AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0380016701.01


Query id Subject id identity % alignment length mismatches gap openings q. start q. end s. start s. end e-value bit score
MsG0380016701.01.T01 MTR_3g093620 58.333 336 55 6 10 306 57 346 5.29e-91 275
Query id Subject id identity % alignment length mismatches gap openings q. start q. end s. start s. end e-value bit score
MsG0380016701.01.T01 AT3G56460 48.503 334 87 6 10 304 58 345 6.36e-73 228

Find 89 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 295 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
CGCTAATACTTGCAGATTCT+TGG 0.164798 3:-86728110 MsG0380016701.01.T01:intron
GGAGCGAACATTCTAATAAT+TGG 0.169619 3:-86726685 MsG0380016701.01.T01:CDS
GAGCACTTGCTGTGGCATTT+TGG 0.216520 3:-86727646 MsG0380016701.01.T01:CDS
GGACAGTACATGGACTTTAT+TGG 0.229971 3:-86724933 MsG0380016701.01.T01:CDS
CTTGTTTGCATAATCTGTTT+TGG 0.231373 3:-86726888 MsG0380016701.01.T01:CDS
ACAGTTTGGCAATTATTTAT+TGG 0.234689 3:+86723879 None:intergenic
GACAGTACATGGACTTTATT+GGG 0.241684 3:-86724932 MsG0380016701.01.T01:CDS
CCTCCTTTGCCATTCATTCC+TGG 0.241695 3:-86728071 MsG0380016701.01.T01:CDS
CAGATCACCAACACGGAAAT+TGG 0.247989 3:+86728004 None:intergenic
GTTTGTTCCTTTGCTGCTCT+TGG 0.265097 3:-86727982 MsG0380016701.01.T01:CDS
GTTTGTAGGTATTGCTAGTT+TGG 0.273338 3:-86727482 MsG0380016701.01.T01:intron
GGATAAATCAGCATGTTTAC+TGG 0.277628 3:-86724615 MsG0380016701.01.T01:intron
CATGTTTACTGGCCTTGTTC+AGG 0.301961 3:-86724604 MsG0380016701.01.T01:intron
TGTTGATCATGTGGTGGACT+TGG 0.319846 3:-86726830 MsG0380016701.01.T01:CDS
GATTCACGCGAATTGCAATT+TGG 0.331473 3:-86723817 MsG0380016701.01.T01:three_prime_UTR
TAAAATCACTCTGGCAGAAT+TGG 0.333554 3:-86724954 MsG0380016701.01.T01:CDS
TATGCTCGACTAATATCTTC+TGG 0.348556 3:-86723962 MsG0380016701.01.T01:three_prime_UTR
ATGCTATTTATCACTAATAA+TGG 0.355505 3:-86723846 MsG0380016701.01.T01:three_prime_UTR
GGTTGTGATTTGGTTGCTGC+TGG 0.359205 3:-86727668 MsG0380016701.01.T01:CDS
ATCAGAGATAGGAAAGCTAT+AGG 0.384250 3:-86724050 MsG0380016701.01.T01:CDS
GAGCGAACATTCTAATAATT+GGG 0.396914 3:-86726684 MsG0380016701.01.T01:CDS
GGTCTTGCAGCTGTGCAAAT+TGG 0.397069 3:-86727442 MsG0380016701.01.T01:CDS
CCTTCACTGCCATCAGAGAT+AGG 0.409182 3:-86724061 MsG0380016701.01.T01:CDS
CGTTCACATTCTCATTCTTA+CGG 0.411817 3:-86724827 MsG0380016701.01.T01:CDS
AATTTGTAGGTTTCGCGTGC+CGG 0.416854 3:-86727693 MsG0380016701.01.T01:intron
CATAGAGCTCAGTTGAAATC+TGG 0.418835 3:-86727601 MsG0380016701.01.T01:intron
CGTGCCGGAGGGTTGTGATT+TGG 0.423686 3:-86727678 MsG0380016701.01.T01:CDS
TTTGTATACTAGCATCTCCT+TGG 0.427995 3:+86723908 None:intergenic
GCATCTATTCTACAACAGTT+TGG 0.433813 3:+86723865 None:intergenic
AGAGAATCTTCAAGAACAGC+TGG 0.435112 3:+86724889 None:intergenic
TCTGGGCACTCAAACATCAT+AGG 0.441996 3:-86723944 MsG0380016701.01.T01:three_prime_UTR
ATCTTTGCGGCTTCTGAACA+TGG 0.447761 3:-86726708 MsG0380016701.01.T01:CDS
TTTGTAGGTATTGCTAGTTT+GGG 0.449903 3:-86727481 MsG0380016701.01.T01:intron
ATTGCTAGTTTGGGTGCAGC+AGG 0.453975 3:-86727472 MsG0380016701.01.T01:CDS
GGTGCAGCTCTTGAAATCAA+TGG 0.469140 3:-86726854 MsG0380016701.01.T01:CDS
CTACTGTCTTGGTTGGCAAA+AGG 0.470601 3:-86724859 MsG0380016701.01.T01:CDS
TCAGAGATAGGAAAGCTATA+GGG 0.473276 3:-86724049 MsG0380016701.01.T01:CDS
AAATCTGATCCAGGAATGAA+TGG 0.473348 3:+86728062 None:intergenic
TTAACAAGAGCTATGTTAGC+AGG 0.478741 3:+86726635 None:intergenic
TTGGGTGCAGCAGGAGGTGT+GGG 0.485073 3:-86727463 MsG0380016701.01.T01:CDS
GTGCAGCTCTTGAAATCAAT+GGG 0.486437 3:-86726853 MsG0380016701.01.T01:CDS
GCTATTGTCATTGCTGTGCT+AGG 0.491093 3:-86727406 MsG0380016701.01.T01:CDS
TGCTAACATAGCTCTTGTTA+AGG 0.494266 3:-86726633 MsG0380016701.01.T01:intron
GATGGCAGTGAAGGCGAGGT+TGG 0.495840 3:+86724070 None:intergenic
ATGCTCGACTAATATCTTCT+GGG 0.496198 3:-86723961 MsG0380016701.01.T01:three_prime_UTR
CTCTCAAGGAGCTACTGTCT+TGG 0.497731 3:-86724870 MsG0380016701.01.T01:CDS
AGGAGATGCTAGTATACAAA+AGG 0.502843 3:-86723905 MsG0380016701.01.T01:three_prime_UTR
TGCTGCTGGAGCACTTGCTG+TGG 0.510040 3:-86727654 MsG0380016701.01.T01:CDS
GTTGATCATGTGGTGGACTT+GGG 0.511415 3:-86726829 MsG0380016701.01.T01:intron
TGGCAGAATTGGACAGTACA+TGG 0.511468 3:-86724943 MsG0380016701.01.T01:CDS
TGTAGGTTTCGCGTGCCGGA+GGG 0.517884 3:-86727689 MsG0380016701.01.T01:intron
TTTGGGTGCAGCAGGAGGTG+TGG 0.520993 3:-86727464 MsG0380016701.01.T01:CDS
TTGTAGGTTTCGCGTGCCGG+AGG 0.522078 3:-86727690 MsG0380016701.01.T01:intron
AACACGGAAATTGGTAACAT+TGG 0.526095 3:+86728013 None:intergenic
TATAGCTTTCCTATCTCTGA+TGG 0.527406 3:+86724052 None:intergenic
AATGTTACCAATTTCCGTGT+TGG 0.534038 3:-86728011 MsG0380016701.01.T01:CDS
CTAATAATTGGGTTTGCAAG+TGG 0.543319 3:-86726673 MsG0380016701.01.T01:CDS
AGCTCATGAAAGAATCTTTG+CGG 0.548659 3:-86726721 MsG0380016701.01.T01:CDS
ATAAGATCCAAGAGCAGCAA+AGG 0.551039 3:+86727975 None:intergenic
TCTTTGCGGCTTCTGAACAT+GGG 0.552211 3:-86726707 MsG0380016701.01.T01:CDS
TTTGTTTGTTAAAATCACTC+TGG 0.555113 3:-86724963 MsG0380016701.01.T01:CDS
CCTATCTCTGATGGCAGTGA+AGG 0.555242 3:+86724061 None:intergenic
GCTAGTTTGGGTGCAGCAGG+AGG 0.560873 3:-86727469 MsG0380016701.01.T01:CDS
ATTGGTAACATTGGAACCAC+CGG 0.564056 3:+86728022 None:intergenic
CCAGGAATGAATGGCAAAGG+AGG 0.564534 3:+86728071 None:intergenic
CTCTGATGGCAGTGAAGGCG+AGG 0.567574 3:+86724066 None:intergenic
CAAGGAGCTACTGTCTTGGT+TGG 0.572684 3:-86724866 MsG0380016701.01.T01:CDS
TGTTCTTGAAGATTCTCTCA+AGG 0.573910 3:-86724884 MsG0380016701.01.T01:CDS
AGAGAGATGTGCAGCACGCG+TGG 0.580307 3:+86723791 None:intergenic
GCAGATTCTTGGAAAGTACC+AGG 0.581141 3:-86728099 MsG0380016701.01.T01:intron
ATGGCAAAGGAGGTTTCTCC+TGG 0.585688 3:+86728081 None:intergenic
TGCAAATTGGAAAAGCATGT+GGG 0.585981 3:-86727429 MsG0380016701.01.T01:CDS
TCAGGCATCGTTGATTCCGG+TGG 0.604397 3:-86728038 MsG0380016701.01.T01:CDS
GATCCAGGAATGAATGGCAA+AGG 0.610430 3:+86728068 None:intergenic
TCATTCTTACGGCCTGTCAG+AGG 0.612699 3:-86724816 MsG0380016701.01.T01:intron
TAACAAGAGCTATGTTAGCA+GGG 0.614061 3:+86726636 None:intergenic
TAGGTTCATATTAGAGACCA+AGG 0.621322 3:-86723925 MsG0380016701.01.T01:three_prime_UTR
GCAACCAAATCACAACCCTC+CGG 0.621624 3:+86727674 None:intergenic
CTTTGCGGCTTCTGAACATG+GGG 0.621776 3:-86726706 MsG0380016701.01.T01:CDS
ATCAATGGGTGTTGATCATG+TGG 0.629567 3:-86726839 MsG0380016701.01.T01:CDS
CGTAAGAATGAGAATGTGAA+CGG 0.636424 3:+86724828 None:intergenic
AGATAGGAAAGCTATAGGGA+AGG 0.636916 3:-86724045 MsG0380016701.01.T01:CDS
GTGCAAATTGGAAAAGCATG+TGG 0.641885 3:-86727430 MsG0380016701.01.T01:CDS
GAGAATCTTCAAGAACAGCT+GGG 0.655056 3:+86724890 None:intergenic
GAACAAACAGATCACCAACA+CGG 0.686520 3:+86727997 None:intergenic
AATGGGTGTTGATCATGTGG+TGG 0.686665 3:-86726836 MsG0380016701.01.T01:CDS
AGTCAGCACTAACCTGAACA+AGG 0.687351 3:+86724592 None:intergenic
ACAGTACATGGACTTTATTG+GGG 0.692527 3:-86724931 MsG0380016701.01.T01:CDS
GCAAATTGGAAAAGCATGTG+GGG 0.732786 3:-86727428 MsG0380016701.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! CAAATTTAAACTAAAAAAAT+AGG + Chr3:86727812-86727831 None:intergenic 10.0%
!! AAACATAACAATATATACAT+TGG + Chr3:86724538-86724557 None:intergenic 15.0%
!! AAATACACAAATTATTAGAA+CGG + Chr3:86727305-86727324 None:intergenic 15.0%
!! AACAAAAAATGACATATAAA+TGG - Chr3:86725959-86725978 MsG0380016701.01.T01:intron 15.0%
!! AATCCCATATAAATAAAAAA+AGG - Chr3:86726665-86726684 MsG0380016701.01.T01:CDS 15.0%
!! ACAAAAAATGACATATAAAT+GGG - Chr3:86725960-86725979 MsG0380016701.01.T01:intron 15.0%
!! TATAAATTCTTTGAATTTGT+AGG - Chr3:86724368-86724387 MsG0380016701.01.T01:intron 15.0%
!! TATTTGGTATATAATGAAAA+AGG - Chr3:86726423-86726442 MsG0380016701.01.T01:intron 15.0%
!! TTAATTTCAACTTAATAAAG+AGG - Chr3:86725014-86725033 MsG0380016701.01.T01:intron 15.0%
!! TTATGTATGTAGTTTAAATT+AGG + Chr3:86726732-86726751 None:intergenic 15.0%
!! TTTCATTATATACCAAATAT+GGG + Chr3:86726422-86726441 None:intergenic 15.0%
!!! AAATATTTTATGGATTATGT+TGG - Chr3:86727769-86727788 MsG0380016701.01.T01:intron 15.0%
!!! AATTTTGGTGAAATATTTTA+TGG - Chr3:86727759-86727778 MsG0380016701.01.T01:intron 15.0%
!!! TAAAGTTATAGTTGTTTTAT+GGG - Chr3:86724950-86724969 MsG0380016701.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTACTGAATCTTTTTTTTTT+TGG - Chr3:86727438-86727457 MsG0380016701.01.T01:CDS 15.0%
!!! TTTTCATTATATACCAAATA+TGG + Chr3:86726423-86726442 None:intergenic 15.0%
!! AAATAAATGCACAAATTGTA+TGG + Chr3:86725800-86725819 None:intergenic 20.0%
!! AATAAATGCACAAATTGTAT+GGG + Chr3:86725799-86725818 None:intergenic 20.0%
!! AATTTGATATACTGTATACT+TGG - Chr3:86727826-86727845 MsG0380016701.01.T01:intron 20.0%
!! ACATTCTATGATAATCAATT+CGG - Chr3:86725587-86725606 MsG0380016701.01.T01:intron 20.0%
!! ATTTGATATACTGTATACTT+GGG - Chr3:86727827-86727846 MsG0380016701.01.T01:intron 20.0%
!! GTATATATTGTTATGTTTGT+TGG - Chr3:86724540-86724559 MsG0380016701.01.T01:intron 20.0%
!! TAAAATTCAATGTACATTCA+AGG - Chr3:86727337-86727356 MsG0380016701.01.T01:intron 20.0%
!! TTAATGTAAATATGCAATGT+GGG + Chr3:86726874-86726893 None:intergenic 20.0%
!! TTAGATATAGCATAAAGTAA+CGG + Chr3:86726280-86726299 None:intergenic 20.0%
!!! AAATTAATTCAAGTTCAACA+TGG + Chr3:86726209-86726228 None:intergenic 20.0%
!!! AATTAATTCAAGTTCAACAT+GGG + Chr3:86726208-86726227 None:intergenic 20.0%
!!! ACAGCCTTTTTTTATTTATA+TGG + Chr3:86726672-86726691 None:intergenic 20.0%
!!! AGTGATTTTAACAAACAAAA+AGG + Chr3:86727110-86727129 None:intergenic 20.0%
!!! ATGCTATTTATCACTAATAA+TGG - Chr3:86728228-86728247 MsG0380016701.01.T01:intron 20.0%
!!! CAGCCTTTTTTTATTTATAT+GGG + Chr3:86726671-86726690 None:intergenic 20.0%
!!! CTCGTTAGTTTTTAAAATTT+TGG - Chr3:86727744-86727763 MsG0380016701.01.T01:intron 20.0%
!!! GTAAAGTTATAGTTGTTTTA+TGG - Chr3:86724949-86724968 MsG0380016701.01.T01:CDS 20.0%
! AAACAATTTCTTATTGTTGC+AGG - Chr3:86727981-86728000 MsG0380016701.01.T01:CDS 25.0%
! AAATAGATATGTACTAAGCA+TGG - Chr3:86726035-86726054 MsG0380016701.01.T01:intron 25.0%
! ACAGTTTGGCAATTATTTAT+TGG + Chr3:86728198-86728217 None:intergenic 25.0%
! AGATACATTCACGTAAAAAT+GGG - Chr3:86724277-86724296 MsG0380016701.01.T01:intron 25.0%
! ATCAATGCTGAAAAATATAC+AGG - Chr3:86725922-86725941 MsG0380016701.01.T01:intron 25.0%
! CATTTGTTTAATAAACACAC+AGG - Chr3:86725038-86725057 MsG0380016701.01.T01:intron 25.0%
! CTTAATGTAAATATGCAATG+TGG + Chr3:86726875-86726894 None:intergenic 25.0%
! GATAATCAATTCGGAATTAA+TGG - Chr3:86725596-86725615 MsG0380016701.01.T01:intron 25.0%
! GTAGATATATATCACAACTT+TGG + Chr3:86726394-86726413 None:intergenic 25.0%
! TAAAAACTAACGAGAATAGA+AGG + Chr3:86727738-86727757 None:intergenic 25.0%
! TAAGACTACTTAGACAATAA+AGG - Chr3:86726527-86726546 MsG0380016701.01.T01:intron 25.0%
! TAGATACATTCACGTAAAAA+TGG - Chr3:86724276-86724295 MsG0380016701.01.T01:intron 25.0%
! TAGTTCAATGTTCATTTCTT+GGG - Chr3:86727529-86727548 MsG0380016701.01.T01:intron 25.0%
! TGGATTCTTGATATGATTAT+TGG + Chr3:86723866-86723885 None:intergenic 25.0%
! TTAAAATTAGTGAGTGGTTA+GGG - Chr3:86727568-86727587 MsG0380016701.01.T01:intron 25.0%
! TTAGTTCAATGTTCATTTCT+TGG - Chr3:86727528-86727547 MsG0380016701.01.T01:intron 25.0%
!! ATATTGTTATGTTTGTTGGT+GGG - Chr3:86724544-86724563 MsG0380016701.01.T01:intron 25.0%
!! GCTTAGCTAAAATGAATTTT+GGG - Chr3:86724903-86724922 MsG0380016701.01.T01:CDS 25.0%
!! TATATTGTTATGTTTGTTGG+TGG - Chr3:86724543-86724562 MsG0380016701.01.T01:intron 25.0%
!! TGTAACTGATGACATTATTT+TGG + Chr3:86725753-86725772 None:intergenic 25.0%
!! TTGTAGCTTCTTAATTTTCA+CGG - Chr3:86724831-86724850 MsG0380016701.01.T01:CDS 25.0%
!! TTGTTTGCATAATCTGTTTT+GGG - Chr3:86725187-86725206 MsG0380016701.01.T01:intron 25.0%
!! TTTGTTTGTTAAAATCACTC+TGG - Chr3:86727111-86727130 MsG0380016701.01.T01:intron 25.0%
!!! CGTAAAAATGGGTTAAATAA+TGG - Chr3:86724288-86724307 MsG0380016701.01.T01:intron 25.0%
!!! TTAGTTTTTCAGGTTAGTTA+GGG + Chr3:86726167-86726186 None:intergenic 25.0%
AAATCGCTACAATACTCTAA+TGG - Chr3:86726765-86726784 MsG0380016701.01.T01:intron 30.0%
AAATTAGGTTCCAAGATTCA+AGG + Chr3:86726717-86726736 None:intergenic 30.0%
AACTAAACTAGTGAGATCTT+TGG - Chr3:86726810-86726829 MsG0380016701.01.T01:intron 30.0%
AAGAAACATACTGAATACCT+AGG - Chr3:86726569-86726588 MsG0380016701.01.T01:intron 30.0%
ACCAACACACACTAAATAAA+CGG + Chr3:86724179-86724198 None:intergenic 30.0%
AGGATTTAGTCATATGTATG+AGG + Chr3:86726697-86726716 None:intergenic 30.0%
AGTTCAATGTTCATTTCTTG+GGG - Chr3:86727530-86727549 MsG0380016701.01.T01:intron 30.0%
ATCAATTCGGAATTAATGGA+AGG - Chr3:86725600-86725619 MsG0380016701.01.T01:intron 30.0%
ATGACTAAATCCTTGAATCT+TGG - Chr3:86726704-86726723 MsG0380016701.01.T01:CDS 30.0%
ATTAGCGAATTTCAATCTTG+TGG + Chr3:86723951-86723970 None:intergenic 30.0%
CTAAGAAATAACTGACCTAT+TGG - Chr3:86726362-86726381 MsG0380016701.01.T01:intron 30.0%
CTACTGTTGTAACTCTTTAA+AGG - Chr3:86727388-86727407 MsG0380016701.01.T01:CDS 30.0%
CTTAACACTCATTCTCTTAT+TGG + Chr3:86727011-86727030 None:intergenic 30.0%
GAGCGAACATTCTAATAATT+GGG - Chr3:86725390-86725409 MsG0380016701.01.T01:intron 30.0%
GTTAAAATTAGTGAGTGGTT+AGG - Chr3:86727567-86727586 MsG0380016701.01.T01:intron 30.0%
TATTAGAACGGATAAGACAA+GGG + Chr3:86727293-86727312 None:intergenic 30.0%
TCAATTCGGAATTAATGGAA+GGG - Chr3:86725601-86725620 MsG0380016701.01.T01:intron 30.0%
TCATATTTACTAATGCCCAT+TGG + Chr3:86727701-86727720 None:intergenic 30.0%
TCTTAGTGATGAGATAGAAA+AGG + Chr3:86726348-86726367 None:intergenic 30.0%
TGATGAGAAATTGTCATATG+TGG + Chr3:86725638-86725657 None:intergenic 30.0%
TGTAGCGATTTAATCACAAT+GGG + Chr3:86726756-86726775 None:intergenic 30.0%
TGTTATTATCTTGTCTTGCT+TGG - Chr3:86725488-86725507 MsG0380016701.01.T01:intron 30.0%
TTATTAGAACGGATAAGACA+AGG + Chr3:86727294-86727313 None:intergenic 30.0%
TTATTGGATGAAATCCATGT+AGG + Chr3:86726995-86727014 None:intergenic 30.0%
TTGTAGCGATTTAATCACAA+TGG + Chr3:86726757-86726776 None:intergenic 30.0%
TTTCAGCTTCACTATCTTAA+AGG + Chr3:86726239-86726258 None:intergenic 30.0%
! AAAGATCTCACTAGTTTAGT+TGG + Chr3:86726811-86726830 None:intergenic 30.0%
! AAGATCTCACTAGTTTAGTT+GGG + Chr3:86726810-86726829 None:intergenic 30.0%
! CGCTTAGCTAAAATGAATTT+TGG - Chr3:86724902-86724921 MsG0380016701.01.T01:CDS 30.0%
! CTTGTTTGCATAATCTGTTT+TGG - Chr3:86725186-86725205 MsG0380016701.01.T01:intron 30.0%
! TATTGTTATGTTTGTTGGTG+GGG - Chr3:86724545-86724564 MsG0380016701.01.T01:intron 30.0%
! TGAGGACTAGTATTATACAA+TGG - Chr3:86727955-86727974 MsG0380016701.01.T01:intron 30.0%
! TGTTTGCATAATCTGTTTTG+GGG - Chr3:86725188-86725207 MsG0380016701.01.T01:intron 30.0%
! TTCACAGTTTGCATAGATTT+TGG - Chr3:86726138-86726157 MsG0380016701.01.T01:intron 30.0%
! TTTGTAGGTATTGCTAGTTT+GGG - Chr3:86724593-86724612 MsG0380016701.01.T01:intron 30.0%
!! GGATTTTACATTGCTTTTCA+GGG + Chr3:86726650-86726669 None:intergenic 30.0%
!! GTTATAGTTGTTTTATGGGT+AGG - Chr3:86724954-86724973 MsG0380016701.01.T01:CDS 30.0%
!! TCGCATTTTAATCTCTAACT+TGG - Chr3:86725133-86725152 MsG0380016701.01.T01:intron 30.0%
!!! GATGACATTATTTTGGAAGT+GGG + Chr3:86725746-86725765 None:intergenic 30.0%
!!! GTTAGTTTTTCAGGTTAGTT+AGG + Chr3:86726168-86726187 None:intergenic 30.0%
!!! TGATGACATTATTTTGGAAG+TGG + Chr3:86725747-86725766 None:intergenic 30.0%
AAAATGGATCCCACATAAAG+TGG + Chr3:86726960-86726979 None:intergenic 35.0%
AAACATACTGAATACCTAGG+TGG - Chr3:86726572-86726591 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
AAATCTGATCCAGGAATGAA+TGG + Chr3:86724015-86724034 None:intergenic 35.0%
AACATACTGAATACCTAGGT+GGG - Chr3:86726573-86726592 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
AATCTATGCAAACTGTGAAG+CGG + Chr3:86726137-86726156 None:intergenic 35.0%
AATGTTACCAATTTCCGTGT+TGG - Chr3:86724063-86724082 MsG0380016701.01.T01:CDS 35.0%
ACACACTAAATAAACGGAAG+AGG + Chr3:86724173-86724192 None:intergenic 35.0%
ACAGTACATGGACTTTATTG+GGG - Chr3:86727143-86727162 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
ACCAGGTTAAAATTAGTGAG+TGG - Chr3:86727562-86727581 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
ACTTGGGTCATTATAACAGT+TGG - Chr3:86727843-86727862 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
AGAAAAGGACTACATCATAC+TGG + Chr3:86726333-86726352 None:intergenic 35.0%
AGAATCCAATTGAGAGGATA+GGG + Chr3:86723894-86723913 None:intergenic 35.0%
AGCTCATGAAAGAATCTTTG+CGG - Chr3:86725353-86725372 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
AGGAGATGCTAGTATACAAA+AGG - Chr3:86728169-86728188 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
AGGCAAATGATACAAACTAC+TGG + Chr3:86727914-86727933 None:intergenic 35.0%
AGGTACATCAGGAATAGATT+TGG - Chr3:86725461-86725480 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
AGTAACGGTAGTATTTAAGC+AGG + Chr3:86726265-86726284 None:intergenic 35.0%
AGTATGTTTCTTAGATGTCG+TGG + Chr3:86726561-86726580 None:intergenic 35.0%
ATCAGAGATAGGAAAGCTAT+AGG - Chr3:86728024-86728043 MsG0380016701.01.T01:CDS 35.0%
ATGCTCGACTAATATCTTCT+GGG - Chr3:86728113-86728132 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
CAAAAGCAACAGTCATGATA+TGG + Chr3:86725701-86725720 None:intergenic 35.0%
CAATTCGGAATTAATGGAAG+GGG - Chr3:86725602-86725621 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
CAGATCAAGCAACAAAAATC+AGG + Chr3:86725531-86725550 None:intergenic 35.0%
CAGCAAATCACAATGACTAA+AGG + Chr3:86725834-86725853 None:intergenic 35.0%
CGTAAGAATGAGAATGTGAA+CGG + Chr3:86727249-86727268 None:intergenic 35.0%
CGTTCACATTCTCATTCTTA+CGG - Chr3:86727247-86727266 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
CTAATAATTGGGTTTGCAAG+TGG - Chr3:86725401-86725420 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
CTTAAGGTCAAAAGGCTTAA+GGG - Chr3:86725300-86725319 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
GAAAGAGTCTTAAGGTCAAA+AGG - Chr3:86725292-86725311 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
GAACTAACATAAGAGAGCTT+TGG + Chr3:86727055-86727074 None:intergenic 35.0%
GACAGTACATGGACTTTATT+GGG - Chr3:86727142-86727161 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
GCATCTATTCTACAACAGTT+TGG + Chr3:86728212-86728231 None:intergenic 35.0%
GGAGCGAACATTCTAATAAT+TGG - Chr3:86725389-86725408 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
GGATAAATCAGCATGTTTAC+TGG - Chr3:86727459-86727478 MsG0380016701.01.T01:CDS 35.0%
TAAAATCACTCTGGCAGAAT+TGG - Chr3:86727120-86727139 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
TAAATATGCAATGTGGGCAA+GGG + Chr3:86726868-86726887 None:intergenic 35.0%
TAACAAGAGCTATGTTAGCA+GGG + Chr3:86725441-86725460 None:intergenic 35.0%
TAGGTCTCACACTTAGAAAA+TGG + Chr3:86726976-86726995 None:intergenic 35.0%
TAGGTTCATATTAGAGACCA+AGG - Chr3:86728149-86728168 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
TAGTCCTCATTGAACATCAA+TGG + Chr3:86727944-86727963 None:intergenic 35.0%
TATAGCTTTCCTATCTCTGA+TGG + Chr3:86728025-86728044 None:intergenic 35.0%
TATCTACACACACCCATATT+TGG - Chr3:86726407-86726426 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
TATGCTCGACTAATATCTTC+TGG - Chr3:86728112-86728131 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
TCAGAGATAGGAAAGCTATA+GGG - Chr3:86728025-86728044 MsG0380016701.01.T01:CDS 35.0%
TCCGTTTATTTAGTGTGTGT+TGG - Chr3:86724175-86724194 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
TCTTAAGGTCAAAAGGCTTA+AGG - Chr3:86725299-86725318 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
TGAACATCAATGGAGCATAT+AGG + Chr3:86727934-86727953 None:intergenic 35.0%
TGCTAACATAGCTCTTGTTA+AGG - Chr3:86725441-86725460 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
TGTTCTTGAAGATTCTCTCA+AGG - Chr3:86727190-86727209 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
TTAACAAGAGCTATGTTAGC+AGG + Chr3:86725442-86725461 None:intergenic 35.0%
TTGTGACATCAATGACCAAT+GGG - Chr3:86727683-86727702 MsG0380016701.01.T01:CDS 35.0%
TTTATGAGTGAATCCCATGT+GGG - Chr3:86726929-86726948 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
TTTGTATACTAGCATCTCCT+TGG + Chr3:86728169-86728188 None:intergenic 35.0%
! AACACGGAAATTGGTAACAT+TGG + Chr3:86724064-86724083 None:intergenic 35.0%
! AAGCACTTTTGTGCAGAAAA+TGG - Chr3:86723806-86723825 MsG0380016701.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
! AATAAACGGAAGAGGAGTAT+CGG + Chr3:86724165-86724184 None:intergenic 35.0%
! AATGGGAAGAGAATTTTGAG+CGG - Chr3:86725977-86725996 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
! AGCACTTTTGTGCAGAAAAT+GGG - Chr3:86723807-86723826 MsG0380016701.01.T01:three_prime_UTR 35.0%
! ATTCCTGGATCAGATTTTTC+AGG - Chr3:86724018-86724037 MsG0380016701.01.T01:CDS 35.0%
! CATCATACTGGCATTTTGTT+TGG + Chr3:86726321-86726340 None:intergenic 35.0%
! GTTTGTAGGTATTGCTAGTT+TGG - Chr3:86724592-86724611 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
! TGCAAATTGGAAAAGCATGT+GGG - Chr3:86724645-86724664 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
! TTGGATCTGCAAACTTTTGT+TGG - Chr3:86726829-86726848 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
!! AATTAATGGAAGGGGTATCA+AGG - Chr3:86725610-86725629 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
!! ACCACTCACTAATTTTAACC+TGG + Chr3:86727566-86727585 None:intergenic 35.0%
!! ATTAATGGAAGGGGTATCAA+GGG - Chr3:86725611-86725630 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
!! CAACTTTGGAATAGACCAAT+AGG + Chr3:86726380-86726399 None:intergenic 35.0%
!! GGGATTTTACATTGCTTTTC+AGG + Chr3:86726651-86726670 None:intergenic 35.0%
!! TATGTTAGTTCTGCTATAGC+TGG - Chr3:86727064-86727083 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
!!! CTGGGGAATTTTTAGTTATC+TGG - Chr3:86726465-86726484 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
!!! GCATTGATTTTCACTTGACA+TGG + Chr3:86725910-86725929 None:intergenic 35.0%
!!! GGAATTTTTAGTTATCTGGC+TGG - Chr3:86726469-86726488 MsG0380016701.01.T01:intron 35.0%
AAATTAGTGAGTGGTTAGGG+TGG - Chr3:86727571-86727590 MsG0380016701.01.T01:intron 40.0%
AACATAGGCTAAGAAGCTCA+TGG + Chr3:86724771-86724790 None:intergenic 40.0%
AATTAGTGAGTGGTTAGGGT+GGG - Chr3:86727572-86727591 MsG0380016701.01.T01:intron 40.0%
ACATAGGCTAAGAAGCTCAT+GGG + Chr3:86724770-86724789 None:intergenic 40.0%
ACTCAACTCCAACTTTCCAA+GGG + Chr3:86725162-86725181 None:intergenic 40.0%
ACTCTAACTCTCAACGATGT+AGG + Chr3:86723917-86723936 None:intergenic 40.0%
AGAGAATCTTCAAGAACAGC+TGG + Chr3:86727188-86727207 None:intergenic 40.0%
AGATAGGAAAGCTATAGGGA+AGG - Chr3:86728029-86728048 MsG0380016701.01.T01:CDS 40.0%
AGCTCTTGTTAAGGTACATC+AGG - Chr3:86725450-86725469 MsG0380016701.01.T01:intron 40.0%
ATAAGATCCAAGAGCAGCAA+AGG + Chr3:86724102-86724121 None:intergenic 40.0%
ATCTCTAACTTGGTATCCCT+TGG - Chr3:86725143-86725162 MsG0380016701.01.T01:intron 40.0%
ATGCCTGAAAAATCTGATCC+AGG + Chr3:86724024-86724043 None:intergenic 40.0%
CATAGAGCTCAGTTGAAATC+TGG - Chr3:86724473-86724492 MsG0380016701.01.T01:intron 40.0%
CATCGTTGAGAGTTAGAGTT+AGG - Chr3:86723918-86723937 MsG0380016701.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
CGCTAATACTTGCAGATTCT+TGG - Chr3:86723964-86723983 MsG0380016701.01.T01:three_prime_UTR 40.0%
CTTGTGACATCAATGACCAA+TGG - Chr3:86727682-86727701 MsG0380016701.01.T01:CDS 40.0%
CTTTATGAGTGAATCCCATG+TGG - Chr3:86726928-86726947 MsG0380016701.01.T01:intron 40.0%
GAACAAACAGATCACCAACA+CGG + Chr3:86724080-86724099 None:intergenic 40.0%
GAGAATCCAATTGAGAGGAT+AGG + Chr3:86723895-86723914 None:intergenic 40.0%
GAGAATCTTCAAGAACAGCT+GGG + Chr3:86727187-86727206 None:intergenic 40.0%
GATTCACGCGAATTGCAATT+TGG - Chr3:86728257-86728276 MsG0380016701.01.T01:intron 40.0%
GGACAGTACATGGACTTTAT+TGG - Chr3:86727141-86727160 MsG0380016701.01.T01:intron 40.0%
GTAAATATGCAATGTGGGCA+AGG + Chr3:86726869-86726888 None:intergenic 40.0%
GTGCAGCTCTTGAAATCAAT+GGG - Chr3:86725221-86725240 MsG0380016701.01.T01:intron 40.0%
TGCTCCATTGATGTTCAATG+AGG - Chr3:86727937-86727956 MsG0380016701.01.T01:intron 40.0%
TGGGTTGTGGAATTGTTTGT+AGG - Chr3:86724578-86724597 MsG0380016701.01.T01:intron 40.0%
TGTAGGAGAATCCAATTGAG+AGG + Chr3:86723900-86723919 None:intergenic 40.0%
TTCTAAGTGTGAGACCTACA+TGG - Chr3:86726978-86726997 MsG0380016701.01.T01:intron 40.0%
TTGGTGGGGTTAAGTTATGT+GGG - Chr3:86724559-86724578 MsG0380016701.01.T01:intron 40.0%
! ATTGGTAACATTGGAACCAC+CGG + Chr3:86724055-86724074 None:intergenic 40.0%
! GAGAGTGTGAAAGAGTCTTA+AGG - Chr3:86725284-86725303 MsG0380016701.01.T01:intron 40.0%
! GCAAATTGGAAAAGCATGTG+GGG - Chr3:86724646-86724665 MsG0380016701.01.T01:intron 40.0%
! GTGCAAATTGGAAAAGCATG+TGG - Chr3:86724644-86724663 MsG0380016701.01.T01:intron 40.0%
!! ATCAATGGGTGTTGATCATG+TGG - Chr3:86725235-86725254 MsG0380016701.01.T01:intron 40.0%
!! CATTTTGGCACTTCACATGT+TGG - Chr3:86724443-86724462 MsG0380016701.01.T01:intron 40.0%
!! TCATTGTGATTTGCTGACGA+GGG - Chr3:86725838-86725857 MsG0380016701.01.T01:intron 40.0%
!! TTTAGTGTGTGTTGGTTCTG+TGG - Chr3:86724183-86724202 MsG0380016701.01.T01:intron 40.0%
!!! CTGGCATTTTGTTTGGCTTT+TGG + Chr3:86726314-86726333 None:intergenic 40.0%
!!! TTTTCAGGCATCGTTGATTC+CGG - Chr3:86724033-86724052 MsG0380016701.01.T01:CDS 40.0%
AACATGGGCATTTAAGCTGC+AGG + Chr3:86726193-86726212 None:intergenic 45.0%
AATTTGTAGGTTTCGCGTGC+CGG - Chr3:86724381-86724400 MsG0380016701.01.T01:intron 45.0%
ACTGAATACCTAGGTGGGTA+AGG - Chr3:86726578-86726597 MsG0380016701.01.T01:intron 45.0%
AGACACCCTATCCTCTCAAT+TGG - Chr3:86723886-86723905 MsG0380016701.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
AGCAGTTGCTAAATGTGCTG+CGG + Chr3:86724806-86724825 None:intergenic 45.0%
AGCTCAGTTGAAATCTGGTC+AGG - Chr3:86724478-86724497 MsG0380016701.01.T01:intron 45.0%
AGTCAGCACTAACCTGAACA+AGG + Chr3:86727485-86727504 None:intergenic 45.0%
ATAAAGTGGTGAGACCCACA+TGG + Chr3:86726946-86726965 None:intergenic 45.0%
ATCTTTGCGGCTTCTGAACA+TGG - Chr3:86725366-86725385 MsG0380016701.01.T01:intron 45.0%
ATGAAACTGAGAGCTGAGAC+TGG - Chr3:86726446-86726465 MsG0380016701.01.T01:intron 45.0%
ATGCCATGATGCCTTTGAGT+TGG - Chr3:86724719-86724738 MsG0380016701.01.T01:intron 45.0%
CACTCAACTCCAACTTTCCA+AGG + Chr3:86725163-86725182 None:intergenic 45.0%
CAGATCACCAACACGGAAAT+TGG + Chr3:86724073-86724092 None:intergenic 45.0%
CCACAATGAACCCAACTCAA+AGG + Chr3:86724733-86724752 None:intergenic 45.0%
CTACTGTCTTGGTTGGCAAA+AGG - Chr3:86727215-86727234 MsG0380016701.01.T01:intron 45.0%
CTTGGTATCCCTTGGAAAGT+TGG - Chr3:86725151-86725170 MsG0380016701.01.T01:intron 45.0%
GATCCAGGAATGAATGGCAA+AGG + Chr3:86724009-86724028 None:intergenic 45.0%
GCTATTGTCATTGCTGTGCT+AGG - Chr3:86724668-86724687 MsG0380016701.01.T01:intron 45.0%
GGTGCAGCTCTTGAAATCAA+TGG - Chr3:86725220-86725239 MsG0380016701.01.T01:intron 45.0%
GTTTGTTCCTTTGCTGCTCT+TGG - Chr3:86724092-86724111 MsG0380016701.01.T01:intron 45.0%
TAAAGTGGTGAGACCCACAT+GGG + Chr3:86726945-86726964 None:intergenic 45.0%
TCTGGGCACTCAAACATCAT+AGG - Chr3:86728130-86728149 MsG0380016701.01.T01:intron 45.0%
TCTTGGGGTTCTATTTGACC+AGG - Chr3:86727545-86727564 MsG0380016701.01.T01:intron 45.0%
TCTTTGCGGCTTCTGAACAT+GGG - Chr3:86725367-86725386 MsG0380016701.01.T01:intron 45.0%
TGAAACTGAGAGCTGAGACT+GGG - Chr3:86726447-86726466 MsG0380016701.01.T01:intron 45.0%
TGGCAGAATTGGACAGTACA+TGG - Chr3:86727131-86727150 MsG0380016701.01.T01:intron 45.0%
TGGGTCTCACCACTTTATGT+GGG - Chr3:86726948-86726967 MsG0380016701.01.T01:intron 45.0%
TGGTCAGGTATGATCTAGTG+CGG - Chr3:86724493-86724512 MsG0380016701.01.T01:intron 45.0%
! ATTGAGAGGATAGGGTGTCT+TGG + Chr3:86723886-86723905 None:intergenic 45.0%
! GGGTTAAGTTATGTGGGTTG+TGG - Chr3:86724565-86724584 MsG0380016701.01.T01:intron 45.0%
! GTTGGTGGGGTTAAGTTATG+TGG - Chr3:86724558-86724577 MsG0380016701.01.T01:intron 45.0%
! TGCCATGATGCCTTTGAGTT+GGG - Chr3:86724720-86724739 MsG0380016701.01.T01:intron 45.0%
!! AACCCAACTCAAAGGCATCA+TGG + Chr3:86724725-86724744 None:intergenic 45.0%
!! AATGGGTGTTGATCATGTGG+TGG - Chr3:86725238-86725257 MsG0380016701.01.T01:intron 45.0%
!! CATGTTTACTGGCCTTGTTC+AGG - Chr3:86727470-86727489 MsG0380016701.01.T01:CDS 45.0%
!! CCTTTGAGTTGGGTTCATTG+TGG - Chr3:86724730-86724749 MsG0380016701.01.T01:intron 45.0%
!! GCAGATTCTTGGAAAGTACC+AGG - Chr3:86723975-86723994 MsG0380016701.01.T01:three_prime_UTR 45.0%
!! GTCATTGTGATTTGCTGACG+AGG - Chr3:86725837-86725856 MsG0380016701.01.T01:intron 45.0%
!! GTTGATCATGTGGTGGACTT+GGG - Chr3:86725245-86725264 MsG0380016701.01.T01:intron 45.0%
!! TGTTGATCATGTGGTGGACT+TGG - Chr3:86725244-86725263 MsG0380016701.01.T01:intron 45.0%
!!! CTGCAGGCTGTTAGTTTTTC+AGG + Chr3:86726177-86726196 None:intergenic 45.0%
!!! TCTGTTTTGGGGAGCTGAAA+AGG - Chr3:86725199-86725218 MsG0380016701.01.T01:intron 45.0%
!! AAATTTAAACTAAAAAAATA+GGG + Chr3:86727811-86727830 None:intergenic 5.0%
AGTGGTTAGGGTGGGAAAGT+TGG - Chr3:86727580-86727599 MsG0380016701.01.T01:intron 50.0%
ATGGCAAAGGAGGTTTCTCC+TGG + Chr3:86723996-86724015 None:intergenic 50.0%
CAAGGAGCTACTGTCTTGGT+TGG - Chr3:86727208-86727227 MsG0380016701.01.T01:intron 50.0%
CAGTTACAGCACCCGTAGTA+GGG - Chr3:86725765-86725784 MsG0380016701.01.T01:intron 50.0%
CCAGGAATGAATGGCAAAGG+AGG + Chr3:86724006-86724025 None:intergenic 50.0%
CCTATCTCTGATGGCAGTGA+AGG + Chr3:86728016-86728035 None:intergenic 50.0%
CCTCCTTTGCCATTCATTCC+TGG - Chr3:86724003-86724022 MsG0380016701.01.T01:CDS 50.0%
CCTTCACTGCCATCAGAGAT+AGG - Chr3:86728013-86728032 MsG0380016701.01.T01:CDS 50.0%
CGGCACGTGAATGCAAACAT+AGG + Chr3:86724786-86724805 None:intergenic 50.0%
CTCTCAAGGAGCTACTGTCT+TGG - Chr3:86727204-86727223 MsG0380016701.01.T01:intron 50.0%
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GCAACCAAATCACAACCCTC+CGG + Chr3:86724403-86724422 None:intergenic 50.0%
GCAGAAAATGGGTGACCCAA+CGG - Chr3:86723818-86723837 MsG0380016701.01.T01:three_prime_UTR 50.0%
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TCATGAGCTTGCCTCCTACT+GGG + Chr3:86725342-86725361 None:intergenic 50.0%
TCATTCTTACGGCCTGTCAG+AGG - Chr3:86727258-86727277 MsG0380016701.01.T01:intron 50.0%
TGAGAGAACCTTACCCACCT+AGG + Chr3:86726589-86726608 None:intergenic 50.0%
TGATGTCCGTATGACCCAGT+AGG - Chr3:86725325-86725344 MsG0380016701.01.T01:intron 50.0%
TTCATGAGCTTGCCTCCTAC+TGG + Chr3:86725343-86725362 None:intergenic 50.0%
TTGCCTCCTACTGGGTCATA+CGG + Chr3:86725334-86725353 None:intergenic 50.0%
! ATTGCTAGTTTGGGTGCAGC+AGG - Chr3:86724602-86724621 MsG0380016701.01.T01:intron 50.0%
! GGGATTTTCTGACCTCTGAC+AGG + Chr3:86727273-86727292 None:intergenic 50.0%
!! GGTTGTGATTTGGTTGCTGC+TGG - Chr3:86724406-86724425 MsG0380016701.01.T01:intron 50.0%
!!! GAGCACTTGCTGTGGCATTT+TGG - Chr3:86724428-86724447 MsG0380016701.01.T01:intron 50.0%
CGTCTTCAACGCTCACCGTT+GGG + Chr3:86723836-86723855 None:intergenic 55.0%
TCGTCTTCAACGCTCACCGT+TGG + Chr3:86723837-86723856 None:intergenic 55.0%
TGGGTCTGCTAGCCCTACTA+CGG + Chr3:86725780-86725799 None:intergenic 55.0%
TGTCCGTATGACCCAGTAGG+AGG - Chr3:86725328-86725347 MsG0380016701.01.T01:intron 55.0%
!! TCAGGCATCGTTGATTCCGG+TGG - Chr3:86724036-86724055 MsG0380016701.01.T01:CDS 55.0%
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CTCTGATGGCAGTGAAGGCG+AGG + Chr3:86728011-86728030 None:intergenic 60.0%
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GGGTCTGCTAGCCCTACTAC+GGG + Chr3:86725779-86725798 None:intergenic 60.0%
TGTAGGTTTCGCGTGCCGGA+GGG - Chr3:86724385-86724404 MsG0380016701.01.T01:intron 60.0%
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! TGCTGCTGGAGCACTTGCTG+TGG - Chr3:86724420-86724439 MsG0380016701.01.T01:intron 60.0%
! TTGGGTGCAGCAGGAGGTGT+GGG - Chr3:86724611-86724630 MsG0380016701.01.T01:intron 60.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr3 gene 86723802 86728294 86723802 ID=MsG0380016701.01;Name=MsG0380016701.01
Chr3 mRNA 86723802 86728294 86723802 ID=MsG0380016701.01.T01;Parent=MsG0380016701.01;Name=MsG0380016701.01.T01;_AED=0.39;_eAED=0.45;_QI=0|0|0.11|1|0.62|0.77|9|199|306
Chr3 exon 86723802 86724093 86723802 ID=MsG0380016701.01.T01:exon:22018;Parent=MsG0380016701.01.T01
Chr3 exon 86724605 86724626 86724605 ID=MsG0380016701.01.T01:exon:22017;Parent=MsG0380016701.01.T01
Chr3 exon 86724817 86725013 86724817 ID=MsG0380016701.01.T01:exon:22016;Parent=MsG0380016701.01.T01
Chr3 exon 86726634 86726749 86726634 ID=MsG0380016701.01.T01:exon:22015;Parent=MsG0380016701.01.T01
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Chr3 exon 86727381 86727496 86727381 ID=MsG0380016701.01.T01:exon:22013;Parent=MsG0380016701.01.T01
Chr3 exon 86727602 86727706 86727602 ID=MsG0380016701.01.T01:exon:22012;Parent=MsG0380016701.01.T01
Chr3 exon 86727970 86728117 86727970 ID=MsG0380016701.01.T01:exon:22011;Parent=MsG0380016701.01.T01
Chr3 exon 86728268 86728294 86728268 ID=MsG0380016701.01.T01:exon:22010;Parent=MsG0380016701.01.T01
Chr3 CDS 86728268 86728294 86728268 ID=MsG0380016701.01.T01:cds;Parent=MsG0380016701.01.T01
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Chr3 CDS 86724817 86725013 86724817 ID=MsG0380016701.01.T01:cds;Parent=MsG0380016701.01.T01
Chr3 CDS 86724605 86724626 86724605 ID=MsG0380016701.01.T01:cds;Parent=MsG0380016701.01.T01
Chr3 CDS 86724001 86724093 86724001 ID=MsG0380016701.01.T01:cds;Parent=MsG0380016701.01.T01
Chr3 three_prime_UTR 86723802 86724000 86723802 ID=MsG0380016701.01.T01:three_prime_utr;Parent=MsG0380016701.01.T01
Gene Sequence

>MsG0380016701.01.T01

ATGGAAGCACTTTTGTGCAGAAAATGGATTCTTGGAAAGTACCAGGAGAAACCTCCTTTGCCATTCATTCCTGGATCAGATTTTTCAGGCATCGTTGATTCCGGTGGTTCCAATGTTACCAATTTCCGTGTTGGTGATCTGTTTGTTCCTTTGCTGCTCTTGGATCTTATGCTCAGTTTCGCGTGCCGGAGGGTTGTGATTTGGTTGCTGCTGGAGCACTTGCTGTGGCATTTTGGCACTTCACATGTTGGACTTGTTCATAGAGCTCAGTTGAAATCTGGTATTGCTAGTTTGGGTGCAGCAGGAGGTGTGGGTCTTGCAGCTGTGCAAATTGGAAAAGCATGTGGGGCTATTGTCATTGCTGTGCTAGGTACTCTTCTGCTTTGTATTGTGCGCTTGGAGTTGAGTGTTTCTTGTTTGCATAATCTGTTTTGGGGAGCTGAAAAGGTGCAGCTCTTGAAATCAATGGGTGTTGATCATGTGGTGGACTTGGGAGGCAAGCTCATGAAAGAATCTTTGCGGCTTCTGAACATGGGGAGCGAACATTCTAATAATTGGGTTTGCAAGTGGAGAAATTCTGTCATCCCTGCTAACATAGCTCTTGTTAAGCTGGAAGTAATTGTGCTTATTTTTCCTTTTTGTTTGTTAAAATCACTCTGGCAGAATTGGACAGTACATGGACTTTATTGGGGTAGTTACAAAATACATCGCCCAGCTGTTCTTGAAGATTCTCTCAAGGAGCTACTGTCTTGGTTGGCAAAAGGCTTGATTTCCGTTCACATTCTCATTCTTACGGCCTGTCAGAGCATGTTTACTGGCCTTGTTCAGGCCAACCTCGCCTTCACTGCCATCAGAGATAGGAAAGCTATAGGGAAGGTGATGATTGTATTCGATGAGAAAATTACAAGATCTAAGCTGTGA

Protein sequence

>MsG0380016701.01.T01

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