AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0480022067.01

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MsG0480022067.01.T01 AT4G03230 28.008 507 318 18 38 519 43 527 1.84e-47 182
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MsG0480022067.01.T01 AT4G23190 56.426 319 134 3 431 746 326 642 4.76e-117 368
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MsG0480022067.01.T01 AT4G23310 54.305 302 135 3 443 743 496 795 9.16e-109 351
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MsG0480022067.01.T01 AT4G11460 53.595 306 136 4 443 744 334 637 1.26e-104 337
MsG0480022067.01.T01 AT4G23300 53.420 307 138 3 443 746 341 645 2.83e-104 334
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MsG0480022067.01.T01 AT4G21410 51.327 339 151 6 442 769 344 679 6.74e-103 331
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MsG0480022067.01.T01 AT4G00340 32.600 773 403 28 33 727 27 759 4.76e-102 333
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MsG0480022067.01.T01 AT1G65790 63.830 94 33 1 449 542 513 605 2.42e-28 121
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MsG0480022067.01.T01 AT4G04570 54.153 301 131 4 443 743 336 629 1.45e-97 317
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MsG0480022067.01.T01 AT1G53440 48.852 305 152 4 425 727 636 938 3.20e-81 281
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MsG0480022067.01.T01 AT4G11900 30.673 639 323 19 5 544 8 625 2.22e-80 270
MsG0480022067.01.T01 AT5G40380 45.938 320 163 5 443 757 303 617 2.83e-80 270
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MsG0480022067.01.T01 AT1G56120 45.455 308 153 7 443 745 698 995 4.67e-74 261
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MsG0480022067.01.T01 AT4G28670 43.260 319 172 5 431 744 307 621 1.04e-72 249
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MsG0480022067.01.T01 AT4G11890 44.211 285 149 5 443 724 28 305 1.55e-67 227
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MsG0480022067.01.T01 AT5G40380 50.391 256 123 4 443 697 303 555 3.01e-67 233
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MsG0480022067.01.T01 AT5G18500 41.216 296 171 3 443 737 154 447 4.46e-67 230
MsG0480022067.01.T01 AT5G18500 41.216 296 171 3 443 737 154 447 4.46e-67 230
MsG0480022067.01.T01 AT5G18500 41.216 296 171 3 443 737 154 447 4.46e-67 230
MsG0480022067.01.T01 AT5G18500 41.216 296 171 3 443 737 154 447 4.46e-67 230
MsG0480022067.01.T01 AT2G37710 41.472 299 168 4 443 738 335 629 4.55e-67 235
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MsG0480022067.01.T01 AT5G03140 40.282 355 176 9 424 761 351 686 2.97e-66 233
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MsG0480022067.01.T01 AT1G68690 44.674 291 145 7 442 724 364 646 3.59e-66 233
MsG0480022067.01.T01 AT1G68690 45.172 290 143 7 442 723 364 645 5.40e-66 232
MsG0480022067.01.T01 AT4G23200 57.949 195 81 1 427 621 308 501 9.10e-66 227
MsG0480022067.01.T01 AT3G59110 41.611 298 166 5 443 737 178 470 1.02e-65 227
MsG0480022067.01.T01 AT3G17420 39.931 288 170 3 443 729 142 427 1.02e-65 226
MsG0480022067.01.T01 AT4G04500 60.894 179 69 1 443 621 333 510 1.08e-65 227
MsG0480022067.01.T01 AT4G04500 60.894 179 69 1 443 621 333 510 1.08e-65 227
MsG0480022067.01.T01 AT3G53810 41.176 289 162 5 443 727 335 619 3.38e-65 230
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MsG0480022067.01.T01 AT5G02800 40.767 287 168 2 443 727 61 347 6.37e-65 221
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MsG0480022067.01.T01 AT2G42960 42.759 290 159 4 443 729 171 456 2.21e-64 223
MsG0480022067.01.T01 AT2G42960 42.759 290 159 4 443 729 171 456 2.21e-64 223
MsG0480022067.01.T01 AT2G42960 42.759 290 159 4 443 729 171 456 2.21e-64 223
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MsG0480022067.01.T01 AT4G01330 40.559 286 167 3 443 727 150 433 3.51e-64 222
MsG0480022067.01.T01 AT1G26150 41.946 298 166 4 442 735 417 711 1.02e-63 228
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MsG0480022067.01.T01 AT1G56720 39.583 288 171 3 443 729 167 452 2.03e-63 220
MsG0480022067.01.T01 AT1G56720 39.583 288 171 3 443 729 167 452 2.03e-63 220
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MsG0480022067.01.T01 AT1G55200 40.418 287 167 4 442 727 366 649 2.12e-63 225
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MsG0480022067.01.T01 AT3G13690 39.735 302 178 4 442 742 398 696 5.08e-63 225
MsG0480022067.01.T01 AT3G24790 40.625 288 169 2 442 727 52 339 5.54e-63 216
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MsG0480022067.01.T01 AT3G45430 42.105 285 161 4 443 727 332 612 1.71e-62 222
MsG0480022067.01.T01 AT3G45430 42.105 285 161 4 443 727 332 612 1.71e-62 222
MsG0480022067.01.T01 AT1G07870 40.972 288 166 4 443 727 91 377 1.86e-62 219
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MsG0480022067.01.T01 AT3G16030 27.473 455 273 14 5 430 6 432 5.13e-32 133
MsG0480022067.01.T01 AT1G23540 39.456 294 161 5 443 727 359 644 6.90e-62 221
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MsG0480022067.01.T01 AT3G20530 45.455 231 124 1 442 670 69 299 1.80e-61 209
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MsG0480022067.01.T01 AT4G34440 37.730 326 175 8 448 757 305 618 1.25e-60 217
MsG0480022067.01.T01 AT5G38560 38.621 290 171 4 443 727 327 614 1.33e-60 217
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MsG0480022067.01.T01 AT5G18610 39.931 288 169 4 443 727 71 357 5.84e-60 211
MsG0480022067.01.T01 AT3G53380 34.492 374 215 8 397 758 333 688 5.90e-60 216
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MsG0480022067.01.T01 AT3G45410 39.667 300 177 4 443 742 330 625 1.02e-59 214
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MsG0480022067.01.T01 AT1G10620 37.667 300 170 5 443 733 358 649 3.37e-59 214
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MsG0480022067.01.T01 AT5G24080 35.811 148 81 5 36 182 42 176 6.04e-14 76.3
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MsG0480022067.01.T01 AT3G25560 42.034 295 156 7 439 727 297 582 6.68e-59 211
MsG0480022067.01.T01 AT3G25560 42.034 295 156 7 439 727 296 581 7.16e-59 212
MsG0480022067.01.T01 AT5G55830 38.567 293 176 3 443 732 353 644 9.99e-59 212
MsG0480022067.01.T01 AT4G13190 38.328 287 175 2 443 727 59 345 1.06e-58 204
MsG0480022067.01.T01 AT2G26290 37.377 305 182 4 440 737 73 375 1.56e-58 205
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MsG0480022067.01.T01 AT5G07280 39.375 320 174 9 416 724 876 1186 1.98e-58 216
MsG0480022067.01.T01 AT4G34500 38.889 288 171 4 443 727 133 418 2.85e-58 205
MsG0480022067.01.T01 AT4G33430 41.176 289 164 5 443 727 277 563 2.95e-58 209
MsG0480022067.01.T01 AT2G01820 38.511 309 180 7 431 731 561 867 4.02e-58 214
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MsG0480022067.01.T01 AT4G23210 55.495 182 78 2 443 624 348 526 1.37e-54 197
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MsG0480022067.01.T01 AT2G43690 36.054 294 179 5 443 733 325 612 6.91e-54 198
MsG0480022067.01.T01 AT5G47070 38.080 323 171 10 431 732 56 370 7.72e-54 192
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MsG0480022067.01.T01 AT5G60270 36.513 304 183 6 443 742 329 626 9.89e-54 197
MsG0480022067.01.T01 AT3G05140 38.908 293 160 8 443 728 179 459 1.07e-53 194
MsG0480022067.01.T01 AT5G11020 35.331 317 200 3 420 735 106 418 1.15e-53 192
MsG0480022067.01.T01 AT1G21230 35.395 291 186 2 437 727 390 678 1.22e-53 198
MsG0480022067.01.T01 AT1G16120 34.356 326 210 4 400 723 372 695 1.25e-53 198
MsG0480022067.01.T01 AT1G76370 36.585 287 179 3 443 727 63 348 1.29e-53 190
MsG0480022067.01.T01 AT5G60280 38.721 297 174 6 447 742 331 620 1.47e-53 197
MsG0480022067.01.T01 AT1G07570 37.377 305 169 8 439 727 52 350 1.52e-53 191
MsG0480022067.01.T01 AT1G07570 37.377 305 169 8 439 727 52 350 1.52e-53 191
MsG0480022067.01.T01 AT1G07570 37.377 305 169 8 439 727 52 350 1.52e-53 191
MsG0480022067.01.T01 AT1G07570 37.377 305 169 8 439 727 63 361 2.23e-53 191
MsG0480022067.01.T01 AT5G15080 35.690 297 175 4 443 727 130 422 2.32e-53 192
MsG0480022067.01.T01 AT1G76360 36.964 303 171 6 439 727 147 443 2.41e-53 192
MsG0480022067.01.T01 AT2G28590 42.373 236 130 3 443 677 86 316 2.67e-53 187
MsG0480022067.01.T01 AT5G16000 41.611 298 155 9 439 727 296 583 2.71e-53 196
MsG0480022067.01.T01 AT1G26970 37.621 311 172 9 440 736 68 370 3.00e-53 190
MsG0480022067.01.T01 AT1G74490 35.474 327 196 6 440 754 76 399 3.14e-53 190
MsG0480022067.01.T01 AT2G18470 43.925 214 117 3 443 656 272 482 3.95e-53 193
MsG0480022067.01.T01 AT5G35960 37.282 287 171 5 442 727 121 399 4.31e-53 190
MsG0480022067.01.T01 AT4G04960 46.919 211 109 3 448 656 340 549 5.02e-53 194
MsG0480022067.01.T01 AT3G45330 37.919 298 177 5 447 742 340 631 5.45e-53 196
MsG0480022067.01.T01 AT4G13190 42.791 215 122 1 443 656 59 273 6.18e-53 186
MsG0480022067.01.T01 AT5G35960 37.456 283 168 5 442 723 121 395 6.40e-53 189
MsG0480022067.01.T01 AT2G43700 35.616 292 183 3 443 733 300 587 7.22e-53 194
MsG0480022067.01.T01 AT2G43700 35.616 292 183 3 443 733 300 587 7.22e-53 194
MsG0480022067.01.T01 AT2G43700 35.616 292 183 3 443 733 300 587 7.22e-53 194
MsG0480022067.01.T01 AT2G43700 35.616 292 183 3 443 733 300 587 7.22e-53 194
MsG0480022067.01.T01 AT5G35580 35.849 318 183 5 417 727 50 353 1.02e-52 191
MsG0480022067.01.T01 AT5G35580 35.849 318 183 5 417 727 62 365 1.04e-52 191
MsG0480022067.01.T01 AT4G17660 37.542 301 163 8 439 724 75 365 1.21e-52 188
MsG0480022067.01.T01 AT1G78530 37.410 278 167 4 452 727 72 344 1.29e-52 187
MsG0480022067.01.T01 AT2G43700 35.616 292 183 3 443 733 324 611 1.32e-52 194
MsG0480022067.01.T01 AT5G62710 38.870 301 170 8 444 738 263 555 1.54e-52 192
MsG0480022067.01.T01 AT1G69730 35.548 301 187 4 442 737 434 732 1.98e-52 196
MsG0480022067.01.T01 AT1G72300 36.585 287 176 4 439 724 790 1071 2.02e-52 197
MsG0480022067.01.T01 AT2G28930 35.880 301 179 5 439 727 53 351 2.08e-52 188
MsG0480022067.01.T01 AT1G21210 34.708 291 188 2 437 727 392 680 2.24e-52 195
MsG0480022067.01.T01 AT1G31420 38.406 276 163 6 455 729 306 575 2.43e-52 192
MsG0480022067.01.T01 AT2G28930 35.880 301 179 5 439 727 64 362 2.49e-52 188
MsG0480022067.01.T01 AT2G28930 35.880 301 179 5 439 727 56 354 2.59e-52 187
MsG0480022067.01.T01 AT5G62710 38.870 301 170 8 444 738 297 589 3.07e-52 192
MsG0480022067.01.T01 AT2G28940 35.625 320 193 5 435 741 82 401 3.36e-52 189
MsG0480022067.01.T01 AT3G01300 35.690 297 175 4 443 727 124 416 3.56e-52 189

Find 137 sgRNAs with CRISPR-Local

Find 224 sgRNAs with CRISPR-GE


CRISPR-Local

CRISPR-Local
sgRNA_sequence on_target_score Position Region
ACAAAACTTACCTTGGTATT+TGG 0.161354 4:+67652543 MsG0480022067.01.T01:CDS
CAAGTTCAAATCTTCCATTT+TGG 0.164918 4:-67652496 None:intergenic
ACCAAGAAGATGATTATTTC+TGG 0.213511 4:+67652795 MsG0480022067.01.T01:CDS
GCCAGAAATAATCATCTTCT+TGG 0.237455 4:-67652796 None:intergenic
TTCATCAAGATTCCCGATTA+AGG 0.238915 4:+67654791 MsG0480022067.01.T01:CDS
GTGTAGTATCTGGAACTTTC+AGG 0.245182 4:-67653435 None:intergenic
AAAATTGGCGAAGGTGGTTT+TGG 0.246497 4:+67654232 MsG0480022067.01.T01:CDS
TTTGGAACAGCTAGAACTTT+TGG 0.261415 4:+67654883 MsG0480022067.01.T01:CDS
TACCGATTCCACAAATTATA+TGG 0.270001 4:-67654753 None:intergenic
CCATGGAATGGTCTACATTT+TGG 0.284465 4:+67653019 MsG0480022067.01.T01:CDS
GATCTCTATATTAGGATGTT+TGG 0.290071 4:+67653625 MsG0480022067.01.T01:CDS
CTCTATGGATAATCCTTAAT+CGG 0.296613 4:-67654804 None:intergenic
TTCTCCGAAAACAATAAAAT+TGG 0.298275 4:+67654217 MsG0480022067.01.T01:CDS
ATCTATAGGAGATGTTTCTT+TGG 0.301501 4:+67652928 MsG0480022067.01.T01:CDS
GTAGTACTGAGATGGAATTA+AGG 0.301564 4:+67655433 MsG0480022067.01.T01:CDS
GAAGAAGATTTCATCATTGT+TGG 0.303206 4:-67653092 None:intergenic
AACCTTGTCATCACTCAAAA+TGG 0.318435 4:+67652668 MsG0480022067.01.T01:CDS
CTAGCAGCTTTACTAGATTT+CGG 0.318986 4:-67654472 None:intergenic
AATACCTTGGTGTCCCAAAA+TGG 0.321722 4:+67652482 MsG0480022067.01.T01:CDS
GTGAACAAGATCTCTATATT+AGG 0.327281 4:+67653617 MsG0480022067.01.T01:CDS
TCTCCTATAGATGGATCTTC+TGG 0.328761 4:-67652917 None:intergenic
AGGATGTTTGGTTCAGAGTT+AGG 0.332864 4:+67653637 MsG0480022067.01.T01:CDS
ACCATTTCCACTGCAACTAA+TGG 0.334441 4:+67654193 MsG0480022067.01.T01:CDS
GAACATAACTGGAAGATATA+TGG 0.334719 4:+67653199 MsG0480022067.01.T01:CDS
TCTATAGGAGATGTTTCTTT+GGG 0.335021 4:+67652929 MsG0480022067.01.T01:CDS
GAAATGAAACCAGGTTCTTC+AGG 0.340585 4:-67655459 None:intergenic
TTTGAAGTACTATTATTGAT+AGG 0.342190 4:-67652617 None:intergenic
TACTTGCTTTGAGATCTCTA+TGG 0.342213 4:-67654819 None:intergenic
ATAAGTGTCACAAAAGTCTT+TGG 0.345097 4:-67653230 None:intergenic
TCCTGTTCAGAATGTTGTTT+GGG 0.345920 4:+67652577 MsG0480022067.01.T01:CDS
GATTCATCGAGCATCTAATA+AGG 0.355181 4:-67655538 None:intergenic
CTGCTAGGTTCTTGCATTCA+AGG 0.359973 4:+67654488 MsG0480022067.01.T01:CDS
GAGAGAGTTAACAAGTATAT+AGG 0.369418 4:-67652405 None:intergenic
AAGTTGTTTGAACCTTGTTC+TGG 0.369620 4:-67653049 None:intergenic
CCAAGAGTAAATTGTTAGAT+TGG 0.371499 4:+67654719 MsG0480022067.01.T01:CDS
GGAATGAACAAGAACATAAC+TGG 0.375068 4:+67653188 MsG0480022067.01.T01:CDS
CTTCTTCAGATATAGCATTA+TGG 0.382868 4:+67653108 MsG0480022067.01.T01:CDS
GCCATTAGTTGCAGTGGAAA+TGG 0.383369 4:-67654194 None:intergenic
AACCAAGTATGTGTAGTATC+TGG 0.388180 4:-67653445 None:intergenic
TTCCATATAATTTGTGGAAT+CGG 0.392199 4:+67654751 MsG0480022067.01.T01:CDS
TTCCTGTTCAGAATGTTGTT+TGG 0.394412 4:+67652576 MsG0480022067.01.T01:CDS
AATTCCAACGTAAGTGGAAA+AGG 0.399556 4:+67653538 MsG0480022067.01.T01:CDS
AAAGAAACATCTCCTATAGA+TGG 0.400226 4:-67652926 None:intergenic
GACGGGTTTGTCAAATTTCA+AGG 0.409218 4:+67653412 MsG0480022067.01.T01:CDS
CAAAAGAACATCGCTATGTA+TGG 0.411668 4:+67653167 MsG0480022067.01.T01:CDS
AGTGGTTGTGTTATGTGGTT+TGG 0.418186 4:+67653562 MsG0480022067.01.T01:CDS
ATCCATGCTTGTGGTGACTT+TGG 0.422494 4:-67653325 None:intergenic
TTGATTGGAAGTTAACATCT+TGG 0.424445 4:+67652888 MsG0480022067.01.T01:CDS
AACATTGGCAAACCTGTTGT+TGG 0.424546 4:-67653288 None:intergenic
TCCATAGCAGCTAATTCTCT+TGG 0.426797 4:+67652434 MsG0480022067.01.T01:CDS
CCAATCTAACAATTTACTCT+TGG 0.429146 4:-67654719 None:intergenic
TTGAAGTACTATTATTGATA+GGG 0.431196 4:-67652616 None:intergenic
CTTTACTTCATTTATGAACT+CGG 0.436470 4:-67654429 None:intergenic
CAAAATGGAAGATTTGAACT+TGG 0.437101 4:+67652497 MsG0480022067.01.T01:CDS
TAGTACTGAGATGGAATTAA+GGG 0.438214 4:+67655434 MsG0480022067.01.T01:CDS
TATTCAAATTCCAACGTAAG+TGG 0.438334 4:+67653532 MsG0480022067.01.T01:CDS
GAGTTGATCGACTCAAACTT+AGG 0.442271 4:+67655297 MsG0480022067.01.T01:CDS
AGTCCAGAAGATCCATCTAT+AGG 0.446961 4:+67652914 MsG0480022067.01.T01:CDS
AAGAGACTTTCAAGCATCTC+AGG 0.449890 4:+67654395 MsG0480022067.01.T01:CDS
TTGCATAACAATCCAACAAC+AGG 0.450382 4:+67653276 MsG0480022067.01.T01:CDS
ACCAAGAGAATTAGCTGCTA+TGG 0.453055 4:-67652435 None:intergenic
GTAAATATAATCATGAAAAC+AGG 0.455010 4:-67652383 None:intergenic
TCGAGCATCTAATAAGGAAA+TGG 0.457247 4:-67655532 None:intergenic
CAGGTTTGCCAATGTTTCGA+TGG 0.458232 4:+67653295 MsG0480022067.01.T01:CDS
TCGTCTGTGATTCTAATGTT+GGG 0.460002 4:+67655408 MsG0480022067.01.T01:CDS
ACACGGTTCCATATAATTTG+TGG 0.463168 4:+67654745 MsG0480022067.01.T01:CDS
ACCCAAACAACATTCTGAAC+AGG 0.464025 4:-67652578 None:intergenic
AAGGGAGTGGTTGTGTTATG+TGG 0.466818 4:+67653557 MsG0480022067.01.T01:CDS
GTCGTCTGTGATTCTAATGT+TGG 0.472087 4:+67655407 MsG0480022067.01.T01:CDS
AACAATAAAATTGGCGAAGG+TGG 0.472884 4:+67654226 MsG0480022067.01.T01:CDS
GAACTTGGTTTCTTCACTCC+AGG 0.477322 4:+67652512 MsG0480022067.01.T01:CDS
TCTATGGATAATCCTTAATC+GGG 0.487658 4:-67654803 None:intergenic
CAAGGTATTATTATTGCCGA+TGG 0.487818 4:-67652468 None:intergenic
TTTCATATGCAGTGGGTACA+TGG 0.492341 4:+67655018 MsG0480022067.01.T01:intron
AAGCATGGATAGAATCTGAT+TGG 0.493382 4:+67653338 MsG0480022067.01.T01:CDS
GCACCAGAGTATGCTGTTGA+TGG 0.495558 4:+67655040 MsG0480022067.01.T01:CDS
TTCCAGATACTACACATACT+TGG 0.498600 4:+67653443 MsG0480022067.01.T01:CDS
CCTTTCATCATATAATACTC+AGG 0.499841 4:-67652971 None:intergenic
GTTTAAACCCATCGAAACAT+TGG 0.502288 4:-67653303 None:intergenic
TTCAGGATTGGGCCATGGAA+TGG 0.504110 4:+67653007 MsG0480022067.01.T01:CDS
ATATAATTTGTGGAATCGGT+AGG 0.508151 4:+67654755 MsG0480022067.01.T01:CDS
CTGTCTAACAGCACTGCCAC+TGG 0.510300 4:-67652737 None:intergenic
GACATGGTAGGCCTATCTTC+AGG 0.514535 4:-67655387 None:intergenic
AACTCTAACAAAACTTACCT+TGG 0.518324 4:+67652536 MsG0480022067.01.T01:CDS
TTAAGGGAGCCTGAAGAACC+TGG 0.522886 4:+67655450 MsG0480022067.01.T01:CDS
CTTGGTTTGTCAAAATCCAT+CGG 0.523759 4:+67652452 MsG0480022067.01.T01:CDS
AATGTTGATTTATGAATACA+TGG 0.525617 4:+67654520 MsG0480022067.01.T01:CDS
CACAGCAGAATCCTGAAGAT+AGG 0.533497 4:+67655376 MsG0480022067.01.T01:CDS
TATAATTTGTGGAATCGGTA+GGG 0.534414 4:+67654756 MsG0480022067.01.T01:CDS
AGGTTTGCCAATGTTTCGAT+GGG 0.535321 4:+67653296 MsG0480022067.01.T01:CDS
TATGGTCGCTGTGGACCGTA+TGG 0.536111 4:+67653250 MsG0480022067.01.T01:CDS
TAAGTGTCACAAAAGTCTTT+GGG 0.536257 4:-67653229 None:intergenic
AAAGTTATTGACAAATCAGA+AGG 0.542115 4:+67655485 MsG0480022067.01.T01:CDS
ATAATTTGTGGAATCGGTAG+GGG 0.543667 4:+67654757 MsG0480022067.01.T01:CDS
CCTGAGTATTATATGATGAA+AGG 0.543815 4:+67652971 MsG0480022067.01.T01:CDS
GCAATGACACAAACAAAGAC+GGG 0.544769 4:+67653395 MsG0480022067.01.T01:CDS
ATTCCAACGTAAGTGGAAAA+GGG 0.546613 4:+67653539 MsG0480022067.01.T01:CDS
TGGTTGGCAGATCAAACAAT+GGG 0.548090 4:-67654174 None:intergenic
GGAGAAGCCATTAGTTGCAG+TGG 0.548171 4:-67654200 None:intergenic
ATTGTTATGCAATTTCCATA+CGG 0.551312 4:-67653265 None:intergenic
GTTGGGGAGTAGTACTGAGA+TGG 0.556007 4:+67655425 MsG0480022067.01.T01:CDS
AGGCACTTACTTGGCGAACA+AGG 0.558822 4:-67655168 None:intergenic
AACCAAAGTCACCACAAGCA+TGG 0.560093 4:+67653323 MsG0480022067.01.T01:CDS
CATCGGCAATAATAATACCT+TGG 0.565166 4:+67652469 MsG0480022067.01.T01:CDS
TAGATGGGATGAAATTGGGA+AGG 0.570463 4:+67652849 MsG0480022067.01.T01:CDS
TGCAATGACACAAACAAAGA+CGG 0.576002 4:+67653394 MsG0480022067.01.T01:CDS
TTTGGAGGAGACCAAATCAA+AGG 0.576586 4:+67654901 MsG0480022067.01.T01:CDS
ATAGAATCTGATTGGAGTCA+AGG 0.577962 4:+67653346 MsG0480022067.01.T01:CDS
AACGTAAGTGGAAAAGGGAG+TGG 0.588652 4:+67653544 MsG0480022067.01.T01:CDS
TTATTATTGGAGATTATCTG+TGG 0.590654 4:+67655103 MsG0480022067.01.T01:CDS
TGATTCAGGCATGGGCATTG+TGG 0.591514 4:+67655256 MsG0480022067.01.T01:intron
ATTTATGAATACATGGCTAA+CGG 0.592296 4:+67654527 MsG0480022067.01.T01:CDS
CGAAATCTAGTAAAGCTGCT+AGG 0.593137 4:+67654473 MsG0480022067.01.T01:CDS
GGCATTGTGGAAAGAAGAGA+GGG 0.594146 4:+67655269 MsG0480022067.01.T01:CDS
TTAGTTGCAGTGGAAATGGT+TGG 0.594281 4:-67654190 None:intergenic
CTTTCAAGCATCTCAGGACA+AGG 0.599571 4:+67654401 MsG0480022067.01.T01:CDS
CCATCTAAAAGAGTATCTGA+TGG 0.604518 4:-67652833 None:intergenic
CAAATTATATGGAACCGTGT+TGG 0.609659 4:-67654742 None:intergenic
GAAAACAATAAAATTGGCGA+AGG 0.610310 4:+67654223 MsG0480022067.01.T01:CDS
CCAAAATGTAGACCATTCCA+TGG 0.614971 4:-67653019 None:intergenic
CATTAGAATCACAGACGACA+TGG 0.615700 4:-67655403 None:intergenic
AATCCATCAACAGCATACTC+TGG 0.620074 4:-67655043 None:intergenic
AGTGATGACAAGGTTTCCTG+TGG 0.621279 4:-67652660 None:intergenic
ACATTACAACTCAACACCAC+AGG 0.622528 4:+67652644 MsG0480022067.01.T01:CDS
TCAGATTCTATCCATGCTTG+TGG 0.628161 4:-67653334 None:intergenic
TGTGACACTTATGGTCGCTG+TGG 0.628851 4:+67653241 MsG0480022067.01.T01:CDS
TTTGGTGGATTACCAGAACA+AGG 0.631828 4:+67653037 MsG0480022067.01.T01:CDS
CGTCTGTGATTCTAATGTTG+GGG 0.638367 4:+67655409 MsG0480022067.01.T01:CDS
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TAATTTGTGGAATCGGTAGG+GGG 0.653395 4:+67654758 MsG0480022067.01.T01:CDS
AATTGTTAGATTGGCCAACA+CGG 0.655515 4:+67654728 MsG0480022067.01.T01:CDS
ATGGTTGGCAGATCAAACAA+TGG 0.661020 4:-67654175 None:intergenic
GAATGTTAGTATGAGTCTCG+AGG 0.666568 4:+67653468 MsG0480022067.01.T01:CDS
AGAATCACAGACGACATGGT+AGG 0.668564 4:-67655399 None:intergenic
GTTAGACAGTGGTAATCTTG+TGG 0.672434 4:+67652751 MsG0480022067.01.T01:CDS
AAAGCAAGTACATAATCCAG+TGG 0.678936 4:+67652721 MsG0480022067.01.T01:CDS
GTGGCAGTGCTGTTAGACAG+TGG 0.711990 4:+67652740 MsG0480022067.01.T01:CDS

CRISPR-GE

badsite warning sgRNA_sequence Strand Position Region GC_content
!!! AATATTCTAATTTGTTGTAA+TGG + Chr4:67654995-67655014 MsG0480022067.01.T01:intron 15.0%
!! AGATTAAAATGCATGTAAAA+TGG - Chr4:67654076-67654095 None:intergenic 20.0%
!! ATAAGGTAATTTAACATTTG+AGG + Chr4:67654263-67654282 MsG0480022067.01.T01:intron 20.0%
!! ATTAAAATGCATGTAAAATG+GGG - Chr4:67654074-67654093 None:intergenic 20.0%
!! GAAAAACAGAAAGAATAATT+GGG + Chr4:67654923-67654942 MsG0480022067.01.T01:CDS 20.0%
!! GATTAAAATGCATGTAAAAT+GGG - Chr4:67654075-67654094 None:intergenic 20.0%
!! GTAAATATAATCATGAAAAC+AGG - Chr4:67652386-67652405 None:intergenic 20.0%
!!! AATCCAAAAATATCAGATTT+TGG + Chr4:67654865-67654884 MsG0480022067.01.T01:CDS 20.0%
!!! AATGTTGATTTATGAATACA+TGG + Chr4:67654520-67654539 MsG0480022067.01.T01:CDS 20.0%
!!! ATTATGTACTTGCTTTTTAA+TGG - Chr4:67652717-67652736 None:intergenic 20.0%
!!! TTGAAGTACTATTATTGATA+GGG - Chr4:67652619-67652638 None:intergenic 20.0%
!!! TTTGAAGTACTATTATTGAT+AGG - Chr4:67652620-67652639 None:intergenic 20.0%
! AAAGTTATTGACAAATCAGA+AGG + Chr4:67655485-67655504 MsG0480022067.01.T01:CDS 25.0%
! AAGATTATAGGTAAAAATCC+AGG + Chr4:67653895-67653914 MsG0480022067.01.T01:intron 25.0%
! AATAACAGTGGAAGTTATTA+TGG - Chr4:67653821-67653840 None:intergenic 25.0%
! ATTGTTATGCAATTTCCATA+CGG - Chr4:67653268-67653287 None:intergenic 25.0%
! ATTTATGAATACATGGCTAA+CGG + Chr4:67654527-67654546 MsG0480022067.01.T01:CDS 25.0%
! CTTAACTATTAATGTTGCTA+GGG + Chr4:67653666-67653685 MsG0480022067.01.T01:intron 25.0%
! CTTTACTTCATTTATGAACT+CGG - Chr4:67654432-67654451 None:intergenic 25.0%
! GGAAAAACAGAAAGAATAAT+TGG + Chr4:67654922-67654941 MsG0480022067.01.T01:CDS 25.0%
! TAAAACTTCTCATATGATTC+AGG + Chr4:67655242-67655261 MsG0480022067.01.T01:intron 25.0%
! TATTCACATCCATGTAAATA+TGG - Chr4:67654979-67654998 None:intergenic 25.0%
! TTATTATTGGAGATTATCTG+TGG + Chr4:67655103-67655122 MsG0480022067.01.T01:CDS 25.0%
! TTCTCCGAAAACAATAAAAT+TGG + Chr4:67654217-67654236 MsG0480022067.01.T01:CDS 25.0%
!! AAGTTCAAATCTTCCATTTT+GGG - Chr4:67652498-67652517 None:intergenic 25.0%
!! CAATTGATCTAAAATTAACC+TGG - Chr4:67653916-67653935 None:intergenic 25.0%
!! CAGGTTAATTTTAGATCAAT+TGG + Chr4:67653914-67653933 MsG0480022067.01.T01:intron 25.0%
!! GTTCCAAAATCTGATATTTT+TGG - Chr4:67654871-67654890 None:intergenic 25.0%
!! TAGCTTCGGAATTTTATTAT+TGG + Chr4:67655090-67655109 MsG0480022067.01.T01:CDS 25.0%
!! TTATGCAAAGTATCTATTGA+TGG + Chr4:67654322-67654341 MsG0480022067.01.T01:intron 25.0%
!! TTCCATATAATTTGTGGAAT+CGG + Chr4:67654751-67654770 MsG0480022067.01.T01:CDS 25.0%
!! TTCGCCAATTTTATTGTTTT+CGG - Chr4:67654224-67654243 None:intergenic 25.0%
!! TTTTAGCAATTGTTCTTGTA+TGG + Chr4:67653507-67653526 MsG0480022067.01.T01:CDS 25.0%
!!! CACTGTTATTTTAATTTGTG+GGG + Chr4:67653831-67653850 MsG0480022067.01.T01:intron 25.0%
!!! CCACTGTTATTTTAATTTGT+GGG + Chr4:67653830-67653849 MsG0480022067.01.T01:intron 25.0%
!!! CTGATTTGTCAATAACTTTT+TGG - Chr4:67655484-67655503 None:intergenic 25.0%
!!! TCCACTGTTATTTTAATTTG+TGG + Chr4:67653829-67653848 MsG0480022067.01.T01:intron 25.0%
!!! TGTTTTTATACCAAATACCA+AGG - Chr4:67652556-67652575 None:intergenic 25.0%
!!! TTTCTGTTTTTCCTTTGATT+TGG - Chr4:67654915-67654934 None:intergenic 25.0%
AAAGAAACATCTCCTATAGA+TGG - Chr4:67652929-67652948 None:intergenic 30.0%
AACTCTAACAAAACTTACCT+TGG + Chr4:67652536-67652555 MsG0480022067.01.T01:CDS 30.0%
AATCTTGTGGTCAAAAATGA+AGG + Chr4:67652764-67652783 MsG0480022067.01.T01:CDS 30.0%
ACAAAACTTACCTTGGTATT+TGG + Chr4:67652543-67652562 MsG0480022067.01.T01:CDS 30.0%
ACCAAGAAGATGATTATTTC+TGG + Chr4:67652795-67652814 MsG0480022067.01.T01:CDS 30.0%
ATAAGTGTCACAAAAGTCTT+TGG - Chr4:67653233-67653252 None:intergenic 30.0%
ATCTATAGGAGATGTTTCTT+TGG + Chr4:67652928-67652947 MsG0480022067.01.T01:CDS 30.0%
CAAAATGGAAGATTTGAACT+TGG + Chr4:67652497-67652516 MsG0480022067.01.T01:CDS 30.0%
CCAAGAGTAAATTGTTAGAT+TGG + Chr4:67654719-67654738 MsG0480022067.01.T01:CDS 30.0%
CCAATCTAACAATTTACTCT+TGG - Chr4:67654722-67654741 None:intergenic 30.0%
CCCACAAATTAAAATAACAG+TGG - Chr4:67653833-67653852 None:intergenic 30.0%
CCTGAGTATTATATGATGAA+AGG + Chr4:67652971-67652990 MsG0480022067.01.T01:CDS 30.0%
CCTTTCATCATATAATACTC+AGG - Chr4:67652974-67652993 None:intergenic 30.0%
CTCTATGGATAATCCTTAAT+CGG - Chr4:67654807-67654826 None:intergenic 30.0%
CTTCTTCAGATATAGCATTA+TGG + Chr4:67653108-67653127 MsG0480022067.01.T01:CDS 30.0%
GAAAACAATAAAATTGGCGA+AGG + Chr4:67654223-67654242 MsG0480022067.01.T01:CDS 30.0%
GAACATAACTGGAAGATATA+TGG + Chr4:67653199-67653218 MsG0480022067.01.T01:CDS 30.0%
GAAGAAGATTTCATCATTGT+TGG - Chr4:67653095-67653114 None:intergenic 30.0%
GAGAGAGTTAACAAGTATAT+AGG - Chr4:67652408-67652427 None:intergenic 30.0%
GATCTCTATATTAGGATGTT+TGG + Chr4:67653625-67653644 MsG0480022067.01.T01:CDS 30.0%
GCTTAACTATTAATGTTGCT+AGG + Chr4:67653665-67653684 MsG0480022067.01.T01:intron 30.0%
GTGAACAAGATCTCTATATT+AGG + Chr4:67653617-67653636 MsG0480022067.01.T01:CDS 30.0%
TAAGTGTCACAAAAGTCTTT+GGG - Chr4:67653232-67653251 None:intergenic 30.0%
TATTCAAATTCCAACGTAAG+TGG + Chr4:67653532-67653551 MsG0480022067.01.T01:CDS 30.0%
TCTATAGGAGATGTTTCTTT+GGG + Chr4:67652929-67652948 MsG0480022067.01.T01:CDS 30.0%
TCTATGGATAATCCTTAATC+GGG - Chr4:67654806-67654825 None:intergenic 30.0%
TTGATTGGAAGTTAACATCT+TGG + Chr4:67652888-67652907 MsG0480022067.01.T01:CDS 30.0%
TTTATTTCATCTTCAGAGTC+CGG + Chr4:67653869-67653888 MsG0480022067.01.T01:intron 30.0%
TTTCAGATCTGTCTACAAAA+TGG - Chr4:67654132-67654151 None:intergenic 30.0%
TTTCCAACACCATATTTACA+TGG + Chr4:67654967-67654986 MsG0480022067.01.T01:intron 30.0%
! AAAGACTTTTGTGACACTTA+TGG + Chr4:67653232-67653251 MsG0480022067.01.T01:CDS 30.0%
! AAGGAAATGAGAAAGTTTTC+AGG + Chr4:67652990-67653009 MsG0480022067.01.T01:CDS 30.0%
! ATATAATTTGTGGAATCGGT+AGG + Chr4:67654755-67654774 MsG0480022067.01.T01:CDS 30.0%
! ATTGATGGATGTGATTATGT+AGG + Chr4:67654337-67654356 MsG0480022067.01.T01:intron 30.0%
! ATTTTGTAGACAGATCTGAA+AGG + Chr4:67654131-67654150 MsG0480022067.01.T01:intron 30.0%
! CAAGTTCAAATCTTCCATTT+TGG - Chr4:67652499-67652518 None:intergenic 30.0%
! CATCAGATACTCTTTTAGAT+GGG + Chr4:67652834-67652853 MsG0480022067.01.T01:CDS 30.0%
! CTTTTAGATGGGATGAAATT+GGG + Chr4:67652845-67652864 MsG0480022067.01.T01:CDS 30.0%
! TAGTACTGAGATGGAATTAA+GGG + Chr4:67655434-67655453 MsG0480022067.01.T01:CDS 30.0%
! TATAATTTGTGGAATCGGTA+GGG + Chr4:67654756-67654775 MsG0480022067.01.T01:CDS 30.0%
! TATGGTGTTGGAAAGTTATT+AGG - Chr4:67654961-67654980 None:intergenic 30.0%
! TCACACTAGATATTGATTAG+AGG + Chr4:67653986-67654005 MsG0480022067.01.T01:intron 30.0%
! TCTTTTAGATGGGATGAAAT+TGG + Chr4:67652844-67652863 MsG0480022067.01.T01:CDS 30.0%
! TTGATGGATGTGATTATGTA+GGG + Chr4:67654338-67654357 MsG0480022067.01.T01:intron 30.0%
! TTTTACCTATAATCTTCCTC+CGG - Chr4:67653891-67653910 None:intergenic 30.0%
!! AACTTTTTGGAAATGAAACC+AGG - Chr4:67655471-67655490 None:intergenic 30.0%
!! AATGAGAAAGTTTTCAGGAT+TGG + Chr4:67652995-67653014 MsG0480022067.01.T01:CDS 30.0%
!! ATCTAAAAACTGGTCTTGAT+TGG + Chr4:67652873-67652892 MsG0480022067.01.T01:CDS 30.0%
!! ATGAGAAAGTTTTCAGGATT+GGG + Chr4:67652996-67653015 MsG0480022067.01.T01:CDS 30.0%
!! TACCGATTCCACAAATTATA+TGG - Chr4:67654756-67654775 None:intergenic 30.0%
!!! AAGTCTGATGTTTTTAGCTT+CGG + Chr4:67655076-67655095 MsG0480022067.01.T01:CDS 30.0%
!!! TAAGTTTTGTTAGAGTTACC+TGG - Chr4:67652533-67652552 None:intergenic 30.0%
!!! TGGTTTTGGAACTGTATATA+AGG + Chr4:67654246-67654265 MsG0480022067.01.T01:CDS 30.0%
AAAGCAAGTACATAATCCAG+TGG + Chr4:67652721-67652740 MsG0480022067.01.T01:CDS 35.0%
AACAATAAAATTGGCGAAGG+TGG + Chr4:67654226-67654245 MsG0480022067.01.T01:CDS 35.0%
AACCAAGTATGTGTAGTATC+TGG - Chr4:67653448-67653467 None:intergenic 35.0%
AACCTTGTCATCACTCAAAA+TGG + Chr4:67652668-67652687 MsG0480022067.01.T01:CDS 35.0%
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AAGTTGTTTGAACCTTGTTC+TGG - Chr4:67653052-67653071 None:intergenic 35.0%
AATTCCAACGTAAGTGGAAA+AGG + Chr4:67653538-67653557 MsG0480022067.01.T01:CDS 35.0%
ACACGGTTCCATATAATTTG+TGG + Chr4:67654745-67654764 MsG0480022067.01.T01:CDS 35.0%
AGAGAGTAGGGAAATCAAAT+TGG - Chr4:67654109-67654128 None:intergenic 35.0%
ATAGAATCTGATTGGAGTCA+AGG + Chr4:67653346-67653365 MsG0480022067.01.T01:CDS 35.0%
ATATCTAGTGTGATGAACTC+TGG - Chr4:67653979-67653998 None:intergenic 35.0%
ATTCCAACGTAAGTGGAAAA+GGG + Chr4:67653539-67653558 MsG0480022067.01.T01:CDS 35.0%
CAAAAGAACATCGCTATGTA+TGG + Chr4:67653167-67653186 MsG0480022067.01.T01:CDS 35.0%
CAAATTATATGGAACCGTGT+TGG - Chr4:67654745-67654764 None:intergenic 35.0%
CATCCATGTAAATATGGTGT+TGG - Chr4:67654973-67654992 None:intergenic 35.0%
CATCGGCAATAATAATACCT+TGG + Chr4:67652469-67652488 MsG0480022067.01.T01:CDS 35.0%
CTAGCAGCTTTACTAGATTT+CGG - Chr4:67654475-67654494 None:intergenic 35.0%
GAGAGTAGGGAAATCAAATT+GGG - Chr4:67654108-67654127 None:intergenic 35.0%
GCCAGAAATAATCATCTTCT+TGG - Chr4:67652799-67652818 None:intergenic 35.0%
GGAATGAACAAGAACATAAC+TGG + Chr4:67653188-67653207 MsG0480022067.01.T01:CDS 35.0%
GTAATGGTTTCATATGCAGT+GGG + Chr4:67655011-67655030 MsG0480022067.01.T01:intron 35.0%
GTAGTGCATACCAAAAATGA+AGG - Chr4:67654564-67654583 None:intergenic 35.0%
GTTTAAACCCATCGAAACAT+TGG - Chr4:67653306-67653325 None:intergenic 35.0%
TACCAAAAATGAAGGAGTCT+AGG - Chr4:67654556-67654575 None:intergenic 35.0%
TCGAGCATCTAATAAGGAAA+TGG - Chr4:67655535-67655554 None:intergenic 35.0%
TCGTCTGTGATTCTAATGTT+GGG + Chr4:67655408-67655427 MsG0480022067.01.T01:CDS 35.0%
TCTACAAAATGGAGAGAGTA+GGG - Chr4:67654121-67654140 None:intergenic 35.0%
TGCAATGACACAAACAAAGA+CGG + Chr4:67653394-67653413 MsG0480022067.01.T01:CDS 35.0%
TGTAATGGTTTCATATGCAG+TGG + Chr4:67655010-67655029 MsG0480022067.01.T01:intron 35.0%
TTCATCAAGATTCCCGATTA+AGG + Chr4:67654791-67654810 MsG0480022067.01.T01:CDS 35.0%
TTCCAGATACTACACATACT+TGG + Chr4:67653443-67653462 MsG0480022067.01.T01:CDS 35.0%
TTCCTGTTCAGAATGTTGTT+TGG + Chr4:67652576-67652595 MsG0480022067.01.T01:CDS 35.0%
TTCTCATATGATTCAGGCAT+GGG + Chr4:67655248-67655267 MsG0480022067.01.T01:intron 35.0%
TTGCATAACAATCCAACAAC+AGG + Chr4:67653276-67653295 MsG0480022067.01.T01:CDS 35.0%
TTGGGAAGGAATCTAAAAAC+TGG + Chr4:67652863-67652882 MsG0480022067.01.T01:CDS 35.0%
! AATTGTTAGATTGGCCAACA+CGG + Chr4:67654728-67654747 MsG0480022067.01.T01:CDS 35.0%
! ACATTTATACATGACTTGCC+AGG - Chr4:67655191-67655210 None:intergenic 35.0%
! ATAATTTGTGGAATCGGTAG+GGG + Chr4:67654757-67654776 MsG0480022067.01.T01:CDS 35.0%
! CAAGGTATTATTATTGCCGA+TGG - Chr4:67652471-67652490 None:intergenic 35.0%
! CATAGCGATGTTCTTTTGTT+TGG - Chr4:67653165-67653184 None:intergenic 35.0%
! CCATCAGATACTCTTTTAGA+TGG + Chr4:67652833-67652852 MsG0480022067.01.T01:CDS 35.0%
! CTCAAAATGGCTCTTTTGTT+TGG + Chr4:67652681-67652700 MsG0480022067.01.T01:CDS 35.0%
! GTAGTACTGAGATGGAATTA+AGG + Chr4:67655433-67655452 MsG0480022067.01.T01:CDS 35.0%
! TCCTGTTCAGAATGTTGTTT+GGG + Chr4:67652577-67652596 MsG0480022067.01.T01:CDS 35.0%
!! CCATCTAAAAGAGTATCTGA+TGG - Chr4:67652836-67652855 None:intergenic 35.0%
!! CTTGGTTTGTCAAAATCCAT+CGG + Chr4:67652452-67652471 MsG0480022067.01.T01:CDS 35.0%
!! TACTTGCTTTGAGATCTCTA+TGG - Chr4:67654822-67654841 None:intergenic 35.0%
!! TTTGGAACAGCTAGAACTTT+TGG + Chr4:67654883-67654902 MsG0480022067.01.T01:CDS 35.0%
!!! TTTAATTTGTGGGGTGCTTT+TGG + Chr4:67653840-67653859 MsG0480022067.01.T01:intron 35.0%
AACATTGGCAAACCTGTTGT+TGG - Chr4:67653291-67653310 None:intergenic 40.0%
AACGCTGAAGAACCAGAAAA+CGG + Chr4:67653772-67653791 MsG0480022067.01.T01:intron 40.0%
AAGAGACTTTCAAGCATCTC+AGG + Chr4:67654395-67654414 MsG0480022067.01.T01:CDS 40.0%
AATCCATCAACAGCATACTC+TGG - Chr4:67655046-67655065 None:intergenic 40.0%
ACATTACAACTCAACACCAC+AGG + Chr4:67652644-67652663 MsG0480022067.01.T01:CDS 40.0%
ACCAAGAGAATTAGCTGCTA+TGG - Chr4:67652438-67652457 None:intergenic 40.0%
ACCATTTCCACTGCAACTAA+TGG + Chr4:67654193-67654212 MsG0480022067.01.T01:CDS 40.0%
ACCCAAACAACATTCTGAAC+AGG - Chr4:67652581-67652600 None:intergenic 40.0%
AGGTTTGCCAATGTTTCGAT+GGG + Chr4:67653296-67653315 MsG0480022067.01.T01:CDS 40.0%
AGTCCAGAAGATCCATCTAT+AGG + Chr4:67652914-67652933 MsG0480022067.01.T01:CDS 40.0%
AGTGGTTGTGTTATGTGGTT+TGG + Chr4:67653562-67653581 MsG0480022067.01.T01:CDS 40.0%
ATGGTTGGCAGATCAAACAA+TGG - Chr4:67654178-67654197 None:intergenic 40.0%
CATTAGAATCACAGACGACA+TGG - Chr4:67655406-67655425 None:intergenic 40.0%
CCAAAATGTAGACCATTCCA+TGG - Chr4:67653022-67653041 None:intergenic 40.0%
CGAAATCTAGTAAAGCTGCT+AGG + Chr4:67654473-67654492 MsG0480022067.01.T01:CDS 40.0%
CGTCTGTGATTCTAATGTTG+GGG + Chr4:67655409-67655428 MsG0480022067.01.T01:CDS 40.0%
CTTCTCATATGATTCAGGCA+TGG + Chr4:67655247-67655266 MsG0480022067.01.T01:intron 40.0%
GAAATGAAACCAGGTTCTTC+AGG - Chr4:67655462-67655481 None:intergenic 40.0%
GAATGTTAGTATGAGTCTCG+AGG + Chr4:67653468-67653487 MsG0480022067.01.T01:CDS 40.0%
GCAATGACACAAACAAAGAC+GGG + Chr4:67653395-67653414 MsG0480022067.01.T01:CDS 40.0%
GCACTAGTGCAACTAGATTT+AGG - Chr4:67654600-67654619 None:intergenic 40.0%
GTCGTCTGTGATTCTAATGT+TGG + Chr4:67655407-67655426 MsG0480022067.01.T01:CDS 40.0%
GTCTACAAAATGGAGAGAGT+AGG - Chr4:67654122-67654141 None:intergenic 40.0%
GTTAGACAGTGGTAATCTTG+TGG + Chr4:67652751-67652770 MsG0480022067.01.T01:CDS 40.0%
TAGATGGGATGAAATTGGGA+AGG + Chr4:67652849-67652868 MsG0480022067.01.T01:CDS 40.0%
TCAGATTCTATCCATGCTTG+TGG - Chr4:67653337-67653356 None:intergenic 40.0%
TCCATAGCAGCTAATTCTCT+TGG + Chr4:67652434-67652453 MsG0480022067.01.T01:CDS 40.0%
TCTCCTATAGATGGATCTTC+TGG - Chr4:67652920-67652939 None:intergenic 40.0%
TGGTTGGCAGATCAAACAAT+GGG - Chr4:67654177-67654196 None:intergenic 40.0%
TTAGTTGCAGTGGAAATGGT+TGG - Chr4:67654193-67654212 None:intergenic 40.0%
TTTCATATGCAGTGGGTACA+TGG + Chr4:67655018-67655037 MsG0480022067.01.T01:intron 40.0%
TTTGGAGGAGACCAAATCAA+AGG + Chr4:67654901-67654920 MsG0480022067.01.T01:CDS 40.0%
! AAAATTGGCGAAGGTGGTTT+TGG + Chr4:67654232-67654251 MsG0480022067.01.T01:CDS 40.0%
! AGCCTAGACTCCTTCATTTT+TGG + Chr4:67654551-67654570 MsG0480022067.01.T01:CDS 40.0%
! AGGATGTTTGGTTCAGAGTT+AGG + Chr4:67653637-67653656 MsG0480022067.01.T01:CDS 40.0%
! CCATGGAATGGTCTACATTT+TGG + Chr4:67653019-67653038 MsG0480022067.01.T01:CDS 40.0%
! GACGGGTTTGTCAAATTTCA+AGG + Chr4:67653412-67653431 MsG0480022067.01.T01:CDS 40.0%
! GAGTTGATCGACTCAAACTT+AGG + Chr4:67655297-67655316 MsG0480022067.01.T01:CDS 40.0%
! GTGTAGTATCTGGAACTTTC+AGG - Chr4:67653438-67653457 None:intergenic 40.0%
! TAATTTGTGGAATCGGTAGG+GGG + Chr4:67654758-67654777 MsG0480022067.01.T01:CDS 40.0%
! TGGAATGGTCTACATTTTGG+TGG + Chr4:67653022-67653041 MsG0480022067.01.T01:CDS 40.0%
!! AATACCTTGGTGTCCCAAAA+TGG + Chr4:67652482-67652501 MsG0480022067.01.T01:CDS 40.0%
!! AGCCATTTTGAGTGATGACA+AGG - Chr4:67652673-67652692 None:intergenic 40.0%
!! TTTGGTGGATTACCAGAACA+AGG + Chr4:67653037-67653056 MsG0480022067.01.T01:CDS 40.0%
AACCAAAGTCACCACAAGCA+TGG + Chr4:67653323-67653342 MsG0480022067.01.T01:CDS 45.0%
AACGTAAGTGGAAAAGGGAG+TGG + Chr4:67653544-67653563 MsG0480022067.01.T01:CDS 45.0%
AAGGGAGTGGTTGTGTTATG+TGG + Chr4:67653557-67653576 MsG0480022067.01.T01:CDS 45.0%
ACGCTGAAGAACCAGAAAAC+GGG + Chr4:67653773-67653792 MsG0480022067.01.T01:intron 45.0%
AGAATCACAGACGACATGGT+AGG - Chr4:67655402-67655421 None:intergenic 45.0%
AGAGTCCGGAGGAAGATTAT+AGG + Chr4:67653883-67653902 MsG0480022067.01.T01:intron 45.0%
AGTGATGACAAGGTTTCCTG+TGG - Chr4:67652663-67652682 None:intergenic 45.0%
ATCCATGCTTGTGGTGACTT+TGG - Chr4:67653328-67653347 None:intergenic 45.0%
ATTTCATCTTCAGAGTCCGG+AGG + Chr4:67653872-67653891 MsG0480022067.01.T01:intron 45.0%
CACAGCAGAATCCTGAAGAT+AGG + Chr4:67655376-67655395 MsG0480022067.01.T01:CDS 45.0%
CAGGTTTGCCAATGTTTCGA+TGG + Chr4:67653295-67653314 MsG0480022067.01.T01:CDS 45.0%
CTGCTAGGTTCTTGCATTCA+AGG + Chr4:67654488-67654507 MsG0480022067.01.T01:CDS 45.0%
CTTTCAAGCATCTCAGGACA+AGG + Chr4:67654401-67654420 MsG0480022067.01.T01:CDS 45.0%
GAACTTGGTTTCTTCACTCC+AGG + Chr4:67652512-67652531 MsG0480022067.01.T01:CDS 45.0%
GCCATTAGTTGCAGTGGAAA+TGG - Chr4:67654197-67654216 None:intergenic 45.0%
GGCATTGTGGAAAGAAGAGA+GGG + Chr4:67655269-67655288 MsG0480022067.01.T01:CDS 45.0%
! ACTCCCTTTTCCACTTACGT+TGG - Chr4:67653545-67653564 None:intergenic 45.0%
! GGAACAGCTAGAACTTTTGG+AGG + Chr4:67654886-67654905 MsG0480022067.01.T01:CDS 45.0%
!! AAGTTTTCAGGATTGGGCCA+TGG + Chr4:67653002-67653021 MsG0480022067.01.T01:CDS 45.0%
!!! TCTTCCATTTTGGGACACCA+AGG - Chr4:67652489-67652508 None:intergenic 45.0%
AAAACGGGCGCAAATGGAAC+AGG + Chr4:67653788-67653807 MsG0480022067.01.T01:intron 50.0%
AACCAGAAAACGGGCGCAAA+TGG + Chr4:67653782-67653801 MsG0480022067.01.T01:intron 50.0%
AGGCACTTACTTGGCGAACA+AGG - Chr4:67655171-67655190 None:intergenic 50.0%
GACATGGTAGGCCTATCTTC+AGG - Chr4:67655390-67655409 None:intergenic 50.0%
GCACCAGAGTATGCTGTTGA+TGG + Chr4:67655040-67655059 MsG0480022067.01.T01:CDS 50.0%
GCGCAAATGGAACAGGAGAA+CGG + Chr4:67653795-67653814 MsG0480022067.01.T01:intron 50.0%
GGAGAAGCCATTAGTTGCAG+TGG - Chr4:67654203-67654222 None:intergenic 50.0%
TGTGACACTTATGGTCGCTG+TGG + Chr4:67653241-67653260 MsG0480022067.01.T01:CDS 50.0%
TTAAGGGAGCCTGAAGAACC+TGG + Chr4:67655450-67655469 MsG0480022067.01.T01:CDS 50.0%
TTCAGGATTGGGCCATGGAA+TGG + Chr4:67653007-67653026 MsG0480022067.01.T01:CDS 50.0%
TTGTTCGCCAAGTAAGTGCC+TGG + Chr4:67655170-67655189 MsG0480022067.01.T01:intron 50.0%
! GGGCATTGTGGAAAGAAGAG+AGG + Chr4:67655268-67655287 MsG0480022067.01.T01:CDS 50.0%
! GTTGGGGAGTAGTACTGAGA+TGG + Chr4:67655425-67655444 MsG0480022067.01.T01:CDS 50.0%
! TGACTTGCCAGGCACTTACT+TGG - Chr4:67655180-67655199 None:intergenic 50.0%
! TGATTCAGGCATGGGCATTG+TGG + Chr4:67655256-67655275 MsG0480022067.01.T01:intron 50.0%
! TTCCATTTGCGCCCGTTTTC+TGG - Chr4:67653787-67653806 None:intergenic 50.0%
CTGTCTAACAGCACTGCCAC+TGG - Chr4:67652740-67652759 None:intergenic 55.0%
TATGGTCGCTGTGGACCGTA+TGG + Chr4:67653250-67653269 MsG0480022067.01.T01:CDS 55.0%
! GTGGCAGTGCTGTTAGACAG+TGG + Chr4:67652740-67652759 MsG0480022067.01.T01:CDS 55.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr4 gene 67652374 67655557 67652374 ID=MsG0480022067.01;Name=MsG0480022067.01
Chr4 mRNA 67652374 67655557 67652374 ID=MsG0480022067.01.T01;Parent=MsG0480022067.01;Name=MsG0480022067.01.T01;_AED=0.42;_eAED=0.42;_QI=0|0|0|1|1|1|6|0|769
Chr4 exon 67652374 67653658 67652374 ID=MsG0480022067.01.T01:exon:21135;Parent=MsG0480022067.01.T01
Chr4 exon 67654140 67654267 67654140 ID=MsG0480022067.01.T01:exon:21136;Parent=MsG0480022067.01.T01
Chr4 exon 67654359 67654572 67654359 ID=MsG0480022067.01.T01:exon:21137;Parent=MsG0480022067.01.T01
Chr4 exon 67654713 67654950 67654713 ID=MsG0480022067.01.T01:exon:21138;Parent=MsG0480022067.01.T01
Chr4 exon 67655030 67655180 67655030 ID=MsG0480022067.01.T01:exon:21139;Parent=MsG0480022067.01.T01
Chr4 exon 67655264 67655557 67655264 ID=MsG0480022067.01.T01:exon:21140;Parent=MsG0480022067.01.T01
Chr4 CDS 67652374 67653658 67652374 ID=MsG0480022067.01.T01:cds;Parent=MsG0480022067.01.T01
Chr4 CDS 67654140 67654267 67654140 ID=MsG0480022067.01.T01:cds;Parent=MsG0480022067.01.T01
Chr4 CDS 67654359 67654572 67654359 ID=MsG0480022067.01.T01:cds;Parent=MsG0480022067.01.T01
Chr4 CDS 67654713 67654950 67654713 ID=MsG0480022067.01.T01:cds;Parent=MsG0480022067.01.T01
Chr4 CDS 67655030 67655180 67655030 ID=MsG0480022067.01.T01:cds;Parent=MsG0480022067.01.T01
Chr4 CDS 67655264 67655557 67655264 ID=MsG0480022067.01.T01:cds;Parent=MsG0480022067.01.T01
Gene Sequence

>MsG0480022067.01.T01

ATGGACATTCCTGTTTTCATGATTATATTTACCTATATACTTGTTAACTCTCTCAAACATTCCATAGCAGCTAATTCTCTTGGTTTGTCAAAATCCATCGGCAATAATAATACCTTGGTGTCCCAAAATGGAAGATTTGAACTTGGTTTCTTCACTCCAGGTAACTCTAACAAAACTTACCTTGGTATTTGGTATAAAAACATTCCTGTTCAGAATGTTGTTTGGGTTGCAAACAGAAACAACCCTATCAATAATAGTACTTCAAACTACACATTACAACTCAACACCACAGGAAACCTTGTCATCACTCAAAATGGCTCTTTTGTTTGGTACACAACAACCATTAAAAAGCAAGTACATAATCCAGTGGCAGTGCTGTTAGACAGTGGTAATCTTGTGGTCAAAAATGAAGGAGAAACTAACCAAGAAGATGATTATTTCTGGCAAAGCTTTGATTATCCATCAGATACTCTTTTAGATGGGATGAAATTGGGAAGGAATCTAAAAACTGGTCTTGATTGGAAGTTAACATCTTGGAAGAGTCCAGAAGATCCATCTATAGGAGATGTTTCTTTGGGTTTAGTACTCAATGATTATCCTGAGTATTATATGATGAAAGGAAATGAGAAAGTTTTCAGGATTGGGCCATGGAATGGTCTACATTTTGGTGGATTACCAGAACAAGGTTCAAACAACTTTTTGCAGTACGAAACTGTTTCCAACAATGATGAAATCTTCTTCAGATATAGCATTATGGTCGATAATGTTATCTCAAAATTAGTAGTAGACCAAACAAAAGAACATCGCTATGTATGGAATGAACAAGAACATAACTGGAAGATATATGGAACACGTCCCAAAGACTTTTGTGACACTTATGGTCGCTGTGGACCGTATGGAAATTGCATAACAATCCAACAACAGGTTTGCCAATGTTTCGATGGGTTTAAACCAAAGTCACCACAAGCATGGATAGAATCTGATTGGAGTCAAGGTTGTGTGCGCGATAAACATTTGAGTTGCAATGACACAAACAAAGACGGGTTTGTCAAATTTCAAGGCCTGAAAGTTCCAGATACTACACATACTTGGTTGAATGTTAGTATGAGTCTCGAGGAATGCAGAGAAAAATGTTTTAGCAATTGTTCTTGTATGGCTTATTCAAATTCCAACGTAAGTGGAAAAGGGAGTGGTTGTGTTATGTGGTTTGGTGATCTAATTGACATAAGACAGTTTGAAAACAGTGAACAAGATCTCTATATTAGGATGTTTGGTTCAGAGTTAGACAGATCTGAAAGGCATGTAGATGATCTTGATCTCCCATTGTTTGATCTGCCAACCATTTCCACTGCAACTAATGGCTTCTCCGAAAACAATAAAATTGGCGAAGGTGGTTTTGGAACTGTATATAAGGGAATAATAGTCAATGATCAAGAGATGATTGCTGTTAAGAGACTTTCAAGCATCTCAGGACAAGGAATGACCGAGTTCATAAATGAAGTAAAGCTAATAGCAAAGCTTCAACACCGAAATCTAGTAAAGCTGCTAGGTTCTTGCATTCAAGGAGAAGAACAAATGTTGATTTATGAATACATGGCTAACGGTAGCCTAGACTCCTTCATTTTTGATGATACCAAGAGTAAATTGTTAGATTGGCCAACACGGTTCCATATAATTTGTGGAATCGGTAGGGGGCTCGTGTATCTTCATCAAGATTCCCGATTAAGGATTATCCATAGAGATCTCAAAGCAAGTAATGTTTTACTCGACGATAATTTGAATCCAAAAATATCAGATTTTGGAACAGCTAGAACTTTTGGAGGAGACCAAATCAAAGGAAAAACAGAAAGAATAATTGGGACTTATGGGTACATGGCACCAGAGTATGCTGTTGATGGATTGTTTTCAGTGAAGTCTGATGTTTTTAGCTTCGGAATTTTATTATTGGAGATTATCTGTGGCAAAAGAAATAGAGCATATTATCACACAGATGAGACTCTTAACCTTGTTCGCCAAGCATGGGCATTGTGGAAAGAAGAGAGGGCTTTAGAGTTGATCGACTCAAACTTAGGCGAGACGTATGTTGTATCAGAAGTGTTGCGTTGTATGCATGTTAGTCTCTTGTGTGCACAGCAGAATCCTGAAGATAGGCCTACCATGTCGTCTGTGATTCTAATGTTGGGGAGTAGTACTGAGATGGAATTAAGGGAGCCTGAAGAACCTGGTTTCATTTCCAAAAAGTTATTGACAAATCAGAAGGATTGCAGTACAGTCAATGAAGTGACCATTTCCTTATTAGATGCTCGATGA
Protein sequence

>MsG0480022067.01.T01

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