGGTGGTGGTGGAAGAGG+TGG + Chr4:57963662-57963681 MsG0480021448.01.T01:CDS 55.0%
GGAGGTGGTTATGGAGGAGG+TGG + Chr4:57963635-57963654 MsG0480021448.01.T01:CDS 60.0%
GGTGGAAGCTGCTACAGCTG+TGG + Chr4:57963812-57963831 MsG0480021448.01.T01:CDS 60.0%
GGTGGAGGTGGTTATGGAGG+AGG + Chr4:57963632-57963651 MsG0480021448.01.T01:CDS 60.0%
GGTGGTTATGGAGGAGGTGG+TGG + Chr4:57963638-57963657 MsG0480021448.01.T01:CDS 60.0%
GTTCAAGGATCGAGACGCGG+AGG + Chr4:57963506-57963525 MsG0480021448.01.T01:CDS 60.0%
! AGAGGAGGTGGTGGCTATGG+TGG + Chr4:57963614-57963633 MsG0480021448.01.T01:CDS 60.0%
! GGAAGAGGAGGTGGTGGCTA+TGG + Chr4:57963611-57963630 MsG0480021448.01.T01:CDS 60.0%
! GGAAGGTATGGAGGTGGTGG+TGG + Chr4:57963776-57963795 MsG0480021448.01.T01:CDS 60.0%
! GGAGGAGGTGGTGGTTATGG+TGG + Chr4:57963647-57963666 MsG0480021448.01.T01:CDS 60.0%
! GGAGGTGGTGGTTATGGTGG+TGG + Chr4:57963593-57963612 MsG0480021448.01.T01:CDS 60.0%
! GGTGGAAGGTATGGAGGTGG+TGG + Chr4:57963773-57963792 MsG0480021448.01.T01:CDS 60.0%
! GGTGGAGGTGGTGGTTATGG+TGG + Chr4:57963590-57963609 MsG0480021448.01.T01:CDS 60.0%
!! AGGTATGGAGGTGGTGGTGG+TGG + Chr4:57963779-57963798 MsG0480021448.01.T01:CDS 60.0%
!! GGTGGTGGAGGTGGTGGTTA+TGG + Chr4:57963587-57963606 MsG0480021448.01.T01:CDS 60.0%
!! GGTGGTGGTTATGGTGGTGG+TGG + Chr4:57963653-57963672 MsG0480021448.01.T01:CDS 60.0%
!! GGTTACGGTGGTGGCGGTTA+TGG + Chr4:57963566-57963585 MsG0480021448.01.T01:CDS 60.0%
!! GGTTATGGTGGTGGAGGTGG+TGG + Chr4:57963581-57963600 MsG0480021448.01.T01:CDS 60.0%
!! TACGGTGGTGGCGGTTATGG+TGG + Chr4:57963569-57963588 MsG0480021448.01.T01:CDS 60.0%
!! TATGGAGGTGGTGGTGGTGG+AGG + Chr4:57963782-57963801 MsG0480021448.01.T01:CDS 60.0%
!! TGGTGGTGGTGGAAGAGGTG+GGG + Chr4:57963664-57963683 MsG0480021448.01.T01:CDS 60.0%
ATCCACCACCGCCTCCTCCA+CGG - Chr4:57963691-57963710 None:intergenic 65.0%
CAAGGATCGAGACGCGGAGG+CGG + Chr4:57963509-57963528 MsG0480021448.01.T01:CDS 65.0%
GAGTGTACCAGCGGTGGAGG+TGG + Chr4:57963746-57963765 MsG0480021448.01.T01:CDS 65.0%
TGTACCAGCGGTGGAGGTGG+TGG + Chr4:57963749-57963768 MsG0480021448.01.T01:CDS 65.0%
! AGGGAGTGTACCAGCGGTGG+AGG + Chr4:57963743-57963762 MsG0480021448.01.T01:CDS 65.0%
! GCAAGGGAGTGTACCAGCGG+TGG + Chr4:57963740-57963759 MsG0480021448.01.T01:CDS 65.0%
! GGAGGTGGTGGCTATGGTGG+AGG + Chr4:57963617-57963636 MsG0480021448.01.T01:CDS 65.0%
! GGCGGTGGAAGGTATGGAGG+TGG + Chr4:57963770-57963789 MsG0480021448.01.T01:CDS 65.0%
! GGTGGCGGTGGAAGGTATGG+AGG + Chr4:57963767-57963786 MsG0480021448.01.T01:CDS 65.0%
! GGTGGTGGCTATGGTGGAGG+TGG + Chr4:57963620-57963639 MsG0480021448.01.T01:CDS 65.0%
! GGTGGTGGTTACGGTGGTGG+CGG + Chr4:57963560-57963579 MsG0480021448.01.T01:CDS 65.0%
!! CGTGGTGGTGGTGGTTACGG+TGG + Chr4:57963554-57963573 MsG0480021448.01.T01:CDS 65.0%
!! GGCGGTTATGGTGGTGGAGG+TGG + Chr4:57963578-57963597 MsG0480021448.01.T01:CDS 65.0%
!! GGTGGCGGTTATGGTGGTGG+AGG + Chr4:57963575-57963594 MsG0480021448.01.T01:CDS 65.0%
!! GGTGGTGGCGGTGGAAGGTA+TGG + Chr4:57963764-57963783 MsG0480021448.01.T01:CDS 65.0%
!! GGTGGTGGCGGTTATGGTGG+TGG + Chr4:57963572-57963591 MsG0480021448.01.T01:CDS 65.0%
!! GGTGGTGGTGGAAGAGGTGG+GGG + Chr4:57963665-57963684 MsG0480021448.01.T01:CDS 65.0%
!! GGTGGTGGTGGTTACGGTGG+TGG + Chr4:57963557-57963576 MsG0480021448.01.T01:CDS 65.0%
! ACCAGCGGTGGAGGTGGTGG+CGG + Chr4:57963752-57963771 MsG0480021448.01.T01:CDS 70.0%
!! GGAGGTGGTGGTGGTGGAGG+CGG + Chr4:57963785-57963804 MsG0480021448.01.T01:CDS 70.0%
!! GTGGAGGTGGTGGCGGTGGA+AGG + Chr4:57963759-57963778 MsG0480021448.01.T01:CDS 70.0%
ACCGCCACCACCTCCACCGC+TGG - Chr4:57963756-57963775 None:intergenic 75.0%
AGAGGTGGGGGCCGTGGAGG+AGG + Chr4:57963677-57963696 MsG0480021448.01.T01:CDS 75.0%
GGAAGAGGTGGGGGCCGTGG+AGG + Chr4:57963674-57963693 MsG0480021448.01.T01:CDS 75.0%
GGATCGAGACGCGGAGGCGG+TGG + Chr4:57963512-57963531 MsG0480021448.01.T01:CDS 75.0%
GGTGGAAGAGGTGGGGGCCG+TGG + Chr4:57963671-57963690 MsG0480021448.01.T01:CDS 75.0%
TCGAGACGCGGAGGCGGTGG+CGG + Chr4:57963515-57963534 MsG0480021448.01.T01:CDS 75.0%
!! AGCGGTGGAGGTGGTGGCGG+TGG + Chr4:57963755-57963774 MsG0480021448.01.T01:CDS 75.0%
!! GGTGGTGGTGGAGGCGGTGG+CGG + Chr4:57963791-57963810 MsG0480021448.01.T01:CDS 75.0%
!! GGTGGTGGTGGTGGAGGCGG+TGG + Chr4:57963788-57963807 MsG0480021448.01.T01:CDS 75.0%
! GGCCGTGGAGGAGGCGGTGG+TGG + Chr4:57963686-57963705 MsG0480021448.01.T01:CDS 80.0%
! GGTGGGGGCCGTGGAGGAGG+CGG + Chr4:57963680-57963699 MsG0480021448.01.T01:CDS 80.0%
!! AGACGCGGAGGCGGTGGCGG+TGG + Chr4:57963518-57963537 MsG0480021448.01.T01:CDS 80.0%
!! GGAGGCGGTGGCGGTGGAGG+TGG + Chr4:57963524-57963543 MsG0480021448.01.T01:CDS 80.0%
!!! GGTGGTGGAGGCGGTGGCGG+TGG + Chr4:57963794-57963813 MsG0480021448.01.T01:CDS 80.0%
! GGGGGCCGTGGAGGAGGCGG+TGG + Chr4:57963683-57963702 MsG0480021448.01.T01:CDS 85.0%
!! CGCGGAGGCGGTGGCGGTGG+AGG + Chr4:57963521-57963540 MsG0480021448.01.T01:CDS 85.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr4 gene 57963278 57963883 57963278 ID=MsG0480021448.01;Name=MsG0480021448.01
Chr4 mRNA 57963278 57963883 57963278 ID=MsG0480021448.01.T01;Parent=MsG0480021448.01;Name=MsG0480021448.01.T01;_AED=0.50;_eAED=0.50;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|201
Chr4 exon 57963278 57963883 57963278 ID=MsG0480021448.01.T01:exon:17225;Parent=MsG0480021448.01.T01
Chr4 CDS 57963278 57963883 57963278 ID=MsG0480021448.01.T01:cds;Parent=MsG0480021448.01.T01
Gene Sequence

>MsG0480021448.01.T01

ATGAGTGGGTCAAAATTAACTGGGAAGGTGAAATGGTTCAATGATCAGAAGGGGTTTGGATTCATCACCCCTGATGATGGAAGTGAGGAGTTGTTTGTTCACCAATCTCAGATCCAGACTGATGGATTCCGTTCTCTTGCTGAAGGTGAATCTGTTGAGTATCAGATTGAGTCTGATAACGATGGAAGATCCAAGGCTGTTAGTGTGACTGGACCTGATGGTGCTTCTGTTCAAGGATCGAGACGCGGAGGCGGTGGCGGTGGAGGTGGTTATGAACGTGGTGGTGGTGGTTACGGTGGTGGCGGTTATGGTGGTGGAGGTGGTGGTTATGGTGGAAGAGGAGGTGGTGGCTATGGTGGAGGTGGTTATGGAGGAGGTGGTGGTTATGGTGGTGGTGGAAGAGGTGGGGGCCGTGGAGGAGGCGGTGGTGGATGTTACAACTGTGGTGAATCTGGCCACATGGCAAGGGAGTGTACCAGCGGTGGAGGTGGTGGCGGTGGAAGGTATGGAGGTGGTGGTGGTGGAGGCGGTGGCGGTGGAAGCTGCTACAGCTGTGGTGAATCTGGTCATTTTGCAAGAGATTGTCCAACAGGCAGCGCTCGTTGA

Protein sequence

>MsG0480021448.01.T01

MSGSKLTGKVKWFNDQKGFGFITPDDGSEELFVHQSQIQTDGFRSLAEGESVEYQIESDNDGRSKAVSVTGPDGASVQGSRRGGGGGGGGYERGGGGYGGGGYGGGGGGYGGRGGGGYGGGGYGGGGGYGGGGRGGGRGGGGGGCYNCGESGHMARECTSGGGGGGGRYGGGGGGGGGGGSCYSCGESGHFARDCPTGSAR*