AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0480018187.01

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MsG0480018187.01.T01 AT4G38230 37.638 271 151 8 1 260 56 319 2.82e-44 162
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MsG0480018187.01.T01 AT4G04740 37.945 253 143 7 13 256 83 330 7.70e-44 160
MsG0480018187.01.T01 AT4G04740 37.945 253 143 7 13 256 83 330 7.70e-44 160
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MsG0480018187.01.T01 AT1G49180 31.349 252 157 7 5 246 13 258 3.48e-31 124
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MsG0480018187.01.T01 AT4G38470 35.323 201 121 5 2 200 293 486 6.25e-29 119
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MsG0480018187.01.T01 AT4G38470 35.149 202 122 5 1 200 292 486 1.15e-28 119
MsG0480018187.01.T01 AT5G50860 27.564 312 187 9 5 283 120 425 2.90e-28 117
MsG0480018187.01.T01 AT5G50860 27.707 314 184 10 5 283 120 425 4.92e-28 117
MsG0480018187.01.T01 AT1G53570 30.651 261 167 9 2 254 217 471 9.37e-28 115
MsG0480018187.01.T01 AT1G53570 30.651 261 167 9 2 254 217 471 1.03e-27 115
MsG0480018187.01.T01 AT1G53050 33.645 214 133 5 5 213 140 349 1.11e-27 116
MsG0480018187.01.T01 AT1G53050 33.645 214 133 5 5 213 140 349 1.11e-27 116
MsG0480018187.01.T01 AT5G58140 28.996 269 160 5 3 241 581 848 1.14e-27 116
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MsG0480018187.01.T01 AT3G05840 27.986 293 157 12 3 253 77 357 2.27e-20 93.2
MsG0480018187.01.T01 AT5G61560 32.212 208 116 9 5 195 454 653 2.29e-20 94.4
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MsG0480018187.01.T01 AT1G18390 33.668 199 116 8 3 193 342 532 2.42e-20 94.4
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MsG0480018187.01.T01 AT5G61560 32.212 208 116 9 5 195 435 634 2.42e-20 94.4
MsG0480018187.01.T01 AT1G09600 32.394 213 137 5 5 213 169 378 2.48e-20 94.4
MsG0480018187.01.T01 AT3G46930 30.435 207 127 8 2 200 108 305 2.56e-20 92.0
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MsG0480018187.01.T01 AT1G10210 28.767 292 159 9 3 253 36 319 2.69e-20 92.4
MsG0480018187.01.T01 AT1G10210 28.767 292 159 9 3 253 36 319 2.69e-20 92.4
MsG0480018187.01.T01 AT2G30980 29.010 293 154 13 3 253 76 356 2.94e-20 92.8
MsG0480018187.01.T01 AT5G11850 29.412 255 166 9 1 248 611 858 2.99e-20 94.4
MsG0480018187.01.T01 AT1G70110 29.703 202 131 5 3 198 348 544 3.13e-20 94.0
MsG0480018187.01.T01 AT3G06630 33.880 183 106 5 1 176 436 610 3.37e-20 93.6
MsG0480018187.01.T01 AT4G26070 24.080 299 189 8 3 286 72 347 3.40e-20 92.0
MsG0480018187.01.T01 AT4G26070 24.080 299 189 8 3 286 72 347 3.40e-20 92.0
MsG0480018187.01.T01 AT2G01450 28.283 297 164 10 1 254 18 308 3.78e-20 93.2
MsG0480018187.01.T01 AT2G01450 28.283 297 164 10 1 254 18 308 3.78e-20 93.2
MsG0480018187.01.T01 AT2G01450 28.283 297 164 10 1 254 18 308 3.78e-20 93.2
MsG0480018187.01.T01 AT2G01450 28.283 297 164 10 1 254 18 308 3.78e-20 93.2
MsG0480018187.01.T01 AT3G61160 29.210 291 138 13 4 245 107 378 4.98e-20 91.7
MsG0480018187.01.T01 AT5G38280 28.634 227 144 6 4 222 336 552 6.56e-20 92.8
MsG0480018187.01.T01 AT5G38280 28.634 227 144 6 4 222 336 552 7.06e-20 92.8
MsG0480018187.01.T01 AT3G46930 30.435 207 127 8 2 200 204 401 7.32e-20 91.7
MsG0480018187.01.T01 AT1G18150 28.912 294 160 10 3 253 108 395 7.56e-20 92.4
MsG0480018187.01.T01 AT1G18150 28.912 294 160 10 3 253 108 395 7.56e-20 92.4
MsG0480018187.01.T01 AT1G18150 28.912 294 160 10 3 253 108 395 7.56e-20 92.4
MsG0480018187.01.T01 AT1G67580 27.551 294 162 8 5 254 412 698 7.89e-20 92.8
MsG0480018187.01.T01 AT1G67580 27.551 294 162 8 5 254 412 698 7.89e-20 92.8
MsG0480018187.01.T01 AT3G46930 30.435 207 127 8 2 200 204 401 8.15e-20 91.7
MsG0480018187.01.T01 AT1G53570 27.969 261 148 9 2 254 217 445 8.18e-20 92.4
MsG0480018187.01.T01 AT5G39030 32.599 227 134 7 4 222 497 712 8.29e-20 92.8
MsG0480018187.01.T01 AT1G18160 30.196 255 158 9 5 249 721 965 8.94e-20 92.8
MsG0480018187.01.T01 AT5G39030 32.599 227 134 7 4 222 503 718 8.95e-20 92.8
MsG0480018187.01.T01 AT3G46930 30.435 207 127 8 2 200 169 366 9.42e-20 91.3
MsG0480018187.01.T01 AT3G46930 30.435 207 127 8 2 200 204 401 1.27e-19 91.7
MsG0480018187.01.T01 AT5G19010 31.308 214 131 7 3 205 29 237 1.41e-19 91.7
MsG0480018187.01.T01 AT3G46930 30.435 207 127 8 2 200 169 366 1.47e-19 91.3
MsG0480018187.01.T01 AT5G64960 30.594 219 129 6 5 203 32 247 1.81e-19 91.3
MsG0480018187.01.T01 AT1G24030 30.500 200 129 4 4 195 67 264 2.00e-19 88.6
MsG0480018187.01.T01 AT4G12020 22.266 256 170 5 2 252 1629 1860 2.01e-19 92.0
MsG0480018187.01.T01 AT1G69220 28.641 206 134 5 7 207 230 427 2.05e-19 91.7
MsG0480018187.01.T01 AT4G12020 22.266 256 170 5 2 252 1621 1852 2.18e-19 92.0
MsG0480018187.01.T01 AT2G38620 28.139 231 139 7 5 213 10 235 2.23e-19 87.8
MsG0480018187.01.T01 AT2G38620 28.139 231 139 7 5 213 10 235 2.23e-19 87.8

Find 93 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 112 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
GACCTCAAGGTCTCCGATTT+TGG 0.126420 4:-1338369 MsG0480018187.01.T01:CDS
CTCTTTCTTTATCACCTTGA+TGG 0.199409 4:+1338692 None:intergenic
ATCTCGAATGCATTATAAAA+AGG 0.266054 4:+1337862 None:intergenic
CCATCCTCTCGGCGTTGTTC+TGG 0.287617 4:+1338333 None:intergenic
TTCAATACTCAAATTCTTCA+TGG 0.289683 4:+1337978 None:intergenic
AAGTTAAATTTGAAGATAAC+AGG 0.292267 4:-1337712 MsG0480018187.01.T01:CDS
GGTTTCACCATTACCAATTC+AGG 0.302198 4:+1337892 None:intergenic
GCTTGTGGAGAAATCCATTC+AGG 0.310989 4:+1338114 None:intergenic
CTTCACTCAAAGATATTGTT+TGG 0.330687 4:-1337519 MsG0480018187.01.T01:CDS
AATATTGATTTCAATGAGAT+TGG 0.343630 4:-1337937 MsG0480018187.01.T01:CDS
ATTCTTTATGCTTTACTTTG+TGG 0.355541 4:-1338207 MsG0480018187.01.T01:CDS
CTTGTAGTGGAATATGTAAA+AGG 0.355691 4:-1338549 MsG0480018187.01.T01:CDS
GGCGCGAAGGAGGGGAGAAA+GGG 0.363081 4:-1337661 MsG0480018187.01.T01:CDS
ATGGTTCTAAAGCTGATTTA+TGG 0.371569 4:-1338242 MsG0480018187.01.T01:CDS
GCGCGAAGGAGGGGAGAAAG+GGG 0.374013 4:-1337660 MsG0480018187.01.T01:CDS
ATGATCCTTGGTTTCGAGTT+GGG 0.381060 4:-1338023 MsG0480018187.01.T01:CDS
GGGCGCGAAGGAGGGGAGAA+AGG 0.381206 4:-1337662 MsG0480018187.01.T01:CDS
ACCTCAGGTGCCACGTAAGC+AGG 0.391539 4:+1338285 None:intergenic
TCTTTGAGTTCAACGATATG+AGG 0.399241 4:+1338600 None:intergenic
GAAGGAGTTTGTGGTGAGAA+TGG 0.411279 4:-1337686 MsG0480018187.01.T01:CDS
CGTTGAACTCAAAGAAGTTA+TGG 0.412310 4:-1338592 MsG0480018187.01.T01:CDS
TGATGTTGATATTCCTGAAT+TGG 0.415157 4:-1337905 MsG0480018187.01.T01:CDS
GTTTGTTTGAGACGAGGAAG+AGG 0.427128 4:-1337804 MsG0480018187.01.T01:CDS
AAAGCTGATTTATGGTCTTG+TGG 0.435090 4:-1338234 MsG0480018187.01.T01:CDS
AAGCTGATTTATGGTCTTGT+GGG 0.436886 4:-1338233 MsG0480018187.01.T01:CDS
AACTCAACCACTGCCACCTC+TGG 0.437622 4:+1337601 None:intergenic
AACAGGGAAGAAGGAGTTTG+TGG 0.439382 4:-1337695 MsG0480018187.01.T01:CDS
CCTTTCTTCTTCAAAACCTC+AGG 0.441408 4:+1338270 None:intergenic
CAATGTGTCTCCACCACACT+TGG 0.442770 4:+1337576 None:intergenic
TATACTAGTTGTTACTATTG+AGG 0.444821 4:+1337463 None:intergenic
TCAAAGATATTGTTTGGAGT+TGG 0.453220 4:-1337513 MsG0480018187.01.T01:CDS
GATGTGTGACACCACGACTA+TGG 0.467124 4:+1338433 None:intergenic
TATGAGATGGGTAAAGTCTT+GGG 0.467694 4:-1338774 None:intergenic
TTTGAAGATAACAGGGAAGA+AGG 0.468894 4:-1337704 MsG0480018187.01.T01:CDS
AGAATGGAGGGCGCGAAGGA+GGG 0.470560 4:-1337670 MsG0480018187.01.T01:CDS
ATATGAGATGGGTAAAGTCT+TGG 0.471466 4:-1338775 None:intergenic
TTGAAGAAGAAAGGTTATGA+TGG 0.472429 4:-1338261 MsG0480018187.01.T01:CDS
ATAACATTCTCACCTTGAAA+AGG 0.482097 4:+1338177 None:intergenic
AATGATCCTTGGTTTCGAGT+TGG 0.485875 4:-1338024 MsG0480018187.01.T01:CDS
GAATGGAGGGCGCGAAGGAG+GGG 0.486635 4:-1337669 MsG0480018187.01.T01:CDS
GAGAATGGAGGGCGCGAAGG+AGG 0.491382 4:-1337671 MsG0480018187.01.T01:CDS
CAACGCCGAGAGTCCAAAAT+CGG 0.494547 4:+1338356 None:intergenic
GATGACAATGGAGGTATTTG+AGG 0.499005 4:-1337629 MsG0480018187.01.T01:CDS
ATTCTTCATGGAAAATGCAA+TGG 0.501942 4:+1337990 None:intergenic
TTCTTCATGGAAAATGCAAT+GGG 0.507087 4:+1337991 None:intergenic
CCAGAACAACGCCGAGAGGA+TGG 0.509158 4:-1338333 MsG0480018187.01.T01:CDS
TTCAAGGTGAGAATGTTATG+AGG 0.509620 4:-1338173 MsG0480018187.01.T01:CDS
GTGTGGAACCCCTGCTTACG+TGG 0.510570 4:-1338295 MsG0480018187.01.T01:CDS
GGAGTTTGTGGTGAGAATGG+AGG 0.513334 4:-1337683 MsG0480018187.01.T01:CDS
CAAAGAAGTTATGGCAACAA+AGG 0.524591 4:-1338583 MsG0480018187.01.T01:CDS
GGTGGCACCAGAGGTGGCAG+TGG 0.525755 4:-1337608 MsG0480018187.01.T01:CDS
AAAGAAGTTATGGCAACAAA+GGG 0.532839 4:-1338582 MsG0480018187.01.T01:CDS
CCCTGCTTACGTGGCACCTG+AGG 0.534856 4:-1338286 MsG0480018187.01.T01:CDS
TTGATATTATGAATGATCCT+TGG 0.535138 4:-1338035 MsG0480018187.01.T01:CDS
CCTCAGGTGCCACGTAAGCA+GGG 0.539447 4:+1338286 None:intergenic
GATATTGTTTGGAGTTGGCA+AGG 0.541128 4:-1337508 MsG0480018187.01.T01:CDS
AAATGAGAGTGTAGCCATCA+AGG 0.545380 4:-1338706 MsG0480018187.01.T01:CDS
TGATATTCCTGAATTGGTAA+TGG 0.547131 4:-1337899 MsG0480018187.01.T01:CDS
GTGAATACGAGTTTCCTGAA+TGG 0.548675 4:-1338128 MsG0480018187.01.T01:CDS
CTCTTCAACAAGTTGGCGAA+AGG 0.553378 4:-1338519 MsG0480018187.01.T01:CDS
CAGAACAACGCCGAGAGGAT+GGG 0.558188 4:-1338332 MsG0480018187.01.T01:CDS
AACAATGTTGGAGAAACTTG+AGG 0.560233 4:-1337746 MsG0480018187.01.T01:CDS
CTTTGAGTTCAACGATATGA+GGG 0.562107 4:+1338601 None:intergenic
AGTTAAATTTGAAGATAACA+GGG 0.562468 4:-1337711 MsG0480018187.01.T01:CDS
CAAGTGTGGTGGAGACACAT+TGG 0.570490 4:-1337575 MsG0480018187.01.T01:CDS
AGATGAAAACGAAGACCTCA+AGG 0.571534 4:-1338382 MsG0480018187.01.T01:CDS
AACTTTGATATAAACATCGA+TGG 0.579328 4:+1337778 None:intergenic
ATTTGAGGTGGCACCAGAGG+TGG 0.580205 4:-1337614 MsG0480018187.01.T01:CDS
GAGTTTGTGGTGAGAATGGA+GGG 0.583500 4:-1337682 MsG0480018187.01.T01:CDS
GGTATTTGAGGTGGCACCAG+AGG 0.588422 4:-1337617 MsG0480018187.01.T01:CDS
AGGTGAACTCTTCAACAAGT+TGG 0.601185 4:-1338526 MsG0480018187.01.T01:CDS
GGTGAGAATGGAGGGCGCGA+AGG 0.601837 4:-1337674 MsG0480018187.01.T01:CDS
GGGTCAAGGAAACTTTGCAA+AGG 0.602169 4:-1338754 MsG0480018187.01.T01:CDS
GTTGGAGAAACTTGAGGTGA+TGG 0.607494 4:-1337740 MsG0480018187.01.T01:CDS
ATGGGTAAAGTCTTGGGTCA+AGG 0.610035 4:-1338768 MsG0480018187.01.T01:CDS
TTAAAAGCATCCCATCCTCT+CGG 0.614217 4:+1338322 None:intergenic
CAAACAATATCTTTGAGTGA+AGG 0.615958 4:+1337520 None:intergenic
ATAATTTCATCGTTGTCACA+TGG 0.618650 4:-1337841 MsG0480018187.01.T01:CDS
GAATTTGAGTATTGAAGACA+AGG 0.619832 4:-1337971 MsG0480018187.01.T01:CDS
GGGGAAAGTCGCGATGACAA+TGG 0.619873 4:-1337641 MsG0480018187.01.T01:CDS
GTAGTGGAATATGTAAAAGG+AGG 0.620421 4:-1338546 MsG0480018187.01.T01:CDS
TCAAGGTGATAAAGAAAGAG+AGG 0.623856 4:-1338689 MsG0480018187.01.T01:CDS
GACAATGGAGGTATTTGAGG+TGG 0.631581 4:-1337626 MsG0480018187.01.T01:CDS
CTCAGGTGCCACGTAAGCAG+GGG 0.634429 4:+1338287 None:intergenic
GTCCAAAATCGGAGACCTTG+AGG 0.640264 4:+1338367 None:intergenic
AGCTGATTTATGGTCTTGTG+GGG 0.641888 4:-1338232 MsG0480018187.01.T01:CDS
ACGTAAGCAGGGGTTCCACA+CGG 0.652347 4:+1338297 None:intergenic
ACAAACCCAACTCGAAACCA+AGG 0.661686 4:+1338018 None:intergenic
TGAGTTCAACGATATGAGGG+TGG 0.662156 4:+1338604 None:intergenic
TTAGAAGTTTGTTTGAGACG+AGG 0.665373 4:-1337810 MsG0480018187.01.T01:CDS
GAAAGTCGCGATGACAATGG+AGG 0.674912 4:-1337638 MsG0480018187.01.T01:CDS
GTTGCCAGAACAACGCCGAG+AGG 0.731380 4:-1338337 MsG0480018187.01.T01:CDS
GGAGTATGTTAAGATGTGTG+AGG 0.751180 4:-1337554 MsG0480018187.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!! AAGTTAAATTTGAAGATAAC+AGG - Chr4:1338533-1338552 MsG0480018187.01.T01:CDS 20.0%
!! AGTTAAATTTGAAGATAACA+GGG - Chr4:1338534-1338553 MsG0480018187.01.T01:CDS 20.0%
!!! AATATTGATTTCAATGAGAT+TGG - Chr4:1338308-1338327 MsG0480018187.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATTTATAGAAAGACTTTTAG+AGG - Chr4:1338095-1338114 MsG0480018187.01.T01:CDS 20.0%
!!! GATGTTTATATCAAAGTTTT+CGG - Chr4:1338472-1338491 MsG0480018187.01.T01:CDS 20.0%
! AACTTTGATATAAACATCGA+TGG + Chr4:1338470-1338489 None:intergenic 25.0%
! ATCTCGAATGCATTATAAAA+AGG + Chr4:1338386-1338405 None:intergenic 25.0%
! ATTCTTTATGCTTTACTTTG+TGG - Chr4:1338038-1338057 MsG0480018187.01.T01:CDS 25.0%
! TTCAATACTCAAATTCTTCA+TGG + Chr4:1338270-1338289 None:intergenic 25.0%
! TTGATATTATGAATGATCCT+TGG - Chr4:1338210-1338229 MsG0480018187.01.T01:CDS 25.0%
!! ACAATTGAATACCTCTTTTT+AGG + Chr4:1338191-1338210 None:intergenic 25.0%
!!! GAAATCAAAATTTTAGCTTG+TGG + Chr4:1338149-1338168 None:intergenic 25.0%
!!! TTTCTGAAAGGTTTTTACAA+TGG + Chr4:1337521-1337540 None:intergenic 25.0%
AAAGAAGTTATGGCAACAAA+GGG - Chr4:1337663-1337682 MsG0480018187.01.T01:CDS 30.0%
ATAACATTCTCACCTTGAAA+AGG + Chr4:1338071-1338090 None:intergenic 30.0%
ATAATTTCATCGTTGTCACA+TGG - Chr4:1338404-1338423 MsG0480018187.01.T01:CDS 30.0%
ATTCTTCATGGAAAATGCAA+TGG + Chr4:1338258-1338277 None:intergenic 30.0%
CAAACAATATCTTTGAGTGA+AGG + Chr4:1338728-1338747 None:intergenic 30.0%
CTTCACTCAAAGATATTGTT+TGG - Chr4:1338726-1338745 MsG0480018187.01.T01:CDS 30.0%
TGATATTCCTGAATTGGTAA+TGG - Chr4:1338346-1338365 MsG0480018187.01.T01:CDS 30.0%
TGATGTTGATATTCCTGAAT+TGG - Chr4:1338340-1338359 MsG0480018187.01.T01:CDS 30.0%
TTCTTCATGGAAAATGCAAT+GGG + Chr4:1338257-1338276 None:intergenic 30.0%
TTGAAGAAGAAAGGTTATGA+TGG - Chr4:1337984-1338003 MsG0480018187.01.T01:CDS 30.0%
! CTTGTAGTGGAATATGTAAA+AGG - Chr4:1337696-1337715 MsG0480018187.01.T01:CDS 30.0%
! TCAAAGATATTGTTTGGAGT+TGG - Chr4:1338732-1338751 MsG0480018187.01.T01:CDS 30.0%
! TCATCTAAGAGTAGATTTTC+TGG + Chr4:1337849-1337868 None:intergenic 30.0%
!! ATGGTTCTAAAGCTGATTTA+TGG - Chr4:1338003-1338022 MsG0480018187.01.T01:CDS 30.0%
!! GAATTTGAGTATTGAAGACA+AGG - Chr4:1338274-1338293 MsG0480018187.01.T01:CDS 30.0%
AACAATGTTGGAGAAACTTG+AGG - Chr4:1338499-1338518 MsG0480018187.01.T01:CDS 35.0%
ACGACTATGGCAAAAATCTA+CGG + Chr4:1337802-1337821 None:intergenic 35.0%
CAAAGAAGTTATGGCAACAA+AGG - Chr4:1337662-1337681 MsG0480018187.01.T01:CDS 35.0%
CGTTGAACTCAAAGAAGTTA+TGG - Chr4:1337653-1337672 MsG0480018187.01.T01:CDS 35.0%
CTCTTTCTTTATCACCTTGA+TGG + Chr4:1337556-1337575 None:intergenic 35.0%
GCATTATAAAAAGGACGAGA+CGG + Chr4:1338377-1338396 None:intergenic 35.0%
GGGAAAAATCTTTCTTGTAG+TGG - Chr4:1337683-1337702 MsG0480018187.01.T01:CDS 35.0%
TCAAGGTGATAAAGAAAGAG+AGG - Chr4:1337556-1337575 MsG0480018187.01.T01:CDS 35.0%
TTCAAGGTGAGAATGTTATG+AGG - Chr4:1338072-1338091 MsG0480018187.01.T01:CDS 35.0%
TTGTTCCTGATCCTAAAAAG+AGG - Chr4:1338177-1338196 MsG0480018187.01.T01:CDS 35.0%
TTTGAAGATAACAGGGAAGA+AGG - Chr4:1338541-1338560 MsG0480018187.01.T01:CDS 35.0%
! AAAGCTGATTTATGGTCTTG+TGG - Chr4:1338011-1338030 MsG0480018187.01.T01:CDS 35.0%
! CTACACTCTCATTTTCTGAA+AGG + Chr4:1337533-1337552 None:intergenic 35.0%
! CTTTGAGTTCAACGATATGA+GGG + Chr4:1337647-1337666 None:intergenic 35.0%
! GTAGTGGAATATGTAAAAGG+AGG - Chr4:1337699-1337718 MsG0480018187.01.T01:CDS 35.0%
! TCTTTGAGTTCAACGATATG+AGG + Chr4:1337648-1337667 None:intergenic 35.0%
! TGTGGATATCTTCCTTTTCA+AGG - Chr4:1338056-1338075 MsG0480018187.01.T01:CDS 35.0%
! TTAGAAGTTTGTTTGAGACG+AGG - Chr4:1338435-1338454 MsG0480018187.01.T01:CDS 35.0%
!! AAGCTGATTTATGGTCTTGT+GGG - Chr4:1338012-1338031 MsG0480018187.01.T01:CDS 35.0%
!!! GAATACCTCTTTTTAGGATC+AGG + Chr4:1338185-1338204 None:intergenic 35.0%
AAGAGAGGCTGAAAAAAGAG+AGG - Chr4:1337571-1337590 MsG0480018187.01.T01:CDS 40.0%
AGATGAAAACGAAGACCTCA+AGG - Chr4:1337863-1337882 MsG0480018187.01.T01:CDS 40.0%
AGGTGAACTCTTCAACAAGT+TGG - Chr4:1337719-1337738 MsG0480018187.01.T01:CDS 40.0%
CCTTTCTTCTTCAAAACCTC+AGG + Chr4:1337978-1337997 None:intergenic 40.0%
GGAGTATGTTAAGATGTGTG+AGG - Chr4:1338691-1338710 MsG0480018187.01.T01:CDS 40.0%
GGTTTCACCATTACCAATTC+AGG + Chr4:1338356-1338375 None:intergenic 40.0%
GTGAATACGAGTTTCCTGAA+TGG - Chr4:1338117-1338136 MsG0480018187.01.T01:CDS 40.0%
! AAATGAGAGTGTAGCCATCA+AGG - Chr4:1337539-1337558 MsG0480018187.01.T01:CDS 40.0%
! AATGATCCTTGGTTTCGAGT+TGG - Chr4:1338221-1338240 MsG0480018187.01.T01:CDS 40.0%
! GATATTGTTTGGAGTTGGCA+AGG - Chr4:1338737-1338756 MsG0480018187.01.T01:CDS 40.0%
! GTAGATTTTTGCCATAGTCG+TGG - Chr4:1337801-1337820 MsG0480018187.01.T01:CDS 40.0%
! GTTTTCGGCTTCAACAATGT+TGG - Chr4:1338487-1338506 MsG0480018187.01.T01:CDS 40.0%
!! AGCTGATTTATGGTCTTGTG+GGG - Chr4:1338013-1338032 MsG0480018187.01.T01:CDS 40.0%
!! ATGATCCTTGGTTTCGAGTT+GGG - Chr4:1338222-1338241 MsG0480018187.01.T01:CDS 40.0%
!! GATGACAATGGAGGTATTTG+AGG - Chr4:1338616-1338635 MsG0480018187.01.T01:CDS 40.0%
!! TTAAAAGCATCCCATCCTCT+CGG + Chr4:1337926-1337945 None:intergenic 40.0%
!!! CCTGAGGTTTTGAAGAAGAA+AGG - Chr4:1337975-1337994 MsG0480018187.01.T01:CDS 40.0%
AACAGGGAAGAAGGAGTTTG+TGG - Chr4:1338550-1338569 MsG0480018187.01.T01:CDS 45.0%
ACAAACCCAACTCGAAACCA+AGG + Chr4:1338230-1338249 None:intergenic 45.0%
ATGGGTAAAGTCTTGGGTCA+AGG - Chr4:1337477-1337496 MsG0480018187.01.T01:CDS 45.0%
GAAGGAGTTTGTGGTGAGAA+TGG - Chr4:1338559-1338578 MsG0480018187.01.T01:CDS 45.0%
GAGTTTGTGGTGAGAATGGA+GGG - Chr4:1338563-1338582 MsG0480018187.01.T01:CDS 45.0%
GCTTGTGGAGAAATCCATTC+AGG + Chr4:1338134-1338153 None:intergenic 45.0%
GGGTCAAGGAAACTTTGCAA+AGG - Chr4:1337491-1337510 MsG0480018187.01.T01:CDS 45.0%
GTTGGAGAAACTTGAGGTGA+TGG - Chr4:1338505-1338524 MsG0480018187.01.T01:CDS 45.0%
TGAGTTCAACGATATGAGGG+TGG + Chr4:1337644-1337663 None:intergenic 45.0%
! CTCTTCAACAAGTTGGCGAA+AGG - Chr4:1337726-1337745 MsG0480018187.01.T01:CDS 45.0%
! GTGGTTGAGTTTTCCAAGTG+TGG - Chr4:1338656-1338675 MsG0480018187.01.T01:CDS 45.0%
! GTTGAGTTTTCCAAGTGTGG+TGG - Chr4:1338659-1338678 MsG0480018187.01.T01:CDS 45.0%
! GTTTGTTTGAGACGAGGAAG+AGG - Chr4:1338441-1338460 MsG0480018187.01.T01:CDS 45.0%
!! GACAATGGAGGTATTTGAGG+TGG - Chr4:1338619-1338638 MsG0480018187.01.T01:CDS 45.0%
CAACGCCGAGAGTCCAAAAT+CGG + Chr4:1337892-1337911 None:intergenic 50.0%
CAATGTGTCTCCACCACACT+TGG + Chr4:1338672-1338691 None:intergenic 50.0%
GAAAGTCGCGATGACAATGG+AGG - Chr4:1338607-1338626 MsG0480018187.01.T01:CDS 50.0%
GAGGCTGAAAAAAGAGAGGC+TGG - Chr4:1337575-1337594 MsG0480018187.01.T01:CDS 50.0%
GATGTGTGACACCACGACTA+TGG + Chr4:1337815-1337834 None:intergenic 50.0%
GGAGTTTGTGGTGAGAATGG+AGG - Chr4:1338562-1338581 MsG0480018187.01.T01:CDS 50.0%
GTCCAAAATCGGAGACCTTG+AGG + Chr4:1337881-1337900 None:intergenic 50.0%
! CAAGTGTGGTGGAGACACAT+TGG - Chr4:1338670-1338689 MsG0480018187.01.T01:CDS 50.0%
! GACCTCAAGGTCTCCGATTT+TGG - Chr4:1337876-1337895 MsG0480018187.01.T01:CDS 50.0%
! GGTCTCCGATTTTGGACTCT+CGG - Chr4:1337884-1337903 MsG0480018187.01.T01:CDS 50.0%
!! GGGATGCTTTTAACTCCGTG+TGG - Chr4:1337933-1337952 MsG0480018187.01.T01:CDS 50.0%
AACTCAACCACTGCCACCTC+TGG + Chr4:1338647-1338666 None:intergenic 55.0%
ACGTAAGCAGGGGTTCCACA+CGG + Chr4:1337951-1337970 None:intergenic 55.0%
CAGAACAACGCCGAGAGGAT+GGG - Chr4:1337913-1337932 MsG0480018187.01.T01:CDS 55.0%
GGGGAAAGTCGCGATGACAA+TGG - Chr4:1338604-1338623 MsG0480018187.01.T01:CDS 55.0%
! ATTTGAGGTGGCACCAGAGG+TGG - Chr4:1338631-1338650 MsG0480018187.01.T01:CDS 55.0%
! GGTATTTGAGGTGGCACCAG+AGG - Chr4:1338628-1338647 MsG0480018187.01.T01:CDS 55.0%
CCAGAACAACGCCGAGAGGA+TGG - Chr4:1337912-1337931 MsG0480018187.01.T01:CDS 60.0%
CCATCCTCTCGGCGTTGTTC+TGG + Chr4:1337915-1337934 None:intergenic 60.0%
GTGTGGAACCCCTGCTTACG+TGG - Chr4:1337950-1337969 MsG0480018187.01.T01:CDS 60.0%
GTTGCCAGAACAACGCCGAG+AGG - Chr4:1337908-1337927 MsG0480018187.01.T01:CDS 60.0%
! ACCTCAGGTGCCACGTAAGC+AGG + Chr4:1337963-1337982 None:intergenic 60.0%
! AGAATGGAGGGCGCGAAGGA+GGG - Chr4:1338575-1338594 MsG0480018187.01.T01:CDS 60.0%
! CCTCAGGTGCCACGTAAGCA+GGG + Chr4:1337962-1337981 None:intergenic 60.0%
! CTCAGGTGCCACGTAAGCAG+GGG + Chr4:1337961-1337980 None:intergenic 60.0%
CCCTGCTTACGTGGCACCTG+AGG - Chr4:1337959-1337978 MsG0480018187.01.T01:CDS 65.0%
GCGCGAAGGAGGGGAGAAAG+GGG - Chr4:1338585-1338604 MsG0480018187.01.T01:CDS 65.0%
GGCGCGAAGGAGGGGAGAAA+GGG - Chr4:1338584-1338603 MsG0480018187.01.T01:CDS 65.0%
! GAATGGAGGGCGCGAAGGAG+GGG - Chr4:1338576-1338595 MsG0480018187.01.T01:CDS 65.0%
! GAGAATGGAGGGCGCGAAGG+AGG - Chr4:1338574-1338593 MsG0480018187.01.T01:CDS 65.0%
! GGTGAGAATGGAGGGCGCGA+AGG - Chr4:1338571-1338590 MsG0480018187.01.T01:CDS 65.0%
GGGCGCGAAGGAGGGGAGAA+AGG - Chr4:1338583-1338602 MsG0480018187.01.T01:CDS 70.0%
GGTGGCACCAGAGGTGGCAG+TGG - Chr4:1338637-1338656 MsG0480018187.01.T01:CDS 70.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr4 gene 1337477 1338790 1337477 ID=MsG0480018187.01;Name=MsG0480018187.01
Chr4 mRNA 1337477 1338790 1337477 ID=MsG0480018187.01.T01;Parent=MsG0480018187.01;Name=MsG0480018187.01.T01;_AED=0.49;_eAED=0.49;_QI=0|-1|0|1|-1|1|1|0|437
Chr4 exon 1337477 1338790 1337477 ID=MsG0480018187.01.T01:exon:921;Parent=MsG0480018187.01.T01
Chr4 CDS 1337477 1338790 1337477 ID=MsG0480018187.01.T01:cds;Parent=MsG0480018187.01.T01
Gene Sequence

>MsG0480018187.01.T01

ATGGGTAAAGTCTTGGGTCAAGGAAACTTTGCAAAGGTTTACCATTGTAAAAACCTTTCAGAAAATGAGAGTGTAGCCATCAAGGTGATAAAGAAAGAGAGGCTGAAAAAAGAGAGGCTGGTGAAGCAAATCAAGCGCGAAGTTTCAGTGATGCGTCTAGTTCGCCACCCTCATATCGTTGAACTCAAAGAAGTTATGGCAACAAAGGGAAAAATCTTTCTTGTAGTGGAATATGTAAAAGGAGGTGAACTCTTCAACAAGTTGGCGAAAGGAAAATTGAATGAAGATGTTGCTAGAAAGTACTTTCAGCAACTCATAAGTGCCGTAGATTTTTGCCATAGTCGTGGTGTCACACATCGCGATTTGAAACCAGAAAATCTACTCTTAGATGAAAACGAAGACCTCAAGGTCTCCGATTTTGGACTCTCGGCGTTGCCAGAACAACGCCGAGAGGATGGGATGCTTTTAACTCCGTGTGGAACCCCTGCTTACGTGGCACCTGAGGTTTTGAAGAAGAAAGGTTATGATGGTTCTAAAGCTGATTTATGGTCTTGTGGGGTAATTCTTTATGCTTTACTTTGTGGATATCTTCCTTTTCAAGGTGAGAATGTTATGAGGATTTATAGAAAGACTTTTAGAGGTGAATACGAGTTTCCTGAATGGATTTCTCCACAAGCTAAAATTTTGATTTCAAATCTTCTTGTTCCTGATCCTAAAAAGAGGTATTCAATTGTTGATATTATGAATGATCCTTGGTTTCGAGTTGGGTTTGTTAGACCCATTGCATTTTCCATGAAGAATTTGAGTATTGAAGACAAGGACAAAGATATTAATATTGATTTCAATGAGATTGGTGAAGATGATGATGTTGATATTCCTGAATTGGTAATGGTGAAACCGTCTCGTCCTTTTTATAATGCATTCGAGATAATTTCATCGTTGTCACATGGTTTTGATCTTAGAAGTTTGTTTGAGACGAGGAAGAGGTTGCCATCGATGTTTATATCAAAGTTTTCGGCTTCAACAATGTTGGAGAAACTTGAGGTGATGGCGAAGAAGTTAAATTTGAAGATAACAGGGAAGAAGGAGTTTGTGGTGAGAATGGAGGGCGCGAAGGAGGGGAGAAAGGGGAAAGTCGCGATGACAATGGAGGTATTTGAGGTGGCACCAGAGGTGGCAGTGGTTGAGTTTTCCAAGTGTGGTGGAGACACATTGGAGTATGTTAAGATGTGTGAGGAACAATTGAGACCTTCACTCAAAGATATTGTTTGGAGTTGGCAAGGTGACAATCATAATGATGATAATCCTCAATAG
Protein sequence

>MsG0480018187.01.T01

MGKVLGQGNFAKVYHCKNLSENESVAIKVIKKERLKKERLVKQIKREVSVMRLVRHPHIVELKEVMATKGKIFLVVEYVKGGELFNKLAKGKLNEDVARKYFQQLISAVDFCHSRGVTHRDLKPENLLLDENEDLKVSDFGLSALPEQRREDGMLLTPCGTPAYVAPEVLKKKGYDGSKADLWSCGVILYALLCGYLPFQGENVMRIYRKTFRGEYEFPEWISPQAKILISNLLVPDPKKRYSIVDIMNDPWFRVGFVRPIAFSMKNLSIEDKDKDINIDFNEIGEDDDVDIPELVMVKPSRPFYNAFEIISSLSHGFDLRSLFETRKRLPSMFISKFSASTMLEKLEVMAKKLNLKITGKKEFVVRMEGAKEGRKGKVAMTMEVFEVAPEVAVVEFSKCGGDTLEYVKMCEEQLRPSLKDIVWSWQGDNHNDDNPQ*