AlfalfaGEDB Alfalfa Gene Editing Database

M. sativa cultivar ZhongmuNo.1 / MsG0480022718.01

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MsG0480022718.01.T01 AT1G74630 25.373 402 259 11 45 429 172 549 1.82e-23 105
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MsG0480022718.01.T01 AT3G15930 23.285 481 292 12 14 436 189 650 2.84e-22 102
MsG0480022718.01.T01 AT4G22760 31.107 524 329 9 58 570 67 569 8.98e-82 270
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MsG0480022718.01.T01 AT1G18485 29.253 629 367 12 1 570 228 837 3.47e-74 258
MsG0480022718.01.T01 AT1G18485 22.533 608 354 15 45 541 100 701 1.23e-33 138
MsG0480022718.01.T01 AT1G18485 24.000 375 225 7 129 452 50 415 2.88e-24 109
MsG0480022718.01.T01 AT5G13230 28.776 629 359 11 1 570 90 688 3.94e-74 255
MsG0480022718.01.T01 AT5G13230 24.551 501 345 10 53 541 74 553 1.69e-34 141
MsG0480022718.01.T01 AT1G33350 37.771 323 195 4 253 570 181 502 6.68e-74 248
MsG0480022718.01.T01 AT1G33350 30.769 221 131 6 16 231 151 354 1.98e-21 99.0
MsG0480022718.01.T01 AT1G33350 25.070 355 200 9 108 411 107 446 3.26e-19 92.0
MsG0480022718.01.T01 AT1G33350 37.771 323 195 4 253 570 181 502 6.68e-74 248
MsG0480022718.01.T01 AT1G33350 30.769 221 131 6 16 231 151 354 1.98e-21 99.0
MsG0480022718.01.T01 AT1G33350 25.070 355 200 9 108 411 107 446 3.26e-19 92.0
MsG0480022718.01.T01 AT5G08305 38.953 344 206 4 230 570 139 481 6.79e-74 248
MsG0480022718.01.T01 AT5G08305 23.837 344 231 8 1 328 149 477 7.13e-17 84.7
MsG0480022718.01.T01 AT5G08305 23.810 273 158 6 25 291 142 370 1.03e-15 81.3
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MsG0480022718.01.T01 AT1G59720 25.641 312 166 11 64 328 190 482 6.92e-16 82.0
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MsG0480022718.01.T01 AT1G10330 21.555 283 185 5 1 265 57 320 9.56e-11 65.1
MsG0480022718.01.T01 AT2G02980 31.105 389 227 3 222 570 82 469 7.07e-63 220
MsG0480022718.01.T01 AT2G02980 30.290 241 162 5 279 517 77 313 3.38e-25 111
MsG0480022718.01.T01 AT2G02980 22.485 338 184 10 11 292 79 394 6.73e-12 69.3
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MsG0480022718.01.T01 AT3G56550 23.322 283 187 7 59 326 141 408 1.05e-13 74.7
MsG0480022718.01.T01 AT1G64310 24.723 542 324 9 70 570 50 548 7.17e-52 189
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MsG0480022718.01.T01 AT1G11710 22.045 313 218 7 202 494 223 529 1.42e-12 71.2
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MsG0480022718.01.T01 AT5G40400 22.538 457 290 17 103 511 160 600 3.42e-14 76.6
MsG0480022718.01.T01 AT5G40400 23.724 392 238 11 59 430 236 586 1.78e-12 71.2
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MsG0480022718.01.T01 AT1G18900 25.461 271 176 11 303 553 329 593 2.16e-14 77.4
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MsG0480022718.01.T01 AT1G18900 22.507 351 221 9 106 443 343 655 1.78e-16 84.3
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MsG0480022718.01.T01 AT1G18900 25.461 271 176 11 303 553 329 593 2.16e-14 77.4
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MsG0480022718.01.T01 AT5G16420 24.000 325 225 9 202 507 190 511 1.23e-15 80.9
MsG0480022718.01.T01 AT5G16420 25.899 278 167 10 1 256 232 492 1.86e-16 83.6
MsG0480022718.01.T01 AT5G16420 24.000 325 225 9 202 507 190 511 1.23e-15 80.9
MsG0480022718.01.T01 AT5G16420 25.899 278 167 10 1 256 232 492 1.86e-16 83.6
MsG0480022718.01.T01 AT5G16420 24.000 325 225 9 202 507 190 511 1.23e-15 80.9
MsG0480022718.01.T01 AT5G65820 21.805 532 303 15 65 568 188 634 1.96e-16 83.6
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MsG0480022718.01.T01 AT2G19280 21.800 500 332 18 28 483 182 666 3.24e-16 83.2
MsG0480022718.01.T01 AT2G19280 21.800 500 332 18 28 483 182 666 3.24e-16 83.2
MsG0480022718.01.T01 AT2G19280 21.800 500 332 18 28 483 182 666 3.24e-16 83.2
MsG0480022718.01.T01 AT2G17525 21.442 513 338 13 2 492 153 622 3.95e-16 82.8
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MsG0480022718.01.T01 AT1G63630 27.059 170 105 6 1 154 102 268 5.46e-13 70.5
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MsG0480022718.01.T01 AT5G14820 23.256 301 194 10 13 290 281 567 1.55e-15 80.9
MsG0480022718.01.T01 AT5G14820 19.643 392 247 12 59 427 193 539 7.48e-12 68.9
MsG0480022718.01.T01 AT1G55890 23.301 309 192 8 196 491 67 343 2.03e-15 79.3
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MsG0480022718.01.T01 AT1G06580 21.396 444 313 11 75 494 59 490 4.18e-15 79.0
MsG0480022718.01.T01 AT5G18950 24.646 353 222 12 164 490 146 480 3.79e-15 79.0
MsG0480022718.01.T01 AT1G06580 23.864 440 253 13 57 466 5 392 5.22e-15 78.2
MsG0480022718.01.T01 AT1G06580 23.864 440 253 13 57 466 5 392 5.22e-15 78.2
MsG0480022718.01.T01 AT2G37230 21.961 510 317 18 107 565 130 609 8.05e-15 79.0
MsG0480022718.01.T01 AT2G37230 21.388 533 333 16 10 519 165 634 5.75e-13 72.8
MsG0480022718.01.T01 AT3G49240 20.379 422 243 13 25 423 164 515 8.83e-15 78.6
MsG0480022718.01.T01 AT3G59040 21.294 371 239 11 66 387 152 518 1.02e-14 78.2
MsG0480022718.01.T01 AT3G59040 19.454 293 220 6 240 517 152 443 4.00e-12 69.7
MsG0480022718.01.T01 AT3G59040 19.325 326 230 8 56 360 212 525 5.01e-12 69.7
MsG0480022718.01.T01 AT3G59040 20.783 332 224 11 128 436 152 467 2.15e-11 67.4

Find 192 sgRNAs with CRISPR-Local

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TTTAATCTTTATGCTGATTT+AGG 0.157378 4:+75857427 MsG0480022718.01.T01:CDS
AGCCTATTGTGGGGCAAATA+TGG 0.178941 4:+75858725 MsG0480022718.01.T01:CDS
GCATAAGGAGCTGAACTTTC+TGG 0.217283 4:-75857397 None:intergenic
GCCTCTCTTGTGGACATCTT+GGG 0.221377 4:+75857220 MsG0480022718.01.T01:CDS
TGCCTCTCTTGTGGACATCT+TGG 0.239702 4:+75857219 MsG0480022718.01.T01:CDS
TTCTCTTAGCGGGCTTATAT+CGG 0.251247 4:+75856175 MsG0480022718.01.T01:CDS
CACCCACTTGCTTGACTGTT+TGG 0.256154 4:-75858837 None:intergenic
GTAATGAGGGAATTATTTAT+TGG 0.276837 4:-75856902 None:intergenic
TACCTATATAACCTTTATTT+CGG 0.280928 4:+75857096 MsG0480022718.01.T01:CDS
GCTGTGTGGGGTGCTCTACT+TGG 0.282120 4:+75857307 MsG0480022718.01.T01:CDS
GAAGACTATAAGGGTGCTAT+TGG 0.296199 4:+75856734 MsG0480022718.01.T01:CDS
TCGTGTAATGCTGTGGTAAA+TGG 0.301902 4:+75856083 MsG0480022718.01.T01:CDS
GCACCCCACACAGCCTTATC+TGG 0.310135 4:-75857298 None:intergenic
CTGTGTGGGGTGCTCTACTT+GGG 0.314109 4:+75857308 MsG0480022718.01.T01:CDS
TCCAAGACACAATATCTCTA+TGG 0.317838 4:-75855872 None:intergenic
GGATATGGCCGCTGAGATTT+TGG 0.327412 4:+75856220 MsG0480022718.01.T01:CDS
AATATGGGTAATAATGGTTA+TGG 0.328605 4:+75858741 MsG0480022718.01.T01:CDS
ACAGCCTTATCTGGTTTAAC+TGG 0.332420 4:-75857289 None:intergenic
GAATTATTTATTGGCAAATC+AGG 0.339539 4:-75856893 None:intergenic
GTCTTGGAACCTCATTATAT+CGG 0.340606 4:+75855887 MsG0480022718.01.T01:CDS
TGTGGACATCTTGGGGCGGC+AGG 0.343803 4:+75857228 MsG0480022718.01.T01:CDS
GCTTATAATACGTTGATTGC+AGG 0.365237 4:+75856287 MsG0480022718.01.T01:CDS
GCCTTTGATGGCTGCAAGAT+TGG 0.367166 4:+75857802 MsG0480022718.01.T01:CDS
GAAGACAAAGTGTGCCTATC+TGG 0.369792 4:-75856791 None:intergenic
TGGAGAGAGATGCTTGTTCT+TGG 0.371023 4:+75856495 MsG0480022718.01.T01:CDS
ATTGGAGGTTATGCATTTCA+TGG 0.372764 4:+75857016 MsG0480022718.01.T01:CDS
CAAGTCCTGATGTGCTTTCA+TGG 0.373832 4:+75856588 MsG0480022718.01.T01:CDS
AGCATTCAAAACCGAAATAA+AGG 0.375749 4:-75857107 None:intergenic
TACTCGAGATGTGGGGAAAT+TGG 0.377306 4:+75856929 MsG0480022718.01.T01:CDS
ATATCGGGGCTTGTTAGAAA+TGG 0.378051 4:+75856191 MsG0480022718.01.T01:CDS
TCAAAGCTTTGGCTGCTACT+TGG 0.382834 4:-75857363 None:intergenic
ATTTCATGGCTTTGCTGCAC+AGG 0.387616 4:+75857030 MsG0480022718.01.T01:CDS
TCATGGAATTCAATAATATC+CGG 0.388342 4:+75856605 MsG0480022718.01.T01:CDS
TCTCTTAGCGGGCTTATATC+GGG 0.389865 4:+75856176 MsG0480022718.01.T01:CDS
TAGAAATGGGAAGTTGGATA+TGG 0.389923 4:+75856205 MsG0480022718.01.T01:CDS
ATTAGTGGTTATGCGAAGAA+TGG 0.391268 4:+75856005 MsG0480022718.01.T01:CDS
CAAAGCTTTGGCTGCTACTT+GGG 0.393061 4:-75857362 None:intergenic
CGAGAGAGTAAAAGCGTTGA+TGG 0.396340 4:+75857465 MsG0480022718.01.T01:CDS
CAAGGGACTCCAGCCTTTGA+TGG 0.399495 4:+75857790 MsG0480022718.01.T01:CDS
TGGAAATGGAGAACTACAAT+TGG 0.404132 4:+75858797 MsG0480022718.01.T01:CDS
GGGGCAAATATGGGTAATAA+TGG 0.412417 4:+75858735 MsG0480022718.01.T01:CDS
ACCCATATTTGCCCCACAAT+AGG 0.412655 4:-75858727 None:intergenic
GTTGAATGGTGATGTGGATT+CGG 0.417564 4:+75856112 MsG0480022718.01.T01:CDS
AACCGAAATAAAGGTTATAT+AGG 0.421979 4:-75857098 None:intergenic
GCCTATTGTGGGGCAAATAT+GGG 0.423157 4:+75858726 MsG0480022718.01.T01:CDS
TGCCACTGCATCGATGGAAA+TGG 0.432578 4:+75858783 MsG0480022718.01.T01:CDS
TTCATCAGATTGAGCACCTT+CGG 0.432636 4:-75858151 None:intergenic
GAGTCCCTTGCTGCCGACAC+TGG 0.433200 4:-75857777 None:intergenic
TCAATTCTAAGTGTGAGTAC+TGG 0.434849 4:+75856812 MsG0480022718.01.T01:CDS
AGTGCATGGTAATGTAGAAT+TGG 0.435209 4:+75857339 MsG0480022718.01.T01:CDS
CTCAAGACCGATCAAAGCTT+TGG 0.438808 4:-75857374 None:intergenic
TGAACACTTTGCCTCTCTTG+TGG 0.440255 4:+75857210 MsG0480022718.01.T01:CDS
CACGACACACAATCCCTTTG+AGG 0.443900 4:-75855972 None:intergenic
CACGACACAACATTGCGTTC+CGG 0.448649 4:-75856065 None:intergenic
CAATTCTAAGTGTGAGTACT+GGG 0.451219 4:+75856813 MsG0480022718.01.T01:CDS
GGTGATGTGGATTCGGCTGT+TGG 0.452472 4:+75856119 MsG0480022718.01.T01:CDS
TTGCCGTGGAAGTAGGTTTG+TGG 0.454240 4:+75855920 MsG0480022718.01.T01:CDS
TATCGGGGCTTGTTAGAAAT+GGG 0.454321 4:+75856192 MsG0480022718.01.T01:CDS
GGGTGATGAGAAAGATGATT+TGG 0.456974 4:+75856259 MsG0480022718.01.T01:CDS
AAAAGAACAAGCTGCTGTCC+AGG 0.460382 4:+75858401 MsG0480022718.01.T01:CDS
GTTTGATATAATGCCTCAAA+GGG 0.461322 4:+75855959 MsG0480022718.01.T01:CDS
ATATGGGTAATAATGGTTAT+GGG 0.463623 4:+75858742 MsG0480022718.01.T01:CDS
TTAGTGGTTATGCGAAGAAT+GGG 0.466071 4:+75856006 MsG0480022718.01.T01:CDS
GATTAGTGGCTATGTTCAAA+TGG 0.466356 4:+75856526 MsG0480022718.01.T01:CDS
GAATTCCATGAAAGCACATC+AGG 0.467748 4:-75856593 None:intergenic
CTGCTAGGGAACTCTTTGAT+AGG 0.468621 4:+75856468 MsG0480022718.01.T01:CDS
TCTTGGAATACTGTGATTAG+TGG 0.468734 4:+75856512 MsG0480022718.01.T01:CDS
AATACCATGGTCAATAATCA+TGG 0.469382 4:-75857176 None:intergenic
CGTGTAATGCTGTGGTAAAT+GGG 0.470429 4:+75856084 MsG0480022718.01.T01:CDS
AACAGTCAAGCAAGTGGGTG+TGG 0.471796 4:+75858840 MsG0480022718.01.T01:CDS
TCGTGGAATACGGTTATTAG+TGG 0.473086 4:+75855990 MsG0480022718.01.T01:CDS
TCTTGGAACCTCATTATATC+GGG 0.475466 4:+75855888 MsG0480022718.01.T01:CDS
AAGACTATAAGGGTGCTATT+GGG 0.475951 4:+75856735 MsG0480022718.01.T01:CDS
CCAAGACACAATATCTCTAT+GGG 0.477035 4:-75855871 None:intergenic
GGATTGTGTGTCGTGGAATA+CGG 0.477300 4:+75855980 MsG0480022718.01.T01:CDS
CCTCTCTTGTGGACATCTTG+GGG 0.483192 4:+75857221 MsG0480022718.01.T01:CDS
TGATCAAGGTGAGGGAAATG+AGG 0.483828 4:+75856367 MsG0480022718.01.T01:CDS
CTGCAAGTTCATCAGAATCC+TGG 0.483950 4:-75858419 None:intergenic
AATACGTTGATTGCAGGGTA+TGG 0.484691 4:+75856293 MsG0480022718.01.T01:CDS
GTGACTCGGCTTCTCTTAGC+GGG 0.485699 4:+75856165 MsG0480022718.01.T01:CDS
TAATAATGGTTATGGGCCTA+TGG 0.486938 4:+75858749 MsG0480022718.01.T01:CDS
CATGCCAGTTAAACCAGATA+AGG 0.487398 4:+75857285 MsG0480022718.01.T01:CDS
CATGGAATTCAATAATATCC+GGG 0.490201 4:+75856606 MsG0480022718.01.T01:CDS
TACAATTGGGAGCTTCTGCT+TGG 0.492403 4:+75858811 MsG0480022718.01.T01:CDS
AATAATGTCAAGAAGCAAGC+AGG 0.492574 4:+75857493 MsG0480022718.01.T01:CDS
CATGAAAGCACATCAGGACT+TGG 0.496970 4:-75856587 None:intergenic
ATCTTGCAGCCATCAAAGGC+TGG 0.498679 4:-75857799 None:intergenic
GAAGTAGGTTTGTGGAGGAA+GGG 0.502358 4:+75855928 MsG0480022718.01.T01:CDS
GATGGGGTTATGAGTGATCA+AGG 0.504914 4:+75856353 MsG0480022718.01.T01:CDS
TTGAACGTAACCAGTGATCA+TGG 0.505238 4:-75855805 None:intergenic
ATAACTTGGAATGCAATGAT+TGG 0.505940 4:+75856998 MsG0480022718.01.T01:CDS
CTTATAATACGTTGATTGCA+GGG 0.506539 4:+75856288 MsG0480022718.01.T01:CDS
GTAGGTTTGTGGAGGAAGGG+AGG 0.506682 4:+75855931 MsG0480022718.01.T01:CDS
TCTGTAAAGATGTGATAACT+TGG 0.506815 4:+75856984 MsG0480022718.01.T01:CDS
AGATTAAATAACAACGCATA+AGG 0.507089 4:-75857412 None:intergenic
ATTAGTGGCTATGTTCAAAT+GGG 0.507481 4:+75856527 MsG0480022718.01.T01:CDS
GGGACAGCTTCAAGTGGCTA+TGG 0.512202 4:+75857249 MsG0480022718.01.T01:CDS
TTGAGGGAGAGAGACCAGAT+AGG 0.517683 4:+75856777 MsG0480022718.01.T01:CDS
AGAAAAGGAAAGCCTATTGT+GGG 0.518396 4:+75858715 MsG0480022718.01.T01:intron
GGAAGTAGGTTTGTGGAGGA+AGG 0.518874 4:+75855927 MsG0480022718.01.T01:CDS
CGTGACTCGGCTTCTCTTAG+CGG 0.520544 4:+75856164 MsG0480022718.01.T01:CDS
TTATGCTGATTTAGGACAGT+GGG 0.521486 4:+75857435 MsG0480022718.01.T01:CDS
TGGCAGTTGCACCATGCCAT+AGG 0.522455 4:-75858765 None:intergenic
GTGATGTGGATTCGGCTGTT+GGG 0.523197 4:+75856120 MsG0480022718.01.T01:CDS
TGCAACTGCCACTGCATCGA+TGG 0.523695 4:+75858777 MsG0480022718.01.T01:CDS
TGACCATGGTATTGAGCCAC+GGG 0.530686 4:+75857186 MsG0480022718.01.T01:CDS
TTGAATGCTTGTGCACATGC+AGG 0.530710 4:+75857121 MsG0480022718.01.T01:CDS
GTGGACATCTTGGGGCGGCA+GGG 0.531574 4:+75857229 MsG0480022718.01.T01:CDS
TAAACCAGATAAGGCTGTGT+GGG 0.532719 4:+75857294 MsG0480022718.01.T01:CDS
TGTTTGATATAATGCCTCAA+AGG 0.532744 4:+75855958 MsG0480022718.01.T01:CDS
ATCTCGAGTACATGGTAATG+AGG 0.532839 4:-75856916 None:intergenic
TTCCCCACATCTCGAGTACA+TGG 0.533318 4:-75856924 None:intergenic
TTTGCCAGTGTCGGCAGCAA+GGG 0.534075 4:+75857773 MsG0480022718.01.T01:CDS
ACTTGGAATGCAATGATTGG+AGG 0.535865 4:+75857001 MsG0480022718.01.T01:CDS
AAGAAAAGGAAAGCCTATTG+TGG 0.535884 4:+75858714 MsG0480022718.01.T01:intron
GCTTGTTAGAAATGGGAAGT+TGG 0.536251 4:+75856199 MsG0480022718.01.T01:CDS
GAAATAAAGGTTATATAGGT+AGG 0.536503 4:-75857094 None:intergenic
GGGGCATTTCATCGAACAGT+TGG 0.539111 4:-75855851 None:intergenic
GTGAGGGAAATGAGGGTACA+AGG 0.539592 4:+75856375 MsG0480022718.01.T01:CDS
TCGTGGAACTCAGTAATAGC+TGG 0.539709 4:+75856698 MsG0480022718.01.T01:CDS
TTGGTTGAGTATGGGAATGA+GGG 0.540381 4:+75856239 MsG0480022718.01.T01:CDS
TTTGGTTGAGTATGGGAATG+AGG 0.542918 4:+75856238 MsG0480022718.01.T01:CDS
CAGGAGATGTTGTCTCTGCT+AGG 0.544772 4:+75856453 MsG0480022718.01.T01:CDS
CTCCATTTCCATCGATGCAG+TGG 0.544953 4:-75858785 None:intergenic
CTCTTAGCGGGCTTATATCG+GGG 0.545638 4:+75856177 MsG0480022718.01.T01:CDS
CCACCATCTGATGTAGCAGT+AGG 0.546053 4:+75858111 MsG0480022718.01.T01:CDS
GGAAATGGAGAACTACAATT+GGG 0.546511 4:+75858798 MsG0480022718.01.T01:CDS
TAGGGAACTCTTTGATAGGA+TGG 0.548239 4:+75856472 MsG0480022718.01.T01:CDS
TTACCATGTACTCGAGATGT+GGG 0.550822 4:+75856921 MsG0480022718.01.T01:CDS
TTCCCTACTGCTACATCAGA+TGG 0.551309 4:-75858114 None:intergenic
ATTACCATGTACTCGAGATG+TGG 0.552609 4:+75856920 MsG0480022718.01.T01:CDS
AGATTGAGCACCTTCGGTAT+CGG 0.552940 4:-75858145 None:intergenic
ATGATGTGTTATGTGAAAGC+AGG 0.553419 4:+75856434 MsG0480022718.01.T01:CDS
ACATGGAATTCCATGATCAC+TGG 0.556982 4:+75855795 None:intergenic
ACCAATCTTGCAGCCATCAA+AGG 0.557874 4:-75857803 None:intergenic
AAAAGTAACCCGATATAATG+AGG 0.561003 4:-75855896 None:intergenic
CCCATAGAGATATTGTGTCT+TGG 0.566082 4:+75855871 MsG0480022718.01.T01:CDS
CTTGGGGCTTGTAGAGTGCA+TGG 0.567341 4:+75857325 MsG0480022718.01.T01:CDS
TGCAGATAGCACTTTGAACA+AGG 0.568409 4:+75858437 MsG0480022718.01.T01:CDS
CATGCAGGATTAGTTGAAGA+AGG 0.568578 4:+75857136 MsG0480022718.01.T01:CDS
ATCACCAATCTGAGAAAACC+CGG 0.572642 4:-75856624 None:intergenic
TTAAGAGAAATGTGGTATCG+TGG 0.574214 4:+75856402 MsG0480022718.01.T01:CDS
AGGAGATGTTGTCTCTGCTA+GGG 0.574543 4:+75856454 MsG0480022718.01.T01:CDS
ATTTGCCAGTGTCGGCAGCA+AGG 0.580912 4:+75857772 MsG0480022718.01.T01:CDS
CCTCCACAAACCTACTTCCA+CGG 0.587254 4:-75855923 None:intergenic
CACCATCTGATGTAGCAGTA+GGG 0.588083 4:+75858112 MsG0480022718.01.T01:CDS
TCTAAGTGTGAGTACTGGGT+TGG 0.589212 4:+75856817 MsG0480022718.01.T01:CDS
GGGTTGGTCGATCTTTACCT+TGG 0.590188 4:+75856833 MsG0480022718.01.T01:CDS
TGTGTGGGGTGCTCTACTTG+GGG 0.593295 4:+75857309 MsG0480022718.01.T01:CDS
CCCCAAGATGTCCACAAGAG+AGG 0.597426 4:-75857221 None:intergenic
TTGACCATGGTATTGAGCCA+CGG 0.600846 4:+75857185 MsG0480022718.01.T01:CDS
GATTAGTTGAAGAAGGAAAG+AGG 0.600988 4:+75857143 MsG0480022718.01.T01:CDS
AATTCCATGATTATTGACCA+TGG 0.602124 4:+75857172 MsG0480022718.01.T01:CDS
GTGGTTATGCGAAGAATGGG+AGG 0.603338 4:+75856009 MsG0480022718.01.T01:CDS
GCGGCAGGGACAGCTTCAAG+TGG 0.604306 4:+75857243 MsG0480022718.01.T01:CDS
ATAGATCTATTTGCCAGTGT+CGG 0.605354 4:+75857764 MsG0480022718.01.T01:intron
AAGGAGATTTAAGAGAAATG+TGG 0.606939 4:+75856394 MsG0480022718.01.T01:CDS
ATGTGAAAGAGTTCTTTGAA+AGG 0.608504 4:+75856654 MsG0480022718.01.T01:CDS
CCGTGGAAGTAGGTTTGTGG+AGG 0.611868 4:+75855923 MsG0480022718.01.T01:CDS
GATCAAGGTGAGGGAAATGA+GGG 0.619658 4:+75856368 MsG0480022718.01.T01:CDS
TCTCGAGTACATGGTAATGA+GGG 0.620119 4:-75856915 None:intergenic
GAAGATGAGAGAGCGTGACT+CGG 0.620249 4:+75856151 MsG0480022718.01.T01:CDS
GTAGCAGCCAAAGCTTTGAT+CGG 0.623119 4:+75857367 MsG0480022718.01.T01:CDS
GTTATGAGTGATCAAGGTGA+GGG 0.624207 4:+75856359 MsG0480022718.01.T01:CDS
TCAGAGAGGAATGGTTGAAG+AGG 0.627609 4:+75856316 MsG0480022718.01.T01:CDS
AATGAAAATGCCGATACCGA+AGG 0.631930 4:+75858135 MsG0480022718.01.T01:CDS
ATAATGTCAAGAAGCAAGCA+GGG 0.633078 4:+75857494 MsG0480022718.01.T01:CDS
TTATGCGAAGAATGGGAGGA+TGG 0.637099 4:+75856013 MsG0480022718.01.T01:CDS
GAGGAATGGTTGAAGAGGCG+CGG 0.639155 4:+75856321 MsG0480022718.01.T01:CDS
GGAACTCTTTGATAGGATGG+TGG 0.640861 4:+75856475 MsG0480022718.01.T01:CDS
TTTCCAAACAGTCAAGCAAG+TGG 0.640959 4:+75858834 MsG0480022718.01.T01:CDS
GCTGATGTATCTGCTTGCCA+AGG 0.647697 4:-75856850 None:intergenic
GGTTATGAGTGATCAAGGTG+AGG 0.647785 4:+75856358 MsG0480022718.01.T01:CDS
AGGGTATGGTCAGAGAGGAA+TGG 0.648398 4:+75856307 MsG0480022718.01.T01:CDS
TTCCAAACAGTCAAGCAAGT+GGG 0.652521 4:+75858835 MsG0480022718.01.T01:CDS
CAACCCGTGGCTCAATACCA+TGG 0.656313 4:-75857189 None:intergenic
CTCAAAGGGATTGTGTGTCG+TGG 0.658451 4:+75855973 MsG0480022718.01.T01:CDS
TTTATGCTGATTTAGGACAG+TGG 0.659657 4:+75857434 MsG0480022718.01.T01:CDS
CTCTTGTGGACATCTTGGGG+CGG 0.660746 4:+75857224 MsG0480022718.01.T01:CDS
GAGGCAAAGTGTTCAACCCG+TGG 0.669664 4:-75857202 None:intergenic
TTAGTGGCTATGTTCAAATG+GGG 0.675056 4:+75856528 MsG0480022718.01.T01:CDS
ATGGTTATGGGCCTATGGCA+TGG 0.677078 4:+75858754 MsG0480022718.01.T01:CDS
TAGTGGCTATGTTCAAATGG+GGG 0.680708 4:+75856529 MsG0480022718.01.T01:CDS
TACCATGTACTCGAGATGTG+GGG 0.686114 4:+75856922 MsG0480022718.01.T01:CDS
CCTACTGCTACATCAGATGG+TGG 0.686306 4:-75858111 None:intergenic
AAACCAGATAAGGCTGTGTG+GGG 0.686880 4:+75857295 MsG0480022718.01.T01:CDS
TGTTGTGTCGTGTAATGCTG+TGG 0.686920 4:+75856076 MsG0480022718.01.T01:CDS
GAAAAGGAAAGCCTATTGTG+GGG 0.693864 4:+75858716 MsG0480022718.01.T01:intron
ATTGCAGGGTATGGTCAGAG+AGG 0.702523 4:+75856302 MsG0480022718.01.T01:CDS
TTAAACCAGATAAGGCTGTG+TGG 0.715792 4:+75857293 MsG0480022718.01.T01:CDS
CAAGACACAATATCTCTATG+GGG 0.728806 4:-75855870 None:intergenic
ATACTCAACCAAAATCTCAG+CGG 0.748071 4:-75856228 None:intergenic

CRISPR-GE

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!!! AATGATAAATTTTTCCATTT+TGG + Chr4:75857545-75857564 MsG0480022718.01.T01:intron 15.0%
!! AAAAATTTATCATTGACGAT+TGG - Chr4:75857539-75857558 None:intergenic 20.0%
!! ACAGAAAAGTTATAACATTT+AGG - Chr4:75857736-75857755 None:intergenic 20.0%
!! ATATTAATGAATAAGAGCAA+AGG - Chr4:75858327-75858346 None:intergenic 20.0%
!! CTCTTATTCATTAATATATC+TGG + Chr4:75858330-75858349 MsG0480022718.01.T01:intron 20.0%
!! GTGAGAAAGAATAAAATATA+GGG + Chr4:75857995-75858014 MsG0480022718.01.T01:intron 20.0%
!! TGTGAGAAAGAATAAAATAT+AGG + Chr4:75857994-75858013 MsG0480022718.01.T01:intron 20.0%
!!! TACCTATATAACCTTTATTT+CGG + Chr4:75857096-75857115 MsG0480022718.01.T01:CDS 20.0%
!!! TTTAATCTTTATGCTGATTT+AGG + Chr4:75857427-75857446 MsG0480022718.01.T01:CDS 20.0%
! AACCGAAATAAAGGTTATAT+AGG - Chr4:75857101-75857120 None:intergenic 25.0%
! AATATGGGTAATAATGGTTA+TGG + Chr4:75858741-75858760 MsG0480022718.01.T01:CDS 25.0%
! AGATTAAATAACAACGCATA+AGG - Chr4:75857415-75857434 None:intergenic 25.0%
! ATATGGGTAATAATGGTTAT+GGG + Chr4:75858742-75858761 MsG0480022718.01.T01:CDS 25.0%
! GAAATAAAGGTTATATAGGT+AGG - Chr4:75857097-75857116 None:intergenic 25.0%
! GAATTATTTATTGGCAAATC+AGG - Chr4:75856896-75856915 None:intergenic 25.0%
! GAGAAAAATGAAGACTATAA+GGG + Chr4:75856725-75856744 MsG0480022718.01.T01:CDS 25.0%
! GTAATGAGGGAATTATTTAT+TGG - Chr4:75856905-75856924 None:intergenic 25.0%
! TCATGGAATTCAATAATATC+CGG + Chr4:75856605-75856624 MsG0480022718.01.T01:CDS 25.0%
! TTATTCTTTCTCACAAGTAA+TGG - Chr4:75857989-75858008 None:intergenic 25.0%
!!! ATAGATTTTGAAAAGGCAAA+AGG + Chr4:75858188-75858207 MsG0480022718.01.T01:intron 25.0%
AAAAGTAACCCGATATAATG+AGG - Chr4:75855899-75855918 None:intergenic 30.0%
AAATATAGGGAAACATTGAG+TGG + Chr4:75858008-75858027 MsG0480022718.01.T01:intron 30.0%
AAGGAGATTTAAGAGAAATG+TGG + Chr4:75856394-75856413 MsG0480022718.01.T01:CDS 30.0%
AATACCATGGTCAATAATCA+TGG - Chr4:75857179-75857198 None:intergenic 30.0%
AATATAGGGAAACATTGAGT+GGG + Chr4:75858009-75858028 MsG0480022718.01.T01:intron 30.0%
AATATATGTGACCTTATACG+TGG + Chr4:75857892-75857911 MsG0480022718.01.T01:intron 30.0%
AATTCCATGATTATTGACCA+TGG + Chr4:75857172-75857191 MsG0480022718.01.T01:CDS 30.0%
AGCATTCAAAACCGAAATAA+AGG - Chr4:75857110-75857129 None:intergenic 30.0%
ATAACTTGGAATGCAATGAT+TGG + Chr4:75856998-75857017 MsG0480022718.01.T01:CDS 30.0%
ATATGGTCAGATAGGAAAAT+TGG + Chr4:75857582-75857601 MsG0480022718.01.T01:intron 30.0%
ATGCAATGGTAAAAAAGACA+AGG + Chr4:75858262-75858281 MsG0480022718.01.T01:intron 30.0%
ATGTGAAAGAGTTCTTTGAA+AGG + Chr4:75856654-75856673 MsG0480022718.01.T01:CDS 30.0%
ATTAGTGGCTATGTTCAAAT+GGG + Chr4:75856527-75856546 MsG0480022718.01.T01:CDS 30.0%
CAAATATTTAATCGAGAAGC+AGG - Chr4:75857847-75857866 None:intergenic 30.0%
CATGGAATTCAATAATATCC+GGG + Chr4:75856606-75856625 MsG0480022718.01.T01:CDS 30.0%
CGAGAAAAATGAAGACTATA+AGG + Chr4:75856724-75856743 MsG0480022718.01.T01:CDS 30.0%
GTAATAATGCAACAAAGAAC+AGG - Chr4:75858678-75858697 None:intergenic 30.0%
GTTTGATATAATGCCTCAAA+GGG + Chr4:75855959-75855978 MsG0480022718.01.T01:CDS 30.0%
TATGAAAGATTCCACGTATA+AGG - Chr4:75857906-75857925 None:intergenic 30.0%
TATTAATATGCGCCAAACTA+TGG - Chr4:75858467-75858486 None:intergenic 30.0%
TCGAAGAAATAGTATGTCTT+CGG + Chr4:75857649-75857668 MsG0480022718.01.T01:intron 30.0%
TCTGTAAAGATGTGATAACT+TGG + Chr4:75856984-75857003 MsG0480022718.01.T01:CDS 30.0%
TCTTTGTTGCATTATTACTG+TGG + Chr4:75858680-75858699 MsG0480022718.01.T01:intron 30.0%
TGAAGAAGAGATACAAAGTT+TGG + Chr4:75858597-75858616 MsG0480022718.01.T01:intron 30.0%
TGTTTGATATAATGCCTCAA+AGG + Chr4:75855958-75855977 MsG0480022718.01.T01:CDS 30.0%
! CACAAGTAATGGAATTGAAT+AGG - Chr4:75857978-75857997 None:intergenic 30.0%
! CTTATAATACGTTGATTGCA+GGG + Chr4:75856288-75856307 MsG0480022718.01.T01:CDS 30.0%
! GGTTTTCTTATATCAAGCTT+AGG - Chr4:75857957-75857976 None:intergenic 30.0%
! TGAGATTTTTGAATCTATGC+CGG + Chr4:75856046-75856065 MsG0480022718.01.T01:CDS 30.0%
! TTGACGAGTTATGTATCTTT+TGG + Chr4:75857867-75857886 MsG0480022718.01.T01:intron 30.0%
!! CAAGCTCATAGATTTTGAAA+AGG + Chr4:75858181-75858200 MsG0480022718.01.T01:intron 30.0%
!! GTAAATGGGTTTTTGTTGAA+TGG + Chr4:75856098-75856117 MsG0480022718.01.T01:CDS 30.0%
!!! GTCTTTTTTACCATTGCATA+TGG - Chr4:75858261-75858280 None:intergenic 30.0%
AAGAAAAGGAAAGCCTATTG+TGG + Chr4:75858714-75858733 MsG0480022718.01.T01:intron 35.0%
AATAATGTCAAGAAGCAAGC+AGG + Chr4:75857493-75857512 MsG0480022718.01.T01:CDS 35.0%
AGAAAAGGAAAGCCTATTGT+GGG + Chr4:75858715-75858734 MsG0480022718.01.T01:intron 35.0%
ATAATGTCAAGAAGCAAGCA+GGG + Chr4:75857494-75857513 MsG0480022718.01.T01:CDS 35.0%
ATACTCAACCAAAATCTCAG+CGG - Chr4:75856231-75856250 None:intergenic 35.0%
ATAGATCTATTTGCCAGTGT+CGG + Chr4:75857764-75857783 MsG0480022718.01.T01:intron 35.0%
ATGATGTGTTATGTGAAAGC+AGG + Chr4:75856434-75856453 MsG0480022718.01.T01:CDS 35.0%
ATTAGTGGTTATGCGAAGAA+TGG + Chr4:75856005-75856024 MsG0480022718.01.T01:CDS 35.0%
ATTGGAGGTTATGCATTTCA+TGG + Chr4:75857016-75857035 MsG0480022718.01.T01:CDS 35.0%
CAAGACACAATATCTCTATG+GGG - Chr4:75855873-75855892 None:intergenic 35.0%
CAATTCTAAGTGTGAGTACT+GGG + Chr4:75856813-75856832 MsG0480022718.01.T01:CDS 35.0%
CCAAGACACAATATCTCTAT+GGG - Chr4:75855874-75855893 None:intergenic 35.0%
CGAAGAAATAGTATGTCTTC+GGG + Chr4:75857650-75857669 MsG0480022718.01.T01:intron 35.0%
GAACAAGGTAAACCATAGTT+TGG + Chr4:75858452-75858471 MsG0480022718.01.T01:intron 35.0%
GAACTTGAACTTGACCAAAA+TGG - Chr4:75857562-75857581 None:intergenic 35.0%
GATTAGTGGCTATGTTCAAA+TGG + Chr4:75856526-75856545 MsG0480022718.01.T01:CDS 35.0%
GGAAATGGAGAACTACAATT+GGG + Chr4:75858798-75858817 MsG0480022718.01.T01:CDS 35.0%
GTCTTGGAACCTCATTATAT+CGG + Chr4:75855887-75855906 MsG0480022718.01.T01:CDS 35.0%
TAATAATGGTTATGGGCCTA+TGG + Chr4:75858749-75858768 MsG0480022718.01.T01:CDS 35.0%
TAGAAATGGGAAGTTGGATA+TGG + Chr4:75856205-75856224 MsG0480022718.01.T01:CDS 35.0%
TCAAAATGTGCAGCAGAAAA+GGG + Chr4:75858533-75858552 MsG0480022718.01.T01:intron 35.0%
TCAAGTTCATATGGTCAGAT+AGG + Chr4:75857574-75857593 MsG0480022718.01.T01:intron 35.0%
TCAATTCTAAGTGTGAGTAC+TGG + Chr4:75856812-75856831 MsG0480022718.01.T01:CDS 35.0%
TCCAAGACACAATATCTCTA+TGG - Chr4:75855875-75855894 None:intergenic 35.0%
TCTTGGAACCTCATTATATC+GGG + Chr4:75855888-75855907 MsG0480022718.01.T01:CDS 35.0%
TCTTGGAATACTGTGATTAG+TGG + Chr4:75856512-75856531 MsG0480022718.01.T01:CDS 35.0%
TGGAAATGGAGAACTACAAT+TGG + Chr4:75858797-75858816 MsG0480022718.01.T01:CDS 35.0%
TGTATCTCTTCTTCAAATCC+AGG - Chr4:75858592-75858611 None:intergenic 35.0%
TTAAGAGAAATGTGGTATCG+TGG + Chr4:75856402-75856421 MsG0480022718.01.T01:CDS 35.0%
TTAGTGGCTATGTTCAAATG+GGG + Chr4:75856528-75856547 MsG0480022718.01.T01:CDS 35.0%
TTAGTGGTTATGCGAAGAAT+GGG + Chr4:75856006-75856025 MsG0480022718.01.T01:CDS 35.0%
TTCAAAATGTGCAGCAGAAA+AGG + Chr4:75858532-75858551 MsG0480022718.01.T01:intron 35.0%
! AGTGCATGGTAATGTAGAAT+TGG + Chr4:75857339-75857358 MsG0480022718.01.T01:CDS 35.0%
! GATTAGTTGAAGAAGGAAAG+AGG + Chr4:75857143-75857162 MsG0480022718.01.T01:CDS 35.0%
! GCTTATAATACGTTGATTGC+AGG + Chr4:75856287-75856306 MsG0480022718.01.T01:CDS 35.0%
! TGGTCAAGTTCAAGTTCATA+TGG + Chr4:75857565-75857584 MsG0480022718.01.T01:intron 35.0%
!! AAGACTATAAGGGTGCTATT+GGG + Chr4:75856735-75856754 MsG0480022718.01.T01:CDS 35.0%
!! GTTTTTGTTGAATGGTGATG+TGG + Chr4:75856106-75856125 MsG0480022718.01.T01:CDS 35.0%
!! TTATGCTGATTTAGGACAGT+GGG + Chr4:75857435-75857454 MsG0480022718.01.T01:CDS 35.0%
!! TTTATGCTGATTTAGGACAG+TGG + Chr4:75857434-75857453 MsG0480022718.01.T01:CDS 35.0%
!!! AGAGGCTTCAAAGCTTTTTT+TGG + Chr4:75856559-75856578 MsG0480022718.01.T01:CDS 35.0%
!!! CTGAGATTTTGGTTGAGTAT+GGG + Chr4:75856231-75856250 MsG0480022718.01.T01:CDS 35.0%
!!! TGAGTGGGTTTTTGTTTTAG+TGG + Chr4:75858024-75858043 MsG0480022718.01.T01:intron 35.0%
AATGAAAATGCCGATACCGA+AGG + Chr4:75858135-75858154 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
ACTCACTCTACCATATGCAA+TGG + Chr4:75858248-75858267 MsG0480022718.01.T01:intron 40.0%
ACTTGGAATGCAATGATTGG+AGG + Chr4:75857001-75857020 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
ATCACCAATCTGAGAAAACC+CGG - Chr4:75856627-75856646 None:intergenic 40.0%
ATCTCTTCTTCAAATCCAGG+AGG - Chr4:75858589-75858608 None:intergenic 40.0%
ATTACCATGTACTCGAGATG+TGG + Chr4:75856920-75856939 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
CATGCCAGTTAAACCAGATA+AGG + Chr4:75857285-75857304 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
CCCATAGAGATATTGTGTCT+TGG + Chr4:75855871-75855890 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
CGTGTAATGCTGTGGTAAAT+GGG + Chr4:75856084-75856103 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
GAAAAGGAAAGCCTATTGTG+GGG + Chr4:75858716-75858735 MsG0480022718.01.T01:intron 40.0%
GGGGCAAATATGGGTAATAA+TGG + Chr4:75858735-75858754 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
GGGTGATGAGAAAGATGATT+TGG + Chr4:75856259-75856278 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
GTTATGAGTGATCAAGGTGA+GGG + Chr4:75856359-75856378 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
TAAACCAGATAAGGCTGTGT+GGG + Chr4:75857294-75857313 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
TAGGGAACTCTTTGATAGGA+TGG + Chr4:75856472-75856491 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
TAGTGGCTATGTTCAAATGG+GGG + Chr4:75856529-75856548 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
TATGTCTTCGGGCTGATATT+TGG + Chr4:75857661-75857680 MsG0480022718.01.T01:intron 40.0%
TCGTGGAATACGGTTATTAG+TGG + Chr4:75855990-75856009 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
TCGTGTAATGCTGTGGTAAA+TGG + Chr4:75856083-75856102 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
TGCAGATAGCACTTTGAACA+AGG + Chr4:75858437-75858456 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
TGGTTGCTCTTGCAAAGAAA+AGG + Chr4:75858700-75858719 MsG0480022718.01.T01:intron 40.0%
TGTGCATGGAAACAATGAAC+TGG - Chr4:75858627-75858646 None:intergenic 40.0%
TTAAACCAGATAAGGCTGTG+TGG + Chr4:75857293-75857312 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
TTACCATGTACTCGAGATGT+GGG + Chr4:75856921-75856940 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
TTCATCAGATTGAGCACCTT+CGG - Chr4:75858154-75858173 None:intergenic 40.0%
TTCCAAACAGTCAAGCAAGT+GGG + Chr4:75858835-75858854 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
TTGCATATGGTAGAGTGAGT+CGG - Chr4:75858248-75858267 None:intergenic 40.0%
TTGGTTGAGTATGGGAATGA+GGG + Chr4:75856239-75856258 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
TTTCCAAACAGTCAAGCAAG+TGG + Chr4:75858834-75858853 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
TTTGGTTGAGTATGGGAATG+AGG + Chr4:75856238-75856257 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
! AATACGTTGATTGCAGGGTA+TGG + Chr4:75856293-75856312 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
! ACAGCCTTATCTGGTTTAAC+TGG - Chr4:75857292-75857311 None:intergenic 40.0%
! ATATCCGGGTTTTCTCAGAT+TGG + Chr4:75856620-75856639 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
! ATCTCGAGTACATGGTAATG+AGG - Chr4:75856919-75856938 None:intergenic 40.0%
! ATTTTCTCAGATGCAGCTTG+AGG + Chr4:75856760-75856779 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
! CACGAGATCAAGTTTTTGTG+GGG - Chr4:75856683-75856702 None:intergenic 40.0%
! CATCAACGCTTTTACTCTCT+CGG - Chr4:75857467-75857486 None:intergenic 40.0%
! CCACGAGATCAAGTTTTTGT+GGG - Chr4:75856684-75856703 None:intergenic 40.0%
! GAATTCCATGAAAGCACATC+AGG - Chr4:75856596-75856615 None:intergenic 40.0%
! GCTTGTTAGAAATGGGAAGT+TGG + Chr4:75856199-75856218 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
! GTTGAATGGTGATGTGGATT+CGG + Chr4:75856112-75856131 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
! TCCACGAGATCAAGTTTTTG+TGG - Chr4:75856685-75856704 None:intergenic 40.0%
! TCTCGAGTACATGGTAATGA+GGG - Chr4:75856918-75856937 None:intergenic 40.0%
! TTTTCTCAGATGCAGCTTGA+GGG + Chr4:75856761-75856780 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
!! ATATCGGGGCTTGTTAGAAA+TGG + Chr4:75856191-75856210 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
!! CATGCAGGATTAGTTGAAGA+AGG + Chr4:75857136-75857155 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
!! GAAGACTATAAGGGTGCTAT+TGG + Chr4:75856734-75856753 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
!! TATCGGGGCTTGTTAGAAAT+GGG + Chr4:75856192-75856211 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
!! TTCTCTTAGCGGGCTTATAT+CGG + Chr4:75856175-75856194 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
!!! ATTCGGCTGTTGGGTTTTTT+AGG + Chr4:75856129-75856148 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
!!! GCTGAGATTTTGGTTGAGTA+TGG + Chr4:75856230-75856249 MsG0480022718.01.T01:CDS 40.0%
AAAAGAACAAGCTGCTGTCC+AGG + Chr4:75858401-75858420 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
AAACCAGATAAGGCTGTGTG+GGG + Chr4:75857295-75857314 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
ACCAATCTTGCAGCCATCAA+AGG - Chr4:75857806-75857825 None:intergenic 45.0%
ACCCATATTTGCCCCACAAT+AGG - Chr4:75858730-75858749 None:intergenic 45.0%
AGAAGCAAGCAGGGTATAGT+TGG + Chr4:75857503-75857522 MsG0480022718.01.T01:intron 45.0%
AGATTGAGCACCTTCGGTAT+CGG - Chr4:75858148-75858167 None:intergenic 45.0%
AGCCTATTGTGGGGCAAATA+TGG + Chr4:75858725-75858744 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
AGGAGATGTTGTCTCTGCTA+GGG + Chr4:75856454-75856473 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
AGTGAGTCGGACACAATAAG+TGG - Chr4:75858235-75858254 None:intergenic 45.0%
CAAGTCCTGATGTGCTTTCA+TGG + Chr4:75856588-75856607 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
CACCATCTGATGTAGCAGTA+GGG + Chr4:75858112-75858131 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
CCCACAAAAACTTGATCTCG+TGG + Chr4:75856681-75856700 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
CGTTGTAAATCTGTAGCTGC+TGG + Chr4:75857703-75857722 MsG0480022718.01.T01:intron 45.0%
CTATGTTCAAATGGGGGACA+TGG + Chr4:75856535-75856554 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
CTCAAGACCGATCAAAGCTT+TGG - Chr4:75857377-75857396 None:intergenic 45.0%
CTGCAAGTTCATCAGAATCC+TGG - Chr4:75858422-75858441 None:intergenic 45.0%
CTGCTAGGGAACTCTTTGAT+AGG + Chr4:75856468-75856487 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
GAAGACAAAGTGTGCCTATC+TGG - Chr4:75856794-75856813 None:intergenic 45.0%
GAAGTAGGTTTGTGGAGGAA+GGG + Chr4:75855928-75855947 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
GATCAAGGTGAGGGAAATGA+GGG + Chr4:75856368-75856387 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
GATGGGGTTATGAGTGATCA+AGG + Chr4:75856353-75856372 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
GCATAAGGAGCTGAACTTTC+TGG - Chr4:75857400-75857419 None:intergenic 45.0%
GCCTATTGTGGGGCAAATAT+GGG + Chr4:75858726-75858745 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
GGAACTCTTTGATAGGATGG+TGG + Chr4:75856475-75856494 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
GGATTGTGTGTCGTGGAATA+CGG + Chr4:75855980-75855999 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
GGTTATGAGTGATCAAGGTG+AGG + Chr4:75856358-75856377 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
TACAATTGGGAGCTTCTGCT+TGG + Chr4:75858811-75858830 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
TACCATGTACTCGAGATGTG+GGG + Chr4:75856922-75856941 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
TACTCGAGATGTGGGGAAAT+TGG + Chr4:75856929-75856948 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
TCAGAGAGGAATGGTTGAAG+AGG + Chr4:75856316-75856335 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
TCGTGGAACTCAGTAATAGC+TGG + Chr4:75856698-75856717 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
TGAACACTTTGCCTCTCTTG+TGG + Chr4:75857210-75857229 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
TGATCAAGGTGAGGGAAATG+AGG + Chr4:75856367-75856386 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
TGGAGAGAGATGCTTGTTCT+TGG + Chr4:75856495-75856514 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
TGTTGTGTCGTGTAATGCTG+TGG + Chr4:75856076-75856095 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
TTATGCGAAGAATGGGAGGA+TGG + Chr4:75856013-75856032 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
TTCCCTACTGCTACATCAGA+TGG - Chr4:75858117-75858136 None:intergenic 45.0%
TTGAATGCTTGTGCACATGC+AGG + Chr4:75857121-75857140 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
! ACTTTTCTTGCCGTGGAAGT+AGG + Chr4:75855913-75855932 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
! AGAGCTTTTCGAACGGATGA+AGG + Chr4:75857057-75857076 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
! AGCTTTTCGAACGGATGAAG+GGG + Chr4:75857059-75857078 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
! ATTTCATGGCTTTGCTGCAC+AGG + Chr4:75857030-75857049 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
! CAAAGCTTTGGCTGCTACTT+GGG - Chr4:75857365-75857384 None:intergenic 45.0%
! CATGAAAGCACATCAGGACT+TGG - Chr4:75856590-75856609 None:intergenic 45.0%
! GAGCTTTTCGAACGGATGAA+GGG + Chr4:75857058-75857077 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
! GTAGCAGCCAAAGCTTTGAT+CGG + Chr4:75857367-75857386 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
! TCAAAGCTTTGGCTGCTACT+TGG - Chr4:75857366-75857385 None:intergenic 45.0%
! TTGACCATGGTATTGAGCCA+CGG + Chr4:75857185-75857204 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
!! CGAGAGAGTAAAAGCGTTGA+TGG + Chr4:75857465-75857484 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
!! TCTAAGTGTGAGTACTGGGT+TGG + Chr4:75856817-75856836 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
!! TCTCTTAGCGGGCTTATATC+GGG + Chr4:75856176-75856195 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
!!! AGGCTCTAGAGCTTTTCGAA+CGG + Chr4:75857050-75857069 MsG0480022718.01.T01:CDS 45.0%
AACAGTCAAGCAAGTGGGTG+TGG + Chr4:75858840-75858859 MsG0480022718.01.T01:CDS 50.0%
AGGGTATGGTCAGAGAGGAA+TGG + Chr4:75856307-75856326 MsG0480022718.01.T01:CDS 50.0%
ATCTTGCAGCCATCAAAGGC+TGG - Chr4:75857802-75857821 None:intergenic 50.0%
ATGGTTATGGGCCTATGGCA+TGG + Chr4:75858754-75858773 MsG0480022718.01.T01:CDS 50.0%
ATTGCAGGGTATGGTCAGAG+AGG + Chr4:75856302-75856321 MsG0480022718.01.T01:CDS 50.0%
CACCCACTTGCTTGACTGTT+TGG - Chr4:75858840-75858859 None:intergenic 50.0%
CACGACACAACATTGCGTTC+CGG - Chr4:75856068-75856087 None:intergenic 50.0%
CACGACACACAATCCCTTTG+AGG - Chr4:75855975-75855994 None:intergenic 50.0%
CAGGAGATGTTGTCTCTGCT+AGG + Chr4:75856453-75856472 MsG0480022718.01.T01:CDS 50.0%
CAGTTATTTGCGCATCCTCC+TGG + Chr4:75858571-75858590 MsG0480022718.01.T01:intron 50.0%
CCACCATCTGATGTAGCAGT+AGG + Chr4:75858111-75858130 MsG0480022718.01.T01:CDS 50.0%
CCTACTGCTACATCAGATGG+TGG - Chr4:75858114-75858133 None:intergenic 50.0%
CCTCCACAAACCTACTTCCA+CGG - Chr4:75855926-75855945 None:intergenic 50.0%
CCTCTCTTGTGGACATCTTG+GGG + Chr4:75857221-75857240 MsG0480022718.01.T01:CDS 50.0%
CGGGCTGATATTTGGAGGTA+AGG + Chr4:75857669-75857688 MsG0480022718.01.T01:intron 50.0%
CTCAAAGGGATTGTGTGTCG+TGG + Chr4:75855973-75855992 MsG0480022718.01.T01:CDS 50.0%
CTCCATTTCCATCGATGCAG+TGG - Chr4:75858788-75858807 None:intergenic 50.0%
GAGTCATTCACTGGTGTGCA+TGG - Chr4:75858641-75858660 None:intergenic 50.0%
GCCTCTCTTGTGGACATCTT+GGG + Chr4:75857220-75857239 MsG0480022718.01.T01:CDS 50.0%
GCTGATGTATCTGCTTGCCA+AGG - Chr4:75856853-75856872 None:intergenic 50.0%
GGAAGTAGGTTTGTGGAGGA+AGG + Chr4:75855927-75855946 MsG0480022718.01.T01:CDS 50.0%
GTCTTCGGGCTGATATTTGG+AGG + Chr4:75857664-75857683 MsG0480022718.01.T01:intron 50.0%
GTGATGTGGATTCGGCTGTT+GGG + Chr4:75856120-75856139 MsG0480022718.01.T01:CDS 50.0%
GTGGTTATGCGAAGAATGGG+AGG + Chr4:75856009-75856028 MsG0480022718.01.T01:CDS 50.0%
TCAAATGGGGGACATGGAAG+AGG + Chr4:75856541-75856560 MsG0480022718.01.T01:CDS 50.0%
TGCCTCTCTTGTGGACATCT+TGG + Chr4:75857219-75857238 MsG0480022718.01.T01:CDS 50.0%
TTCCCCACATCTCGAGTACA+TGG - Chr4:75856927-75856946 None:intergenic 50.0%
TTGAGGGAGAGAGACCAGAT+AGG + Chr4:75856777-75856796 MsG0480022718.01.T01:CDS 50.0%
TTGCCGTGGAAGTAGGTTTG+TGG + Chr4:75855920-75855939 MsG0480022718.01.T01:CDS 50.0%
! ACATCAGATGGTGGCACAAC+TGG - Chr4:75858105-75858124 None:intergenic 50.0%
! CGTAGCATCGAGTCATTCAC+TGG - Chr4:75858650-75858669 None:intergenic 50.0%
! GAAGATGAGAGAGCGTGACT+CGG + Chr4:75856151-75856170 MsG0480022718.01.T01:CDS 50.0%
! GCCTTTGATGGCTGCAAGAT+TGG + Chr4:75857802-75857821 MsG0480022718.01.T01:CDS 50.0%
! GGATATGGCCGCTGAGATTT+TGG + Chr4:75856220-75856239 MsG0480022718.01.T01:CDS 50.0%
! GGGGCATTTCATCGAACAGT+TGG - Chr4:75855854-75855873 None:intergenic 50.0%
! GTGAGGGAAATGAGGGTACA+AGG + Chr4:75856375-75856394 MsG0480022718.01.T01:CDS 50.0%
! TGACCATGGTATTGAGCCAC+GGG + Chr4:75857186-75857205 MsG0480022718.01.T01:CDS 50.0%
! TGCCACTGCATCGATGGAAA+TGG + Chr4:75858783-75858802 MsG0480022718.01.T01:CDS 50.0%
!! CTCTTAGCGGGCTTATATCG+GGG + Chr4:75856177-75856196 MsG0480022718.01.T01:CDS 50.0%
!! GGGTTGGTCGATCTTTACCT+TGG + Chr4:75856833-75856852 MsG0480022718.01.T01:CDS 50.0%
!!! GGCGTGCTTTTGCTATTTCG+CGG - Chr4:75855833-75855852 None:intergenic 50.0%
!!! TCGGGTTACTTTTCTTGCCG+TGG + Chr4:75855906-75855925 MsG0480022718.01.T01:CDS 50.0%
CAACCCGTGGCTCAATACCA+TGG - Chr4:75857192-75857211 None:intergenic 55.0%
CAAGGGACTCCAGCCTTTGA+TGG + Chr4:75857790-75857809 MsG0480022718.01.T01:CDS 55.0%
CCCCAAGATGTCCACAAGAG+AGG - Chr4:75857224-75857243 None:intergenic 55.0%
CCGTGGAAGTAGGTTTGTGG+AGG + Chr4:75855923-75855942 MsG0480022718.01.T01:CDS 55.0%
CTCTTGTGGACATCTTGGGG+CGG + Chr4:75857224-75857243 MsG0480022718.01.T01:CDS 55.0%
CTTGGGGCTTGTAGAGTGCA+TGG + Chr4:75857325-75857344 MsG0480022718.01.T01:CDS 55.0%
GAGGAATGGTTGAAGAGGCG+CGG + Chr4:75856321-75856340 MsG0480022718.01.T01:CDS 55.0%
GGGACAGCTTCAAGTGGCTA+TGG + Chr4:75857249-75857268 MsG0480022718.01.T01:CDS 55.0%
GGTGATGTGGATTCGGCTGT+TGG + Chr4:75856119-75856138 MsG0480022718.01.T01:CDS 55.0%
GTAGGTTTGTGGAGGAAGGG+AGG + Chr4:75855931-75855950 MsG0480022718.01.T01:CDS 55.0%
TGCAACTGCCACTGCATCGA+TGG + Chr4:75858777-75858796 MsG0480022718.01.T01:CDS 55.0%
TGGCAGTTGCACCATGCCAT+AGG - Chr4:75858768-75858787 None:intergenic 55.0%
! CGTGACTCGGCTTCTCTTAG+CGG + Chr4:75856164-75856183 MsG0480022718.01.T01:CDS 55.0%
! CTGTGTGGGGTGCTCTACTT+GGG + Chr4:75857308-75857327 MsG0480022718.01.T01:CDS 55.0%
! GAGGCAAAGTGTTCAACCCG+TGG - Chr4:75857205-75857224 None:intergenic 55.0%
! GTGACTCGGCTTCTCTTAGC+GGG + Chr4:75856165-75856184 MsG0480022718.01.T01:CDS 55.0%
! TCAGATGGTGGCACAACTGG+TGG - Chr4:75858102-75858121 None:intergenic 55.0%
! TGTGTGGGGTGCTCTACTTG+GGG + Chr4:75857309-75857328 MsG0480022718.01.T01:CDS 55.0%
!! AGGCGCGGCGTGTTTTTGAT+GGG + Chr4:75856336-75856355 MsG0480022718.01.T01:CDS 55.0%
!! ATTTGCCAGTGTCGGCAGCA+AGG + Chr4:75857772-75857791 MsG0480022718.01.T01:CDS 55.0%
!! TTTGCCAGTGTCGGCAGCAA+GGG + Chr4:75857773-75857792 MsG0480022718.01.T01:CDS 55.0%
! GCACCCCACACAGCCTTATC+TGG - Chr4:75857301-75857320 None:intergenic 60.0%
! GCTGTGTGGGGTGCTCTACT+TGG + Chr4:75857307-75857326 MsG0480022718.01.T01:CDS 60.0%
!! GAGGCGCGGCGTGTTTTTGA+TGG + Chr4:75856335-75856354 MsG0480022718.01.T01:CDS 60.0%
!! GGCGCGGCGTGTTTTTGATG+GGG + Chr4:75856337-75856356 MsG0480022718.01.T01:CDS 60.0%
GAGTCCCTTGCTGCCGACAC+TGG - Chr4:75857780-75857799 None:intergenic 65.0%
GCGGCAGGGACAGCTTCAAG+TGG + Chr4:75857243-75857262 MsG0480022718.01.T01:CDS 65.0%
GTGGACATCTTGGGGCGGCA+GGG + Chr4:75857229-75857248 MsG0480022718.01.T01:CDS 65.0%
TGTGGACATCTTGGGGCGGC+AGG + Chr4:75857228-75857247 MsG0480022718.01.T01:CDS 65.0%
Chromosome Type Strat End Strand Name
Chr4 gene 75855807 75858875 75855807 ID=MsG0480022718.01;Name=MsG0480022718.01
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Chr4 exon 75858106 75858173 75858106 ID=MsG0480022718.01.T01:exon:8491;Parent=MsG0480022718.01.T01
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Chr4 CDS 75857768 75857823 75857768 ID=MsG0480022718.01.T01:cds;Parent=MsG0480022718.01.T01
Chr4 CDS 75858106 75858173 75858106 ID=MsG0480022718.01.T01:cds;Parent=MsG0480022718.01.T01
Chr4 CDS 75858393 75858458 75858393 ID=MsG0480022718.01.T01:cds;Parent=MsG0480022718.01.T01
Chr4 CDS 75858717 75858875 75858717 ID=MsG0480022718.01.T01:cds;Parent=MsG0480022718.01.T01
Gene Sequence

>MsG0480022718.01.T01

ATGATCACTGGTTACGTTCAACGCCGCGAAATAGCAAAAGCACGCCAACTGTTCGATGAAATGCCCCATAGAGATATTGTGTCTTGGAACCTCATTATATCGGGTTACTTTTCTTGCCGTGGAAGTAGGTTTGTGGAGGAAGGGAGGAAACTGTTTGATATAATGCCTCAAAGGGATTGTGTGTCGTGGAATACGGTTATTAGTGGTTATGCGAAGAATGGGAGGATGGATCAAGCGATTGAGATTTTTGAATCTATGCCGGAACGCAATGTTGTGTCGTGTAATGCTGTGGTAAATGGGTTTTTGTTGAATGGTGATGTGGATTCGGCTGTTGGGTTTTTTAGGAAGATGAGAGAGCGTGACTCGGCTTCTCTTAGCGGGCTTATATCGGGGCTTGTTAGAAATGGGAAGTTGGATATGGCCGCTGAGATTTTGGTTGAGTATGGGAATGAGGGTGATGAGAAAGATGATTTGGTGTATGCTTATAATACGTTGATTGCAGGGTATGGTCAGAGAGGAATGGTTGAAGAGGCGCGGCGTGTTTTTGATGGGGTTATGAGTGATCAAGGTGAGGGAAATGAGGGTACAAGGAGATTTAAGAGAAATGTGGTATCGTGGAATTCGATGATGATGTGTTATGTGAAAGCAGGAGATGTTGTCTCTGCTAGGGAACTCTTTGATAGGATGGTGGAGAGAGATGCTTGTTCTTGGAATACTGTGATTAGTGGCTATGTTCAAATGGGGGACATGGAAGAGGCTTCAAAGCTTTTTTTGGAAATGCCAAGTCCTGATGTGCTTTCATGGAATTCAATAATATCCGGGTTTTCTCAGATTGGTGATTTGAAACATGTGAAAGAGTTCTTTGAAAGGATGCCCCACAAAAACTTGATCTCGTGGAACTCAGTAATAGCTGGCTACGAGAAAAATGAAGACTATAAGGGTGCTATTGGGCTATTTTCTCAGATGCAGCTTGAGGGAGAGAGACCAGATAGGCACACTTTGTCTTCAATTCTAAGTGTGAGTACTGGGTTGGTCGATCTTTACCTTGGCAAGCAGATACATCAGCTTGTAACAAAGACTGTTGTTCCTGATTTGCCAATAAATAATTCCCTCATTACCATGTACTCGAGATGTGGGGAAATTGGTGATGCACGCGATGTGTTTAATGAGATGAAACTCTGTAAAGATGTGATAACTTGGAATGCAATGATTGGAGGTTATGCATTTCATGGCTTTGCTGCACAGGCTCTAGAGCTTTTCGAACGGATGAAGGGGCTTAAAATTCAACCTACCTATATAACCTTTATTTCGGTTTTGAATGCTTGTGCACATGCAGGATTAGTTGAAGAAGGAAAGAGGCAATTCAATTCCATGATTATTGACCATGGTATTGAGCCACGGGTTGAACACTTTGCCTCTCTTGTGGACATCTTGGGGCGGCAGGGACAGCTTCAAGTGGCTATGGATTTGATTGATAACATGCCAGTTAAACCAGATAAGGCTGTGTGGGGTGCTCTACTTGGGGCTTGTAGAGTGCATGGTAATGTAGAATTGGCCCAAGTAGCAGCCAAAGCTTTGATCGGTCTTGAGCCAGAAAGTTCAGCTCCTTATGCGTTGTTATTTAATCTTTATGCTGATTTAGGACAGTGGGATGATGCCGAGAGAGTAAAAGCGTTGATGGAAGAAAATAATGTCAAGAAGCAAGCAGGATCTATTTGCCAGTGTCGGCAGCAAGGGACTCCAGCCTTTGATGGCTGCAAGATTGTTGTGCCACCATCTGATGTAGCAGTAGGGAATGAAAATGCCGATACCGAAGGTGCTCAATCTGATGAAATAAAAGGAAAAGAACAAGCTGCTGTCCAGGATTCTGATGAACTTGCAGATAGCACTTTGAACAAGAAAAGGAAAGCCTATTGTGGGGCAAATATGGGTAATAATGGTTATGGGCCTATGGCATGGTGCAACTGCCACTGCATCGATGGAAATGGAGAACTACAATTGGGAGCTTCTGCTTGGTTTCCAAACAGTCAAGCAAGTGGGTGTGGATTTCAGCAATGA
Protein sequence

>MsG0480022718.01.T01

MITGYVQRREIAKARQLFDEMPHRDIVSWNLIISGYFSCRGSRFVEEGRKLFDIMPQRDCVSWNTVISGYAKNGRMDQAIEIFESMPERNVVSCNAVVNGFLLNGDVDSAVGFFRKMRERDSASLSGLISGLVRNGKLDMAAEILVEYGNEGDEKDDLVYAYNTLIAGYGQRGMVEEARRVFDGVMSDQGEGNEGTRRFKRNVVSWNSMMMCYVKAGDVVSARELFDRMVERDACSWNTVISGYVQMGDMEEASKLFLEMPSPDVLSWNSIISGFSQIGDLKHVKEFFERMPHKNLISWNSVIAGYEKNEDYKGAIGLFSQMQLEGERPDRHTLSSILSVSTGLVDLYLGKQIHQLVTKTVVPDLPINNSLITMYSRCGEIGDARDVFNEMKLCKDVITWNAMIGGYAFHGFAAQALELFERMKGLKIQPTYITFISVLNACAHAGLVEEGKRQFNSMIIDHGIEPRVEHFASLVDILGRQGQLQVAMDLIDNMPVKPDKAVWGALLGACRVHGNVELAQVAAKALIGLEPESSAPYALLFNLYADLGQWDDAERVKALMEENNVKKQAGSICQCRQQGTPAFDGCKIVVPPSDVAVGNENADTEGAQSDEIKGKEQAAVQDSDELADSTLNKKRKAYCGANMGNNGYGPMAWCNCHCIDGNGELQLGASAWFPNSQASGCGFQQ*